Normal	Chrom	Pos	Ref	Alt	Gene	Transcript	RNA	CDS	Protein	Effect	DIS_sample_PD9694b_depth	DIS_MtAll_PD9694b	DIS_MtAllPct_PD9694b	DIS_sample_PD9694a_depth	DIS_MtAll_PD9694a	DIS_MtAllPct_PD9694a	DIS_sample_PD9694c_depth	DIS_MtAll_PD9694c	DIS_MtAllPct_PD9694c	DIS_sample_PD9694d_depth	DIS_MtAll_PD9694d	DIS_MtAllPct_PD9694d	VAL_sample_WGA_PD9694b_depth	VAL_MtAll_WGA_PD9694b	VAL_MtAllPct_WGA_PD9694b	VAL_sample_PD9694a_depth	VAL_MtAll_PD9694a	VAL_MtAllPct_PD9694a	VAL_sample_PD9694c_depth	VAL_MtAll_PD9694c	VAL_MtAllPct_PD9694c	VAL_sample_PD9694d_depth	VAL_MtAll_PD9694d	VAL_MtAllPct_PD9694d	in.discovery	in.validation	subclonal.CN.a	subclonal.CN.c	subclonal.CN.d	nMaj1.a	nMaj1.c	nMaj1.d	nMin1.a	nMin1.c	nMin1.d	frac1.a	frac1.c	frac1.d	nMaj2.a	nMaj2.c	nMaj2.d	nMin2.a	nMin2.c	nMin2.d	frac2.a	frac2.c	frac2.d	mutation.copy.number.a	subclonal.fraction.a	no.chrs.bearing.mut.a	mutation.copy.number.c	subclonal.fraction.c	no.chrs.bearing.mut.c	mutation.copy.number.d	subclonal.fraction.d	no.chrs.bearing.mut.d	val.mutation.copy.number.a	val.subclonal.fraction.a	val.no.chrs.bearing.mut.a	val.mutation.copy.number.c	val.subclonal.fraction.c	val.no.chrs.bearing.mut.c	val.mutation.copy.number.d	val.subclonal.fraction.d	val.no.chrs.bearing.mut.d	discovery.DP.cluster	validation.DP.cluster	pbinom_dis_b	pbinom_val_b	pbinom_dis_a	pbinom_val_a	pbinom_dis_c	pbinom_val_c	pbinom_dis_d	pbinom_val_d	VAL_LOCUS	val_status_a	val_status_c	val_status_d	current.conf.status	val.platform
PD9694b	1	700469	G	A	-	-	-	-	-	-	11	0	0	10	3	30	8	0	0	6	0	0	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.842075227	2	2	1	1	1	0	1	1	0.157924773	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.842075227	NA	NA	1.200023815	1.200023815	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.0000146	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	2171507	C	G	SKI	CCDS39.1	r.?	-	-	intronic	53	0	0	32	6	18.8	52	12	23.1	56	17	30.4	57	0	0	209	39	18.7	221	52	23.5	220	63	28.6	TRUE	TRUE	1.842075227	2	2	1	1	1	0	1	1	0.157924773	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.842075227	NA	NA	0.752014924	0.752014924	1	0.944785276	0.944785276	1	1.085714286	1.085714286	1	0.748014845	0.888299312	0.842075227	0.961145194	0.961145194	1	1.021428571	1.021428571	1	8	5	1	1	1.27E-08	2.70E-48	4.19E-17	1.42E-69	6.22E-26	4.91E-90	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	3100589	C	T	PRDM16	CCDS44048.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	38	5	13.2	50	1	2	51	9	17.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.842075227	2	2	1	1	1	0	1	1	0.157924773	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.842075227	NA	NA	0.528010479	0.528010479	1	0.081799591	0.081799591	1	0.628571429	0.628571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.00000137	1	0.221687443	1	4.92E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	3266528	C	T	PRDM16	CCDS44048.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	35	9	25.7	68	0	0	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.842075227	2	2	1	1	1	0	1	1	0.157924773	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.842075227	NA	NA	1.028020402	1.028020402	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.23E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	3393211	C	G	ARHGEF16	CCDS46.2	r.?	-	-	intronic	48	0	0	37	0	0	64	24	37.5	58	1	1.7	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	1	0	0	FALSE	FALSE	1.842075227	2	2	1	1	1	0	1	1	0.157924773	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.842075227	NA	NA	0	NA	0	1.533742331	1.533742331	1	0.060714286	0.060714286	1	NA	NA	0	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	1	1	1	1.23E-38	1	0.252280541	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	5206166	C	A	-	-	-	-	-	-	51	0	0	45	0	0	67	11	16.4	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.842075227	2	2	1	1	1	0	1	1	0.157924773	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.842075227	NA	NA	0	NA	0	0.670756646	0.670756646	1	0.071428571	0.071428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	4.85E-14	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	5417580	G	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	50	12	24	55	2	3.6	36	4	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.842075227	2	2	1	1	1	0	1	1	0.157924773	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.842075227	NA	NA	0.960019052	0.960019052	1	0.147239264	0.147239264	1	0.396428571	0.396428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.49E-17	1	0.031164417	1	0.0000324	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	6160506	C	T	KCNAB2	CCDS55.1	r.3540c>u	c.?	p.?	3'UTR variant	43	0	0	44	0	0	65	11	16.9	51	0	0	7	0	0	64	0	0	138	24	17.4	75	0	0	FALSE	FALSE	1.842075227	2	2	1	1	1	0	1	1	0.157924773	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.842075227	NA	NA	0	NA	0	0.691206544	0.691206544	1	0	0	1	0	NA	0	0.711656442	0.711656442	1	0	0	1	NA	NA	1	1	1	1	3.41E-14	1.51E-29	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	7519867	G	A	CAMTA1	CCDS30576.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	41	8	19.5	51	0	0	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.842075227	2	2	1	1	1	0	1	1	0.157924773	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.842075227	NA	NA	0.78001548	0.78001548	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.22E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	7836332	T	A	VAMP3	CCDS88.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	45	9	20	50	1	2	63	10	15.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.842075227	2	2	1	1	1	0	1	1	0.157924773	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.842075227	NA	NA	0.800015877	0.800015877	1	0.081799591	0.081799591	1	0.567857143	0.567857143	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.47E-12	1	0.221687443	1	9.81E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	11951691	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	42	5	11.9	47	1	2.1	37	7	18.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.842075227	2	2	1	1	1	0	1	1	0.157924773	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.842075227	NA	NA	0.476009447	0.565281381	0.842075227	0.085889571	0.085889571	1	0.675	0.675	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.00000228	1	0.209895027	1	7.05E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	16673156	C	T	FBXO42	CCDS30613.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	39	0	0	53	11	20.8	62	1	1.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.850715746	0.850715746	1	0.057142857	0.057142857	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	3.07E-15	1	0.267123145	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	17733475	G	C	RCC2	CCDS181.1	r.3868c>g	c.?	p.?	3'UTR variant	41	0	0	34	10	29.4	40	0	0	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	1.172439217	1.172439217	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.15E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	19081083	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	43	9	20.9	60	14	23.3	43	13	30.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.833468695	0.833468695	1	0.952965235	0.952965235	1	1.078571429	1.078571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	9.45E-13	1	8.54E-20	1	3.88E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	19653729	G	A	PQLC2	CCDS195.2	r.1267g>a	c.627G>A	p.R209R	silent	48	0	0	40	10	25	58	14	24.1	46	13	28.3	58	0	0	100	25	25	145	30	20.7	116	28	24.1	TRUE	TRUE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.996972123	0.996972123	1	0.985685072	0.985685072	1	1.010714286	1.010714286	1	0.996972123	0.996972123	1	0.846625767	0.846625767	1	0.860714286	0.860714286	1	8	5	1	1	7.22E-15	5.04E-35	5.04E-20	5.53E-39	1.07E-19	1.46E-38	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	24663334	G	A	GRHL3	CCDS44088.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	39	0	0	51	12	23.5	55	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.961145194	0.961145194	1	0.064285714	0.064285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	3.24E-17	1	0.240951649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	25126901	G	A	CLIC4	CCDS256.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	43	0	0	54	11	20.4	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.834355828	0.834355828	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	3.84E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	25143133	A	T	CLIC4	CCDS256.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	45	0	0	51	7	13.7	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.560327198	0.560327198	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	7.46E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	25193699	G	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	33	6	18.2	46	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.725795706	0.725795706	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.54E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	25245642	G	T	RUNX3	CCDS30633.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	45	0	0	52	10	19.2	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.785276074	0.785276074	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.28E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	26530063	G	A	CATSPER4	CCDS30645.1	r.?	-	-	downstream	42	0	0	37	9	24.3	48	0	0	54	10	18.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.969056904	0.969056904	1	0	0	1	0.660714286	0.660714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.14E-13	1	1	1	1.91E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	27018830	T	G	ARID1A	CCDS285.1	r.?	-	-	upstream	41	0	0	33	0	0	53	13	24.5	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	1.00204499	1.00204499	1	0.071428571	0.071428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	8.53E-19	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	27933812	C	T	AHDC1	CCDS30652.1	r.?	-	-	upstream	38	0	0	34	0	0	44	2	4.5	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.18404908	0.18404908	1	0.435714286	0.435714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.020580492	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	30564724	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	35	8	22.9	55	1	1.8	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.913226465	0.913226465	1	0.073619632	0.073619632	1	0.075	0.075	1	NA	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	8.15E-12	1	0.240951649	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	34596306	T	G	CSMD2	CCDS380.1	r.?	-	-	intronic	49	0	0	33	6	18.2	47	0	0	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.725795706	0.725795706	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.54E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	36211095	C	T	CLSPN	CCDS396.1	r.3003g>a	c.2923G>A	p.E975K	missense	27	0	0	40	0	0	53	16	30.2	53	9	17	141	0	0	142	0	0	81	12	14.8	94	3	3.2	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	1.235173824	1.235173824	1	0.607142857	0.607142857	1	0	NA	0	0.605316973	0.605316973	1	0.114285714	0.114285714	1	NA	NA	1	1	1	1	1.90E-24	1.26E-14	7.10E-12	0.011950808	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	36792367	G	C	C1orf113	CCDS30674.1	r.?	-	-	downstream	57	0	0	37	9	24.3	53	7	13.2	47	14	29.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.969056904	0.969056904	1	0.539877301	0.539877301	1	1.064285714	1.064285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.14E-13	1	9.85E-09	1	1.79E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	37853336	C	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	46	10	21.7	50	1	2	47	0	0	166	0	0	184	26	14.1	140	0	0	153	0	0	TRUE	TRUE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.865371803	0.865371803	1	0.081799591	0.081799591	1	0	0	1	0.562292277	0.562292277	1	0	0	1	0	0	1	6	4	1	1	3.38E-14	2.07E-29	0.221687443	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	38208572	C	T	EPHA10	CCDS41305.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	30	5	16.7	46	0	0	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.665977378	0.665977378	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000000401	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	40646012	C	T	RLF	CCDS448.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	58	16	27.6	57	12	21.1	39	13	33.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	1.100657224	1.100657224	1	0.862985685	0.862985685	1	1.189285714	1.189285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.00E-23	1	1.40E-16	1	8.79E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	41751346	T	C	-	-	-	-	-	-	30	0	0	32	5	15.6	46	0	0	39	6	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.622110605	0.622110605	1	0	0	1	0.55	0.55	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.000000562	1	1	1	4.43E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	43802665	T	C	MPL	CCDS483.1	r.?	-	-	upstream	46	0	0	37	11	29.7	51	15	29.4	53	15	28.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	1.184402882	1.184402882	1	1.202453988	1.202453988	1	1.010714286	1.010714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.70E-17	1	8.22E-23	1	1.60E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	47538236	G	A	CYP4Z1	CCDS545.1	r.?	-	-	intronic	9	0	0	8	1	12.5	11	6	54.5	11	1	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.498486062	0.498486062	1	2.229038855	2.229038855	1	0.325	0.325	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.039306956	1	7.07E-12	1	0.05364542	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	47616656	C	T	CYP4A22	CCDS30707.1	r.?	-	-	downstream	27	0	0	37	0	0	56	7	12.5	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.511247444	0.511247444	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.46E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	47701803	C	T	TAL1	CCDS547.1	r.?	-	-	upstream	21	0	0	41	0	0	64	10	15.6	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.63803681	0.63803681	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.16E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	49767940	T	C	AGBL4	CCDS44137.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	27	0	0	49	12	24.5	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	1.00204499	1.00204499	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.90E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	50777231	C	G	-	-	-	-	-	-	44	0	0	25	9	36	54	15	27.8	45	12	26.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	1.435639857	1.435639857	1	1.137014315	1.137014315	1	0.953571429	0.953571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.71E-15	1	2.20E-22	1	6.03E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	51593382	G	A	C1orf185	CCDS44142.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	43	13	30.2	43	15	34.9	34	8	23.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	1.204342325	1.204342325	1	1.427402863	1.427402863	1	0.839285714	0.839285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.88E-20	1	4.05E-24	1	6.32E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	52370589	A	G	RAB3B	CCDS560.1	r.?	-	-	downstream	45	0	0	54	0	0	61	13	21.3	52	0	0	52	0	0	153	0	0	106	20	18.9	147	0	0	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.871165644	0.871165644	1	0	0	1	0	NA	0	0.773006135	0.773006135	1	0	0	1	NA	NA	1	1	1	1	6.41E-18	1.23E-25	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	52635359	C	T	ZFYVE9	CCDS563.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	50	0	0	48	11	22.9	67	1	1.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.936605317	0.936605317	1	0.053571429	0.053571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	9.31E-16	1	0.285262761	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	53077053	C	T	GPX7	CCDS569.1	r.?	-	-	downstream	41	0	0	43	0	0	65	15	23.1	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.944785276	0.944785276	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	5.00E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	56568307	C	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	38	10	26.3	63	0	0	44	0	0	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	1.048814674	1.048814674	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.06E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	56717595	C	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	40	9	22.5	53	0	0	41	9	22	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.897274911	0.897274911	1	0	0	1	0.785714286	0.785714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.64E-13	1	1	1	5.92E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	57747175	G	A	DAB1	CCDS607.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	46	9	19.6	47	0	0	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.781626145	0.781626145	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.82E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	59357048	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	40	6	15	58	0	0	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.598183274	0.598183274	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.18E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	62078116	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	40	7	17.5	39	10	25.6	27	9	33.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.697880486	0.697880486	1	1.047034765	1.047034765	1	1.189285714	1.189285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.26E-09	1	5.44E-15	1	8.44E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	62508959	G	A	INADL	CCDS617.2	r.?	-	-	intronic	43	0	0	61	10	16.4	61	17	27.9	47	6	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.654013713	0.654013713	1	1.141104294	1.141104294	1	0.457142857	0.457142857	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.98E-13	1	3.33E-25	1	0.000000141	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	63735575	A	G	-	-	-	-	-	-	32	0	0	40	0	0	35	7	20	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.81799591	0.81799591	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	4.65E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	63918803	A	G	ITGB3BP	CCDS30736.1	r.?	-	-	intronic	53	0	0	51	1	2	45	0	0	50	5	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.07975777	NA	0	0	0	1	0.357142857	0.357142857	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.225579006	1	1	1	0.00000549	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	64880962	G	C	-	-	-	-	-	-	19	0	0	29	0	0	34	4	11.8	28	4	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.482617587	0.482617587	1	0.510714286	0.510714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.0000257	1	0.0000116	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	64880973	T	G	-	-	-	-	-	-	11	0	0	23	0	0	25	4	16	22	3	13.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.654396728	0.654396728	1	0.485714286	0.485714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.00000727	1	0.000179267	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	67295319	C	A	WDR78	CCDS635.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	43	1	2.3	58	13	22.4	55	6	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.091721435	NA	0	0.916155419	0.916155419	1	0.389285714	0.389285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.193893409	1	3.12E-18	1	0.000000367	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	69347324	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	38	14	36.8	37	2	5.4	48	5	10.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	1.467542965	1.467542965	1	0.220858896	0.220858896	1	0.371428571	0.371428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.28E-23	1	0.014826063	1	0.00000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	70518285	G	A	LRRC7	CCDS645.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	34	7	20.6	46	17	37	49	10	20.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.821505029	0.821505029	1	1.513292434	1.513292434	1	0.728571429	0.728571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.73E-10	1	1.16E-27	1	6.72E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	72940763	A	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	43	0	0	71	10	14.1	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.576687117	0.576687117	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	3.42E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	73429162	A	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	49	0	0	50	7	14	64	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.572597137	0.572597137	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	6.46E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	74310304	T	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	50	13	26	51	3	5.9	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	1.036851008	1.036851008	1	0.241308793	0.241308793	1	0.310714286	0.310714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.65E-19	1	0.002175924	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	78202993	T	G	USP33	CCDS679.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	53	4	7.5	52	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.299091637	0.299091637	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000150502	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	80275575	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	47	0	0	62	13	21	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.858895706	0.858895706	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	8.08E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	80468192	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	41	12	29.3	45	17	37.8	65	10	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	1.168451328	1.168451328	1	1.54601227	1.54601227	1	0.55	0.55	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.69E-18	1	7.37E-28	1	1.36E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	81051475	T	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	45	11	24.4	55	0	0	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.973044792	0.973044792	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.24E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	83193316	A	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	40	6	15	58	0	0	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.598183274	0.598183274	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.18E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	84044451	C	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	35	0	0	41	7	17.1	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.699386503	0.699386503	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.51E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	84171399	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	37	4	10.8	47	1	2.1	38	8	21.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.430691957	0.518978295	0.829884334	0.085889571	0.085889571	1	0.753571429	0.753571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.0000362	1	0.209895027	1	1.67E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	88753784	A	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	39	0	0	60	5	8.3	58	10	17.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.339468303	0.339468303	1	0.614285714	0.614285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.0000136	1	4.10E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	89514001	G	T	GBP1	CCDS718.1	r.?	-	-	downstream	38	0	0	52	0	0	48	8	16.7	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.683026585	0.683026585	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.23E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	91209179	T	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	42	0	0	48	4	8.3	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.339468303	0.339468303	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000102016	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	91402643	C	A	ZNF644	CCDS731.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	48	0	0	43	12	27.9	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	1.141104294	1.141104294	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	3.24E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	95988009	G	A	-	-	-	-	-	-	50	0	0	49	1	2	54	13	24.1	54	5	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.07975777	NA	0	0.985685072	0.985685072	1	0.332142857	0.332142857	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.217776325	1	1.12E-18	1	0.00000806	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	96033529	T	C	-	-	-	-	-	-	37	0	0	48	0	0	64	13	20.3	58	6	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.830265849	0.830265849	1	0.367857143	0.367857143	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.26E-17	1	0.000000506	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	96419385	T	C	-	-	-	-	-	-	34	0	0	24	4	16.7	48	13	27.1	41	14	34.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.665977378	0.665977378	1	1.108384458	1.108384458	1	1.217857143	1.217857143	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.00000613	1	2.00E-19	1	1.90E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	96845623	T	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	47	9	19.1	54	18	33.3	52	15	28.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.761686702	0.761686702	1	1.36196319	1.36196319	1	1.028571429	1.028571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	0	0	1	8	NA	1	1	2.24E-12	1	3.12E-28	1	1.15E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	97759979	G	A	DPYD	CCDS30777.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	35	9	25.7	59	4	6.8	58	16	27.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	1.024887343	1.024887343	1	0.278118609	0.278118609	1	0.985714286	0.985714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.23E-13	1	0.00022841	1	1.00E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	98722603	C	G	-	-	-	-	-	-	45	0	0	30	0	0	42	7	16.7	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.683026585	0.683026585	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.81E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	101310838	A	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	35	8	22.9	47	1	2.1	55	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.913226465	0.913226465	1	0.085889571	0.085889571	1	0.064285714	0.064285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	8.15E-12	1	0.209895027	1	0.240951649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	102193652	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	40	12	30	56	3	5.4	39	7	17.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	1.196366548	1.196366548	1	0.220858896	0.220858896	1	0.639285714	0.639285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.20E-18	1	0.00284314	1	1.04E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	102702278	G	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	36	5	13.9	42	13	31	62	22	35.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.5543165	0.5543165	1	1.267893661	1.267893661	1	1.267857143	1.267857143	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.00000104	1	2.72E-20	1	6.75E-35	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	103649373	A	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	42	0	0	55	13	23.6	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.965235174	0.965235174	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.46E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	104960085	T	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	46	7	15.2	46	0	0	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.606159051	0.606159051	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.53E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	105113787	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	29	9	31	53	15	28.3	43	13	30.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	1.236245433	1.236245433	1	1.157464213	1.157464213	1	1.078571429	1.078571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.79E-14	1	1.60E-22	1	3.88E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	105961437	G	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	43	10	23.3	48	0	0	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.929178019	0.929178019	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.61E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	106197039	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	44	0	0	53	0	0	56	8	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0	0	1	0.510714286	0.510714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	4.48E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	107028708	T	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	56	0	0	44	0	0	47	5	10.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0	0	1	0.378571429	0.378571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000402	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	107703065	G	A	NTNG1	CCDS44180.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	30	0	0	46	6	13	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.531697342	0.531697342	1	0.092857143	0.092857143	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000000123	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	108207480	G	A	VAV3	CCDS785.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	45	8	17.8	56	0	0	49	6	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.709844152	0.709844152	1	0	0	1	0.435714286	0.435714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.14E-11	1	1	1	0.000000182	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	108608249	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	41	1	2.4	43	0	0	40	7	17.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.095709324	NA	0	0	0	1	0.625	0.625	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.18577148	1	1	1	1.26E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	109479027	G	C	CLCC1	CCDS41362.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	36	0	0	55	9	16.4	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.670756646	0.670756646	1	0.071428571	0.071428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.01E-11	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	109783037	C	G	SARS	CCDS795.1	r.?	-	-	downstream	43	0	0	39	0	0	71	22	31	52	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	1.267893661	1.267893661	1	0.135714286	0.135714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.34E-33	1	0.028101652	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	110446026	C	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	27	3	11.1	42	12	28.6	61	12	19.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.442655623	0.442655623	1	1.169734151	1.169734151	1	0.703571429	0.703571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.000334187	1	2.35E-18	1	3.39E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	110489458	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	30	0	0	52	7	13.5	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.552147239	0.552147239	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	8.58E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	112629122	T	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	48	0	0	64	1	1.6	54	5	9.3	589	1	0.2	186	1	0.5	106	4	3.8	126	11	8.7	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.065439673	0.065439673	1	0.332142857	0.332142857	1	0.019939442	NA	0	0.155419223	0.155419223	1	0.310714286	0.310714286	1	NA	NA	1	0.947785087	1	0.606365624	0.274433592	0.002070303	0.00000806	5.85E-11	YES	0_0	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	113678861	A	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	52	10	19.2	72	19	26.4	48	11	22.9	149	0	0	147	23	15.6	123	21	17.1	171	38	22.2	TRUE	TRUE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.765674591	0.765674591	1	1.079754601	1.079754601	1	0.817857143	0.817857143	1	0.622110605	0.749635315	0.829884334	0.699386503	0.699386503	1	0.792857143	0.792857143	1	8	5	1	1	1.28E-13	2.92E-27	1.75E-27	7.24E-26	9.31E-16	3.03E-50	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	115445797	C	A	SYCP1	CCDS879.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	32	0	0	56	10	17.9	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.732106339	0.732106339	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.82E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	118155774	G	A	FAM46C	CCDS896.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	31	0	0	41	6	14.6	49	0	0	176	0	0	195	0	0	117	15	12.8	133	0	0	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.597137014	0.597137014	1	0	0	1	0	NA	0	0.523517382	0.523517382	1	0	0	1	NA	NA	1	1	1	1	6.05E-08	5.97E-17	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	118436657	C	T	GDAP2	CCDS897.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	50	14	28	49	0	0	45	0	0	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	1.116608778	1.116608778	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.84E-21	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	118760300	T	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	39	0	0	44	9	20.5	35	0	0	474	2	0.4	202	0	0	143	38	26.6	172	3	1.7	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0.838445808	0.838445808	1	0	0	1	0	NA	0	1.08793456	1.08793456	1	0.060714286	0.060714286	1	NA	NA	1	0.685730481	1	1	1.18E-12	1.48E-53	1	0.055985365	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	119297509	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	54	0	0	43	0	0	44	5	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0	NA	0	0	0	1	0.407142857	0.407142857	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000288	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	119858495	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	29	3	10.3	40	0	0	32	7	21.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.829884334	2	2	1	1	1	0	1	1	0.170115666	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.829884334	NA	NA	0.410752515	0.410752515	1	0	0	1	0.782142857	0.782142857	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.000414371	1	1	1	2.36E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	142840740	C	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	19	0	0	28	0	0	18	3	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0	0	1	0.596428571	0.596428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000964	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	143159915	G	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	82	1	1.2	65	6	9.2	76	2	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0.072600985	NA	0	0.455939086	0.52656147	0.865880075	0.092857143	0.092857143	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.337031917	1	0.000001	1	0.055865747	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	146164121	C	T	ENSG00000232637	ENST00000436832	r.?	-	-	intronic	30	0	0	57	20	35.1	49	5	10.2	29	7	24.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	2.123578801	1.00742755	2.107922104	0.505497682	0.505497682	1	0.860714286	0.860714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	9.67E-32	1	0.00000496	1	1.11E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	146467389	T	A	NBPF12	ENST00000442909	r.12100u>a	c.?	p.?	3'UTR variant	17	0	0	33	1	3	41	3	7.3	26	3	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0.181502462	NA	0	0.361777753	0.41781508	0.865880075	0.410714286	0.410714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.15245715	1	0.001155993	1	0.000298167	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	146493237	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	44	20	45.5	50	1	2	30	1	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	2.752787334	0.917595778	3	0.099117193	0.099117193	1	0.117857143	0.117857143	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.50E-34	1	0.221687443	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	146548833	C	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	55	8	14.5	65	2	3.1	51	11	21.6	29	0	0	56	6	10.7	114	0	0	70	9	12.9	TRUE	TRUE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0.877261898	0.877261898	1	0.153631648	0.153631648	1	0.771428571	0.771428571	1	0.64735878	0.64735878	1	0	0	1	0.460714286	0.460714286	1	7	6	1	1	3.86E-10	0.000000409	0.042252341	1	1.94E-15	9.65E-11	YES	1_1	1_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	150330927	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	54	29	53.7	59	23	39	33	9	27.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	3.248894063	1.082964688	3	1.932785254	1.03585717	1.865880075	0.975	0.975	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.78E-52	1	1.45E-37	1	6.76E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	151038025	C	G	MLLT11	CCDS982.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	60	0	0	64	5	7.8	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.386557051	0.446432551	0.865880075	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.0000186	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	151376912	A	C	POGZ	CCDS997.1	r.4914u>g	c.?	p.?	3'UTR variant	22	0	0	63	0	0	66	29	43.9	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	2.175622376	1.166003327	1.865880075	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	6.96E-49	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	152043342	A	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	57	29	50.9	72	2	2.8	49	10	20.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	3.079491765	1.026497255	3	0.13876407	0.13876407	1	0.728571429	0.728571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.45E-51	1	0.050755634	1	6.72E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	152365050	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	56	0	0	80	21	26.2	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	1.298435222	1.298435222	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	3.63E-30	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	153146128	C	A	-	-	-	-	-	-	49	0	0	59	0	0	63	13	20.6	60	1	1.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	1.020907083	1.020907083	1	0.060714286	0.060714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.01E-17	1	0.259739042	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	154471435	A	G	SHE	CCDS30877.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	61	6	9.8	66	0	0	69	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0.592908041	0.592908041	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000000685	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	155325794	T	A	ASH1L	CCDS1113.2	r.?	-	-	intronic	37	0	0	68	6	8.8	67	12	17.9	63	15	23.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0.532407221	0.532407221	1	0.887098873	0.887098873	1	0.85	0.85	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.00000131	1	1.14E-15	1	2.97E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	157709852	C	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	51	22	43.1	45	1	2.2	26	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	2.607585365	0.869195122	3	0.109028912	0.109028912	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.24E-37	1	0.201934322	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	158308580	T	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	70	0	0	60	7	11.7	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.579835576	0.579835576	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.39E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	158311312	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	60	5	8.3	69	0	0	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0.50215681	0.50215681	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.0000136	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	158339637	T	C	-	-	-	-	-	-	54	0	0	68	8	11.8	70	0	0	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0.713909682	0.713909682	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.21E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	158390850	A	G	OR10K2	CCDS30896.1	r.?	-	-	upstream	46	0	0	52	26	50	54	0	0	54	0	0	496	0	0	220	114	51.8	103	0	0	142	0	0	TRUE	TRUE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	3.025041027	1.008347009	3	0	0	1	0	0	1	3.133942504	1.044647501	3	0	0	1	0	0	1	6	4	1	1	6.52E-46	2.23E-198	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	158973762	T	C	IFI16	ENST00000359709	r.?	-	-	intronic	34	0	0	57	0	0	54	11	20.4	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	1.010995364	1.010995364	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	3.84E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	159051006	T	G	AIM2	CCDS1181.1	r.?	-	-	upstream	49	0	0	57	0	0	56	10	17.9	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.887098873	0.887098873	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.82E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	159286205	G	A	OR10J3	CCDS30909.1	r.?	-	-	upstream	36	0	0	52	0	0	61	11	18	52	1	1.9	531	0	0	205	0	0	91	23	25.3	93	0	0	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.892054733	0.892054733	1	0.067857143	0.067857143	1	0	NA	0	1.253832485	1.253832485	1	0	0	1	NA	NA	1	1	1	1	1.62E-14	1.81E-32	0.229451111	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	159364315	T	A	OR10J1	ENST00000328408	r.?	-	-	intronic	45	0	0	48	0	0	86	23	26.7	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	1.32321452	1.32321452	1	0.275	0.275	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	4.16E-33	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	163479492	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	64	29	45.3	70	0	0	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	2.74068717	0.91356239	3	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.18E-49	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	163736369	T	C	-	-	-	-	-	-	45	0	0	65	0	0	45	7	15.6	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.773114102	0.773114102	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000000003	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	164652305	C	T	PBX1	CCDS1246.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	58	0	0	61	15	24.6	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	1.219141468	1.219141468	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.73E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	166227282	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	58	24	41.4	41	12	29.3	47	13	27.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	2.50473397	0.834911323	3	1.45206687	1.45206687	1	0.989285714	0.989285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.49E-40	1	1.69E-18	1	1.47E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	167780763	G	T	ADCY10	CCDS1265.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	57	5	8.8	79	1	1.3	60	6	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0.532407221	0.532407221	1	0.064426175	0.064426175	1	0.357142857	0.357142857	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.0000105	1	0.326987115	1	0.000000621	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	170257001	A	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	74	0	0	55	12	21.8	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	1.080377398	1.080377398	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	8.78E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	170469760	T	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	67	0	0	49	6	12.2	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.604614874	0.604614874	1	0.178571429	0.178571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000000182	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	170778082	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	59	0	0	68	7	10.3	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.510453541	0.589519907	0.865880075	0.078571429	0.078571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000000058	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	172621293	G	T	-	-	-	-	-	-	51	0	0	60	0	0	67	13	19.4	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.961436767	0.961436767	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.41E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	176203856	C	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	61	1	1.6	78	21	26.9	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0.096801313	NA	0	1.333126239	1.333126239	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.263440347	1	1.99E-30	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	176448618	A	C	PAPPA2	CCDS41438.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	57	0	0	71	13	18.3	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.906922311	0.906922311	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	5.42E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	176966893	C	T	ASTN1	CCDS1319.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	67	6	9	64	4	6.2	51	10	19.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0.544507385	0.544507385	1	0.307263297	0.307263297	1	0.7	0.7	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.0000012	1	0.000312605	1	1.04E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	177524383	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	66	35	53	51	0	0	42	11	26.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	3.206543488	1.068847829	3	0	0	1	0.935714286	0.935714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.60E-62	1	1	1	1.81E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	177801869	C	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	63	0	0	53	11	20.8	46	0	0	359	0	0	307	0	0	127	5	3.9	145	0	0	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	1.030818802	1.030818802	1	0	0	1	0	NA	0	0.193278525	0.193278525	1	0	0	1	NA	NA	1	1	1	1	3.07E-15	0.000479193	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	178381100	C	A	RASAL2	CCDS1322.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	71	33	46.5	84	1	1.2	49	7	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	2.813288155	0.937762718	3	0.059470316	0.059470316	1	0.510714286	0.510714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.81E-56	1	0.343645023	1	5.58E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	179346656	G	A	C1orf125	CCDS30948.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	73	10	13.7	56	0	0	48	0	0	182	2	1.1	269	23	8.6	122	0	0	124	0	0	TRUE	TRUE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0.828861241	0.828861241	1	0	0	1	0	0	1	0.520307057	0.520307057	1	0	0	1	0	0	1	6	4	1	0.231095159	4.56E-12	4.12E-21	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	179543871	T	G	NPHS2	CCDS1331.1	r.?	-	-	intronic	50	0	0	60	0	0	80	8	10	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.495585963	0.572349424	0.865880075	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	8.22E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	179828827	G	T	TOR1AIP2	CCDS1334.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	59	0	0	63	26	41.3	48	0	0	292	0	0	285	0	0	125	47	37.6	136	3	2.2	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	2.046770025	1.096946182	1.865880075	0	0	1	0	NA	0	1.863403219	0.998672553	1.865880075	0.078571429	0.078571429	1	NA	NA	1	1	1	1	4.45E-43	3.11E-74	1	0.031365832	YES	0_0	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	180720962	A	C	XPR1	CCDS1340.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	69	0	0	81	15	18.5	63	2	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.916834031	0.916834031	1	0.114285714	0.114285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.82E-19	1	0.03993132	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	180817475	G	A	XPR1	CCDS1340.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	67	8	11.9	58	13	22.4	61	18	29.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0.719959764	0.719959764	1	1.110112556	1.110112556	1	1.053571429	1.053571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.96E-09	1	3.12E-18	1	4.08E-27	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	181136321	T	C	-	-	-	-	-	-	59	0	0	48	0	0	60	22	36.7	41	6	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	1.818800483	0.974768157	1.865880075	0.521428571	0.521428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.81E-35	1	6.05E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	181755825	A	G	CACNA1E	ENST00000367573	r.?	-	-	intronic	40	0	0	67	41	61.2	68	2	2.9	58	8	13.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	3.702650217	1.234216739	3	0.143719929	0.143719929	1	0.492857143	0.492857143	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.08E-76	1	0.045825786	1	5.99E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	182628758	C	T	RGS8	CCDS41443.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	59	0	0	52	8	15.4	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.763202382	0.763202382	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.42E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	183965572	A	G	GLT25D2	CCDS1360.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	73	0	0	68	7	10.3	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.510453541	0.589519907	0.865880075	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000000058	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	184256559	C	G	-	-	-	-	-	-	44	0	0	61	0	0	83	10	12	60	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.594703155	0.686819309	0.865880075	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.70E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	185003464	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	45	5	11.1	49	0	0	37	1	2.7	96	0	0	172	20	11.6	130	0	0	108	0	0	TRUE	TRUE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0.671559108	0.671559108	1	0	0	1	0.096428571	0.096428571	1	0.701809518	0.701809518	1	0	0	1	0	0	1	6	4	1	1	0.00000323	3.09E-21	1	1	0.169281299	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	185066959	G	T	RNF2	CCDS1365.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	58	32	55.2	67	0	0	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	3.339645294	1.113215098	3	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.55E-58	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	186377833	A	C	C1orf27	ENST00000287859	r.?	-	-	intronic	35	0	0	41	0	0	45	8	17.8	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.882143013	0.882143013	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	7.14E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	186782142	A	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	65	0	0	60	11	18.3	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.906922311	0.906922311	1	0.078571429	0.078571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.34E-14	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	187130150	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	58	18	31	74	3	4.1	63	11	17.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	1.875525437	0.937762718	2	0.203190245	0.203190245	1	0.625	0.625	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.42E-27	1	0.006220661	1	2.37E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	187294189	T	C	-	-	-	-	-	-	45	0	0	55	5	9.1	70	2	2.9	53	10	18.9	161	0	0	156	18	11.5	55	0	0	47	8	17	TRUE	TRUE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0.550557467	0.550557467	1	0.143719929	0.143719929	1	0.675	0.675	1	0.695759436	0.695759436	1	0	0	1	0.607142857	0.607142857	1	7	6	1	1	0.00000883	3.34E-19	0.048267597	1	1.57E-13	1.03E-10	YES	1_1	1_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	187294269	T	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	59	5	8.5	54	1	1.9	54	8	14.8	169	0	0	161	14	8.7	56	0	0	49	7	14.3	FALSE	TRUE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0.514256975	0.514256975	1	0.094161333	NA	0	0.528571429	0.528571429	1	0.526357139	0.526357139	1	0	0	1	0.510714286	0.510714286	1	NA	6	1	1	0.0000125	1.55E-13	0.237137336	1	3.31E-10	5.58E-09	YES	1_1	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	187394769	T	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	59	7	11.9	57	2	3.5	43	11	25.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0.719959764	0.719959764	1	0.173455087	0.173455087	1	0.914285714	0.914285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.12E-08	1	0.03327602	1	2.42E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	187410180	G	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	69	15	21.7	57	1	1.8	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	1.312867806	1.312867806	1	0.089205473	NA	0	0.310714286	0.310714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.34E-20	1	0.248523156	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	187915898	A	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	59	0	0	61	0	0	53	5	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0	0	1	0.335714286	0.335714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000734	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	188512048	T	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	62	29	46.8	75	0	0	57	4	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	2.831438401	0.9438128	3	0	0	1	0.25	0.25	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	6.51E-50	1	1	1	0.000199821	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	189160040	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	49	0	0	60	9	15	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.743378944	0.743378944	1	0.071428571	0.071428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.29E-11	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	189999369	G	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	62	34	54.8	58	0	0	47	0	0	0	0	NA	2	2	100	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	3.315444965	1.105148322	3	0	0	1	0	0	1	6.050082054	2.016694018	3	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.78E-61	0.000025	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	190143794	A	T	FAM5C	CCDS1373.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	49	22	44.9	67	3	4.5	49	11	22.4	144	0	0	165	92	55.8	88	3	3.4	71	14	19.7	TRUE	TRUE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	2.716486842	0.905495614	3	0.223013683	0.223013683	1	0.8	0.8	1	3.375945786	1.125315262	3	0.168499227	0.168499227	1	0.703571429	0.703571429	1	7	6	1	1	1.04E-37	1.37E-164	0.004717431	0.010001517	1.19E-15	1.13E-18	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	190409719	C	T	FAM5C	CCDS1373.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	51	13	25.5	69	16	23.2	41	11	26.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	1.542770924	1.542770924	1	1.149759433	1.149759433	1	0.957142857	0.957142857	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.87E-19	1	2.27E-22	1	1.34E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	191470552	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	58	11	19	64	14	21.9	42	8	19	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	1.14951559	1.14951559	1	1.085333258	1.085333258	1	0.678571429	0.678571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	8.96E-15	1	2.31E-19	1	3.96E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	193665926	G	A	-	-	-	-	-	-	46	0	0	46	0	0	57	6	10.5	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.520365261	0.600966895	0.865880075	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000000456	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	195793721	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	75	0	0	58	7	12.1	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.599659015	0.599659015	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.88E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	197343107	C	T	CRB1	CCDS1390.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	51	6	11.8	61	0	0	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0.713909682	0.713909682	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000000232	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	199783173	C	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	61	0	0	60	13	21.7	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	1.075421539	1.075421539	1	0.078571429	0.078571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	5.07E-18	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	200014411	G	A	NR5A2	CCDS1401.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	53	0	0	51	9	17.6	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.872231294	0.872231294	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	4.92E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	200496561	C	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	61	6	9.8	57	0	0	50	10	20	128	0	0	275	32	11.6	152	3	2	131	34	26	TRUE	TRUE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0.592908041	0.592908041	1	0	0	1	0.714285714	0.714285714	1	0.701809518	0.78671327	0.892077896	0.099117193	0.099117193	1	0.928571429	0.928571429	1	7	6	1	1	0.000000685	4.76E-33	1	0.041424792	8.36E-14	1.08E-47	YES	1_1	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	200587279	C	T	KIF14	CCDS30963.1	r.1012g>a	c.573G>A	p.M191I	missense	46	0	0	58	0	0	57	11	19.3	56	0	0	163	0	0	211	0	0	78	17	21.8	107	0	0	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.956480908	0.956480908	1	0	0	1	0	NA	0	1.080377398	1.080377398	1	0	0	1	NA	NA	1	1	1	1	7.29E-15	3.59E-23	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	200936901	C	T	KIF21B	CCDS30965.1	r.?	-	-	downstream	38	0	0	64	0	0	68	12	17.6	56	2	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.872231294	0.872231294	1	0.128571429	0.128571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.37E-15	1	0.032213353	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	204282919	C	T	PLEKHA6	CCDS1444.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	57	0	0	59	16	27.1	49	0	0	170	0	0	256	0	0	179	28	15.6	162	0	0	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	1.343037958	1.343037958	1	0	0	1	0	NA	0	0.773114102	0.773114102	1	0	0	1	NA	NA	1	1	1	1	1.37E-23	7.61E-33	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	204745637	G	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	62	0	0	72	11	15.3	57	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.758246523	0.758246523	1	0.064285714	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.12E-13	1	0.248523156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	205256810	G	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	66	0	0	53	20	37.7	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	1.868359079	1.001328597	1.865880075	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.65E-32	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	205797812	A	T	PM20D1	CCDS1460.1	r.1490u>a	c.1445T>A	p.I482N	missense	36	0	0	61	18	29.5	66	0	0	63	0	0	346	0	0	247	118	47.8	195	0	0	180	0	0	TRUE	TRUE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	1.784774206	0.892387103	2	0	0	1	0	0	1	2.891939222	0.963979741	3	0	0	1	0	0	1	6	4	1	1	4.08E-27	1.42E-199	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	206191895	G	T	-	-	-	-	-	-	52	0	0	69	0	0	67	13	19.4	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.961436767	0.961436767	1	0.085714286	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.41E-17	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	208391168	C	T	PLXNA2	CCDS31013.1	r.858g>a	c.100G>A	p.G34S	missense	37	0	0	70	8	11.4	64	1	1.6	40	8	20	154	0	0	233	27	11.6	291	13	4.5	165	21	12.7	FALSE	TRUE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0.689709354	0.689709354	1	0.079293754	NA	0	0.714285714	0.714285714	1	0.701809518	0.78671327	0.892077896	0.223013683	0.223013683	1	0.453571429	0.453571429	1	NA	6	1	1	2.80E-09	4.38E-28	0.274433592	4.42E-09	2.61E-11	4.58E-23	YES	1_1	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	210493579	T	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	69	0	0	59	0	0	52	6	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0	0	1	0.410714286	0.410714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000261	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	212101792	T	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	75	44	58.7	73	0	0	40	10	25	115	0	0	220	100	45.5	143	5	3.5	128	18	14.1	TRUE	TRUE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	3.551398166	1.183799389	3	0	0	1	0.892857143	0.892857143	1	2.752787334	0.917595778	3	0.173455087	0.173455087	1	0.503571429	0.503571429	1	7	6	1	1	5.54E-81	1.59E-166	1	0.000819497	7.22E-15	8.58E-21	YES	1_1	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	212924543	T	C	NSL1	CCDS1509.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	69	0	0	64	8	12.5	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.619482453	0.619482453	1	0.310714286	0.310714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.35E-09	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	213232169	C	T	RPS6KC1	CCDS1513.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	63	0	0	64	13	20.3	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	1.006039504	1.006039504	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.26E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	214100376	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	66	0	0	62	28	45.2	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	2.240048551	1.200531899	1.865880075	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.10E-47	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	214609613	G	A	PTPN14	CCDS1514.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	61	36	59	62	0	0	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	3.569548412	1.189849471	3	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.13E-66	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	215920270	G	A	USH2A	CCDS31025.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	70	10	14.3	78	0	0	44	0	0	184	0	0	210	25	11.9	93	0	0	88	0	0	TRUE	TRUE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0.865161734	0.865161734	1	0	0	1	0	0	1	0.719959764	0.807059303	0.892077896	0	0	1	0	0	1	6	4	1	1	2.95E-12	2.02E-26	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	216235607	G	T	USH2A	CCDS31025.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	66	0	0	61	7	11.5	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.569923857	0.569923857	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.69E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	216820051	A	G	ESRRG	CCDS1517.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	62	0	0	59	0	0	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0	0	1	0.414285714	0.414285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	217219849	C	T	ESRRG	CCDS1517.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	62	0	0	80	17	21.2	53	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	1.050642241	1.050642241	1	0.135714286	0.135714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	5.75E-23	1	0.029108399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	217602508	A	G	GPATCH2	CCDS1518.1	r.3677u>c	c.?	p.?	3'UTR variant	48	0	0	69	0	0	66	14	21.2	56	0	0	259	0	0	186	0	0	71	15	21.1	80	0	0	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	1.050642241	1.050642241	1	0	0	1	0	NA	0	1.045686381	1.045686381	1	0	0	1	NA	NA	1	1	1	1	3.71E-19	2.15E-20	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	219310702	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	61	0	0	66	12	18.2	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0	NA	0	0.901966452	0.901966452	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	9.36E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	219377880	G	A	LYPLAL1	CCDS1522.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	50	5	10	72	20	27.8	57	16	28.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2.865880075	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	0.134119925	1	3	2	NA	1	1	NA	0.892077896	0.865880075	NA	0.605008205	0.605008205	1	1.377728976	1.377728976	1	1.003571429	1.003571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.00000549	1	2.32E-29	1	7.28E-24	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	220758504	A	G	MARK1	CCDS31029.2	r.?	-	-	intronic	46	0	0	57	0	0	56	0	0	58	7	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	1	1	3	NA	NA	1	NA	NA	0.892077896	NA	NA	0	NA	0	0	0	1	0.432142857	0.432142857	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	1.88E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	222005034	C	A	-	-	-	-	-	-	48	0	0	62	0	0	59	9	15.3	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	1	1	3	NA	NA	1	NA	NA	0.892077896	NA	NA	0	NA	0	0.625766871	0.625766871	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.96E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	222891271	A	G	C1orf58	CCDS1534.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	79	12	15.2	52	3	5.8	54	12	22.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	1	1	3	NA	NA	1	NA	NA	0.892077896	NA	NA	0.919612472	0.919612472	1	0.237218814	0.237218814	1	0.792857143	0.792857143	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.17E-15	1	0.002300591	1	6.90E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	224697478	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	68	0	0	52	0	0	42	5	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	1	1	3	NA	NA	1	NA	NA	0.892077896	NA	NA	0	NA	0	0	0	1	0.425	0.425	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	225525922	C	T	DNAH14	CCDS44321.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	65	13	20	49	0	0	52	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2	2	3	1	1	0	1	1	0.107922104	1	1	3	NA	NA	1	NA	NA	0.892077896	NA	NA	1.210016411	1.210016411	1	0	0	1	0.067857143	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.57E-17	1	1	1	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	227096632	G	A	CABC1	CCDS1557.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	71	0	0	58	11	19	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2	2.272259675	3	1	1	0	1	1	0.107922104	1	0.727740325	3	NA	2	1	NA	1	0.892077896	NA	0.272259675	0	NA	0	0.777096115	0.777096115	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	8.96E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	227912879	T	A	SNAP47	ENST00000366760	r.?	-	-	upstream	71	0	0	78	10	12.8	46	0	0	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2	2.272259675	3	1	1	0	1	1	0.107922104	1	0.727740325	3	NA	2	1	NA	1	0.892077896	NA	0.272259675	0.774410503	0.774410503	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	9.02E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	227912880	G	A	SNAP47	ENST00000366760	r.?	-	-	upstream	67	0	0	77	10	13	46	0	0	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2	2.272259675	3	1	1	0	1	1	0.107922104	1	0.727740325	3	NA	2	1	NA	1	0.892077896	NA	0.272259675	0.786510667	0.786510667	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	7.90E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	227912881	T	C	SNAP47	ENST00000366760	r.?	-	-	upstream	68	0	0	75	10	13.3	46	0	0	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2	2.272259675	3	1	1	0	1	1	0.107922104	1	0.727740325	3	NA	2	1	NA	1	0.892077896	NA	0.272259675	0.804660913	0.804660913	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	6.02E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	227912882	T	A	SNAP47	ENST00000366760	r.?	-	-	upstream	69	0	0	74	10	13.5	45	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2	2.272259675	3	1	1	0	1	1	0.107922104	1	0.727740325	3	NA	2	1	NA	1	0.892077896	NA	0.272259675	0.816761077	0.816761077	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.24E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	227948617	G	A	SNAP47	CCDS1562.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	67	9	13.4	49	0	0	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2	2.272259675	3	1	1	0	1	1	0.107922104	1	0.727740325	3	NA	2	1	NA	1	0.892077896	NA	0.272259675	0.810710995	0.810710995	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	6.43E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	229125657	G	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	69	0	0	57	0	0	50	8	16	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2	2.272259675	3	1	1	0	1	1	0.107922104	1	0.727740325	3	NA	2	1	NA	1	0.892077896	NA	0.272259675	0	NA	0	0	0	1	0.614990119	0.614990119	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	1.74E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	231743411	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	50	17	34	39	5	12.8	43	7	16.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.892077896	2	2.272259675	3	1	1	0	1	1	0.107922104	1	0.727740325	3	NA	2	1	NA	1	0.892077896	NA	0.272259675	2.057027898	0.975855746	2.107922104	0.523517382	0.523517382	1	0.626521184	0.626521184	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.43E-27	1	0.00000156	1	2.15E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	232513801	G	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	44	0	0	45	9	20	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.892077896	2	2.272259675	3	1	1	0	1	1	0.107922104	1	0.727740325	3	NA	2	1	NA	1	0.892077896	NA	0.272259675	0	NA	0	0.81799591	0.81799591	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.47E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	235917247	C	T	LYST	CCDS31062.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	88	0	0	37	6	16.2	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	2	2.272259675	4	1	1	1	1	1	1	1	0.727740325	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.272259675	0	0	1	0.662576687	0.662576687	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.18E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	237411599	C	A	RYR2	ENST00000366574	r.?	-	-	intronic	16	0	0	12	6	50	16	1	6.2	10	3	30	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	2	2.272259675	4	1	1	1	1	1	1	1	0.727740325	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.272259675	3.579002079	0.89475052	4	0.253578732	0.253578732	1	1.153106474	1.153106474	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.41E-11	1	0.077068876	1	0.0000146	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	238379455	G	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	66	0	0	52	10	19.2	48	3	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	2	2.272259675	4	1	1	1	1	1	1	1	0.727740325	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.272259675	0	0	1	0.785276074	0.785276074	1	0.238308671	0.875299185	0.272259675	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	1.28E-13	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	239006206	C	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	54	0	0	49	8	16.3	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	2	2.272259675	4	1	1	1	1	1	1	1	0.727740325	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.272259675	0	0	1	0.666666667	0.666666667	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.47E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	239416314	T	C	-	-	-	-	-	-	50	0	0	76	0	0	53	9	17	60	6	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	2	2.272259675	4	1	1	1	1	1	1	1	0.727740325	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.272259675	0	0	1	0.695296524	0.695296524	1	0.384368825	1.411772879	0.272259675	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	7.10E-12	1	0.000000621	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	239573067	C	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	70	0	0	49	10	20.4	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	2	2.272259675	4	1	1	1	1	1	1	1	0.727740325	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.272259675	0	0	1	0.834355828	0.834355828	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	6.72E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	240464564	G	T	FMN2	CCDS31069.2	r.?	-	-	intronic	36	0	0	71	13	18.3	41	0	0	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	2	2.272259675	4	1	1	1	1	1	1	1	0.727740325	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.272259675	1.309914761	1.309914761	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	6	NA	1	1	5.42E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	240565626	T	C	FMN2	CCDS31069.2	r.?	-	-	intronic	47	0	0	68	9	13.2	45	1	2.2	43	8	18.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	FALSE	FALSE	5	2	2.272259675	4	1	1	1	1	1	1	1	0.727740325	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.272259675	0.944856549	0.944856549	1	0.08997955	NA	0	0.714926014	0.714926014	1	NA	NA	1	NA	NA	0	0	NA	0	NA	NA	1	1	7.38E-11	1	0.201934322	1	4.85E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	240796748	G	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	89	1	1.1	69	18	26.1	63	0	0	266	0	0	250	0	0	114	28	24.6	130	1	0.8	TRUE	TRUE	5	2	2.272259675	4	1	1	1	1	1	1	1	0.727740325	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.272259675	0.078738046	0.078738046	1	1.067484663	1.067484663	1	0	0	1	0	0	1	1.006134969	1.006134969	1	0.030749506	0.030749506	1	2	1	1	1	0.359890627	1	5.16E-26	8.46E-39	1	0.478804693	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	1	241303848	C	A	RGS7	CCDS31071.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	58	34	58.6	50	0	0	50	15	30	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	2	2.272259675	4	1	1	1	1	1	1	1	0.727740325	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.272259675	4.194590437	1.048647609	4	0	0	1	1.153106474	1.153106474	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	6.65E-63	1	1	1	5.83E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	241358942	T	C	RGS7	CCDS31071.1	r.?	-	-	intronic	49	0	0	51	26	51	45	0	0	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	2	2.272259675	4	1	1	1	1	1	1	1	0.727740325	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.272259675	3.650582121	0.91264553	4	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	6	NA	1	1	3.27E-46	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	241753470	A	G	KMO	CCDS1618.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	72	8	11.1	48	0	0	65	11	16.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	2	2.272259675	4	1	1	1	1	1	1	1	0.727740325	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.272259675	0.794538462	0.794538462	1	0	0	1	0.649583314	0.649583314	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	7	NA	1	1	3.52E-09	1	1	1	3.41E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	242282579	T	A	PLD5	CCDS1621.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	75	0	0	65	15	23.1	60	1	1.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	5	2	2.272259675	4	1	1	1	1	1	1	1	0.727740325	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.272259675	0	0	1	0.944785276	0.944785276	1	0.0653427	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	5.00E-21	1	0.259739042	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	242891621	A	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	75	37	49.3	35	0	0	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	2	2.272259675	4	1	1	1	1	1	1	1	0.727740325	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.272259675	3.52889605	0.882224012	4	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	6	NA	1	1	2.08E-64	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	242895227	G	A	-	-	-	-	-	-	53	0	0	72	38	52.8	46	6	13	59	26	44.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	2	2.272259675	4	1	1	1	1	1	1	1	0.727740325	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.272259675	3.779426195	0.944856549	4	0.531697342	0.531697342	1	1.695066516	1.332327472	1.272259675	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	8	NA	1	1	1.22E-67	1	0.000000123	1	5.03E-44	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	245013073	A	T	HNRNPU	CCDS31081.1	r.?	-	-	downstream	37	0	0	73	11	15.1	48	15	31.2	50	13	26	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	2	2.272259675	4	1	1	1	1	1	1	1	0.727740325	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.272259675	1.080858628	1.080858628	1	1.27607362	1.27607362	1	0.999358944	0.999358944	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	8	NA	1	1	1.31E-13	1	2.86E-23	1	3.65E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	246858644	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	67	5	7.5	53	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	2	2.272259675	4	1	1	1	1	1	1	1	0.727740325	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.272259675	0.536850312	0.536850312	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	6	NA	1	1	0.0000233	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	248081706	A	T	OR2T8	CCDS31100.1	r.?	-	-	upstream	45	0	0	72	0	0	53	17	32.1	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	2	2.272259675	4	1	1	1	1	1	1	1	0.727740325	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.272259675	0	0	1	1.312883436	1.312883436	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	2.08E-26	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	1	248821647	A	G	-	-	-	-	-	-	18	0	0	25	5	20	21	7	33.3	28	10	35.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	2	2.272259675	4	1	1	1	1	1	1	1	0.727740325	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.272259675	1.431600832	1.431600832	1	1.36196319	1.36196319	1	1.372196704	1.372196704	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	8	NA	1	1	0.000000153	1	8.54E-12	1	1.18E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	399242	A	T	-	-	-	-	-	-	11	0	0	22	2	9.1	34	2	5.9	21	3	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.378378378	0.378378378	1	0.241308793	0.241308793	1	0.510714286	0.510714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.005403392	1	0.012612579	1	0.000155401	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	632182	T	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	50	4	8	56	1	1.8	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.332640333	0.332640333	1	0.073619632	0.073619632	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000119787	1	0.244746891	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	1160039	C	T	SNTG2	CCDS46220.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	39	5	12.8	55	2	3.6	39	8	20.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.532224532	0.532224532	1	0.147239264	0.147239264	1	0.732142857	0.732142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.00000156	1	0.031164417	1	2.09E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	2360925	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	43	0	0	50	10	20	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.81799591	0.81799591	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.36E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	2537425	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	57	14	24.6	62	1	1.6	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.022869023	1.022869023	1	0.065439673	0.065439673	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.84E-20	1	0.267123145	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	3983661	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	33	4	12.1	36	0	0	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.503118503	0.503118503	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.0000228	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	4094769	C	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	38	0	0	41	8	19.5	45	4	8.9	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.797546012	0.797546012	1	0.317857143	0.317857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	3.22E-11	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	4870948	G	T	-	-	-	-	-	-	49	0	0	46	7	15.2	60	0	0	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.632016632	0.632016632	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.53E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	5898164	A	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	53	12	22.6	59	1	1.7	51	7	13.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.93970894	0.93970894	1	0.069529652	0.069529652	1	0.489285714	0.489285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.39E-17	1	0.256019138	1	7.46E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	6016582	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	46	0	0	39	9	23.1	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.944785276	0.944785276	1	0.075	0.075	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.62E-13	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	6027671	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	40	0	0	50	11	22	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.899795501	0.899795501	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.52E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	6781019	G	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	49	0	0	44	0	0	36	4	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.396428571	0.396428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000324	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	7969169	C	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	43	0	0	53	10	18.9	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.773006135	0.773006135	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.57E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	10173106	C	T	-	-	-	-	-	-	48	0	0	37	0	0	54	12	22.2	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.90797546	0.90797546	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.90E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	12429747	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	46	0	0	63	1	1.6	39	6	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.065439673	0.065439673	1	0.55	0.55	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.27078753	1	4.43E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	13533375	T	C	-	-	-	-	-	-	37	0	0	46	0	0	52	12	23.1	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.944785276	0.944785276	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.19E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	13944372	G	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	29	8	27.6	52	18	34.6	36	7	19.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.147609148	1.147609148	1	1.415132924	1.415132924	1	0.692857143	0.692857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.53E-12	1	1.39E-28	1	5.74E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	14673455	G	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	42	13	31	59	0	0	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.288981289	1.288981289	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.72E-20	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	14960278	A	G	-	-	-	-	-	-	47	0	0	67	10	14.9	54	0	0	43	6	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.61954262	0.61954262	1	0	0	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.87E-12	1	1	1	8.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	16197219	G	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	33	0	0	49	9	18.4	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.752556237	0.752556237	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.35E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	16479916	G	T	-	-	-	-	-	-	55	0	0	42	1	2.4	44	11	25	52	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.0997921	0.0997921	1	1.022494888	1.022494888	1	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	0.189842622	1	3.22E-16	1	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	16588644	G	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	44	0	0	46	8	17.4	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.711656442	0.711656442	1	0.075	0.075	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.61E-11	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	17267830	C	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	44	12	27.3	57	3	5.3	49	9	18.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.135135135	1.135135135	1	0.216768916	0.216768916	1	0.657142857	0.657142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.44E-18	1	0.002989991	1	3.35E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	17367310	T	C	-	-	-	-	-	-	27	0	0	41	0	0	49	10	20.4	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.834355828	0.834355828	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.72E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	17624903	A	G	-	-	-	-	-	-	38	0	0	46	0	0	45	9	20	55	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.81799591	0.81799591	1	0.064285714	0.064285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.47E-12	1	0.240951649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	18013468	G	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	61	0	0	62	11	17.7	59	6	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.72392638	0.72392638	1	0.364285714	0.364285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.96E-14	1	0.000000561	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	20122383	C	T	WDR35	CCDS33152.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	25	0	0	40	9	22.5	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.920245399	0.920245399	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.64E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	20998697	C	T	C2orf43	CCDS1702.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	50	0	0	51	9	17.6	55	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.719836401	0.719836401	1	0.064285714	0.064285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.92E-12	1	0.240951649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	21074651	C	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	38	13	34.2	42	0	0	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.422037422	1.422037422	1	0	0	1	0.1	0.1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.88E-21	1	1	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	21339953	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	32	7	21.9	33	6	18.2	36	12	33.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.910602911	0.910602911	1	0.744376278	0.744376278	1	1.189285714	1.189285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.36E-10	1	1.54E-08	1	2.73E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	21523009	C	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	44	0	0	56	9	16.1	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.658486708	0.658486708	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.20E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	22229291	T	C	-	-	-	-	-	-	31	0	0	39	12	30.8	50	3	6	33	6	18.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.280665281	1.280665281	1	0.245398773	0.245398773	1	0.65	0.65	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	8.43E-19	1	0.002055544	1	1.54E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	25714964	A	C	DTNB	CCDS46237.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	41	8	19.5	61	0	0	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.810810811	0.810810811	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.22E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	30097051	A	G	ALK	CCDS33172.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	58	0	0	49	7	14.3	57	8	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.584867076	0.584867076	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	5.58E-09	1	5.19E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	30122670	C	T	ALK	CCDS33172.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	35	4	11.4	61	8	13.1	43	10	23.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.474012474	0.474012474	1	0.535787321	0.535787321	1	0.832142857	0.832142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.0000289	1	9.09E-10	1	1.61E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	30847386	T	C	LCLAT1	CCDS1772.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	58	10	17.2	61	18	29.5	47	10	21.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.715176715	0.715176715	1	1.206543967	1.206543967	1	0.760714286	0.760714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.10E-13	1	4.08E-27	1	4.27E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	31518212	G	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	32	0	0	38	7	18.4	53	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.752556237	0.752556237	1	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.61E-10	1	0.233303855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	34075017	C	A	-	-	-	-	-	-	49	0	0	40	7	17.5	70	6	8.6	51	8	15.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.727650728	0.727650728	1	0.351738241	0.351738241	1	0.560714286	0.560714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.26E-09	1	0.00000156	1	2.05E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	34889893	C	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	52	0	0	61	11	18	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.736196319	0.736196319	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.62E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	35410123	G	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	44	0	0	58	15	25.9	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.059304703	1.059304703	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.42E-22	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	38006838	G	A	-	-	-	-	-	-	65	0	0	60	9	15	50	2	4	53	13	24.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.623700624	0.623700624	1	0.163599182	0.163599182	1	0.875	0.875	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.29E-11	1	0.026131524	1	8.53E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	38145765	C	T	FAM82A1	ENST00000414644	r.?	-	-	upstream	43	0	0	70	0	0	55	10	18.2	56	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.744376278	0.744376278	1	0.064285714	0.064285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.33E-13	1	0.244746891	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	38707425	T	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	49	12	24.5	59	17	28.8	44	10	22.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.018711019	1.018711019	1	1.17791411	1.17791411	1	0.810714286	0.810714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.90E-17	1	1.74E-25	1	2.08E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	38844772	C	A	-	-	-	-	-	-	55	0	0	60	20	33.3	49	13	26.5	55	15	27.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.384615385	1.384615385	1	1.083844581	1.083844581	1	0.975	0.975	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.30E-31	1	2.71E-19	1	3.01E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	39800332	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	54	11	20.4	51	0	0	52	10	19.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.848232848	0.848232848	1	0	0	1	0.685714286	0.685714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.84E-15	1	1	1	1.28E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	40786298	G	A	SLC8A1	CCDS46264.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	37	8	21.6	49	0	0	49	5	10.2	164	0	0	174	41	23.6	87	3	3.4	118	19	16.1	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.898128898	0.898128898	1	0	0	1	0.364285714	0.364285714	1	0.981288981	0.981288981	1	0.139059305	0.139059305	1	0.575	0.575	1	7	6	1	1	1.33E-11	3.06E-55	1	0.009696123	0.00000496	4.91E-23	YES	1_1	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	41625782	C	G	-	-	-	-	-	-	32	0	0	47	0	0	44	8	18.2	47	5	10.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.744376278	0.744376278	1	0.378571429	0.378571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	5.90E-11	1	0.00000402	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	42709734	T	C	KCNG3	CCDS1809.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	44	0	0	36	12	33.3	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.36196319	1.36196319	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.73E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	43010740	G	T	HAAO	CCDS33187.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	39	11	28.2	54	0	0	51	4	7.8	1	0	0	1	0	0	0	0	NA	3	1	33.3	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.172557173	1.172557173	1	0	0	1	0.278571429	0.278571429	1	0	0	1	NA	NA	1	1.189285714	1.189285714	1	7	NA	1	1	7.20E-17	1	1	1	0.000129466	0.014925125	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	43730249	C	A	THADA	CCDS46268.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	36	0	0	52	6	11.5	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.470347648	0.470347648	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000261	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	45954786	G	T	PRKCE	CCDS1824.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	50	1	2	58	10	17.2	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.083160083	0.083160083	1	0.703476483	0.703476483	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	0.221687443	1	4.10E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	48504869	G	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	54	1	1.9	38	7	18.4	55	9	16.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.079002079	0.079002079	1	0.752556237	0.752556237	1	0.585714286	0.585714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.237137336	1	8.61E-10	1	1.01E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	49385482	C	A	FSHR	CCDS1843.1	r.?	-	-	upstream	42	0	0	45	0	0	40	8	20	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.81799591	0.81799591	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.61E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	52317693	G	C	-	-	-	-	-	-	43	0	0	50	0	0	42	4	9.5	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.388548057	0.388548057	1	0.085714286	0.085714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000601	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	54926141	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	37	7	18.9	51	12	23.5	46	18	39.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.785862786	0.785862786	1	0.961145194	0.961145194	1	1.396428571	1.396428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	7.05E-10	1	3.24E-17	1	9.41E-30	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	59015941	A	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	51	0	0	57	10	17.5	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.715746421	0.715746421	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.40E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	59942288	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	50	10	20	48	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	8.36E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	60075234	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	43	0	0	39	7	17.9	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.732106339	0.732106339	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.04E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	61227095	G	A	PUS10	CCDS1865.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	49	0	0	57	15	26.3	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.075664622	1.075664622	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.53E-22	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	64174624	C	A	VPS54	CCDS33208.1	r.1293g>u	c.1138G>T	p.E380*	nonsense	36	0	0	49	0	0	49	7	14.3	62	0	0	264	0	0	126	0	0	56	10	17.9	78	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.584867076	0.584867076	1	0	0	1	0	0	1	0.732106339	0.732106339	1	0	0	1	2	1	1	1	1	1	5.58E-09	2.82E-13	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	64411923	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	42	11	26.2	38	2	5.3	51	6	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.089397089	1.089397089	1	0.216768916	0.216768916	1	0.421428571	0.421428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.81E-16	1	0.015598339	1	0.000000232	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	64694107	G	C	-	-	-	-	-	-	51	0	0	47	13	27.7	54	0	0	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.151767152	1.151767152	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.47E-19	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	64749497	C	T	AFTPH	CCDS46303.1	r.?	-	-	upstream	54	0	0	56	11	19.6	53	1	1.9	49	10	20.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.814968815	0.814968815	1	0.077709611	0.077709611	1	0.728571429	0.728571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.91E-15	1	0.233303855	1	6.72E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	64998637	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	40	0	0	48	13	27.1	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.108384458	1.108384458	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.00E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	65399429	A	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	40	8	20	51	0	0	31	5	16.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	0	0	1	0.575	0.575	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.61E-11	1	1	1	0.000000476	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	65753513	C	T	-	-	-	-	-	-	50	0	0	52	0	0	54	14	25.9	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.059304703	1.059304703	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.64E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	66662105	G	A	MEIS1	CCDS46309.1	r.?	-	-	upstream	47	0	0	57	16	28.1	44	10	22.7	37	8	21.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.168399168	1.168399168	1	0.928425358	0.928425358	1	0.771428571	0.771428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	7.28E-24	1	2.08E-14	1	1.33E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	69501304	G	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	41	9	22	40	1	2.5	49	10	20.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914760915	0.914760915	1	0.102249489	0.102249489	1	0.728571429	0.728571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.92E-13	1	0.181679879	1	6.72E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	70330967	T	A	-	-	-	-	-	-	49	0	0	53	0	0	55	13	23.6	42	5	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.965235174	0.965235174	1	0.425	0.425	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.46E-18	1	0.00000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	70903958	C	T	ADD2	CCDS1906.1	r.2008g>a	c.1563G>A	p.A521A	silent	34	0	0	47	10	21.3	55	0	0	62	0	0	154	1	0.6	212	45	21.2	223	3	1.3	177	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.885654886	0.885654886	1	0	0	1	0	0	1	0.881496881	0.881496881	1	0.053169734	0.053169734	1	0	0	1	6	4	1	0.537880351	4.27E-14	3.30E-58	1	0.102169746	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	70991658	A	G	ADD2	CCDS1906.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	53	16	30.2	62	14	22.6	52	12	23.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.255717256	1.255717256	1	0.924335378	0.924335378	1	0.825	0.825	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.90E-24	1	1.42E-19	1	4.19E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	71126740	C	T	VAX2	CCDS1911.1	r.?	-	-	upstream	41	0	0	42	11	26.2	49	0	0	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.089397089	1.089397089	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.81E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	72039438	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	56	9	16.1	56	1	1.8	52	0	0	387	0	0	121	27	22.3	113	2	1.8	121	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.669438669	0.669438669	1	0.073619632	0.073619632	1	0	0	1	0.927234927	0.927234927	1	0.073619632	0.073619632	1	0	0	1	6	4	1	1	1.20E-11	3.23E-36	0.244746891	0.110164676	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	74348442	G	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	23	0	0	38	0	0	39	7	17.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.639285714	0.639285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	1.04E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	77392699	A	C	LRRTM4	CCDS46346.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	40	15	37.5	60	2	3.3	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.559251559	1.559251559	1	0.134969325	0.134969325	1	0.267857143	0.267857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.09E-24	1	0.036544784	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	77420027	G	T	LRRTM4	CCDS46346.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	57	15	26.3	58	14	24.1	69	13	18.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.093555094	1.093555094	1	0.985685072	0.985685072	1	0.671428571	0.671428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.53E-22	1	5.04E-20	1	3.64E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	77907408	T	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	24	5	20.8	37	0	0	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.864864865	0.864864865	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000000123	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	78242729	A	G	-	-	-	-	-	-	42	0	0	51	0	0	52	15	28.8	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.17791411	1.17791411	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.15E-22	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	79235478	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	48	0	0	51	9	17.6	37	4	10.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.719836401	0.719836401	1	0.385714286	0.385714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	4.92E-12	1	0.0000362	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	79244693	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	50	13	26	65	0	0	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.081081081	1.081081081	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.65E-19	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	80213708	G	A	CTNNA2	CCDS42703.2	r.?	-	-	intronic	49	0	0	46	13	28.3	43	13	30.2	40	10	25	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.176715177	1.176715177	1	1.235173824	1.235173824	1	0.892857143	0.892857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.07E-19	1	3.88E-20	1	7.22E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	80923134	T	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	39	0	0	49	7	14.3	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.584867076	0.584867076	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.58E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	81098703	C	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	44	6	13.6	71	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.565488565	0.565488565	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	9.37E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	81280460	G	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	42	5	11.9	48	2	4.2	39	5	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.494802495	0.494802495	1	0.171779141	0.171779141	1	0.457142857	0.457142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.00000228	1	0.024220359	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	81345354	C	A	-	-	-	-	-	-	50	0	0	57	0	0	55	10	18.2	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.744376278	0.744376278	1	0.075	0.075	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.33E-13	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	81917554	T	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	38	8	21.1	55	4	7.3	32	6	18.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.877338877	0.877338877	1	0.298568507	0.298568507	1	0.671428571	0.671428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.67E-11	1	0.000173903	1	1.27E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	81922860	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	25	10	40	55	0	0	37	7	18.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.663201663	1.663201663	1	0	0	1	0.675	0.675	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.98E-17	1	1	1	7.05E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	83211029	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	49	13	26.5	51	14	27.5	55	11	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.101871102	1.101871102	1	1.124744376	1.124744376	1	0.714285714	0.714285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.71E-19	1	6.64E-21	1	4.77E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	83404192	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	39	6	15.4	63	4	6.3	51	11	21.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.64033264	0.64033264	1	0.257668712	0.257668712	1	0.771428571	0.771428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.43E-08	1	0.000294233	1	1.94E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	84745656	G	A	DNAH6	CCDS46348.1	r.?	-	-	intronic	49	0	0	39	9	23.1	60	0	0	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.96049896	0.96049896	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.62E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	85282132	A	G	KCMF1	CCDS46350.1	r.3105a>g	c.?	p.?	3'UTR variant	34	0	0	35	6	17.1	54	12	22.2	51	13	25.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.711018711	0.711018711	1	0.90797546	0.90797546	1	0.910714286	0.910714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.24E-08	1	6.90E-17	1	4.87E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	87497501	G	A	-	-	-	-	-	-	15	0	0	25	8	32	29	9	31	16	10	62.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.330561331	1.330561331	1	1.267893661	1.267893661	1	2.232142857	2.232142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.92E-13	1	1.79E-14	1	7.61E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	89572281	A	C	-	-	-	-	-	-	36	0	0	45	0	0	64	14	21.9	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.895705521	0.895705521	1	0.085714286	0.085714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.31E-19	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	90246370	G	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	34	10	29.4	39	0	0	42	4	9.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.222453222	1.222453222	1	0	0	1	0.339285714	0.339285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.15E-15	1	1	1	0.0000601	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	91652352	T	C	-	-	-	-	-	-	9	0	0	13	0	0	12	3	25	21	1	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.022494888	1.022494888	1	0.171428571	0.171428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000266	1	0.099912572	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	92139777	C	T	-	-	-	-	-	-	62	0	0	82	10	12.2	75	12	16	80	16	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.507276507	0.507276507	1	0.654396728	0.654396728	1	0.714285714	0.714285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.51E-11	1	4.77E-15	1	3.04E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	98755702	G	A	VWA3B	CCDS42718.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	41	0	0	55	10	18.2	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.744376278	0.744376278	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.33E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	100214336	C	G	AFF3	CCDS42723.1	r.?	-	-	intronic	50	0	0	48	8	16.7	51	2	3.9	53	11	20.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.694386694	0.694386694	1	0.159509202	0.159509202	1	0.742857143	0.742857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.23E-10	1	0.027109304	1	3.07E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	100282107	G	C	AFF3	CCDS42723.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	55	0	0	63	14	22.2	54	8	14.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.90797546	0.90797546	1	0.528571429	0.528571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.81E-19	1	3.31E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	100575021	G	C	AFF3	CCDS42723.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	51	9	17.6	50	0	0	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.731808732	0.731808732	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.92E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	100598693	G	A	AFF3	CCDS42723.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	46	0	0	50	12	24	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.981595092	0.981595092	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.49E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	101497578	C	T	NPAS2	CCDS2048.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	41	0	0	45	11	24.4	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.99795501	0.99795501	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.24E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	102990529	G	A	IL18R1	CCDS2060.1	r.?	-	-	intronic	50	0	0	39	0	0	47	9	19.1	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.781186094	0.781186094	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.24E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	103099909	C	A	SLC9A4	CCDS33264.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	28	0	0	57	10	17.5	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.715746421	0.715746421	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.40E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	103115278	C	G	SLC9A4	CCDS33264.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	46	11	23.9	51	16	31.4	58	14	24.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.993762994	0.993762994	1	1.284253579	1.284253579	1	0.860714286	0.860714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.55E-16	1	9.28E-25	1	5.04E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	103833926	G	C	-	-	-	-	-	-	50	0	0	60	0	0	49	7	14.3	60	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.584867076	0.584867076	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.58E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	103854612	C	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	35	0	0	45	11	24.4	53	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.99795501	0.99795501	1	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.24E-16	1	0.233303855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	104089273	G	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	37	14	37.8	38	10	26.3	44	19	43.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.571725572	1.571725572	1	1.075664622	1.075664622	1	1.542857143	1.542857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.35E-23	1	4.06E-15	1	2.39E-32	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	104255061	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	44	7	15.9	59	2	3.4	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.661122661	0.661122661	1	0.139059305	0.139059305	1	0.389285714	0.389285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.55E-09	1	0.035441897	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	104296811	C	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	46	0	0	69	0	0	59	5	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.303571429	0.303571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000125	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	104901140	G	A	-	-	-	-	-	-	50	0	0	45	12	26.7	48	0	0	48	11	22.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.11018711	1.11018711	1	0	0	1	0.817857143	0.817857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	6.03E-18	1	1	1	9.31E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	104956128	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	36	8	22.2	51	2	3.9	47	8	17	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.923076923	0.923076923	1	0.159509202	0.159509202	1	0.607142857	0.607142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.04E-11	1	0.027109304	1	1.03E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	105098139	C	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	41	6	14.6	52	1	1.9	57	5	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.607068607	0.607068607	1	0.077709611	0.077709611	1	0.314285714	0.314285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	6.05E-08	1	0.229451111	1	0.0000105	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	105340877	A	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	46	11	23.9	56	18	32.1	55	13	23.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.993762994	0.993762994	1	1.312883436	1.312883436	1	0.842857143	0.842857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.55E-16	1	6.76E-28	1	1.46E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	105542163	A	G	-	-	-	-	-	-	67	0	0	43	13	30.2	58	0	0	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.255717256	1.255717256	1	0	0	1	0.071428571	0.071428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.88E-20	1	1	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	106639734	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	34	12	35.3	56	0	0	52	9	17.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.467775468	1.467775468	1	0	0	1	0.617857143	0.617857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.21E-19	1	1	1	5.92E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	107438532	C	A	ST6GAL2	CCDS2073.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	50	0	0	44	9	20.5	37	4	10.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.838445808	0.838445808	1	0.385714286	0.385714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.18E-12	1	0.0000362	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	107873484	T	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	45	9	20	53	0	0	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.47E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	107995039	G	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	58	10	17.2	53	5	9.4	42	12	28.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.715176715	0.715176715	1	0.384458078	0.384458078	1	1.021428571	1.021428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.10E-13	1	0.00000734	1	2.35E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	108016632	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	43	0	0	43	0	0	48	7	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.521428571	0.521428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	4.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	108133219	C	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	52	0	0	44	10	22.7	53	0	0	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.928425358	0.928425358	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.08E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	109038876	T	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	53	5	9.4	46	1	2.2	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.390852391	0.390852391	1	0.08997955	0.08997955	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.00000734	1	0.205924651	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	110264446	C	T	SH3RF3	ENST00000444352	r.?	-	-	downstream	44	0	0	46	0	0	63	1	1.6	47	7	14.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.065439673	0.065439673	1	0.532142857	0.532142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.27078753	1	4.12E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	112711176	G	A	MERTK	CCDS2094.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	51	0	0	53	11	20.8	47	8	17	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.850715746	0.850715746	1	0.607142857	0.607142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	3.07E-15	1	1.03E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	117494614	G	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	38	0	0	46	5	10.9	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.445807771	0.445807771	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000361	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	118755210	T	G	CCDC93	CCDS2121.2	r.?	-	-	intronic	37	0	0	55	16	29.1	56	10	17.9	63	22	34.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.20997921	1.20997921	1	0.732106339	0.732106339	1	1.246428571	1.246428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.78E-24	1	2.82E-13	1	1.03E-34	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	119056747	C	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	38	9	23.7	51	2	3.9	40	6	15	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.985446985	0.985446985	1	0.159509202	0.159509202	1	0.535714286	0.535714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.79E-13	1	0.027109304	1	5.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	119790928	T	C	-	-	-	-	-	-	37	0	0	52	7	13.5	51	1	2	40	6	15	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.561330561	0.561330561	1	0.081799591	0.081799591	1	0.535714286	0.535714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	8.58E-09	1	0.225579006	1	5.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	119797996	T	C	-	-	-	-	-	-	43	0	0	44	0	0	51	10	19.6	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.801635992	0.801635992	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.04E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	121945252	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	38	8	21.1	50	3	6	30	6	20	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.877338877	0.877338877	1	0.245398773	0.245398773	1	0.714285714	0.714285714	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.67E-11	1	0.002055544	1	8.37E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	122198521	G	A	CLASP1	ENST00000263710	r.?	-	-	intronic	40	0	0	39	10	25.6	50	20	40	45	11	24.4	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.064449064	1.064449064	1	1.63599182	1.63599182	1	0.871428571	0.871428571	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.44E-15	1	3.90E-33	1	4.24E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	123943600	C	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	42	10	23.8	36	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.98960499	0.98960499	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.24E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	123944782	A	T	-	-	-	-	-	-	51	0	0	31	6	19.4	40	0	0	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.806652807	0.806652807	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.03E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	124257184	C	G	-	-	-	-	-	-	47	0	0	39	11	28.2	66	0	0	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.172557173	1.172557173	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	7.20E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	124428314	A	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	36	0	0	50	2	4	45	6	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.163599182	0.163599182	1	0.475	0.475	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.026131524	1	0.000000108	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	125331780	G	T	CNTNAP5	CCDS46401.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	44	0	0	52	1	1.9	49	8	16.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.077709611	0.077709611	1	0.582142857	0.582142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.229451111	1	1.47E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	125419696	G	A	CNTNAP5	CCDS46401.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	45	0	0	64	3	4.7	44	5	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.192229039	0.192229039	1	0.407142857	0.407142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.004148608	1	0.00000288	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	126290372	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	61	0	0	59	13	22	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.899795501	0.899795501	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.99E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	126595535	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	41	3	7.3	42	15	35.7	35	7	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.303534304	0.303534304	1	1.460122699	1.460122699	1	0.714285714	0.714285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.001155993	1	2.65E-24	1	4.65E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	127432006	C	G	GYPC	CCDS2136.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	36	9	25	62	13	21	48	23	47.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.03950104	1.03950104	1	0.858895706	0.858895706	1	1.710714286	1.710714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.63E-13	1	8.08E-18	1	3.27E-40	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	127489067	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	38	10	26.3	45	9	20	44	12	27.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.093555094	1.093555094	1	0.81799591	0.81799591	1	0.975	0.975	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.06E-15	1	1.47E-12	1	4.44E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	129232891	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	55	0	0	47	10	21.3	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.871165644	0.871165644	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.27E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	129422741	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	35	6	17.1	49	6	12.2	60	9	15	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.711018711	0.711018711	1	0.498977505	0.498977505	1	0.535714286	0.535714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.24E-08	1	0.000000182	1	2.29E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	129587391	T	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	48	10	20.8	43	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.864864865	0.864864865	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.37E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	131851118	A	G	FAM168B	CCDS42755.1	r.?	-	-	upstream	42	0	0	60	17	28.3	60	11	18.3	43	13	30.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.176715177	1.176715177	1	0.748466258	0.748466258	1	1.078571429	1.078571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.41E-25	1	1.34E-14	1	3.88E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	132406217	T	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	50	0	0	47	12	25.5	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.042944785	1.042944785	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.09E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	137195075	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	38	10	26.3	50	10	20	43	9	20.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.093555094	1.093555094	1	0.81799591	0.81799591	1	0.746428571	0.746428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.06E-15	1	8.36E-14	1	9.45E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	137367085	G	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	49	0	0	58	2	3.4	42	6	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.139059305	0.139059305	1	0.510714286	0.510714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.034352256	1	7.02E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	137372089	G	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	39	0	0	51	0	0	49	5	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.364285714	0.364285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000496	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	137499658	A	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	58	0	0	65	13	20	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.81799591	0.81799591	1	0.075	0.075	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.57E-17	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	137861368	C	T	THSD7B	ENST00000409968	r.?	-	-	intronic	37	0	0	56	0	0	55	0	0	54	8	14.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.528571429	0.528571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	3.31E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	141135854	C	T	LRP1B	CCDS2182.1	r.11505g>a	c.10533G>A	p.K3511K	silent	38	0	0	43	0	0	47	10	21.3	39	4	10.3	246	0	0	199	1	0.5	92	21	22.8	111	9	8.1	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.871165644	0.871165644	1	0.367857143	0.367857143	1	0.020790021	0.020790021	1	0.932515337	0.932515337	1	0.289285714	0.289285714	1	3	3	1	1	1	0.631198169	4.27E-14	9.72E-29	0.0000447	6.24E-09	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	141500601	C	A	LRP1B	CCDS2182.1	r.?	-	-	intronic	50	0	0	44	0	0	53	15	28.3	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.157464213	1.157464213	1	0.096428571	0.096428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.60E-22	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	141681400	T	A	LRP1B	CCDS2182.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	37	6	16.2	53	1	1.9	45	11	24.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.673596674	0.673596674	1	0.077709611	0.077709611	1	0.871428571	0.871428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.18E-08	1	0.233303855	1	4.24E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	142625181	C	T	LRP1B	CCDS2182.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	43	0	0	67	0	0	52	8	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.495661187	2	1	1	1	1	1	1	1	0.504338813	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.495661187	NA	0	0	1	0	0	1	0.55	0.55	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	1	NA	1	1	1	1	1	1	2.42E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	143544827	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	57	0	0	60	17	28.3	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.157464213	1.157464213	1	0.071428571	0.071428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.41E-25	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	143953940	A	G	ARHGAP15	CCDS2184.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	58	18	31	44	0	0	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.288981289	1.288981289	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.42E-27	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	144302104	C	T	ARHGAP15	CCDS2184.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	58	11	19	54	0	0	63	8	12.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.79002079	0.79002079	1	0	0	1	0.453571429	0.453571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	8.96E-15	1	1	1	1.18E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	145214339	T	A	ZEB2	CCDS2186.1	r.?	-	-	intronic	55	0	0	54	14	25.9	47	2	4.3	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.076923077	1.076923077	1	0.175869121	0.175869121	1	0.25	0.25	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.64E-20	1	0.02328732	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	145660995	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	28	0	0	47	5	10.6	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.433537832	0.433537832	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.00000402	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	146868424	A	G	-	-	-	-	-	-	23	0	0	21	0	0	23	10	43.5	21	4	19	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	1.779141104	1.779141104	1	0.646088107	0.646088107	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	1.05E-17	1	0.00000349	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	146993131	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	56	8	14.3	41	13	31.7	45	9	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.594594595	0.594594595	1	1.296523517	1.296523517	1	0.680092744	0.680092744	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	4.48E-10	1	1.89E-20	1	1.47E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	147019550	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	39	13	33.3	65	2	3.1	44	7	15.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.384615385	1.384615385	1	0.126789366	0.126789366	1	0.540673732	0.652172265	0.82903515	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	8.79E-21	1	0.042252341	1	2.55E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	148281151	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	38	0	0	49	9	18.4	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.752556237	0.752556237	1	0.068009274	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	3.35E-12	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	152772679	C	T	CACNB4	CCDS46428.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	42	0	0	39	10	25.6	41	0	0	140	0	0	119	0	0	59	12	20.3	59	2	3.4	FALSE	TRUE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	1.047034765	1.047034765	1	0	NA	0	0	0	1	0.830265849	0.830265849	1	0.115615767	0.115615767	1	NA	1	1	1	1	1	5.44E-15	2.20E-16	1	0.035441897	YES	0_0	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	152772706	C	G	CACNB4	CCDS46428.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	36	0	0	42	14	33.3	38	0	0	170	0	0	155	0	0	71	15	21.1	79	2	2.5	FALSE	TRUE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	1.36196319	1.36196319	1	0	NA	0	0	0	1	0.862985685	0.862985685	1	0.085011593	0.085011593	1	NA	1	1	1	1	1	2.83E-22	2.15E-20	1	0.059811146	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	152772831	C	T	CACNB4	CCDS46428.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	43	0	0	65	14	21.5	54	2	3.7	228	0	0	173	0	0	76	16	21.1	114	0	0	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.879345603	0.879345603	1	0.125817158	0.125817158	1	0	0	1	0.862985685	0.862985685	1	0	NA	0	2	NA	1	1	1	1	2.93E-19	1.25E-21	0.030129377	1	YES	0_0	1_1	1_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	152773034	C	T	CACNB4	CCDS46428.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	39	0	0	52	13	25	63	0	0	238	0	0	165	0	0	81	15	18.5	103	0	0	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	1.022494888	1.022494888	1	0	NA	0	0	0	1	0.756646217	0.756646217	1	0	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	6.47E-19	1.82E-19	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	152773052	C	G	CACNB4	CCDS46428.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	39	0	0	52	10	19.2	63	0	0	235	0	0	176	0	0	82	17	20.7	106	0	0	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.785276074	0.785276074	1	0	NA	0	0	0	1	0.846625767	0.846625767	1	0	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.28E-13	9.09E-23	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	152773071	C	G	CACNB4	CCDS46428.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	41	0	0	49	7	14.3	59	0	0	235	0	0	167	0	0	78	16	20.5	104	1	1	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.584867076	0.584867076	1	0	NA	0	0	0	1	0.838445808	0.838445808	1	0.034004637	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	5.58E-09	1.96E-21	1	0.406254409	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	152773277	C	T	CACNB4	CCDS46428.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	55	0	0	56	15	26.8	52	1	1.9	19	0	0	8	0	0	4	2	50	2	0	0	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	1.096114519	1.096114519	1	0.064608811	NA	0	0	0	1	2.044989775	2.044989775	1	0	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	4.09E-22	0.000149002	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	152773448	C	G	CACNB4	CCDS46428.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	42	0	0	50	7	14	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.572597137	0.572597137	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	6.46E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	152774766	C	A	CACNB4	CCDS46428.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	51	0	0	47	8	17	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.695296524	0.695296524	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.03E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	152775631	C	T	CACNB4	CCDS46428.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	54	0	0	44	6	13.6	41	1	2.4	362	0	0	199	1	0.5	114	24	21.1	180	0	0	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.556237219	0.556237219	1	0.081611129	NA	0	0.020790021	0.020790021	1	0.862985685	0.862985685	1	0	NA	0	NA	NA	1	1	1	0.631198169	9.37E-08	1.07E-31	0.18577148	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	152775637	C	T	CACNB4	CCDS46428.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	56	0	0	42	6	14.3	39	1	2.6	364	0	0	201	0	0	114	23	20.2	175	0	0	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.584867076	0.584867076	1	0.088412057	NA	0	0	0	1	0.826175869	0.826175869	1	0	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	7.02E-08	5.60E-30	0.177567718	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	153388929	C	A	FMNL2	CCDS46429.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	42	0	0	46	9	19.6	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.801635992	0.801635992	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.82E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	154635137	A	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	52	0	0	58	7	12.1	63	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.494887526	0.494887526	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.88E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	155529641	A	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	43	7	16.3	62	18	29	54	9	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.677754678	0.677754678	1	1.18609407	1.18609407	1	0.567877441	0.684985964	0.82903515	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	2.15E-09	1	5.72E-27	1	8.48E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	156420957	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	47	9	19.1	50	9	18	36	6	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.794178794	0.794178794	1	0.736196319	0.736196319	1	0.567877441	0.567877441	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	2.24E-12	1	4.07E-12	1	2.68E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	157145377	T	C	-	-	-	-	-	-	42	0	0	46	0	0	54	0	0	44	9	20.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0	0	1	0.697095063	0.697095063	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	1	NA	1	1	1	1	1	1	1.18E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	157287477	G	T	GPD2	CCDS2202.1	r.?	-	-	upstream	38	0	0	47	10	21.3	56	1	1.8	62	12	19.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.885654886	0.885654886	1	0.073619632	0.073619632	1	0.659689962	0.659689962	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	4.27E-14	1	0.244746891	1	4.19E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	157360537	T	G	GPD2	CCDS2202.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	50	0	0	42	1	2.4	43	4	9.3	218	0	0	84	0	0	53	0	0	55	6	10.9	TRUE	TRUE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.098159509	0.098159509	1	0.316243126	0.316243126	1	0	0	1	0	0	1	0.370650546	0.370650546	1	1	2	1	1	1	1	0.189842622	1	0.000066	0.000000367	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	157869508	T	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	47	16	34	54	14	25.9	49	10	20.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.413721414	1.413721414	1	1.059304703	1.059304703	1	0.693694599	0.693694599	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	1.98E-25	1	1.64E-20	1	6.72E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	158614403	A	C	ACVR1	CCDS2206.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	55	16	29.1	41	11	26.8	53	11	20.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.20997921	1.20997921	1	1.096114519	1.096114519	1	0.707296454	0.707296454	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	3.78E-24	1	1.34E-16	1	3.07E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	158784991	C	G	-	-	-	-	-	-	42	0	0	50	0	0	51	10	19.6	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.801635992	0.801635992	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.04E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	159292374	G	T	CCDC148	CCDS33304.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	54	11	20.4	53	0	0	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.848232848	0.848232848	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	3.84E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	159680801	G	T	DAPL1	ENST00000343761	r.?	-	-	intronic	46	0	0	44	10	22.7	45	0	0	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.943866944	0.943866944	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	2.08E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	162584121	C	A	SLC4A10	CCDS46438.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	44	4	9.1	57	2	3.5	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.378378378	0.378378378	1	0.143149284	0.143149284	1	0.170023186	0.170023186	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	4	NA	1	1	0.0000723	1	0.03327602	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	163419588	C	T	KCNH7	CCDS2219.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	44	0	0	52	8	15.4	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.629856851	0.629856851	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	2.42E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	165574015	C	T	COBLL1	CCDS2223.2	r.?	-	-	intronic	41	0	0	53	0	0	46	8	17.4	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.711656442	0.711656442	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	8.61E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	166609129	T	G	GALNT3	CCDS2226.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	45	19	42.2	49	3	6.1	49	9	18.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.754677755	1.754677755	1	0.249488753	0.249488753	1	0.625685325	0.625685325	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	4.11E-32	1	0.001939399	1	3.35E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	167414398	A	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	49	15	30.6	46	1	2.2	29	5	17.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.272349272	1.272349272	1	0.08997955	0.08997955	1	0.58487976	0.58487976	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	4.10E-23	1	0.205924651	1	0.000000336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	167599826	G	T	-	-	-	-	-	-	48	0	0	45	14	31.1	40	1	2.5	45	10	22.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.293139293	1.293139293	1	0.102249489	0.102249489	1	0.754902946	0.754902946	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	8.81E-22	1	0.181679879	1	2.66E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	168336468	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	41	1	2.4	55	10	18.2	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.0997921	0.0997921	1	0.744376278	0.744376278	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.18577148	1	2.33E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	171306908	T	C	MYO3B	CCDS42773.1	r.?	-	-	intronic	50	0	0	52	0	0	58	12	20.7	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.846625767	0.846625767	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.76E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	171709340	G	A	GAD1	CCDS2239.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	34	0	0	46	9	19.6	45	4	8.9	115	0	0	137	2	1.5	95	19	20	120	12	10	TRUE	TRUE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.801635992	0.801635992	1	0.302641271	0.302641271	1	0.062370062	0.062370062	1	0.81799591	0.81799591	1	0.340046372	0.340046372	1	3	3	1	1	1	0.150333955	1.82E-12	5.98E-25	0.0000791	1.56E-12	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	172386604	A	G	CYBRD1	CCDS2244.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	48	11	22.9	52	8	15.4	34	9	26.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.952182952	0.952182952	1	0.629856851	0.629856851	1	0.901122886	0.901122886	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	9.31E-16	1	2.42E-10	1	9.15E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	173035975	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	48	0	0	51	6	11.8	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.482617587	0.482617587	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.000000232	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	174070925	G	A	ENSG00000091436	CCDS2251.