Normal Chrom Pos Ref Alt Gene Transcript RNA CDS Protein Effect DIS_sample_PD9773b_depth DIS_MtAll_PD9773b DIS_MtAllPct_PD9773b DIS_sample_PD9773c_depth DIS_MtAll_PD9773c DIS_MtAllPct_PD9773c DIS_sample_PD9773a_depth DIS_MtAll_PD9773a DIS_MtAllPct_PD9773a VAL_sample_PD9773b_depth VAL_MtAll_PD9773b VAL_MtAllPct_PD9773b VAL_sample_WGA_PD9773c_depth VAL_MtAll_WGA_PD9773c VAL_MtAllPct_WGA_PD9773c VAL_sample_WGA_PD9773a_depth VAL_MtAll_WGA_PD9773a VAL_MtAllPct_WGA_PD9773a in.discovery in.validation subclonal.CN.a subclonal.CN.c nMaj1.a nMaj1.c nMin1.a nMin1.c frac1.a frac1.c nMaj2.a nMaj2.c nMin2.a nMin2.c frac2.a frac2.c mutation.copy.number.a subclonal.fraction.a no.chrs.bearing.mut.a mutation.copy.number.c subclonal.fraction.c no.chrs.bearing.mut.c val.mutation.copy.number.a val.subclonal.fraction.a val.no.chrs.bearing.mut.a val.mutation.copy.number.c val.subclonal.fraction.c val.no.chrs.bearing.mut.c discovery.DP.cluster validation.DP.cluster pbinom_dis_b pbinom_val_b pbinom_dis_a pbinom_val_a pbinom_dis_c pbinom_val_c VAL_LOCUS val_status_a val_status_c current.conf.status val.platform PD9773b 1 1288448 G T MXRA8 CCDS24.1 r.1896c>a c.? p.? 3'UTR variant 34 0 0 53 5 9.4 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.676461027 2.698551327 1 1 1 1 0.323538973 0.301448673 2 2 1 1 0.676461027 0.698551327 0 0 1 0.651333607 0.651333607 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 5195351 T C - - - - - - 34 0 0 51 4 7.8 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.676461027 2.698551327 1 1 1 1 0.323538973 0.301448673 2 2 1 1 0.676461027 0.698551327 0 0 1 0.540468312 0.540468312 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000129466 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 5414825 G C - - - - - - 44 0 0 55 6 10.9 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.676461027 2.698551327 1 1 1 1 0.323538973 0.301448673 2 2 1 1 0.676461027 0.698551327 0.461173479 0.461173479 1 0.755269821 0.755269821 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 5543319 A C - - - - - - 41 0 0 51 5 9.8 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.676461027 2.698551327 1 1 1 1 0.323538973 0.301448673 2 2 1 1 0.676461027 0.698551327 0 0 1 0.67904993 0.67904993 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000606 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 10984389 G A - - - - - - 30 0 0 56 5 8.9 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.676461027 2.698551327 1 1 1 1 0.323538973 0.301448673 2 2 1 1 0.676461027 0.698551327 0 0 1 0.616688202 0.616688202 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000965 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 11235163 A C MTOR CCDS127.1 r.? - - intronic 32 0 0 55 8 14.5 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.676461027 2.698551327 1 1 1 1 0.323538973 0.301448673 2 2 1 1 0.676461027 0.698551327 0.488843887 0.488843887 1 1.004716734 1.004716734 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 3.86E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 56998469 G A BAZ2A CCDS44924.1 r.3063c>u c.2869C>T p.R957C missense 31 0 0 49 6 12.2 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.606837607 0.606837607 1 0.760124611 0.760124611 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.000000182 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 17833845 C A AL390994.1 ENST00000509615 r.? - - intronic 45 0 0 47 5 10.6 15 3 20 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.676461027 2.698551327 1 1 1 1 0.323538973 0.301448673 2 2 1 1 0.676461027 0.698551327 1.844693915 1.844693915 1 0.734482578 0.734482578 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000544 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 22171768 C G HSPG2 ENST00000374695 r.? - - intronic 44 0 0 61 5 8.2 23 2 8.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.676461027 2.698551327 1 1 1 1 0.323538973 0.301448673 2 2 1 1 0.676461027 0.698551327 0.802441853 0.802441853 1 0.568184636 0.568184636 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.00589844 1 0.0000147 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 22638582 G C - - - - - - 45 0 0 45 4 8.9 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.676461027 2.698551327 1 1 1 1 0.323538973 0.301448673 2 2 1 1 0.676461027 0.698551327 0 0 1 0.616688202 0.616688202 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 24002918 G A - - - - - - 33 0 0 44 6 13.6 9 1 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.676461027 2.698551327 1 1 1 1 0.323538973 0.301448673 2 2 1 1 0.676461027 0.698551327 1.023805123 1.023805123 1 0.942355005 0.942355005 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.044110422 1 9.37E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 25041585 G C - - - - - - 47 0 0 42 7 16.7 12 2 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.676461027 2.698551327 1 1 1 1 0.323538973 0.301448673 2 2 1 1 0.676461027 0.698551327 1.540319419 1.540319419 1 1.157156514 1.157156514 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.001595918 1 1.81E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 25243197 G T RUNX3 CCDS30633.1 r.? - - intronic 30 0 0 51 6 11.8 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.676461027 2.698551327 1 1 1 1 0.323538973 0.301448673 2 2 1 1 0.676461027 0.698551327 0.710207157 0.710207157 1 0.817631549 0.817631549 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 27010127 G A - - - - - - 40 0 0 42 6 14.3 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.676461027 2.698551327 1 1 1 1 0.323538973 0.301448673 2 2 1 1 0.676461027 0.698551327 0 0 1 0.990858572 0.990858572 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 7.02E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 29733215 A G ENSG00000231360 ENST00000455342 r.? - - intronic 42 0 0 56 4 7.1 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.676461027 2.698551327 1 1 1 1 0.323538973 0.301448673 2 2 1 1 0.676461027 0.698551327 0 0 1 0.491964745 0.491964745 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000186538 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 35095665 T A - - - - - - 49 0 0 52 3 5.8 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.676461027 2.698551327 1 1 1 1 0.323538973 0.301448673 2 2 1 1 0.676461027 0.698551327 0 0 1 0.401886693 0.401886693 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.002300591 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 35131231 A C MIR552 ENST00000385206 r.? - - downstream 40 0 0 55 3 5.5 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.676461027 2.698551327 1 1 1 1 0.323538973 0.301448673 2 2 1 1 0.676461027 0.698551327 0 0 1 0.381099451 0.545556834 0.698551327 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.002700822 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 38823859 A T - - - - - - 37 0 0 46 3 6.5 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.676461027 2.698551327 1 1 1 1 0.323538973 0.301448673 2 2 1 1 0.676461027 0.698551327 0 0 1 0.45039026 0.45039026 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.001615827 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 42473717 T C - - - - - - 39 0 0 54 6 11.1 27 5 18.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.676461027 3.812080819 1 2 1 1 0.323538973 0.187919181 2 2 1 2 0.676461027 0.812080819 1.706341871 1.706341871 1 0.892729756 0.892729756 1 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 0.00000023 1 0.000000329 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 43756697 G A - - - - - - 28 0 0 59 9 15.3 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0.812119658 0.812119658 1 1.230519393 1.230519393 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.063085307 1 1.96E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 45036201 A C RNF220 CCDS510.1 r.? - - intronic 31 0 0 58 4 6.9 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0 0 1 0.554940119 0.554940119 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000213772 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 45362516 C T EIF2B3 CCDS517.1 r.? - - intronic 34 0 0 58 5 8.6 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0.590632479 0.590632479 1 0.691664496 0.691664496 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.0000115 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 48068662 C T - - - - - - 35 0 0 61 7 11.5 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0.812119658 0.812119658 1 0.924900198 0.924900198 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.063085307 1 2.69E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 48272807 T A - - - - - - 34 0 0 57 4 7 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0 0 1 0.562982729 0.562982729 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000199821 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 51495225 G C - - - - - - 33 0 0 37 3 8.1 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0 0 1 0.651451444 0.651451444 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000855237 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 52826057 C T CC2D1B CCDS30714.1 r.? - - intronic 33 0 0 41 7 17.1 11 2 18.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 1.919555556 1.919555556 1 1.375286381 1.375286381 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.001334363 1 1.51E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 55379140 G T - - - - - - 38 0 0 67 6 9 21 2 9.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 1.001965812 1.001965812 1 0.723834937 0.723834937 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004928472 1 0.0000012 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 56158874 C G - - - - - - 33 0 0 56 4 7.1 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0 0 1 0.571025339 0.571025339 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000186538 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 56541800 A C - - - - - - 27 0 0 63 4 6.3 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0 0 1 0.506684456 0.506684456 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000294233 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 57596658 T A DAB1 CCDS607.1 r.? - - intronic 34 0 0 53 4 7.5 17 0 0 0 0 NA 1 1 100 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0 0 1 0.603195781 0.603195781 1 NA NA 1 8.042610414 8.042610414 1 2 NA 1 1 1 1 0.000150502 0.005 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 60237974 G A - - - - - - 43 0 0 66 5 7.6 23 1 4.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0.453521368 0.453521368 1 0.611238391 0.611238391 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.108890944 1 0.0000217 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 61503843 A T NFIA ENST00000371191 r.? - - intronic 45 0 0 46 7 15.2 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0 0 1 1.222476783 1.222476783 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 3.53E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 67605122 T C - - - - - - 39 0 0 56 5 8.9 11 2 18.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 1.919555556 1.919555556 1 0.715792327 0.715792327 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.001334363 1 0.00000965 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 68409066 A T - - - - - - 37 0 0 57 5 8.8 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0.527350427 0.527350427 1 0.707749716 0.707749716 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 70653669 G C LRRC40 CCDS646.1 r.? - - intronic 51 0 0 50 4 8 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0.590632479 0.590632479 1 0.643408833 0.643408833 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.000119787 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 72572270 G C NEGR1 CCDS661.1 r.? - - intronic 44 0 0 54 4 7.4 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0 0 1 0.595153171 0.595153171 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 72597407 G T NEGR1 CCDS661.1 r.? - - intronic 33 0 0 74 4 5.4 25 1 4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0.421880342 0.421880342 1 0.434300962 0.534800173 0.812080819 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.117779757 1 0.00054411 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 80696722 G C - - - - - - 52 0 0 56 5 8.9 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0 0 1 0.715792327 0.715792327 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000965 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 80944578 A T - - - - - - 39 0 0 56 3 5.4 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0 0 1 0.434300962 0.434300962 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00284314 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 90418782 T G - - - - - - 25 0 0 50 6 12 20 3 15 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 1.582051282 1.582051282 1 0.96511325 0.96511325 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0001337 1 0.000000206 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 94115450 G A BCAR3 CCDS745.1 r.? - - intronic 29 0 0 36 4 11.1 25 3 12 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 1.265641026 1.265641026 1 0.892729756 0.892729756 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.00026475 1 0.0000324 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 95683541 T A - - - - - - 35 0 0 49 3 6.1 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0.65391453 0.65391453 1 0.490599235 0.490599235 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.001939399 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 96961459 A C - - - - - - 37 0 0 57 5 8.8 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 1.244547009 1.244547009 1 0.707749716 0.707749716 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 97633615 T C DPYD CCDS30777.1 r.? - - intronic 57 0 0 60 5 8.3 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0 0 1 0.667536664 0.667536664 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000136 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 98745315 A G - - - - - - 39 0 0 67 7 10.4 13 1 7.7 0 0 NA 2 0 0 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0.812119658 0.812119658 1 0.836431483 0.836431483 1 NA NA 1 0 NA 0 2 NA 1 1 0.063085307 1 5.23E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 98929897 G C - - - - - - 44 0 0 58 4 6.9 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0 0 1 0.554940119 0.554940119 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000213772 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 99194994 A G SNX7 CCDS755.2 r.? - - intronic 33 0 0 59 4 6.8 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0 0 1 0.546897508 0.546897508 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00022841 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 99247528 G C - - - - - - 39 0 0 56 4 7.1 11 2 18.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 1.919555556 1.919555556 1 0.571025339 0.571025339 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.001334363 1 0.000186538 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 99443030 G A ENSG00000117598 CCDS30779.1 r.? - - intronic 50 0 0 57 5 8.8 21 2 9.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 1.001965812 1.001965812 1 0.707749716 0.707749716 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004928472 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 103286412 G C - - - - - - 30 0 0 55 5 9.1 23 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0 0 1 0.731877548 0.731877548 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000883 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 106646154 T C - - - - - - 25 0 0 49 5 10.2 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0.748837607 0.748837607 1 0.820346262 0.820346262 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 107451110 T C - - - - - - 33 0 0 56 6 10.7 27 1 3.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0.390239316 0.390239316 1 0.860559314 0.860559314 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.126579904 1 0.000000409 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 108414569 C T VAV3 CCDS785.1 r.? - - intronic 28 0 0 66 7 10.6 12 2 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 1.761350427 1.761350427 1 0.852516704 0.852516704 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.001595918 1 0.000000047 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 115926263 C T - - - - - - 51 0 0 59 11 18.6 18 3 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 1.761350427 1.761350427 1 1.495925537 1.495925537 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.0000964 1 1.1E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 118010421 T C MAN1A2 CCDS895.1 r.? - - intronic 30 0 0 54 5 9.3 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0 0 1 0.747962769 0.747962769 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000806 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 119458621 A C TBX15 CCDS30816.1 r.? - - intronic 42 0 0 62 4 6.5 22 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0 0 1 0.522769677 0.522769677 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000276647 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 146781072 A T - - - - - - 40 0 0 46 7 15.2 23 2 8.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0.917589744 0.917589744 1 1.222476783 1.222476783 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.00589844 1 3.53E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 146871882 A T - - - - - - 41 0 0 50 4 8 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0 0 1 0.643408833 0.643408833 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000119787 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 152511080 T G LCE3C ENST00000419212 r.? - - intronic 40 0 0 48 3 6.2 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0 0 1 0.498641846 0.498641846 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.001827434 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 155551896 G T - - - - - - 28 0 0 46 4 8.7 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0 0 1 0.699707106 0.699707106 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 156395169 G A C1orf61 CCDS1142.1 r.? - - intronic 33 0 0 50 5 10 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0.706649573 0.706649573 1 0.804261041 0.804261041 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 156691313 C T ISG20L2 CCDS1153.1 r.? - - downstream 44 0 0 49 7 14.3 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0.558991453 0.558991453 1 1.150093289 1.150093289 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 5.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 159146251 C A CADM3 CCDS44251.1 r.? - - intronic 34 0 0 62 4 6.5 26 1 3.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3 5 2 3 1 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.362786325 NA 0 0.599984424 0.599984424 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.122190858 1 0.000276647 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 159464704 G A - - - - - - 34 0 0 34 5 14.7 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3 5 2 3 1 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 NA 0 1.35688785 1.35688785 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000000771 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 159476788 G A - - - - - - 31 0 0 61 7 11.5 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3 5 2 3 1 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.477350427 NA 0 1.061510903 1.061510903 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.09538952 1 2.69E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 159721140 G A - - - - - - 26 0 0 45 6 13.3 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3 5 2 3 1 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.505991453 NA 0 1.227660436 1.227660436 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.090843738 1 0.000000108 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 160318308 G A NCSTN CCDS1203.1 r.? - - intronic 46 0 0 71 8 11.3 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 5 2 3 1 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.954700855 0.954700855 1 1.043049844 1.043049844 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004473894 1 3.14E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 160907149 G A - - - - - - 25 0 0 60 9 15 18 5 27.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 5 2 3 1 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.654068376 1.327034188 2 1.384579439 1.384579439 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 2.54E-08 1 2.29E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 161117100 T A - - - - - - 38 0 0 52 4 7.7 24 1 4.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3 5 2 3 1 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.400974359 NA 0 0.710750779 0.710750779 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.113346489 1 0.000139698 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 161476606 G C FCGR2A CCDS44264.1 r.? - - intronic 34 0 0 54 4 7.4 23 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3 5 2 3 1 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 NA 0 0.68305919 0.68305919 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 163445772 C G - - - - - - 45 0 0 63 6 9.5 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 5 2 3 1 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.954700855 0.954700855 1 0.876900312 0.876900312 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004473894 1 0.000000832 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 164021428 A G - - - - - - 39 0 0 69 5 7.2 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3 5 2 3 1 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 NA 0 0.664598131 0.664598131 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.0000269 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 165303284 A C LMX1A CCDS1247.1 r.? - - intronic 42 0 0 75 4 5.3 25 1 4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3 5 2 3 1 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.381880342 NA 0 0.489218069 0.489218069 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.117779757 1 0.000572493 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 165362334 C G - - - - - - 38 0 0 63 4 6.3 22 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3 5 2 3 1 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 NA 0 0.581523364 0.581523364 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000294233 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 166039057 C G FAM78B CCDS30931.1 r.? - - downstream 34 0 0 63 4 6.3 19 3 15.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 5 2 3 1 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.50842735 1.50842735 1 0.581523364 0.581523364 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000114071 1 0.000294233 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 167548049 C T - - - - - - 37 0 0 59 5 8.5 25 2 8 0 0 NA 2 0 0 0 0 NA TRUE FALSE 3 5 2 3 1 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.763760684 0.763760684 1 0.784595016 0.784595016 1 NA NA 0 0 0 1 2 NA 1 1 0.006948068 1 0.0000125 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 68358670 G C CENPC1 CCDS47063.1 r.2587c>g c.2336C>G p.S779C missense 33 0 0 48 4 8.3 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.53070946 0.53070946 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000102016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 168898458 T G - - - - - - 35 0 0 61 4 6.6 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3 5 2 3 1 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 NA 0 0.609214953 0.609214953 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000259828 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 169345362 G A BLZF1 CCDS1278.1 r.? - - intronic 51 0 0 69 8 11.6 24 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3 5 2 3 1 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 NA 0 1.070741433 1.070741433 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 2.49E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 171925955 C G DNM3 CCDS44276.1 r.? - - intronic 33 0 0 56 7 12.5 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 0.994698892 0.994698892 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 1.46E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 172086663 T G DNM3 CCDS44276.1 r.? - - intronic 40 0 0 65 7 10.8 24 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 0.859419843 0.859419843 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 4.22E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 174179695 C T RABGAP1L CCDS1314.1 r.? - - intronic 31 0 0 43 5 11.6 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 0.923080572 0.923080572 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000257 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 175017174 A G - - - - - - 37 0 0 63 5 7.9 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 1.107435897 1.107435897 1 0.6286497 0.6286497 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.0000173 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 175317836 G A TNR CCDS1318.1 r.? - - intronic 26 0 0 40 4 10 22 3 13.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 1.434393162 1.434393162 1 0.795759114 0.795759114 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000179267 1 0.0000495 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 177378600 T C - - - - - - 39 0 0 38 5 13.2 23 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 1.05040203 1.05040203 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000137 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 177675976 G T - - - - - - 30 0 0 49 5 10.2 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 0.811674296 0.811674296 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 177876494 G T - - - - - - 38 0 0 67 6 9 13 2 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 1.624239316 1.624239316 1 0.716183203 0.716183203 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.001879825 1 0.0000012 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 178156627 T A RASAL2 CCDS1321.1 r.? - - intronic 42 0 0 62 9 14.5 11 2 18.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 1.919555556 1.919555556 1 1.153850715 1.153850715 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.001334363 1 3.12E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 178464332 G A - - - - - - 36 0 0 55 7 12.7 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 1.010614075 1.010614075 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 1.28E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 184798490 C G FAM129A CCDS1364.1 r.? - - intronic 20 0 0 48 5 10.4 15 3 20 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 2.109401709 2.109401709 1 0.827589479 0.827589479 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000544 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 185234623 A G C1orf26 CCDS1367.1 r.? - - intronic 34 0 0 46 6 13 18 2 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 1.170717949 1.170717949 1 1.034486848 1.034486848 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003626632 1 0.000000123 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 185912423 G T HMCN1 CCDS30956.1 r.? - - intronic 39 0 0 51 4 7.8 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 1.107435897 1.107435897 1 0.620692109 0.620692109 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.000129466 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 186467070 G C - - - - - - 42 0 0 62 5 8.1 26 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 0.644564882 0.644564882 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 186492864 G A - - - - - - 29 0 0 57 12 21.1 15 3 20 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 2.109401709 2.109401709 1 1.67905173 0.839525865 2 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000544 1 1.4E-16 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 187119027 G T - - - - - - 50 0 0 54 4 7.4 22 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 0.588861744 0.588861744 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 188645949 T A - - - - - - 64 0 0 55 6 10.9 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 0.867377434 0.867377434 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 189230349 G C - - - - - - 42 0 0 58 4 6.9 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 1.107435897 1.107435897 1 0.549073789 0.549073789 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.000213772 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 189477920 T C - - - - - - 36 0 0 49 4 8.2 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 0.652522473 0.652522473 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 191589900 C T - - - - - - 53 0 0 60 6 10 21 2 9.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 1.001965812 1.001965812 1 0.795759114 0.795759114 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004928472 1 0.000000621 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 194659499 G T - - - - - - 46 0 0 53 4 7.5 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0.590632479 0.590632479 1 0.596819335 0.596819335 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 194907489 G A - - - - - - 38 0 0 53 5 9.4 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0.748837607 0.748837607 1 0.748013567 0.748013567 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 196012823 A G - - - - - - 40 0 0 60 4 6.7 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0.959777778 0.959777778 1 0.533158606 0.533158606 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.05364542 1 0.000243755 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 196801807 G T CFHR1 CCDS1386.1 r.? - - downstream 33 0 0 61 7 11.5 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0.590632479 0.590632479 1 0.915122981 0.915122981 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 2.69E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 197782821 T A - - - - - - 34 0 0 56 4 7.1 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 0.564988971 0.564988971 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000186538 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 201384641 C T TNNI1 CCDS1411.1 r.? - - intronic 34 0 0 48 6 12.5 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 0.994698892 0.994698892 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 204329613 C T PLEKHA6 CCDS1444.1 r.? - - upstream 40 0 0 51 5 9.8 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 0.779843932 0.779843932 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000606 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 208919342 T A - - - - - - 41 0 0 45 5 11.1 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0.590632479 0.590632479 1 0.883292616 0.883292616 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.00000323 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 209128696 G A - - - - - - 34 0 0 53 6 11.3 9 1 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 1.170717949 1.170717949 1 0.899207799 0.899207799 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.044110422 1 0.000000293 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 209520036 A C - - - - - - 39 0 0 70 4 5.7 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0.706649573 0.706649573 1 0.453582695 0.453582695 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.000440508 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 210377706 C T - - - - - - 42 0 0 50 7 14 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 1.107435897 1.107435897 1 1.11406276 1.11406276 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004039874 1 6.46E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 212663750 C G - - - - - - 30 0 0 58 5 8.6 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 0.684352838 0.684352838 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000115 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 213943319 T A - - - - - - 36 0 0 41 4 9.8 26 1 3.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0.400786325 0.400786325 1 0.779843932 0.779843932 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.122190858 1 0.0000546 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 215469116 C A - - - - - - 36 0 0 43 8 18.6 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 1.054700855 1.054700855 1 1.480111952 1.480111952 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.04888987 1 4.85E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 217643371 G T GPATCH2 CCDS1518.1 r.? - - intronic 34 0 0 60 7 11.7 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0.590632479 0.590632479 1 0.931038163 0.931038163 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 2.39E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 219398105 C G - - - - - - 37 0 0 47 7 14.9 18 2 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 1.170717949 1.170717949 1 1.18568108 1.18568108 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003626632 1 4.12E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 220335400 T C RAB3GAP2 CCDS31028.1 r.? - - intronic 37 0 0 62 6 9.7 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0.590632479 0.590632479 1 0.771886341 0.771886341 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.000000756 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 221039389 C G - - - - - - 39 0 0 46 5 10.9 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 1.054700855 1.054700855 1 0.867377434 0.867377434 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004473894 1 0.00000361 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 221219588 T C - - - - - - 37 0 0 49 6 12.2 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 0.970826119 0.970826119 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000182 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 223324336 A T - - - - - - 34 0 0 38 3 7.9 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 0.6286497 0.6286497 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000925091 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 226484308 T G LIN9 CCDS1553.1 r.? - - intronic 44 0 0 57 5 8.8 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 0.70026802 0.70026802 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 226759784 C G C1orf95 CCDS31044.1 r.? - - intronic 39 0 0 47 5 10.6 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0.590632479 0.590632479 1 0.843504661 0.843504661 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 227937314 C T SNAP47 CCDS1562.1 r.? - - intronic 44 0 0 53 5 9.4 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0.590632479 0.590632479 1 0.748013567 0.748013567 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 228380916 C G - - - - - - 27 0 0 38 3 7.9 14 3 21.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 2.257059829 2.257059829 1 0.6286497 0.6286497 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000437 1 0.000925091 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 231704498 G C TSNAX CCDS1596.1 r.? - - downstream 42 0 0 47 4 8.5 24 2 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0.875401709 0.875401709 1 0.676395247 0.676395247 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.006413403 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 234444488 T C SLC35F3 CCDS1600.1 r.? - - intronic 33 0 0 32 5 15.6 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0.875401709 0.875401709 1 1.241384218 1.241384218 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.000000562 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 234663049 T C - - - - - - 34 0 0 61 6 9.8 18 2 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 1.170717949 1.170717949 1 0.779843932 0.779843932 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003626632 1 0.000000685 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 234774574 G T - - - - - - 45 0 0 68 5 7.4 25 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 0.588861744 0.588861744 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000251 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 237025493 C T MTR CCDS1614.1 r.? - - intronic 40 0 0 50 5 10 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0.875401709 0.875401709 1 0.795759114 0.795759114 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 237524733 C T RYR2 ENST00000366574 r.? - - intronic 33 0 0 45 7 15.6 23 3 13 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 1.371111111 1.371111111 1 1.241384218 1.241384218 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.000205387 1 0.000000003 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 238823854 T C - - - - - - 51 0 0 52 5 9.6 25 1 4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0.421880342 0.421880342 1 0.763928749 0.763928749 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.117779757 1 0.00000668 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 239772476 C T - - - - - - 42 0 0 44 6 13.6 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 1.082232395 1.082232395 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 9.37E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 240412194 T A FMN2 CCDS31069.2 r.? - - intronic 25 0 0 57 5 8.8 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 2 0 0 TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 0.70026802 0.70026802 1 0 0 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 242199653 G T - - - - - - 44 0 0 56 8 14.3 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 1.508222222 1.508222222 1 1.137935533 1.137935533 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002185852 1 4.48E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 242266010 C T PLD5 CCDS1621.1 r.? - - intronic 36 0 0 53 5 9.4 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0.706649573 0.706649573 1 0.748013567 0.748013567 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 242270841 T G PLD5 CCDS1621.1 r.? - - intronic 33 0 0 45 5 11.1 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 0.883292616 0.883292616 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000323 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 28499917 T G CLN3 CCDS10632.1 r.648a>c c.289A>C p.T97P missense 25 0 0 53 5 9.4 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.585669782 0.585669782 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 243999056 A T AKT3 CCDS31077.1 r.? - - intronic 40 0 0 51 5 9.8 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 0.779843932 0.779843932 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000606 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 247570235 T G - - - - - - 27 0 0 49 8 16.3 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 1.402752137 1.402752137 1 1.297087356 1.297087356 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002513772 1 1.47E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 248355924 T G - - - - - - 39 0 0 60 4 6.7 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 0.533158606 0.533158606 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000243755 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 334464 T C DIP2C CCDS7054.1 r.? - - intronic 32 0 0 44 5 11.4 22 2 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.959777778 0.959777778 1 1.052280374 1.052280374 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.005403392 1 0.00000288 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 532791 C T DIP2C CCDS7054.1 r.? - - intronic 33 0 0 55 5 9.1 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 NA 0 0.839978193 0.839978193 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00000883 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 1263726 C T ADARB2 CCDS7058.1 r.? - - intronic 41 0 0 53 5 9.4 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.054700855 1.054700855 1 0.867669782 0.867669782 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004473894 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 3637123 C G - - - - - - 35 0 0 56 4 7.1 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.812119658 0.812119658 1 0.655367601 0.655367601 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.000186538 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 3865839 G T - - - - - - 35 0 0 64 4 6.2 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 NA 0 0.572292835 0.572292835 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000312605 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 4243268 C T - - - - - - 39 0 0 52 9 17.3 16 4 25 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.636752137 1.318376068 2 1.59688162 1.59688162 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.00000108 1 5.92E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 4969444 G C - - - - - - 42 0 0 63 8 12.7 33 2 6.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.643367521 0.643367521 1 1.172277259 1.172277259 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.011909843 1 1.18E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 6040163 C A IL2RA ENST00000397243 r.? - - downstream 22 0 0 46 7 15.2 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.812119658 0.812119658 1 1.403040498 1.403040498 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 3.53E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 7052803 G C - - - - - - 26 0 0 49 4 8.2 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.622273504 NA 0 0.756903427 0.756903427 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.081683532 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 7370263 A G SFMBT2 CCDS31138.1 r.? - - intronic 40 0 0 70 5 7.1 26 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 NA 0 0.655367601 0.655367601 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.0000289 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 7513652 A T - - - - - - 34 0 0 75 14 18.7 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.402752137 1.402752137 1 1.726109034 0.863054517 2 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002513772 1 2.57E-18 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 8037674 T A TAF3 CCDS41487.1 r.? - - intronic 27 0 0 68 5 7.4 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.50625641 NA 0 0.68305919 0.68305919 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.099912572 1 0.0000251 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 8672810 A T - - - - - - 27 0 0 46 4 8.7 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.558991453 NA 0 0.803056075 0.803056075 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.090843738 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 8954849 G T - - - - - - 37 0 0 47 5 10.6 22 5 22.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.39417094 1.19708547 2 0.978436137 0.978436137 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 7.67E-08 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 9047245 C A - - - - - - 38 0 0 67 5 7.5 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 NA 0 0.69228972 0.69228972 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.0000233 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 9491939 A G - - - - - - 42 0 0 73 7 9.6 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 NA 0 0.886130841 0.886130841 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 9.54E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 10563269 G T - - - - - - 43 0 0 52 6 11.5 19 5 26.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.773863248 1.386931624 2 1.061510903 1.061510903 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 3.43E-08 1 0.000000261 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 10841411 C T - - - - - - 31 0 0 52 7 13.5 23 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 NA 0 1.246121495 1.246121495 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 8.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 11887372 T A C10orf47 CCDS7085.1 r.? - - intronic 32 0 0 44 5 11.4 8 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 NA 0 1.052280374 1.052280374 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00000288 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 14650633 C T FAM107B CCDS7102.1 r.? - - intronic 52 0 0 36 8 22.2 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 1.76794949 1.76794949 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 1.04E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 15948701 A C - - - - - - 28 0 0 46 3 6.5 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.558991453 0.558991453 1 0.517642869 0.517642869 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.001615827 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 16305552 C G - - - - - - 38 0 0 49 5 10.2 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.812301117 0.812301117 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 16351796 G C - - - - - - 39 0 0 64 5 7.8 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.622273504 0.622273504 1 0.621171442 0.621171442 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.0000186 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 16732807 T A RSU1 CCDS7112.1 r.? - - intronic 39 0 0 61 4 6.6 13 1 7.7 0 0 NA 1 0 0 1 0 0 TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.812119658 0.812119658 1 0.525606605 0.525606605 1 0 0 1 0 NA 0 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.000259828 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 17363892 C T ST8SIA6 CCDS31158.1 r.? - - intronic 34 0 0 58 6 10.3 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.820264853 0.820264853 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000506 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 17521197 T A - - - - - - 37 0 0 55 4 7.3 24 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.58135276 0.58135276 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000173903 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 19615128 G C C10orf112 ENST00000377266 r.? - - intronic 50 0 0 48 5 10.4 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 1.402752137 1.402752137 1 0.82822859 0.82822859 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002513772 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 21957609 G A MLLT10 CCDS7135.1 r.? - - intronic 43 0 0 56 8 14.3 20 3 15 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 1.582051282 1.582051282 1 1.138814311 1.138814311 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.0001337 1 4.48E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 22596304 G T ENSG00000224369 ENST00000412505 r.? - - intronic 30 0 0 50 4 8 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.637098915 0.637098915 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000119787 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 25583813 G C GPR158 CCDS31166.1 r.? - - intronic 40 0 0 64 4 6.2 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.493751659 0.493751659 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000312605 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 29023401 T A - - - - - - 18 0 0 50 5 10 13 2 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 1.624239316 1.624239316 1 0.796373644 0.796373644 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.001879825 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 31082520 C G - - - - - - 28 0 0 54 6 11.1 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.883974745 0.883974745 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000329 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 32421743 G A - - - - - - 30 0 0 59 8 13.6 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 1.508222222 1.508222222 1 1.083068156 1.083068156 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002185852 1 6.9E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 33225508 G C ITGB1 CCDS31178.1 r.? - - intronic 42 0 0 48 5 10.4 24 1 4.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.442974359 0.442974359 1 0.82822859 0.82822859 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.113346489 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 35554961 A G CCNY CCDS7190.1 r.? - - intronic 42 0 0 59 7 11.9 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.527350427 0.527350427 1 0.947684636 0.947684636 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.09538952 1 2.12E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 36543754 T A - - - - - - 45 0 0 60 5 8.3 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.660990125 0.660990125 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000136 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 39117895 G A - - - - - - 32 1 3.1 37 9 24.3 12 4 33.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 3.512153846 1.756076923 2 1.935187955 0.967593977 2 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 0.14819814 1 0.0000003 1 2.14E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 42790549 G A - - - - - - 40 0 0 50 6 12 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.955648373 0.955648373 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000206 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 45154733 T G - - - - - - 37 0 0 40 3 7.5 24 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.597280233 0.597280233 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.001075403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 45674763 C A - - - - - - 38 0 0 54 7 13 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.748837607 0.748837607 1 1.035285737 1.035285737 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.067769881 1 1.13E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 48489924 T G - - - - - - 35 0 0 38 6 15.8 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 1.258270358 1.258270358 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 3.76E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 49727092 C G ARHGAP22 CCDS7227.1 r.? - - intronic 26 0 0 42 6 14.3 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 1.138814311 1.138814311 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 7.02E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 50416267 C T - - - - - - 33 0 0 61 5 8.2 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.653026388 0.653026388 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000147 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 54301451 T G - - - - - - 40 0 0 48 4 8.3 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.660990125 0.660990125 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000102016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 55758118 A G PCDH15 CCDS44404.1 r.? - - intronic 44 0 0 53 7 13.2 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 1.05121321 1.05121321 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 9.85E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 56572280 G A PCDH15 ENST00000373957 r.? - - intronic 46 0 0 48 6 12.5 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.995467055 0.995467055 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 57028824 G C PCDH15 ENST00000373957 r.? - - intronic 41 0 0 54 5 9.3 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.558991453 0.558991453 1 0.740627489 0.740627489 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.00000806 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 61434052 C G SLC16A9 CCDS7256.1 r.? - - intronic 37 0 0 64 6 9.4 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.748591225 0.748591225 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000914 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 64082929 C A - - - - - - 34 0 0 57 5 8.8 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.700808807 0.700808807 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 65329217 C A REEP3 CCDS44411.1 r.? - - intronic 28 0 0 45 5 11.1 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.812119658 0.812119658 1 0.883974745 0.883974745 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.00000323 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 66343688 C A - - - - - - 43 0 0 57 4 7 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.557461551 0.557461551 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000199821 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 66798792 G C - - - - - - 46 0 0 62 4 6.5 22 2 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.959777778 0.959777778 1 0.517642869 0.517642869 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.005403392 1 0.000276647 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 67991533 A G CTNNA3 CCDS7269.1 r.? - - intronic 37 0 0 54 6 11.1 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.706649573 0.706649573 1 0.883974745 0.883974745 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.000000329 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 75445897 T G AGAP5 CCDS44439.1 r.? - - intronic 35 0 0 54 9 16.7 9 1 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 1.170717949 1.170717949 1 1.329943986 1.329943986 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.044110422 1 8.48E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 75651629 C T - - - - - - 34 0 0 39 5 12.8 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.706649573 0.706649573 1 1.019358264 1.019358264 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.00000156 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 78508082 T C - - - - - - 50 0 0 57 7 12.3 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.979539582 0.979539582 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 1.66E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 78794082 A G KCNMA1 CCDS7352.1 r.? - - intronic 42 0 0 47 4 8.5 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.590632479 0.590632479 1 0.676917597 0.676917597 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 81899103 T C PLAC9 CCDS31232.1 r.? - - intronic 29 0 0 54 4 7.4 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 1.054700855 1.054700855 1 0.589316497 0.589316497 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.04888987 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 82375315 G C SH2D4B CCDS7370.1 r.? - - intronic 37 0 0 71 6 8.5 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.676917597 0.676917597 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000169 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 85367858 C T - - - - - - 35 0 0 44 4 9.1 22 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.724700016 0.724700016 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000723 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 86527435 C T - - - - - - 23 0 0 47 5 10.6 26 2 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.812119658 0.812119658 1 0.844156063 0.844156063 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.007502227 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 86673159 C A - - - - - - 38 0 0 49 4 8.2 17 4 23.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 2.478547009 2.478547009 1 0.653026388 0.653026388 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.00000141 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 86830620 A C - - - - - - 45 0 0 60 5 8.3 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.660990125 0.660990125 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000136 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 87141123 A G - - - - - - 37 0 0 42 6 14.3 25 3 12 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 1.265641026 1.265641026 1 1.138814311 1.138814311 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.00026475 1 7.02E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 88265590 G C WAPAL CCDS7375.1 r.? - - intronic 36 0 0 62 7 11.3 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.899902218 0.899902218 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 3.02E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 91333810 C G - - - - - - 36 0 0 38 4 10.5 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.836192326 0.836192326 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 95680817 C G - - - - - - 38 0 0 54 5 9.3 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.740627489 0.740627489 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000806 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 97307149 C A SORBS1 CCDS31255.1 r.? - - intronic 38 0 0 53 4 7.5 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.959777778 0.959777778 1 0.597280233 0.597280233 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.05364542 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 98899236 G C SLIT1 CCDS7453.1 r.? - - intronic 41 0 0 44 5 11.4 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.558991453 0.558991453 1 0.907865954 0.907865954 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.00000288 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 101970066 G A CHUK CCDS7488.1 r.? - - intronic 32 0 0 33 4 12.1 8 1 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 1.318376068 1.318376068 1 0.963612109 0.963612109 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.039306956 1 0.0000228 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 103375824 T C FBXW4 CCDS31271.1 r.? - - intronic 42 0 0 59 5 8.5 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.590632479 0.590632479 1 0.676917597 0.676917597 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.0000125 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 104281770 T G SUFU CCDS7537.1 r.? - - intronic 36 0 0 57 6 10.5 21 4 19 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 2.003931624 2.003931624 1 0.836192326 0.836192326 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.00000349 1 0.000000456 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 104932274 G C NT5C2 CCDS7544.1 r.? - - intronic 30 0 0 49 4 8.2 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.653026388 0.653026388 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 105438080 G C SH3PXD2A CCDS31278.1 r.? - - intronic 34 0 0 37 4 10.8 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 1.402752137 1.402752137 1 0.860083536 0.860083536 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002513772 1 0.0000362 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 106102205 T G ITPRIP CCDS7557.1 r.? - - upstream 33 0 0 62 5 8.1 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.645062652 0.645062652 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 107212374 T A - - - - - - 44 0 0 54 6 11.1 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.622273504 0.622273504 1 0.883974745 0.883974745 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.000000329 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 107235385 G T - - - - - - 41 0 0 61 4 6.6 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.525606605 0.525606605 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000259828 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 108121238 A G - - - - - - 36 0 0 50 4 8 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.637098915 0.637098915 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000119787 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 108705837 C T SORCS1 CCDS7559.1 r.? - - intronic 43 0 0 55 6 10.9 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.868047272 0.868047272 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 108747653 A G SORCS1 CCDS7559.1 r.? - - intronic 47 0 0 54 11 20.4 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.706649573 0.706649573 1 1.624602234 1.624602234 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 3.84E-15 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 109921637 A T - - - - - - 38 0 0 55 6 10.9 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.868047272 0.868047272 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 110652671 G C - - - - - - 25 0 0 47 5 10.6 24 1 4.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.442974359 0.442974359 1 0.844156063 0.844156063 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.113346489 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 111094810 C T - - - - - - 46 0 0 53 5 9.4 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.748591225 0.748591225 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 113226380 C G - - - - - - 33 0 0 45 4 8.9 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.622273504 0.622273504 1 0.708772543 0.708772543 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.0000791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 113324914 G C - - - - - - 31 0 0 48 6 12.5 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.995467055 0.995467055 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 116433730 T C ABLIM1 CCDS31288.1 r.? - - intronic 34 0 0 57 4 7 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 1.107435897 1.107435897 1 0.557461551 0.557461551 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.000199821 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 118040780 G T - - - - - - 44 0 0 43 5 11.6 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.923793427 0.923793427 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000257 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 119015723 A T SLC18A2 CCDS7599.1 r.? - - intronic 42 0 0 60 5 8.3 21 2 9.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 1.001965812 1.001965812 1 0.660990125 0.660990125 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004928472 1 0.0000136 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 119530580 A G - - - - - - 33 0 0 53 4 7.5 31 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.597280233 0.597280233 1 NA NA 1 NA NA 0 1 NA 1 1 1 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 120162683 G A - - - - - - 35 0 0 58 5 8.6 20 3 15 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 1.582051282 1.582051282 1 0.684881334 0.684881334 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0001337 1 0.0000115 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 122335242 C A PPAPDC1A CCDS41573.1 r.? - - intronic 38 0 0 53 4 7.5 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.527350427 0.527350427 1 0.597280233 0.597280233 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 122925622 C T - - - - - - 43 0 0 53 6 11.3 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.622273504 0.622273504 1 0.899902218 0.899902218 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.000000293 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 124241530 C T HTRA1 CCDS7630.1 r.? - - intronic 41 0 0 55 5 9.1 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.724700016 0.724700016 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000883 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 129805820 C A PTPRE CCDS7657.1 r.? - - intronic 38 0 0 58 4 6.9 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 1.402752137 1.402752137 1 0.549497814 0.549497814 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002513772 1 0.000213772 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 129805821 C A PTPRE CCDS7657.1 r.? - - intronic 38 0 0 57 4 7 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 1.402752137 1.402752137 1 0.557461551 0.557461551 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002513772 1 0.000199821 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 132104442 C G - - - - - - 31 0 0 65 10 15.4 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 2 2 100 TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 1.054700855 1.054700855 1 1.226415412 1.226415412 1 10.54700855 5.273504274 2 NA NA 0 2 NA 1 1 0.04888987 0.000025 1.36E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 132353789 T A - - - - - - 38 0 0 54 6 11.1 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.883974745 0.883974745 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000329 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 134532047 G T INPP5A CCDS7669.2 r.? - - intronic 29 0 0 49 5 10.2 24 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 0.812301117 0.812301117 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 449666 C G PTDSS2 CCDS7696.1 r.? - - upstream 34 0 0 37 3 8.1 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.585672897 0.585672897 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000855237 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 2092717 C T - - - - - - 29 0 0 67 15 22.4 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.534632479 0.534632479 1 1.619638629 0.809819315 2 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 8.27E-21 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 8873002 T C ST5 CCDS7791.1 r.? - - intronic 46 0 0 45 7 15.6 22 2 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.868777778 0.868777778 1 1.127962617 1.127962617 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.005403392 1 0.000000003 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 9338730 C T TMEM41B CCDS31424.1 r.? - - upstream 28 0 0 43 5 11.6 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.002435897 1.002435897 1 0.838741433 0.838741433 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.00000257 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 9376651 G C - - - - - - 29 0 0 38 5 13.2 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.792401709 0.792401709 1 0.954429907 0.954429907 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.00000137 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 9668973 C A - - - - - - 22 0 0 47 5 10.6 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.677837607 0.677837607 1 0.766436137 0.766436137 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 10511409 G T AMPD3 CCDS44537.1 r.? - - intronic 39 0 0 34 5 14.7 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.954700855 0.954700855 1 1.06288785 1.06288785 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.04888987 1 0.000000771 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 10909907 C G AC069360.2 ENST00000503469 r.? - - intronic 35 0 0 42 6 14.3 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.868777778 0.868777778 1 1.033965732 1.033965732 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.05364542 1 7.02E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 13320206 G T ARNTL CCDS31430.1 r.? - - intronic 30 0 0 48 9 18.8 25 2 8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.763760684 0.763760684 1 1.359339564 1.359339564 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.006948068 1 2.75E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 13654618 G T - - - - - - 34 0 0 72 9 12.5 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.903816199 0.903816199 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 1.25E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 13867984 C T - - - - - - 26 0 0 36 12 33.3 6 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 2.407766355 1.203883178 2 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 2.73E-19 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 16856403 A C PLEKHA7 CCDS31434.1 r.? - - intronic 39 0 0 52 9 17.3 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.59191453 0.59191453 1 1.25088162 1.25088162 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 5.92E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 20206384 C T - - - - - - 35 0 0 50 6 12 12 3 25 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.386752137 2.386752137 1 0.867663551 0.867663551 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0000266 1 0.000000206 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 21281835 A G NELL1 CCDS7855.1 r.? - - intronic 32 0 0 68 6 8.8 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.636286604 0.636286604 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000131 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 21853739 A T - - - - - - 32 0 0 67 10 14.9 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.07734891 1.07734891 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 1.87E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 22336171 T G - - - - - - 35 0 0 61 4 6.6 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.505991453 0.505991453 1 0.477214953 0.477214953 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.000259828 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 23975607 G T - - - - - - 48 0 0 53 5 9.4 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.679669782 0.679669782 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 26093007 C T - - - - - - 37 0 0 45 6 13.3 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.269752137 1.269752137 1 0.961660436 0.961660436 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002513772 1 0.000000108 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 29125363 T C - - - - - - 45 0 0 52 8 15.4 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.126547009 1.126547009 1 1.113501558 1.113501558 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.003234386 1 2.42E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 29505607 T A - - - - - - 40 0 0 40 3 7.5 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.54228972 0.54228972 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.001075403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 29999742 T A - - - - - - 35 0 0 53 9 17 20 3 15 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.432051282 1.432051282 1 1.229190031 1.229190031 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.0001337 1 7.1E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 30054317 T C - - - - - - 58 0 0 46 12 26.1 27 5 18.