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	50	8	16	50	0	0	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.665280665	0.665280665	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.74E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	175411449	C	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	51	9	17.6	41	0	0	50	7	14	113	0	0	154	29	18.8	134	2	1.5	98	9	9.2	TRUE	TRUE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.731808732	0.731808732	1	0	0	1	0.476064921	0.574239731	0.82903515	0.781704782	0.781704782	1	0.061349693	0.061349693	1	0.312842662	0.312842662	1	7	6	1	1	4.92E-12	1.89E-36	1	0.14516169	6.46E-09	2.06E-09	YES	1_1	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	175411454	C	G	-	-	-	-	-	-	44	0	0	48	8	16.7	39	0	0	50	7	14	116	0	0	157	32	20.4	137	2	1.5	99	9	9.1	TRUE	TRUE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.694386694	0.694386694	1	0	0	1	0.476064921	0.574239731	0.82903515	0.848232848	0.848232848	1	0.061349693	0.061349693	1	0.309442199	0.309442199	1	7	6	1	1	1.23E-10	3.00E-41	1	0.150333955	6.46E-09	2.25E-09	YES	1_1	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	175825100	G	T	CHN1	CCDS46455.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	42	6	14.3	54	2	3.7	60	8	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.594594595	0.594594595	1	0.151329243	0.151329243	1	0.452261675	0.545527744	0.82903515	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	7.02E-08	1	0.030129377	1	7.93E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	176383085	C	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	41	0	0	51	11	21.6	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.883435583	0.883435583	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.94E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	180170274	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	28	5	17.9	27	1	3.7	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.744282744	0.744282744	1	0.151329243	0.151329243	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000000279	1	0.126579904	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	180228814	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	42	15	35.7	54	17	31.5	60	19	31.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.484407484	1.484407484	1	1.288343558	1.288343558	1	1.077947	1.077947	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	2.65E-24	1	3.02E-26	1	3.21E-29	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	181864363	C	G	UBE2E3	CCDS2282.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	42	14	33.3	52	15	28.8	28	7	25	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.384615385	1.384615385	1	1.17791411	1.17791411	1	0.85011593	0.85011593	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	2.83E-22	1	1.15E-22	1	8.44E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	183196151	C	T	PDE1A	CCDS2285.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	63	15	23.8	40	0	0	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.98960499	0.98960499	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	2.97E-21	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	183267317	G	C	PDE1A	CCDS2285.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	48	0	0	55	15	27.3	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	1.116564417	1.116564417	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	3.01E-22	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	183836303	A	C	NCKAP1	CCDS2288.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	45	0	0	45	14	31.1	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	1.27198364	1.27198364	1	0.268636634	0.268636634	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	8.81E-22	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	184085645	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	48	7	14.6	43	1	2.3	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.607068607	0.607068607	1	0.09406953	0.09406953	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.81E-09	1	0.193893409	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	184844742	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	48	0	0	52	10	19.2	27	2	7.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.785276074	0.785276074	1	0.251634315	0.303526715	0.82903515	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	1.28E-13	1	0.00807567	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	184906672	G	C	-	-	-	-	-	-	48	0	0	52	0	0	45	13	28.9	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	1.18200409	1.18200409	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	7.68E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	188268976	C	T	CALCRL	CCDS2293.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	29	0	0	46	11	23.9	41	4	9.8	251	1	0.4	144	1	0.7	97	12	12.4	84	16	19	TRUE	TRUE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.977505112	0.977505112	1	0.333245445	0.333245445	1	0.029106029	0.029106029	1	0.507157464	0.507157464	1	0.646088107	0.779325349	0.82903515	3	3	1	0.715820159	1	0.514126036	5.55E-16	1.18E-13	0.0000546	7.07E-21	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	189857480	A	T	COL3A1	CCDS2297.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	45	9	20	48	2	4.2	52	7	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.831600832	0.831600832	1	0.171779141	0.171779141	1	0.459062602	0.553731169	0.82903515	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.47E-12	1	0.024220359	1	8.58E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	191399129	C	T	TMEM194B	CCDS46476.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	50	8	16	54	11	20.4	36	12	33.3	104	0	0	174	40	23	271	72	26.6	149	36	24.2	TRUE	TRUE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.665280665	0.665280665	1	0.834355828	0.834355828	1	1.132354419	1.132354419	1	0.956340956	0.956340956	1	1.08793456	1.08793456	1	0.82291222	0.82291222	1	8	5	1	1	1.74E-10	1.87E-53	3.84E-15	5.92E-100	2.73E-19	3.85E-49	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	192120488	G	T	MYO1B	CCDS46477.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	43	7	16.3	36	0	0	43	4	9.3	305	0	0	173	46	26.6	134	0	0	175	21	12	TRUE	TRUE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.677754678	0.677754678	1	0	0	1	0.316243126	0.316243126	1	1.106029106	1.106029106	1	0	0	1	0.408055647	0.408055647	1	7	6	1	1	2.15E-09	1.70E-64	1	1	0.000066	1.63E-22	YES	1_1	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	192524472	A	G	-	-	-	-	-	-	44	0	0	44	14	31.8	48	2	4.2	41	7	17.1	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.322245322	1.322245322	1	0.171779141	0.171779141	1	0.581479296	0.581479296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	6.10E-22	1	0.024220359	1	1.51E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	193205500	C	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	38	11	28.9	43	0	0	40	3	7.5	322	0	0	166	22	13.3	63	4	6.3	99	15	15.2	TRUE	TRUE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.201663202	1.201663202	1	0	0	1	0.255034779	0.255034779	1	0.553014553	0.553014553	1	0.257668712	0.257668712	1	0.516870486	0.516870486	1	7	6	1	1	5.19E-17	1.73E-24	1	0.000294233	0.001075403	4.43E-18	YES	1_1	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	194179094	G	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	55	9	16.4	50	8	16	54	8	14.8	232	2	0.9	108	22	20.4	67	8	11.9	48	17	35.4	TRUE	TRUE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.681912682	0.681912682	1	0.654396728	0.654396728	1	0.503268631	0.607053429	0.82903515	0.848232848	0.848232848	1	0.486707566	0.486707566	1	1.203764157	1.203764157	1	8	5	1	0.323015186	1.01E-11	7.68E-29	1.74E-10	1.96E-09	3.31E-10	2.80E-27	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	195832707	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	44	9	20.5	57	16	28.1	54	14	25.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.852390852	0.852390852	1	1.149284254	1.149284254	1	0.880720104	0.880720104	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	1.18E-12	1	7.28E-24	1	1.64E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	196503321	G	A	SLC39A10	ENST00000458054	r.?	-	-	intronic	39	0	0	54	9	16.7	50	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.694386694	0.694386694	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	8.48E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	198266834	T	C	SF3B1	CCDS33356.1	r.2190a>g	c.2098A>G	p.K700E	missense	36	0	0	35	5	14.3	49	10	20.4	43	11	25.6	210	0	0	203	42	20.7	120	24	20	150	34	22.7	TRUE	TRUE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.594594595	0.594594595	1	0.834355828	0.834355828	1	0.870518713	0.870518713	1	0.860706861	0.860706861	1	0.81799591	0.81799591	1	0.771905265	0.931088706	0.82903515	8	5	1	1	0.000000895	6.30E-54	6.72E-14	4.08E-31	2.42E-16	1.89E-45	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	199819453	G	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	56	9	16.1	51	0	0	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.669438669	0.669438669	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.20E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	199920163	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	51	0	0	50	12	24	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.981595092	0.981595092	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	2.49E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	200091230	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	61	12	19.7	54	0	0	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.819126819	0.819126819	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	3.39E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	200644621	A	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	35	9	25.7	50	2	4	40	7	17.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.068607069	1.068607069	1	0.163599182	0.163599182	1	0.595081151	0.595081151	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.23E-13	1	0.026131524	1	1.26E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	200768492	G	A	-	-	-	-	-	-	18	0	0	25	7	28	36	0	0	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.164241164	1.164241164	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	3.47E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	201542652	A	C	AOX1	ENST00000439380	r.?	-	-	downstream	34	0	0	38	10	26.3	46	0	0	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.093555094	1.093555094	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.06E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	201858003	G	A	FAM126B	CCDS2335.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	46	10	21.7	54	11	20.4	56	9	16.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.902286902	0.902286902	1	0.834355828	0.834355828	1	0.547474659	0.66037569	0.82903515	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	3.38E-14	1	3.84E-15	1	1.20E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	203877601	G	T	NBEAL1	CCDS46495.1	r.?	-	-	upstream	37	0	0	47	0	0	50	6	12	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.490797546	0.490797546	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.000000206	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	203923891	A	T	NBEAL1	CCDS46495.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	40	17	42.5	46	9	19.6	49	13	26.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.767151767	1.767151767	1	0.801635992	0.801635992	1	0.901122886	0.901122886	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	6.07E-29	1	1.82E-12	1	2.71E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	204511658	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	46	0	0	57	18	31.6	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	1.292433538	1.292433538	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	9.84E-28	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	204711813	A	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	43	11	25.6	56	1	1.8	50	10	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.064449064	1.064449064	1	0.073619632	0.073619632	1	0.680092744	0.680092744	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	2.42E-16	1	0.244746891	1	8.36E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	206500832	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	49	0	0	31	6	19.4	44	0	0	355	0	0	191	0	0	73	11	15.1	126	0	0	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.793456033	0.793456033	1	0	NA	0	0	0	1	0.617586912	0.617586912	1	0	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.03E-08	1.31E-13	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	206553197	G	T	NRP2	CCDS2364.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	56	11	19.6	46	2	4.3	48	6	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.814968815	0.814968815	1	0.175869121	0.175869121	1	0.425057965	0.512714045	0.82903515	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	5.91E-15	1	0.022369545	1	0.00000016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	207771621	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	36	0	0	55	10	18.2	50	4	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.744376278	0.744376278	1	0.272037098	0.272037098	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	2.33E-13	1	0.000119787	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	209749370	T	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	37	0	0	39	5	12.8	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.523517382	0.523517382	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.00000156	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	209999393	T	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	51	0	0	45	7	15.6	54	0	0	187	0	0	181	0	0	83	14	16.9	110	0	0	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.63803681	0.63803681	1	0	NA	0	0	0	1	0.691206544	0.691206544	1	0	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.000000003	1.17E-17	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	213845206	T	C	-	-	-	-	-	-	45	0	0	51	15	29.4	56	11	19.6	37	6	16.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.222453222	1.222453222	1	0.801635992	0.801635992	1	0.550875123	0.550875123	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	8.22E-23	1	5.91E-15	1	3.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	214608987	C	T	SPAG16	CCDS2396.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	50	14	28	52	1	1.9	36	9	25	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.164241164	1.164241164	1	0.077709611	0.077709611	1	0.85011593	0.85011593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	4.84E-21	1	0.229451111	1	1.63E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	215146607	T	A	SPAG16	CCDS2396.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	46	14	30.4	56	1	1.8	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.264033264	1.264033264	1	0.073619632	0.073619632	1	0.333245445	0.333245445	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.26E-21	1	0.244746891	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	215798058	C	G	ABCA12	CCDS33372.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	45	0	0	54	15	27.8	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	1.137014315	1.137014315	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	2.20E-22	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	216081553	C	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	60	13	21.7	44	13	29.5	56	18	32.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.902286902	0.902286902	1	1.206543967	1.206543967	1	1.091548854	1.091548854	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	5.07E-18	1	5.49E-20	1	6.76E-28	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	216391029	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	47	0	0	43	5	11.6	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.474437628	0.474437628	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.00000257	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	216462466	A	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	44	10	22.7	56	1	1.8	48	8	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.943866944	0.943866944	1	0.073619632	0.073619632	1	0.567877441	0.684985964	0.82903515	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	2.08E-14	1	0.244746891	1	1.23E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	217332415	C	A	SMARCAL1	CCDS2403.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	51	10	19.6	53	0	0	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.814968815	0.814968815	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.04E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	218931822	C	T	RUFY4	ENST00000344321	r.?	-	-	intronic	42	0	0	47	0	0	56	11	19.6	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.801635992	0.801635992	1	0	NA	0	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	5.91E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	219741046	C	A	WNT10A	CCDS2426.1	r.?	-	-	upstream	38	0	0	49	10	20.4	71	3	4.2	63	10	15.9	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.848232848	0.848232848	1	0.171779141	0.171779141	1	0.540673732	0.652172265	0.82903515	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	6.72E-14	1	0.00554578	1	9.81E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	220362463	G	A	SPEG	CCDS42824.1	r.?	-	-	downstream	39	0	0	56	9	16.1	47	2	4.3	37	3	8.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.669438669	0.669438669	1	0.175869121	0.175869121	1	0.275437561	0.275437561	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.20E-11	1	0.02328732	1	0.000855237	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	220427639	G	A	OBSL1	CCDS46520.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	40	10	25	47	13	27.7	50	18	36	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.03950104	1.03950104	1	1.132924335	1.132924335	1	1.22416694	1.22416694	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	7.22E-15	1	1.47E-19	1	5.92E-29	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	221573942	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	50	10	20	59	2	3.4	45	7	15.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.831600832	0.831600832	1	0.139059305	0.139059305	1	0.53047234	0.639867128	0.82903515	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	8.36E-14	1	0.035441897	1	0.000000003	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	221794386	C	A	-	-	-	-	-	-	49	0	0	43	12	27.9	52	0	0	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.16008316	1.16008316	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	3.24E-18	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	221945412	T	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	45	0	0	32	7	21.9	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.895705521	0.895705521	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	2.36E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	222108783	G	A	-	-	-	-	-	-	56	0	0	43	4	9.3	41	0	0	43	6	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.386694387	0.386694387	1	0	0	1	0.476064921	0.574239731	0.82903515	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	0.000066	1	1	1	8.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	223622955	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	37	0	0	45	5	11.1	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.45398773	0.45398773	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.00000323	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	224054771	G	T	-	-	-	-	-	-	45	1	2.2	32	9	28.1	55	0	0	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.168399168	1.168399168	1	0	0	1	0.088412057	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0.201934322	1	4.94E-14	1	1	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	224073140	T	C	-	-	-	-	-	-	45	0	0	45	5	11.1	53	0	0	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.461538462	0.461538462	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000323	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	224341293	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	43	15	34.9	45	0	0	59	7	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.451143451	1.451143451	1	0	0	1	0.404655183	0.404655183	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	4.05E-24	1	1	1	2.12E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	224629503	T	G	AP1S3	CCDS42827.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	42	7	16.7	76	17	22.4	43	10	23.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.694386694	0.694386694	1	0.916155419	0.916155419	1	0.792308047	0.792308047	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	1.81E-09	1	2.21E-23	1	1.61E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	227289793	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	45	11	24.4	51	0	0	43	9	20.9	335	3	0.9	170	26	15.3	97	0	0	153	16	10.5	TRUE	TRUE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.014553015	1.014553015	1	0	0	1	0.710696918	0.710696918	1	0.636174636	0.636174636	1	0	0	1	0.357048691	0.357048691	1	7	6	1	0.235977412	4.24E-16	2.41E-30	1	1	9.45E-13	1.53E-16	YES	1_1	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	227542173	G	A	-	-	-	-	-	-	50	0	0	42	0	0	63	8	12.7	58	0	0	252	0	0	175	0	0	77	17	22.1	125	1	0.8	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.519427403	0.519427403	1	0	NA	0	0	0	1	0.903885481	0.903885481	1	0.02720371	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.18E-09	2.82E-23	1	0.465577058	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	228996851	A	G	SPHKAP	CCDS46537.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	59	1	1.7	61	1	1.6	55	6	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.070686071	0.070686071	1	0.065439673	0.065439673	1	0.370650546	0.370650546	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	1	NA	1	1	0.256019138	1	0.263440347	1	0.000000367	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	229258532	C	G	-	-	-	-	-	-	47	0	0	56	0	0	52	9	17.3	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.707566462	0.707566462	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	5.92E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	229452087	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	36	11	30.6	52	0	0	50	15	30	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.272349272	1.272349272	1	0	0	1	1.020139116	1.020139116	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	2.62E-17	1	1	1	5.83E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	229472443	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	45	0	0	49	12	24.5	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	1.00204499	1.00204499	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.90E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	229552565	G	T	-	-	-	-	-	-	53	0	0	44	0	0	53	9	17	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.695296524	0.695296524	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	7.10E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	229788984	C	G	-	-	-	-	-	-	46	0	0	34	5	14.7	35	0	0	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.611226611	0.611226611	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000000771	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	229949814	T	G	PID1	CCDS2471.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	46	0	0	47	1	2.1	49	9	18.4	319	0	0	149	0	0	78	0	0	88	7	8	TRUE	TRUE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.085889571	0.085889571	1	0.625685325	0.625685325	1	0	0	1	0	0	1	0.272037098	0.272037098	1	1	2	1	1	1	1	0.209895027	1	3.35E-12	0.000000348	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	230075141	C	T	PID1	CCDS2471.1	r.?	-	-	intronic	30	1	3.3	36	11	30.6	35	12	34.3	56	16	28.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.272349272	1.272349272	1	1.402862986	1.402862986	1	0.972532624	0.972532624	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	NA	0	8	NA	0.139615808	1	2.62E-17	1	1.83E-19	1	5.26E-24	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	230154713	G	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	46	7	15.2	55	2	3.6	49	13	26.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.632016632	0.632016632	1	0.147239264	0.147239264	1	0.901122886	0.901122886	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	3.53E-09	1	0.031164417	1	2.71E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	230163195	G	C	-	-	-	-	-	-	51	0	0	43	12	27.9	43	3	7	60	3	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.16008316	1.16008316	1	0.286298569	0.286298569	1	0.170023186	0.170023186	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	3.24E-18	1	0.001328364	1	0.003458198	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	230315689	A	C	DNER	CCDS33390.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	30	8	26.7	58	1	1.7	36	0	0	243	1	0.4	200	40	20	157	0	0	163	0	0	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.11018711	1.11018711	1	0.069529652	0.069529652	1	0	NA	0	0.831600832	0.831600832	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	0.704192881	2.07E-12	8.53E-51	0.252280541	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	231461042	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	56	0	0	57	14	24.6	40	0	0	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	1.006134969	1.006134969	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	3.84E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	233599520	A	T	GIGYF2	CCDS33401.1	r.?	-	-	upstream	32	0	0	43	1	2.3	47	5	10.6	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.095634096	0.095634096	1	0.433537832	0.433537832	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.193893409	1	0.00000402	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	234731206	C	A	HEATR7B1	ENST00000396517	r.3959+4c>a	c.3959+4C>A	p.?	splice region	27	0	0	45	12	26.7	64	18	28.1	43	14	32.6	25	1	4	109	45	41.3	183	56	30.6	103	24	23.3	TRUE	TRUE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	1.11018711	1.11018711	1	1.149284254	1.149284254	1	1.108551173	1.108551173	1	1.717255717	1.717255717	1	1.251533742	1.251533742	1	0.792308047	0.792308047	1	8	7	1	0.117779757	6.03E-18	1.98E-73	1.10E-26	4.20E-82	4.18E-22	7.27E-33	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	2	235619846	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	49	0	0	46	12	26.1	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	1.067484663	1.067484663	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	8.12E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	241598317	C	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	42	0	0	59	10	16.9	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0	0	1	0.691206544	0.691206544	1	0.068009274	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	4.91E-13	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	241921737	G	A	ENSG00000226321	ENST00000443866	r.?	-	-	intronic	44	0	0	37	5	13.5	47	0	0	44	0	0	16	0	0	153	17	11.1	145	1	0.7	125	0	0	FALSE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.561330561	0.561330561	1	0	0	1	0	NA	0	0.461538462	0.461538462	1	0.028629857	0.028629857	1	0	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000119	6.18E-18	1	0.516555406	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	242138058	G	T	ANO7	CCDS33423.1	r.?	-	-	intronic	53	0	0	44	7	15.9	57	1	1.8	61	14	23	20	0	0	203	54	26.6	198	2	1	154	27	17.5	TRUE	TRUE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.661122661	0.661122661	1	0.073619632	0.073619632	1	0.782106656	0.782106656	1	1.106029106	1.106029106	1	0.040899796	0.040899796	1	0.595081151	0.717799663	0.82903515	7	6	1	1	2.55E-09	1.97E-75	0.248523156	0.260552376	1.10E-19	3.80E-33	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	2	242724838	G	A	GAL3ST2	CCDS33427.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	41	8	19.5	60	2	3.3	56	4	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.82903515	1	1	1	1	1	0	1	1	0.17096485	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.82903515	0.810810811	0.810810811	1	0.134969325	0.134969325	1	0.241432924	0.241432924	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	3.22E-11	1	0.036544784	1	0.000186538	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	404393	G	C	CHL1	CCDS2556.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	35	11	31.4	39	1	2.6	40	3	7.5	303	0	0	178	38	21.3	86	2	2.3	135	13	9.6	FALSE	TRUE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	1.305613306	1.305613306	1	0.080339468	NA	0	0.220530643	0.597676408	0.368980004	0.885654886	0.885654886	1	0.07106953	0.07106953	1	0.282279223	0.765025802	0.368980004	NA	6	1	1	1.82E-17	1.63E-49	0.177567718	0.069370687	0.001075403	3.03E-13	YES	1_1	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	525774	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	33	7	21.2	39	0	0	32	7	21.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	0.881496881	0.881496881	1	0	0	1	0.643949478	0.643949478	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	7	NA	1	1	2.98E-10	1	1	1	2.36E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	643087	C	T	-	-	-	-	-	-	48	0	0	43	0	0	43	15	34.9	61	6	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	0	0	1	1.078402863	1.078402863	1	0.28816004	0.780963839	0.368980004	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	4.05E-24	1	0.000000685	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	1021113	C	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	38	0	0	35	7	20	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	0	0	1	0.61799591	0.61799591	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	4.65E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	1656826	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	43	8	18.6	36	2	5.6	37	10	27	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	0.773388773	0.773388773	1	0.173038855	0.173038855	1	0.793910315	0.793910315	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.85E-11	1	0.014070883	1	3.01E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	2562741	G	A	CNTN4	CCDS43041.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	41	0	0	35	12	34.3	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	0	0	1	1.059862986	1.059862986	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.83E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	3109346	C	T	IL5RA	CCDS2559.1	r.?	-	-	downstream	63	0	0	49	7	14.3	32	3	9.4	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	0.594594595	0.594594595	1	0.290458078	0.290458078	1	0.220530643	0.597676408	0.368980004	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.58E-09	1	0.000556213	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	3940064	G	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	43	5	11.6	38	4	10.5	28	2	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	0.482328482	0.482328482	1	0.324447853	0.324447853	1	0.208769009	0.565800332	0.368980004	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.00000257	1	0.0000403	1	0.008668191	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	4702820	G	T	ITPR1	CCDS46740.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	45	7	15.6	26	0	0	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	0.648648649	0.648648649	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.000000003	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	6786216	G	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	49	24	49	32	9	28.1	33	15	45.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	2.037422037	1.018711019	2	0.868284254	0.868284254	1	1.337885902	1.337885902	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.34E-42	1	4.94E-14	1	2.91E-26	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	7339449	C	T	GRM7	CCDS43042.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	45	7	15.6	29	1	3.4	39	3	7.7	313	0	0	196	42	21.4	97	2	2.1	129	8	6.2	TRUE	TRUE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	0.648648649	0.648648649	1	0.105059305	0.105059305	1	0.22641146	0.613614445	0.368980004	0.88981289	0.88981289	1	0.064889571	0.064889571	1	0.182305332	0.182305332	1	7	4	1	1	0.000000003	1.25E-54	0.135292269	0.085302553	0.000998458	0.000000348	YES	1_1	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	7339517	G	T	GRM7	CCDS43042.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	45	7	15.6	35	2	5.7	31	3	9.7	330	0	0	174	35	20.1	77	3	3.9	130	9	6.9	TRUE	TRUE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	0.648648649	0.648648649	1	0.176128834	0.176128834	1	0.285219632	0.77299482	0.368980004	0.835758836	0.835758836	1	0.120509202	0.120509202	1	0.202888192	0.549862295	0.368980004	7	6	1	1	0.000000003	9.56E-45	0.013332991	0.006942426	0.000505952	0.000000025	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	7475338	T	C	GRM7	CCDS43042.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	47	26	55.3	47	13	27.7	32	17	53.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	2.299376299	1.14968815	2	0.855924335	0.855924335	1	1.561356953	1.140525756	1.368980004	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.69E-47	1	1.47E-19	1	4.02E-31	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	7811242	G	T	AC024171.1	ENST00000510631	r.?	-	-	intronic	46	0	0	49	0	0	60	12	20	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	0	0	1	0.61799591	0.61799591	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.74E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	9010452	G	A	RAD18	ENST00000413832	r.?	-	-	upstream	38	0	0	43	0	0	60	16	26.7	61	1	1.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	0	0	1	0.82502454	0.82502454	1	0.047046537	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.86E-23	1	0.263440347	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	10499399	G	T	ATP2B2	CCDS2601.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	48	0	0	55	18	32.7	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	0	0	1	1.010423313	1.010423313	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.61E-28	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	10663606	C	T	ATP2B2	CCDS2601.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	40	0	0	45	11	24.4	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	0	0	1	0.75395501	0.75395501	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.24E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	12009860	C	A	-	-	-	-	-	-	46	0	0	47	0	0	34	9	26.5	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	0	0	1	0.818844581	0.818844581	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.15E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	12223768	C	A	SYN2	ENST00000341648	r.?	-	-	intronic	38	0	0	37	0	0	38	1	2.6	43	6	14	0	0	NA	4	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	0	0	1	0.080339468	0.080339468	1	0.411657201	1.115662627	0.368980004	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.173434892	1	8.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	13098141	G	A	IQSEC1	ENST00000435445	r.?	-	-	intronic	41	0	0	42	5	11.9	38	0	0	34	0	0	40	0	0	137	26	19	88	1	1.1	99	1	1	FALSE	TRUE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	0.494802495	0.494802495	1	0	0	1	0	NA	0	0.79002079	0.79002079	1	0.033989775	0.033989775	1	0.029404086	0.029404086	1	NA	4	1	1	0.00000228	6.15E-33	1	0.356673997	1	0.391185491	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	15855517	C	T	ANKRD28	CCDS46769.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	50	0	0	44	14	31.8	43	1	2.3	236	0	0	179	1	0.6	71	22	31	94	0	0	FALSE	TRUE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	0	0	1	0.982613497	0.982613497	1	0.067629397	NA	0	0.024948025	0.024948025	1	0.957893661	0.957893661	1	0	0	1	NA	1	1	1	1	0.592308691	6.10E-22	2.34E-33	0.193893409	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	16897391	G	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	50	21	42	49	11	22.4	36	17	47.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	1.746361746	0.873180873	2	0.692155419	0.692155419	1	1.387872848	1.387872848	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.79E-35	1	1.19E-15	1	6.00E-30	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	17017895	G	T	PLCL2	CCDS33713.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	43	19	44.2	36	10	27.8	39	17	43.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1	1.368980004	2	1	1	0	0	0	1	1	0.631019996	NA	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.368980004	1.837837838	0.918918919	2	0.859014315	0.859014315	1	1.282018139	1.282018139	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.36E-32	1	2.21E-15	1	3.51E-29	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	19020803	C	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	27	10	37	38	1	2.6	30	9	30	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.168461538	1.168461538	1	0.080339468	0.080339468	1	0.771428571	0.771428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.62E-17	1	0.173434892	1	2.54E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	19551848	C	A	KCNH8	CCDS2632.1	r.2307-7c>a	c.2041-7C>A	p.?	splice region	35	0	0	48	11	22.9	43	0	0	40	0	0	402	0	0	130	30	23.1	65	0	0	76	0	0	TRUE	TRUE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.723182952	0.723182952	1	0	0	1	0	0	1	0.72949896	0.72949896	1	0	0	1	0	0	1	6	4	1	1	9.31E-16	1.50E-40	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	20165240	G	A	KAT2B	CCDS2634.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	46	0	0	41	9	22	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.679795501	0.679795501	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.92E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	20572026	C	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	28	0	0	34	0	0	38	7	18.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.473142857	0.473142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	8.61E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	21470054	G	T	ZNF385D	CCDS2636.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	31	0	0	37	5	13.5	40	0	0	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.417147239	0.417147239	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000119	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	22552988	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	26	8	30.8	51	3	5.9	23	10	43.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.972665281	0.972665281	1	0.182308793	0.182308793	1	1.118571429	1.118571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.63E-13	1	0.002175924	1	1.05E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	23783422	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	41	0	0	36	9	25	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.772494888	0.772494888	1	0.056571429	0.056571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.63E-13	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	25835873	A	G	OXSM	CCDS2643.1	r.1367a>g	c.1268A>G	p.N423S	missense	41	0	0	42	12	28.6	34	13	38.2	46	12	26.1	308	1	0.3	157	48	30.6	80	20	25	93	38	40.9	TRUE	TRUE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.903189189	0.903189189	1	1.180372188	1.180372188	1	0.671142857	0.671142857	1	0.966349272	0.966349272	1	0.772494888	0.772494888	1	1.051714286	1.051714286	1	8	5	1	0.78644543	2.35E-18	1.36E-70	1.03E-21	2.53E-28	8.12E-18	4.84E-62	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	28730467	G	A	-	-	-	-	-	-	16	0	0	23	4	17.4	27	12	44.4	22	12	54.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.549492723	0.549492723	1	1.37195092	1.37195092	1	1.401428571	1.401428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.00000513	1	3.96E-21	1	1.51E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	29089647	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	47	0	0	33	13	39.4	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.217451943	1.217451943	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.37E-22	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	29357446	T	A	RBMS3	CCDS33725.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	33	9	27.3	40	0	0	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.862135135	0.862135135	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	6.76E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	30723558	C	A	TGFBR2	CCDS2648.1	r.?	-	-	intronic	40	1	2.5	25	0	0	32	9	28.1	36	5	13.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.868284254	0.868284254	1	0.357428571	0.357428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	0.181679879	1	1	1	4.94E-14	1	0.00000104	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	30725195	T	A	TGFBR2	CCDS2648.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	37	10	27	50	23	46	40	18	45	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852661123	0.852661123	1	1.421390593	1.421390593	1	1.157142857	1.157142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.01E-15	1	1.13E-39	1	3.90E-31	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	32304543	C	T	CMTM8	CCDS2652.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	41	14	34.1	42	1	2.4	45	10	22.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.076879418	1.076879418	1	0.074159509	0.074159509	1	0.570857143	0.570857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.90E-22	1	0.189842622	1	2.66E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	33909862	A	G	PDCD6IP	CCDS2660.1	r.4829a>g	c.?	p.?	3'UTR variant	38	0	0	38	0	0	40	0	0	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.285428571	0.285428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	38798830	C	T	SCN10A	CCDS33736.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	32	0	0	40	10	25	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.772494888	0.772494888	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.22E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	44567014	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	32	0	0	25	8	32	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.988793456	0.988793456	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.92E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	44722518	C	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	29	0	0	47	15	31.9	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.985703476	0.985703476	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.97E-23	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	47564071	C	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	43	0	0	43	13	30.2	27	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.933173824	0.933173824	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.88E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	50348996	C	T	HYAL1	CCDS2816.1	r.?	-	-	intronic	48	1	2.1	41	11	26.8	37	0	0	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.846345114	0.846345114	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	0.213845552	1	1.34E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	52548799	C	T	STAB1	CCDS33768.1	r.3837c>u	c.3761C>T	p.T1254M	missense	49	0	0	38	11	28.9	39	3	7.7	44	13	29.5	11	0	0	170	51	30	257	14	5.4	138	18	13	TRUE	TRUE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.912663202	0.912663202	1	0.237928425	0.237928425	1	0.758571429	0.758571429	1	0.947401247	0.947401247	1	0.166858896	0.166858896	1	0.334285714	0.334285714	1	7	6	1	1	5.19E-17	2.08E-74	0.000998458	8.62E-11	5.49E-20	3.49E-20	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	57796859	C	T	SLMAP	CCDS33774.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	37	0	0	47	16	34	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.050593047	1.050593047	1	0.051428571	0.051428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.98E-25	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	59612578	A	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	38	9	23.7	35	0	0	24	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.748446985	0.748446985	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.79E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	59617355	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	21	8	38.1	43	15	34.9	37	11	29.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.203199584	1.203199584	1	1.078402863	1.078402863	1	0.763714286	0.763714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	7.50E-14	1	4.05E-24	1	3.70E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	61201681	G	C	FHIT	CCDS2894.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	37	9	24.3	48	1	2.1	36	4	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.76739501	0.76739501	1	0.064889571	0.064889571	1	0.285428571	0.285428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.14E-13	1	0.213845552	1	0.0000324	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	61201690	A	C	FHIT	CCDS2894.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	39	9	23.1	52	2	3.8	40	4	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.72949896	0.72949896	1	0.117419223	0.117419223	1	0.257142857	0.257142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.62E-13	1	0.028101652	1	0.0000495	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	62871758	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	33	0	0	30	6	20	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.61799591	0.61799591	1	0.072	0.072	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.37E-09	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	62918605	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	37	12	32.4	40	1	2.5	33	11	33.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.023193347	1.023193347	1	0.077249489	0.077249489	1	0.856285714	0.856285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.03E-19	1	0.181679879	1	8.54E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	65430858	T	C	MAGI1	CCDS33781.1	r.?	-	-	intronic	50	0	0	35	14	40	40	0	0	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.263201663	1.263201663	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.28E-23	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	67545749	C	T	SUCLG2	CCDS43104.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	35	11	31.4	44	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.991613306	0.991613306	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.82E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	70713196	C	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	34	1	2.9	50	12	24	38	5	13.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.091582121	0.091582121	1	0.741595092	0.741595092	1	0.339428571	0.339428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.156694864	1	2.49E-17	1	0.00000137	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	72142605	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	41	13	31.7	38	2	5.3	30	7	23.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.001087318	1.001087318	1	0.163768916	0.163768916	1	0.599142857	0.599142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.89E-20	1	0.015598339	1	1.44E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	72744037	G	A	AC103560.1	ENST00000509224	r.?	-	-	intronic	45	0	0	32	0	0	35	8	22.9	34	6	17.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.707605317	0.707605317	1	0.452571429	0.452571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	8.15E-12	1	1.86E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	74475828	C	T	CNTN3	CCDS33790.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	29	0	0	41	0	0	34	6	17.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.452571429	0.452571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	1.86E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	74788982	A	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	31	8	25.8	26	3	11.5	43	9	20.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.814765073	0.814765073	1	0.355347648	0.355347648	1	0.537428571	0.537428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.78E-12	1	0.000298167	1	9.45E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	81841600	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	27	0	0	36	7	19.4	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.599456033	0.599456033	1	0.156857143	0.156857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.74E-10	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	84272736	C	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	33	10	30.3	32	10	31.2	35	11	31.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.95687526	0.95687526	1	0.96407362	0.96407362	1	0.807428571	0.807428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	8.14E-16	1	5.70E-16	1	1.82E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	84387657	G	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	35	11	31.4	42	0	0	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.991613306	0.991613306	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.82E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	86745216	C	A	-	-	-	-	-	-	50	0	0	35	0	0	60	0	0	44	5	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2.753405805	1.434295286	1	1	1	0	1	0	1	0.246594195	0.565704714	NA	2	1	NA	1	1	NA	0.753405805	0.434295286	0	0	1	0	0	1	0.34265252	0.788985123	0.434295286	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000288	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	88310196	C	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	27	5	18.5	33	1	3	23	4	17.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1.061245898	1.064914624	1	1	1	0	0	0	1	0.938754102	0.935085376	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.061245898	0.064914624	0.584230769	0.584230769	1	0.094536763	0.094536763	1	0.458723716	0.458723716	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.00000023	1	0.15245715	1	0.00000513	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	89936498	T	G	-	-	-	-	-	-	38	0	0	26	3	11.5	34	1	2.9	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1.061245898	1.064914624	1	1	1	0	0	0	1	0.938754102	0.935085376	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.061245898	0.064914624	0.363170478	0.363170478	1	0.091385538	0.091385538	1	0.073817609	0.073817609	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000298167	1	0.156694864	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	93642836	C	G	PROS1	CCDS2923.1	r.?	-	-	intronic	54	0	0	35	0	0	70	5	7.1	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	0.348934681	0.348934681	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.0000289	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	94347657	T	G	-	-	-	-	-	-	48	0	0	40	13	32.5	73	1	1.4	42	8	19	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	1.026351351	1.026351351	1	0.068804022	0.068804022	1	0.868571429	0.868571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.30E-20	1	0.306438632	1	3.96E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	95940671	T	G	-	-	-	-	-	-	46	0	0	49	6	12.2	61	24	39.3	52	13	25	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.227637236	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	0.772362764	0.175406579	1	2	2	NA	1	1	NA	0.227637236	0.824593421	NA	0.53504825	0.53504825	1	1.931427178	1.058552089	1.824593421	0.892857143	0.892857143	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.000000182	1	2.97E-39	1	6.47E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	97368985	C	T	EPHA6	CCDS46876.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	38	15	39.5	66	13	19.7	51	13	25.5	250	0	0	168	49	29.2	102	21	20.6	128	43	33.6	TRUE	TRUE	2.227637236	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	0.772362764	0.175406579	1	2	2	NA	1	1	NA	0.227637236	0.824593421	NA	1.73232835	1.411107696	1.227637236	0.968170875	0.968170875	1	0.910714286	0.910714286	1	1.280607287	1.043147967	1.227637236	1.012402032	1.012402032	1	1.2	1.2	1	8	7	1	1	4.24E-25	7.38E-71	1.95E-17	1.05E-27	4.87E-19	1.70E-65	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	97877349	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	33	0	0	57	12	21.1	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.227637236	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	0.772362764	0.175406579	1	2	2	NA	1	1	NA	0.227637236	0.824593421	NA	0	0	1	1.036974897	1.036974897	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.40E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	98208556	T	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	61	21	34.4	74	5	6.8	64	28	43.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.227637236	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	0.772362764	0.175406579	1	2	2	NA	1	1	NA	0.227637236	0.824593421	NA	1.508660639	1.228914044	1.227637236	0.334190962	0.334190962	1	1.564285714	1.564285714	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.80E-33	1	0.0000378	1	3.50E-47	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	98401959	G	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	48	0	0	71	0	0	63	7	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.227637236	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	0.772362764	0.175406579	1	2	2	NA	1	1	NA	0.227637236	0.824593421	NA	0	0	1	0	0	1	0.396428571	0.396428571	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	3.38E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	98578863	A	T	DCBLD2	CCDS46878.1	r.?	-	-	intronic	50	0	0	67	0	0	56	9	16.1	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.227637236	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	0.772362764	0.175406579	1	2	2	NA	1	1	NA	0.227637236	0.824593421	NA	0	0	1	0.791246248	0.791246248	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.20E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	99005139	T	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	54	3	5.6	57	2	3.5	53	12	22.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.227637236	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	0.772362764	0.175406579	1	2	2	NA	1	1	NA	0.227637236	0.824593421	NA	0.245595918	1.078891674	0.227637236	0.172010054	0.172010054	1	0.807142857	0.807142857	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.00256299	1	0.03327602	1	5.39E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	99435419	C	T	COL8A1	CCDS2934.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	52	0	0	66	10	15.2	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.227637236	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	0.772362764	0.175406579	1	2	2	NA	1	1	NA	0.227637236	0.824593421	NA	0	NA	0	0.747015092	0.747015092	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.60E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	101481333	C	T	CEP97	CCDS2944.1	r.2574c>u	c.1822C>T	p.R608*	nonsense	33	0	0	61	2	3.3	53	1	1.9	55	8	14.5	490	0	0	161	1	0.6	83	0	0	127	9	7.1	TRUE	FALSE	2.227637236	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	0.772362764	0.175406579	1	2	2	NA	1	1	NA	0.227637236	0.824593421	NA	0.144726166	0.635775451	0.227637236	0.093376886	0.093376886	1	0.517857143	0.517857143	1	0.026313848	0.026313848	1	0	NA	0	0.253571429	0.253571429	1	7	NA	1	1	0.037660755	0.553813938	0.233303855	1	3.86E-10	2.04E-08	YES	1_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	102170258	C	T	ZPLD1	CCDS2947.1	r.?	-	-	intronic	52	0	0	50	18	36	69	3	4.3	53	10	18.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	NA	2.824593421	3	NA	1	2	NA	1	1	NA	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	NA	NA	1	0.211326638	0.211326638	1	0.864	0.864	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	5.92E-29	1	0.005121501	1	1.57E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	102170700	C	G	ZPLD1	CCDS2947.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	44	13	29.5	58	0	0	41	11	26.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	NA	2.824593421	3	NA	1	2	NA	1	1	NA	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	NA	NA	1	0	NA	0	1.225142857	1.225142857	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	5.49E-20	1	1	1	1.34E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	102170739	C	G	ZPLD1	CCDS2947.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	45	12	26.7	77	2	2.6	53	9	17	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	NA	2.824593421	3	NA	1	2	NA	1	1	NA	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	NA	NA	1	0.127778897	0.127778897	1	0.777142857	0.777142857	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	6.03E-18	1	0.057170369	1	7.10E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	102172102	C	G	ZPLD1	CCDS2947.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	61	19	31.1	62	0	0	44	8	18.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	NA	2.824593421	3	NA	1	2	NA	1	1	NA	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	NA	NA	1	0	NA	0	0.832	0.832	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	4.64E-29	1	1	1	5.90E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	102172421	C	G	ZPLD1	CCDS2947.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	38	14	36.8	55	2	3.6	44	7	15.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	NA	2.824593421	3	NA	1	2	NA	1	1	NA	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	NA	NA	1	0.176924627	0.176924627	1	0.726857143	0.726857143	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	5.28E-23	1	0.031164417	1	2.55E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	102172828	C	G	ZPLD1	CCDS2947.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	37	8	21.6	55	1	1.8	58	9	15.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	NA	2.824593421	3	NA	1	2	NA	1	1	NA	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	NA	NA	1	0.088462313	NA	0	0.708571429	0.708571429	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.33E-11	1	0.240951649	1	1.67E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	102173822	C	A	ZPLD1	CCDS2947.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	49	12	24.5	57	1	1.8	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	NA	2.824593421	3	NA	1	2	NA	1	1	NA	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	NA	NA	1	0.088462313	NA	0	0.292571429	0.292571429	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.90E-17	1	0.248523156	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	102173983	C	G	ZPLD1	CCDS2947.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	41	12	29.3	61	2	3.3	53	13	24.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	NA	2.824593421	3	NA	1	2	NA	1	1	NA	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	NA	NA	1	0.162180908	0.162180908	1	1.12	1.12	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.69E-18	1	0.037660755	1	8.53E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	102335126	C	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	26	12	46.2	62	0	0	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	1.458997921	1.458997921	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.21E-21	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	104806681	T	C	-	-	-	-	-	-	54	0	0	50	8	16	51	0	0	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.766433618	2.824593421	2.268954577	1	1	1	1	1	1	0.233566382	0.175406579	0.731045423	2	2	2	1	1	1	0.766433618	0.824593421	0.268954577	0.787910044	0.787910044	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.74E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	105114601	G	C	ALCAM	CCDS33810.1	r.?	-	-	intronic	49	0	0	41	0	0	45	18	40	54	3	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.766433618	2.824593421	2.268954577	1	1	1	1	1	1	0.233566382	0.175406579	0.731045423	2	2	2	1	1	1	0.766433618	0.824593421	0.268954577	0	0	1	1.965829189	1.077406706	1.824593421	0.215061456	0.79961999	0.268954577	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	5.76E-30	1	0.00256299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	106594512	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	60	0	0	63	7	11.1	69	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.766433618	2.824593421	2.268954577	1	1	1	1	1	1	0.233566382	0.175406579	0.731045423	2	2	2	1	1	1	0.766433618	0.824593421	0.268954577	0	0	1	0.5455176	0.661559486	0.824593421	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.38E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	106674163	T	C	-	-	-	-	-	-	50	0	0	58	0	0	73	28	38.4	68	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.766433618	2.824593421	2.268954577	1	1	1	1	1	1	0.233566382	0.175406579	0.731045423	2	2	2	1	1	1	0.766433618	0.824593421	0.268954577	0	0	1	1.887196021	1.034310438	1.824593421	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.67E-45	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	106852560	C	T	-	-	-	-	-	-	49	0	0	51	0	0	56	10	17.9	60	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.766433618	2.824593421	2.268954577	1	1	1	1	1	1	0.233566382	0.175406579	0.731045423	2	2	2	1	1	1	0.766433618	0.824593421	0.268954577	0	0	1	0.879708562	0.879708562	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.82E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	109109170	C	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	50	4	8	56	0	0	44	7	15.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.766433618	2.824593421	2.268954577	1	1	1	1	1	1	0.233566382	0.175406579	0.731045423	2	2	2	1	1	1	0.766433618	0.824593421	0.268954577	0.393955022	0.514010624	0.766433618	0	0	1	0.610620921	0.610620921	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.000119787	1	1	1	2.55E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	109241859	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	46	12	26.1	72	2	2.8	43	14	32.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.824593421	2.268954577	1	1	1	1	1	1	1	0.175406579	0.731045423	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.824593421	0.268954577	1.085239085	1.085239085	1	0.137608043	0.137608043	1	1.251964906	1.251964906	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	8.12E-18	1	0.050755634	1	4.18E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	109512920	G	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	48	0	0	67	15	22.4	56	3	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.824593421	2.268954577	1	1	1	1	1	1	1	0.175406579	0.731045423	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.824593421	0.268954577	0	0	1	1.100864346	1.100864346	1	0.20738069	0.771062133	0.268954577	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	8.27E-21	1	0.00284314	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	109969791	G	A	-	-	-	-	-	-	46	0	0	49	9	18.4	57	2	3.5	58	9	15.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.824593421	2.268954577	1	1	1	1	1	1	1	0.175406579	0.731045423	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.824593421	0.268954577	0.765072765	0.765072765	1	0.172010054	0.172010054	1	0.595259388	0.595259388	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.35E-12	1	0.03327602	1	1.67E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	110537589	A	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	53	0	0	61	19	31.1	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.824593421	2.268954577	1	1	1	1	1	1	1	0.175406579	0.731045423	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.824593421	0.268954577	0	0	1	1.528432194	0.837683714	1.824593421	0.161296092	0.599714993	0.268954577	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	4.64E-29	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	110890259	C	G	PVRL3	ENST00000493615	r.?	-	-	intronic	37	0	0	38	13	34.2	53	0	0	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	1.080037422	1.080037422	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	5.88E-21	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	110962002	G	A	PVRL3	ENST00000485506	r.?	-	-	intronic	40	0	0	42	12	28.6	62	0	0	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0.903189189	0.903189189	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	2.35E-18	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	111202909	C	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	39	8	20.5	64	12	18.8	42	8	19	467	0	0	134	36	26.9	102	21	20.6	86	36	41.9	TRUE	TRUE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0.647390852	0.647390852	1	0.923939719	0.923939719	1	0.868571429	0.868571429	1	0.849503119	0.849503119	1	1.012402032	1.012402032	1	1.915428571	0.957714286	2	8	5	1	1	2.09E-11	5.13E-51	6.30E-16	1.05E-27	3.96E-11	2.44E-59	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	111394446	G	T	PLCXD2	CCDS46884.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	43	0	0	54	1	1.9	54	6	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	0.093376886	0.093376886	1	0.507428571	0.507428571	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.237137336	1	0.000000329	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	113907492	T	G	DRD3	CCDS2978.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	36	0	0	70	11	15.7	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	0.771587956	0.771587956	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	8.06E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	116127815	G	A	LSAMP	CCDS2982.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	42	0	0	67	10	14.9	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	0.732271373	0.732271373	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.87E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	117881509	C	T	-	-	-	-	-	-	52	0	0	40	16	40	59	14	23.7	37	12	32.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	1.263201663	1.263201663	1	1.164753794	1.164753794	1	1.481142857	1.481142857	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	8.56E-27	1	6.58E-20	1	4.03E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	118326158	A	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	35	0	0	57	0	0	39	8	20.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	0	NA	0	0.937142857	0.937142857	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	2.09E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	118504014	C	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	41	0	0	53	0	0	27	4	14.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	0	NA	0	0.676571429	0.676571429	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.00001	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	118534201	G	C	-	-	-	-	-	-	54	0	0	32	0	0	48	21	43.8	39	6	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	2.152582961	1.179760344	1.824593421	0.704	0.704	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	9.35E-36	1	4.43E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	118825275	G	A	IGSF11	CCDS2983.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	37	12	32.4	49	1	2	46	10	21.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	1.023193347	1.023193347	1	0.098291459	0.098291459	1	0.992	0.992	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.03E-19	1	0.217776325	1	3.38E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	119320228	T	A	PLA1A	CCDS2991.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	34	7	20.6	59	0	0	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0.650548857	0.650548857	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	3.73E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	120269739	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	45	0	0	66	12	18.2	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	0.894452281	0.894452281	1	0.096	0.096	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	9.36E-16	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	121070315	G	A	STXBP5L	CCDS43137.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	32	0	0	53	14	26.4	35	4	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	1.297447264	1.297447264	1	0.521142857	0.521142857	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.22E-20	1	0.0000289	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	121105713	C	T	STXBP5L	CCDS43137.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	31	0	0	69	26	37.7	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	1.85279401	1.015455821	1.824593421	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	8.50E-42	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	121470326	G	T	GOLGB1	CCDS3004.1	r.?	-	-	upstream	24	1	4.2	22	1	4.5	46	0	0	31	4	12.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0.142110187	NA	0	0	0	1	0.589714286	0.589714286	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0.113346489	1	0.104413009	1	1	1	0.0000177	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	123128173	T	A	ADCY5	CCDS3022.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	38	0	0	63	14	22.2	37	4	10.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	1.0910352	1.0910352	1	0.493714286	0.493714286	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.81E-19	1	0.0000362	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	125101472	A	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	30	0	0	59	21	35.6	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	1.749587978	0.958891969	1.824593421	0.406857143	0.406857143	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.06E-33	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	126657658	G	A	CHCHD6	CCDS3041.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	26	0	0	68	20	29.4	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	1.444884454	0.791893929	1.824593421	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	6.23E-30	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	127392286	G	A	PODXL2	CCDS3044.1	r.?	-	-	downstream	50	0	0	34	0	0	69	10	14.5	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	0.712613081	0.712613081	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.54E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	128283131	G	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	28	0	0	46	6	13	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	0.638894486	0.638894486	1	0.269714286	0.269714286	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000000123	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	129003163	T	G	C3orf37	CCDS33852.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	41	0	0	60	32	53.3	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	2.619467394	1.435644436	1.824593421	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.11E-57	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	129060437	G	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	36	0	0	73	24	32.9	31	2	6.5	80	1	1.2	105	0	0	164	53	32.3	71	7	9.9	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	1.616894508	0.886167016	1.824593421	0.297142857	0.297142857	1	0	NA	0	1.58740707	0.870005915	1.824593421	0.452571429	0.452571429	1	NA	NA	1	0.33035218	1	1	5.58E-37	2.81E-79	0.010558179	7.85E-08	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	129904109	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	34	0	0	62	17	27.4	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	1.346592994	1.346592994	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	4.56E-25	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	130173968	T	C	COL29A1	ENST00000312481	r.?	-	-	intronic	39	0	0	32	0	0	52	9	17.3	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	0.850221124	0.850221124	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	5.92E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	130782860	G	A	NEK11	CCDS3069.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	37	8	21.6	67	2	3	39	8	20.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0.682128898	0.682128898	1	0.147437189	0.147437189	1	0.937142857	0.937142857	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.33E-11	1	0.044622585	1	2.09E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	131011509	G	A	NEK11	CCDS3069.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	29	10	34.5	70	2	2.9	42	8	19	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	1.089511435	1.089511435	1	0.142522616	0.142522616	1	0.868571429	0.868571429	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.79E-16	1	0.048267597	1	3.96E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	132515992	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	26	8	30.8	52	9	17.3	32	17	53.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0.972665281	0.972665281	1	0.850221124	0.850221124	1	2.427428571	1.213714286	2	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.63E-13	1	5.92E-12	1	4.02E-31	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	133140895	G	C	BFSP2	CCDS33859.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	39	0	0	60	4	6.7	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	0	1	0.329276389	0.39931969	0.824593421	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000243755	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	133254068	C	T	-	-	-	-	-	-	53	0	0	40	10	25	61	14	23	61	21	34.4	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	1.03950104	1.03950104	1	1.130351783	1.130351783	1	1.228571429	1.228571429	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	7.22E-15	1	1.10E-19	1	4.80E-33	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	133423844	C	T	TF	CCDS3080.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	33	0	0	65	20	30.8	54	6	11.1	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	0	1	1.513688475	0.829603164	1.824593421	0.396428571	0.396428571	1	NA	NA	1	0	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	2.18E-30	1	0.000000329	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	134797225	C	A	EPHB1	CCDS46921.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	44	0	0	64	1	1.6	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	0	1	0.078633168	0.078633168	1	0.435714286	0.435714286	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.274433592	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	134827022	C	T	EPHB1	CCDS46921.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	39	0	0	59	9	15.3	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	0	1	0.751929665	0.751929665	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.96E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	135142249	A	G	-	-	-	-	-	-	48	0	0	43	4	9.3	60	23	38.3	61	15	24.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0.386694387	0.386694387	1	1.882281448	1.031616921	1.824593421	0.878571429	0.878571429	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.000066	1	2.33E-37	1	1.73E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	135269519	C	A	-	-	-	-	-	-	46	0	0	49	0	0	60	27	45	49	1	2	267	0	0	136	0	0	94	27	28.7	108	4	3.7	TRUE	TRUE	2	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	0	1	2.211557837	1.212082545	1.824593421	0.071428571	0.071428571	1	0	0	1	1.410482443	0.773039312	1.824593421	0.132142857	0.132142857	1	2	1	1	1	1	1	5.59E-46	1.48E-39	0.217776325	0.00221591	YES	0_0	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	135349940	C	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	41	0	0	48	12	25	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	0	1	1.228643243	1.228643243	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.44E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	136726511	C	G	IL20RB	CCDS3093.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	51	9	17.6	62	2	3.2	60	7	11.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.810587903	2.824593421	2.506602062	1	1	1	1	1	1	0.189412097	0.175406579	0.493397938	2	2	2	1	1	1	0.810587903	0.824593421	0.506602062	0.874472203	0.874472203	1	0.157266335	0.157266335	1	0.477129584	0.941823217	0.506602062	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.92E-12	1	0.038789653	1	2.39E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	137480945	C	A	SOX14	CCDS3094.1	r.?	-	-	upstream	39	0	0	57	0	0	74	29	39.2	52	3	5.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.810587903	2.824593421	2.506602062	1	1	1	1	1	1	0.189412097	0.175406579	0.493397938	2	2	2	1	1	1	0.810587903	0.824593421	0.506602062	0	0	1	1.926512605	1.055858572	1.824593421	0.236525777	0.466886723	0.506602062	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	4.68E-47	1	0.002300591	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	137870299	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	69	11	15.9	71	7	9.9	54	5	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.810587903	2.824593421	2.506602062	1	1	1	1	1	1	0.189412097	0.175406579	0.493397938	2	2	2	1	1	1	0.810587903	0.824593421	0.506602062	0.790006138	0.790006138	1	0.486542724	0.590039541	0.824593421	0.379256849	0.748628711	0.506602062	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.82E-14	1	7.85E-08	1	0.00000806	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	140469978	A	G	-	-	-	-	-	-	45	0	0	59	11	18.6	76	0	0	69	0	0	0	0	NA	1	0	0	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.810587903	2.824593421	2.506602062	1	1	1	1	1	1	0.189412097	0.175406579	0.493397938	2	2	2	1	1	1	0.810587903	0.824593421	0.506602062	0.924158123	0.924158123	1	0	0	1	0	0	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.10E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	140749263	C	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	56	8	14.3	65	0	0	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.810587903	2.824593421	2.506602062	1	1	1	1	1	1	0.189412097	0.175406579	0.493397938	2	2	2	1	1	1	0.810587903	0.824593421	0.506602062	0.710508665	0.710508665	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	0	NA	0	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.48E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	141090814	T	G	ZBTB38	ENST00000509842	r.?	-	-	intronic	30	0	0	43	0	0	69	7	10.1	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.810587903	2.824593421	2.506602062	1	1	1	1	1	1	0.189412097	0.175406579	0.493397938	2	2	2	1	1	1	0.810587903	0.824593421	0.506602062	0	0	1	0.49637187	0.601959532	0.824593421	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.43E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	141578719	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	51	0	0	64	18	28.1	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.810587903	2.824593421	2.506602062	1	1	1	1	1	1	0.189412097	0.175406579	0.493397938	2	2	2	1	1	1	0.810587903	0.824593421	0.506602062	0	0	1	1.380995005	1.380995005	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.10E-26	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	142879298	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	41	11	26.8	71	0	0	51	1	2	292	0	0	236	35	14.8	151	1	0.7	211	7	3.3	TRUE	TRUE	2.435325272	2.824593421	2.506602062	1	1	1	1	1	1	0.564674728	0.175406579	0.493397938	2	2	2	1	1	1	0.435325272	0.824593421	0.506602062	1.231012287	1.231012287	1	0	0	1	0.081560613	0.081560613	1	0.679812756	0.679812756	1	0.034402011	0.034402011	1	0.134575011	0.134575011	1	6	4	1	1	1.34E-16	8.39E-40	1	0.530878656	0.225579006	0.000107425	YES	1_1	0_0	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	143539943	T	C	SLC9A9	CCDS33872.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	58	0	0	75	30	40	82	0	0	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.435325272	2.824593421	2.506602062	1	1	1	1	1	1	0.564674728	0.175406579	0.493397938	2	2	2	1	1	1	0.435325272	0.824593421	0.506602062	0	NA	0	1.965829189	1.077406706	1.824593421	0	0	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	5.85E-49	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	144770304	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	32	0	0	78	13	16.7	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.435325272	2.824593421	2.506602062	1	1	1	1	1	1	0.564674728	0.175406579	0.493397938	2	2	2	1	1	1	0.435325272	0.824593421	0.506602062	0	0	1	0.820733686	0.820733686	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.99E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	144770342	T	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	35	0	0	64	9	14.1	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.435325272	2.824593421	2.506602062	1	1	1	1	1	1	0.564674728	0.175406579	0.493397938	2	2	2	1	1	1	0.435325272	0.824593421	0.506602062	0	0	1	0.692954789	0.692954789	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.20E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	146082576	T	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	51	6	11.8	47	3	6.4	69	7	10.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.435325272	2.824593421	2.506602062	1	1	1	1	1	1	0.564674728	0.175406579	0.493397938	2	2	2	1	1	1	0.435325272	0.824593421	0.506602062	0.542012873	0.542012873	1	0.31453267	0.381439704	0.824593421	0.411881094	0.81302688	0.506602062	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.000000232	1	0.001719595	1	6.43E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	146358918	A	G	-	-	-	-	-	-	56	0	0	59	0	0	74	10	13.5	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.435325272	2.824593421	2.506602062	1	1	1	1	1	1	0.564674728	0.175406579	0.493397938	2	2	2	1	1	1	0.435325272	0.824593421	0.506602062	0	0	1	0.663467351	0.663467351	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.24E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	149136480	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	56	10	17.9	58	7	12.1	72	14	19.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.435325272	2.824593421	2.506602062	1	1	1	1	1	1	0.564674728	0.175406579	0.493397938	2	2	2	1	1	1	0.435325272	0.824593421	0.506602062	0.822205968	0.822205968	1	0.59466333	0.59466333	1	0.791137943	0.791137943	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.82E-13	1	1.88E-08	1	1.39E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	149205751	A	G	TM4SF4	CCDS46932.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	62	13	21	74	0	0	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.435325272	2.824593421	2.506602062	1	1	1	1	1	1	0.564674728	0.175406579	0.493397938	2	2	2	1	1	1	0.435325272	0.824593421	0.506602062	0.96459918	0.96459918	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	8.08E-18	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	150832137	G	A	MED12L	CCDS33876.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	50	8	16	57	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2.824593421	2.506602062	2	1	1	1	1	1	1	0.175406579	0.493397938	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.824593421	0.506602062	0.825280665	0.825280665	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.74E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	151930355	C	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	58	7	12.1	63	0	0	63	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2.824593421	2.506602062	2	1	1	1	1	1	1	0.175406579	0.493397938	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.824593421	0.506602062	0.624118503	0.624118503	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.88E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	152078912	G	A	MBNL1	CCDS3165.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	48	6	12.5	59	2	3.4	63	11	17.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2.824593421	2.506602062	2	1	1	1	1	1	1	0.175406579	0.493397938	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.824593421	0.506602062	0.64475052	0.64475052	1	0.167095481	0.167095481	1	0.713655361	0.713655361	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.00000016	1	0.035441897	1	2.37E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	152453319	G	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	74	15	20.3	53	0	0	77	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2.824593421	2.506602062	2	1	1	1	1	1	1	0.175406579	0.493397938	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.824593421	0.506602062	1.047074844	1.047074844	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.22E-20	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	152977184	A	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	53	0	0	49	8	16.3	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2.824593421	2.506602062	2	1	1	1	1	1	1	0.175406579	0.493397938	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.824593421	0.506602062	0	0	1	0.801075394	0.801075394	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.47E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	152992867	A	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	50	0	0	69	22	31.9	58	3	5.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2.824593421	2.506602062	2	1	1	1	1	1	1	0.175406579	0.493397938	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.824593421	0.506602062	0	0	1	1.567748778	0.859231848	1.824593421	0.212057593	0.418588096	0.506602062	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.12E-33	1	0.003141421	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	155607559	T	G	GMPS	CCDS46941.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	54	0	0	70	16	22.9	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2.824593421	2.506602062	2	1	1	1	1	1	1	0.175406579	0.493397938	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.824593421	0.506602062	0	0	1	1.12543721	1.12543721	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.93E-22	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	156300281	C	G	-	-	-	-	-	-	32	0	0	62	11	17.7	71	3	4.2	75	14	18.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2.824593421	2.506602062	2	1	1	1	1	1	1	0.175406579	0.493397938	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.824593421	0.506602062	0.912966736	0.912966736	1	0.206412065	0.206412065	1	0.762591729	0.762591729	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.96E-14	1	0.00554578	1	2.57E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	158010251	A	G	RSRC1	CCDS3181.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	47	6	12.8	73	3	4.1	53	3	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2.824593421	2.506602062	2	1	1	1	1	1	1	0.175406579	0.493397938	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.824593421	0.506602062	0.660224532	0.660224532	1	0.201497492	0.201497492	1	0.232447746	0.458836952	0.506602062	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.000000141	1	0.005990531	1	0.002429596	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	158087209	A	C	RSRC1	CCDS3181.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	42	6	14.3	67	2	3	50	6	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2.824593421	2.506602062	2	1	1	1	1	1	1	0.175406579	0.493397938	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.824593421	0.506602062	0.737594595	0.737594595	1	0.147437189	0.147437189	1	0.489363676	0.96597253	0.506602062	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.02E-08	1	0.044622585	1	0.000000206	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	159069954	C	T	SCHIP1	CCDS3186.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	50	9	18	51	1	2	56	11	19.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.369638404	2.824593421	2.506602062	1	1	1	1	1	1	0.630361596	0.175406579	0.493397938	2	2	2	1	1	1	0.369638404	0.824593421	0.506602062	0.814975661	0.814975661	1	0.098291459	0.098291459	1	0.799294004	0.799294004	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.07E-12	1	0.225579006	1	5.91E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	159232965	C	G	SCHIP1	CCDS3186.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	36	6	16.7	64	0	0	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.369638404	2.824593421	2.506602062	1	1	1	1	1	1	0.630361596	0.175406579	0.493397938	2	2	2	1	1	1	0.369638404	0.824593421	0.506602062	0.756116308	0.756116308	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.68E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	160206205	C	A	TRIM59	ENST00000468542	r.?	-	-	upstream	48	0	0	62	11	17.7	68	2	2.9	84	8	9.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.369638404	2.824593421	2.506602062	1	1	1	1	1	1	0.630361596	0.175406579	0.493397938	2	2	2	1	1	1	0.369638404	0.824593421	0.506602062	0.801392733	0.801392733	1	0.142522616	0.142522616	1	0.38741291	0.764728253	0.506602062	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.96E-14	1	0.045825786	1	1.21E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	161072389	C	G	C3orf57	CCDS33887.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	52	6	11.5	74	0	0	68	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.369638404	2.824593421	2.506602062	1	1	1	1	1	1	0.630361596	0.175406579	0.493397938	2	2	2	1	1	1	0.369638404	0.824593421	0.506602062	0.520678895	1.408616879	0.369638404	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000000261	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	161668978	C	G	-	-	-	-	-	-	48	0	0	51	0	0	55	17	30.9	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.369638404	2.824593421	2.506602062	1	1	1	1	1	1	0.630361596	0.175406579	0.493397938	2	2	2	1	1	1	0.369638404	0.824593421	0.506602062	0	0	1	1.518603048	0.832296681	1.824593421	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.35E-26	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	162729934	G	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	42	9	21.4	71	0	0	44	0	0	206	0	0	149	38	25.5	82	0	0	93	0	0	TRUE	TRUE	2.369638404	2.824593421	2.184178358	1	1	1	1	1	1	0.630361596	0.175406579	0.815821642	2	2	2	1	1	1	0.369638404	0.824593421	0.184178358	0.968915508	0.968915508	1	0	0	1	0	0	1	1.154548853	1.154548853	1	0	0	1	0	0	1	6	4	1	1	7.51E-13	8.74E-53	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	163761291	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	58	8	13.8	61	14	23	55	14	25.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.369638404	2.824593421	2.184178358	1	1	1	1	1	1	0.630361596	0.175406579	0.815821642	2	2	2	1	1	1	0.369638404	0.824593421	0.184178358	0.624814674	0.624814674	1	1.130351783	1.130351783	1	0.957679767	0.957679767	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.99E-10	1	1.10E-19	1	2.19E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	165225040	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	43	14	32.6	58	1	1.7	43	6	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.369638404	2.824593421	2.184178358	1	1	1	1	1	1	0.630361596	0.175406579	0.815821642	2	2	2	1	1	1	0.369638404	0.824593421	0.184178358	1.476011475	1.476011475	1	0.083547741	0.083547741	1	0.52578497	0.52578497	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.18E-22	1	0.252280541	1	8.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	165771959	C	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	51	9	17.6	51	3	5.9	59	9	15.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.369638404	2.824593421	2.184178358	1	1	1	1	1	1	0.630361596	0.175406579	0.815821642	2	2	2	1	1	1	0.369638404	0.824593421	0.184178358	0.796865091	0.796865091	1	0.289959805	0.351639727	0.824593421	0.57460786	0.57460786	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.92E-12	1	0.002175924	1	1.96E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	167420763	C	A	PDCD10	CCDS3202.1	r.?	-	-	intronic	47	1	2.1	44	0	0	51	20	39.2	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.369638404	2.824593421	2.184178358	1	1	1	1	1	1	0.630361596	0.175406579	0.815821642	2	2	2	1	1	1	0.369638404	0.824593421	0.184178358	0	0	1	1.926512605	1.055858572	1.824593421	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	0.209895027	1	1	1	6.38E-33	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	170002434	C	G	PRKCI	CCDS3212.2	r.?	-	-	intronic	50	0	0	60	13	21.7	46	1	2.2	54	5	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.369638404	2.824593421	2.184178358	1	1	1	1	1	1	0.630361596	0.175406579	0.815821642	2	2	2	1	1	1	0.369638404	0.824593421	0.184178358	0.982498436	0.982498436	1	0.108120605	0.108120605	1	0.349271444	0.349271444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.07E-18	1	0.205924651	1	0.00000806	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	170535400	G	T	CLDN11	ENST00000486975	r.?	-	-	intronic	43	0	0	46	1	2.2	66	30	45.5	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.369638404	2.824593421	2.184178358	1	1	1	1	1	1	0.630361596	0.175406579	0.815821642	2	2	2	1	1	1	0.369638404	0.824593421	0.184178358	0.099608136	0.099608136	1	2.236130702	1.225550129	1.824593421	0.165246705	0.897210218	0.184178358	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.205924651	1	4.31E-51	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	171957721	C	T	FNDC3B	CCDS3217.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	32	7	21.9	43	0	0	23	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.369638404	2.824593421	2.184178358	1	1	1	1	1	1	0.630361596	0.175406579	0.815821642	2	2	2	1	1	1	0.369638404	0.824593421	0.184178358	0.991553721	0.991553721	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.36E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	172277103	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	58	12	20.7	68	0	0	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.369638404	2.824593421	2.184178358	1	1	1	1	1	1	0.630361596	0.175406579	0.815821642	2	2	2	1	1	1	0.369638404	0.824593421	0.184178358	0.93722201	0.93722201	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.76E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	172884963	G	C	-	-	-	-	-	-	41	0	0	42	0	0	65	12	18.5	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.369638404	2.824593421	2.184178358	1	1	1	1	1	1	0.630361596	0.175406579	0.815821642	2	2	2	1	1	1	0.369638404	0.824593421	0.184178358	0	0	1	0.909196	0.909196	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.70E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	174282588	G	T	NAALADL2	ENST00000434257	r.?	-	-	intronic	33	1	3	38	7	18.4	59	17	28.8	37	12	32.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.330248897	2.824593421	2.184178358	1	1	1	1	1	1	0.669751103	0.175406579	0.815821642	2	2	2	1	1	1	0.330248897	0.824593421	0.184178358	0.825838562	0.825838562	1	1.415397016	1.415397016	1	1.216816645	1.216816645	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	0.15245715	1	8.61E-10	1	1.74E-25	1	4.03E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	174686516	C	G	NAALADL2	CCDS46960.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	41	0	0	63	25	39.7	59	1	1.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.330248897	2.824593421	2.184178358	1	1	1	1	1	1	0.669751103	0.175406579	0.815821642	2	2	2	1	1	1	0.330248897	0.824593421	0.184178358	0	0	1	1.95108547	1.069326156	1.824593421	0.063845318	0.063845318	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.06E-41	1	0.256019138	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	175635360	G	C	-	-	-	-	-	-	45	0	0	55	11	20	71	3	4.2	67	11	16.4	144	1	0.7	63	11	17.5	22	0	0	38	12	31.6	TRUE	TRUE	2.330248897	2.824593421	2.184178358	1	1	1	1	1	1	0.669751103	0.175406579	0.815821642	2	2	2	1	1	1	0.330248897	0.824593421	0.184178358	0.897650611	0.897650611	1	0.206412065	0.206412065	1	0.615919536	0.615919536	1	0.785444285	0.785444285	1	0	0	1	1.18677179	1.18677179	1	7	6	1	0.514126036	4.77E-15	2.37E-14	0.00554578	1	4.85E-14	5.86E-19	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	175635494	G	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	50	10	20	53	2	3.8	51	11	21.6	581	1	0.2	230	31	13.5	102	2	2	141	15	10.6	TRUE	FALSE	2.330248897	2.824593421	2.184178358	1	1	1	1	1	1	0.669751103	0.175406579	0.815821642	2	2	2	1	1	1	0.330248897	0.824593421	0.184178358	0.897650611	0.897650611	1	0.186753773	0.186753773	1	0.811211097	0.811211097	1	0.605914162	0.605914162	1	0.098291459	NA	0	0.398094335	0.398094335	1	7	NA	1	0.945648703	8.36E-14	4.24E-34	0.029108399	0.092873916	1.94E-15	1.03E-15	YES	1_1	1_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	175635509	G	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	43	6	14	50	2	4	49	11	22.4	587	1	0.2	229	30	13.1	113	2	1.8	151	13	8.6	TRUE	FALSE	2.330248897	2.824593421	2.184178358	1	1	1	1	1	1	0.669751103	0.175406579	0.815821642	2	2	2	1	1	1	0.330248897	0.824593421	0.184178358	0.628355428	0.628355428	1	0.196582919	0.196582919	1	0.841255952	0.841255952	1	0.58796115	0.58796115	1	0.088462313	NA	0	0.322982196	0.322982196	1	7	NA	1	0.947258995	8.13E-08	1.14E-32	0.026131524	0.110164676	1.19E-15	1.29E-12	YES	1_1	1_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	175635521	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	45	6	13.3	50	2	4	51	11	21.6	592	0	0	228	31	13.6	119	2	1.7	145	14	9.7	TRUE	FALSE	2.330248897	2.824593421	2.184178358	1	1	1	1	1	1	0.669751103	0.175406579	0.815821642	2	2	2	1	1	1	0.330248897	0.824593421	0.184178358	0.596937656	0.596937656	1	0.196582919	0.196582919	1	0.811211097	0.811211097	1	0.610402416	0.610402416	1	0.083547741	NA	0	0.364293872	0.364293872	1	7	NA	1	1	0.000000108	3.20E-34	0.026131524	0.119923038	1.94E-15	3.61E-14	YES	1_1	1_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	175635621	G	C	-	-	-	-	-	-	44	0	0	39	5	12.8	61	2	3.3	83	8	9.6	531	1	0.2	227	36	15.9	126	2	1.6	151	21	13.9	TRUE	TRUE	2.330248897	2.824593421	2.184178358	1	1	1	1	1	1	0.669751103	0.175406579	0.815821642	2	2	2	1	1	1	0.330248897	0.824593421	0.184178358	0.574496391	0.574496391	1	0.162180908	0.162180908	1	0.360538265	0.360538265	1	0.713632236	0.713632236	1	0.078633168	0.078633168	1	0.522029363	0.522029363	1	7	6	1	0.930167776	0.00000156	5.39E-42	0.037660755	0.13156272	0.000000011	6.69E-24	YES	1_1	1_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	175635650	G	C	-	-	-	-	-	-	41	0	0	41	8	19.5	62	1	1.6	79	4	5.1	536	0	0	227	38	16.7	117	2	1.7	135	22	16.3	TRUE	TRUE	2.330248897	2.824593421	2.184178358	1	1	1	1	1	1	0.669751103	0.175406579	0.815821642	2	2	2	1	1	1	0.330248897	0.824593421	0.184178358	0.875209346	0.875209346	1	0.078633168	0.078633168	1	0.191535953	1.039948207	0.184178358	0.74953826	0.74953826	1	0.083547741	0.083547741	1	0.61216393	0.61216393	1	7	6	1	1	3.22E-11	3.51E-45	0.267123145	0.116646664	0.000696582	1.49E-26	YES	1_1	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	175635707	G	C	-	-	-	-	-	-	37	0	0	58	11	19	68	0	0	63	7	11.1	483	0	0	219	34	15.5	103	1	1	126	23	18.3	TRUE	TRUE	2.330248897	2.824593421	2.184178358	1	1	1	1	1	1	0.669751103	0.175406579	0.815821642	2	2	2	1	1	1	0.330248897	0.824593421	0.184178358	0.852768081	0.852768081	1	0	0	1	0.416872369	0.416872369	1	0.695679224	0.695679224	1	0.04914573	0.04914573	1	0.687276068	0.687276068	1	7	6	1	1	8.96E-15	2.02E-39	1	0.403270763	3.38E-08	6.74E-29	YES	1_1	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	178990336	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	54	8	14.8	66	0	0	58	7	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.330248897	2.824593421	2.560955132	1	1	1	1	1	1	0.669751103	0.175406579	0.439044868	2	2	2	1	1	1	0.330248897	0.824593421	0.560955132	0.664261452	0.664261452	1	0	0	1	0.500018428	0.891369736	0.560955132	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.31E-10	1	1	1	1.88E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	179244019	G	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	41	0	0	65	22	33.8	53	6	11.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.330248897	2.824593421	2.560955132	1	1	1	1	1	1	0.669751103	0.175406579	0.439044868	2	2	2	1	1	1	0.330248897	0.824593421	0.560955132	0	0	1	1.661125664	0.910408667	1.824593421	0.466959359	0.8324362	0.560955132	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	2.36E-34	1	0.000000293	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	179445488	T	G	USP13	CCDS3235.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	40	1	2.5	44	6	13.6	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.330248897	2.824593421	2.560955132	1	1	1	1	1	1	0.669751103	0.175406579	0.439044868	2	2	2	1	1	1	0.330248897	0.824593421	0.560955132	0.112206326	0.112206326	1	0.668381924	0.668381924	1	0.206619185	0.368334602	0.560955132	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.181679879	1	9.37E-08	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	180182263	G	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	39	16	41	62	7	11.3	45	14	31.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.330248897	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	0.669751103	0.175406579	1	2	2	NA	1	1	NA	0.330248897	0.824593421	NA	1.840183753	1.383337927	1.330248897	0.555346746	0.555346746	1	1.110714286	1.110714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.16E-27	1	3.02E-08	1	8.81E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	181329884	G	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	24	6	25	55	2	3.6	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.330248897	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	0.669751103	0.175406579	1	2	2	NA	1	1	NA	0.330248897	0.824593421	NA	1.122063264	1.122063264	1	0.176924627	0.176924627	1	0.325	0.325	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.95E-09	1	0.031164417	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	181494035	G	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	40	9	22.5	50	0	0	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.330248897	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	0.669751103	0.175406579	1	2	2	NA	1	1	NA	0.330248897	0.824593421	NA	1.009856937	1.009856937	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.64E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	183892683	G	T	AP2M1	CCDS43177.1	r.41g>u	c.?	p.?	5'UTR variant	45	0	0	35	5	14.3	59	18	30.5	45	11	24.4	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.330248897	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	0.669751103	0.175406579	1	2	2	NA	1	1	NA	0.330248897	0.824593421	NA	0.641820187	0.641820187	1	1.498944756	0.821522614	1.824593421	0.871428571	0.871428571	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.000000895	1	2.03E-27	1	4.24E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	184391038	G	C	EIF2B5	ENST00000444495	r.?	-	-	intronic	45	0	0	53	11	20.8	78	0	0	59	12	20.3	65	0	0	76	20	26.3	153	3	2	76	12	15.8	TRUE	TRUE	2.330248897	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	0.669751103	0.175406579	1	2	2	NA	1	1	NA	0.330248897	0.824593421	NA	0.933556636	0.933556636	1	0	0	1	0.725	0.725	1	1.180410554	1.180410554	1	0.098291459	0.098291459	1	0.564285714	0.564285714	1	7	6	1	1	3.07E-15	7.96E-29	1	0.042101128	2.20E-16	5.63E-15	YES	1_1	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	184440913	T	C	-	-	-	-	-	-	41	0	0	40	13	32.5	62	0	0	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.330248897	2.824593421	2	1	1	1	1	1	1	0.669751103	0.175406579	1	2	2	NA	1	1	NA	0.330248897	0.824593421	NA	1.458682243	1.458682243	1	0	0	1	0.078571429	0.078571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.30E-20	1	1	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	186145741	A	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	41	0	0	53	22	41.5	46	10	21.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	2.039547783	1.117809458	1.824593421	0.992	0.992	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	9.50E-37	1	3.38E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	186204928	C	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	24	0	0	72	10	13.9	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	0.683125643	0.683125643	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	3.95E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	186988918	G	A	MASP1	CCDS33907.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	42	12	28.6	55	1	1.8	39	12	30.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0.903189189	0.903189189	1	0.088462313	0.088462313	1	1.408	1.408	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.35E-18	1	0.240951649	1	8.43E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	188964980	C	T	TPRG1	CCDS3292.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	34	0	0	61	8	13.1	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	0.643809059	0.643809059	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	9.09E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	189061096	G	T	-	-	-	-	-	-	51	0	0	40	11	27.5	48	0	0	30	6	20	308	1	0.3	118	44	37.3	111	5	4.5	102	31	30.4	TRUE	TRUE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0.868451143	0.868451143	1	0	0	1	0.914285714	0.914285714	1	1.177935551	1.177935551	1	0.221155784	0.221155784	1	1.389714286	0.694857143	2	7	6	1	0.78644543	9.88E-17	2.11E-69	1	0.000258017	8.37E-09	4.54E-46	YES	1_1	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	189061118	T	C	-	-	-	-	-	-	57	0	0	38	11	28.9	51	0	0	34	6	17.6	309	0	0	119	48	40.3	109	5	4.6	107	29	27.1	TRUE	TRUE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0.912663202	0.912663202	1	0	0	1	0.804571429	0.804571429	1	1.272675676	1.272675676	1	0.226070357	0.226070357	1	1.238857143	1.238857143	1	7	6	1	1	5.19E-17	1.32E-77	1	0.000237142	1.86E-08	1.56E-41	YES	1_1	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	189909962	T	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	28	0	0	56	10	17.9	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	0.879708562	0.879708562	1	0.128	0.128	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.82E-13	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	191331550	G	T	-	-	-	-	-	-	51	0	0	29	0	0	74	14	18.9	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	0.928854292	0.928854292	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.10E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	191412227	G	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	37	0	0	55	9	16.4	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	0.805989967	0.805989967	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.01E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	191723290	G	A	-	-	-	-	-	-	49	0	0	26	0	0	69	6	8.7	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	0.427567849	0.518519597	0.824593421	0.105142857	0.105142857	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.00000143	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	191736900	C	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	44	0	0	64	7	10.9	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	0.535688454	0.649639495	0.824593421	0.123428571	0.123428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	3.78E-08	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	191805805	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	36	0	0	69	11	15.9	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	0.781417102	0.781417102	1	0.109714286	0.109714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	6.82E-14	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	193767433	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	28	0	0	43	9	20.9	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	1.027145751	1.027145751	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	9.45E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	3	193867564	T	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	45	0	0	62	25	40.3	41	4	9.8	85	0	0	136	0	0	120	45	37.5	117	2	1.7	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	1.980572907	1.085487257	1.824593421	0.448	0.448	1	0	NA	0	1.842964864	1.010068787	1.824593421	0.077714286	0.077714286	1	NA	NA	1	1	1	1	3.68E-41	4.44E-71	0.0000546	0.116646664	YES	0_0	1_1	1_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	3	194611597	A	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	38	0	0	61	26	42.6	54	1	1.9	158	0	0	110	1	0.9	109	29	26.6	109	2	1.8	FALSE	FALSE	1	2.824593421	3	1	1	2	0	1	1	1	0.175406579	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.824593421	NA	0	NA	0	2.093608086	1.147438142	1.824593421	0.086857143	0.086857143	1	0.028422037	NA	0	1.30727641	1.30727641	1	0.082285714	0.082285714	1	NA	NA	1	1	1	0.423845601	1.53E-43	2.88E-41	0.237137336	0.103782456	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	4	389214	T	G	ENSG00000186777	ENST00000414523	r.?	-	-	intronic	27	0	0	35	0	0	24	0	0	39	5	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	0	NA	0	0.457142857	0.457142857	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	1232550	G	A	CTBP1	CCDS43203.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	37	11	29.7	46	1	2.2	38	5	13.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	1.234927235	1.234927235	1	0.071504047	NA	0	0.471428571	0.471428571	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	3.70E-17	1	0.205924651	1	0.00000137	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	1509155	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	44	0	0	47	0	0	54	7	13	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	0	NA	0	0.464285714	0.464285714	1	NA	NA	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	1.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	1617142	A	G	FAM53A	ENST00000489029	r.?	-	-	downstream	41	0	0	41	4	9.8	45	0	0	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0.407484407	0.407484407	1	0	NA	0	0.210714286	0.210714286	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.0000546	1	1	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	1718607	G	T	TMEM129	CCDS46998.1	r.1883c>a	c.?	p.?	3'UTR variant	47	0	0	35	12	34.3	42	1	2.4	60	12	20	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	1.426195426	1.426195426	1	0.078004415	NA	0	0.714285714	0.714285714	1	NA	NA	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.83E-19	1	0.189842622	1	2.74E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	2686385	G	T	FAM193A	CCDS33943.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	43	13	30.2	39	1	2.6	48	0	0	115	0	0	169	30	17.8	112	0	0	119	4	3.4	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	1.255717256	1.255717256	1	0.084504783	NA	0	0	0	1	0.74012474	0.74012474	1	0	NA	0	0.121428571	0.121428571	1	NA	NA	1	1	3.88E-20	7.94E-37	0.177567718	1	1	0.003144426	YES	1_1	0_0	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	4	3379832	A	C	RGS12	CCDS3367.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	49	9	18.4	38	1	2.6	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0.765072765	0.765072765	1	0.084504783	NA	0	0.25	0.25	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	3.35E-12	1	0.173434892	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	3461813	C	A	DOK7	CCDS3370.2	r.?	-	-	upstream	46	0	0	48	15	31.2	41	2	4.9	47	9	19.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	1.297297297	1.297297297	1	0.159259015	0.99409875	0.160204421	0.682142857	0.682142857	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.86E-23	1	0.018015855	1	2.24E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	3939997	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	36	12	33.3	41	0	0	36	0	0	34	0	0	179	32	17.9	188	1	0.5	149	1	0.7	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	1.384615385	1.384615385	1	0	NA	0	0	0	1	0.744282744	0.744282744	1	0.01625092	NA	0	0.025	0.025	1	NA	NA	1	1	2.73E-19	2.80E-39	1	0.610292126	1	0.526152023	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	4	4149594	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	40	7	17.5	46	19	41.3	57	12	21.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0.727650728	0.727650728	1	1.34232598	1.34232598	1	0.753571429	0.753571429	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.26E-09	1	6.97E-32	1	1.40E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	4155772	G	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	38	11	28.9	39	0	0	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	1.201663202	1.201663202	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	5.19E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	4527072	G	A	STX18	CCDS3377.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	43	8	18.6	35	0	0	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0.773388773	0.773388773	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	4.85E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	6791370	A	C	KIAA0232	CCDS43209.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	35	12	34.3	42	1	2.4	53	6	11.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	1.426195426	1.426195426	1	0.078004415	NA	0	0.403571429	0.403571429	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.83E-19	1	0.189842622	1	0.000000293	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	7475179	C	T	SORCS2	CCDS47008.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	36	11	30.6	49	3	6.1	50	7	14	41	0	0	86	23	26.7	111	2	1.8	81	11	13.6	TRUE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	1.272349272	1.272349272	1	0.198261222	1.237551505	0.160204421	0.5	0.5	1	1.11018711	1.11018711	1	0.058503311	NA	0	0.485714286	0.485714286	1	8	NA	1	1	2.62E-17	4.16E-33	0.001939399	0.106960682	6.46E-09	4.29E-13	YES	1_1	1_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	4	7837236	A	C	AFAP1	CCDS47010.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	15	0	0	21	0	0	13	3	23.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	0	NA	0	0.825	0.825	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000344	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	8340643	C	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	48	0	0	42	7	16.7	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	0.542780723	0.542780723	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.81E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	10197297	C	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	45	11	24.4	63	2	3.2	56	23	41.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	1.014553015	1.014553015	1	0.104005887	0.649207347	0.160204421	1.467857143	1.467857143	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.24E-16	1	0.03993132	1	3.22E-38	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	10667017	C	T	CLNK	CCDS47024.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	42	4	9.5	40	5	12.5	54	6	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0.395010395	0.395010395	1	0.406272996	0.406272996	1	0.396428571	0.396428571	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.0000601	1	0.00000178	1	0.000000329	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	10946700	T	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	46	9	19.6	40	0	0	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0.814968815	0.814968815	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.82E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	10955828	C	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	37	0	0	30	11	36.7	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	1.192817517	1.192817517	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.44E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	11925408	C	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	54	0	0	40	0	0	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	0	NA	0	0.35	0.35	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	13371290	T	C	RAB28	CCDS3409.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	48	0	0	40	0	0	34	4	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	0	NA	0	0.421428571	0.421428571	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	13766848	A	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	57	0	0	57	19	33.3	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	1.082311262	1.082311262	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.01E-29	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	15557613	A	C	CC2D2A	CCDS47026.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	50	0	0	43	0	0	44	4	9.1	187	0	0	174	2	1.1	74	0	0	94	4	4.3	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	0	NA	0	0.325	0.325	1	0.045738046	0.045738046	1	0	NA	0	0.153571429	0.153571429	1	NA	NA	1	1	1	0.216440816	1	1	0.0000723	0.001332441	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	4	17999257	C	A	LCORL	CCDS3425.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	42	0	0	36	0	0	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	0	NA	0	0.414285714	0.414285714	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	18376147	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	43	9	20.9	46	0	0	57	9	15.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0.869022869	0.869022869	1	0	NA	0	0.564285714	0.564285714	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	9.45E-13	1	1	1	1.42E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	18803378	C	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	54	0	0	33	0	0	59	9	15.3	262	1	0.4	133	0	0	102	0	0	117	8	6.8	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	0	NA	0	0.546428571	0.546428571	1	0	0	1	0	NA	0	0.242857143	0.242857143	1	NA	NA	1	0.731065106	1	1	1	1	1.96E-11	0.000000164	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	4	18978285	C	T	-	-	-	-	-	-	54	0	0	47	0	0	44	8	18.2	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	0.591533483	0.591533483	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.90E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	19359086	G	A	-	-	-	-	-	-	56	0	0	43	10	23.3	41	0	0	61	11	18	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0.968814969	0.968814969	1	0	NA	0	0.642857143	0.642857143	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.61E-14	1	1	1	1.62E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	19787600	A	G	-	-	-	-	-	-	45	0	0	56	18	32.1	38	0	0	55	12	21.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	1.334719335	1.334719335	1	0	NA	0	0.778571429	0.778571429	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	6.76E-28	1	1	1	8.78E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	20170618	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	36	0	0	44	15	34.1	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	1.108312734	1.108312734	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.12E-24	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	20248394	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	52	0	0	34	9	26.5	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	0.861298752	0.861298752	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.15E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	20393322	G	C	SLIT2	ENST00000504154	r.?	-	-	intronic	33	0	0	45	0	0	43	6	14	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	0.455025756	0.455025756	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.13E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	20606485	G	T	SLIT2	ENST00000504154	r.?	-	-	intronic	38	0	0	48	14	29.2	32	1	3.1	29	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	1.214137214	1.214137214	1	0.100755703	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	2.51E-21	1	0.14819814	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	20736944	G	A	KCNIP4	CCDS43217.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	38	5	13.2	49	0	0	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0.548856549	0.548856549	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.00000137	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	20922170	A	G	KCNIP4	CCDS43217.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	32	0	0	43	0	0	55	6	10.9	234	0	0	195	1	0.5	95	0	0	158	23	14.6	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	0	NA	0	0.389285714	0.389285714	1	0.020790021	0.020790021	1	0	NA	0	0.521428571	0.521428571	1	NA	NA	1	1	1	0.623729002	1	1	0.000000367	1.66E-26	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	4	21445165	G	T	KCNIP4	CCDS43217.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	46	8	17.4	56	3	5.4	54	6	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0.723492723	0.723492723	1	0.175509934	1.095537398	0.160204421	0.396428571	0.396428571	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	8.61E-11	1	0.00284314	1	0.000000329	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	21989845	C	A	-	-	-	-	-	-	56	0	0	46	11	23.9	50	0	0	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0.993762994	0.993762994	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	5.55E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	22709418	G	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	53	0	0	59	1	1.7	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	0.055253128	NA	0	0.396428571	0.396428571	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.256019138	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	24031537	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	34	0	0	40	10	25	48	5	10.4	307	1	0.3	144	1	0.7	85	27	31.8	149	10	6.7	TRUE	TRUE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	0.812545993	0.812545993	1	0.371428571	0.371428571	1	0.029106029	0.029106029	1	1.033558503	1.033558503	1	0.239285714	0.239285714	1	3	3	1	0.785372291	1	0.514126036	7.22E-15	6.20E-41	0.00000447	5.67E-09	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	4	24458824	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	26	0	0	32	10	31.2	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	1.014057399	1.014057399	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.70E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	25694409	G	A	ENSG00000237795	ENST00000438783	r.?	-	-	intronic	50	0	0	52	1	1.9	47	0	0	54	8	14.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0.079002079	0.079002079	1	0	NA	0	0.528571429	0.528571429	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.229451111	1	1	1	3.31E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	27130771	C	T	-	-	-	-	-	-	52	0	0	49	0	0	40	0	0	54	7	13	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	0	NA	0	0.464285714	0.464285714	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	1.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	27404498	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	39	8	20.5	40	0	0	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0.852390852	0.852390852	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	2.09E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	28011566	T	C	-	-	-	-	-	-	48	0	0	46	0	0	33	6	18.2	60	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	0.591533483	0.591533483	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.54E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	28343183	C	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	40	0	0	41	15	36.6	59	0	0	205	1	0.5	76	0	0	56	10	17.9	59	1	1.7	TRUE	TRUE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	1.189567333	1.189567333	1	0	0	1	0	0	1	0.581782931	0.581782931	1	0.060714286	0.060714286	1	2	1	1	0.642124842	1	1	1.71E-24	2.82E-13	1	0.256019138	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	4	29811269	A	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	43	13	30.2	39	0	0	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	1.255717256	1.255717256	1	0	NA	0	0.092857143	0.092857143	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	3.88E-20	1	1	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	30306008	A	G	ENSG00000237496	ENST00000424014	r.?	-	-	intronic	42	0	0	30	5	16.7	47	2	4.3	50	8	16	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0.694386694	0.694386694	1	0.139757911	0.872372373	0.160204421	0.571428571	0.571428571	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.000000401	1	0.02328732	1	1.74E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	31114664	T	A	PCDH7	CCDS43220.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	39	8	20.5	48	17	35.4	35	6	17.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0.852390852	0.852390852	1	1.150565126	1.150565126	1	0.610714286	0.610714286	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.09E-11	1	2.80E-27	1	2.24E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	32400661	A	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	29	0	0	65	12	18.5	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.160204421	2	1	1	1	1	0	1	1	0.839795579	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.160204421	NA	0	0	1	0.601284035	0.601284035	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.70E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	33285088	T	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	53	0	0	56	21	37.5	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.533742331	1.533742331	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.43E-34	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	33335686	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	42	12	28.6	64	1	1.6	45	7	15.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.189189189	1.189189189	1	0.065439673	0.065439673	1	0.557142857	0.557142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.35E-18	1	0.274433592	1	0.000000003	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	34049671	G	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	30	5	16.7	51	13	25.5	45	11	24.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.694386694	0.694386694	1	1.042944785	1.042944785	1	0.871428571	0.871428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.000000401	1	4.87E-19	1	4.24E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	34074751	A	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	39	8	20.5	52	0	0	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852390852	0.852390852	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.09E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	34283667	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	47	0	0	51	11	21.6	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.883435583	0.883435583	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.94E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	35755465	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	52	9	17.3	40	0	0	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.719334719	0.719334719	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.92E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	38783530	C	T	TLR10	CCDS3445.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	44	7	15.9	62	0	0	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.661122661	0.661122661	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.55E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	39171462	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	44	8	18.2	66	1	1.5	55	12	21.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.756756757	0.756756757	1	0.061349693	0.061349693	1	0.778571429	0.778571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.90E-11	1	0.281671117	1	8.78E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	41742524	C	G	PHOX2B	CCDS3463.1	r.?	-	-	downstream	42	0	0	48	9	18.8	63	0	0	74	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.781704782	0.781704782	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.75E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	43003497	C	T	GRXCR1	CCDS43225.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	41	9	22	45	9	20	52	12	23.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914760915	0.914760915	1	0.81799591	0.81799591	1	0.825	0.825	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.92E-13	1	1.47E-12	1	4.19E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	43216467	C	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	44	0	0	38	0	0	61	6	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.35	0.35	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000685	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	43395963	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	45	0	0	45	5	11.1	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.45398773	0.45398773	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000323	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	43423786	A	C	-	-	-	-	-	-	52	0	0	42	7	16.7	59	0	0	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.694386694	0.694386694	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.81E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	43610420	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	46	16	34.8	50	0	0	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.446985447	1.446985447	1	0	0	1	0.089285714	0.089285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.31E-25	1	1	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	44190488	G	C	KCTD8	CCDS3467.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	44	10	22.7	55	11	20	45	12	26.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.943866944	0.943866944	1	0.81799591	0.81799591	1	0.953571429	0.953571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.08E-14	1	4.77E-15	1	6.03E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	44221478	G	T	KCTD8	CCDS3467.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	39	0	0	41	13	31.7	52	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.296523517	1.296523517	1	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.89E-20	1	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	44423615	T	C	KCTD8	CCDS3467.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	39	5	12.8	61	0	0	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.532224532	0.532224532	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.00000156	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	44423682	T	C	KCTD8	CCDS3467.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	38	4	10.5	48	0	0	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.436590437	0.436590437	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.0000403	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	44435872	A	T	KCTD8	CCDS3467.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	41	10	24.4	37	0	0	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.014553015	1.014553015	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	9.51E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	44655311	G	A	YIPF7	ENST00000332990	r.?	-	-	upstream	46	0	0	54	0	0	51	9	17.6	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.719836401	0.719836401	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.92E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	45510170	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	51	0	0	53	14	26.4	49	5	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.079754601	1.079754601	1	0.364285714	0.364285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.22E-20	1	0.00000496	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	46354252	C	T	GABRA2	CCDS3471.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	39	11	28.2	51	0	0	41	7	17.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.172557173	1.172557173	1	0	0	1	0.610714286	0.610714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.20E-17	1	1	1	1.51E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	47116337	C	T	GABRB1	CCDS3474.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	50	0	0	48	6	12.5	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.511247444	0.511247444	1	0.110714286	0.110714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000016	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	47298596	C	G	GABRB1	CCDS3474.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	43	0	0	59	19	32.2	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.316973415	1.316973415	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.20E-29	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	48266106	A	T	TEC	CCDS3481.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	48	0	0	50	14	28	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.145194274	1.145194274	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.84E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	49244860	G	T	-	-	-	-	-	-	96	0	0	113	9	8	119	2	1.7	125	7	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.332640333	0.332640333	1	0.069529652	0.069529652	1	0.2	0.2	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	7.30E-09	1	0.119923038	1	0.00000372	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	53426417	G	A	-	-	-	-	-	-	51	0	0	40	8	20	49	0	0	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.61E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	53488706	A	T	USP46	CCDS47053.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	38	5	13.2	65	12	18.5	45	10	22.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.548856549	0.548856549	1	0.756646217	0.756646217	1	0.792857143	0.792857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.00000137	1	7.70E-16	1	2.66E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	56075070	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	50	9	18	64	0	0	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.748440748	0.748440748	1	0	0	1	0.082142857	0.082142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.07E-12	1	1	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	56218631	C	T	SRD5A3	CCDS3498.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	42	0	0	56	17	30.4	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.243353783	1.243353783	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.22E-26	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	59030859	G	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	54	0	0	50	0	0	55	6	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.389285714	0.389285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000367	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	59469120	A	G	-	-	-	-	-	-	53	0	0	41	11	26.8	62	21	33.9	40	13	32.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.114345114	1.114345114	1	1.386503067	1.386503067	1	1.160714286	1.160714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.34E-16	1	7.22E-33	1	1.30E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	59563040	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	49	11	22.4	60	0	0	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.931392931	0.931392931	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.19E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	60249058	C	A	-	-	-	-	-	-	63	0	0	44	9	20.5	63	1	1.6	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852390852	0.852390852	1	0.065439673	0.065439673	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.18E-12	1	0.27078753	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	61322342	C	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	36	0	0	49	5	10.2	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.417177914	0.417177914	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000496	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	61409135	C	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	48	0	0	51	14	27.5	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.124744376	1.124744376	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.64E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	61413545	T	C	-	-	-	-	-	-	36	0	0	33	6	18.2	39	3	7.7	52	10	19.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.756756757	0.756756757	1	0.314928425	0.314928425	1	0.685714286	0.685714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.54E-08	1	0.000998458	1	1.28E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	61420085	G	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	50	0	0	40	5	12.5	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.511247444	0.511247444	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000178	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	61511464	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	39	8	20.5	50	10	20	50	10	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852390852	0.852390852	1	0.81799591	0.81799591	1	0.714285714	0.714285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.09E-11	1	8.36E-14	1	8.36E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	70903710	G	A	HTN3	CCDS33999.1	r.?	-	-	downstream	39	0	0	46	0	0	55	8	14.5	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.593047035	0.593047035	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.86E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	71318869	G	C	MUC7	CCDS3541.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	39	0	0	47	8	17	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.695296524	0.695296524	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.03E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	74037187	A	C	ANKRD17	CCDS34004.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	57	12	21.1	43	0	0	47	9	19.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.877338877	0.877338877	1	0	0	1	0.682142857	0.682142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.40E-16	1	1	1	2.24E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	75202167	C	T	-	-	-	-	-	-	48	0	0	47	11	23.4	39	0	0	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.972972973	0.972972973	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	7.21E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	75997797	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	54	13	24.1	58	0	0	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.002079002	1.002079002	1	0	0	1	0.153571429	0.153571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.12E-18	1	1	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	76161203	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	49	0	0	58	8	13.8	52	11	21.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.564417178	0.564417178	1	0.757142857	0.757142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	5.99E-10	1	2.44E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	77678965	C	G	SHROOM3	CCDS3579.2	r.?	-	-	intronic	45	0	0	28	0	0	45	12	26.7	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.09202454	1.09202454	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.03E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	78685924	C	G	CNOT6L	CCDS47082.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	62	0	0	53	9	17	41	1	2.4	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.695296524	0.695296524	1	0.085714286	0.085714286	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.10E-12	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	79215889	G	A	FRAS1	ENST00000264895	r.?	-	-	intronic	42	0	0	49	10	20.4	52	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.848232848	0.848232848	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	6.72E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	80426376	T	C	-	-	-	-	-	-	36	0	0	51	0	0	50	8	16	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.654396728	0.654396728	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.74E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	81181496	G	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	49	9	18.4	50	0	0	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.765072765	0.765072765	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.35E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	82999155	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	31	5	16.1	50	2	4	41	7	17.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.669438669	0.669438669	1	0.163599182	0.163599182	1	0.610714286	0.610714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.000000476	1	0.026131524	1	1.51E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	83082230	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	45	0	0	42	7	16.7	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.683026585	0.683026585	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.81E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	83504242	G	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	46	0	0	42	9	21.4	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.875255624	0.875255624	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.51E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	85676167	A	G	WDFY3	CCDS3609.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	31	6	19.4	44	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.806652807	0.806652807	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.03E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	86879325	C	T	ARHGAP24	CCDS34025.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	35	0	0	36	10	27.8	62	7	11.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.137014315	1.137014315	1	0.403571429	0.403571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	2.21E-15	1	3.02E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	86965653	T	C	MAPK10	CCDS3612.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	31	0	0	49	10	20.4	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.834355828	0.834355828	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.72E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	88650352	G	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	55	10	18.2	45	1	2.2	63	1	1.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.756756757	0.756756757	1	0.08997955	0.08997955	1	0.057142857	0.057142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.33E-13	1	0.201934322	1	0.27078753	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	89732536	C	A	FAM13A	CCDS34029.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	58	0	0	48	14	29.2	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.194274029	1.194274029	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.51E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	92660817	A	C	-	-	-	-	-	-	53	0	0	51	8	15.7	57	0	0	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.652806653	0.652806653	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.05E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	92939478	C	T	-	-	-	-	-	-	49	0	0	51	0	0	66	14	21.2	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.867075665	0.867075665	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.71E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	93680305	A	G	GRID2	CCDS3637.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	53	6	11.3	47	13	27.7	45	14	31.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.46985447	0.46985447	1	1.132924335	1.132924335	1	1.110714286	1.110714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.000000293	1	1.47E-19	1	8.81E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	94247444	C	A	GRID2	CCDS3637.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	41	0	0	42	7	16.7	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.683026585	0.683026585	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.81E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	95153436	C	G	SMARCAD1	CCDS47101.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	40	0	0	59	18	30.5	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.247443763	1.247443763	1	0.078571429	0.078571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.03E-27	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	95940239	A	T	BMPR1B	ENST00000515059	r.?	-	-	intronic	42	0	0	46	13	28.3	42	0	0	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.176715177	1.176715177	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.07E-19	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	96734593	A	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	40	8	20	59	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.61E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	98122193	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	38	9	23.7	55	1	1.8	56	15	26.8	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.985446985	0.985446985	1	0.073619632	0.073619632	1	0.957142857	0.957142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.79E-13	1	0.240951649	1	4.09E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	98382031	T	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	42	12	28.6	53	9	17	50	14	28	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.189189189	1.189189189	1	0.695296524	0.695296524	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.35E-18	1	7.10E-12	1	4.84E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	101268525	A	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	34	6	17.6	31	2	6.5	42	19	45.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.731808732	0.731808732	1	0.265848671	0.265848671	1	1.614285714	1.614285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.86E-08	1	0.010558179	1	7.64E-33	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	103479871	G	A	NFKB1	CCDS3657.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	30	4	13.3	50	0	0	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.553014553	0.553014553	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.0000154	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	104082159	C	T	CENPE	CCDS34042.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	53	11	20.8	59	0	0	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.864864865	0.864864865	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.07E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	104270255	T	C	-	-	-	-	-	-	41	0	0	39	0	0	45	10	22.2	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.90797546	0.90797546	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.66E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	104445516	A	G	-	-	-	-	-	-	41	0	0	43	14	32.6	49	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.355509356	1.355509356	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.18E-22	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	107148939	C	A	TBCK	CCDS3673.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	43	0	0	52	8	15.4	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.629856851	0.629856851	1	0.082142857	0.082142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.42E-10	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	107341984	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	52	0	0	57	11	19.3	52	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.789366053	0.789366053	1	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.29E-15	1	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	107994155	C	T	DKK2	ENST00000513208	r.?	-	-	intronic	40	0	0	45	0	0	50	13	26	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.063394683	1.063394683	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.65E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	109243825	T	C	-	-	-	-	-	-	28	0	0	51	11	21.6	56	0	0	64	2	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.898128898	0.898128898	1	0	0	1	0.110714286	0.110714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.94E-15	1	1	1	0.041085601	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	111925838	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	61	0	0	52	14	26.9	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.100204499	1.100204499	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.04E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	112573242	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	43	0	0	58	13	22.4	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.916155419	0.916155419	1	0.310714286	0.310714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	3.12E-18	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	113682111	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	43	12	27.9	42	0	0	35	5	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.16008316	1.16008316	1	0	0	1	0.510714286	0.510714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.24E-18	1	1	1	0.000000895	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	115003630	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	34	0	0	33	10	30.3	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.239263804	1.239263804	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.14E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	115466797	G	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	49	0	0	44	4	9.1	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.372188139	0.372188139	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000723	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	117240139	T	C	-	-	-	-	-	-	42	0	0	46	0	0	46	11	23.9	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.977505112	0.977505112	1	0.103571429	0.103571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.55E-16	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	117383816	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	38	0	0	47	11	23.4	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.957055215	0.957055215	1	0.389285714	0.389285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	7.21E-16	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	117901880	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	38	7	18.4	43	0	0	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.765072765	0.765072765	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	8.61E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	118350025	C	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	38	0	0	42	6	14.3	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.584867076	0.584867076	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.02E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	118652326	G	C	-	-	-	-	-	-	41	0	0	46	5	10.9	53	0	0	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.453222453	0.453222453	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.00000361	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	118831015	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	38	0	0	49	9	18.4	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.752556237	0.752556237	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.35E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	119507379	T	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	45	0	0	55	12	21.8	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.891615542	0.891615542	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.78E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	119841017	A	T	SYNPO2	CCDS34054.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	29	4	13.8	50	4	8	48	7	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.573804574	0.573804574	1	0.327198364	0.327198364	1	0.521428571	0.521428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.0000134	1	0.000119787	1	4.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	121899647	C	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	49	5	10.2	53	14	26.4	50	16	32	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.424116424	0.424116424	1	1.079754601	1.079754601	1	1.142857143	1.142857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.00000496	1	1.22E-20	1	6.40E-25	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	121993681	T	A	C4orf31	CCDS3717.2	r.?	-	-	upstream	15	0	0	27	5	18.5	23	3	13	28	8	28.6	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.769230769	0.769230769	1	0.531697342	0.531697342	1	1.021428571	1.021428571	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.00000023	1	0.000205387	1	1.11E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	124309210	T	C	-	-	-	-	-	-	49	0	0	39	0	0	43	9	20.9	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.854805726	0.854805726	1	0.075	0.075	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.45E-13	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	126212895	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	48	0	0	40	6	15	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.613496933	0.613496933	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.18E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	126288847	G	A	FAT4	CCDS3732.3	r.?	-	-	intronic	51	0	0	27	10	37	59	1	1.7	41	7	17.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.538461538	1.538461538	1	0.069529652	0.069529652	1	0.610714286	0.610714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.62E-17	1	0.256019138	1	1.51E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	131304632	C	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	40	13	32.5	42	1	2.4	39	8	20.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.351351351	1.351351351	1	0.098159509	0.098159509	1	0.732142857	0.732142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.30E-20	1	0.189842622	1	2.09E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	132076001	A	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	54	15	27.8	46	2	4.3	44	8	18.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.155925156	1.155925156	1	0.175869121	0.175869121	1	0.65	0.65	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.20E-22	1	0.022369545	1	5.90E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	132382167	C	G	-	-	-	-	-	-	38	0	0	33	0	0	54	12	22.2	56	5	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.90797546	0.90797546	1	0.317857143	0.317857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	6.90E-17	1	0.00000965	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	132669479	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	15	5	33.3	28	0	0	25	0	0	2	0	0	3	2	66.7	6	0	0	1	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.384615385	1.384615385	1	0	0	1	0	0	1	2.773388773	2.773388773	1	0	0	1	0	0	1	6	6	1	1	0.000000009	0.0000748	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	133240819	G	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	36	10	27.8	57	10	17.5	46	9	19.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.155925156	1.155925156	1	0.715746421	0.715746421	1	0.7	0.7	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.21E-15	1	3.40E-13	1	1.82E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	135447093	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	58	15	25.9	47	2	4.3	47	0	0	174	0	0	157	30	19.1	87	0	0	107	1	0.9	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.076923077	1.076923077	1	0.175869121	0.175869121	1	0	0	1	0.794178794	0.794178794	1	0	0	1	0.032142857	0.032142857	1	6	4	1	1	7.42E-22	7.38E-38	0.02328732	1	1	0.415116136	YES	1_1	1_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	4	135498076	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	41	0	0	48	11	22.9	52	7	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.936605317	0.936605317	1	0.482142857	0.482142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	9.31E-16	1	8.58E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	135608585	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	37	1	2.7	33	1	3	55	6	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.112266112	0.112266112	1	0.122699387	0.122699387	1	0.389285714	0.389285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	0.169281299	1	0.15245715	1	0.000000367	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	136498762	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	52	0	0	59	13	22	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.899795501	0.899795501	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.99E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	137227211	T	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	51	13	25.5	52	0	0	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.06029106	1.06029106	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.87E-19	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	137229604	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	46	0	0	47	10	21.3	58	1	1.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.871165644	0.871165644	1	0.060714286	0.060714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.27E-14	1	0.252280541	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	140425476	A	G	SETD7	CCDS3748.1	r.?	-	-	downstream	37	0	0	51	12	23.5	55	2	3.6	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.977130977	0.977130977	1	0.147239264	0.147239264	1	0.071428571	0.071428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.24E-17	1	0.031164417	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	141875074	C	T	RNF150	ENST00000306799	r.?	-	-	intronic	42	0	0	47	12	25.5	51	0	0	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.06029106	1.06029106	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.09E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	142139495	T	A	ZNF330	CCDS3754.1	r.?	-	-	upstream	47	0	0	41	12	29.3	55	4	7.3	46	7	15.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.218295218	1.218295218	1	0.298568507	0.298568507	1	0.542857143	0.542857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.69E-18	1	0.000173903	1	3.53E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	142167040	T	A	ENSG00000230981	ENST00000438406	r.?	-	-	intronic	40	0	0	45	14	31.1	54	20	37	58	13	22.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.293139293	1.293139293	1	1.513292434	1.513292434	1	0.8	0.8	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	8.81E-22	1	2.61E-32	1	3.12E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	143300844	T	A	INPP4B	CCDS47112.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	42	0	0	54	11	20.4	54	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.834355828	0.834355828	1	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.84E-15	1	0.237137336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	143761575	T	G	INPP4B	CCDS47112.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	52	0	0	53	9	17	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.695296524	0.695296524	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.10E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	144811060	T	G	GYPE	CCDS47138.1	r.?	-	-	intronic	36	1	2.8	46	12	26.1	60	13	21.7	49	24	49	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.085239085	1.085239085	1	0.887525562	0.887525562	1	1.75	1.75	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	0.165106833	1	8.12E-18	1	5.07E-18	1	3.34E-42	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	146643237	T	C	C4orf51	CCDS47140.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	48	9	18.8	50	12	24	50	17	34	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.781704782	0.781704782	1	0.981595092	0.981595092	1	1.214285714	1.214285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.75E-12	1	2.49E-17	1	6.43E-27	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	149808529	G	A	-	-	-	-	-	-	51	0	0	53	11	20.8	62	0	0	69	2	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.765418004	2	2.63125859	1	1	1	1	1	1	0.234581996	1	0.36874141	2	NA	2	1	NA	1	0.765418004	NA	0.63125859	1.02407181	1.02407181	1	0	0	1	0.121877928	0.121877928	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.07E-15	1	1	1	0.04704084	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	150834954	T	G	-	-	-	-	-	-	26	0	0	49	11	22.4	55	1	1.8	60	8	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.765418004	2	2.63125859	1	1	1	1	1	1	0.234581996	1	0.36874141	2	NA	2	1	NA	1	0.765418004	NA	0.63125859	1.102846564	1.102846564	1	0.073619632	0.073619632	1	0.558957393	0.885465008	0.63125859	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.19E-15	1	0.240951649	1	7.93E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	151198822	A	T	LRBA	CCDS3773.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	36	3	8.3	60	8	13.3	55	5	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.345114345	0.345114345	1	0.54396728	0.54396728	1	0.325	0.325	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000788827	1	7.93E-10	1	0.00000883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	151906462	T	C	LRBA	CCDS3773.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	40	0	0	47	0	0	45	7	15.6	105	0	0	106	0	0	75	0	0	79	5	6.3	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.557142857	0.557142857	1	0	0	1	0	0	1	0.225	0.225	1	1	2	1	1	1	1	1	1	0.000000003	0.0000518	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	4	153518248	G	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	45	0	0	44	5	11.4	57	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.466257669	0.466257669	1	0.064285714	0.064285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000288	1	0.248523156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	154976398	T	A	-	-	-	-	-	-	51	0	0	46	0	0	64	15	23.4	63	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.957055215	0.957055215	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.87E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	155794909	C	T	-	-	-	-	-	-	56	0	0	47	0	0	54	5	9.3	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.380368098	0.380368098	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000806	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	155851054	C	T	-	-	-	-	-	-	52	0	0	64	0	0	41	11	26.8	54	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.096114519	1.096114519	1	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.34E-16	1	0.237137336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	156590432	T	C	GUCY1A3	CCDS34085.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	38	8	21.1	60	18	30	50	8	16	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.877338877	0.877338877	1	1.226993865	1.226993865	1	0.571428571	0.571428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.67E-11	1	2.89E-27	1	1.74E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	160326310	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	44	6	13.6	52	2	3.8	57	12	21.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.565488565	0.565488565	1	0.155419223	0.155419223	1	0.753571429	0.753571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.37E-08	1	0.028101652	1	1.40E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	160533482	G	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	35	7	20	54	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.65E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	161262809	T	C	-	-	-	-	-	-	45	0	0	40	0	0	59	1	1.7	59	8	13.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.069529652	0.069529652	1	0.485714286	0.485714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.256019138	1	6.90E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	162958249	G	T	FSTL5	CCDS3802.1	r.?	-	-	intronic	49	0	0	38	11	28.9	54	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.201663202	1.201663202	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.19E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	164144122	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	43	6	14	54	10	18.5	51	16	31.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.582120582	0.582120582	1	0.756646217	0.756646217	1	1.121428571	1.121428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	8.13E-08	1	1.91E-13	1	9.28E-25	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	164812254	G	A	Mar-01	CCDS45732.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	42	0	0	51	12	23.5	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.961145194	0.961145194	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.24E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	165382461	C	A	-	-	-	-	-	-	48	0	0	60	0	0	50	7	14	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.572597137	0.572597137	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.46E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	165791420	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	34	0	0	41	5	12.2	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.498977505	0.498977505	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000202	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	165843120	G	A	-	-	-	-	-	-	48	0	0	44	0	0	57	0	0	51	6	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.421428571	0.421428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000232	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	166175398	C	A	KLHL2	CCDS34094.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	42	0	0	53	0	0	60	5	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.296428571	0.296428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000136	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	166392031	G	A	CPE	CCDS3810.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	36	0	0	57	7	12.3	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.503067485	0.503067485	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.66E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	166851354	G	T	TLL1	CCDS3811.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	38	12	31.6	44	9	20.5	35	11	31.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.313929314	1.313929314	1	0.838445808	0.838445808	1	1.121428571	1.121428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.86E-19	1	1.18E-12	1	1.82E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	167269579	A	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	32	9	28.1	55	0	0	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.168399168	1.168399168	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.94E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	167702470	G	A	SPOCK3	CCDS34095.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	55	0	0	48	13	27.1	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.108384458	1.108384458	1	0.078571429	0.078571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.00E-19	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	167825118	C	A	SPOCK3	CCDS34095.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	39	10	25.6	57	0	0	48	10	20.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.064449064	1.064449064	1	0	0	1	0.742857143	0.742857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.44E-15	1	1	1	5.37E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	168544757	C	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	49	13	26.5	49	15	30.6	38	9	23.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.101871102	1.101871102	1	1.251533742	1.251533742	1	0.846428571	0.846428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.71E-19	1	4.10E-23	1	2.79E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	169491764	G	A	PALLD	CCDS34098.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	47	12	25.5	58	0	0	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.06029106	1.06029106	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.09E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	170717729	G	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	53	11	20.8	80	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.864864865	0.864864865	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.07E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	171094065	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	41	0	0	53	14	26.4	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.079754601	1.079754601	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.22E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	171203174	A	C	-	-	-	-	-	-	49	0	0	57	17	29.8	56	0	0	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.239085239	1.239085239	1	0	0	1	0.310714286	0.310714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	8.82E-26	1	1	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	171290610	G	A	-	-	-	-	-	-	49	0	0	49	15	30.6	48	0	0	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.272349272	1.272349272	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.10E-23	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	172064593	G	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	39	7	17.9	41	10	24.4	59	22	37.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.744282744	0.744282744	1	0.99795501	0.99795501	1	1.332142857	1.332142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.04E-09	1	9.51E-15	1	1.79E-35	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	173174459	G	A	GALNTL6	CCDS34104.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	38	0	0	49	15	30.6	51	6	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.251533742	1.251533742	1	0.421428571	0.421428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	4.10E-23	1	0.000000232	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	173553234	G	A	GALNTL6	CCDS34104.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	47	7	14.9	48	8	16.7	45	15	33.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.61954262	0.61954262	1	0.683026585	0.683026585	1	1.189285714	1.189285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.12E-09	1	1.23E-10	1	9.14E-24	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	173555027	C	T	GALNTL6	CCDS34104.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	43	1	2.3	40	11	27.5	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.095634096	0.095634096	1	1.124744376	1.124744376	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	0.193893409	1	9.88E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	174509286	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	39	0	0	52	14	26.9	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.100204499	1.100204499	1	0.092857143	0.092857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.04E-21	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	176865473	T	G	GPM6A	CCDS3824.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	39	0	0	42	11	26.2	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.071574642	1.071574642	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.81E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	177873354	T	G	-	-	-	-	-	-	52	0	0	51	10	19.6	57	1	1.8	44	10	22.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.814968815	0.814968815	1	0.073619632	0.073619632	1	0.810714286	0.810714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.04E-13	1	0.248523156	1	2.08E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	178032572	A	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	40	8	20	42	3	7.1	47	7	14.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	0.290388548	0.290388548	1	0.532142857	0.532142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.61E-11	1	0.001240292	1	4.12E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	179126588	G	C	-	-	-	-	-	-	58	0	0	47	0	0	56	11	19.6	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.801635992	0.801635992	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.91E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	179681152	T	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	51	10	19.6	63	0	0	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.814968815	0.814968815	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.04E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	179688601	A	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	33	7	21.2	56	1	1.8	65	0	0	167	0	0	130	15	11.5	70	0	0	87	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.881496881	0.881496881	1	0.073619632	0.073619632	1	0	0	1	0.478170478	0.478170478	1	0	0	1	0	0	1	6	4	1	1	2.98E-10	3.01E-16	0.244746891	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	4	179880061	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	43	9	20.9	48	1	2.1	58	9	15.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.869022869	0.869022869	1	0.085889571	0.085889571	1	0.553571429	0.553571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.45E-13	1	0.213845552	1	1.67E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	180581717	A	G	-	-	-	-	-	-	44	0	0	56	0	0	55	11	20	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.81799591	0.81799591	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.77E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	180610809	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	29	0	0	48	10	20.8	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.850715746	0.850715746	1	0.332142857	0.332142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	5.37E-14	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	180952284	A	C	-	-	-	-	-	-	42	0	0	35	0	0	57	9	15.8	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.646216769	0.646216769	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.42E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	181799253	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	52	9	17.3	65	3	4.6	36	8	22.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.719334719	0.719334719	1	0.188139059	0.188139059	1	0.792857143	0.792857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.92E-12	1	0.004333293	1	1.04E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	182450850	T	C	-	-	-	-	-	-	34	0	0	49	8	16.3	58	10	17.2	49	16	32.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.677754678	0.677754678	1	0.703476483	0.703476483	1	1.167857143	1.167857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.47E-10	1	4.10E-13	1	4.37E-25	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	182635043	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	31	8	25.8	41	12	29.3	27	8	29.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.072765073	1.072765073	1	1.198364008	1.198364008	1	1.057142857	1.057142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.78E-12	1	1.69E-18	1	7.97E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	182884429	G	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	39	0	0	51	14	27.5	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.124744376	1.124744376	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.64E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	183898815	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	47	9	19.1	38	0	0	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.794178794	0.794178794	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.24E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	184232888	C	G	WWC2	CCDS34109.2	r.?	-	-	intronic	35	0	0	31	10	32.3	43	0	0	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.343035343	1.343035343	1	0	0	1	0.103571429	0.103571429	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.94E-16	1	1	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	184520415	G	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	35	15	42.9	62	4	6.5	35	7	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.783783784	1.783783784	1	0.265848671	0.265848671	1	0.714285714	0.714285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.02E-26	1	0.000276647	1	4.65E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	185140790	G	T	ENPP6	CCDS3834.1	r.?	-	-	upstream	34	0	0	46	0	0	45	7	15.6	45	6	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.63803681	0.63803681	1	0.475	0.475	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	3	NA	1	1	1	1	0.000000003	1	0.000000108	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	185184948	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	48	0	0	56	10	17.9	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.732106339	0.732106339	1	0.071428571	0.071428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.82E-13	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	187963225	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	52	0	0	62	14	22.6	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.924335378	0.924335378	1	0.075	0.075	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.42E-19	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	188773010	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	56	0	0	51	8	15.7	63	1	1.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.642126789	0.642126789	1	0.057142857	0.057142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.05E-10	1	0.27078753	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	189065451	G	A	TRIML1	CCDS3851.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	45	0	0	51	9	17.6	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.719836401	0.719836401	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.92E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	189323391	G	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	37	7	18.9	42	6	14.3	38	10	26.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.785862786	0.785862786	1	0.584867076	0.584867076	1	0.939285714	0.939285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	7.05E-10	1	7.02E-08	1	4.06E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	189966089	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	42	0	0	54	9	16.7	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.683026585	0.683026585	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.48E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	190005691	A	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	46	10	21.7	45	0	0	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.902286902	0.902286902	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.38E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	4	190696972	A	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	41	0	0	47	10	21.3	52	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.871165644	0.871165644	1	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.27E-14	1	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	693435	G	A	TPPP	CCDS3856.1	r.76c>u	c.?	p.?	5'UTR variant	40	0	0	31	9	29	81	45	55.6	39	12	30.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	1.205821206	1.205821206	1	3.652430885	1.049808315	3.479140746	1.234020221	1.234020221	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.57E-14	1	3.10E-81	1	8.43E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	769851	G	T	ZDHHC11	CCDS3857.1	r.?	-	-	intronic	66	0	0	56	10	17.9	146	0	0	98	7	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0.744282744	0.744282744	1	0	0	1	0.2844657	0.653747881	0.435130589	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.82E-13	1	1	1	0.000000726	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	1335469	C	T	CLPTM1L	CCDS3862.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	45	0	0	82	7	8.5	59	1	1.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	NA	0	0.558375225	0.558375225	1	0.068111506	0.068111506	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000000214	1	0.256019138	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	2497800	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	39	0	0	79	8	10.1	49	0	0	121	0	0	151	2	1.3	110	13	11.8	131	1	0.8	FALSE	TRUE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	NA	0	0.66348115	0.66348115	1	0	NA	0	0.054054054	0.054054054	1	0.775156195	0.775156195	1	0.032052473	0.032052473	1	NA	1	1	1	1	0.17491221	7.43E-09	2.06E-14	1	0.481410669	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	5	2791786	T	G	-	-	-	-	-	-	53	0	0	38	0	0	78	5	6.4	67	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	0	1	0.420423699	0.877453447	0.479140746	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000487	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	2823893	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	34	0	0	102	8	7.8	70	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	0	1	0.512391383	1.069396388	0.479140746	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	5.64E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	2890869	G	A	-	-	-	-	-	-	54	0	0	42	9	21.4	88	3	3.4	50	7	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0.88981289	0.88981289	1	0.22335009	0.466147144	0.479140746	0.560918282	0.560918282	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.51E-13	1	0.010001517	1	6.46E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	3065583	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	49	0	0	87	13	14.9	51	0	0	449	0	0	208	0	0	186	26	14	156	0	0	TRUE	TRUE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	0	1	0.978798924	0.978798924	1	0	0	1	0	0	1	0.919676841	0.919676841	1	0	0	1	2	1	1	1	1	1	8.85E-16	2.78E-29	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	5	3143379	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	38	7	18.4	101	0	0	59	0	0	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0.765072765	0.765072765	1	0	0	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	8.61E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	3178195	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	71	0	0	97	0	0	71	5	7	118	0	0	144	2	1.4	203	0	0	135	9	6.7	FALSE	TRUE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	NA	0	0	0	1	0.280459141	0.644540164	0.435130589	0.058212058	0.058212058	1	0	0	1	0.268439464	0.616917014	0.435130589	NA	2	1	1	1	0.162538846	1	1	0.0000309	3.46E-08	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	5	3229471	C	A	-	-	-	-	-	-	50	0	0	56	0	0	103	17	16.5	68	0	0	147	0	0	179	0	0	188	25	13.3	172	1	0.6	FALSE	TRUE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	NA	0	1.083904849	1.083904849	1	0	0	1	0	0	1	0.873692999	0.873692999	1	0.024039355	0.024039355	1	NA	1	1	1	1	1	5.84E-21	1.18E-27	1	0.577749776	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	5	3728919	T	C	-	-	-	-	-	-	47	0	0	44	7	15.9	97	0	0	66	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0.661122661	0.661122661	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.55E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	3818587	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	54	0	0	96	8	8.3	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	NA	0	0.545236985	1.137947439	0.479140746	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000000035	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	3889998	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	63	10	15.9	74	2	2.7	56	13	23.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0.661122661	0.661122661	1	0.177366248	0.370175673	0.479140746	0.929521725	0.929521725	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.81E-13	1	0.053288733	1	1.89E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	4172508	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	34	0	0	73	9	12.3	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	NA	0	0.808001796	0.808001796	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.42E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	4205425	G	C	-	-	-	-	-	-	43	0	0	48	13	27.1	84	1	1.2	55	10	18.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	1.126819127	1.126819127	1	0.078829444	0.078829444	1	0.729193767	0.729193767	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.00E-19	1	0.343645023	1	2.33E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	4795841	G	T	ENSG00000224867	ENST00000416839	r.?	-	-	intronic	42	0	0	40	0	0	72	9	12.5	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	NA	0	0.821140037	0.821140037	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.25E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	4864878	A	G	ENSG00000224867	ENST00000416839	r.?	-	-	intronic	39	0	0	43	0	0	77	9	11.7	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	0	1	0.768587075	0.768587075	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.32E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	5029120	T	A	-	-	-	-	-	-	54	0	0	50	0	0	82	8	9.8	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	NA	0	0.643773789	0.643773789	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.00000001	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	5182980	G	A	ADAMTS16	CCDS43299.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	50	13	26	82	36	43.9	54	20	37	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	1.081081081	1.081081081	1	2.88384381	0.96128127	3	1.482426889	1.032956095	1.435130589	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.65E-19	1	2.70E-60	1	2.61E-32	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	5537026	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	42	0	0	98	19	19.4	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	0	1	1.274409337	1.274409337	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.13E-24	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	5881690	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	46	0	0	111	12	10.8	60	0	0	218	0	0	192	0	0	271	42	15.5	169	3	1.8	FALSE	TRUE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	NA	0	0.709464992	0.709464992	1	0	NA	0	0	0	1	1.018213646	1.018213646	1	0.072118065	0.072118065	1	NA	1	1	1	1	1	6.09E-13	2.82E-48	1	0.053664708	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	5	6154013	G	C	-	-	-	-	-	-	46	0	0	53	0	0	96	15	15.6	53	1	1.9	130	0	0	134	0	0	98	8	8.2	118	12	10.2	FALSE	TRUE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	NA	0	1.024782766	1.024782766	1	0.076124624	0.076124624	1	0	0	1	0.538667864	1.124237229	0.479140746	0.408669034	0.939187096	0.435130589	NA	3	1	1	1	1	2.73E-18	4.12E-08	0.233303855	1.28E-12	YES	0_0	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	5	6499765	G	A	UBE2QL1	CCDS47189.1	r.?	-	-	downstream	48	0	0	38	0	0	103	9	8.7	59	8	13.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	NA	0	0.571513466	1.192788279	0.479140746	0.544892046	1.252249461	0.435130589	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	3.21E-09	1	6.90E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	6574177	G	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	50	0	0	75	0	0	48	7	14.6	46	0	0	153	2	1.3	149	1	0.7	128	10	7.8	FALSE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	NA	0	0	0	1	0.584957637	0.584957637	1	0.054054054	NA	0	0.045983842	0.045983842	1	0.312511615	0.718201897	0.435130589	NA	NA	1	1	1	0.178474703	1	0.526152023	4.81E-09	1.30E-09	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	5	7179068	A	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	38	0	0	75	0	0	59	8	13.6	323	0	0	199	0	0	146	0	0	179	13	7.3	FALSE	TRUE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	NA	0	0	0	1	0.544892046	1.252249461	0.435130589	0	0	1	0	0	1	0.292478819	0.672163314	0.435130589	NA	2	1	1	1	1	1	1	6.90E-10	1.12E-11	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	5	7398578	C	A	ADCY2	CCDS3872.2	r.?	-	-	intronic	44	0	0	56	15	26.8	97	2	2.1	68	10	14.7	35	0	0	147	36	24.5	144	3	2.1	161	28	17.4	TRUE	TRUE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	1.114345114	1.114345114	1	0.137951526	0.137951526	1	0.588964197	1.353534344	0.435130589	1.018711019	1.018711019	1	0.137951526	0.137951526	1	0.697141294	0.697141294	1	7	6	1	1	4.09E-22	2.23E-49	0.085302553	0.036214806	2.18E-12	3.28E-34	YES	1_1	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	5	7719525	C	G	ADCY2	CCDS3872.2	r.?	-	-	intronic	44	0	0	60	1	1.7	80	7	8.8	42	0	0	488	0	0	226	1	0.4	139	9	6.5	152	2	1.3	FALSE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0.070686071	0.070686071	1	0.578082586	0.578082586	1	0	NA	0	0.016632017	NA	0	0.426992819	0.891163657	0.479140746	0.052085269	0.052085269	1	NA	NA	1	1	0.259739042	0.677881069	0.00000018	4.46E-08	1	0.176692042	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	5	8119898	A	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	38	10	26.3	103	0	0	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	1.093555094	1.093555094	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	4.06E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	8122124	A	C	-	-	-	-	-	-	46	0	0	48	12	25	77	0	0	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	1.03950104	1.03950104	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.44E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	8177112	G	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	32	0	0	48	10	20.8	33	1	3	139	0	0	106	0	0	114	22	19.3	115	1	0.9	TRUE	TRUE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	0	1	1.366377022	1.366377022	1	0.120196775	0.120196775	1	0	0	1	1.267840217	1.267840217	1	0.036059032	0.036059032	1	2	1	1	1	1	1	5.37E-14	2.79E-28	0.15245715	0.438106141	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	5	9509532	G	A	SEMA5A	CCDS3875.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	32	12	37.5	67	0	0	39	5	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	1.559251559	1.559251559	1	0	0	1	0.512839573	0.512839573	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.03E-20	1	1	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	10156617	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	47	0	0	78	10	12.8	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	0	1	0.840847398	0.840847398	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	9.02E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	11016891	T	A	CTNND2	CCDS3881.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	39	7	17.9	83	0	0	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0.744282744	0.744282744	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.04E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	12282141	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	42	15	35.7	77	46	59.7	59	20	33.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	1.484407484	1.484407484	1	3.921764817	1.127222238	3.479140746	1.358223555	1.358223555	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.65E-24	1	3.92E-85	1	2.21E-31	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	12420765	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	30	0	0	84	9	10.7	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	0	1	0.702895872	0.702895872	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	5.13E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	13056160	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	38	6	15.8	75	8	10.7	50	11	22	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0.656964657	0.656964657	1	0.702895872	0.702895872	1	0.881443015	0.881443015	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.76E-08	1	4.89E-09	1	1.52E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	13165399	T	C	-	-	-	-	-	-	17	0	0	34	0	0	59	26	44.1	35	6	17.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	0	1	2.896982051	0.965660684	3	0.685121616	0.685121616	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	5.03E-44	1	2.24E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	13641527	G	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	56	0	0	81	6	7.4	66	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	NA	0	0.486114902	1.014555548	0.479140746	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.00000368	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	13667042	G	A	-	-	-	-	-	-	54	0	0	50	0	0	76	0	0	51	10	19.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	NA	0	0	NA	0	0.785285595	0.785285595	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	1.04E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	13780481	T	C	DNAH5	CCDS3882.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	41	0	0	84	14	16.7	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	NA	0	1.097043089	1.097043089	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.40E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	13992422	G	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	46	15	32.6	78	4	5.1	68	11	16.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	1.355509356	1.355509356	1	0.335025135	0.699220715	0.479140746	0.649062584	0.649062584	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.35E-23	1	0.000663934	1	5.76E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	14253223	G	C	TRIO	CCDS3883.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	46	13	28.3	97	16	16.5	49	12	24.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	1.176715177	1.176715177	1	1.083904849	1.083904849	1	0.981606994	0.981606994	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.07E-19	1	8.26E-20	1	1.90E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	14529261	C	G	TRIO	ENST00000513206	r.?	-	-	intronic	41	0	0	35	0	0	68	24	35.3	58	6	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	NA	0	2.318899464	0.935364185	2.479140746	0.412675594	0.948394813	0.435130589	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	7.25E-38	1	0.000000506	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	14788172	T	C	ANKH	CCDS3885.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	56	14	25	80	12	15	72	19	26.4	224	0	0	148	29	19.6	127	20	15.7	140	36	25.7	TRUE	TRUE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	1.03950104	1.03950104	1	0.985368044	0.985368044	1	1.057731618	1.057731618	1	0.814968815	0.814968815	1	1.031351886	1.031351886	1	1.029685704	1.029685704	1	8	5	1	1	2.91E-20	5.43E-37	1.07E-14	5.78E-24	1.75E-27	3.08E-50	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	5	16095884	C	T	Mar-11	CCDS47192.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	42	8	19	60	10	16.7	52	8	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0.79002079	0.79002079	1	1.097043089	1.097043089	1	0.617010111	0.617010111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.96E-11	1	5.86E-13	1	2.42E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	16226732	C	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	44	0	0	77	6	7.8	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	NA	0	0.512391383	1.069396388	0.479140746	0.084137742	0.084137742	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.00000273	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	16227007	C	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	45	0	0	78	13	16.7	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	4.479140746	2.435130589	1	3	1	1	1	1	1	0.520859254	0.564869411	NA	4	2	NA	1	1	NA	0.479140746	0.435130589	0	0	1	1.097043089	1.097043089	1	0.092150861	0.092150861	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.99E-16	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	16259685	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	37	0	0	73	24	32.9	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.552922733	2.435130589	1	2	1	1	1	1	1	0.447077267	0.564869411	NA	3	2	NA	1	1	NA	0.552922733	0.435130589	0	0	1	1.856514851	0.928257426	2	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.58E-37	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	16897773	C	T	MYO10	ENST00000427430	r.?	-	-	intronic	30	0	0	53	11	20.8	82	34	41.5	45	17	37.8	480	0	0	194	43	22.2	213	123	57.7	173	70	40.5	TRUE	TRUE	2	3.552922733	2.435130589	1	2	1	1	1	1	1	0.447077267	0.564869411	NA	3	2	NA	1	1	NA	0.552922733	0.435130589	0.864864865	0.864864865	1	2.341804447	0.9173033	2.552922733	1.514479363	1.055290281	1.435130589	0.923076923	0.923076923	1	3.255954617	1.275383142	2.552922733	1.62265646	1.130668158	1.435130589	8	7	1	1	3.07E-15	1.38E-56	5.98E-56	3.36E-222	7.37E-28	1.59E-112	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	5	17699269	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	38	6	15.8	72	0	0	61	0	0	1	0	0	1	1	100	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.552922733	2.435130589	1	2	1	1	1	1	1	0.447077267	0.564869411	NA	3	2	NA	1	1	NA	0.552922733	0.435130589	0.656964657	0.656964657	1	0	0	1	0	NA	0	4.158004158	4.158004158	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	3.76E-08	0.005	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	19025297	T	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	44	0	0	73	10	13.7	66	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.552922733	2.435130589	1	2	1	1	1	1	1	0.447077267	0.564869411	NA	3	2	NA	1	1	NA	0.552922733	0.435130589	0	NA	0	0.773077613	0.773077613	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	4.56E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	22486857	C	T	CDH12	CCDS3890.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	41	1	2.4	55	15	27.3	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.552922733	2	1	2	1	1	1	1	1	0.447077267	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.552922733	NA	0.0997921	0.0997921	1	1.540512323	0.992008354	1.552922733	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.18577148	1	3.01E-22	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	23981470	A	T	C5orf17	ENST00000507936	r.?	-	-	downstream	41	0	0	37	0	0	62	10	16.1	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.658486708	0.658486708	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.29E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	24242553	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	47	8	17	48	0	0	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.706860707	0.706860707	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.03E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	24295705	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	44	4	9.1	50	12	24	48	8	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.378378378	0.378378378	1	0.981595092	0.981595092	1	0.596428571	0.596428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.0000723	1	2.49E-17	1	1.23E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	25175637	G	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	54	12	22.2	54	0	0	66	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.923076923	0.923076923	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	6.90E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	25197820	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	45	0	0	48	7	14.6	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.597137014	0.597137014	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.81E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	25252160	T	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	45	0	0	53	10	18.9	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.773006135	0.773006135	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.57E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	25788641	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	44	10	22.7	44	0	0	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.943866944	0.943866944	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.08E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	26239910	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	42	0	0	42	7	16.7	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.683026585	0.683026585	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.81E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	27360334	T	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	51	0	0	66	14	21.2	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.867075665	0.867075665	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.71E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	27694273	C	T	-	-	-	-	-	-	49	0	0	58	0	0	47	6	12.8	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.523517382	0.523517382	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000141	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	27694820	C	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	41	0	0	55	6	10.9	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.445807771	0.445807771	1	0.082142857	0.082142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000367	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	27695591	C	G	-	-	-	-	-	-	32	0	0	38	0	0	50	10	20	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.81799591	0.81799591	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.36E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	27862126	C	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	40	0	0	62	13	21	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.858895706	0.858895706	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.08E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	27863710	C	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	44	0	0	77	6	7.8	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.319018405	0.319018405	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000273	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	27864070	C	G	-	-	-	-	-	-	41	0	0	51	0	0	75	14	18.7	57	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.764826176	0.764826176	1	0.064285714	0.064285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.57E-18	1	0.248523156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	27864483	C	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	42	0	0	60	9	15	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.613496933	0.613496933	1	0.071428571	0.071428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.29E-11	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	27864564	C	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	40	0	0	65	11	16.9	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.691206544	0.691206544	1	0.071428571	0.071428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.41E-14	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	27864742	C	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	44	0	0	49	9	18.4	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.752556237	0.752556237	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.35E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	27864768	C	G	-	-	-	-	-	-	32	0	0	42	0	0	53	12	22.6	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.924335378	0.924335378	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.39E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	27865920	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	47	0	0	73	12	16.4	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.670756646	0.670756646	1	0.157142857	0.157142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.39E-15	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	27866492	C	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	39	0	0	64	12	18.8	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.768916155	0.768916155	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.30E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	27866991	C	G	-	-	-	-	-	-	50	0	0	50	0	0	69	8	11.6	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.474437628	0.474437628	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.49E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	27868703	C	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	39	0	0	66	11	16.7	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.683026585	0.683026585	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.07E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	27869323	C	G	-	-	-	-	-	-	45	0	0	46	0	0	63	9	14.3	54	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.584867076	0.584867076	1	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.62E-11	1	0.237137336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	27869517	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	29	0	0	61	14	23	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.940695297	0.940695297	1	0.075	0.075	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.10E-19	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	27960865	C	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	58	0	0	61	10	16.4	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.670756646	0.670756646	1	0.085714286	0.085714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.98E-13	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	28083519	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	35	8	22.9	58	0	0	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.952182952	0.952182952	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	8.15E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	28781655	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	52	7	13.5	44	10	22.7	51	8	15.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.561330561	0.561330561	1	0.928425358	0.928425358	1	0.560714286	0.560714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	8.58E-09	1	2.08E-14	1	2.05E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	29230707	T	A	-	-	-	-	-	-	49	0	0	50	0	0	49	11	22.4	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.916155419	0.916155419	1	0.078571429	0.078571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.19E-15	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	29667745	A	G	-	-	-	-	-	-	52	0	0	38	0	0	51	7	13.7	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.560327198	0.560327198	1	0.078571429	0.078571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.46E-09	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	30093382	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	46	0	0	60	10	16.7	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.683026585	0.683026585	1	0.153571429	0.153571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.86E-13	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	30295820	G	C	-	-	-	-	-	-	42	0	0	47	0	0	64	5	7.8	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.319018405	0.319018405	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000186	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	30304620	T	A	-	-	-	-	-	-	50	0	0	42	0	0	45	1	2.2	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.08997955	0.08997955	1	0.389285714	0.389285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.201934322	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	30395647	T	G	-	-	-	-	-	-	41	1	2.4	35	0	0	46	12	26.1	49	2	4.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.067484663	1.067484663	1	0.146428571	0.146428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	0.18577148	1	1	1	8.12E-18	1	0.025168485	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	30536233	G	A	-	-	-	-	-	-	51	0	0	32	0	0	45	1	2.2	46	7	15.2	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.08997955	0.08997955	1	0.542857143	0.542857143	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.201934322	1	3.53E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	30935660	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	48	15	31.2	57	21	36.8	43	8	18.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.297297297	1.297297297	1	1.505112474	1.505112474	1	0.664285714	0.664285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.86E-23	1	8.56E-34	1	4.85E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	32498709	C	G	-	-	-	-	-	-	45	0	0	47	13	27.7	59	20	33.9	45	13	28.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.151767152	1.151767152	1	1.386503067	1.386503067	1	1.032142857	1.032142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.47E-19	1	2.21E-31	1	7.68E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	33877961	A	G	ADAMTS12	ENST00000504830	r.?	-	-	intronic	35	0	0	39	8	20.5	61	0	0	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852390852	0.852390852	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.09E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	35340822	C	T	-	-	-	-	-	-	52	0	0	43	5	11.6	54	1	1.9	52	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.482328482	0.482328482	1	0.077709611	0.077709611	1	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.00000257	1	0.237137336	1	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	39405103	G	T	DAB2	CCDS34149.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	59	10	16.9	56	4	7.1	61	15	24.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.702702703	0.702702703	1	0.290388548	0.290388548	1	0.878571429	0.878571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.91E-13	1	0.000186538	1	1.73E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	42330581	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	45	0	0	59	14	23.7	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.969325153	0.969325153	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.58E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	42990821	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	48	14	29.2	47	1	2.1	46	9	19.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.214137214	1.214137214	1	0.085889571	0.085889571	1	0.7	0.7	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.51E-21	1	0.209895027	1	1.82E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	43213440	T	G	ENSG00000177453	CCDS3943.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	40	3	7.5	52	4	7.7	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.311850312	0.311850312	1	0.314928425	0.314928425	1	0.085714286	0.085714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.001075403	1	0.000139698	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	43587633	A	G	-	-	-	-	-	-	42	1	2.4	56	3	5.4	73	5	6.8	35	8	22.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.224532225	0.224532225	1	0.278118609	0.278118609	1	0.817857143	0.817857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	0.189842622	1	0.00284314	1	0.0000354	1	8.15E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	44126591	T	C	-	-	-	-	-	-	50	0	0	53	13	24.5	51	0	0	54	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.018711019	1.018711019	1	0	0	1	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	8.53E-19	1	1	1	0.237137336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	44297797	C	G	-	-	-	-	-	-	45	0	0	41	0	0	47	0	0	48	8	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.596428571	0.596428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	1.23E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	46374884	G	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	54	0	0	61	7	11.5	47	5	10.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.470347648	0.470347648	1	0.378571429	0.378571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	2.69E-08	1	0.00000402	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	50180476	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	55	15	27.3	51	0	0	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.135135135	1.135135135	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.01E-22	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	50244247	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	42	11	26.2	39	0	0	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.089397089	1.089397089	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.81E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	51002376	G	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	46	10	21.7	55	15	27.3	36	6	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.902286902	0.902286902	1	1.116564417	1.116564417	1	0.596428571	0.596428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.38E-14	1	3.01E-22	1	2.68E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	51055718	T	C	-	-	-	-	-	-	36	0	0	52	15	28.8	57	16	28.1	53	15	28.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.197505198	1.197505198	1	1.149284254	1.149284254	1	1.010714286	1.010714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.15E-22	1	7.28E-24	1	1.60E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	51228511	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	58	14	24.1	63	10	15.9	42	11	26.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.002079002	1.002079002	1	0.650306748	0.650306748	1	0.935714286	0.935714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.04E-20	1	9.81E-13	1	1.81E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	51397015	C	A	-	-	-	-	-	-	40	1	2.5	34	10	29.4	60	0	0	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.222453222	1.222453222	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	0.181679879	1	1.15E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	51765393	G	C	-	-	-	-	-	-	47	0	0	31	9	29	62	0	0	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.205821206	1.205821206	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.57E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	52463832	G	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	35	9	25.7	47	8	17	48	15	31.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.068607069	1.068607069	1	0.695296524	0.695296524	1	1.114285714	1.114285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.23E-13	1	1.03E-10	1	2.86E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	52463864	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	36	9	25	47	7	14.9	45	13	28.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.03950104	1.03950104	1	0.609406953	0.609406953	1	1.032142857	1.032142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.63E-13	1	4.12E-09	1	7.68E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	54599169	G	A	DHX29	CCDS34158.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	33	0	0	50	0	0	48	7	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.521428571	0.521428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	4.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	54807526	G	A	PPAP2A	CCDS34159.1	r.?	-	-	intronic	17	0	0	30	8	26.7	14	0	0	26	5	19.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.11018711	1.11018711	1	0	0	1	0.685714286	0.685714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.07E-12	1	1	1	0.000000188	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	56528969	A	T	GPBP1	CCDS47212.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	48	15	31.2	52	0	0	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.297297297	1.297297297	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.86E-23	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	57035818	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	42	13	31	46	2	4.3	49	7	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.288981289	1.288981289	1	0.175869121	0.175869121	1	0.510714286	0.510714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.72E-20	1	0.022369545	1	5.58E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	57137329	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	48	15	31.2	56	0	0	44	7	15.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.297297297	1.297297297	1	0	0	1	0.567857143	0.567857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.86E-23	1	1	1	2.55E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	57467882	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	50	6	12	38	0	0	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.498960499	0.498960499	1	0	0	1	0.089285714	0.089285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	6	NA	1	1	0.000000206	1	1	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	58863553	T	G	PDE4D	CCDS47213.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	40	0	0	52	12	23.1	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.944785276	0.944785276	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.19E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	59062716	C	G	PDE4D	CCDS47213.1	r.?	-	-	intronic	50	0	0	38	0	0	52	11	21.2	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.867075665	0.867075665	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.44E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	59555321	C	T	PDE4D	CCDS47032.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	44	0	0	53	6	11.3	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.462167689	0.462167689	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000293	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	59680521	T	A	PDE4D	CCDS47032.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	55	12	21.8	61	0	0	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.906444906	0.906444906	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	8.78E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	60240542	C	A	ERCC8	CCDS3978.1	r.?	-	-	intronic	15	0	0	16	0	0	24	4	16.7	17	2	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.683026585	0.683026585	1	0.421428571	0.421428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.00000613	1	0.003234386	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	60461979	T	A	C5orf43	CCDS34165.1	r.?	-	-	upstream	35	0	0	49	0	0	40	5	12.5	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.511247444	0.511247444	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000178	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	62134045	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	41	0	0	53	6	11.3	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.462167689	0.462167689	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000293	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	62134046	C	G	-	-	-	-	-	-	32	0	0	42	0	0	55	6	10.9	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.445807771	0.445807771	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000367	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	62340676	C	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	40	1	2.5	48	1	2.1	42	6	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.103950104	0.103950104	1	0.085889571	0.085889571	1	0.510714286	0.510714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	0.181679879	1	0.213845552	1	7.02E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	62914103	G	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	37	0	0	45	4	8.9	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.36400818	0.36400818	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000791	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	63179535	G	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	44	0	0	63	0	0	62	7	11.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.403571429	0.403571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	3.02E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	63288348	C	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	42	0	0	41	6	14.6	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.597137014	0.597137014	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.05E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	63393790	T	C	-	-	-	-	-	-	41	0	0	45	0	0	50	9	18	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.736196319	0.736196319	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.07E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	63415821	G	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	47	17	36.2	53	13	24.5	55	12	21.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.505197505	1.505197505	1	1.00204499	1.00204499	1	0.778571429	0.778571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.81E-27	1	8.53E-19	1	8.78E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	63602972	G	A	RNF180	CCDS47219.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	38	0	0	41	11	26.8	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.096114519	1.096114519	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.34E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	63624315	A	T	RNF180	CCDS47219.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	48	15	31.2	51	0	0	50	2	4	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.297297297	1.297297297	1	0	0	1	0.142857143	0.142857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.86E-23	1	1	1	0.026131524	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	64399334	C	A	-	-	-	-	-	-	50	0	0	38	12	31.6	61	1	1.6	51	13	25.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.313929314	1.313929314	1	0.065439673	0.065439673	1	0.910714286	0.910714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.86E-19	1	0.263440347	1	4.87E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	64440911	C	A	ADAMTS6	CCDS3983.2	r.?	-	-	downstream	49	0	0	46	15	32.6	58	15	25.9	40	10	25	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.355509356	1.355509356	1	1.059304703	1.059304703	1	0.892857143	0.892857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.35E-23	1	7.42E-22	1	7.22E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	68038691	T	C	-	-	-	-	-	-	47	0	0	52	0	0	59	13	22	53	11	20.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.899795501	0.899795501	1	0.742857143	0.742857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	3.99E-18	1	3.07E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	71145802	C	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	48	8	16.7	54	13	24.1	43	12	27.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.694386694	0.694386694	1	0.985685072	0.985685072	1	0.996428571	0.996428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.23E-10	1	1.12E-18	1	3.24E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	73128222	C	G	ENSG00000214944	CCDS47231.1	r.1260c>g	c.1084C>G	p.R362G	missense	36	0	0	39	10	25.6	55	14	25.5	46	12	26.1	307	1	0.3	205	49	23.9	153	35	22.9	182	48	26.4	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.064449064	1.064449064	1	1.042944785	1.042944785	1	0.932142857	0.932142857	1	0.993762994	0.993762994	1	0.936605317	0.936605317	1	0.942857143	0.942857143	1	8	5	1	0.785372291	5.44E-15	4.94E-66	2.19E-20	6.79E-47	8.12E-18	4.92E-67	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	5	73969614	C	T	HEXB	ENST00000511181	r.?	-	-	intronic	35	0	0	47	10	21.3	59	13	22	36	8	22.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.885654886	0.885654886	1	0.899795501	0.899795501	1	0.792857143	0.792857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.27E-14	1	3.99E-18	1	1.04E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	77863362	C	A	LHFPL2	CCDS4042.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	42	11	26.2	57	2	3.5	50	8	16	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.089397089	1.089397089	1	0.143149284	0.143149284	1	0.571428571	0.571428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.81E-16	1	0.03327602	1	1.74E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	78929588	G	C	PAPD4	CCDS4048.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	39	13	33.3	40	0	0	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.384615385	1.384615385	1	0	0	1	0.092857143	0.092857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	8.79E-21	1	1	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	79205731	C	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	45	0	0	62	21	33.9	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.386503067	1.386503067	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.22E-33	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	80384547	C	T	RASGRF2	CCDS4052.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	50	11	22	48	3	6.2	47	14	29.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914760915	0.914760915	1	0.253578732	0.253578732	1	1.064285714	1.064285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.52E-15	1	0.001827434	1	1.79E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	83819629	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	37	10	27	57	0	0	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.122661123	1.122661123	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.01E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	84689297	A	G	-	-	-	-	-	-	32	0	0	51	14	27.5	65	0	0	47	12	25.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.143451143	1.143451143	1	0	0	1	0.910714286	0.910714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	6.64E-21	1	1	1	1.09E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	85350392	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	32	9	28.1	54	16	29.6	47	12	25.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.168399168	1.168399168	1	1.210633947	1.210633947	1	0.910714286	0.910714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.94E-14	1	2.69E-24	1	1.09E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	86914011	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	39	11	28.2	47	0	0	49	5	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.172557173	1.172557173	1	0	0	1	0.364285714	0.364285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.20E-17	1	1	1	0.00000496	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	87062074	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	44	7	15.9	46	0	0	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.661122661	0.661122661	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.55E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	89054765	T	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	47	0	0	48	6	12.5	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.511247444	0.511247444	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000016	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	89535529	A	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	47	11	23.4	46	4	8.7	52	14	26.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.972972973	0.972972973	1	0.355828221	0.355828221	1	0.960714286	0.960714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.21E-16	1	0.0000862	1	9.04E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	89674622	C	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	51	0	0	61	0	0	46	9	19.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.7	0.7	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	1.82E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	90485612	A	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	51	14	27.5	53	10	18.9	56	21	37.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.143451143	1.143451143	1	0.773006135	0.773006135	1	1.339285714	1.339285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.64E-21	1	1.57E-13	1	5.43E-34	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	90710609	G	A	-	-	-	-	-	-	56	0	0	43	9	20.9	62	2	3.2	47	8	17	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.869022869	0.869022869	1	0.130879346	0.130879346	1	0.607142857	0.607142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.45E-13	1	0.038789653	1	1.03E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	91116119	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	44	7	15.9	50	2	4	44	9	20.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.661122661	0.661122661	1	0.163599182	0.163599182	1	0.732142857	0.732142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.55E-09	1	0.026131524	1	1.18E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	91480840	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	41	8	19.5	47	3	6.4	40	10	25	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.810810811	0.810810811	1	0.261758691	0.261758691	1	0.892857143	0.892857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.22E-11	1	0.001719595	1	7.22E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	91997366	C	T	-	-	-	-	-	-	48	0	0	56	0	0	55	15	27.3	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.116564417	1.116564417	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.01E-22	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	93207126	C	A	MIR2277	CCDS4069.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	52	13	25	59	0	0	65	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.03950104	1.03950104	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	6.47E-19	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	93885845	C	A	C5orf36	CCDS4070.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	52	0	0	59	12	20.3	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.830265849	0.830265849	1	0.35	0.35	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	2.20E-16	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	94451974	T	A	MCTP1	ENST00000515393	r.?	-	-	intronic	48	0	0	49	0	0	61	0	0	60	8	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.475	0.475	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	7.93E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	95398140	G	A	-	-	-	-	-	-	54	0	0	37	8	21.6	53	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.898128898	0.898128898	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.33E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	96159699	T	A	ENSG00000247121	ENST00000504056	r.?	-	-	intronic	37	0	0	32	0	0	61	14	23	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.940695297	0.940695297	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.10E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	97087736	G	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	27	0	0	54	13	24.1	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.985685072	0.985685072	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.12E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	98463845	G	C	-	-	-	-	-	-	41	0	0	41	9	22	55	0	0	45	0	0	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914760915	0.914760915	1	0	0	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.92E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	99548330	A	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	33	6	18.2	48	4	8.3	47	5	10.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.756756757	0.756756757	1	0.339468303	0.339468303	1	0.378571429	0.378571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.54E-08	1	0.000102016	1	0.00000402	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	99753941	A	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	43	0	0	50	7	14	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.572597137	0.572597137	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.46E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	101203035	G	A	-	-	-	-	-	-	49	0	0	39	15	38.5	62	0	0	61	1	1.6	221	0	0	181	34	18.8	81	0	0	100	3	3	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.600831601	1.600831601	1	0	0	1	0.057142857	0.057142857	1	0.781704782	0.781704782	1	0	0	1	0.107142857	0.107142857	1	6	4	1	1	6.85E-25	2.03E-42	1	1	0.263440347	0.014102917	YES	1_1	0_0	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	5	102367875	C	T	PAM	CCDS43348.1	r.?	-	-	downstream	37	0	0	41	9	22	56	2	3.6	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914760915	0.914760915	1	0.147239264	0.147239264	1	0.389285714	0.389285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.92E-13	1	0.032213353	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	103371721	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	50	17	34	44	12	27.3	44	15	34.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.413721414	1.413721414	1	1.116564417	1.116564417	1	1.217857143	1.217857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.43E-27	1	4.44E-18	1	6.12E-24	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	103905915	T	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	44	1	2.3	57	0	0	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.095634096	0.095634096	1	0	0	1	0.396428571	0.396428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	0.197923942	1	1	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	104830673	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	57	12	21.1	56	0	0	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.877338877	0.877338877	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.40E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	105904633	A	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	48	7	14.6	67	0	0	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.607068607	0.607068607	1	0	0	1	0.160714286	0.160714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.81E-09	1	1	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	105922232	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	54	0	0	44	11	25	53	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.022494888	1.022494888	1	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.22E-16	1	0.233303855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	106316435	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	46	0	0	46	6	13	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.531697342	0.531697342	1	0.078571429	0.078571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000123	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	107060490	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	32	5	15.6	53	0	0	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.648648649	0.648648649	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000000562	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	108781262	T	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	20	0	0	26	6	23.1	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.944785276	0.944785276	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.30E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	109474560	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	46	6	13	53	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.540540541	0.540540541	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000000123	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	109669326	G	A	TMEM232	CCDS33841.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	49	0	0	47	11	23.4	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.957055215	0.957055215	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.21E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	110011100	G	A	TMEM232	CCDS47253.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	42	0	0	51	12	23.5	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.961145194	0.961145194	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.24E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	110144706	A	C	-	-	-	-	-	-	42	0	0	47	10	21.3	51	0	0	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.885654886	0.885654886	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.27E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	110292847	C	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	42	10	23.8	46	6	13	49	12	24.5	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.98960499	0.98960499	1	0.531697342	0.531697342	1	0.875	0.875	1	4.158004158	4.158004158	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.24E-14	0.005	0.000000123	1	1.90E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	110340865	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	35	6	17.1	57	0	0	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.711018711	0.711018711	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.24E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	110819898	G	A	CAMK4	CCDS4103.1	r.1554g>a	c.1156G>A	p.A386T	missense	48	0	0	53	16	30.2	61	0	0	58	0	0	217	0	0	153	25	16.3	181	0	0	151	2	1.3	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.255717256	1.255717256	1	0	0	1	0	0	1	0.677754678	0.677754678	1	0	0	1	0.046428571	0.046428571	1	6	4	1	1	1.90E-24	5.40E-30	1	1	1	0.17491221	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	5	111168447	C	A	C5orf13	CCDS47255.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	51	11	21.6	47	0	0	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.898128898	0.898128898	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.94E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	111965939	C	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	49	13	26.5	54	16	29.6	53	18	34	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.101871102	1.101871102	1	1.210633947	1.210633947	1	1.214285714	1.214285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.71E-19	1	2.69E-24	1	2.09E-28	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	113815676	C	A	KCNN2	CCDS43352.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	44	7	15.9	48	0	0	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.661122661	0.661122661	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.55E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	116223453	T	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	41	11	26.8	51	3	5.9	42	8	19	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.114345114	1.114345114	1	0.241308793	0.241308793	1	0.678571429	0.678571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.34E-16	1	0.002175924	1	3.96E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	120211820	C	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	47	9	19.1	39	0	0	60	2	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.794178794	0.794178794	1	0	0	1	0.117857143	0.117857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.24E-12	1	1	1	0.036544784	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	120407227	T	C	-	-	-	-	-	-	43	0	0	55	8	14.5	46	0	0	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.602910603	0.602910603	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.86E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	121126142	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	47	0	0	44	9	20.5	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.838445808	0.838445808	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.18E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	121231538	G	A	-	-	-	-	-	-	63	0	0	36	10	27.8	53	1	1.9	52	5	9.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.155925156	1.155925156	1	0.077709611	0.077709611	1	0.342857143	0.342857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.21E-15	1	0.233303855	1	0.00000668	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	121831737	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	42	9	21.4	44	0	0	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.88981289	0.88981289	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	7.51E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	122067979	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	58	1	1.7	48	8	16.7	54	0	0	191	0	0	222	0	0	119	30	25.2	131	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.070686071	0.070686071	1	0.683026585	0.683026585	1	0	0	1	0	0	1	1.030674847	1.030674847	1	0	0	1	2	1	1	1	0.252280541	1	1.23E-10	7.70E-42	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	5	123094146	C	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	42	14	33.3	54	2	3.7	50	2	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.384615385	1.384615385	1	0.151329243	0.151329243	1	0.142857143	0.142857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.83E-22	1	0.030129377	1	0.026131524	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	123401387	T	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	43	11	25.6	54	18	33.3	46	15	32.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.064449064	1.064449064	1	1.36196319	1.36196319	1	1.164285714	1.164285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.42E-16	1	3.12E-28	1	1.35E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	127414652	C	T	SLC12A2	CCDS4144.1	r.?	-	-	upstream	47	0	0	49	0	0	60	9	15	68	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.613496933	0.613496933	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.29E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	128079087	C	T	SLC27A6	ENST00000508645	r.?	-	-	intronic	28	0	0	41	10	24.4	57	16	28.1	44	7	15.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.014553015	1.014553015	1	1.149284254	1.149284254	1	0.567857143	0.567857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	9.51E-15	1	7.28E-24	1	2.55E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	128673966	A	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	42	0	0	47	10	21.3	75	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.871165644	0.871165644	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.27E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	129159406	C	G	-	-	-	-	-	-	45	0	0	44	14	31.8	43	8	18.6	53	11	20.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.322245322	1.322245322	1	0.760736196	0.760736196	1	0.742857143	0.742857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.10E-22	1	4.85E-11	1	3.07E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	130159909	A	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	62	0	0	58	2	3.4	41	6	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.139059305	0.139059305	1	0.521428571	0.521428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.034352256	1	6.05E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	131323633	G	A	ACSL6	CCDS34229.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	54	8	14.8	61	0	0	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.615384615	0.615384615	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.31E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	134043029	T	A	SEC24A	CCDS43363.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	43	7	16.3	43	0	0	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.677754678	0.677754678	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.15E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	136512802	A	G	SPOCK1	CCDS4191.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	44	9	20.5	49	2	4.1	42	7	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852390852	0.852390852	1	0.167689162	0.167689162	1	0.596428571	0.596428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.18E-12	1	0.025168485	1	1.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	136932739	A	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	39	0	0	58	14	24.1	54	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.985685072	0.985685072	1	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.04E-20	1	0.237137336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	136964183	G	A	KLHL3	CCDS4192.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	42	10	23.8	46	0	0	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.98960499	0.98960499	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.24E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	139116550	C	A	-	-	-	-	-	-	51	0	0	57	0	0	56	1	1.8	67	6	9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.073619632	0.073619632	1	0.321428571	0.321428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.244746891	1	0.0000012	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	139736924	G	T	SLC4A9	CCDS47278.1	r.?	-	-	upstream	45	0	0	46	11	23.9	51	14	27.5	43	10	23.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.993762994	0.993762994	1	1.124744376	1.124744376	1	0.832142857	0.832142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.55E-16	1	6.64E-21	1	1.61E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	140313493	T	A	PCDHA11	CCDS47284.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	51	0	0	63	11	17.5	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.715746421	0.715746421	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.37E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	140331824	G	T	PCDHA11	CCDS47284.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	41	0	0	53	13	24.5	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.00204499	1.00204499	1	0.089285714	0.089285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.53E-19	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	140478436	T	C	PCDHB3	CCDS4245.1	r.?	-	-	upstream	26	0	0	37	10	27	46	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.122661123	1.122661123	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.01E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	141000865	G	A	HDAC3	CCDS4264.1	r.1537c>u	c.?	p.?	3'UTR variant	39	0	0	44	13	29.5	53	13	24.5	52	18	34.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.226611227	1.226611227	1	1.00204499	1.00204499	1	1.235714286	1.235714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.49E-20	1	8.53E-19	1	1.39E-28	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	141788701	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	52	16	30.8	39	2	5.1	39	6	15.4	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.280665281	1.280665281	1	0.208588957	0.208588957	1	0.55	0.55	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.33E-24	1	0.016387522	1	4.43E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	142312472	C	G	ARHGAP26	CCDS47297.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	43	4	9.3	46	0	0	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.386694387	0.386694387	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000066	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	142650648	C	T	-	-	-	-	-	-	49	0	0	48	5	10.4	56	0	0	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.432432432	0.432432432	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.00000447	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	142785414	T	A	NR3C1	CCDS4278.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	54	0	0	37	5	13.5	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.552147239	0.552147239	1	0.096428571	0.096428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000119	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	144640930	C	T	-	-	-	-	-	-	53	0	0	44	11	25	46	2	4.3	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.03950104	1.03950104	1	0.175869121	0.175869121	1	0.35	0.35	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.22E-16	1	0.022369545	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	145538146	T	C	LARS	CCDS34265.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	47	11	23.4	56	12	21.4	48	16	33.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.972972973	0.972972973	1	0.875255624	0.875255624	1	1.189285714	1.189285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	7.21E-16	1	1.11E-16	1	2.96E-25	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	145905964	G	T	-	-	-	-	-	-	59	0	0	31	9	29	42	1	2.4	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.205821206	1.205821206	1	0.098159509	0.098159509	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.57E-14	1	0.189842622	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	147665917	C	G	SPINK5L3	CCDS43383.1	r.?	-	-	downstream	37	0	0	45	9	20	52	0	0	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.47E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	149253044	G	A	PDE6A	CCDS4299.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	40	0	0	43	9	20.9	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.854805726	0.854805726	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.45E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	149292034	G	A	PDE6A	CCDS4299.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	40	13	32.5	65	1	1.5	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.351351351	1.351351351	1	0.061349693	0.061349693	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.30E-20	1	0.278061424	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	150628801	G	T	GM2A	CCDS4313.1	r.?	-	-	upstream	28	1	3.6	40	8	20	66	17	25.8	55	15	27.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	1.055214724	1.055214724	1	0.975	0.975	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	0.130947004	1	2.61E-11	1	1.52E-24	1	3.01E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	151327854	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	33	0	0	57	15	26.3	69	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.075664622	1.075664622	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.53E-22	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	152199388	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	37	7	18.9	51	10	19.6	41	8	19.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.785862786	0.785862786	1	0.801635992	0.801635992	1	0.696428571	0.696428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	7.05E-10	1	1.04E-13	1	3.22E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	153117903	G	T	GRIA1	CCDS4322.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	35	0	0	50	8	16	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.654396728	0.654396728	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.74E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	153631028	C	T	GALNT10	CCDS4325.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	40	10	25	58	11	19	52	14	26.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.03950104	1.03950104	1	0.777096115	0.777096115	1	0.960714286	0.960714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	7.22E-15	1	8.96E-15	1	9.04E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	154341576	C	A	MRPL22	CCDS43391.1	r.?	-	-	intronic	41	1	2.4	69	1	1.4	61	15	24.6	52	6	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.058212058	0.058212058	1	1.006134969	1.006134969	1	0.410714286	0.410714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	0.18577148	1	0.292392265	1	1.73E-21	1	0.000000261	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	154586605	A	G	-	-	-	-	-	-	44	0	0	53	11	20.8	58	0	0	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.864864865	0.864864865	1	0	0	1	0.075	0.075	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.07E-15	1	1	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	156567968	T	C	MED7	CCDS4334.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	46	0	0	54	14	25.9	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.059304703	1.059304703	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.64E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	157126902	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	37	0	0	40	14	35	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.431492843	1.431492843	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.25E-22	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	157191684	C	T	LSM11	CCDS4342.1	r.?	-	-	downstream	40	0	0	47	0	0	49	8	16.3	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.666666667	0.666666667	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.47E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	157329408	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	40	8	20	48	0	0	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.61E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	158808637	G	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	49	8	16.3	48	2	4.2	52	9	17.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.677754678	0.677754678	1	0.171779141	0.171779141	1	0.617857143	0.617857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.47E-10	1	0.024220359	1	5.92E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	159756340	T	A	CCNJL	ENST00000377503	r.?	-	-	intronic	28	0	0	46	15	32.6	39	1	2.6	43	7	16.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.355509356	1.355509356	1	0.106339468	0.106339468	1	0.582142857	0.582142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.35E-23	1	0.177567718	1	2.15E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	160795537	G	T	GABRB2	CCDS4355.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	33	0	0	51	13	25.5	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.042944785	1.042944785	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.87E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	160835426	A	T	GABRB2	CCDS4355.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	34	0	0	46	7	15.2	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.621676892	0.621676892	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.53E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	164856347	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	40	8	20	50	2	4	37	8	21.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	0.163599182	0.163599182	1	0.771428571	0.771428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.61E-11	1	0.026131524	1	1.33E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	164976244	A	C	-	-	-	-	-	-	36	0	0	62	11	17.7	47	0	0	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.735966736	0.735966736	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.96E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	165108958	A	G	-	-	-	-	-	-	26	0	0	53	13	24.5	54	2	3.7	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.018711019	1.018711019	1	0.151329243	0.151329243	1	0.267857143	0.267857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	8.53E-19	1	0.030129377	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	165839409	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	35	10	28.6	45	3	6.7	48	5	10.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.189189189	1.189189189	1	0.27402863	0.27402863	1	0.371428571	0.371428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.60E-15	1	0.001516071	1	0.00000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	165858018	G	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	43	7	16.3	50	1	2	56	9	16.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.677754678	0.677754678	1	0.081799591	0.081799591	1	0.575	0.575	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.15E-09	1	0.221687443	1	1.20E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	165886411	G	T	-	-	-	-	-	-	48	0	0	47	0	0	54	8	14.8	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.605316973	0.605316973	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.31E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	166376972	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	43	0	0	53	1	1.9	57	11	19.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.077709611	0.077709611	1	0.689285714	0.689285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.233303855	1	7.29E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	167202644	T	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	56	0	0	52	13	25	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.232894803	1	1	1	1	1	1	1	1	0.767105197	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.232894803	0	0	1	1.022494888	1.022494888	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.47E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	167210381	T	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	55	14	25.5	49	1	2	54	7	13	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.232894803	1	1	1	1	1	1	1	1	0.767105197	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.232894803	1.06029106	1.06029106	1	0.081799591	0.081799591	1	0.494562039	0.494562039	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.19E-20	1	0.217776325	1	1.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	168539980	C	A	SLIT3	CCDS4369.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	48	0	0	55	8	14.5	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.232894803	1	1	1	1	1	1	1	1	0.767105197	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.232894803	0	0	1	0.593047035	0.593047035	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.86E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	168885355	G	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	45	0	0	50	11	22	47	0	0	240	0	0	189	0	0	85	13	15.3	185	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2.232894803	1	1	1	1	1	1	1	1	0.767105197	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.232894803	0	0	1	0.899795501	0.899795501	1	0	0	1	0	0	1	0.625766871	0.625766871	1	0	0	1	2	1	1	1	1	1	1.52E-15	6.45E-16	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	5	169136230	C	A	DOCK2	CCDS4371.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	47	0	0	56	16	28.6	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	2.232894803	1	1	1	1	1	1	1	1	0.767105197	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.232894803	0	0	1	1.169734151	1.169734151	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	5.26E-24	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	171175177	C	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	57	0	0	55	7	12.7	60	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.232894803	1	1	1	1	1	1	1	1	0.767105197	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.232894803	0	0	1	0.519427403	0.519427403	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.28E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	172729994	T	G	-	-	-	-	-	-	38	0	0	43	7	16.3	41	0	0	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	2.232894803	1	1	1	1	1	1	1	1	0.767105197	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.232894803	0.677754678	0.677754678	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	2.15E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	173035743	G	A	BOD1	CCDS4389.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	53	0	0	65	13	20	75	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.232894803	1	1	1	1	1	1	1	1	0.767105197	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.232894803	0	0	1	0.81799591	0.81799591	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.57E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	173227362	C	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	30	5	16.7	64	3	4.7	62	13	21	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.232894803	1	1	1	1	1	1	1	1	0.767105197	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.232894803	0.694386694	0.694386694	1	0.192229039	0.192229039	1	0.798907909	0.798907909	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.000000401	1	0.004148608	1	8.08E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	173640560	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	50	11	22	69	11	15.9	50	19	38	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.232894803	1	1	1	1	1	1	1	1	0.767105197	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.232894803	0.914760915	0.914760915	1	0.650306748	0.650306748	1	1.445642882	1.172559799	1.232894803	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.52E-15	1	6.82E-14	1	5.00E-31	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	176544032	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	32	0	0	55	4	7.3	61	10	16.4	0	0	NA	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	2.232894803	1	1	1	1	1	1	1	1	0.767105197	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.232894803	0	NA	0	0.298568507	0.298568507	1	0.623909033	0.623909033	1	NA	NA	1	4.08997955	4.08997955	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000173903	0.005	6.98E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	179122253	G	A	CANX	CCDS4447.1	r.?	-	-	upstream	36	0	0	52	0	0	58	0	0	54	6	11.1	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	2.232894803	1	1	1	1	1	1	1	1	0.767105197	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.232894803	0	0	1	0	NA	0	0.422279895	0.422279895	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000329	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	179172005	C	G	MAML1	CCDS34315.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	41	0	0	48	10	20.8	60	8	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	2.232894803	1	1	1	1	1	1	1	1	0.767105197	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.232894803	0	NA	0	0.850715746	0.850715746	1	0.505975009	0.505975009	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	5.37E-14	1	7.93E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	180513401	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	49	13	26.5	34	6	17.6	46	16	34.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.232894803	1	1	1	1	1	1	1	1	0.767105197	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.232894803	1.101871102	1.101871102	1	0.719836401	0.719836401	1	1.323904534	1.323904534	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.71E-19	1	1.86E-08	1	1.31E-25	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	5	180682737	A	G	TRIM52	CCDS4467.1	r.?	-	-	downstream	35	0	0	68	15	22.1	50	12	24	66	16	24.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.232894803	1	1	1	1	1	1	1	1	0.767105197	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.232894803	0.918918919	0.918918919	1	0.981595092	0.981595092	1	0.920646257	0.920646257	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.06E-20	1	2.49E-17	1	1.03E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	455892	C	T	ENSG00000237960	ENST00000449432	r.?	-	-	intronic	39	0	0	41	8	19.5	46	0	0	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.810810811	0.810810811	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.22E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	966742	C	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	53	0	0	53	0	0	47	6	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.457142857	0.457142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000141	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	1676840	T	C	GMDS	CCDS4474.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	35	6	17.1	50	0	0	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.711018711	0.711018711	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.24E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	2764467	G	A	WRNIP1	CCDS4475.1	r.?	-	-	upstream	44	0	0	33	0	0	46	13	28.3	63	11	17.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.157464213	1.157464213	1	0.625	0.625	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.07E-19	1	2.37E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	3156731	G	A	BPHL	CCDS4483.2	r.?	-	-	downstream	42	0	0	47	8	17	39	3	7.7	27	4	14.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.706860707	0.706860707	1	0.314928425	0.314928425	1	0.528571429	0.528571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.03E-10	1	0.000998458	1	0.00001	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	3430156	T	C	SLC22A23	CCDS47363.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	38	0	0	54	7	13	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.531697342	0.531697342	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.13E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	3461416	A	C	SLC22A23	CCDS47363.1	r.?	-	-	upstream	50	0	0	55	11	20	57	0	0	58	8	13.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	0	0	1	0.492857143	0.492857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.77E-15	1	1	1	5.99E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	7144473	A	G	RREB1	CCDS34335.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	48	9	18.8	55	18	32.7	46	14	30.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.781704782	0.781704782	1	1.337423313	1.337423313	1	1.085714286	1.085714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.75E-12	1	4.61E-28	1	1.26E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	8240601	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	39	0	0	56	13	23.2	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.948875256	0.948875256	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.89E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	9096130	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	33	0	0	57	7	12.3	31	2	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.503067485	0.503067485	1	0.232142857	0.232142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.66E-08	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	9235421	T	C	-	-	-	-	-	-	51	0	0	41	13	31.7	50	1	2	50	5	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.318087318	1.318087318	1	0.081799591	0.081799591	1	0.357142857	0.357142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.89E-20	1	0.221687443	1	0.00000549	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	9612879	C	T	ENSG00000228565	ENST00000455975	r.?	-	-	upstream	40	0	0	43	0	0	34	6	17.6	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.719836401	0.719836401	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.86E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	11457606	G	A	-	-	-	-	-	-	41	1	2.4	52	15	28.8	44	0	0	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.197505198	1.197505198	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	0.18577148	1	1.15E-22	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	12101639	G	T	HIVEP1	CCDS43426.1	r.?	-	-	intronic	13	1	7.7	29	6	20.7	43	14	32.6	36	14	38.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.860706861	0.860706861	1	1.333333333	1.333333333	1	1.389285714	1.389285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	0.063085307	1	6.72E-09	1	4.18E-22	1	2.09E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	14703640	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	46	12	26.1	51	0	0	35	5	14.3	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.085239085	1.085239085	1	0	0	1	0.510714286	0.510714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	8.12E-18	1	1	1	0.000000895	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	17394776	G	T	CAP2	CCDS4539.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	40	8	20	49	0	0	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.61E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	18378542	T	A	RNF144B	ENST00000429054	r.?	-	-	intronic	51	0	0	42	0	0	43	4	9.3	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.380368098	0.380368098	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000066	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	22944979	A	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	37	9	24.3	50	1	2	45	11	24.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.01039501	1.01039501	1	0.081799591	0.081799591	1	0.871428571	0.871428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.14E-13	1	0.221687443	1	4.24E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	24284407	T	C	DCDC2	CCDS4550.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	41	12	29.3	48	0	0	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.218295218	1.218295218	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.69E-18	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	25215973	C	T	CMAH	ENST00000377993	r.?	-	-	intronic	27	0	0	36	10	27.8	42	2	4.8	44	7	15.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.155925156	1.155925156	1	0.196319018	0.196319018	1	0.567857143	0.567857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.21E-15	1	0.018854633	1	2.55E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	25292769	G	A	LRRC16A	ENST00000329474	r.?	-	-	intronic	38	0	0	39	13	33.3	34	0	0	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.384615385	1.384615385	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	8.79E-21	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	26279660	C	G	HIST1H4H	CCDS4604.1	r.?	-	-	downstream	29	0	0	40	0	0	58	0	0	42	5	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.425	0.425	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	27388479	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	36	9	25	57	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.03950104	1.03950104	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.63E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	27540617	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	43	11	25.6	44	0	0	34	4	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.064449064	1.064449064	1	0	0	1	0.421428571	0.421428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.42E-16	1	1	1	0.0000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	27884750	G	T	OR2B2	CCDS4641.1	r.?	-	-	upstream	42	0	0	59	15	25.4	57	1	1.8	55	13	23.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.056133056	1.056133056	1	0.073619632	0.073619632	1	0.842857143	0.842857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.90E-22	1	0.248523156	1	1.46E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	29062368	A	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	45	0	0	49	11	22.4	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.916155419	0.916155419	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.19E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	30333548	T	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	42	10	23.8	58	0	0	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.98960499	0.98960499	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.24E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	30756130	G	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	48	0	0	59	7	11.9	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.486707566	0.486707566	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.12E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	31138672	T	C	POU5F1	CCDS34391.1	r.?	-	-	upstream	35	0	0	56	12	21.4	57	2	3.5	53	13	24.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.88981289	0.88981289	1	0.143149284	0.143149284	1	0.875	0.875	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.11E-16	1	0.03327602	1	8.53E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	31337933	T	C	-	-	-	-	-	-	27	0	0	57	0	0	42	0	0	55	7	12.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.453571429	0.453571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	1.28E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	34996785	G	T	ANKS1A	CCDS4798.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	43	0	0	45	7	15.6	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.63803681	0.63803681	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000003	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	36241230	G	T	PNPLA1	CCDS34438.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	38	10	26.3	47	0	0	39	14	35.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.093555094	1.093555094	1	0	0	1	1.282142857	1.282142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.06E-15	1	1	1	8.19E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	38439618	A	C	BTBD9	CCDS47418.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	70	0	0	62	17	27.4	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.120654397	1.120654397	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.56E-25	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	38674698	G	A	GLO1	CCDS4837.1	r.?	-	-	upstream	31	0	0	42	14	33.3	50	0	0	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.384615385	1.384615385	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.83E-22	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	39459711	C	T	KIF6	CCDS4844.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	67	0	0	53	6	11.3	63	8	12.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.462167689	0.462167689	1	0.453571429	0.453571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.000000293	1	1.18E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	41132422	A	G	TREM2	CCDS4852.1	r.?	-	-	upstream	39	0	0	33	0	0	62	17	27.4	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.120654397	1.120654397	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.56E-25	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	41596005	C	T	-	-	-	-	-	-	48	0	0	36	10	27.8	60	0	0	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.155925156	1.155925156	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.21E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	42225214	C	T	TRERF1	CCDS4867.1	r.?	-	-	intronic	49	0	0	52	0	0	42	9	21.4	56	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.875255624	0.875255624	1	0.064285714	0.064285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.51E-13	1	0.244746891	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	42432312	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	38	5	13.2	58	12	20.7	52	18	34.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.548856549	0.548856549	1	0.846625767	0.846625767	1	1.235714286	1.235714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.00000137	1	1.76E-16	1	1.39E-28	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	42791093	C	A	KIAA0240	CCDS34451.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	48	9	18.8	58	3	5.2	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.781704782	0.781704782	1	0.212678937	0.212678937	1	0.389285714	0.389285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.75E-12	1	0.003141421	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	44716334	G	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	43	0	0	54	12	22.2	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.90797546	0.90797546	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.90E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	45742623	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	50	9	18	45	2	4.4	50	10	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.748440748	0.748440748	1	0.1799591	0.1799591	1	0.714285714	0.714285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.07E-12	1	0.021467209	1	8.36E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	46543998	C	T	CYP39A1	CCDS4916.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	47	0	0	55	15	27.3	60	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.116564417	1.116564417	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.01E-22	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	48243796	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	39	0	0	64	15	23.4	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.957055215	0.957055215	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.87E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	48364004	T	G	-	-	-	-	-	-	44	0	0	56	0	0	50	15	30	65	6	9.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.226993865	1.226993865	1	0.328571429	0.328571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	5.83E-23	1	0.000001	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	50029151	C	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	42	9	21.4	53	0	0	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.88981289	0.88981289	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	7.51E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	51735567	C	A	PKHD1	CCDS4935.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	63	14	22.2	38	0	0	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.923076923	0.923076923	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.81E-19	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	52071332	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	37	0	0	42	10	23.8	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.973415133	0.973415133	1	0.192857143	0.192857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.24E-14	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	53734980	C	T	LRRC1	CCDS4953.2	r.?	-	-	intronic	37	0	0	36	12	33.3	56	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.384615385	1.384615385	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.73E-19	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	54697058	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	35	0	0	59	14	23.7	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.969325153	0.969325153	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.58E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	56658698	G	A	DST	CCDS47441.1	r.?	-	-	intronic	52	0	0	53	0	0	54	8	14.8	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.605316973	0.605316973	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.31E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	56852661	G	A	BEND6	CCDS43476.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	39	0	0	50	14	28	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.145194274	1.145194274	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.84E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	57894129	C	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	47	7	14.9	37	0	0	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.61954262	0.61954262	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.12E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	58156753	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	32	10	31.2	43	4	9.3	34	6	17.6	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.297297297	1.297297297	1	0.380368098	0.380368098	1	0.628571429	0.628571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.70E-16	1	0.000066	1	1.86E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	58668753	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	42	5	11.9	41	10	24.4	44	9	20.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.494802495	0.494802495	1	0.99795501	0.99795501	1	0.732142857	0.732142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.00000228	1	9.51E-15	1	1.18E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	63742607	G	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	61	15	24.6	40	8	20	59	20	33.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.022869023	1.022869023	1	0.81799591	0.81799591	1	1.210714286	1.210714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.73E-21	1	2.61E-11	1	2.21E-31	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	64074932	T	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	41	7	17.1	52	12	23.1	49	15	30.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.711018711	0.711018711	1	0.944785276	0.944785276	1	1.092857143	1.092857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.51E-09	1	4.19E-17	1	4.10E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	64137612	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	52	13	25	42	0	0	56	13	23.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.03950104	1.03950104	1	0	0	1	0.828571429	0.828571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	6.47E-19	1	1	1	1.89E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	64998016	A	G	EYS	CCDS47445.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	44	14	31.8	47	12	25.5	38	8	21.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.322245322	1.322245322	1	1.042944785	1.042944785	1	0.753571429	0.753571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.10E-22	1	1.09E-17	1	1.67E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	65901361	C	G	EYS	CCDS47445.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	44	14	31.8	36	9	25	38	12	31.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.322245322	1.322245322	1	1.022494888	1.022494888	1	1.128571429	1.128571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.10E-22	1	1.63E-13	1	5.86E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	69716544	T	C	BAI3	CCDS4968.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	41	0	0	52	14	26.9	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.100204499	1.100204499	1	0.114285714	0.114285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.04E-21	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	69837189	C	A	BAI3	CCDS4968.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	58	0	0	46	11	23.9	49	4	8.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.977505112	0.977505112	1	0.292857143	0.292857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	5.55E-16	1	0.000110643	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	69954030	C	T	BAI3	CCDS4968.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	51	0	0	48	0	0	47	6	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.457142857	0.457142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000141	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	71621167	A	G	B3GAT2	CCDS4974.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	47	13	27.7	48	1	2.1	53	6	11.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.151767152	1.151767152	1	0.085889571	0.085889571	1	0.403571429	0.403571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.47E-19	1	0.213845552	1	0.000000293	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	71743360	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	54	0	0	63	19	30.2	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.235173824	1.235173824	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.48E-29	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	71905306	A	C	-	-	-	-	-	-	37	0	0	47	0	0	46	4	8.7	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.355828221	0.355828221	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000862	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	73697443	C	T	KCNQ5	CCDS4976.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	45	0	0	58	12	20.7	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.846625767	0.846625767	1	0.103571429	0.103571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.76E-16	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	78172486	G	A	HTR1B	CCDS4986.1	r.696c>u	c.635C>T	p.S212F	missense	39	0	0	32	0	0	54	12	22.2	41	4	9.8	59	0	0	112	0	0	108	30	27.8	102	8	7.8	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.90797546	0.90797546	1	0.35	0.35	1	0	0	1	1.137014315	1.137014315	1	0.278571429	0.278571429	1	3	3	1	1	1	1	6.90E-17	2.81E-43	0.0000546	5.64E-08	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	6	79134857	C	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	53	13	24.5	48	11	22.9	57	20	35.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.018711019	1.018711019	1	0.936605317	0.936605317	1	1.253571429	1.253571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	8.53E-19	1	9.31E-16	1	9.67E-32	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	79305859	C	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	49	0	0	50	12	24	44	7	15.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.981595092	0.981595092	1	0.567857143	0.567857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	2.49E-17	1	2.55E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	82036052	G	C	-	-	-	-	-	-	47	0	0	51	7	13.7	64	1	1.6	47	7	14.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.56964657	0.56964657	1	0.065439673	0.065439673	1	0.532142857	0.532142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.46E-09	1	0.274433592	1	4.12E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	83859237	T	C	DOPEY1	CCDS4996.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	43	14	32.6	48	1	2.1	48	6	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.355509356	1.355509356	1	0.085889571	0.085889571	1	0.446428571	0.446428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.18E-22	1	0.213845552	1	0.00000016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	83859242	T	C	DOPEY1	CCDS4996.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	45	15	33.3	51	1	2	49	6	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.384615385	1.384615385	1	0.081799591	0.081799591	1	0.435714286	0.435714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.14E-24	1	0.225579006	1	0.000000182	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	84022488	T	A	ME1	CCDS34492.