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.766196581 1.766196581 1 1.887168224 0.943584112 2 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.00000023 1 8.12E-18 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 31603310 T C ELP4 CCDS7875.2 r.? - - intronic 35 0 0 41 7 17.1 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.735119658 0.735119658 1 1.236420561 1.236420561 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 1.51E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 32696517 C T CCDC73 CCDS41630.1 r.? - - intronic 18 0 0 53 8 15.1 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.091809969 1.091809969 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 2.83E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 37099806 G C - - - - - - 49 0 0 53 4 7.5 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.54228972 0.54228972 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 37778009 G T - - - - - - 44 0 0 45 6 13.3 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.961660436 0.961660436 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000108 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 37785468 A T - - - - - - 48 0 0 50 5 10 16 1 6.2 0 0 NA 2 0 0 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.59191453 0.59191453 1 0.72305296 0.72305296 1 NA NA 1 0 0 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 40472658 A T - - - - - - 36 0 0 55 8 14.5 16 3 18.8 0 0 NA 1 0 0 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.794837607 1.794837607 1 1.048426791 1.048426791 1 NA NA 1 0 0 1 3 NA 1 1 0.0000667 1 3.86E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 40483873 T C - - - - - - 46 0 0 51 10 19.6 19 3 15.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.50842735 1.50842735 1 1.417183801 1.417183801 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.000114071 1 1.04E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 40647552 A G - - - - - - 41 0 0 42 12 28.6 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.639649573 0.639649573 1 2.067931464 1.033965732 2 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.072431031 1 2.35E-18 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 41433077 G C - - - - - - 37 0 0 51 7 13.7 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.639649573 0.639649573 1 0.990582555 0.990582555 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.072431031 1 7.46E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 42677445 C T - - - - - - 46 0 0 53 5 9.4 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.868777778 0.868777778 1 0.679669782 0.679669782 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.05364542 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 42756389 T G - - - - - - 37 0 0 52 3 5.8 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.419370717 0.419370717 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.002300591 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 42836805 T A - - - - - - 38 0 0 41 5 12.2 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.563273504 0.563273504 1 0.882124611 0.882124611 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.00000202 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 44122952 C A EXT2 CCDS7908.1 r.? - - intronic 36 0 0 53 5 9.4 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.679669782 0.679669782 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 44675281 C G - - - - - - 27 0 0 51 5 9.8 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.563273504 0.563273504 1 0.7085919 0.7085919 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.00000606 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 48088521 G A PTPRJ CCDS7945.1 r.? - - intronic 43 0 0 48 6 12.5 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.563273504 0.563273504 1 0.903816199 0.903816199 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.00000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 48645095 T C - - - - - - 40 0 0 45 11 24.4 13 3 23.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.205358974 2.205358974 1 1.764249221 0.882124611 2 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0000344 1 4.24E-16 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 51272624 C A - - - - - - 36 0 0 62 8 12.9 27 3 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.059717949 1.059717949 1 0.932738318 0.932738318 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000334187 1 1.04E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 55202405 T C - - - - - - 33 0 0 40 7 17.5 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.59191453 0.59191453 1 1.265342679 1.265342679 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 1.26E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 55333988 C T - - - - - - 38 0 0 53 6 11.3 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.954700855 0.954700855 1 0.817049844 0.817049844 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004473894 1 0.000000293 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 56884891 T C - - - - - - 41 0 0 52 4 7.7 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.563273504 0.563273504 1 0.556750779 0.556750779 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.000139698 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 57316933 A G SMTNL1 CCDS44599.1 r.? - - intronic 47 0 0 64 4 6.2 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.448292835 0.448292835 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000312605 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 58143465 A C - - - - - - 32 0 0 47 5 10.6 22 1 4.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.429615385 0.429615385 1 0.766436137 0.766436137 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.104413009 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 59061754 G C - - - - - - 39 0 0 47 4 8.5 27 1 3.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.353239316 0.353239316 1 0.614595016 0.614595016 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.126579904 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 62739207 G T SLC22A6 CCDS31591.1 r.? - - downstream 36 0 0 41 6 14.6 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.677837607 0.677837607 1 1.055657321 1.055657321 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.067769881 1 6.05E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 64747628 G T - - - - - - 27 0 0 41 6 14.6 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.055657321 1.055657321 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 6.05E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 64779089 C A SNX15 CCDS8089.1 r.? - - upstream 37 0 0 48 5 10.4 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.751975078 0.751975078 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 68165822 G T LRP5 CCDS8181.1 r.? - - intronic 33 0 0 32 4 12.5 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.903816199 0.903816199 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000201 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 69570352 C A - - - - - - 23 0 0 43 5 11.6 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.677837607 0.677837607 1 0.838741433 0.838741433 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.00000257 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 69570353 C A - - - - - - 24 0 0 45 6 13.3 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.639649573 0.639649573 1 0.961660436 0.961660436 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.000000108 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 70400242 C A SHANK2 ENST00000338508 r.? - - intronic 29 0 0 46 11 23.9 15 3 20 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.765313964 2 2 1 1 1 0.234686036 NA 3 NA 1 NA 0.765313964 1.909401709 1.909401709 1 1.911006611 0.955503305 2 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.0000544 1 5.55E-16 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 73839640 G T C2CD3 CCDS31636.1 r.? - - intronic 40 0 0 66 11 16.7 9 2 22.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.765313964 2 2 1 1 1 0.234686036 NA 3 NA 1 NA 0.765313964 2.119435897 2.119435897 1 1.335305874 1.335305874 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.000879235 1 4.07E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 75027804 T A ARRB1 CCDS44684.1 r.? - - intronic 44 0 0 61 5 8.2 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.765313964 2 2 1 1 1 0.234686036 NA 3 NA 1 NA 0.765313964 0 0 1 0.655659172 0.655659172 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000147 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 76041530 T C - - - - - - 43 0 0 62 11 17.7 17 4 23.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.765313964 2 2 1 1 1 0.234686036 NA 3 NA 1 NA 0.765313964 2.243547009 2.243547009 1 1.41526431 1.41526431 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.00000141 1 1.96E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 78972257 G T ODZ4 CCDS44688.1 r.? - - intronic 43 0 0 54 12 22.2 20 5 25 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.386752137 1.193376068 2 1.60517757 1.60517757 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 4.55E-08 1 6.9E-17 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 79029663 C G ODZ4 CCDS44688.1 r.? - - intronic 44 0 0 52 6 11.5 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.831510903 0.831510903 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000261 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 79220520 A T - - - - - - 35 0 0 58 9 15.5 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.120732087 1.120732087 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 1.67E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 80173827 G T - - - - - - 42 0 0 42 6 14.3 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.45825641 0.45825641 1 1.033965732 1.033965732 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.099912572 1 7.02E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 80742614 A G - - - - - - 41 0 0 56 5 8.9 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.59191453 0.59191453 1 0.643517134 0.643517134 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.00000965 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 81447574 G C - - - - - - 38 0 0 48 8 16.7 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.563273504 0.563273504 1 1.207498442 1.207498442 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 1.23E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 83072506 A C - - - - - - 22 0 0 39 7 17.9 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.294264798 1.294264798 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 1.04E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 83393159 C G DLG2 CCDS41696.1 r.? - - intronic 31 0 0 50 8 16 16 3 18.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.794837607 1.794837607 1 1.156884735 1.156884735 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.0000667 1 1.74E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 85126914 T C DLG2 CCDS44690.1 r.? - - intronic 42 0 0 60 8 13.3 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.002435897 1.002435897 1 0.961660436 0.961660436 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 7.93E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 85586103 G A CCDC83 CCDS8271.1 r.? - - intronic 38 0 0 55 7 12.7 13 3 23.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.205358974 2.205358974 1 0.918277259 0.918277259 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.0000344 1 1.28E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 87177368 C G - - - - - - 22 0 0 39 9 23.1 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.792401709 0.792401709 1 1.670252336 1.670252336 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 3.62E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 87290321 T G - - - - - - 46 0 0 48 10 20.8 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.677837607 0.677837607 1 1.503950156 1.503950156 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.067769881 1 5.37E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 87357843 C T - - - - - - 31 0 0 60 5 8.3 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.563273504 0.563273504 1 0.600133956 0.600133956 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.0000136 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 89180519 C G NOX4 CCDS8285.1 r.? - - intronic 43 0 0 63 8 12.7 13 3 23.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.205358974 2.205358974 1 0.918277259 0.918277259 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.0000344 1 1.18E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 90403499 T C - - - - - - 39 0 0 60 6 10 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.269752137 1.269752137 1 0.72305296 0.72305296 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002513772 1 0.000000621 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 90599641 A G MIR1261 ENST00000408659 r.? - - downstream 35 0 0 55 7 12.7 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.954700855 0.954700855 1 0.918277259 0.918277259 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004473894 1 1.28E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 91326956 A C - - - - - - 48 0 0 60 4 6.7 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 2 0 0 TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.735119658 0.735119658 1 0.484445483 0.484445483 1 0 0 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.000243755 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 92580705 C A FAT3 CCDS44706.1 r.? - - intronic 30 0 0 51 8 15.7 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.59191453 0.59191453 1 1.135193146 1.135193146 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 2.05E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 93087893 C T CCDC67 CCDS44707.1 r.? - - intronic 36 0 0 53 6 11.3 22 1 4.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.429615385 0.429615385 1 0.817049844 0.817049844 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.104413009 1 0.000000293 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 93524901 C G MED17 CCDS8295.1 r.? - - intronic 33 0 0 59 12 20.3 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.193376068 1.193376068 1 1.467797508 1.467797508 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.002863359 1 2.2E-16 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 96791252 T C - - - - - - 35 0 0 40 4 10 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.72305296 0.72305296 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000495 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 97343506 A T - - - - - - 30 0 0 59 4 6.8 25 0 0 0 0 NA 0 0 NA 2 0 0 TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.491676012 0.491676012 1 0 0 1 NA NA 1 1 NA 1 1 1 1 0.00022841 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 98102682 A C - - - - - - 29 0 0 59 4 6.8 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.534632479 0.534632479 1 0.491676012 0.491676012 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.00022841 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 101015892 A G - - - - - - 35 0 0 49 7 14.3 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.534632479 0.534632479 1 1.033965732 1.033965732 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 5.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 101526536 A T - - - - - - 38 0 0 53 4 7.5 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.002435897 1.002435897 1 0.54228972 0.54228972 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 103647014 G C - - - - - - 29 0 0 47 11 23.4 13 2 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.470239316 1.470239316 1 1.691943925 0.845971963 2 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001879825 1 7.21E-16 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 105765184 A T GRIA4 CCDS41706.1 r.? - - intronic 35 0 0 50 6 12 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.269752137 1.269752137 1 0.867663551 0.867663551 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002513772 1 0.000000206 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 108754529 C G DDX10 CCDS8342.1 r.? - - intronic 31 0 0 64 6 9.4 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.505991453 0.505991453 1 0.679669782 0.679669782 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.000000914 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 109851347 G A - - - - - - 42 0 0 58 9 15.5 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.954700855 0.954700855 1 1.120732087 1.120732087 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.04888987 1 1.67E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 110982172 A T - - - - - - 33 0 0 43 5 11.6 22 4 18.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.737555556 1.737555556 1 0.838741433 0.838741433 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.00000425 1 0.00000257 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 111152405 T G C11orf53 CCDS31674.1 r.? - - intronic 45 0 0 46 4 8.7 24 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.629056075 0.629056075 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 111570644 G C SIK2 CCDS8347.1 r.? - - intronic 28 0 0 56 4 7.1 18 4 22.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.119435897 2.119435897 1 0.513367601 0.513367601 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.00000181 1 0.000186538 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 112335604 C T - - - - - - 26 0 0 49 7 14.3 13 2 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.470239316 1.470239316 1 1.033965732 1.033965732 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001879825 1 5.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 112976629 C G ENSG00000223456 ENST00000423957 r.? - - intronic 37 0 0 57 6 10.5 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.792401709 0.792401709 1 0.759205607 0.759205607 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.000000456 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 113980302 C G ZBTB16 CCDS8367.1 r.? - - intronic 38 0 0 61 5 8.2 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.592903427 0.592903427 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000147 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 114179522 C G NNMT CCDS8368.1 r.? - - intronic 42 0 0 48 4 8.3 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.59191453 0.59191453 1 0.600133956 0.600133956 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.000102016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 114953298 T C - - - - - - 24 0 0 56 11 19.6 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.563273504 0.563273504 1 1.417183801 1.417183801 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 5.91E-15 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 118274220 A T UBE4A CCDS8396.1 r.? - - downstream 39 0 0 51 9 17.6 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.477350427 0.477350427 1 1.272573209 1.272573209 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.09538952 1 4.92E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 121061392 A G TECTA CCDS8434.1 r.? - - intronic 26 0 0 48 5 10.4 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.751975078 0.751975078 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 121671920 A C - - - - - - 25 0 0 45 6 13.3 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.961660436 0.961660436 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000108 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 121725366 A G - - - - - - 29 0 0 46 5 10.9 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.563273504 0.563273504 1 0.788127726 0.788127726 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.00000361 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 122126744 C T - - - - - - 41 0 0 48 8 16.7 17 1 5.9 0 0 NA 1 0 0 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.563273504 0.563273504 1 1.207498442 1.207498442 1 NA NA 1 0 0 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 1.23E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 123057289 G C ENSG00000166250 CCDS8441.1 r.? - - intronic 36 0 0 40 9 22.5 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.365222222 1.365222222 1 1.626869159 1.626869159 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.002185852 1 4.64E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 124421473 C A - - - - - - 48 0 0 45 5 11.1 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.477350427 0.477350427 1 0.802588785 0.802588785 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.00000323 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 125611506 A G PATE1 CCDS8464.1 r.? - - upstream 38 0 0 50 5 10 19 4 21.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.014418803 2.014418803 1 0.72305296 0.72305296 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.00000228 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 126007891 G T - - - - - - 40 0 0 52 8 15.4 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.792401709 0.792401709 1 1.113501558 1.113501558 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 2.42E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 126308596 C T KIRREL3 ENST00000278934 r.? - - intronic 33 0 0 50 6 12 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.269752137 1.269752137 1 0.867663551 0.867663551 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002513772 1 0.000000206 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 127390748 G A - - - - - - 33 0 0 44 8 18.2 13 2 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.470239316 1.470239316 1 1.315956386 1.315956386 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001879825 1 5.9E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 127849801 T C - - - - - - 46 0 0 47 7 14.9 22 1 4.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.429615385 0.429615385 1 1.07734891 1.07734891 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.104413009 1 4.12E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 128184344 T A - - - - - - 37 0 0 60 12 20 14 4 28.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.730444444 1.365222222 2 1.446105919 1.446105919 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.000000601 1 2.74E-16 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 128340486 G C ETS1 CCDS8475.1 r.? - - intronic 30 0 0 65 4 6.2 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.505991453 0.505991453 1 0.448292835 0.448292835 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.000331785 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 130418464 T C - - - - - - 37 0 0 54 6 11.1 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.802588785 0.802588785 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000329 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 131714103 G A OPCML CCDS41733.1 r.? - - intronic 41 0 0 55 7 12.7 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.918277259 0.918277259 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 1.28E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 133481319 G T - - - - - - 32 0 0 54 6 11.1 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.802588785 0.802588785 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000329 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 2656089 T C CACNA1C CCDS44794.1 r.? - - intronic 40 0 0 58 4 6.9 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 0 0 1 0.441656491 0.441656491 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000213772 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 3158027 C G - - - - - - 35 0 0 47 5 10.6 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 0.427350427 0.427350427 1 0.678486783 0.678486783 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 3333461 G A TSPAN9 CCDS8520.1 r.? - - intronic 29 0 0 44 4 9.1 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 0 0 1 0.582474502 0.582474502 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000723 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 3481580 G A - - - - - - 34 0 0 70 5 7.1 24 1 4.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 0.358974359 0.358974359 1 0.454458128 0.454458128 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.113346489 1 0.0000289 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 4801026 C G NDUFA9 CCDS8532.1 r.? - - downstream 41 0 0 45 5 11.1 17 3 17.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 1.504273504 1.504273504 1 0.710490876 0.710490876 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0000807 1 0.00000323 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 5510047 A T - - - - - - 38 0 0 66 5 7.6 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 1.068376068 1.068376068 1 0.486462222 0.486462222 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.0000217 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 5535313 A G - - - - - - 30 0 0 59 5 8.5 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 0.504273504 0.504273504 1 0.54406959 0.54406959 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.0000125 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 5784364 C T ANO2 CCDS44807.1 r.? - - intronic 38 0 0 61 5 8.2 21 3 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 1.222222222 1.222222222 1 0.524867134 0.524867134 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000155401 1 0.0000147 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 11240082 C A TAS2R43 ENST00000422992 r.? - - intronic 41 0 0 46 4 8.7 21 2 9.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 0.811965812 0.811965812 1 0.556871227 0.556871227 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004928472 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 19210110 T C - - - - - - 36 0 0 46 5 10.9 20 3 15 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 1.282051282 1.282051282 1 0.697689239 0.697689239 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0001337 1 0.00000361 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 19960920 G C - - - - - - 39 0 0 50 5 10 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 0 0 1 0.640081871 0.640081871 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 22876109 A T - - - - - - 41 0 0 49 4 8.2 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 0.658119658 0.658119658 1 0.524867134 0.524867134 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 23731665 C T SOX5 CCDS8699.1 r.? - - intronic 31 0 0 57 5 8.8 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 0 0 1 0.563272046 0.563272046 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 24586049 T C - - - - - - 46 0 0 64 5 7.8 8 1 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 1.068376068 1.068376068 1 0.499263859 0.499263859 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.039306956 1 0.0000186 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 24826800 C A - - - - - - 33 0 0 42 7 16.7 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 0.452991453 0.452991453 1 1.068936724 1.068936724 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.090843738 1 1.81E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 30433108 C T - - - - - - 60 0 0 56 5 8.9 21 3 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 1.222222222 1.222222222 1 0.569672865 0.569672865 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000155401 1 0.00000965 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 33210719 T C - - - - - - 39 0 0 46 5 10.9 23 1 4.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 0.367521368 0.367521368 1 0.697689239 0.697689239 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.108890944 1 0.00000361 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 38651618 A T - - - - - - 29 0 0 37 3 8.1 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 0 0 1 0.518466315 0.518466315 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000855237 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 43367266 A G - - - - - - 28 0 0 44 4 9.1 27 3 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 0.948717949 0.948717949 1 0.582474502 0.582474502 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000334187 1 0.0000723 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 44296832 A G TMEM117 CCDS8745.1 r.? - - intronic 39 0 0 54 4 7.4 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 0.709401709 0.709401709 1 0.473660584 0.473660584 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 46377967 T A SFRS2IP CCDS8748.2 r.? - - intronic 35 0 0 60 4 6.7 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 0.572649573 0.572649573 1 0.428854853 0.428854853 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.000243755 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 50588381 C G LIMA1 CCDS44877.1 r.? - - intronic 29 0 0 42 4 9.5 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 0.504273504 0.504273504 1 0.608077777 0.608077777 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.0000601 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 52597176 C G AC068987.1 ENST00000513193 r.? - - intronic 42 0 0 49 4 8.2 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 0.52991453 0.52991453 1 0.524867134 0.524867134 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 69368844 C A COG8 CCDS10876.1 r.1051g>u c.993G>T p.E331D missense 36 0 0 30 5 16.7 14 1 7.1 64 0 0 59 6 10.2 68 4 5.9 TRUE TRUE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.606837607 0.606837607 1 1.040498442 1.040498442 1 0.504273504 0.504273504 1 0.635514019 0.635514019 1 2 2 1 1 0.067769881 0.000394372 0.000000401 0.000000561 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 12 57819993 A T R3HDM2 CCDS8937.2 r.? - - intronic 33 0 0 46 3 6.5 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.478632479 0.478632479 1 0.404984424 0.404984424 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.001615827 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 61839007 A T - - - - - - 34 0 0 50 4 8 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.777777778 0.777777778 1 0.498442368 0.498442368 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.05364542 1 0.000119787 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 67919649 C G - - - - - - 28 0 0 38 4 10.5 9 1 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.948717949 0.948717949 1 0.654205607 0.654205607 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.044110422 1 0.0000403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 69933873 A T FRS2 CCDS41809.1 r.? - - intronic 27 0 0 42 7 16.7 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.504273504 0.504273504 1 1.040498442 1.040498442 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 1.81E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 72510786 G T - - - - - - 52 0 0 42 5 11.9 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.709401709 0.709401709 1 0.741433022 0.741433022 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.00000228 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 73217951 C G - - - - - - 28 0 0 47 4 8.5 22 1 4.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.384615385 0.384615385 1 0.529595016 0.529595016 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.104413009 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 75049234 G A - - - - - - 59 0 0 53 5 9.4 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.606837607 0.606837607 1 0.585669782 0.585669782 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 75879830 T A GLIPR1 CCDS9011.1 r.? - - intronic 45 0 0 42 3 7.1 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.442367601 0.442367601 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.001240292 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 76694654 C G - - - - - - 41 0 0 41 5 12.2 7 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.760124611 0.760124611 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000202 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 85073871 C G - - - - - - 40 0 0 52 4 7.7 8 1 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.068376068 1.068376068 1 0.479750779 0.479750779 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.039306956 1 0.000139698 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 88887069 G T KITLG CCDS31868.1 r.4932c>a c.? p.? 3'UTR variant 36 0 0 67 4 6 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.068376068 1.068376068 1 0.373831776 0.373831776 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.000372648 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 91996349 A G - - - - - - 53 0 0 46 4 8.7 21 2 9.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.811965812 0.811965812 1 0.542056075 0.542056075 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004928472 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 92753074 C G - - - - - - 38 0 0 55 4 7.3 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.45482866 0.45482866 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000173903 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 100411465 C G - - - - - - 42 0 0 47 4 8.5 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.529595016 0.529595016 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 102313402 C G DRAM1 CCDS41823.1 r.? - - intronic 38 0 0 46 5 10.9 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.679127726 0.679127726 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000361 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 103102633 A T - - - - - - 30 0 0 45 4 8.9 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.709401709 0.709401709 1 0.554517134 0.554517134 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.0000791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 103102671 G C - - - - - - 26 0 0 48 5 10.4 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.606837607 0.606837607 1 0.647975078 0.647975078 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 103415058 C A - - - - - - 39 0 0 56 5 8.9 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.52991453 0.52991453 1 0.554517134 0.554517134 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.00000965 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 103743576 C T C12orf42 CCDS44963.1 r.? - - intronic 40 0 0 51 5 9.8 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.6105919 0.6105919 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000606 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 104207877 C G NT5DC3 CCDS41824.1 r.? - - intronic 39 0 0 41 7 17.1 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.065420561 1.065420561 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 1.51E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 110429756 T C GIT2 CCDS9138.1 r.? - - intronic 31 0 0 37 5 13.5 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.841121495 0.841121495 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000119 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 112563733 C T TRAFD1 CCDS9160.1 r.385c>u c.? p.? 5'UTR variant 44 0 0 34 4 11.8 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.735202492 0.735202492 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000257 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 113174231 A T - - - - - - 33 0 0 58 4 6.9 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.429906542 0.429906542 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000213772 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 114451933 A C - - - - - - 43 0 0 47 10 21.3 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.136752137 1.136752137 1 1.327102804 1.327102804 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002513772 1 4.27E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 119753932 A T - - - - - - 33 0 0 43 3 7 24 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.436137072 0.436137072 1 NA NA 1 NA NA 1 1 NA 1 1 1 1 0.001328364 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 119767610 C T CCDC60 CCDS9190.1 r.? - - upstream 40 0 0 39 7 17.9 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.115264798 1.115264798 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 1.04E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 126632723 T C - - - - - - 27 0 0 49 4 8.2 24 1 4.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.358974359 0.358974359 1 0.510903427 0.510903427 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.113346489 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 128804947 C T - - - - - - 37 0 0 44 4 9.1 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.658119658 0.658119658 1 0.566978193 0.566978193 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.0000723 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 131394940 A T - - - - - - 30 0 0 55 4 7.3 22 2 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.777777778 0.777777778 1 0.45482866 0.45482866 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.005403392 1 0.000173903 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 131479558 G C GPR133 CCDS9272.1 r.? - - intronic 42 0 0 41 6 14.6 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 2 0 0 TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.909657321 0.909657321 1 0 0 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 6.05E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 131993403 T C - - - - - - 34 0 0 56 4 7.1 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.222222222 1.222222222 1 0.442367601 0.442367601 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002185852 1 0.000186538 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 132407526 T G ULK1 CCDS9274.1 r.5041u>g c.? p.? 3'UTR variant 30 0 0 39 3 7.7 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.479750779 0.479750779 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000998458 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 19664926 A T - - - - - - 37 0 0 38 5 13.2 21 3 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 1.365222222 1.365222222 1 0.909930481 0.909930481 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000155401 1 0.00000137 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 24527186 G A - - - - - - 47 0 0 34 6 17.6 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0 0 1 1.213240641 1.213240641 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 1.86E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 25727751 A C - - - - - - 43 0 0 48 3 6.2 17 1 5.9 0 0 NA 1 0 0 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0.563273504 0.563273504 1 0.42739159 0.42739159 1 NA NA 1 0 NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.001827434 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 26979380 G T CDK8 CCDS9317.1 r.? - - downstream 46 0 0 53 4 7.5 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0.563273504 0.563273504 1 0.517005955 0.517005955 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 26979381 A T CDK8 CCDS9317.1 r.? - - downstream 46 0 0 54 4 7.4 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0.59191453 0.59191453 1 0.510112542 0.510112542 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 31202912 T A USPL1 CCDS9336.1 r.? - - intronic 29 0 0 47 9 19.1 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0 0 1 1.316641832 1.316641832 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 2.24E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 32315144 A T RXFP2 CCDS9342.1 r.? - - intronic 55 0 0 30 4 13.3 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0 0 1 0.916823894 0.916823894 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000154 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 33726775 T G STARD13 CCDS9350.1 r.? - - intronic 27 0 0 53 3 5.7 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0.639649573 0.639649573 1 0.392924526 0.392924526 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.002429596 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 37672213 C G - - - - - - 35 0 0 47 7 14.9 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0.792401709 0.792401709 1 1.027118497 1.027118497 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.058377193 1 4.12E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 40613745 A G - - - - - - 35 0 0 43 6 14 7 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0 0 1 0.965077783 0.965077783 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 8.13E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 42199630 C G KIAA0564 CCDS41881.1 r.? - - intronic 34 0 0 54 5 9.3 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0 0 1 0.641087384 0.641087384 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000806 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 42489065 A G KIAA0564 CCDS41881.1 r.? - - intronic 40 0 0 48 5 10.4 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 1.126547009 1.126547009 1 0.716914924 0.716914924 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 44907714 G T - - - - - - 40 0 0 51 5 9.8 23 3 13 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 1.241111111 1.241111111 1 0.675554448 0.675554448 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000205387 1 0.00000606 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 48974579 T C RB1 CCDS31973.1 r.? - - intronic 31 0 0 47 5 10.6 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0.639649573 0.639649573 1 0.73070175 0.73070175 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 49220894 G A - - - - - - 36 0 0 48 5 10.4 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0.477350427 0.477350427 1 0.716914924 0.716914924 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 51262522 T A - - - - - - 41 0 0 47 4 8.5 15 3 20 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 1.909401709 1.909401709 1 0.585940082 0.585940082 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000544 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 51947351 T G INTS6 CCDS41890.1 r.? - - intronic 40 0 0 44 4 9.1 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0 0 1 0.627300559 0.627300559 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000723 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 56533519 T C - - - - - - 45 0 0 49 4 8.2 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0.563273504 0.563273504 1 0.565259844 0.565259844 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 56875463 T G - - - - - - 37 0 0 41 6 14.6 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0 0 1 1.006438259 1.006438259 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 6.05E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 57642527 T C - - - - - - 30 0 0 39 4 10.3 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0.534632479 0.534632479 1 0.710021512 0.710021512 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.0000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 57679374 G A - - - - - - 42 0 0 40 5 12.5 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0.677837607 0.677837607 1 0.861676592 0.861676592 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.00000178 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 59713388 C G - - - - - - 38 0 0 47 4 8.5 10 2 20 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 1.909401709 1.909401709 1 0.585940082 0.585940082 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.001095391 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 62928100 T C - - - - - - 40 0 0 44 6 13.6 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0 0 1 0.937504132 0.937504132 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 9.37E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 63222655 A T - - - - - - 43 0 0 39 3 7.7 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0 0 1 0.530792781 0.530792781 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000998458 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 70315505 A G KLHL1 CCDS9445.1 r.? - - intronic 32 0 0 61 10 16.4 19 3 15.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 1.50842735 1.50842735 1 1.130519688 1.130519688 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.000114071 1 6.98E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 75831625 A C - - - - - - 30 0 0 62 7 11.3 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0.59191453 0.59191453 1 0.778955639 0.778955639 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 3.02E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 76594190 C T - - - - - - 30 0 0 52 5 9.6 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0 0 1 0.661767623 0.661767623 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000668 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 77545423 A T - - - - - - 36 0 0 48 5 10.4 23 1 4.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0.410521368 0.410521368 1 0.716914924 0.716914924 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.108890944 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 80549257 A G - - - - - - 33 0 0 44 5 11.4 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0.677837607 0.677837607 1 0.785849052 0.785849052 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.00000288 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 80728744 C G - - - - - - 30 0 0 40 4 10 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0 0 1 0.689341273 0.689341273 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000495 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 84285777 G C - - - - - - 44 0 0 61 7 11.5 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 1.193376068 1.193376068 1 0.792742464 0.792742464 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002863359 1 2.69E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 85298586 G C - - - - - - 41 0 0 47 5 10.6 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0.477350427 0.477350427 1 0.73070175 0.73070175 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 91388058 T G - - - - - - 37 0 0 54 10 18.5 19 3 15.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 1.50842735 1.50842735 1 1.3827486 1.3827486 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.000114071 1 1.91E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 91873466 C G - - - - - - 50 0 0 65 11 16.9 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 0.505991453 0.505991453 1 1.263159532 1.263159532 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.090843738 1 3.41E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 91962760 T G - - - - - - 35 0 0 43 3 7 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 0.505991453 0.505991453 1 0.523202173 0.523202173 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.001328364 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 92392116 A T GPC5 CCDS9468.1 r.? - - intronic 44 0 0 62 10 16.1 12 2 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 1.594350427 1.594350427 1 1.203364998 1.203364998 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.001595918 1 8.29E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 93747943 T A - - - - - - 32 0 0 52 8 15.4 11 4 36.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 3.475111111 1.737555556 2 1.15104478 1.15104478 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.000000201 1 2.42E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 95819891 G T ABCC4 CCDS9474.1 r.? - - intronic 43 0 0 62 4 6.5 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 0.45825641 0.45825641 1 0.485830589 0.485830589 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.099912572 1 0.000276647 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 95931463 G A ABCC4 CCDS9474.1 r.? - - intronic 40 0 0 66 10 15.2 25 4 16 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 1.527521368 1.527521368 1 1.136096147 1.136096147 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.00000727 1 1.6E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 95958446 T C ABCC4 CCDS9474.1 r.? - - upstream 24 0 0 51 4 7.8 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 0.677837607 0.677837607 1 0.582996707 0.582996707 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.000129466 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 96405663 C T DNAJC3 CCDS9479.1 r.? - - intronic 37 0 0 45 6 13.3 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 0 0 1 0.994084129 0.994084129 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000108 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 96730496 T C - - - - - - 39 0 0 59 7 11.9 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 1.269752137 1.269752137 1 0.889443694 0.889443694 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002513772 1 2.12E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 99121789 C T STK24 CCDS32001.1 r.? - - intronic 26 0 0 32 5 15.6 7 1 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 1.365222222 1.365222222 1 1.165993414 1.165993414 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.034479353 1 0.000000562 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 99388385 T C SLC15A1 CCDS9489.1 r.? - - intronic 31 0 0 52 11 21.2 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 1.126547009 1.126547009 1 1.584555152 1.584555152 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.003234386 1 2.44E-15 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 99741889 G C DOCK9 ENST00000357329 r.? - - upstream 39 0 0 54 4 7.4 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 0 0 1 0.55309944 0.55309944 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 101463037 A G - - - - - - 30 0 0 67 8 11.9 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 0.534632479 0.534632479 1 0.889443694 0.889443694 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 1.96E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 102235721 A C ITGBL1 CCDS9499.1 r.? - - intronic 31 0 0 51 3 5.9 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 0 0 1 0.440984689 0.440984689 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.002175924 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 103862277 T G - - - - - - 40 0 0 49 5 10.2 24 1 4.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 0.400974359 0.400974359 1 0.762380309 0.762380309 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.113346489 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 104747208 A C - - - - - - 38 0 0 50 3 6 32 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 0 0 1 0.448459005 0.448459005 1 NA NA 0 NA NA 1 1 NA 1 1 1 1 0.002055544 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 106511773 A C - - - - - - 26 0 0 43 4 9.3 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 0 0 1 0.695111458 0.695111458 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 108233145 C T FAM155A CCDS32006.1 r.? - - intronic 35 0 0 62 10 16.1 26 4 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 1.470239316 1.470239316 1 1.203364998 1.203364998 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.00000856 1 8.29E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 109866489 C G - - - - - - 52 0 0 65 11 16.9 23 2 8.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 0.830589744 0.830589744 1 1.263159532 1.263159532 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.00589844 1 3.41E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 113653463 A G MCF2L CCDS9527.2 r.? - - intronic 23 0 0 51 6 11.8 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 0.868777778 0.868777778 1 0.881969377 0.881969377 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.05364542 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 114610531 C T - - - - - - 43 0 0 48 10 20.8 19 6 31.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 3.016854701 1.50842735 2 1.554657885 1.554657885 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 4.01E-10 1 5.37E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 20744188 T C - - - - - - 45 0 0 43 8 18.6 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0 0 1 1.285540849 1.285540849 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 4.85E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 25006404 T C - - - - - - 47 0 0 60 5 8.3 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 1 0 0 TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0 0 1 0.573655325 0.573655325 1 0 NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000136 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 27169358 T A - - - - - - 37 0 0 65 4 6.2 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0 0 1 0.428513616 0.629259889 0.680980345 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000331785 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 28319264 C G - - - - - - 43 0 0 53 5 9.4 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0 0 1 0.649681934 0.649681934 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 32015692 A T - - - - - - 35 0 0 43 4 9.3 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 1.088833875 1.088833875 1 0.642770424 0.642770424 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 35537458 C T FAM177A1 CCDS41944.1 r.? - - intronic 44 0 0 51 5 9.8 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0.710510241 0.710510241 1 0.677327974 0.677327974 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.00000606 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 36690379 G A - - - - - - 29 0 0 46 6 13 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0.710510241 0.710510241 1 0.898496292 0.898496292 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.000000123 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 37849682 A C MIPOL1 CCDS9664.1 r.? - - intronic 33 0 0 51 5 9.8 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0 0 1 0.677327974 0.677327974 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000606 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 38395871 A G - - - - - - 39 0 0 55 5 9.1 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0 0 1 0.628947405 0.628947405 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000883 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 40045778 C G - - - - - - 34 0 0 52 5 9.6 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0.710510241 0.710510241 1 0.663504954 0.663504954 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.00000668 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 40898697 C A - - - - - - 27 0 0 51 6 11.8 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0.572099155 0.572099155 1 0.815558173 0.815558173 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 41163144 A G - - - - - - 37 0 0 44 4 9.1 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0.968877601 0.968877601 1 0.628947405 0.628947405 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.0000723 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 41176907 C G - - - - - - 34 0 0 41 7 17.1 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0 0 1 1.1818682 1.1818682 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 1.51E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 42137431 T A LRFN5 CCDS9678.1 r.? - - intronic 44 0 0 39 6 15.4 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0 0 1 1.064372531 1.064372531 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 4.43E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 44848343 A C - - - - - - 41 0 0 43 4 9.3 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0 0 1 0.642770424 0.642770424 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 45306493 A G - - - - - - 51 0 0 55 6 10.9 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0 0 1 0.753354583 0.753354583 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 49652922 A G - - - - - - 38 0 0 49 6 12.2 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0 0 1 0.843204213 0.843204213 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000182 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 50454785 G T C14orf182 CCDS41949.1 r.? - - intronic 31 0 0 62 7 11.3 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0.655145806 0.655145806 1 0.781000623 0.781000623 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.067769881 1 3.02E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 51524097 A G TRIM9 CCDS9703.1 r.? - - intronic 50 0 0 43 5 11.6 18 4 22.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 2.048484071 2.048484071 1 0.801735153 0.801735153 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.00000181 1 0.00000257 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 56557045 T A - - - - - - 45 0 0 52 7 13.5 18 3 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 1.540976756 1.540976756 1 0.933053842 0.933053842 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0000964 1 8.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 60434072 A C - - - - - - 33 0 0 58 9 15.5 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0.572099155 0.572099155 1 1.071284041 1.071284041 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 1.67E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 61455425 C T SLC38A6 CCDS9751.1 r.? - - intronic 42 0 0 44 8 18.2 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0.461370286 0.461370286 1 1.257894809 1.257894809 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.09538952 1 5.9E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 61645657 T G - - - - - - 25 0 0 54 4 7.4 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0.618236184 0.618236184 1 0.511451736 0.511451736 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 61732327 G A - - - - - - 39 0 0 45 7 15.6 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0.572099155 0.572099155 1 1.078195551 1.078195551 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.000000003 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 62131637 C T - - - - - - 23 0 0 60 10 16.7 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 1.319519019 1.319519019 1 1.15422216 1.15422216 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002185852 1 5.86E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 62328175 G T - - - - - - 42 0 0 57 6 10.5 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0.489052503 0.489052503 1 0.725708544 0.725708544 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.000000456 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 62995152 G A - - - - - - 40 0 0 56 7 12.5 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0 0 1 0.863938742 0.863938742 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 1.46E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 70507924 G A SLC8A3 CCDS35498.1 r.? - - downstream 27 0 0 52 5 9.6 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0.544416938 0.544416938 1 0.663504954 0.663504954 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.00000668 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 72018484 A T SIPA1L1 CCDS9807.1 r.? - - intronic 41 0 0 46 3 6.5 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0.922740572 0.922740572 1 0.449248146 0.449248146 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.04888987 1 0.001615827 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 74355283 T C PTGR2 CCDS9820.1 r.? - - downstream 31 0 0 53 6 11.3 25 2 8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0.738192458 0.738192458 1 0.781000623 0.781000623 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.006948068 1 0.000000293 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 79495088 G C NRXN3 CCDS9870.1 r.? - - intronic 54 0 0 55 4 7.3 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0.968877601 0.968877601 1 0.504540226 0.504540226 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.000173903 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 80215327 G A NRXN3 CCDS45145.1 r.? - - intronic 39 0 0 46 4 8.7 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0 0 1 0.601301365 0.601301365 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 83834572 A C - - - - - - 33 0 0 44 5 11.4 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0.489052503 0.489052503 1 0.787912133 0.787912133 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.00000288 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 85819031 C T - - - - - - 33 0 0 31 4 12.9 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0 0 1 0.891584782 0.891584782 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000177 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 87021608 G A - - - - - - 37 0 0 58 8 13.8 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0.839693921 0.839693921 1 0.953788372 0.953788372 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.05364542 1 5.99E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 98137089 G A ENSG00000197176 ENST00000355909 r.? - - intronic 46 0 0 47 5 10.6 18 5 27.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 2.565218791 1.526555047 1.680397177 0.732620054 0.732620054 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 2.54E-08 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 99951923 G T SETD3 CCDS9951.1 r.? - - upstream 49 0 0 54 5 9.3 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0.572099155 0.572099155 1 0.642770424 0.642770424 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.00000806 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 20459327 A G ENSG00000215407 ENST00000400226 r.? - - intronic 143 0 0 227 10 4.4 61 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.557111675 2 1 2 1 0 0.442888325 1 2 NA 1 NA 0.557111675 NA 0 NA 0 0.274143302 0.274143302 1 NA NA 0 NA NA 0 NA NA 1 1 1 1 0.000000299 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 22752534 C T - - - - - - 37 0 0 51 8 15.7 12 4 33.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 3.031672034 1.946984332 1.557111675 1.079318511 1.079318511 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.0000003 1 2.05E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 24292232 A T - - - - - - 45 0 0 53 6 11.3 8 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0 0 1 0.776834343 0.776834343 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000293 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 27393352 A G GABRG3 CCDS45195.1 r.? - - intronic 48 0 0 41 4 9.8 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0 0 1 0.67371474 0.67371474 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000546 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 28577041 G T - - - - - - 26 0 0 19 5 26.3 9 1 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 1.010557345 1.010557345 1 1.808030373 1.808030373 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.044110422 1 3.43E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 28708878 C G - - - - - - 44 0 0 77 5 6.5 23 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0 0 1 0.446851613 0.693749815 0.644110605 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000458 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 31276765 G C MTMR10 CCDS45204.1 r.? - - intronic 34 0 0 59 7 11.9 17 3 17.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 1.602325159 1.602325159 1 0.818082184 0.818082184 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0000807 1 2.12E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 32364836 G C CHRNA7 CCDS10027.1 r.? - - intronic 30 0 0 45 5 11.1 9 1 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 1.010557345 1.010557345 1 0.763085062 0.763085062 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.044110422 1 0.00000323 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 39049792 C G - - - - - - 49 0 0 38 4 10.5 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 1.301889192 1.301889192 1 0.721837221 0.721837221 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002185852 1 0.0000403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 42579600 T C GANC CCDS10084.1 r.? - - intronic 44 0 0 63 6 9.5 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0 0 1 0.653090819 0.653090819 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000832 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 43888575 C G STRCP1 CCDS10098.1 r.? - - downstream 23 0 0 35 3 8.6 8 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0 0 1 0.591219057 0.591219057 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000725791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 47532927 A G - - - - - - 38 0 0 53 5 9.4 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0 0 1 0.646216179 0.646216179 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 48214936 G A - - - - - - 38 0 0 45 4 8.9 7 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0 0 1 0.611842978 0.611842978 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 50090254 G A - - - - - - 38 0 0 61 6 9.8 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0 0 1 0.67371474 0.67371474 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000685 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 50777247 G A USP8 CCDS10137.1 r.? - - intronic 40 0 0 42 5 11.9 21 3 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 1.301889192 1.301889192 1 0.818082184 0.818082184 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000155401 1 0.00000228 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 52431609 T C GNB5 CCDS10149.1 r.? - - intronic 29 0 0 45 5 11.1 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 1.138015028 1.138015028 1 0.763085062 0.763085062 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.00000323 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 53001629 A C - - - - - - 46 0 0 41 5 12.2 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0 0 1 0.838706104 0.838706104 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000202 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 54297686 C T - - - - - - 38 0 0 59 5 8.5 22 2 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0.82847494 0.82847494 1 0.584344417 0.584344417 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.005403392 1 0.0000125 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 58055330 C A - - - - - - 43 0 0 48 6 12.5 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0 0 1 0.859330025 0.859330025 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 59215003 G A SLTM CCDS10168.2 r.? - - intronic 22 0 0 41 6 14.6 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0.910412022 0.910412022 1 1.003697469 1.003697469 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.04888987 1 6.05E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 61627942 A T - - - - - - 31 0 0 44 4 9.1 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 1.138015028 1.138015028 1 0.625592258 0.625592258 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.0000723 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 66180444 T A RAB11A CCDS10212.1 r.1045u>a c.? p.? 3'UTR variant 47 0 0 51 4 7.8 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0.755641978 0.755641978 1 0.536221936 0.536221936 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.000129466 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 72438266 T A SENP8 CCDS10240.1 r.? - - downstream 23 0 0 39 6 15.4 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0 0 1 1.058694591 1.058694591 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 4.43E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 76614862 G T - - - - - - 28 0 0 50 6 12 17 4 23.