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	32	0	0	53	10	18.9	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.773006135	0.773006135	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.57E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	84482516	C	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	58	11	19	52	0	0	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.79002079	0.79002079	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	8.96E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	84563839	C	T	RIPPLY2	CCDS34493.1	r.349c>u	c.198C>T	p.T66T	silent	37	0	0	45	10	22.2	44	1	2.3	43	5	11.6	48	0	0	165	40	24.2	198	6	3	149	23	15.4	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.923076923	0.923076923	1	0.09406953	0.09406953	1	0.414285714	0.414285714	1	1.006237006	1.006237006	1	0.122699387	0.122699387	1	0.55	0.55	1	7	6	1	1	2.66E-14	1.74E-54	0.197923942	0.000535023	0.00000257	4.04E-27	YES	1_1	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	6	84975614	C	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	38	0	0	51	11	21.6	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.883435583	0.883435583	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.94E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	85330389	C	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	41	0	0	66	13	19.7	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.805725971	0.805725971	1	0.35	0.35	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.95E-17	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	85390910	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	43	0	0	54	17	31.5	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.288343558	1.288343558	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.02E-26	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	85524533	T	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	51	0	0	49	0	0	44	5	11.4	180	0	0	125	0	0	61	0	0	67	4	6	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.407142857	0.407142857	1	0	0	1	0	0	1	0.214285714	0.214285714	1	1	2	1	1	1	1	1	1	0.00000288	0.000372648	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	6	90551194	C	T	CASP8AP2	ENST00000455594	r.?	-	-	intronic	37	0	0	49	0	0	53	5	9.4	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.384458078	0.384458078	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000734	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	92910163	A	G	-	-	-	-	-	-	52	0	0	46	0	0	51	8	15.7	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.642126789	0.642126789	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.05E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	93157494	A	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	48	0	0	40	7	17.5	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.715746421	0.715746421	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.26E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	93795093	T	C	-	-	-	-	-	-	46	0	0	40	12	30	57	0	0	51	9	17.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.247401247	1.247401247	1	0	0	1	0.628571429	0.628571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.20E-18	1	1	1	4.92E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	94273974	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	38	12	31.6	51	6	11.8	46	10	21.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.313929314	1.313929314	1	0.482617587	0.482617587	1	0.775	0.775	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.86E-19	1	0.000000232	1	3.38E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	95341954	A	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	44	11	25	49	0	0	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.03950104	1.03950104	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.22E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	96387697	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	47	10	21.3	53	0	0	64	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.885654886	0.885654886	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.27E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	97305432	C	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	61	13	21.3	41	11	26.8	47	14	29.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.885654886	0.885654886	1	1.096114519	1.096114519	1	1.064285714	1.064285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.41E-18	1	1.34E-16	1	1.79E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	99301766	C	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	26	0	0	48	13	27.1	39	5	12.8	4	0	0	1	0	0	3	1	33.3	0	0	NA	FALSE	FALSE	1	2	1	1	1	1	0	1	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	NA	0	1.108384458	1.108384458	1	0.329142857	0.329142857	1	0	0	1	1.36196319	1.36196319	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.00E-19	0.014925125	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	99301850	C	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	31	0	0	47	8	17	54	7	13	27	0	0	14	0	0	8	2	25	7	0	0	FALSE	TRUE	1	2	1	1	1	1	0	1	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	NA	0	0.695296524	0.695296524	1	0.334285714	0.334285714	1	0	0	1	1.022494888	1.022494888	1	0	0	1	NA	1	1	1	1	1	1.03E-10	0.000686131	1.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	99301860	C	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	31	0	0	49	7	14.3	52	6	11.5	37	0	0	22	0	0	11	2	18.2	9	0	0	FALSE	TRUE	1	2	1	1	1	1	0	1	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	NA	0	0.584867076	0.584867076	1	0.295714286	0.295714286	1	0	0	1	0.744376278	0.744376278	1	0	0	1	NA	1	1	1	1	1	5.58E-09	0.001334363	0.000000261	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	99301950	C	G	-	-	-	-	-	-	52	0	0	42	0	0	49	8	16.3	41	4	9.8	145	0	0	89	0	0	47	11	23.4	51	2	3.9	FALSE	TRUE	1	2	1	1	1	1	0	1	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	NA	0	0.666666667	0.666666667	1	0.252	0.252	1	0	0	1	0.957055215	0.957055215	1	0.100285714	0.100285714	1	NA	1	1	1	1	1	1.47E-10	7.21E-16	0.0000546	0.027109304	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	6	100620187	C	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	31	8	25.8	39	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.814765073	0.814765073	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.78E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	102513708	C	T	GRIK2	CCDS5049.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	26	10	38.5	34	12	35.3	34	9	26.5	269	0	0	122	44	36.1	64	20	31.2	77	30	39	TRUE	TRUE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.215831601	1.215831601	1	1.090762781	1.090762781	1	0.681428571	0.681428571	1	1.140039501	1.140039501	1	0.96407362	0.96407362	1	1.002857143	1.002857143	1	8	7	1	1	4.82E-17	1.27E-68	1.21E-19	1.52E-30	9.15E-14	1.57E-48	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	6	102752587	G	C	-	-	-	-	-	-	45	0	0	36	13	36.1	44	1	2.3	34	9	26.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.140039501	1.140039501	1	0.07106953	0.07106953	1	0.681428571	0.681428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.53E-21	1	0.197923942	1	9.15E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	103273963	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	50	13	26	47	0	0	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.821081081	0.821081081	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.65E-19	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	104302983	G	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	31	12	38.7	30	1	3.3	33	9	27.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.222147609	1.222147609	1	0.101969325	0.101969325	1	0.702	0.702	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.16E-20	1	0.139615808	1	6.76E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	106142477	T	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	28	0	0	38	0	0	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.27	0.27	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	107873236	C	A	SOBP	CCDS43488.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	43	0	0	43	0	0	48	10	20.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.534857143	0.534857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	5.37E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	111484623	G	T	SLC16A10	CCDS5089.1	r.?	-	-	intronic	28	1	3.6	39	0	0	21	11	52.4	29	3	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.619149284	1.619149284	1	0.264857143	0.264857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	0.130947004	1	1	1	1.64E-20	1	0.000414371	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	116651954	C	A	DSE	CCDS5107.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	23	11	47.8	38	0	0	31	7	22.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.509525988	1.509525988	1	0	0	1	0.581142857	0.581142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	6.25E-20	1	1	1	1.85E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	120815977	G	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	29	0	0	34	6	17.6	23	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.543836401	0.543836401	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	2	NA	1	1	1	1	1.86E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	122876361	C	A	SERINC1	CCDS5125.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	33	13	39.4	40	0	0	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.244253638	1.244253638	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	6.37E-22	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	123835946	A	T	TRDN	ENST00000334268	r.?	-	-	intronic	49	0	0	28	5	17.9	40	0	0	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.565282744	0.565282744	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000000279	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	124364566	G	C	NKAIN2	CCDS34526.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	34	0	0	48	7	14.6	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.451137014	0.451137014	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.81E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	124821933	A	G	NKAIN2	CCDS34526.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	34	11	32.4	42	0	0	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.023193347	1.023193347	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.26E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	126376491	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	35	11	31.4	39	0	0	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.991613306	0.991613306	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.82E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	129189440	C	G	-	-	-	-	-	-	46	0	0	14	0	0	31	11	35.5	33	4	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.09694274	1.09694274	1	0.311142857	0.311142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	3.77E-18	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	130562091	G	A	SAMD3	ENST00000368134	r.?	-	-	intronic	38	0	0	38	0	0	34	11	32.4	29	6	20.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.001153374	1.001153374	1	0.532285714	0.532285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.26E-17	1	6.72E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	131633663	G	T	-	-	-	-	-	-	55	0	0	45	11	24.4	33	9	27.3	32	14	43.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.770553015	0.770553015	1	0.843564417	0.843564417	1	1.126285714	1.126285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.24E-16	1	6.76E-14	1	2.65E-24	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	131791246	G	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	33	0	0	23	0	0	37	5	13.5	181	1	0.6	142	0	0	70	1	1.4	74	13	17.6	TRUE	TRUE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.347142857	0.347142857	1	0	0	1	0.043259714	0.043259714	1	0.452571429	0.452571429	1	1	2	1	0.596375412	1	1	1	0.295930304	0.00000119	9.62E-17	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	6	135119190	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	40	0	0	45	0	0	46	8	17.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.447428571	0.447428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	8.61E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	137492938	C	T	IL22RA2	CCDS5182.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	28	0	0	32	12	37.5	33	6	18.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.158742331	1.158742331	1	0.468	0.468	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	5.03E-20	1	1.54E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	137824088	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	46	12	26.1	42	0	0	36	7	19.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.824239085	0.824239085	1	0	0	1	0.498857143	0.498857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	8.12E-18	1	1	1	5.74E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	142863227	T	C	-	-	-	-	-	-	34	0	0	40	0	0	26	6	23.1	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.713785276	0.713785276	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.30E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	145445105	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	25	0	0	46	13	28.3	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.874464213	0.874464213	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.07E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	145685777	A	T	-	-	-	-	-	-	51	0	0	33	8	24.2	39	2	5.1	35	7	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.764237006	0.764237006	1	0.157588957	0.157588957	1	0.514285714	0.514285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.85E-12	1	0.016387522	1	4.65E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	146542110	C	T	GRM1	CCDS47497.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	38	8	21.1	40	17	42.5	28	8	28.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.666338877	0.666338877	1	1.313241309	1.313241309	1	0.735428571	0.735428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.67E-11	1	6.07E-29	1	1.11E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	146775313	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	27	3	11.1	39	11	28.2	27	14	51.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.350538462	0.350538462	1	0.871374233	0.871374233	1	1.334571429	1.334571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.000334187	1	7.20E-17	1	1.15E-25	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	147877374	G	A	SAMD5	CCDS34548.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	28	9	32.1	24	0	0	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.013719335	1.013719335	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.24E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	148295054	C	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	30	0	0	31	8	25.8	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.797214724	0.797214724	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.78E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	153676831	A	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	40	1	2.5	29	1	3.4	40	5	12.5	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.078950104	0.078950104	1	0.105059305	0.105059305	1	0.321428571	0.321428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	0.181679879	1	0.135292269	1	0.00000178	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	154213584	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	41	13	31.7	34	1	2.9	21	3	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.001087318	1.001087318	1	0.089609407	0.089609407	1	0.367714286	0.367714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.89E-20	1	0.156694864	1	0.000155401	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	159828629	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	26	8	30.8	34	2	5.9	26	5	19.2	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.972665281	0.972665281	1	0.182308793	0.182308793	1	0.493714286	0.493714286	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.63E-13	1	0.012612579	1	0.000000188	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	162637539	G	A	PARK2	CCDS5281.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	31	8	25.8	22	0	0	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.814765073	0.814765073	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.78E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	164021827	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	40	8	20	34	1	2.9	31	6	19.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.631600832	0.631600832	1	0.089609407	0.089609407	1	0.498857143	0.498857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.61E-11	1	0.156694864	1	1.03E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	164196365	C	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	43	12	27.9	41	0	0	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.88108316	0.88108316	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.24E-18	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	164953130	C	T	ENSG00000237744	ENST00000425920	r.?	-	-	intronic	39	0	0	35	12	34.3	43	1	2.3	45	9	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.083195426	1.083195426	1	0.07106953	0.07106953	1	0.514285714	0.514285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.83E-19	1	0.193893409	1	1.47E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	166131989	C	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	28	10	35.7	20	0	0	28	14	50	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.127407484	1.127407484	1	0	0	1	1.285714286	1.285714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.18E-16	1	1	1	2.29E-25	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	169238047	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	31	0	0	52	1	1.9	39	4	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.058709611	0.058709611	1	0.264857143	0.264857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.229451111	1	0.0000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	6	169846526	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	33	0	0	24	0	0	36	5	13.9	0	0	NA	1	0	0	4	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.357428571	0.357428571	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000104	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	178827	G	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	69	15	21.7	108	0	0	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	3.71135889	3.441236645	3	2	2	1	1	1	1	0.28864111	0.558763355	NA	3	3	NA	1	1	NA	0.71135889	0.441236645	1.336286902	1.336286902	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.34E-20	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	701909	G	A	PRKAR1B	CCDS34579.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	39	6	15.4	38	3	7.9	27	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	3.71135889	3.441236645	3	2	2	1	1	1	1	0.28864111	0.558763355	NA	3	3	NA	1	1	NA	0.71135889	0.441236645	0.94833264	0.94833264	1	0.458305737	0.458305737	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.43E-08	1	0.000925091	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	1079008	T	C	C7orf50	CCDS5320.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	22	5	22.7	22	0	0	12	3	25	0	0	NA	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	3.71135889	3.441236645	3	2	2	1	1	1	1	0.28864111	0.558763355	NA	3	3	NA	1	1	NA	0.71135889	0.441236645	1.397866944	1.397866944	1	0	0	1	1.253166304	1.253166304	1	NA	NA	1	5.80133844	5.80133844	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.67E-08	1	1	0.005	0.0000266	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	1636613	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	56	0	0	86	14	16.3	68	0	0	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	3.71135889	3.441236645	3	2	2	1	1	1	1	0.28864111	0.558763355	NA	3	3	NA	1	1	NA	0.71135889	0.441236645	0	0	1	0.945618166	0.945618166	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.98E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	2740293	C	T	AMZ1	CCDS34589.1	r.576c>u	c.208C>T	p.R70*	nonsense	42	0	0	69	0	0	85	13	15.3	56	1	1.8	46	0	0	194	0	0	334	71	21.3	228	2	0.9	TRUE	TRUE	4	3.71135889	3.441236645	3	2	2	1	1	1	1	0.28864111	0.558763355	NA	3	3	NA	1	1	NA	0.71135889	0.441236645	0	0	1	0.887604781	0.887604781	1	0.090227974	0.090227974	1	0	0	1	1.235685088	1.235685088	1	0.045113987	0.045113987	1	2	1	1	1	1	1	6.45E-16	6.80E-91	0.244746891	0.315714703	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	7	2856133	G	C	GNA12	CCDS5335.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	71	22	31	99	4	4	77	17	22.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	3.71135889	3.441236645	3	2	2	1	1	1	1	0.28864111	0.558763355	NA	3	3	NA	1	1	NA	0.71135889	0.441236645	1.908981289	0.954490644	2	0.232053538	0.232053538	1	1.107799013	1.107799013	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.34E-33	1	0.001612681	1	2.82E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	3924016	G	A	SDK1	CCDS34590.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	60	10	16.7	59	0	0	54	6	11.1	132	0	0	307	39	12.7	217	4	1.8	249	24	9.6	FALSE	TRUE	4	3.71135889	3.441236645	3	2	2	1	1	1	1	0.28864111	0.558763355	NA	3	3	NA	1	1	NA	0.71135889	0.441236645	1.028386694	1.028386694	1	0	NA	0	0.556405839	0.556405839	1	0.782066528	0.782066528	1	0.104424092	0.104424092	1	0.481215861	1.090607198	0.441236645	NA	6	1	1	5.86E-13	1.93E-41	1	0.024303635	0.000000329	3.34E-23	YES	1_1	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	7	4157546	T	A	SDK1	CCDS34590.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	65	0	0	72	8	11.1	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	3.71135889	3.441236645	3	2	2	1	1	1	1	0.28864111	0.558763355	NA	3	3	NA	1	1	NA	0.71135889	0.441236645	0	0	1	0.643948567	0.643948567	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.52E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	4265937	C	T	SDK1	CCDS34590.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	49	9	18.4	82	0	0	73	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	3.71135889	3.441236645	3	2	2	1	1	1	1	0.28864111	0.558763355	NA	3	3	NA	1	1	NA	0.71135889	0.441236645	1.133072765	1.133072765	1	0	NA	0	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	3.35E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	6281033	C	T	CYTH3	CCDS5346.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	65	0	0	76	12	15.8	59	1	1.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	3.71135889	3.441236645	3	2	2	1	1	1	1	0.28864111	0.558763355	NA	3	3	NA	1	1	NA	0.71135889	0.441236645	0	0	1	0.916611474	0.916611474	1	0.085215309	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	5.63E-15	1	0.256019138	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	6695973	A	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	45	0	0	74	10	13.5	55	0	0	35	0	0	159	0	0	165	20	12.1	166	1	0.6	FALSE	TRUE	4	3.71135889	3.441236645	3	2	2	1	1	1	1	0.28864111	0.558763355	NA	3	3	NA	1	1	NA	0.71135889	0.441236645	0	0	1	0.783180689	0.783180689	1	0	NA	0	0	0	1	0.701961951	0.701961951	1	0.030075991	0.030075991	1	NA	1	1	1	1	1	5.24E-12	1.32E-21	1	0.564857599	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	7	7398382	C	A	COL28A1	CCDS43553.1	r.3401g>u	c.3260G>T	p.R1087L	missense	41	0	0	71	14	19.7	63	1	1.6	39	3	7.7	458	2	0.4	287	33	11.5	165	0	0	195	31	15.9	TRUE	TRUE	4	3.71135889	3.441236645	3	2	2	1	1	1	1	0.28864111	0.558763355	NA	3	3	NA	1	1	NA	0.71135889	0.441236645	1.213126819	1.213126819	1	0.092821415	0.092821415	1	0.385975222	0.874757857	0.441236645	0.708170478	0.708170478	1	0	0	1	0.797013769	0.797013769	1	7	6	1	0.667582963	1.13E-18	7.42E-34	0.27078753	1	0.000998458	2.01E-36	YES	1_1	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	7	9017371	A	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	80	10	12.5	73	0	0	72	8	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	3.71135889	3.441236645	3	2	2	1	1	1	1	0.28864111	0.558763355	NA	3	3	NA	1	1	NA	0.71135889	0.441236645	0.76975052	0.76975052	1	0	NA	0	0.556405839	1.261014573	0.441236645	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.17E-11	1	1	1	3.52E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	9889953	T	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	55	0	0	66	8	12.1	66	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	3.71135889	3.441236645	3	2	2	1	1	1	1	0.28864111	0.558763355	NA	3	3	NA	1	1	NA	0.71135889	0.441236645	0	0	1	0.701961951	0.701961951	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.73E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	10200228	C	T	-	-	-	-	-	-	50	0	0	66	0	0	67	10	14.9	67	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	3.71135889	3.441236645	3	2	2	1	1	1	1	0.28864111	0.558763355	NA	3	3	NA	1	1	NA	0.71135889	0.441236645	0	0	1	0.864399428	0.864399428	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.87E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	11313588	C	T	-	-	-	-	-	-	13	0	0	35	6	17.1	38	0	0	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	3.71135889	3.441236645	3	2	2	1	1	1	1	0.28864111	0.558763355	NA	3	3	NA	1	1	NA	0.71135889	0.441236645	1.053018711	1.053018711	1	0	NA	0	0.130329296	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	2.24E-08	1	1	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	13417143	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	46	10	21.7	66	0	0	63	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	1.09777785	1.09777785	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.38E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	14859247	G	T	DGKB	CCDS47547.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	47	13	27.7	68	2	2.9	62	7	11.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	1.401310896	1.401310896	1	0.168238815	0.168238815	1	0.516571429	0.516571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.47E-19	1	0.045825786	1	3.02E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	15361170	G	A	TMEM195	CCDS34604.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	57	10	17.5	82	0	0	63	0	0	243	0	0	171	23	13.5	80	0	0	112	1	0.9	FALSE	TRUE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.885304718	0.885304718	1	0	NA	0	0	0	1	0.682949354	0.758091418	0.900879943	0	0	1	0.041142857	0.041142857	1	NA	4	1	1	3.40E-13	1.10E-25	1	1	1	0.429592741	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	7	15411357	G	A	TMEM195	CCDS34604.1	r.?	-	-	intronic	28	1	3.6	44	21	47.7	71	27	38	51	25	49	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	2.413087716	1.206543858	2	2.204508607	1.102254304	2	2.24	1.12	2	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	0.130947004	1	8.60E-37	1	1.77E-43	1	6.52E-44	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	16525009	T	C	SOSTDC1	ENST00000396652	r.?	-	-	intronic	38	0	0	45	0	0	79	8	10.1	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.585935182	0.585935182	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	7.43E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	18464765	C	T	HDAC9	ENST00000433709	r.?	-	-	intronic	38	0	0	58	0	0	63	11	17.5	62	2	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	1.015234227	1.015234227	1	0.146285714	0.146285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.37E-14	1	0.038789653	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	18475831	T	A	HDAC9	ENST00000433709	r.?	-	-	intronic	46	0	0	66	13	19.7	73	0	0	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.996600168	0.996600168	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.95E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	19863342	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	45	0	0	60	22	36.7	58	1	1.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	2.129091207	1.064545604	2	0.077714286	0.077714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.81E-35	1	0.252280541	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	20797016	A	C	ABCB5	CCDS5371.1	r.?	-	-	downstream	42	0	0	50	0	0	75	25	33.3	60	5	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	1.931845701	0.96592285	2	0.379428571	0.379428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.23E-38	1	0.0000136	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	21072068	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	62	0	0	70	10	14.3	69	8	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.829591397	0.829591397	1	0.530285714	0.530285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.95E-12	1	2.49E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	21162995	T	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	57	6	10.5	89	0	0	55	0	0	131	0	0	226	46	20.4	108	0	0	130	0	0	FALSE	TRUE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.531182831	0.531182831	1	0	NA	0	0	NA	0	1.032012357	1.032012357	1	0	0	1	0	0	1	NA	4	1	1	0.000000456	1.51E-58	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	7	21222566	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	53	0	0	59	6	10.2	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.591736521	0.591736521	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000000561	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	22485459	T	G	ENSG00000105889	ENST00000404369	r.?	-	-	intronic	35	0	0	66	0	0	72	8	11.1	53	0	0	149	0	0	155	0	0	95	10	10.5	124	1	0.8	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.643948567	0.643948567	1	0	0	1	0	NA	0	0.609140536	0.609140536	1	0.036571429	0.036571429	1	NA	NA	1	1	1	1	3.52E-09	6.70E-11	1	0.462891516	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	7	22815633	G	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	46	17	37	67	28	41.8	58	24	41.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	1.871787117	0.935893559	2	2.424959468	0.894370523	2.71135889	1.892571429	0.946285714	2	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.16E-27	1	1.81E-46	1	6.49E-40	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	22909563	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	50	0	0	60	6	10	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.580133844	0.580133844	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000000621	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	23356774	G	T	IGF2BP3	CCDS5382.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	59	0	0	84	7	8.3	51	0	0	183	0	0	219	0	0	116	18	15.5	173	2	1.2	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.481511091	0.676889117	0.71135889	0	0	1	0	NA	0	0.899207458	0.899207458	1	0.054857143	0.054857143	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000000253	1.35E-21	1	0.214614584	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	7	23403856	G	A	IGF2BP3	CCDS5382.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	34	0	0	56	12	21.4	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	1.241486426	1.241486426	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.11E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	23976766	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	56	11	19.6	53	9	17	51	10	19.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.991541284	0.991541284	1	0.986227535	0.986227535	1	0.896	0.896	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.91E-15	1	7.10E-12	1	1.04E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	24133599	A	G	-	-	-	-	-	-	35	1	2.9	68	24	35.3	72	34	47.2	52	26	50	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	1.785786088	0.892893044	2	2.738231744	1.009911212	2.71135889	2.285714286	1.142857143	2	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	0.16091139	1	7.25E-38	1	1.92E-58	1	6.52E-46	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	24219947	G	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	63	9	14.3	76	1	1.3	65	6	9.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.723420426	0.723420426	1	0.0754174	0.0754174	1	0.420571429	0.420571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.62E-11	1	0.316790122	1	0.000001	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	26189476	T	A	NFE2L3	CCDS5396.1	r.?	-	-	upstream	47	0	0	83	0	0	67	0	0	80	11	13.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0	0	1	0.630857143	0.630857143	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	3.73E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	26537233	T	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	51	8	15.7	82	0	0	75	1	1.3	248	0	0	221	50	22.6	113	2	1.8	173	0	0	TRUE	TRUE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.794244804	0.794244804	1	0	0	1	0.059428571	0.059428571	1	1.143307807	1.143307807	1	0.104424092	0.104424092	1	0	0	1	6	4	1	1	2.05E-10	5.13E-66	1	0.110164676	0.313356907	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	7	27032786	C	T	SKAP2	ENST00000432747	r.?	-	-	intronic	32	0	0	51	0	0	60	10	16.7	52	0	0	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.968823519	0.968823519	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	5.86E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	27077354	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	56	0	0	74	7	9.5	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.551127152	0.551127152	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000000105	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	27516355	A	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	41	9	22	50	4	8	50	8	16	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	1.112954502	1.112954502	1	0.464107075	0.464107075	1	0.731428571	0.731428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.92E-13	1	0.000119787	1	1.74E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	27889344	G	A	JAZF1	CCDS5416.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	41	0	0	64	4	6.2	49	6	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.359682983	0.505628015	0.71135889	0.557714286	0.557714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000312605	1	0.000000182	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	29646473	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	46	0	0	81	12	14.8	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.858598089	0.858598089	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.26E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	30068136	G	A	PLEKHA8	CCDS5424.1	r.159g>a	c.?	p.?	5'UTR variant	40	0	0	46	0	0	92	17	18.5	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	1.073247611	1.073247611	1	0.091428571	0.091428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	7.54E-22	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	30471304	C	T	NOD1	CCDS5427.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	66	0	0	86	12	14	75	5	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.812187382	0.812187382	1	0.306285714	0.306285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.65E-14	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	30797825	C	T	INMT	CCDS5430.1	r.?	-	-	downstream	44	0	0	41	0	0	72	6	8.3	64	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.481511091	0.676889117	0.71135889	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.00000184	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	31103317	C	A	ADCYAP1R1	CCDS5433.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	47	0	0	61	11	18	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	1.044240919	1.044240919	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.62E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	31243760	G	A	AC006978.1	ENST00000507825	r.?	-	-	intronic	52	0	0	61	11	18	81	0	0	82	1	1.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.910599138	0.910599138	1	0	NA	0	0.054857143	0.054857143	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.62E-14	1	1	1	0.337031917	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	31547092	G	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	56	10	17.9	62	2	3.2	53	6	11.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.905540254	0.905540254	1	0.18564283	0.18564283	1	0.516571429	0.516571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.82E-13	1	0.038789653	1	0.000000293	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	32104856	G	A	PDE1C	CCDS5437.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	53	0	0	75	6	8	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.464107075	0.652423245	0.71135889	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.00000234	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	32145397	C	T	PDE1C	ENST00000396193	r.?	-	-	intronic	38	0	0	66	0	0	91	29	31.9	63	5	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	1.850626962	0.925313481	2	0.361142857	0.361142857	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	6.70E-44	1	0.0000173	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	35445019	G	A	-	-	-	-	-	-	46	0	0	61	10	16.4	77	0	0	60	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.829656993	0.829656993	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	6.98E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	36316526	G	A	EEPD1	CCDS34619.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	73	14	19.2	71	3	4.2	73	7	9.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.971305747	0.971305747	1	0.243656214	0.342522204	0.71135889	0.438857143	0.438857143	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.71E-18	1	0.00554578	1	9.54E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	36414356	T	A	KIAA0895	CCDS43570.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	38	16	42.1	70	35	50	67	32	47.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	2.129790206	1.064895103	2	2.90066922	1.0698212	2.71135889	2.185142857	1.092571429	2	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.06E-27	1	2.75E-61	1	2.63E-55	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	36835333	A	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	68	11	16.2	73	0	0	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.819539224	0.819539224	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.76E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	37036648	G	A	ELMO1	CCDS5449.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	57	19	33.3	81	42	51.9	49	24	49	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	1.684608406	0.842304203	2	3.01089465	1.110474405	2.71135889	2.24	1.12	2	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.01E-29	1	3.80E-74	1	3.34E-42	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	37487039	C	A	ELMO1	CCDS5449.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	42	0	0	59	12	20.3	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	1.177671703	1.177671703	1	0.091428571	0.091428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.20E-16	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	37628064	A	G	-	-	-	-	-	-	47	0	0	53	5	9.4	57	0	0	53	5	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.475535105	0.527856247	0.900879943	0	0	1	0.429714286	0.429714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.00000734	1	1	1	0.00000734	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	37636935	A	T	-	-	-	-	-	-	51	0	0	61	0	0	79	5	6.3	55	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.365484322	0.513783305	0.71135889	0.082285714	0.082285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.0000518	1	0.240951649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	37754944	C	A	GPR141	CCDS5451.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	54	0	0	101	9	8.9	77	1	1.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.516319121	0.72582086	0.71135889	0.059428571	0.059428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.70E-09	1	0.320206172	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	38026040	G	T	SFRP4	ENST00000447200	r.?	-	-	intronic	36	0	0	50	0	0	71	0	0	45	5	11.1	733	3	0.4	211	0	0	172	0	0	162	5	3.1	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0	NA	0	0.507428571	0.507428571	1	0	NA	0	0	0	1	0.141714286	0.141714286	1	NA	NA	1	0.709313513	1	1	1	1	0.00000323	0.001426486	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	7	38029860	G	A	SFRP4	ENST00000447200	r.?	-	-	intronic	49	0	0	62	23	37.1	82	33	40.2	64	29	45.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	1.876846001	0.938423001	2	2.332138053	0.860136244	2.71135889	2.070857143	1.035428571	2	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.90E-37	1	8.26E-54	1	2.18E-49	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	38373688	C	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	49	10	20.4	70	0	0	71	0	0	51	1	2	161	22	13.7	95	0	0	114	0	0	TRUE	TRUE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	1.032012357	1.032012357	1	0	0	1	0	0	1	0.693067122	0.769322402	0.900879943	0	0	1	0	0	1	6	4	1	0.225579006	6.72E-14	8.60E-25	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	7	39064556	C	A	POU6F2	CCDS34620.2	r.?	-	-	intronic	39	0	0	53	0	0	71	10	14.1	64	1	1.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.81798872	0.81798872	1	0.073142857	0.073142857	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	3.42E-12	1	0.274433592	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	39086185	G	A	POU6F2	CCDS34620.2	r.?	-	-	intronic	45	0	0	49	9	18.4	67	0	0	68	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.930834675	0.930834675	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	3.35E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	39627842	G	T	C7orf36	ENST00000432096	r.?	-	-	intronic	33	0	0	56	11	19.6	71	0	0	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.991541284	0.991541284	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	5.91E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	40014516	T	C	CDK13	CCDS5461.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	49	9	18.4	86	0	0	67	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.930834675	0.930834675	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	3.35E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	40466061	T	C	C7orf10	ENST00000309930	r.?	-	-	intronic	57	0	0	69	14	20.3	78	1	1.3	43	7	16.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	1.026953472	1.026953472	1	0.0754174	0.0754174	1	0.745142857	0.745142857	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.30E-19	1	0.323605141	1	2.15E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	40960687	T	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	39	0	0	63	7	11.1	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.643948567	0.643948567	1	0.448	0.448	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	3.38E-08	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	41355891	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	44	0	0	65	7	10.8	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.626544552	0.626544552	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	4.22E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	41632454	A	C	ENSG00000236089	ENST00000443116	r.?	-	-	intronic	41	0	0	63	13	20.6	79	0	0	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	1.042130125	1.042130125	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.01E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	41834887	G	C	-	-	-	-	-	-	46	0	0	37	17	45.9	72	34	47.2	51	26	51	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	2.322027802	1.161013901	2	2.738231744	1.009911212	2.71135889	2.331428571	1.165714286	2	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.10E-29	1	1.92E-58	1	3.27E-46	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	42895742	A	C	-	-	-	-	-	-	37	0	0	55	8	14.5	89	10	11.2	44	14	31.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.733538195	0.733538195	1	0.649749905	0.649749905	1	1.453714286	1.453714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.86E-10	1	3.47E-11	1	6.10E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	43638515	C	G	STK17A	CCDS5470.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	54	7	13	59	1	1.7	52	5	9.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.657654933	0.657654933	1	0.098622753	0.098622753	1	0.438857143	0.438857143	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.13E-08	1	0.256019138	1	0.00000668	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	44315913	C	T	CAMK2B	CCDS5483.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	45	6	13.3	100	0	0	75	0	0	26	0	0	259	54	20.8	427	0	0	219	0	0	TRUE	TRUE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.672831585	0.672831585	1	0	0	1	0	0	1	1.052247893	1.052247893	1	0	0	1	0	0	1	6	4	1	1	0.000000108	4.75E-69	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	7	44807938	G	A	ZMIZ2	CCDS43576.1	r.3602g>a	c.?	p.?	3'UTR variant	44	0	0	46	6	13	94	2	2.1	56	2	3.6	27	0	0	183	31	16.9	206	1	0.5	148	16	10.8	TRUE	TRUE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.657654933	0.657654933	1	0.121828107	0.121828107	1	0.164571429	0.164571429	1	0.854951413	0.854951413	1	0.029006692	0.029006692	1	0.493714286	0.493714286	1	7	6	1	1	0.000000123	2.50E-37	0.080854778	0.643914218	0.032213353	8.95E-17	YES	1_1	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	7	45147888	C	T	SNORA5B	CCDS5501.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	52	14	26.9	83	0	0	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	1.360839823	1.360839823	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	9.04E-21	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	45329772	A	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	56	0	0	75	0	0	51	6	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0	NA	0	0.539428571	0.539428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000232	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	45474799	A	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	64	0	0	80	8	10	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.580133844	0.580133844	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	8.22E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	45642769	C	G	ADCY1	CCDS34631.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	69	14	20.3	108	2	1.9	61	8	13.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	1.026953472	1.026953472	1	0.11022543	0.11022543	1	0.598857143	0.598857143	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.30E-19	1	0.102203269	1	9.09E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	46084213	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	60	10	16.7	79	11	13.9	36	10	27.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	1	100	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.844833645	0.844833645	1	0.806386043	0.806386043	1	1.270857143	1.270857143	1	NA	NA	0	NA	NA	1	4.571428571	4.571428571	1	8	NA	1	1	5.86E-13	1	3.23E-13	1	2.21E-15	0.005	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	46405176	C	G	-	-	-	-	-	-	38	0	0	51	0	0	89	0	0	74	5	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0	0	1	0.310857143	0.310857143	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000378	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	46913048	T	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	42	5	11.9	62	16	25.8	50	7	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.602007208	0.602007208	1	1.496745318	1.496745318	1	0.64	0.64	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.00000228	1	3.36E-23	1	6.46E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	47683766	G	A	-	-	-	-	-	-	49	0	0	54	12	22.2	82	0	0	71	1	1.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	1.12307227	1.12307227	1	0	0	1	0.064	0.064	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	6.90E-17	1	1	1	0.299450652	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	48294987	A	T	ABCA13	CCDS47584.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	57	0	0	77	13	16.9	61	1	1.6	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.980426196	0.980426196	1	0.073142857	0.073142857	1	NA	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.67E-16	1	0.263440347	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	48542289	C	T	ABCA13	CCDS47584.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	46	0	0	82	12	14.6	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.846995412	0.846995412	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	1	1	1	1.46E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	48672109	C	T	ABCA13	CCDS47584.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	57	0	0	59	11	18.6	66	1	1.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	1.07904895	1.07904895	1	0.068571429	0.068571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.10E-14	1	0.281671117	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	48757292	G	A	-	-	-	-	-	-	42	1	2.4	58	26	44.8	61	28	45.9	60	26	43.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	2.266380077	1.133190039	2	2.662814344	0.982095861	2.71135889	1.979428571	0.989714286	2	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	0.189842622	1	2.83E-44	1	6.09E-48	1	8.84E-44	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	48977938	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	64	0	0	74	6	8.1	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.469908414	0.660578535	0.71135889	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.00000216	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	49113823	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	57	0	0	63	0	0	57	6	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0	NA	0	0.48	0.48	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000456	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	49135156	G	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	55	0	0	71	10	14.1	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.81798872	0.81798872	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	3.42E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	49353093	C	G	-	-	-	-	-	-	29	0	0	40	6	15	61	0	0	38	5	13.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.758832615	0.758832615	1	0	NA	0	0.603428571	0.603428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	5.18E-08	1	1	1	0.00000137	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	49380639	T	C	-	-	-	-	-	-	53	0	0	53	0	0	77	11	14.3	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.829591397	0.829591397	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.41E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	49410113	T	C	-	-	-	-	-	-	27	0	0	45	9	20	65	0	0	65	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	1.01177682	1.01177682	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.47E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	49643882	A	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	39	0	0	54	1	1.9	60	6	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.11022543	0.11022543	1	0.457142857	0.457142857	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.237137336	1	0.000000621	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	52139378	T	C	-	-	-	-	-	-	45	0	0	59	1	1.7	68	8	11.8	72	0	0	292	1	0.3	116	0	0	61	7	11.5	66	0	0	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.08600103	NA	0	0.684557936	0.684557936	1	0	0	1	0	NA	0	0.667153921	0.667153921	1	0	0	1	NA	NA	1	0.768612668	0.256019138	1	2.21E-09	2.69E-08	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	7	52162515	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	46	14	30.4	66	29	43.9	38	15	39.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	1.537900767	1.537900767	1	2.546787575	0.939303013	2.71135889	1.805714286	0.902857143	2	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.26E-21	1	6.96E-49	1	4.24E-25	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	52699846	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	49	0	0	67	10	14.9	66	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.864399428	0.864399428	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.87E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	54115027	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	40	6	15	79	1	1.3	47	7	14.9	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.758832615	0.758832615	1	0.0754174	0.0754174	1	0.681142857	0.681142857	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.18E-08	1	0.326987115	1	4.12E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	54347911	C	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	59	14	23.7	78	8	10.3	70	13	18.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	1.198955532	1.198955532	1	0.597537859	0.597537859	1	0.850285714	0.850285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.58E-20	1	6.71E-09	1	4.44E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	54535399	G	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	52	7	13.5	80	0	0	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.682949354	0.682949354	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	8.58E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	54591567	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	53	27	50.9	69	30	43.5	53	26	49.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	2.574972007	1.287486004	2	2.523582221	0.930744444	2.71135889	2.244571429	1.122285714	2	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.40E-48	1	2.44E-50	1	1.27E-45	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	54603332	T	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	41	0	0	73	14	19.2	56	0	0	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	1.11385698	1.11385698	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.71E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	54721267	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	46	6	13	77	3	3.9	77	10	13	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.657654933	0.657654933	1	0.226252199	0.226252199	1	0.594285714	0.594285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.000000123	1	0.006942426	1	7.90E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	54744440	A	G	-	-	-	-	-	-	48	0	0	67	0	0	75	10	13.3	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.771578013	0.771578013	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	6.02E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	54788144	A	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	61	0	0	85	24	28.2	71	9	12.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	1.63597744	0.955952284	1.71135889	0.580571429	0.580571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	3.98E-35	1	1.10E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	56026655	C	T	MRPS17	CCDS5520.1	r.?	-	-	downstream	45	0	0	45	0	0	92	10	10.9	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.63234589	0.63234589	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	4.85E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	56398967	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	40	10	25	64	16	25	50	4	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	1.264721025	1.264721025	1	1.45033461	1.45033461	1	0.365714286	0.365714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	7.22E-15	1	5.94E-23	1	0.000119787	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	56914262	A	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	60	3	5	77	6	7.8	76	1	1.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.252944205	0.252944205	1	0.452504398	0.636112664	0.71135889	0.059428571	0.059428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.003458198	1	0.00000273	1	0.316790122	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	57301747	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	57	6	10.5	91	15	16.5	58	9	15.5	631	1	0.2	277	64	23.1	169	15	8.9	180	45	25	TRUE	TRUE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.531182831	0.531182831	1	0.957220843	0.957220843	1	0.708571429	0.708571429	1	1.168602227	1.168602227	1	0.516319121	0.72582086	0.71135889	1.142857143	1.142857143	1	8	7	1	0.957697703	0.000000456	1.14E-84	1.17E-18	1.57E-14	1.67E-11	9.15E-62	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	7	57336475	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	63	0	0	65	5	7.7	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	0.44670306	0.627957373	0.71135889	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.0000201	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	57409807	G	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	52	1	1.9	93	11	11.8	70	5	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.096118798	NA	0	0.684557936	0.684557936	1	0.324571429	0.324571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.229451111	1	2.04E-12	1	0.0000289	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	57432496	T	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	49	0	0	61	13	21.3	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	1.235685088	1.235685088	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	6.41E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	57591333	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	54	0	0	69	18	26.1	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0	NA	0	1.514149333	0.884764348	1.71135889	0.498285714	0.498285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	5.16E-26	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	61666704	C	T	-	-	-	-	-	-	57	0	0	66	9	13.6	103	0	0	85	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.900879943	3.71135889	3	2	2	2	0	1	1	0.099120057	0.28864111	1	2	3	NA	1	1	NA	0.900879943	0.71135889	NA	0.688008238	0.688008238	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.59E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	62364135	C	G	-	-	-	-	-	-	38	0	0	36	9	25	48	1	2.1	52	9	17.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.03950104	1.03950104	1	0.085889571	0.085889571	1	0.617857143	0.617857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.63E-13	1	0.213845552	1	5.92E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	62836759	A	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	45	12	26.7	39	12	30.8	55	18	32.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.11018711	1.11018711	1	1.259713701	1.259713701	1	1.167857143	1.167857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.03E-18	1	8.43E-19	1	4.61E-28	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	63334772	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	50	11	22	57	0	0	59	15	25.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914760915	0.914760915	1	0	0	1	0.907142857	0.907142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.52E-15	1	1	1	9.90E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	66628667	T	G	TYW1	CCDS5538.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	28	9	32.1	34	14	41.2	33	13	39.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.334719335	1.334719335	1	1.685071575	1.685071575	1	1.407142857	1.407142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.24E-14	1	7.74E-24	1	6.37E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	66633403	C	A	TYW1	CCDS5538.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	33	0	0	48	0	0	45	7	15.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.557142857	0.557142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000003	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	67758801	G	A	-	-	-	-	-	-	49	0	0	53	13	24.5	51	1	2	42	5	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.018711019	1.018711019	1	0.081799591	0.081799591	1	0.425	0.425	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	8.53E-19	1	0.225579006	1	0.00000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	68439461	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	48	10	20.8	48	5	10.4	50	6	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.864864865	0.864864865	1	0.425357873	0.425357873	1	0.428571429	0.428571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.37E-14	1	0.00000447	1	0.000000206	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	68541932	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	45	18	40	62	3	4.8	53	6	11.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.663201663	1.663201663	1	0.196319018	0.196319018	1	0.403571429	0.403571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.76E-30	1	0.003793816	1	0.000000293	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	68749303	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	39	7	17.9	64	1	1.6	61	9	14.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.744282744	0.744282744	1	0.065439673	0.065439673	1	0.528571429	0.528571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.04E-09	1	0.274433592	1	2.68E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	70626024	G	A	WBSCR17	CCDS5540.1	r.?	-	-	intronic	52	0	0	46	0	0	46	10	21.7	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.887525562	0.887525562	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.38E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	70812577	A	G	WBSCR17	CCDS5540.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	50	0	0	56	6	10.7	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.437627812	0.437627812	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000409	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	70981721	C	T	WBSCR17	CCDS5540.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	33	6	18.2	56	0	0	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.756756757	0.756756757	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.54E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	72945030	A	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	46	15	32.6	48	1	2.1	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.355509356	1.355509356	1	0.085889571	0.085889571	1	0.35	0.35	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.35E-23	1	0.213845552	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	75917036	G	T	SRRM3	ENST00000388802	r.?	-	-	downstream	47	0	0	49	12	24.5	62	0	0	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.018711019	1.018711019	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.90E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	76242495	G	T	POMZP3	CCDS43606.1	r.?	-	-	intronic	6	0	0	11	3	27.3	6	0	0	8	1	12.5	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.135135135	1.135135135	1	0	0	1	0.446428571	0.446428571	1	4.158004158	4.158004158	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.00002	0.005	1	1	0.039306956	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	77036763	A	C	PION	CCDS34672.2	r.?	-	-	intronic	36	0	0	43	1	2.3	45	8	17.8	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.095634096	0.095634096	1	0.72801636	0.72801636	1	0.157142857	0.157142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.193893409	1	7.14E-11	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	78400769	C	T	MAGI2	CCDS5594.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	39	0	0	54	6	11.1	47	0	0	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.45398773	0.45398773	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000329	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	78876397	A	T	MAGI2	CCDS5594.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	45	8	17.8	59	0	0	64	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.74012474	0.74012474	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	7.14E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	79105154	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	46	0	0	39	8	20.5	34	4	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.838445808	0.838445808	1	0.421428571	0.421428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	2.09E-11	1	0.0000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	79417541	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	37	0	0	38	0	0	63	7	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.396428571	0.396428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	3.38E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	80423574	C	A	SEMA3C	CCDS5596.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	48	7	14.6	52	0	0	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.607068607	0.607068607	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.81E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	82624188	C	T	PCLO	CCDS47630.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	41	0	0	51	12	23.5	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.961145194	0.961145194	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	2	NA	1	1	1	1	3.24E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	83197802	G	C	SEMA3E	CCDS34674.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	59	13	22	41	0	0	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914760915	0.914760915	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.99E-18	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	83291992	T	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	44	0	0	53	0	0	54	5	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.332142857	0.332142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000806	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	85309092	C	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	46	0	0	45	9	20	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.81799591	0.81799591	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.47E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	85368153	C	T	-	-	-	-	-	-	49	0	0	52	11	21.2	49	0	0	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.881496881	0.881496881	1	0	0	1	0.078571429	0.078571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.44E-15	1	1	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	86135114	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	43	0	0	52	12	23.1	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.944785276	0.944785276	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.19E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	91334625	C	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	53	8	15.1	63	13	20.6	47	7	14.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.627858628	0.627858628	1	0.842535787	0.842535787	1	0.532142857	0.532142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.83E-10	1	1.01E-17	1	4.12E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	93658776	T	G	-	-	-	-	-	-	52	0	0	47	0	0	55	14	25.5	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.042944785	1.042944785	1	0.085714286	0.085714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.19E-20	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	95546021	C	A	DYNC1I1	CCDS5644.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	42	10	23.8	45	2	4.4	38	8	21.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.98960499	0.98960499	1	0.1799591	0.1799591	1	0.753571429	0.753571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.24E-14	1	0.021467209	1	1.67E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	96525162	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	34	0	0	60	12	20	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.81799591	0.81799591	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.74E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	98132188	G	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	37	8	21.6	27	2	7.4	25	8	32	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.898128898	0.898128898	1	0.302658487	0.302658487	1	1.142857143	1.142857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.33E-11	1	0.00807567	1	3.92E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	98308129	C	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	43	9	20.9	52	3	5.8	47	7	14.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.869022869	0.869022869	1	0.237218814	0.237218814	1	0.532142857	0.532142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.45E-13	1	0.002300591	1	4.12E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	102723227	T	C	ARMC10	CCDS5728.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	48	0	0	48	12	25	54	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.022494888	1.022494888	1	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.44E-17	1	0.237137336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	103417965	A	G	RELN	CCDS47680.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	44	9	20.5	51	1	2	52	8	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852390852	0.852390852	1	0.081799591	0.081799591	1	0.55	0.55	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.18E-12	1	0.225579006	1	2.42E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	103756000	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	35	0	0	48	10	20.8	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.850715746	0.850715746	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.37E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	104001267	G	T	LHFPL3	ENST00000424859	r.?	-	-	intronic	43	0	0	37	0	0	48	8	16.7	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.683026585	0.683026585	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.23E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	104101933	G	A	LHFPL3	ENST00000424859	r.?	-	-	intronic	44	0	0	52	0	0	47	12	25.5	43	6	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.042944785	1.042944785	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.09E-17	1	8.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	104227081	T	G	LHFPL3	ENST00000424859	r.?	-	-	intronic	40	0	0	33	5	15.2	50	0	0	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.632016632	0.632016632	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.00000066	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	104406932	G	C	LHFPL3	ENST00000424859	r.?	-	-	intronic	49	0	0	46	0	0	59	16	27.1	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.108384458	1.108384458	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.37E-23	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	108907132	C	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	44	0	0	48	9	18.8	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.768916155	0.768916155	1	0.075	0.075	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.75E-12	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	109167354	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	52	0	0	43	8	18.6	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.760736196	0.760736196	1	0.107142857	0.107142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.85E-11	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	109857638	C	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	52	0	0	45	8	17.8	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.72801636	0.72801636	1	0.210714286	0.210714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	7.14E-11	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	110457352	C	T	IMMP2L	CCDS5753.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	43	0	0	52	12	23.1	50	7	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.944785276	0.944785276	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	4.19E-17	1	6.46E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	111989820	T	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	36	0	0	52	0	0	57	9	15.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.564285714	0.564285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	1.42E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	112091056	C	G	IFRD1	CCDS34736.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	38	0	0	40	8	20	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.81799591	0.81799591	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.61E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	112139388	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	34	9	26.5	50	2	4	35	7	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.101871102	1.101871102	1	0.163599182	0.163599182	1	0.714285714	0.714285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.15E-14	1	0.026131524	1	4.65E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	112610498	A	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	58	0	0	45	5	11.1	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.45398773	0.45398773	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000323	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	115372717	A	C	-	-	-	-	-	-	48	0	0	47	0	0	47	8	17	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.695296524	0.695296524	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.03E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	115741373	A	G	TFEC	ENST00000484212	r.?	-	-	intronic	40	0	0	45	0	0	48	8	16.7	62	1	1.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.683026585	0.683026585	1	0.057142857	0.057142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.23E-10	1	0.267123145	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	120500673	C	G	TSPAN12	CCDS5777.1	r.?	-	-	upstream	35	0	0	34	0	0	57	12	21.1	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.862985685	0.862985685	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.40E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	120962016	C	T	WNT16	CCDS5780.1	r.?	-	-	upstream	42	0	0	45	0	0	49	0	0	48	5	10.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.371428571	0.371428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	120973338	C	T	WNT16	CCDS5781.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	49	10	20.4	49	0	0	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.848232848	0.848232848	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	6.72E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	123128215	G	A	IQUB	CCDS5787.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	39	1	2.6	51	14	27.5	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.108108108	0.108108108	1	1.124744376	1.124744376	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	0.177567718	1	6.64E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	124982727	G	A	-	-	-	-	-	-	13	0	0	18	0	0	22	8	36.4	20	1	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.488752556	1.488752556	1	0.178571429	0.178571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.17E-13	1	0.09538952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	125795714	C	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	47	0	0	64	12	18.8	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.768916155	0.768916155	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.30E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	125797550	G	A	-	-	-	-	-	-	49	0	0	49	16	32.7	53	2	3.8	60	8	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.35966736	1.35966736	1	0.155419223	0.155419223	1	0.475	0.475	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.37E-25	1	0.029108399	1	7.93E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	126466355	C	T	GRM8	CCDS5794.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	34	0	0	41	7	17.1	29	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.699386503	0.699386503	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.51E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	126834991	G	T	GRM8	CCDS5794.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	45	0	0	53	13	24.5	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.00204499	1.00204499	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.53E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	132637635	T	C	CHCHD3	CCDS5828.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	48	0	0	48	11	22.9	52	0	0	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.936605317	0.936605317	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.31E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	135047386	T	A	CNOT4	CCDS43650.1	r.?	-	-	downstream	31	0	0	53	0	0	56	13	23.2	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.948875256	0.948875256	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.89E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	135211535	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	47	9	19.1	38	0	0	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.794178794	0.794178794	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.24E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	135303124	C	T	NUP205	CCDS34759.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	40	13	32.5	52	20	38.5	40	10	25	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.351351351	1.351351351	1	1.574642127	1.574642127	1	0.892857143	0.892857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.30E-20	1	1.03E-32	1	7.22E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	135610188	G	A	LUZP6	CCDS5842.1	r.?	-	-	downstream	38	0	0	47	0	0	43	7	16.3	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.666666667	0.666666667	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.15E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	135670031	A	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	46	9	19.6	54	0	0	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.814968815	0.814968815	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.82E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	135844373	T	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	62	20	32.3	55	1	1.8	57	9	15.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.343035343	1.343035343	1	0.073619632	0.073619632	1	0.564285714	0.564285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.19E-31	1	0.240951649	1	1.42E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	135863629	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	44	12	27.3	57	1	1.8	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.135135135	1.135135135	1	0.073619632	0.073619632	1	0.232142857	0.232142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.44E-18	1	0.248523156	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	136185219	G	C	-	-	-	-	-	-	46	0	0	43	17	39.5	61	1	1.6	45	10	22.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.642411642	1.642411642	1	0.065439673	0.065439673	1	0.792857143	0.792857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.84E-28	1	0.263440347	1	2.66E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	136454741	C	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	45	10	22.2	42	1	2.4	41	6	14.6	1	1	100	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.923076923	0.923076923	1	0.098159509	0.098159509	1	0.521428571	0.521428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	0.005	2.66E-14	1	0.189842622	1	6.05E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	137088807	G	T	DGKI	CCDS5845.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	63	0	0	53	5	9.4	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.384458078	0.384458078	1	0.435714286	0.435714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.00000734	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	137155604	C	A	DGKI	CCDS5845.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	47	6	12.8	52	0	0	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.532224532	0.532224532	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000000141	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	138263640	A	G	TRIM24	CCDS5847.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	45	9	20	47	0	0	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.47E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	138533861	C	A	KIAA1549	CCDS47723.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	41	7	17.1	53	0	0	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.711018711	0.711018711	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.51E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	141180022	C	T	-	-	-	-	-	-	52	0	0	56	0	0	51	11	21.6	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.883435583	0.883435583	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.94E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	141509081	G	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	44	0	0	54	16	29.6	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.210633947	1.210633947	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.69E-24	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	141831004	C	A	ENSG00000204987	ENST00000477922	r.?	-	-	intronic	42	0	0	40	0	0	49	6	12.2	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.498977505	0.498977505	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000182	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	142160709	T	C	-	-	-	-	-	-	45	0	0	39	0	0	66	19	28.8	48	3	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.17791411	1.17791411	1	0.221428571	0.221428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	2.64E-28	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	143772750	G	A	OR2A25	CCDS43669.1	r.?	-	-	downstream	37	0	0	39	9	23.1	45	1	2.2	44	11	25	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.96049896	0.96049896	1	0.08997955	0.08997955	1	0.892857143	0.892857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.62E-13	1	0.201934322	1	3.22E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	145053728	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	29	0	0	41	6	14.6	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.597137014	0.597137014	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.05E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	145228347	T	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	41	11	26.8	43	0	0	52	6	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.114345114	1.114345114	1	0	0	1	0.410714286	0.410714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.34E-16	1	1	1	0.000000261	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	146774865	C	T	CNTNAP2	CCDS5889.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	47	7	14.9	56	0	0	64	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.820751134	2	2.663935691	1	1	1	1	1	1	0.179248866	1	0.336064309	2	NA	2	1	NA	1	0.820751134	NA	0.663935691	0.741834539	0.741834539	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.12E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	147582361	C	A	CNTNAP2	CCDS5889.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	41	7	17.1	49	0	0	48	0	0	464	2	0.4	261	29	11.1	96	0	0	155	0	0	FALSE	TRUE	2.820751134	2	2.663935691	1	1	1	1	1	1	0.179248866	1	0.336064309	2	NA	2	1	NA	1	0.820751134	NA	0.663935691	0.851367155	0.851367155	1	0	NA	0	0	0	1	0.552641837	0.552641837	1	0	0	1	0	0	1	NA	4	1	0.674485815	1.51E-09	1.65E-29	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	7	147595348	C	T	CNTNAP2	CCDS5889.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	41	6	14.6	58	0	0	67	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.820751134	2	2.663935691	1	1	1	1	1	1	0.179248866	1	0.336064309	2	NA	2	1	NA	1	0.820751134	NA	0.663935691	0.726898273	0.726898273	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	6.05E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	147894905	T	C	CNTNAP2	CCDS5889.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	39	21	53.8	39	12	30.8	65	34	52.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2.820751134	2	2.663935691	1	1	1	1	1	1	0.179248866	1	0.336064309	2	NA	2	1	NA	1	0.820751134	NA	0.663935691	2.678570347	1.471134795	1.820751134	1.259713701	1.259713701	1	2.215095509	1.331238654	1.663935691	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	8	NA	1	1	2.73E-38	1	8.43E-19	1	1.70E-60	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	148684584	A	C	-	-	-	-	-	-	52	0	0	48	9	18.8	54	0	0	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.820751134	2	2.663935691	1	1	1	1	1	1	0.179248866	1	0.336064309	2	NA	2	1	NA	1	0.820751134	NA	0.663935691	0.936005995	0.936005995	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	2.75E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	149641600	C	G	-	-	-	-	-	-	49	0	0	53	17	32.1	43	2	4.7	40	17	42.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.820751134	2	2.663935691	1	1	1	1	1	1	0.179248866	1	0.336064309	2	NA	2	1	NA	1	0.820751134	NA	0.663935691	1.598180449	0.877758865	1.820751134	0.192229039	0.192229039	1	1.800029812	1.081790493	1.663935691	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.08E-26	1	0.019709573	1	6.07E-29	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	149743404	A	T	-	-	-	-	-	-	20	0	0	30	0	0	22	5	22.7	25	2	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.820751134	2	2.663935691	1	1	1	1	1	1	0.179248866	1	0.336064309	2	NA	2	1	NA	1	0.820751134	NA	0.663935691	0	0	1	0.928425358	0.928425358	1	0.338829141	0.338829141	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	7.67E-08	1	0.006948068	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	150039105	C	T	LRRC61	CCDS5901.1	r.?	-	-	downstream	46	0	0	45	6	13.3	60	0	0	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.820751134	2	2.663935691	1	1	1	1	1	1	0.179248866	1	0.336064309	2	NA	2	1	NA	1	0.820751134	NA	0.663935691	0.662174454	0.662174454	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000000108	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	151664765	A	T	GALNTL5	CCDS5929.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	71	7	9.9	65	0	0	55	0	0	111	0	0	126	16	12.7	68	0	0	92	0	0	TRUE	TRUE	2.820751134	2	2.663935691	1	1	1	1	1	1	0.179248866	1	0.336064309	2	NA	2	1	NA	1	0.820751134	NA	0.663935691	0.492896774	0.600543519	0.820751134	0	0	1	0	0	1	0.632301922	0.770394211	0.820751134	0	0	1	0	0	1	6	4	1	1	7.85E-08	6.49E-18	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	7	152551784	C	T	ACTR3B	CCDS5934.1	r.1537c>u	c.?	p.?	3'UTR variant	33	0	0	43	0	0	62	12	19.4	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.820751134	2	2.663935691	1	1	1	1	1	1	0.179248866	1	0.336064309	2	NA	2	1	NA	1	0.820751134	NA	0.663935691	0	0	1	0.793456033	0.793456033	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.19E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	152836989	C	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	42	0	0	51	9	17.6	53	3	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.820751134	2	2.663935691	1	1	1	1	1	1	0.179248866	1	0.336064309	2	NA	2	1	NA	1	0.820751134	NA	0.663935691	0	0	1	0.719836401	0.719836401	1	0.241415763	0.363613173	0.663935691	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	4.92E-12	1	0.002429596	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	153981188	C	T	DPP6	ENST00000404039	r.?	-	-	intronic	44	0	0	41	0	0	45	6	13.3	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.820751134	2	2.663935691	1	1	1	1	1	1	0.179248866	1	0.336064309	2	NA	2	1	NA	1	0.820751134	NA	0.663935691	0	0	1	0.54396728	0.54396728	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000108	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	154009317	G	T	DPP6	ENST00000404039	r.?	-	-	intronic	46	0	0	59	0	0	56	1	1.8	56	5	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.820751134	2	2.663935691	1	1	1	1	1	1	0.179248866	1	0.336064309	2	NA	2	1	NA	1	0.820751134	NA	0.663935691	0	0	1	0.073619632	0.073619632	1	0.376947419	0.567746883	0.663935691	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.244746891	1	0.00000965	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	155275022	C	T	CNPY1	CCDS43684.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	61	0	0	56	0	0	79	6	7.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.820751134	2	2.663935691	1	1	1	1	1	1	0.179248866	1	0.336064309	2	NA	2	1	NA	1	0.820751134	NA	0.663935691	0	0	1	0	NA	0	0.321887684	0.484817563	0.663935691	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000318	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	156111415	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	48	19	39.6	48	1	2.1	49	20	40.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.820751134	2	2.663935691	1	1	1	1	1	1	0.179248866	1	0.336064309	2	NA	2	1	NA	1	0.820751134	NA	0.663935691	1.971587096	1.082842712	1.820751134	0.085889571	0.085889571	1	1.728028619	1.038518873	1.663935691	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.92E-31	1	0.213845552	1	2.35E-33	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	157536884	C	T	PTPRN2	CCDS5949.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	48	25	52.1	53	1	1.9	58	15	25.9	22	0	0	255	85	33.3	197	8	4.1	125	29	23.2	TRUE	TRUE	2.820751134	2	2.663935691	1	1	1	1	1	1	0.179248866	1	0.336064309	2	NA	2	1	NA	1	0.820751134	NA	0.663935691	2.593931507	1.424649123	1.820751134	0.077709611	0.077709611	1	1.096959344	1.096959344	1	1.657925512	0.91057228	1.820751134	0.167689162	0.167689162	1	0.982604509	0.982604509	1	7	6	1	1	8.26E-45	1.83E-127	0.233303855	0.00000824	7.42E-22	2.51E-39	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	158016384	C	T	PTPRN2	CCDS5949.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	49	9	18.4	44	0	0	66	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.820751134	2	2.663935691	1	1	1	1	1	1	0.179248866	1	0.336064309	2	NA	2	1	NA	1	0.820751134	NA	0.663935691	0.916090974	0.916090974	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	3.35E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	158644749	C	G	WDR60	CCDS47757.1	r.?	-	-	upstream	40	0	0	41	0	0	50	1	2	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.820751134	2	2.663935691	1	1	1	1	1	1	0.179248866	1	0.336064309	2	NA	2	1	NA	1	0.820751134	NA	0.663935691	0	0	1	0.081799591	0.081799591	1	0.461654705	0.695330453	0.663935691	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.221687443	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	158982070	A	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	63	0	0	42	7	16.7	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.820751134	2	2.663935691	1	1	1	1	1	1	0.179248866	1	0.336064309	2	NA	2	1	NA	1	0.820751134	NA	0.663935691	0	0	1	0.683026585	0.683026585	1	0.084707285	0.084707285	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.81E-09	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	7	159107313	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	44	0	0	47	12	25.5	53	8	15.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.09E-17	1	2.83E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	572797	T	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	28	0	0	27	10	37	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0	0	1	1.025849557	1.025849557	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.62E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	2700079	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	35	0	0	45	16	35.6	25	3	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0	0	1	0.987033628	0.987033628	1	0.188571429	0.188571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	8.61E-26	1	0.00026475	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	2972494	T	A	CSMD1	ENST00000318252	r.?	-	-	intronic	36	0	0	30	11	36.7	43	0	0	20	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	1.124642888	1.124642888	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.44E-18	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	3169093	C	A	CSMD1	ENST00000318252	r.?	-	-	intronic	55	0	0	37	0	0	42	8	19	43	6	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0	0	1	0.526787611	0.771751804	0.682586821	0.22	0.22	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	3.96E-11	1	8.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	3685369	C	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	30	0	0	32	4	12.5	38	7	18.4	369	0	0	98	2	2	55	9	16.4	75	8	10.7	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0	0	1	0.346570796	0.50773145	0.682586821	0.289142857	0.289142857	1	0.061288441	NA	0	0.454700885	0.666143662	0.682586821	0.168142857	0.168142857	1	3	NA	1	1	1	0.086801297	0.0000201	1.01E-11	8.61E-10	4.89E-09	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	8	3754937	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	35	0	0	41	10	24.4	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0	0	1	0.676506195	0.676506195	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.51E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	3950524	G	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	39	6	15.4	38	0	0	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0.471920994	0.520643959	0.906417881	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.43E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	4666327	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	40	11	27.5	36	3	8.3	28	3	10.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0.842716061	0.842716061	1	0.230123009	0.230123009	1	0.168142857	0.168142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.88E-17	1	0.000788827	1	0.000372895	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	4796715	C	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	44	10	22.7	39	0	0	35	8	22.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0.695623803	0.695623803	1	0	0	1	0.359857143	0.359857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.08E-14	1	1	1	8.15E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	7660032	A	C	-	-	-	-	-	-	20	0	0	6	0	0	4	2	50	3	1	33.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0	0	1	1.386283186	1.386283186	1	0.523285714	0.523285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.000149002	1	0.014925125	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	7936926	C	A	-	-	-	-	-	-	18	0	0	15	0	0	18	9	50	20	2	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0	0	1	1.386283186	1.386283186	1	0.157142857	0.157142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.12E-17	1	0.004473894	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	9730081	C	T	-	-	-	-	-	-	49	0	0	35	0	0	44	0	0	40	8	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0	0	1	0	0	1	0.314285714	0.314285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	2.61E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	13780998	C	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	37	9	24.3	43	2	4.7	36	8	22.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0.744654556	0.744654556	1	0.130310619	0.130310619	1	0.348857143	0.348857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.14E-13	1	0.019709573	1	1.04E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	14530810	G	A	SGCZ	CCDS5992.2	r.?	-	-	intronic	25	0	0	25	6	24	38	0	0	36	12	33.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0.735461289	0.735461289	1	0	0	1	0.523285714	0.523285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.55E-09	1	1	1	2.73E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	14989832	G	C	SGCZ	CCDS5992.2	r.?	-	-	intronic	35	0	0	40	0	0	33	13	39.4	29	1	3.4	240	0	0	115	0	0	65	20	30.8	78	2	2.6	TRUE	TRUE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0	0	1	1.09239115	1.09239115	1	0.053428571	0.053428571	1	0	0	1	0.853950442	0.853950442	1	0.040857143	0.040857143	1	2	1	1	1	1	1	6.37E-22	2.18E-30	0.135292269	0.058485548	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	8	15772895	T	A	-	-	-	-	-	-	50	0	0	30	0	0	56	19	33.9	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0	0	1	0.9399	0.9399	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.79E-30	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	16314968	G	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	28	6	21.4	39	0	0	32	5	15.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0.655786316	0.655786316	1	0	0	1	0.245142857	0.245142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.36E-09	1	1	1	0.000000562	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	16792869	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	37	13	35.1	32	0	0	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	1.075612136	1.075612136	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.89E-21	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	18995713	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	31	0	0	41	0	0	38	6	15.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0	0	1	0	NA	0	0.248285714	0.248285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	3.76E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	19793312	C	T	LPL	CCDS6012.1	r.?	-	-	upstream	34	0	0	30	0	0	31	8	25.8	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0	0	1	0.715322124	0.715322124	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.78E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	19913508	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	42	16	38.1	39	3	7.7	22	4	18.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	1.167544797	1.167544797	1	0.213487611	0.213487611	1	0.286	0.286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.25E-26	1	0.000998458	1	0.00000425	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	20565734	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	37	0	0	41	6	14.6	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0	0	1	0.40479469	0.593030333	0.682586821	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.05E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	22677972	C	T	PEBP4	CCDS43724.1	r.?	-	-	intronic	59	0	0	32	9	28.1	44	2	4.5	30	6	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0.861102593	0.861102593	1	0.124765487	0.124765487	1	0.314285714	0.314285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.94E-14	1	0.020580492	1	8.37E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	28199070	T	C	ZNF395	CCDS6067.1	r.?	-	-	downstream	47	0	0	29	0	0	35	12	34.3	33	0	0	141	0	0	116	2	1.7	81	25	30.9	81	0	0	TRUE	TRUE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0	0	1	0.950990265	0.950990265	1	0	0	1	0.052095175	0.052095175	1	0.856723009	0.856723009	1	0	0	1	2	1	1	1	1	0.115017172	1.83E-19	1.20E-37	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	8	29609469	G	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	33	9	27.3	29	1	3.4	19	4	21.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	0.906417881	0.682586821	0	0	0	0	0	0	0	0.093582119	0.317413179	1	1	1	NA	0	0	NA	0.906417881	0.682586821	NA	0.836587217	0.836587217	1	0.094267257	0.094267257	1	0.331571429	0.331571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	6.76E-14	1	0.135292269	1	0.00000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	33302153	T	C	FUT10	CCDS6088.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	34	17	50	31	1	3.2	40	18	45	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.457644966	2	1.254870278	3	1	1	0	1	0	0.542355034	1	0.745129722	3	NA	1	1	NA	1	0.457644966	NA	0.254870278	2.807824562	0.935941521	3	0.130879346	0.130879346	1	1.271834482	1.271834482	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.64E-30	1	0.143917729	1	3.90E-31	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	36093276	G	T	-	-	-	-	-	-	51	0	0	51	0	0	52	6	11.5	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.457644966	2	1.254870278	3	1	1	0	1	0	0.542355034	1	0.745129722	3	NA	1	1	NA	1	0.457644966	NA	0.254870278	0	0	1	0.470347648	0.470347648	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.000000261	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	36500299	A	T	-	-	-	-	-	-	58	0	0	125	8	6.4	53	0	0	110	5	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.457644966	2	6.424962249	3	1	5	0	1	1	0.542355034	1	0.575037751	3	NA	5	1	NA	2	0.457644966	NA	0.424962249	0.359401544	0.785328301	0.457644966	0	NA	0	0.359837587	0.846751889	0.424962249	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.000000273	1	1	1	0.000247412	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	36537709	T	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	121	14	11.6	65	3	4.6	114	12	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.457644966	2	6.424962249	3	1	5	0	1	1	0.542355034	1	0.575037751	3	NA	5	1	NA	2	0.457644966	NA	0.424962249	0.651415298	0.651415298	1	0.188139059	0.188139059	1	0.839621036	0.839621036	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.80E-15	1	0.004333293	1	8.42E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	36819183	C	A	-	-	-	-	-	-	56	0	0	104	9	8.7	58	0	0	108	4	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.457644966	2	6.424962249	3	1	5	0	1	1	0.542355034	1	0.575037751	3	NA	5	1	NA	2	0.457644966	NA	0.424962249	0.488561474	1.06755566	0.457644966	0	NA	0	0.29586646	0.69621822	0.424962249	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	3.50E-09	1	1	1	0.00221591	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	37099146	G	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	137	11	8	71	0	0	112	1	0.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.457644966	2	6.424962249	3	1	5	0	1	1	0.542355034	1	0.575037751	3	NA	5	1	NA	2	0.457644966	NA	0.424962249	0.44925193	0.981660377	0.457644966	0	NA	0	0.071967517	0.071967517	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.45E-10	1	1	1	0.429592741	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	37159513	C	G	-	-	-	-	-	-	45	0	0	125	10	8	63	0	0	112	0	0	149	0	0	455	35	7.7	104	0	0	318	0	0	FALSE	FALSE	3.457644966	2	6.424962249	3	1	5	0	1	1	0.542355034	1	0.575037751	3	NA	5	1	NA	2	0.457644966	NA	0.424962249	0.44925193	0.981660377	0.457644966	0	NA	0	0	0	1	0.432404983	0.944848113	0.457644966	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	1	1.03E-09	1.02E-29	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	8	37712811	G	A	RAB11FIP1	CCDS34882.1	r.?	-	-	downstream	45	0	0	126	0	0	74	11	14.9	105	1	1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.457644966	2	6.424962249	3	1	5	0	1	1	0.542355034	1	0.575037751	3	NA	5	1	NA	2	0.457644966	NA	0.424962249	0	NA	0	0.609406953	0.609406953	1	0.079963908	0.079963908	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.53E-13	1	0.409223137	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	37964465	G	A	ASH2L	CCDS47840.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	101	9	8.9	60	3	5	86	6	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.457644966	2	6.424962249	3	1	5	0	1	1	0.542355034	1	0.575037751	3	NA	5	1	NA	2	0.457644966	NA	0.424962249	0.499792772	1.092097169	0.457644966	0.204498978	0.204498978	1	0.559747357	0.559747357	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.70E-09	1	0.003458198	1	0.00000522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	38067352	T	C	BAG4	CCDS6104.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	118	29	24.6	46	3	6.5	106	26	24.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.457644966	2	6.424962249	3	1	5	0	1	1	0.542355034	1	0.575037751	3	NA	5	1	NA	2	0.457644966	NA	0.424962249	1.381449685	0.895675544	1.542355034	0.265848671	0.265848671	1	1.959115751	0.979557875	2	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.88E-40	1	0.001615827	1	4.02E-36	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	38112698	G	A	DDHD2	CCDS34883.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	69	13	18.8	45	4	8.9	67	22	32.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.457644966	2	6.424962249	3	1	5	0	1	1	0.542355034	1	0.575037751	3	NA	5	1	NA	2	0.457644966	NA	0.424962249	1.055742035	1.055742035	1	0.36400818	0.36400818	1	2.622816189	1.018554461	2.575037751	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.64E-17	1	0.0000791	1	5.21E-34	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	38185048	T	A	WHSC1L1	CCDS43729.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	109	23	21.1	47	2	4.3	108	29	26.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.457644966	2	6.424962249	3	1	5	0	1	1	0.542355034	1	0.575037751	3	NA	5	1	NA	2	0.457644966	NA	0.424962249	1.184901965	1.184901965	1	0.175869121	0.175869121	1	2.151029131	1.075514565	2	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.82E-30	1	0.02328732	1	2.13E-41	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	38211081	A	T	WHSC1L1	CCDS43729.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	141	22	15.6	63	4	6.3	110	15	13.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.457644966	2	6.424962249	3	1	5	0	1	1	0.542355034	1	0.575037751	3	NA	5	1	NA	2	0.457644966	NA	0.424962249	0.876041263	0.876041263	1	0.257668712	0.257668712	1	1.087509152	1.087509152	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.08E-26	1	0.000294233	1	2.30E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	38211548	C	T	WHSC1L1	CCDS43729.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	153	30	19.6	67	4	6	119	23	19.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.457644966	2	6.424962249	3	1	5	0	1	1	0.542355034	1	0.575037751	3	NA	5	1	NA	2	0.457644966	NA	0.424962249	1.100667228	1.100667228	1	0.245398773	0.245398773	1	1.543303428	0.979851706	1.575037751	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.19E-38	1	0.000372648	1	1.63E-29	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	38212073	T	C	WHSC1L1	CCDS43729.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	147	30	20.4	60	2	3.3	137	29	21.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.457644966	2	6.424962249	3	1	5	0	1	1	0.542355034	1	0.575037751	3	NA	5	1	NA	2	0.457644966	NA	0.424962249	1.145592421	1.145592421	1	0.134969325	0.134969325	1	1.695234854	1.076313791	1.575037751	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	8.66E-39	1	0.036544784	1	4.72E-38	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	38247041	T	G	LETM2	CCDS6106.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	145	15	10.3	81	3	3.7	121	6	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.457644966	2	6.424962249	3	1	5	0	1	1	0.542355034	1	0.575037751	3	NA	5	1	NA	2	0.457644966	NA	0.424962249	0.57841186	1.263887735	0.457644966	0.151329243	0.151329243	1	0.399819541	0.940835432	0.424962249	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.58E-15	1	0.007979008	1	0.0000367	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	38532693	T	A	-	-	-	-	-	-	51	0	0	150	20	13.3	66	3	4.5	101	13	12.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.457644966	2	6.424962249	3	1	5	0	1	1	0.542355034	1	0.575037751	3	NA	5	1	NA	2	0.457644966	NA	0.424962249	0.746881334	0.746881334	1	0.18404908	0.18404908	1	1.031534416	1.031534416	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.86E-22	1	0.004522888	1	6.62E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	38825172	C	G	PLEKHA2	ENST00000388745	r.?	-	-	intronic	39	0	0	105	57	54.3	55	5	9.1	77	34	44.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.457644966	2	6.424962249	3	1	5	0	1	1	0.542355034	1	0.575037751	3	NA	5	1	NA	2	0.457644966	NA	0.424962249	3.049297474	1.016432491	3	0.372188139	0.372188139	1	3.534404742	0.988634243	3.575037751	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.18E-101	1	0.00000883	1	3.84E-57	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	39025555	T	C	ADAM32	CCDS47846.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	65	0	0	55	16	29.1	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	1.190184049	1.190184049	1	0.078697646	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	3.78E-24	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	40190324	T	C	-	-	-	-	-	-	19	0	0	42	5	11.9	34	7	20.6	44	11	25	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.613802495	0.613802495	1	0.842535787	0.842535787	1	0.983720576	0.983720576	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.00000228	1	3.73E-10	1	3.22E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	40472076	T	C	ZMAT4	CCDS34885.1	r.?	-	-	intronic	52	0	0	31	0	0	41	12	29.3	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	1.198364008	1.198364008	1	0.086567411	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.69E-18	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	40474834	G	T	ZMAT4	CCDS34885.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	49	0	0	55	0	0	58	5	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0	NA	0	0.338399878	0.931067284	0.363453731	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000115	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	41138121	C	T	SFRP1	CCDS34886.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	57	12	21.1	58	0	0	61	0	0	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	1.088338877	1.088338877	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.40E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	41171346	T	C	SFRP1	CCDS34886.1	r.?	-	-	upstream	35	0	0	66	7	10.6	60	14	23.3	65	18	27.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.546748441	0.546748441	1	0.952965235	0.952965235	1	1.089962398	1.089962398	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.000000047	1	8.54E-20	1	1.52E-26	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	42990031	A	C	-	-	-	-	-	-	51	0	0	63	0	0	52	17	32.7	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	1.337423313	1.337423313	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.42E-26	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	43358197	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	52	6	11.5	54	0	0	57	5	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.593170478	0.593170478	1	0	NA	0	0.346269643	0.952720011	0.363453731	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.000000261	1	1	1	0.0000105	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	49067346	A	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	42	1	2.4	59	13	22	60	6	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.1237921	0.1237921	1	0.899795501	0.899795501	1	0.39348823	1.082636376	0.363453731	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.189842622	1	3.99E-18	1	0.000000621	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	49137980	C	A	-	-	-	-	-	-	62	0	0	54	7	13	52	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.670540541	0.670540541	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.13E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	50392705	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	61	9	14.8	49	0	0	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.763384615	0.763384615	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	2.68E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	50920564	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	46	0	0	48	10	20.8	53	3	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.850715746	0.850715746	1	0.224288291	0.617102735	0.363453731	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	5.37E-14	1	0.002429596	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	50982418	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	62	9	14.5	57	0	0	39	0	0	111	0	0	182	26	14.3	149	0	0	170	1	0.6	TRUE	TRUE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.747910603	0.747910603	1	0	0	1	0	0	1	0.737594595	0.737594595	1	0	0	1	0.023609294	0.023609294	1	6	4	1	1	3.12E-11	1.54E-29	1	1	1	0.573495393	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	8	51691146	G	T	SNTG1	CCDS6147.1	r.?	-	-	intronic	34	1	2.9	58	17	29.3	48	5	10.4	58	10	17.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	1.511295218	0.755647609	2	0.425357873	0.425357873	1	0.676799756	0.676799756	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	0.156694864	1	1.24E-25	1	0.00000447	1	4.10E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	51970641	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	61	30	49.2	57	12	21.1	60	27	45	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	2.537738046	1.268869023	2	0.862985685	0.862985685	1	1.770697036	1.298685094	1.363453731	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.86E-52	1	1.40E-16	1	5.59E-46	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	52209576	C	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	46	7	15.2	57	0	0	69	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.784016632	0.784016632	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	3.53E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	52646684	G	A	PXDNL	CCDS47855.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	46	10	21.7	46	1	2.2	57	2	3.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	1.119286902	1.119286902	1	0.08997955	NA	0	0.137720881	0.378922732	0.363453731	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	3.38E-14	1	0.205924651	1	0.03327602	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	53127995	G	T	ST18	CCDS6149.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	44	0	0	66	21	31.8	64	0	0	151	0	0	192	0	0	92	23	25	116	0	0	TRUE	TRUE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	1.300613497	1.300613497	1	0	0	1	0	0	1	1.022494888	1.022494888	1	0	0	1	2	1	1	1	1	1	3.42E-32	2.41E-32	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	8	54137088	G	A	OPRK1	CCDS6152.1	r.?	-	-	downstream	29	0	0	49	0	0	53	2	3.8	56	8	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.155419223	0.155419223	1	0.562688169	0.562688169	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.029108399	1	4.48E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	55783487	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	46	0	0	54	10	18.5	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.756646217	0.756646217	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.91E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	55791685	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	65	0	0	53	14	26.4	54	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	1.079754601	1.079754601	1	0.074762764	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.22E-20	1	0.237137336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	55991360	G	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	73	0	0	60	16	26.7	57	4	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	1.09202454	1.09202454	1	0.275441761	0.757845463	0.363453731	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.86E-23	1	0.000199821	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	56637812	T	C	-	-	-	-	-	-	57	0	0	74	12	16.2	61	1	1.6	58	6	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.835596674	0.835596674	1	0.065439673	0.065439673	1	0.405292877	1.115115468	0.363453731	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.02E-15	1	0.263440347	1	0.000000506	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	56946641	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	62	11	17.7	47	0	0	54	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.912966736	0.912966736	1	0	0	1	0.074762764	0.074762764	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.96E-14	1	1	1	0.237137336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	57946351	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	57	9	15.8	68	0	0	74	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.814964657	0.814964657	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.42E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	58832030	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	42	8	19	37	0	0	42	4	9.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.98002079	0.98002079	1	0	NA	0	0.373813819	1.028504558	0.363453731	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	3.96E-11	1	1	1	0.0000601	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	59147034	C	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	57	0	0	61	9	14.8	65	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.605316973	0.605316973	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	2.68E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	59379548	C	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	50	0	0	52	4	7.7	54	7	13	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.314928425	0.314928425	1	0.511534699	1.407427289	0.363453731	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	0.000139698	1	1.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	60347604	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	40	0	0	34	7	20.6	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.842535787	0.842535787	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	3.73E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	60389980	T	C	-	-	-	-	-	-	45	0	0	67	7	10.4	53	1	1.9	60	7	11.7	363	0	0	164	33	20.1	70	0	0	118	23	19.5	FALSE	TRUE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.536432432	0.536432432	1	0.077709611	NA	0	0.460381229	1.26668456	0.363453731	1.036758836	1.036758836	1	0	0	1	0.767302049	0.767302049	1	NA	6	1	1	5.23E-08	2.75E-42	0.233303855	1	2.39E-08	1.33E-29	YES	1_1	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	8	60795799	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	46	10	21.7	64	0	0	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	1.119286902	1.119286902	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	3.38E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	61018800	T	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	57	0	0	47	7	14.9	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.609406953	0.609406953	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	4.12E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	61137952	A	G	CA8	CCDS6174.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	39	0	0	55	0	0	45	5	11.1	222	0	0	203	0	0	109	2	1.8	138	9	6.5	FALSE	TRUE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0	NA	0	0.436771936	1.201726378	0.363453731	0	0	1	0.073619632	0.073619632	1	0.25576735	0.703713645	0.363453731	NA	2	1	1	1	1	1	0.103782456	0.00000323	4.19E-08	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	8	61201226	G	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	59	9	15.3	59	3	5.1	52	7	13.5	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.789174636	0.789174636	1	0.208588957	0.208588957	1	0.531209111	1.461559108	0.363453731	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.96E-11	1	0.003297476	1	8.58E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	63215753	A	G	-	-	-	-	-	-	41	0	0	64	0	0	62	16	25.8	60	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	1.055214724	1.055214724	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.36E-23	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	63385525	G	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	66	0	0	51	15	29.4	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	1.202453988	1.202453988	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	8.22E-23	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	64346247	G	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	41	0	0	54	10	18.5	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.756646217	0.756646217	1	0.090502293	0.090502293	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.91E-13	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	64596520	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	35	12	34.3	56	11	19.6	51	15	29.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	1.769195426	0.884597713	2	0.801635992	0.801635992	1	1.156855397	1.156855397	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	1.83E-19	1	5.91E-15	1	8.22E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	64663263	G	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	55	0	0	57	8	14	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.572597137	0.572597137	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	5.19E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	64916669	A	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	54	11	20.4	56	5	8.9	62	12	19.4	369	0	0	104	20	19.2	71	0	0	93	14	15.1	TRUE	TRUE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	1.052232848	1.052232848	1	0.36400818	0.36400818	1	0.763367167	0.763367167	1	0.990336798	0.990336798	1	0	0	1	0.594167228	0.594167228	1	7	6	1	1	3.84E-15	8.16E-26	0.00000965	1	4.19E-16	6.26E-17	YES	1_1	1_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	8	64981613	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	46	15	32.6	57	1	1.8	62	17	27.4	235	0	0	189	61	32.3	64	3	4.7	88	13	14.8	TRUE	TRUE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	1.681509356	0.840754678	2	0.073619632	0.073619632	1	1.078157751	1.078157751	1	1.666035343	0.833017672	2	0.192229039	0.192229039	1	0.582362581	0.582362581	1	7	6	1	1	1.35E-23	6.01E-91	0.248523156	0.004148608	4.56E-25	1.03E-15	YES	1_1	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	8	65085252	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	60	0	0	42	6	14.3	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.584867076	0.584867076	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	7.02E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	67725186	A	G	SGK3	CCDS6195.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	57	13	22.8	70	22	31.4	96	29	30.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	1.176024948	1.176024948	1	1.284253579	1.284253579	1	1.188334455	1.188334455	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	8	NA	1	1	2.44E-18	1	1.63E-33	1	4.14E-43	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	68744461	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	46	0	0	55	9	16.4	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.670756646	0.670756646	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.01E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	68749119	G	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	45	6	13.3	52	14	26.9	56	16	28.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.686014553	0.686014553	1	1.100204499	1.100204499	1	1.125376338	1.125376338	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	8	NA	1	1	0.000000108	1	9.04E-21	1	5.26E-24	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	71599819	G	T	XKR9	CCDS34905.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	41	0	0	53	7	13.2	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.539877301	0.539877301	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	9.85E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	71812671	A	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	39	9	23.1	48	1	2.1	59	5	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	1.19149896	1.19149896	1	0.085889571	0.085889571	1	0.334464996	0.92024092	0.363453731	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	3.62E-13	1	0.213845552	1	0.0000125	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	73601844	A	C	KCNB2	CCDS6209.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	53	8	15.1	48	0	0	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.778858628	0.778858628	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	2.83E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	73882682	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	57	0	0	52	13	25	56	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	1.022494888	1.022494888	1	0.070827881	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	6.47E-19	1	0.244746891	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	74306210	C	G	-	-	-	-	-	-	47	0	0	63	0	0	68	14	20.6	71	2	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.842535787	0.842535787	1	0.110176704	0.303138185	0.363453731	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	5.84E-19	1	0.04950591	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	74661125	C	T	STAU2	CCDS6214.1	r.?	-	-	upstream	17	0	0	23	3	13	25	2	8	23	2	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.670540541	0.670540541	1	0.327198364	0.327198364	1	0.34233476	0.34233476	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	7	NA	1	1	0.000205387	1	0.006948068	1	0.00589844	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	77536188	C	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	50	10	20	60	0	0	61	4	6.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	1.031600832	1.031600832	1	0	0	1	0.259702232	0.714540008	0.363453731	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	7	NA	1	1	8.36E-14	1	1	1	0.000259828	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	77593345	T	C	ZFHX4	CCDS47878.1	r.?	-	-	upstream	33	0	0	52	9	17.3	46	0	0	49	7	14.3	131	0	0	58	15	25.9	72	5	6.9	76	15	19.7	TRUE	TRUE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.892334719	0.892334719	1	0	0	1	0.562688169	0.562688169	1	1.335923077	1.335923077	1	0.282208589	0.282208589	1	0.775171814	0.775171814	1	7	6	1	1	5.92E-12	7.42E-22	1	0.0000331	5.58E-09	6.51E-20	YES	1_1	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	8	78389458	G	C	-	-	-	-	-	-	41	0	0	53	0	0	59	13	22	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.899795501	0.899795501	1	0.078697646	0.078697646	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	3.99E-18	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	78690046	C	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	48	0	0	51	7	13.7	56	0	0	59	0	0	49	0	0	25	6	24	35	0	0	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.560327198	0.560327198	1	0	0	1	0	0	1	0.981595092	0.981595092	1	0	NA	0	2	NA	1	1	1	1	7.46E-09	2.55E-09	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	8	79046648	C	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	52	11	21.2	62	0	0	69	1	1.4	252	0	0	223	37	16.6	89	0	0	163	0	0	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	1.093496881	1.093496881	1	0	0	1	0.055088352	0.055088352	1	0.85622869	0.85622869	1	0	NA	0	0	NA	0	6	NA	1	1	2.44E-15	6.95E-44	1	1	0.292392265	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	8	79653373	C	A	IL7	CCDS6224.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	63	12	19	55	0	0	55	8	14.5	292	0	0	193	41	21.2	75	4	5.3	126	14	11.1	TRUE	TRUE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.98002079	0.98002079	1	0	0	1	0.570557934	0.570557934	1	1.093496881	1.093496881	1	0.216768916	0.216768916	1	0.436771936	1.201726378	0.363453731	7	6	1	1	5.15E-16	3.38E-53	1	0.000572493	3.86E-10	4.98E-15	YES	1_1	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	8	79925922	G	A	-	-	-	-	-	-	52	0	0	43	0	0	62	10	16.1	59	5	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.658486708	0.658486708	1	0.334464996	0.92024092	0.363453731	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	8.29E-13	1	0.0000125	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	79987216	C	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	48	0	0	65	10	15.4	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.629856851	0.629856851	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.36E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	80058821	G	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	49	0	0	43	7	16.3	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.666666667	0.666666667	1	0.279376643	0.768671827	0.363453731	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	2.15E-09	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	80106033	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	43	10	23.3	52	3	5.8	53	15	28.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	1.201814969	1.201814969	1	0.237218814	0.237218814	1	1.113571692	1.113571692	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.61E-14	1	0.002300591	1	1.60E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	80130148	G	A	-	-	-	-	-	-	49	0	0	62	0	0	64	10	15.6	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.63803681	0.63803681	1	0.098372058	0.098372058	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.16E-12	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	80237134	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	45	0	0	38	8	21.1	53	3	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.862985685	0.862985685	1	0.224288291	0.617102735	0.363453731	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	1.67E-11	1	0.002429596	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	80892314	G	A	MRPS28	CCDS6226.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	40	18	45	51	16	31.4	41	13	31.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	2.321101871	1.160550936	2	1.284253579	1.284253579	1	1.24735769	1.24735769	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	3.90E-31	1	9.28E-25	1	1.89E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	83269588	A	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	48	0	0	55	1	1.8	60	9	15	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.073619632	NA	0	0.590232345	0.590232345	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.240951649	1	2.29E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	84423350	G	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	55	18	32.7	49	12	24.5	58	19	32.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	1.68666736	0.84333368	2	1.00204499	1.00204499	1	1.290641395	1.290641395	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	4.61E-28	1	1.90E-17	1	1.50E-29	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	84602297	A	G	-	-	-	-	-	-	41	0	0	40	0	0	49	16	32.7	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	1.337423313	1.337423313	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	4.37E-25	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	85007405	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	52	8	15.4	47	0	0	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.79433264	0.79433264	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	2.42E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	85336369	A	C	-	-	-	-	-	-	11	0	0	19	4	21.1	17	6	35.3	21	3	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	1.088338877	1.088338877	1	1.443762781	1.443762781	1	0.562688169	0.562688169	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	8	NA	1	1	0.00000228	1	1.84E-10	1	0.000155401	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	85670268	T	C	RALYL	ENST00000399361	r.?	-	-	intronic	45	0	0	54	0	0	45	9	20	42	0	0	242	2	0.8	183	0	0	64	8	12.5	103	0	0	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.81799591	0.81799591	1	0	0	1	0	0	1	0.511247444	0.511247444	1	0	NA	0	2	NA	1	0.341173509	1	1	1.47E-12	1.35E-09	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	8	88028822	G	C	-	-	-	-	-	-	37	0	0	47	4	8.5	52	2	3.8	66	8	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.438430353	0.438430353	1	0.155419223	0.155419223	1	0.476120759	1.309990015	0.363453731	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	7	NA	1	1	0.0000939	1	0.028101652	1	1.73E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	88045167	G	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	63	14	22.2	47	0	0	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	1.145076923	1.145076923	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.81E-19	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	88378141	C	T	CNBD1	ENST00000319712	r.?	-	-	intronic	47	0	0	43	11	25.6	55	1	1.8	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	1.320449064	1.320449064	1	0.073619632	NA	0	0.385618466	1.060983649	0.363453731	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	2.42E-16	1	0.240951649	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	88463891	A	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	42	0	0	49	13	26.5	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	1.083844581	1.083844581	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	2.71E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	88697546	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	52	0	0	45	5	11.1	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	0.45398773	0.45398773	1	0	0	1	NA	NA	1	0	NA	0	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	0.00000323	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	90494812	A	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	46	12	26.1	50	0	0	66	0	0	372	0	0	208	25	12	80	0	0	139	0	0	FALSE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	1.346239085	1.346239085	1	0	NA	0	0	0	1	0.618960499	0.618960499	1	0	NA	0	0	NA	0	NA	NA	1	1	8.12E-18	1.58E-26	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	8	92019296	G	A	TMEM55A	CCDS6252.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	56	11	19.6	53	1	1.9	62	10	16.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	1.010968815	1.010968815	1	0.077709611	0.077709611	1	0.633516051	0.633516051	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	7	NA	1	1	5.91E-15	1	0.233303855	1	8.29E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	92148045	C	G	LRRC69	CCDS47890.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	52	0	0	35	9	25.7	53	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0	0	1	1.051124744	1.051124744	1	0.149525527	0.411401823	0.363453731	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	1.23E-13	1	0.029108399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	92458984	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	40	6	15	49	14	28.6	56	12	21.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2.363453731	2	1	1	1	1	1	1	1	0.636546269	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.363453731	0.773700624	0.773700624	1	1.169734151	1.169734151	1	0.842064813	0.842064813	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	8	NA	1	1	5.18E-08	1	3.50E-21	1	1.11E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	93976829	C	G	C8orf83	ENST00000378861	r.?	-	-	intronic	29	0	0	51	0	0	40	9	22.5	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.920245399	0.920245399	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.64E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	94484044	A	T	AC011118.2	ENST00000501400	r.?	-	-	intronic	53	0	0	66	9	13.6	59	0	0	68	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.837488565	0.837488565	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	5.59E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	94535066	C	T	AC011118.2	ENST00000501400	r.?	-	-	intronic	48	0	0	69	9	13	62	0	0	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.800540541	0.800540541	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	8.45E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	94591305	C	T	AC011118.2	ENST00000501400	r.?	-	-	intronic	38	0	0	64	7	10.9	53	0	0	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.671222453	0.671222453	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	3.78E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	95508723	C	A	KIAA1429	CCDS34923.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	65	9	13.8	53	0	0	75	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.849804574	0.849804574	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	4.85E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	97040614	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	59	0	0	51	11	21.6	64	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.883435583	0.883435583	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.94E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	97273997	G	A	PTDSS1	CCDS6271.1	r.?	-	-	upstream	49	0	0	79	11	13.9	68	0	0	79	2	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.855962578	0.855962578	1	0	NA	0	0.139285714	0.139285714	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	3.23E-13	1	1	1	0.059811146	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	98666089	T	G	MTDH	CCDS6274.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	64	22	34.4	49	16	32.7	67	18	26.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.11835343	1.059176715	2	1.337423313	1.337423313	1	1.498714286	0.749357143	2	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.57E-34	1	4.37E-25	1	2.83E-26	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	98872674	A	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	74	17	23	56	0	0	73	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.416340956	1.416340956	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.34E-23	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	99201505	C	G	NIPAL2	CCDS6278.1	r.?	-	-	downstream	30	0	0	49	4	8.2	49	0	0	65	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.504956341	0.504956341	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.000110643	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	99833681	G	A	ENSG00000104375	CCDS47900.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	66	25	37.9	54	17	31.5	75	27	36	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.333883576	1.166941788	2	1.288343558	1.288343558	1	2.005714286	1.002857143	2	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.57E-40	1	3.02E-26	1	1.08E-42	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	100288881	G	T	VPS13B	CCDS6280.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	70	0	0	43	0	0	64	6	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	NA	0	0.523714286	0.523714286	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000914	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	102358999	A	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	72	23	31.9	63	16	25.4	82	36	43.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.964403326	0.982201663	2	1.038854806	1.038854806	1	2.445857143	1.222928571	2	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.67E-35	1	4.48E-23	1	2.70E-60	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	103284449	G	T	UBR5	CCDS34933.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	60	8	13.3	53	0	0	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.819014553	0.819014553	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	7.93E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	103389541	C	T	UBR5	CCDS34933.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	83	11	13.3	61	0	0	75	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.819014553	0.819014553	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	5.66E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	103452615	C	T	-	-	-	-	-	-	50	0	0	71	8	11.3	57	0	0	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.69585447	0.69585447	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	3.14E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	105175705	A	G	RIMS2	ENST00000507740	r.?	-	-	intronic	40	0	0	68	11	16.2	69	0	0	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.997596674	0.997596674	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	5.76E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	105355256	G	A	TM7SF4	CCDS6301.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	58	10	17.2	56	0	0	65	6	9.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.059176715	1.059176715	1	0	NA	0	0.512571429	0.512571429	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	4.10E-13	1	1	1	0.000001	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	105399666	C	T	DPYS	CCDS6302.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	75	20	26.7	68	2	2.9	55	7	12.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.64418711	0.822093555	2	0.118609407	0.118609407	1	0.707571429	0.707571429	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.89E-29	1	0.045825786	1	1.28E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	106112006	T	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	66	9	13.6	58	0	0	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.837488565	0.837488565	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	5.59E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	106778072	C	T	ZFPM2	CCDS47908.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	61	10	16.4	56	0	0	63	20	31.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.009912682	1.009912682	1	0	NA	0	1.766142857	0.883071429	2	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	6.98E-13	1	1	1	1.05E-30	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	106866647	A	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	58	25	43.1	62	13	21	63	19	30.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.654099792	1.327049896	2	0.858895706	0.858895706	1	1.682571429	0.841285714	2	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.44E-42	1	8.08E-18	1	9.48E-29	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	106928728	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	79	13	16.5	58	0	0	72	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.016070686	1.016070686	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	2.37E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	107443403	G	T	OXR1	CCDS47909.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	73	0	0	50	14	28	64	4	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.145194274	1.145194274	1	0.345428571	0.345428571	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	4.84E-21	1	0.000312605	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	107733726	C	T	OXR1	CCDS47909.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	62	0	0	54	14	25.9	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.059304703	1.059304703	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.64E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	108810485	A	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	68	13	19.1	62	0	0	72	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.176178794	1.176178794	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	2.96E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	108840407	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	62	17	27.4	61	16	26.2	61	19	31.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.687293139	0.84364657	2	1.071574642	1.071574642	1	1.732714286	0.866357143	2	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.56E-25	1	2.50E-23	1	4.64E-29	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	108885926	G	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	79	1	1.3	47	0	0	66	5	7.