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 2.139468252 2.139468252 1 0.824956824 0.824956824 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.00000141 1 0.000000206 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 77081540 A G SCAPER ENST00000303521 r.? - - intronic 40 0 0 49 5 10.2 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0.509830732 0.509830732 1 0.7012133 0.7012133 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 77501477 C G ENSG00000173517 CCDS42062.1 r.? - - intronic 48 0 0 60 5 8.3 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0 0 1 0.570595137 0.570595137 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000136 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 78838667 T G PSMA4 CCDS10303.1 r.? - - intronic 35 0 0 36 4 11.1 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0.564455454 0.564455454 1 0.763085062 0.763085062 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.0000324 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 79835030 G C - - - - - - 36 0 0 47 9 19.1 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0 0 1 1.313056278 1.313056278 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 2.24E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 84101681 G A - - - - - - 34 0 0 60 10 16.7 19 3 15.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 1.438450995 1.438450995 1 1.148064913 1.148064913 1 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 0.000114071 1 5.86E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 85379006 C T ALPK3 CCDS10333.1 r.? - - intronic 37 0 0 43 5 11.6 18 2 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 1.010557345 1.010557345 1 0.797458263 0.797458263 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003626632 1 0.00000257 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 86637968 A T - - - - - - 45 0 0 56 4 7.1 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0 0 1 0.488099454 0.488099454 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000186538 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 87297766 C G - - - - - - 39 0 0 42 9 21.4 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0.755641978 0.755641978 1 1.471173003 1.471173003 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.058377193 1 7.51E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 88618460 G T NTRK3 CCDS10340.1 r.? - - intronic 22 0 0 38 4 10.5 7 2 28.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 2.603778383 2.603778383 1 0.721837221 0.721837221 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000516315 1 0.0000403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 89795264 C A FANCI CCDS45346.1 r.? - - intronic 29 0 0 51 5 9.8 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0 0 1 0.67371474 0.67371474 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000606 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 91832982 A T SV2B CCDS10370.1 r.? - - intronic 33 0 0 49 6 12.2 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0.455206011 0.455206011 1 0.838706104 0.838706104 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.000000182 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 93134398 A G - - - - - - 42 0 0 43 7 16.3 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 1.210847989 1.210847989 1 1.120566353 1.120566353 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002513772 1 2.15E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 94346235 A T - - - - - - 27 0 0 44 7 15.9 13 2 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 1.402034514 1.402034514 1 1.093067792 1.093067792 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.001879825 1 2.55E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 95561862 C G - - - - - - 28 0 0 47 5 10.6 23 1 4.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0.39147717 0.39147717 1 0.728711861 0.728711861 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.108890944 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 95716079 C A - - - - - - 54 0 0 67 4 6 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 1.138015028 1.138015028 1 0.412478412 0.640384444 0.644110605 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.000372648 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 97031509 C A - - - - - - 33 0 0 53 5 9.4 24 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0 0 1 0.646216179 0.646216179 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 97843496 A C - - - - - - 48 0 0 48 8 16.7 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0.910412022 0.910412022 1 1.148064913 1.148064913 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.04888987 1 1.23E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 98330781 C T AC027708.1 ENST00000503768 r.? - - intronic 46 0 0 42 5 11.9 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0.609976055 0.609976055 1 0.818082184 0.818082184 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.00000228 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 99539635 A T PGPEP1L ENST00000378919 r.? - - intronic 29 0 0 58 6 10.3 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 1.074286186 1.074286186 1 0.708087941 0.708087941 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.000000506 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 2421306 T A - - - - - - 34 0 0 53 5 9.4 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.585669782 0.585669782 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 9826503 C A - - - - - - 43 0 0 47 4 8.5 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.529595016 0.529595016 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 12954844 A T - - - - - - 35 0 0 43 3 7 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.504273504 0.504273504 1 0.436137072 0.436137072 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.001328364 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 13601987 A C - - - - - - 32 0 0 47 5 10.6 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.660436137 0.660436137 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 19569899 C T C16orf62 CCDS32397.1 r.? - - intronic 24 0 0 48 5 10.4 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.647975078 0.647975078 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 22308422 A C POLR3E CCDS10605.1 r.? - - upstream 38 0 0 34 4 11.8 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.735202492 0.735202492 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000257 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 22682247 G T ENSG00000224154 ENST00000430965 r.? - - intronic 67 0 0 119 7 5.9 25 2 8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.683760684 0.683760684 1 0.367601246 0.367601246 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.006948068 1 0.00000268 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 24036028 G A PRKCB CCDS10619.1 r.? - - intronic 26 0 0 46 4 8.7 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.542056075 0.542056075 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 26896299 C T - - - - - - 44 0 0 43 4 9.3 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.579439252 0.579439252 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 27120659 A C - - - - - - 37 0 0 39 5 12.8 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.797507788 0.797507788 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000156 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 107850042 G T COL4A5 CCDS35366.1 r.2559g>u c.2315G>T p.G772V missense 36 0 0 31 4 12.9 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.704050758 1 1 1 1 0.519821524 0.295949242 2 2 1 1 0.480178476 0.704050758 0 0 1 0.894560866 0.894560866 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000177 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 31993025 T C ENSG00000214627 ENST00000398685 r.? - - intronic 30 0 0 32 5 15.6 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.606837607 0.606837607 1 0.971962617 0.971962617 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.000000562 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 34421098 G A - - - - - - 38 0 0 51 9 17.6 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.222222222 1.222222222 1 1.096573209 1.096573209 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002185852 1 4.92E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 34546930 G C ENSG00000237113 ENST00000425453 r.? - - intronic 56 0 0 87 8 9.2 25 2 8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.683760684 0.683760684 1 0.573208723 0.573208723 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.006948068 1 1.61E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 48912715 A G - - - - - - 47 0 0 50 4 8 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.498442368 0.498442368 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000119787 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 54884964 C T - - - - - - 42 0 0 58 7 12.1 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.478632479 0.478632479 1 0.753894081 0.753894081 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 1.88E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 56020513 C A - - - - - - 33 0 0 52 5 9.6 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.598130841 0.598130841 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000668 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 56328907 T A GNAO1 CCDS10756.1 r.? - - intronic 33 0 0 46 4 8.7 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.542056075 0.542056075 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 56500746 G A OGFOD1 CCDS10761.2 r.? - - intronic 38 0 0 46 5 10.9 25 1 4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.341880342 0.341880342 1 0.679127726 0.679127726 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.117779757 1 0.00000361 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 60460855 A C - - - - - - 46 0 0 59 4 6.8 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.423676012 0.423676012 1 NA NA 1 NA NA 1 1 NA 1 1 1 1 0.00022841 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 60665571 A C - - - - - - 37 0 0 52 7 13.5 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.606837607 0.606837607 1 0.841121495 0.841121495 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.067769881 1 8.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 62259019 T A - - - - - - 40 0 0 47 4 8.5 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.529595016 0.529595016 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 63594871 G T - - - - - - 44 0 0 40 4 10 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.452991453 0.452991453 1 0.62305296 0.62305296 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.0000495 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 72147418 G C DHX38 CCDS10907.1 r.? - - downstream 44 0 0 65 5 7.7 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.479750779 0.479750779 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000201 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 73434690 G T - - - - - - 36 0 0 53 5 9.4 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.585669782 0.585669782 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 75971830 T C - - - - - - 33 0 0 53 5 9.4 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.585669782 0.585669782 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 76900830 T A - - - - - - 33 0 0 55 6 10.9 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.504273504 0.504273504 1 0.679127726 0.679127726 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 77680001 G C - - - - - - 30 0 0 46 6 13 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.222222222 1.222222222 1 0.809968847 0.809968847 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002185852 1 0.000000123 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 77680002 A G - - - - - - 30 0 0 47 6 12.8 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.222222222 1.222222222 1 0.797507788 0.797507788 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002185852 1 0.000000141 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 80963145 C T - - - - - - 34 0 0 38 4 10.5 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.41025641 0.41025641 1 0.654205607 0.654205607 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.099912572 1 0.0000403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 82337254 G A - - - - - - 46 0 0 41 5 12.2 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.760124611 0.760124611 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000202 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 88618165 C A C16orf85 ENST00000378416 r.? - - downstream 43 0 0 41 5 12.2 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.760124611 0.760124611 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000202 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 92659 C T RPH3AL CCDS10994.1 r.? - - intronic 61 0 0 76 6 7.9 25 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0 0 1 0.544545711 0.544545711 1 NA NA 0 NA NA 0 1 NA 1 1 1 1 0.00000253 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 1199010 G A TUSC5 CCDS42225.1 r.? - - intronic 34 0 0 27 5 18.5 6 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0 0 1 1.275201983 1.275201983 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000023 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 3049906 G T - - - - - - 45 0 0 48 8 16.7 13 3 23.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 2.118280379 2.118280379 1 1.151128276 1.151128276 1 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 0.0000344 1 1.23E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 43020290 G C CUL7 CCDS4881.1 r.323c>g c.237C>G p.H79Q missense 31 0 0 52 9 17.3 13 2 15.4 143 0 0 58 12 20.7 51 7 13.7 TRUE TRUE 4.581695873 3.184476375 3 2 1 1 0.418304127 0.815523625 3 3 2 1 0.581695873 0.184476375 1.713820481 1.713820481 1 1.282796033 1.282796033 1 1.524632506 1.524632506 1 1.534906236 1.534906236 1 3 3 1 1 0.001879825 7.46E-09 5.92E-12 1.76E-16 YES 1_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 17 9667330 G C - - - - - - 35 0 0 59 7 11.9 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0.65107319 0.65107319 1 0.820265059 0.820265059 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.067769881 1 2.12E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 12080395 G A - - - - - - 42 0 0 46 8 17.4 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0.568542786 0.568542786 1 1.199379162 1.199379162 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 8.61E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 12360677 G T - - - - - - 28 0 0 53 4 7.5 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0.917004493 0.917004493 1 0.516973777 0.516973777 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004473894 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 13265680 T A - - - - - - 25 0 0 52 3 5.8 22 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0 0 1 0.399793054 0.399793054 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.002300591 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 167962480 A C DCAF6 CCDS1267.2 r.956a>c c.705A>C p.R235R silent 35 0 0 46 4 8.7 18 2 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 5 2 3 1 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.059717949 1.059717949 1 0.803056075 0.803056075 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.003626632 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 20772820 G A CCDC144NL CCDS32591.1 r.? - - intronic 62 1 1.6 113 9 8 34 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0 0 1 0.551438695 0.832417974 0.662454094 NA NA 0 NA NA 1 1 NA 0.267123145 1 1 1 7.3E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 29582569 A G NF1 CCDS42292.1 r.? - - intronic 40 0 0 71 11 15.5 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0.70609346 0.70609346 1 1.068412472 1.068412472 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 9.49E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 34261689 T C LYZL6 CCDS11302.1 r.758a>g c.? p.? 3'UTR variant 35 0 0 57 4 7 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 1.311316425 1.311316425 1 0.482508858 0.482508858 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002185852 1 0.000199821 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 38889642 G A - - - - - - 32 0 0 34 4 11.8 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0.70609346 0.70609346 1 0.813372075 0.813372075 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.0000257 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 41867189 G T C17orf105 CCDS45695.1 r.? - - downstream 42 0 0 52 4 7.7 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0 0 1 0.530759744 0.530759744 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000139698 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 42832685 G C ADAM11 CCDS11486.1 r.? - - upstream 24 0 0 51 4 7.8 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0.541032651 0.541032651 1 0.537652728 0.537652728 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.000129466 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 44123655 T A KIAA1267 CCDS11503.1 r.? - - intronic 32 0 0 53 4 7.5 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0.962854718 0.962854718 1 0.516973777 0.516973777 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 52300514 C G - - - - - - 27 0 0 53 4 7.5 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0 0 1 0.516973777 0.516973777 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 52886054 T G - - - - - - 36 0 0 53 8 15.1 17 4 23.5 0 0 NA 1 0 0 1 0 0 TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 2.154960558 2.154960558 1 1.040840537 1.040840537 1 0 NA 0 0 0 1 3 NA 1 1 0.00000141 1 2.83E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 52980460 C T TOM1L1 CCDS11582.1 r.? - - intronic 38 0 0 45 4 8.9 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0 0 1 0.613475548 0.613475548 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 54168983 G A - - - - - - 43 0 0 61 6 9.8 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0.917004493 0.917004493 1 0.675512402 0.675512402 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.04888987 1 0.000000685 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 54618776 G A - - - - - - 39 0 0 50 5 10 10 3 30 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 2.751013479 2.751013479 1 0.689298369 0.689298369 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0000146 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 57479899 T C YPEL2 CCDS32695.1 r.? - - downstream 31 0 0 54 4 7.4 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0.458502246 0.458502246 1 0.510080793 0.510080793 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 59062857 G A BCAS3 CCDS45749.1 r.? - - intronic 36 0 0 54 5 9.3 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0 0 1 0.641047483 0.641047483 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000806 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 59986742 T A INTS2 CCDS45750.1 r.? - - intronic 30 0 0 56 5 8.9 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0 0 1 0.613475548 0.613475548 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000965 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 67978768 C G - - - - - - 38 0 0 51 6 11.8 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0 0 1 0.813372075 0.813372075 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 68084592 C A KCNJ16 CCDS11687.1 r.? - - intronic 41 0 0 53 4 7.5 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0 0 1 0.516973777 0.516973777 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 72757303 G C SLC9A3R1 CCDS11705.1 r.? - - intronic 33 0 0 53 5 9.4 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0 0 1 0.647940467 0.647940467 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 73421993 C T - - - - - - 31 0 0 60 5 8.3 22 3 13.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 1.24712611 1.24712611 1 0.572117646 0.572117646 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000179267 1 0.0000136 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 73477761 T A KIAA0195 CCDS32732.1 r.? - - intronic 36 0 0 49 4 8.2 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0.761113729 0.761113729 1 0.565224663 0.565224663 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 75541767 G A AC021683.1 ENST00000510620 r.? - - upstream 40 0 0 42 6 14.3 15 4 26.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 2.448401996 2.448401996 1 0.985696668 0.985696668 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.000000816 1 7.02E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 75669455 C G - - - - - - 31 0 0 67 7 10.4 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0.541032651 0.541032651 1 0.716870304 0.716870304 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 5.23E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 441293 G A COLEC12 CCDS32782.1 r.? - - intronic 43 0 0 62 9 14.5 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.65391453 NA 0 1.338426791 1.338426791 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.077068876 1 3.12E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 893978 T C - - - - - - 37 0 0 64 7 10.9 27 1 3.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.390239316 NA 0 1.006127726 1.006127726 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.126579904 1 3.78E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 1787943 G T - - - - - - 36 0 0 42 4 9.5 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 NA 0 0.876900312 0.876900312 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.0000601 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 1933718 C T - - - - - - 28 0 0 62 5 8.1 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.50625641 NA 0 0.747672897 0.747672897 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.099912572 1 0.000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 1955085 G A - - - - - - 48 0 0 51 10 19.6 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.508222222 1.508222222 1 1.809183801 0.9045919 2 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002185852 1 1.04E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 2031643 C T - - - - - - 29 0 0 69 5 7.2 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 NA 0 0.664598131 0.664598131 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.0000269 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 3407815 G A TGIF1 CCDS11835.1 r.? - - upstream 33 0 0 55 5 9.1 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.054700855 1.054700855 1 0.839978193 0.839978193 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004473894 1 0.00000883 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 3646513 T G DLGAP1 CCDS11836.1 r.? - - intronic 28 0 0 57 4 7 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.622273504 NA 0 0.646137072 0.646137072 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.081683532 1 0.000199821 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 3841127 A G DLGAP1 CCDS11836.1 r.? - - intronic 34 0 0 60 5 8.3 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 NA 0 0.766133956 0.766133956 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.0000136 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 4939778 C G - - - - - - 35 0 0 55 6 10.9 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 NA 0 1.006127726 1.006127726 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 5217821 A T - - - - - - 33 0 0 78 7 9 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 NA 0 0.830747664 0.830747664 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000000151 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 6606562 T A - - - - - - 29 0 0 49 4 8.2 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.622273504 0.622273504 1 0.674903427 0.674903427 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 7414909 G A - - - - - - 42 0 0 56 8 14.3 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.65391453 0.65391453 1 1.176965732 1.176965732 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 4.48E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 7576664 T C PTPRM CCDS11840.1 r.? - - intronic 35 0 0 64 6 9.4 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.773669782 0.773669782 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000914 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 7839409 T A PTPRM CCDS11840.1 r.? - - intronic 35 0 0 54 5 9.3 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.765439252 0.765439252 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000806 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 8027611 C A PTPRM CCDS11840.1 r.? - - intronic 32 0 0 39 5 12.8 21 2 9.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.001965812 1.001965812 1 1.053507788 1.053507788 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004928472 1 0.00000156 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 8456268 C T - - - - - - 44 0 0 51 5 9.8 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.107435897 1.107435897 1 0.8065919 0.8065919 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.00000606 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 8999435 A C - - - - - - 32 0 0 29 6 20.7 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.875401709 0.875401709 1 1.703719626 1.703719626 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 6.72E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 13338779 T A C18orf1 CCDS32793.1 r.? - - intronic 27 0 0 61 6 9.8 15 3 20 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.109401709 2.109401709 1 0.8065919 0.8065919 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0000544 1 0.000000685 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 14163610 A G - - - - - - 37 0 0 65 6 9.2 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.318376068 1.318376068 1 0.757208723 0.757208723 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.000001 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 14268629 C T - - - - - - 33 0 0 56 5 8.9 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.622273504 0.622273504 1 0.732517134 0.732517134 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.00000965 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 14321040 T A - - - - - - 32 0 0 68 5 7.4 23 1 4.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.453521368 0.453521368 1 0.60905919 0.60905919 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.108890944 1 0.0000251 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 18668145 C G ROCK1 CCDS11870.2 r.? - - intronic 38 0 0 62 4 6.5 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.534984424 0.534984424 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000276647 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 19178879 T A ESCO1 CCDS32800.1 r.? - - intronic 23 0 0 67 4 6 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.493831776 0.493831776 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000372648 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 21276022 A T LAMA3 CCDS42419.1 r.? - - intronic 29 0 0 58 8 13.8 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.65391453 0.65391453 1 1.135813084 1.135813084 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 5.99E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 22319593 T A - - - - - - 41 0 0 48 6 12.5 26 2 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.812119658 0.812119658 1 1.028816199 1.028816199 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.007502227 1 0.00000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 24409711 G A - - - - - - 22 0 0 37 5 13.5 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.111121495 1.111121495 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000119 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 25273733 T C - - - - - - 47 0 0 51 6 11.8 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.527350427 0.527350427 1 0.971202492 0.971202492 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 25909623 C T - - - - - - 39 0 0 55 5 9.1 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.318376068 1.318376068 1 0.748978193 0.748978193 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.00000883 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 26226587 T G - - - - - - 41 0 0 55 4 7.3 11 2 18.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.919555556 1.919555556 1 0.60082866 0.60082866 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001334363 1 0.000173903 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 26553034 C A - - - - - - 45 0 0 40 5 12.5 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.028816199 1.028816199 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000178 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 27020494 T C - - - - - - 39 0 0 65 6 9.2 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.558991453 0.558991453 1 0.757208723 0.757208723 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.000001 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 27091001 C A - - - - - - 21 0 0 56 5 8.9 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.732517134 0.732517134 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000965 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 27116380 C A - - - - - - 42 0 0 45 5 11.1 15 3 20 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.109401709 2.109401709 1 0.913588785 0.913588785 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.0000544 1 0.00000323 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 27650480 T C - - - - - - 37 0 0 55 6 10.9 21 3 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.508222222 1.508222222 1 0.897127726 0.897127726 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000155401 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 28014763 G T - - - - - - 37 0 0 74 7 9.5 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.748837607 0.748837607 1 0.781900312 0.781900312 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.000000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 31575175 C T NOL4 CCDS11907.2 r.? - - intronic 53 0 0 44 5 11.4 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.938280374 0.938280374 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000288 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 35412718 T G - - - - - - 34 0 0 51 4 7.8 8 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.641981308 0.641981308 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000129466 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 35603737 C T - - - - - - 46 0 0 38 4 10.5 24 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.864205607 0.864205607 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 35714945 T A - - - - - - 34 0 0 53 5 9.4 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.773669782 0.773669782 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 38881178 C T - - - - - - 32 0 0 63 6 9.5 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.781900312 0.781900312 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000832 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 38910820 A T - - - - - - 41 0 0 48 7 14.6 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.201657321 1.201657321 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 4.81E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 39083435 T C - - - - - - 33 0 0 56 5 8.9 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.054700855 1.054700855 1 0.732517134 0.732517134 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.04888987 1 0.00000965 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 39650983 C T PIK3C3 CCDS11920.1 r.? - - intronic 48 0 0 69 8 11.6 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.706649573 0.706649573 1 0.954741433 0.954741433 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.072431031 1 2.49E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 40038526 C T - - - - - - 40 0 0 57 6 10.5 24 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.864205607 0.864205607 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000456 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 40232799 C G - - - - - - 41 0 0 47 4 8.5 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.699595016 0.699595016 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 41297074 A T - - - - - - 37 0 0 50 5 10 12 2 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.761350427 1.761350427 1 0.82305296 0.82305296 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001595918 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 41566978 C T - - - - - - 43 0 0 65 5 7.7 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.633750779 0.633750779 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000201 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 41857781 A T - - - - - - 28 0 0 58 4 6.9 22 1 4.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.474615385 0.474615385 1 0.567906542 0.567906542 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.104413009 1 0.000213772 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 44182237 C T LOXHD1 ENST00000398722 r.? - - upstream 45 0 0 64 6 9.4 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.773669782 0.773669782 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000914 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 44588535 G A KATNAL2 CCDS32828.1 r.? - - intronic 38 0 0 66 8 12.1 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.054700855 1.054700855 1 0.995894081 0.995894081 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.04888987 1 1.73E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 45185607 A C - - - - - - 48 0 0 57 5 8.8 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.724286604 0.724286604 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 45719489 C G - - - - - - 33 0 0 44 7 15.9 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.812119658 0.812119658 1 1.308654206 1.308654206 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 2.55E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 47860008 T G - - - - - - 34 0 0 38 4 10.5 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.864205607 0.864205607 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 48140292 G C MAPK4 CCDS42437.1 r.? - - intronic 41 0 0 62 5 8.1 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.875401709 0.875401709 1 0.666672897 0.666672897 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 49395430 A T - - - - - - 46 0 0 58 4 6.9 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.567906542 0.567906542 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000213772 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 49625996 T A - - - - - - 29 0 0 46 4 8.7 20 3 15 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.582051282 1.582051282 1 0.716056075 0.716056075 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0001337 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 50738081 G A DCC CCDS11952.1 r.? - - intronic 50 0 0 52 5 9.6 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.790130841 0.790130841 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000668 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 51036080 T C DCC CCDS11952.1 r.? - - intronic 34 0 0 65 9 13.8 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.135813084 1.135813084 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 4.85E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 51934207 G T - - - - - - 42 0 0 51 6 11.8 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.971202492 0.971202492 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 53319370 C G - - - - - - 30 0 0 66 5 7.6 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.625520249 0.625520249 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000217 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 53345012 A C - - - - - - 42 0 0 53 7 13.2 23 2 8.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.917589744 0.917589744 1 1.086429907 1.086429907 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.00589844 1 9.85E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 53528600 T G - - - - - - 39 0 0 59 6 10.2 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.839514019 0.839514019 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000561 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 55058787 T G - - - - - - 41 0 0 57 6 10.5 22 3 13.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.434393162 1.434393162 1 0.864205607 0.864205607 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000179267 1 0.000000456 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 55296354 C T - - - - - - 38 0 0 46 7 15.2 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.508222222 1.508222222 1 1.251040498 1.251040498 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002185852 1 3.53E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 57156868 C T CCBE1 CCDS32838.1 r.? - - intronic 44 0 0 57 5 8.8 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.724286604 0.724286604 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 57808445 C G - - - - - - 38 0 0 40 5 12.5 11 2 18.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.919555556 1.919555556 1 1.028816199 1.028816199 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001334363 1 0.00000178 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 59390678 C T - - - - - - 44 0 0 50 7 14 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.65391453 0.65391453 1 1.152274143 1.152274143 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 6.46E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 62772950 A C - - - - - - 47 0 0 54 11 20.4 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.054700855 1.054700855 1 1.679028037 0.839514019 2 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004473894 1 3.84E-15 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 63712736 A G - - - - - - 40 0 0 44 5 11.4 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.706649573 0.706649573 1 0.938280374 0.938280374 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.00000288 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 64281723 C T - - - - - - 28 0 0 36 4 11.1 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.318376068 1.318376068 1 0.913588785 0.913588785 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.0000324 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 64431026 C G - - - - - - 38 0 0 68 7 10.3 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.847744548 0.847744548 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000058 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 64768086 G A - - - - - - 42 0 0 46 4 8.7 13 2 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.624239316 1.624239316 1 0.716056075 0.716056075 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001879825 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 65024570 A T - - - - - - 46 0 0 62 5 8.1 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.666672897 0.666672897 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 65210602 T C AC114689.1 ENST00000500778 r.? - - intronic 42 0 0 71 7 9.9 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.81482243 0.81482243 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 7.85E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 65716058 G T - - - - - - 32 0 0 56 7 12.5 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.50625641 0.50625641 1 1.028816199 1.028816199 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.099912572 1 1.46E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 66348090 A G TMX3 CCDS32840.1 r.? - - intronic 34 0 0 65 6 9.2 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.748837607 0.748837607 1 0.757208723 0.757208723 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.000001 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 67655029 A T - - - - - - 41 0 0 61 5 8.2 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.674903427 0.674903427 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000147 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 69935391 G T - - - - - - 46 0 0 63 6 9.5 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.706649573 0.706649573 1 0.781900312 0.781900312 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.000000832 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 70604549 T G - - - - - - 33 0 0 47 3 6.4 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.622273504 0.622273504 1 0.526753894 0.526753894 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.001719595 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 70650028 T C - - - - - - 26 0 0 45 4 8.9 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.054700855 1.054700855 1 0.732517134 0.732517134 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004473894 1 0.0000791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 70816437 T G - - - - - - 42 0 0 59 5 8.5 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.65391453 0.65391453 1 0.699595016 0.699595016 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.0000125 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 71256139 T C - - - - - - 38 0 0 48 6 12.5 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.054700855 1.054700855 1 1.028816199 1.028816199 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.04888987 1 0.00000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 71259891 A C - - - - - - 40 0 0 50 7 14 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.107435897 1.107435897 1 1.152274143 1.152274143 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 6.46E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 71981032 T A ENSG00000206043 ENST00000382675 r.? - - upstream 29 0 0 46 5 10.9 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.897127726 0.897127726 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000361 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 73025210 T C - - - - - - 34 0 0 58 6 10.3 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.812119658 0.812119658 1 0.847744548 0.847744548 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.000000506 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 74831561 C T MBP CCDS42450.1 r.? - - intronic 37 0 0 55 6 10.9 7 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.897127726 0.897127726 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 75139884 G T - - - - - - 25 0 0 57 7 12.3 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.054700855 1.054700855 1 1.01235514 1.01235514 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004473894 1 1.66E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 76117159 A G - - - - - - 30 0 0 47 6 12.8 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.812119658 0.812119658 1 1.053507788 1.053507788 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.000000141 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 76362144 A T - - - - - - 35 0 0 47 4 8.5 29 2 6.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.72774359 0.72774359 1 0.699595016 0.699595016 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.009279585 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 77364861 A T - - - - - - 41 0 0 32 3 9.4 13 2 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.624239316 1.624239316 1 0.773669782 0.773669782 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001879825 1 0.000556213 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 77891108 C A ADNP2 CCDS32853.1 r.? - - intronic 35 0 0 58 5 8.6 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.707825545 0.707825545 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000115 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 4717668 C A DPP9 CCDS45928.1 r.? - - intronic 38 0 0 46 7 15.2 22 3 13.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 2.600747585 1 1 1 1 0.73235901 0.399252415 2 2 1 1 0.26764099 0.600747585 1.198792337 1.198792337 1 1.038354131 1.038354131 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000179267 1 3.53E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 8880326 A T - - - - - - 20 0 0 29 3 10.3 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 2.600747585 1 1 1 1 0.73235901 0.399252415 2 2 1 1 0.26764099 0.600747585 0 0 1 0.70362155 0.70362155 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000414371 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 11669048 G A ELOF1 CCDS12264.1 r.? - - intronic 45 0 0 58 5 8.6 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 2.600747585 1 1 1 1 0.73235901 0.399252415 2 2 1 1 0.26764099 0.600747585 0 0 1 0.587489837 0.587489837 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000115 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 13612857 C T CACNA1A CCDS45998.1 r.? - - intronic 29 0 0 46 4 8.7 17 3 17.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 2.600747585 1 1 1 1 0.73235901 0.399252415 2 2 1 1 0.26764099 0.600747585 1.551378318 1.551378318 1 0.594321115 0.594321115 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0000807 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 15492902 C G AKAP8 CCDS12329.1 r.? - - upstream 28 0 0 46 4 8.7 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 2.600747585 1 1 1 1 0.73235901 0.399252415 2 2 1 1 0.26764099 0.600747585 0 0 1 0.594321115 0.594321115 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 17363364 T A USHBP1 CCDS12353.1 r.? - - intronic 41 0 0 61 5 8.2 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 2.600747585 1 1 1 1 0.73235901 0.399252415 2 2 1 1 0.26764099 0.600747585 0 0 1 0.560164729 0.560164729 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000147 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 18923516 C A - - - - - - 26 0 0 41 5 12.2 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 2.600747585 1 1 1 1 0.73235901 0.399252415 2 2 1 1 0.26764099 0.600747585 0 0 1 0.833415816 0.833415816 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000202 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 19684133 A C PBX4 CCDS12406.1 r.? - - intronic 25 0 0 42 5 11.9 6 1 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 1.472046473 1.472046473 1 0.979433022 0.979433022 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.029627491 1 0.00000228 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 19769996 G T ATP13A1 CCDS32970.2 r.? - - intronic 32 0 0 45 6 13.3 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 0.881464954 0.881464954 1 1.094660436 1.094660436 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.04888987 1 0.000000108 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 19955671 A C AC011477.2 ENST00000499171 r.? - - intronic 37 0 0 55 5 9.1 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 0.731615912 0.731615912 1 0.748978193 0.748978193 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.00000883 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 20765234 C T - - - - - - 44 0 0 64 5 7.8 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 0 NA 0 0.641981308 0.641981308 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.0000186 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 20993539 A G AC010329.1 ENST00000506371 r.? - - upstream 43 0 0 47 4 8.5 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 0 NA 0 0.699595016 0.699595016 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 22198210 C G ZNF208 ENST00000397126 r.? - - upstream 40 0 0 47 5 10.6 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 0.590581519 NA 0 0.872436137 0.872436137 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.072431031 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 22357130 T C ZNF676 CCDS42539.1 r.? - - downstream 45 0 0 53 6 11.3 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 0.423103178 NA 0 0.930049844 0.930049844 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.099912572 1 0.000000293 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 29343014 T A - - - - - - 45 0 0 44 5 11.4 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 0 NA 0 0.938280374 0.938280374 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00000288 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 29437448 G C - - - - - - 25 0 0 55 9 16.4 21 2 9.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 0.837391706 0.837391706 1 1.349806854 1.349806854 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004928472 1 1.01E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 29440009 T A - - - - - - 17 0 0 30 4 13.3 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 0 NA 0 1.094660436 1.094660436 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.0000154 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 30001289 C G - - - - - - 25 0 0 48 5 10.4 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 0.925538201 0.925538201 1 0.855975078 0.855975078 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 30012324 G A - - - - - - 37 0 0 57 5 8.8 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 1.260494884 1.260494884 1 0.724286604 0.724286604 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002185852 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 30991962 A G ZNF536 CCDS32984.1 r.? - - intronic 38 0 0 63 7 11.1 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 0.493620374 NA 0 0.913588785 0.913588785 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.086275114 1 3.38E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 31061888 G T - - - - - - 25 0 0 43 5 11.6 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 0.520064323 NA 0 0.954741433 0.954741433 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.081683532 1 0.00000257 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 31285784 C T - - - - - - 35 0 0 44 5 11.4 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 0.625840117 NA 0 0.938280374 0.938280374 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.067769881 1 0.00000288 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 32156999 G C - - - - - - 31 0 0 43 5 11.6 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 0.467176425 NA 0 0.954741433 0.954741433 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.090843738 1 0.00000257 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 32488010 C A - - - - - - 56 0 0 60 5 8.3 23 1 4.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 0.37902993 NA 0 0.683133956 0.683133956 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.108890944 1 0.0000136 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 33403205 G C CCDC123 CCDS32987.1 r.? - - intronic 32 0 0 67 9 13.4 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 0.520064323 NA 0 1.102890966 1.102890966 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.081683532 1 6.43E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 35605082 G A FXYD3 CCDS46048.1 r.? - - upstream 39 0 0 47 9 19.1 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 0.520064323 NA 0 1.572031153 1.572031153 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.081683532 1 2.24E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 63058152 A G EHBP1 CCDS1872.1 r.977-2a>g c.495-2A>G p.? ess splice 26 0 0 57 11 19.3 15 0 0 81 0 0 358 32 8.9 313 27 8.6 TRUE TRUE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 1.231565757 1.231565757 1 0.907042735 0.907042735 1 0.567924106 0.567924106 1 2 2 1 1 1 1.3E-24 7.29E-15 2.31E-29 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 19 40953063 G T SERTAD3 CCDS12558.1 r.? - - upstream 38 0 0 41 4 9.8 22 4 18.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 1.604266216 1.604266216 1 0.8065919 0.8065919 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.00000425 1 0.0000546 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 45424989 G C APOC1 CCDS12648.1 r.? - - downstream 19 0 0 35 5 14.3 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 0 NA 0 1.127549299 1.127549299 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000000895 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 47293891 G C SLC1A5 CCDS12692.1 r.? - - upstream 36 0 0 49 7 14.3 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 0 NA 0 1.127549299 1.127549299 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 5.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 47865145 A G DHX34 CCDS12700.1 r.? - - intronic 36 0 0 41 6 14.6 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 0 NA 0 1.15120418 1.15120418 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 6.05E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 48081000 T C - - - - - - 37 0 0 39 6 15.4 14 3 21.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 1.886335001 1.886335001 1 1.214283861 1.214283861 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.0000437 1 4.43E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 48090100 C T - - - - - - 21 0 0 36 4 11.1 13 2 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 1.357456029 1.357456029 1 0.875230575 0.875230575 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001879825 1 0.0000324 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 48428016 C T - - - - - - 11 0 0 26 4 15.4 12 3 25 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 2.203662384 2.203662384 1 1.214283861 1.214283861 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.0000266 1 0.00000856 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 48907357 C T GRIN2D CCDS12719.1 r.? - - intronic 22 0 0 46 7 15.2 9 1 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 0.978426099 0.978426099 1 1.198513941 1.198513941 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.044110422 1 3.53E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 50483739 G A VRK3 CCDS12791.1 r.? - - intronic 25 0 0 33 5 15.2 18 3 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 1.472046473 1.472046473 1 1.198513941 1.198513941 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0000964 1 0.00000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 52009559 A G SIGLEC10 CCDS12833.1 r.? - - upstream 47 0 0 56 5 8.9 26 1 3.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 0.334956682 NA 0 0.701761452 0.701761452 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.122190858 1 0.00000965 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 52117346 C A SIGLEC14 CCDS33088.1 r.? - - intronic 32 0 0 57 7 12.3 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 0.925538201 0.925538201 1 0.969850097 0.969850097 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 1.66E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 54433917 G A CACNG7 CCDS12868.1 r.? - - intronic 30 0 0 40 6 15 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 0 NA 0 1.18274402 1.18274402 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 5.18E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 55498623 T C NLRP2 CCDS12913.1 r.? - - intronic 27 0 0 55 6 10.9 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 0 NA 0 0.859460655 0.859460655 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 55734595 C T TMEM86B CCDS12920.1 r.? - - downstream 23 0 0 53 7 13.2 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 0 NA 0 1.040814738 1.040814738 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 9.85E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 55844963 T G - - - - - - 25 0 0 52 4 7.7 10 0 0 0 0 NA 2 0 0 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 0 NA 0 0.60714193 0.60714193 1 NA NA 0 0 0 1 NA NA 1 1 1 1 0.000139698 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 56437425 C G NLRP13 CCDS33119.1 r.? - - intronic 34 0 0 65 8 12.3 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 0.546508271 NA 0 0.969850097 0.969850097 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.077068876 1 1.53E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 57372435 T A - - - - - - 33 0 0 56 4 7.1 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 0.625840117 NA 0 0.55983217 0.55983217 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.067769881 1 0.000186538 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 57492460 G A - - - - - - 25 0 0 51 6 11.8 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 0 NA 0 0.930425296 0.930425296 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 57763144 T C ZNF805 CCDS46207.1 r.? - - intronic 37 0 0 63 8 12.7 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 1.040128645 1.040128645 1 1.001389937 1.001389937 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.003234386 1 1.18E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 58369674 T A ZNF587 CCDS12964.1 r.? - - intronic 34 0 0 46 3 6.5 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 0.546508271 NA 0 0.512522409 0.512522409 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.077068876 1 0.001615827 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 58798430 G A ZNF8 CCDS12974.1 r.? - - intronic 38 0 0 71 8 11.3 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 0 NA 0 0.891000495 0.891000495 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 3.14E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 1226873 T C SNTG2 CCDS46220.1 r.? - - intronic 37 0 0 43 4 9.3 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.593448784 0.593448784 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 2051986 C A MYT1L CCDS46222.1 r.? - - intronic 34 0 0 41 5 12.2 22 1 4.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.474615385 0.474615385 1 0.778502707 0.778502707 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.104413009 1 0.00000202 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 2051987 T A MYT1L CCDS46222.1 r.? - - intronic 34 0 0 41 4 9.8 23 1 4.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.453521368 0.453521368 1 0.625354633 0.625354633 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.108890944 1 0.0000546 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 3925343 T A - - - - - - 23 0 0 40 4 10 7 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.638116973 0.638116973 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000495 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 6591176 T C - - - - - - 37 0 0 58 5 8.6 9 1 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.170717949 1.170717949 1 0.548780596 0.548780596 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.044110422 1 0.0000115 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 7655228 A G - - - - - - 32 0 0 57 5 8.8 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.706649573 0.706649573 1 0.561542936 0.561542936 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 8500505 G T - - - - - - 38 0 0 45 4 8.9 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.567924106 0.567924106 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 13108894 C T - - - - - - 37 0 0 58 5 8.6 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.548780596 0.548780596 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000115 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 13326919 T A - - - - - - 39 0 0 51 3 5.9 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.622273504 0.622273504 1 0.376489014 0.376489014 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.002175924 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 13378213 G A - - - - - - 46 0 0 41 5 12.2 12 2 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.761350427 1.761350427 1 0.778502707 0.778502707 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.001595918 1 0.00000202 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 14191939 C T - - - - - - 30 0 0 40 5 12.5 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.797646216 0.797646216 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000178 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 15422363 A T NBAS CCDS1685.1 r.? - - intronic 33 0 0 53 3 5.7 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.363726674 0.363726674 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.002429596 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 15613005 T G NBAS CCDS1685.1 r.? - - intronic 39 0 0 50 4 8 29 1 3.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.358598291 0.358598291 1 0.510493578 0.510493578 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.135292269 1 0.000119787 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 17309371 C A - - - - - - 32 0 0 56 7 12.5 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.797646216 0.797646216 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 1.46E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 18126796 C G - - - - - - 30 0 0 43 5 11.6 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.622273504 0.622273504 1 0.740215688 0.740215688 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.00000257 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 22730593 G A - - - - - - 37 0 0 40 4 10 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.244547009 1.244547009 1 0.638116973 0.638116973 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.0000495 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 22988847 A G - - - - - - 39 0 0 47 4 8.5 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.542399427 0.542399427 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 23009805 C A - - - - - - 29 0 0 41 4 9.8 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.625354633 0.625354633 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000546 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 24187981 G T UBXN2A CCDS1704.1 r.? - - intronic 35 0 0 36 5 13.9 22 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.886982592 0.886982592 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000104 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 30686367 A G LCLAT1 CCDS1772.1 r.? - - intronic 32 0 0 41 4 9.8 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.959777778 0.959777778 1 0.625354633 0.625354633 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.05364542 1 0.0000546 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 32288448 G C SPAST CCDS1778.1 r.? - - upstream 39 0 0 26 4 15.4 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.812119658 0.812119658 1 0.982700138 0.982700138 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.00000856 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 32552466 C G - - - - - - 36 0 0 45 4 8.9 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.959777778 0.959777778 1 0.567924106 0.567924106 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.05364542 1 0.0000791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 32788518 C G BIRC6 CCDS33175.2 r.? - - intronic 33 0 0 46 4 8.7 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.244547009 1.244547009 1 0.555161766 0.555161766 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 36058105 G A - - - - - - 41 0 0 54 5 9.3 22 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.593448784 0.593448784 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000806 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 36294458 C G - - - - - - 36 0 0 59 5 8.5 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.748837607 0.748837607 1 0.542399427 0.542399427 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.0000125 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 36296598 A G - - - - - - 39 0 0 58 4 6.9 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.590632479 0.590632479 1 0.440300711 0.440300711 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.000213772 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 36632585 A T CRIM1 CCDS1783.1 r.? - - intronic 25 0 0 50 4 8 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.706649573 0.706649573 1 0.510493578 0.510493578 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.000119787 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 37792950 G T - - - - - - 35 0 0 52 5 9.6 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.612592294 0.612592294 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000668 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 37940636 G T CDC42EP3 ENST00000453555 r.? - - intronic 53 0 0 43 6 14 22 2 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.959777778 0.959777778 1 0.893363762 0.893363762 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.005403392 1 8.13E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 41100342 A G - - - - - - 39 0 0 46 6 13 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.527350427 0.527350427 1 0.829552064 0.829552064 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.000000123 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 41312836 T C - - - - - - 29 0 0 62 9 14.5 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.65391453 0.65391453 1 0.92526961 0.92526961 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 3.12E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 41523895 G T - - - - - - 46 0 0 45 4 8.9 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.65391453 0.65391453 1 0.567924106 0.567924106 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.0000791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 47032456 G T - - - - - - 33 0 0 52 5 9.6 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.558991453 0.558991453 1 0.612592294 0.612592294 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.00000668 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 48710868 C G KLRAQ1 CCDS46279.1 r.? - - intronic 36 0 0 40 7 17.5 16 3 18.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.982837607 1.982837607 1 1.116704702 1.116704702 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.0000667 1 1.26E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 49634674 C G - - - - - - 34 0 0 46 5 10.9 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.6955475 0.6955475 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000361 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 50617047 T C NRXN1 CCDS46282.1 r.? - - intronic 29 0 0 47 7 14.9 18 3 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.761350427 1.761350427 1 0.950794289 0.950794289 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000964 1 4.12E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 50918688 C G NRXN1 CCDS46282.1 r.? - - intronic 37 0 0 54 4 7.4 8 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.47220656 0.47220656 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 51906498 G A - - - - - - 45 0 0 56 5 8.9 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.567924106 0.567924106 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000965 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 52149080 C A - - - - - - 39 0 0 54 6 11.1 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.70830984 0.70830984 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000329 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 53283933 C G - - - - - - 45 0 0 54 6 11.1 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.244547009 1.244547009 1 0.70830984 0.70830984 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.000000329 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 53960837 C T ASB3 CCDS1847.1 r.? - - intronic 43 0 0 50 5 10 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.638116973 0.638116973 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 57171953 T G - - - - - - 37 0 0 59 7 11.9 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.748837607 0.748837607 1 0.759359197 0.759359197 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.067769881 1 2.12E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 59874888 C G - - - - - - 42 0 0 47 5 10.6 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.65391453 0.65391453 1 0.676403991 0.676403991 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 61946855 G T - - - - - - 52 0 0 55 5 9.1 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.580686445 0.580686445 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000883 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 62790604 T C - - - - - - 52 0 0 54 5 9.3 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.593448784 0.593448784 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000806 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 63440466 G C C2orf86 CCDS42688.1 r.? - - intronic 38 0 0 48 4 8.3 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.529637087 0.529637087 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000102016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 64767939 G T AFTPH CCDS46303.1 r.? - - intronic 32 0 0 55 6 10.9 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.558991453 0.558991453 1 0.6955475 0.6955475 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 65723553 G C - - - - - - 43 0 0 53 4 7.5 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.478587729 0.478587729 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 68627084 A C PLEK CCDS1887.1 r.? - - downstream 40 0 0 59 5 8.5 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.244547009 1.244547009 1 0.542399427 0.542399427 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.0000125 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 69439694 A T ANTXR1 CCDS1892.1 r.? - - intronic 44 0 0 51 4 7.8 29 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.497731239 0.497731239 1 NA NA 1 NA NA 0 1 NA 1 1 1 1 0.000129466 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 72832221 G C EXOC6B CCDS46333.1 r.? - - intronic 36 0 0 57 7 12.3 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.784883876 0.784883876 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 1.66E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 72993317 G T EXOC6B CCDS46333.1 r.? - - intronic 39 0 0 44 4 9.1 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.580686445 0.580686445 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000723 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 78327444 A T - - - - - - 40 0 0 47 3 6.4 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 2 0 0 TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.408394862 0.408394862 1 0 0 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.001719595 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 78983631 T G - - - - - - 34 0 0 44 3 6.8 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.65391453 0.65391453 1 0.433919541 0.433919541 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.00142027 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 79793006 C T CTNNA2 CCDS42703.2 r.? - - intronic 34 0 0 55 6 10.9 22 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.6955475 0.6955475 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 79878084 A G CTNNA2 CCDS42703.2 r.? - - intronic 33 0 0 59 7 11.9 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.759359197 0.759359197 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 2.12E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 79896388 T C CTNNA2 CCDS42703.2 r.? - - intronic 40 0 0 41 5 12.2 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.812119658 0.812119658 1 0.778502707 0.778502707 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.00000202 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 80642015 A C CTNNA2 CCDS42703.2 r.? - - intronic 38 0 0 51 4 7.8 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.497731239 0.497731239 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000129466 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 81995728 C T - - - - - - 33 0 0 47 6 12.8 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.816789725 0.816789725 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000141 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 82660720 G A - - - - - - 42 0 0 53 7 13.2 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.842314404 0.842314404 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 9.85E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 83401175 C G - - - - - - 34 0 0 35 6 17.1 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.590632479 0.590632479 1 1.091180023 1.091180023 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 2.24E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 100440783 G C AFF3 CCDS42723.1 r.? - - intronic 24 0 0 55 7 12.7 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.244547009 1.244547009 1 0.810408555 0.810408555 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003234386 1 1.28E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 100947284 G T - - - - - - 46 0 0 55 4 7.3 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.46582539 0.46582539 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000173903 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 101276424 G T - - - - - - 35 0 0 71 5 7 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.527350427 0.527350427 1 0.446681881 0.446681881 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.0000309 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 101739568 C T TBC1D8 CCDS46375.1 r.? - - intronic 37 0 0 39 4 10.3 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.812119658 0.812119658 1 0.657260482 0.657260482 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.0000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 102290055 C T - - - - - - 29 0 0 48 5 10.4 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.107435897 1.107435897 1 0.663641651 0.663641651 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 105419336 C T - - - - - - 36 0 0 57 6 10.5 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.670022821 0.670022821 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000456 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 106080043 G A - - - - - - 41 0 0 52 7 13.5 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.748837607 0.748837607 1 0.861457913 0.861457913 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.067769881 1 8.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 107547405 C G - - - - - - 42 0 0 41 4 9.8 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.625354633 0.625354633 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000546 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 115028301 A G - - - - - - 44 0 0 60 7 11.7 31 3 9.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.023059829 1.023059829 1 0.746596858 0.746596858 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000505952 1 2.39E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 115784942 T A DPP10 CCDS46400.1 r.? - - intronic 30 0 0 47 4 8.5 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.748837607 0.748837607 1 0.542399427 0.542399427 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 115838740 T A DPP10 CCDS46400.1 r.? - - intronic 38 0 0 44 3 6.8 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.527350427 0.527350427 1 0.433919541 0.433919541 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.00142027 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 116154653 G C DPP10 CCDS46400.1 r.? - - intronic 35 0 0 59 5 8.5 23 2 8.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.917589744 0.917589744 1 0.542399427 0.542399427 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.00589844 1 0.0000125 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 117258249 G A - - - - - - 33 0 0 55 6 10.9 21 4 19 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 2.003931624 2.003931624 1 0.6955475 0.6955475 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.00000349 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 120303684 G C ENSG00000163075 CCDS33282.1 r.103g>c c.? p.? 5'UTR variant 36 0 0 69 4 5.8 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.244547009 1.244547009 1 0.370107844 0.370107844 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.000416985 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 121623164 G A GLI2 CCDS33283.1 r.? - - intronic 42 0 0 44 4 9.1 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.580686445 0.580686445 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000723 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 123546127 T A - - - - - - 44 0 0 52 3 5.8 9 2 22.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 2.341435897 2.341435897 1 0.370107844 0.370107844 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000879235 1 0.002300591 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 124295590 A G - - - - - - 35 0 0 55 4 7.3 18 3 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.761350427 1.761350427 1 0.46582539 0.46582539 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000964 1 0.000173903 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 125910573 C A - - - - - - 43 0 0 49 5 10.2 18 2 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.170717949 1.170717949 1 0.650879312 0.650879312 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003626632 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 126121752 G C - - - - - - 49 0 0 55 7 12.7 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.622273504 0.622273504 1 0.810408555 0.810408555 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 1.28E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 126165712 A G - - - - - - 30 0 0 40 4 10 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.244547009 1.244547009 1 0.638116973 0.638116973 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.0000495 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 126222741 G C - - - - - - 37 0 0 50 7 14 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.590632479 0.590632479 1 0.893363762 0.893363762 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 6.46E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 127043040 A G - - - - - - 43 0 0 50 6 12 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.054700855 1.054700855 1 0.765740367 0.765740367 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.04888987 1 0.000000206 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 130529565 T C - - - - - - 41 0 0 57 6 10.5 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.508222222 1.508222222 1 0.670022821 0.670022821 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002185852 1 0.000000456 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 135378250 T G TMEM163 CCDS2172.1 r.? - - intronic 40 0 0 53 5 9.4 17 3 17.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.856273504 1.856273504 1 0.599829954 0.599829954 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000807 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 136309266 T G R3HDM1 CCDS2177.1 r.? - - intronic 27 0 0 44 3 6.8 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.622273504 0.622273504 1 0.433919541 0.433919541 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.00142027 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 137362233 G T - - - - - - 44 0 0 62 5 8.1 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.516874748 0.516874748 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 137754931 G T THSD7B ENST00000409968 r.? - - intronic 35 0 0 46 4 8.7 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.244547009 1.244547009 1 0.555161766 0.555161766 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 138275410 G A THSD7B ENST00000409968 r.? - - intronic 34 0 0 47 6 12.8 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.816789725 0.816789725 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000141 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 140705579 T C - - - - - - 26 0 0 39 5 12.8 7 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.816789725 0.816789725 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000156 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 141102588 C G LRP1B CCDS2182.1 r.? - - intronic 32 0 0 38 5 13.2 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.508222222 1.508222222 1 0.842314404 0.842314404 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002185852 1 0.00000137 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 143362409 G C - - - - - - 40 0 0 49 3 6.1 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.389251353 0.389251353 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.001939399 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 144214433 T A ARHGAP15 CCDS2184.1 r.? - - intronic 52 0 0 45 3 6.7 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.65391453 0.65391453 1 0.427538372 0.427538372 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.001516071 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 144638436 T C - - - - - - 42 0 0 47 5 10.6 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.054700855 1.054700855 1 0.676403991 0.676403991 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004473894 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 144832117 G A GTDC1 CCDS33300.1 r.? - - intronic 33 0 0 53 6 11.3 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.959777778 0.959777778 1 0.721072179 0.721072179 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.05364542 1 0.000000293 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 148131309 A G - - - - - - 30 0 0 55 5 9.1 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.580686445 0.580686445 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000883 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 149115975 G C MBD5 CCDS33302.1 r.? - - intronic 44 0 0 63 4 6.3 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.65391453 0.65391453 1 0.402013693 0.402013693 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.000294233 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 150322517 A G LYPD6 CCDS2188.1 r.? - - intronic 39 0 0 66 5 7.6 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.484968899 0.484968899 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000217 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 150869966 G C - - - - - - 36 0 0 58 6 10.3 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.527350427 0.527350427 1 0.657260482 0.657260482 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.000000506 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 151396369 T G RND3 ENST00000439275 r.? - - upstream 45 0 0 50 5 10 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.638116973 0.638116973 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 152644222 T G - - - - - - 35 0 0 57 5 8.8 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.561542936 0.561542936 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 153824992 C T - - - - - - 40 0 0 42 5 11.9 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.759359197 0.759359197 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000228 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 154683433 C A - - - - - - 24 0 0 50 6 12 21 5 23.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 2.510188034 1.255094017 2 0.765740367 0.765740367 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 5.95E-08 1 0.000000206 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 157925598 T A - - - - - - 45 0 0 53 5 9.4 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.402752137 1.402752137 1 0.599829954 0.599829954 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002513772 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 159973100 G T TANC1 CCDS42766.1 r.? - - intronic 31 0 0 39 4 10.3 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.657260482 0.657260482 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 165553939 A T COBLL1 CCDS2223.2 r.? - - intronic 54 0 0 59 5 8.5 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.590632479 0.590632479 1 0.542399427 0.542399427 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.0000125 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 166911363 A T SCN1A CCDS33316.1 r.? - - intronic 34 0 0 60 5 8.3 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.706649573 0.706649573 1 0.529637087 0.529637087 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.0000136 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 167599926 C A - - - - - - 32 0 0 49 4 8.2 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.812119658 0.812119658 1 0.523255917 0.523255917 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 168508712 A G - - - - - - 40 0 0 50 4 8 25 2 8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.843760684 0.843760684 1 0.510493578 0.510493578 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.006948068 1 0.000119787 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 170431831 G A FASTKD1 CCDS33318.1 r.? - - upstream 12 0 0 18 6 33.3 7 4 57.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 6.02234188 3.01117094 2 2.124929519 1.84673684 1.15064013 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 2.16E-08 1 2.75E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 171481992 T G MYO3B CCDS42773.1 r.? - - intronic 35 0 0 56 5 8.9 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.567924106 0.567924106 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000965 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 174063262 T C ENSG00000091436 CCDS2251.1 r.? - - intronic 31 0 0 43 7 16.3 23 1 4.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.453521368 0.453521368 1 1.040130665 1.040130665 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.108890944 1 2.15E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 174846329 C G - - - - - - 38 0 0 45 4 8.9 18 2 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.170717949 1.170717949 1 0.567924106 0.567924106 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003626632 1 0.0000791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 175967421 C G ATF2 CCDS2262.1 r.? - - intronic 37 0 0 61 4 6.6 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.421157202 0.421157202 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000259828 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 177893061 G C - - - - - - 40 0 0 61 5 8.2 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.590632479 0.590632479 1 0.523255917 0.523255917 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.0000147 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 178440177 T C - - - - - - 36 0 0 53 4 7.5 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.478587729 0.478587729 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 180631511 G T ZNF385B CCDS33339.1 r.? - - intronic 36 0 0 48 7 14.6 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.93165078 0.93165078 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 4.81E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 181734614 A G - - - - - - 34 0 0 53 5 9.4 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.599829954 0.599829954 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 181981909 G C - - - - - - 52 0 0 60 4 6.7 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.244547009 1.244547009 1 0.427538372 0.427538372 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.000243755 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 182881215 C A PPP1R1C CCDS46468.1 r.? - - intronic 37 0 0 52 4 7.7 26 1 3.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.400786325 0.400786325 1 0.491350069 0.491350069 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.122190858 1 0.000139698 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 186263450 G A - - - - - - 51 0 0 48 5 10.4 22 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.663641651 0.663641651 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 186847695 A C - - - - - - 37 0 0 39 4 10.3 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.657260482 0.657260482 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 187091091 C T - - - - - - 37 0 0 45 7 15.6 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.995462477 0.995462477 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000003 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 187612250 A G FAM171B CCDS33347.1 r.? - - intronic 45 0 0 56 4 7.1 25 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.453063051 0.453063051 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000186538 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 188395923 T A TFPI CCDS2294.1 r.? - - intronic 36 0 0 44 3 6.8 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.812119658 0.812119658 1 0.433919541 0.433919541 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.00142027 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 191555878 C A NAB1 CCDS2307.1 r.2744c>a c.? p.? 3'UTR variant 35 0 0 69 9 13 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.812119658 0.812119658 1 0.829552064 0.829552064 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.063085307 1 8.45E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 195005915 C A - - - - - - 31 0 0 45 4 8.9 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.567924106 0.567924106 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 195894756 G C - - - - - - 42 0 0 64 5 7.8 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.497731239 0.497731239 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000186 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 196570119 G C SLC39A10 CCDS33353.1 r.? - - intronic 36 0 0 53 5 9.4 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.590632479 0.590632479 1 0.599829954 0.599829954 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 199742985 T C - - - - - - 32 0 0 34 5 14.7 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.93803195 0.93803195 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000771 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 201439729 G A SGOL2 CCDS42796.1 r.? - - intronic 27 0 0 37 4 10.8 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.959777778 0.959777778 1 0.68916633 0.68916633 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.05364542 1 0.0000362 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 202021718 G C CFLAR CCDS2337.1 r.? - - intronic 27 0 0 54 5 9.3 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.593448784 0.593448784 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000806 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 204616424 A C - - - - - - 40 0 0 48 3 6.2 17 0 0 0 0 NA 2 0 0 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.395632523 0.395632523 1 NA NA 1 0 NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.001827434 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 210827513 C A UNC80 CCDS46504.1 r.? - - intronic 40 0 0 58 4 6.9 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.440300711 0.440300711 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000213772 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 211145969 A C - - - - - - 34 0 0 68 5 7.4 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.875401709 0.875401709 1 0.47220656 0.47220656 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.0000251 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 213207497 C A ERBB4 CCDS2394.1 r.? - - intronic 38 0 0 54 5 9.3 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.748837607 0.748837607 1 0.593448784 0.593448784 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.00000806 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 217606543 C T - - - - - - 32 0 0 67 6 9 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.706649573 0.706649573 1 0.574305275 0.574305275 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.0000012 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 217858454 G C - - - - - - 58 0 0 57 5 8.8 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.622273504 0.622273504 1 0.561542936 0.561542936 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 219279273 A G VIL1 CCDS2417.1 r.? - - upstream 32 0 0 67 6 9 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.574305275 0.574305275 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000012 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 220069644 A C ABCB6 CCDS2436.1 r.? - - downstream 37 0 0 43 4 9.3 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.593448784 0.593448784 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 226617658 G A - - - - - - 46 0 0 46 6 13 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.65391453 0.65391453 1 0.829552064 0.829552064 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.000000123 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 227207132 A T - - - - - - 41 0 0 54 3 5.6 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.357345505 0.357345505 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00256299 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 227767439 T A RHBDD1 CCDS2464.1 r.? - - intronic 39 0 0 45 3 6.7 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.812119658 0.812119658 1 0.427538372 0.427538372 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.001516071 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 229458514 T A - - - - - - 26 0 0 42 4 9.5 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.606211124 0.606211124 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000601 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 231799687 C A GPR55 CCDS2480.1 r.? - - intronic 40 0 0 42 4 9.5 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.606211124 0.606211124 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000601 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 232203740 A C ARMC9 CCDS2484.1 r.? - - intronic 40 0 0 54 6 11.1 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.558991453 0.558991453 1 0.70830984 0.70830984 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.000000329 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 236677808 C A AGAP1 CCDS33408.1 r.? - - intronic 33 0 0 41 4 9.8 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.625354633 0.625354633 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000546 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 238080308 T G - - - - - - 32 0 0 59 5 8.5 20 6 30 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 3.164102564 1.582051282 2 0.542399427 0.542399427 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 5.7E-10 1 0.0000125 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 238838073 T A - - - - - - 24 0 0 45 10 22.2 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 1.416619679 1.416619679 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 2.66E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 242143458 C T ANO7 CCDS33423.1 r.? - - intronic 45 0 0 39 4 10.3 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.657260482 0.657260482 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 243076794 A G - - - - - - 37 0 0 58 5 8.6 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.548780596 0.548780596 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000115 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 167407 A C DEFB128 CCDS33430.1 r.? - - downstream 48 0 0 61 9 14.8 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 1.06618642 1.06618642 1 1.156866515 1.156866515 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004039874 1 2.68E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 785966 A G - - - - - - 35 0 0 51 11 21.6 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0 0 1 1.688399778 0.844199889 2 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 1.94E-15 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 1063873 G A - - - - - - 42 0 0 59 7 11.9 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0.568632757 0.568632757 1 0.930183211 0.930183211 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 2.12E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 2699703 G C EBF4 CCDS46573.1 r.? - - intronic 40 0 0 58 5 8.6 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0 0 1 0.672233245 0.672233245 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000115 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 3248569 T G C20orf194 CCDS42851.1 r.? - - intronic 35 0 0 58 5 8.6 29 1 3.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0.345241317 0.345241317 1 0.672233245 0.672233245 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.135292269 1 0.0000115 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 4497850 A G - - - - - - 28 0 0 36 9 25 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 1.452044362 1.452044362 1 1.95416641 0.977083205 2 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002185852 1 1.63E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 5446991 C G - - - - - - 29 0 0 36 4 11.1 19 3 15.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 1.604356708 1.604356708 1 0.867649886 0.867649886 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000114071 1 0.0000324 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 7016856 G C - - - - - - 40 0 0 59 6 10.2 21 5 23.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 2.416689218 1.208344609 2 0.797299895 0.797299895 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 5.95E-08 1 0.000000561 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 7758692 G A - - - - - - 33 0 0 54 7 13 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 1.452044362 1.452044362 1 1.016166533 1.016166533 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002185852 1 1.13E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 7906814 A G HAO1 CCDS13100.1 r.? - - intronic 29 0 0 46 4 8.7 12 2 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 1.695744115 1.695744115 1 0.680049911 0.680049911 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.001595918 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 10984370 T G - - - - - - 36 0 0 62 6 9.7 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0 0 1 0.758216567 0.758216567 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000756 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 11614259 A T - - - - - - 8 0 0 15 4 26.7 5 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0 0 1 2.087049726 2.087049726 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000816 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 12615962 G T - - - - - - 11 0 0 18 3 16.7 1 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0 0 1 1.305383162 1.305383162 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000964 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 14956416 C G MACROD2 CCDS13120.2 r.? - - intronic 41 0 0 50 4 8 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0 0 1 0.625333251 0.625333251 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000119787 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 16029866 A T MACROD2 CCDS13120.2 r.? - - intronic 39 0 0 60 4 6.7 22 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0 0 1 0.523716598 0.523716598 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000243755 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 18884596 T C - - - - - - 42 0 0 62 6 9.7 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0 0 1 0.758216567 0.758216567 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000756 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 21867042 C A - - - - - - 40 0 0 47 5 10.6 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0 0 1 0.828566558 0.828566558 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 22069398 G T - - - - - - 34 0 0 38 7 18.4 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0 0 1 1.438266478 1.438266478 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 8.61E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 23495945 C T - - - - - - 40 0 0 57 5 8.8 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0 0 1 0.687866576 0.687866576 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 23636288 G T - - - - - - 39 0 0 47 4 8.5 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0.629557696 0.629557696 1 0.664416579 0.664416579 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 24385562 A C - - - - - - 39 0 0 66 4 6.1 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0 0 1 0.476816604 0.476816604 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000351793 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 25121255 T A - - - - - - 20 0 0 57 5 8.8 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 1.198190453 1.198190453 1 0.687866576 0.687866576 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 25598524 C G NANP CCDS13173.1 r.? - - intronic 38 0 0 59 4 6.8 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0 0 1 0.531533263 0.531533263 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00022841 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 25717335 A T - - - - - - 39 0 0 57 5 8.8 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0 0 1 0.687866576 0.687866576 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 31903208 T A - - - - - - 33 0 0 46 6 13 13 2 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 1.563740083 1.563740083 1 1.016166533 1.016166533 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.001879825 1 0.000000123 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 52305166 G A - - - - - - 29 0 0 41 6 14.6 5 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0 0 1 1.141233183 1.141233183 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 6.05E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 53134811 C T DOK5 CCDS13446.1 r.? - - intronic 30 0 0 48 4 8.3 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0 0 1 0.648783248 0.648783248 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000102016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 53515110 C G - - - - - - 45 0 0 53 5 9.4 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0 0 1 0.73476657 0.73476657 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 53760963 T C - - - - - - 51 0 0 51 5 9.8 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0 0 1 0.766033233 0.766033233 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000606 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 54350999 G C - - - - - - 36 0 0 68 4 5.9 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 1.015415638 1.015415638 1 0.461183273 0.461183273 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.04888987 1 0.000394372 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 59107360 A G ENSG00000237240 ENST00000456299 r.? - - intronic 33 0 0 58 5 8.6 9 1 11.1 0 0 NA 0 0 NA 2 0 0 TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 1.127111358 1.127111358 1 0.672233245 0.672233245 1 0 0 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.044110422 1 0.0000115 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 59107361 G A ENSG00000237240 ENST00000456299 r.? - - intronic 33 0 0 57 5 8.8 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 2 0 0 TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 1.015415638 1.015415638 1 0.687866576 0.687866576 1 0 0 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.04888987 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 62099052 T C KCNQ2 CCDS13520.1 r.? - - intronic 33 0 0 58 7 12.1 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0.538170288 0.538170288 1 0.945816542 0.945816542 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 1.88E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 21 14412799 T G - - - - - - 65 0 0 72 7 9.7 31 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 0 0 1 0.618225012 0.618225012 1 NA NA 1 NA NA 0 1 NA 1 1 1 1 8.66E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 21 14738685 C T - - - - - - 41 0 0 46 6 13 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 0.452991453 0.452991453 1 0.828548985 0.828548985 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.000000123 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 21 14879250 G A - - - - - - 35 0 0 27 5 18.5 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 1.068376068 1.068376068 1 1.179088941 1.179088941 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.00000023 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 21 14879251 T C - - - - - - 34 0 0 28 5 17.9 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 1.068376068 1.068376068 1 1.140848218 1.140848218 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.000000279 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 21 14891055 C G - - - - - - 42 0 0 45 4 8.9 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 0.452991453 0.452991453 1 0.567237382 0.567237382 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.0000791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 21 15090331 C A - - - - - - 14 0 0 16 4 25 4 1 25 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 2.136752137 2.136752137 1 1.593363434 1.593363434 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.019850499 1 0.00000108 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 21 15517231 A T LIPI CCDS13564.1 r.? - - intronic 48 0 0 35 4 11.4 22 1 4.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 0.384615385 0.384615385 1 0.726573726 0.726573726 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.104413009 1 0.0000289 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 21 20019794 G T - - - - - - 42 0 0 57 4 7 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 1.008547009 1.008547009 1 0.446141761 0.446141761 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.000199821 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 21 22437116 T G NCAM2 CCDS42910.1 r.? - - intronic 36 0 0 53 4 7.5 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 0.427350427 0.427350427 1 0.47800903 0.47800903 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 21 24178808 G T - - - - - - 41 0 0 53 6 11.3 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 0 0 1 0.720200272 0.720200272 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000293 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 21 24351747 C G - - - - - - 44 0 0 56 7 12.5 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 0.52991453 0.52991453 1 0.796681717 0.796681717 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 1.46E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 21 25398871 T A - - - - - - 45 0 0 50 7 14 21 2 9.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 0.811965812 0.811965812 1 0.892283523 0.892283523 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004928472 1 6.46E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 21 27648817 C T - - - - - - 32 0 0 47 5 10.6 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 0 0 1 0.675586096 0.675586096 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 21 29003467 C A - - - - - - 51 0 0 60 4 6.7 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 0 0 1 0.4270214 0.4270214 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000243755 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 21 30963129 G C GRIK1 CCDS42913.1 r.? - - intronic 33 0 0 45 4 8.9 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 0 0 1 0.567237382 0.567237382 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 21 32940328 A T - - - - - - 40 0 0 52 4 7.7 21 2 9.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 0.811965812 0.811965812 1 0.490755938 0.490755938 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004928472 1 0.000139698 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 21 35923320 T A RCAN1 CCDS42921.1 r.? - - intronic 37 0 0 62 5 8.1 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 0.452991453 0.452991453 1 0.516249752 0.516249752 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 21 37445340 T A CBR1 CCDS13641.1 r.1169u>a c.? p.? 3'UTR variant 51 0 0 62 5 8.1 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 0.777777778 0.777777778 1 0.516249752 0.516249752 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.05364542 1 0.000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 21 40245179 C T - - - - - - 38 0 0 63 6 9.5 25 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 0 0 1 0.605478105 0.605478105 1 NA NA 1 NA NA 1 1 NA 1 1 1 1 0.000000832 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 21 44135651 C G PDE9A CCDS13690.1 r.? - - intronic 33 0 0 58 4 6.9 22 1 4.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 0.384615385 0.384615385 1 0.439768308 0.439768308 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.104413009 1 0.000213772 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 16269599 T A POTEH CCDS46658.1 r.? - - intronic 10 0 0 10 3 30 3 2 66.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.586035395 1 1 1 1 0.346847308 0.413964605 2 2 1 1 0.653152692 0.586035395 6.136507546 3.712002876 1.653152692 2.044969497 2.044969497 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.0000748 1 0.0000146 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 27620810 G A - - - - - - 33 0 0 40 5 12.5 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.586035395 1 1 1 1 0.346847308 0.413964605 2 2 1 1 0.653152692 0.586035395 0 0 1 0.852070624 0.852070624 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000178 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 28834322 A C TTC28 CCDS46678.1 r.? - - intronic 49 0 0 67 16 23.9 19 3 15.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.586035395 1 1 1 1 0.346847308 0.413964605 2 2 1 1 0.653152692 0.586035395 1.453625476 1.453625476 1 1.629159033 1.027189581 1.586035395 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.000114071 1 1.35E-22 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 29054167 T A TTC28 CCDS46678.1 r.? - - intronic 26 0 0 84 4 4.8 24 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.653152692 6 1 4 1 2 0.346847308 1 2 NA 1 NA 0.653152692 NA 0 NA 0 0.491065421 0.491065421 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000877031 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 29205622 A G - - - - - - 30 1 3.3 85 6 7.1 26 2 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 6 1 4 1 2 0.346847308 1 2 NA 1 NA 0.653152692 NA 0.708412415 0.708412415 1 0.726367601 0.726367601 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 0.139615808 1 0.007502227 1 0.00000487 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 29359758 C G ZNRF3 CCDS42999.1 r.? - - intronic 43 0 0 77 6 7.8 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.653152692 6 1 4 1 2 0.346847308 1 2 NA 1 NA 0.653152692 NA 0 NA 0 0.797981308 0.797981308 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00000273 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 29550718 A T KREMEN1 CCDS13849.1 r.? - - intronic 37 0 0 95 5 5.3 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.653152692 6 1 4 1 2 0.346847308 1 2 NA 1 NA 0.653152692 NA 0 NA 0 0.542218069 0.542218069 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000124602 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 30083284 C T NF2 CCDS13861.1 r.? - - intronic 38 0 0 64 7 10.9 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.653152692 6 1 4 1 2 0.346847308 1 2 NA 1 NA 0.653152692 NA 0.515209029 NA 0 1.115127726 1.115127726 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.086275114 1 3.78E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 30210591 G A ASCC2 CCDS13869.1 r.? - - intronic 38 0 0 66 9 13.6 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 6 1 4 1 2 0.346847308 1 2 NA 1 NA 0.653152692 NA 0.96601693 0.96601693 1 1.391352025 1.391352025 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 5.59E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 32120289 A G C22orf30 CCDS13900.2 r.? - - intronic 45 0 0 72 5 6.9 26 3 11.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 6 1 4 1 2 0.346847308 1 2 NA 1 NA 0.653152692 NA 1.058018542 1.058018542 1 0.705906542 0.705906542 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000298167 1 0.0000331 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 32942777 G A SYN3 CCDS13908.1 r.? - - intronic 31 0 0 56 6 10.7 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 0 0 1 0.732797785 0.732797785 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000409 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 33230028 C A TIMP3 CCDS13911.1 r.? - - intronic 44 0 0 55 13 23.6 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 0.515209029 0.515209029 1 1.616264273 0.998897709 1.618047833 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 1.46E-18 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 33415388 G A SYN3 CCDS13908.1 r.? - - intronic 32 0 0 50 5 10 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 0 0 1 0.684857743 0.684857743 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 37173214 G A RABL4 CCDS13932.1 r.? - - upstream 50 0 0 36 7 19.4 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 0.653211448 0.653211448 1 1.328624021 1.328624021 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.067769881 1 5.74E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 37269710 G A NCF4 CCDS13935.1 r.? - - intronic 40 0 0 39 6 15.4 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 0.616410803 0.616410803 1 1.054680924 1.054680924 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.072431031 1 4.43E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 38085432 C G NOL12 CCDS13955.1 r.? - - intronic 34 0 0 38 4 10.5 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 0.542809513 0.542809513 1 0.71910063 0.71910063 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.0000403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 39928359 C A RPS19BP1 CCDS13997.1 r.? - - intronic 35 0 0 49 5 10.2 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 0 0 1 0.698554898 0.698554898 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 40392701 T G FAM83F CCDS14000.2 r.? - - intronic 39 0 0 43 7 16.3 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 0.96601693 0.96601693 1 1.116318121 1.116318121 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 2.15E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 41221524 A C FAM10A4 CCDS14006.1 r.2610u>g c.? p.? 3'UTR variant 37 0 0 44 4 9.1 26 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 0 0 1 0.623220546 0.623220546 1 NA NA 0 NA NA 1 1 NA 1 1 1 1 0.0000723 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 41429610 C G - - - - - - 31 0 0 35 3 8.6 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 0 0 1 0.588977659 0.588977659 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000725791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 41455078 G T - - - - - - 41 0 0 31 4 12.9 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 0.763613383 0.763613383 1 0.883466488 0.883466488 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.0000177 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 41864892 T G ACO2 CCDS14017.1 r.? - - upstream 43 0 0 32 4 12.5 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 0 0 1 0.856072178 0.856072178 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000201 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 43199847 A C ARFGAP3 CCDS14042.1 r.? - - intronic 33 0 0 41 4 9.8 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 0 0 1 0.671160588 0.671160588 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000546 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 43908179 G A - - - - - - 43 0 0 42 4 9.5 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 0 0 1 0.650614856 0.650614856 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000601 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 44951416 A T - - - - - - 31 0 0 49 6 12.2 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 1.223621445 1.223621445 1 0.835526446 0.835526446 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002513772 1 0.000000182 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 46164935 G A ATXN10 CCDS14070.1 r.? - - intronic 36 0 0 41 5 12.2 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 0.487608546 0.487608546 1 0.835526446 0.835526446 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.00000202 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 47527481 G T TBC1D22A CCDS14078.1 r.? - - intronic 38 0 0 46 4 8.7 6 1 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 1.536426927 1.536426927 1 0.595826236 0.595826236 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.029627491 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 47732838 C A - - - - - - 37 0 0 60 4 6.7 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 0 0 1 0.458854688 0.458854688 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000243755 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 48125989 T G - - - - - - 29 0 0 52 4 7.7 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 0 0 1 0.527340462 0.527340462 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000139698 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 48391710 T A - - - - - - 43 0 0 48 4 8.3 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 0 0 1 0.568431927 0.568431927 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000102016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 22 50035584 C T C22orf34 ENST00000380976 r.? - - intronic 43 0 0 42 4 9.5 9 1 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 1.021217897 1.021217897 1 0.650614856 0.650614856 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.044110422 1 0.0000601 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 1046039 A T - - - - - - 29 0 0 56 5 8.9 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.517036035 0.517036035 1 0.618451002 0.618451002 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.00000965 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 1066733 A G - - - - - - 46 0 0 54 4 7.4 18 3 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 1.541875318 1.541875318 1 0.514217687 0.514217687 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0000964 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 1378932 A G CNTN6 CCDS2557.1 r.? - - intronic 29 0 0 46 4 8.7 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.461639317 0.461639317 1 0.604553227 0.604553227 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 2907789 T G CNTN4 CCDS43041.1 r.? - - intronic 44 0 0 49 4 8.2 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.569808788 0.569808788 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 2931995 C G CNTN4 CCDS43041.1 r.? - - intronic 35 0 0 57 4 7 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.486422136 0.486422136 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000199821 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 3603873 G T - - - - - - 29 0 0 49 6 12.2 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.847764295 0.847764295 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000182 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 3680010 A C - - - - - - 43 0 0 57 5 8.8 8 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.611502114 0.611502114 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 5445768 A T - - - - - - 38 0 0 52 4 7.7 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.544734394 0.544734394 1 0.53506435 0.53506435 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.000139698 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 5797375 G C - - - - - - 40 0 0 36 4 11.1 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.771326531 0.771326531 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000324 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 6111738 C T - - - - - - 37 0 0 59 11 18.6 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.969442565 0.969442565 1 1.292493105 1.292493105 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 1.1E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 7704779 A G GRM7 CCDS43042.1 r.? - - intronic 34 0 0 47 4 8.5 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.590655451 0.590655451 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 15839175 A T ANKRD28 CCDS46769.1 r.? - - intronic 29 0 0 43 5 11.6 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.806070969 0.806070969 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000257 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 18865712 T C - - - - - - 36 0 0 36 4 11.1 10 2 20 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 1.846557267 1.846557267 1 0.771326531 0.771326531 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001095391 1 0.0000324 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 20078166 G A KAT2B CCDS2634.1 r.? - - upstream 19 0 0 38 6 15.8 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 1.097924251 1.097924251 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 3.76E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 22023219 G T - - - - - - 58 0 0 57 4 7 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 1.227960582 1.227960582 1 0.486422136 0.486422136 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002513772 1 0.000199821 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 22630178 A T - - - - - - 34 0 0 55 8 14.5 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.618596684 0.618596684 1 1.007588711 1.007588711 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.072431031 1 3.86E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 26233344 G A - - - - - - 34 0 0 43 4 9.3 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.969442565 0.969442565 1 0.646246553 0.646246553 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 26310910 C A - - - - - - 42 0 0 52 7 13.5 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.938099835 0.938099835 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 8.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 33542849 C A CLASP2 ENST00000307312 r.? - - intronic 36 0 0 48 5 10.4 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.710924548 0.710924548 1 0.722684317 0.722684317 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 36789277 C A - - - - - - 39 0 0 49 4 8.2 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.569808788 0.569808788 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 39931495 A T MYRIP CCDS2689.1 r.? - - intronic 25 0 0 46 10 21.7 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.517036035 0.517036035 1 1.507908623 1.507908623 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 3.38E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 40046433 C G MYRIP CCDS2689.1 r.? - - intronic 32 0 0 41 6 14.6 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 1.320288446 1.320288446 1 1.014537599 1.014537599 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002185852 1 6.05E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 45242575 T C - - - - - - 36 0 0 43 6 14 6 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.972844273 0.972844273 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 8.13E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 46776861 G A PRSS46 CCDS2745.1 r.? - - intronic 39 0 0 55 7 12.7 13 4 30.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 2.843698191 1.686876059 1.685777788 0.882508733 0.882508733 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.000000431 1 1.28E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 48340848 T C NME6 CCDS2763.1 r.? - - intronic 33 0 0 53 7 13.2 26 3 11.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 1.061770428 1.061770428 1 0.917253172 0.917253172 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000298167 1 9.85E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 49787941 A G IP6K1 CCDS43092.1 r.? - - intronic 25 0 0 50 5 10 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.65552783 0.65552783 1 0.694888766 0.694888766 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 51855087 C T IQCF3 CCDS46837.1 r.? - - intronic 33 0 0 47 8 17 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 1.181310903 1.181310903 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 1.03E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 52845512 G C ITIH4 CCDS2865.1 r.? - - downstream 42 0 0 46 4 8.7 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.572432753 0.572432753 1 0.604553227 0.604553227 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 56762824 C A ARHGEF3 CCDS46854.1 r.2261g>u c.? p.? 3'UTR variant 32 0 0 49 5 10.2 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.708786542 0.708786542 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 59216259 G A - - - - - - 42 0 0 48 5 10.4 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.722684317 0.722684317 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 61191977 T A FHIT CCDS2894.1 r.? - - intronic 31 0 0 50 4 8 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.517036035 0.517036035 1 0.555911013 0.555911013 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.000119787 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 61191978 C A FHIT CCDS2894.1 r.? - - intronic 29 0 0 49 4 8.2 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.517036035 0.517036035 1 0.569808788 0.569808788 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 62866560 G T - - - - - - 45 0 0 64 5 7.8 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 1.227960582 1.227960582 1 0.542013238 0.542013238 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002513772 1 0.0000186 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 70250598 T C - - - - - - 30 0 0 37 5 13.5 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.618596684 0.618596684 1 0.938099835 0.938099835 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.00000119 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 73633413 G A PDZRN3 CCDS33789.1 r.? - - intronic 20 0 0 41 4 9.8 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.618596684 0.618596684 1 0.680990991 0.680990991 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.0000546 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 74391215 G A CNTN3 CCDS33790.1 r.? - - intronic 29 0 0 54 9 16.7 16 3 18.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 1.735763831 1.735763831 1 1.16046424 1.16046424 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.0000667 1 8.48E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 76765826 T A ROBO2 ENST00000487694 r.? - - intronic 38 0 0 55 4 7.3 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.507268799 0.507268799 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000173903 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 78300473 G C - - - - - - 43 0 0 69 5 7.2 27 5 18.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 1.708065472 1.708065472 1 0.500319912 0.500319912 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.00000023 1 0.0000269 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 83790449 C T - - - - - - 33 0 0 40 4 10 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 1.089468787 1.089468787 1 0.694888766 0.694888766 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.0000495 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 87591927 G T - - - - - - 39 0 0 49 7 14.3 19 4 21.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 1.948117917 1.948117917 1 0.993690936 0.993690936 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.00000228 1 5.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 87738321 G C - - - - - - 45 0 0 46 6 13 10 2 20 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 1.846557267 1.846557267 1 0.903355396 0.903355396 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001095391 1 0.000000123 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 87790007 G T - - - - - - 38 0 0 45 4 8.9 22 1 4.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.415475385 0.415475385 1 0.618451002 0.618451002 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.104413009 1 0.0000791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 93752249 G C ARL13B CCDS2924.1 r.? - - intronic 37 0 0 46 7 15.2 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 1.056230925 1.056230925 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 3.53E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 97360527 G A EPHA6 CCDS46876.1 r.? - - intronic 25 0 0 46 4 8.7 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.604553227 0.604553227 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 98524032 T C DCBLD2 CCDS46878.1 r.? - - intronic 38 0 0 51 4 7.8 25 1 4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.369311453 0.369311453 1 0.542013238 0.542013238 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.117779757 1 0.000129466 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 100098764 G A TOMM70A CCDS33807.1 r.? - - intronic 33 0 0 51 5 9.8 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.680990991 0.680990991 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000606 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 104134199 C G - - - - - - 34 0 0 47 8 17 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.517036035 0.517036035 1 1.181310903 1.181310903 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 1.03E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 105500853 C G CBLB CCDS2948.1 r.? - - intronic 36 0 0 53 4 7.5 23 1 4.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.397009812 0.397009812 1 0.521166575 0.521166575 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.108890944 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 105568909 G A CBLB CCDS2948.1 r.? - - intronic 28 0 0 45 4 8.9 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.618451002 0.618451002 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 106211722 T G - - - - - - 41 0 0 58 4 6.9 22 2 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.840183556 0.840183556 1 0.479473249 0.479473249 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.005403392 1 0.000213772 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 106609411 T C - - - - - - 33 0 0 59 4 6.8 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.65552783 0.65552783 1 0.472524361 0.472524361 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.00022841 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 107586075 C T - - - - - - 25 0 0 51 5 9.8 6 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.680990991 0.680990991 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000606 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 107727621 G T - - - - - - 47 0 0 31 4 12.9 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.896406509 0.896406509 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000177 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 110410009 A C - - - - - - 47 0 0 52 5 9.6 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.667093216 0.667093216 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000668 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 118002043 T C - - - - - - 42 0 0 45 6 13.3 16 3 18.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 1.735763831 1.735763831 1 0.924202059 0.924202059 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000667 1 0.000000108 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 118849111 C A IGSF11 CCDS2983.1 r.? - - intronic 37 0 0 54 6 11.1 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.771326531 0.771326531 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000329 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 120581467 T C - - - - - - 49 0 0 45 6 13.3 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.924202059 0.924202059 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000108 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 121988285 T G CASR CCDS3010.1 r.? - - intronic 36 0 0 61 6 9.8 24 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.680990991 0.680990991 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000685 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 123638303 A T CCDC14 CCDS3025.2 r.? - - intronic 35 0 0 40 4 10 8 1 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 1.154098292 1.154098292 1 0.694888766 0.694888766 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.039306956 1 0.0000495 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 124327892 A G KALRN CCDS3028.1 r.? - - intronic 35 0 0 52 5 9.6 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.65552783 0.65552783 1 0.667093216 0.667093216 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.00000668 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 124674696 G C - - - - - - 35 0 0 46 7 15.2 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 1.056230925 1.056230925 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 3.53E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 125590252 A T - - - - - - 30 0 0 49 3 6.1 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.423882147 0.423882147 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.001939399 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 131059846 C G NEK11 CCDS3069.1 r.? - - intronic 47 0 0 51 4 7.8 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.542013238 0.542013238 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000129466 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 131871176 A G CPNE4 ENST00000512055 r.? - - intronic 35 0 0 52 5 9.6 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.840183556 0.840183556 1 0.667093216 0.667093216 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.05364542 1 0.00000668 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 137042664 G T - - - - - - 35 0 0 40 5 12.5 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.868610958 0.868610958 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000178 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 140307536 C A - - - - - - 38 0 0 56 4 7.1 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.493371024 0.493371024 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000186538 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 140945106 T C ACPL2 ENST00000505013 r.? - - upstream 46 0 0 45 4 8.9 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.618451002 0.618451002 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 143477822 T A SLC9A9 CCDS33872.1 r.? - - intronic 42 0 0 65 10 15.4 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.618596684 0.618596684 1 1.0701287 1.0701287 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 1.36E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 148489704 G C - - - - - - 35 0 0 47 6 12.8 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.889457621 0.889457621 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000141 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 151051469 G A MED12L CCDS33876.1 r.? - - intronic 44 0 0 69 5 7.2 23 1 4.