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.080054054	0.080054054	1	0	NA	0	0.423428571	0.423428571	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.326987115	1	1	1	0.0000217	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	109401804	G	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	76	0	0	66	7	10.6	60	0	0	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.433537832	0.433537832	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000047	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	110221653	G	A	-	-	-	-	-	-	52	0	0	60	20	33.3	48	16	33.3	59	20	33.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.050615385	1.025307692	2	1.36196319	1.36196319	1	1.888714286	0.944357143	2	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.30E-31	1	2.96E-25	1	2.21E-31	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	110518964	A	G	PKHD1L1	CCDS47911.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	49	11	22.4	59	0	0	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.379392931	1.379392931	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.19E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	110908961	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	49	0	0	47	11	23.4	73	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.957055215	0.957055215	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.21E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	110952621	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	53	5	9.4	44	0	0	68	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.578852391	0.578852391	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.00000734	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	111007689	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	59	0	0	46	8	17.4	68	2	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.711656442	0.711656442	1	0.161571429	0.161571429	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.61E-11	1	0.045825786	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	111382631	G	A	-	-	-	-	-	-	57	0	0	70	0	0	54	9	16.7	80	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.683026585	0.683026585	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.48E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	113870827	G	C	CSMD3	CCDS6315.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	69	22	31.9	63	2	3.2	72	16	22.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.964403326	0.982201663	2	0.130879346	0.130879346	1	1.236857143	1.236857143	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.12E-33	1	0.03993132	1	4.82E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	114258058	C	A	CSMD3	CCDS6315.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	70	0	0	56	14	25	51	6	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.022494888	1.022494888	1	0.657428571	0.657428571	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	2.91E-20	1	0.000000232	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	115218201	C	T	-	-	-	-	-	-	48	0	0	72	12	16.7	62	2	3.2	80	8	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.028386694	1.028386694	1	0.130879346	0.130879346	1	0.557142857	0.557142857	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.84E-15	1	0.038789653	1	8.22E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	116197234	A	G	-	-	-	-	-	-	27	0	0	51	11	21.6	65	0	0	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.330128898	1.330128898	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.94E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	116760716	T	C	TRPS1	ENST00000422939	r.?	-	-	intronic	47	0	0	57	7	12.3	65	2	3.1	70	9	12.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.757434511	0.757434511	1	0.126789366	0.126789366	1	0.718714286	0.718714286	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.66E-08	1	0.042252341	1	9.65E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	117300184	G	A	AF130342.1	ENST00000505156	r.?	-	-	intronic	30	0	0	62	24	38.7	53	12	22.6	51	21	41.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.383147609	1.191573805	2	0.924335378	0.924335378	1	2.295428571	1.147714286	2	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.81E-39	1	5.39E-17	1	4.73E-35	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	118714352	A	C	-	-	-	-	-	-	44	0	0	65	10	15.4	54	0	0	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.94833264	0.94833264	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.36E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	120192030	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	61	12	19.7	62	3	4.8	54	8	14.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.213126819	1.213126819	1	0.196319018	0.196319018	1	0.824571429	0.824571429	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.39E-16	1	0.003793816	1	3.31E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	120533335	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	54	7	13	52	1	1.9	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.800540541	0.800540541	1	0.077709611	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.13E-08	1	0.229451111	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	120690434	A	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	57	0	0	59	12	20.3	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.830265849	0.830265849	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.20E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	121250415	G	T	COL14A1	CCDS34938.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	70	10	14.3	51	0	0	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4	2	4	2	1	2	2	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.880594595	0.880594595	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	2.95E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	122780900	A	G	-	-	-	-	-	-	55	0	0	68	10	14.7	70	1	1.4	62	7	11.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.905226611	0.905226611	1	0.099259714	0.099259714	1	0.629571429	0.629571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	2.18E-12	1	0.295930304	1	3.02E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	122847265	G	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	76	0	0	66	31	47	65	5	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	3.332290389	1.110763463	3	0.429	0.429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	2.52E-53	1	0.0000201	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	124540769	G	C	FBXO32	CCDS6345.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	82	0	0	78	0	0	55	7	12.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.707571429	0.707571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	1	NA	1	1	1	1	1	1	1.28E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	124660040	C	T	KLHL38	CCDS43766.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	58	0	0	59	22	37.3	53	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	2.644562372	0.881520791	3	0.105857143	0.105857143	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.79E-35	1	0.233303855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	125424543	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	57	7	12.3	60	1	1.7	65	9	13.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.757434511	0.757434511	1	0.120529652	0.120529652	1	0.768857143	0.768857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.66E-08	1	0.259739042	1	4.85E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	125861084	G	A	ENSG00000235517	ENST00000422573	r.?	-	-	intronic	39	0	0	74	18	24.3	67	13	19.4	59	16	27.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.49639501	0.748197505	2	1.375456033	1.375456033	1	1.509857143	0.754928571	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	2.13E-25	1	2.41E-17	1	1.37E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	126737992	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	75	0	0	45	8	17.8	76	1	1.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.26201636	1.26201636	1	0.072428571	0.072428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	7.14E-11	1	0.316790122	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	128462657	A	G	AC018714.1	ENST00000502082	r.?	-	-	intronic	49	0	0	57	0	0	71	13	18.3	77	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.297466258	1.297466258	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	5.42E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	129051414	C	T	PVT1	CCDS3617.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	59	0	0	63	9	14.3	71	2	2.8	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.013867076	1.013867076	1	0.156	0.156	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	3.62E-11	1	0.04950591	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	129144629	T	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	63	0	0	62	15	24.2	53	6	11.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.715775051	0.857887526	2	0.629571429	0.629571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	2.28E-21	1	0.000000293	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	129156598	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	56	0	0	52	7	13.5	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.957147239	0.957147239	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	8.58E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	129168054	C	G	-	-	-	-	-	-	45	0	0	61	17	27.9	57	10	17.5	50	15	30	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.71808316	0.85904158	2	1.240746421	1.240746421	1	1.671428571	0.835714286	2	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	3.33E-25	1	3.40E-13	1	5.83E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	130138922	A	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	60	12	20	70	1	1.4	64	6	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.231600832	1.231600832	1	0.099259714	0.099259714	1	0.523714286	0.523714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	2.74E-16	1	0.295930304	1	0.000000914	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	131118547	G	A	ASAP1	CCDS6362.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	79	0	0	77	10	13	78	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.921697342	0.921697342	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	7.90E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	131655873	C	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	69	1	1.4	84	12	14.3	72	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.086212058	0.086212058	1	1.013867076	1.013867076	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	0.292392265	1	1.98E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	131927697	G	A	ADCY8	CCDS6363.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	57	0	0	62	25	40.3	58	1	1.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	2.857261759	0.952420586	3	0.094714286	0.094714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	3.68E-41	1	0.252280541	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	132240287	A	G	-	-	-	-	-	-	32	0	0	59	0	0	61	8	13.1	52	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.928787321	0.928787321	1	0.105857143	0.105857143	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	9.09E-10	1	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	132663097	T	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	60	0	0	69	8	11.6	66	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.822437628	0.822437628	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	2.49E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	133480131	G	A	KCNQ3	CCDS34943.1	r.?	-	-	intronic	49	0	0	50	9	18	41	0	0	65	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.108440748	1.108440748	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	6	NA	1	1	4.07E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	133936219	G	A	TG	CCDS34944.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	64	10	15.6	73	0	0	59	2	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.960648649	0.960648649	1	0	0	1	0.189428571	0.189428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.16E-12	1	1	1	0.035441897	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	134218150	A	G	WISP1	CCDS6371.1	r.?	-	-	intronic	54	0	0	85	0	0	87	31	35.6	73	1	1.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	2.52403272	0.84134424	3	0.078	0.078	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.28E-48	1	0.306438632	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	135188530	C	T	-	-	-	-	-	-	54	0	0	88	0	0	81	11	13.6	63	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.964237219	0.964237219	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	4.29E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	136660048	G	A	KHDRBS3	CCDS6374.1	r.?	-	-	downstream	46	0	0	71	19	26.8	76	3	3.9	61	17	27.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.650345114	0.825172557	2	0.276509202	0.276509202	1	1.554428571	0.777214286	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.29E-27	1	0.006696581	1	3.33E-25	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	136732626	G	A	-	-	-	-	-	-	46	0	0	71	0	0	64	11	17.2	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.219476483	1.219476483	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	2.85E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	136752135	C	G	-	-	-	-	-	-	24	0	0	54	1	1.9	54	1	1.9	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.117002079	0.117002079	1	0.134709611	0.134709611	1	0.507	0.507	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	1	NA	1	1	0.237137336	1	0.237137336	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	137435452	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	61	7	11.5	72	1	1.4	42	4	9.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.708170478	0.708170478	1	0.099259714	0.099259714	1	0.529285714	0.529285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	2.69E-08	1	0.302953399	1	0.0000601	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	137864135	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	67	0	0	74	12	16.2	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.148576687	1.148576687	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	4.02E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	138155335	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	71	9	12.7	72	0	0	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.782066528	0.782066528	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	6	NA	1	1	1.10E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	138463447	C	G	-	-	-	-	-	-	44	0	0	59	0	0	57	10	17.5	72	1	1.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.240746421	1.240746421	1	0.078	0.078	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	3.40E-13	1	0.302953399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	138534683	T	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	49	6	12.2	76	0	0	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.751276507	0.751276507	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000000182	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	138746603	A	G	-	-	-	-	-	-	52	0	0	64	7	10.9	67	1	1.5	50	0	0	438	0	0	208	18	8.7	102	0	0	121	0	0	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.671222453	0.671222453	1	0.106349693	0.106349693	1	0	0	1	0.535746362	0.535746362	1	0	0	1	0	NA	0	6	NA	1	1	3.78E-08	6.03E-17	0.285262761	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	8	138968199	G	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	64	0	0	76	0	0	68	7	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.573857143	0.573857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	139606250	C	A	COL22A1	CCDS6376.1	r.5062+10g>u	c.4615+10G>T	p.?	splice region	35	0	0	52	0	0	67	0	0	60	7	11.7	148	1	0.7	220	0	0	200	2	1	152	14	9.2	TRUE	TRUE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.651857143	0.651857143	1	0	0	1	0.070899796	0.070899796	1	0.512571429	0.512571429	1	1	2	1	0.523770877	1	1	1	0.264240347	2.39E-08	6.97E-14	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	8	139917516	G	T	COL22A1	CCDS6376.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	52	7	13.5	70	0	0	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831330561	0.831330561	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	6	NA	1	1	8.58E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	140104883	G	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	62	20	32.3	67	1	1.5	59	12	20.3	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.989035343	0.994517672	2	0.106349693	0.106349693	1	1.131	1.131	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	7.19E-31	1	0.285262761	1	2.20E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	140267027	G	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	55	0	0	65	26	40	59	2	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	2.83599182	0.945330607	3	0.189428571	0.189428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	1.24E-42	1	0.035441897	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	140348995	G	A	-	-	-	-	-	-	48	0	0	62	11	17.7	71	2	2.8	50	4	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.089966736	1.089966736	1	0.198519427	0.198519427	1	0.445714286	0.445714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.96E-14	1	0.04950591	1	0.000119787	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	140994128	C	T	TRAPPC9	CCDS34946.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	70	0	0	87	16	18.4	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.304556237	1.304556237	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.29E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	141228026	G	T	TRAPPC9	CCDS34946.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	75	0	0	76	15	19.7	73	3	4.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.396725971	1.396725971	1	0.228428571	0.228428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	6.51E-20	1	0.005990531	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	142540702	A	C	-	-	-	-	-	-	46	0	0	52	0	0	73	14	19.2	66	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.361276074	1.361276074	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.71E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	142597493	C	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	68	2	2.9	57	0	0	74	7	9.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.178582121	0.178582121	1	0	0	1	0.529285714	0.529285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	0.045825786	1	1	1	0.000000105	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	143033005	C	G	-	-	-	-	-	-	42	0	0	60	8	13.3	56	0	0	67	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.819014553	0.819014553	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	7.93E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	143127362	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	66	8	12.1	75	2	2.7	69	5	7.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.745118503	0.745118503	1	0.191429448	0.191429448	1	0.401142857	0.401142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.73E-09	1	0.054571821	1	0.0000269	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	143231124	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	74	12	16.2	81	0	0	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.997596674	0.997596674	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.02E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	144325654	T	A	ZFP41	CCDS6397.1	r.?	-	-	upstream	23	0	0	28	5	17.9	36	0	0	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.102282744	1.102282744	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000000279	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	145105816	G	T	SPATC1	CCDS6413.2	r.?	-	-	downstream	48	0	0	64	0	0	75	15	20	65	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.41799591	1.41799591	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.25E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	145502422	C	T	BOP1	CCDS6418.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	70	9	12.9	80	1	1.2	62	2	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.794382536	0.794382536	1	0.085079755	0.085079755	1	0.178285714	0.178285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.65E-11	1	0.33035218	1	0.038789653	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	8	146181156	T	C	ZNF16	CCDS6437.1	r.?	-	-	upstream	24	0	0	56	0	0	54	8	14.8	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	5	4	2	3	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.049316973	1.049316973	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.31E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	1115424	T	C	-	-	-	-	-	-	47	0	0	55	11	20	46	0	0	40	4	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0.831600832	0.831600832	1	0	0	1	0.312258302	0.566553177	0.551154444	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	4.77E-15	1	1	1	0.0000495	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	3015543	A	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	42	0	0	65	0	0	49	9	18.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0	0	1	0	0	1	0.574555275	1.042457847	0.551154444	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	1	NA	1	1	1	1	1	1	3.35E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	3300331	G	T	RFX3	CCDS6449.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	41	9	22	50	4	8	33	10	30.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0.914760915	0.914760915	1	0.327198364	0.327198364	1	0.946142654	0.946142654	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	5.92E-13	1	0.000119787	1	8.14E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	4224360	C	G	GLIS3	CCDS43784.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	50	0	0	69	20	29	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0	0	1	1.18609407	1.18609407	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	8.73E-30	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	4528868	G	A	SLC1A1	CCDS6452.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	38	0	0	59	12	20.3	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0	0	1	0.830265849	0.830265849	1	0.087432324	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	2.20E-16	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	6262595	G	A	IL33	CCDS6468.1	r.?	-	-	downstream	12	0	0	29	12	41.4	21	3	14.3	15	5	33.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	1.721413721	1.721413721	1	0.584867076	0.584867076	1	1.039820144	1.039820144	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	1.17E-20	1	0.000155401	1	0.000000009	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	7242355	T	C	-	-	-	-	-	-	53	0	0	44	6	13.6	56	0	0	38	7	18.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0.565488565	0.565488565	1	0	0	1	0.574555275	0.574555275	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	9.37E-08	1	1	1	8.61E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	7680127	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	45	12	26.7	66	0	0	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	1.11018711	1.11018711	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	6.03E-18	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	7916141	G	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	51	0	0	47	9	19.1	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0	0	1	0.781186094	0.781186094	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	2.24E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	8220451	C	A	-	-	-	-	-	-	54	0	0	44	1	2.3	52	9	17.3	52	7	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0.095634096	0.095634096	1	0.707566462	0.707566462	1	0.421548707	0.76484679	0.551154444	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	0.197923942	1	5.92E-12	1	8.58E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	9673891	G	A	PTPRD	CCDS43786.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	55	5	9.1	48	0	0	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0.378378378	0.378378378	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000883	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	10361388	T	A	PTPRD	CCDS43786.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	44	14	31.8	45	3	6.7	37	9	24.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	1.322245322	1.322245322	1	0.27402863	0.27402863	1	0.758787673	0.758787673	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	6.10E-22	1	0.001516071	1	2.14E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	11668470	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	50	9	18	50	0	0	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0.748440748	0.748440748	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.07E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	11986437	A	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	49	8	16.3	56	0	0	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0.677754678	0.677754678	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.47E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	12536371	A	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	39	10	25.6	56	13	23.2	51	13	25.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	1.064449064	1.064449064	1	0.948875256	0.948875256	1	0.796258669	0.796258669	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	5.44E-15	1	1.89E-18	1	4.87E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	13415516	C	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	42	10	23.8	52	0	0	43	8	18.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0.98960499	0.98960499	1	0	0	1	0.580800441	1.05378891	0.551154444	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.24E-14	1	1	1	4.85E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	14075119	C	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	44	0	0	51	13	25.5	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0	0	1	1.042944785	1.042944785	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	4.87E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	14099286	A	G	NFIB	CCDS6474.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	41	0	0	56	9	16.1	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0	0	1	0.658486708	0.658486708	1	0.149883985	0.149883985	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.20E-11	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	15023930	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	42	12	28.6	37	8	21.6	38	6	15.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	1.189189189	1.189189189	1	0.883435583	0.883435583	1	0.493368116	0.89515402	0.551154444	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	2.35E-18	1	1.33E-11	1	3.76E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	15149012	G	A	-	-	-	-	-	-	53	0	0	45	0	0	47	0	0	42	5	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0	0	1	0	0	1	0.371587379	0.674198281	0.551154444	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	15518041	T	A	-	-	-	-	-	-	50	1	2	46	18	39.1	43	1	2.3	48	9	18.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	1.625779626	1.625779626	1	0.09406953	0.09406953	1	0.587045607	1.065119974	0.551154444	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	0.221687443	1	9.41E-30	1	0.193893409	1	2.75E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	15604194	G	T	C9orf93	CCDS6481.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	47	11	23.4	50	2	4	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0.972972973	0.972972973	1	0.163599182	0.163599182	1	0.29040022	0.526894455	0.551154444	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	7.21E-16	1	0.026131524	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	21092611	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	45	11	24.4	48	10	20.8	52	13	25	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	1.014553015	1.014553015	1	0.850715746	0.850715746	1	0.780645754	0.780645754	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	4.24E-16	1	5.37E-14	1	6.47E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	21567137	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	36	9	25	53	15	28.3	47	6	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	1.03950104	1.03950104	1	1.157464213	1.157464213	1	0.399690626	0.725188067	0.551154444	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	1.63E-13	1	1.60E-22	1	0.000000141	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	21753091	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	39	8	20.5	64	3	4.7	43	7	16.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0.852390852	0.852390852	1	0.192229039	0.192229039	1	0.508981032	0.923481679	0.551154444	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	2.09E-11	1	0.004148608	1	2.15E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	22786051	A	G	-	-	-	-	-	-	41	0	0	43	8	18.6	37	0	0	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0.773388773	0.773388773	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.85E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	23179613	G	T	-	-	-	-	-	-	32	1	3.1	48	11	22.9	47	0	0	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0.952182952	0.952182952	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0.14819814	1	9.31E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	24102962	G	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	60	0	0	52	14	26.9	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0	0	1	1.100204499	1.100204499	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	9.04E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	24256510	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	43	10	23.3	52	2	3.8	32	7	21.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0.968814969	0.968814969	1	0.155419223	0.155419223	1	0.68384568	0.68384568	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.61E-14	1	0.028101652	1	2.36E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	25495026	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	38	0	0	52	11	21.2	31	3	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0	0	1	0.867075665	0.867075665	1	0.302890552	0.549556582	0.551154444	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	2.44E-15	1	0.000505952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	27570615	G	C	C9orf72	CCDS6522.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	45	13	28.9	33	8	24.2	44	16	36.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	1.201663202	1.201663202	1	0.989775051	0.989775051	1	1.136620218	1.136620218	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	7.68E-20	1	4.85E-12	1	5.57E-26	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	27610527	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	46	10	21.7	56	0	0	43	8	18.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0.902286902	0.902286902	1	0	0	1	0.580800441	1.05378891	0.551154444	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	3.38E-14	1	1	1	4.85E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	27881966	C	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	37	0	0	61	11	18	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0	0	1	0.736196319	0.736196319	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.62E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	28312296	A	T	LINGO2	CCDS6524.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	39	0	0	53	12	22.6	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0	0	1	0.924335378	0.924335378	1	0.074941992	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	5.39E-17	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	28560640	G	T	LINGO2	CCDS6524.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	53	0	0	65	0	0	42	6	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0	0	1	0	0	1	0.446529371	0.810171044	0.551154444	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	1	NA	1	1	1	1	1	1	7.02E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	28666141	C	A	LINGO2	CCDS6524.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	53	8	15.1	37	0	0	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0.627858628	0.627858628	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	2.83E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	29418274	G	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	36	0	0	40	0	0	41	4	9.8	432	0	0	237	1	0.4	95	0	0	104	3	2.9	TRUE	TRUE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0	0	1	0	0	1	0.306013136	0.555222114	0.551154444	0.016632017	0.016632017	1	0	0	1	0.090554907	0.090554907	1	1	2	1	1	1	0.695161275	1	1	0.0000546	0.015651643	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	9	30226636	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	41	0	0	48	9	18.8	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0	0	1	0.768916155	0.768916155	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	2.75E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	34079949	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	55	0	0	58	18	31	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0	0	1	1.267893661	1.267893661	1	0.071819409	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.42E-27	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	38674966	C	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	71	0	0	58	17	29.3	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0	0	1	1.198364008	1.198364008	1	0.078064575	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.24E-25	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	39113067	T	C	CNTNAP3	CCDS6616.1	r.?	-	-	intronic	56	0	0	55	10	18.2	47	1	2.1	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0.756756757	0.756756757	1	0.085889571	0.085889571	1	0.149883985	0.149883985	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	2.33E-13	1	0.209895027	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	39113101	T	C	CNTNAP3	CCDS6616.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	50	8	16	54	1	1.9	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.551154444	1	1	1	1	1	0	1	1	0.448845556	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.551154444	0.665280665	0.665280665	1	0.077709611	0.077709611	1	0.153006568	0.277611057	0.551154444	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.74E-10	1	0.237137336	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	39760885	T	C	-	-	-	-	-	-	7	0	0	10	6	60	11	4	36.4	3	1	33.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	NA	1	1	NA	1	1	NA	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.494802495	2.494802495	1	1.488752556	1.488752556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	3.23E-12	1	0.000000201	1	0.014925125	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	40158358	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	49	0	0	43	0	0	49	6	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.435714286	0.435714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000182	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	68281718	C	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	40	0	0	42	0	0	40	6	15	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.535714286	0.535714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	5.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	68668511	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	30	7	23.3	45	1	2.2	31	5	16.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.968814969	0.968814969	1	0.08997955	0.08997955	1	0.575	0.575	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.44E-10	1	0.201934322	1	0.000000476	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	70987858	G	A	PGM5	CCDS6622.2	r.?	-	-	intronic	32	0	0	47	0	0	53	13	24.5	44	6	13.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.00204499	1.00204499	1	0.485714286	0.485714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	8.53E-19	1	9.37E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	71457049	G	T	PIP5K1B	CCDS6624.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	46	0	0	57	16	28.1	53	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.149284254	1.149284254	1	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.28E-24	1	0.233303855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	71983714	A	T	FAM189A2	CCDS6629.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	50	11	22	59	11	18.6	57	17	29.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914760915	0.914760915	1	0.760736196	0.760736196	1	1.064285714	1.064285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.52E-15	1	1.10E-14	1	8.82E-26	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	72579715	T	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	58	0	0	49	11	22.4	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.916155419	0.916155419	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.19E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	74446204	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	43	0	0	53	13	24.5	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.00204499	1.00204499	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.53E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	74508948	G	A	FAM108B1	CCDS35043.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	30	0	0	35	12	34.3	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.402862986	1.402862986	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.83E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	75906639	G	A	AL449083.1	ENST00000408183	r.?	-	-	upstream	28	0	0	47	14	29.8	38	3	7.9	45	8	17.8	3	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.239085239	1.239085239	1	0.323108384	0.323108384	1	0.635714286	0.635714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.79E-21	1	0.000925091	1	7.14E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	76028061	T	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	54	0	0	47	11	23.4	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.957055215	0.957055215	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.21E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	76878825	C	A	-	-	-	-	-	-	49	0	0	38	10	26.3	59	2	3.4	47	5	10.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.093555094	1.093555094	1	0.139059305	0.139059305	1	0.378571429	0.378571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.06E-15	1	0.035441897	1	0.00000402	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	78765973	C	T	PCSK5	CCDS6652.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	48	11	22.9	52	0	0	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.952182952	0.952182952	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	9.31E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	80131964	G	A	GNA14	CCDS6657.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	43	13	30.2	42	0	0	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.255717256	1.255717256	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.88E-20	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	80447168	C	T	GNAQ	CCDS6658.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	48	0	0	53	7	13.2	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.539877301	0.539877301	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.85E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	80538953	T	A	GNAQ	CCDS6658.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	46	13	28.3	48	0	0	51	11	21.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.176715177	1.176715177	1	0	0	1	0.771428571	0.771428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.07E-19	1	1	1	1.94E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	80884311	G	A	CEP78	CCDS47984.1	r.?	-	-	downstream	46	0	0	50	11	22	56	0	0	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914760915	0.914760915	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.52E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	81368717	G	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	52	0	0	57	8	14	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.572597137	0.572597137	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.19E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	84139029	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	39	7	17.9	48	15	31.2	40	13	32.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.744282744	0.744282744	1	1.27607362	1.27607362	1	1.160714286	1.160714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.04E-09	1	2.86E-23	1	1.30E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	84814330	T	C	-	-	-	-	-	-	42	0	0	53	11	20.8	54	1	1.9	59	0	0	311	0	0	144	25	17.4	55	0	0	88	2	2.3	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.864864865	0.864864865	1	0.077709611	0.077709611	1	0	0	1	0.723492723	0.723492723	1	0	0	1	0.082142857	0.082142857	1	6	4	1	1	3.07E-15	1.08E-30	0.237137336	1	1	0.072188127	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	9	85721717	C	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	38	8	21.1	47	2	4.3	48	4	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.877338877	0.877338877	1	0.175869121	0.175869121	1	0.296428571	0.296428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.67E-11	1	0.02328732	1	0.000102016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	86535967	G	T	KIF27	CCDS6665.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	54	0	0	62	7	11.3	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.462167689	0.462167689	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.02E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	86729148	A	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	35	0	0	48	0	0	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.396428571	0.396428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	88659345	C	T	GOLM1	CCDS35054.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	27	0	0	40	9	22.5	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	0.920245399	0.920245399	1	0.094417713	0.094417713	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	4.64E-13	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	93250082	C	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	45	21	46.7	41	1	2.4	50	12	24	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	1.474787942	1.474787942	1	0.098159509	0.098159509	1	0.70813285	0.70813285	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.60E-36	1	0.18577148	1	2.49E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	104048248	G	A	ENSG00000148123	CCDS6751.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	38	0	0	47	6	12.8	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	0.523517382	0.523517382	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	0.000000141	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	104102919	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	31	0	0	36	8	22.2	45	6	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	0.90797546	0.90797546	1	0.392423621	1.035077217	0.379124972	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	1.04E-11	1	0.000000108	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	104423952	G	A	GRIN3A	CCDS6758.1	r.?	-	-	intronic	50	0	0	46	0	0	42	13	31	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	1.267893661	1.267893661	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	2.72E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	104824983	T	A	-	-	-	-	-	-	46	0	0	38	0	0	48	9	18.8	40	7	17.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	0.768916155	0.768916155	1	0.51634687	1.361943707	0.379124972	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	2.75E-12	1	1.26E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	106395871	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	36	1	2.8	47	11	23.4	35	4	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0.088424116	0.088424116	1	0.957055215	0.957055215	1	0.336363104	0.887209043	0.379124972	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	0.165106833	1	7.21E-16	1	0.0000289	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	106522896	A	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	43	12	27.9	59	19	32.2	58	22	37.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0.88108316	0.88108316	1	1.316973415	1.316973415	1	1.118259793	1.118259793	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.24E-18	1	2.20E-29	1	1.13E-35	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	108657254	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	35	0	0	44	9	20.5	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	0.838445808	0.838445808	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.18E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	113156778	C	T	SVEP1	CCDS48004.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	31	7	22.6	52	0	0	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0.71370894	0.71370894	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.85E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	113618242	A	G	-	-	-	-	-	-	42	0	0	26	0	0	45	8	17.8	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	0.72801636	0.72801636	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.14E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	114130435	C	T	KIAA0368	CCDS48006.1	r.?	-	-	intronic	49	0	0	28	8	28.6	43	0	0	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0.903189189	0.903189189	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.11E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	114147419	T	C	KIAA0368	CCDS48006.1	r.?	-	-	intronic	42	1	2.4	32	0	0	44	13	29.5	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	1.206543967	1.206543967	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	0.189842622	1	1	1	5.49E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	114353364	G	A	PTGR1	CCDS6779.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	37	0	0	60	12	20	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	0.81799591	0.81799591	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.74E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	114367671	A	G	C9orf29	ENST00000374306	r.?	-	-	intronic	48	0	0	28	0	0	40	4	10	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	0.408997955	0.408997955	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000495	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	115018384	A	C	ROD1	CCDS6784.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	22	0	0	51	12	23.5	27	3	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	0.961145194	0.961145194	1	0.327511443	0.863861437	0.379124972	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	3.24E-17	1	0.000334187	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	115721992	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	30	8	26.7	36	9	25	32	11	34.4	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0.84318711	0.84318711	1	1.022494888	1.022494888	1	1.014990419	1.014990419	1	NA	NA	0	NA	NA	1	0	0	1	8	NA	1	1	2.07E-12	1	1.63E-13	1	5.72E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	118710131	G	A	-	-	-	-	-	-	48	0	0	37	0	0	60	0	0	53	9	17	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	0	0	1	0.501594102	1.32303103	0.379124972	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	7.10E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	119639158	A	T	ASTN2	CCDS48009.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	33	7	21.2	42	0	0	41	8	19.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0.669496881	0.669496881	1	0	0	1	0.575357941	0.575357941	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.98E-10	1	1	1	3.22E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	119837447	C	G	ASTN2	CCDS48009.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	22	0	0	40	10	25	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	1.022494888	1.022494888	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.22E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	120511105	C	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	39	0	0	63	9	14.3	39	0	0	213	0	0	97	0	0	78	9	11.5	82	0	0	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	0.584867076	0.584867076	1	0	0	1	0	NA	0	0.470347648	0.470347648	1	0	0	1	2	NA	1	1	1	1	3.62E-11	2.61E-10	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	9	122363675	C	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	32	0	0	40	15	37.5	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	1.533742331	1.533742331	1	0.064912178	0.064912178	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.09E-24	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	122767454	G	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	30	0	0	57	13	22.8	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	0.932515337	0.932515337	1	0.227192623	0.599255231	0.379124972	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	2.44E-18	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	125370305	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	39	14	35.9	42	1	2.4	45	7	15.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	1.133723493	1.133723493	1	0.098159509	0.098159509	1	0.460286353	1.214075533	0.379124972	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	8.19E-23	1	0.189842622	1	0.000000003	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	126143781	G	A	DENND1A	CCDS35133.1	r.3162c>u	c.2960C>T	p.P987L	missense	51	0	0	37	12	32.4	53	1	1.9	43	12	27.9	16	0	0	103	26	25.2	224	7	3.1	84	17	20.2	TRUE	TRUE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	1.023193347	1.023193347	1	0.077709611	0.077709611	1	0.823204439	0.823204439	1	0.795817048	0.795817048	1	0.126789366	0.126789366	1	0.596011816	0.596011816	1	7	6	1	1	4.03E-19	1.74E-36	0.233303855	0.000155261	3.24E-18	1.42E-22	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	126902806	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	31	0	0	53	15	28.3	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	1.157464213	1.157464213	1	0.156379338	0.41247438	0.379124972	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.60E-22	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	127664734	C	A	GOLGA1	CCDS6860.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	37	0	0	42	13	31	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	1.267893661	1.267893661	1	0.209489302	0.552560018	0.379124972	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	2.72E-20	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	129949249	G	A	RALGPS1	CCDS35143.1	r.?	-	-	intronic	49	0	0	26	0	0	51	9	17.6	36	3	8.3	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	0.719836401	0.719836401	1	0.244895944	0.645950444	0.379124972	0	0	1	NA	NA	1	0	0	1	3	NA	1	1	1	1	4.92E-12	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	130904213	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	29	0	0	53	13	24.5	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	1.00204499	1.00204499	1	0.321610336	0.848296366	0.379124972	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	8.53E-19	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	133248607	C	G	-	-	-	-	-	-	38	0	0	27	0	0	53	15	28.3	41	8	19.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	1.157464213	1.157464213	1	0.575357941	0.575357941	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.60E-22	1	3.22E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	133248608	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	27	0	0	53	16	30.2	39	8	20.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	1.235173824	1.235173824	1	0.604863476	0.604863476	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.90E-24	1	2.09E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	133948520	C	T	LAMC3	CCDS6938.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	32	0	0	52	11	21.2	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	0.867075665	0.867075665	1	0.070813285	0.070813285	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.44E-15	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	134137335	C	T	FAM78A	CCDS6941.2	r.?	-	-	intronic	33	0	0	26	9	34.6	49	4	8.2	33	7	21.2	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	1.092669439	1.092669439	1	0.335378323	0.335378323	1	0.625517351	0.625517351	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.65E-15	1	0.000110643	1	2.98E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	135284881	T	C	TTF1	CCDS6948.1	r.?	-	-	upstream	48	0	0	46	0	0	54	12	22.2	46	7	15.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	0.90797546	0.90797546	1	0.448484139	1.182945391	0.379124972	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	6.90E-17	1	3.53E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	136019305	G	A	RALGDS	CCDS43897.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	37	0	0	57	0	0	34	6	17.6	10	0	0	33	0	0	44	0	0	22	0	0	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0	0	1	0	0	1	0.519297424	1.369726242	0.379124972	0	NA	0	0	0	1	0	0	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	1.86E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	138015410	C	T	OLFM1	CCDS6986.1	r.?	-	-	downstream	52	0	0	34	10	29.4	57	5	8.8	44	7	15.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0.928453222	0.928453222	1	0.3599182	0.3599182	1	0.469138013	1.237423139	0.379124972	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.15E-15	1	0.0000105	1	2.55E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	138678274	C	A	KCNT1	CCDS35175.1	r.3476c>a	c.3409C>A	p.R1137S	missense	33	0	0	25	9	36	62	9	14.5	36	16	44.4	4	0	0	58	13	22.4	177	52	29.4	90	35	38.9	TRUE	TRUE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	1.136881497	1.136881497	1	0.593047035	0.593047035	1	1.310045773	1.310045773	1	0.707392931	0.707392931	1	1.202453988	1.202453988	1	1.147765329	1.147765329	1	8	7	1	1	3.71E-15	3.12E-18	3.12E-11	2.77E-75	1.01E-27	2.52E-56	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	140998919	G	T	CACNA1B	ENST00000371372	r.?	-	-	intronic	38	0	0	36	14	38.9	52	2	3.8	31	10	32.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	1.228463617	1.228463617	1	0.155419223	0.155419223	1	0.953028795	0.953028795	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.09E-23	1	0.028101652	1	3.94E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	9	141009338	A	T	CACNA1B	ENST00000371372	r.?	-	-	intronic	31	0	0	38	11	28.9	60	16	26.7	33	12	36.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	2	1.379124972	1	1	1	0	1	0	1	1	0.620875028	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.379124972	0.912663202	0.912663202	1	1.09202454	1.09202454	1	1.07400149	1.07400149	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.19E-17	1	1.86E-23	1	7.86E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	1003465	T	C	-	-	-	-	-	-	42	0	0	46	6	13	73	18	24.7	51	19	37.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0.540540541	0.540540541	1	1.010224949	1.010224949	1	1.371995965	1.371995965	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.000000123	1	1.62E-25	1	7.94E-31	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	3245928	T	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	44	0	0	51	1	2	47	6	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0	0	1	0.081799591	0.081799591	1	0.470818991	0.470818991	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.225579006	1	0.000000141	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	6217187	C	T	PFKFB3	CCDS44353.1	r.?	-	-	intronic	52	0	0	45	13	28.9	71	0	0	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	1.201663202	1.201663202	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	6	NA	1	1	7.68E-20	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	13304200	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	44	10	22.7	49	3	6.1	52	9	17.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0.943866944	0.943866944	1	0.249488753	0.249488753	1	0.636341292	0.636341292	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.08E-14	1	0.001939399	1	5.92E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	13905666	T	A	FRMD4A	CCDS7101.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	48	0	0	56	7	12.5	50	0	0	151	0	0	163	0	0	103	21	20.4	139	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0	0	1	0.511247444	0.511247444	1	0	0	1	0	0	1	0.834355828	0.834355828	1	0	0	1	2	1	1	1	1	1	1.46E-08	1.31E-27	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	10	14282256	C	A	FRMD4A	CCDS7101.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	37	0	0	49	5	10.2	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0	0	1	0.417177914	0.417177914	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000496	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	14881879	A	G	HSPA14	CCDS7103.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	38	0	0	44	8	18.2	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0	0	1	0.744376278	0.744376278	1	0.080922014	0.080922014	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.90E-11	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	15545041	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	44	11	25	53	0	0	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	1.03950104	1.03950104	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.22E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	16175510	A	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	50	0	0	58	15	25.9	61	1	1.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0	0	1	1.059304703	1.059304703	1	0.058852374	0.058852374	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.42E-22	1	0.263440347	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	16207117	G	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	39	0	0	40	6	15	52	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0	0	1	0.613496933	0.613496933	1	0.069887194	0.069887194	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.18E-08	1	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	16294002	C	A	-	-	-	-	-	-	53	0	0	48	0	0	62	0	0	47	7	14.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0	0	1	0	0	1	0.548062731	0.548062731	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	4.12E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	16338719	G	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	56	9	16.1	40	0	0	44	0	0	160	0	0	129	33	25.6	74	0	0	121	1	0.8	TRUE	TRUE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0.669438669	0.669438669	1	0	0	1	0	0	1	1.064449064	1.064449064	1	0	0	1	0.029426187	0.029426187	1	6	4	1	1	1.20E-11	4.22E-46	1	1	1	0.454753646	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	10	16433044	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	37	8	21.6	53	2	3.8	40	7	17.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0.898128898	0.898128898	1	0.155419223	0.155419223	1	0.643697839	0.643697839	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.33E-11	1	0.029108399	1	1.26E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	17082141	T	C	CUBN	CCDS7113.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	50	6	12	44	0	0	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0.498960499	0.498960499	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000000206	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	17082142	C	A	CUBN	CCDS7113.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	47	5	10.6	44	0	0	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0.440748441	0.440748441	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.00000402	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	17521975	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	42	14	33.3	65	0	0	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	1.384615385	1.384615385	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.83E-22	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	19734447	A	T	C10orf112	ENST00000377266	r.?	-	-	intronic	34	0	0	44	10	22.7	56	0	0	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0.943866944	0.943866944	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.08E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	20431334	C	T	PLXDC2	CCDS7132.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	41	6	14.6	61	13	21.3	44	9	20.5	235	0	0	155	34	21.9	54	9	16.7	98	19	19.4	TRUE	TRUE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0.607068607	0.607068607	1	0.871165644	0.871165644	1	0.75404604	0.75404604	1	0.910602911	0.910602911	1	0.683026585	0.683026585	1	0.713585033	0.713585033	1	8	5	1	1	6.05E-08	6.47E-45	6.41E-18	8.48E-12	1.18E-12	1.13E-24	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	10	21336317	A	G	NEBL	CCDS7133.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	37	12	32.4	57	8	14	42	7	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	1.347193347	1.347193347	1	0.572597137	0.572597137	1	0.614271652	0.614271652	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.03E-19	1	5.19E-10	1	1.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	24047758	C	T	KIAA1217	CCDS41496.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	40	7	17.5	42	2	4.8	39	11	28.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0.727650728	0.727650728	1	0.196319018	0.196319018	1	1.037273089	1.037273089	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.26E-09	1	0.018854633	1	7.20E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	25641350	A	G	GPR158	CCDS31166.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	43	11	25.6	51	0	0	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	1.064449064	1.064449064	1	0	0	1	0.217018129	0.217018129	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.42E-16	1	1	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	30202944	A	G	AL160060.2	ENST00000502624	r.?	-	-	intronic	34	0	0	46	0	0	47	11	23.4	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0	0	1	0.957055215	0.957055215	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.21E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	30780605	C	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	41	0	0	63	11	17.5	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0	0	1	0.715746421	0.715746421	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.37E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	31228493	T	C	ZNF438	CCDS44369.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	57	18	31.6	50	0	0	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	1.313929314	1.313929314	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	6	NA	1	1	9.84E-28	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	31373440	A	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	39	10	25.6	37	1	2.7	49	11	22.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	1.064449064	1.064449064	1	0.110429448	0.110429448	1	0.823933234	0.823933234	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.44E-15	1	0.169281299	1	1.19E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	31470667	A	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	47	4	8.5	54	16	29.6	58	17	29.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0.353430353	0.353430353	1	1.210633947	1.210633947	1	1.077734096	1.077734096	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.0000939	1	2.69E-24	1	1.24E-25	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	33392202	T	C	-	-	-	-	-	-	45	0	0	54	17	31.5	60	0	0	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	1.30977131	1.30977131	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.02E-26	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	33685415	A	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	36	0	0	55	10	18.2	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0	0	1	0.744376278	0.744376278	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.33E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	33742800	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	46	11	23.9	52	0	0	51	14	27.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0.993762994	0.993762994	1	0	0	1	1.011525175	1.011525175	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.55E-16	1	1	1	6.64E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	33744254	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	40	13	32.5	58	1	1.7	42	8	19	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	1.351351351	1.351351351	1	0.069529652	0.069529652	1	0.698871939	0.698871939	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.30E-20	1	0.252280541	1	3.96E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	35984834	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	34	0	0	54	10	18.5	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0	0	1	0.756646217	0.756646217	1	0.172878848	1.618037175	0.106844794	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.91E-13	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	37175299	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	37	1	2.7	55	1	1.8	49	6	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0.112266112	0.112266112	1	0.073619632	0.073619632	1	0.448749351	0.448749351	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	NA	1	1	0.169281299	1	0.240951649	1	0.000000182	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	37584194	G	C	-	-	-	-	-	-	37	0	0	43	0	0	56	8	14.3	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0	0	1	0.584867076	0.584867076	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.48E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	37908545	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	60	20	33.3	67	5	7.5	56	9	16.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	1.384615385	1.384615385	1	0.306748466	0.306748466	1	0.592202012	0.592202012	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.30E-31	1	0.0000233	1	1.20E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	44273800	T	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	40	9	22.5	47	0	0	54	0	0	108	0	0	107	21	19.6	52	0	0	52	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0.935550936	0.935550936	1	0	0	1	0	0	1	0.814968815	0.814968815	1	0	0	1	0	0	1	6	4	1	1	4.64E-13	3.13E-27	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	10	44371224	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	40	6	15	59	0	0	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.106844794	1	1	1	1	1	1	1	1	0.893155206	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.106844794	0.623700624	0.623700624	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.18E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	46994040	C	T	GPRIN2	CCDS31192.1	r.?	-	-	upstream	129	0	0	186	16	8.6	200	2	1	162	1	0.6	111	0	0	342	29	8.5	347	3	0.9	234	9	3.8	FALSE	TRUE	2	2	1.389868452	1	1	1	1	1	0	1	1	0.610131548	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.389868452	0.357588358	0.357588358	1	0.040899796	0.040899796	1	0.017767782	NA	0	0.353430353	0.353430353	1	0.036809816	0.036809816	1	0.112529287	0.112529287	1	NA	4	1	1	3.46E-15	4.19E-26	0.264240347	0.251866105	0.556044868	0.00000353	YES	1_1	0_0	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	10	47965724	A	G	-	-	-	-	-	-	48	0	0	32	0	0	43	10	23.3	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.389868452	1	1	1	1	1	0	1	1	0.610131548	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.389868452	0	0	1	0.952965235	0.952965235	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.61E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	49214014	G	A	-	-	-	-	-	-	21	1	4.8	18	6	33.3	26	2	7.7	22	6	27.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.389868452	1	1	1	1	1	0	1	1	0.610131548	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.389868452	1.384615385	1.384615385	1	0.314928425	0.314928425	1	0.808434087	0.808434087	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	0.099912572	1	2.75E-10	1	0.007502227	1	1.09E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	49765284	G	A	ARHGAP22	CCDS7227.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	51	0	0	49	12	24.5	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.389868452	1	1	1	1	1	0	1	1	0.610131548	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.389868452	0	0	1	1.00204499	1.00204499	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.90E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	50411877	G	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	55	0	0	53	13	24.5	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.389868452	1	1	1	1	1	0	1	1	0.610131548	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.389868452	0	0	1	1.00204499	1.00204499	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	8.53E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	50590864	C	T	DRGX	CCDS44388.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	42	0	0	46	9	19.6	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.389868452	1	1	1	1	1	0	1	1	0.610131548	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.389868452	0	0	1	0.801635992	0.801635992	1	0.062187237	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.82E-12	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	50806543	G	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	42	0	0	49	10	20.4	36	0	0	91	0	0	129	1	0.8	113	12	10.6	97	1	1	FALSE	FALSE	2	2	1.389868452	1	1	1	1	1	0	1	1	0.610131548	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.389868452	0	0	1	0.834355828	0.834355828	1	0	NA	0	0.033264033	0.033264033	1	0.433537832	0.433537832	1	0.02961297	NA	0	NA	NA	1	1	1	0.476185621	6.72E-14	7.57E-13	1	0.385051378	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	10	51830366	G	C	FAM21A	CCDS41527.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	29	1	3.4	21	3	14.3	16	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.389868452	1	1	1	1	1	0	1	1	0.610131548	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.389868452	0.141372141	0.141372141	1	0.584867076	0.584867076	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.135292269	1	0.000155401	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	52117256	A	G	SGMS1	CCDS7240.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	37	0	0	36	9	25	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.389868452	1	1	1	1	1	0	1	1	0.610131548	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.389868452	0	0	1	1.022494888	1.022494888	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.63E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	53063752	G	T	PRKG1	CCDS7244.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	39	9	23.1	53	18	34	50	19	38	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.389868452	1	1	1	1	1	0	1	1	0.610131548	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.389868452	0.96049896	0.96049896	1	1.390593047	1.390593047	1	1.125292869	1.125292869	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	3.62E-13	1	2.09E-28	1	5.00E-31	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	53412471	A	G	PRKG1	CCDS7244.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	49	14	28.6	46	1	2.2	52	3	5.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.389868452	1	1	1	1	1	0	1	1	0.610131548	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.389868452	1.189189189	1.189189189	1	0.08997955	0.08997955	1	0.171755227	0.440546617	0.389868452	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	3.50E-21	1	0.205924651	1	0.002300591	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	54291952	T	C	-	-	-	-	-	-	52	0	0	52	14	26.9	60	18	30	35	11	31.4	329	0	0	156	37	23.7	82	26	31.7	85	38	44.7	TRUE	TRUE	2	2	1.389868452	1	1	1	1	1	0	1	1	0.610131548	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.389868452	1.118503119	1.118503119	1	1.226993865	1.226993865	1	0.929847265	0.929847265	1	0.985446985	0.985446985	1	1.296523517	1.296523517	1	1.323699769	1.323699769	1	8	7	1	1	9.04E-21	3.96E-50	2.89E-27	1.89E-39	1.82E-17	6.02E-64	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	10	54468931	C	A	-	-	-	-	-	-	61	0	0	55	0	0	55	0	0	50	9	18	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.389868452	1	1	1	1	1	0	1	1	0.610131548	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.389868452	0	0	1	0	0	1	0.533033464	1.367213638	0.389868452	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	1	NA	1	1	1	1	1	1	4.07E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	54535805	G	A	MBL2	CCDS7247.1	r.?	-	-	upstream	47	0	0	45	8	17.8	62	0	0	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.389868452	1	1	1	1	1	0	1	1	0.610131548	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.389868452	0.74012474	0.74012474	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	7.14E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	54588085	A	G	-	-	-	-	-	-	21	0	0	28	7	25	24	6	25	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.389868452	1	1	1	1	1	0	1	1	0.610131548	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.389868452	1.03950104	1.03950104	1	1.022494888	1.022494888	1	0.27836192	0.713989344	0.389868452	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	8.44E-11	1	1.95E-09	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	55712138	C	T	PCDH15	CCDS44404.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	48	8	16.7	46	3	6.5	46	10	21.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.389868452	1	1	1	1	1	0	1	1	0.610131548	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.389868452	0.694386694	0.694386694	1	0.265848671	0.265848671	1	0.642601454	0.642601454	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.23E-10	1	0.001615827	1	3.38E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	56444139	C	A	PCDH15	CCDS44404.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	43	12	27.9	41	0	0	48	3	6.2	317	0	0	116	15	12.9	41	0	0	48	4	8.3	FALSE	TRUE	2	1.050949359	1.389868452	1	1	1	1	0	0	1	0.949050641	0.610131548	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.050949359	0.389868452	1.16008316	1.16008316	1	0	NA	0	0.183600415	0.470929142	0.389868452	0.536382536	0.536382536	1	0	0	1	0.245787653	0.6304374	0.389868452	NA	6	1	1	3.24E-18	5.23E-17	1	1	0.001827434	0.000102016	YES	1_1	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	10	58462883	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	42	7	16.7	48	0	0	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.050949359	1.389868452	1	1	1	1	0	0	1	0.949050641	0.610131548	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.050949359	0.389868452	0.694386694	0.694386694	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.81E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	59488230	A	C	-	-	-	-	-	-	43	0	0	49	14	28.6	55	0	0	47	6	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.050949359	1.389868452	1	1	1	1	0	0	1	0.949050641	0.610131548	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.050949359	0.389868452	1.189189189	1.189189189	1	0	0	1	0.379046019	0.972240809	0.389868452	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.50E-21	1	1	1	0.000000141	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	59943094	C	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	44	0	0	48	0	0	40	5	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.050949359	1.389868452	1	1	1	1	0	0	1	0.949050641	0.610131548	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.050949359	0.389868452	0	0	1	0	0	1	0.370162128	0.949453915	0.389868452	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000178	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	60123765	T	G	UBE2D1	CCDS7252.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	46	15	32.6	39	5	12.8	45	9	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.050949359	1.389868452	1	1	1	1	0	0	1	0.949050641	0.610131548	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.050949359	0.389868452	1.355509356	1.355509356	1	0.4020389	0.4020389	1	0.592259405	0.592259405	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.35E-23	1	0.00000156	1	1.47E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	61256788	T	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	47	11	23.4	55	5	9.1	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.050949359	1.389868452	1	1	1	1	0	0	1	0.949050641	0.610131548	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.050949359	0.389868452	0.972972973	0.972972973	1	0.285824531	0.285824531	1	0.222097277	0.569672349	0.389868452	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.21E-16	1	0.00000883	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	62265189	C	T	ANK3	ENST00000373827	r.?	-	-	intronic	31	0	0	43	12	27.9	45	1	2.2	41	6	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.050949359	1.389868452	1	1	1	1	0	0	1	0.949050641	0.610131548	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.050949359	0.389868452	1.16008316	1.16008316	1	0.069100436	0.069100436	1	0.432349365	1.108962173	0.389868452	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.24E-18	1	0.201934322	1	6.05E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	62803268	C	G	-	-	-	-	-	-	42	0	0	60	9	15	42	1	2.4	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.050949359	1.389868452	1	1	1	1	0	0	1	0.949050641	0.610131548	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.050949359	0.389868452	0.623700624	0.623700624	1	0.075382294	NA	0	0.068109832	0.068109832	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	2.29E-11	1	0.189842622	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	62840027	G	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	53	0	0	39	0	0	49	6	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.050949359	1.389868452	1	1	1	1	0	0	1	0.949050641	0.610131548	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.050949359	0.389868452	0	0	1	0	0	1	0.361278237	0.926667021	0.389868452	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000182	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	64798303	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	43	7	16.3	39	0	0	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.050949359	1.389868452	1	1	1	1	0	0	1	0.949050641	0.610131548	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.050949359	0.389868452	0.677754678	0.677754678	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.15E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	67390393	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	47	15	31.9	40	10	25	54	14	25.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.050949359	1.389868452	1	1	1	1	0	0	1	0.949050641	0.610131548	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.050949359	0.389868452	1.326403326	1.326403326	1	0.785232227	0.785232227	1	0.766975929	0.766975929	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.97E-23	1	7.22E-15	1	1.64E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	68427122	A	G	CTNNA3	CCDS7269.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	49	14	28.6	43	13	30.2	44	12	27.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.050949359	1.389868452	1	1	1	1	0	0	1	0.949050641	0.610131548	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.050949359	0.389868452	1.189189189	1.189189189	1	0.94856053	0.94856053	1	0.808434087	0.808434087	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.50E-21	1	3.88E-20	1	4.44E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	68505256	T	C	CTNNA3	CCDS7269.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	44	9	20.5	48	0	0	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.050949359	1.389868452	1	1	1	1	0	0	1	0.949050641	0.610131548	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.050949359	0.389868452	0.852390852	0.852390852	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.18E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	69719919	C	T	HERC4	CCDS41533.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	36	0	0	50	10	20	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.050949359	1.389868452	1	1	1	1	0	0	1	0.949050641	0.610131548	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.050949359	0.389868452	0	0	1	0.628185782	0.628185782	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.36E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	70823772	C	A	-	-	-	-	-	-	53	0	0	60	12	20	43	13	30.2	46	21	45.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.050949359	1.389868452	1	1	1	1	0	0	1	0.949050641	0.610131548	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.050949359	0.389868452	0.831600832	0.831600832	1	0.94856053	0.94856053	1	1.35331274	1.35331274	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.74E-16	1	3.88E-20	1	2.94E-36	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	71031391	G	A	HK1	CCDS7290.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	28	5	17.9	37	0	0	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.050949359	1.389868452	1	1	1	1	0	0	1	0.949050641	0.610131548	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.050949359	0.389868452	0.744282744	0.744282744	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000000279	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	74876784	A	C	NUDT13	CCDS31220.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	37	8	21.6	23	0	0	23	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.050949359	1.389868452	1	1	1	1	0	0	1	0.949050641	0.610131548	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.050949359	0.389868452	0.898128898	0.898128898	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.33E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	82174261	C	T	C10orf57	CCDS7368.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	46	0	0	55	0	0	42	6	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.050949359	1.389868452	1	1	1	1	0	0	1	0.949050641	0.610131548	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.050949359	0.389868452	0	0	1	0	0	1	0.423465474	1.086175279	0.389868452	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	7.02E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	84430617	G	A	NRG3	CCDS31233.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	40	13	32.5	27	1	3.7	35	7	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.050949359	1.389868452	1	1	1	1	0	0	1	0.949050641	0.610131548	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.050949359	0.389868452	1.351351351	1.351351351	1	0.11621437	NA	0	0.592259405	0.592259405	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.30E-20	1	0.126579904	1	4.65E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	85389983	T	C	-	-	-	-	-	-	30	0	0	42	10	23.8	40	0	0	40	4	10	328	0	0	138	32	23.2	49	1	2	58	11	19	TRUE	TRUE	2	1.050949359	1.389868452	1	1	1	1	0	0	1	0.949050641	0.610131548	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.050949359	0.389868452	0.98960499	0.98960499	1	0	0	1	0.296129702	0.759563132	0.389868452	0.964656965	0.964656965	1	0.062818578	0.062818578	1	0.562646434	0.562646434	1	7	6	1	1	1.24E-14	3.19E-43	1	0.217776325	0.0000495	8.96E-15	YES	1_1	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	10	86441280	C	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	39	0	0	34	15	44.1	26	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.050949359	1.389868452	1	1	1	1	0	0	1	0.949050641	0.610131548	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.050949359	0.389868452	0	0	1	1.385149649	1.385149649	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.18E-26	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	87593563	A	G	GRID1	CCDS31236.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	35	0	0	49	8	16.3	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1.114268738	1	1	1	1	0	0	0	1	0.885731262	1	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.114268738	NA	0	0	1	0.522292471	0.522292471	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.47E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	89692904	C	T	PTEN	ENST00000371953	r.1745c>u	c.388C>T	p.R130*	nonsense	42	0	0	32	0	0	37	10	27	34	0	0	494	0	0	183	0	0	97	28	28.9	122	1	0.8	TRUE	FALSE	1	1.114268738	1	1	1	1	0	0	0	1	0.885731262	1	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.114268738	NA	0	0	1	0.865147038	0.865147038	1	0	0	1	0	NA	0	0.926027755	0.926027755	1	0.020571429	0.020571429	1	2	NA	1	1	1	1	3.01E-15	4.92E-41	1	0.457479878	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	10	89692911	G	A	PTEN	ENST00000371953	r.1752g>a	c.395G>A	p.G132D	missense	37	0	0	36	9	25	32	0	0	36	0	0	488	0	0	187	53	28.3	95	0	0	125	0	0	TRUE	TRUE	1	1.114268738	1	1	1	1	0	0	0	1	0.885731262	1	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.114268738	NA	0.78950104	0.78950104	1	0	0	1	0	0	1	0.893715177	0.893715177	1	0	0	1	0	0	1	6	4	1	1	1.63E-13	9.67E-76	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	10	93440297	T	C	-	-	-	-	-	-	47	0	0	36	11	30.6	44	2	4.5	29	5	17.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1.114268738	1	1	1	1	0	0	0	1	0.885731262	1	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.114268738	NA	0.966349272	0.966349272	1	0.144191173	1.261860206	0.114268738	0.442285714	0.442285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.62E-17	1	0.020580492	1	0.000000336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	97000714	C	G	PDLIM1	CCDS7441.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	35	0	0	59	18	30.5	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1.114268738	1	1	1	1	0	0	0	1	0.885731262	1	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.114268738	NA	0	0	1	0.977295728	0.977295728	1	0.187714286	0.187714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	2.03E-27	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	98130234	C	A	TLL2	CCDS7449.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	22	0	0	26	6	23.1	30	10	33.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1.114268738	1	1	1	1	0	0	0	1	0.885731262	1	NA	2	NA	NA	0	NA	NA	0.114268738	NA	0	0	1	0.740181354	0.740181354	1	0.856285714	0.856285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	3.30E-09	1	2.68E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	101252993	A	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	29	2	6.9	37	2	5.4	23	3	13	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	0.286902287	0.286902287	1	0.173029408	1.514232247	0.114268738	0.38497603	0.98730661	0.389925507	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.009279585	1	0.014826063	1	0.000205387	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	102116116	G	C	SCD	CCDS7493.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	49	9	18.4	52	0	0	50	11	22	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	0.765072765	0.765072765	1	0	0	1	0.651497897	0.651497897	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.35E-12	1	1	1	1.52E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	106753945	C	A	SORCS3	CCDS7558.1	r.?	-	-	intronic	50	0	0	52	0	0	46	0	0	37	5	13.5	303	1	0.3	153	0	0	76	2	2.6	79	9	11.4	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	0	0	1	0	0	1	0.399782801	1.025279941	0.389925507	0	NA	0	0.083310455	0.729074786	0.114268738	0.337594365	0.86579195	0.389925507	1	NA	1	0.781025539	1	1	1	0.055865747	0.00000119	2.93E-10	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	10	109580447	C	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	40	0	0	39	4	10.3	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	0	0	1	0.330037574	0.330037574	1	0.085879268	0.085879268	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000447	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	110306835	T	C	-	-	-	-	-	-	54	0	0	39	1	2.6	45	0	0	49	6	12.2	134	0	0	138	2	1.4	56	0	0	90	10	11.1	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	0.108108108	0.108108108	1	0	0	1	0.361285198	0.92654928	0.389925507	0.058212058	NA	0	0	0	1	0.328710303	0.843007951	0.389925507	1	NA	1	1	0.177567718	0.152066161	1	1	0.000000182	3.88E-11	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	10	112409172	A	G	RBM20	CCDS44477.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	43	6	14	50	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	0.582120582	0.582120582	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	8.13E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	115223781	A	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	49	12	24.5	47	3	6.4	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	1.018711019	1.018711019	1	0.20507189	1.794645627	0.114268738	0.278367283	0.713898626	0.389925507	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.90E-17	1	0.001719595	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	119358102	G	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	47	12	25.5	45	0	0	44	6	13.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	1.06029106	1.06029106	1	0	0	1	0.402744155	1.032874607	0.389925507	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.09E-17	1	1	1	9.37E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	119389616	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	42	5	11.9	36	0	0	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	0.494802495	0.494802495	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.00000228	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	121452770	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	49	12	24.5	36	1	2.8	31	3	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	1.018711019	1.018711019	1	0.089718952	0.089718952	1	0.287251346	0.736682624	0.389925507	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.90E-17	1	0.165106833	1	0.000505952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	121581796	T	G	INPP5F	CCDS7616.1	r.?	-	-	intronic	56	0	0	45	7	15.6	58	2	3.4	33	7	21.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	0.648648649	0.648648649	1	0.108944442	0.953405489	0.114268738	0.627807065	0.627807065	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.000000003	1	0.034352256	1	2.98E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	123454670	A	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	42	9	21.4	52	18	34.6	42	13	31	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	0.88981289	0.88981289	1	1.108669908	1.108669908	1	0.918019764	0.918019764	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	7.51E-13	1	1.39E-28	1	2.72E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	125816387	G	A	CHST15	CCDS7638.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	42	11	26.2	44	2	4.5	28	7	25	103	0	0	291	56	19.2	398	15	3.8	250	45	18	TRUE	TRUE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	1.089397089	1.089397089	1	0.144191173	1.261860206	0.114268738	0.74033852	0.74033852	1	0.798336798	0.798336798	1	0.121761435	1.065570841	0.114268738	0.533043734	0.533043734	1	8	5	1	1	1.81E-16	2.02E-69	0.020580492	2.96E-09	8.44E-11	1.03E-54	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	10	126467624	T	C	METTL10	CCDS31307.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	48	0	0	34	12	35.3	35	4	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	0	0	1	1.131099646	1.131099646	1	0.337594365	0.86579195	0.389925507	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.21E-19	1	0.0000289	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	128319434	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	38	0	0	46	14	30.4	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	0	0	1	0.97409148	0.97409148	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.26E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	128614246	C	T	DOCK1	ENST00000398025	r.?	-	-	intronic	45	0	0	38	9	23.7	40	2	5	37	6	16.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	0.985446985	0.985446985	1	0.160212414	1.402066896	0.114268738	0.479739361	1.230335929	0.389925507	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.79E-13	1	0.017193422	1	3.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	129636138	T	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	62	6	9.7	52	0	0	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	0.403326403	0.403326403	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000000756	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	129765936	C	A	PTPRE	CCDS7657.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	54	5	9.3	38	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	0.386694387	0.386694387	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.00000806	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	130766127	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	41	15	36.6	40	3	7.5	46	6	13	63	0	0	97	33	34	60	0	0	89	27	30.3	TRUE	TRUE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	1.521829522	1.521829522	1	0.240318622	0.240318622	1	0.38497603	0.98730661	0.389925507	1.413721414	1.413721414	1	0	0	1	0.897290286	0.897290286	1	7	6	1	1	1.71E-24	7.44E-51	0.001075403	1	0.000000123	2.66E-40	YES	1_1	1_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	10	130788317	T	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	48	9	18.8	43	18	41.9	45	14	31.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	0.781704782	0.781704782	1	1.342580033	1.342580033	1	0.920981118	0.920981118	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.75E-12	1	2.06E-30	1	8.81E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	130864245	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	29	5	17.2	27	0	0	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	0.715176715	0.715176715	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000000336	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	131688366	G	C	EBF3	CCDS31314.1	r.?	-	-	intronic	50	0	0	30	5	16.7	47	19	40.4	28	6	21.4	116	0	0	195	57	29.2	109	41	37.6	123	44	35.8	TRUE	TRUE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	0.694386694	0.694386694	1	1.294516308	1.294516308	1	0.633729773	0.633729773	1	1.214137214	1.214137214	1	1.204797356	1.204797356	1	1.06016476	1.06016476	1	8	7	1	1	0.000000401	3.25E-82	1.16E-31	5.67E-65	5.36E-09	1.97E-68	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	10	132173040	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	43	9	20.9	34	2	5.9	52	12	23.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	0.869022869	0.869022869	1	0.189050649	1.654438937	0.114268738	0.684072792	0.684072792	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	9.45E-13	1	0.012612579	1	4.19E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	132379513	G	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	52	14	26.9	44	0	0	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	1.118503119	1.118503119	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	9.04E-21	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	132580702	G	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	50	15	30	40	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	1.247401247	1.247401247	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.83E-23	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	135305505	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	35	9	25.7	43	3	7	40	6	15	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	1.068607069	1.068607069	1	0.22429738	0.22429738	1	0.444203112	1.139199934	0.389925507	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.23E-13	1	0.001328364	1	5.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	10	135461848	C	T	-	-	-	-	-	-	95	0	0	100	4	4	141	11	7.8	109	5	4.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.114268738	1.389925507	1	1	1	1	0	0	1	0.885731262	0.610074493	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.114268738	0.389925507	0.166320166	0.166320166	1	0.249931366	0.249931366	1	0.136222288	0.136222288	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.001673268	1	1.98E-10	1	0.000237142	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	2588319	C	T	KCNQ1	CCDS7736.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	35	14	40	51	0	0	35	5	14.3	11	0	0	131	34	26	127	0	0	89	10	11.2	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.663201663	1.663201663	1	0	0	1	0.510714286	0.510714286	1	1.081081081	1.081081081	1	0	0	1	0.4	0.4	1	7	6	1	1	1.28E-23	1.08E-47	1	1	0.000000895	3.47E-11	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	3424925	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	25	0	0	47	10	21.3	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.871165644	0.871165644	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.27E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	3939057	C	T	STIM1	CCDS7749.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	40	0	0	45	0	0	45	6	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.475	0.475	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000108	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	4062880	T	A	STIM1	CCDS7749.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	33	0	0	52	14	26.9	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.100204499	1.100204499	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.04E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	4319687	G	C	-	-	-	-	-	-	34	0	0	53	13	24.5	56	12	21.4	49	11	22.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.018711019	1.018711019	1	0.875255624	0.875255624	1	0.8	0.8	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	8.53E-19	1	1.11E-16	1	1.19E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	4329486	A	G	-	-	-	-	-	-	26	0	0	27	0	0	45	10	22.2	39	7	17.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.90797546	0.90797546	1	0.639285714	0.639285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	2.66E-14	1	1.04E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	4742634	C	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	40	0	0	60	7	11.7	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.478527607	0.478527607	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.39E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	5416532	G	C	HBG2	CCDS7755.1	r.?	-	-	intronic	60	0	0	43	4	9.3	53	0	0	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.386694387	0.386694387	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000066	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	6103059	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	48	0	0	50	0	0	59	6	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.364285714	0.364285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000561	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	7278764	C	T	SYT9	CCDS7778.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	45	9	20	50	0	0	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.47E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	7540623	G	T	PPFIBP2	CCDS31419.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	40	0	0	40	10	25	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.022494888	1.022494888	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.22E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	7948958	T	C	OR10A6	CCDS31420.1	r.?	-	-	downstream	36	0	0	59	15	25.4	51	3	5.9	55	5	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.056133056	1.056133056	1	0.241308793	0.241308793	1	0.325	0.325	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.90E-22	1	0.002175924	1	0.00000883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	8207491	T	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	48	0	0	51	9	17.6	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.719836401	0.719836401	1	0.078571429	0.078571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.92E-12	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	8833511	C	A	ST5	CCDS7791.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	37	0	0	45	11	24.4	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.99795501	0.99795501	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.24E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	10699324	T	C	MRVI1	CCDS44539.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	46	0	0	55	14	25.5	51	2	3.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.042944785	1.042944785	1	0.139285714	0.139285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.19E-20	1	0.027109304	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	10721402	A	G	-	-	-	-	-	-	29	0	0	29	5	17.2	41	12	29.3	42	13	31	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.715176715	0.715176715	1	1.198364008	1.198364008	1	1.107142857	1.107142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.000000336	1	1.69E-18	1	2.72E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	11088660	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	38	0	0	52	11	21.2	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.867075665	0.867075665	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.44E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	11117630	T	C	-	-	-	-	-	-	41	0	0	55	11	20	56	1	1.8	60	10	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	0.073619632	0.073619632	1	0.596428571	0.596428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.77E-15	1	0.244746891	1	5.86E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	11777151	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	36	4	11.1	66	1	1.5	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.461538462	0.461538462	1	0.061349693	0.061349693	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.0000324	1	0.281671117	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	13585404	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	41	11	26.8	54	24	44.4	52	16	30.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.114345114	1.114345114	1	1.81595092	1.81595092	1	1.1	1.1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.34E-16	1	7.24E-41	1	1.33E-24	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	15360076	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	35	8	22.9	48	12	25	38	11	28.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.952182952	0.952182952	1	1.022494888	1.022494888	1	1.032142857	1.032142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	8.15E-12	1	1.44E-17	1	5.19E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	18760007	C	A	PTPN5	CCDS41626.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	39	0	0	61	13	21.3	55	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.871165644	0.871165644	1	0.064285714	0.064285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.41E-18	1	0.240951649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	19000456	G	T	-	-	-	-	-	-	49	0	0	36	0	0	56	15	26.8	60	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.096114519	1.096114519	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.09E-22	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	19239687	A	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	43	0	0	55	0	0	54	5	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.332142857	0.332142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000806	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	20554408	C	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	30	8	26.7	33	0	0	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.11018711	1.11018711	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.07E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	20945989	C	T	NELL1	CCDS7855.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	34	5	14.7	52	1	1.9	42	7	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.611226611	0.611226611	1	0.077709611	0.077709611	1	0.596428571	0.596428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.000000771	1	0.229451111	1	1.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	21910411	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	48	10	20.8	36	0	0	60	5	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.864864865	0.864864865	1	0	0	1	0.296428571	0.296428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.37E-14	1	1	1	0.0000136	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	22809348	G	A	GAS2	CCDS7858.1	r.?	-	-	intronic	49	0	0	34	0	0	133	7	5.3	52	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	5.313912838	2	1	4	1	1	1	1	1	0.686087162	1	NA	5	NA	NA	1	NA	NA	0.313912838	NA	0	0	1	0.392406297	1.250048578	0.313912838	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000561	1	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	23421665	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	36	4	11.1	85	15	17.6	54	13	24.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	5.313912838	2	1	4	1	1	1	1	1	0.686087162	1	NA	5	NA	NA	1	NA	NA	0.313912838	NA	0.461538462	0.461538462	1	1.30308506	1.30308506	1	0.860714286	0.860714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.0000324	1	3.95E-19	1	1.12E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	23511118	G	A	-	-	-	-	-	-	46	0	0	33	10	30.3	100	59	59	39	10	25.6	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	5.313912838	2	1	4	1	1	1	1	1	0.686087162	1	NA	5	NA	NA	1	NA	NA	0.313912838	NA	1.25987526	1.25987526	1	4.368296509	1.012606576	4.313912838	0.914285714	0.914285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	8.14E-16	1	2.85E-108	1	5.44E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	23881417	C	G	-	-	-	-	-	-	41	0	0	51	0	0	82	30	36.6	54	2	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	5.313912838	2	1	4	1	1	1	1	1	0.686087162	1	NA	5	NA	NA	1	NA	NA	0.313912838	NA	0	0	1	2.709824614	0.903274871	3	0.132142857	0.132142857	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.61E-47	1	0.030129377	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	24960607	C	T	LUZP2	CCDS31446.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	43	16	37.2	50	16	32	42	13	31	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.546777547	1.546777547	1	1.308793456	1.308793456	1	1.107142857	1.107142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.56E-26	1	6.40E-25	1	2.72E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	25650297	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	28	5	17.9	44	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.744282744	0.744282744	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000000279	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	25807667	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	44	0	0	50	7	14	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.572597137	0.572597137	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.46E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	27807374	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	32	0	0	48	5	10.4	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.425357873	0.425357873	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000447	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	28375560	G	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	32	11	34.4	42	1	2.4	31	5	16.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.43035343	1.43035343	1	0.098159509	0.098159509	1	0.575	0.575	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.72E-18	1	0.189842622	1	0.000000476	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	28532670	T	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	48	0	0	56	11	19.6	51	6	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.801635992	0.801635992	1	0.421428571	0.421428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	5.91E-15	1	0.000000232	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	28834214	G	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	27	0	0	40	0	0	37	4	10.8	566	1	0.2	201	2	1	123	0	0	123	8	6.5	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.385714286	0.385714286	1	0.041580042	0.041580042	1	0	0	1	0.232142857	0.232142857	1	1	2	1	0.941404576	1	0.266084357	1	1	0.0000362	0.000000241	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	11	30080084	T	C	-	-	-	-	-	-	25	0	0	25	0	0	36	8	22.2	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.90797546	0.90797546	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.04E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	30199799	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	39	0	0	56	0	0	58	8	13.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.492857143	0.492857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	5.99E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	30233970	A	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	50	0	0	52	13	25	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.022494888	1.022494888	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.47E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	30315959	T	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	23	0	0	42	8	19	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.777096115	0.777096115	1	0.092857143	0.092857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.96E-11	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	30723330	G	A	-	-	-	-	-	-	46	0	0	39	5	12.8	52	11	21.2	52	15	28.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.532224532	0.532224532	1	0.867075665	0.867075665	1	1.028571429	1.028571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.00000156	1	2.44E-15	1	1.15E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	32990939	T	G	QSER1	CCDS41631.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	48	0	0	61	18	29.5	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.206543967	1.206543967	1	0.396428571	0.396428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	4.08E-27	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	34570130	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	46	8	17.4	47	0	0	44	10	22.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.723492723	0.723492723	1	0	0	1	0.810714286	0.810714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	8.61E-11	1	1	1	2.08E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	34701403	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	57	18	31.6	62	15	24.2	50	11	22	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.313929314	1.313929314	1	0.989775051	0.989775051	1	0.785714286	0.785714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	9.84E-28	1	2.28E-21	1	1.52E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	37115705	C	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	55	0	0	46	11	23.9	61	1	1.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.977505112	0.977505112	1	0.057142857	0.057142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.55E-16	1	0.263440347	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	38144001	T	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	30	0	0	58	12	20.7	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.846625767	0.846625767	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.76E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	38511034	T	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	44	11	25	56	0	0	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.03950104	1.03950104	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.22E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	39121558	A	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	32	0	0	48	6	12.5	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.511247444	0.511247444	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000016	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	39543757	G	A	-	-	-	-	-	-	46	0	0	51	12	23.5	60	0	0	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.977130977	0.977130977	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.24E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	39791158	T	C	-	-	-	-	-	-	24	0	0	36	6	16.7	43	0	0	40	6	15	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.694386694	0.694386694	1	0	0	1	0.535714286	0.535714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.68E-08	1	1	1	5.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	41122796	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	44	11	25	41	11	26.8	56	21	37.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.03950104	1.03950104	1	1.096114519	1.096114519	1	1.339285714	1.339285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.22E-16	1	1.34E-16	1	5.43E-34	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	41347840	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	39	0	0	63	14	22.2	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.90797546	0.90797546	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.81E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	41450125	C	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	32	5	15.6	41	1	2.4	42	9	21.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.648648649	0.648648649	1	0.098159509	0.098159509	1	0.764285714	0.764285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.000000562	1	0.18577148	1	7.51E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	42397854	A	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	39	12	30.8	46	15	32.6	54	13	24.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.280665281	1.280665281	1	1.333333333	1.333333333	1	0.860714286	0.860714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	8.43E-19	1	1.35E-23	1	1.12E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	42732340	G	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	44	0	0	57	9	15.8	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.646216769	0.646216769	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.42E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	42809642	C	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	45	9	20	45	13	28.9	49	13	26.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	1.18200409	1.18200409	1	0.946428571	0.946428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.47E-12	1	7.68E-20	1	2.71E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	46667445	C	G	KIAA0652	CCDS44582.1	r.865c>g	c.176C>G	p.P59R	missense	29	0	0	49	0	0	63	0	0	72	8	11.1	233	1	0.4	155	2	1.3	161	1	0.6	191	24	12.6	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.396428571	0.396428571	1	0.054054054	0.054054054	1	0.024539877	0.024539877	1	0.45	0.45	1	1	2	1	0.688987522	1	0.182048221	1	0.553813938	3.52E-09	5.29E-26	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	11	46810304	C	T	CKAP5	CCDS31477.1	r.2005g>a	c.1895G>A	p.R632Q	missense	43	0	0	37	0	0	58	12	20.7	51	9	17.6	234	0	0	167	1	0.6	105	18	17.1	145	17	11.7	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.846625767	0.846625767	1	0.628571429	0.628571429	1	0.024948025	0.024948025	1	0.699386503	0.699386503	1	0.417857143	0.417857143	1	3	3	1	1	1	0.567033311	1.76E-16	2.02E-22	4.92E-12	2.44E-18	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	11	47398863	C	T	SPI1	CCDS44591.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	42	0	0	53	10	18.9	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.773006135	0.773006135	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.57E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	49375662	A	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	32	0	0	42	0	0	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.303571429	0.303571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	50139849	G	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	21	5	23.8	25	7	28	19	3	15.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.98960499	0.98960499	1	1.145194274	1.145194274	1	0.564285714	0.564285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.95E-08	1	3.47E-11	1	0.000114071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	50210374	T	G	ENSG00000236919	ENST00000435540	r.?	-	-	upstream	45	0	0	49	0	0	51	7	13.7	60	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.560327198	0.560327198	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.46E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	51494452	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	48	20	41.7	56	19	33.9	44	19	43.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.733887734	1.733887734	1	1.386503067	1.386503067	1	1.542857143	1.542857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.40E-33	1	6.79E-30	1	2.39E-32	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	55297465	A	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	38	6	15.8	67	2	3	38	9	23.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.656964657	0.656964657	1	0.122699387	0.122699387	1	0.846428571	0.846428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.76E-08	1	0.044622585	1	2.79E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	55767921	A	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	49	7	14.3	42	1	2.4	56	8	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.594594595	0.594594595	1	0.098159509	0.098159509	1	0.510714286	0.510714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.58E-09	1	0.189842622	1	4.48E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	56298915	C	T	OR5M5P	ENST00000341231	r.?	-	-	upstream	43	0	0	42	8	19	59	0	0	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.79002079	0.79002079	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.96E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	56322448	A	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	47	0	0	53	11	20.8	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.850715746	0.850715746	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.07E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	56612801	G	A	-	-	-	-	-	-	46	0	0	50	7	14	74	0	0	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.582120582	0.582120582	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	6.46E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	56864109	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	37	8	21.6	40	0	0	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.898128898	0.898128898	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.33E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	57800019	G	C	OR9Q1	CCDS31543.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	37	8	21.6	58	18	31	55	18	32.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.898128898	0.898128898	1	1.267893661	1.267893661	1	1.167857143	1.167857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.33E-11	1	1.42E-27	1	4.61E-28	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	58136076	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	44	13	29.5	65	24	36.9	59	19	32.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.226611227	1.226611227	1	1.509202454	1.509202454	1	1.15	1.15	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.49E-20	1	1.94E-38	1	2.20E-29	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	58248851	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	52	0	0	73	15	20.5	69	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.838445808	0.838445808	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.38E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	61021603	G	A	VWCE	CCDS8002.1	r.?	-	-	downstream	43	0	0	43	7	16.3	54	0	0	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.677754678	0.677754678	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.15E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	62873658	G	A	SLC22A24	ENST00000417740	r.?	-	-	intronic	41	0	0	41	11	26.8	44	0	0	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.114345114	1.114345114	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.34E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	65427681	T	A	RELA	CCDS31609.1	r.481a>u	c.341A>T	p.Q114L	missense	32	0	0	35	2	5.7	56	8	14.3	37	9	24.3	76	0	0	137	22	16.1	164	26	15.9	172	49	28.5	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.237006237	0.237006237	1	0.584867076	0.584867076	1	0.867857143	0.867857143	1	0.669438669	0.669438669	1	0.650306748	0.650306748	1	1.017857143	1.017857143	1	8	5	1	1	0.013332991	2.10E-26	4.48E-10	9.02E-31	2.14E-13	2.80E-70	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	11	65648151	G	A	FIBP	CCDS8119.1	r.?	-	-	downstream	62	0	0	50	11	22	44	2	4.5	43	7	16.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914760915	0.914760915	1	0.18404908	0.18404908	1	0.582142857	0.582142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.52E-15	1	0.020580492	1	2.15E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	67780437	G	A	AC004923.1	ENST00000499964	r.1771c>u	-	-	non-coding variant	37	0	0	33	0	0	51	10	19.6	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.801635992	0.801635992	1	0.239285714	0.239285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.04E-13	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	69173477	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	33	11	33.3	55	18	32.7	47	12	25.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.384615385	1.384615385	1	1.337423313	1.337423313	1	0.910714286	0.910714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	8.54E-18	1	4.61E-28	1	1.09E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	69244456	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	56	7	12.5	57	0	0	67	1	1.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.51975052	0.51975052	1	0	0	1	0.053571429	0.053571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.46E-08	1	1	1	0.285262761	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	72729470	A	G	FCHSD2	CCDS8218.2	r.?	-	-	intronic	43	0	0	50	0	0	50	8	16	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.654396728	0.654396728	1	0.435714286	0.435714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.74E-10	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	73457219	A	T	RAB6A	CCDS8223.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	51	0	0	48	11	22.9	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.936605317	0.936605317	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.31E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	73594597	C	T	PAAF1	CCDS8226.1	r.?	-	-	intronic	52	0	0	53	1	1.9	57	9	15.8	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.079002079	0.079002079	1	0.646216769	0.646216769	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	0.233303855	1	1.42E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	75589028	G	A	UVRAG	CCDS8241.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	34	0	0	44	12	27.3	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.116564417	1.116564417	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.44E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	76486056	C	G	-	-	-	-	-	-	42	0	0	50	12	24	46	2	4.3	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.997920998	0.997920998	1	0.175869121	0.175869121	1	0.435714286	0.435714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.49E-17	1	0.022369545	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	76812802	C	T	CAPN5	CCDS8248.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	41	8	19.5	52	0	0	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.810810811	0.810810811	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.22E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	78207580	G	T	NARS2	CCDS8261.1	r.?	-	-	intronic	52	0	0	39	8	20.5	54	2	3.7	53	7	13.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852390852	0.852390852	1	0.151329243	0.151329243	1	0.471428571	0.471428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.09E-11	1	0.030129377	1	9.85E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	78888803	G	A	ODZ4	CCDS44688.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	39	5	12.8	57	3	5.3	38	6	15.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.532224532	0.532224532	1	0.216768916	0.216768916	1	0.564285714	0.564285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.00000156	1	0.002989991	1	3.76E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	78917026	C	T	ODZ4	CCDS44688.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	46	0	0	39	12	30.8	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.259713701	1.259713701	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.43E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	80572926	T	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	47	7	14.9	55	13	23.6	49	14	28.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.61954262	0.61954262	1	0.965235174	0.965235174	1	1.021428571	1.021428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.12E-09	1	1.46E-18	1	3.50E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	81326134	A	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	41	9	22	51	8	15.7	42	10	23.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914760915	0.914760915	1	0.642126789	0.642126789	1	0.85	0.85	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.92E-13	1	2.05E-10	1	1.24E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	81703618	G	A	AP002802.1	ENST00000500502	r.?	-	-	intronic	49	0	0	38	8	21.1	55	16	29.1	50	16	32	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.877338877	0.877338877	1	1.190184049	1.190184049	1	1.142857143	1.142857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.67E-11	1	3.78E-24	1	6.40E-25	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	84761846	A	G	DLG2	CCDS44690.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	42	0	0	51	9	17.6	63	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.719836401	0.719836401	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.92E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	86663442	C	G	FZD4	CCDS8279.1	r.662g>c	c.356G>C	p.G119A	missense	40	0	0	48	0	0	61	15	24.6	44	0	0	168	0	0	206	0	0	134	13	9.7	163	2	1.2	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.006134969	1.006134969	1	0	0	1	0	0	1	0.396728016	0.396728016	1	0.042857143	0.042857143	1	2	1	1	1	1	1	1.73E-21	2.75E-13	1	0.196441211	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	11	87483228	A	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	30	0	0	47	9	19.1	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.781186094	0.781186094	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.24E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	88244795	C	T	GRM5	CCDS44694.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	61	16	26.2	58	16	27.6	52	9	17.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.089397089	1.089397089	1	1.128834356	1.128834356	1	0.617857143	0.617857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.50E-23	1	1.00E-23	1	5.92E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	88561688	G	T	GRM5	CCDS44694.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	34	4	11.8	48	12	25	56	10	17.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.490644491	0.490644491	1	1.022494888	1.022494888	1	0.639285714	0.639285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.0000257	1	1.44E-17	1	2.82E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	89125959	C	A	NOX4	CCDS8285.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	52	8	15.4	53	0	0	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.64033264	0.64033264	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.42E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	91551413	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	53	0	0	49	8	16.3	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.666666667	0.666666667	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.47E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	91898221	G	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	44	12	27.3	53	17	32.1	43	15	34.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.135135135	1.135135135	1	1.312883436	1.312883436	1	1.246428571	1.246428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.44E-18	1	2.08E-26	1	4.05E-24	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	91908627	G	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	22	0	0	24	4	16.7	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.683026585	0.683026585	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000613	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	92894837	A	G	SLC36A4	CCDS8291.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	40	0	0	39	9	23.1	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.944785276	0.944785276	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.62E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	93326462	A	C	-	-	-	-	-	-	11	0	0	7	0	0	20	2	10	28	6	21.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.408997955	0.408997955	1	0.764285714	0.764285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1	1	0.004473894	1	5.36E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	93771034	G	C	HEPHL1	CCDS44710.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	46	0	0	56	0	0	49	8	16.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.582142857	0.582142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	1.47E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	93927492	G	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	52	0	0	60	12	20	60	10	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.81799591	0.81799591	1	0.596428571	0.596428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	2.74E-16	1	5.86E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	94682029	C	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	25	6	24	48	0	0	42	0	0	333	0	0	157	30	19.1	70	0	0	99	0	0	FALSE	FALSE	2	1.129121397	2	1	1	1	1	0	1	1	0.870878603	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.129121397	NA	0.997920998	0.997920998	1	0	NA	0	0	0	1	0.794178794	0.794178794	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	1	2.55E-09	7.38E-38	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	11	95442400	C	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	63	12	19	37	0	0	37	6	16.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.129121397	2	1	1	1	1	0	1	1	0.870878603	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.129121397	NA	0.79002079	0.79002079	1	0	NA	0	0.578571429	0.578571429	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	5.15E-16	1	1	1	3.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	95650189	C	T	MTMR2	CCDS8305.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	45	12	26.7	48	2	4.2	57	11	19.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	2	1	1	1	1	0	1	1	0.870878603	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.129121397	NA	1.11018711	1.11018711	1	0.13520224	1.047094	0.129121397	0.689285714	0.689285714	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.03E-18	1	0.024220359	1	7.29E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	97937660	G	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	50	15	30	44	0	0	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.129121397	2	1	1	1	1	0	1	1	0.870878603	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.129121397	NA	1.247401247	1.247401247	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	5.83E-23	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	97951290	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	47	0	0	49	0	0	47	7	14.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.129121397	2	1	1	1	1	0	1	1	0.870878603	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.129121397	NA	0	0	1	0	NA	0	0.532142857	0.532142857	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	4.12E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	98385871	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	40	8	20	48	0	0	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.129121397	2	1	1	1	1	0	1	1	0.870878603	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.129121397	NA	0.831600832	0.831600832	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	2.61E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	100946590	C	T	PGR	CCDS8310.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	37	7	18.9	29	0	0	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.785862786	0.785862786	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	7.05E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	101686603	C	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	44	6	13.6	43	0	0	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.565488565	0.565488565	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	9.37E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	102144597	C	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	45	13	28.9	42	3	7.1	46	7	15.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	1.201663202	1.201663202	1	0.228556167	1.770087477	0.129121397	0.49540603	0.720253641	0.687821625	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	7.68E-20	1	0.001240292	1	3.53E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	103683434	A	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	42	0	0	46	1	2.2	39	4	10.3	179	0	0	118	0	0	63	0	0	100	4	4	TRUE	TRUE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0	0	1	0.070820221	0.070820221	1	0.33570277	0.488066612	0.687821625	0	0	1	0	0	1	0.130370008	0.130370008	1	1	2	1	1	1	1	0.205924651	1	0.0000447	0.001673268	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	11	103865791	T	G	PDGFD	CCDS41703.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	23	0	0	42	1	2.4	45	7	15.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0	0	1	0.077258423	0.077258423	1	0.508443031	0.739207684	0.687821625	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.189842622	1	0.000000003	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	104135005	A	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	34	0	0	48	5	10.4	27	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0	0	1	0.334786498	0.334786498	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000447	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	105320776	A	G	-	-	-	-	-	-	38	0	0	37	8	21.6	36	0	0	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.898128898	0.898128898	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.33E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	106630619	C	T	GUCY1A2	CCDS8335.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	34	0	0	40	8	20	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0	0	1	0.643820189	0.643820189	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.61E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	108947184	G	A	-	-	-	-	-	-	46	0	0	44	0	0	30	3	10	47	5	10.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0	0	1	0.321910095	0.321910095	1	0.345480521	0.502282144	0.687821625	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.000458697	1	0.00000402	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	110856538	A	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	52	0	0	43	9	20.9	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0	0	1	0.672792098	0.672792098	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.45E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	112825908	A	C	AP000802.1	ENST00000500537	r.?	-	-	downstream	44	0	0	50	10	20	41	0	0	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.831600832	0.831600832	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	8.36E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	114367243	T	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	54	0	0	41	0	0	44	5	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0	0	1	0	0	1	0.371554522	0.540190231	0.687821625	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000288	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	114572691	C	A	FAM55B	CCDS44738.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	26	4	15.4	41	3	7.3	36	8	22.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.64033264	0.64033264	1	0.234994369	0.234994369	1	0.723553544	0.723553544	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.00000856	1	0.001155993	1	1.04E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	114581250	C	T	FAM55B	CCDS44738.1	r.?	-	-	downstream	39	0	0	39	11	28.2	41	4	9.8	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	1.172557173	1.172557173	1	0.315471893	0.315471893	1	0.208592013	0.208592013	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.20E-17	1	0.0000546	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	115459179	T	C	-	-	-	-	-	-	42	0	0	53	9	17	49	0	0	54	15	27.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.706860707	0.706860707	1	0	0	1	0.906071555	0.906071555	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.10E-12	1	1	1	2.20E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	115776599	T	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	61	0	0	39	0	0	49	6	12.2	198	0	0	146	1	0.7	60	0	0	122	12	9.8	TRUE	TRUE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0	0	1	0	0	1	0.397628524	0.578098317	0.687821625	0.029106029	0.029106029	1	0	0	1	0.319406519	0.319406519	1	1	2	1	1	1	0.518972629	1	1	0.000000182	1.91E-12	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	11	115862581	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	51	5	9.8	36	0	0	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.407484407	0.407484407	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.00000606	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	116236221	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	43	0	0	56	12	21.4	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0	0	1	0.688887603	0.688887603	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.11E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	119774858	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	47	14	29.8	39	1	2.6	43	8	18.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	1.239085239	1.239085239	1	0.083696625	0.083696625	1	0.606220537	0.606220537	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.79E-21	1	0.177567718	1	4.85E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	120456728	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	46	9	19.6	35	10	28.6	41	11	26.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.814968815	0.814968815	1	0.920662871	0.920662871	1	0.873479053	0.873479053	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.82E-12	1	1.60E-15	1	1.34E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	121631139	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	40	8	20	34	0	0	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.831600832	0.831600832	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.61E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	122556844	C	G	UBASH3B	CCDS31694.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	46	0	0	47	0	0	40	5	12.5	213	0	0	165	0	0	85	0	0	144	4	2.8	TRUE	TRUE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0	0	1	0	0	1	0.407406275	0.592313849	0.687821625	0	0	1	0	0	1	0.091259006	0.091259006	1	1	2	1	1	1	1	1	1	0.00000178	0.006167882	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	11	122900392	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	43	8	18.6	42	2	4.8	37	7	18.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.773388773	0.773388773	1	0.154516845	1.196678858	0.129121397	0.615998287	0.615998287	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.85E-11	1	0.018854633	1	7.05E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	122921213	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	33	6	18.2	37	0	0	35	10	28.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.756756757	0.756756757	1	0	0	1	0.932145556	0.932145556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.54E-08	1	1	1	1.60E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	123188025	C	G	-	-	-	-	-	-	26	0	0	30	0	0	27	5	18.5	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0	0	1	0.595533675	0.595533675	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000023	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	123219974	C	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	46	10	21.7	35	0	0	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.902286902	0.902286902	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.38E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	123251679	G	A	-	-	-	-	-	-	53	0	0	62	0	0	52	0	0	44	5	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0	0	1	0	0	1	0.371554522	0.540190231	0.687821625	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000288	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	127055607	T	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	55	4	7.3	50	4	8	48	3	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.303534304	0.303534304	1	0.257528076	0.257528076	1	0.202073512	0.202073512	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000173903	1	0.000119787	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	127220585	C	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	43	9	20.9	39	1	2.6	40	2	5	602	2	0.3	132	28	21.2	76	4	5.3	88	14	15.9	FALSE	TRUE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.869022869	0.869022869	1	0.083696625	NA	0	0.16296251	0.16296251	1	0.881496881	0.881496881	1	0.17061235	1.321332905	0.129121397	0.518220781	0.753423217	0.687821625	NA	5	1	0.803087154	9.45E-13	8.02E-37	0.177567718	0.00060191	0.017193422	2.78E-17	YES	1_1	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	11	127318232	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	41	9	22	36	0	0	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.914760915	0.914760915	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.92E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	127508299	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	49	7	14.3	43	2	4.7	34	5	14.7	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.594594595	0.594594595	1	0.151297744	1.171748048	0.129121397	0.479109779	0.696561087	0.687821625	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.58E-09	1	0.019709573	1	0.000000771	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	127632866	T	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	35	11	31.4	38	1	2.6	48	15	31.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	1.305613306	1.305613306	1	0.083696625	NA	0	1.016886061	1.016886061	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.82E-17	1	0.173434892	1	2.86E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	127687677	C	T	-	-	-	-	-	-	54	0	0	48	8	16.7	42	0	0	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.694386694	0.694386694	1	0	0	1	0.065185004	0.065185004	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.23E-10	1	1	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	127817733	A	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	48	11	22.9	46	0	0	58	11	19	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.952182952	0.952182952	1	0	0	1	0.619257537	0.900317051	0.687821625	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.31E-16	1	1	1	8.96E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	128051210	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	44	0	0	34	9	26.5	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0	0	1	0.853061751	0.853061751	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.15E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	128368957	C	G	ETS1	CCDS8475.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	36	0	0	47	0	0	54	9	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0	0	1	0	0	1	0.544294783	0.791331303	0.687821625	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	8.48E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	128492658	G	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	33	0	0	38	11	28.9	42	1	2.4	342	1	0.3	174	0	0	129	37	28.7	151	7	4.6	TRUE	TRUE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0	0	1	0.930320174	0.930320174	1	0.078222005	0.078222005	1	0	0	1	0.923881972	0.923881972	1	0.149925509	0.149925509	1	2	1	1	0.819908334	1	1	5.19E-17	1.35E-53	0.189842622	0.0000129	YES	0_0	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	11	131218769	C	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	35	0	0	37	8	21.6	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0	0	1	0.695325804	0.695325804	1	0.074962755	0.074962755	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.33E-11	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	131820079	C	A	OPCML	CCDS8491.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	31	6	19.4	41	0	0	38	0	0	227	1	0.4	107	19	17.8	62	0	0	71	0	0	TRUE	TRUE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.806652807	0.806652807	1	0	0	1	0	0	1	0.74012474	0.74012474	1	0	0	1	0	0	1	6	4	1	0.679491664	1.03E-08	6.82E-24	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	11	131957546	G	T	OPCML	CCDS8491.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	46	0	0	55	13	23.6	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0	0	1	0.759707823	0.759707823	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.46E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	132028730	C	T	OPCML	CCDS8491.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	47	0	0	42	0	0	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0	0	1	0	0	1	0.361776772	0.525974698	0.687821625	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	132737989	G	A	ENSG00000183715	CCDS8492.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	43	5	11.6	32	1	3.1	36	8	22.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.482328482	0.482328482	1	0.099792129	0.099792129	1	0.723553544	0.723553544	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	0.00000257	1	0.14819814	1	1.04E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	132764677	G	A	ENSG00000183715	CCDS8492.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	36	8	22.2	37	0	0	40	9	22.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.923076923	0.923076923	1	0	0	1	0.733331294	0.733331294	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.04E-11	1	1	1	4.64E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	132917483	C	A	ENSG00000183715	CCDS31722.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	35	0	0	42	10	23.8	38	3	7.9	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0	0	1	0.766146025	0.766146025	1	0.257480766	0.374342353	0.687821625	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.24E-14	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	132996281	C	T	ENSG00000183715	CCDS31722.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	46	6	13	41	0	0	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.540540541	0.540540541	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000000123	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	133083341	G	A	ENSG00000183715	CCDS31722.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	50	12	24	43	0	0	39	0	0	176	0	0	145	23	15.9	58	0	0	93	2	2.2	TRUE	TRUE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	0.997920998	0.997920998	1	0	0	1	0	0	1	0.661122661	0.661122661	1	0	0	1	0.071703504	0.071703504	1	6	4	1	1	2.49E-17	2.09E-27	1	1	1	0.079388736	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	11	133640862	C	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	45	12	26.7	41	9	22	51	16	31.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	1.11018711	1.11018711	1	0.708202208	0.708202208	1	1.023404562	1.023404562	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.03E-18	1	5.92E-13	1	9.28E-25	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	11	133838833	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	57	14	24.6	40	2	5	33	6	18.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.129121397	1.687821625	1	1	1	1	0	0	1	0.870878603	0.312178375	NA	1	1	NA	1	1	NA	0.129121397	0.687821625	1.022869023	1.022869023	1	0.160955047	1.246540477	0.129121397	0.593183536	0.593183536	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.84E-20	1	0.017193422	1	1.54E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	1431970	C	T	ERC1	CCDS8508.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	57	13	22.8	49	2	4.1	40	5	12.5	498	2	0.4	171	31	18.1	69	2	2.9	105	23	21.9	TRUE	TRUE	2	2	1.766892779	1	1	1	1	1	0	1	1	0.233107221	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.766892779	0.948024948	0.948024948	1	0.167689162	0.167689162	1	0.417290169	0.544131045	0.766892779	0.752598753	0.752598753	1	0.118609407	0.118609407	1	0.731092376	0.95331759	0.766892779	7	6	1	0.711414894	2.44E-18	2.65E-38	0.025168485	0.04704084	0.00000178	7.08E-31	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	1481668	G	A	ERC1	CCDS8508.1	r.?	-	-	intronic	50	0	0	36	5	13.9	62	1	1.6	54	13	24.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.766892779	1	1	1	1	1	0	1	1	0.233107221	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.766892779	0.577962578	0.577962578	1	0.065439673	0.065439673	1	0.804535445	0.804535445	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	0.00000104	1	0.267123145	1	1.12E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	3089902	T	A	TEAD4	CCDS31729.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	34	5	14.7	36	5	13.9	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.766892779	1	1	1	1	1	0	1	1	0.233107221	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.766892779	0.611226611	0.611226611	1	0.568507157	0.568507157	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000000771	1	0.00000104	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	4277417	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	37	0	0	52	6	11.5	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.766892779	1	1	1	1	1	0	1	1	0.233107221	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.766892779	0	0	1	0.470347648	0.470347648	1	0.076781391	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.000000261	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	4291124	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	49	0	0	46	8	17.4	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.766892779	1	1	1	1	1	0	1	1	0.233107221	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.766892779	0	0	1	0.711656442	0.711656442	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	8.61E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	4841076	G	A	GALNT8	CCDS8533.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	45	0	0	47	10	21.3	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.766892779	1	1	1	1	1	0	1	1	0.233107221	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.766892779	0	0	1	0.871165644	0.871165644	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	4.27E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	5046034	G	A	-	-	-	-	-	-	49	0	0	49	0	0	45	12	26.7	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.766892779	1	1	1	1	1	0	1	1	0.233107221	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.766892779	0	0	1	1.09202454	1.09202454	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	6.03E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	5921558	G	A	ANO2	CCDS44807.1	r.?	-	-	intronic	17	0	0	24	5	20.8	28	6	21.4	26	1	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.766892779	1	1	1	1	1	0	1	1	0.233107221	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.766892779	0.864864865	0.864864865	1	0.875255624	0.875255624	1	0.126856211	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000000123	1	5.36E-09	1	0.122190858	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	10889517	G	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	49	11	22.4	56	16	28.6	43	12	27.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.766892779	1	1	1	1	1	0	1	1	0.233107221	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.766892779	0.931392931	0.931392931	1	1.169734151	1.169734151	1	0.931391657	0.931391657	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	1.19E-15	1	5.26E-24	1	3.24E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	14301189	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	37	0	0	47	10	21.3	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.766892779	1	1	1	1	1	0	1	1	0.233107221	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.766892779	0	0	1	0.871165644	0.871165644	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	4.27E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	16128949	G	A	DERA	CCDS44838.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	47	6	12.8	52	0	0	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.766892779	1	1	1	1	1	0	1	1	0.233107221	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.766892779	0.532224532	0.532224532	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000000141	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	16198492	G	T	-	-	-	-	-	-	32	1	3.1	50	13	26	64	1	1.6	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.766892779	1	1	1	1	1	0	1	1	0.233107221	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.766892779	1.081081081	1.081081081	1	0.065439673	0.065439673	1	0.327155492	0.426598739	0.766892779	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	0.14819814	1	3.65E-19	1	0.274433592	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	19585695	T	C	-	-	-	-	-	-	28	0	0	49	12	24.5	45	4	8.9	38	10	26.3	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.766892779	1	1	1	1	1	0	1	1	0.233107221	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.766892779	1.018711019	1.018711019	1	0.36400818	0.36400818	1	0.877978515	0.877978515	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.90E-17	1	0.0000791	1	4.06E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	21860504	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	37	9	24.3	38	1	2.6	49	5	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.766892779	1	1	1	1	1	0	1	1	0.233107221	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.766892779	1.01039501	1.01039501	1	0.106339468	0.106339468	1	0.340508778	0.444010932	0.766892779	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	2.14E-13	1	0.173434892	1	0.00000496	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	24256002	C	G	-	-	-	-	-	-	42	0	0	51	14	27.5	42	9	21.4	39	12	30.8	232	0	0	161	39	24.2	93	30	32.3	101	24	23.8	TRUE	TRUE	2	2	1.766892779	1	1	1	1	1	0	1	1	0.233107221	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.766892779	1.143451143	1.143451143	1	0.875255624	0.875255624	1	1.028202976	1.028202976	1	1.006237006	1.006237006	1	1.321063395	1.321063395	1	0.794520481	0.794520481	1	8	7	1	1	6.64E-21	3.78E-53	7.51E-13	1.51E-45	8.43E-19	4.31E-33	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	24698502	A	G	-	-	-	-	-	-	48	0	0	38	6	15.8	58	0	0	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.766892779	1	1	1	1	1	0	1	1	0.233107221	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.766892779	0.656964657	0.656964657	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	3.76E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	25442798	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	47	12	25.5	64	3	4.7	45	13	28.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.766892779	1	1	1	1	1	0	1	1	0.233107221	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.766892779	1.06029106	1.06029106	1	0.192229039	0.192229039	1	0.96477487	0.96477487	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.09E-17	1	0.004148608	1	7.68E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	25875015	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	42	0	0	48	14	29.2	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.766892779	1	1	1	1	1	0	1	1	0.233107221	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.766892779	0	0	1	1.194274029	1.194274029	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	2.51E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	28151445	T	C	-	-	-	-	-	-	37	0	0	49	0	0	56	10	17.9	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.766892779	1	1	1	1	1	0	1	1	0.233107221	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.766892779	0	0	1	0.732106339	0.732106339	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	2.82E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	28959882	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	38	11	28.9	54	3	5.6	36	9	25	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.766892779	1	1	1	1	1	0	1	1	0.233107221	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.766892779	1.201663202	1.201663202	1	0.229038855	0.229038855	1	0.834580338	0.834580338	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	5.19E-17	1	0.00256299	1	1.63E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	29030447	G	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	44	0	0	53	10	18.9	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.766892779	1	1	1	1	1	0	1	1	0.233107221	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.766892779	0	0	1	0.773006135	0.773006135	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.57E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	32199211	G	T	-	-	-	-	-	-	21	0	0	34	0	0	44	0	0	30	3	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.357142857	0.357142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.000458697	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	32442220	T	C	BICD1	CCDS8726.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	42	0	0	63	13	20.6	59	1	1.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.842535787	0.842535787	1	0.060714286	0.060714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.01E-17	1	0.256019138	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	33996254	G	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	48	9	18.8	61	21	34.4	54	13	24.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.781704782	0.781704782	1	1.406952965	1.406952965	1	0.860714286	0.860714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.75E-12	1	4.80E-33	1	1.12E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	38627340	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	39	0	0	54	10	18.5	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.756646217	0.756646217	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.91E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	38808401	C	A	-	-	-	-	-	-	46	0	0	41	0	0	47	0	0	57	7	12.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.439285714	0.439285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	1.66E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	39350874	C	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	56	9	16.1	37	11	29.7	71	12	16.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.669438669	0.669438669	1	1.214723926	1.214723926	1	0.603571429	0.603571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.20E-11	1	3.70E-17	1	2.38E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	39399089	G	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	41	0	0	45	12	26.7	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.09202454	1.09202454	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.03E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	40071081	G	A	C12orf40	CCDS41770.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	51	17	33.3	66	3	4.5	42	10	23.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.384615385	1.384615385	1	0.18404908	0.18404908	1	0.85	0.85	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.59E-27	1	0.004522888	1	1.24E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	40899343	C	T	MUC19	ENST00000398702	r.?	-	-	intronic	45	0	0	46	14	30.4	72	0	0	64	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.264033264	1.264033264	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.26E-21	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	41062179	C	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	44	13	29.5	63	0	0	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.226611227	1.226611227	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.49E-20	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	42309984	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	44	0	0	43	11	25.6	68	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.047034765	1.047034765	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.42E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	43088028	G	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	48	9	18.8	49	0	0	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.781704782	0.781704782	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.75E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	43765159	T	A	ADAMTS20	ENST00000389420	r.?	-	-	intronic	40	0	0	35	5	14.3	42	0	0	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.594594595	0.594594595	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000000895	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	44110369	G	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	41	0	0	54	8	14.8	34	5	14.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.605316973	0.605316973	1	0.525	0.525	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	3.31E-10	1	0.000000771	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	45522879	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	45	8	17.8	59	2	3.4	35	9	25.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.74012474	0.74012474	1	0.139059305	0.139059305	1	0.917857143	0.917857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.14E-11	1	0.035441897	1	1.23E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	46818389	G	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	35	10	28.6	38	0	0	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.189189189	1.189189189	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.60E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	47106628	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	37	0	0	42	0	0	39	5	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.457142857	0.457142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	47854951	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	47	0	0	39	9	23.1	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.944785276	0.944785276	1	0.078571429	0.078571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.62E-13	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	47881384	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	52	0	0	51	0	0	62	9	14.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.517857143	0.517857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	3.12E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	49230031	G	A	DDX23	CCDS8770.1	r.1346c>u	c.1255C>T	p.R419C	missense	42	0	0	44	0	0	46	12	26.1	49	0	0	261	1	0.4	157	2	1.3	109	11	10.1	140	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.067484663	1.067484663	1	0	0	1	0.054054054	0.054054054	1	0.413087935	0.413087935	1	0	0	1	2	1	1	0.729713674	1	0.18563219	8.12E-18	1.20E-11	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	49634524	C	T	-	-	-	-	-	-	50	0	0	40	11	27.5	55	3	5.5	47	6	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.143451143	1.143451143	1	0.224948875	0.224948875	1	0.457142857	0.457142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.88E-17	1	0.002700822	1	0.000000141	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	50902403	G	C	DIP2B	CCDS31799.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	38	6	15.8	61	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.656964657	0.656964657	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.76E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	51561357	G	C	TFCP2	CCDS8808.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	52	0	0	71	12	16.9	52	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.691206544	0.691206544	1	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.38E-15	1	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	54710233	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	47	9	19.1	54	1	1.9	37	6	16.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.794178794	0.794178794	1	0.077709611	0.077709611	1	0.578571429	0.578571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.24E-12	1	0.237137336	1	3.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	56289620	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	38	9	23.7	50	0	0	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.985446985	0.985446985	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.79E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	57356840	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	39	0	0	52	14	26.9	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.100204499	1.100204499	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.04E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	57852871	C	A	GLI1	CCDS8940.1	r.?	-	-	upstream	47	0	0	33	0	0	63	9	14.3	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.584867076	0.584867076	1	0.075	0.075	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.62E-11	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	58785681	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	36	11	30.6	42	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.272349272	1.272349272	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.62E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	60135791	C	T	SLC16A7	CCDS8961.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	48	9	18.8	59	4	6.8	50	6	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.781704782	0.781704782	1	0.278118609	0.278118609	1	0.428571429	0.428571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.75E-12	1	0.00022841	1	0.000000206	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	60688032	C	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	42	0	0	47	8	17	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.695296524	0.695296524	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.03E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	62290156	G	T	FAM19A2	CCDS8962.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	57	8	14	72	0	0	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.860823931	2	1	1	1	1	1	1	1	0.139176069	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.860823931	NA	0.582120582	0.582120582	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.19E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	62747248	T	C	USP15	CCDS8963.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	44	12	27.3	68	1	1.5	47	9	19.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.860823931	2	1	1	1	1	1	1	1	0.139176069	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.860823931	NA	1.135135135	1.135135135	1	0.074262052	0.074262052	1	0.682142857	0.682142857	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.44E-18	1	0.288836448	1	2.24E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	65775826	C	G	MSRB3	CCDS31853.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	44	0	0	66	8	12.1	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.860823931	2	1	1	1	1	1	1	1	0.139176069	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.860823931	NA	0	0	1	0.599047221	0.599047221	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.73E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	67797258	G	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	56	12	21.4	70	38	54.3	57	13	22.8	218	1	0.5	153	30	19.6	114	41	36	108	22	20.4	TRUE	TRUE	2	2.860823931	2	1	1	1	1	1	1	1	0.139176069	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.860823931	NA	0.88981289	0.88981289	1	2.68828629	1.444675257	1.860823931	0.814285714	0.814285714	1	0.814968815	0.814968815	1	1.782289253	0.95779575	1.860823931	0.728571429	0.728571429	1	8	5	1	0.664701506	1.11E-16	3.19E-38	2.71E-68	5.41E-64	2.44E-18	7.68E-29	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	68001498	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	42	9	21.4	47	0	0	47	6	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.860823931	2	1	1	1	1	1	1	1	0.139176069	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.860823931	NA	0.88981289	0.88981289	1	0	0	1	0.457142857	0.457142857	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.51E-13	1	1	1	0.000000141	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	68498286	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	51	0	0	45	10	22.2	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.860823931	2	1	1	1	1	1	1	1	0.139176069	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.860823931	NA	0	0	1	1.099078373	1.099078373	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.66E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	69769857	C	T	YEATS4	CCDS8990.1	r.?	-	-	intronic	49	0	0	51	0	0	71	12	16.9	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.960418144	0.960418144	1	0.078571429	0.078571429	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.38E-15	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	69770317	C	T	YEATS4	CCDS8990.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	36	0	0	63	7	11.1	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.630807184	0.630807184	1	0.089285714	0.089285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.38E-08	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	69771759	C	G	YEATS4	CCDS8990.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	45	0	0	66	11	16.7	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.949052249	0.949052249	1	0.082142857	0.082142857	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.07E-14	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	69771934	C	G	YEATS4	CCDS8990.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	50	0	0	70	9	12.9	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.73310024	0.73310024	1	0.092857143	0.092857143	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.65E-11	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	69772005	C	G	YEATS4	CCDS8990.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	43	0	0	85	12	14.1	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.801295612	0.801295612	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.29E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	69772431	C	T	YEATS4	CCDS8990.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	39	0	0	63	7	11.1	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.630807184	0.630807184	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.38E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	69773059	C	T	YEATS4	CCDS8990.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	55	0	0	68	10	14.7	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.835393297	0.835393297	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.18E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	69773231	C	T	YEATS4	CCDS8990.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	45	0	0	53	12	22.6	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	1.284346158	1.284346158	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.39E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	69773713	C	G	YEATS4	CCDS8990.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	40	0	0	51	5	9.8	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.556928865	0.556928865	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000606	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	70127555	G	T	AC025263.1	ENST00000501387	r.?	-	-	intronic	36	0	0	48	0	0	69	12	17.4	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.988832882	0.988832882	1	0.085714286	0.085714286	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.65E-15	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	71177186	C	A	PTPRR	CCDS8998.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	45	10	22.2	80	0	0	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0.923076923	0.923076923	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.66E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	71706687	G	A	TSPAN8	CCDS8999.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	50	0	0	63	11	17.5	55	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.99451583	0.99451583	1	0.064285714	0.064285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.37E-14	1	0.240951649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	71707051	G	A	TSPAN8	CCDS8999.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	42	0	0	62	13	21	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	1.193418996	1.193418996	1	0.082142857	0.082142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.08E-18	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	71707197	G	C	TSPAN8	CCDS8999.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	49	0	0	67	10	14.9	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.846759192	0.846759192	1	0.078571429	0.078571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.87E-12	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	71708395	G	C	TSPAN8	CCDS8999.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	52	0	0	68	8	11.8	58	1	1.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.670587817	0.670587817	1	0.060714286	0.060714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.21E-09	1	0.252280541	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	71708458	G	A	TSPAN8	CCDS8999.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	40	0	0	67	8	11.9	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.676270764	0.676270764	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.96E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	71708654	G	A	TSPAN8	CCDS8999.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	37	0	0	61	7	11.5	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.653538974	0.653538974	1	0.071428571	0.071428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.69E-08	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	71709181	G	C	TSPAN8	CCDS8999.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	38	0	0	63	5	7.9	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.44895286	0.757128247	0.59296805	0.092857143	0.092857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000173	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	71709598	C	A	TSPAN8	CCDS8999.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	33	0	0	62	7	11.3	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.642173079	0.642173079	1	0.075	0.075	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.02E-08	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	71709851	C	G	TSPAN8	CCDS8999.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	46	0	0	71	9	12.7	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.721734345	0.721734345	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.10E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	71867314	G	A	LGR5	CCDS9000.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	30	0	0	62	10	16.1	50	0	0	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.914954564	0.914954564	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.29E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	71867330	G	A	LGR5	CCDS9000.1	r.?	-	-	intronic	49	0	0	35	0	0	61	12	19.7	48	0	0	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	1.119540677	1.119540677	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.39E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	71867567	G	A	LGR5	CCDS9000.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	37	0	0	67	9	13.4	59	0	0	109	0	0	124	0	0	85	10	11.8	60	0	0	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.761514978	0.761514978	1	0	0	1	0	NA	0	0.670587817	0.670587817	1	0	0	1	2	NA	1	1	1	1	6.43E-11	2.17E-11	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	71867692	G	C	LGR5	CCDS9000.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	36	0	0	62	13	21	46	0	0	122	0	0	132	0	0	89	7	7.9	81	2	2.5	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	1.193418996	1.193418996	1	0	0	1	0	NA	0	0.44895286	0.757128247	0.59296805	0.089285714	0.089285714	1	2	NA	1	1	1	1	8.08E-18	0.000000376	1	0.062493051	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	71867813	G	A	LGR5	CCDS9000.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	45	0	0	67	8	11.9	54	1	1.9	9	0	0	7	0	0	2	0	0	5	0	0	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.676270764	0.676270764	1	0.067857143	0.067857143	1	0	NA	0	0	0	1	0	0	1	2	NA	1	1	1	1	1.96E-09	1	0.237137336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	71868014	G	A	LGR5	CCDS9000.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	54	0	0	60	7	11.7	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.664904869	0.664904869	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.39E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	71868772	G	A	LGR5	CCDS9000.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	43	0	0	68	10	14.7	52	0	0	167	0	0	186	0	0	115	16	13.9	136	0	0	TRUE	TRUE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.835393297	0.835393297	1	0	0	1	0	0	1	0.789929716	0.789929716	1	0	0	1	2	1	1	1	1	1	2.18E-12	1.43E-18	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	71868807	G	C	LGR5	CCDS9000.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	51	0	0	62	9	14.5	42	0	0	163	0	0	188	1	0.5	109	18	16.5	139	0	0	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.824027402	0.824027402	1	0	0	1	0.020790021	NA	0	0.937686354	0.937686354	1	0	0	1	2	NA	1	1	1	0.610292126	3.12E-11	4.13E-22	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	71869512	G	A	LGR5	CCDS9000.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	26	0	0	81	10	12.3	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.699002555	0.699002555	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.33E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	71869725	G	A	LGR5	CCDS9000.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	40	0	0	73	7	9.6	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.54556297	0.54556297	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.54E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	71869733	G	C	LGR5	CCDS9000.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	40	0	0	67	6	9	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.511465284	0.862551167	0.59296805	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000012	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	71880939	G	A	LGR5	CCDS9000.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	53	0	0	83	13	15.7	60	2	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.892222773	0.892222773	1	0.117857143	0.117857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.66E-16	1	0.036544784	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	71971146	C	G	LGR5	CCDS9000.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	42	0	0	66	14	21.2	46	1	2.2	360	1	0.3	192	0	0	103	24	23.3	121	2	1.7	TRUE	TRUE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	1.204784891	1.204784891	1	0.078571429	0.078571429	1	0	0	1	1.324126791	1.324126791	1	0.060714286	0.060714286	1	2	1	1	0.835445763	1	1	3.71E-19	7.27E-33	0.205924651	0.123221943	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	71971188	C	G	LGR5	CCDS9000.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	58	0	0	75	10	13.3	48	1	2.1	429	0	0	218	0	0	133	21	15.8	123	1	0.8	TRUE	TRUE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.755832031	0.755832031	1	0.075	0.075	1	0	0	1	0.897905721	0.897905721	1	0.028571429	0.028571429	1	2	1	1	1	1	1	6.02E-12	4.12E-25	0.213845552	0.460192478	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	71971214	C	T	LGR5	CCDS9000.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	63	0	0	79	8	10.1	56	1	1.8	446	1	0.2	218	0	0	127	20	15.7	124	2	1.6	TRUE	TRUE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.573977708	0.573977708	1	0.064285714	0.064285714	1	0	0	1	0.892222773	0.892222773	1	0.057142857	0.057142857	1	2	1	1	0.893071368	1	1	7.43E-09	5.78E-24	0.244746891	0.128210852	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	71972115	C	T	LGR5	CCDS9000.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	59	0	0	82	8	9.8	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.556928865	0.939222382	0.59296805	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	0.00000001	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72690245	G	C	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	45	0	0	77	10	13	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.738783188	0.738783188	1	0.075	0.075	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	7.90E-12	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72690587	G	A	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	52	0	0	81	6	7.4	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	0.420538122	0.709208738	0.59296805	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.00000368	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72690684	G	A	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	45	0	0	63	15	23.8	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	1.352541529	1.352541529	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	2.97E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72691001	G	A	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	42	0	0	63	7	11.1	46	1	2.2	194	0	0	157	0	0	146	17	11.6	147	2	1.4	TRUE	TRUE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.630807184	0.630807184	1	0.078571429	0.078571429	1	0	0	1	0.659221922	1.111732616	0.59296805	0.05	0.05	1	2	1	1	1	1	1	3.38E-08	2.75E-18	0.205924651	0.167822648	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72691002	A	C	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	41	0	0	63	7	11.1	46	1	2.2	195	1	0.5	158	0	0	149	19	12.8	149	0	0	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.630807184	0.630807184	1	0.078571429	0.078571429	1	0	0	1	0.727417293	0.727417293	1	0	NA	0	2	NA	1	0.623729002	1	1	3.38E-08	4.98E-21	0.205924651	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72691100	G	C	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	44	0	0	56	11	19.6	37	0	0	274	1	0.4	222	1	0.5	180	27	15	188	0	0	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	1.11385773	1.11385773	1	0	0	1	0.020790021	NA	0	0.85244214	0.85244214	1	0	NA	0	NA	NA	1	0.74676477	1	0.671357349	5.91E-15	3.27E-31	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72691122	G	C	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	39	0	0	51	10	19.6	41	0	0	276	0	0	222	0	0	167	24	14.4	184	0	0	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	1.11385773	1.11385773	1	0	0	1	0	0	1	0.818344454	0.818344454	1	0	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.04E-13	1.88E-27	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72698515	G	C	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	46	0	0	69	7	10.1	42	0	0	394	0	0	198	0	0	140	31	22.1	122	0	0	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	0.573977708	0.573977708	1	0	0	1	0	0	1	1.25593142	1.25593142	1	0	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	6.43E-08	3.11E-41	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72698580	G	A	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	45	0	0	63	9	14.3	57	0	0	411	1	0.2	191	1	0.5	128	24	18.8	130	0	0	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.812661507	0.812661507	1	0	0	1	0.020790021	NA	0	1.068394149	1.068394149	1	0	NA	0	2	NA	1	0.872565744	1	0.616108565	3.62E-11	2.18E-30	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72698870	G	C	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	56	0	0	76	11	14.5	51	0	0	2	0	0	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	0.824027402	0.824027402	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	2.08E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72699210	G	T	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	52	0	0	69	10	14.5	52	0	0	537	1	0.2	219	2	0.9	127	29	22.8	146	3	2.1	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	0.824027402	0.824027402	1	0	0	1	0.037422037	NA	0	1.295712053	1.295712053	1	0.075	0.075	1	NA	NA	1	0.932236729	1	0.299226148	2.54E-12	4.19E-39	1	0.037483678	YES	0_0	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72699219	G	A	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	44	0	0	73	13	17.8	50	1	2	548	0	0	214	1	0.5	131	27	20.6	153	7	4.6	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	1.011564673	1.011564673	1	0.071428571	0.071428571	1	0.020790021	NA	0	1.170687206	1.170687206	1	0.164285714	0.164285714	1	NA	NA	1	1	1	0.657910866	7.97E-17	3.41E-35	0.221687443	0.000014	YES	0_0	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72699275	G	A	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	43	0	0	77	9	11.7	43	0	0	583	0	0	232	0	0	134	25	18.7	154	5	3.2	FALSE	TRUE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	0.664904869	0.664904869	1	0	0	1	0	0	1	1.062711201	1.062711201	1	0.114285714	0.114285714	1	NA	1	1	1	1	1	2.32E-10	1.57E-31	1	0.001140514	YES	0_0	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72699300	G	A	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	40	0	0	69	6	8.7	34	0	0	543	2	0.4	226	0	0	134	21	15.7	140	4	2.9	FALSE	TRUE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	0.494416441	0.833799462	0.59296805	0	0	1	0	0	1	0.892222773	0.892222773	1	0.103571429	0.103571429	1	NA	1	1	0.754820772	1	1	0.00000143	4.86E-25	1	0.005590685	YES	0_0	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72806513	C	G	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	64	12	18.8	81	0	0	49	0	0	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0.781704782	0.781704782	1	0	0	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	6	NA	1	1	6.30E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72810032	C	T	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	62	0	0	79	13	16.5	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	0.937686354	0.937686354	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	2.37E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72810085	C	T	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	50	0	0	72	17	23.6	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	1.341175634	1.341175634	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	7.97E-24	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72810204	C	G	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	47	0	0	72	13	18.1	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	1.028613516	1.028613516	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	6.58E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72810423	C	T	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	42	0	0	71	8	11.3	62	1	1.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	0.642173079	0.642173079	1	0.057142857	0.057142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	3.14E-09	1	0.267123145	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72810424	C	G	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	50	0	0	43	0	0	69	8	11.6	62	1	1.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	0.659221922	0.659221922	1	0.057142857	0.057142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	2.49E-09	1	0.267123145	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72810678	C	T	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	48	0	0	76	8	10.5	43	0	0	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.596709498	0.596709498	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	5.44E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72810935	C	G	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	58	0	0	52	9	17.3	52	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.983149935	0.983149935	1	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	5.92E-12	1	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72811438	C	A	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	54	0	0	83	12	14.5	46	0	0	304	2	0.7	147	0	0	114	16	14	98	1	1	TRUE	TRUE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.824027402	0.824027402	1	0	0	1	0	0	1	0.795612664	0.795612664	1	0.035714286	0.035714286	1	2	1	1	0.449279231	1	1	1.70E-14	1.24E-18	1	0.388126122	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72811507	C	T	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	66	0	0	70	12	17.1	53	1	1.9	264	0	0	161	0	0	96	9	9.4	104	0	0	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.97178404	0.97178404	1	0.067857143	0.067857143	1	0	0	1	0.534197074	0.900886775	0.59296805	0	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.99E-15	1.71E-09	0.233303855	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72811905	C	G	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	51	0	0	83	11	13.3	57	0	0	215	0	0	173	0	0	102	12	11.8	82	0	0	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.755832031	0.755832031	1	0	0	1	0	0	1	0.670587817	0.670587817	1	0	NA	0	2	NA	1	1	1	1	5.66E-13	2.18E-13	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72811959	C	G	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	49	0	0	72	8	11.1	57	0	0	187	0	0	166	0	0	77	11	14.3	86	2	2.3	TRUE	TRUE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.630807184	0.630807184	1	0	0	1	0	0	1	0.812661507	0.812661507	1	0.082142857	0.082142857	1	2	1	1	1	1	1	3.52E-09	2.41E-13	1	0.069370687	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72812252	C	T	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	40	1	2.5	89	14	15.7	64	1	1.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0.103950104	NA	0	0.892222773	0.892222773	1	0.057142857	0.057142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.181679879	1	3.28E-17	1	0.274433592	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72812490	C	T	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	37	0	0	88	12	13.6	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.772880874	0.772880874	1	0.071428571	0.071428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	3.53E-14	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72812594	C	G	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	50	0	0	40	0	0	74	10	13.5	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	0.767197926	0.767197926	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	5.24E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72812878	C	T	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	47	0	0	76	8	10.5	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	0.596709498	0.596709498	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	5.44E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72813215	C	T	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	39	0	0	71	12	16.9	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	0.960418144	0.960418144	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	2.38E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72813249	C	G	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	43	0	0	73	12	16.4	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.932003406	0.932003406	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	3.39E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72813490	C	T	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	52	0	0	75	15	20	52	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	1.13658952	1.13658952	1	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	5.25E-20	1	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72813853	C	T	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	56	0	0	61	12	19.7	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	1.119540677	1.119540677	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	3.39E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72814292	C	T	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	51	0	0	76	9	11.8	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.670587817	0.670587817	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	2.06E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72814841	C	T	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	49	0	0	68	8	11.8	54	1	1.9	214	0	0	124	0	0	156	10	6.4	119	0	0	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.670587817	0.670587817	1	0.067857143	0.067857143	1	0	0	1	0.363708646	0.613369719	0.59296805	0	NA	0	2	NA	1	1	1	1	2.21E-09	8.82E-09	0.237137336	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72814862	C	G	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	50	0	0	77	8	10.4	59	1	1.7	241	0	0	141	0	0	170	16	9.4	139	0	0	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.59102655	0.59102655	1	0.060714286	0.060714286	1	0	0	1	0.534197074	0.900886775	0.59296805	0	NA	0	2	NA	1	1	1	1	6.05E-09	8.29E-16	0.256019138	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72814919	C	T	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	46	0	0	81	11	13.6	58	0	0	248	0	0	173	0	0	164	25	15.2	145	1	0.7	FALSE	TRUE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	0.772880874	0.772880874	1	0	0	1	0	0	1	0.863808035	0.863808035	1	0.025	0.025	1	NA	1	1	1	1	1	4.29E-13	3.36E-29	1	0.516555406	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72816897	C	G	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	49	0	0	40	0	0	79	14	17.7	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	1.005881725	1.005881725	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	5.60E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72817215	C	T	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	43	0	0	66	6	9.1	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.517148232	0.872135069	0.59296805	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	0.0000011	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72818725	A	C	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	51	0	0	67	8	11.9	40	0	0	131	0	0	135	0	0	67	14	20.9	88	0	0	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.676270764	0.676270764	1	0	0	1	0	0	1	1.187736048	1.187736048	1	0	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.96E-09	4.66E-19	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72818728	C	T	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	51	0	0	66	8	12.1	39	0	0	129	0	0	136	1	0.7	70	16	22.9	88	0	0	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	0.68763666	0.68763666	1	0	0	1	0.029106029	NA	0	1.301395	1.301395	1	0	NA	0	NA	NA	1	1	1	0.494246402	1.73E-09	2.93E-22	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72819954	C	G	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	43	0	0	78	13	16.7	63	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	0.949052249	0.949052249	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.99E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72820929	C	T	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	57	0	0	68	8	11.8	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.670587817	0.670587817	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	2.21E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72822252	C	T	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	41	0	0	67	10	14.9	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.846759192	0.846759192	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.87E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72834261	G	A	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	52	0	0	70	15	21.4	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	1.216150786	1.216150786	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.70E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72838435	G	C	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	41	0	0	77	19	24.7	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	1.403688057	1.403688057	1	0.075	0.075	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	7.35E-27	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72838915	G	A	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	55	0	0	86	12	14	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	0.795612664	0.795612664	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	2.65E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72897390	G	A	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	52	0	0	86	17	19.8	49	1	2	293	0	0	198	0	0	104	15	14.4	103	0	0	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	1.125223625	1.125223625	1	0.071428571	0.071428571	1	0	0	1	0.818344454	0.818344454	1	0	NA	0	2	NA	1	1	1	1	2.19E-22	9.59E-18	0.217776325	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72897562	G	C	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	53	0	0	47	0	0	76	17	22.4	43	0	0	351	0	0	218	0	0	176	25	14.2	144	0	0	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	1.272980262	1.272980262	1	0	0	1	0	0	1	0.806978559	0.806978559	1	0	NA	0	2	NA	1	1	1	1	2.21E-23	2.13E-28	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72897572	G	A	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	50	0	0	49	0	0	78	16	20.5	40	0	0	334	0	0	209	1	0.5	171	21	12.3	147	0	0	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	1.165004258	1.165004258	1	0	0	1	0.020790021	NA	0	0.699002555	1.178819929	0.59296805	0	NA	0	NA	NA	1	1	1	0.649228843	1.96E-21	9.90E-23	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72897597	G	A	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	47	0	0	83	12	14.5	44	0	0	302	0	0	190	0	0	162	20	12.3	127	0	0	FALSE	TRUE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	0.824027402	0.824027402	1	0	0	1	0	0	1	0.699002555	1.178819929	0.59296805	0	0	1	NA	1	1	1	1	1	1.70E-14	9.08E-22	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72897729	G	A	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	41	0	0	70	8	11.4	44	0	0	133	0	0	82	1	1.2	75	8	10.7	76	0	0	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.647856026	0.647856026	1	0	0	1	0.04989605	NA	0	0.608075393	0.608075393	1	0	NA	0	2	NA	1	1	1	0.337031917	2.80E-09	4.89E-09	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72897768	G	A	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	42	0	0	68	10	14.7	41	0	0	167	0	0	94	0	0	85	11	12.9	77	1	1.3	FALSE	TRUE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	0.835393297	0.835393297	1	0	0	1	0	0	1	0.73310024	0.73310024	1	0.046428571	0.046428571	1	NA	1	1	1	1	1	2.18E-12	7.42E-13	1	0.320206172	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72897799	G	A	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	48	0	0	72	13	18.1	41	0	0	202	0	0	134	1	0.7	97	19	19.6	87	0	0	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	1.028613516	1.028613516	1	0	0	1	0.029106029	NA	0	1.11385773	1.11385773	1	0	NA	0	2	NA	1	1	1	0.48915068	6.58E-17	9.19E-25	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72897858	G	C	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	58	0	0	50	0	0	76	15	19.7	49	0	0	305	0	0	191	0	0	144	24	16.7	123	0	0	FALSE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	NA	0	1.119540677	1.119540677	1	0	0	1	0	0	1	0.949052249	0.949052249	1	0	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	6.51E-20	4.48E-29	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72897922	G	C	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	42	0	0	79	13	16.5	46	0	0	302	0	0	236	0	0	146	21	14.4	140	0	0	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.937686354	0.937686354	1	0	0	1	0	0	1	0.818344454	0.818344454	1	0	NA	0	2	NA	1	1	1	1	2.37E-16	3.20E-24	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	72899876	C	T	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	48	1	2.1	76	11	14.5	51	2	3.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0.087318087	0.087318087	1	0.824027402	0.824027402	1	0.139285714	0.139285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	0.213845552	1	2.08E-13	1	0.027109304	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72900570	C	A	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	34	0	0	69	7	10.1	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.573977708	0.573977708	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.43E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72905591	C	T	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	41	0	0	92	14	15.2	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	0	0	1	0.863808035	0.863808035	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	5.34E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	72910424	C	G	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	35	13	37.1	56	0	0	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.59296805	2	1	2	1	1	1	1	1	0.40703195	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.59296805	NA	1.542619543	1.542619543	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	6	NA	1	1	1.63E-21	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	74343063	C	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	48	0	0	56	8	14.3	44	1	2.3	286	1	0.3	162	1	0.6	102	13	12.7	97	0	0	TRUE	FALSE	2	2.838437767	2	1	1	1	1	1	1	1	0.161562233	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.838437767	NA	0	0	1	0.704763676	0.704763676	1	0.082142857	0.082142857	1	0.024948025	NA	0	0.625908999	0.746518136	0.838437767	0	0	1	2	NA	1	0.761547932	1	0.556044868	4.48E-10	7.55E-15	0.197923942	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	74343090	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	49	0	0	62	7	11.3	46	0	0	317	0	0	177	0	0	111	11	9.9	105	0	0	TRUE	TRUE	2	2.838437767	2	1	1	1	1	1	1	1	0.161562233	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.838437767	NA	0	0	1	0.556911157	0.556911157	1	0	0	1	0	0	1	0.487913314	0.581931461	0.838437767	0	0	1	2	1	1	1	1	1	3.02E-08	1.46E-11	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	74343154	C	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	39	0	0	68	7	10.3	46	0	0	316	1	0.3	178	0	0	107	14	13.1	101	0	0	TRUE	TRUE	2	2.838437767	2	1	1	1	1	1	1	1	0.161562233	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.838437767	NA	0	0	1	0.507626984	0.605443843	0.838437767	0	0	1	0	0	1	0.645622669	0.770030519	0.838437767	0	0	1	2	1	1	0.79483961	1	1	0.000000058	4.81E-16	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	74344544	C	G	-	-	-	-	-	-	32	0	0	35	0	0	58	7	12.1	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.838437767	2	1	1	1	1	1	1	1	0.161562233	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.838437767	NA	0	0	1	0.596338495	0.596338495	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.88E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	76701338	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	37	0	0	78	13	16.7	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.838437767	2	1	1	1	1	1	1	1	0.161562233	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.838437767	NA	0	0	1	0.823045692	0.823045692	1	0.210714286	0.210714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.99E-16	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	77298434	C	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	39	0	0	69	10	14.5	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	0.838021911	0.838021911	1	0.082142857	0.082142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.54E-12	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	77299539	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	40	0	0	63	13	20.6	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	1.190569059	1.190569059	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.01E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	77465805	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	45	11	24.4	59	0	0	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	1.014553015	1.014553015	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.24E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	77848397	T	G	-	-	-	-	-	-	38	0	0	48	0	0	68	10	14.7	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	0.849580833	0.849580833	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.18E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	79477252	G	A	SYT1	CCDS9017.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	41	16	39	70	5	7.1	55	11	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	1.621621622	1.621621622	1	0.410341763	0.595145082	0.689481902	0.714285714	0.714285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.40E-26	1	0.0000289	1	4.77E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	79729233	G	C	SYT1	CCDS9017.1	r.?	-	-	intronic	49	0	0	58	0	0	66	32	48.5	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	2.803038804	1.042222594	2.689481902	0.160714286	0.160714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.38E-55	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	79960967	C	A	-	-	-	-	-	-	59	0	0	59	7	11.9	87	0	0	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0.494802495	0.494802495	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.12E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	80093712	T	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	46	16	34.8	70	2	2.9	57	7	12.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	1.446985447	1.446985447	1	0.167604382	0.167604382	1	0.439285714	0.439285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.31E-25	1	0.048267597	1	1.66E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	80800872	T	C	-	-	-	-	-	-	30	0	0	38	4	10.5	52	14	26.9	43	8	18.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0.436590437	0.436590437	1	1.554675131	0.920208218	1.689481902	0.664285714	0.664285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.0000403	1	9.04E-21	1	4.85E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	81558057	G	A	ACSS3	CCDS9022.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	55	6	10.9	81	40	49.4	55	17	30.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0.453222453	0.453222453	1	2.855053957	1.061562807	2.689481902	1.103571429	1.103571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.000000367	1	1.58E-69	1	4.35E-26	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	83785095	G	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	42	0	0	62	12	19.4	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	1.121215522	1.121215522	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	4.19E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	83785133	G	C	-	-	-	-	-	-	42	0	0	48	0	0	80	18	22.5	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	1.300378827	1.300378827	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.01E-24	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	83785190	G	C	-	-	-	-	-	-	36	0	0	43	0	0	80	16	20	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	1.15589229	1.15589229	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	3.04E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	83785420	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	43	0	0	64	6	9.4	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	0.543269376	0.543269376	1	0.167857143	0.167857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000000914	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	83785891	G	A	-	-	-	-	-	-	48	0	0	52	0	0	75	11	14.7	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	0.849580833	0.849580833	1	0.075	0.075	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.78E-13	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	83786320	G	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	55	0	0	68	5	7.4	57	0	0	275	0	0	208	0	0	145	16	11	150	0	0	FALSE	TRUE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	0.427680147	0.620292057	0.689481902	0	0	1	0	0	1	0.63574076	0.922055761	0.689481902	0	0	1	NA	1	1	1	1	1	0.0000251	6.42E-17	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	83786346	G	C	-	-	-	-	-	-	41	0	0	56	0	0	66	6	9.1	62	0	0	291	0	0	222	1	0.5	154	17	11	146	0	0	TRUE	TRUE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	0.525930992	0.525930992	1	0	0	1	0.020790021	0.020790021	1	0.63574076	0.922055761	0.689481902	0	0	1	2	1	1	1	1	0.671357349	0.0000011	6.92E-18	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	83786799	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	43	0	0	87	12	13.8	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	0.79756568	0.79756568	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	3.06E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	83786916	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	48	0	0	80	13	16.2	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	0.936272755	0.936272755	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.82E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	84267995	G	A	-	-	-	-	-	-	48	0	0	57	0	0	54	11	20.4	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	1.179010136	1.179010136	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	3.84E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	85016019	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	46	0	0	80	25	31.2	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	1.803191973	1.067304699	1.689481902	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.31E-38	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	86405142	T	G	MGAT4C	CCDS9030.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	48	0	0	82	1	1.2	57	7	12.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	0.069353537	0.069353537	1	0.439285714	0.439285714	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.337031917	1	1.66E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	86482591	A	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	43	10	23.3	68	0	0	46	8	17.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0.968814969	0.968814969	1	0	0	1	0.621428571	0.621428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.61E-14	1	1	1	8.61E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	86999703	T	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	42	0	0	70	10	14.3	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	0.826462988	0.826462988	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.95E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	87238830	G	C	-	-	-	-	-	-	27	0	0	16	6	37.5	39	1	2.6	21	4	19	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	1.559251559	1.559251559	1	0.150265998	0.150265998	1	0.678571429	0.678571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.20E-10	1	0.177567718	1	0.00000349	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	87962483	C	G	-	-	-	-	-	-	51	0	0	50	0	0	72	7	9.7	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	0.560607761	0.560607761	1	0.103571429	0.103571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	8.66E-08	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	89918594	C	T	WDR51B	CCDS31869.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	39	0	0	81	8	9.9	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	0.572166684	0.572166684	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.08E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	90132837	C	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	47	0	0	71	27	38	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	2.196195352	1.098097676	2	0.071428571	0.071428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.77E-43	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	90357184	T	C	-	-	-	-	-	-	26	0	0	51	0	0	74	0	0	40	6	15	183	0	0	130	0	0	87	0	0	114	5	4.4	TRUE	TRUE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	0	0	1	0.535714286	0.535714286	1	0	0	1	0	0	1	0.157142857	0.157142857	1	1	2	1	1	1	1	1	1	5.18E-08	0.00029191	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	90441984	G	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	34	0	0	384	321	83.6	52	5	9.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	4.831629774	1.796490904	2.689481902	0.342857143	0.342857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0	1	0.00000668	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	90442075	G	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	38	0	0	309	233	75.4	58	9	15.5	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	4.357713935	1.620280074	2.689481902	0.553571429	0.553571429	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0	1	1.67E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	90442095	T	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	36	0	0	96	14	14.6	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	0.843801372	0.843801372	1	0.071428571	0.071428571	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	9.96E-17	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	90442660	G	C	-	-	-	-	-	-	44	0	0	56	0	0	367	288	78.5	52	12	23.1	228	1	0.4	155	0	0	298	219	73.5	123	21	17.1	TRUE	TRUE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	4.53687724	1.686896363	2.689481902	0.825	0.825	1	0	0	1	4.247904167	1.579450735	2.689481902	0.610714286	0.610714286	1	3	3	1	0.681094206	1	1	0	0	4.19E-17	7.24E-26	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	90442699	G	C	-	-	-	-	-	-	48	0	0	64	0	0	354	279	78.8	48	10	20.8	238	0	0	182	0	0	369	276	74.8	151	27	17.9	FALSE	TRUE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	4.554215624	1.693343101	2.689481902	0.742857143	0.742857143	1	0	0	1	4.323037166	1.607386599	2.689481902	0.639285714	0.639285714	1	NA	3	1	1	1	1	0	0	5.37E-14	2.15E-33	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	90442721	C	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	65	0	0	361	291	80.6	48	10	20.8	255	1	0.4	189	0	0	409	311	76	156	23	14.7	FALSE	TRUE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	4.65824593	1.732023527	2.689481902	0.742857143	0.742857143	1	0	0	1	4.392390703	1.633173549	2.689481902	0.525	0.525	1	NA	3	1	0.721461271	1	1	0	0	5.37E-14	1.22E-26	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	90442727	G	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	62	0	0	359	287	79.9	51	10	19.6	267	1	0.4	196	0	0	449	348	77.5	158	23	14.6	TRUE	TRUE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	4.6177897	1.716981139	2.689481902	0.7	0.7	1	0	0	1	4.479082625	1.665407238	2.689481902	0.521428571	0.521428571	1	3	3	1	0.73772158	1	1	0	0	1.04E-13	1.66E-26	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	90442840	G	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	45	0	0	343	288	84	61	10	16.4	360	0	0	231	0	0	807	641	79.4	225	33	14.7	TRUE	TRUE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	4.85474762	1.805086555	2.689481902	0.585714286	0.585714286	1	0	0	1	4.588892393	1.706236577	2.689481902	0.525	0.525	1	3	3	1	1	1	1	0	0	6.98E-13	1.87E-37	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	90442936	G	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	58	0	0	336	277	82.4	50	12	24	249	1	0.4	165	0	0	600	478	79.7	157	30	19.1	TRUE	TRUE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	4.762276236	1.770703953	2.689481902	0.857142857	0.857142857	1	0	0	1	4.606230777	1.712683314	2.689481902	0.682142857	0.682142857	1	3	3	1	0.712956904	1	1	0	0	2.49E-17	7.38E-38	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	90443266	G	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	45	0	0	362	294	81.2	66	16	24.2	213	0	0	126	0	0	355	293	82.5	90	13	14.4	TRUE	TRUE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	4.692922699	1.744917003	2.689481902	0.864285714	0.864285714	1	0	0	1	4.768055698	1.772852866	2.689481902	0.514285714	0.514285714	1	3	3	1	1	1	1	0	0	1.03E-22	1.40E-15	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	90443439	G	A	-	-	-	-	-	-	46	0	0	34	0	0	428	350	81.8	54	11	20.4	291	0	0	173	0	0	475	391	82.3	137	19	13.9	FALSE	TRUE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	4.727599468	1.757810478	2.689481902	0.728571429	0.728571429	1	0	0	1	4.756496775	1.768555041	2.689481902	0.496428571	0.496428571	1	NA	3	1	1	1	1	0	0	3.84E-15	9.57E-22	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	90443543	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	47	0	0	380	311	81.8	54	6	11.1	204	1	0.5	142	0	0	418	338	80.9	120	14	11.7	FALSE	TRUE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	4.727599468	1.757810478	2.689481902	0.396428571	0.396428571	1	0	0	1	4.675584315	1.738470265	2.689481902	0.417857143	0.417857143	1	NA	3	1	0.640326474	1	1	0	0	0.000000329	2.49E-15	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	90445599	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	26	0	0	250	200	80	29	5	17.2	0	0	NA	0	0	NA	2	2	100	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	4.623569162	1.719130052	2.689481902	0.614285714	0.614285714	1	NA	NA	1	5.779461452	2.148912565	2.689481902	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0	0.000025	0.000000336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	90445692	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	40	0	0	284	240	84.5	47	9	19.1	0	0	NA	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	4.883644927	1.815831117	2.689481902	0.682142857	0.682142857	1	NA	NA	1	5.779461452	5.779461452	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0	0.005	2.24E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	90445713	G	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	39	0	0	285	238	83.5	47	7	14.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	4.825850312	1.794341992	2.689481902	0.532142857	0.532142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0	1	4.12E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	90445721	G	T	-	-	-	-	-	-	20	0	0	39	0	0	276	233	84.4	51	7	13.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	4.877865465	1.813682205	2.689481902	0.489285714	0.489285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0	1	7.46E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	90445748	G	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	39	0	0	279	240	86	52	7	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	4.970336849	1.848064806	2.689481902	0.482142857	0.482142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0	1	8.58E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	90446283	G	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	35	0	0	408	331	81.1	43	8	18.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	4.687143238	1.74276809	2.689481902	0.664285714	0.664285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0	1	4.85E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	90447016	G	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	52	0	0	394	301	76.4	55	8	14.5	434	4	0.9	203	0	0	794	527	66.4	205	34	16.6	TRUE	TRUE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	4.415508549	1.6417692	2.689481902	0.517857143	0.517857143	1	0	0	1	3.837562404	1.426877943	2.689481902	0.592857143	0.592857143	1	3	3	1	0.174375556	1	1	0	0	3.86E-10	1.88E-40	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	90447132	G	A	-	-	-	-	-	-	48	0	0	46	0	0	398	311	78.1	60	7	11.7	398	2	0.5	168	0	0	608	430	70.7	146	13	8.9	FALSE	TRUE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	4.513759394	1.678300713	2.689481902	0.417857143	0.417857143	1	0	0	1	4.086079247	1.519281183	2.689481902	0.317857143	0.317857143	1	NA	3	1	0.591955629	1	1	0	0	2.39E-08	8.35E-13	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	90447138	G	C	-	-	-	-	-	-	47	0	0	46	0	0	402	313	77.9	59	8	13.6	390	0	0	170	0	0	587	413	70.4	145	13	9	TRUE	TRUE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	4.502200471	1.674002888	2.689481902	0.485714286	0.485714286	1	0	0	1	4.068740862	1.512834446	2.689481902	0.321428571	0.321428571	1	3	3	1	1	1	1	0	0	6.90E-10	7.64E-13	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	90447149	G	C	-	-	-	-	-	-	54	0	0	42	0	0	404	311	77	59	9	15.3	374	0	0	163	0	0	543	382	70.3	138	13	9.4	FALSE	TRUE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	4.450185318	1.654662675	2.689481902	0.546428571	0.546428571	1	0	0	1	4.062961401	1.510685533	2.689481902	0.335714286	0.335714286	1	NA	3	1	1	1	1	0	0	1.96E-11	4.03E-13	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	90447521	G	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	55	0	0	402	331	82.3	67	9	13.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	4.756496775	1.768555041	2.689481902	0.478571429	0.478571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0	1	6.43E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	90448276	G	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	44	0	0	389	310	79.7	66	14	21.2	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	4.606230777	1.712683314	2.689481902	0.757142857	0.757142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0	1	3.71E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	90448532	G	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	46	0	0	350	237	67.7	72	9	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	3.912695403	1.454813806	2.689481902	0.446428571	0.446428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0	1	1.25E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	90448777	G	A	-	-	-	-	-	-	49	0	0	43	0	0	355	191	53.8	56	10	17.9	20	0	0	6	0	0	39	17	43.6	4	0	0	FALSE	TRUE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	3.109350261	1.15611496	2.689481902	0.639285714	0.639285714	1	0	0	1	2.519845193	0.936925878	2.689481902	0	0	1	NA	1	1	1	1	1	0	3.51E-29	2.82E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	90448933	G	C	-	-	-	-	-	-	41	0	0	31	0	0	417	215	51.6	72	10	13.9	285	0	0	152	0	0	565	248	43.9	141	14	9.9	TRUE	TRUE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	2.982202109	1.108838883	2.689481902	0.496428571	0.496428571	1	0	0	1	2.537183577	0.943372616	2.689481902	0.353571429	0.353571429	1	3	3	1	1	1	1	0	0	3.95E-12	2.44E-14	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	90448965	G	A	-	-	-	-	-	-	50	1	2	36	0	0	473	269	56.9	71	11	15.5	343	0	0	178	0	0	752	403	53.6	197	29	14.7	TRUE	TRUE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	3.288513566	1.222731249	2.689481902	0.553571429	0.553571429	1	0	0	1	3.097791338	1.151817135	2.689481902	0.525	0.525	1	3	3	0.221687443	1	1	1	0	0	9.49E-14	3.70E-33	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	90449021	G	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	41	0	0	427	259	60.7	64	13	20.3	490	0	0	248	0	0	1104	669	60.6	262	39	14.9	TRUE	TRUE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	3.508133101	1.304389927	2.689481902	0.725	0.725	1	0	0	1	3.50235364	1.302241014	2.689481902	0.532142857	0.532142857	1	3	3	1	1	1	1	0	0	1.26E-17	3.14E-44	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	90449142	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	42	0	0	365	189	51.8	57	7	12.3	309	0	0	189	0	0	698	337	48.3	160	15	9.4	TRUE	TRUE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	0	1	2.993761032	1.113136709	2.689481902	0.439285714	0.439285714	1	0	0	1	2.791479881	1.037924769	2.689481902	0.335714286	0.335714286	1	3	3	1	1	1	1	0	0	1.66E-08	6.92E-15	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	90449499	G	C	-	-	-	-	-	-	36	0	0	50	0	0	376	237	63	56	8	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.689481902	2	1	2	1	1	1	1	1	0.310518098	1	NA	3	NA	NA	1	NA	NA	0.689481902	NA	0	NA	0	3.641060715	1.353814916	2.689481902	0.510714286	0.510714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0	1	4.48E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	91883823	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	53	0	0	44	0	0	44	5	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.407142857	0.407142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000288	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	91945692	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	41	0	0	47	16	34	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.390593047	1.390593047	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.98E-25	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	93374548	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	51	0	0	35	6	17.1	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.699386503	0.699386503	1	0.078571429	0.078571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.24E-08	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	95772671	C	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	42	9	21.4	52	0	0	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.88981289	0.88981289	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	7.51E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	99439263	G	T	ANKS1B	ENST00000329257	r.?	-	-	intronic	43	0	0	54	0	0	52	12	23.1	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.944785276	0.944785276	1	0.071428571	0.071428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.19E-17	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	100200439	A	G	ANKS1B	ENST00000329257	r.412u>c	c.412T>C	p.Y138H	missense	33	0	0	41	9	22	52	0	0	33	0	0	279	0	0	209	46	22	93	0	0	157	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914760915	0.914760915	1	0	0	1	0	0	1	0.914760915	0.914760915	1	0	0	1	0	0	1	6	4	1	1	5.92E-13	2.92E-60	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	12	100230091	A	T	ANKS1B	ENST00000329257	r.?	-	-	intronic	45	0	0	54	0	0	51	8	15.7	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.642126789	0.642126789	1	0.075	0.075	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.05E-10	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	103094837	T	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	47	0	0	58	15	25.9	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.059304703	1.059304703	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.42E-22	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	103837960	G	T	C12orf42	CCDS44963.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	45	0	0	48	12	25	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.022494888	1.022494888	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.44E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	104006462	C	T	STAB2	CCDS31888.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	39	0	0	68	17	25	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.022494888	1.022494888	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.69E-24	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	104293145	C	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	52	7	13.5	52	3	5.8	46	9	19.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.561330561	0.561330561	1	0.237218814	0.237218814	1	0.7	0.7	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	8.58E-09	1	0.002300591	1	1.82E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	104746757	A	G	TXNRD1	ENST00000429002	r.?	-	-	downstream	56	0	0	61	15	24.6	53	0	0	60	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.022869023	1.022869023	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.73E-21	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	106373647	G	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	49	0	0	72	13	18.1	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.740286299	0.740286299	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.58E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	107517739	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	57	9	15.8	54	0	0	63	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.656964657	0.656964657	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.42E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	107534854	T	C	-	-	-	-	-	-	22	0	0	32	0	0	43	8	18.6	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.760736196	0.760736196	1	0	0	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.85E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	107709230	G	T	BTBD11	CCDS31893.1	r.?	-	-	upstream	45	0	0	55	0	0	45	12	26.7	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.09202454	1.09202454	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.03E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	107954879	A	G	BTBD11	CCDS31893.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	45	0	0	59	14	23.7	55	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.969325153	0.969325153	1	0.064285714	0.064285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.58E-20	1	0.240951649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	108075929	G	A	PWP1	CCDS9114.1	r.?	-	-	upstream	41	0	0	44	0	0	44	9	20.5	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.838445808	0.838445808	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.18E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	108081366	A	G	PWP1	CCDS9114.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	47	15	31.9	65	16	24.6	38	12	31.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.326403326	1.326403326	1	1.006134969	1.006134969	1	1.128571429	1.128571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.97E-23	1	7.85E-23	1	5.86E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	110096818	A	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	45	13	28.9	54	2	3.7	39	11	28.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.201663202	1.201663202	1	0.151329243	0.151329243	1	1.007142857	1.007142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.68E-20	1	0.030129377	1	7.20E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	110183496	A	T	C12orf34	CCDS9133.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	54	10	18.5	51	0	0	49	9	18.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.769230769	0.769230769	1	0	0	1	0.657142857	0.657142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.91E-13	1	1	1	3.35E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	111666128	C	G	CUX2	CCDS41837.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	41	8	19.5	49	0	0	66	7	10.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.810810811	0.810810811	1	0	0	1	0.378571429	0.378571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.22E-11	1	1	1	0.000000047	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	113798000	T	A	PLBD2	CCDS9168.1	r.?	-	-	intronic	52	0	0	39	9	23.1	56	4	7.1	60	13	21.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.96049896	0.96049896	1	0.290388548	0.290388548	1	0.775	0.775	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.62E-13	1	0.000186538	1	5.07E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	113840587	G	A	SDS	CCDS9169.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	47	9	19.1	63	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.794178794	0.794178794	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.24E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	114185682	G	C	AC009731.1	ENST00000510694	r.?	-	-	downstream	52	0	0	43	0	0	66	13	19.7	45	5	11.1	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.805725971	0.805725971	1	0.396428571	0.396428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.95E-17	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	114804851	G	A	TBX5	CCDS9173.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	56	14	25	54	19	35.2	61	16	26.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.03950104	1.03950104	1	1.439672802	1.439672802	1	0.935714286	0.935714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.91E-20	1	2.97E-30	1	2.50E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	115383204	A	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	39	6	15.4	53	0	0	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.64033264	0.64033264	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.43E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	117630989	C	T	FBXO21	CCDS9184.1	r.?	-	-	upstream	43	0	0	40	0	0	54	14	25.9	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.059304703	1.059304703	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.64E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	117853057	G	A	-	-	-	-	-	-	51	0	0	50	16	32	45	14	31.1	48	21	43.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.330561331	1.330561331	1	1.27198364	1.27198364	1	1.564285714	1.564285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.40E-25	1	8.81E-22	1	9.35E-36	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	119102181	T	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	52	0	0	56	11	19.6	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.801635992	0.801635992	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.91E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	120058968	T	A	TMEM233	CCDS44995.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	37	9	24.3	54	0	0	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.01039501	1.01039501	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.14E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	121003095	T	A	RNF10	CCDS9201.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	47	0	0	42	7	16.7	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.683026585	0.683026585	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.81E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	121020878	C	T	POP5	CCDS9202.1	r.?	-	-	upstream	38	0	0	51	13	25.5	50	3	6	44	7	15.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.06029106	1.06029106	1	0.245398773	0.245398773	1	0.567857143	0.567857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.87E-19	1	0.002055544	1	2.55E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	121168734	G	T	ACADS	CCDS9207.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	48	10	20.8	57	2	3.5	61	15	24.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.864864865	0.864864865	1	0.143149284	0.143149284	1	0.878571429	0.878571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.37E-14	1	0.03327602	1	1.73E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	122405876	C	A	WDR66	CCDS41853.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	56	17	30.4	63	0	0	60	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.264033264	1.264033264	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	6.22E-26	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	125143959	A	C	-	-	-	-	-	-	48	0	0	38	4	10.5	54	0	0	66	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.436590437	0.436590437	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.0000403	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	125842525	C	T	TMEM132B	CCDS41859.1	r.?	-	-	intronic	55	0	0	35	6	17.1	71	2	2.8	43	6	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.711018711	0.711018711	1	0.114519427	0.114519427	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.24E-08	1	0.04950591	1	8.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	126226630	G	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	39	7	17.9	64	4	6.2	57	13	22.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.744282744	0.744282744	1	0.253578732	0.253578732	1	0.814285714	0.814285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.04E-09	1	0.000312605	1	2.44E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	126298552	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	41	7	17.1	49	13	26.5	43	13	30.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.711018711	0.711018711	1	1.083844581	1.083844581	1	1.078571429	1.078571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.51E-09	1	2.71E-19	1	3.88E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	126642217	T	C	-	-	-	-	-	-	60	0	0	45	13	28.9	58	2	3.4	44	7	15.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.201663202	1.201663202	1	0.139059305	0.139059305	1	0.567857143	0.567857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.68E-20	1	0.034352256	1	2.55E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	126790048	A	G	-	-	-	-	-	-	48	0	0	40	9	22.5	45	2	4.4	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.935550936	0.935550936	1	0.1799591	0.1799591	1	0.296428571	0.296428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.64E-13	1	0.021467209	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	127336358	G	A	-	-	-	-	-	-	50	0	0	39	8	20.5	67	1	1.5	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852390852	0.852390852	1	0.061349693	0.061349693	1	0.310714286	0.310714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.09E-11	1	0.285262761	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	127399230	G	A	AC078878.2	ENST00000512624	r.?	-	-	downstream	46	0	0	45	10	22.2	63	11	17.5	51	15	29.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.923076923	0.923076923	1	0.715746421	0.715746421	1	1.05	1.05	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.66E-14	1	2.37E-14	1	8.22E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	128201762	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	37	0	0	49	14	28.6	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.169734151	1.169734151	1	0.075	0.075	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.50E-21	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	128514190	G	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	48	0	0	62	0	0	67	7	10.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.371428571	0.371428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	5.23E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	128776550	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	39	0	0	37	7	18.9	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.773006135	0.773006135	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.05E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	128872138	C	G	-	-	-	-	-	-	47	0	0	43	0	0	43	5	11.6	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.474437628	0.474437628	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000257	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	129182935	A	G	TMEM132C	CCDS45009.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	46	11	23.9	46	0	0	53	1	1.9	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.993762994	0.993762994	1	0	0	1	0.067857143	0.067857143	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.55E-16	1	1	1	0.233303855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	129486590	T	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	50	0	0	56	14	25	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.022494888	1.022494888	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.91E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	130298575	G	T	TMEM132D	CCDS9266.1	r.?	-	-	intronic	50	0	0	51	0	0	53	17	32.1	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.312883436	1.312883436	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.08E-26	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	130914273	G	A	RIMBP2	CCDS31925.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	41	0	0	45	1	2.2	50	6	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.08997955	0.08997955	1	0.428571429	0.428571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.201934322	1	0.000000206	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	131337589	T	C	-	-	-	-	-	-	36	0	0	33	0	0	48	0	0	30	5	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.596428571	0.596428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000401	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	12	132340636	G	A	MMP17	CCDS31927.1	r.?	-	-	downstream	39	0	0	43	0	0	67	14	20.9	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.854805726	0.854805726	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.66E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	19174684	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	43	6	14	43	2	4.7	48	11	22.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.582120582	0.582120582	1	0.192229039	0.192229039	1	0.817857143	0.817857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	8.13E-08	1	0.019709573	1	9.31E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	21392665	A	C	XPO4	CCDS41872.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	44	10	22.7	56	1	1.8	44	6	13.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.943866944	0.943866944	1	0.073619632	0.073619632	1	0.485714286	0.485714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.08E-14	1	0.244746891	1	9.37E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	21392680	A	T	XPO4	CCDS41872.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	51	11	21.6	56	4	7.1	40	8	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.898128898	0.898128898	1	0.290388548	0.290388548	1	0.714285714	0.714285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.94E-15	1	0.000186538	1	2.61E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	22834598	G	A	AL137248.1	ENST00000413646	r.?	-	-	intronic	40	0	0	35	6	17.1	53	0	0	66	6	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.711018711	0.711018711	1	0	0	1	0.325	0.325	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.24E-08	1	1	1	0.0000011	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	23288797	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	53	0	0	52	12	23.1	54	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.944785276	0.944785276	1	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.19E-17	1	0.237137336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	23323614	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	50	11	22	46	0	0	43	7	16.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914760915	0.914760915	1	0	0	1	0.582142857	0.582142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.52E-15	1	1	1	2.15E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	24195082	G	T	TNFRSF19	CCDS9301.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	50	17	34	47	2	4.3	56	8	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.413721414	1.413721414	1	0.175869121	0.175869121	1	0.510714286	0.510714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	6.43E-27	1	0.02328732	1	4.48E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	24442117	C	T	MIPEP	CCDS9303.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	50	0	0	41	8	19.5	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.797546012	0.797546012	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.22E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	24622439	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	43	15	34.9	62	0	0	67	2	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.451143451	1.451143451	1	0	0	1	0.107142857	0.107142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.05E-24	1	1	1	0.044622585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	25642217	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	46	0	0	49	11	22.4	37	5	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.916155419	0.916155419	1	0.482142857	0.482142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.19E-15	1	0.00000119	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	25957204	A	T	ATP8A2	CCDS41873.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	47	13	27.7	49	2	4.1	40	9	22.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.151767152	1.151767152	1	0.167689162	0.167689162	1	0.803571429	0.803571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.47E-19	1	0.025168485	1	4.64E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	26100962	T	C	ATP8A2	CCDS41873.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	48	0	0	48	12	25	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.022494888	1.022494888	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.44E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	26613281	G	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	40	8	20	58	3	5.2	48	5	10.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	0.212678937	0.212678937	1	0.371428571	0.371428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.61E-11	1	0.003141421	1	0.00000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	28376930	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	49	9	18.4	63	3	4.8	70	14	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.765072765	0.765072765	1	0.196319018	0.196319018	1	0.714285714	0.714285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.35E-12	1	0.003968795	1	9.08E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	28880236	G	A	FLT1	CCDS9330.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	47	11	23.4	39	0	0	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.972972973	0.972972973	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	7.21E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	29619176	A	G	MTUS2	CCDS45022.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	35	9	25.7	55	0	0	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.068607069	1.068607069	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.23E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	29931926	C	T	MTUS2	CCDS45022.1	r.?	-	-	intronic	53	0	0	45	0	0	57	15	26.3	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.075664622	1.075664622	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.53E-22	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	32599838	T	C	-	-	-	-	-	-	34	0	0	36	3	8.3	55	20	36.4	38	15	39.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.345114345	0.345114345	1	1.488752556	1.488752556	1	1.410714286	1.410714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.000788827	1	4.08E-32	1	4.24E-25	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	33849720	G	A	STARD13	CCDS9350.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	53	0	0	42	12	28.6	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.169734151	1.169734151	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.35E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	34182598	A	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	57	16	28.1	53	3	5.7	47	7	14.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.168399168	1.168399168	1	0.233128834	0.233128834	1	0.532142857	0.532142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.28E-24	1	0.002429596	1	4.12E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	35379095	A	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	54	0	0	59	17	28.8	54	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.17791411	1.17791411	1	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.74E-25	1	0.237137336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	37122052	G	T	-	-	-	-	-	-	43	1	2.3	47	12	25.5	56	12	21.4	58	14	24.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.06029106	1.06029106	1	0.875255624	0.875255624	1	0.860714286	0.860714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	0.193893409	1	1.09E-17	1	1.11E-16	1	5.04E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	37792161	T	C	-	-	-	-	-	-	28	0	0	45	14	31.1	58	2	3.4	48	11	22.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.293139293	1.293139293	1	0.139059305	0.139059305	1	0.817857143	0.817857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	8.81E-22	1	0.034352256	1	9.31E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	39339338	C	T	FREM2	CCDS31960.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	48	11	22.9	53	3	5.7	53	11	20.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.952182952	0.952182952	1	0.233128834	0.233128834	1	0.742857143	0.742857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.31E-16	1	0.002429596	1	3.07E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	39858697	G	A	-	-	-	-	-	-	53	0	0	56	15	26.8	47	10	21.3	46	11	23.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.114345114	1.114345114	1	0.871165644	0.871165644	1	0.853571429	0.853571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.09E-22	1	4.27E-14	1	5.55E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	40383948	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	45	0	0	40	5	12.5	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.511247444	0.511247444	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000178	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	40878262	T	A	-	-	-	-	-	-	49	0	0	43	8	18.6	43	18	41.9	51	15	29.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.773388773	0.773388773	1	1.713701431	1.713701431	1	1.05	1.05	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.85E-11	1	2.06E-30	1	8.22E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	41780260	T	C	AL354696.6	ENST00000499512	r.?	-	-	intronic	31	0	0	39	0	0	63	10	15.9	59	7	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.650306748	0.650306748	1	0.425	0.425	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	9.81E-13	1	2.12E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	43100087	G	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	45	10	22.2	47	0	0	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.923076923	0.923076923	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.66E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	43962705	C	G	ENOX1	CCDS9389.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	57	15	26.3	63	4	6.3	55	9	16.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.093555094	1.093555094	1	0.257668712	0.257668712	1	0.585714286	0.585714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.53E-22	1	0.000294233	1	1.01E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	45633499	T	C	-	-	-	-	-	-	37	0	0	49	0	0	44	9	20.5	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.838445808	0.838445808	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.18E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	46295329	C	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	54	13	24.1	57	2	3.5	49	7	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.002079002	1.002079002	1	0.143149284	0.143149284	1	0.510714286	0.510714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.12E-18	1	0.03327602	1	5.58E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	47974652	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	42	0	0	60	14	23.3	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.952965235	0.952965235	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.54E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	48545974	G	A	SUCLA2	CCDS9406.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	65	0	0	63	16	25.4	50	2	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.038854806	1.038854806	1	0.142857143	0.142857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.48E-23	1	0.026131524	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	51819978	G	C	FAM124A	CCDS9427.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	47	15	31.9	50	0	0	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.326403326	1.326403326	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.97E-23	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	53002209	C	A	VPS36	CCDS9434.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	51	0	0	57	0	0	41	7	17.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.610714286	0.610714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	1.51E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	53552674	G	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	44	0	0	58	10	17.2	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.703476483	0.703476483	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.10E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	54350769	A	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	49	7	14.3	49	2	4.1	48	6	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.594594595	0.594594595	1	0.167689162	0.167689162	1	0.446428571	0.446428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.58E-09	1	0.025168485	1	0.00000016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	55661114	T	C	-	-	-	-	-	-	45	0	0	36	8	22.2	53	0	0	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.923076923	0.923076923	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.04E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	55745632	G	C	-	-	-	-	-	-	51	0	0	47	7	14.9	40	0	0	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.61954262	0.61954262	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.12E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	56507182	G	C	-	-	-	-	-	-	42	0	0	31	1	3.2	52	15	28.8	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.133056133	0.133056133	1	1.17791411	1.17791411	1	0.414285714	0.414285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.143917729	1	1.15E-22	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	56649806	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	38	8	21.1	56	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.877338877	0.877338877	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.67E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	56678987	G	A	-	-	-	-	-	-	59	0	0	35	7	20	59	15	25.4	52	16	30.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	1.038854806	1.038854806	1	1.1	1.1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.65E-10	1	9.90E-22	1	1.33E-24	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	60295480	T	A	DIAPH3	CCDS41898.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	48	0	0	51	12	23.5	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.961145194	0.961145194	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.24E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	61848350	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	38	13	34.2	55	14	25.5	52	15	28.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.422037422	1.422037422	1	1.042944785	1.042944785	1	1.028571429	1.028571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.88E-21	1	2.19E-20	1	1.15E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	61885575	A	G	-	-	-	-	-	-	44	0	0	56	9	16.1	51	0	0	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.669438669	0.669438669	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.20E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	62644722	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	36	9	25	42	11	26.2	50	13	26	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.03950104	1.03950104	1	1.071574642	1.071574642	1	0.928571429	0.928571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.63E-13	1	1.81E-16	1	3.65E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	62813796	G	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	46	0	0	48	10	20.8	59	1	1.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.850715746	0.850715746	1	0.060714286	0.060714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.37E-14	1	0.256019138	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	63740002	G	A	-	-	-	-	-	-	52	0	0	38	10	26.3	65	0	0	55	8	14.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.093555094	1.093555094	1	0	0	1	0.517857143	0.517857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.06E-15	1	1	1	3.86E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	64200950	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	42	1	2.4	41	1	2.4	52	8	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.0997921	0.0997921	1	0.098159509	0.098159509	1	0.55	0.55	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	0.189842622	1	0.18577148	1	2.42E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	64624259	A	G	-	-	-	-	-	-	44	0	0	40	0	0	53	13	24.5	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.00204499	1.00204499	1	0.103571429	0.103571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.53E-19	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	65528853	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	49	12	24.5	46	15	32.6	36	5	13.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.018711019	1.018711019	1	1.333333333	1.333333333	1	0.496428571	0.496428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.90E-17	1	1.35E-23	1	0.00000104	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	65542965	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	49	9	18.4	43	0	0	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.765072765	0.765072765	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.35E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	66261635	G	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	47	9	19.1	46	2	4.3	46	9	19.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.794178794	0.794178794	1	0.175869121	0.175869121	1	0.7	0.7	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.24E-12	1	0.022369545	1	1.82E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	67050569	C	T	PCDH9	CCDS9443.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	38	6	15.8	53	3	5.7	49	8	16.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.656964657	0.656964657	1	0.233128834	0.233128834	1	0.582142857	0.582142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.76E-08	1	0.002429596	1	1.47E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	67204041	A	G	PCDH9	CCDS9443.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	48	8	16.7	37	1	2.7	50	6	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.694386694	0.694386694	1	0.110429448	0.110429448	1	0.428571429	0.428571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.23E-10	1	0.169281299	1	0.000000206	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	68207484	A	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	43	0	0	37	8	21.6	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.883435583	0.883435583	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.33E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	69259040	A	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	37	0	0	68	15	22.1	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.903885481	0.903885481	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.06E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	70848717	T	G	-	-	-	-	-	-	46	0	0	39	8	20.5	65	11	16.9	49	14	28.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852390852	0.852390852	1	0.691206544	0.691206544	1	1.021428571	1.021428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.09E-11	1	3.41E-14	1	3.50E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	71253510	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	57	11	19.3	42	0	0	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.802494802	0.802494802	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	7.29E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	71426825	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	37	11	29.7	43	4	9.3	59	13	22	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.234927235	1.234927235	1	0.380368098	0.380368098	1	0.785714286	0.785714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.70E-17	1	0.000066	1	3.99E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	71925386	A	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	54	11	20.4	60	17	28.3	46	11	23.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.848232848	0.848232848	1	1.157464213	1.157464213	1	0.853571429	0.853571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.84E-15	1	2.41E-25	1	5.55E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	72527726	A	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	31	0	0	57	14	24.6	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.006134969	1.006134969	1	0.089285714	0.089285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.84E-20	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	73217118	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	49	15	30.6	45	2	4.4	52	10	19.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.272349272	1.272349272	1	0.1799591	0.1799591	1	0.685714286	0.685714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.10E-23	1	0.021467209	1	1.28E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	73430879	T	A	PIBF1	CCDS31991.1	r.?	-	-	intronic	49	0	0	64	19	29.7	63	0	0	43	6	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.234927235	1.234927235	1	0	0	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.34E-28	1	1	1	8.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	74120580	C	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	42	6	14.3	61	0	0	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.594594595	0.594594595	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	7.02E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	74442529	G	A	KLF12	CCDS9449.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	36	7	19.4	41	0	0	47	0	0	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.806652807	0.806652807	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	6	NA	1	1	5.74E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	75820242	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	34	8	23.5	48	9	18.8	49	12	24.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.977130977	0.977130977	1	0.768916155	0.768916155	1	0.875	0.875	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.32E-12	1	2.75E-12	1	1.90E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	76318299	A	G	LMO7	CCDS9454.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	43	0	0	48	0	0	41	7	17.1	220	1	0.5	187	0	0	86	0	0	131	15	11.5	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.610714286	0.610714286	1	0	0	1	0	0	1	0.410714286	0.410714286	1	1	2	1	0.668046109	1	1	1	1	1.51E-09	3.38E-16	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	13	78636329	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	44	0	0	45	12	26.7	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.09202454	1.09202454	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.03E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	79950749	T	C	RBM26	CCDS9462.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	43	0	0	62	11	17.7	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.72392638	0.72392638	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.96E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	81934428	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	45	13	28.9	59	1	1.7	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.201663202	1.201663202	1	0.069529652	0.069529652	1	0.317857143	0.317857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.68E-20	1	0.256019138	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	83473718	G	C	-	-	-	-	-	-	54	0	0	47	17	36.2	45	12	26.7	66	23	34.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.505197505	1.505197505	1	1.09202454	1.09202454	1	1.242857143	1.242857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.81E-27	1	6.03E-18	1	3.38E-36	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	84181402	T	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	35	0	0	47	6	12.8	60	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.523517382	0.523517382	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000141	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	84639158	T	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	28	6	21.4	55	11	20	39	12	30.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.88981289	0.88981289	1	0.81799591	0.81799591	1	1.1	1.1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.36E-09	1	4.77E-15	1	8.43E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	84906830	T	C	-	-	-	-	-	-	43	0	0	52	0	0	60	14	23.3	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.952965235	0.952965235	1	0.089285714	0.089285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.54E-20	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	85409825	A	T	-	-	-	-	-	-	52	0	0	50	16	32	51	10	19.6	59	16	27.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.330561331	1.330561331	1	0.801635992	0.801635992	1	0.967857143	0.967857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.40E-25	1	1.04E-13	1	1.37E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	85721234	G	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	41	12	29.3	48	14	29.2	49	13	26.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.218295218	1.218295218	1	1.194274029	1.194274029	1	0.946428571	0.946428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.69E-18	1	2.51E-21	1	2.71E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	86207143	T	C	-	-	-	-	-	-	41	0	0	34	0	0	52	14	26.9	53	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.100204499	1.100204499	1	0.067857143	0.067857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.04E-21	1	0.233303855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	86427355	T	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	30	4	13.3	45	0	0	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.553014553	0.553014553	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.0000154	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	87368413	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	32	1	3.1	78	8	10.3	64	0	0	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0.128898129	0.128898129	1	0.508130248	0.602532774	0.843323833	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	0.14819814	1	6.71E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	87569083	G	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	50	0	0	74	11	14.9	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.735062204	0.735062204	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.53E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	88241310	T	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	43	0	0	62	7	11.3	63	6	9.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.557463282	0.557463282	1	0.38183807	0.852470239	0.447919531	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	3.02E-08	1	0.000000832	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	88247807	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	44	0	0	70	10	14.3	54	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.705462384	0.705462384	1	0.076367614	0.076367614	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.95E-12	1	0.237137336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	88879832	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	40	0	0	56	7	12.5	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.616662923	0.616662923	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.46E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	89941172	A	T	-	-	-	-	-	-	48	0	0	43	9	20.9	51	2	3.9	50	14	28	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0.869022869	0.869022869	1	0.192398832	0.192398832	1	1.125417469	1.125417469	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.45E-13	1	0.027109304	1	4.84E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	90520039	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	57	0	0	61	15	24.6	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	1.213592632	1.213592632	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.73E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	90753444	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	47	0	0	64	9	14.1	50	5	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.695595777	0.695595777	1	0.40193481	0.897337094	0.447919531	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	4.20E-11	1	0.00000549	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	91450365	A	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	37	0	0	64	5	7.8	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.384797664	0.456286955	0.843323833	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000186	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	91526721	C	A	-	-	-	-	-	-	48	0	0	37	0	0	59	10	16.9	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.833728272	0.833728272	1	0.080386962	0.080386962	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.91E-13	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	92239008	A	T	GPC5	CCDS9468.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	31	0	0	51	13	25.5	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	1.257992363	1.257992363	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.87E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	92407868	C	A	GPC5	CCDS9468.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	46	7	15.2	72	3	4.2	65	6	9.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0.632016632	0.632016632	1	0.207198742	0.207198742	1	0.369780025	0.825550127	0.447919531	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.53E-09	1	0.00576558	1	0.000001	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	93215315	G	T	GPC5	CCDS9468.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	45	0	0	47	8	17	63	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.838661575	0.838661575	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.03E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	94325458	A	T	GPC6	CCDS9469.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	30	1	3.3	54	6	11.1	49	0	0	246	0	0	207	0	0	177	26	14.7	192	0	0	FALSE	TRUE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0.137214137	NA	0	0.547596675	0.547596675	1	0	0	1	0	0	1	0.725195597	0.859925416	0.843323833	0	0	1	NA	1	1	1	0.139615808	1	0.000000329	7.24E-30	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	13	95375788	C	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	39	0	0	63	12	19	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.937327643	0.937327643	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.15E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	95402625	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	53	0	0	60	13	21.7	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	1.070526834	1.070526834	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.07E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	95444303	A	G	AL139381.2	ENST00000505287	r.?	-	-	intronic	37	0	0	46	0	0	57	10	17.5	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.863328092	0.863328092	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.40E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	95473078	G	A	AL139381.2	ENST00000505287	r.?	-	-	intronic	30	0	0	43	0	0	77	12	15.6	60	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.769595328	0.769595328	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.64E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	96990603	G	C	HS6ST3	CCDS9481.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	42	0	0	62	13	21	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	1.03599371	1.03599371	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.08E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	99827776	C	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	48	0	0	62	10	16.1	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.794261845	0.794261845	1	0.088425658	0.088425658	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.29E-13	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	100026275	T	A	UBAC2	CCDS9490.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	41	7	17.1	65	1	1.5	47	8	17	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0.711018711	0.711018711	1	0.073999551	0.073999551	1	0.683289177	0.683289177	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.51E-09	1	0.278061424	1	1.03E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	101033713	C	T	PCCA	CCDS9496.2	r.?	-	-	intronic	33	0	0	38	0	0	70	11	15.7	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	NA	0	0.774528631	0.774528631	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	8.06E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	101753251	T	G	NALCN	CCDS9498.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	40	0	0	64	12	18.8	67	0	0	183	1	0.5	153	0	0	112	17	15.2	111	2	1.8	TRUE	TRUE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.927461036	0.927461036	1	0	0	1	0	0	1	0.749862114	0.749862114	1	0.072348266	0.072348266	1	2	1	1	0.600401567	1	1	6.30E-16	2.62E-20	1	0.106960682	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	13	101946551	G	T	NALCN	CCDS9498.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	46	0	0	74	16	21.6	53	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	1.065593531	1.065593531	1	0.076367614	0.076367614	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.81E-22	1	0.233303855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	102090370	C	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	59	0	0	53	10	18.9	65	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.932394339	0.932394339	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.57E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	102293927	T	A	ITGBL1	CCDS9499.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	39	0	0	71	8	11.3	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.557463282	0.661031102	0.843323833	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.14E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	102293944	G	T	ITGBL1	CCDS9499.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	40	0	0	73	6	8.2	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.404530877	0.479686286	0.843323833	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000002	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	102996234	G	T	FGF14	CCDS9500.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	35	0	0	50	8	16	49	5	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.789328541	0.789328541	1	0.409973506	0.915283836	0.447919531	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.74E-10	1	0.00000496	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	103591365	G	T	-	-	-	-	-	-	50	0	0	63	16	25.4	56	2	3.6	48	12	25	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	1.056133056	1.056133056	1	0.177598922	0.177598922	1	1.004837026	1.004837026	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.48E-23	1	0.032213353	1	1.44E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	103766802	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	59	0	0	58	9	15.5	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.764662024	0.764662024	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.67E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	103916891	C	T	-	-	-	-	-	-	49	0	0	60	0	0	45	7	15.6	57	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.769595328	0.769595328	1	0.072348266	0.072348266	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000003	1	0.248523156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	105053164	G	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	48	5	10.4	55	0	0	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0.432432432	0.432432432	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.00000447	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	106776573	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	37	8	21.6	48	1	2.1	55	5	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0.898128898	0.898128898	1	0.103599371	0.103599371	1	0.365760677	0.816576756	0.447919531	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.33E-11	1	0.213845552	1	0.00000883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	108153612	C	T	FAM155A	CCDS32006.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	41	8	19.5	56	15	26.8	48	7	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0.810810811	0.810810811	1	1.322125307	1.322125307	1	0.586824823	0.586824823	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.22E-11	1	4.09E-22	1	4.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	108158081	T	A	FAM155A	CCDS32006.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	46	0	0	46	6	13	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.64132944	0.64132944	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000123	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	108546948	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	43	0	0	81	16	19.8	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.97679407	0.97679407	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.77E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	108666452	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	51	0	0	55	7	12.7	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	NA	0	0.62652953	0.62652953	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.28E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	110814367	A	G	COL4A1	CCDS9511.1	r.?	-	-	intronic	52	0	0	53	12	22.6	78	9	11.5	60	14	23.3	395	0	0	214	41	19.2	151	22	14.6	215	58	27	TRUE	TRUE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0.93970894	0.93970894	1	0.567329889	0.672730767	0.843323833	0.936508108	0.936508108	1	0.798336798	0.798336798	1	0.720262294	0.720262294	1	1.085223988	1.085223988	1	8	5	1	1	5.39E-17	3.41E-51	2.61E-10	1.98E-25	8.54E-20	2.69E-81	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	13	112128547	C	G	-	-	-	-	-	-	57	0	0	65	6	9.2	76	0	0	63	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0.382536383	0.382536383	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000001	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	112140959	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	46	0	0	57	8	14	64	5	7.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.690662474	0.690662474	1	0.313509152	0.699922933	0.447919531	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	5.19E-10	1	0.0000186	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	113088566	C	T	C13orf28	CCDS9524.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	33	0	0	72	11	15.3	43	2	4.7	54	1	1.9	138	0	0	151	28	18.5	101	2	2	TRUE	TRUE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0.754795418	0.754795418	1	0.188909361	0.421748434	0.447919531	0	0	1	0.912661126	0.912661126	1	0.080386962	0.080386962	1	3	1	1	0.237137336	1	1	1.12E-13	4.79E-35	0.019709573	0.091344345	YES	0_0	1_1	1_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	13	114575200	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	48	0	0	65	14	21.5	59	4	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	1.060660227	1.060660227	1	0.273315671	0.610189224	0.447919531	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	2.93E-19	1	0.00022841	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	114581548	C	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	46	16	34.8	76	0	0	57	6	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	1.446985447	1.446985447	1	0	0	1	0.422031551	0.942203949	0.447919531	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.31E-25	1	1	1	0.000000456	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	13	114838482	C	T	RASA3	CCDS32016.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	43	0	0	77	0	0	53	5	9.4	98	0	0	261	1	0.4	248	6	2.4	264	13	4.9	TRUE	TRUE	2	2.843323833	2.447919531	1	1	1	1	1	1	1	0.156676167	0.552080469	NA	2	2	NA	1	1	NA	0.843323833	0.447919531	0	0	1	0	0	1	0.377818722	0.843496868	0.447919531	0.016632017	0.016632017	1	0.118399281	0.118399281	1	0.196948057	0.196948057	1	1	2	1	1	1	0.729713674	1	0.001700411	0.00000734	1.37E-09	YES	0_0	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	14	19087979	T	C	-	-	-	-	-	-	82	0	0	66	0	0	93	7	7.5	94	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.306748466	0.306748466	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000508	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	19101106	C	T	-	-	-	-	-	-	85	0	0	84	9	10.7	87	2	2.3	84	6	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.444906445	0.444906445	1	0.09406953	0.09406953	1	0.253571429	0.253571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.13E-10	1	0.070774795	1	0.00000455	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	19209044	G	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	31	2	6.5	41	2	4.9	36	10	27.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.27027027	0.27027027	1	0.200408998	0.200408998	1	0.992857143	0.992857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.010558179	1	0.018015855	1	2.21E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	20589208	C	A	OR4K17	CCDS32030.1	r.?	-	-	downstream	42	0	0	48	12	25	52	1	1.9	31	3	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.03950104	1.03950104	1	0.077709611	0.077709611	1	0.346428571	0.346428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.44E-17	1	0.229451111	1	0.000505952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	27583956	C	G	-	-	-	-	-	-	41	0	0	43	0	0	67	11	16.4	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	NA	2	1	NA	1	1	NA	1	1	NA	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	4.85E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	27583970	C	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	41	0	0	69	11	15.9	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	NA	2	1	NA	1	1	NA	1	1	NA	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	6.82E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	27584124	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	59	0	0	65	8	12.3	41	0	0	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	NA	2	1	NA	1	1	NA	1	1	NA	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.53E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	27584137	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	57	0	0	64	7	10.9	36	0	0	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	NA	2	1	NA	1	1	NA	1	1	NA	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	3.78E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	28315278	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	45	8	17.8	59	0	0	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	0.74012474	0.74012474	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	7.14E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	28480126	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	48	18	37.5	48	0	0	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	1.559251559	1.559251559	1	0	0	1	0.071428571	0.071428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.42E-29	1	1	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	28735492	C	A	ENSG00000197358	ENST00000355069	r.?	-	-	downstream	51	1	2	39	10	25.6	63	28	44.4	44	14	31.