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.397009812 0.397009812 1 0.500319912 0.500319912 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.108890944 1 0.0000269 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 152466150 C T - - - - - - 40 0 0 52 6 11.5 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.799122081 0.799122081 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000261 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 155374844 T A PLCH1 CCDS33881.1 r.? - - intronic 39 0 0 42 4 9.5 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.660144328 0.660144328 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000601 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 156152492 G T KCNAB1 CCDS33882.1 r.? - - intronic 34 0 0 63 10 15.9 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.517036035 0.517036035 1 1.104873139 1.104873139 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 9.81E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 158084526 G C RSRC1 CCDS3181.1 r.? - - intronic 36 0 0 62 4 6.5 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.544734394 0.544734394 1 0.451677698 0.451677698 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.000276647 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 162227863 A C - - - - - - 42 0 0 42 4 9.5 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.660144328 0.660144328 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000601 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 163288816 G T - - - - - - 41 0 0 55 9 16.4 24 1 4.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.387777026 0.387777026 1 1.139617577 1.139617577 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.113346489 1 1.01E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 163800220 G T - - - - - - 41 0 0 41 6 14.6 9 2 22.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 2.049678566 2.049678566 1 1.014537599 1.014537599 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000879235 1 6.05E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 165995574 G T - - - - - - 37 0 0 49 5 10.2 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 1.320288446 1.320288446 1 0.708786542 0.708786542 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002185852 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 167179946 A T SERPINI2 CCDS3200.1 r.? - - intronic 42 0 0 58 8 13.8 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.923278633 0.923278633 1 0.958946498 0.958946498 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.04888987 1 5.99E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 167387405 C G PDCD10 CCDS3202.1 r.? - - intronic 39 0 0 45 4 8.9 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.618451002 0.618451002 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 168365916 A G - - - - - - 34 0 0 64 13 20.3 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 1.410624196 1.410624196 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 1.26E-17 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 170046278 G T - - - - - - 33 0 0 54 5 9.3 22 1 4.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.415475385 0.415475385 1 0.646246553 0.646246553 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.104413009 1 0.00000806 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 173439508 A G NLGN1 CCDS3222.1 r.? - - intronic 28 0 0 52 4 7.7 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0.618596684 0.618596684 1 0.53506435 0.53506435 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.000139698 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 175117640 G T NAALADL2 CCDS46960.1 r.? - - intronic 38 0 0 57 9 15.8 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 1.097924251 1.097924251 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 1.42E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 179885239 T A - - - - - - 37 0 0 66 6 9.1 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.685777788 3 1 2 1 1 0.314222212 1 2 NA 1 NA 0.685777788 NA 0 NA 0 0.657978193 0.657978193 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.0000011 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 180465136 G T CCDC39 ENST00000471307 r.? - - intronic 42 0 0 42 4 9.5 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 3 1 2 1 1 0.314222212 1 2 NA 1 NA 0.685777788 NA 0.710924548 0.710924548 1 0.686900312 0.686900312 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.0000601 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 183279457 C G - - - - - - 46 0 0 57 6 10.5 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.685777788 3 1 2 1 1 0.314222212 1 2 NA 1 NA 0.685777788 NA 0 NA 0 0.759205607 0.759205607 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000000456 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 183615990 T C - - - - - - 36 0 0 56 4 7.1 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 3 1 2 1 1 0.314222212 1 2 NA 1 NA 0.685777788 NA 0.710924548 0.710924548 1 0.513367601 0.513367601 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.000186538 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 184518366 T A - - - - - - 41 0 0 51 5 9.8 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.685777788 3 1 2 1 1 0.314222212 1 2 NA 1 NA 0.685777788 NA 0 NA 0 0.7085919 0.7085919 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00000606 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 184978672 T A - - - - - - 30 0 0 59 11 18.6 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.685777788 3 1 2 1 1 0.314222212 1 2 NA 1 NA 0.685777788 NA 0.461639317 NA 0 1.344878505 1.344878505 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.09538952 1 1.1E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 187027291 G A - - - - - - 31 0 0 42 9 21.4 22 1 4.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.685777788 3 1 2 1 1 0.314222212 1 2 NA 1 NA 0.685777788 NA 0.415475385 NA 0 1.547333333 1.547333333 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.104413009 1 7.51E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 187934078 T C LPP CCDS3291.1 r.? - - intronic 19 0 0 30 6 20 6 3 50 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.254239097 1 1 1 1 0.314222212 0.745760903 2 2 1 1 0.685777788 0.254239097 4.616393167 2.738435161 1.685777788 1.296953738 1.296953738 1 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 0.00000247 1 8.37E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 195394680 C G - - - - - - 14 0 0 27 5 18.5 6 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.254239097 1 1 1 1 0.314222212 0.745760903 2 2 1 1 0.685777788 0.254239097 0 0 1 1.199682208 1.199682208 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000023 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 197901820 C T - - - - - - 19 0 0 24 4 16.7 3 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 NA NA 1 NA NA 1 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00000613 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 1022755 A T FGFRL1 CCDS3344.1 r.? - - downstream 31 0 0 42 3 7.1 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 1.360752923 1.360752923 1 0.453980381 0.453980381 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002513772 1 0.001240292 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 1594317 C G - - - - - - 40 0 0 30 3 10 8 1 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 1.278903123 1.278903123 1 0.639408988 0.639408988 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.039306956 1 0.000458697 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 3110711 T C HTT CCDS43206.1 r.? - - intronic 30 0 0 45 5 11.1 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.709743976 0.709743976 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000323 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 5945583 G T C4orf50 CCDS3384.1 r.? - - intronic 43 0 0 54 4 7.4 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.473162651 0.473162651 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 6011308 T A - - - - - - 35 0 0 52 3 5.8 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.931041473 0.931041473 1 0.370857213 0.370857213 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.05364542 1 0.002300591 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 8205097 G C SH3TC1 CCDS3399.1 r.? - - intronic 32 0 0 44 4 9.1 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.849191673 0.849191673 1 0.581862179 0.581862179 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.0000723 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 8340655 C A - - - - - - 43 0 0 51 6 11.8 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 1.360752923 1.360752923 1 0.754502606 0.754502606 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002513772 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 11570781 A G - - - - - - 30 0 0 63 6 9.5 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.607438538 0.607438538 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000832 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 11889079 T A - - - - - - 30 0 0 47 3 6.4 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.409221752 0.409221752 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.001719595 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 12115809 T C - - - - - - 42 0 0 64 5 7.8 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.542254924 0.542254924 1 0.49873901 0.49873901 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.0000186 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 12207393 G T - - - - - - 45 0 0 47 4 8.5 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.491098799 0.491098799 1 0.54349764 0.54349764 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.099912572 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 13585319 G C BOD1L CCDS3411.2 r.? - - intronic 56 0 0 47 4 8.5 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.634335949 0.634335949 1 0.54349764 0.54349764 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 16176377 T C TAPT1 CCDS47030.1 r.? - - intronic 36 0 0 50 5 10 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.639408988 0.639408988 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 16523810 G T LDB2 CCDS3420.1 r.? - - intronic 35 0 0 41 4 9.8 20 4 20 0 0 NA 1 0 0 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 2.046244996 2.046244996 1 0.626620808 0.626620808 1 NA NA 0 0 NA 0 2 NA 1 1 0.00000284 1 0.0000546 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 19832285 T C - - - - - - 47 0 0 61 4 6.6 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 1.207284548 1.207284548 1 0.422009932 0.422009932 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.000259828 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 20324093 C G SLIT2 ENST00000504154 r.? - - intronic 40 0 0 52 4 7.7 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 1 0 0 TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.492344921 0.492344921 1 0 NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000139698 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 21500275 A C KCNIP4 CCDS43217.1 r.? - - intronic 46 0 0 50 4 8 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.511561249 0.511561249 1 0.51152719 0.51152719 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.000119787 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 21569959 G C KCNIP4 CCDS43217.1 r.? - - intronic 36 0 0 54 4 7.4 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.473162651 0.473162651 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 22607525 A G - - - - - - 31 0 0 61 5 8.2 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.52431537 0.52431537 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000147 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 22860509 G C - - - - - - 46 0 0 51 4 7.8 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.634335949 0.634335949 1 0.49873901 0.49873901 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.000129466 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 22860510 A T - - - - - - 45 0 0 50 4 8 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.634335949 0.634335949 1 0.51152719 0.51152719 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.000119787 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 23613857 C A - - - - - - 39 0 0 51 6 11.8 8 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.754502606 0.754502606 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 23693694 T C - - - - - - 37 0 0 47 6 12.8 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.818443504 0.818443504 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000141 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 27944982 G A - - - - - - 37 0 0 58 8 13.8 8 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.882384403 0.882384403 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 5.99E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 30611791 T C - - - - - - 36 0 0 43 4 9.3 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.594650359 0.594650359 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 31426748 C G - - - - - - 45 0 0 41 5 12.2 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.726416974 0.726416974 1 0.780078965 0.780078965 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.00000202 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 34370427 G T - - - - - - 49 0 0 58 6 10.3 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.685492074 0.685492074 1 0.658591257 0.658591257 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.000000506 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 38857793 C A TLR6 CCDS3446.1 r.? - - intronic 33 0 0 56 9 16.1 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.491098799 0.491098799 1 1.02944847 1.02944847 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.099912572 1 1.2E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 41360682 C A LIMCH1 CCDS33977.1 r.? - - upstream 32 0 0 40 4 10 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.639408988 0.639408988 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000495 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 41901775 T C - - - - - - 41 0 0 64 6 9.4 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.601044448 0.601044448 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000914 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 42456821 T A ATP8A1 CCDS3466.1 r.? - - intronic 35 0 0 52 6 11.5 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.735320336 0.735320336 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000261 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 43150714 G A - - - - - - 36 0 0 47 5 10.6 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.677773527 0.677773527 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 43388002 G A - - - - - - 50 0 0 52 7 13.5 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.685492074 0.685492074 1 0.863202133 0.863202133 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 8.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 43671025 T C - - - - - - 30 0 0 57 5 8.8 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.562679909 0.562679909 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 43921859 T G - - - - - - 39 0 0 69 10 14.5 8 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.927143032 0.927143032 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 2.54E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 44126643 G T - - - - - - 41 0 0 56 6 10.7 23 1 4.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.439942674 0.439942674 1 0.684167617 0.684167617 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.108890944 1 0.000000409 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 44370856 T A KCTD8 CCDS3467.1 r.? - - intronic 56 0 0 56 6 10.7 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.684167617 0.684167617 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000409 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 47440333 G A - - - - - - 59 0 0 51 7 13.7 13 2 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 1.575608647 1.575608647 1 0.875990313 0.875990313 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.001879825 1 7.46E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 49588328 C A - - - - - - 38 0 0 48 5 10.4 23 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.664985347 0.664985347 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 53551107 G T - - - - - - 26 0 0 39 4 10.3 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 1.207284548 1.207284548 1 0.658591257 0.658591257 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.0000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 54715546 A C AC110792.1 ENST00000511394 r.? - - intronic 33 0 0 47 3 6.4 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.409221752 0.409221752 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.001719595 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 56867305 G C CEP135 CCDS33986.1 r.? - - intronic 33 0 0 61 5 8.2 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.931041473 0.931041473 1 0.52431537 0.52431537 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.05364542 1 0.0000147 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 59515488 A G - - - - - - 39 0 0 39 5 12.8 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.491098799 0.491098799 1 0.818443504 0.818443504 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.099912572 1 0.00000156 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 62054062 A G - - - - - - 43 0 0 54 4 7.4 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.473162651 0.473162651 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 63237538 T G - - - - - - 43 0 0 41 3 7.3 27 1 3.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.378555324 0.378555324 1 0.466768561 0.466768561 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.126579904 1 0.001155993 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 9346595 A G ENSG00000188314 ENST00000344049 r.461a>g c.461A>G p.Y154C missense 35 0 0 47 5 10.6 16 3 18.8 10 0 0 8 0 0 3 1 33.3 TRUE FALSE 2.26764099 2.600747585 1 1 1 1 0.73235901 0.399252415 2 2 1 1 0.26764099 0.600747585 1.657154113 1.657154113 1 0.724115381 0.724115381 1 2.935278296 2.935278296 1 0 NA 0 2 NA 1 1 0.0000667 0.014925125 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 68824459 G T TMPRSS11A CCDS3519.1 r.? - - intronic 33 0 0 66 6 9.1 11 2 18.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 1.862082947 1.862082947 1 0.581862179 0.581862179 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.001334363 1 0.0000011 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 72353953 G T SLC4A4 CCDS3549.1 r.? - - intronic 53 0 0 48 4 8.3 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.53070946 0.53070946 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000102016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 76967556 C G ART3 CCDS47080.1 r.? - - intronic 47 0 0 63 4 6.3 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.931041473 0.931041473 1 0.402827662 0.402827662 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.05364542 1 0.000294233 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 80262609 C T - - - - - - 44 0 0 48 10 20.8 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.634335949 0.634335949 1 1.329970695 1.329970695 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 5.37E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 80536681 A C - - - - - - 35 0 0 58 4 6.9 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 1.023122498 1.023122498 1 0.441192202 0.441192202 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004473894 1 0.000213772 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 82964313 G T - - - - - - 32 0 0 62 8 12.9 22 2 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.931041473 0.931041473 1 0.824837594 0.824837594 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.005403392 1 1.04E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 83542233 G C - - - - - - 30 0 0 60 9 15 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 1.278903123 1.278903123 1 0.959113482 0.959113482 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002863359 1 2.29E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 85116379 C G - - - - - - 34 0 0 61 4 6.6 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.572948599 0.572948599 1 0.422009932 0.422009932 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.000259828 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 85250215 A G - - - - - - 53 0 0 57 7 12.3 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 1.074278623 1.074278623 1 0.786473055 0.786473055 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004039874 1 1.66E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 85837055 T A WDFY3 CCDS3609.1 r.? - - intronic 42 0 0 66 4 6.1 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.390039483 0.390039483 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000351793 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 86547742 A C ARHGAP24 CCDS34025.1 r.? - - intronic 35 0 0 52 5 9.6 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.542254924 0.542254924 1 0.613832628 0.613832628 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.00000668 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 89230032 T C - - - - - - 36 0 0 62 7 11.3 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.722532156 0.722532156 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 3.02E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 90417121 G C - - - - - - 37 0 0 51 7 13.7 24 2 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.849191673 0.849191673 1 0.875990313 0.875990313 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.006413403 1 7.46E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 95794404 T G BMPR1B ENST00000515059 r.? - - intronic 28 0 0 55 6 10.9 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0.572948599 0.572948599 1 0.696955797 0.696955797 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 96027513 T C BMPR1B CCDS3642.1 r.? - - intronic 34 0 0 46 7 15.2 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.971901661 0.971901661 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 3.53E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 96788120 A T - - - - - - 40 0 0 51 6 11.8 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 0 0 1 0.899821619 0.899821619 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 97690146 G T - - - - - - 42 0 0 63 7 11.1 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 1.023122498 1.023122498 1 0.84644237 0.84644237 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004473894 1 3.38E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 99819146 C T EIF4E CCDS34031.1 r.? - - intronic 34 0 0 50 5 10 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 0 0 1 0.762560694 0.762560694 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 104932055 A T - - - - - - 47 0 0 57 5 8.8 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 0.542254924 0.542254924 1 0.671053411 0.671053411 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 105520155 A T - - - - - - 37 0 0 56 6 10.7 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 0.634335949 0.634335949 1 0.815939943 0.815939943 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.000000409 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 106234869 C G - - - - - - 22 0 0 38 5 13.2 9 1 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 1.135665973 1.135665973 1 1.006580116 1.006580116 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.044110422 1 0.00000137 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 108254420 T A - - - - - - 44 0 0 56 7 12.5 12 4 33.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 3.406997919 1.703498959 2 0.953200868 0.953200868 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.0000003 1 1.46E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 111971816 C T - - - - - - 23 0 0 43 10 23.3 12 3 25 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 2.557806245 2.557806245 1 1.776766417 1.107072925 1.604922654 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.0000266 1 1.61E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 112868189 G C - - - - - - 32 0 0 52 4 7.7 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 0 0 1 0.587171734 0.587171734 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000139698 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 116551864 A G - - - - - - 36 0 0 49 4 8.2 26 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 0 0 1 0.625299769 0.625299769 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 117932824 G C - - - - - - 46 0 0 52 5 9.6 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 1.023122498 1.023122498 1 0.732058266 0.732058266 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004473894 1 0.00000668 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 121333988 A C - - - - - - 29 0 0 64 4 6.2 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 0.542254924 0.542254924 1 0.47278763 0.47278763 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.000312605 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 121545334 A T - - - - - - 38 0 0 47 5 10.6 21 4 19 0 0 NA 0 0 NA 1 0 0 TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 1.943932746 1.943932746 1 0.808314336 0.808314336 1 0 NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.00000349 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 123632203 T A - - - - - - 47 0 0 47 5 10.6 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 0.511561249 0.511561249 1 0.808314336 0.808314336 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 124591534 G C - - - - - - 45 0 0 62 6 9.7 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 1.074278623 1.074278623 1 0.739683873 0.739683873 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.000000756 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 125306510 G C - - - - - - 40 0 0 71 6 8.5 19 0 0 0 0 NA 2 0 0 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 0 0 1 0.64817659 0.64817659 1 NA NA 0 0 0 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000169 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 125524428 G C - - - - - - 40 0 0 36 7 19.4 17 3 17.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 1.800695597 1.800695597 1 1.479367747 1.479367747 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.0000807 1 5.74E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 126335667 C G FAT4 CCDS3732.3 r.? - - intronic 41 0 0 54 5 9.3 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 0 0 1 0.709181446 0.709181446 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000806 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 126893260 T C - - - - - - 38 0 0 50 5 10 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 1.207284548 1.207284548 1 0.762560694 0.762560694 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 130022488 A C C4orf33 CCDS3741.1 r.? - - intronic 35 0 0 54 5 9.3 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 0 0 1 0.709181446 0.709181446 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000806 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 130900530 C A - - - - - - 46 0 0 61 4 6.6 24 1 4.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 0.429711449 0.429711449 1 0.503290058 0.503290058 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.113346489 1 0.000259828 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 131600000 C G - - - - - - 43 0 0 57 4 7 23 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 0 0 1 0.533792486 0.533792486 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000199821 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 132470165 G A - - - - - - 30 0 0 37 4 10.8 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 0.787804324 0.787804324 1 0.82356555 0.82356555 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.0000362 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 132716539 T C - - - - - - 43 0 0 54 4 7.4 23 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 0 0 1 0.564294914 0.564294914 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 133420701 G C - - - - - - 38 0 0 45 5 11.1 14 4 28.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 2.926130345 1.463065172 2 0.84644237 0.84644237 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000000601 1 0.00000323 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 133918873 C T - - - - - - 38 0 0 41 7 17.1 18 2 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.059717949 1.059717949 1 1.236420561 1.236420561 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.003626632 1 1.51E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 134372127 C G - - - - - - 41 0 0 49 9 18.4 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.330417445 1.330417445 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 3.35E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 135262263 A T - - - - - - 37 0 0 58 10 17.2 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.792401709 0.792401709 1 1.24365109 1.24365109 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 4.1E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 135750828 T C - - - - - - 41 0 0 53 10 18.9 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.563273504 0.563273504 1 1.366570093 1.366570093 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 1.57E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 136336992 C T - - - - - - 47 0 0 41 5 12.2 16 3 18.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.794837607 1.794837607 1 0.882124611 0.882124611 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0000667 1 0.00000202 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 137088593 A T - - - - - - 40 0 0 41 5 12.2 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.002435897 1.002435897 1 0.882124611 0.882124611 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.00000202 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 138475122 G A - - - - - - 28 0 0 60 8 13.3 22 3 13.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.298393162 1.298393162 1 0.961660436 0.961660436 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000179267 1 7.93E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 139001105 C G - - - - - - 37 0 0 55 7 12.7 22 2 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.868777778 0.868777778 1 0.918277259 0.918277259 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.005403392 1 1.28E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 139675133 A G - - - - - - 44 0 0 63 4 6.3 21 2 9.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.906965812 0.906965812 1 0.455523364 0.455523364 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004928472 1 0.000294233 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 140411674 T A - - - - - - 29 0 0 53 4 7.5 8 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.54228972 0.54228972 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 140758936 T G MAML3 CCDS43266.1 r.? - - intronic 32 0 0 39 4 10.3 22 2 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.868777778 0.868777778 1 0.744744548 0.744744548 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.005403392 1 0.0000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 141811427 G A RNF150 ENST00000306799 r.? - - intronic 28 0 0 48 6 12.5 21 2 9.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.906965812 0.906965812 1 0.903816199 0.903816199 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004928472 1 0.00000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 142215949 G T - - - - - - 43 0 0 51 8 15.7 18 4 22.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.119435897 2.119435897 1 1.135193146 1.135193146 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.00000181 1 2.05E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 143548288 C T INPP4B CCDS47112.1 r.? - - intronic 34 0 0 51 5 9.8 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.7085919 0.7085919 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000606 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 144447664 C G SMARCA5 CCDS3761.1 r.? - - intronic 42 0 0 74 4 5.4 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.390448598 0.390448598 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00054411 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 145573223 T G HHIP CCDS3762.1 r.? - - intronic 34 0 0 49 5 10.2 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.677837607 0.677837607 1 0.737514019 0.737514019 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 146279209 A G - - - - - - 31 0 0 40 5 12.5 23 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.903816199 0.903816199 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000178 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 147677147 C A TTC29 CCDS47141.1 r.? - - intronic 32 0 0 49 4 8.2 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.592903427 0.592903427 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 148084183 C T - - - - - - 44 0 0 54 6 11.1 24 4 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.594350427 1.594350427 1 0.802588785 0.802588785 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.00000613 1 0.000000329 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 151446882 T C LRBA CCDS3773.1 r.? - - intronic 43 0 0 65 6 9.2 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.665208723 0.665208723 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000001 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 154726427 C A - - - - - - 35 0 0 54 4 7.4 22 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.53505919 0.53505919 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 155021183 G A - - - - - - 55 0 0 47 11 23.4 9 1 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.059717949 1.059717949 1 1.691943925 0.845971963 2 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.044110422 1 7.21E-16 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 156352351 A G - - - - - - 42 0 0 49 5 10.2 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.534632479 0.534632479 1 0.737514019 0.737514019 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 158170760 A C GRIA2 CCDS43275.1 r.? - - intronic 34 0 0 51 6 11.8 9 3 33.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 3.179153846 1.589576923 2 0.853202492 0.853202492 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0000103 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 159831564 T C FNIP2 CCDS47155.1 r.? - - downstream 35 0 0 42 7 16.7 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.868777778 0.868777778 1 1.207498442 1.207498442 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.05364542 1 1.81E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 160151493 A G RAPGEF2 ENST00000505478 r.? - - intronic 37 0 0 55 9 16.4 16 4 25 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.386752137 2.386752137 1 1.185806854 1.185806854 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.00000108 1 1.01E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 163493087 C A - - - - - - 35 0 0 57 5 8.8 18 2 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.059717949 1.059717949 1 0.636286604 0.636286604 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.003626632 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 163682741 C T - - - - - - 38 0 0 39 5 12.8 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.126547009 1.126547009 1 0.925507788 0.925507788 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.00000156 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 166461830 G A - - - - - - 39 0 0 56 7 12.5 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.193376068 1.193376068 1 0.903816199 0.903816199 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002863359 1 1.46E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 169691328 G T PALLD CCDS34098.1 r.? - - intronic 42 0 0 52 7 13.5 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.269752137 1.269752137 1 0.976121495 0.976121495 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002513772 1 8.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 171540767 G A - - - - - - 28 0 0 37 6 16.2 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.171345794 1.171345794 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 3.18E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 172369342 C A - - - - - - 36 0 0 51 6 11.8 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.002435897 1.002435897 1 0.853202492 0.853202492 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 173864519 A T GALNTL6 CCDS34104.1 r.? - - intronic 33 0 0 42 5 11.9 13 2 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.470239316 1.470239316 1 0.860433022 0.860433022 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001879825 1 0.00000228 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 175121099 G T - - - - - - 50 0 0 54 4 7.4 22 4 18.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.737555556 1.737555556 1 0.53505919 0.53505919 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.00000425 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 176278837 A C - - - - - - 45 0 0 49 5 10.2 25 3 12 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.145641026 1.145641026 1 0.737514019 0.737514019 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.00026475 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 178354819 G T AGA CCDS3829.1 r.? - - intronic 34 0 0 49 4 8.2 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.269752137 1.269752137 1 0.592903427 0.592903427 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002513772 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 180567354 G C - - - - - - 48 0 0 49 9 18.4 24 4 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.594350427 1.594350427 1 1.330417445 1.330417445 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.00000613 1 3.35E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 181527094 A G - - - - - - 52 0 0 49 4 8.2 22 1 4.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.429615385 0.429615385 1 0.592903427 0.592903427 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.104413009 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 181528350 G T - - - - - - 37 0 0 58 4 6.9 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.269752137 1.269752137 1 0.498906542 0.498906542 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002513772 1 0.000213772 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 181624689 C G - - - - - - 43 0 0 55 6 10.9 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.788127726 0.788127726 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 181810044 G C - - - - - - 35 0 0 53 10 18.9 18 3 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.594350427 1.594350427 1 1.366570093 1.366570093 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.0000964 1 1.57E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 182795179 G A - - - - - - 42 0 0 64 5 7.8 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.534632479 0.534632479 1 0.563981308 0.563981308 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.0000186 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 182892419 C A - - - - - - 35 0 0 49 4 8.2 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.534632479 0.534632479 1 0.592903427 0.592903427 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 183926380 C A - - - - - - 28 0 0 49 7 14.3 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.033965732 1.033965732 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 5.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 188139522 C T - - - - - - 27 0 0 58 6 10.3 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.505991453 0.505991453 1 0.744744548 0.744744548 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.000000506 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 977698 G C ENSG00000250173 ENST00000511936 r.? - - upstream 47 0 0 55 5 9.1 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.616848896 0.616848896 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000883 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 1211286 G A SLC6A19 CCDS34130.1 r.? - - intronic 27 0 0 39 4 10.3 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.698191608 0.698191608 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 2795556 C A - - - - - - 48 0 0 39 5 12.8 13 2 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.391933145 1.391933145 1 0.86765559 0.86765559 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001879825 1 0.00000156 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 3969735 A G - - - - - - 43 0 0 58 7 12.1 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.695966572 0.695966572 1 0.820205675 0.820205675 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 1.88E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 4758076 C G ENSG00000224867 ENST00000416839 r.? - - intronic 48 0 0 76 7 9.2 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.433849292 0.433849292 1 0.623627455 0.623627455 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.099912572 1 0.000000126 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 7324359 G T - - - - - - 39 0 0 51 4 7.8 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.528727625 0.528727625 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000129466 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 8102458 G C - - - - - - 46 0 0 39 5 12.8 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.605581303 0.605581303 1 0.86765559 0.86765559 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.00000156 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 8829346 G T - - - - - - 34 0 0 50 6 12 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.813427116 0.813427116 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000206 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 11086064 A G CTNND2 CCDS3881.1 r.? - - intronic 31 0 0 52 5 9.6 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.650741693 0.650741693 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000668 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 12197062 T C - - - - - - 37 0 0 37 4 10.8 23 2 8.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.786351842 0.786351842 1 0.732084404 0.732084404 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.00589844 1 0.0000362 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 15299383 C T - - - - - - 23 0 0 43 5 11.6 13 2 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.391933145 1.391933145 1 0.786312879 0.786312879 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001879825 1 0.00000257 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 16130736 A C Mar-11 CCDS47192.1 r.? - - intronic 30 0 0 58 6 10.3 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.698191608 0.698191608 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000506 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 16280064 G C - - - - - - 52 0 0 52 4 7.7 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.521949066 0.521949066 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000139698 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 16280182 T A - - - - - - 25 0 0 40 4 10 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.67785593 0.67785593 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000495 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 17640763 T G - - - - - - 39 0 0 54 5 9.3 23 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.630406015 0.630406015 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000806 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 17992794 A G - - - - - - 39 0 0 53 7 13.2 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.894769827 0.894769827 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 9.85E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 18465443 A T - - - - - - 38 0 0 55 6 10.9 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.738862963 0.738862963 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 21302573 G T - - - - - - 34 0 0 58 8 13.8 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.506157507 0.506157507 1 0.935441183 0.935441183 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 5.99E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 22441738 T G CDH12 CCDS3890.1 r.? - - intronic 43 0 0 46 3 6.5 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.949045326 0.949045326 1 0.440606354 0.440606354 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.001615827 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 23691713 C T - - - - - - 28 0 0 36 6 16.7 11 2 18.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.645011898 1.645011898 1 1.132019403 1.132019403 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001334363 1 2.68E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 24096378 G A - - - - - - 50 0 0 61 4 6.6 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.447384914 0.447384914 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000259828 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 24735900 G A - - - - - - 31 0 0 50 8 16 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 1.084569488 1.084569488 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 1.74E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 24841670 G T - - - - - - 34 0 0 47 4 8.5 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.57617754 0.57617754 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 24948633 A T - - - - - - 39 0 0 49 4 8.2 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.555841862 0.555841862 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 25553193 C T - - - - - - 44 0 0 44 5 11.4 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.77275576 0.77275576 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000288 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 26792367 T C - - - - - - 41 0 0 51 6 11.8 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.799869997 0.799869997 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 27195915 T C - - - - - - 43 0 0 52 5 9.6 24 1 4.2 0 0 NA 1 0 0 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.37961813 0.37961813 1 0.650741693 0.650741693 1 NA NA 1 0 0 1 2 NA 1 1 0.113346489 1 0.00000668 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 29252037 C A - - - - - - 41 0 0 56 5 8.9 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.603291778 0.603291778 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000965 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 29369774 T C - - - - - - 43 0 0 41 4 9.8 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.433849292 0.433849292 1 0.664298811 0.664298811 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.099912572 1 0.0000546 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 29836000 A C - - - - - - 42 0 0 51 3 5.9 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.399934999 0.399934999 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.002175924 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 30092082 G T - - - - - - 37 0 0 49 7 14.3 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.560388669 0.560388669 1 0.96933398 0.96933398 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 5.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 30497484 C A - - - - - - 41 0 0 60 9 15 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 1.016783895 1.016783895 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 2.29E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 31939539 C G PDZD2 CCDS34137.1 r.? - - intronic 31 0 0 51 6 11.8 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.292509349 1.292509349 1 0.799869997 0.799869997 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002185852 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 33485953 G C - - - - - - 29 0 0 53 5 9.4 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.637184574 0.637184574 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 36539819 G C - - - - - - 33 0 0 49 4 8.2 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.695966572 0.695966572 1 0.555841862 0.555841862 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 37776720 T A - - - - - - 45 0 0 51 6 11.8 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.799869997 0.799869997 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 37972139 C G - - - - - - 32 0 0 58 4 6.9 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.467720592 0.467720592 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000213772 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 41259831 G A C6 CCDS3936.1 r.? - - intronic 41 0 0 51 5 9.8 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.641735411 0.641735411 1 0.664298811 0.664298811 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.00000606 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 41677323 T C - - - - - - 42 0 0 49 6 12.2 9 1 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.003276487 1.003276487 1 0.826984234 0.826984234 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.044110422 1 0.000000182 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 41677353 A C - - - - - - 41 0 0 43 4 9.3 8 1 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.129815864 1.129815864 1 0.630406015 0.630406015 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.039306956 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 42215285 G A - - - - - - 45 0 0 52 6 11.5 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.451926346 0.451926346 1 0.779534319 0.779534319 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.000000261 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 42282477 C G - - - - - - 38 0 0 60 6 10 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.750197734 0.750197734 1 0.67785593 0.67785593 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.000000621 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 45547556 C T HCN1 CCDS3952.1 r.? - - intronic 41 0 0 55 5 9.1 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.616848896 0.616848896 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000883 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 51453929 A T - - - - - - 38 0 0 37 4 10.8 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.129815864 1.129815864 1 0.732084404 0.732084404 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.0000362 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 52423656 G T - - - - - - 48 0 0 61 6 9.8 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.903852691 0.903852691 1 0.664298811 0.664298811 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.04888987 1 0.000000685 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 53043118 T C - - - - - - 39 0 0 38 6 15.8 13 3 23.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 2.087899717 2.087899717 1 1.071012369 1.071012369 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.0000344 1 3.76E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 53724891 A T - - - - - - 37 0 0 53 5 9.4 25 1 4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.361541077 0.361541077 1 0.637184574 0.637184574 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.117779757 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 54122290 G C - - - - - - 25 0 0 53 4 7.5 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.479041926 0.479041926 1 0.508391947 0.508391947 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 58126446 G A RAB3C CCDS3976.1 r.? - - intronic 35 0 0 51 6 11.8 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.560388669 0.560388669 1 0.799869997 0.799869997 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 59175006 C T PDE4D CCDS47213.1 r.? - - intronic 27 0 0 49 6 12.2 8 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.826984234 0.826984234 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000182 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 60237411 C A ERCC8 CCDS3978.1 r.? - - intronic 34 0 0 47 5 10.6 15 3 20 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.807705383 1.807705383 1 0.718527286 0.718527286 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0000544 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 68457560 A G - - - - - - 32 0 0 54 4 7.4 25 1 4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.361541077 0.361541077 1 0.501613388 0.501613388 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.117779757 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 68570816 G C CDK7 CCDS3999.1 r.? - - intronic 26 0 0 55 4 7.3 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.903852691 0.903852691 1 0.494834829 0.494834829 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.04888987 1 0.000173903 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 75393372 A C SV2C ENST00000502798 r.? - - intronic 41 0 0 54 4 7.4 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.129815864 1.129815864 1 0.501613388 0.501613388 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 81256306 G C - - - - - - 19 0 0 28 3 10.7 7 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.725305845 0.725305845 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000372895 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 81612887 A G ATP6AP1L CCDS34196.1 r.? - - intronic 34 0 0 42 6 14.3 9 2 22.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 2.006552975 2.006552975 1 0.96933398 0.96933398 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000879235 1 7.02E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 82621744 A G XRCC4 CCDS4058.1 r.? - - intronic 32 0 0 53 4 7.5 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.533273088 0.533273088 1 0.508391947 0.508391947 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 85339364 T C - - - - - - 42 0 0 55 5 9.1 11 2 18.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.645011898 1.645011898 1 0.616848896 0.616848896 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001334363 1 0.00000883 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 86203939 T C - - - - - - 38 0 0 47 5 10.6 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.750197734 0.750197734 1 0.718527286 0.718527286 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 87741684 T A - - - - - - 30 0 0 36 3 8.3 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.562620422 0.562620422 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000788827 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 92967814 C G MIR2277 CCDS4069.1 r.? - - intronic 39 0 0 45 4 8.9 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.129815864 1.129815864 1 0.603291778 0.603291778 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.0000791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 94469184 C A MCTP1 ENST00000515393 r.? - - intronic 30 0 0 41 6 14.6 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.451926346 0.451926346 1 0.989669658 0.989669658 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.09538952 1 6.05E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 96433584 A G LIX1 CCDS4088.1 r.? - - intronic 38 0 0 43 4 9.3 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.605581303 0.605581303 1 0.630406015 0.630406015 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 96624572 A G - - - - - - 45 0 0 48 4 8.3 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.506157507 0.506157507 1 0.562620422 0.562620422 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.000102016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 97206395 A C - - - - - - 28 0 0 50 3 6 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.406713558 0.406713558 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.002055544 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 97993587 T A - - - - - - 44 0 0 49 6 12.2 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.129815864 1.129815864 1 0.826984234 0.826984234 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.000000182 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 101789518 G C SLCO6A1 CCDS34206.1 r.? - - intronic 42 0 0 53 5 9.4 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.637184574 0.637184574 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 105777085 A G - - - - - - 33 0 0 47 6 12.8 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.560388669 0.560388669 1 0.86765559 0.86765559 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.000000141 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 106505392 G C - - - - - - 38 0 0 51 8 15.7 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.605581303 0.605581303 1 1.06423381 1.06423381 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.072431031 1 2.05E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 107632417 C T FBXL17 ENST00000359660 r.? - - intronic 40 0 0 54 6 11.1 8 1 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.129815864 1.129815864 1 0.752420082 0.752420082 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.039306956 1 0.000000329 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 109227556 G A - - - - - - 45 0 0 75 5 6.7 12 2 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.509433995 1.509433995 1 0.454163473 0.828720543 0.548029703 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001595918 1 0.0000403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 111904767 T C - - - - - - 46 0 0 41 7 17.1 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.066546176 1.066546176 1 1.15913364 1.15913364 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003234386 1 1.51E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 112455804 G A MCC CCDS4111.1 r.? - - intronic 43 0 0 47 7 14.9 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 1.010005335 1.010005335 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 4.12E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 113422414 A T - - - - - - 35 0 0 44 7 15.9 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.20212408 1.20212408 1 1.077790928 1.077790928 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002513772 1 2.55E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 113522677 A G - - - - - - 31 0 0 41 4 9.8 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.664298811 0.664298811 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000546 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 115113102 C T - - - - - - 48 0 0 44 6 13.6 19 2 10.5 0 0 NA 1 0 0 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.949045326 0.949045326 1 0.921884065 0.921884065 1 NA NA 1 0 NA 0 2 NA 1 1 0.004039874 1 9.37E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 117591605 T A - - - - - - 50 0 0 43 4 9.3 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.630406015 0.630406015 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 118407661 G T DMXL1 CCDS4125.1 r.? - - intronic 29 0 0 61 7 11.5 18 2 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.003276487 1.003276487 1 0.779534319 0.779534319 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003626632 1 2.69E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 121607312 A T - - - - - - 44 0 0 49 6 12.2 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.826984234 0.826984234 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000182 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 122243172 C T SNX24 CCDS4132.1 r.? - - intronic 32 0 0 49 5 10.2 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.691413048 0.691413048 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 122547932 T G - - - - - - 25 0 0 42 3 7.1 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.48127771 0.48127771 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.001240292 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 123411734 A G - - - - - - 45 0 0 56 7 12.5 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.433849292 0.433849292 1 0.847319912 0.847319912 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.099912572 1 1.46E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 124266143 C T - - - - - - 42 0 0 36 5 13.9 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.20212408 1.20212408 1 0.942219742 0.942219742 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002513772 1 0.00000104 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 125030265 T C - - - - - - 46 0 0 54 4 7.4 28 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.501613388 0.501613388 1 NA NA 1 NA NA 0 1 NA 1 1 1 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 125068324 A C - - - - - - 31 0 0 51 6 11.8 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.799869997 0.799869997 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 125166294 A G - - - - - - 34 0 0 43 4 9.3 22 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.630406015 0.630406015 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 128599113 A G - - - - - - 39 0 0 58 6 10.3 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.695966572 0.695966572 1 0.698191608 0.698191608 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.000000506 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 135922945 A T - - - - - - 37 0 0 49 4 8.2 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.555841862 0.555841862 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 136355943 T C SPOCK1 CCDS4191.1 r.? - - intronic 45 0 0 51 5 9.8 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.664298811 0.664298811 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000606 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 141818899 A T - - - - - - 42 0 0 48 3 6.2 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.420270676 0.420270676 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.001827434 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 142131189 G A - - - - - - 39 0 0 46 6 13 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.881212709 0.881212709 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000123 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 142640428 A G - - - - - - 26 0 0 50 5 10 18 2 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.003276487 1.003276487 1 0.67785593 0.67785593 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003626632 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 144033815 T A - - - - - - 27 0 0 59 8 13.6 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.506157507 0.506157507 1 0.921884065 0.921884065 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 6.9E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 144132389 G A - - - - - - 33 0 0 63 8 12.7 18 3 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.509433995 1.509433995 1 0.860877031 0.860877031 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000964 1 1.18E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 146641966 A C STK32A CCDS47299.1 r.? - - intronic 23 0 0 33 5 15.2 9 1 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.003276487 1.003276487 1 1.030341013 1.030341013 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.044110422 1 0.00000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 146712643 A C STK32A CCDS47299.1 r.? - - intronic 36 0 0 59 5 8.5 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.533273088 0.533273088 1 0.57617754 0.57617754 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.0000125 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 148478870 G C - - - - - - 36 0 0 61 8 13.1 22 2 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.822505949 0.822505949 1 0.887991268 0.887991268 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.005403392 1 9.09E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 148965681 A G ENSG00000183111 CCDS43385.1 r.? - - intronic 33 0 0 42 6 14.3 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.96933398 0.96933398 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 7.02E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 149768327 C G TCOF1 CCDS43388.1 r.? - - intronic 24 0 0 34 3 8.8 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.596513218 0.596513218 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000666058 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 150172300 C A C5orf62 CCDS47312.1 r.? - - intronic 38 0 0 48 5 10.4 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.704970167 0.704970167 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 151395050 A T - - - - - - 32 0 0 54 4 7.4 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.479041926 0.479041926 1 0.501613388 0.501613388 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 151618851 C T - - - - - - 29 0 0 49 7 14.3 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.695966572 0.695966572 1 0.96933398 0.96933398 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.063085307 1 5.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 155229184 A G - - - - - - 28 0 0 54 4 7.4 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.479041926 0.479041926 1 0.501613388 0.501613388 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 157768438 T G - - - - - - 34 0 0 48 4 8.3 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.533273088 0.533273088 1 0.562620422 0.562620422 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.000102016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 159491350 G T TTC1 CCDS4348.1 r.? - - intronic 32 0 0 50 5 10 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.67785593 0.67785593 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 160585836 G C - - - - - - 32 0 0 51 4 7.8 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.560388669 0.560388669 1 0.528727625 0.528727625 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.000129466 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 160763279 A G GABRB2 CCDS4355.1 r.? - - intronic 35 0 0 61 5 8.2 13 2 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.391933145 1.391933145 1 0.555841862 0.555841862 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.001879825 1 0.0000147 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 162518075 C A - - - - - - 34 0 0 43 7 16.3 6 1 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.509433995 1.509433995 1 1.104905166 1.104905166 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.029627491 1 2.15E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 165454282 G C - - - - - - 52 0 0 54 5 9.3 21 2 9.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.858660057 0.858660057 1 0.630406015 0.630406015 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004928472 1 0.00000806 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 166552443 G A - - - - - - 29 0 0 53 5 9.4 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.506157507 0.506157507 1 0.637184574 0.637184574 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 171659461 A C UBTD2 CCDS4379.2 r.? - - intronic 38 0 0 53 5 9.4 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 1 0 0 TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.533273088 0.533273088 1 0.637184574 0.637184574 1 0 0 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 172078342 T G NEURL1B CCDS47342.1 r.? - - intronic 40 0 0 43 4 9.3 12 2 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.509433995 1.509433995 1 0.630406015 0.630406015 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.001595918 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 172155172 C A - - - - - - 22 0 0 38 4 10.5 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.711748726 0.711748726 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 172912783 T A - - - - - - 36 0 0 55 6 10.9 28 5 17.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.617896318 1.617896318 1 0.738862963 0.738862963 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.000000279 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 173311922 G T CPEB4 CCDS4390.1 r.? - - upstream 33 0 0 55 5 9.1 10 3 30 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 2.711558074 2.711558074 1 0.616848896 0.616848896 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000146 1 0.00000883 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 174443590 T A - - - - - - 33 1 3 44 5 11.4 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.560388669 0.560388669 1 0.77275576 0.77275576 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 0.15245715 1 0.077068876 1 0.00000288 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 179465684 C A RNF130 CCDS4451.1 r.? - - intronic 45 0 0 55 4 7.3 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.451926346 0.451926346 1 0.494834829 0.494834829 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.000173903 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 179889206 T A - - - - - - 41 0 0 40 5 12.5 22 1 4.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.406733711 0.406733711 1 0.847319912 0.847319912 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.104413009 1 0.00000178 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 185676 A G - - - - - - 24 0 0 46 6 13 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2 2 1 2 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.558991453 0.558991453 1 0.809968847 0.809968847 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.000000123 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 300509 C T DUSP22 CCDS4468.1 r.? - - intronic 66 0 0 80 6 7.5 28 2 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2 2 1 2 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.748837607 0.748837607 1 0.46728972 0.46728972 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.008668191 1 0.00000342 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 2653540 T G - - - - - - 26 0 0 46 3 6.5 10 3 30 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2 2 1 2 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 3.164102564 1.582051282 2 0.404984424 0.404984424 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000146 1 0.001615827 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 3960455 T G - - - - - - 37 0 0 55 4 7.3 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2 2 1 2 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.45482866 0.45482866 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000173903 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 5204964 C G AL121978.1 ENST00000512904 r.? - - intronic 35 0 0 54 4 7.4 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2 2 1 2 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.46105919 0.46105919 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 6206574 C G F13A1 CCDS4496.1 r.? - - intronic 32 0 0 54 5 9.3 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2 2 1 2 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.812119658 0.812119658 1 0.579439252 0.579439252 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.00000806 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 10635173 G A GCNT6 ENST00000417671 r.? - - intronic 48 0 0 46 5 10.9 21 3 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2 2 1 2 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.508222222 1.508222222 1 0.679127726 0.679127726 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000155401 1 0.00000361 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 13827909 T C - - - - - - 28 0 0 60 6 10 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2 2 1 2 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.62305296 0.62305296 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000621 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 14229593 G C - - - - - - 37 0 0 59 6 10.2 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2 2 1 2 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.635514019 0.635514019 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000561 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 15869296 C G - - - - - - 49 0 0 51 6 11.8 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 1 0 0 TRUE FALSE 4 2 2 1 2 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.65391453 0.65391453 1 0.735202492 0.735202492 1 0 0 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 17384900 A T - - - - - - 34 0 0 49 4 8.2 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2 2 1 2 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.510903427 0.510903427 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 19209789 G C ENSG00000196333 ENST00000358740 r.? - - intronic 44 0 0 52 5 9.6 24 2 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2 2 1 2 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.875401709 0.875401709 1 0.598130841 0.598130841 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.006413403 1 0.00000668 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 22635538 T G - - - - - - 50 0 0 58 5 8.6 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2 2 1 2 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.535825545 0.535825545 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000115 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 23748075 C G - - - - - - 41 0 0 51 8 15.7 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2 2 1 2 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.622273504 0.622273504 1 0.978193146 0.978193146 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 2.05E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 26245237 T C HIST1H4F CCDS4598.1 r.? - - downstream 41 0 0 42 5 11.9 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2 2 1 2 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.741433022 0.741433022 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000228 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 29214240 T C - - - - - - 41 0 0 52 4 7.7 18 2 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 11.55057298 2 3 2 0 1 -7.550572982 NA 4 NA 0 NA 8.550572982 1.170717949 1.170717949 1 1.215144898 1.215144898 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003626632 1 0.000139698 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 31007975 G A - - - - - - 37 0 0 61 8 13.1 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.731571775 2 2 2 1 1 0.268428225 NA 2 NA 2 NA 0.731571775 0.959777778 0.959777778 1 1.04303528 1.04303528 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.05364542 1 9.09E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 36637341 G A - - - - - - 39 0 0 48 6 12.5 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.731571775 2 2 2 1 1 0.268428225 NA 2 NA 2 NA 0.731571775 0 0 1 0.995262671 0.995262671 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 37329563 T G RNF8 CCDS4834.1 r.? - - intronic 41 0 0 55 4 7.3 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.731571775 2 2 2 1 1 0.268428225 NA 2 NA 2 NA 0.731571775 0 0 1 0.5812334 0.5812334 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000173903 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 38408022 A C BTBD9 CCDS47418.1 r.? - - intronic 35 0 0 52 4 7.7 8 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.731571775 2 2 2 1 1 0.268428225 NA 2 NA 2 NA 0.731571775 0 0 1 0.613081806 0.613081806 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000139698 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 40103072 T C - - - - - - 34 0 0 48 7 14.6 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.731571775 2 2 2 1 1 0.268428225 NA 2 NA 2 NA 0.731571775 0 0 1 1.1624668 1.1624668 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 4.81E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 40704831 A G - - - - - - 39 0 0 52 6 11.5 9 2 22.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.731571775 2 2 2 1 1 0.268428225 NA 2 NA 2 NA 0.731571775 2.341435897 2.341435897 1 0.915641658 0.915641658 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000879235 1 0.000000261 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 41341957 C G - - - - - - 35 0 0 37 4 10.8 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.731571775 2 2 2 1 1 0.268428225 NA 2 NA 2 NA 0.731571775 0 0 1 0.859906948 0.859906948 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000362 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 42257698 T A TRERF1 CCDS4867.1 r.? - - intronic 32 0 0 42 5 11.9 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.731571775 2 2 2 1 1 0.268428225 NA 2 NA 2 NA 0.731571775 0 0 1 0.947490063 0.947490063 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000228 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 47342973 A C - - - - - - 41 0 0 71 6 8.5 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4.581695873 3.184476375 3 2 1 1 0.418304127 0.815523625 3 3 2 1 0.581695873 0.184476375 0 0 1 0.630275507 0.630275507 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000169 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 48018582 C G C6orf138 ENST00000398738 r.? - - intronic 35 0 0 63 5 7.9 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4.581695873 3.184476375 3 2 1 1 0.418304127 0.815523625 3 3 2 1 0.581695873 0.184476375 1.112870442 1.112870442 1 0.585785472 0.585785472 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004473894 1 0.0000173 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 48554819 C T - - - - - - 45 0 0 62 15 24.2 22 3 13.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4.581695873 3.184476375 3 2 1 1 0.418304127 0.815523625 3 3 2 1 0.581695873 0.184476375 1.513503801 1.513503801 1 1.794431445 0.897215722 2 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000179267 1 2.28E-21 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 49074849 A C - - - - - - 36 0 0 55 5 9.1 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4.581695873 3.184476375 3 2 1 1 0.418304127 0.815523625 3 3 2 1 0.581695873 0.184476375 0 0 1 0.674765543 0.674765543 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000883 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 50291429 C T - - - - - - 37 0 0 66 5 7.6 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4.581695873 3.184476375 3 2 1 1 0.418304127 0.815523625 3 3 2 1 0.581695873 0.184476375 0 0 1 0.563540454 0.563540454 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000217 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 50494526 T C - - - - - - 33 0 0 56 4 7.1 22 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4.581695873 3.184476375 3 2 1 1 0.418304127 0.815523625 3 3 2 1 0.581695873 0.184476375 0 0 1 0.526465424 0.526465424 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000186538 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 50724910 A T TFAP2D CCDS4933.1 r.? - - intronic 24 0 0 33 3 9.1 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4.581695873 3.184476375 3 2 1 1 0.418304127 0.815523625 3 3 2 1 0.581695873 0.184476375 0 0 1 0.674765543 0.674765543 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000609557 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 53340953 G T - - - - - - 31 0 0 52 16 30.8 26 7 26.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4.581695873 3.184476375 3 2 1 1 0.418304127 0.815523625 3 3 2 1 0.581695873 0.184476375 2.993621489 0.99787383 3 2.283821839 1.04547793 2.184476375 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 4.73E-11 1 1.33E-24 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 53497634 C A - - - - - - 39 0 0 60 12 20 21 3 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4.581695873 3.184476375 3 2 1 1 0.418304127 0.815523625 3 3 2 1 0.581695873 0.184476375 1.591404732 1.591404732 1 1.483001194 1.483001194 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.000155401 1 2.74E-16 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 53592683 G C - - - - - - 40 0 0 66 6 9.1 16 3 18.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4.581695873 3.184476375 3 2 1 1 0.418304127 0.815523625 3 3 2 1 0.581695873 0.184476375 2.092196431 2.092196431 1 0.674765543 0.674765543 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000667 1 0.0000011 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 54673049 G C - - - - - - 28 0 0 57 7 12.3 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4.581695873 3.184476375 3 2 1 1 0.418304127 0.815523625 3 3 2 1 0.581695873 0.184476375 0.656593561 0.656593561 1 0.912045734 0.912045734 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 1.66E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 55323618 G C HMGCLL1 CCDS43475.1 r.? - - intronic 41 0 0 53 5 9.4 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4.581695873 3.184476375 3 2 1 1 0.418304127 0.815523625 3 3 2 1 0.581695873 0.184476375 0.689979674 0.689979674 1 0.697010561 0.697010561 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 57704754 T G - - - - - - 18 0 0 34 3 8.8 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.548286604 0.548286604 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000666058 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 62549954 G T KHDRBS2 CCDS4963.1 r.? - - intronic 40 0 0 52 6 11.5 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.008547009 1.008547009 1 0.716510903 0.716510903 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.000000261 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 62549981 G T KHDRBS2 CCDS4963.1 r.? - - intronic 44 0 0 62 7 11.3 11 2 18.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.555555556 1.555555556 1 0.704049844 0.704049844 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001334363 1 3.02E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 62626533 G C KHDRBS2 CCDS4963.1 r.? - - intronic 40 0 0 51 5 9.8 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.427350427 0.427350427 1 0.6105919 0.6105919 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.00000606 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 63683863 A G - - - - - - 33 0 0 58 4 6.9 11 2 18.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.555555556 1.555555556 1 0.429906542 0.429906542 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001334363 1 0.000213772 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 63878383 A T - - - - - - 37 0 0 55 6 10.9 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.854700855 0.854700855 1 0.679127726 0.679127726 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.04888987 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 68511458 T A - - - - - - 38 0 0 37 4 10.8 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.672897196 0.672897196 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000362 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 68938376 C T - - - - - - 40 0 0 35 4 11.4 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.709401709 0.709401709 1 0.710280374 0.710280374 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.0000289 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 69511862 C T BAI3 CCDS4968.1 r.? - - intronic 47 0 0 54 5 9.3 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.41025641 0.41025641 1 0.579439252 0.579439252 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.099912572 1 0.00000806 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 70897644 T A COL19A1 CCDS4970.1 r.? - - intronic 40 0 0 47 4 8.5 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.572649573 0.572649573 1 0.529595016 0.529595016 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 73573633 T G KCNQ5 CCDS4976.1 r.? - - intronic 34 0 0 44 3 6.8 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.423676012 0.423676012 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00142027 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 76055783 C G FILIP1 CCDS4984.1 r.? - - intronic 36 0 0 55 6 10.9 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.679127726 0.679127726 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 77874509 C G - - - - - - 45 0 0 54 5 9.3 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.579439252 0.579439252 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000806 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 78539661 G T - - - - - - 42 0 0 50 5 10 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.62305296 0.62305296 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 79032504 C G - - - - - - 42 0 0 31 3 9.7 15 5 33.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.846153846 2.846153846 1 0.604361371 0.604361371 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.000000009 1 0.000505952 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 79303864 T G - - - - - - 40 0 0 50 4 8 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.606837607 0.606837607 1 0.498442368 0.498442368 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.000119787 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 83713071 G C UBE2CBP CCDS34491.1 r.? - - intronic 36 0 0 48 4 8.3 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.517133956 0.517133956 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000102016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 84610440 A C CYB5R4 CCDS5000.2 r.? - - intronic 38 0 0 60 4 6.7 13 2 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.316239316 1.316239316 1 0.417445483 0.417445483 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001879825 1 0.000243755 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 87465712 C T - - - - - - 36 0 0 46 5 10.9 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.709401709 0.709401709 1 0.679127726 0.679127726 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.00000361 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 89567238 A G RNGTT CCDS5017.1 r.? - - intronic 38 0 0 58 5 8.6 23 2 8.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.743589744 0.743589744 1 0.535825545 0.535825545 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.00589844 1 0.0000115 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 92565047 T G - - - - - - 38 0 0 43 4 9.3 24 0 0 0 0 NA 2 0 0 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.579439252 0.579439252 1 NA NA 1 0 0 1 1 NA 1 1 1 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 93512846 G A - - - - - - 35 0 0 53 5 9.4 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.658119658 0.658119658 1 0.585669782 0.585669782 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 93530368 T G - - - - - - 49 0 0 46 4 8.7 13 2 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.316239316 1.316239316 1 0.542056075 0.542056075 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001879825 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 96439149 T A - - - - - - 25 0 0 63 4 6.3 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.392523364 0.392523364 1 NA NA 1 NA NA 1 1 NA 1 1 1 1 0.000294233 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 96936043 C A - - - - - - 41 0 0 49 4 8.2 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.478632479 0.478632479 1 0.510903427 0.510903427 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 97788688 A G - - - - - - 50 0 0 57 4 7 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.436137072 0.436137072 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000199821 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 99516669 A C - - - - - - 36 0 0 50 3 6 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.222222222 1.222222222 1 0.373831776 0.373831776 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002185852 1 0.002055544 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 99628430 T C - - - - - - 46 0 0 49 7 14.3 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.890965732 0.890965732 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 5.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 100637400 A C - - - - - - 43 0 0 51 3 5.9 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.367601246 0.367601246 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.002175924 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 101142323 A G ASCC3 CCDS5046.1 r.? - - intronic 40 0 0 51 4 7.8 23 1 4.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.367521368 0.367521368 1 0.485981308 0.485981308 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.108890944 1 0.000129466 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 101308990 T G ASCC3 CCDS5046.1 r.? - - intronic 38 0 0 64 4 6.2 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.386292835 0.386292835 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000312605 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 102051429 C G GRIK2 CCDS5049.1 r.? - - intronic 50 0 0 49 5 10.2 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.427350427 0.427350427 1 0.635514019 0.635514019 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 102427649 G A GRIK2 CCDS5049.1 r.? - - intronic 53 0 0 59 7 11.9 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.741433022 0.741433022 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 2.12E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 103580327 C G - - - - - - 28 0 0 48 6 12.5 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.778816199 0.778816199 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 103688029 A G - - - - - - 38 0 0 59 5 8.5 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.136752137 1.136752137 1 0.529595016 0.529595016 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002513772 1 0.0000125 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 107420695 T C BEND3 CCDS34507.1 r.? - - intronic 31 0 0 47 4 8.5 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.529595016 0.529595016 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 107514688 A G PDSS2 CCDS5059.1 r.? - - intronic 38 0 0 52 4 7.7 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.479750779 0.479750779 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000139698 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 107604861 T C PDSS2 CCDS5059.1 r.? - - intronic 50 0 0 60 4 6.7 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.452991453 0.452991453 1 0.417445483 0.417445483 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.000243755 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 111144906 C G - - - - - - 38 0 0 57 5 8.8 9 1 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.948717949 0.948717949 1 0.548286604 0.548286604 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.044110422 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 113196044 C G - - - - - - 33 0 0 59 5 8.5 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.777777778 0.777777778 1 0.529595016 0.529595016 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.05364542 1 0.0000125 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 113524229 C A - - - - - - 34 0 0 60 4 6.7 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.417445483 0.417445483 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000243755 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 113664556 T A - - - - - - 42 0 0 57 4 7 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.897435897 0.897435897 1 0.436137072 0.436137072 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.000199821 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 119016886 G T C6orf204 ENST00000392500 r.? - - intronic 41 0 0 47 5 10.6 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.658119658 0.658119658 1 0.660436137 0.660436137 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 119498807 A T MAN1A1 CCDS5122.1 r.4581u>a c.? p.? 3'UTR variant 38 0 0 57 4 7 21 3 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.222222222 1.222222222 1 0.436137072 0.436137072 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000155401 1 0.000199821 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 122692552 T G - - - - - - 36 0 0 53 3 5.7 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.355140187 0.355140187 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.002429596 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 122916113 C A PKIB CCDS5126.1 r.? - - intronic 46 0 0 49 5 10.2 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.635514019 0.635514019 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 124205006 C A NKAIN2 CCDS34526.1 r.? - - intronic 17 0 0 40 6 15 5 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.934579439 0.934579439 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 5.18E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 124896464 A C NKAIN2 CCDS34526.1 r.? - - intronic 39 0 0 46 3 6.5 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.658119658 0.658119658 1 0.404984424 0.404984424 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.001615827 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 138146506 G A - - - - - - 40 0 0 41 4 9.8 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.52991453 0.52991453 1 0.6105919 0.6105919 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.0000546 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 145956879 T A EPM2A CCDS5206.1 r.? - - intronic 43 0 0 40 3 7.5 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.46728972 0.46728972 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.001075403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 147155059 A C - - - - - - 41 0 0 49 3 6.1 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.380062305 0.380062305 1 NA NA 1 NA NA 1 1 NA 1 1 1 1 0.001939399 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 151380744 C G MTHFD1L CCDS5228.1 r.? - - intronic 26 0 0 44 4 9.1 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.566978193 0.566978193 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000723 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 157945332 A C ZDHHC14 CCDS5252.1 r.? - - intronic 30 0 0 61 6 9.8 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.6105919 0.6105919 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000685 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 158686017 T G - - - - - - 33 0 0 40 3 7.5 13 2 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.316239316 1.316239316 1 0.46728972 0.46728972 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001879825 1 0.001075403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 160989784 C G LPA CCDS43523.1 r.? - - intronic 31 0 0 56 4 7.1 23 1 4.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.367521368 0.367521368 1 0.442367601 0.442367601 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.108890944 1 0.000186538 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 161190842 T C - - - - - - 38 0 0 39 4 10.3 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.641744548 0.641744548 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 161642062 C T AGPAT4 CCDS5280.1 r.? - - intronic 48 0 0 47 5 10.6 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.504273504 0.504273504 1 0.660436137 0.660436137 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 163779512 G C - - - - - - 33 0 0 44 4 9.1 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.566978193 0.566978193 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000723 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 164542251 A T - - - - - - 34 0 0 50 8 16 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.897435897 0.897435897 1 0.996884735 0.996884735 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 1.74E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 165017941 C T ENSG00000237744 ENST00000425920 r.? - - intronic 32 0 0 48 7 14.6 20 4 20 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.709401709 1.709401709 1 0.909657321 0.909657321 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.00000284 1 4.81E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 166041590 A G PDE10A CCDS5289.1 r.? - - intronic 37 0 0 57 5 8.8 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.452991453 0.452991453 1 0.548286604 0.548286604 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 166094478 C A - - - - - - 42 0 0 60 4 6.7 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.572649573 0.572649573 1 0.417445483 0.417445483 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.000243755 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 169114152 G C ENSG00000237355 ENST00000431326 r.? - - upstream 33 0 0 36 3 8.3 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.517133956 0.517133956 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000788827 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 169749979 T C - - - - - - 34 0 0 51 6 11.8 13 2 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.316239316 1.316239316 1 0.735202492 0.735202492 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001879825 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 1714943 C A ENSG00000224268 ENST00000436115 r.? - - intronic 38 0 0 38 5 13.2 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.822429907 0.822429907 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000137 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 4028473 G C SDK1 CCDS34590.1 r.? - - intronic 33 0 0 41 4 9.8 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.6105919 0.6105919 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000546 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 5415610 C A TNRC18 CCDS47534.1 r.? - - intronic 34 0 0 32 4 12.5 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.572649573 0.572649573 1 0.778816199 0.778816199 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.0000201 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 8519835 A C NXPH1 CCDS47540.1 r.? - - intronic 53 0 0 44 4 9.1 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.566978193 0.566978193 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000723 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 11377605 A G - - - - - - 36 0 0 53 4 7.5 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.46728972 0.46728972 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 12321618 A T - - - - - - 38 0 0 48 3 6.2 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.386292835 0.386292835 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.001827434 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 14495722 A T DGKB CCDS47547.1 r.? - - intronic 46 0 0 53 5 9.4 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.41025641 0.41025641 1 0.585669782 0.585669782 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.099912572 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 15809804 A T - - - - - - 40 0 0 56 3 5.4 22 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.336448598 0.336448598 1 NA NA 1 NA NA 1 1 NA 1 1 1 1 0.00284314 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 18137567 A C HDAC9 ENST00000433709 r.? - - intronic 32 0 0 57 6 10.5 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.654205607 0.654205607 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000456 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 18985539 A T HDAC9 CCDS47554.1 r.? - - intronic 29 0 0 44 3 6.8 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.504273504 0.504273504 1 0.423676012 0.423676012 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.00142027 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 20811066 G A - - - - - - 30 0 0 45 4 8.9 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.554517134 0.554517134 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 24129567 A G - - - - - - 40 0 0 51 8 15.7 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.658119658 0.658119658 1 0.978193146 0.978193146 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 2.05E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 25265457 G C NPVF CCDS5395.1 r.? - - intronic 33 0 0 60 5 8.3 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.427350427 0.427350427 1 0.517133956 0.517133956 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.0000136 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 28927612 A G - - - - - - 36 0 0 43 4 9.3 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.579439252 0.579439252 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 28927613 C A - - - - - - 36 0 0 43 4 9.3 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.579439252 0.579439252 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 52590866 G C - - - - - - 30 0 0 34 4 11.8 8 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.735202492 0.735202492 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000257 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 53808660 C G - - - - - - 28 0 0 44 4 9.1 22 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.566978193 0.566978193 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000723 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 54259986 C T - - - - - - 50 0 0 46 4 8.7 22 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.542056075 0.542056075 1 NA NA 1 NA NA 1 1 NA 1 1 1 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 64218523 C A - - - - - - 32 0 0 50 5 10 24 2 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.792401709 0.792401709 1 0.743202071 0.743202071 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.006413403 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 65282944 G C AC008267.2 ENST00000418858 r.? - - intronic 33 0 0 52 9 17.3 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.563273504 0.563273504 1 1.285739583 1.285739583 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 5.92E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 66813297 C T - - - - - - 32 0 0 44 9 20.5 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.45825641 0.45825641 1 1.523564246 1.523564246 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.099912572 1 1.18E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 67815828 G A - - - - - - 40 0 0 59 5 8.5 26 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0 0 1 0.63172176 0.63172176 1 NA NA 1 NA NA 0 1 NA 1 1 1 1 0.0000125 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 67902414 T G - - - - - - 40 0 0 56 8 14.3 24 5 20.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.985777778 1.985777778 1 1.062778962 1.062778962 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.000000123 1 4.48E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 68994666 A T - - - - - - 38 0 0 48 10 20.8 11 2 18.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.737555556 1.737555556 1 1.545860308 1.545860308 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.001334363 1 5.37E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 70419713 A G - - - - - - 35 0 0 68 11 16.2 14 3 21.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 2.043059829 2.043059829 1 1.203987355 1.203987355 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.0000437 1 5.76E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 70772508 A C WBSCR17 CCDS5540.1 r.? - - intronic 39 0 0 60 9 15 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0 0 1 1.114803107 1.114803107 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 2.29E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 70791524 G A WBSCR17 CCDS5540.1 r.? - - intronic 37 0 0 53 9 17 27 4 14.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.412957265 1.412957265 1 1.263443521 1.263443521 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.00001 1 7.1E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 71313946 C A CALN1 CCDS47603.1 r.? - - intronic 39 0 0 53 4 7.5 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.639649573 0.639649573 1 0.557401553 0.557401553 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 71407308 G A CALN1 CCDS47603.1 r.? - - intronic 28 0 0 46 9 19.6 8 2 25 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 2.386752137 2.386752137 1 1.456676059 1.456676059 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.000686131 1 1.82E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 75172918 A T HIP1 CCDS34669.1 r.? - - intronic 33 0 0 52 7 13.5 15 4 26.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 2.549051282 2.549051282 1 1.003322796 1.003322796 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.000000816 1 8.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 77794761 A G MAGI2 CCDS5594.1 r.? - - intronic 57 0 0 52 14 26.9 16 4 25 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 2.386752137 2.386752137 1 1.999213571 0.999606786 2 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.00000108 1 9.04E-21 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 79946721 T A - - - - - - 45 0 0 58 10 17.2 27 5 18.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.766196581 1.766196581 1 1.278307562 1.278307562 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.00000023 1 4.1E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 80806919 G C ENSG00000237896 ENST00000431501 r.? - - intronic 40 0 0 73 11 15.1 21 3 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.365222222 1.365222222 1 1.122235127 1.122235127 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.000155401 1 1.31E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 82880494 C A - - - - - - 51 0 0 60 6 10 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.534632479 0.534632479 1 0.743202071 0.743202071 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.000000621 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 82992822 C A SEMA3E CCDS34674.1 r.? - - downstream 43 0 0 56 4 7.1 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0 0 1 0.52767347 0.52767347 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000186538 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 83378905 C G - - - - - - 38 0 0 34 8 23.5 10 2 20 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.909401709 1.909401709 1 1.746524867 1.746524867 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.001095391 1 6.32E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 83492386 C A - - - - - - 37 0 0 55 12 21.8 16 6 37.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 3.580128205 1.790064103 2 1.620180515 1.620180515 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 1.2E-10 1 8.78E-17 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 84691655 A G SEMA3D CCDS34676.1 r.? - - intronic 34 0 0 67 5 7.5 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0 0 1 0.557401553 0.557401553 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000233 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 86068551 T C - - - - - - 41 0 0 60 11 18.3 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.505991453 0.505991453 1 1.36005979 1.36005979 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 1.34E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 86218473 T C - - - - - - 37 0 0 47 6 12.8 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0 0 1 0.951298651 0.951298651 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000141 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 86290662 G A GRM3 CCDS5600.1 r.? - - intronic 42 0 0 53 11 20.8 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.954700855 0.954700855 1 1.545860308 1.545860308 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.04888987 1 3.07E-15 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 87038759 G A ABCB4 CCDS5606.1 r.? - - intronic 39 0 0 63 7 11.1 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.563273504 0.563273504 1 0.824954299 0.824954299 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 3.38E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 89109596 C T - - - - - - 35 0 0 63 10 15.9 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.534632479 0.534632479 1 1.181691293 1.181691293 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 9.81E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 89234695 T G - - - - - - 32 0 0 48 6 12.5 21 5 23.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 2.272188034 2.272188034 1 0.929002589 0.929002589 1 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 5.95E-08 1 0.00000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 91459524 C A - - - - - - 37 0 0 72 4 5.6 22 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0 0 1 0.41619316 0.41619316 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000490365 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 92745185 G A SAMD9 CCDS34680.1 r.? - - intronic 35 0 0 49 9 18.4 22 4 18.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.737555556 1.737555556 1 1.367491811 1.367491811 1 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 0.00000425 1 3.35E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 93454926 C G GNGT1 ENST00000455502 r.? - - intronic 46 0 0 61 4 6.6 21 2 9.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.906965812 0.906965812 1 0.490513367 0.490513367 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004928472 1 0.000259828 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 93626229 T C BET1 CCDS5635.1 r.? - - intronic 47 0 0 64 5 7.8 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.002435897 1.002435897 1 0.579697615 0.579697615 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.0000186 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 94783269 T G PPP1R9A CCDS34683.1 r.? - - intronic 48 0 0 57 9 15.8 21 2 9.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.906965812 0.906965812 1 1.174259272 1.174259272 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004928472 1 1.42E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 95151078 G A ASB4 CCDS5641.1 r.? - - intronic 38 0 0 62 9 14.5 19 3 15.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.50842735 1.50842735 1 1.077643003 1.077643003 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.000114071 1 3.12E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 96015071 C T - - - - - - 28 0 0 57 5 8.8 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.477350427 0.477350427 1 0.654017823 0.654017823 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 98206623 G C - - - - - - 45 0 0 47 10 21.3 24 5 20.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.985777778 1.985777778 1 1.583020411 1.583020411 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.000000123 1 4.27E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 99110759 G A ZKSCAN5 CCDS5667.1 r.? - - intronic 33 0 0 59 13 22 11 3 27.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 2.606333333 2.606333333 1 1.635044556 0.817522278 2 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.00002 1 3.99E-18 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 100812254 G T C7orf52 CCDS5713.1 r.? - - downstream 43 0 0 57 4 7 22 2 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.868777778 0.868777778 1 0.52024145 0.52024145 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.005403392 1 0.000199821 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 101118069 C T EMID2 ENST00000397927 r.? - - intronic 48 0 0 63 6 9.5 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.505991453 0.505991453 1 0.706041968 0.706041968 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.000000832 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 108801240 T G - - - - - - 35 0 0 45 6 13.3 19 5 26.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 2.510863248 1.255431624 2 0.988458755 0.988458755 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 3.43E-08 1 0.000000108 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 112529205 A G C7orf60 CCDS43634.1 r.? - - intronic 48 0 0 55 10 18.2 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.59191453 0.59191453 1 1.352627769 1.352627769 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 2.33E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 114480827 G C - - - - - - 28 0 0 51 8 15.7 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.954700855 0.954700855 1 1.166827252 1.166827252 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004473894 1 2.05E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 114748197 G T - - - - - - 32 0 0 63 17 27 24 2 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.792401709 0.792401709 1 2.006645592 1.003322796 2 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.006413403 1 6.22E-25 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 118701639 C G - - - - - - 45 0 0 60 4 6.7 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.792401709 0.792401709 1 0.497945388 0.497945388 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.000243755 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 119193858 A T - - - - - - 33 0 0 63 5 7.9 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.477350427 0.477350427 1 0.587129636 0.587129636 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.0000173 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 119219326 A G - - - - - - 34 0 0 66 5 7.6 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.477350427 0.477350427 1 0.564833574 0.564833574 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.0000217 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 119340536 A G - - - - - - 54 0 0 50 4 8 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.505991453 0.505991453 1 0.594561657 0.594561657 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.000119787 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 119629196 T C - - - - - - 39 0 0 50 12 24 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.59191453 0.59191453 1 1.783684971 0.891842485 2 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 2.49E-17 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 119909008 C G KCND2 CCDS5776.1 r.? - - upstream 46 0 0 57 9 15.8 24 4 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.594350427 1.594350427 1 1.174259272 1.174259272 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.00000613 1 1.42E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 120243814 A C KCND2 CCDS5776.1 r.? - - intronic 51 0 0 62 6 9.7 31 1 3.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.305504274 0.305504274 1 0.720906009 0.720906009 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.143917729 1 0.000000756 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 122294824 T C CADPS2 CCDS47691.1 r.? - - intronic 43 0 0 68 18 26.5 19 4 21.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 2.014418803 2.014418803 1 1.969485488 0.984742744 2 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.00000228 1 3.83E-26 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 123891970 A G - - - - - - 38 0 0 57 4 7 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.45825641 0.45825641 1 0.52024145 0.52024145 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.099912572 1 0.000199821 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 124655613 C A - - - - - - 48 0 0 59 6 10.2 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0 0 1 0.758066113 0.758066113 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000561 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 124960295 C T - - - - - - 30 0 0 54 12 22.2 19 4 21.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 2.014418803 2.014418803 1 1.649908598 0.824954299 2 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 0.00000228 1 6.9E-17 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 125427708 G T - - - - - - 30 0 0 56 10 17.9 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.954700855 0.954700855 1 1.330331707 1.330331707 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004473894 1 2.82E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 125659570 T C ENSG00000230519 ENST00000420567 r.? - - intronic 38 0 0 61 5 8.2 28 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0 0 1 0.609425698 0.609425698 1 NA NA 0 NA NA 0 1 NA 1 1 1 1 0.0000147 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 126432052 T C GRM8 CCDS5794.1 r.? - - intronic 33 0 0 54 4 7.4 22 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0 0 1 0.549969533 0.549969533 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 126641976 T G GRM8 CCDS5794.1 r.? - - intronic 38 0 0 66 5 7.6 27 1 3.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.353239316 0.353239316 1 0.564833574 0.564833574 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.126579904 1 0.0000217 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 128560026 G T - - - - - - 32 0 0 54 6 11.1 21 4 19 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.813931624 1.813931624 1 0.824954299 0.824954299 1 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 0.00000349 1 0.000000329 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 129949002 A T CPA4 CCDS5818.1 r.? - - intronic 41 0 0 50 4 8 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.477350427 0.477350427 1 0.594561657 0.594561657 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.000119787 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 131019755 T G MKLN1 CCDS34754.1 r.? - - intronic 28 0 0 47 10 21.3 20 3 15 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.432051282 1.432051282 1 1.583020411 1.583020411 1 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 0.0001337 1 4.27E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 133502984 T A EXOC4 CCDS5829.1 r.? - - intronic 35 0 0 70 16 22.9 21 3 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.365222222 1.365222222 1 1.701932743 0.850966371 2 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000155401 1 2.93E-22 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 134245249 T C AKR1B15 CCDS47715.1 r.? - - upstream 47 0 0 49 4 8.2 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0 0 1 0.609425698 0.609425698 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 136674349 G T CHRM2 CCDS5843.1 r.? - - intronic 27 0 0 67 12 17.9 17 3 17.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.680273504 1.680273504 1 1.330331707 1.330331707 1 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 0.0000807 1 1.14E-15 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 137428591 T G DGKI CCDS5845.1 r.? - - intronic 21 0 0 51 4 7.8 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0 0 1 0.579697615 0.579697615 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000129466 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 139500649 G T TBXAS1 CCDS5855.1 r.? - - intronic 38 0 0 58 5 8.6 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.954700855 0.954700855 1 0.639153781 0.639153781 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004473894 1 0.0000115 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 139525655 T C TBXAS1 CCDS5855.1 r.? - - intronic 23 0 0 62 14 22.6 21 2 9.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.906965812 0.906965812 1 1.679636681 0.83981834 2 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004928472 1 1.42E-19 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 141848973 G T ENSG00000204987 ENST00000477922 r.? - - intronic 40 0 0 64 13 20.3 28 5 17.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.70891453 1.70891453 1 1.508700204 1.508700204 1 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 0.000000279 1 1.26E-17 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 142845891 C G - - - - - - 41 0 0 68 14 20.6 19 3 15.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.50842735 1.50842735 1 1.530996266 1.530996266 1 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 0.000114071 1 5.84E-19 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 146079120 A G CNTNAP2 CCDS5889.1 r.? - - intronic 41 0 0 58 16 27.6 21 6 28.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 2.730444444 1.365222222 2 2.051237716 1.025618858 2 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 7.95E-10 1 1E-23 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 146632400 C G CNTNAP2 CCDS5889.1 r.? - - intronic 34 0 0 69 5 7.2 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.505991453 0.505991453 1 0.535105491 0.535105491 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.0000269 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 147128673 G C CNTNAP2 CCDS5889.1 r.? - - intronic 41 0 0 55 13 23.6 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0 0 1 1.753956888 0.876978444 2 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 1.46E-18 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 147734474 G A CNTNAP2 CCDS5889.1 r.? - - intronic 33 0 0 62 5 8.1 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.563273504 0.563273504 1 0.601993678 0.601993678 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 147802185 G C CNTNAP2 CCDS5889.1 r.? - - intronic 34 0 0 53 10 18.9 15 0 0 0 0 NA 1 0 0 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0 0 1 1.404651914 1.404651914 1 NA NA 0 0 NA 0 2 NA 1 1 1 1 1.57E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 148226411 A C - - - - - - 51 0 0 61 7 11.5 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0 0 1 0.854682382 0.854682382 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 2.69E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 149294278 G T - - - - - - 34 0 0 50 9 18 18 5 27.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 2.654068376 1.327034188 2 1.337763728 1.337763728 1 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 2.54E-08 1 4.07E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 150221531 C G GIMAP7 CCDS5903.1 r.? - - downstream 42 0 0 55 4 7.3 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0 0 1 0.542537512 0.542537512 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000173903 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 151204235 C T RHEB CCDS5927.1 r.? - - intronic 39 0 0 66 5 7.6 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.677837607 0.677837607 1 0.564833574 0.564833574 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.0000217 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 152371507 G C XRCC2 CCDS5933.1 r.? - - intronic 24 0 0 50 9 18 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.126547009 1.126547009 1 1.337763728 1.337763728 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003234386 1 4.07E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 152677858 G C - - - - - - 41 0 0 58 5 8.6 20 5 25 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 2.386752137 1.193376068 2 0.639153781 0.639153781 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 4.55E-08 1 0.0000115 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 152821810 C G - - - - - - 32 0 0 54 10 18.5 14 3 21.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 2.043059829 2.043059829 1 1.374923832 1.374923832 1 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 0.0000437 1 1.91E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 155927268 T C - - - - - - 42 0 0 67 5 7.5 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.735119658 0.735119658 1 0.557401553 0.557401553 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.0000233 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 157500767 C G PTPRN2 CCDS5949.1 r.? - - intronic 32 0 0 60 5 8.3 24 1 4.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.400974359 0.400974359 1 0.616857719 0.616857719 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.113346489 1 0.0000136 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 157597834 T C PTPRN2 CCDS5949.1 r.? - - intronic 40 0 0 47 8 17 19 5 26.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 2.510863248 1.255431624 2 1.263443521 1.263443521 1 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 3.43E-08 1 1.03E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 158197381 C A PTPRN2 CCDS5949.1 r.? - - intronic 31 0 0 34 4 11.8 8 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0 0 1 0.876978444 0.876978444 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000257 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 158276096 T A PTPRN2 CCDS5949.1 r.? - - intronic 33 0 0 48 10 20.8 21 3 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.365222222 1.365222222 1 1.545860308 1.545860308 1 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 0.000155401 1 5.37E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 1661306 T A DLGAP2 CCDS47760.1 r.? - - downstream 37 0 0 51 9 17.6 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 1.028131345 1.028131345 1 1.150855561 1.150855561 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.04888987 1 4.92E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 1743888 C T - - - - - - 35 0 0 54 7 13 24 3 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 1.285164181 1.285164181 1 0.850063767 0.850063767 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000233853 1 1.13E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 2069435 C A MYOM2 CCDS5957.1 r.? - - intronic 36 0 0 51 7 13.7 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 1.079537912 1.079537912 1 0.895836431 0.895836431 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004039874 1 7.46E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 2319685 G T - - - - - - 43 0 0 47 5 10.6 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0 0 1 0.693128917 0.693128917 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 3389848 T A CSMD1 ENST00000318252 r.? - - intronic 39 0 0 40 3 7.5 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0 0 1 0.490421404 0.490421404 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.001075403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 4564232 C A - - - - - - 33 0 0 57 5 8.8 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0 0 1 0.57542778 0.57542778 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 4642233 G A - - - - - - 35 0 0 42 4 9.5 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0.544909613 0.544909613 1 0.621200445 0.621200445 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.0000601 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 5487825 A C - - - - - - 30 0 0 58 4 6.9 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 1.028131345 1.028131345 1 0.451187692 0.451187692 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.04888987 1 0.000213772 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 6208211 A T - - - - - - 40 0 0 58 5 8.6 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0 0 1 0.562349876 0.562349876 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000115 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 6500245 G C MCPH1 CCDS43689.1 r.? - - intronic 29 0 0 45 4 8.9 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0 0 1 0.581966733 0.581966733 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 8186435 C A ENSG00000182319 CCDS43706.1 r.? - - intronic 39 0 0 74 9 12.2 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0.514065672 0.514065672 1 0.79775215 0.79775215 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.09538952 1 1.61E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 9790593 G C - - - - - - 42 0 0 37 3 8.1 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0.853349016 0.853349016 1 0.529655116 0.529655116 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.000855237 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 9971276 T G MSRA CCDS47799.1 r.? - - intronic 37 0 0 51 6 11.8 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0.688848001 0.688848001 1 0.771596342 0.771596342 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 10232773 G A MSRA CCDS47799.1 r.? - - intronic 42 0 0 43 4 9.3 16 3 18.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 1.932886928 1.932886928 1 0.608122541 0.608122541 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000667 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 13108823 G T DLC1 CCDS5989.1 r.? - - intronic 25 0 0 55 4 7.3 22 2 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0.935599524 0.935599524 1 0.4773435 0.4773435 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.005403392 1 0.000173903 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 13639341 G A - - - - - - 47 0 0 42 7 16.7 20 3 15 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 1.542197017 1.542197017 1 1.092004993 1.092004993 1 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 0.0001337 1 1.81E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 14411638 T G SGCZ CCDS5992.2 r.? - - intronic 35 0 0 48 4 8.3 14 3 21.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 2.200201078 2.200201078 1 0.54273302 0.54273302 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000437 1 0.000102016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 14585568 G A SGCZ CCDS5992.2 r.? - - intronic 29 0 0 50 5 10 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0 0 1 0.653895205 0.653895205 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 16316202 G A - - - - - - 39 0 0 50 7 14 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0.688848001 0.688848001 1 0.915453287 0.915453287 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 6.46E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 16727251 T G - - - - - - 34 0 0 57 5 8.8 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0 0 1 0.57542778 0.57542778 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 20010584 T G SLC18A1 CCDS6013.1 r.? - - intronic 35 0 0 56 9 16.1 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0.791661135 0.791661135 1 1.05277128 1.05277128 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.063085307 1 1.2E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 25325028 A G CDCA2 CCDS6049.1 r.? - - intronic 35 0 0 46 5 10.9 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0 0 1 0.712745774 0.712745774 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000361 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 25795297 G T EBF2 CCDS43726.1 r.? - - intronic 22 0 0 49 5 10.2 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0 0 1 0.666973109 0.666973109 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 26096826 T G ENSG00000228451 ENST00000434116 r.? - - intronic 36 0 0 53 3 5.7 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0.688848001 0.688848001 1 0.372720267 1.208473182 0.308422456 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.002429596 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 29095779 A T KIF13B ENST00000357808 r.? - - intronic 42 0 0 40 3 7.5 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0.935599524 0.935599524 1 0.490421404 0.490421404 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.05364542 1 0.001075403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 29317135 A G - - - - - - 42 0 0 56 5 8.9 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0.853349016 0.853349016 1 0.581966733 0.581966733 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.00000965 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 31210897 T C - - - - - - 29 0 0 48 4 8.3 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0.606597493 0.606597493 1 0.54273302 0.54273302 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.000102016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 31697741 C A NRG1 CCDS47836.1 r.? - - intronic 23 0 0 57 5 8.8 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 1.470227823 1.470227823 1 0.57542778 0.57542778 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002185852 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 33440185 G C - - - - - - 35 0 0 53 7 13.2 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0 0 1 0.863141671 0.863141671 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 9.85E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 33835112 C G - - - - - - 40 0 0 53 5 9.4 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0 0 1 0.614661493 0.614661493 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 34360119 C T - - - - - - 27 0 0 56 6 10.7 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0.729973255 0.729973255 1 0.699667869 0.699667869 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.000000409 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 34478768 T A - - - - - - 52 0 0 52 7 13.5 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0 0 1 0.882758527 0.882758527 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 8.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 36297141 T C - - - - - - 40 0 0 58 5 8.6 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0.606597493 0.606597493 1 0.562349876 0.562349876 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.0000115 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 36355384 C G - - - - - - 44 0 0 45 5 11.1 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0.544909613 0.544909613 1 0.725823678 0.725823678 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.00000323 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 36584944 A C - - - - - - 34 0 0 59 4 6.8 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0 0 1 0.444648739 0.444648739 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00022841 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 36757337 A C KCNU1 ENST00000399881 r.? - - intronic 45 0 0 46 4 8.7 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0.606597493 0.606597493 1 0.568888828 0.568888828 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 36806271 C G - - - - - - 47 0 0 47 6 12.8 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0 0 1 0.836985863 0.836985863 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000141 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 37916606 G C EIF4EBP1 CCDS6100.1 r.? - - intronic 37 0 0 65 19 29.2 25 5 20 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 2.056262689 2.056262689 1 1.909373999 1.459294733 1.308422456 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 0.000000153 1 1.89E-28 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 37916700 G C EIF4EBP1 CCDS6100.1 r.? - - intronic 32 0 0 74 27 36.5 25 6 24 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 2.467515227 1.233757614 2 2.386717499 1.824118417 1.308422456 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 2.55E-09 1 6.97E-43 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 37916737 G T EIF4EBP1 CCDS6100.1 r.? - - intronic 32 0 0 67 23 34.3 27 4 14.