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	1.064449064	1.064449064	1	2.175824924	1.201763288	1.810527036	1.135714286	1.135714286	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	0.225579006	1	5.44E-15	1	1.98E-47	1	6.10E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	29721521	C	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	50	0	0	51	20	39.2	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	0	0	1	1.920998582	1.061016236	1.810527036	0.078571429	0.078571429	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.38E-33	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	30508272	T	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	58	0	0	67	7	10.4	51	2	3.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	0	0	1	0.509652685	0.628791715	0.810527036	0.139285714	0.139285714	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.23E-08	1	0.027109304	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	30738416	G	A	AL121840.1	ENST00000508469	r.?	-	-	intronic	30	0	0	23	3	13	58	9	15.5	42	14	33.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	0.540540541	0.540540541	1	0.759578521	0.759578521	1	1.189285714	1.189285714	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.000205387	1	1.67E-11	1	2.83E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	32854737	C	T	AKAP6	CCDS9644.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	36	8	22.2	52	0	0	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	0.923076923	0.923076923	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.04E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	32896744	C	G	AKAP6	CCDS9644.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	62	0	0	61	13	21.3	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	0	0	1	1.043807903	1.043807903	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.41E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	33541562	T	C	NPAS3	CCDS9645.1	r.?	-	-	intronic	55	0	0	57	0	0	64	7	10.9	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	0	0	1	0.534155218	0.659022086	0.810527036	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.78E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	38756006	T	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	42	7	16.7	52	1	1.9	40	10	25	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	0.694386694	0.694386694	1	0.093109625	0.093109625	1	0.892857143	0.892857143	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.81E-09	1	0.229451111	1	7.22E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	38842674	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	45	13	28.9	50	11	22	56	12	21.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	1.201663202	1.201663202	1	1.078111449	1.078111449	1	0.764285714	0.764285714	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	7.68E-20	1	1.52E-15	1	1.11E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	40682971	C	G	-	-	-	-	-	-	50	0	0	49	16	32.7	59	0	0	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	1.35966736	1.35966736	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.37E-25	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	41155190	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	45	0	0	56	8	14.3	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	0	0	1	0.700772442	0.700772442	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.48E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	43161075	C	T	-	-	-	-	-	-	50	0	0	43	0	0	65	11	16.9	45	11	24.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	0	0	1	0.828185613	0.828185613	1	0.871428571	0.871428571	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	3.41E-14	1	4.24E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	43747784	T	C	-	-	-	-	-	-	47	0	0	54	0	0	60	12	20	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	0	0	1	0.980101317	0.980101317	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.74E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	43747787	T	G	-	-	-	-	-	-	47	0	0	53	0	0	58	11	19	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	0	0	1	0.931096251	0.931096251	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.96E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	44046094	A	G	-	-	-	-	-	-	47	0	0	53	8	15.1	67	0	0	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	0.627858628	0.627858628	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.83E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	49202878	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	31	0	0	66	8	12.1	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	0	0	1	0.592961297	0.592961297	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.73E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	50782701	C	G	L2HGDH	CCDS9698.1	r.?	-	-	upstream	37	0	0	50	0	0	51	7	13.7	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	0	0	1	0.671369402	0.671369402	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.46E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	51349775	C	A	ABHD12B	CCDS45104.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	44	12	27.3	60	11	18.3	51	10	19.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	1.135135135	1.135135135	1	0.896792705	0.896792705	1	0.7	0.7	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.44E-18	1	1.34E-14	1	1.04E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	51535341	A	C	TRIM9	CCDS9703.1	r.?	-	-	intronic	52	0	0	45	0	0	77	18	23.4	65	7	10.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	0	0	1	1.146718541	1.146718541	1	0.385714286	0.385714286	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	4.71E-25	1	4.22E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	51704194	C	T	TMX1	CCDS41953.1	r.?	-	-	upstream	31	0	0	40	7	17.5	43	0	0	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	0.727650728	0.727650728	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.26E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	52564123	T	C	-	-	-	-	-	-	26	0	0	29	0	0	48	5	10.4	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	0	0	1	0.509652685	0.509652685	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000447	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	52971608	T	C	TXNDC16	CCDS32083.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	42	7	16.7	51	0	0	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	0.694386694	0.694386694	1	0	0	1	0.325	0.325	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.81E-09	1	1	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	53149662	G	A	ERO1L	CCDS9709.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	38	0	0	61	14	23	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.810527036	2	1	1	1	1	1	1	1	0.189472964	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.810527036	NA	0	0	1	1.127116515	1.127116515	1	0.15	0.15	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.10E-19	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	55690372	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	37	8	21.6	33	7	21.2	32	17	53.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.682128898	0.682128898	1	0.655075665	0.655075665	1	1.365428571	1.365428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.33E-11	1	2.98E-10	1	4.02E-31	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	59987017	G	A	C14orf38	ENST00000281581	r.?	-	-	intronic	41	0	0	37	12	32.4	36	2	5.6	39	12	30.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.023193347	1.023193347	1	0.173038855	0.173038855	1	0.792	0.792	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.03E-19	1	0.014070883	1	8.43E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	62521316	G	A	SYT16	CCDS45121.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	38	0	0	39	9	23.1	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.713785276	0.713785276	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.62E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	63541793	G	T	KCNH5	CCDS45123.1	r.?	-	-	intronic	60	0	0	51	0	0	46	15	32.6	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.007333333	1.007333333	1	0.061714286	0.061714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.35E-23	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	68708398	A	T	RAD51L1	CCDS9789.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	43	18	41.9	40	4	10	36	6	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.323203742	1.323203742	1	0.308997955	0.308997955	1	0.429428571	0.429428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.06E-30	1	0.0000495	1	2.68E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	68753141	G	T	RAD51L1	CCDS9789.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	29	9	31	50	15	30	42	15	35.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.978981289	0.978981289	1	0.926993865	0.926993865	1	0.918	0.918	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.79E-14	1	5.83E-23	1	2.65E-24	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	69779311	G	A	GALNTL1	CCDS32107.1	r.?	-	-	intronic	55	0	0	32	12	37.5	32	0	0	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.184251559	1.184251559	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.03E-20	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	71458848	A	G	PCNX	CCDS9806.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	44	0	0	49	14	28.6	29	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.883734151	0.883734151	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.50E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	76108274	C	T	FLVCR2	CCDS9844.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	33	12	36.4	42	0	0	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.149513514	1.149513514	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	7.86E-20	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	77466646	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	27	0	0	44	21	47.7	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.473920245	1.473920245	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.60E-37	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	78791159	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	28	13	46.4	45	17	37.8	31	15	48.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.465313929	1.465313929	1	1.16801227	1.16801227	1	1.244571429	1.244571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.26E-23	1	7.37E-28	1	8.51E-27	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	78933200	A	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	40	8	20	37	1	2.7	39	10	25.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.631600832	0.631600832	1	0.083429448	0.083429448	1	0.658285714	0.658285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.61E-11	1	0.169281299	1	5.44E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	81652905	G	A	GTF2A1	CCDS9873.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	34	0	0	46	12	26.1	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.806484663	0.806484663	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.12E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	82359532	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	38	0	0	36	6	16.7	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.516026585	0.516026585	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.68E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	82367323	A	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	32	11	34.4	46	19	41.3	45	14	31.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.08635343	1.08635343	1	1.276161554	1.276161554	1	0.799714286	0.799714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.72E-18	1	6.97E-32	1	8.81E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	82943491	T	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	41	0	0	40	10	25	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.772494888	0.772494888	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.22E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	83031437	G	A	-	-	-	-	-	-	46	0	0	32	0	0	36	9	25	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.772494888	0.772494888	1	0.079714286	0.079714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.63E-13	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	83342527	C	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	32	0	0	35	7	20	24	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.61799591	0.61799591	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.65E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	84415401	C	A	-	-	-	-	-	-	53	0	0	36	0	0	41	0	0	33	4	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.311142857	0.311142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	86280659	C	T	-	-	-	-	-	-	49	0	0	46	0	0	45	15	33.3	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.02896319	1.02896319	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.14E-24	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	87905820	A	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	26	9	34.6	29	0	0	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.092669439	1.092669439	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.65E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	88188552	C	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	26	10	38.5	38	1	2.6	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.215831601	1.215831601	1	0.080339468	0.080339468	1	0.151714286	0.151714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	7	NA	1	1	4.82E-17	1	0.173434892	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	88241715	G	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	32	0	0	33	9	27.3	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.843564417	0.843564417	1	0.198	0.198	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	6.76E-14	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	88588792	A	G	-	-	-	-	-	-	44	0	0	38	0	0	45	19	42.2	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.30397137	1.30397137	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.11E-32	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	88755133	G	A	KCNK10	CCDS9881.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	37	13	35.1	45	0	0	40	0	0	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.108459459	1.108459459	1	0	0	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.89E-21	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	90361916	A	G	C14orf143	CCDS9887.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	53	0	0	35	7	20	31	1	3.2	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.61799591	0.61799591	1	0.082285714	0.082285714	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.65E-10	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	96089035	A	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	37	11	29.7	28	10	35.7	34	15	44.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.937927235	0.937927235	1	1.103122699	1.103122699	1	1.134	1.134	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.70E-17	1	1.18E-16	1	5.18E-26	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	96352168	C	T	AL133167.1	ENST00000503525	r.?	-	-	intronic	38	0	0	49	0	0	50	20	40	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.23599182	1.23599182	1	0.239142857	0.239142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	3.90E-33	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	99197001	T	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	38	13	34.2	34	0	0	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.080037422	1.080037422	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.88E-21	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	100608862	G	T	EVL	CCDS9955.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	31	0	0	55	12	21.8	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.673615542	0.673615542	1	0.159428571	0.159428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.78E-17	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	102641741	T	C	WDR20	CCDS9968.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	32	17	53.1	35	10	28.6	32	10	31.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.676900208	1.676900208	1	0.883734151	0.883734151	1	0.802285714	0.802285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.02E-31	1	1.60E-15	1	5.70E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	104725118	C	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	36	12	33.3	40	0	0	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.051615385	1.051615385	1	0	0	1	0.061714286	0.061714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.73E-19	1	1	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	105086077	C	G	-	-	-	-	-	-	50	0	0	29	10	34.5	44	14	31.8	36	16	44.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.089511435	1.089511435	1	0.982613497	0.982613497	1	1.141714286	1.141714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.79E-16	1	6.10E-22	1	1.01E-27	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	14	106065109	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	19	5	26.3	24	1	4.2	26	5	19.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.830555094	0.830555094	1	0.129779141	0.129779141	1	0.493714286	0.493714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.43E-08	1	0.113346489	1	0.000000188	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	20758391	C	A	-	-	-	-	-	-	10	0	0	12	3	25	10	2	20	11	2	18.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.03950104	1.03950104	1	0.81799591	0.81799591	1	0.65	0.65	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.0000266	1	0.001095391	1	0.001334363	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	22859858	G	A	TUBGCP5	CCDS10008.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	42	13	31	62	0	0	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.288981289	1.288981289	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.72E-20	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	23378154	C	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	47	0	0	67	1	1.5	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.061349693	0.061349693	1	0.414285714	0.414285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.285262761	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	24323138	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	39	0	0	53	11	20.8	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.850715746	0.850715746	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.07E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	25110902	A	G	SNRPN	CCDS10017.1	r.?	-	-	intronic	62	0	0	35	14	40	64	18	28.1	51	13	25.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.663201663	1.663201663	1	1.149284254	1.149284254	1	0.910714286	0.910714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.28E-23	1	1.10E-26	1	4.87E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	25171579	A	G	SNRPN	CCDS10017.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	52	11	21.2	51	1	2	48	11	22.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.881496881	0.881496881	1	0.081799591	0.081799591	1	0.817857143	0.817857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.44E-15	1	0.225579006	1	9.31E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	25608856	T	C	UBE3A	CCDS45191.1	r.?	-	-	intronic	52	0	0	57	0	0	59	9	15.3	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.625766871	0.625766871	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.96E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	25888961	G	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	57	9	15.8	49	0	0	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.656964657	0.656964657	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.42E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	25924582	C	T	ATP10A	CCDS32178.1	r.4512g>a	c.4406G>A	p.R1469H	missense	24	0	0	35	10	28.6	51	2	3.9	49	7	14.3	76	0	0	188	55	29.3	153	4	2.6	125	15	12	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.189189189	1.189189189	1	0.159509202	0.159509202	1	0.510714286	0.510714286	1	1.218295218	1.218295218	1	0.106339468	0.106339468	1	0.428571429	0.428571429	1	7	6	1	1	1.60E-15	2.06E-79	0.027109304	0.00760798	5.58E-09	1.65E-16	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	15	26296567	G	A	ENSG00000206187	ENST00000383019	r.?	-	-	intronic	54	0	0	43	9	20.9	55	0	0	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.869022869	0.869022869	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	9.45E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	26713084	C	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	46	0	0	56	12	21.4	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.875255624	0.875255624	1	0.110714286	0.110714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.11E-16	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	26899248	T	G	GABRB3	CCDS10019.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	46	0	0	60	8	13.3	54	0	0	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.54396728	0.54396728	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.93E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	27042737	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	34	12	35.3	59	14	23.7	42	10	23.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.467775468	1.467775468	1	0.969325153	0.969325153	1	0.85	0.85	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.21E-19	1	6.58E-20	1	1.24E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	27079670	G	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	36	7	19.4	50	2	4	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.806652807	0.806652807	1	0.163599182	0.163599182	1	0.310714286	0.310714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.74E-10	1	0.026131524	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	27269958	G	T	GABRG3	CCDS45195.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	39	7	17.9	55	0	0	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.744282744	0.744282744	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.04E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	27301438	C	T	GABRG3	CCDS45195.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	36	9	25	45	0	0	39	10	25.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.03950104	1.03950104	1	0	0	1	0.914285714	0.914285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.63E-13	1	1	1	5.44E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	27592185	G	A	GABRG3	CCDS45195.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	42	10	23.8	47	2	4.3	50	7	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.98960499	0.98960499	1	0.175869121	0.175869121	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.24E-14	1	0.02328732	1	6.46E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	27787035	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	59	15	25.4	55	19	34.5	55	17	30.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	1	100	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.056133056	1.056133056	1	1.411042945	1.411042945	1	1.103571429	1.103571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3.571428571	3.571428571	1	8	NA	1	1	9.90E-22	1	4.51E-30	1	4.35E-26	0.005	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	28232123	C	T	OCA2	CCDS10020.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	45	0	0	47	0	0	41	6	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.521428571	0.521428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	6.05E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	30252114	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	41	14	34.1	55	0	0	52	10	19.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.417879418	1.417879418	1	0	0	1	0.685714286	0.685714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.90E-22	1	1	1	1.28E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	30268094	C	G	-	-	-	-	-	-	45	0	0	47	0	0	55	0	0	51	6	11.8	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.421428571	0.421428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000232	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	32967204	A	G	SCG5	CCDS45207.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	41	7	17.1	57	11	19.3	48	14	29.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.711018711	0.711018711	1	0.789366053	0.789366053	1	1.042857143	1.042857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.51E-09	1	7.29E-15	1	2.51E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	35014376	G	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	41	0	0	53	8	15.1	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.617586912	0.617586912	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.83E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	35058142	G	A	AC087457.1	ENST00000503496	r.?	-	-	intronic	43	0	0	39	0	0	41	5	12.2	55	0	0	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.498977505	0.498977505	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000202	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	37277954	C	T	MEIS2	CCDS45217.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	53	12	22.6	46	9	19.6	57	16	28.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.93970894	0.93970894	1	0.801635992	0.801635992	1	1.003571429	1.003571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.39E-17	1	1.82E-12	1	7.28E-24	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	37330419	T	C	MEIS2	CCDS45217.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	46	0	0	74	13	17.6	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.719836401	0.719836401	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.62E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	37590245	A	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	28	0	0	53	11	20.8	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.850715746	0.850715746	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.07E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	37594389	C	T	-	-	-	-	-	-	49	0	0	48	13	27.1	60	0	0	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.126819127	1.126819127	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.00E-19	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	38046675	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	40	0	0	47	8	17	44	9	20.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.695296524	0.695296524	1	0.732142857	0.732142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.03E-10	1	1.18E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	45297622	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	42	9	21.4	59	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.88981289	0.88981289	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	7.51E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	46811901	A	G	-	-	-	-	-	-	42	0	0	46	9	19.6	39	0	0	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.814968815	0.814968815	1	0	0	1	0.260714286	0.260714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.82E-12	1	1	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	47262401	C	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	43	11	25.6	42	12	28.6	39	9	23.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.064449064	1.064449064	1	1.169734151	1.169734151	1	0.825	0.825	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.42E-16	1	2.35E-18	1	3.62E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	49345043	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	55	0	0	51	12	23.5	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.961145194	0.961145194	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.24E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	49506322	C	G	GALK2	CCDS32236.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	37	0	0	48	10	20.8	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.850715746	0.850715746	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.37E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	50519610	C	A	SLC27A2	CCDS10133.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	51	0	0	63	1	1.6	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.065439673	0.065439673	1	0.35	0.35	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.27078753	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	52268308	A	T	LEO1	CCDS10146.1	r.?	-	-	upstream	36	0	0	39	0	0	38	15	39.5	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.615541922	1.615541922	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.24E-25	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	52441926	C	T	GNB5	CCDS10149.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	35	8	22.9	55	0	0	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.952182952	0.952182952	1	0	0	1	0.107142857	0.107142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	8.15E-12	1	1	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	52768878	G	C	MYO5A	CCDS42037.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	50	0	0	69	0	0	63	7	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.396428571	0.396428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	3.38E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	53173374	A	T	-	-	-	-	-	-	57	0	0	46	0	0	59	12	20.3	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.830265849	0.830265849	1	0.082142857	0.082142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.20E-16	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	53422094	C	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	49	0	0	51	14	27.5	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.124744376	1.124744376	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	2	NA	1	1	1	1	6.64E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	54313289	C	T	UNC13C	CCDS45264.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	57	10	17.5	55	0	0	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.727650728	0.727650728	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.40E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	55546169	G	A	RAB27A	CCDS10153.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	43	6	14	53	1	1.9	57	0	0	294	0	0	182	39	21.4	85	0	0	122	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.582120582	0.582120582	1	0.077709611	0.077709611	1	0	0	1	0.88981289	0.88981289	1	0	0	1	0	0	1	6	4	1	1	8.13E-08	7.61E-51	0.233303855	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	15	56674155	C	G	TEX9	CCDS10157.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	44	1	2.3	47	10	21.3	66	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.095634096	0.095634096	1	0.871165644	0.871165644	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	0.197923942	1	4.27E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	58069119	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	42	10	23.8	41	1	2.4	51	8	15.7	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.98960499	0.98960499	1	0.098159509	0.098159509	1	0.560714286	0.560714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.24E-14	1	0.18577148	1	2.05E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	59630047	T	G	MYO1E	CCDS32254.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	52	8	15.4	58	0	0	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.64033264	0.64033264	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.42E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	60637667	A	G	ANXA2	CCDS10175.1	r.?	-	-	downstream	45	0	0	37	0	0	57	6	10.5	36	4	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.429447853	0.429447853	1	0.396428571	0.396428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.000000456	1	0.0000324	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	61809035	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	40	9	22.5	48	16	33.3	43	11	25.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.935550936	0.935550936	1	1.36196319	1.36196319	1	0.914285714	0.914285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.64E-13	1	2.96E-25	1	2.42E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	61948071	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	55	12	21.8	40	0	0	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.906444906	0.906444906	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	8.78E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	63099880	C	A	TLN2	CCDS32261.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	42	0	0	57	9	15.8	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.646216769	0.646216769	1	0.296428571	0.296428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.42E-11	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	63540484	G	A	RAB8B	CCDS10183.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	42	12	28.6	45	0	0	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.189189189	1.189189189	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.35E-18	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	64188839	G	C	-	-	-	-	-	-	42	0	0	37	8	21.6	49	0	0	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.898128898	0.898128898	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.33E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	66296354	C	T	MEGF11	CCDS10213.2	r.?	-	-	intronic	51	0	0	51	11	21.6	57	1	1.8	48	6	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.898128898	0.898128898	1	0.073619632	0.073619632	1	0.446428571	0.446428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.94E-15	1	0.248523156	1	0.00000016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	68698564	G	A	ITGA11	CCDS45291.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	37	8	21.6	55	3	5.5	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.898128898	0.898128898	1	0.224948875	0.224948875	1	0.203571429	0.203571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.33E-11	1	0.002700822	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	68740222	T	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	44	0	0	49	9	18.4	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.752556237	0.752556237	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.35E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	71285921	C	T	LRRC49	CCDS32282.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	44	11	25	59	0	0	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.03950104	1.03950104	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.22E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	72156385	C	T	MYO9A	CCDS10239.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	50	9	18	37	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.748440748	0.748440748	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.07E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	74527657	C	A	CCDC33	CCDS42058.1	r.?	-	-	upstream	37	0	0	52	16	30.8	65	11	16.9	52	12	23.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.280665281	1.280665281	1	0.691206544	0.691206544	1	0.825	0.825	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.33E-24	1	3.41E-14	1	4.19E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	74530280	C	A	CCDC33	CCDS42058.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	29	0	0	60	0	0	61	7	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.410714286	0.410714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	2.69E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	74633490	G	A	CYP11A1	CCDS45303.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	49	9	18.4	49	2	4.1	39	7	17.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.765072765	0.765072765	1	0.167689162	0.167689162	1	0.639285714	0.639285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.35E-12	1	0.025168485	1	1.04E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	75081312	C	A	CSK	CCDS10269.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	42	0	0	61	1	1.6	53	9	17	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.065439673	0.065439673	1	0.607142857	0.607142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.263440347	1	7.10E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	75176574	G	C	-	-	-	-	-	-	46	0	0	66	0	0	66	20	30.3	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.239263804	1.239263804	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.11E-30	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	75415974	T	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	53	9	17	60	1	1.7	51	11	21.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.706860707	0.706860707	1	0.069529652	0.069529652	1	0.771428571	0.771428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.10E-12	1	0.259739042	1	1.94E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	76731675	C	A	SCAPER	ENST00000303521	r.?	-	-	intronic	51	0	0	31	6	19.4	65	0	0	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.806652807	0.806652807	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.03E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	78504701	C	T	ACSBG1	CCDS10298.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	48	0	0	61	18	29.5	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.206543967	1.206543967	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.08E-27	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	81298674	T	G	MESDC1	CCDS10316.1	r.?	-	-	downstream	36	0	0	56	0	0	51	15	29.4	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.202453988	1.202453988	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.22E-23	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	83335494	C	G	AP3B2	CCDS45331.1	r.2029+5g>c	c.1852+5G>C	p.?	ess splice	35	0	0	36	8	22.2	63	11	17.5	36	15	41.7	176	0	0	192	62	32.3	195	38	19.5	174	42	24.1	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.923076923	0.923076923	1	0.715746421	0.715746421	1	1.489285714	1.489285714	1	1.343035343	1.343035343	1	0.797546012	0.797546012	1	0.860714286	0.860714286	1	8	5	1	1	1.04E-11	1.99E-92	2.37E-14	7.14E-48	1.54E-25	4.87E-57	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	15	84389242	G	A	ADAMTSL3	CCDS10326.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	50	0	0	62	12	19.4	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.793456033	0.793456033	1	0.153571429	0.153571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.19E-16	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	85295122	C	G	-	-	-	-	-	-	46	0	0	50	0	0	50	9	18	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.736196319	0.736196319	1	0.253571429	0.253571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	4.07E-12	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	85797664	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	35	6	17.1	58	14	24.1	60	19	31.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.711018711	0.711018711	1	0.985685072	0.985685072	1	1.132142857	1.132142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.24E-08	1	5.04E-20	1	3.21E-29	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	87178177	G	A	AGBL1	ENST00000421325	r.?	-	-	intronic	38	0	0	40	10	25	34	0	0	29	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.03950104	1.03950104	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	7.22E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	88753393	A	C	NTRK3	CCDS10340.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	57	12	21.1	51	0	0	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.877338877	0.877338877	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.40E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	92940096	C	T	ST8SIA2	CCDS10372.1	r.?	-	-	intronic	58	0	0	53	0	0	55	7	12.7	63	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.519427403	0.519427403	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.28E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	93403370	A	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	49	0	0	58	16	27.6	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.128834356	1.128834356	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.00E-23	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	93899314	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	43	0	0	49	12	24.5	40	6	15	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.00204499	1.00204499	1	0.535714286	0.535714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.90E-17	1	5.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	94325641	C	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	40	6	15	51	2	3.9	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.623700624	0.623700624	1	0.159509202	0.159509202	1	0.414285714	0.414285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.18E-08	1	0.027109304	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	94425229	C	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	46	16	34.8	56	0	0	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.446985447	1.446985447	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.31E-25	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	95035880	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	52	0	0	48	7	14.6	53	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.597137014	0.597137014	1	0.135714286	0.135714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.81E-09	1	0.029108399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	95217032	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	46	0	0	49	13	26.5	47	7	14.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.083844581	1.083844581	1	0.532142857	0.532142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	2.71E-19	1	4.12E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	95330691	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	52	0	0	50	14	28	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.145194274	1.145194274	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.84E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	95602344	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	50	0	0	31	0	0	53	6	11.3	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.403571429	0.403571429	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000293	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	96629798	A	C	-	-	-	-	-	-	30	0	0	52	16	30.8	59	13	22	45	13	28.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.280665281	1.280665281	1	0.899795501	0.899795501	1	1.032142857	1.032142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.33E-24	1	3.99E-18	1	7.68E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	97366799	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	20	8	40	22	2	9.1	33	10	30.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.663201663	1.663201663	1	0.372188139	0.372188139	1	1.082142857	1.082142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.66E-14	1	0.005403392	1	8.14E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	97889840	T	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	63	8	12.7	60	0	0	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.528066528	0.528066528	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.18E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	98027863	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	55	0	0	52	10	19.2	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.785276074	0.785276074	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.28E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	98069365	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	45	0	0	43	8	18.6	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.760736196	0.760736196	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.85E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	15	98928106	G	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	47	1	2.1	48	8	16.7	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.087318087	0.087318087	1	0.683026585	0.683026585	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	0.209895027	1	1.23E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	85025	C	T	-	-	-	-	-	-	55	0	0	45	0	0	70	12	17.1	72	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.870386503	0.870386503	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.99E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	215013	G	C	HBM	CCDS32347.1	r.?	-	-	upstream	8	0	0	16	1	6.2	18	5	27.8	23	3	13	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.319796258	0.319796258	1	1.415014315	1.415014315	1	0.594285714	0.594285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.077068876	1	2.54E-08	1	0.000205387	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	426713	C	T	TMEM8A	CCDS10407.1	r.896g>a	c.735G>A	p.P245P	silent	54	0	0	57	0	0	79	18	22.8	55	0	0	11	0	0	164	0	0	334	60	18	238	0	0	TRUE	TRUE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.160515337	1.160515337	1	0	0	1	0	0	1	0.916196319	0.916196319	1	0	0	1	2	1	1	1	1	1	7.86E-25	2.54E-72	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	731557	G	A	STUB1	CCDS10419.1	r.728g>a	c.478G>A	p.E160K	missense	43	0	0	78	18	23.1	94	17	18.1	83	22	26.5	8	0	0	123	27	22	140	33	23.6	104	27	26	TRUE	TRUE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.19149896	1.19149896	1	0.921286299	0.921286299	1	1.211428571	1.211428571	1	1.134760915	1.134760915	1	1.201235174	1.201235174	1	1.188571429	1.188571429	1	8	7	1	1	6.10E-25	5.27E-36	1.12E-21	8.74E-45	1.23E-31	3.35E-38	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	2423814	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	61	14	23	59	2	3.4	58	11	19	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.186340956	1.186340956	1	0.173059305	0.173059305	1	0.868571429	0.868571429	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.10E-19	1	0.035441897	1	8.96E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	2768093	C	T	PRSS27	CCDS10476.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	60	12	20	71	1	1.4	65	7	10.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.031600832	1.031600832	1	0.071259714	0.071259714	1	0.493714286	0.493714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.74E-16	1	0.299450652	1	4.22E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	3681357	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	62	8	12.9	65	4	6.2	72	8	11.1	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.665382536	0.665382536	1	0.315578732	0.315578732	1	0.507428571	0.507428571	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.04E-09	1	0.000331785	1	3.52E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	3820624	G	A	CREBBP	CCDS10509.1	r.3632c>u	c.2827C>T	p.Q943*	nonsense	43	0	0	68	15	22.1	61	13	21.3	64	12	18.8	142	0	0	288	59	20.5	362	88	24.3	227	53	23.3	TRUE	TRUE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.139918919	1.139918919	1	1.084165644	1.084165644	1	0.859428571	0.859428571	1	1.057390852	1.057390852	1	1.236865031	1.236865031	1	1.065142857	1.065142857	1	8	7	1	1	1.06E-20	8.63E-75	6.41E-18	6.35E-118	6.30E-16	1.11E-70	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	16	4210383	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	63	0	0	75	28	37.3	64	1	1.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.898562372	0.949281186	2	0.073142857	0.073142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.34E-45	1	0.274433592	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	4789470	C	T	C16orf71	CCDS10521.1	r.?	-	-	intronic	52	0	0	54	7	13	74	11	14.9	64	11	17.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.670540541	0.670540541	1	0.758406953	0.758406953	1	0.786285714	0.786285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.13E-08	1	1.53E-13	1	2.85E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	5021807	C	A	SEC14L5	CCDS45403.1	r.?	-	-	intronic	52	0	0	50	0	0	69	23	33.3	62	1	1.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.69496319	0.847481595	2	0.073142857	0.073142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.15E-35	1	0.267123145	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	5274070	G	A	-	-	-	-	-	-	46	0	0	59	16	27.1	81	8	9.9	63	9	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.397819127	1.397819127	1	0.503907975	0.503907975	1	0.653714286	0.653714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.37E-23	1	9.08E-09	1	3.62E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	6201035	C	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	39	0	0	50	11	22	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.730612199	3	3	1	2	2	0	1	1	0.269387801	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	0.730612199	NA	NA	0	NA	0	1.119795501	1.119795501	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.52E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	6215397	G	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	49	0	0	61	5	8.2	47	1	2.1	292	0	0	168	0	0	97	15	15.5	160	0	0	FALSE	FALSE	1.730612199	3	2.406981261	1	2	1	0	1	1	0.269387801	1	0.593018739	1	NA	2	1	NA	1	0.730612199	NA	0.406981261	0	NA	0	0.417378323	0.417378323	1	0.083546606	0.083546606	1	0	NA	0	0.78894683	0.78894683	1	0	0	1	NA	NA	1	1	1	1	0.0000147	3.21E-18	0.209895027	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	16	6263566	G	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	56	9	16.1	60	0	0	62	0	0	34	0	0	155	37	23.9	159	0	0	181	0	0	TRUE	TRUE	1.730612199	3	2.406981261	1	2	1	0	1	1	0.269387801	1	0.593018739	1	NA	2	1	NA	1	0.730612199	NA	0.406981261	0.626067233	0.626067233	1	0	0	1	0	0	1	0.929379309	0.929379309	1	0	0	1	0	0	1	6	4	1	1	1.20E-11	3.04E-50	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	16	6610785	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	45	9	20	63	0	0	59	8	13.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	1.730612199	3	2.406981261	1	2	1	0	1	1	0.269387801	1	0.593018739	1	NA	2	1	NA	1	0.730612199	NA	0.406981261	0.777723271	0.777723271	1	0	0	1	0.541063737	1.329456143	0.406981261	NA	NA	0	NA	NA	1	0	0	1	7	NA	1	1	1.47E-12	1	1	1	6.90E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	6902677	G	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	47	7	14.9	67	0	0	56	0	0	446	1	0.2	186	22	11.8	202	0	0	243	3	1.2	TRUE	TRUE	1.730612199	3	2.406981261	1	2	1	0	1	1	0.269387801	1	0.593018739	1	NA	2	1	NA	1	0.730612199	NA	0.406981261	0.579403837	0.579403837	1	0	0	1	0	0	1	0.45885673	0.45885673	1	0	0	1	0.047740918	0.047740918	1	6	4	1	0.893071368	4.12E-09	2.26E-23	1	1	1	0.123349934	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	16	8123533	T	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	30	2	6.7	55	1	1.8	58	9	15.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.730612199	3	2.406981261	1	2	1	0	1	1	0.269387801	1	0.593018739	1	NA	2	1	NA	1	0.730612199	NA	0.406981261	0.260537296	0.356601349	0.730612199	0.091619632	0.091619632	1	0.616653524	0.616653524	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.009909649	1	0.240951649	1	1.67E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	8186813	C	A	-	-	-	-	-	-	51	0	0	37	7	18.9	71	0	0	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.730612199	3	2.406981261	1	2	1	0	1	1	0.269387801	1	0.593018739	1	NA	2	1	NA	1	0.730612199	NA	0.406981261	0.734948491	0.734948491	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	7.05E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	8325634	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	43	1	2.3	59	0	0	61	12	19.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.730612199	3	2.406981261	1	2	1	0	1	1	0.269387801	1	0.593018739	1	NA	2	1	NA	1	0.730612199	NA	0.406981261	0.089438176	NA	0	0	0	1	0.783746737	0.783746737	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.193893409	1	1	1	3.39E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	8365649	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	41	0	0	54	0	0	56	5	8.9	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	FALSE	FALSE	1.730612199	3	2.406981261	1	2	1	0	1	1	0.269387801	1	0.593018739	1	NA	2	1	NA	1	0.730612199	NA	0.406981261	0	NA	0	0	0	1	0.354078475	0.87001174	0.406981261	NA	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000965	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	9108416	C	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	66	11	16.7	67	0	0	71	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.730612199	3	2.406981261	1	2	1	0	1	1	0.269387801	1	0.593018739	1	NA	2	1	NA	1	0.730612199	NA	0.406981261	0.649398932	0.649398932	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.07E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	10183393	G	A	GRIN2A	CCDS10539.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	64	9	14.1	53	2	3.8	61	8	13.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.730612199	3	2.876826665	1	2	1	0	1	1	0.269387801	1	0.123173335	1	NA	2	1	NA	1	0.730612199	NA	0.876826665	0.548294906	0.750459556	0.730612199	0.193419223	0.193419223	1	0.582721436	0.582721436	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.20E-11	1	0.029108399	1	9.09E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	10184192	G	T	GRIN2A	CCDS10539.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	58	9	15.5	76	2	2.6	50	11	22	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.730612199	3	2.876826665	1	2	1	0	1	1	0.269387801	1	0.123173335	1	NA	2	1	NA	1	0.730612199	NA	0.876826665	0.602735535	0.602735535	1	0.132339468	0.132339468	1	0.978616152	0.978616152	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.67E-11	1	0.055865747	1	1.52E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	10184283	G	C	GRIN2A	CCDS10539.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	68	15	22.1	64	4	6.2	59	15	25.4	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.730612199	3	2.876826665	1	2	1	0	1	1	0.269387801	1	0.123173335	1	NA	2	1	NA	1	0.730612199	NA	0.876826665	0.859384215	0.859384215	1	0.315578732	0.315578732	1	1.12985683	1.12985683	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.06E-20	1	0.000312605	1	9.90E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	10184785	G	C	GRIN2A	CCDS10539.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	71	20	28.2	65	4	6.2	65	13	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	NA	3	2.876826665	NA	2	1	NA	1	1	NA	1	0.123173335	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.876826665	NA	NA	1	0.315578732	0.315578732	1	0.889651047	0.889651047	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.68E-29	1	0.000331785	1	1.57E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	10185140	G	C	GRIN2A	CCDS10539.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	72	25	34.7	58	1	1.7	67	9	13.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	NA	3	2.876826665	NA	2	1	NA	1	1	NA	1	0.123173335	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.876826665	NA	NA	1	0.086529652	0.086529652	1	0.596066202	0.596066202	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	3.63E-39	1	0.252280541	1	6.43E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	10277211	G	T	GRIN2A	CCDS10539.1	r.?	-	-	upstream	36	0	0	47	0	0	53	14	26.4	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	3	2.876826665	2	2	1	1	1	1	1	1	0.123173335	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.876826665	0	0	1	1.343754601	1.343754601	1	0.088965105	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.22E-20	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	10886477	C	T	FAM18A	CCDS45408.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	55	19	34.5	82	7	8.5	62	20	32.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2.876826665	2	2	1	1	1	1	1	1	0.123173335	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.876826665	1.779511435	0.889755717	2	0.432648262	0.432648262	1	1.436786441	0.765540296	1.876826665	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	4.51E-30	1	0.000000214	1	7.19E-31	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	10888530	G	T	FAM18A	CCDS45408.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	56	12	21.4	61	2	3.3	61	7	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	3	3	2.876826665	2	2	1	1	1	1	1	1	0.123173335	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.876826665	1.10381289	1.10381289	1	0.167969325	0.167969325	1	0.511549352	0.583409895	0.876826665	NA	NA	1	NA	NA	1	0	NA	0	7	NA	1	1	1.11E-16	1	0.037660755	1	2.69E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	11566597	C	T	ENSG00000188897	ENST00000344649	r.?	-	-	intronic	40	0	0	61	13	21.3	80	3	3.8	76	9	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2.876826665	2	2	1	1	1	1	1	1	0.123173335	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.876826665	1.098654886	1.098654886	1	0.193419223	0.193419223	1	0.524894118	0.598629283	0.876826665	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	6.41E-18	1	0.007711832	1	2.06E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	11798741	G	A	TXNDC11	CCDS32387.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	65	11	16.9	60	1	1.7	52	5	9.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2.876826665	2	2	1	1	1	1	1	1	0.123173335	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.876826665	0.871702703	0.871702703	1	0.086529652	0.086529652	1	0.427032503	0.487020434	0.876826665	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	3.41E-14	1	0.259739042	1	0.00000668	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	12228200	A	T	SNX29	CCDS45416.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	56	11	19.6	79	1	1.3	75	10	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2.876826665	2	2	1	1	1	1	1	1	0.123173335	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.876826665	1.010968815	1.010968815	1	0.066169734	0.066169734	1	0.591617946	0.674726226	0.876826665	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	5.91E-15	1	0.326987115	1	6.02E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	12330402	C	T	SNX29	CCDS45416.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	52	17	32.7	61	2	3.3	60	10	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2.876826665	2	2	1	1	1	1	1	1	0.123173335	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.876826665	1.68666736	0.84333368	2	0.167969325	0.167969325	1	0.742858624	0.742858624	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.42E-26	1	0.037660755	1	5.86E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	12774853	C	A	CPPED1	CCDS42120.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	44	14	31.8	56	1	1.8	66	10	15.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3	2.876826665	1	2	1	1	1	1	1	1	0.123173335	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.876826665	1.322245322	1.322245322	1	0.091619632	0.091619632	1	0.676134796	0.676134796	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	6.10E-22	1	0.244746891	1	1.60E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	13236296	C	A	SHISA9	CCDS45417.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	47	0	0	71	14	19.7	60	1	1.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3	2.876826665	1	2	1	1	1	1	1	1	0.123173335	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.876826665	0	0	1	1.002725971	1.002725971	1	0.075620339	0.075620339	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.13E-18	1	0.259739042	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	13297142	G	A	SHISA9	CCDS45417.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	52	0	0	42	6	14.3	47	4	8.5	373	1	0.3	218	5	2.3	132	27	20.5	177	21	11.9	TRUE	TRUE	2	3	2.876826665	1	2	1	1	1	1	1	1	0.123173335	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.876826665	0	0	1	0.727867076	0.727867076	1	0.378101695	0.431216009	0.876826665	0.095634096	0.095634096	1	1.043445808	1.043445808	1	0.529342373	0.529342373	1	3	3	1	0.845826718	1	0.005091582	7.02E-08	4.26E-35	0.0000939	2.08E-22	YES	0_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	16	16844724	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	76	15	19.7	75	1	1.3	74	9	12.2	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.309564301	3	2.876826665	2	2	1	1	1	1	0.690435699	1	0.123173335	3	NA	2	1	NA	1	0.309564301	NA	0.876826665	1.077110986	1.077110986	1	0.066169734	0.066169734	1	0.542687139	0.618921801	0.876826665	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	7	NA	1	1	6.51E-20	1	0.313356907	1	1.61E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	17916258	A	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	57	0	0	72	8	11.1	54	0	0	168	1	0.6	187	0	0	87	3	3.4	123	0	0	FALSE	FALSE	3.309564301	3	2.876826665	2	2	1	1	1	1	0.690435699	1	0.123173335	3	NA	2	1	NA	1	0.309564301	NA	0.876826665	0	0	1	0.56498773	0.56498773	1	0	NA	0	0	0	1	0.173059305	0.173059305	1	0	NA	0	NA	NA	1	0.569198144	1	1	3.52E-09	0.009696123	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	16	19075038	G	A	TMC7	CCDS10573.1	r.?	-	-	downstream	39	0	0	65	11	16.9	54	10	18.5	67	13	19.4	124	0	0	119	20	16.8	69	16	23.2	91	10	11	TRUE	TRUE	3.309564301	3	2.876826665	2	2	1	1	1	1	0.690435699	1	0.123173335	3	NA	2	1	NA	1	0.309564301	NA	0.876826665	0.92401907	0.92401907	1	0.941646217	0.941646217	1	0.862961516	0.862961516	1	0.918551501	0.918551501	1	1.180875256	1.180875256	1	0.489308076	0.558044247	0.876826665	8	5	1	1	3.41E-14	1.46E-24	1.91E-13	2.27E-22	2.41E-17	4.34E-11	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	16	19089787	T	A	COQ7	CCDS10574.1	r.1027u>a	c.?	p.?	3'UTR variant	43	0	0	75	0	0	87	0	0	78	7	9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.309564301	3	2.876826665	2	2	1	1	1	1	0.690435699	1	0.123173335	3	NA	2	1	NA	1	0.309564301	NA	0.876826665	0	0	1	0	0	1	0.400342971	0.400342971	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000151	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	19469566	C	G	TMC5	CCDS45431.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	70	15	21.4	69	1	1.4	67	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.309564301	3	2.876826665	2	2	1	1	1	1	0.690435699	1	0.123173335	3	NA	2	1	NA	1	0.309564301	NA	0.876826665	1.17005965	1.17005965	1	0.071259714	0.071259714	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.70E-20	1	0.292392265	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	20188528	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	65	11	16.9	60	3	5	50	6	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.309564301	3	2.876826665	2	2	1	1	1	1	0.690435699	1	0.123173335	3	NA	2	1	NA	1	0.309564301	NA	0.876826665	0.92401907	0.92401907	1	0.254498978	0.254498978	1	0.533790628	0.533790628	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	3.41E-14	1	0.003458198	1	0.000000206	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	20327310	C	T	GP2	CCDS42128.1	r.1628g>a	c.1478G>A	p.R493Q	missense	35	0	0	40	11	27.5	52	0	0	51	0	0	502	1	0.2	273	65	23.8	205	1	0.5	188	0	0	TRUE	TRUE	2.740461819	3	2.876826665	1	2	1	1	1	1	0.259538181	1	0.123173335	2	NA	2	1	NA	1	0.740461819	NA	0.876826665	1.347078144	1.347078144	1	0	0	1	0	0	1	1.165834902	1.165834902	1	0.025449898	0.025449898	1	0	0	1	6	4	1	0.919241818	9.88E-17	6.55E-87	1	0.642124842	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	16	22681993	G	A	ENSG00000224154	ENST00000430965	r.?	-	-	intronic	65	0	0	62	6	9.7	85	1	1.2	76	2	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.740461819	3	2.876826665	1	2	1	1	1	1	0.259538181	1	0.123173335	2	NA	2	1	NA	1	0.740461819	NA	0.876826665	0.4751512	0.641695747	0.740461819	0.061079755	0.061079755	1	0.115654636	0.115654636	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.000000756	1	0.346926798	1	0.055865747	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	23759892	T	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	48	0	0	68	12	17.6	70	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.740461819	3	2.876826665	1	2	1	1	1	1	0.259538181	1	0.123173335	2	NA	2	1	NA	1	0.740461819	NA	0.876826665	0	0	1	0.895836401	0.895836401	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.37E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	23923418	G	A	PRKCB	CCDS10619.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	39	0	0	73	0	0	55	7	12.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.740461819	3	2.876826665	1	2	1	1	1	1	0.259538181	1	0.123173335	2	NA	2	1	NA	1	0.740461819	NA	0.876826665	0	0	1	0	0	1	0.564928415	0.564928415	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	1.28E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	24085039	G	A	PRKCB	CCDS10619.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	68	0	0	71	1	1.4	67	7	10.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.740461819	3	2.876826665	1	2	1	1	1	1	0.259538181	1	0.123173335	2	NA	2	1	NA	1	0.740461819	NA	0.876826665	0	0	1	0.071259714	0.071259714	1	0.462618545	0.52760547	0.876826665	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.299450652	1	5.23E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	24146246	A	G	PRKCB	CCDS10619.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	51	11	21.6	73	1	1.4	73	7	9.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.740461819	3	2.876826665	1	2	1	1	1	1	0.259538181	1	0.123173335	2	NA	2	1	NA	1	0.740461819	NA	0.876826665	1.058068651	1.058068651	1	0.071259714	0.071259714	1	0.427032503	0.427032503	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.94E-15	1	0.306438632	1	9.54E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	24412801	G	A	RNU7-24P	ENST00000458867	r.?	-	-	upstream	41	0	0	64	0	0	67	11	16.4	66	1	1.5	182	0	0	198	0	0	74	17	23	121	2	1.7	TRUE	TRUE	2.740461819	3	2.876826665	1	2	1	1	1	1	0.259538181	1	0.123173335	2	NA	2	1	NA	1	0.740461819	NA	0.876826665	0	0	1	0.834756646	0.834756646	1	0.066723829	0.066723829	1	0	0	1	1.170695297	1.170695297	1	0.075620339	0.075620339	1	2	1	1	1	1	1	4.85E-14	1.34E-23	0.281671117	0.123221943	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	16	26303659	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	33	0	0	54	10	18.5	52	7	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.740461819	3	2	1	2	1	1	1	1	0.259538181	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.740461819	NA	NA	0	0	1	0.941646217	0.941646217	1	0.482142857	0.482142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.91E-13	1	8.58E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	26763005	C	T	-	-	-	-	-	-	50	0	0	43	0	0	58	10	17.2	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.740461819	3	2	1	2	1	1	1	1	0.259538181	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.740461819	NA	NA	0	0	1	0.875476483	0.875476483	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.10E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	26924802	G	A	-	-	-	-	-	-	49	0	0	43	12	27.9	70	1	1.4	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.740461819	3	2.646646418	1	2	1	1	1	1	0.259538181	1	0.353353582	2	NA	2	1	NA	1	0.740461819	NA	0.646646418	1.366672008	1.366672008	1	0.071259714	0.071259714	1	0.088579575	0.088579575	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.24E-18	1	0.295930304	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	27958279	G	A	GSG1L	CCDS45450.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	52	11	21.2	78	0	0	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.740461819	3	2.646646418	1	2	1	1	1	1	0.259538181	1	0.353353582	2	NA	2	1	NA	1	0.740461819	NA	0.646646418	1.038474787	1.038474787	1	0	0	1	0.097015725	0.097015725	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.44E-15	1	1	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	30601528	C	T	ZNF785	CCDS10685.1	r.?	-	-	upstream	31	0	0	39	5	12.8	51	0	0	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.740461819	3	2.646646418	1	2	1	1	1	1	0.259538181	1	0.353353582	2	NA	2	1	NA	1	0.740461819	NA	0.646646418	0.627003645	0.627003645	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.00000156	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	31493216	C	T	SLC5A2	CCDS10714.1	r.?	-	-	upstream	61	0	0	75	23	30.7	54	2	3.7	76	11	14.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.740461819	3	2.646646418	1	2	1	1	1	1	0.259538181	1	0.353353582	2	NA	2	1	NA	1	0.740461819	NA	0.646646418	1.503829055	0.864040244	1.740461819	0.188329243	0.188329243	1	0.611620873	0.945835091	0.646646418	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.10E-34	1	0.030129377	1	2.08E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	31769892	C	T	ZNF720	CCDS45473.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	52	0	0	66	0	0	52	6	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.740461819	3	2.646646418	1	2	1	1	1	1	0.259538181	1	0.353353582	2	NA	2	1	NA	1	0.740461819	NA	0.646646418	0	0	1	0	0	1	0.485078624	0.750145072	0.646646418	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000261	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	31917290	T	A	ZNF267	CCDS32440.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	62	0	0	48	5	10.4	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.740461819	3	2.646646418	1	2	1	1	1	1	0.259538181	1	0.353353582	2	NA	2	1	NA	1	0.740461819	NA	0.646646418	0	0	1	0.529357873	0.529357873	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000447	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	32126257	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	43	8	18.6	45	0	0	46	0	0	182	0	0	220	33	15	99	0	0	100	0	0	FALSE	FALSE	2.740461819	1	2.646646418	1	1	1	1	0	1	0.259538181	1	0.353353582	2	NA	2	1	NA	1	0.740461819	NA	0.646646418	0.911114672	0.911114672	1	0	NA	0	0	0	1	0.734769897	0.992313011	0.740461819	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	1	4.85E-11	8.60E-38	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	16	32126262	G	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	39	8	20.5	41	0	0	44	0	0	174	2	1.1	211	30	14.2	96	0	0	97	0	0	FALSE	FALSE	2.740461819	1	2.646646418	1	1	1	1	0	1	0.259538181	1	0.353353582	2	NA	2	1	NA	1	0.740461819	NA	0.646646418	1.004185525	1.004185525	1	0	NA	0	0	0	1	0.695582169	0.93938965	0.740461819	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	0.216440816	2.09E-11	8.97E-34	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	16	32607715	G	T	-	-	-	-	-	-	55	0	0	69	11	15.9	77	1	1.3	80	9	11.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	2.646646418	1	1	1	0	0	1	1	1	0.353353582	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.646646418	0.502122661	0.502122661	1	0.040169734	0.040169734	1	0.472424399	0.73057607	0.646646418	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	6.82E-14	1	0.320206172	1	3.29E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	32628434	G	A	-	-	-	-	-	-	53	0	0	58	8	13.8	78	0	0	68	1	1.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	2.646646418	1	1	1	0	0	1	1	1	0.353353582	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.646646418	0.435804574	0.435804574	1	0	0	1	0.063271125	0.063271125	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.99E-10	1	1	1	0.288836448	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	33426909	G	C	-	-	-	-	-	-	73	0	0	90	0	0	95	6	6.3	108	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	2.646646418	1	1	1	0	0	1	1	1	0.353353582	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.646646418	0	0	1	0.194668712	0.194668712	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	4	NA	1	1	1	1	0.00000928	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	34336177	G	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	23	0	0	42	10	23.8	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.735415133	0.735415133	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.24E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	35112358	G	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	31	12	38.7	40	1	2.5	38	10	26.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.222147609	1.222147609	1	0.077249489	0.077249489	1	0.676285714	0.676285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.16E-20	1	0.181679879	1	4.06E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	46849224	T	C	C16orf87	CCDS10724.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	26	0	0	54	14	25.9	31	0	0	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.800304703	0.800304703	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.64E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	49703933	C	T	ZNF423	CCDS32445.1	r.?	-	-	intronic	49	0	0	44	16	36.4	46	0	0	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.149513514	1.149513514	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.57E-26	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	50580202	A	G	NKD1	CCDS10743.1	r.?	-	-	upstream	37	0	0	21	5	23.8	41	0	0	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.75160499	0.75160499	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.95E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	50720062	C	T	SNX20	CCDS10744.1	r.?	-	-	upstream	46	0	0	29	8	27.6	46	0	0	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.871609148	0.871609148	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.53E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	51143171	C	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	38	0	0	41	12	29.3	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.905364008	0.905364008	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.69E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	51577262	A	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	32	10	31.2	46	0	0	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.985297297	0.985297297	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.70E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	60329609	G	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	28	0	0	41	14	34.1	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.053683027	1.053683027	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.90E-22	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	61930537	C	A	CDH8	CCDS10802.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	38	12	31.6	31	1	3.2	35	10	28.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.997929314	0.997929314	1	0.098879346	0.098879346	1	0.735428571	0.735428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.86E-19	1	0.143917729	1	1.60E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	62519130	G	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	35	0	0	39	9	23.1	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.713785276	0.713785276	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.62E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	62614795	T	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	45	0	0	48	14	29.2	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.902274029	0.902274029	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.51E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	63729781	T	G	-	-	-	-	-	-	38	0	0	38	0	0	38	2	5.3	38	5	13.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.163768916	0.163768916	1	0.339428571	0.339428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.015598339	1	0.00000137	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	63845005	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	42	15	35.7	49	0	0	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.127407484	1.127407484	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.65E-24	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	64455685	G	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	35	0	0	39	11	28.2	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.871374233	0.871374233	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.20E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	65204412	T	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	31	0	0	37	1	2.7	46	9	19.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.083429448	0.083429448	1	0.504	0.504	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.169281299	1	1.82E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	65666786	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	39	0	0	35	14	40	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.23599182	1.23599182	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.28E-23	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	65676505	C	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	34	0	0	40	12	30	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.926993865	0.926993865	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.20E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	69783138	T	C	NOB1	CCDS10884.1	r.519a>g	c.503A>G	p.D168G	missense	35	0	0	42	17	40.5	40	20	50	24	8	33.3	96	0	0	140	56	40	94	38	40.4	103	45	43.7	TRUE	TRUE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.278991684	1.278991684	1	1.544989775	1.544989775	1	0.856285714	0.856285714	1	1.263201663	1.263201663	1	1.248351738	1.248351738	1	1.123714286	1.123714286	1	8	7	1	1	1.73E-28	5.24E-90	1.19E-35	8.09E-62	2.68E-13	7.53E-75	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	16	70143602	G	A	ENSG00000090857	CCDS45520.1	r.?	-	-	upstream	40	0	0	40	0	0	41	10	24.4	25	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.75395501	0.75395501	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.51E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	70549348	G	A	COG4	CCDS10892.2	r.?	-	-	intronic	42	0	0	38	0	0	42	8	19	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.587096115	0.587096115	1	0	0	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.96E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	72816943	G	A	ZFHX3	CCDS10908.1	r.15905c>u	c.?	p.?	3'UTR variant	36	0	0	20	7	35	39	14	35.9	46	20	43.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.105301455	1.105301455	1	1.109302658	1.109302658	1	1.118571429	1.118571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.72E-12	1	8.19E-23	1	4.72E-34	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	73463381	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	35	0	0	22	4	18.2	20	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.562376278	0.562376278	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000425	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	74116407	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	40	13	32.5	43	0	0	25	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.026351351	1.026351351	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.30E-20	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	76564569	C	T	CNTNAP4	ENST00000307431	r.?	-	-	intronic	44	0	0	31	9	29	35	0	0	41	17	41.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.915821206	0.915821206	1	0	0	1	1.067142857	1.067142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.57E-14	1	1	1	1.03E-28	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	76668925	G	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	42	14	33.3	53	4	7.5	40	14	35	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.051615385	1.051615385	1	0.231748466	0.231748466	1	0.9	0.9	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.83E-22	1	0.000150502	1	1.25E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	77843188	A	C	VAT1L	CCDS32492.1	r.?	-	-	intronic	50	0	0	40	0	0	39	14	35.9	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.109302658	1.109302658	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.19E-23	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	79701850	G	A	-	-	-	-	-	-	46	0	0	27	0	0	37	16	43.2	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.334871166	1.334871166	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.78E-27	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	80167648	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	33	9	27.3	24	14	58.3	36	18	50	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.862135135	0.862135135	1	1.801458078	1.801458078	1	1.285714286	1.285714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.76E-14	1	1.14E-26	1	3.18E-32	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	81252161	G	A	PKD1L2	CCDS42202.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	33	0	0	35	10	28.6	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.883734151	0.883734151	1	0.051428571	0.051428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.60E-15	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	82727578	G	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	34	8	23.5	41	0	0	24	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.742130977	0.742130977	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	6.32E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	83031995	G	A	CDH13	ENST00000268613	r.?	-	-	intronic	49	0	0	30	12	40	36	11	30.6	29	14	48.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.263201663	1.263201663	1	0.945533742	0.945533742	1	1.242	1.242	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.94E-20	1	2.62E-17	1	4.41E-25	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	84521341	G	A	KIAA1609	CCDS32498.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	26	0	0	57	14	24.6	27	1	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.760134969	0.760134969	1	0.095142857	0.095142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.84E-20	1	0.126579904	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	86215554	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	31	0	0	39	12	30.8	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.951713701	0.951713701	1	0.061714286	0.061714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.43E-19	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	86539970	G	A	FOXF1	CCDS10957.2	r.?	-	-	upstream	37	0	0	40	0	0	40	10	25	19	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.772494888	0.772494888	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.22E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	88234762	G	A	-	-	-	-	-	-	50	0	0	44	15	34.1	58	16	27.6	35	10	28.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.076879418	1.076879418	1	0.852834356	0.852834356	1	0.735428571	0.735428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.12E-24	1	1.00E-23	1	1.60E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	88715978	G	T	MVD	CCDS10968.1	r.?	-	-	downstream	36	0	0	48	0	0	54	12	22.2	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.68597546	0.68597546	1	0.082285714	0.082285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.90E-17	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	16	89378519	T	C	ANKRD11	CCDS32513.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	33	9	27.3	43	1	2.3	29	5	17.2	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.862135135	0.862135135	1	0.07106953	0.07106953	1	0.442285714	0.442285714	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	6.76E-14	1	0.193893409	1	0.000000336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	1181867	T	C	TUSC5	CCDS42225.1	r.?	-	-	upstream	33	0	0	32	0	0	31	10	32.3	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.998063395	0.998063395	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.94E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	2572789	G	T	PAFAH1B1	CCDS32528.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	31	10	32.3	35	18	51.4	31	11	35.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.020035343	1.020035343	1	1.588249489	1.588249489	1	0.912857143	0.912857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.94E-16	1	1.60E-32	1	3.77E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	2624343	G	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	42	15	35.7	40	1	2.5	40	11	27.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.127407484	1.127407484	1	0.077249489	0.077249489	1	0.707142857	0.707142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.65E-24	1	0.181679879	1	9.88E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	3794388	G	A	CAMKK1	CCDS11038.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	35	13	37.1	49	0	0	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.171619543	1.171619543	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.63E-21	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	6129130	G	A	-	-	-	-	-	-	14	1	7.1	15	6	40	13	7	53.8	17	6	35.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.263201663	1.263201663	1	1.662408998	1.662408998	1	0.907714286	0.907714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	0.067769881	1	7.52E-11	1	1.31E-13	1	1.84E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	10055379	T	A	GAS7	CCDS11152.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	34	10	29.4	37	12	32.4	39	14	35.9	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.928453222	0.928453222	1	1.001153374	1.001153374	1	0.923142857	0.923142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.15E-15	1	4.03E-19	1	8.19E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	11521632	C	T	DNAH9	CCDS11160.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	44	12	27.3	39	1	2.6	21	3	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.862135135	0.862135135	1	0.080339468	0.080339468	1	0.367714286	0.367714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.44E-18	1	0.177567718	1	0.000155401	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	12288423	T	A	-	-	-	-	-	-	59	0	0	39	15	38.5	37	0	0	39	8	20.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.215831601	1.215831601	1	0	0	1	0.527142857	0.527142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	6.85E-25	1	1	1	2.09E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	12396767	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	27	10	37	50	3	6	33	8	24.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.168461538	1.168461538	1	0.185398773	0.185398773	1	0.622285714	0.622285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.62E-17	1	0.002055544	1	4.85E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	13907111	C	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	36	10	27.8	44	0	0	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.877925156	0.877925156	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.21E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	14740918	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	32	8	25	43	8	18.6	50	22	44	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.78950104	0.78950104	1	0.574736196	0.574736196	1	1.131428571	1.131428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.69E-12	1	4.85E-11	1	1.85E-37	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	15694119	T	G	-	-	-	-	-	-	46	0	0	37	3	8.1	42	4	9.5	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.255798337	0.255798337	1	0.293548057	0.293548057	1	0.239142857	0.239142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000855237	1	0.0000601	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	16618139	C	G	CCDC144A	CCDS45621.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	12	1	8.3	18	3	16.7	18	4	22.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.262114345	0.262114345	1	0.516026585	0.516026585	1	0.570857143	0.570857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.058377193	1	0.0000964	1	0.00000181	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	16859356	C	T	TNFRSF13B	CCDS11181.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	31	0	0	37	12	32.4	21	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.001153374	1.001153374	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.03E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	20877214	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	43	13	30.2	36	0	0	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.953717256	0.953717256	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.88E-20	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	22105371	C	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	26	0	0	36	0	0	29	4	13.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.354857143	0.354857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000134	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	28896079	C	A	ENSG00000231421	ENST00000436477	r.?	-	-	downstream	33	0	0	38	0	0	65	0	0	46	6	13	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.206293714	3	2.369512841	1	2	1	1	1	1	0.793706286	1	0.630487159	2	NA	2	1	NA	1	0.206293714	NA	0.369512841	0	0	1	0	0	1	0.512322384	1.386480596	0.369512841	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000123	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	30135569	A	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	62	27	43.5	68	1	1.5	61	8	13.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.206293714	3	2.369512841	1	2	1	1	1	1	0.793706286	1	0.630487159	2	NA	2	1	NA	1	0.206293714	NA	0.369512841	1.898469574	1.573803753	1.206293714	0.076349693	0.076349693	1	0.516263325	1.397145831	0.369512841	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.76E-45	1	0.288836448	1	9.09E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	30339565	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	39	0	0	71	14	19.7	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.206293714	3	2.369512841	1	2	1	1	1	1	0.793706286	1	0.630487159	2	NA	2	1	NA	1	0.206293714	NA	0.369512841	0	0	1	1.002725971	1.002725971	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.13E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	31020968	G	T	MYO1D	CCDS32615.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	44	0	0	61	13	21.3	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.206293714	3	2.369512841	1	2	1	1	1	1	0.793706286	1	0.630487159	2	NA	2	1	NA	1	0.206293714	NA	0.369512841	0	0	1	1.084165644	1.084165644	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.41E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	32354846	C	A	ACCN1	CCDS42296.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	40	12	30	65	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.206293714	3	2.369512841	1	2	1	1	1	1	0.793706286	1	0.630487159	2	NA	2	1	NA	1	0.206293714	NA	0.369512841	1.309289362	1.309289362	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.20E-18	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	32521213	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	56	1	1.8	63	12	19	58	0	0	203	0	0	145	0	0	100	20	20	130	0	0	TRUE	TRUE	2.206293714	3	2.369512841	1	2	1	1	1	1	0.793706286	1	0.630487159	2	NA	2	1	NA	1	0.206293714	NA	0.369512841	0.078557362	0.078557362	1	0.967096115	0.967096115	1	0	0	1	0	0	1	1.01799591	1.01799591	1	0	0	1	2	1	1	1	0.244746891	1	5.15E-16	3.49E-26	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	17	35242859	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	74	37	50	82	35	42.7	45	19	42.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	2.814306405	1.139114608	2.470608652	2.173421268	1.086710634	2	1.869479553	1.005844015	1.858617764	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	8	NA	1	1	1.06E-64	1	4.12E-58	1	4.11E-32	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	36453673	G	A	MRPL45	CCDS11326.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	53	0	0	73	13	17.8	60	2	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0	0	1	0.90601636	0.90601636	1	0.146191529	0.146191529	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	7.97E-17	1	0.036544784	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	36677621	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	56	0	0	63	6	9.5	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0	0	1	0.483548057	0.483548057	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.000000832	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	37034733	G	A	LASP1	CCDS11331.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	62	14	22.6	62	0	0	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	1.272066495	1.272066495	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.42E-19	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	38822967	G	T	KRT222	CCDS11371.1	r.?	-	-	upstream	41	0	0	66	0	0	59	14	23.7	72	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0	0	1	1.206325153	1.206325153	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	6.58E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	39255392	G	A	KRTAP4-8	CCDS45674.1	r.?	-	-	upstream	39	0	0	63	11	17.5	66	0	0	76	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0.985007242	0.985007242	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	2.37E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	39405546	A	G	KRTAP9-4	CCDS11386.1	r.?	-	-	upstream	42	0	0	62	0	0	57	10	17.5	69	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0	0	1	0.890746421	0.890746421	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	3.40E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	40255215	G	A	DHX58	CCDS11416.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	68	29	42.6	52	22	42.3	60	24	40	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	2.397789057	0.970525646	2.470608652	2.15306135	1.076530675	2	1.772018534	0.953406649	1.858617764	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	8	NA	1	1	2.12E-48	1	5.59E-37	1	1.81E-39	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	42327464	C	A	SLC4A1	CCDS11481.1	r.3254g>u	c.?	p.?	3'UTR variant	43	0	0	46	0	0	63	10	15.9	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0	0	1	0.809306748	0.809306748	1	0.088600927	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	9.81E-13	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	43437854	T	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	60	16	26.7	46	0	0	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	1.50283962	1.50283962	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.86E-23	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	45021102	G	T	GOSR2	CCDS42355.1	r.?	-	-	downstream	38	0	0	47	0	0	67	0	0	56	8	14.3	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0	0	1	0	0	1	0.633496626	0.633496626	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	1	NA	1	1	1	1	1	1	4.48E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	48064652	C	T	DLX3	CCDS11556.1	r.?	-	-	downstream	45	0	0	53	0	0	83	10	12	63	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0	0	1	0.610797546	0.610797546	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.70E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	48407801	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	51	0	0	70	15	21.4	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0	NA	0	1.089255624	1.089255624	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.70E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	49029020	C	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	47	0	0	51	9	17.6	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0	0	1	0.895836401	0.895836401	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	4.92E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	50952124	C	G	-	-	-	-	-	-	38	0	0	69	11	15.9	49	0	0	60	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0.894949437	0.894949437	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	6.82E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	51183341	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	65	10	15.4	51	0	0	63	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0.866806373	0.866806373	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.36E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	51379115	C	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	68	14	20.6	75	0	0	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	1.159494239	1.159494239	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	5.84E-19	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	53320964	C	T	-	-	-	-	-	-	34	1	2.9	62	31	50	58	3	5.2	64	18	28.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	2.814306405	1.139114608	2.470608652	0.264678937	0.264678937	1	1.24484302	1.24484302	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	0.156694864	1	1.86E-54	1	0.003141421	1	1.10E-26	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	54304608	C	T	ANKFN1	CCDS32686.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	68	10	14.7	65	1	1.5	62	4	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0.827406083	0.827406083	1	0.076349693	0.076349693	1	0.287953012	0.287953012	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	2.18E-12	1	0.278061424	1	0.000276647	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	55883494	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	61	13	21.3	67	0	0	61	0	0	172	0	0	268	45	16.8	111	0	0	152	0	0	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	1.198894529	1.198894529	1	0	0	1	0	NA	0	0.945606952	0.945606952	1	0	NA	0	0	NA	0	NA	NA	1	1	6.41E-18	2.92E-53	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	17	56554329	C	T	HSF5	CCDS32690.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	59	13	22	54	0	0	46	0	0	160	1	0.6	274	31	11.3	376	1	0.3	236	4	1.7	FALSE	TRUE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	1.238294818	1.238294818	1	0	0	1	0	NA	0	0.636033248	1.351512015	0.470608652	0.015269939	0.015269939	1	0.075310788	0.075310788	1	NA	4	1	0.551571797	3.99E-18	1.11E-31	1	0.848127773	1	0.03167645	YES	1_1	0_0	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	17	57034086	T	G	PPM1E	CCDS11613.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	63	0	0	64	21	32.8	55	7	12.7	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0	0	1	1.669513292	0.834756646	2	0.562615885	0.562615885	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	1.60E-32	1	1.28E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	62766943	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	70	0	0	72	1	1.4	62	8	12.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0	0	1	0.071259714	0.071259714	1	0.571475977	0.665576699	0.858617764	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	1	NA	1	1	1	1	0.302953399	1	1.04E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	63486661	G	C	-	-	-	-	-	-	24	0	0	40	15	37.5	60	24	40	48	20	41.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	2.110729804	1.055364902	2	2.03599182	1.01799591	2	1.847329322	0.993926432	1.858617764	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	1.09E-24	1	1.81E-39	1	1.40E-33	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	64511349	C	T	PRKCA	CCDS11664.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	47	13	27.7	45	0	0	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	1.559125748	1.559125748	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.47E-19	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	65581963	G	A	PITPNC1	ENST00000423236	r.?	-	-	intronic	27	0	0	66	11	16.7	58	0	0	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0.939978339	0.939978339	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.07E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	67645152	A	C	-	-	-	-	-	-	41	0	0	74	0	0	80	14	17.5	60	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0	0	1	0.890746421	0.890746421	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	6.76E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	67864663	A	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	55	0	0	53	0	0	65	6	9.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0	0	1	0	0	1	0.407564263	0.474674855	0.858617764	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.000001	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	68145185	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	54	8	14.8	47	0	0	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0.833034696	0.833034696	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	3.31E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	69192436	C	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	72	17	23.6	52	2	3.8	69	10	14.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	1.328352623	1.328352623	1	0.193419223	0.193419223	1	0.642356719	0.642356719	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	7.97E-24	1	0.028101652	1	2.54E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	69381268	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	49	0	0	74	15	20.3	65	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0	0	1	1.033265849	1.033265849	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	4.22E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	70667544	T	C	SLC39A11	CCDS11690.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	61	13	21.3	65	0	0	63	13	20.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	1.198894529	1.198894529	1	0	0	1	0.912589545	0.912589545	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	6.41E-18	1	1	1	1.01E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	71612453	C	T	SDK2	CCDS45769.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	62	8	12.9	63	17	27	65	16	24.6	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0.726091052	0.726091052	1	1.374294479	1.374294479	1	1.089791398	1.089791398	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	1.04E-09	1	6.22E-25	1	7.85E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	71744435	C	T	C17orf54	ENST00000444747	r.?	-	-	downstream	44	0	0	65	9	13.8	65	0	0	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0.776748568	0.776748568	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.85E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	72823894	T	G	TMEM104	CCDS32723.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	65	8	12.3	60	0	0	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0.692319376	0.692319376	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.53E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	72996141	G	A	CDR2L	CCDS11710.2	r.?	-	-	intronic	44	0	0	74	12	16.2	86	2	2.3	64	8	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0.911835275	0.911835275	1	0.11706953	0.11706953	1	0.553755792	0.644938662	0.858617764	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	4.02E-15	1	0.069370687	1	1.35E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	75164750	G	A	SEC14L1	CCDS42385.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	56	13	23.2	67	0	0	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	1.305838172	1.305838172	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.89E-18	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	75403191	C	G	Sep-09	CCDS45791.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	63	6	9.5	74	0	0	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0.534718217	0.534718217	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000000832	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	75550850	G	A	AC021683.1	ENST00000510484	r.?	-	-	upstream	33	0	0	53	12	22.6	64	4	6.2	48	5	10.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	1.272066495	1.272066495	1	0.315578732	0.315578732	1	0.460724819	0.536588967	0.858617764	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	5.39E-17	1	0.000312605	1	0.00000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	75800886	C	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	45	7	15.6	44	2	4.5	45	5	11.1	44	0	0	96	21	21.9	130	0	0	81	10	12.3	TRUE	TRUE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0.878063598	0.878063598	1	0.22904908	0.22904908	1	0.491735143	0.572705532	0.858617764	1.232666205	1.232666205	1	0	0	1	0.544895699	0.634619644	0.858617764	7	6	1	1	0.000000003	2.61E-28	0.020580492	1	0.00000323	1.33E-11	YES	1_1	1_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	17	76686109	T	C	CYTH1	CCDS42392.2	r.?	-	-	intronic	34	0	0	66	13	19.7	62	4	6.5	68	8	11.8	137	0	0	245	48	19.6	258	4	1.6	206	22	10.7	TRUE	TRUE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	1.108836724	1.108836724	1	0.330848671	0.330848671	1	0.522745468	0.608822097	0.858617764	1.103208111	1.103208111	1	0.081439673	0.081439673	1	0.474014958	0.474014958	1	7	6	1	1	1.95E-17	3.75E-60	0.000276647	0.041681931	2.21E-09	2.21E-22	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	17	77477301	C	T	ENSG00000167281	CCDS45805.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	73	8	11	68	13	19.1	55	21	38.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0.619147409	0.619147409	1	0.972186094	0.972186094	1	1.6922777	0.91050335	1.858617764	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	3.93E-09	1	2.96E-17	1	3.41E-34	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	77851185	C	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	57	0	0	60	6	10	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0	0	1	0.508997955	0.508997955	1	0.097461019	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.000000621	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	78104807	G	A	EIF4A3	CCDS11767.1	r.?	-	-	downstream	45	0	0	54	0	0	56	0	0	68	8	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0	0	1	0	0	1	0.522745468	0.608822097	0.858617764	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	1	NA	1	1	1	1	1	1	2.21E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	17	79425800	G	A	BAHCC1	ENST00000307745	r.?	-	-	intronic	40	0	0	59	9	15.3	78	1	1.3	54	0	0	1	0	0	125	25	20	196	2	1	108	0	0	FALSE	FALSE	3.470608652	3	2.858617764	2	2	1	1	1	1	0.529391348	1	0.141382236	3	NA	2	1	NA	1	0.470608652	NA	0.858617764	0.86117776	0.86117776	1	0.066169734	0.066169734	1	0	NA	0	1.125722562	1.125722562	1	0.050899796	0.050899796	1	0	NA	0	NA	NA	1	1	1.96E-11	2.39E-32	0.323605141	0.256864779	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	455648	C	T	COLEC12	CCDS32782.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	40	9	22.5	52	0	0	36	4	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.84871154	2	1	1	1	1	1	1	1	0.15128846	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.84871154	NA	0.935550936	0.935550936	1	0	0	1	0.396428571	0.396428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.64E-13	1	1	1	0.0000324	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	2892021	T	C	EMILIN2	CCDS11828.1	r.2055u>c	c.1896T>C	p.C632C	silent	36	0	0	58	0	0	50	11	22	50	0	0	138	0	0	209	0	0	155	36	23.2	147	1	0.7	TRUE	FALSE	2	2.84871154	2	1	1	1	1	1	1	1	0.15128846	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.84871154	NA	0	0	1	1.08651204	1.08651204	1	0	0	1	0	NA	0	1.145776333	1.145776333	1	0.025	0.025	1	2	NA	1	1	1	1	1.52E-15	1.88E-48	1	0.521377766	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	18	3418831	G	A	TGIF1	CCDS11835.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	50	0	0	74	14	18.9	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.84871154	2	1	1	1	1	1	1	1	0.15128846	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.84871154	NA	0	0	1	0.933412616	0.933412616	1	0.071428571	0.071428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.10E-18	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	5717561	C	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	41	0	0	51	6	11.8	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.84871154	2	1	1	1	1	1	1	1	0.15128846	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.84871154	NA	0	0	1	0.582765549	0.582765549	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000232	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	5741957	A	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	41	0	0	57	19	33.3	50	8	16	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.84871154	2	1	1	1	1	1	1	1	0.15128846	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.84871154	NA	0	0	1	1.644584133	0.88958396	1.84871154	0.571428571	0.571428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.01E-29	1	1.74E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	5841830	A	C	-	-	-	-	-	-	30	0	0	40	4	10	51	0	0	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.84871154	2	1	1	1	1	1	1	1	0.15128846	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.84871154	NA	0.415800416	0.415800416	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.0000495	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	6397502	G	T	L3MBTL4	CCDS11839.2	r.?	-	-	intronic	39	0	0	45	0	0	74	14	18.9	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.84871154	2	1	1	1	1	1	1	1	0.15128846	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.84871154	NA	0	0	1	0.933412616	0.933412616	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.10E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	6465283	A	G	-	-	-	-	-	-	51	0	0	43	0	0	70	15	21.4	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.84871154	2	1	1	1	1	1	1	1	0.15128846	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.84871154	NA	0	0	1	1.056879893	1.056879893	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.70E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	6685502	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	49	12	24.5	56	3	5.4	38	5	13.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.84871154	2	1	1	1	1	1	1	1	0.15128846	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.84871154	NA	1.018711019	1.018711019	1	0.266689319	0.266689319	1	0.471428571	0.471428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.90E-17	1	0.00284314	1	0.00000137	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	6820812	T	C	ARHGAP28	ENST00000419673	r.?	-	-	upstream	38	0	0	48	0	0	60	12	20	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.84871154	2	1	1	1	1	1	1	1	0.15128846	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.84871154	NA	0	0	1	0.987738218	0.987738218	1	0.075	0.075	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.74E-16	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	6844873	T	A	ARHGAP28	CCDS32785.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	37	0	0	50	1	2	43	6	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.84871154	2	1	1	1	1	1	1	1	0.15128846	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.84871154	NA	0	0	1	0.098773822	0.098773822	1	0.5	0.5	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.221687443	1	8.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	7187737	T	C	-	-	-	-	-	-	47	0	0	41	13	31.7	64	3	4.7	43	8	18.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.84871154	2	1	1	1	1	1	1	1	0.15128846	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.84871154	NA	1.318087318	1.318087318	1	0.232118481	0.232118481	1	0.664285714	0.664285714	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.89E-20	1	0.004148608	1	4.85E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	9471988	C	T	RALBP1	CCDS11845.1	r.?	-	-	upstream	45	0	0	46	8	17.4	66	11	16.7	61	18	29.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.84871154	2	1	1	1	1	1	1	1	0.15128846	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.84871154	NA	0.723492723	0.723492723	1	0.824761412	0.824761412	1	1.053571429	1.053571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	8.61E-11	1	4.07E-14	1	4.08E-27	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	9987912	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	47	8	17	63	0	0	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.84871154	2	1	1	1	1	1	1	1	0.15128846	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.84871154	NA	0.706860707	0.706860707	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.03E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	11393459	C	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	41	12	29.3	67	11	16.4	45	13	28.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.84871154	2	1	1	1	1	1	1	1	0.15128846	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.84871154	NA	1.218295218	1.218295218	1	0.809945339	0.809945339	1	1.032142857	1.032142857	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.69E-18	1	4.85E-14	1	7.68E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	13074995	G	A	CEP192	CCDS32792.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	55	0	0	79	0	0	56	7	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.84871154	2	1	1	1	1	1	1	1	0.15128846	1	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.84871154	NA	0	0	1	0	0	1	0.446428571	0.446428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	1.46E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	13940376	C	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	55	9	16.4	47	14	29.8	39	11	28.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.681912682	0.681912682	1	1.218813906	1.218813906	1	1.007142857	1.007142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.01E-11	1	1.79E-21	1	7.20E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	15047508	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	55	12	21.8	71	1	1.4	53	13	24.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0.906444906	0.906444906	1	0.057259714	0.057259714	1	0.801306795	0.801306795	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	8.78E-17	1	0.299450652	1	8.53E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	15253950	G	T	-	-	-	-	-	-	36	1	2.8	37	12	32.4	43	3	7	50	10	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	1.347193347	1.347193347	1	0.286298569	0.286298569	1	0.654127996	0.654127996	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	0.165106833	1	4.03E-19	1	0.001328364	1	8.36E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	18604297	G	C	ROCK1	CCDS11870.2	r.?	-	-	intronic	43	0	0	59	0	0	65	11	16.9	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.691206544	0.691206544	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	3.41E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	19567842	T	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	42	0	0	65	13	20	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.81799591	0.81799591	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.57E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	23449859	A	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	44	0	0	38	9	23.7	28	2	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.969325153	0.969325153	1	0.232215438	0.332110484	0.699211407	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	2.79E-13	1	0.008668191	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	25135395	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	39	11	28.2	39	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	1.172557173	1.172557173	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	7.20E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	26034822	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	32	0	0	45	0	0	50	5	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0	0	1	0.327063998	0.467761245	0.699211407	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000549	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	26350923	G	A	-	-	-	-	-	-	48	0	0	32	5	15.6	46	0	0	43	7	16.3	154	0	0	163	33	20.2	79	2	2.5	113	16	14.2	TRUE	TRUE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0.648648649	0.648648649	1	0	0	1	0.533114316	0.762450829	0.699211407	0.83991684	0.83991684	1	0.102249489	0.102249489	1	0.464430877	0.664220967	0.699211407	7	6	1	1	0.000000562	2.21E-42	1	0.059811146	2.15E-09	1.07E-18	YES	1_1	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	18	26728806	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	41	0	0	40	8	20	49	0	0	252	1	0.4	126	0	0	66	9	13.6	101	0	0	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.81799591	0.81799591	1	0	NA	0	0	0	1	0.556237219	0.556237219	1	0	NA	0	NA	NA	1	0.717241058	1	1	2.61E-11	5.59E-11	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	18	28721900	C	A	DSC1	CCDS11895.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	39	8	20.5	56	0	0	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0.852390852	0.852390852	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	2.09E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	30825508	G	T	C18orf34	CCDS42424.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	38	0	0	50	12	24	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.981595092	0.981595092	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	2.49E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	31240877	T	A	ASXL3	CCDS45847.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	43	7	16.3	57	17	29.8	48	8	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0.677754678	0.677754678	1	1.218813906	1.218813906	1	0.546196876	0.781161278	0.699211407	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	2.15E-09	1	8.82E-26	1	1.23E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	31346507	T	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	55	0	0	58	13	22.4	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.916155419	0.916155419	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	3.12E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	32653875	G	A	MAPRE2	CCDS11910.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	61	0	0	49	15	30.6	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	1.251533742	1.251533742	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	4.10E-23	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	32692297	G	A	MAPRE2	CCDS11910.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	46	13	28.3	41	10	24.4	42	8	19	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	1.176715177	1.176715177	1	0.99795501	0.99795501	1	0.621421596	0.621421596	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	1.07E-19	1	9.51E-15	1	3.96E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	35611097	C	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	31	9	29	59	15	25.4	41	10	24.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	1.205821206	1.205821206	1	1.038854806	1.038854806	1	0.798036155	0.798036155	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	3.57E-14	1	9.90E-22	1	9.51E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	35802478	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	41	15	36.6	51	0	0	36	0	0	269	0	0	174	46	26.4	87	1	1.1	114	0	0	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	1.521829522	1.521829522	1	0	0	1	0	NA	0	1.097713098	1.097713098	1	0.044989775	0.044989775	1	0	NA	0	NA	NA	1	1	1.71E-24	2.30E-64	1	0.353441203	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	18	36420783	G	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	41	0	0	49	7	14.3	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.584867076	0.584867076	1	0.379394237	0.542603044	0.699211407	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	5.58E-09	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	37963894	T	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	44	0	0	55	11	20	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.81799591	0.81799591	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	4.77E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	40807221	A	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	40	4	10	47	0	0	36	5	13.9	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0.415800416	0.415800416	1	0	0	1	0.454618957	0.65018813	0.699211407	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	0.0000495	1	1	1	0.00000104	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	41637768	C	T	-	-	-	-	-	-	50	0	0	46	8	17.4	56	3	5.4	52	7	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0.723492723	0.723492723	1	0.220858896	0.220858896	1	0.441536397	0.63147768	0.699211407	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	8.61E-11	1	0.00284314	1	8.58E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	44932117	T	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	50	13	26	37	0	0	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	1.081081081	1.081081081	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	0	NA	0	NA	NA	1	1	3.65E-19	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	46305370	C	T	KIAA0427	CCDS45864.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	50	0	0	65	19	29.2	52	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	1.194274029	1.194274029	1	0.06214216	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.89E-28	1	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	46845612	C	T	DYM	CCDS11937.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	32	0	0	59	9	15.3	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.625766871	0.625766871	1	0.0654128	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.96E-11	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	47938242	C	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	34	8	23.5	47	13	27.7	36	16	44.4	280	0	0	205	47	22.9	86	20	23.3	90	31	34.4	TRUE	TRUE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0.977130977	0.977130977	1	1.132924335	1.132924335	1	1.45216415	1.45216415	1	0.952182952	0.952182952	1	0.952965235	0.952965235	1	1.125100153	1.125100153	1	8	5	1	1	6.32E-12	1.86E-62	1.47E-19	1.27E-27	1.01E-27	4.56E-48	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	18	48323523	G	A	MRO	CCDS45868.1	r.3122c>u	c.?	p.?	3'UTR variant	36	0	0	49	0	0	52	9	17.3	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.707566462	0.707566462	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	5.92E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	49404589	A	C	-	-	-	-	-	-	36	0	0	49	10	20.4	45	0	0	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0.848232848	0.848232848	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	6.72E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	50584077	G	A	DCC	CCDS11952.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	47	0	0	67	11	16.4	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.670756646	0.670756646	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	4.85E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	50995190	A	G	DCC	CCDS11952.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	43	11	25.6	48	2	4.2	45	9	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	1.064449064	1.064449064	1	0.171779141	0.171779141	1	0.654127996	0.654127996	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	2.42E-16	1	0.024220359	1	1.47E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	51464639	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	53	16	30.2	65	0	0	46	0	0	208	2	1	158	37	23.4	61	0	0	106	0	0	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	1.255717256	1.255717256	1	0	0	1	0	NA	0	0.972972973	0.972972973	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	0.278988606	1.90E-24	6.71E-50	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	18	53410476	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	34	0	0	59	9	15.3	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.625766871	0.625766871	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.96E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	55308472	G	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	44	6	13.6	50	0	0	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0.565488565	0.565488565	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	9.37E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	56405300	A	G	MALT1	CCDS11967.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	37	10	27	43	10	23.3	31	11	35.5	237	3	1.3	209	49	23.4	62	11	17.7	88	21	23.9	TRUE	TRUE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	1.122661123	1.122661123	1	0.952965235	0.952965235	1	1.161077192	1.161077192	1	0.972972973	0.972972973	1	0.72392638	0.72392638	1	0.781682955	0.781682955	1	8	5	1	0.116836773	3.01E-15	1.42E-65	1.61E-14	1.96E-14	3.77E-18	3.45E-29	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	18	58009262	T	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	35	9	25.7	50	2	4	54	18	33.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	1.068607069	1.068607069	1	0.163599182	0.163599182	1	1.089123113	1.089123113	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.23E-13	1	0.026131524	1	3.12E-28	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	58276657	T	C	ENSG00000225749	ENST00000427772	r.?	-	-	upstream	34	0	0	32	5	15.6	46	0	0	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0.648648649	0.648648649	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000000562	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	58896167	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	48	11	22.9	55	1	1.8	38	8	21.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0.952182952	0.952182952	1	0.073619632	0.073619632	1	0.690105035	0.690105035	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	9.31E-16	1	0.240951649	1	1.67E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	59855271	G	A	KIAA1468	CCDS11979.2	r.758+7g>a	c.526+7G>A	p.?	splice region	31	0	0	42	16	38.1	52	16	30.8	46	10	21.7	109	0	0	175	37	21.1	222	47	21.2	145	43	29.7	TRUE	TRUE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	1.584199584	1.584199584	1	1.259713701	1.259713701	1	0.709728875	0.709728875	1	0.877338877	0.877338877	1	0.867075665	0.867075665	1	0.971380074	0.971380074	1	8	5	1	1	2.25E-26	4.38E-48	1.33E-24	1.16E-60	3.38E-14	9.56E-63	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	18	60299977	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	40	8	20	53	1	1.9	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0.831600832	0.831600832	1	0.077709611	0.077709611	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	2.61E-11	1	0.233303855	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	61732241	A	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	46	9	19.6	48	0	0	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0.814968815	0.814968815	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.82E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	62157760	G	T	-	-	-	-	-	-	51	0	0	44	11	25	48	12	25	41	9	22	162	0	0	152	30	19.7	82	25	30.5	88	18	20.5	TRUE	TRUE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	1.03950104	1.03950104	1	1.022494888	1.022494888	1	0.719540795	0.719540795	1	0.819126819	0.819126819	1	1.247443763	1.247443763	1	0.670481196	0.958910551	0.699211407	8	5	1	1	3.22E-16	2.58E-38	1.44E-17	1.71E-37	5.92E-13	6.62E-24	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	18	62713915	G	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	47	0	0	55	1	1.8	52	6	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.073619632	0.073619632	1	0.376123597	0.537925431	0.699211407	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	1	NA	1	1	1	1	0.240951649	1	0.000000261	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	62747923	A	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	46	0	0	37	5	13.5	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.552147239	0.552147239	1	0.081765999	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.00000119	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	62913552	A	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	52	0	0	50	0	0	38	5	13.2	338	0	0	223	1	0.4	117	0	0	132	8	6.1	TRUE	TRUE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0	0	1	0.431724477	0.617444843	0.699211407	0.016632017	0.016632017	1	0	0	1	0.199509039	0.199509039	1	1	2	1	1	1	0.673000562	1	1	0.00000137	0.000000415	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	18	64794005	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	21	0	0	31	6	19.4	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.793456033	0.793456033	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	0	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.03E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	64941682	T	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	51	0	0	62	12	19.4	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.793456033	0.793456033	1	0.363041038	0.519214981	0.699211407	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	4.19E-16	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	65180175	C	T	DSEL	CCDS11995.1	r.3175g>a	c.1701G>A	p.V567V	silent	42	0	0	33	0	0	43	10	23.3	48	0	0	170	0	0	170	0	0	116	15	12.9	131	0	0	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.952965235	0.952965235	1	0	NA	0	0	0	1	0.527607362	0.527607362	1	0	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.61E-14	5.23E-17	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	18	65211388	A	G	AC114689.1	ENST00000500778	r.?	-	-	intronic	33	0	0	41	10	24.4	39	0	0	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	1.014553015	1.014553015	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	9.51E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	65483109	A	G	AC114689.1	ENST00000500778	r.?	-	-	intronic	39	0	0	45	0	0	47	12	25.5	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	1.042944785	1.042944785	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.09E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	65554994	T	C	AC114689.1	ENST00000500778	r.?	-	-	intronic	53	0	0	41	7	17.1	54	12	22.2	43	7	16.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0.711018711	0.711018711	1	0.90797546	0.90797546	1	0.533114316	0.762450829	0.699211407	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	1.51E-09	1	6.90E-17	1	2.15E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	66191756	A	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	55	6	10.9	57	12	21.1	57	12	21.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0.453222453	0.453222453	1	0.862985685	0.862985685	1	0.690105035	0.690105035	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	0.000000367	1	1.40E-16	1	1.40E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	68444024	G	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	48	0	0	47	0	0	52	7	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0	0	1	0.441536397	0.63147768	0.699211407	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	1	NA	1	1	1	1	1	1	8.58E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	68621586	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	52	12	23.1	43	11	25.6	43	10	23.3	254	0	0	172	43	25	83	22	26.5	86	12	14	TRUE	TRUE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0.96049896	0.96049896	1	1.047034765	1.047034765	1	0.762059115	0.762059115	1	1.03950104	1.03950104	1	1.083844581	1.083844581	1	0.457889597	0.654865742	0.699211407	8	5	1	1	4.19E-17	4.29E-59	2.42E-16	1.23E-31	1.61E-14	2.65E-14	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	18	68936838	C	A	-	-	-	-	-	-	54	0	0	52	0	0	50	12	24	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.981595092	0.981595092	1	0.07195408	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	2.49E-17	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	70404886	G	A	NETO1	CCDS12000.1	r.?	-	-	downstream	34	0	0	47	16	34	51	17	33.3	47	19	40.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	1.413721414	1.413721414	1	1.36196319	1.36196319	1	1.321338551	1.321338551	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	1.98E-25	1	9.59E-27	1	1.16E-31	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	72426638	T	G	ZNF407	CCDS45885.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	50	0	0	62	16	25.8	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	1.055214724	1.055214724	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	3.36E-23	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	73182767	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	39	0	0	48	10	20.8	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.850715746	0.850715746	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	5.37E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	73222193	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	38	8	21.1	58	1	1.7	45	7	15.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0.877338877	0.877338877	1	0.069529652	0.069529652	1	0.510219837	0.729707541	0.699211407	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.67E-11	1	0.252280541	1	0.000000003	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	75015210	T	C	-	-	-	-	-	-	46	0	0	38	0	0	57	9	15.8	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.646216769	0.646216769	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.42E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	75480790	C	G	-	-	-	-	-	-	48	0	0	46	0	0	50	11	22	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.899795501	0.899795501	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.52E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	75561129	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	33	0	0	41	8	19.5	45	0	0	294	0	0	162	0	0	140	21	15	122	1	0.8	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.797546012	0.797546012	1	0	NA	0	0	0	1	0.613496933	0.613496933	1	0.02616512	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	3.22E-11	1.28E-24	1	0.457479878	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	18	75591787	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	46	0	0	46	7	15.2	53	0	0	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.621676892	0.621676892	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	3.53E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	75824786	A	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	41	7	17.1	54	14	25.9	57	11	19.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0.711018711	0.711018711	1	1.059304703	1.059304703	1	0.631233516	0.902779202	0.699211407	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	1.51E-09	1	1.64E-20	1	7.29E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	76222281	A	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	65	16	24.6	51	2	3.9	37	8	21.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	1.022869023	1.022869023	1	0.159509202	0.159509202	1	0.706458235	0.706458235	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	7.85E-23	1	0.027109304	1	1.33E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	76579803	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	47	9	19.1	65	14	21.5	51	14	27.5	128	0	0	231	42	18.2	202	46	22.8	154	25	16.2	TRUE	TRUE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0.794178794	0.794178794	1	0.879345603	0.879345603	1	0.899425994	0.899425994	1	0.756756757	0.756756757	1	0.932515337	0.932515337	1	0.529843676	0.757773216	0.699211407	8	5	1	1	2.24E-12	2.26E-51	2.93E-19	5.15E-61	6.64E-21	6.41E-30	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	18	76640779	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	26	0	0	53	9	17	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.695296524	0.695296524	1	0.307440158	0.43969557	0.699211407	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	7.10E-12	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	76699580	T	G	-	-	-	-	-	-	42	0	0	55	0	0	59	9	15.3	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0	0	1	0.625766871	0.625766871	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.96E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	18	76920202	G	A	ATP9B	CCDS12014.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	54	7	13	55	15	27.3	47	7	14.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	1.699211407	1	1	1	1	1	0	1	1	0.300788593	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.699211407	0.540540541	0.540540541	1	1.116564417	1.116564417	1	0.487325357	0.696964254	0.699211407	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	1.13E-08	1	3.01E-22	1	4.12E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	526321	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	37	6	16.2	57	0	0	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.673596674	0.673596674	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.18E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	2452991	C	A	LMNB2	CCDS12090.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	12	1	8.3	16	2	12.5	26	3	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.345114345	0.345114345	1	0.511247444	0.511247444	1	0.410714286	0.410714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.058377193	1	0.002863359	1	0.000298167	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	3219599	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	28	5	17.9	41	10	24.4	39	8	20.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.744282744	0.744282744	1	0.99795501	0.99795501	1	0.732142857	0.732142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.000000279	1	9.51E-15	1	2.09E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	4027577	T	G	PIAS4	CCDS12118.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	28	4	14.3	46	7	15.2	40	9	22.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.594594595	0.594594595	1	0.621676892	0.621676892	1	0.803571429	0.803571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.0000116	1	3.53E-09	1	4.64E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	6428035	C	T	KHSRP	CCDS45936.1	r.?	-	-	upstream	43	0	0	59	0	0	54	11	20.4	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.834355828	0.834355828	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.84E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	7627558	G	A	PNPLA6	CCDS32891.1	r.?	-	-	downstream	47	0	0	42	0	0	48	13	27.1	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.108384458	1.108384458	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.00E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	7796134	G	A	CLEC4G	CCDS12185.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	33	8	24.2	59	0	0	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.006237006	1.006237006	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.85E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	8856734	T	C	-	-	-	-	-	-	11	0	0	13	1	7.7	12	3	25	16	1	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.32016632	0.32016632	1	1.022494888	1.022494888	1	0.221428571	0.221428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.063085307	1	0.0000266	1	0.077068876	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	8856777	A	C	-	-	-	-	-	-	15	0	0	12	0	0	12	3	25	18	2	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.022494888	1.022494888	1	0.396428571	0.396428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.0000266	1	0.003626632	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	8983572	G	A	ENSG00000205631	ENST00000380951	r.?	-	-	intronic	37	0	0	36	6	16.7	59	3	5.1	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.694386694	0.694386694	1	0.208588957	0.208588957	1	0.332142857	0.332142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.68E-08	1	0.003297476	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	10344472	C	T	S1PR2	CCDS12229.1	r.?	-	-	upstream	28	0	0	36	0	0	44	10	22.7	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.928425358	0.928425358	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.08E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	10892786	G	A	DNM2	CCDS45969.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	47	0	0	50	12	24	63	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.981595092	0.981595092	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.49E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	11421048	G	A	TSPAN16	CCDS12256.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	36	13	36.1	55	1	1.8	54	13	24.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.501039501	1.501039501	1	0.073619632	0.073619632	1	0.860714286	0.860714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.53E-21	1	0.240951649	1	1.12E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	11926041	G	A	ZNF440	CCDS42503.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	32	0	0	37	9	24.3	54	2	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.993865031	0.993865031	1	0.132142857	0.132142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.14E-13	1	0.030129377	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	12165382	G	A	ZNF878	CCDS45984.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	31	0	0	57	20	35.1	63	4	6.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.435582822	1.435582822	1	0.225	0.225	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	9.67E-32	1	0.000294233	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	14726981	C	T	EMR3	CCDS12315.1	r.?	-	-	downstream	38	0	0	46	0	0	47	10	21.3	39	5	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.871165644	0.871165644	1	0.457142857	0.457142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	4.27E-14	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	15132707	C	A	CCDC105	CCDS12322.1	r.1326c>a	c.1227C>A	p.L409L	silent	31	0	0	38	9	23.7	47	16	34	45	11	24.4	87	0	0	124	22	17.7	136	31	22.8	101	15	14.9	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.985446985	0.985446985	1	1.390593047	1.390593047	1	0.871428571	0.871428571	1	0.735966736	0.735966736	1	0.932515337	0.932515337	1	0.532142857	0.532142857	1	8	5	1	1	2.79E-13	2.04E-27	1.98E-25	1.15E-41	4.24E-16	6.06E-18	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	19	18591751	G	A	ELL	CCDS12380.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	43	0	0	88	18	20.5	57	12	21.