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 1.52163439 1.52163439 1 2.242860554 1.714171553 1.308422456 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 0.00001 1 5.12E-36 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 38454121 T A - - - - - - 38 0 0 51 9 17.6 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0 0 1 1.150855561 1.150855561 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 4.92E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 38992035 C A ADAM32 CCDS47846.1 r.? - - intronic 34 0 0 65 8 12.3 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0.935599524 0.935599524 1 0.804291102 0.804291102 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.05364542 1 1.53E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 40633951 T G ZMAT4 CCDS34885.1 r.? - - intronic 34 0 0 54 9 16.7 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 1.285164181 1.285164181 1 1.092004993 1.092004993 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002863359 1 8.48E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 41332808 A G - - - - - - 37 0 0 51 6 11.8 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 2.308422456 2 1 1 1 0.265695101 0.691577544 2 2 2 1 0.734304899 0.308422456 0.544909613 0.544909613 1 0.771596342 0.771596342 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 47505098 T C - - - - - - 41 0 0 47 6 12.8 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 1.053507788 1.053507788 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000000141 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 50158989 G T - - - - - - 44 0 0 47 7 14.9 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.606597493 NA 0 1.22634891 1.22634891 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.081683532 1 4.12E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 51656418 G T SNTG1 CCDS6147.1 r.? - - intronic 31 0 0 55 4 7.3 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.60082866 0.60082866 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000173903 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 51885055 T G - - - - - - 32 0 0 50 3 6 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.493831776 0.493831776 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.002055544 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 55233641 T C - - - - - - 46 0 0 60 6 10 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.079537912 1.079537912 1 0.82305296 0.82305296 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.000000621 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 56061364 T C XKR4 CCDS34893.1 r.? - - intronic 34 0 0 59 4 6.8 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.559676012 0.559676012 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00022841 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 56071812 A T XKR4 CCDS34893.1 r.? - - intronic 43 0 0 43 3 7 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.576137072 0.576137072 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.001328364 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 56242492 A T XKR4 CCDS34893.1 r.? - - intronic 27 0 0 48 5 10.4 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.855975078 0.855975078 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 57221689 T A SDR16C5 CCDS6167.1 r.? - - intronic 42 0 0 47 4 8.5 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.853349016 0.853349016 1 0.699595016 0.699595016 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 57870035 C G IMPAD1 CCDS6169.1 r.? - - downstream 37 0 0 58 4 6.9 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.567906542 0.567906542 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000213772 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 57938692 T C - - - - - - 49 0 0 54 5 9.3 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.606597493 NA 0 0.765439252 0.765439252 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.081683532 1 0.00000806 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 57938693 A T - - - - - - 48 0 0 53 5 9.4 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.606597493 NA 0 0.773669782 0.773669782 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.081683532 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 58568686 C G - - - - - - 48 0 0 60 5 8.3 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.606597493 NA 0 0.683133956 0.683133956 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.081683532 1 0.0000136 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 58917886 T G FAM110B CCDS6170.1 r.? - - intronic 38 0 0 65 7 10.8 11 2 18.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.871199047 1.871199047 1 0.888897196 0.888897196 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001334363 1 4.22E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 59417754 T C - - - - - - 25 0 0 66 6 9.1 23 2 8.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.89447427 0.89447427 1 0.748978193 0.748978193 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.00589844 1 0.0000011 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 60365325 A T - - - - - - 39 0 0 72 5 6.9 22 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.567906542 0.567906542 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.0000331 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 61211812 T C - - - - - - 40 0 0 43 5 11.6 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.729973255 NA 0 0.954741433 0.954741433 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.067769881 1 0.00000257 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 61420175 A G - - - - - - 27 0 0 44 6 13.6 8 1 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.285164181 1.285164181 1 1.119352025 1.119352025 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.039306956 1 9.37E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 63338622 T C - - - - - - 34 0 0 64 9 14.1 23 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 1.160504673 1.160504673 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 4.2E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 65718785 C G - - - - - - 33 0 0 56 5 8.9 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.732517134 0.732517134 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00000965 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 66368896 G T - - - - - - 27 0 0 55 4 7.3 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.60082866 0.60082866 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000173903 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 67882480 T G LRRC67 ENST00000421742 r.? - - intronic 37 0 0 58 4 6.9 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.028131345 1.028131345 1 0.567906542 0.567906542 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.04888987 1 0.000213772 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 69504266 C T C8orf34 CCDS6203.1 r.? - - intronic 39 0 0 56 8 14.3 20 3 15 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.542197017 1.542197017 1 1.176965732 1.176965732 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.0001337 1 4.48E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 69710220 A G C8orf34 CCDS6203.1 r.? - - intronic 33 0 0 40 4 10 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.82305296 0.82305296 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.0000495 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 69760626 T G - - - - - - 35 0 0 49 7 14.3 24 1 4.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.431815165 NA 0 1.176965732 1.176965732 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.113346489 1 5.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 69766435 G T - - - - - - 36 0 0 52 4 7.7 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.633750779 0.633750779 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000139698 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 69978891 C A - - - - - - 33 0 0 49 5 10.2 25 1 4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.411252538 NA 0 0.839514019 0.839514019 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.117779757 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 70161760 C T - - - - - - 20 0 0 24 4 16.7 4 1 25 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 2.570328362 2.570328362 1 1.374498442 1.374498442 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.019850499 1 0.00000613 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 71910365 G T - - - - - - 43 0 0 51 4 7.8 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.641981308 0.641981308 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000129466 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 72104073 C G - - - - - - 41 0 0 67 7 10.4 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.688848001 NA 0 0.855975078 0.855975078 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.072431031 1 5.23E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 72130598 C A EYA1 CCDS34906.1 r.? - - intronic 28 0 0 59 7 11.9 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.575753553 NA 0 0.979433022 0.979433022 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.086275114 1 2.12E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 72131596 G C EYA1 CCDS34906.1 r.? - - intronic 33 0 0 57 4 7 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.576137072 0.576137072 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000199821 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 72669457 A T - - - - - - 32 0 0 64 8 12.5 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.493503045 NA 0 1.028816199 1.028816199 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.099912572 1 1.35E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 74297399 G A - - - - - - 35 0 0 58 11 19 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.544909613 NA 0 1.563800623 1.563800623 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.090843738 1 8.96E-15 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 74305311 A T - - - - - - 37 0 0 53 4 7.5 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.079537912 1.079537912 1 0.61728972 0.61728972 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 74325410 G C - - - - - - 40 0 0 47 4 8.5 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.637441434 NA 0 0.699595016 0.699595016 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.077068876 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 74524408 A G STAU2 CCDS6214.1 r.? - - intronic 39 0 0 40 4 10 25 1 4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.411252538 NA 0 0.82305296 0.82305296 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.117779757 1 0.0000495 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 76126528 T C - - - - - - 40 0 0 47 4 8.5 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.699595016 0.699595016 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 77543559 C A - - - - - - 32 0 0 58 7 12.1 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.995894081 0.995894081 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 1.88E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 77543560 A G - - - - - - 32 0 0 58 7 12.1 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.995894081 0.995894081 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 1.88E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 77735320 T A ZFHX4 CCDS47878.1 r.? - - intronic 37 0 0 57 4 7 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.688848001 NA 0 0.576137072 0.576137072 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.072431031 1 0.000199821 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 78892427 A G - - - - - - 43 0 0 46 5 10.9 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.853349016 0.853349016 1 0.897127726 0.897127726 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.00000361 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 80145261 A C - - - - - - 51 0 0 57 4 7 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.285164181 1.285164181 1 0.576137072 0.576137072 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.000199821 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 81396952 T C ZBTB10 CCDS47880.1 r.? - - upstream 38 0 0 53 7 13.2 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.853349016 0.853349016 1 1.086429907 1.086429907 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 9.85E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 82496566 C T - - - - - - 29 0 0 59 5 8.5 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.606597493 NA 0 0.699595016 0.699595016 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.081683532 1 0.0000125 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 83730145 G T - - - - - - 34 0 0 68 7 10.3 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.544909613 NA 0 0.847744548 0.847744548 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.090843738 1 0.000000058 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 83751614 G C - - - - - - 51 0 0 59 7 11.9 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.213194987 1.213194987 1 0.979433022 0.979433022 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.003234386 1 2.12E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 83903724 G T - - - - - - 36 0 0 44 4 9.1 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.748978193 0.748978193 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.0000723 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 84250303 G T - - - - - - 35 0 0 55 5 9.1 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.748978193 0.748978193 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00000883 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 84727052 G C - - - - - - 29 0 0 57 9 15.8 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.514065672 NA 0 1.300423676 1.300423676 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.09538952 1 1.42E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 85773968 A T RALYL ENST00000399361 r.? - - intronic 52 0 0 60 4 6.7 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.514065672 NA 0 0.551445483 0.551445483 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.09538952 1 0.000243755 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 85933277 C A - - - - - - 46 0 0 50 5 10 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.82305296 0.82305296 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 88005674 A C - - - - - - 43 0 0 53 4 7.5 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.61728972 0.61728972 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 88898972 C T - - - - - - 41 0 0 61 8 13.1 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.637441434 NA 0 1.078199377 1.078199377 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.077068876 1 9.09E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 89708717 C A - - - - - - 27 0 0 53 8 15.1 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 1.242809969 1.242809969 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 2.83E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 89725151 C G - - - - - - 42 0 0 53 5 9.4 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.213194987 1.213194987 1 0.773669782 0.773669782 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 90179585 C G - - - - - - 29 0 0 43 5 11.6 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.954741433 0.954741433 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00000257 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 91362447 T C - - - - - - 46 0 0 61 4 6.6 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.544909613 NA 0 0.543214953 0.543214953 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.090843738 1 0.000259828 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 92594134 T A - - - - - - 36 0 0 49 5 10.2 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.839514019 0.839514019 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 92635015 C A - - - - - - 44 0 0 60 8 13.3 22 2 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.935599524 0.935599524 1 1.094660436 1.094660436 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.005403392 1 7.93E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 93119268 C A - - - - - - 35 0 0 52 4 7.7 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.633750779 0.633750779 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000139698 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 93297610 T C - - - - - - 43 0 0 54 5 9.3 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.765439252 0.765439252 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00000806 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 93412634 A T - - - - - - 28 0 0 57 6 10.5 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.575753553 NA 0 0.864205607 0.864205607 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.086275114 1 0.000000456 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 93791744 C A - - - - - - 39 0 0 50 4 8 18 2 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.141225793 1.141225793 1 0.658442368 0.658442368 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.003626632 1 0.000119787 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 93849966 A T - - - - - - 41 0 0 53 4 7.5 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.61728972 0.61728972 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 94415794 C A AC011118.2 ENST00000501400 r.? - - intronic 42 0 0 47 4 8.5 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.637441434 NA 0 0.699595016 0.699595016 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.077068876 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 95241115 A G - - - - - - 42 0 0 46 5 10.9 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.544909613 NA 0 0.897127726 0.897127726 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.090843738 1 0.00000361 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 95517766 T A KIAA1429 CCDS34923.1 r.? - - intronic 31 0 0 43 3 7 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.576137072 0.576137072 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.001328364 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 98110703 G T ENSG00000104324 CCDS6273.1 r.? - - intronic 34 0 0 70 4 5.7 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.285164181 1.285164181 1 0.469140187 0.469140187 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.000440508 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 98946083 T C MATN2 ENST00000254898 r.? - - intronic 29 0 0 44 5 11.4 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.853349016 0.853349016 1 0.938280374 0.938280374 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.00000288 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 99738401 G C ENSG00000104375 CCDS47900.1 r.? - - intronic 36 0 0 52 6 11.5 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.946510903 0.946510903 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000000261 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 100163326 T G VPS13B CCDS6280.1 r.? - - intronic 40 0 0 48 6 12.5 22 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 1.028816199 1.028816199 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 100440789 A G VPS13B CCDS6280.1 r.? - - intronic 36 0 0 41 5 12.2 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 1.004124611 1.004124611 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00000202 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 100468105 C G VPS13B CCDS6280.1 r.? - - intronic 51 0 0 61 7 11.5 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 2 0 0 TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.367414688 1.367414688 1 0.946510903 0.946510903 1 0 NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002513772 1 2.69E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 103044075 T A NCALD CCDS6292.1 r.? - - intronic 36 0 0 45 4 8.9 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.732517134 0.732517134 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.0000791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 104291440 A G - - - - - - 44 0 0 48 4 8.3 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.683133956 0.683133956 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000102016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 106729915 C G ZFPM2 CCDS47908.1 r.? - - intronic 46 0 0 65 4 6.2 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.572292835 0.572292835 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000331785 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 106825176 A C - - - - - - 43 0 0 54 4 7.4 23 1 4.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.442096478 NA 0 0.68305919 0.68305919 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.108890944 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 107149356 G A - - - - - - 34 0 0 62 6 9.7 19 3 15.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.624447525 1.624447525 1 0.895361371 0.895361371 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000114071 1 0.000000756 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 108374576 A T ANGPT1 CCDS6306.1 r.? - - intronic 60 0 0 61 7 11.5 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.079537912 1.079537912 1 1.061510903 1.061510903 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004039874 1 2.69E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 109038303 G A RSPO2 CCDS6307.1 r.? - - intronic 36 0 0 64 5 7.8 25 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.719981308 0.719981308 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.0000186 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 110430934 C T PKHD1L1 CCDS47911.1 r.? - - intronic 37 0 0 50 6 12 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 1.107663551 1.107663551 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000000206 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 111724620 T C - - - - - - 40 0 0 56 5 8.9 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.821517134 0.821517134 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00000965 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 112163814 T G - - - - - - 40 0 0 78 11 14.1 21 2 9.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.976724777 0.976724777 1 1.301504673 1.301504673 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004928472 1 2.79E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 113056404 T A - - - - - - 41 0 0 46 6 13 7 1 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.470227823 1.470227823 1 1.199968847 1.199968847 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.034479353 1 0.000000123 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 113728761 C G CSMD3 CCDS6315.1 r.? - - intronic 51 0 0 56 4 7.1 24 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.655367601 0.655367601 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000186538 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 114302919 C T CSMD3 CCDS6315.1 r.? - - intronic 36 0 0 58 9 15.5 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.367414688 1.367414688 1 1.430732087 1.430732087 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.002513772 1 1.67E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 116164769 A T - - - - - - 37 0 0 54 7 13 12 2 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.716979346 1.716979346 1 1.199968847 1.199968847 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001595918 1 1.13E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 117449674 T A - - - - - - 40 0 0 61 11 18 28 1 3.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.370127284 NA 0 1.661495327 1.661495327 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.130947004 1 1.62E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 119372540 C G SAMD12 CCDS47913.1 r.? - - intronic 45 0 0 66 4 6.1 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.606597493 NA 0 0.563062305 0.563062305 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.081683532 1 0.000351793 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 119854142 G C - - - - - - 31 0 0 88 6 6.8 20 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.627676012 0.627676012 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00000596 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 120963926 A T DEPDC6 CCDS6331.1 r.? - - intronic 40 0 0 61 6 9.8 23 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.9045919 0.9045919 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000000685 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 122352198 T C - - - - - - 38 0 0 48 5 10.4 22 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.959975078 0.959975078 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 123249536 A C - - - - - - 40 0 0 51 7 13.7 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.637441434 NA 0 1.264582555 1.264582555 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.077068876 1 7.46E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 123402634 G C - - - - - - 42 0 0 63 5 7.9 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.729211838 0.729211838 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.0000173 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 123655358 A C - - - - - - 46 0 0 61 5 8.2 22 2 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.935599524 0.935599524 1 0.756903427 0.756903427 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.005403392 1 0.0000147 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 125277461 A C - - - - - - 37 0 0 50 10 20 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.575753553 NA 0 1.846105919 0.92305296 2 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.086275114 1 8.36E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 125504306 C T RNF139 CCDS6350.1 r.? - - downstream 40 0 0 48 7 14.6 11 2 18.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.871199047 1.871199047 1 1.347657321 1.347657321 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.001334363 1 4.81E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 125791413 G A ENSG00000235517 ENST00000422573 r.? - - intronic 32 0 0 52 5 9.6 27 4 14.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.52163439 1.52163439 1 0.886130841 0.886130841 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.00001 1 0.00000668 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 126192286 G A NSMCE2 CCDS6356.1 r.? - - intronic 31 0 0 74 5 6.8 23 3 13 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.336570748 1.336570748 1 0.627676012 0.627676012 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000205387 1 0.0000378 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 127184371 T C - - - - - - 32 0 0 66 6 9.1 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.285164181 1.285164181 1 0.839978193 0.839978193 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.0000011 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 127272178 A T - - - - - - 41 0 0 57 6 10.5 18 2 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.141225793 1.141225793 1 0.969205607 0.969205607 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.003626632 1 0.000000456 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 128279192 T G - - - - - - 19 0 0 40 3 7.5 8 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.69228972 0.69228972 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.001075403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 128334143 T C AC018714.1 ENST00000502082 r.? - - intronic 35 0 0 51 6 11.8 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.688848001 NA 0 1.089202492 1.089202492 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.072431031 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 128904234 G A PVT1 CCDS3617.1 r.? - - intronic 43 0 0 49 5 10.2 20 1 5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.514065672 NA 0 0.941514019 0.941514019 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.09538952 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 129411962 T G - - - - - - 45 0 0 60 6 10 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.92305296 0.92305296 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000000621 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 131054369 C G - - - - - - 38 0 0 49 5 10.2 8 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.941514019 0.941514019 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 138430704 C T - - - - - - 38 0 0 44 4 9.1 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.839978193 0.839978193 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.0000723 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 138839972 C A - - - - - - 34 0 0 47 4 8.5 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 0.784595016 0.784595016 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 139972915 A T - - - - - - 37 0 0 45 3 6.7 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.606597493 NA 0 0.618445483 0.618445483 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.081683532 1 0.001516071 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 140167995 T A - - - - - - 51 0 0 40 5 12.5 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.470227823 1.470227823 1 1.153816199 1.153816199 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002185852 1 0.00000178 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 140432483 C T - - - - - - 31 0 0 54 7 13 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.688848001 NA 0 1.199968847 1.199968847 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.072431031 1 1.13E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 142601228 G A - - - - - - 37 0 0 63 10 15.9 18 2 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.141225793 1.141225793 1 1.467654206 1.467654206 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.003626632 1 9.81E-13 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 143232737 C G - - - - - - 39 0 0 45 5 11.1 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.493503045 NA 0 1.024588785 1.024588785 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.099912572 1 0.00000323 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 830304 G A - - - - - - 40 0 0 52 7 13.5 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.244547009 1.244547009 1 1.111121495 1.111121495 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.003234386 1 8.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 1150389 A G - - - - - - 48 0 0 47 5 10.6 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.872436137 0.872436137 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 1798541 T C - - - - - - 39 0 0 39 5 12.8 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.50625641 0.50625641 1 1.053507788 1.053507788 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.099912572 1 0.00000156 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 5099636 T C JAK2 CCDS6457.1 r.? - - intronic 36 0 0 48 6 12.5 22 2 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.959777778 0.959777778 1 1.028816199 1.028816199 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.005403392 1 0.00000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 8235717 G C - - - - - - 44 0 0 61 4 6.6 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.50625641 0.50625641 1 0.543214953 0.543214953 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.099912572 1 0.000259828 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 8411403 A G PTPRD CCDS43786.1 r.? - - intronic 45 0 0 55 4 7.3 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.812119658 0.812119658 1 0.60082866 0.60082866 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.000173903 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 8566292 A T PTPRD CCDS43786.1 r.? - - intronic 28 0 0 52 5 9.6 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.622273504 0.622273504 1 0.790130841 0.790130841 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.00000668 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 8572012 G T PTPRD CCDS43786.1 r.? - - intronic 34 0 0 53 6 11.3 21 1 4.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.50625641 0.50625641 1 0.930049844 0.930049844 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.099912572 1 0.000000293 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 8823769 G C PTPRD CCDS43786.1 r.? - - intronic 33 0 0 68 6 8.8 21 3 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.508222222 1.508222222 1 0.724286604 0.724286604 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000155401 1 0.00000131 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 9078395 A T PTPRD CCDS43786.1 r.? - - intronic 35 0 0 47 4 8.5 24 1 4.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.442974359 0.442974359 1 0.699595016 0.699595016 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.113346489 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 9178182 A T PTPRD CCDS43786.1 r.? - - intronic 46 0 0 52 5 9.6 24 2 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.875401709 0.875401709 1 0.790130841 0.790130841 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.006413403 1 0.00000668 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 9316811 C T PTPRD CCDS43786.1 r.? - - intronic 31 0 0 66 5 7.6 25 2 8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.843760684 0.843760684 1 0.625520249 0.625520249 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.006948068 1 0.0000217 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 9355120 T C PTPRD CCDS43786.1 r.? - - intronic 32 0 0 57 6 10.5 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.318376068 1.318376068 1 0.864205607 0.864205607 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.000000456 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 10390517 C T PTPRD CCDS43786.1 r.? - - intronic 39 0 0 65 5 7.7 22 1 4.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.474615385 0.474615385 1 0.633750779 0.633750779 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.104413009 1 0.0000201 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 10548888 T C PTPRD CCDS43786.1 r.? - - intronic 28 0 0 69 5 7.2 23 1 4.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.453521368 0.453521368 1 0.592598131 0.592598131 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.108890944 1 0.0000269 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 10570171 C A PTPRD CCDS43786.1 r.? - - intronic 40 0 0 56 4 7.1 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.584367601 0.584367601 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000186538 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 11591176 G A - - - - - - 35 0 0 57 6 10.5 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.706649573 0.706649573 1 0.864205607 0.864205607 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.000000456 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 12073989 T C - - - - - - 32 0 0 46 5 10.9 18 3 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.761350427 1.761350427 1 0.897127726 0.897127726 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0000964 1 0.00000361 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 12486157 G A - - - - - - 28 0 0 51 6 11.8 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.054700855 1.054700855 1 0.971202492 0.971202492 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004473894 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 14166233 T A NFIB CCDS6474.1 r.? - - intronic 31 0 0 67 5 7.5 25 3 12 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.265641026 1.265641026 1 0.61728972 0.61728972 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.00026475 1 0.0000233 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 14960538 T C - - - - - - 39 0 0 74 6 8.1 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.666672897 0.666672897 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000216 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 15189815 C G TTC39B CCDS6477.1 r.? - - intronic 37 0 0 55 6 10.9 24 1 4.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.442974359 0.442974359 1 0.897127726 0.897127726 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.113346489 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 16193749 G A - - - - - - 33 0 0 56 8 14.3 18 3 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.761350427 1.761350427 1 1.176965732 1.176965732 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.0000964 1 4.48E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 17303080 T A CNTLN CCDS43789.1 r.? - - intronic 32 0 0 44 5 11.4 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.938280374 0.938280374 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000288 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 17395924 G C CNTLN CCDS43789.1 r.? - - intronic 41 0 0 64 6 9.4 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.959777778 0.959777778 1 0.773669782 0.773669782 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.05364542 1 0.000000914 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 17788165 C T SH3GL2 CCDS6483.1 r.? - - intronic 41 0 0 55 6 10.9 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.318376068 1.318376068 1 0.897127726 0.897127726 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 17997478 G A - - - - - - 34 0 0 62 5 8.1 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.666672897 0.666672897 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 18518961 T C ADAMTSL1 CCDS47954.1 r.? - - intronic 29 0 0 47 4 8.5 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.699595016 0.699595016 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 18856735 C G ADAMTSL1 CCDS47954.1 r.? - - intronic 38 0 0 48 5 10.4 19 3 15.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.66642735 1.66642735 1 0.855975078 0.855975078 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000114071 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 20207691 G C - - - - - - 42 0 0 66 5 7.6 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.054700855 1.054700855 1 0.625520249 0.625520249 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004473894 1 0.0000217 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 20304065 T A - - - - - - 40 0 0 51 7 13.7 21 5 23.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.510188034 1.255094017 2 1.127582555 1.127582555 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 5.95E-08 1 7.46E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 20380147 C G MLLT3 CCDS6494.1 r.? - - intronic 27 0 0 55 6 10.9 18 2 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.170717949 1.170717949 1 0.897127726 0.897127726 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.003626632 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 20480372 C G MLLT3 CCDS6494.1 r.? - - intronic 49 0 0 52 6 11.5 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.590632479 0.590632479 1 0.946510903 0.946510903 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.000000261 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 21655517 A T - - - - - - 41 0 0 51 5 9.8 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.65391453 0.65391453 1 0.8065919 0.8065919 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.00000606 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 21714058 G T - - - - - - 35 0 0 53 7 13.2 18 2 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.170717949 1.170717949 1 1.086429907 1.086429907 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.003626632 1 9.85E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 22217835 A G - - - - - - 36 0 0 44 6 13.6 25 1 4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.421880342 0.421880342 1 1.119352025 1.119352025 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.117779757 1 9.37E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 22635145 T C - - - - - - 35 0 0 58 7 12.1 15 5 33.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 3.512153846 1.756076923 2 0.995894081 0.995894081 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.000000009 1 1.88E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 23383481 G A - - - - - - 43 0 0 43 4 9.3 23 4 17.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.835179487 1.835179487 1 0.765439252 0.765439252 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.00000513 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 24203730 A T - - - - - - 42 0 0 53 6 11.3 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.65391453 0.65391453 1 0.930049844 0.930049844 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.000000293 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 24995160 A G - - - - - - 46 0 0 43 7 16.3 12 2 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.761350427 1.761350427 1 1.341576324 1.341576324 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.001595918 1 2.15E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 26357281 T G - - - - - - 41 0 0 53 4 7.5 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.590632479 0.590632479 1 0.61728972 0.61728972 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 26440507 G C - - - - - - 38 0 0 57 6 10.5 22 1 4.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.474615385 0.474615385 1 0.864205607 0.864205607 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.104413009 1 0.000000456 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 26477425 A G - - - - - - 39 0 0 47 6 12.8 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.053507788 1.053507788 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000141 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 28660713 T C LINGO2 CCDS6524.1 r.? - - intronic 42 0 0 47 5 10.6 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.812119658 0.812119658 1 0.872436137 0.872436137 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 29907376 A G - - - - - - 32 0 0 52 6 11.5 20 2 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.054700855 1.054700855 1 0.946510903 0.946510903 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004473894 1 0.000000261 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 30177678 T G - - - - - - 31 0 0 62 4 6.5 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.534984424 0.534984424 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000276647 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 30278947 A G - - - - - - 32 0 0 42 6 14.3 15 3 20 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.109401709 2.109401709 1 1.176965732 1.176965732 1 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.0000544 1 7.02E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 30351429 G T - - - - - - 44 0 0 55 5 9.1 27 2 7.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.780478632 0.780478632 1 0.748978193 0.748978193 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.00807567 1 0.00000883 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 30351430 A G - - - - - - 43 0 0 55 5 9.1 26 2 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.812119658 0.812119658 1 0.748978193 0.748978193 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.007502227 1 0.00000883 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 30708467 C T - - - - - - 33 0 0 40 7 17.5 24 2 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.875401709 0.875401709 1 1.440342679 1.440342679 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.006413403 1 1.26E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 33491109 A G - - - - - - 33 0 0 56 5 8.9 22 1 4.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.474615385 0.474615385 1 0.732517134 0.732517134 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.104413009 1 0.00000965 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 33579086 C A - - - - - - 18 0 0 10 4 40 8 1 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.318376068 1.318376068 1 3.292211838 1.646105919 2 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.039306956 1 0.000000128 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 33796202 G C PRSS3 CCDS47958.1 r.? - - intronic 40 0 0 64 6 9.4 25 2 8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.843760684 0.843760684 1 0.773669782 0.773669782 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.006948068 1 0.000000914 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 36195950 G A CLTA CCDS6601.1 r.? - - intronic 32 0 0 46 10 21.7 18 4 22.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.341435897 2.341435897 1 1.786024922 0.893012461 2 NA NA 1 NA NA 1 3 NA 1 1 0.00000181 1 3.38E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 37051006 T A - - - - - - 36 0 0 55 6 10.9 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.558991453 0.558991453 1 0.897127726 0.897127726 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 38307576 A C - - - - - - 35 0 0 53 4 7.5 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 1 0 0 TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.318376068 1.318376068 1 0.61728972 0.61728972 1 0 0 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 38546615 C G ANKRD18A ENST00000357072 r.? - - intronic 45 0 0 68 5 7.4 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.590632479 0.590632479 1 0.60905919 0.60905919 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.0000251 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 38740075 T A - - - - - - 35 0 0 64 11 17.2 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.678812018 4 1 2 1 2 0.321187982 1 2 NA 1 NA 0.678812018 NA 0 NA 0 1.41565109 1.41565109 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 2.85E-14 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 39089505 T G CNTNAP3 CCDS6616.1 r.? - - intronic 31 0 0 54 4 7.4 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.678812018 4 1 2 1 2 0.321187982 1 2 NA 1 NA 0.678812018 NA 0.516645952 NA 0 0.60905919 0.60905919 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 0.086275114 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 41996687 T C - - - - - - 9 0 0 11 3 27.3 5 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0 0 1 1.885197027 1.885197027 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00002 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 69028603 A T - - - - - - 24 0 0 45 6 13.3 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0.765743107 0.765743107 1 0.918429321 0.918429321 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.000000108 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 71147457 C T PGM5 CCDS6622.2 r.? - - downstream 35 0 0 45 6 13.3 13 2 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 1.420776367 1.420776367 1 0.918429321 0.918429321 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.001879825 1 0.000000108 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 75102941 G T - - - - - - 45 0 0 55 4 7.3 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0 0 1 0.504100304 0.504100304 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000173903 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 75455916 G C TMC1 CCDS6643.1 r.? - - downstream 35 0 0 22 3 13.6 4 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0 0 1 0.939145772 0.939145772 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000179267 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 76117253 G A - - - - - - 39 0 0 48 5 10.4 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0 0 1 0.718170296 0.718170296 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 81253953 T C - - - - - - 34 0 0 55 5 9.1 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0 0 1 0.628399009 0.628399009 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000883 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 82173587 T A - - - - - - 30 0 0 55 6 10.9 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0 0 1 0.752697714 0.752697714 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 83907290 G T - - - - - - 41 0 0 57 8 14 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0.65503326 0.65503326 1 0.966767706 0.966767706 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.067769881 1 5.19E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 86459062 T C KIF27 CCDS6665.1 r.? - - intronic 34 0 0 48 5 10.4 10 3 30 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 2.767746169 2.767746169 1 0.718170296 0.718170296 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000146 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 90150707 A G DAPK1 CCDS43842.1 r.? - - intronic 25 0 0 49 5 10.2 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0.968711159 0.968711159 1 0.704359329 0.704359329 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004039874 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 91034972 A T SPIN1 CCDS43843.1 r.? - - intronic 27 0 0 48 4 8.3 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0 0 1 0.57315514 0.57315514 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000102016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 95563117 C G - - - - - - 34 0 0 57 5 8.8 22 2 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0.839549671 0.839549671 1 0.607682558 0.607682558 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.005403392 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 97210135 C T HIATL1 CCDS6710.2 r.? - - intronic 53 0 0 45 5 11.1 21 2 9.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0.876452954 0.876452954 1 0.766508681 0.766508681 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004928472 1 0.00000323 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 97529337 A T MIR24-1 CCDS6713.1 r.? - - intronic 30 0 0 43 3 7 9 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0 0 1 0.483383853 0.483383853 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.001328364 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 100645832 G C - - - - - - 34 0 0 51 4 7.8 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0 0 1 0.538627722 0.538627722 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000129466 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 102761347 C T ERP44 CCDS35082.1 r.? - - intronic 35 0 0 41 5 12.2 5 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0 0 1 0.842469001 0.842469001 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000202 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 104043031 C T ENSG00000148123 CCDS6751.1 r.? - - intronic 49 0 0 43 6 14 22 3 13.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 1.254711597 1.254711597 1 0.966767706 0.966767706 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000179267 1 8.13E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 104160036 C A MRPL50 CCDS6753.1 r.? - - intronic 38 0 0 63 4 6.3 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0.516645952 0.516645952 1 0.435045468 0.644555711 0.67495402 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.000294233 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 104453325 C T GRIN3A CCDS6758.1 r.? - - intronic 37 0 0 54 6 11.1 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 2 0 0 TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0 0 1 0.766508681 0.766508681 1 0 NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000329 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 120374987 G C - - - - - - 36 0 0 42 4 9.5 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 1 0 0 TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0.544323413 0.544323413 1 0.656020943 0.656020943 1 0 NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.0000601 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 121074461 T G - - - - - - 39 0 0 52 6 11.5 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0.544323413 0.544323413 1 0.794130616 0.794130616 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.000000261 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 121622983 G C - - - - - - 51 0 0 48 7 14.6 14 2 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 1.319292341 1.319292341 1 1.008200608 1.008200608 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002185852 1 4.81E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 123988598 G T GSN CCDS6829.1 r.? - - intronic 38 0 0 57 9 15.8 12 3 25 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 2.306455141 2.306455141 1 1.091066411 1.091066411 1 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 0.0000266 1 1.42E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 131308714 G T GLE1 CCDS35154.1 r.? - - downstream 34 0 0 49 5 10.2 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0 0 1 0.704359329 0.704359329 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 133898419 G A LAMC3 CCDS6938.1 r.? - - intronic 36 0 0 41 4 9.8 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0.65503326 0.65503326 1 0.676737394 0.676737394 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.0000546 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 136165515 G C - - - - - - 33 0 0 46 5 10.9 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0 0 1 0.752697714 0.752697714 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000361 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 138056003 G A - - - - - - 33 0 0 47 5 10.6 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0 0 1 0.731981263 0.731981263 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 138614074 G T KCNT1 CCDS35175.1 r.? - - intronic 40 0 0 35 4 11.4 8 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0 0 1 0.787225132 0.787225132 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000289 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 139967915 C G C9orf140 CCDS7027.2 r.? - - upstream 26 0 0 37 3 8.1 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0.922582056 0.922582056 1 0.559344173 0.559344173 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.04888987 1 0.000855237 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 140975633 C G CACNA1B ENST00000371372 r.? - - intronic 46 0 0 43 4 9.3 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 1.088646827 1.088646827 1 0.642209976 0.642209976 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 141128061 C T - - - - - - 8 0 0 19 4 21.1 2 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 NA NA 1 NA NA 1 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00000228 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 141128070 A C - - - - - - 8 0 0 19 4 21.1 2 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1 NA NA 1 NA NA 1 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.00000228 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 3206071 T A CXorf28 ENST00000457435 r.? - - downstream 47 0 0 44 4 9.1 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0.559685595 0.559685595 1 0.595380858 0.595380858 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.0000723 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 3967851 G C - - - - - - 39 0 0 40 4 10 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0.604821531 0.604821531 1 0.654264679 0.654264679 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.0000495 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 8403398 A T ENSG00000227978 ENST00000418307 r.? - - intronic 38 0 0 47 3 6.4 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0.604821531 0.604821531 1 0.418729395 0.418729395 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.001719595 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 13305795 C T - - - - - - 41 0 0 52 5 9.6 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.628094092 0.628094092 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000668 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 13935519 T A GPM6B CCDS48084.1 r.? - - intronic 23 0 0 45 7 15.6 17 2 11.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 1.065208069 1.065208069 1 1.0206529 1.0206529 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.003234386 1 0.000000003 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 15021309 A T - - - - - - 51 0 0 52 3 5.8 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0.902718702 0.902718702 1 0.379473514 1.215804563 0.312117198 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.04888987 1 0.002300591 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 17225369 T A - - - - - - 43 0 0 43 3 7 23 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.457985276 0.457985276 1 NA NA 1 NA NA 0 1 NA 1 1 1 1 0.001328364 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 19264439 G C - - - - - - 41 0 0 67 6 9 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.588838211 0.588838211 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000012 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 22141206 C G PHEX CCDS14204.1 r.? - - intronic 34 0 0 41 6 14.6 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.955226432 0.955226432 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 6.05E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 23190772 G C - - - - - - 30 0 0 54 6 11.1 7 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.726233794 0.726233794 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000329 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 24185528 A G ZFX CCDS14211.1 r.? - - intronic 26 0 0 49 6 12.2 11 4 36.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 3.285896076 2.219932346 1.480178476 0.798202909 0.798202909 1 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 0.000000201 1 0.000000182 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 25755177 G T - - - - - - 40 0 0 61 5 8.2 16 3 18.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 1.69711116 1.69711116 1 0.536497037 0.536497037 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000667 1 0.0000147 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 27698240 C T - - - - - - 32 0 0 63 8 12.7 22 1 4.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0.406223416 0.406223416 1 0.830916143 0.830916143 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.104413009 1 1.18E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 27742455 G A - - - - - - 27 0 0 57 6 10.5 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.686977913 0.686977913 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000456 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 27983200 T A - - - - - - 33 0 0 53 3 5.7 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 1.128398378 1.128398378 1 0.372930867 1.194842415 0.312117198 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.002429596 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 28427483 C A - - - - - - 24 0 0 36 6 16.7 6 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 1.092622015 1.092622015 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 2.68E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 28648522 A C IL1RAPL1 CCDS14218.1 r.? - - intronic 38 0 0 46 3 6.5 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.425272042 0.425272042 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.001615827 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 31720664 C T DMD CCDS14233.1 r.? - - intronic 31 0 0 48 6 12.5 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0.559685595 0.559685595 1 0.817830849 0.817830849 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.00000016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 35269782 C A - - - - - - 36 0 0 53 5 9.4 17 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.615008799 0.615008799 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 39139513 G C - - - - - - 38 0 0 53 4 7.5 12 1 8.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0.749256523 0.749256523 1 0.49069851 0.49069851 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.058377193 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 39921060 G A BCOR CCDS14250.1 r.? - - intronic 28 0 0 40 5 12.5 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.817830849 0.817830849 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000178 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 40149710 G A - - - - - - 34 0 0 49 6 12.2 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.798202909 0.798202909 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000182 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 40642566 T A - - - - - - 32 0 0 49 4 8.2 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0.532604034 0.532604034 1 0.536497037 0.536497037 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 41276975 C G - - - - - - 42 0 0 42 8 19 17 5 29.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 2.653992985 1.793022279 1.480178476 1.243102891 1.243102891 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 1.84E-08 1 3.96E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 50678204 A T - - - - - - 35 0 0 55 7 12.7 16 2 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 1.128398378 1.128398378 1 0.830916143 0.830916143 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002863359 1 1.28E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 51518826 T A - - - - - - 32 0 0 49 4 8.2 24 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.536497037 0.536497037 1 NA NA 0 NA NA 1 1 NA 1 1 1 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 54684521 G A - - - - - - 22 0 0 42 4 9.5 18 2 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 1.00201776 1.00201776 1 0.621551445 0.621551445 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.003626632 1 0.0000601 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 55121335 A G PAGE2 CCDS14367.1 r.? - - downstream 29 0 0 50 5 10 15 3 20 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 1.805437405 1.805437405 1 0.654264679 0.654264679 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0000544 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 55730779 G A - - - - - - 30 0 0 51 6 11.8 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.772032322 0.772032322 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 56697656 G C - - - - - - 49 0 0 50 4 8 19 0 0 0 0 NA 0 0 NA 2 0 0 TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.523411743 0.523411743 1 0 NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000119787 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 62246818 A G - - - - - - 41 0 0 46 5 10.9 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.7131485 0.7131485 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000361 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 63249715 T C - - - - - - 38 0 0 50 5 10 18 2 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 1.00201776 1.00201776 1 0.654264679 0.654264679 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.003626632 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 63525889 G A MTMR8 CCDS14379.1 r.? - - intronic 40 0 0 46 6 13 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.850544083 0.850544083 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000000123 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 64885194 G T MSN CCDS14382.1 r.? - - upstream 39 0 0 43 4 9.3 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.608466152 0.608466152 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 65079174 A C - - - - - - 47 0 0 55 4 7.3 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 1.200615874 1.200615874 1 0.477613216 0.477613216 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002513772 1 0.000173903 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 65465543 C G HEPH CCDS14384.2 r.? - - intronic 33 0 0 38 4 10.5 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.686977913 0.686977913 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 66683175 C T - - - - - - 33 0 0 45 6 13.3 18 1 5.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0.505522473 0.505522473 1 0.870172024 0.870172024 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.086275114 1 0.000000108 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 67786069 A C - - - - - - 31 0 0 37 7 18.9 11 1 9.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0.821474019 0.821474019 1 1.236560244 1.236560244 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.05364542 1 7.05E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 68684775 C G - - - - - - 41 0 0 61 6 9.8 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0.532604034 0.532604034 1 0.641179386 0.641179386 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.000000685 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 73735900 T C SLC16A2 CCDS14426.1 r.? - - intronic 39 0 0 42 4 9.5 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.621551445 0.621551445 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000601 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 73802091 G T RLIM CCDS14427.1 r.? - - downstream 44 0 0 38 4 10.5 24 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.686977913 0.686977913 1 NA NA 0 NA NA 1 1 NA 1 1 1 1 0.0000403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 80610688 G T - - - - - - 38 0 0 57 5 8.8 21 3 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 1.290887744 1.290887744 1 0.575752918 0.575752918 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000155401 1 0.0000105 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 80611352 A G - - - - - - 40 0 0 58 4 6.9 15 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.451442629 0.451442629 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000213772 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 84174586 T G - - - - - - 41 0 0 49 5 10.2 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.667349973 0.667349973 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 85547736 G A DACH2 CCDS48140.1 r.? - - intronic 34 0 0 38 4 10.5 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.686977913 0.686977913 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.0000403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 85678324 C A DACH2 CCDS48140.1 r.? - - intronic 30 0 0 40 5 12.5 17 1 5.9 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0.532604034 0.532604034 1 0.817830849 0.817830849 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.00000178 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 87053945 C G - - - - - - 39 0 0 65 4 6.2 19 1 5.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0.478440912 0.478440912 1 0.405644101 1.299653153 0.312117198 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.090843738 1 0.000331785 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 88271030 C G - - - - - - 45 0 0 51 4 7.8 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0.559685595 0.559685595 1 0.51032645 0.51032645 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.000129466 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 89573505 G C - - - - - - 32 0 0 54 4 7.4 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.484155863 0.484155863 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000161898 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 90616192 G T - - - - - - 36 0 0 49 6 12.2 10 1 10 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0.902718702 0.902718702 1 0.798202909 0.798202909 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.04888987 1 0.000000182 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 91496106 T G PCDH11X CCDS14461.1 r.? - - intronic 44 0 0 51 3 5.9 20 3 15 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 1.354078053 1.354078053 1 0.386016161 1.23676671 0.312117198 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0001337 1 0.002175924 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 92327921 G T - - - - - - 37 0 0 51 7 13.7 14 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.896342611 0.896342611 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 7.46E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 93182694 C G - - - - - - 39 0 0 53 4 7.5 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.49069851 0.49069851 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 94151432 T C - - - - - - 37 0 0 50 4 8 16 1 6.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0.559685595 0.559685595 1 0.523411743 0.523411743 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.000119787 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 98363077 C T - - - - - - 26 0 0 46 8 17.4 15 2 13.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 1.200615874 1.200615874 1 1.138420542 1.138420542 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.002513772 1 8.61E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 98557831 A G - - - - - - 34 0 0 39 4 10.3 21 2 9.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0.857582767 0.857582767 1 0.67389262 0.67389262 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004928472 1 0.0000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 98797344 C T - - - - - - 42 0 0 54 9 16.7 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0.640930279 0.640930279 1 1.092622015 1.092622015 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.067769881 1 8.48E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 103466316 T A - - - - - - 17 0 0 51 6 11.8 21 2 9.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0.857582767 0.857582767 1 0.772032322 0.772032322 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.004928472 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 39760273 C T IL28A CCDS42567.1 r.468c>u c.416C>T p.A139V missense 24 0 0 35 5 14.3 16 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 0 NA 0 1.176965732 1.176965732 1 NA NA 0 NA NA 1 NA NA 1 1 1 1 0.000000895 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 112743297 C T - - - - - - 32 0 0 50 5 10 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.704050758 1 1 1 1 0.519821524 0.295949242 2 2 1 1 0.480178476 0.704050758 0 0 1 0.693458035 0.693458035 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000549 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 112902607 T A - - - - - - 36 0 0 43 4 9.3 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.704050758 1 1 1 1 0.519821524 0.295949242 2 2 1 1 0.480178476 0.704050758 0 0 1 0.644915973 0.644915973 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 114123637 T A HTR2C CCDS14564.1 r.? - - intronic 39 0 0 52 7 13.5 16 4 25 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.704050758 1 1 1 1 0.519821524 0.295949242 2 2 1 1 0.480178476 0.704050758 2.256796756 2.256796756 1 0.936168348 0.936168348 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.00000108 1 8.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 115065564 A C - - - - - - 41 0 0 54 7 13 12 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.704050758 1 1 1 1 0.519821524 0.295949242 2 2 1 1 0.480178476 0.704050758 0 0 1 0.901495446 0.901495446 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 1.13E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 118049718 A T - - - - - - 36 0 0 67 7 10.4 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.704050758 1 1 1 1 0.519821524 0.295949242 2 2 1 1 0.480178476 0.704050758 0.640930279 0.640930279 1 0.721196357 0.721196357 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.067769881 1 5.23E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 121456378 A G - - - - - - 38 0 0 55 6 10.9 15 1 6.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.704050758 1 1 1 1 0.519821524 0.295949242 2 2 1 1 0.480178476 0.704050758 0.604821531 0.604821531 1 0.755869258 0.755869258 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.000000367 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 122091331 A G - - - - - - 34 0 0 44 5 11.4 8 1 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.704050758 1 1 1 1 0.519821524 0.295949242 2 2 1 1 0.480178476 0.704050758 1.128398378 1.128398378 1 0.79054216 0.79054216 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.039306956 1 0.00000288 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 124845928 C G - - - - - - 37 0 0 49 7 14.3 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.704050758 1 1 1 1 0.519821524 0.295949242 2 2 1 1 0.480178476 0.704050758 0.695093401 0.695093401 1 0.99164499 0.99164499 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 5.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 126143457 G C - - - - - - 27 0 0 36 4 11.1 21 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.704050758 1 1 1 1 0.519821524 0.295949242 2 2 1 1 0.480178476 0.704050758 0 0 1 0.769738419 0.769738419 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000324 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 130521401 G C IGSF1 ENST00000370904 r.? - - intronic 42 0 0 47 4 8.5 10 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.704050758 1 1 1 1 0.519821524 0.295949242 2 2 1 1 0.480178476 0.704050758 0 0 1 0.58943933 0.58943933 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000939 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 134518826 A T - - - - - - 48 0 0 55 7 12.7 17 3 17.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.704050758 1 1 1 1 0.519821524 0.295949242 2 2 1 1 0.480178476 0.704050758 1.588784916 1.588784916 1 0.880691705 0.880691705 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000807 1 1.28E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 136038509 C T - - - - - - 35 0 0 53 5 9.4 11 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.704050758 1 1 1 1 0.519821524 0.295949242 2 2 1 1 0.480178476 0.704050758 0 0 1 0.651850553 0.651850553 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 137282688 T A - - - - - - 32 0 0 49 4 8.2 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.704050758 1 1 1 1 0.519821524 0.295949242 2 2 1 1 0.480178476 0.704050758 0.640930279 0.640930279 1 0.568635589 0.568635589 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 137682716 C G - - - - - - 35 0 0 48 4 8.3 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.704050758 1 1 1 1 0.519821524 0.295949242 2 2 1 1 0.480178476 0.704050758 0.640930279 0.640930279 1 0.575570169 0.575570169 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.000102016 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 141574772 G C - - - - - - 39 0 0 59 5 8.5 14 1 7.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.704050758 1 1 1 1 0.519821524 0.295949242 2 2 1 1 0.480178476 0.704050758 0.640930279 0.640930279 1 0.58943933 0.58943933 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.067769881 1 0.0000125 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 145105144 A G MIR891A ENST00000401237 r.? - - downstream 47 0 0 46 4 8.7 18 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.704050758 1 1 1 1 0.519821524 0.295949242 2 2 1 1 0.480178476 0.704050758 0 0 1 0.603308491 0.603308491 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 145575065 G T - - - - - - 31 0 0 36 6 16.7 19 2 10.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.704050758 1 1 1 1 0.519821524 0.295949242 2 2 1 1 0.480178476 0.704050758 0.947854637 0.947854637 1 1.158074919 1.158074919 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004039874 1 2.68E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 152969257 C A BCAP31 CCDS48191.1 r.? - - intronic 31 0 0 39 5 12.8 20 3 15 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.704050758 1 1 1 1 0.519821524 0.295949242 2 2 1 1 0.480178476 0.704050758 1.354078053 1.354078053 1 0.887626285 0.887626285 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0001337 1 0.00000156 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 154270652 G C FUNDC2 CCDS14763.1 r.? - - intronic 42 0 0 37 4 10.8 13 1 7.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.704050758 1 1 1 1 0.519821524 0.295949242 2 2 1 1 0.480178476 0.704050758 0.695093401 0.695093401 1 0.748934678 0.748934678 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.0000362 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 37316397 G T GRIK3 CCDS416.1 r.? - - intronic 35 0 0 55 4 7.3 20 3 15 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.676461027 2.698551327 1 1 1 1 0.323538973 0.301448673 2 2 1 1 0.676461027 0.698551327 1.383520436 1.383520436 1 0.505822907 0.505822907 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0001337 1 0.000173903 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 76485311 C G - - - - - - 52 0 0 52 1 1.9 19 3 15.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 1.66642735 1.66642735 1 0.152809598 NA 0 NA NA 1 NA NA 0 NA NA 1 1 0.000114071 1 0.229451111 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 167389482 C A POU2F1 CCDS1259.1 r.6837c>a c.? p.? 3'UTR variant 34 0 0 54 3 5.6 20 3 15 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 5 2 3 1 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.432051282 1.432051282 1 0.516909657 0.516909657 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0001337 1 0.00256299 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 176501122 C G PAPPA2 CCDS41438.1 r.? - - intronic 27 0 0 50 2 4 19 3 15.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 1.66642735 1.66642735 1 0.318303646 0.318303646 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000114071 1 0.026131524 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 214396329 C T - - - - - - 35 0 0 47 2 4.3 25 4 16 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 1.687521368 1.687521368 1 0.342176419 0.342176419 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.00000727 1 0.02328732 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 240427444 T G FMN2 CCDS31069.2 r.? - - intronic 31 0 0 36 2 5.6 12 3 25 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 2.636752137 2.636752137 1 0.445625104 0.445625104 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000266 1 0.014070883 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 16413716 A T - - - - - - 39 0 0 58 3 5.2 13 3 23.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 2.436358974 2.436358974 1 0.414114295 0.414114295 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000344 1 0.003141421 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 22432658 A C ENSG00000224369 ENST00000412505 r.? - - intronic 29 0 0 48 2 4.2 16 3 18.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 1.982837607 1.982837607 1 0.33447693 0.33447693 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000667 1 0.024220359 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 55189978 C G - - - - - - 43 0 0 54 1 1.9 22 4 18.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 1.919555556 1.919555556 1 0.151310992 NA 0 NA NA 1 NA NA 0 NA NA 1 1 0.00000425 1 0.237137336 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 96433689 T A - - - - - - 43 0 0 42 2 4.8 15 3 20 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 2.109401709 2.109401709 1 0.382259349 0.382259349 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000544 1 0.018854633 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 95134299 C G - - - - - - 49 0 0 57 1 1.8 18 3 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.594350427 1.594350427 1 0.130149533 0.130149533 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0000964 1 0.248523156 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 55543446 A G - - - - - - 32 0 0 56 0 0 25 4 16 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.367521368 1.367521368 1 0 0 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.00000727 1 1 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 78625921 T G - - - - - - 40 0 0 44 2 4.5 23 3 13 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.111111111 1.111111111 1 0.280373832 0.280373832 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000205387 1 0.020580492 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 87855139 A C - - - - - - 35 0 0 40 2 5 26 4 15.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.316239316 1.316239316 1 0.31152648 0.31152648 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.00000856 1 0.017193422 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 107961049 G C BTBD11 CCDS31893.1 r.? - - intronic 33 0 0 40 3 7.5 20 3 15 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.282051282 1.282051282 1 0.46728972 0.46728972 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0001337 1 0.001075403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 53872447 T C - - - - - - 31 0 0 44 3 6.8 19 4 21.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 2.014418803 2.014418803 1 0.468752066 0.468752066 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.00000228 1 0.00142027 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 50028146 A T - - - - - - 34 0 0 52 2 3.8 17 4 23.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 2.139468252 2.139468252 1 0.261236328 0.405576815 0.644110605 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.00000141 1 0.028101652 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 21846351 T C - - - - - - 28 0 0 41 3 7.3 15 4 26.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 2.448401996 2.448401996 1 0.503187809 0.503187809 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000000816 1 0.001155993 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 51970778 C G - - - - - - 40 0 0 43 3 7 19 3 15.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 1.448867099 1.448867099 1 0.482508858 0.482508858 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000114071 1 0.001328364 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 39405285 C G - - - - - - 44 0 0 56 2 3.6 26 5 19.2 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.025025641 2.025025641 1 0.296299065 0.296299065 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000000188 1 0.032213353 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 62874396 T A - - - - - - 34 0 0 40 3 7.5 21 3 14.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.508222222 1.508222222 1 0.61728972 0.61728972 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000155401 1 0.001075403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 65491643 C G AC114689.1 ENST00000500778 r.? - - intronic 37 0 0 51 3 5.9 29 3 10.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.08634188 1.08634188 1 0.485601246 0.485601246 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000414371 1 0.002175924 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 19 43548387 G A PSG1 ENST00000449000 r.? - - intronic 34 1 2.9 45 2 4.4 17 4 23.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 2.071442641 2.071442641 1 0.346938246 0.346938246 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 0.156694864 1 0.00000141 1 0.021467209 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 34232469 G T - - - - - - 45 0 0 35 1 2.9 24 4 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.761350427 1.761350427 1 0.185053922 NA 0 NA NA 1 NA NA 0 NA NA 1 1 0.00000613 1 0.16091139 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 117080676 G T - - - - - - 37 0 0 56 2 3.6 19 4 21.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 2.225418803 2.225418803 1 0.22972211 1.524972857 0.15064013 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.00000228 1 0.032213353 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 118164598 C G - - - - - - 38 0 0 51 1 2 19 3 15.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.66642735 1.66642735 1 0.127623395 NA 0 NA NA 1 NA NA 0 NA NA 1 1 0.000114071 1 0.225579006 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 142790811 C T LRP1B CCDS2182.1 r.? - - intronic 33 0 0 46 2 4.3 21 5 23.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 2.510188034 1.255094017 2 0.274390298 0.274390298 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 5.95E-08 1 0.022369545 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 144648991 G C - - - - - - 34 0 0 54 0 0 17 3 17.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 1.856273504 1.856273504 1 0 NA 0 NA NA 1 NA NA 0 NA NA 1 1 0.0000807 1 1 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 174137356 C A ENSG00000091436 CCDS42777.1 r.? - - downstream 27 0 0 55 2 3.6 23 5 21.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 2.288700855 2.288700855 1 0.22972211 1.524972857 0.15064013 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 9.75E-08 1 0.031164417 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 192937124 G C TMEFF2 CCDS2314.1 r.? - - intronic 37 0 0 51 1 2 20 5 25 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 2.636752137 1.318376068 2 0.127623395 NA 0 NA NA 1 NA NA 0 NA NA 1 1 4.55E-08 1 0.225579006 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 194195320 A T - - - - - - 37 0 0 45 2 4.4 20 4 20 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 2.109401709 2.109401709 1 0.280771468 0.280771468 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.00000284 1 0.021467209 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 204992755 C G - - - - - - 35 0 0 51 3 5.9 13 3 23.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 2.436358974 2.436358974 1 0.376489014 0.376489014 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000344 1 0.002175924 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 2160510 C A CNTN4 CCDS43041.1 r.? - - intronic 38 0 0 38 1 2.6 22 6 27.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 2.520550669 1.495185598 1.685777788 0.180671079 0.180671079 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1.09E-09 1 0.173434892 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 59525443 T G - - - - - - 42 0 0 57 2 3.5 22 3 13.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 1.255658942 1.255658942 1 0.243211068 0.338565235 0.718358069 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000179267 1 0.03327602 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 95277501 A T - - - - - - 49 0 0 39 1 2.6 25 3 12 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 1.10793436 1.10793436 1 0.180671079 0.180671079 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.00026475 1 0.177567718 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 139514595 C G - - - - - - 45 0 0 56 2 3.6 19 3 15.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 1.458780241 1.458780241 1 0.250159956 0.348238527 0.718358069 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000114071 1 0.032213353 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 176258122 T C - - - - - - 32 0 0 49 4 8.2 20 4 20 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 1.846557267 1.846557267 1 0.569808788 0.569808788 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.00000284 1 0.000110643 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 23868366 G T PPARGC1A CCDS3429.1 r.? - - intronic 45 0 0 58 5 8.6 16 3 18.8 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 1.923470297 1.923470297 1 0.549891729 0.549891729 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000667 1 0.0000115 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 70304412 C A - - - - - - 39 0 0 58 3 5.2 13 3 23.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 2.363412971 2.363412971 1 0.332492674 0.332492674 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000344 1 0.003141421 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 85670751 A T WDFY3 CCDS3609.1 r.? - - intronic 51 0 0 48 2 4.2 25 3 12 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 1.227746998 1.227746998 1 0.268551775 1.641913126 0.163560283 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.00026475 1 0.024220359 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 98350672 A C - - - - - - 28 0 0 52 3 5.8 11 3 27.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 2.79312442 2.79312442 1 0.442285203 0.442285203 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.00002 1 0.002300591 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 173651888 G T GALNTL6 CCDS34104.1 r.? - - intronic 52 0 0 55 0 0 14 3 21.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.043059829 2.043059829 1 0 0 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0000437 1 1 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 10127854 A T - - - - - - 44 0 0 39 3 7.7 22 3 13.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.22923966 1.22923966 1 0.521949066 0.521949066 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000179267 1 0.000998458 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 70778202 C A BDP1 CCDS43328.1 r.? - - intronic 31 0 0 45 1 2.2 19 4 21.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 1.907129179 1.907129179 1 0.149128305 0.149128305 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.00000228 1 0.201934322 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 11160877 C G - - - - - - 41 0 0 47 0 0 15 3 20 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4 2 2 1 2 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.109401709 2.109401709 1 0 NA 0 NA NA 1 NA NA 0 NA NA 1 1 0.0000544 1 1 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 23310170 A C - - - - - - 36 0 0 63 3 4.8 17 3 17.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2 2 1 2 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.856273504 1.856273504 1 0.299065421 0.299065421 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000807 1 0.003968795 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 28508641 T A GPX6 ENST00000399282 r.? - - upstream 55 0 0 69 2 2.9 21 3 14.3 0 0 NA 0 0 NA 2 0 0 TRUE FALSE 4 2 2 1 2 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.508222222 1.508222222 1 0.180685358 0.180685358 1 0 0 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000155401 1 0.04704084 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 38387995 C T BTBD9 CCDS47418.1 r.? - - intronic 35 0 0 58 2 3.4 15 4 26.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.731571775 2 2 2 1 1 0.268428225 NA 2 NA 2 NA 0.731571775 2.816051282 1.408025641 2 0.270711447 0.370040857 0.731571775 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000000816 1 0.034352256 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 46279915 G C RCAN2 CCDS43469.1 r.? - - intronic 34 0 0 55 2 3.6 17 3 17.6 0 0 NA 2 0 0 0 0 NA TRUE FALSE 4.581695873 3.184476375 3 2 1 1 0.418304127 0.815523625 3 3 2 1 0.581695873 0.184476375 1.958651978 1.958651978 1 0.266940215 1.447015725 0.184476375 NA NA 0 0 NA 0 2 NA 1 1 0.0000807 1 0.031164417 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 49186700 T C - - - - - - 56 0 0 69 0 0 11 3 27.3 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 4.581695873 3.184476375 3 2 1 1 0.418304127 0.815523625 3 3 2 1 0.581695873 0.184476375 3.038136307 3.038136307 1 0 NA 0 NA NA 0 NA NA 0 NA NA 1 1 0.00002 1 1 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 170013356 G C WDR27 CCDS47520.1 r.? - - intronic 32 0 0 56 2 3.6 17 3 17.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.504273504 1.504273504 1 0.224299065 0.224299065 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0000807 1 0.032213353 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 66401987 C G C7orf42 CCDS5536.1 r.? - - intronic 34 0 0 41 2 4.9 22 3 13.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.298393162 1.298393162 1 0.364169015 0.364169015 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.000179267 1 0.018015855 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 66689981 C A TYW1 CCDS5538.1 r.? - - intronic 28 0 0 48 9 18.8 23 7 30.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 2.902290598 1.451145299 2 1.397219894 1.397219894 1 NA NA 0 NA NA 0 3 NA 1 1 1.79E-11 1 2.75E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 68058071 T A - - - - - - 32 0 0 53 2 3.8 17 3 17.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.680273504 1.680273504 1 0.282416787 1.40163394 0.201491116 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000807 1 0.029108399 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 103947147 C A - - - - - - 47 0 0 68 0 0 12 3 25 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 2.386752137 2.386752137 1 0 NA 0 NA NA 0 NA NA 0 NA NA 1 1 0.0000266 1 1 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 115473007 A T - - - - - - 50 0 0 63 3 4.8 18 3 16.7 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.594350427 1.594350427 1 0.356736994 0.356736994 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000964 1 0.003968795 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 43309177 C G - - - - - - 36 0 0 42 3 7.1 20 3 15 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.542197017 1.542197017 1 0.584367601 0.584367601 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0001337 1 0.001240292 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 79028159 G C - - - - - - 40 1 2.5 53 5 9.4 12 3 25 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 2.570328362 2.570328362 1 0.773669782 0.773669782 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 0.181679879 1 0.0000266 1 0.00000734 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 103344567 T A UBR5 CCDS34933.1 r.? - - intronic 39 0 0 61 3 4.9 17 3 17.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.809511167 1.809511167 1 0.40329595 0.40329595 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0000807 1 0.003623631 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 126620504 T A - - - - - - 38 0 0 58 1 1.7 24 6 25 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 2.570328362 1.285164181 2 0.156919003 0.156919003 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1.95E-09 1 0.252280541 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 127195618 G C - - - - - - 39 0 0 55 5 9.1 21 4 19 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.953449555 1.953449555 1 0.839978193 0.839978193 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.00000349 1 0.00000883 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 140168066 C G - - - - - - 46 0 0 38 3 7.9 16 4 25 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 2.570328362 2.570328362 1 0.729211838 0.729211838 1 NA NA 0 NA NA 1 3 NA 1 1 0.00000108 1 0.000925091 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 3386501 A T RFX3 CCDS6449.1 r.? - - intronic 36 0 0 39 2 5.1 14 3 21.4 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.257059829 2.257059829 1 0.419757009 0.419757009 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0000437 1 0.016387522 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 30788586 G T - - - - - - 47 0 0 47 3 6.4 10 3 30 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 3.164102564 1.582051282 2 0.526753894 0.526753894 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.0000146 1 0.001719595 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b X 92627140 G C - - - - - - 42 0 0 53 3 5.7 17 3 17.6 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 1.588784916 1.588784916 1 0.372930867 1.194842415 0.312117198 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000807 1 0.002429596 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 1616708 C G ENSG00000189339 CCDS44041.1 r.? - - intronic 31 0 0 35 3 8.6 14 0 0 1 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.676461027 2.698551327 1 1 1 1 0.323538973 0.301448673 2 2 1 1 0.676461027 0.698551327 0 0 1 0.595900959 0.595900959 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000725791 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 68663163 G C MRPL21 CCDS44662.1 r.? - - intronic 49 0 0 56 6 10.7 22 1 4.5 1 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.429615385 0.429615385 1 0.773666667 0.773666667 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.104413009 1 0.000000409 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 113118560 T G - - - - - - 45 0 0 58 6 10.3 13 1 7.7 1 0 0 2 0 0 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.658119658 0.658119658 1 0.641744548 0.641744548 1 NA NA 1 0 0 1 2 NA 1 1 0.063085307 1 0.000000506 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 13 111422308 A C - - - - - - 36 0 0 65 5 7.7 14 0 0 1 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.243787161 2 2 1 1 1 0.756212839 NA 3 NA 1 NA 0.243787161 0 0 1 0.57552239 0.57552239 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000201 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 28492831 C G HERC2 CCDS10021.1 r.? - - intronic 35 0 0 48 5 10.4 11 0 0 1 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0 0 1 0.714962581 0.714962581 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000447 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 75994013 G C - - - - - - 35 0 0 53 4 7.5 16 1 6.2 1 0 0 0 0 NA 2 0 0 TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.59191453 0.59191453 1 0.557401553 0.557401553 1 0 NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.000150502 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 134092466 C T - - - - - - 45 0 0 69 10 14.5 23 2 8.7 1 0 0 1 0 0 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.830589744 0.830589744 1 1.077643003 1.077643003 1 NA NA 0 0 NA 0 2 NA 1 1 0.00589844 1 2.54E-12 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 158103173 C T PTPRN2 CCDS5949.1 r.? - - intronic 38 0 0 52 8 15.4 13 2 15.4 1 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.470239316 1.470239316 1 1.14453119 1.14453119 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.001879825 1 2.42E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 81673622 A C - - - - - - 29 0 0 40 3 7.5 17 0 0 1 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0 0 1 0.517911271 0.517911271 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.001075403 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 9 112604306 G T PALM2 CCDS48002.1 r.? - - intronic 31 0 0 32 4 12.5 11 0 0 1 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0 0 1 0.863185452 0.863185452 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.0000201 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 926647 T G LARP4B CCDS31131.1 r.? - - intronic 25 0 0 64 0 0 21 3 14.3 1 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.508222222 1.508222222 1 0 0 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 0.000155401 1 1 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 12 12600285 C G LOH12CR1 CCDS8649.1 r.? - - intronic 36 0 0 50 1 2 21 3 14.3 1 0 0 0 0 NA 0 0 NA FALSE FALSE 2 2.170289111 1 1 1 1 1 0.829710889 NA 2 NA 1 NA 0.170289111 1.222222222 1.222222222 1 0.128016374 NA 0 NA NA 1 NA NA 0 NA NA 1 1 0.000155401 1 0.221687443 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 31711042 C A - - - - - - 42 0 0 50 2 4 19 4 21.1 1 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 2.142526996 2.142526996 1 0.312666626 0.533436953 0.586136044 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.00000228 1 0.026131524 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 46736659 C T RAD54L CCDS532.1 r.? - - intronic 32 0 0 65 12 18.5 22 4 18.2 2 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 1.919555556 1.919555556 1 1.487882927 1.487882927 1 NA NA 1 NA NA 0 3 NA 1 1 0.00000425 1 7.7E-16 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 143205147 C A - - - - - - 61 2 3.3 100 5 5 30 2 6.7 2 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0.706649573 0.706649573 1 0.402130521 0.495185345 0.812080819 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 0.037660755 1 0.009909649 1 0.000158599 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 158480794 C A - - - - - - 44 0 0 56 6 10.7 20 0 0 2 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3.812080819 2 2 1 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0 0 1 0.860559314 0.860559314 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000409 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 10 80809093 C G - - - - - - 35 0 0 49 5 10.2 17 1 5.9 2 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0.622273504 0.622273504 1 0.812301117 0.812301117 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.081683532 1 0.00000496 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 33716708 G C C11orf91 ENST00000451594 r.? - - downstream 39 0 0 46 4 8.7 20 1 5 2 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.477350427 0.477350427 1 0.629056075 0.629056075 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 60849707 G T - - - - - - 39 0 0 32 4 12.5 10 1 10 2 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.954700855 0.954700855 1 0.903816199 0.903816199 1 NA NA 1 NA NA 1 2 NA 1 1 0.04888987 1 0.0000201 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 14 101136531 A G C14orf70 ENST00000360899 r.? - - intronic 55 0 0 46 6 13 16 2 12.5 2 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 1.153425716 1.153425716 1 0.898496292 0.898496292 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002863359 1 0.000000123 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 16 59351891 G C - - - - - - 40 0 0 46 5 10.9 18 0 0 2 0 0 2 0 0 0 0 NA TRUE FALSE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.679127726 0.679127726 1 NA NA 1 0 0 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000361 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 67619720 G C ETAA1 CCDS1882.1 r.? - - upstream 35 0 0 46 4 8.7 16 1 6.2 2 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.65391453 0.65391453 1 0.555161766 0.555161766 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.0000862 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 2 103226165 A G - - - - - - 37 0 0 64 5 7.8 15 1 6.7 2 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.706649573 0.706649573 1 0.497731239 0.497731239 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.072431031 1 0.0000186 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 20871053 C G - - - - - - 57 0 0 62 7 11.3 15 0 0 2 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 0 0 1 0.883283217 0.883283217 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 3.02E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 20 41563485 G T PTPRT CCDS42874.1 r.? - - intronic 38 0 0 56 8 14.3 15 2 13.3 2 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 1.350502799 1.350502799 1 1.117783186 1.117783186 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.002513772 1 4.48E-10 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 15162983 C A - - - - - - 42 0 0 51 6 11.8 17 0 0 2 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.819968744 0.819968744 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000000232 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 17581351 G A LAP3 CCDS3422.1 r.? - - intronic 37 0 0 45 5 11.1 19 0 0 2 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.709743976 0.709743976 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.00000323 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 5 30311168 A G - - - - - - 54 0 0 64 5 7.8 20 1 5 2 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0.451926346 0.451926346 1 0.528727625 0.528727625 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.09538952 1 0.0000186 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 6 24748348 C G - - - - - - 37 0 0 51 5 9.8 20 2 10 2 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 2 2 1 2 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 1.054700855 1.054700855 1 0.6105919 0.6105919 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.004473894 1 0.00000606 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 77461853 G A - - - - - - 43 0 0 63 7 11.1 20 1 5 2 0 0 2 0 0 3 0 0 FALSE FALSE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0.514065672 NA 0 0.913588785 0.913588785 1 0 NA 0 0 0 1 NA NA 1 1 0.09538952 1 3.38E-08 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 17 58241001 G A CA4 CCDS11624.1 r.? - - downstream 38 0 0 56 6 10.7 15 3 20 3 0 0 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 1.834008986 1.834008986 1 0.737549255 0.737549255 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.0000544 1 0.000000409 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 49308176 T A - - - - - - 79 0 0 130 4 3.1 37 0 0 5 0 0 3 0 0 3 0 0 TRUE FALSE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.198216786 1.21188826 0.163560283 0 NA 0 0 NA 0 1 NA 1 1 1 1 0.004307977 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 55964922 G A KDR CCDS3497.1 r.2611c>u c.2315C>T p.A772V missense 33 0 0 55 12 21.8 18 3 16.7 205 0 0 130 7 5.4 114 12 10.5 TRUE TRUE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 1.708614572 1.708614572 1 1.393911593 1.393911593 1 1.074278623 1.074278623 1 0.345280853 0.345280853 1 3 2 1 1 0.0000964 8.42E-13 8.78E-17 0.00000482 YES 1_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 4 132520439 A T - - - - - - 32 0 0 49 7 14.3 20 0 0 11 0 0 77 0 0 92 0 0 TRUE FALSE 3.684216435 3.395077346 2 2 1 1 0.315783565 0.604922654 2 2 2 2 0.684216435 0.395077346 0 0 1 1.090461793 1.090461793 1 0 NA 0 0 NA 0 2 NA 1 1 1 1 5.58E-09 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 11 38589029 A G - - - - - - 41 0 0 46 8 17.4 17 0 0 17 0 0 135 11 8.1 151 8 5.3 TRUE TRUE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.25811215 1.25811215 1 0.505991453 0.505991453 1 0.585672897 0.585672897 1 2 2 1 1 1 0.00000115 8.61E-11 1.24E-10 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 3 21159859 G C - - - - - - 40 0 0 51 8 15.7 18 0 0 17 0 0 99 1 1 118 1 0.8 TRUE FALSE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 1.090975363 1.090975363 1 0.073862291 NA 0 0.069488877 NA 0 2 NA 1 1 1 0.446492477 2.05E-10 0.391185491 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 44911862 C G - - - - - - 44 0 0 45 6 13.3 9 0 0 29 0 0 154 12 7.8 162 8 4.9 TRUE TRUE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 0.850413954 0.850413954 1 0.501330024 0.732706785 0.684216435 0.49873901 0.49873901 1 2 2 1 1 1 0.00000195 0.000000108 3.03E-11 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 21 16268894 A G - - - - - - 23 0 0 52 9 17.3 8 0 0 38 0 0 103 9 8.7 79 1 1.3 TRUE FALSE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 0 0 1 1.102607496 1.102607496 1 0.111111111 NA 0 0.554490475 0.554490475 1 2 NA 1 1 1 0.326987115 5.92E-12 3.21E-09 YES 0_0 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 11 83769248 A T DLG2 CCDS41696.1 r.? - - intronic 39 0 0 57 10 17.5 23 1 4.3 39 0 0 170 29 17.1 150 18 12 TRUE TRUE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.410521368 0.410521368 1 1.265342679 1.265342679 1 1.145641026 1.145641026 1 1.236420561 1.236420561 1 2 3 1 1 0.108890944 1.63E-19 3.4E-13 4.07E-35 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 7 136953695 G T PTN CCDS5844.1 r.? - - intronic 42 0 0 44 11 25 15 2 13.3 42 0 0 290 56 19.3 295 29 9.8 TRUE TRUE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.269752137 1.269752137 1 1.858005178 0.929002589 2 0.935606838 0.935606838 1 1.434379997 1.193833211 1.201491116 2 3 1 1 0.002513772 5.9E-28 3.22E-16 1.64E-69 YES 1_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 18 49446065 T A - - - - - - 43 0 0 45 10 22.2 18 0 0 47 0 0 266 16 6 243 7 2.9 TRUE TRUE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.82717757 0.913588785 2 0.305863248 0.305863248 1 0.493831776 0.493831776 1 2 1 1 1 1 0.000254834 2.66E-14 8.91E-13 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 8 58981389 G C FAM110B CCDS6170.1 r.? - - intronic 33 0 0 57 8 14 7 0 0 49 0 0 112 6 5.4 111 6 5.4 FALSE TRUE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 1.152274143 1.152274143 1 0.555190926 0.555190926 1 0.444448598 0.444448598 1 NA 2 1 1 1 0.0000226 5.19E-10 0.0000238 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 15 78269216 G A - - - - - - 16 0 0 25 7 28 8 1 12.5 50 3 6 8 0 0 4 0 0 TRUE FALSE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 1.138015028 1.138015028 1 1.924899256 1.924899256 1 0 NA 0 0 NA 0 2 NA 1 0.002055544 0.039306956 1 3.47E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 7 63674880 T G - - - - - - 36 0 0 49 7 14.3 21 1 4.8 50 0 0 316 21 6.6 294 7 2.4 TRUE TRUE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0.45825641 0.45825641 1 1.062778962 1.062778962 1 0.229128205 0.229128205 1 0.490513367 0.490513367 1 2 1 1 1 0.099912572 0.000788692 5.58E-09 3.6E-17 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 8 106973928 A G - - - - - - 49 0 0 74 18 24.3 39 5 12.8 50 0 0 196 33 16.8 165 19 11.5 TRUE TRUE 3.734304899 5 2 3 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 1.316008121 1.316008121 1 2.243018692 1.121509346 2 1.182351046 1.182351046 1 1.550728972 0.775364486 2 3 3 1 1 0.00000156 3.61E-20 2.13E-25 1.54E-39 YES 1_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 7 137794891 G C AKR1D1 CCDS5846.1 r.? - - intronic 30 0 0 44 11 25 13 3 23.1 51 0 0 378 93 24.6 414 35 8.5 TRUE TRUE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 2.205358974 2.205358974 1 1.858005178 0.929002589 2 0.811495726 0.811495726 1 1.828277095 0.914138547 2 3 3 1 1 0.0000344 3.99E-31 3.22E-16 4.57E-125 YES 1_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b X 121139133 G C - - - - - - 47 0 0 43 6 14 18 0 0 52 0 0 201 24 11.9 179 16 8.9 TRUE TRUE 2.480178476 2.704050758 1 1 1 1 0.519821524 0.295949242 2 2 1 1 0.480178476 0.704050758 0 0 1 0.970841249 0.970841249 1 0.803419645 0.803419645 1 0.825215062 0.825215062 1 2 3 1 1 1 1.88E-15 8.13E-08 1.86E-25 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 6 70280162 C G - - - - - - 37 0 0 51 9 17.6 13 0 0 54 0 0 143 4 2.8 203 5 2.5 TRUE TRUE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.096573209 1.096573209 1 0.213675214 0.213675214 1 0.174454829 0.174454829 1 2 1 1 1 1 0.003775979 4.92E-12 0.006020038 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b X 5639241 C G - - - - - - 35 0 0 55 7 12.7 14 0 0 55 0 0 142 9 6.3 181 7 3.9 TRUE TRUE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 0.830916143 0.830916143 1 0.352060294 0.733186329 0.480178476 0.412186748 1.320615301 0.312117198 2 3 1 1 1 0.0000411 1.28E-08 5.36E-08 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 2 144968638 C A GTDC1 CCDS33300.1 r.? - - intronic 37 0 0 51 11 21.6 13 0 0 56 0 0 116 11 9.5 124 6 4.8 TRUE TRUE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 1.378332661 1.378332661 1 0.50625641 0.50625641 1 0.606211124 0.606211124 1 2 2 1 1 1 0.0000421 1.94E-15 2.37E-11 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 4 190033412 A T - - - - - - 37 0 0 41 6 14.6 16 0 0 56 0 0 109 17 15.6 68 2 2.9 TRUE TRUE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.055657321 1.055657321 1 0.276863248 0.276863248 1 1.127962617 1.127962617 1 2 3 1 1 1 0.045825786 6.05E-08 1.61E-20 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 14 85856440 A G - - - - - - 44 0 0 49 8 16.3 22 0 0 61 1 1.6 236 16 6.8 263 9 3.4 TRUE TRUE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0 0 1 1.12657612 1.12657612 1 0.313731795 0.313731795 1 0.469982676 0.690156008 0.680980345 2 1 1 0.263440347 1 0.00000904 1.47E-10 1.43E-13 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 6 71798696 T A - - - - - - 38 0 0 50 6 12 13 0 0 63 0 0 344 25 7.3 299 6 2 TRUE TRUE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.747663551 0.747663551 1 0.170940171 0.170940171 1 0.45482866 0.45482866 1 2 1 1 1 1 0.004264089 0.000000206 4.39E-21 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 17 17896094 C T LRRC48 CCDS45622.1 r.750c>u c.460C>T p.R154W missense 34 0 0 40 5 12.5 13 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 0 0 1 0.861622961 0.861622961 1 NA NA 0 NA NA 1 2 NA 1 1 1 1 0.00000178 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 30813811 A C ENSG00000236416 ENST00000423865 r.? - - downstream 31 1 3.2 32 9 28.1 16 2 12.5 71 16 22.5 12 1 8.3 13 3 23.1 TRUE TRUE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 1.138015028 1.138015028 1 1.931773896 1.1749659 1.644110605 2.103051771 2.103051771 1 0.570595137 0.570595137 1 2 3 0.143917729 3.77E-22 0.002863359 0.0000344 4.94E-14 0.058377193 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 89747518 T G - - - - - - 38 0 0 51 7 13.7 20 0 0 72 0 0 149 4 2.7 94 2 2.1 TRUE TRUE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 0 0 1 1.101837627 1.101837627 1 0.221487179 0.221487179 1 0.217150481 0.217150481 1 2 1 1 1 1 0.080854778 7.46E-09 0.006943285 YES 0_0 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 1 197499835 T C DENND1B CCDS44289.1 r.? - - intronic 28 0 0 53 4 7.5 14 4 28.6 70 0 0 181 24 13.3 146 8 5.5 TRUE TRUE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 3.016444444 1.508222222 2 0.596819335 0.596819335 1 0.58008547 0.58008547 1 1.058359622 1.058359622 1 2 3 1 1 0.000000601 0.000000892 0.000150502 1.4E-26 YES 1_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 7 63096275 C A - - - - - - 27 0 0 50 7 14 11 0 0 75 0 0 36 2 5.6 27 2 7.4 FALSE TRUE 2 3.201491116 1 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0 NA 0 1.0404829 1.0404829 1 0.632478632 0.632478632 1 0.41619316 0.41619316 1 NA 2 1 1 1 0.00807567 6.46E-09 0.014070883 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 3 166893785 C T - - - - - - 31 0 0 44 9 20.5 21 0 0 76 0 0 132 5 3.8 162 11 6.8 TRUE TRUE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 1.424521971 1.424521971 1 0.627829471 0.627829471 1 0.264057731 0.264057731 1 2 2 1 1 1 8.73E-10 1.18E-12 0.000571166 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 2 55002011 C A EML6 CCDS46286.1 r.? - - intronic 38 0 0 49 7 14.3 22 1 4.5 78 0 0 279 18 6.5 228 15 6.6 TRUE TRUE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0.474615385 0.474615385 1 0.912507271 0.912507271 1 0.696102564 0.696102564 1 0.414776032 0.414776032 1 2 2 1 1 0.104413009 1.26E-12 5.58E-09 1.04E-14 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 7 125428099 C G - - - - - - 37 0 0 62 9 14.5 9 4 44.4 78 0 0 172 45 26.2 154 16 10.4 TRUE TRUE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 4.238871795 2.119435897 2 1.077643003 1.077643003 1 0.992888889 0.992888889 1 1.947189426 0.973594713 2 3 3 1 1 7.72E-08 1.7E-16 3.12E-11 9.03E-63 YES 1_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 7 146689150 C A CNTNAP2 CCDS5889.1 r.? - - intronic 35 0 0 57 14 24.6 10 2 20 79 0 0 296 49 16.6 283 50 17.7 TRUE TRUE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.909401709 1.909401709 1 1.828277095 0.914138547 2 1.689820513 0.844910256 2 1.233715438 1.233715438 1 2 3 1 1 0.001095391 3.61E-60 3.84E-20 1.6E-57 YES 1_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 14 23889081 G A MYH7 CCDS9601.1 r.3805c>u c.3699C>T p.S1233S silent 27 0 0 24 6 25 9 2 22.2 129 0 0 76 5 6.6 86 3 3.5 TRUE TRUE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 2.048484071 2.048484071 1 1.727877485 1.727877485 1 0.3229592 0.474662757 0.680397177 0.456159656 0.669857301 0.680980345 3 2 1 1 0.000879235 0.009396251 1.95E-09 0.000043 YES 1_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 21 22604527 T G NCAM2 CCDS42910.1 r.? - - intronic 36 0 0 64 9 14.1 16 0 0 83 0 0 145 3 2.1 164 5 3 TRUE TRUE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 0 0 1 0.898656977 0.898656977 1 0.256410256 0.256410256 1 0.133842528 0.936458524 0.142924139 2 1 1 1 1 0.001505536 4.2E-11 0.036846426 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 1 183615726 G T APOBEC4 CCDS1358.1 r.2463c>a c.? p.? 3'UTR variant 46 0 0 42 6 14.3 18 0 0 84 0 0 102 15 14.7 107 6 5.6 TRUE TRUE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 1.137935533 1.137935533 1 0.590632479 0.590632479 1 1.169765898 1.169765898 1 2 3 1 1 1 0.0000183 7.02E-08 7.08E-18 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 1 248396507 C A - - - - - - 46 0 0 57 8 14 23 0 0 84 0 0 236 25 10.6 263 25 9.5 TRUE TRUE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 0 0 1 1.11406276 1.11406276 1 1.001965812 1.001965812 1 0.843504661 0.843504661 1 2 3 1 1 1 5.93E-24 5.19E-10 3.92E-25 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 9 138160618 G A - - - - - - 29 0 0 46 8 17.4 12 0 0 84 0 0 14 0 0 43 0 0 TRUE FALSE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0 0 1 1.201554149 1.201554149 1 0 NA 0 0 NA 0 2 NA 1 1 1 1 8.61E-11 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 8 68592821 A G CPA6 CCDS6200.1 r.? - - intronic 40 0 0 56 8 14.3 13 0 0 85 0 0 248 22 8.9 185 15 8.1 FALSE TRUE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 1.176965732 1.176965732 1 0.832786389 0.832786389 1 0.732517134 0.732517134 1 NA 3 1 1 1 5.97E-14 4.48E-10 1.31E-20 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 13 72870479 T C - - - - - - 44 0 0 51 8 15.7 7 0 0 87 0 0 141 9 6.4 151 14 9.3 TRUE TRUE 3 2.66288314 2 1 1 1 1 0.33711686 NA 2 NA 1 NA 0.66288314 0 0 1 1.082265799 1.082265799 1 0.887871795 0.887871795 1 0.441178415 0.665544782 0.66288314 2 3 1 1 1 6.35E-14 2.05E-10 5.05E-08 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 1 145761224 A G PDZK1 CCDS924.1 r.1110a>g c.1037A>G p.N346S missense 13 0 0 17 4 23.5 9 3 33.3 139 0 0 102 21 20.6 93 11 11.8 TRUE TRUE 4 3.812080819 2 2 2 1 1 0.187919181 NA 2 NA 2 NA 0.812080819 3.512153846 1.756076923 2 1.890013447 1.890013447 1 1.244547009 1.244547009 1 1.656777745 0.828388873 2 3 3 1 1 0.0000103 2.04E-12 0.00000141 1.05E-27 YES 1_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 21 27650157 G C - - - - - - 29 0 0 56 8 14.3 23 0 0 88 0 0 400 13 3.2 450 12 2.7 TRUE TRUE 2 2.142924139 1 1 1 1 1 0.857075861 NA 2 NA 1 NA 0.142924139 0 0 1 0.911403884 0.911403884 1 0.230769231 0.230769231 1 0.203950519 1.426984417 0.142924139 2 1 1 1 1 0.00000405 4.48E-10 0.00000018 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 7 158036650 C T PTPRN2 CCDS5949.1 r.? - - intronic 33 0 0 61 16 26.2 22 9 40.9 94 0 0 127 17 13.4 204 19 9.3 TRUE TRUE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 3.904726496 1.952363248 2 1.947189426 0.973594713 2 0.887871795 0.887871795 1 0.995890775 0.995890775 1 3 3 1 1 9.16E-16 2.09E-18 2.5E-23 2.42E-19 YES 1_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b X 76622627 T A - - - - - - 32 0 0 36 6 16.7 10 0 0 96 0 0 83 7 8.4 74 3 4.1 TRUE TRUE 2.480178476 2.312117198 1 1 1 1 0.519821524 0.687882802 2 2 1 1 0.480178476 0.312117198 0 0 1 1.092622015 1.092622015 1 0.370114668 0.770785628 0.480178476 0.549582331 0.549582331 1 2 2 1 1 1 0.006220661 2.68E-08 0.000000233 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 3 181555016 A G - - - - - - 40 0 0 63 20 31.7 16 2 12.5 99 0 0 178 31 17.4 202 17 8.4 TRUE TRUE 2.685777788 3 1 2 1 1 0.314222212 1 2 NA 1 NA 0.685777788 NA 1.154098292 1.154098292 1 2.292077882 1.146038941 2 0.775554052 0.775554052 1 1.25811215 1.25811215 1 3 3 1 1 0.002863359 6.95E-16 1.05E-30 1E-37 YES 1_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 9 25239326 T C - - - - - - 42 0 0 71 9 12.7 16 0 0 99 0 0 190 15 7.9 208 7 3.4 TRUE TRUE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.045277259 1.045277259 1 0.358598291 0.358598291 1 0.650211838 0.650211838 1 2 1 1 1 1 0.0000983 1.1E-10 8.84E-14 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 4 44259407 A G KCTD8 CCDS3467.1 r.? - - intronic 40 0 0 50 8 16 15 0 0 104 0 0 290 22 7.6 288 12 4.2 TRUE TRUE 3.684216435 2.163560283 2 1 1 1 0.315783565 0.836439717 2 2 2 1 0.684216435 0.163560283 0 0 1 1.02305438 1.02305438 1 0.429711449 0.628034387 0.684216435 0.485950831 0.485950831 1 2 2 1 1 1 3.69E-08 1.74E-10 3.87E-19 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 9 18707768 G A ADAMTSL1 CCDS47954.1 r.? - - intronic 39 0 0 61 13 21.3 20 0 0 104 0 0 137 8 5.8 93 7 7.5 TRUE TRUE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.753102804 0.876551402 2 0.791025641 0.791025641 1 0.477370717 0.477370717 1 2 2 1 1 1 0.000000508 6.41E-18 0.000000551 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 12 130815954 C A - - - - - - 31 0 0 51 9 17.6 13 0 0 118 1 0.8 76 7 9.2 56 3 5.4 TRUE TRUE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.096573209 1.096573209 1 0.461538462 0.461538462 1 0.573208723 0.573208723 1 2 2 1 0.446492477 1 0.00284314 4.92E-12 0.000000126 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 18 5678258 T G - - - - - - 40 0 0 66 8 12.1 22 0 0 119 0 0 208 8 3.8 186 10 5.4 FALSE TRUE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 NA 0 1.116894081 1.116894081 1 0.569538462 0.569538462 1 0.350760125 0.350760125 1 NA 2 1 1 1 4.69E-08 1.73E-09 0.0000122 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 7 157470660 G A PTPRN2 CCDS5949.1 r.? - - intronic 34 0 0 58 14 24.1 14 0 0 119 1 0.8 57 9 15.8 90 13 14.4 TRUE TRUE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0 0 1 1.791116991 0.895558496 2 1.374769231 1.374769231 1 1.174259272 1.174259272 1 2 3 1 0.449260015 1 1.4E-15 5.04E-20 1.42E-11 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 1 164970100 G C - - - - - - 31 0 0 52 5 9.6 27 0 0 122 0 0 414 13 3.1 329 9 2.7 FALSE TRUE 3 5 2 3 1 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 NA 0 0.886130841 0.886130841 1 0.257769231 0.257769231 1 0.286146417 0.286146417 1 NA 1 1 1 1 0.000052 0.00000668 0.000000266 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 3 166802225 G T - - - - - - 38 0 0 64 10 15.6 17 0 0 122 0 0 164 13 7.9 174 16 9.2 TRUE TRUE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 1.084026476 1.084026476 1 0.849416343 0.849416343 1 0.548962125 0.764190101 0.718358069 2 3 1 1 1 1.2E-15 1.16E-12 3.7E-12 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 10 134863936 G A - - - - - - 44 0 0 42 8 19 12 0 0 123 1 0.8 6 1 16.7 6 0 0 TRUE TRUE 4 3.733206845 2 2 2 1 1 0.266793155 NA 2 NA 2 NA 0.733206845 0 0 1 1.513109924 1.513109924 1 0 0 1 1.329943986 1.329943986 1 2 3 1 0.460192478 1 1 3.96E-11 0.029627491 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 15 58787920 G C LIPC CCDS10166.1 r.? - - intronic 29 0 0 54 8 14.8 17 0 0 126 0 0 93 8 8.6 91 6 6.6 TRUE TRUE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0 0 1 1.01744675 1.01744675 1 0.600871935 0.600871935 1 0.591219057 0.591219057 1 2 2 1 1 1 0.00000724 3.31E-10 2.73E-08 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 5 127165925 T C - - - - - - 42 0 0 45 4 8.9 13 4 30.8 127 0 0 251 20 8 267 20 7.5 TRUE TRUE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 2.78386629 1.866464638 1.491518367 0.603291778 0.603291778 1 0.677889519 0.677889519 1 0.542284744 0.989517066 0.548029703 2 3 1 1 0.000000431 1.97E-17 0.0000791 5.9E-18 YES 1_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 20 8782728 C T PLCB1 CCDS13103.1 r.3924c>u c.3449C>T p.S1150L missense 44 0 0 55 9 16.4 18 3 16.7 179 0 0 200 23 11.5 194 12 6.2 TRUE TRUE 3.607147833 3.586136044 2 2 1 1 0.392852167 0.413863956 2 2 2 2 0.607147833 0.586136044 1.695744115 1.695744115 1 1.281933165 1.281933165 1 0.629557696 0.629557696 1 0.898916549 0.898916549 1 3 3 1 1 0.0000964 4.42E-10 1.01E-11 4.44E-24 YES 1_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 7 62694017 C T - - - - - - 35 0 0 31 7 22.6 17 6 35.3 134 0 0 69 7 10.1 60 16 26.7 TRUE TRUE 2 3.201491116 1 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 3.017094017 3.017094017 1 1.679636681 1.679636681 1 2.282051282 2.282051282 1 0.750634092 0.750634092 1 3 3 1 1 1.84E-10 1.86E-23 1.85E-10 6.43E-08 YES 1_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 22 41959257 A T CSDC2 CCDS14019.1 r.? - - intronic 31 0 0 43 7 16.3 9 3 33.3 159 1 0.6 43 5 11.6 43 3 7 TRUE TRUE 2.653152692 2.618047833 1 1 1 1 0.346847308 0.381952167 2 2 1 1 0.653152692 0.618047833 3.063653692 3.063653692 1 1.116318121 1.116318121 1 0.644011287 0.644011287 1 0.794434982 0.794434982 1 3 3 1 0.549318388 0.0000103 0.001328364 2.15E-09 0.00000257 YES 1_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 3 74413156 C A CNTN3 CCDS33790.1 r.? - - intronic 34 0 0 61 8 13.1 16 0 0 135 0 0 146 4 2.7 117 8 6.8 TRUE TRUE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 0 0 1 0.910304284 0.910304284 1 0.627829471 0.627829471 1 0.187619967 0.187619967 1 2 2 1 1 1 0.000000164 9.09E-10 0.006470758 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 1 227982147 A C - - - - - - 46 0 0 57 2 3.5 8 3 37.5 135 0 0 12 1 8.3 2 0 0 TRUE TRUE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 3.955128205 1.977564103 2 0.27851569 0.383070308 0.727061545 0 0 1 0.660480065 0.660480065 1 2 3 1 1 0.00000687 1 0.03327602 0.058377193 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 65314082 T A AC114689.1 ENST00000500778 r.? - - intronic 38 0 0 55 9 16.4 9 0 0 136 1 0.7 315 19 6 336 5 1.5 TRUE TRUE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.349806854 1.349806854 1 0.158205128 0.158205128 1 0.493831776 0.493831776 1 2 1 1 0.494246402 1 0.02800127 1.01E-11 6.48E-15 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 7 101280622 C T - - - - - - 33 0 0 66 18 27.3 18 0 0 137 0 0 178 38 21.3 199 26 13.1 TRUE TRUE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0 0 1 2.028941654 1.014470827 2 1.25065812 1.25065812 1 1.583020411 0.791510206 2 2 3 1 1 1 1.71E-28 2.08E-26 1.63E-49 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 1 243419539 C T SDCCAG8 CCDS31075.1 r.182c>u c.64C>T p.R22W missense 43 0 0 46 5 10.9 8 1 12.5 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 4 3.727061545 2 2 2 1 1 0.272938455 NA 2 NA 2 NA 0.727061545 1.318376068 1.318376068 1 0.867377434 0.867377434 1 NA NA 1 NA NA 0 2 NA 1 1 0.039306956 1 0.00000361 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 16265265 A T SPEN CCDS164.1 r.10961a>u c.10757A>T p.E3586V missense 35 0 0 37 5 13.5 16 1 6.2 88 0 0 18 0 0 11 0 0 TRUE FALSE 2.676461027 2.698551327 1 1 1 1 0.323538973 0.301448673 2 2 1 1 0.676461027 0.698551327 0.571855114 0.571855114 1 0.935425924 0.935425924 1 0 NA 0 0 NA 0 2 NA 1 1 0.077068876 1 0.00000119 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 18 10493955 A C - - - - - - 34 0 0 49 7 14.3 19 0 0 145 0 0 103 8 7.8 104 4 3.8 TRUE TRUE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.176965732 1.176965732 1 0.400786325 0.400786325 1 0.641981308 0.641981308 1 2 2 1 1 1 0.001931437 5.58E-09 6.09E-08 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 1 165877626 G A UCK2 CCDS1252.1 r.? - - downstream 43 0 0 50 6 12 21 1 4.8 154 0 0 80 8 10 97 7 7.2 FALSE TRUE 3 5 2 3 1 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0.45825641 NA 0 1.107663551 1.107663551 1 0.687384615 0.687384615 1 0.92305296 0.92305296 1 NA 3 1 1 0.099912572 0.000000677 0.000000206 8.22E-09 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 2 237893292 G C - - - - - - 34 0 0 53 7 13.2 14 0 0 154 0 0 140 12 8.6 202 14 6.9 TRUE TRUE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.842314404 0.842314404 1 0.72774359 0.72774359 1 0.548780596 0.548780596 1 2 2 1 1 1 3.46E-12 9.85E-09 9.85E-12 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 15 81114683 T A KIAA1199 CCDS10315.1 r.? - - intronic 35 0 0 46 6 13 20 0 0 158 0 0 123 11 8.9 124 7 5.6 TRUE TRUE 2.557111675 2.644110605 1 1 1 1 0.442888325 0.355889395 2 2 1 1 0.557111675 0.644110605 0 0 1 0.893703226 0.893703226 1 0.509830732 0.91513202 0.557111675 0.611842978 0.949903592 0.644110605 2 3 1 1 1 0.00000353 0.000000123 4.5E-11 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 9 34410293 T C C9orf25 CCDS6556.1 r.? - - intronic 35 0 0 50 0 0 22 5 22.7 186 0 0 165 6 3.6 141 9 6.4 TRUE TRUE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 2.39417094 1.19708547 2 0 0 1 0.675008547 0.675008547 1 0.296299065 0.296299065 1 2 2 1 1 7.67E-08 5.05E-08 1 0.000202807 YES 1_1 0_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 6 53908685 C G C6orf142 CCDS4954.1 r.? - - intronic 24 0 0 63 9 14.3 21 1 4.8 160 0 0 318 30 9.4 324 50 15.4 TRUE TRUE 4.581695873 3.184476375 3 2 1 1 0.418304127 0.815523625 3 3 2 1 0.581695873 0.184476375 0.534177812 0.534177812 1 1.060345854 1.060345854 1 1.713820481 0.85691024 2 0.697010561 0.697010561 1 2 3 1 1 0.099912572 4.74E-57 3.62E-11 2.5E-28 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 3 139320102 C A NMNAT3 CCDS3111.1 r.? - - intronic 35 0 0 53 5 9.4 9 3 33.3 161 0 0 75 4 5.3 70 8 11.4 TRUE TRUE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 3.074517849 3.074517849 1 0.65319544 0.65319544 1 1.052537642 1.052537642 1 0.368291046 0.512684498 0.718358069 2 3 1 1 0.0000103 2.8E-09 0.00000734 0.000572493 YES 1_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 18 22445395 G A - - - - - - 26 0 0 61 10 16.4 20 0 0 174 0 0 131 11 8.4 124 2 1.6 TRUE TRUE 4 4 2 2 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.349806854 1.349806854 1 0.168752137 0.168752137 1 0.691364486 0.691364486 1 2 1 1 1 1 0.128210852 6.98E-13 8.94E-11 YES 0_0 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 17 7577538 C T TP53 CCDS11118.1 r.933g>a c.743G>A p.R248Q missense 28 0 0 47 5 10.6 9 1 11.1 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.623036383 2.662454094 1 1 1 1 0.376963617 0.337545906 2 2 1 1 0.623036383 0.662454094 1.017874987 1.017874987 1 0.730656271 0.730656271 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 0.044110422 1 0.00000402 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 1 16269929 C A ZBTB17 CCDS165.1 r.1895g>u c.1662G>T p.G554G silent 34 0 0 43 4 9.3 7 0 0 0 0 NA 0 0 NA 0 0 NA TRUE FALSE 2.676461027 2.698551327 1 1 1 1 0.323538973 0.301448673 2 2 1 1 0.676461027 0.698551327 0 0 1 0.644404526 0.644404526 1 NA NA 0 NA NA 0 2 NA 1 1 1 1 0.000066 1 NO inad_validation_depth inad_validation_depth NA NA PD9773b 4 183669547 G A ODZ3 CCDS47165.1 r.? - - intronic 29 0 0 48 10 20.8 12 0 0 181 0 0 222 31 14 224 22 9.8 TRUE TRUE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.503950156 1.503950156 1 0.935606838 0.935606838 1 1.012274143 1.012274143 1 2 3 1 1 1 1.41E-21 5.37E-14 1.36E-34 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 2 45557070 G C - - - - - - 44 0 0 47 6 12.8 17 0 0 183 0 0 72 4 5.6 56 2 3.6 TRUE TRUE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 0.816789725 0.816789725 1 0.379692308 0.379692308 1 0.357345505 0.357345505 1 2 1 1 1 1 0.032213353 0.000000141 0.000490365 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 9 78778238 C A PCSK5 CCDS6652.1 r.? - - intronic 43 0 0 44 6 13.6 17 0 0 185 2 1.1 99 10 10.1 104 11 10.6 TRUE TRUE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0 0 1 0.939145772 0.939145772 1 0.97793698 0.97793698 1 0.697453845 0.697453845 1 2 3 1 0.236607154 1 7.11E-12 9.37E-08 1.01E-10 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 7 137039427 T G - - - - - - 35 0 0 45 11 24.4 19 4 21.1 248 0 0 369 74 20.1 288 42 14.6 TRUE TRUE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 2.014418803 2.014418803 1 1.813413054 0.906706527 2 1.393863248 0.696931624 2 1.493836163 1.243318526 1.201491116 3 3 1 1 0.00000228 4.12E-47 4.24E-16 1.31E-92 YES 1_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 5 21219523 T C - - - - - - 38 0 0 49 7 14.3 14 0 0 191 0 0 170 8 4.7 96 8 8.3 TRUE TRUE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 0.96933398 0.96933398 1 0.750197734 0.750197734 1 0.318592287 0.581341276 0.548029703 2 2 1 1 1 0.000000035 5.58E-09 0.00000279 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 4 152713367 C A - - - - - - 44 0 0 49 14 28.6 6 2 33.3 192 0 0 138 17 12.3 134 15 11.2 TRUE TRUE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 3.179153846 3.179153846 1 2.067931464 1.033965732 2 1.069264957 1.069264957 1 0.88935514 0.88935514 1 3 3 1 1 0.000370028 4.77E-16 3.5E-21 1.03E-18 YES 1_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 7 89215173 A C - - - - - - 22 0 0 69 0 0 23 4 17.4 73 0 0 351 0 0 336 12 3.6 FALSE FALSE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 1.661179487 1.661179487 1 0 NA 0 0.343692308 0.343692308 1 0 NA 0 NA NA 1 1 0.00000513 0.000000195 1 1 YES 1_1 0_0 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 19 28540803 C A - - - - - - 24 0 0 57 11 19.3 16 0 0 195 0 0 83 4 4.8 72 2 2.8 FALSE TRUE 2.26764099 4 1 2 1 2 0.73235901 1 2 NA 1 NA 0.26764099 NA 0 NA 0 1.588492212 1.588492212 1 0.246810187 0.922168862 0.26764099 0.395065421 0.395065421 1 NA 2 1 1 1 0.050755634 7.29E-15 0.000838577 YES 0_0 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 12 54377719 A T HOXC10 CCDS8868.1 r.? - - upstream 37 0 0 48 7 14.6 15 0 0 196 0 0 131 7 5.3 103 5 4.9 TRUE TRUE 2 2 1 1 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 0.909657321 0.909657321 1 0.418803419 0.418803419 1 0.330218069 0.330218069 1 2 1 1 1 1 0.000182144 4.81E-09 0.00000507 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 8 54341980 G A - - - - - - 42 0 0 68 9 13.2 17 0 0 199 0 0 222 19 8.6 209 12 5.7 FALSE TRUE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 1.086429907 1.086429907 1 0.586034866 0.798081106 0.734304899 0.707825545 0.707825545 1 NA 3 1 1 1 1.03E-09 7.38E-11 1.03E-17 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 11 111847515 G A DIXDC1 ENST00000389821 r.? - - intronic 41 0 0 50 11 22 14 0 0 202 0 0 77 6 7.8 119 6 5 TRUE TRUE 3 3 2 2 1 1 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 0 1 1.590716511 1.590716511 1 0.477350427 0.477350427 1 0.563981308 0.563981308 1 2 2 1 1 1 0.0000335 1.52E-15 0.00000273 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 2 240362792 G A - - - - - - 38 0 0 53 9 17 7 0 0 203 0 0 88 3 3.4 82 8 9.8 TRUE TRUE 4 2.15064013 2 1 2 1 1 0.84935987 NA 2 NA 1 NA 0.15064013 0 0 1 1.084798853 1.084798853 1 1.033606838 1.033606838 1 0.216959771 1.440252143 0.15064013 2 3 1 1 1 0.00000001 7.1E-12 0.010001517 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 19 44896539 A G ZNF285A CCDS12638.1 r.172u>c c.107T>C p.V36A missense 36 0 0 49 6 12.2 18 4 22.2 181 0 0 168 12 7.1 221 14 6.3 TRUE TRUE 2.26764099 3.65443054 1 2 1 1 0.73235901 0.34556946 2 2 1 2 0.26764099 0.65443054 1.956852197 1.956852197 1 0.961965137 0.961965137 1 0.555322921 0.555322921 1 0.55983217 0.855449333 0.65443054 3 3 1 1 0.00000181 1.16E-11 0.000000182 8.39E-11 YES 1_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 9 97334218 C G FBP2 CCDS6711.1 r.? - - intronic 37 0 0 44 8 18.2 17 0 0 205 0 0 150 26 17.3 138 17 12.3 TRUE TRUE 2.678812018 2.67495402 1 1 1 1 0.321187982 0.32504598 2 2 1 1 0.678812018 0.67495402 0 0 1 1.256798018 1.256798018 1 1.134775929 1.134775929 1 1.194648665 1.194648665 1 2 3 1 1 1 1.03E-18 5.9E-11 7.71E-32 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 7 137205506 T G DGKI CCDS5845.1 r.? - - intronic 33 0 0 51 7 13.7 12 0 0 208 0 0 415 64 15.4 391 52 13.3 TRUE TRUE 3 3.201491116 2 2 1 1 1 0.798508884 NA 3 NA 1 NA 0.201491116 0 0 1 1.018186837 1.018186837 1 1.269752137 1.269752137 1 1.14453119 1.14453119 1 2 3 1 1 1 9.27E-56 7.46E-09 1.61E-72 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 14 30666045 A C AL121840.1 ENST00000508469 r.? - - intronic 29 0 0 47 7 14.9 16 0 0 209 0 0 229 15 6.6 190 15 7.9 TRUE TRUE 2.680397177 2.680980345 1 1 1 1 0.319602823 0.319019655 2 2 1 1 0.680397177 0.680980345 0 0 1 1.029814981 1.029814981 1 0.728965052 0.728965052 1 0.456159656 0.669857301 0.680980345 2 2 1 1 1 8.84E-14 4.12E-09 1.34E-12 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 5 133227226 G A - - - - - - 47 0 0 49 8 16.3 19 0 0 213 0 0 65 6 9.2 75 7 9.3 TRUE TRUE 2.491518367 2.548029703 1 1 1 1 0.508481633 0.451970297 2 2 1 1 0.491518367 0.548029703 0 0 1 1.104905166 1.104905166 1 0.840583003 0.840583003 1 0.623627455 0.623627455 1 2 2 1 1 1 0.000000115 1.47E-10 0.000001 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 8 75099379 A T - - - - - - 42 0 0 59 9 15.3 19 0 0 221 0 0 293 16 5.5 254 8 3.1 FALSE TRUE 3.734304899 4 2 2 1 2 0.265695101 1 2 NA 2 NA 0.734304899 NA 0 NA 0 1.259271028 1.259271028 1 0.318720717 0.318720717 1 0.452679128 0.452679128 1 NA 1 1 1 1 0.0000506 1.96E-11 3.85E-12 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 18 913641 A G ADCYAP1 CCDS11825.1 r.? - - downstream 41 0 0 76 10 13.2 8 0 0 237 0 0 198 18 9.1 206 7 3.4 FALSE TRUE 4 5 2 3 2 2 1 1 NA NA NA NA NA NA 0 NA 0 1.218429907 1.218429907 1 0.358598291 0.358598291 1 0.839978193 0.839978193 1 NA 1 1 1 1 0.0000926 6.9E-12 2.5E-17 YES 0_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq PD9773b 3 16655642 T A DAZL ENST00000454457 r.? - - intronic 39 0 0 54 2 3.7 12 4 33.3 134 0 0 144 17 11.8 173 6 3.5 TRUE TRUE 2.685777788 2.718358069 1 1 1 1 0.314222212 0.281641931 2 2 1 1 0.685777788 0.718358069 3.074517849 1.823797817 1.685777788 0.257108844 0.35791182 0.718358069 0.323147522 0.471213165 0.685777788 0.819968744 0.819968744 1 2 3 1 1 0.0000003 0.000261597 0.030129377 2.17E-18 YES 1_1 1_1 somatic custom.pulldown.HiSeq