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.838445808	0.838445808	1	0.753571429	0.753571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	6.62E-24	1	1.40E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	18705238	G	A	CRLF1	CCDS32962.1	r.1225c>u	c.1031C>T	p.P344L	missense	28	0	0	37	7	18.9	42	0	0	25	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.785862786	0.785862786	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	7.05E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	19423180	C	A	SF4	CCDS12399.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	44	9	20.5	46	1	2.2	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852390852	0.852390852	1	0.08997955	0.08997955	1	0.075	0.075	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.18E-12	1	0.205924651	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	20297840	C	G	ZNF90	CCDS46029.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	41	0	0	48	9	18.8	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.768916155	0.768916155	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.75E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	22990651	G	A	-	-	-	-	-	-	51	0	0	48	0	0	56	11	19.6	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.801635992	0.801635992	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.91E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	29506543	C	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	39	0	0	36	9	25	20	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.022494888	1.022494888	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.63E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	30665634	A	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	41	0	0	58	13	22.4	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.916155419	0.916155419	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.12E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	30855566	C	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	53	8	15.1	63	1	1.6	35	0	0	529	3	0.6	162	30	18.5	164	0	0	218	3	1.4	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.627858628	0.627858628	1	0.065439673	0.065439673	1	0	0	1	0.769230769	0.769230769	1	0	0	1	0.05	0.05	1	6	4	1	0.493209374	2.83E-10	2.04E-37	0.27078753	1	1	0.097121533	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	19	31499557	T	A	-	-	-	-	-	-	52	0	0	52	14	26.9	64	0	0	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.118503119	1.118503119	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	9.04E-21	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	31503224	T	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	30	6	20	40	0	0	61	12	19.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	0	0	1	0.703571429	0.703571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	8.37E-09	1	1	1	3.39E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	31510043	G	T	-	-	-	-	-	-	54	0	0	43	0	0	56	11	19.6	44	9	20.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.801635992	0.801635992	1	0.732142857	0.732142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	5.91E-15	1	1.18E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	32135341	G	T	ENSG00000232700	ENST00000441786	r.?	-	-	downstream	33	0	0	43	6	14	45	2	4.4	50	12	24	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.582120582	0.582120582	1	0.1799591	0.1799591	1	0.857142857	0.857142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	8.13E-08	1	0.021467209	1	2.49E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	32670262	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	44	0	0	59	14	23.7	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.969325153	0.969325153	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.58E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	32699871	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	52	9	17.3	42	0	0	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.719334719	0.719334719	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.92E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	32927182	G	T	DPY19L3	CCDS12422.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	45	0	0	48	10	20.8	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.850715746	0.850715746	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.37E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	34767346	G	A	KIAA0355	CCDS12436.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	48	0	0	65	14	21.5	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.879345603	0.879345603	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.93E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	36142481	G	A	COX6B1	CCDS12469.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	53	0	0	50	7	14	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.572597137	0.572597137	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.46E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	36179275	C	G	-	-	-	-	-	-	46	0	0	30	0	0	36	6	16.7	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.683026585	0.683026585	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.68E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	38040562	G	A	ZNF540	CCDS12506.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	43	9	20.9	62	3	4.8	51	6	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.151966758	2	1	2	1	1	1	1	1	0.848033242	1	NA	2	NA	NA	2	NA	NA	0.151966758	NA	0.869022869	0.869022869	1	0.251613423	1.655713564	0.151966758	0.421428571	0.421428571	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	9.45E-13	1	0.003793816	1	0.000000232	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	38825489	C	A	CATSPERG	CCDS12514.2	r.?	-	-	upstream	46	0	0	48	0	0	63	11	17.5	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	3.151966758	2	1	2	1	1	1	1	1	0.848033242	1	NA	2	NA	NA	2	NA	NA	0.151966758	NA	0	0	1	0.917340604	0.917340604	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.37E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	39721459	C	A	-	-	-	-	-	-	53	0	0	51	14	27.5	37	8	21.6	51	13	25.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.143451143	1.143451143	1	0.883435583	0.883435583	1	0.910714286	0.910714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.64E-21	1	1.33E-11	1	4.87E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	39818423	T	C	GMFG	CCDS12532.1	r.?	-	-	downstream	33	0	0	36	0	0	61	8	13.1	60	2	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.535787321	0.535787321	1	0.117857143	0.117857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.09E-10	1	0.036544784	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	43499285	G	A	PSG1	ENST00000449000	r.?	-	-	intronic	43	0	0	47	10	21.3	73	21	28.8	69	20	29	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.885654886	0.885654886	1	1.17791411	1.17791411	1	1.035714286	1.035714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.27E-14	1	4.03E-31	1	8.73E-30	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	44085921	G	A	IRGQ	CCDS33040.1	r.?	-	-	downstream	50	0	0	42	4	9.5	52	2	3.8	42	7	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.395010395	0.395010395	1	0.155419223	0.155419223	1	0.596428571	0.596428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.0000601	1	0.028101652	1	1.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	44949135	T	G	ZNF229	CCDS42574.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	41	0	0	38	0	0	53	5	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.335714286	0.335714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000734	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	45373060	G	A	PVRL2	CCDS42576.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	34	12	35.3	56	2	3.6	46	8	17.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.467775468	1.467775468	1	0.147239264	0.147239264	1	0.621428571	0.621428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.21E-19	1	0.032213353	1	8.61E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	45962854	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	40	12	30	46	14	30.4	33	14	42.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.247401247	1.247401247	1	1.243353783	1.243353783	1	1.514285714	1.514285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.20E-18	1	1.26E-21	1	4.57E-24	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	49204528	C	T	FUT2	CCDS33069.1	r.?	-	-	intronic	58	0	0	43	12	27.9	48	0	0	42	8	19	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.16008316	1.16008316	1	0	0	1	0.678571429	0.678571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.24E-18	1	1	1	3.96E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	51391413	G	T	ENSG00000225500	ENST00000440147	r.114c>a	c.114C>A	p.P38P	silent	45	0	0	54	5	9.3	50	0	0	32	0	0	493	0	0	204	6	2.9	139	0	0	187	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.386694387	0.386694387	1	0	0	1	0	0	1	0.120582121	0.120582121	1	0	0	1	0	0	1	6	2	1	1	0.00000806	0.000625414	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	19	52129456	C	T	SIGLEC14	CCDS33088.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	55	18	32.7	61	2	3.3	57	4	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.35966736	1.35966736	1	0.134969325	0.134969325	1	0.25	0.25	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.61E-28	1	0.037660755	1	0.000199821	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	52202644	G	A	ENSG00000227768	ENST00000417847	r.?	-	-	upstream	45	0	0	41	0	0	44	10	22.7	50	6	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.928425358	0.928425358	1	0.428571429	0.428571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	2.08E-14	1	0.000000206	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	53147407	C	T	-	-	-	-	-	-	48	0	0	44	0	0	63	17	27	45	1	2.2	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.104294479	1.104294479	1	0.078571429	0.078571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.22E-25	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	53344309	C	T	ZNF468	CCDS33094.1	r.1389g>a	c.1238G>A	p.C413Y	missense	37	0	0	51	0	0	45	8	17.8	42	0	0	190	0	0	193	0	0	100	15	15	131	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.72801636	0.72801636	1	0	0	1	0	0	1	0.613496933	0.613496933	1	0	0	1	2	1	1	1	1	1	7.14E-11	5.19E-18	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	19	54491412	T	C	MIR935	CCDS33104.1	r.6690u>c	c.?	p.?	3'UTR variant	34	0	0	60	12	20	48	0	0	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.74E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	54575242	C	T	ENSG00000248385	ENST00000506366	r.?	-	-	intronic	49	0	0	37	6	16.2	51	3	5.9	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.673596674	0.673596674	1	0.241308793	0.241308793	1	0.35	0.35	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.18E-08	1	0.002175924	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	54847939	C	G	LILRA4	CCDS12890.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	47	7	14.9	55	14	25.5	55	13	23.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.61954262	0.61954262	1	1.042944785	1.042944785	1	0.842857143	0.842857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.12E-09	1	2.19E-20	1	1.46E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	54954764	T	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	45	0	0	44	12	27.3	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.116564417	1.116564417	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.44E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	57442499	T	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	48	10	20.8	39	8	20.5	56	12	21.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.864864865	0.864864865	1	0.838445808	0.838445808	1	0.764285714	0.764285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.37E-14	1	2.09E-11	1	1.11E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	19	58835514	C	T	ZSCAN22	CCDS12975.1	r.?	-	-	upstream	40	0	0	51	0	0	61	14	23	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.940695297	0.940695297	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.10E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	741241	C	T	C20orf54	CCDS13007.1	r.2081g>a	c.?	p.?	3'UTR variant	45	0	0	47	0	0	54	16	29.6	68	1	1.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.210633947	1.210633947	1	0.053571429	0.053571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.69E-24	1	0.288836448	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	1658162	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	40	14	35	49	11	22.4	44	20	45.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.455301455	1.455301455	1	0.916155419	0.916155419	1	1.625	1.625	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.25E-22	1	1.19E-15	1	1.50E-34	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	4241504	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	56	0	0	60	17	28.3	57	4	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.157464213	1.157464213	1	0.25	0.25	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	2.41E-25	1	0.000199821	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	4305483	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	38	7	18.4	55	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.765072765	0.765072765	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	8.61E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	4683776	A	T	PRNP	CCDS13080.1	r.?	-	-	downstream	41	0	0	47	15	31.9	51	2	3.9	52	9	17.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.326403326	1.326403326	1	0.159509202	0.159509202	1	0.617857143	0.617857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.97E-23	1	0.027109304	1	5.92E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	5392095	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	49	13	26.5	48	1	2.1	46	7	15.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.101871102	1.101871102	1	0.085889571	0.085889571	1	0.542857143	0.542857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.71E-19	1	0.213845552	1	3.53E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	5444946	T	C	-	-	-	-	-	-	45	0	0	53	10	18.9	51	0	0	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.785862786	0.785862786	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.57E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	5858544	A	G	-	-	-	-	-	-	25	0	0	27	0	0	29	8	27.6	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.128834356	1.128834356	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.53E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	6951199	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	33	0	0	31	5	16.1	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.658486708	0.658486708	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000476	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	7553297	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	48	10	20.8	38	0	0	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.864864865	0.864864865	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.37E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	7735432	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	42	12	28.6	49	14	28.6	50	13	26	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.189189189	1.189189189	1	1.169734151	1.169734151	1	0.928571429	0.928571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.35E-18	1	3.50E-21	1	3.65E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	7986414	G	A	TMX4	CCDS13101.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	50	0	0	57	11	19.3	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.789366053	0.789366053	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.29E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	8481285	C	G	PLCB1	CCDS13103.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	58	0	0	65	13	20	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.81799591	0.81799591	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.57E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	8663773	A	G	PLCB1	CCDS13103.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	47	0	0	51	11	21.6	56	5	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.883435583	0.883435583	1	0.317857143	0.317857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.94E-15	1	0.00000965	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	9172853	G	C	PLCB4	CCDS13104.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	34	0	0	51	12	23.5	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.961145194	0.961145194	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.24E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	9307932	T	A	PLCB4	CCDS13104.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	44	0	0	59	15	25.4	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.038854806	1.038854806	1	0.178571429	0.178571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.90E-22	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	9709649	G	A	PAK7	CCDS13107.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	51	0	0	79	13	16.5	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.674846626	0.674846626	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.37E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	9764420	G	T	PAK7	CCDS13107.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	48	0	0	54	14	25.9	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.059304703	1.059304703	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.64E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	10431423	G	A	C20orf94	CCDS33439.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	35	6	17.1	57	0	0	52	0	0	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.711018711	0.711018711	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.24E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	12207057	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	45	19	42.2	53	3	5.7	49	11	22.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.754677755	1.754677755	1	0.233128834	0.233128834	1	0.8	0.8	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.11E-32	1	0.002429596	1	1.19E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	13059156	G	C	SPTLC3	CCDS13115.2	r.?	-	-	intronic	31	0	0	30	0	0	47	1	2.1	57	6	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.085889571	0.085889571	1	0.375	0.375	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.209895027	1	0.000000456	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	13677756	G	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	51	13	25.5	44	13	29.5	51	16	31.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.06029106	1.06029106	1	1.206543967	1.206543967	1	1.121428571	1.121428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.87E-19	1	5.49E-20	1	9.28E-25	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	13882754	A	T	SEL1L2	CCDS42852.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	39	0	0	51	7	13.7	49	6	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.560327198	0.560327198	1	0.435714286	0.435714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	7.46E-09	1	0.000000182	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	14095500	T	G	MACROD2	CCDS13120.2	r.?	-	-	intronic	35	0	0	58	11	19	48	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.79002079	0.79002079	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	8.96E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	17189860	T	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	50	0	0	54	11	20.4	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.834355828	0.834355828	1	0.167857143	0.167857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.84E-15	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	17504482	C	T	BFSP1	CCDS13126.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	44	13	29.5	60	15	25	38	11	28.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.226611227	1.226611227	1	1.022494888	1.022494888	1	1.032142857	1.032142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.49E-20	1	1.31E-21	1	5.19E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	18580077	C	T	DTD1	CCDS13138.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	44	14	31.8	49	11	22.4	39	9	23.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.322245322	1.322245322	1	0.916155419	0.916155419	1	0.825	0.825	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.10E-22	1	1.19E-15	1	3.62E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	18629373	G	T	DTD1	CCDS13138.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	41	0	0	40	11	27.5	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.124744376	1.124744376	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.88E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	19640720	G	A	SLC24A3	CCDS13140.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	41	10	24.4	54	11	20.4	48	13	27.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.014553015	1.014553015	1	0.834355828	0.834355828	1	0.967857143	0.967857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	9.51E-15	1	3.84E-15	1	2.00E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	20809562	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	61	19	31.1	58	0	0	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.293139293	1.293139293	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.64E-29	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	22206316	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	48	13	27.1	43	12	27.9	47	16	34	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.126819127	1.126819127	1	1.141104294	1.141104294	1	1.214285714	1.214285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.00E-19	1	3.24E-18	1	1.98E-25	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	22233159	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	50	11	22	37	0	0	55	8	14.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914760915	0.914760915	1	0	0	1	0.517857143	0.517857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.52E-15	1	1	1	3.86E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	23126787	A	C	-	-	-	-	-	-	50	0	0	38	6	15.8	57	19	33.3	58	12	20.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.656964657	0.656964657	1	1.36196319	1.36196319	1	0.739285714	0.739285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.76E-08	1	1.01E-29	1	1.76E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	23250820	C	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	33	0	0	46	9	19.6	29	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.801635992	0.801635992	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.82E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	24756472	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	51	10	19.6	52	3	5.8	41	8	19.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.814968815	0.814968815	1	0.237218814	0.237218814	1	0.696428571	0.696428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.04E-13	1	0.002300591	1	3.22E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	24827142	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	43	11	25.6	64	17	26.6	59	20	33.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.064449064	1.064449064	1	1.08793456	1.08793456	1	1.210714286	1.210714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.42E-16	1	8.43E-25	1	2.21E-31	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	30228985	T	A	COX4I2	CCDS13187.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	47	0	0	49	7	14.3	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.584867076	0.584867076	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.58E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	32582026	G	A	RALY	CCDS13229.1	r.?	-	-	intronic	53	0	0	57	0	0	44	9	20.5	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.838445808	0.838445808	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.18E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	35985333	G	A	SRC	CCDS13294.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	45	16	35.6	58	3	5.2	56	11	19.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.48024948	1.48024948	1	0.212678937	0.212678937	1	0.7	0.7	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	8.61E-26	1	0.003141421	1	5.91E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	37228376	A	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	51	0	0	61	10	16.4	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.670756646	0.670756646	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.98E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	38332155	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	43	0	0	52	10	19.2	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.785276074	0.785276074	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.28E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	38499515	G	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	49	13	26.5	36	0	0	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.101871102	1.101871102	1	0	0	1	0.389285714	0.389285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.71E-19	1	1	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	40356108	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	42	8	19	65	0	0	62	12	19.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.79002079	0.79002079	1	0	0	1	0.692857143	0.692857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.96E-11	1	1	1	4.19E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	40736351	C	A	PTPRT	CCDS42874.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	55	0	0	66	14	21.2	57	7	12.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.867075665	0.867075665	1	0.439285714	0.439285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	3.71E-19	1	1.66E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	42126701	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	40	11	27.5	57	0	0	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.143451143	1.143451143	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	9.88E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	43083630	C	T	C20orf62	ENST00000306731	r.?	-	-	intronic	40	0	0	43	12	27.9	85	2	2.4	43	13	30.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.16008316	1.16008316	1	0.098159509	0.098159509	1	1.078571429	1.078571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.24E-18	1	0.067975933	1	3.88E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	44560629	G	T	PCIF1	CCDS13388.1	r.?	-	-	upstream	31	0	0	35	12	34.3	42	14	33.3	54	20	37	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.426195426	1.426195426	1	1.36196319	1.36196319	1	1.321428571	1.321428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.83E-19	1	2.83E-22	1	2.61E-32	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	44560630	C	T	PCIF1	CCDS13388.1	r.?	-	-	upstream	30	0	0	35	12	34.3	42	14	33.3	55	20	36.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.426195426	1.426195426	1	1.36196319	1.36196319	1	1.3	1.3	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.83E-19	1	2.83E-22	1	4.08E-32	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	44720509	C	A	NCOA5	CCDS13392.1	r.?	-	-	upstream	43	0	0	30	0	0	57	8	14	54	6	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.572597137	0.572597137	1	0.396428571	0.396428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	5.19E-10	1	0.000000329	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	46806668	A	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	37	7	18.9	59	2	3.4	48	7	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.785862786	0.785862786	1	0.139059305	0.139059305	1	0.521428571	0.521428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.05E-10	1	0.035441897	1	4.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	46907272	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	62	12	19.4	58	10	17.2	42	14	33.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.806652807	0.806652807	1	0.703476483	0.703476483	1	1.189285714	1.189285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.19E-16	1	4.10E-13	1	2.83E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	47633029	C	T	ARFGEF2	CCDS13411.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	50	0	0	52	10	19.2	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.785276074	0.785276074	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.28E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	50296127	C	T	ATP9A	CCDS33489.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	52	15	28.8	50	0	0	44	0	0	2	0	0	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.197505198	1.197505198	1	0	0	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.15E-22	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	50463929	G	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	66	10	15.2	53	2	3.8	38	6	15.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.784016632	0.784016632	1	0.155419223	0.155419223	1	0.564285714	0.564285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.60E-12	1	0.029108399	1	3.76E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	52057993	G	T	TSHZ2	CCDS33490.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	44	13	29.5	49	13	26.5	46	10	21.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.521611227	1.521611227	1	1.083844581	1.083844581	1	0.775	0.775	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.49E-20	1	2.71E-19	1	3.38E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	52286830	C	T	RNU7-14P	ENST00000459331	r.?	-	-	upstream	37	0	0	62	0	0	59	12	20.3	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.830265849	0.830265849	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.20E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	53101801	C	T	DOK5	CCDS13446.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	49	5	10.2	37	1	2.7	42	7	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.526116424	0.526116424	1	0.110429448	0.110429448	1	0.596428571	0.596428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.00000496	1	0.169281299	1	1.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	53125958	C	T	DOK5	CCDS13446.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	63	27	42.9	45	11	24.4	49	15	30.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.212783784	1.106391892	2	0.99795501	0.99795501	1	1.092857143	1.092857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.06E-45	1	4.24E-16	1	4.10E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	53174086	C	T	DOK5	CCDS13446.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	41	15	36.6	52	12	23.1	49	13	26.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.887829522	0.943914761	2	0.944785276	0.944785276	1	0.946428571	0.946428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.71E-24	1	4.19E-17	1	2.71E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	53498684	T	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	67	28	41.8	43	0	0	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.156045738	1.078022869	2	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.81E-46	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	53588937	C	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	63	12	19	46	0	0	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.98002079	0.98002079	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	5.15E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	53713151	C	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	52	0	0	43	9	20.9	53	6	11.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.854805726	0.854805726	1	0.403571429	0.403571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	9.45E-13	1	0.000000293	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	53724314	A	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	44	10	22.7	41	0	0	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.170866944	1.170866944	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.08E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	54649401	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	39	0	0	51	6	11.8	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.482617587	0.482617587	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000232	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	55863725	C	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	64	12	18.8	58	10	17.2	37	6	16.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.781704782	0.781704782	1	0.703476483	0.703476483	1	0.578571429	0.578571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.30E-16	1	4.10E-13	1	3.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	57992183	G	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	35	17	48.6	32	4	12.5	37	13	35.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.020790021	2.020790021	1	0.511247444	0.511247444	1	1.253571429	1.253571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.18E-30	1	0.0000201	1	3.89E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	58008141	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	52	13	25	50	6	12	36	9	25	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.03950104	1.03950104	1	0.490797546	0.490797546	1	0.892857143	0.892857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.47E-19	1	0.000000206	1	1.63E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	59942754	A	C	CDH4	CCDS13488.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	48	0	0	56	14	25	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.022494888	1.022494888	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.91E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	60029524	C	T	CDH4	CCDS13488.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	43	10	23.3	54	1	1.9	55	8	14.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.968814969	0.968814969	1	0.077709611	0.077709611	1	0.517857143	0.517857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.61E-14	1	0.237137336	1	3.86E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	20	62056144	T	C	KCNQ2	CCDS13520.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	48	11	22.9	40	2	5	50	7	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.952182952	0.952182952	1	0.204498978	0.204498978	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.31E-16	1	0.017193422	1	6.46E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	9537712	A	G	-	-	-	-	-	-	130	0	0	152	0	0	157	10	6.4	138	2	1.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.3316052	1	1.161103333	1	1	1	0	0	0	0.6683948	1	0.838896667	2	NA	1	0	NA	1	0.3316052	NA	0.161103333	0	0	1	0.197758691	0.197758691	1	0.038255447	0.038255447	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	1	1	9.37E-09	1	0.152066161	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	9672648	C	T	-	-	-	-	-	-	123	0	0	153	10	6.5	132	0	0	135	6	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.3316052	1	1.161103333	1	1	1	0	0	0	0.6683948	1	0.838896667	2	NA	1	0	NA	1	0.3316052	NA	0.161103333	0.226824608	0.684020058	0.3316052	0	0	1	0.120231404	0.746299915	0.161103333	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	7.32E-09	1	1	1	0.0000677	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	9970559	A	T	ENSG00000227328	ENST00000416067	r.?	-	-	upstream	133	0	0	139	7	5	149	2	1.3	147	4	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.3316052	1	1.161103333	1	1	1	0	0	0	0.6683948	1	0.838896667	2	NA	1	0	NA	1	0.3316052	NA	0.161103333	0.174480468	0.526169275	0.3316052	0.040169734	0.040169734	1	0.073778361	0.457956766	0.161103333	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.00000749	1	0.171361326	1	0.006625822	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	10989858	C	G	TPTE	CCDS33512.1	r.?	-	-	intronic	76	0	0	99	0	0	113	13	11.5	89	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.3316052	1	1.161103333	1	1	1	0	0	0	0.6683948	1	0.838896667	2	NA	1	0	NA	1	0.3316052	NA	0.161103333	0	0	1	0.355347648	0.355347648	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.94E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	14658301	C	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	35	0	0	48	10	20.8	42	1	2.4	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.850715746	0.850715746	1	0.085714286	0.085714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.37E-14	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	15859215	G	T	SAMSN1	CCDS42906.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	48	12	25	61	2	3.3	51	8	15.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.03950104	1.03950104	1	0.134969325	0.134969325	1	0.560714286	0.560714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.44E-17	1	0.037660755	1	2.05E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	17777228	G	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	59	13	22	43	8	18.6	42	16	38.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914760915	0.914760915	1	0.760736196	0.760736196	1	1.360714286	1.360714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.99E-18	1	4.85E-11	1	2.25E-26	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	18092876	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	50	7	14	46	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.582120582	0.582120582	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	6.46E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	19379334	C	T	AP000998.1	ENST00000510743	r.?	-	-	downstream	39	0	0	44	13	29.5	53	16	30.2	45	14	31.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.226611227	1.226611227	1	1.235173824	1.235173824	1	1.110714286	1.110714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.49E-20	1	1.90E-24	1	8.81E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	19437357	G	C	CHODL	ENST00000400128	r.?	-	-	intronic	40	0	0	43	0	0	41	10	24.4	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.99795501	0.99795501	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.51E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	20068922	A	G	-	-	-	-	-	-	45	0	0	52	1	1.9	51	13	25.5	44	5	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.079002079	0.079002079	1	1.042944785	1.042944785	1	0.407142857	0.407142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.229451111	1	4.87E-19	1	0.00000288	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	22457716	C	A	NCAM2	CCDS42910.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	52	0	0	43	0	0	45	7	15.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.557142857	0.557142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000003	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	22473604	A	T	NCAM2	CCDS42910.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	54	10	18.5	67	14	20.9	59	19	32.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.769230769	0.769230769	1	0.854805726	0.854805726	1	1.15	1.15	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.91E-13	1	4.66E-19	1	2.20E-29	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	22693194	G	C	NCAM2	CCDS42910.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	52	11	21.2	47	1	2.1	46	0	0	188	0	0	154	31	20.1	85	2	2.4	142	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.881496881	0.881496881	1	0.085889571	0.085889571	1	0	0	1	0.835758836	0.835758836	1	0.098159509	0.098159509	1	0	0	1	6	4	1	1	2.44E-15	7.93E-40	0.209895027	0.067975933	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	21	23577767	C	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	47	0	0	47	6	12.8	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.523517382	0.523517382	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000141	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	25013465	T	C	-	-	-	-	-	-	36	0	0	50	16	32	54	2	3.7	61	13	21.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.330561331	1.330561331	1	0.151329243	0.151329243	1	0.760714286	0.760714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	6.40E-25	1	0.030129377	1	6.41E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	25778165	C	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	42	0	0	42	13	31	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.267893661	1.267893661	1	0.071428571	0.071428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.72E-20	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	26416895	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	43	10	23.3	40	1	2.5	56	16	28.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.968814969	0.968814969	1	0.102249489	0.102249489	1	1.021428571	1.021428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.61E-14	1	0.181679879	1	5.26E-24	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	30754509	C	T	BACH1	ENST00000422809	r.?	-	-	intronic	27	0	0	59	15	25.4	41	0	0	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.248678402	1	1	1	1	1	1	1	1	0.751321598	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.248678402	1.056133056	1.056133056	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	9.90E-22	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	31002236	G	T	GRIK1	CCDS42913.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	48	0	0	47	13	27.7	47	0	0	431	0	0	196	1	0.5	138	23	16.7	223	2	0.9	FALSE	TRUE	2	2	2.248678402	1	1	1	1	1	1	1	1	0.751321598	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.248678402	0	NA	0	1.132924335	1.132924335	1	0	0	1	0.020790021	0.020790021	1	0.683026585	0.683026585	1	0.034380963	0.034380963	1	NA	1	1	1	1	0.625610357	1.47E-19	6.28E-28	1	0.306564006	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	21	32005377	G	A	KRTAP20-2	CCDS13604.1	r.?	-	-	upstream	37	0	0	35	6	17.1	62	13	21	51	17	33.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.248678402	1	1	1	1	1	1	1	1	0.751321598	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.248678402	0.711018711	0.711018711	1	0.858895706	0.858895706	1	1.272095622	1.272095622	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.24E-08	1	8.08E-18	1	9.59E-27	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	32325943	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	56	0	0	62	10	16.1	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.248678402	1	1	1	1	1	1	1	1	0.751321598	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.248678402	0	0	1	0.658486708	0.658486708	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	8.29E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	33532955	T	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	44	12	27.3	53	0	0	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.248678402	1	1	1	1	1	1	1	1	0.751321598	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.248678402	1.135135135	1.135135135	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.44E-18	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	35479065	G	A	SLC5A3	CCDS33549.1	r.?	-	-	downstream	38	0	0	55	15	27.3	58	0	0	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	2.248678402	1	1	1	1	1	1	1	1	0.751321598	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.248678402	1.135135135	1.135135135	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	3.01E-22	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	38989661	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	43	0	0	43	7	16.3	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.248678402	1	1	1	1	1	1	1	1	0.751321598	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.248678402	0	0	1	0.666666667	0.666666667	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.15E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	39839509	G	T	ERG	CCDS13657.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	43	11	25.6	60	13	21.7	44	14	31.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.248678402	1	1	1	1	1	1	1	1	0.751321598	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.248678402	1.064449064	1.064449064	1	0.887525562	0.887525562	1	1.214794018	1.214794018	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.42E-16	1	5.07E-18	1	6.10E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	43421173	G	A	ZNF295	CCDS13678.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	56	16	28.6	53	0	0	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.248678402	1	1	1	1	1	1	1	1	0.751321598	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.248678402	1.189189189	1.189189189	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.26E-24	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	44991475	C	T	HSF2BP	CCDS13697.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	50	8	16	46	0	0	48	10	20.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.248678402	1	1	1	1	1	1	1	1	0.751321598	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.248678402	0.665280665	0.665280665	1	0	0	1	0.794582251	0.794582251	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.74E-10	1	1	1	5.37E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	21	45206767	G	A	RRP1	CCDS42951.1	r.?	-	-	upstream	35	0	0	47	0	0	64	15	23.4	50	0	0	92	1	1.1	225	0	0	321	54	16.8	242	1	0.4	TRUE	TRUE	2	2	2.248678402	1	1	1	1	1	1	1	1	0.751321598	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.248678402	0	0	1	0.957055215	0.957055215	1	0	0	1	0	0	1	0.687116564	0.687116564	1	0.015280428	0.015280428	1	2	1	1	0.36944434	1	1	3.87E-21	1.28E-63	1	0.702706413	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	21	47470475	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	37	7	18.9	51	3	5.9	51	7	13.7	9	0	0	107	30	28	123	0	0	104	17	16.3	TRUE	TRUE	2	2	2.248678402	1	1	1	1	1	1	1	1	0.751321598	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.248678402	0.785862786	0.785862786	1	0.241308793	0.241308793	1	0.523354655	0.523354655	1	1.164241164	1.164241164	1	0	0	1	0.622677437	0.622677437	1	7	6	1	1	7.05E-10	2.04E-43	0.002175924	1	7.46E-09	6.94E-21	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	16560859	T	A	-	-	-	-	-	-	55	0	0	60	0	0	66	12	18.2	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.562376278	0.562376278	1	0.27	0.27	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	9.36E-16	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	18006233	G	A	CECR2	ENST00000400579	r.?	-	-	intronic	39	0	0	33	0	0	46	11	23.9	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.738505112	0.738505112	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.55E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	18768783	G	A	-	-	-	-	-	-	23	1	4.3	14	1	7.1	22	2	9.1	9	3	33.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.224218295	0.224218295	1	0.281188139	0.281188139	1	0.856285714	0.856285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	0.108890944	1	0.067769881	1	0.005403392	1	0.0000103	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	19498894	C	T	CDC45L	CCDS13762.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	33	0	0	24	7	29.2	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.902274029	0.902274029	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.51E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	20041829	G	C	C22orf25	CCDS13772.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	52	0	0	47	13	27.7	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.855924335	0.855924335	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.47E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	20973582	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	38	12	31.6	38	0	0	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.997929314	0.997929314	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	5.86E-19	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	25020878	G	A	GGT1	CCDS42992.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	33	0	0	34	2	5.9	36	9	25	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.182308793	0.182308793	1	0.642857143	0.642857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.012612579	1	1.63E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	25674076	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	41	7	17.1	39	1	2.6	37	5	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.540018711	0.540018711	1	0.080339468	0.080339468	1	0.347142857	0.347142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.51E-09	1	0.177567718	1	0.00000119	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	25697094	T	C	-	-	-	-	-	-	43	0	0	38	0	0	52	14	26.9	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.831204499	0.831204499	1	0.074571429	0.074571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.04E-21	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	26206916	C	T	MYO18B	ENST00000335473	r.?	-	-	intronic	45	0	0	35	0	0	58	0	0	47	9	19.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.491142857	0.491142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	2.24E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	28183728	C	G	MN1	CCDS42998.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	26	9	34.6	42	12	28.6	40	21	52.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.092669439	1.092669439	1	0.883734151	0.883734151	1	1.35	1.35	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.65E-15	1	2.35E-18	1	5.72E-38	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	33163201	G	A	Z73979.2	CCDS11576.1	r.?	-	-	intronic	51	0	0	41	15	36.6	37	0	0	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.155829522	1.155829522	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.71E-24	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	34353135	G	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	34	0	0	32	7	21.9	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.676705521	0.676705521	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.36E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	38945978	C	A	DMC1	CCDS13973.1	r.723g>u	c.446G>T	p.G149V	missense	31	0	0	35	15	42.9	43	15	34.9	36	15	41.7	84	0	0	116	51	44	67	23	34.3	71	24	33.8	TRUE	TRUE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.354783784	1.354783784	1	1.078402863	1.078402863	1	1.072285714	1.072285714	1	1.38952183	1.38952183	1	1.059862986	1.059862986	1	0.869142857	0.869142857	1	8	7	1	1	9.02E-26	8.56E-85	4.05E-24	5.12E-36	1.54E-25	2.52E-37	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	22	39101826	C	G	GTPBP1	CCDS13977.2	r.99c>g	c.?	p.?	5'UTR variant	47	0	0	41	16	39	31	0	0	26	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.231621622	1.231621622	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.40E-26	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	39679518	A	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	27	6	22.2	45	0	0	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.701076923	0.701076923	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.23E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	44834658	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	49	13	26.5	53	1	1.9	39	10	25.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.836871102	0.836871102	1	0.058709611	0.058709611	1	0.658285714	0.658285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.71E-19	1	0.233303855	1	5.44E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	48734608	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	37	12	32.4	46	0	0	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.023193347	1.023193347	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.03E-19	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	49547783	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	14	6	42.9	16	2	12.5	23	7	30.4	0	0	NA	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.354783784	1.354783784	1	0.386247444	0.386247444	1	0.781714286	0.781714286	1	NA	NA	1	3.08997955	3.08997955	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.53E-11	1	0.002863359	0.005	1.79E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	49775951	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	44	9	20.5	37	0	0	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.647390852	0.647390852	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.18E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	50453941	G	A	IL17REL	CCDS33679.1	r.?	-	-	upstream	29	0	0	21	6	28.6	29	0	0	15	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.903189189	0.903189189	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	7.95E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	50758271	C	T	FAM116B	CCDS46732.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	31	0	0	44	16	36.4	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.124752556	1.124752556	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.57E-26	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	22	51146639	C	T	ENSG00000251322	ENST00000503869	r.?	-	-	intronic	31	0	0	42	12	28.6	24	1	4.2	32	10	31.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1	1	1	1	1	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.903189189	0.903189189	1	0.129779141	0.129779141	1	0.802285714	0.802285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.35E-18	1	0.113346489	1	5.70E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	2759705	C	T	GYG2	CCDS14121.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	39	0	0	35	12	34.3	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	1.232135019	1.232135019	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.83E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	3131670	C	G	-	-	-	-	-	-	46	0	0	45	0	0	41	16	39	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	1.400969847	1.400969847	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.40E-26	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	3342793	C	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	54	0	0	41	0	0	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	0	NA	0	0.35	0.35	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	3671543	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	47	10	21.3	28	0	0	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0.885654886	0.885654886	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	4.27E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	4071762	G	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	52	7	13.5	35	0	0	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0.561330561	0.561330561	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	8.58E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	5108681	C	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	40	8	20	41	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0.831600832	0.831600832	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	2.61E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	6174800	A	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	32	5	15.6	50	1	2	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0.648648649	0.648648649	1	0.071844608	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.000000562	1	0.221687443	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	6342129	C	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	53	0	0	55	16	29.1	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	1.045339039	1.045339039	1	0.232142857	0.232142857	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	3.78E-24	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	6517131	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	40	9	22.5	38	11	28.9	49	11	22.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0.935550936	0.935550936	1	1.038154579	1.038154579	1	0.8	0.8	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	4.64E-13	1	5.19E-17	1	1.19E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	6882525	G	A	-	-	-	-	-	-	48	0	0	36	0	0	41	0	0	42	5	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	0	NA	0	0.425	0.425	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	6909143	T	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	40	6	15	45	1	2.2	51	11	21.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0.623700624	0.623700624	1	0.079029068	NA	0	0.771428571	0.771428571	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	5.18E-08	1	0.201934322	1	1.94E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	7797096	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	43	8	18.6	39	0	0	51	7	13.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0.773388773	0.773388773	1	0	NA	0	0.489285714	0.489285714	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	4.85E-11	1	1	1	7.46E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	8176330	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	43	7	16.3	44	0	0	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0.677754678	0.677754678	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	2.15E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	8375789	T	C	ENSG00000227978	ENST00000418307	r.?	-	-	intronic	45	0	0	41	0	0	35	0	0	46	7	15.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	0	NA	0	0.542857143	0.542857143	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	3.53E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	9494940	C	T	TBL1X	CCDS14133.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	38	0	0	31	0	0	47	6	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	0	NA	0	0.457142857	0.457142857	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000141	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	9627536	T	G	TBL1X	CCDS14133.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	52	0	0	56	16	28.6	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	1.027377888	1.027377888	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.26E-24	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	10401114	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	45	9	20	46	1	2.2	35	6	17.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0.831600832	0.831600832	1	0.079029068	NA	0	0.610714286	0.610714286	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.47E-12	1	0.205924651	1	2.24E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	10557696	C	T	MID1	CCDS14138.1	r.254g>a	c.?	p.?	5'UTR variant	56	0	0	33	5	15.2	41	2	4.9	42	13	31	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0.632016632	0.632016632	1	0.176019288	0.350460924	0.502250826	1.107142857	1.107142857	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.00000066	1	0.018015855	1	2.72E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	10815903	C	A	MID1	CCDS14138.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	41	0	0	48	13	27.1	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	0.973494432	0.973494432	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.00E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	11133676	C	T	HCCS	CCDS14139.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	33	0	0	35	8	22.9	52	7	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	0.822620756	0.822620756	1	0.482142857	0.482142857	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	8.15E-12	1	8.58E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	11777214	G	A	MSL3	CCDS14148.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	28	8	28.6	41	0	0	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	1.189189189	1.189189189	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.11E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	12203809	T	C	FRMPD4	CCDS35201.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	44	0	0	50	0	0	42	7	16.7	316	2	0.6	143	3	2.1	68	1	1.5	109	8	7.3	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	0	NA	0	0.596428571	0.596428571	1	0.087318087	0.087318087	1	0.053883456	NA	0	0.260714286	0.260714286	1	NA	NA	1	0.469057283	1	0.035588828	1	0.288836448	1.81E-09	9.48E-08	YES	0_1	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	12216245	G	A	FRMPD4	CCDS35201.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	49	12	24.5	38	0	0	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	1.018711019	1.018711019	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.90E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	12576394	T	A	FRMPD4	CCDS35201.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	42	16	38.1	42	1	2.4	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	1.584199584	1.584199584	1	0.086213529	NA	0	0.396428571	0.396428571	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	2.25E-26	1	0.189842622	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	12754883	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	29	0	0	48	18	37.5	54	0	0	81	0	0	168	0	0	118	40	33.9	150	0	0	TRUE	TRUE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	1.347086391	1.347086391	1	0	0	1	0	0	1	1.217766097	1.217766097	1	0	0	1	2	1	1	1	1	1	2.42E-29	3.15E-61	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	14383543	C	T	-	-	-	-	-	-	48	0	0	45	0	0	35	12	34.3	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	1.232135019	1.232135019	1	0.071428571	0.071428571	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.83E-19	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	16200953	G	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	44	6	13.6	36	2	5.6	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0.565488565	0.565488565	1	0.201164901	0.40052677	0.502250826	0.317857143	0.317857143	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.37E-08	1	0.014070883	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	16553971	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	54	0	0	41	0	0	48	6	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	0	NA	0	0.446428571	0.446428571	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	17534429	G	C	NHS	CCDS14181.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	38	11	28.9	25	0	0	47	13	27.7	191	0	0	141	28	19.9	54	2	3.7	134	29	21.6	FALSE	TRUE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	1.201663202	1.201663202	1	0	NA	0	0.989285714	0.989285714	1	0.827442827	0.827442827	1	0.132912524	0.132912524	1	0.771428571	0.771428571	1	NA	6	1	1	5.19E-17	6.02E-36	1	0.030129377	1.47E-19	2.33E-38	YES	1_1	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	18832532	C	A	PPEF1	CCDS14188.1	r.?	-	-	intronic	49	0	0	30	6	20	34	0	0	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0.831600832	0.831600832	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	8.37E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	20128331	C	T	MAP7D2	CCDS14195.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	36	0	0	33	9	27.3	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	0.980678893	0.980678893	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.76E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	20456623	A	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	37	14	37.8	38	0	0	39	12	30.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	1.571725572	1.571725572	1	0	NA	0	1.1	1.1	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	3.35E-23	1	1	1	8.43E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	20700075	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	38	0	0	42	0	0	39	5	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	0	NA	0	0.457142857	0.457142857	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	20901970	A	C	-	-	-	-	-	-	47	0	0	40	9	22.5	46	0	0	54	11	20.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0.935550936	0.935550936	1	0	NA	0	0.728571429	0.728571429	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	4.64E-13	1	1	1	3.84E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	21018783	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	29	6	20.7	33	0	0	40	5	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0.860706861	0.860706861	1	0	NA	0	0.446428571	0.446428571	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	6.72E-09	1	1	1	0.00000178	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	21140496	G	C	-	-	-	-	-	-	37	0	0	38	0	0	35	0	0	49	5	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	0	NA	0	0.364285714	0.364285714	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000496	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	22061724	C	T	PHEX	CCDS14204.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	47	0	0	35	10	28.6	55	9	16.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	1.027377888	1.027377888	1	0.585714286	0.585714286	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.60E-15	1	1.01E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	22825435	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	35	7	20	34	0	0	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0.831600832	0.831600832	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	4.65E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	24008330	G	A	KLHL15	CCDS35217.1	r.?	-	-	intronic	49	0	0	60	12	20	49	1	2	53	6	11.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0.831600832	0.831600832	1	0.071844608	NA	0	0.403571429	0.403571429	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	2.74E-16	1	0.217776325	1	0.000000293	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	25136352	T	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	48	5	10.4	51	0	0	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0.432432432	0.432432432	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.00000447	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	25417936	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	35	9	25.7	39	0	0	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	1.068607069	1.068607069	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.23E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	25813778	T	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	35	0	0	40	0	0	49	6	12.2	260	0	0	165	0	0	66	0	0	135	20	14.8	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	0	NA	0	0.435714286	0.435714286	1	0	0	1	0	NA	0	0.528571429	0.528571429	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000182	2.08E-23	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	27136689	C	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	32	0	0	29	6	20.7	35	5	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	0.743591688	0.743591688	1	0.510714286	0.510714286	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	6.72E-09	1	0.000000895	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	27475428	A	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	54	0	0	47	0	0	40	6	15	146	0	0	107	0	0	60	2	3.3	67	9	13.4	FALSE	TRUE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	0	NA	0	0.535714286	0.535714286	1	0	0	1	0.118543602	0.118543602	1	0.478571429	0.478571429	1	NA	2	1	1	1	1	1	0.036544784	5.18E-08	6.43E-11	YES	0_0	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	28161440	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	34	9	26.5	37	11	29.7	52	13	25	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	1.101871102	1.101871102	1	1.066892422	1.066892422	1	0.892857143	0.892857143	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	9.15E-14	1	3.70E-17	1	6.47E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	29418424	G	A	IL1RAPL1	CCDS14218.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	55	8	14.5	40	0	0	65	1	1.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0.602910603	0.602910603	1	0	NA	0	0.053571429	0.053571429	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	3.86E-10	1	1	1	0.278061424	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	30418990	A	C	-	-	-	-	-	-	42	0	0	36	0	0	48	12	25	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	0.898057594	0.898057594	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.44E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	30526410	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	37	6	16.2	33	1	3	44	5	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0.673596674	0.673596674	1	0.107766911	NA	0	0.407142857	0.407142857	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	3.18E-08	1	0.15245715	1	0.00000288	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	30552327	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	49	12	24.5	45	3	6.7	43	10	23.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	1.018711019	1.018711019	1	0.240679435	0.479201671	0.502250826	0.832142857	0.832142857	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.90E-17	1	0.001516071	1	1.61E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	31430949	A	G	DMD	CCDS14233.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	52	0	0	47	0	0	49	5	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	0	NA	0	0.364285714	0.364285714	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000496	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	32504104	C	A	DMD	CCDS14233.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	40	6	15	31	0	0	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0.623700624	0.623700624	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	5.18E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	34217301	G	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	32	12	37.5	33	1	3	30	4	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	1.559251559	1.559251559	1	0.107766911	NA	0	0.475	0.475	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	5.03E-20	1	0.15245715	1	0.0000154	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	34582751	T	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	54	0	0	48	0	0	44	6	13.6	247	0	0	128	0	0	52	0	0	109	13	11.9	FALSE	FALSE	2	1.502250826	2	1	1	1	1	0	1	1	0.497749174	1	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0.502250826	NA	0	0	1	0	NA	0	0.485714286	0.485714286	1	0	0	1	0	NA	0	0.425	0.425	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	9.37E-08	1.83E-14	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	35723710	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	57	0	0	52	9	17.3	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.707566462	0.707566462	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.92E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	35780347	C	G	-	-	-	-	-	-	52	0	0	53	0	0	62	1	1.6	60	5	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.065439673	0.065439673	1	0.296428571	0.296428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.267123145	1	0.0000136	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	35996178	C	A	CXorf22	CCDS14237.2	r.?	-	-	intronic	44	0	0	54	8	14.8	59	11	18.6	56	10	17.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.615384615	0.615384615	1	0.760736196	0.760736196	1	0.639285714	0.639285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.31E-10	1	1.10E-14	1	2.82E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	36084946	C	T	CXorf59	CCDS14238.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	46	7	15.2	57	14	24.6	59	14	23.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.632016632	0.632016632	1	1.006134969	1.006134969	1	0.846428571	0.846428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.53E-09	1	3.84E-20	1	6.58E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	36132777	G	A	CXorf59	CCDS14238.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	31	4	12.9	59	10	16.9	35	6	17.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.536382536	0.536382536	1	0.691206544	0.691206544	1	0.610714286	0.610714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.0000177	1	4.91E-13	1	2.24E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	36969661	T	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	55	11	20	42	0	0	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.831600832	0.831600832	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.77E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	37029279	G	C	FAM47C	CCDS35227.1	r.2810g>c	c.2796G>C	p.Q932H	missense	44	0	0	43	1	2.3	43	0	0	48	5	10.4	183	0	0	197	2	1	106	0	0	150	9	6	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.095634096	0.095634096	1	0	0	1	0.371428571	0.371428571	1	0.041580042	0.041580042	1	0	0	1	0.214285714	0.214285714	1	1	2	1	1	0.193893409	0.258708507	1	1	0.00000447	0.000000086	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	37235039	T	G	PRRG1	CCDS14239.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	54	0	0	58	9	15.5	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.63394683	0.63394683	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.67E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	37698469	T	A	DYNLT3	CCDS14243.1	r.1837a>u	c.?	p.?	3'UTR variant	42	0	0	46	8	17.4	48	1	2.1	39	0	0	353	0	0	141	29	20.6	96	0	0	117	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.723492723	0.723492723	1	0.085889571	0.085889571	1	0	0	1	0.856548857	0.856548857	1	0	0	1	0	0	1	6	4	1	1	8.61E-11	1.18E-37	0.213845552	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	37712437	G	A	ENSG00000250349	ENST00000465127	r.?	-	-	intronic	44	0	0	36	0	0	36	8	22.2	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.90797546	0.90797546	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.04E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	38151474	G	T	RPGR	CCDS35229.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	45	0	0	48	11	22.9	61	7	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.936605317	0.936605317	1	0.410714286	0.410714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	9.31E-16	1	2.69E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	40259237	G	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	48	10	20.8	62	2	3.2	64	9	14.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.864864865	0.864864865	1	0.130879346	0.130879346	1	0.503571429	0.503571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.37E-14	1	0.038789653	1	4.20E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	40842286	A	C	-	-	-	-	-	-	50	0	0	44	9	20.5	56	1	1.8	54	6	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852390852	0.852390852	1	0.073619632	0.073619632	1	0.396428571	0.396428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.18E-12	1	0.244746891	1	0.000000329	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	41916580	C	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	52	0	0	50	6	12	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.490797546	0.490797546	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000206	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	43051693	T	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	45	0	0	47	8	17	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.695296524	0.695296524	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.03E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	43368031	T	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	34	11	32.4	46	4	8.7	52	8	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.347193347	1.347193347	1	0.355828221	0.355828221	1	0.55	0.55	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.26E-17	1	0.0000862	1	2.42E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	43406950	G	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	44	8	18.2	40	10	25	46	8	17.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.756756757	0.756756757	1	1.022494888	1.022494888	1	0.621428571	0.621428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	5.90E-11	1	7.22E-15	1	8.61E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	44068446	C	T	EFHC2	ENST00000415199	r.?	-	-	intronic	28	0	0	38	6	15.8	38	0	0	41	6	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.656964657	0.656964657	1	0	0	1	0.521428571	0.521428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.76E-08	1	1	1	6.05E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	44176324	G	A	EFHC2	ENST00000415199	r.?	-	-	intronic	32	0	0	37	5	13.5	50	0	0	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.561330561	0.561330561	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.00000119	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	44190543	C	T	EFHC2	ENST00000415199	r.?	-	-	intronic	42	0	0	58	14	24.1	54	2	3.7	57	13	22.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.002079002	1.002079002	1	0.151329243	0.151329243	1	0.814285714	0.814285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.04E-20	1	0.030129377	1	2.44E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	44444478	G	T	-	-	-	-	-	-	49	0	0	52	0	0	54	0	0	56	7	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.446428571	0.446428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	1.46E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	45204425	T	C	-	-	-	-	-	-	27	0	0	41	14	34.1	33	0	0	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.417879418	1.417879418	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.90E-22	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	45391951	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	46	8	17.4	57	1	1.8	58	4	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.723492723	0.723492723	1	0.073619632	0.073619632	1	0.246428571	0.246428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	8.61E-11	1	0.248523156	1	0.000213772	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	45669719	A	G	-	-	-	-	-	-	45	0	0	40	0	0	51	11	21.6	55	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.883435583	0.883435583	1	0.064285714	0.064285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.94E-15	1	0.240951649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	46362045	G	C	ENSG00000251192	ENST00000503801	r.?	-	-	intronic	43	0	0	46	0	0	52	9	17.3	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.707566462	0.707566462	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.92E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	46841865	G	C	PHF16	CCDS14271.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	51	0	0	59	13	22	52	4	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.899795501	0.899795501	1	0.275	0.275	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	3.99E-18	1	0.000139698	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	47196585	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	38	0	0	42	8	19	50	4	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.777096115	0.777096115	1	0.285714286	0.285714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	3.96E-11	1	0.000119787	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	47833739	T	A	ZNF182	CCDS35236.1	r.?	-	-	downstream	47	0	0	66	13	19.7	55	13	23.6	52	15	28.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.819126819	0.819126819	1	0.965235174	0.965235174	1	1.028571429	1.028571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.95E-17	1	1.46E-18	1	1.15E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	48690581	C	T	PCSK1N	CCDS14307.1	r.386g>a	c.285G>A	p.A95A	silent	44	0	0	41	7	17.1	42	0	0	46	0	0	19	0	0	35	4	11.4	57	0	0	32	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.711018711	0.711018711	1	0	0	1	0	0	1	0.474012474	0.474012474	1	0	0	1	0	0	1	6	4	1	1	1.51E-09	0.0000289	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	48721079	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	45	0	0	67	18	26.9	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.100204499	1.100204499	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.83E-26	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	48970606	C	A	GPKOW	CCDS35251.1	r.1463g>u	c.1384G>T	p.D462Y	missense	37	0	0	50	13	26	55	3	5.5	58	15	25.9	182	2	1.1	176	37	21	172	6	3.5	173	21	12.1	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.081081081	1.081081081	1	0.224948875	0.224948875	1	0.925	0.925	1	0.873180873	0.873180873	1	0.143149284	0.143149284	1	0.432142857	0.432142857	1	7	6	1	0.231095159	3.65E-19	5.52E-48	0.002700822	0.000253594	7.42E-22	1.27E-22	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	49399617	G	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	42	13	31	45	2	4.4	53	10	18.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.288981289	1.288981289	1	0.1799591	0.1799591	1	0.675	0.675	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.72E-20	1	0.021467209	1	1.57E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	49572304	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	51	0	0	48	5	10.4	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.425357873	0.425357873	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000447	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	49731070	G	A	CLCN5	CCDS14328.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	52	12	23.1	41	0	0	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.96049896	0.96049896	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.19E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	49923481	G	C	-	-	-	-	-	-	41	0	0	37	8	21.6	60	1	1.7	52	8	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.898128898	0.898128898	1	0.069529652	0.069529652	1	0.55	0.55	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.33E-11	1	0.259739042	1	2.42E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	50210945	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	47	0	0	55	0	0	49	8	16.3	281	0	0	200	0	0	121	5	4.1	175	14	8	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.582142857	0.582142857	1	0	0	1	0.167689162	0.167689162	1	0.285714286	0.285714286	1	1	2	1	1	1	1	1	0.00038406	1.47E-10	4.89E-13	YES	0_0	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	50231334	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	53	0	0	44	14	31.8	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.300613497	1.300613497	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	6.10E-22	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	50595080	G	T	-	-	-	-	-	-	21	0	0	26	0	0	40	1	2.5	42	6	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.102249489	0.102249489	1	0.510714286	0.510714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.181679879	1	7.02E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	51317997	T	C	-	-	-	-	-	-	47	0	0	47	17	36.2	55	13	23.6	48	17	35.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.596315422	1.275310822	1.251706951	0.965235174	0.965235174	1	1.264285714	1.264285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.81E-27	1	1.46E-18	1	2.80E-27	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	51471140	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	29	5	17.2	51	2	3.9	53	12	22.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.758470311	0.758470311	1	0.159509202	0.159509202	1	0.807142857	0.807142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.000000336	1	0.027109304	1	5.39E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	52051473	A	C	-	-	-	-	-	-	30	0	0	41	9	22	40	0	0	38	9	23.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.970136444	0.970136444	1	0	0	1	0.846428571	0.846428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.92E-13	1	1	1	2.79E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	52051480	C	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	42	10	23.8	45	1	2.2	39	8	20.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.049511244	1.049511244	1	0.08997955	0.08997955	1	0.732142857	0.732142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.24E-14	1	0.201934322	1	2.09E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	52094577	T	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	34	18	52.9	54	12	22.2	48	13	27.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	2.332737177	1.863644821	1.251706951	0.90797546	0.90797546	1	0.967857143	0.967857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	7.79E-33	1	6.90E-17	1	2.00E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	53993519	G	A	PHF8	CCDS14355.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	50	0	0	50	13	26	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	1.063394683	1.063394683	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.65E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	54712897	G	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	52	0	0	44	1	2.3	49	5	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.09406953	0.09406953	1	0.364285714	0.364285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.197923942	1	0.00000496	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	55208732	G	A	-	-	-	-	-	-	64	0	0	41	0	0	55	9	16.4	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.670756646	0.670756646	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.01E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	55753395	C	T	RRAGB	CCDS14371.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	50	0	0	34	6	17.6	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.719836401	0.719836401	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.86E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	56275112	T	C	KLF8	CCDS14373.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	48	0	0	54	13	24.1	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.985685072	0.985685072	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.12E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	57676770	A	C	-	-	-	-	-	-	43	0	0	37	0	0	57	0	0	49	6	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.435714286	0.435714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000182	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	57811460	G	C	-	-	-	-	-	-	47	0	0	55	0	0	61	8	13.1	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.535787321	0.535787321	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	9.09E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	62803176	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	53	10	18.9	51	4	7.8	49	15	30.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.8334354	0.8334354	1	0.319018405	0.319018405	1	1.092857143	1.092857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.57E-13	1	0.000129466	1	4.10E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	63019306	G	T	-	-	-	-	-	-	49	0	0	44	0	0	45	11	24.4	49	2	4.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.99795501	0.99795501	1	0.146428571	0.146428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.24E-16	1	0.025168485	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	63106106	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	53	5	9.4	41	0	0	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.414512844	0.414512844	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.00000734	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	63240584	C	G	-	-	-	-	-	-	59	0	0	47	5	10.6	52	0	0	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.467429378	0.467429378	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	0.00000402	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	63483533	C	T	MTMR8	CCDS14379.1	r.?	-	-	downstream	31	0	0	33	12	36.4	39	0	0	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.605134844	1.282356739	1.251706951	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	7.86E-20	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	63722791	C	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	43	11	25.6	53	0	0	45	6	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.128886044	1.128886044	1	0	0	1	0.475	0.475	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.42E-16	1	1	1	0.000000108	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	63747065	G	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	44	0	0	55	0	0	56	7	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.446428571	0.446428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	1	1	1.46E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	64237582	G	T	ZC4H2	ENST00000337990	r.?	-	-	intronic	33	0	0	51	0	0	55	18	32.7	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	1.337423313	1.337423313	1	0.071428571	0.071428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.61E-28	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	64674580	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	43	0	0	51	10	19.6	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.801635992	0.801635992	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.04E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	64813567	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	47	8	17	45	0	0	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.749650889	0.749650889	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.03E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	65513265	G	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	52	8	15.4	57	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.679095511	0.679095511	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	2.42E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	65861630	C	G	EDA2R	CCDS14386.1	r.?	-	-	upstream	48	0	0	41	0	0	52	10	19.2	39	5	12.8	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.785276074	0.785276074	1	0.457142857	0.457142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.28E-13	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	65870926	A	C	-	-	-	-	-	-	42	0	0	54	12	22.2	49	12	24.5	50	22	44	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.978955866	0.978955866	1	1.00204499	1.00204499	1	1.571428571	1.571428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	6.90E-17	1	1.90E-17	1	1.85E-37	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	66045798	C	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	41	0	0	40	3	7.5	52	6	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.306748466	0.306748466	1	0.410714286	0.410714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.001075403	1	0.000000261	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	66052673	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	42	0	0	50	13	26	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	1.063394683	1.063394683	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.65E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	67617555	G	A	OPHN1	CCDS14388.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	30	6	20	38	0	0	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.881942222	0.881942222	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	8.37E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	67651974	A	G	OPHN1	CCDS14388.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	33	0	0	59	9	15.3	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.625766871	0.625766871	1	0.075	0.075	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.96E-11	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	67772580	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	49	7	14.3	55	2	3.6	58	12	20.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.630588689	0.630588689	1	0.147239264	0.147239264	1	0.739285714	0.739285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.58E-09	1	0.031164417	1	1.76E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	68999534	A	G	EDA	CCDS14394.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	61	8	13.1	60	3	5	50	8	16	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.577672155	0.577672155	1	0.204498978	0.204498978	1	0.571428571	0.571428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.09E-10	1	0.003458198	1	1.74E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	69706575	G	A	DLG3	CCDS14403.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	45	9	20	55	0	0	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.881942222	0.881942222	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.47E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	70410254	C	T	-	-	-	-	-	-	48	0	0	54	18	33.3	52	2	3.8	54	9	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.468433799	1.173145038	1.251706951	0.155419223	0.155419223	1	0.596428571	0.596428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	3.12E-28	1	0.028101652	1	8.48E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	70864528	G	A	-	-	-	-	-	-	57	0	0	36	0	0	47	15	31.9	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	1.304703476	1.304703476	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.97E-23	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	71266621	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	43	0	0	55	11	20	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.81799591	0.81799591	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.77E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	73550479	A	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	37	0	0	37	8	21.6	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.883435583	0.883435583	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.33E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	73929985	C	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	44	5	11.4	41	12	29.3	54	16	29.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.502707066	0.502707066	1	1.198364008	1.198364008	1	1.057142857	1.057142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	0.00000288	1	1.69E-18	1	2.69E-24	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	73975872	G	A	KIAA2022	CCDS35337.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	46	11	23.9	56	6	10.7	33	7	21.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.053920955	1.053920955	1	0.437627812	0.437627812	1	0.757142857	0.757142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	5.55E-16	1	0.000000409	1	2.98E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	74694663	C	A	ZDHHC15	CCDS14430.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	41	6	14.6	58	0	0	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.643817822	0.643817822	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	6	NA	1	1	6.05E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	75238976	C	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	44	0	0	49	9	18.4	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.752556237	0.752556237	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.35E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	75340238	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	44	0	0	47	10	21.3	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.871165644	0.871165644	1	0.082142857	0.082142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	4.27E-14	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	76085468	G	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	42	6	14.3	44	10	22.7	33	10	30.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.630588689	0.630588689	1	0.928425358	0.928425358	1	1.082142857	1.082142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	7.02E-08	1	2.08E-14	1	8.14E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	76437234	T	A	-	-	-	-	-	-	51	0	0	42	10	23.8	53	0	0	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.049511244	1.049511244	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.24E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	76499938	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	32	4	12.5	51	1	2	54	13	24.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.551213889	0.551213889	1	0.081799591	0.081799591	1	0.860714286	0.860714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.0000201	1	0.225579006	1	1.12E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	76624587	G	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	53	20	37.7	37	3	8.1	46	8	17.4	161	0	0	184	42	22.8	102	4	3.9	128	20	15.6	TRUE	TRUE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.662461088	1.328155194	1.251706951	0.331288344	0.331288344	1	0.621428571	0.621428571	1	1.005414133	1.005414133	1	0.159509202	0.159509202	1	0.557142857	0.557142857	1	7	6	1	1	1.65E-32	6.68E-56	0.000855237	0.001799146	8.61E-11	6.82E-24	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	76928667	T	C	ATRX	CCDS14434.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	35	9	25.7	52	3	5.8	67	10	14.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.133295755	1.133295755	1	0.237218814	0.237218814	1	0.532142857	0.532142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.23E-13	1	0.002300591	1	1.87E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	77479114	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	48	12	25	45	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.102427777	1.102427777	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	6	NA	1	1	1.44E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	77749112	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	37	6	16.2	38	10	26.3	39	10	25.6	353	0	0	137	21	15.3	95	17	17.9	122	32	26.2	TRUE	TRUE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.7143732	0.7143732	1	1.075664622	1.075664622	1	0.914285714	0.914285714	1	0.6746858	0.6746858	1	0.732106339	0.732106339	1	0.935714286	0.935714286	1	8	5	1	1	3.18E-08	7.92E-25	4.06E-15	1.35E-21	5.44E-15	3.80E-45	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	78391335	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	45	0	0	57	0	0	50	6	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.428571429	0.428571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	6	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000206	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	78500870	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	60	25	41.7	48	1	2.1	42	7	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.838849533	1.469073517	1.251706951	0.085889571	0.085889571	1	0.596428571	0.596428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.31E-41	1	0.213845552	1	1.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	79312806	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	67	1	1.5	50	1	2	50	7	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.066145667	0.066145667	1	0.081799591	0.081799591	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	1	NA	1	1	0.285262761	1	0.221687443	1	6.46E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	79491934	T	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	44	8	18.2	51	0	0	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.802567422	0.802567422	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	6	NA	1	1	5.90E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	79637417	G	T	-	-	-	-	-	-	48	0	0	46	0	0	58	10	17.2	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.703476483	0.703476483	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	4.10E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	80189462	T	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	38	10	26.3	48	4	8.3	62	9	14.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.159754022	1.159754022	1	0.339468303	0.339468303	1	0.517857143	0.517857143	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	4.06E-15	1	0.000102016	1	3.12E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	80281630	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	38	11	28.9	49	1	2	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.274406511	1.274406511	1	0.081799591	0.081799591	1	0.153571429	0.153571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	5.19E-17	1	0.217776325	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	81495520	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	50	15	30	49	11	22.4	44	10	22.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.322913333	1.322913333	1	0.916155419	0.916155419	1	0.810714286	0.810714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	5.83E-23	1	1.19E-15	1	2.08E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	82012534	T	G	-	-	-	-	-	-	48	0	0	29	9	31	60	13	21.7	38	8	21.1	222	0	0	156	43	27.6	108	35	32.4	140	39	27.9	TRUE	TRUE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.367010444	1.367010444	1	0.887525562	0.887525562	1	0.753571429	0.753571429	1	1.217080266	1.217080266	1	1.325153374	1.325153374	1	0.996428571	0.996428571	1	8	7	1	1	1.79E-14	3.62E-61	5.07E-18	5.85E-53	1.67E-11	7.78E-56	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	82279158	T	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	51	0	0	55	14	25.5	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	1.042944785	1.042944785	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	2	NA	1	1	1	1	2.19E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	83885559	G	T	-	-	-	-	-	-	50	0	0	36	0	0	50	8	16	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.654396728	0.654396728	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.74E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	84200070	C	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	43	10	23.3	50	1	2	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.027462688	1.027462688	1	0.081799591	0.081799591	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.61E-14	1	0.221687443	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	85219149	T	C	CHM	CCDS14454.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	43	12	27.9	63	2	3.2	53	7	13.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.230309399	1.230309399	1	0.130879346	0.130879346	1	0.471428571	0.471428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	3.24E-18	1	0.03993132	1	9.85E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	85854558	G	A	DACH2	CCDS48140.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	40	9	22.5	51	1	2	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.992185	0.992185	1	0.081799591	0.081799591	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	6	NA	1	1	4.64E-13	1	0.225579006	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	85901758	C	T	DACH2	CCDS48140.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	62	0	0	54	11	20.4	58	7	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.834355828	0.834355828	1	0.432142857	0.432142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	3.84E-15	1	1.88E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	86499272	G	T	-	-	-	-	-	-	49	0	0	44	0	0	52	5	9.6	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.392638037	0.392638037	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	0.00000668	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	86782066	T	G	KLHL4	CCDS14457.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	50	0	0	52	0	0	58	7	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.432142857	0.432142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	1	NA	1	1	1	1	1	1	1.88E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	87357080	A	G	-	-	-	-	-	-	42	0	0	41	11	26.8	51	13	25.5	40	8	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.181802577	1.181802577	1	1.042944785	1.042944785	1	0.714285714	0.714285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	1.34E-16	1	4.87E-19	1	2.61E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	87405751	C	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	41	8	19.5	57	2	3.5	63	12	19	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.859893666	0.859893666	1	0.143149284	0.143149284	1	0.678571429	0.678571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	3.22E-11	1	0.03327602	1	5.15E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	87443494	C	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	51	0	0	49	12	24.5	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	1.00204499	1.00204499	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.90E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	87662547	C	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	43	13	30.2	54	0	0	43	10	23.3	399	0	0	202	33	16.3	68	0	0	116	14	12.1	TRUE	TRUE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.331732755	1.331732755	1	0	0	1	0.832142857	0.832142857	1	0.718782911	0.718782911	1	0	0	1	0.432142857	0.432142857	1	7	6	1	1	3.88E-20	4.42E-39	1	1	1.61E-14	1.53E-15	YES	1_1	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	88021212	A	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	58	0	0	51	9	17.6	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.719836401	0.719836401	1	0.210714286	0.210714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	4.92E-12	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	88383384	C	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	35	0	0	52	6	11.5	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.470347648	0.470347648	1	0.078571429	0.078571429	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	0.000000261	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	88867821	C	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	38	0	0	53	14	26.4	58	4	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	1.079754601	1.079754601	1	0.246428571	0.246428571	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	1.22E-20	1	0.000213772	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	88944711	C	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	31	0	0	54	8	14.8	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.605316973	0.605316973	1	0.1	0.1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	3.31E-10	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	89083249	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	37	9	24.3	48	1	2.1	53	12	22.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.0715598	1.0715598	1	0.085889571	0.085889571	1	0.807142857	0.807142857	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	2.14E-13	1	0.213845552	1	5.39E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	89162477	A	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	42	11	26.2	45	0	0	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.155344311	1.155344311	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	6	NA	1	1	1.81E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	89411968	G	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	52	9	17.3	34	0	0	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.762880022	0.762880022	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	6	NA	1	1	5.92E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	89427874	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	41	13	31.7	28	0	0	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.397878422	1.397878422	1	0	0	1	0.085714286	0.085714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	6	NA	1	1	1.89E-20	1	1	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	89795210	A	C	-	-	-	-	-	-	20	0	0	45	0	0	42	9	21.4	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.875255624	0.875255624	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	7.51E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	91159489	G	C	PCDH11X	CCDS14461.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	44	5	11.4	55	0	0	38	0	0	294	0	0	74	6	8.1	51	0	0	54	0	0	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.502707066	0.502707066	1	0	0	1	0	0	1	0.3571866	1.419057352	0.251706951	0	NA	0	0	NA	0	6	NA	1	1	0.00000288	0.00000216	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	91506298	A	G	PCDH11X	CCDS14461.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	34	0	0	49	9	18.4	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.752556237	0.752556237	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	3.35E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	92074152	G	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	40	6	15	41	0	0	44	0	0	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.661456666	0.661456666	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	6	NA	1	1	5.18E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	94000886	C	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	44	0	0	47	9	19.1	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.781186094	0.781186094	1	0.071428571	0.071428571	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	2.24E-12	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	94566987	G	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	39	7	17.9	44	0	0	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.789338289	0.789338289	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	6	NA	1	1	1.04E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	94591349	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	48	0	0	51	9	17.6	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.719836401	0.719836401	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	4.92E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	95425532	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	43	0	0	58	7	12.1	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.494887526	0.494887526	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.88E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	99558935	G	T	PCDH19	CCDS43976.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	49	0	0	56	16	28.6	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	1.169734151	1.169734151	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	5.26E-24	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	102650123	G	T	-	-	-	-	-	-	51	0	0	50	0	0	65	13	20	54	8	14.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.81799591	0.81799591	1	0.528571429	0.528571429	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	1.57E-17	1	3.31E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	103251762	G	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	39	14	35.9	61	3	4.9	62	8	12.9	88	2	2.3	170	45	26.5	146	0	0	141	13	9.2	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.583086288	1.264741948	1.251706951	0.200408998	0.200408998	1	0.460714286	0.460714286	1	1.168573444	1.168573444	1	0	NA	0	0.328571429	0.328571429	1	7	NA	1	0.072188127	8.19E-23	4.96E-63	0.003623631	1	1.04E-09	5.32E-13	YES	1_1	1_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	104264015	C	T	IL1RAPL2	CCDS14517.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	47	12	25.5	52	9	17.3	63	15	23.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.124476333	1.124476333	1	0.707566462	0.707566462	1	0.85	0.85	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	8	NA	1	1	1.09E-17	1	5.92E-12	1	2.97E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	104356188	G	T	IL1RAPL2	CCDS14517.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	42	0	0	54	5	9.3	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.380368098	0.380368098	1	0.082142857	0.082142857	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	0.00000806	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	104885561	A	G	IL1RAPL2	CCDS14517.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	64	14	21.9	61	15	24.6	56	22	39.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.965726733	0.965726733	1	1.006134969	1.006134969	1	1.403571429	1.403571429	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	8	NA	1	1	2.31E-19	1	1.73E-21	1	4.34E-36	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	105073002	A	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	45	14	31.1	57	0	0	42	11	26.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.371420155	1.371420155	1	0	0	1	0.935714286	0.935714286	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	7	NA	1	1	8.81E-22	1	1	1	1.81E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	105077598	A	G	-	-	-	-	-	-	38	0	0	52	13	25	57	2	3.5	50	7	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.102427777	1.102427777	1	0.143149284	0.143149284	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	7	NA	1	1	6.47E-19	1	0.03327602	1	6.46E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	105192600	T	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	48	7	14.6	50	8	16	61	19	31.1	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.643817822	0.643817822	1	0.654396728	0.654396728	1	1.110714286	1.110714286	1	4.409711109	4.409711109	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	4.81E-09	0.005	1.74E-10	1	4.64E-29	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	106161494	G	A	CLDN2	CCDS14524.1	r.?	-	-	upstream	43	0	0	50	0	0	50	8	16	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.654396728	0.654396728	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.74E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	106956161	G	A	TSC22D3	CCDS14530.1	r.?	-	-	downstream	33	0	0	51	10	19.6	52	0	0	53	0	0	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.864303377	0.864303377	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.04E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	109899034	T	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	62	0	0	50	14	28	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	1.145194274	1.145194274	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	4.84E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	110489800	C	T	CAPN6	CCDS14555.1	r.2099g>a	c.?	p.?	3'UTR variant	45	0	0	50	13	26	42	14	33.3	52	22	42.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.146524888	1.146524888	1	1.36196319	1.36196319	1	1.510714286	1.510714286	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	3.65E-19	1	2.83E-22	1	5.59E-37	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	111043864	C	A	TRPC5	CCDS14561.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	31	10	32.3	43	1	2.3	39	7	17.9	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	1.424336688	1.424336688	1	0.09406953	0.09406953	1	0.639285714	0.639285714	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	3.94E-16	1	0.193893409	1	1.04E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	111424709	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	43	0	0	45	0	0	49	5	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0	0	1	0.364285714	0.364285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	1	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000496	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	111555683	C	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	49	0	0	59	12	20.3	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.830265849	0.830265849	1	0.075	0.075	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	2.20E-16	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	111815180	C	T	-	-	-	-	-	-	48	0	0	44	0	0	45	11	24.4	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	0	1	0.99795501	0.99795501	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	4.24E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	115132657	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	45	0	0	55	10	18.2	63	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	NA	0	0.744376278	0.744376278	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	2.33E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	116178744	C	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	39	4	10.3	50	13	26	36	14	38.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0.454200244	0.454200244	1	1.063394683	1.063394683	1	1.389285714	1.389285714	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	0.0000447	1	3.65E-19	1	2.09E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	116338274	C	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	42	0	0	42	14	33.3	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.251706951	2	2	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.251706951	NA	NA	0	NA	0	1.36196319	1.36196319	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	2.83E-22	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	116631435	A	G	-	-	-	-	-	-	38	0	0	45	0	0	52	10	19.2	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	0.785276074	0.785276074	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.28E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	117727065	T	C	DOCK11	CCDS35373.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	53	0	0	55	12	21.8	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	0.891615542	0.891615542	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	8.78E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	117852829	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	54	0	0	39	8	20.5	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	NA	0	0.838445808	0.838445808	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	2.09E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	118561445	C	T	SLC25A43	CCDS14577.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	42	8	19	31	6	19.4	53	14	26.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.837845111	0.837845111	1	0.793456033	0.793456033	1	1.02541076	1.02541076	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	3.96E-11	1	1.03E-08	1	1.22E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	119294330	A	G	RHOXF2	CCDS14594.1	r.?	-	-	intronic	7	0	0	6	3	50	6	1	16.7	6	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	2.204855555	2.204855555	1	0.683026585	0.683026585	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	0.00000247	1	0.029627491	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	119334453	G	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	45	8	17.8	51	0	0	46	6	13	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.784928577	0.784928577	1	0	0	1	0.504937117	0.504937117	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	7.14E-11	1	1	1	0.000000123	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	119542308	C	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	62	14	22.6	52	3	5.8	56	4	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.996594711	0.996594711	1	0.237218814	0.237218814	1	0.275773348	0.881901561	0.312703096	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.42E-19	1	0.002300591	1	0.000186538	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	119632462	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	35	0	0	53	8	15.1	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	0.617586912	0.617586912	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	2.83E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	121236838	C	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	40	0	0	51	12	23.5	52	0	0	384	1	0.3	166	0	0	86	9	10.5	141	1	0.7	TRUE	TRUE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	0.961145194	0.961145194	1	0	0	1	0	0	1	0.429447853	0.429447853	1	0.027188922	0.027188922	1	2	1	1	0.854097408	1	1	3.24E-17	6.35E-10	1	0.506764434	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	121454404	A	C	-	-	-	-	-	-	48	0	0	49	0	0	47	1	2.1	53	12	22.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	0.085889571	0.085889571	1	0.877813757	0.877813757	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	1	NA	1	1	1	1	0.209895027	1	5.39E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	121457080	A	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	41	0	0	54	13	24.1	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	0.985685072	0.985685072	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.12E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	121546187	A	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	44	0	0	52	11	21.2	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	0.867075665	0.867075665	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	2.44E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	122547307	A	T	GRIA3	ENST00000264357	r.?	-	-	intronic	41	0	0	31	0	0	55	5	9.1	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	0.372188139	0.372188139	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	0.00000883	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	123004052	T	A	XIAP	CCDS14606.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	45	0	0	52	9	17.3	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	NA	0	0.707566462	0.707566462	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	5.92E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	123394821	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	35	9	25.7	43	16	37.2	53	15	28.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	1.133295755	1.133295755	1	1.521472393	1.521472393	1	1.099209262	1.099209262	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	1.23E-13	1	3.56E-26	1	1.60E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	123634784	C	A	ODZ1	CCDS14609.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	56	1	1.8	53	11	20.8	46	0	0	108	0	0	154	1	0.6	66	19	28.8	135	0	0	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.0793748	0.0793748	1	0.850715746	0.850715746	1	0	0	1	0.026458267	0.026458267	1	1.17791411	1.17791411	1	0	NA	0	2	NA	1	1	0.244746891	0.537880351	3.07E-15	2.64E-28	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	123853882	G	A	ODZ1	CCDS14609.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	45	9	20	55	0	0	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.881942222	0.881942222	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	6	NA	1	1	1.47E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	124612090	T	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	43	0	0	43	8	18.6	61	1	1.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	NA	0	0.760736196	0.760736196	1	0.062146107	0.062146107	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	4.85E-11	1	0.263440347	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	124656984	C	G	-	-	-	-	-	-	47	0	0	36	0	0	43	6	14	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	NA	0	0.572597137	0.572597137	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	8.13E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	124728129	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	34	0	0	58	9	15.5	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	0.63394683	0.63394683	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.67E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	125148394	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	49	0	0	60	13	21.7	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	NA	0	0.887525562	0.887525562	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	5.07E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	125384905	T	C	-	-	-	-	-	-	48	0	0	62	10	16.1	53	1	1.9	68	1	1.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.709963489	0.709963489	1	0.077709611	0.077709611	1	0.058261975	0.058261975	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	6	NA	1	1	8.29E-13	1	0.233303855	1	0.288836448	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	126454388	C	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	49	7	14.3	48	0	0	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.630588689	0.630588689	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	6	NA	1	1	5.58E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	126875412	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	69	21	30.4	64	2	3.1	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	1.340552177	1.340552177	1	0.126789366	0.126789366	1	0.380644903	1.217272577	0.312703096	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.02E-31	1	0.041085601	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	127110629	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	45	15	33.3	44	0	0	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	1.468433799	1.468433799	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	9.14E-24	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	127230955	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	44	0	0	63	8	12.7	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	0.519427403	0.519427403	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.18E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	127494221	A	G	-	-	-	-	-	-	60	0	0	60	0	0	61	0	0	67	10	14.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	0	0	1	0.578735618	0.578735618	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	1	NA	1	1	1	1	1	1	1.87E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	127571873	T	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	52	7	13.5	53	7	13.2	48	14	29.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.595311	0.595311	1	0.539877301	0.539877301	1	1.134166447	1.134166447	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	8.58E-09	1	9.85E-09	1	2.51E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	127760123	A	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	60	11	18.3	53	0	0	69	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.806977133	0.806977133	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	6	NA	1	1	1.34E-14	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	127762950	A	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	41	0	0	41	6	14.6	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	0.597137014	0.597137014	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	6.05E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	127778022	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	54	2	3.7	44	9	20.5	51	7	13.7	320	1	0.3	213	1	0.5	94	28	29.8	144	18	12.5	TRUE	TRUE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.163159311	0.648211383	0.251706951	0.838445808	0.838445808	1	0.532126038	0.532126038	1	0.022048556	0.022048556	1	1.218813906	1.218813906	1	0.485516458	0.485516458	1	8	3	1	0.798912146	0.030129377	0.656191825	1.18E-12	1.77E-41	7.46E-09	7.67E-20	YES	1_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	128306018	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	51	14	27.5	63	16	25.4	76	24	31.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	1.212670555	1.212670555	1	1.038854806	1.038854806	1	1.227385607	1.227385607	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	6.64E-21	1	4.48E-23	1	1.75E-36	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	128606753	C	A	SMARCA1	CCDS14612.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	47	14	29.8	54	2	3.7	48	6	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	1.314093911	1.314093911	1	0.151329243	0.151329243	1	0.485516458	0.485516458	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	1.79E-21	1	0.030129377	1	0.00000016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	130988720	C	G	-	-	-	-	-	-	45	0	0	54	17	31.5	44	1	2.3	59	8	13.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	1.389058999	1.389058999	1	0.09406953	0.09406953	1	0.528241907	0.528241907	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	3.02E-26	1	0.197923942	1	6.90E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	131084923	T	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	37	7	18.9	59	0	0	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.8334354	0.8334354	1	0	0	1	0.089335028	0.089335028	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	6	NA	1	1	7.05E-10	1	1	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	131821475	G	A	HS6ST2	CCDS48169.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	55	19	34.5	52	8	15.4	43	17	39.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	1.521350333	1.215420535	1.251706951	0.629856851	0.629856851	1	1.534232009	1.16875782	1.312703096	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	4.51E-30	1	2.42E-10	1	2.84E-28	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	134177792	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	36	10	27.8	59	2	3.4	43	6	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	1.225899688	1.225899688	1	0.139059305	0.139059305	1	0.543778433	0.543778433	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	2.21E-15	1	0.035441897	1	8.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	136188961	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	47	8	17	45	0	0	55	7	12.7	444	2	0.5	274	51	18.6	168	6	3.6	212	34	16	TRUE	TRUE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.749650889	0.749650889	1	0	0	1	0.493284722	0.493284722	1	0.820206266	0.820206266	1	0.147239264	0.147239264	1	0.621461067	0.621461067	1	7	6	1	0.651015814	1.03E-10	1.41E-62	1	0.000223484	1.28E-08	6.29E-40	YES	1_1	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	136432854	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	41	18	43.9	52	0	0	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	1.935863177	1.546578594	1.251706951	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	6	NA	1	1	6.91E-31	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	136560235	T	A	-	-	-	-	-	-	54	0	0	49	13	26.5	42	4	9.5	47	10	21.3	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	1.168573444	1.168573444	1	0.388548057	0.388548057	1	0.827320045	0.827320045	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	7	NA	1	1	2.71E-19	1	0.0000601	1	4.27E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	136565374	A	G	-	-	-	-	-	-	44	0	0	36	11	30.6	54	17	31.5	46	22	47.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	1.349371599	1.349371599	1	1.288343558	1.288343558	1	1.856614937	1.414344906	1.312703096	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.62E-17	1	3.02E-26	1	1.68E-38	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	136935421	G	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	63	0	0	46	9	19.6	58	13	22.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	0.801635992	0.801635992	1	0.870045494	0.870045494	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	1.82E-12	1	3.12E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	137630879	T	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	49	5	10.2	57	0	0	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.449790533	0.449790533	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	6	NA	1	1	0.00000496	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	139753030	C	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	20	0	0	41	14	34.1	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	1.394683027	1.394683027	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	1.90E-22	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	139789121	G	A	ENSG00000203930	ENST00000370535	r.?	-	-	upstream	38	0	0	44	0	0	47	11	23.4	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	0.957055215	0.957055215	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	7.21E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	140597416	C	T	-	-	-	-	-	-	6	0	0	7	4	57.1	11	4	36.4	9	4	44.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	2.517945043	2.01160906	1.251706951	1.488752556	1.488752556	1	1.72455446	1.72455446	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	8	NA	1	1	2.16E-08	1	0.000000201	1	7.72E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	140729724	G	T	-	-	-	-	-	-	54	0	0	57	10	17.5	64	0	0	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.771699444	0.771699444	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.40E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	142862997	A	C	-	-	-	-	-	-	36	0	0	55	0	0	42	12	28.6	60	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	1.169734151	1.169734151	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.35E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	142959263	C	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	56	0	0	45	7	15.6	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	NA	0	0.63803681	0.63803681	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000000003	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	143791019	G	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	61	8	13.1	53	0	0	70	12	17.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.577672155	0.577672155	1	0	0	1	0.664186515	0.664186515	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.09E-10	1	1	1	1.99E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	144052216	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	52	15	28.8	51	2	3.9	52	6	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	1.269996799	1.269996799	1	0.159509202	0.159509202	1	0.446675142	1.428432105	0.312703096	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.15E-22	1	0.027109304	1	0.000000261	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	144091023	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	56	12	21.4	44	0	0	60	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.943678177	0.943678177	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.11E-16	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	144316177	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	52	14	26.9	45	0	0	51	4	7.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	1.186212288	1.186212288	1	0	0	1	0.30296227	0.968849602	0.312703096	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	9.04E-21	1	1	1	0.000129466	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	144419951	T	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	32	9	28.1	40	3	7.5	46	7	15.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	1.239128822	1.239128822	1	0.306748466	0.306748466	1	0.590388013	0.590388013	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.94E-14	1	0.001075403	1	3.53E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	144694618	C	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	35	6	17.1	61	22	36.1	44	9	20.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.7540606	0.7540606	1	1.476482618	1.476482618	1	0.796246992	0.796246992	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	2.24E-08	1	4.38E-35	1	1.18E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	144700327	T	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	59	0	0	44	9	20.5	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	0.838445808	0.838445808	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.18E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	146859840	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	40	10	25	49	10	20.4	41	6	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	1.102427777	1.102427777	1	0.834355828	0.834355828	1	0.567083223	0.567083223	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	7.22E-15	1	6.72E-14	1	6.05E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	147250330	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	49	0	0	47	11	23.4	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	NA	0	0.957055215	0.957055215	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	7.21E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	147284780	G	A	-	-	-	-	-	-	49	0	0	44	15	34.1	50	12	24	62	18	29	171	0	0	156	47	30.1	83	24	28.9	140	53	37.9	TRUE	TRUE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	1.503711488	1.503711488	1	0.981595092	0.981595092	1	1.126398184	1.126398184	1	1.327323044	1.06041038	1.251706951	1.18200409	1.18200409	1	1.472085902	1.121415731	1.312703096	8	7	1	1	6.12E-24	8.33E-69	2.49E-17	2.06E-35	5.72E-27	1.08E-83	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	147617358	G	A	AFF2	CCDS14684.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	35	7	20	66	0	0	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.881942222	0.881942222	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	4.65E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	147811135	G	T	AFF2	CCDS14684.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	49	0	0	46	11	23.9	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	0.977505112	0.977505112	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	5.55E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	148022792	G	A	AFF2	CCDS14684.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	53	0	0	42	10	23.8	57	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	NA	0	0.973415133	0.973415133	1	0.06991437	0.06991437	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1.24E-14	1	0.248523156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	148126265	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	49	9	18.4	44	0	0	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.811386844	0.811386844	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	3.35E-12	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	148476347	C	G	-	-	-	-	-	-	46	0	0	40	7	17.5	58	14	24.1	44	13	29.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.771699444	0.771699444	1	0.985685072	0.985685072	1	1.145818842	1.145818842	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.26E-09	1	5.04E-20	1	5.49E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	148545901	T	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	44	0	0	57	10	17.5	60	1	1.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	0.715746421	0.715746421	1	0.066030238	0.066030238	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.40E-13	1	0.259739042	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	148729475	G	A	HSFX2	CCDS48179.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	40	5	12.5	47	3	6.4	37	6	16.2	0	0	NA	2	2	100	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.551213889	0.551213889	1	0.261758691	0.261758691	1	0.62922933	0.62922933	1	4.409711109	3.522958073	1.251706951	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.00000178	0.000025	0.001719595	1	3.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	148996358	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	44	10	22.7	36	0	0	44	9	20.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	1.001004422	1.001004422	1	0	0	1	0.796246992	0.796246992	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.08E-14	1	1	1	1.18E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	149442447	G	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	51	17	33.3	46	0	0	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	1.468433799	1.468433799	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	9.59E-27	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	149835100	C	T	MTM1	CCDS14694.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	42	5	11.9	49	1	2	57	9	15.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.524755622	0.524755622	1	0.081799591	0.081799591	1	0.613692803	0.613692803	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	0.00000228	1	0.217776325	1	1.42E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	150832160	C	A	PASD1	CCDS35431.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	43	10	23.3	56	15	26.8	50	16	32	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	1.027462688	1.027462688	1	1.096114519	1.096114519	1	1.242922134	1.242922134	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	8	NA	1	1	1.61E-14	1	4.09E-22	1	6.40E-25	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	150859795	T	G	PRRG3	ENST00000370354	r.?	-	-	upstream	59	0	0	35	0	0	44	8	18.2	40	7	17.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	0.744376278	0.744376278	1	0.679723042	0.679723042	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	5.90E-11	1	1.26E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	151194002	A	G	-	-	-	-	-	-	44	0	0	46	9	19.6	54	2	3.7	56	11	19.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.864303377	0.864303377	1	0.151329243	0.151329243	1	0.761289807	0.761289807	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	1.82E-12	1	0.030129377	1	5.91E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	151436150	C	A	GABRA3	CCDS14706.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	55	0	0	43	10	23.3	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	0.952965235	0.952965235	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.61E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	151578650	C	A	GABRA3	CCDS14706.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	47	10	21.3	48	3	6.2	60	6	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.939268466	0.939268466	1	0.253578732	0.253578732	1	0.388413167	1.242114874	0.312703096	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	4.27E-14	1	0.001827434	1	0.000000621	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	151770765	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	39	0	0	44	11	25	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0	0	1	1.022494888	1.022494888	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.22E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	151896526	G	C	MAGEA12	CCDS14710.1	r.?	-	-	downstream	37	0	0	43	5	11.6	41	9	22	40	7	17.5	353	0	0	147	15	10.2	126	28	22.2	137	38	27.7	TRUE	TRUE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	0.511526489	0.511526489	1	0.899795501	0.899795501	1	0.679723042	0.679723042	1	0.449790533	0.449790533	1	0.90797546	0.90797546	1	1.075904472	1.075904472	1	8	5	1	1	0.00000257	1.94E-15	5.92E-13	1.91E-37	1.26E-09	2.30E-54	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9694b	X	153950756	A	G	GAB3	CCDS48198.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	49	12	24.5	57	0	0	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	1.080379222	1.080379222	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	6	NA	1	1	1.90E-17	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9694b	X	154052428	C	T	ENSG00000203870	ENST00000369529	r.?	-	-	intronic	33	0	0	48	15	31.2	40	0	0	48	9	18.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.251706951	2	2.312703096	1	1	1	1	1	1	0.748293049	1	0.687296904	2	NA	2	1	NA	1	0.251706951	NA	0.312703096	1.375829866	1.375829866	1	0	0	1	0.730216753	0.730216753	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	7	NA	1	1	2.86E-23	1	1	1	2.75E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA