Normal	Chrom	Pos	Ref	Alt	Gene	Transcript	RNA	CDS	Protein	Effect	DIS_sample_PD9849b_depth	DIS_MtAll_PD9849b	DIS_MtAllPct_PD9849b	DIS_sample_PD9849a_depth	DIS_MtAll_PD9849a	DIS_MtAllPct_PD9849a	DIS_sample_PD9849h_depth	DIS_MtAll_PD9849h	DIS_MtAllPct_PD9849h	DIS_sample_PD9849j_depth	DIS_MtAll_PD9849j	DIS_MtAllPct_PD9849j	VAL_sample_PD9849b_depth	VAL_MtAll_PD9849b	VAL_MtAllPct_PD9849b	VAL_sample_PD9849a_depth	VAL_MtAll_PD9849a	VAL_MtAllPct_PD9849a	VAL_sample_PD9849h_depth	VAL_MtAll_PD9849h	VAL_MtAllPct_PD9849h	VAL_sample_PD9849j_depth	VAL_MtAll_PD9849j	VAL_MtAllPct_PD9849j	in.discovery	in.validation	subclonal.CN.a	subclonal.CN.h	subclonal.CN.j	nMaj1.a	nMaj1.h	nMaj1.j	nMin1.a	nMin1.h	nMin1.j	frac1.a	frac1.h	frac1.j	nMaj2.a	nMaj2.h	nMaj2.j	nMin2.a	nMin2.h	nMin2.j	frac2.a	frac2.h	frac2.j	mutation.copy.number.a	subclonal.fraction.a	no.chrs.bearing.mut.a	mutation.copy.number.h	subclonal.fraction.h	no.chrs.bearing.mut.h	mutation.copy.number.j	subclonal.fraction.j	no.chrs.bearing.mut.j	val.mutation.copy.number.a	val.subclonal.fraction.a	val.no.chrs.bearing.mut.a	val.mutation.copy.number.h	val.subclonal.fraction.h	val.no.chrs.bearing.mut.h	val.mutation.copy.number.j	val.subclonal.fraction.j	val.no.chrs.bearing.mut.j	discovery.DP.cluster	validation.DP.cluster	pbinom_dis_b	pbinom_val_b	pbinom_dis_a	pbinom_val_a	pbinom_dis_h	pbinom_val_h	pbinom_dis_j	pbinom_val_j	VAL_LOCUS	val_status_a	val_status_h	val_status_j	current.conf.status	val.platform
PD9849b	1	2420042	G	A	PLCH2	ENST00000343889	r.?	-	-	intronic	20	0	0	28	7	25	36	5	13.9	41	2	4.9	153	0	0	150	26	17.3	114	14	12.3	175	10	5.7	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	0.720207254	0.720207254	1	0.907407407	0.907407407	1	0.982954545	0.982954545	1	0.637305699	0.637305699	1	1.055555556	1.055555556	1	5	4	1	1	8.44E-11	7.71E-32	0.00000104	1.2E-15	0.018015855	2.64E-08	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	1	2420086	G	A	PLCH2	ENST00000343889	r.?	-	-	intronic	27	0	0	34	6	17.6	28	5	17.9	34	1	2.9	163	1	0.6	198	33	16.7	161	23	14.3	225	15	6.7	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	0.92746114	0.92746114	1	0.537037037	0.537037037	1	0.948863636	0.948863636	1	0.740932642	0.740932642	1	1.240740741	1.240740741	1	5	4	1	0.558264644	1.86E-08	2.2E-39	0.000000279	2.61E-26	0.156694864	1.04E-12	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	1	2420159	G	A	PLCH2	ENST00000343889	r.?	-	-	intronic	15	0	0	22	4	18.2	28	9	32.1	43	4	9.3	164	0	0	192	35	18.2	195	27	13.8	238	15	6.3	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	1.663212435	1.663212435	1	1.722222222	1.722222222	1	1.034090909	1.034090909	1	0.715025907	0.715025907	1	1.166666667	1.166666667	1	5	4	1	1	0.00000425	3.97E-43	1.24E-14	3.12E-30	0.000066	2.33E-12	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	1	2490051	C	T	TNFRSF14	CCDS44046.1	r.?	-	-	intronic	7	0	0	9	2	22.2	9	2	22.2	40	6	15	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	1.150259067	1.150259067	1	2.777777778	2.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000879235	1	0.000879235	1	5.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	2709855	C	A	TTC34	ENST00000401094	r.?	-	-	upstream	28	0	0	33	7	21.2	31	2	6.5	29	3	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.204545455	1.204545455	1	0.336787565	0.336787565	1	1.907407407	1.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.98E-10	1	0.010558179	1	0.000414371	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	3697595	G	A	LRRC47	CCDS51.1	r.1837c>u	c.?	p.?	3'UTR variant	13	0	0	18	5	27.8	9	3	33.3	27	0	0	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.579545455	1.579545455	1	1.725388601	1.725388601	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.54E-08	1	0.0000103	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	3697596	C	A	LRRC47	CCDS51.1	r.1836g>u	c.?	p.?	3'UTR variant	14	0	0	18	5	27.8	10	3	30	27	0	0	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.579545455	1.579545455	1	1.554404145	1.554404145	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.54E-08	1	0.0000146	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	5044002	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	45	7	15.6	36	11	30.6	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.886363636	0.886363636	1	1.585492228	1.585492228	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000003	1	2.62E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	5340670	T	A	-	-	-	-	-	-	14	0	0	29	4	13.8	28	5	17.9	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.784090909	0.784090909	1	0.92746114	0.92746114	1	2.148148148	2.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000134	1	0.000000279	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	5684360	G	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	33	6	18.2	29	6	20.7	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	1.07253886	1.07253886	1	1.351851852	1.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.54E-08	1	6.72E-09	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	8357100	C	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	22	4	18.2	40	3	7.5	29	4	13.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	0.388601036	0.388601036	1	2.555555556	2.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000425	1	0.001075403	1	0.0000134	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	10265646	G	A	-	-	-	-	-	-	13	0	0	16	3	18.8	21	7	33.3	16	1	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.068181818	1.068181818	1	1.725388601	1.725388601	1	1.148148148	1.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000667	1	8.54E-12	1	0.077068876	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	10901399	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	26	3	11.5	30	6	20	34	0	0	293	0	0	269	36	13.4	258	60	23.3	214	15	7	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.653409091	0.653409091	1	1.03626943	1.03626943	1	0	0	1	0.761363636	0.761363636	1	1.207253886	1.207253886	1	1.296296296	1.296296296	1	5	5	1	1	0.000298167	3.2E-39	8.37E-09	1.13E-79	1	5.02E-13	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	1	15703051	G	A	FHAD1	CCDS44062.1	r.?	-	-	intronic	14	0	0	22	4	18.2	23	5	21.7	26	2	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	1.124352332	1.124352332	1	1.425925926	1.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000425	1	9.75E-08	1	0.007502227	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	17777750	A	T	AL390994.1	ENST00000509615	r.?	-	-	intronic	7	0	0	16	1	6.2	11	3	27.3	13	4	30.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.352272727	0.352272727	1	1.414507772	1.414507772	1	5.703703704	5.703703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.077068876	1	0.00002	1	0.000000431	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	18398804	G	A	-	-	-	-	-	-	11	0	0	18	5	27.8	18	2	11.1	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.579545455	1.579545455	1	0.575129534	0.575129534	1	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.54E-08	1	0.003626632	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	20130482	A	G	TMCO4	CCDS198.1	r.?	-	-	upstream	35	0	0	49	6	12.2	48	7	14.6	29	1	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.693181818	0.693181818	1	0.756476684	0.756476684	1	0.62962963	0.62962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000182	1	4.81E-09	1	0.135292269	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	20566297	G	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	34	4	11.8	28	7	25	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.670454545	0.670454545	1	1.295336788	1.295336788	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000257	1	8.44E-11	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	22654487	C	G	-	-	-	-	-	-	25	0	0	29	2	6.9	26	5	19.2	26	3	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.392045455	0.392045455	1	0.994818653	0.994818653	1	2.12962963	2.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.009279585	1	0.000000188	1	0.000298167	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	22951848	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	34	5	14.7	26	7	26.9	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.835227273	0.835227273	1	1.393782383	1.393782383	1	0.555555556	0.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000771	1	4.73E-11	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	23168800	T	A	EPHB2	CCDS230.1	r.?	-	-	intronic	10	0	0	18	6	33.3	14	2	14.3	27	1	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.892045455	1.892045455	1	0.740932642	0.740932642	1	0.685185185	0.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.75E-10	1	0.002185852	1	0.126579904	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	23272716	C	T	-	-	-	-	-	-	8	0	0	17	4	23.5	11	0	0	21	1	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.335227273	1.335227273	1	0	0	1	0.888888889	0.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000141	1	1	1	0.099912572	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	25167161	T	G	CLIC4	CCDS256.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	32	3	9.4	39	9	23.1	28	1	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.534090909	0.534090909	1	1.196891192	1.196891192	1	0.666666667	0.666666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000556213	1	3.62E-13	1	0.130947004	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	25364004	T	C	-	-	-	-	-	-	12	0	0	25	6	24	19	2	10.5	14	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.363636364	1.363636364	1	0.544041451	0.544041451	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	0.004039874	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	27680785	G	A	MAP3K6	CCDS299.1	r.?	-	-	downstream	18	0	0	22	4	18.2	35	8	22.9	22	1	4.5	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	1.186528497	1.186528497	1	0.833333333	0.833333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000425	1	8.15E-12	1	0.104413009	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	28255314	A	T	-	-	-	-	-	-	16	0	0	19	5	26.3	23	9	39.1	18	1	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.494318182	1.494318182	1	2.025906736	2.025906736	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.43E-08	1	1.5E-15	1	0.086275114	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	30444758	G	T	-	-	-	-	-	-	18	0	0	35	12	34.3	28	3	10.7	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.948863636	1.948863636	1	0.554404145	0.554404145	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.83E-19	1	0.000372895	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	33019674	G	A	ZBTB8A	CCDS30664.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	22	7	31.8	15	1	6.7	26	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.806818182	1.806818182	1	0.347150259	0.347150259	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.25E-11	1	0.072431031	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	33814603	G	C	PHC2	CCDS379.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	33	7	21.2	27	3	11.1	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.204545455	1.204545455	1	0.575129534	0.575129534	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.98E-10	1	0.000334187	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	34546047	T	C	CSMD2	CCDS380.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	37	4	10.8	48	2	4.2	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.613636364	0.613636364	1	0.21761658	0.21761658	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	4	NA	1	1	0.0000362	1	0.024220359	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	35133679	G	A	MIR552	ENST00000385206	r.?	-	-	downstream	35	0	0	39	11	28.2	41	9	22	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.602272727	1.602272727	1	1.139896373	1.139896373	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.2E-17	1	5.92E-13	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	35621302	G	A	-	-	-	-	-	-	12	0	0	19	2	10.5	17	8	47.1	24	2	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.596590909	0.596590909	1	2.440414508	2.440414508	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.004039874	1	9.12E-15	1	0.006413403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	36443197	T	G	EIF2C3	CCDS399.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	30	2	6.7	33	8	24.2	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.380681818	0.380681818	1	1.25388601	1.25388601	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.009909649	1	4.85E-12	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	39194292	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	26	6	23.1	30	5	16.7	28	2	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.3125	1.3125	1	0.865284974	0.865284974	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.3E-09	1	0.000000401	1	0.008668191	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	39706564	A	T	MACF1	CCDS435.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	32	5	15.6	33	7	21.2	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.886363636	0.886363636	1	1.098445596	1.098445596	1	2.259259259	2.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000562	1	2.98E-10	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	39886238	A	G	MACF1	CCDS436.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	22	2	9.1	27	5	18.5	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.517045455	0.517045455	1	0.958549223	0.958549223	1	1.148148148	1.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.005403392	1	0.00000023	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	41465953	C	T	CTPS	CCDS459.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	23	6	26.1	30	7	23.3	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.482954545	1.482954545	1	1.207253886	1.207253886	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-09	1	1.44E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	44965168	G	A	RNF220	CCDS510.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	28	9	32.1	36	8	22.2	27	1	3.7	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.823863636	1.823863636	1	1.150259067	1.150259067	1	0.685185185	0.685185185	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.24E-14	1	1.04E-11	1	0.126579904	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	45315742	C	G	EIF2B3	CCDS517.1	r.?	-	-	downstream	30	0	0	36	6	16.7	31	6	19.4	29	2	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	1.005181347	1.005181347	1	1.277777778	1.277777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.68E-08	1	1.03E-08	1	0.009279585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	48138227	C	G	-	-	-	-	-	-	41	0	0	48	11	22.9	24	5	20.8	35	4	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.301136364	1.301136364	1	1.077720207	1.077720207	1	2.111111111	2.111111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.31E-16	1	0.000000123	1	0.0000289	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	49097464	G	A	AGBL4	CCDS44137.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	29	6	20.7	32	8	25	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.176136364	1.176136364	1	1.295336788	1.295336788	1	0.87037037	0.87037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.72E-09	1	3.69E-12	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	49259936	C	A	AGBL4	CCDS44137.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	41	6	14.6	38	9	23.7	54	1	1.9	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.829545455	0.829545455	1	1.227979275	1.227979275	1	0.351851852	0.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.05E-08	1	2.79E-13	1	0.237137336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	50142392	C	T	AGBL4	CCDS44137.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	47	9	19.1	29	5	17.2	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.085227273	1.085227273	1	0.89119171	0.89119171	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-12	1	0.000000336	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	50243754	T	A	AGBL4	CCDS44137.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	47	7	14.9	37	9	24.3	51	0	0	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.846590909	0.846590909	1	1.259067358	1.259067358	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.12E-09	1	2.14E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	50498001	G	T	-	-	-	-	-	-	55	0	0	37	6	16.2	56	10	17.9	49	2	4.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.920454545	0.920454545	1	0.92746114	0.92746114	1	0.759259259	0.759259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.18E-08	1	2.82E-13	1	0.025168485	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	50772823	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	43	13	30.2	47	8	17	47	5	10.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.715909091	1.715909091	1	0.880829016	0.880829016	1	1.962962963	1.962962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.88E-20	1	1.03E-10	1	0.00000402	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	52462372	C	G	-	-	-	-	-	-	32	0	0	34	3	8.8	43	9	20.9	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.5	0.5	1	1.082901554	1.082901554	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000666058	1	9.45E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	53253339	C	T	ZYG11B	CCDS30717.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	41	6	14.6	33	9	27.3	28	1	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.829545455	0.829545455	1	1.414507772	1.414507772	1	0.666666667	0.666666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.05E-08	1	6.76E-14	1	0.130947004	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	56277953	A	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	53	2	3.8	44	5	11.4	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.215909091	0.215909091	1	0.590673575	0.590673575	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.029108399	1	0.00000288	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	61350274	C	T	NFIA	ENST00000371191	r.?	-	-	intronic	25	0	0	40	3	7.5	28	9	32.1	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.426136364	0.426136364	1	1.663212435	1.663212435	1	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001075403	1	1.24E-14	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	61668090	A	T	NFIA	CCDS44156.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	38	4	10.5	34	7	20.6	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.596590909	0.596590909	1	1.067357513	1.067357513	1	1.62962963	1.62962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000403	1	3.73E-10	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	63278001	T	A	ATG4C	CCDS623.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	28	0	0	42	0	0	31	4	12.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.388888889	2.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000177	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	63466880	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	43	5	11.6	33	5	15.2	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.659090909	0.659090909	1	0.787564767	0.787564767	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000257	1	0.00000066	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	64446952	G	T	ROR1	CCDS626.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	35	0	0	34	0	0	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	65938647	A	G	LEPR	CCDS631.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	36	8	22.2	50	8	16	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	0.829015544	0.829015544	1	0.777777778	0.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-11	1	1.74E-10	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	66775907	T	C	PDE4B	CCDS632.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	39	8	20.5	35	8	22.9	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.164772727	1.164772727	1	1.186528497	1.186528497	1	1.648148148	1.648148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.09E-11	1	8.15E-12	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	66943511	G	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	40	5	12.5	34	11	32.4	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	1.678756477	1.678756477	1	0.777777778	0.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000178	1	1.26E-17	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	67207739	C	T	SGIP1	CCDS30744.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	24	3	12.5	18	1	5.6	50	7	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	0.29015544	0.29015544	1	2.592592593	2.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000233853	1	0.086275114	1	6.46E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	68324320	C	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	40	6	15	25	3	12	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852272727	0.852272727	1	0.621761658	0.621761658	1	1.740740741	1.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.18E-08	1	0.00026475	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	68511384	G	A	DIRAS3	CCDS641.1	r.?	-	-	downstream	21	0	0	29	3	10.3	30	8	26.7	35	3	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.585227273	0.585227273	1	1.383419689	1.383419689	1	1.592592593	1.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000414371	1	2.07E-12	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	68882061	A	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	37	6	16.2	36	4	11.1	49	2	4.1	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.920454545	0.920454545	1	0.575129534	0.575129534	1	0.759259259	0.759259259	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.18E-08	1	0.0000324	1	0.025168485	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	70113173	G	A	LRRC7	ENST00000310961	r.?	-	-	intronic	41	0	0	37	0	0	39	0	0	56	5	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	1.648148148	1.648148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000965	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	70147967	G	A	LRRC7	ENST00000310961	r.?	-	-	intronic	26	0	0	51	5	9.8	49	4	8.2	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.556818182	0.556818182	1	0.424870466	0.424870466	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000606	1	0.000110643	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	71413977	A	T	PTGER3	CCDS656.1	r.?	-	-	downstream	33	0	0	37	3	8.1	39	4	10.3	48	7	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.460227273	0.460227273	1	0.533678756	0.533678756	1	2.703703704	2.703703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000855237	1	0.0000447	1	4.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	72647047	T	C	NEGR1	CCDS661.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	31	10	32.3	44	9	20.5	48	3	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.835227273	1.835227273	1	1.062176166	1.062176166	1	1.148148148	1.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.94E-16	1	1.18E-12	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	73566374	T	C	-	-	-	-	-	-	47	0	0	40	8	20	35	14	40	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	2.07253886	2.07253886	1	0.777777778	0.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.61E-11	1	1.28E-23	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	76262801	C	T	MSH4	CCDS670.1	r.235c>u	c.131C>T	p.S44L	missense	14	0	0	7	0	0	6	0	0	36	5	13.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.574074074	2.574074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000104	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	76539479	C	T	ST6GALNAC3	CCDS672.1	r.?	-	-	upstream	25	0	0	32	7	21.9	45	8	17.8	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.244318182	1.244318182	1	0.922279793	0.922279793	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.36E-10	1	7.14E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	79940291	A	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	49	8	16.3	47	9	19.1	57	4	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.926136364	0.926136364	1	0.989637306	0.989637306	1	1.296296296	1.296296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-10	1	2.24E-12	1	0.000199821	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	80024510	G	A	-	-	-	-	-	-	20	0	0	32	10	31.2	40	10	25	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.772727273	1.772727273	1	1.295336788	1.295336788	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.7E-16	1	7.22E-15	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	80910512	G	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	41	5	12.2	35	14	40	30	1	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.693181818	0.693181818	1	2.07253886	2.07253886	1	0.611111111	0.611111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000202	1	1.28E-23	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	81348380	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	40	7	17.5	33	6	18.2	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.994318182	0.994318182	1	0.943005181	0.943005181	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-09	1	1.54E-08	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	81502916	A	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	37	0	0	39	0	0	56	4	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.000186538	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	81746914	G	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	41	6	14.6	38	8	21.1	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.829545455	0.829545455	1	1.093264249	1.093264249	1	0.555555556	0.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.05E-08	1	1.67E-11	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	81944617	G	C	LPHN2	ENST00000370728	r.?	-	-	intronic	25	0	0	32	7	21.9	37	13	35.1	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.244318182	1.244318182	1	1.81865285	1.81865285	1	0.833333333	0.833333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.36E-10	1	3.89E-21	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	82052341	C	T	LPHN2	ENST00000370728	r.?	-	-	intronic	34	0	0	38	13	34.2	50	16	32	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.943181818	1.943181818	1	1.658031088	1.658031088	1	0.925925926	0.925925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.88E-21	1	6.4E-25	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	86430920	G	T	COL24A1	CCDS41353.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	38	6	15.8	34	5	14.7	53	3	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.897727273	0.897727273	1	0.761658031	0.761658031	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.76E-08	1	0.000000771	1	0.002429596	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	88110352	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	32	10	31.2	28	3	10.7	42	5	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.772727273	1.772727273	1	0.554404145	0.554404145	1	2.203703704	2.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.7E-16	1	0.000372895	1	0.00000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	88401607	C	T	-	-	-	-	-	-	8	0	0	11	1	9.1	12	5	41.7	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.517045455	0.517045455	1	2.160621762	2.160621762	1	1.425925926	1.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.05364542	1	2.4E-09	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	89011763	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	37	8	21.6	52	9	17.3	48	4	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.227272727	1.227272727	1	0.896373057	0.896373057	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.33E-11	1	5.92E-12	1	0.000102016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	89305590	C	T	PKN2	CCDS714.1	r.?	-	-	downstream	17	0	0	33	7	21.2	25	4	16	24	1	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.204545455	1.204545455	1	0.829015544	0.829015544	1	0.777777778	0.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.98E-10	1	0.00000727	1	0.113346489	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	89833781	T	A	GBP6	CCDS723.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	36	8	22.2	45	10	22.2	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	1.150259067	1.150259067	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-11	1	2.66E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	90113111	T	A	LRRC8C	CCDS725.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	29	6	20.7	36	7	19.4	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.176136364	1.176136364	1	1.005181347	1.005181347	1	1.148148148	1.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.72E-09	1	5.74E-10	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	91238511	T	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	29	2	6.9	28	6	21.4	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.392045455	0.392045455	1	1.10880829	1.10880829	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.009279585	1	5.36E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	93731814	C	T	CCDC18	CCDS41356.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	37	2	5.4	47	11	23.4	31	7	22.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.306818182	0.306818182	1	1.212435233	1.212435233	1	4.185185185	4.185185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.014826063	1	7.21E-16	1	1.85E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	94609936	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	45	9	20	34	9	26.5	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	1.373056995	1.373056995	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-12	1	9.15E-14	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	97827745	G	A	DPYD	CCDS30777.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	46	8	17.4	48	8	16.7	55	4	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.988636364	0.988636364	1	0.865284974	0.865284974	1	1.351851852	1.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-11	1	1.23E-10	1	0.000173903	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	99084482	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	35	6	17.1	52	12	23.1	53	5	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.971590909	0.971590909	1	1.196891192	1.196891192	1	1.740740741	1.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-08	1	4.19E-17	1	0.00000734	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	103295219	A	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	35	4	11.4	41	3	7.3	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.647727273	0.647727273	1	0.378238342	0.378238342	1	1.611111111	1.611111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000289	1	0.001155993	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	103308555	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	39	7	17.9	32	7	21.9	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.017045455	1.017045455	1	1.134715026	1.134715026	1	1.425925926	1.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-09	1	2.36E-10	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	104126483	T	G	AMY2B	CCDS782.1	r.?	-	-	downstream	59	0	0	85	7	8.2	88	9	10.2	118	3	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.465909091	0.465909091	1	0.528497409	0.528497409	1	0.462962963	0.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.000000274	1	7.82E-10	1	0.021797997	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	104424462	T	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	39	8	20.5	41	9	22	35	4	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.164772727	1.164772727	1	1.139896373	1.139896373	1	2.111111111	2.111111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.09E-11	1	5.92E-13	1	0.0000289	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	104778111	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	40	10	25	41	6	14.6	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	0.756476684	0.756476684	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.22E-15	1	6.05E-08	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	104916666	A	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	40	3	7.5	28	5	17.9	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.426136364	0.426136364	1	0.92746114	0.92746114	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001075403	1	0.000000279	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	105204728	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	32	3	9.4	48	9	18.8	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.534090909	0.534090909	1	0.974093264	0.974093264	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000556213	1	2.75E-12	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	111624020	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	53	11	20.8	42	6	14.3	30	1	3.3	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.181818182	1.181818182	1	0.740932642	0.740932642	1	0.611111111	0.611111111	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.07E-15	1	7.02E-08	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	111624021	T	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	55	12	21.8	44	6	13.6	30	1	3.3	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.238636364	1.238636364	1	0.704663212	0.704663212	1	0.611111111	0.611111111	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.78E-17	1	9.37E-08	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	112697429	T	A	-	-	-	-	-	-	17	0	0	13	5	38.5	17	8	47.1	10	2	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.1875	2.1875	1	2.440414508	2.440414508	1	3.703703704	3.703703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.89E-09	1	9.12E-15	1	0.001095391	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	113968563	G	T	MAGI3	CCDS860.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	51	11	21.6	32	7	21.9	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.227272727	1.227272727	1	1.134715026	1.134715026	1	1.185185185	1.185185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.94E-15	1	2.36E-10	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	114619500	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	40	7	17.5	36	6	16.7	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.994318182	0.994318182	1	0.865284974	0.865284974	1	0.87037037	0.87037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-09	1	2.68E-08	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	115975703	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	32	7	21.9	29	6	20.7	35	3	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.244318182	1.244318182	1	1.07253886	1.07253886	1	1.592592593	1.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.36E-10	1	6.72E-09	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	116091188	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	46	8	17.4	38	10	26.3	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.988636364	0.988636364	1	1.362694301	1.362694301	1	0.833333333	0.833333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-11	1	4.06E-15	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	117197595	T	C	IGSF3	CCDS30813.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	51	4	7.8	40	4	10	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.443181818	0.443181818	1	0.518134715	0.518134715	1	1.425925926	1.425925926	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000129466	1	0.0000495	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	117820516	C	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	51	12	23.5	53	8	15.1	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.335227273	1.335227273	1	0.78238342	0.78238342	1	0.833333333	0.833333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.24E-17	1	2.83E-10	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	118701666	G	A	SPAG17	CCDS899.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	25	5	20	37	3	8.1	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	0.419689119	0.419689119	1	1.648148148	1.648148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000153	1	0.000855237	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	119132004	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	32	13	40.6	48	10	20.8	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.306818182	2.306818182	1	1.077720207	1.077720207	1	1.296296296	1.296296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.88E-22	1	5.37E-14	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	120288741	C	A	HMGCS2	CCDS905.1	r.?	-	-	downstream	31	0	0	26	5	19.2	36	5	13.9	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.753990344	2.607681214	2	1	1	1	1	1	1	0.246009656	0.392318786	1	2	2	NA	1	1	NA	0.753990344	0.607681214	NA	1.235675237	1.235675237	1	0.804674943	0.804674943	1	0.833333333	0.833333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000188	1	0.00000104	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	120859103	G	A	FAM72B	CCDS41374.1	r.?	-	-	downstream	29	0	0	22	6	27.3	35	8	22.9	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2.753990344	2.607681214	2	1	1	1	1	1	1	0.246009656	0.392318786	1	2	2	NA	1	1	NA	0.753990344	0.607681214	NA	1.756975728	1.756975728	1	1.325687495	1.325687495	1	0.555555556	0.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	1.09E-09	1	8.15E-12	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	143118565	G	T	-	-	-	-	-	-	20	0	0	46	15	32.6	36	12	33.3	43	9	20.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.753990344	2.607681214	2	1	1	1	1	1	1	0.246009656	0.392318786	1	2	2	NA	1	1	NA	0.753990344	0.607681214	NA	2.098073579	1.196171682	1.753990344	1.927746445	1.19908501	1.607681214	3.87037037	3.87037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.35E-23	1	2.73E-19	1	9.45E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	143221853	A	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	40	13	32.5	30	7	23.3	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.753990344	2.607681214	2	1	1	1	1	1	1	0.246009656	0.392318786	1	2	2	NA	1	1	NA	0.753990344	0.607681214	NA	2.091637771	1.192502443	1.753990344	1.348843609	1.348843609	1	0.888888889	0.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.3E-20	1	1.44E-10	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	143281294	G	C	-	-	-	-	-	-	15	0	0	28	9	32.1	26	9	34.6	31	4	12.9	138	0	0	128	49	38.3	148	58	39.2	104	10	9.6	TRUE	TRUE	2.753990344	2.607681214	2	1	1	1	1	1	1	0.246009656	0.392318786	1	2	2	NA	1	1	NA	0.753990344	0.607681214	NA	2.065894537	1.17782549	1.753990344	2.003003814	1.245896137	1.607681214	2.388888889	2.388888889	1	2.464914665	1.405318264	1.753990344	2.269299119	1.411535508	1.607681214	1.777777778	1.777777778	1	5	5	1	1	1.24E-14	8.54E-78	5.65E-15	1.63E-92	0.0000177	1.66E-10	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	1	143480983	T	C	-	-	-	-	-	-	77	0	0	54	1	1.9	73	6	8.2	80	3	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.753990344	2.607681214	2	1	1	1	1	1	1	0.246009656	0.392318786	1	2	2	NA	1	1	NA	0.753990344	0.607681214	NA	0.122280362	0.122280362	1	0.474700326	0.781166696	0.607681214	0.703703704	0.703703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.237137336	1	0.000002	1	0.007711832	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	144190015	G	C	AL592284.1	CCDS3072.1	r.?	-	-	intronic	5	0	0	16	0	0	31	1	3.2	22	4	18.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.753990344	2.607681214	2	1	1	1	1	1	1	0.246009656	0.392318786	1	2	2	NA	1	1	NA	0.753990344	0.607681214	NA	0	0	1	0.185248908	0.185248908	1	3.37037037	3.37037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.143917729	1	0.00000425	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	144959377	T	G	PDE4DIP	CCDS30824.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	37	9	24.3	31	7	22.6	20	4	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.753990344	2.607681214	2	1	1	1	1	1	1	0.246009656	0.392318786	1	2	2	NA	1	1	NA	0.753990344	0.607681214	NA	1.563901472	1.563901472	1	1.30832041	1.30832041	1	3.703703704	3.703703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.14E-13	1	1.85E-10	1	0.00000284	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	146674834	A	G	FMO5	CCDS926.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	53	3	5.7	51	8	15.7	44	1	2.3	65	0	0	230	20	8.7	260	44	16.9	218	15	6.9	TRUE	TRUE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.45381629	0.45381629	1	1.127471503	1.127471503	1	0.471925926	0.471925926	1	0.692666969	0.692666969	1	1.213647668	1.213647668	1	1.415777778	1.415777778	1	5	5	1	1	0.002429596	1.06E-18	2.05E-10	2.84E-52	0.197923942	6.57E-13	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	1	146880429	A	G	-	-	-	-	-	-	29	0	0	68	12	17.6	38	5	13.2	28	1	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.401257316	1.401257316	1	0.947937824	0.947937824	1	0.738666667	0.738666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.37E-15	1	0.00000137	1	0.130947004	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	147017855	C	A	BCL9	CCDS30833.1	r.?	-	-	intronic	11	0	0	33	1	3	45	5	11.1	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.238850679	0.238850679	1	0.797129534	0.797129534	1	0.554	0.554	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.15245715	1	0.00000323	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	147294612	G	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	44	7	15.9	48	7	14.6	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.265908598	1.265908598	1	1.048476684	1.048476684	1	1.744074074	1.744074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	4.81E-09	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	148836675	G	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	66	5	7.6	96	3	3.1	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.605088387	0.605088387	1	0.222621762	0.222621762	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.0000217	1	0.012645497	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	149173737	G	A	-	-	-	-	-	-	16	0	0	53	18	34	55	24	43.6	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	2.706974361	0.902324787	3	3.131067358	1.043689119	3	1.867185185	1.867185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.09E-28	1	1.28E-40	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	149233453	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	73	5	6.8	56	6	10.7	77	4	5.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.541394872	0.541394872	1	0.768404145	0.768404145	1	1.066962963	1.066962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000354	1	0.000000409	1	0.000632383	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	149344237	C	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	77	12	15.6	63	18	28.6	60	1	1.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.24202353	1.24202353	1	2.053865285	1.026932642	2	0.348814815	0.348814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.64E-15	1	7.98E-27	1	0.259739042	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	150620171	A	G	GOLPH3L	CCDS966.1	r.1529u>c	c.?	p.?	3'UTR variant	30	0	0	37	5	13.5	50	6	12	35	4	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.074828055	1.074828055	1	0.861761658	0.861761658	1	2.339111111	2.339111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000119	1	0.000000206	1	0.0000289	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	151702710	G	A	C1orf230	ENST00000326413	r.?	-	-	downstream	27	0	0	54	22	40.7	66	24	36.4	46	8	17.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.240407544	0.987967951	3.279871115	2.614010363	0.871336788	3	3.570222222	1.190074074	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.6E-36	1	3.04E-38	1	8.61E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	152154097	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	46	4	8.7	37	2	5.4	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.692666969	0.692666969	1	0.387792746	0.387792746	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.0000862	1	0.014826063	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	152488894	C	A	LCE5A	CCDS1011.1	r.?	-	-	downstream	23	0	0	51	3	5.9	52	5	9.6	58	6	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.469739669	0.469739669	1	0.689409326	0.689409326	1	2.113407407	2.113407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.002175924	1	0.00000668	1	0.000000506	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	152618093	C	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	60	0	0	70	6	8.6	53	5	9.4	168	0	0	324	7	2.2	284	28	9.9	227	18	7.9	TRUE	TRUE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0	0	1	0.617595855	0.617595855	1	1.928740741	1.928740741	1	0.175157165	0.625849383	0.279871115	0.710953368	0.710953368	1	1.620962963	0.810481481	2	3	4	1	1	1	0.001378573	0.00000156	4.41E-27	0.00000734	2.84E-16	YES	0_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	1	152923970	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	54	6	11.1	41	1	2.4	41	0	0	84	0	0	226	6	2.7	237	4	1.7	166	0	0	TRUE	TRUE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.883747512	0.883747512	1	0.172352332	0.172352332	1	0	0	1	0.214965611	0.768087879	0.279871115	0.122082902	0.122082902	1	0	0	1	4	3	1	1	0.000000329	0.001061697	0.18577148	0.032096889	1	1	YES	1_1	0_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	1	153202834	A	G	-	-	-	-	-	-	27	0	0	51	7	13.7	50	9	18	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.090751434	1.090751434	1	1.292642487	1.292642487	1	1.333703704	1.333703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.46E-09	1	4.07E-12	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	154337465	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	48	2	4.2	38	7	18.4	23	0	0	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.33439095	0.33439095	1	1.321367876	1.321367876	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.024220359	1	8.61E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	154581337	T	A	ADAR	CCDS1071.1	r.?	-	-	upstream	8	0	0	16	8	50	15	7	46.7	20	5	25	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.980844648	1.213719841	3.279871115	3.353689119	1.117896373	3	5.12962963	1.709876543	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-15	1	4.85E-13	1	4.55E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	154973573	G	A	ZBTB7B	CCDS1081.1	r.?	-	-	upstream	8	0	0	17	10	58.8	12	8	66.7	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	4.681473306	1.427334533	3.279871115	4.789958549	1.59665285	3	1.149037037	1.149037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.84E-19	1	1.9E-16	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	155971260	G	C	-	-	-	-	-	-	16	0	0	45	16	35.6	49	21	42.9	21	4	19	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	2.83436139	0.94478713	3	3.080797927	1.026932642	3	3.898518519	1.299506173	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-26	1	1.63E-35	1	0.00000349	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	156231327	A	C	SMG5	CCDS1137.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	31	6	19.4	39	7	17.9	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.544567724	1.544567724	1	1.28546114	1.28546114	1	1.169555556	1.169555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.03E-08	1	1.04E-09	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	156370639	G	A	C1orf61	CCDS1142.1	r.?	-	-	downstream	10	0	0	7	3	42.9	10	4	40	39	5	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.415564708	1.041371624	3.279871115	2.87253886	0.957512953	3	2.62637037	0.87545679	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000431	1	0.000000128	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	157930450	G	C	-	-	-	-	-	-	20	0	0	48	21	43.8	56	20	35.7	45	9	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.487219912	1.063218581	3.279871115	2.563740933	0.854580311	3	4.103703704	1.367901235	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.35E-36	1	6.31E-32	1	1.47E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	158269632	T	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	59	26	44.1	74	28	37.8	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.51110498	1.0705009	3.279871115	2.714549223	0.904849741	3	1.497851852	1.497851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.03E-44	1	5.88E-45	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	158279124	A	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	55	2	3.6	34	4	11.8	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.286620815	1.024117172	0.279871115	0.847398964	0.847398964	1	1.867185185	1.867185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.031164417	1	0.0000257	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	158562334	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	53	8	15.1	61	3	4.9	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.202215084	1.202215084	1	0.35188601	0.35188601	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	2.83E-10	1	0.003623631	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	158671092	C	A	OR6K2	CCDS30902.1	r.?	-	-	upstream	34	0	0	73	6	8.2	61	11	18	49	3	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.652858522	0.652858522	1	1.292642487	1.292642487	1	1.25162963	1.25162963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000002	1	1.62E-14	1	0.001939399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	158808991	T	A	MNDA	CCDS1177.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	55	2	3.6	52	8	15.4	50	3	6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.286620815	1.024117172	0.279871115	1.105927461	1.105927461	1	1.231111111	1.231111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.031164417	1	2.42E-10	1	0.002055544	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	158811160	T	C	MNDA	CCDS1177.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	45	7	15.6	42	7	16.7	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.24202353	1.24202353	1	1.199284974	1.199284974	1	1.436296296	1.436296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000003	1	1.81E-09	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	158817751	A	C	MNDA	CCDS1177.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	48	4	8.3	50	7	14	60	2	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.660820212	0.660820212	1	1.005388601	1.005388601	1	0.677111111	0.677111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000102016	1	6.46E-09	1	0.036544784	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	160353465	G	A	-	-	-	-	-	-	11	0	0	14	6	42.9	13	5	38.5	35	7	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.415564708	1.041371624	3.279871115	2.764818653	0.921606218	3	4.103703704	1.367901235	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.53E-11	1	3.89E-09	1	4.65E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	160649631	C	T	CD48	CCDS1208.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	48	16	33.3	64	13	20.3	50	4	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	2.651242536	0.883747512	3	1.457813472	1.457813472	1	1.641481481	1.641481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.96E-25	1	1.26E-17	1	0.000119787	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	162914909	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	39	3	7.7	48	5	10.4	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.613050076	0.613050076	1	0.746860104	0.746860104	1	0.533481481	0.533481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000998458	1	0.00000447	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	162960048	A	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	45	7	15.6	66	13	19.7	58	2	3.4	108	0	0	381	29	7.6	280	32	11.4	275	16	5.8	TRUE	TRUE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.24202353	1.24202353	1	1.414725389	1.414725389	1	0.69762963	0.69762963	1	0.605088387	0.605088387	1	0.818673575	0.818673575	1	1.190074074	1.190074074	1	5	4	1	1	0.000000003	9.03E-25	1.95E-17	8.57E-33	0.034352256	1.48E-12	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	1	163256148	A	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	62	5	8.1	52	1	1.9	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.644896833	0.644896833	1	0.136445596	0.136445596	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000016	1	0.229451111	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	163621081	A	G	-	-	-	-	-	-	27	0	0	44	2	4.5	58	7	12.1	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.358276018	0.358276018	1	0.868943005	0.868943005	1	0.533481481	0.533481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.020580492	1	1.88E-08	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	163936846	G	A	-	-	-	-	-	-	17	0	0	58	13	22.4	45	5	11.1	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.783418402	0.891709201	2	0.797129534	0.797129534	1	0.861777778	0.861777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.12E-18	1	0.00000323	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	164269627	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	45	0	0	58	0	0	61	8	13.1	89	0	0	306	0	0	265	0	0	316	8	2.5	TRUE	TRUE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.687925926	0.895975309	3	0	0	1	0	0	1	0.512962963	0.512962963	1	3	2	1	1	1	1	1	1	9.09E-10	0.000226271	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	1	164773949	C	A	PBX1	CCDS1246.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	59	5	8.5	69	8	11.6	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.67674359	0.67674359	1	0.833036269	0.833036269	1	1.436296296	1.436296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000125	1	2.49E-09	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	164843089	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	65	6	9.2	45	0	0	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.732475415	0.732475415	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000001	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	164945324	T	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	43	6	14	55	6	10.9	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.114636502	1.114636502	1	0.782766839	0.782766839	1	0.923333333	0.923333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.13E-08	1	0.000000367	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	165249795	G	A	LMX1A	CCDS1247.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	70	8	11.4	49	1	2	49	3	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.90763258	0.90763258	1	0.143626943	0.143626943	1	1.25162963	1.25162963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.8E-09	1	0.217776325	1	0.001939399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	165635410	T	C	ALDH9A1	CCDS1250.2	r.?	-	-	intronic	24	0	0	39	9	23.1	49	8	16.3	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.839150228	0.919575114	2	1.170559585	1.170559585	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.62E-13	1	1.47E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	166023867	G	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	58	8	13.8	44	7	15.9	32	2	6.2	73	0	0	278	47	16.9	264	21	8	262	12	4.6	TRUE	TRUE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.098713123	1.098713123	1	1.141834197	1.141834197	1	1.272148148	1.272148148	1	1.345525491	1.051297647	1.279871115	0.574507772	0.574507772	1	0.943851852	0.943851852	1	5	4	1	1	5.99E-10	1.06E-55	2.55E-09	9.22E-19	0.011224977	0.000000013	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	1	166372600	A	G	-	-	-	-	-	-	26	0	0	71	8	11.3	44	9	20.5	51	4	7.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.899670891	0.899670891	1	1.472176166	1.472176166	1	1.600444444	1.600444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.14E-09	1	1.18E-12	1	0.000129466	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	166480895	T	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	65	12	18.5	47	16	34	43	9	20.9	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.47291252	1.47291252	1	2.441658031	0.81388601	3	4.28837037	1.42945679	3	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.7E-16	1	1.98E-25	1	9.45E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	166503860	A	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	66	7	10.6	65	8	12.3	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.843939065	0.843939065	1	0.883305699	0.883305699	1	0.492444444	0.492444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000047	1	1.53E-09	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	166692026	T	C	-	-	-	-	-	-	27	0	0	55	8	14.5	45	7	15.6	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.154444948	1.154444948	1	1.120290155	1.120290155	1	1.620962963	1.620962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.86E-10	1	0.000000003	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	167805991	C	T	ADCY10	CCDS1265.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	42	5	11.9	31	4	12.9	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.947441026	0.947441026	1	0.926393782	0.926393782	1	0.656592593	0.656592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000228	1	0.0000177	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	168069076	G	T	GPR161	CCDS1268.1	r.?	-	-	intronic	17	0	0	30	2	6.7	21	0	0	27	5	18.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.533433183	0.533433183	1	0	0	1	3.795925926	1.265308642	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.009909649	1	1	1	0.00000023	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	168616366	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	56	8	14.3	48	5	10.4	60	2	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.138521569	1.138521569	1	0.746860104	0.746860104	1	0.677111111	0.677111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.48E-10	1	0.00000447	1	0.036544784	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	169541605	A	T	F5	CCDS1281.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	58	22	37.9	56	14	25	53	8	15.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.017480243	1.005826748	3	1.795336788	0.897668394	2	3.098296296	1.032765432	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.13E-35	1	2.91E-20	1	2.83E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	170046100	G	A	KIFAP3	CCDS1288.1	r.?	-	-	upstream	30	0	0	48	21	43.8	44	17	38.6	46	8	17.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.487219912	1.063218581	3.279871115	2.772	0.924	3	3.570222222	1.190074074	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.35E-36	1	4.61E-28	1	8.61E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	170335105	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	34	4	11.8	44	7	15.9	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.939479337	0.939479337	1	1.141834197	1.141834197	1	0.533481481	0.533481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000257	1	2.55E-09	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	170431276	C	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	54	17	31.5	41	17	41.5	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	2.507932128	1.100032415	2.279871115	2.980259067	0.993419689	3	1.867185185	1.867185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.02E-26	1	1.03E-28	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	170568440	C	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	54	6	11.1	50	10	20	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.883747512	0.883747512	1	1.43626943	1.43626943	1	0.533481481	0.533481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000329	1	8.36E-14	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	170905484	G	C	C1orf129	CCDS41436.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	32	3	9.4	47	9	19.1	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.748398794	0.748398794	1	1.371637306	1.371637306	1	0.451407407	0.451407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000556213	1	2.24E-12	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	171409810	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	39	5	12.8	42	11	26.2	30	2	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.01909623	1.01909623	1	1.881512953	0.940756477	2	1.374740741	1.374740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000156	1	1.81E-16	1	0.009909649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	172128886	C	T	DNM3	CCDS44276.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	63	33	52.4	56	23	41.1	48	3	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	4.171925191	1.271978393	3.279871115	2.951533679	0.98384456	3	1.272148148	1.272148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.66E-59	1	3.22E-38	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	173088556	C	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	57	18	31.6	60	17	28.3	40	4	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	2.515893818	1.103524581	2.279871115	2.032321244	1.016160622	2	2.051851852	2.051851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.84E-28	1	2.41E-25	1	0.0000495	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	174714271	C	A	RABGAP1L	CCDS1314.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	46	5	10.9	42	5	11.9	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.867824133	0.867824133	1	0.854580311	0.854580311	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000361	1	0.00000228	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	175378676	G	A	TNR	CCDS1318.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	63	22	34.9	51	20	39.2	45	9	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	2.778629565	0.926209855	3	2.815088083	0.938362694	3	4.103703704	1.367901235	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.03E-34	1	6.38E-33	1	1.47E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	176210647	T	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	45	0	0	62	7	11.3	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0	0	1	0.811492228	0.811492228	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.02E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	176603885	C	A	PAPPA2	CCDS41438.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	43	10	23.3	44	6	13.6	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.855073606	0.927536803	2	0.976663212	0.976663212	1	1.272148148	1.272148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.61E-14	1	9.37E-08	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	177017905	A	T	ASTN1	CCDS1319.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	52	7	13.5	51	7	13.7	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.074828055	1.074828055	1	0.98384456	0.98384456	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.58E-09	1	7.46E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	177381329	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	55	6	10.9	66	10	15.2	68	7	10.3	117	0	0	286	42	14.7	218	36	16.5	221	5	2.3	TRUE	TRUE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.867824133	0.867824133	1	1.091564767	1.091564767	1	2.113407407	1.056703704	2	1.170368327	1.170368327	1	1.18492228	1.18492228	1	0.471925926	0.471925926	1	5	5	1	1	0.000000367	3.03E-47	1.6E-12	1.15E-42	0.000000058	0.005389125	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	1	178361451	G	C	RASAL2	CCDS1322.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	49	6	12.2	42	7	16.7	29	2	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.971326094	0.971326094	1	1.199284974	1.199284974	1	1.415777778	1.415777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000182	1	1.81E-09	1	0.009279585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	180585125	T	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	59	27	45.8	50	19	38	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.646453698	1.111767374	3.279871115	2.728911917	0.909637306	3	2.010814815	2.010814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.09E-46	1	5E-31	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	180627677	G	A	XPR1	CCDS1340.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	34	11	32.4	37	12	32.4	39	11	28.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	2.579587332	1.131461913	2.279871115	2.326756477	1.163378238	2	5.786222222	1.928740741	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-17	1	4.03E-19	1	7.2E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	181257518	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	60	6	10	38	5	13.2	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.79616893	0.79616893	1	0.947937824	0.947937824	1	1.436296296	1.436296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000621	1	0.00000137	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	181443887	A	G	CACNA1E	ENST00000367573	r.?	-	-	intronic	32	0	0	40	16	40	50	20	40	45	6	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.184675719	0.970975873	3.279871115	2.87253886	0.957512953	3	2.728962963	0.909654321	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.56E-27	1	3.9E-33	1	0.000000108	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	182183228	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	50	3	6	42	8	19	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.477701358	0.477701358	1	1.364455959	1.364455959	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.002055544	1	3.96E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	182270532	G	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	44	8	18.2	48	5	10.4	30	2	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.449027452	1.449027452	1	0.746860104	0.746860104	1	1.374740741	1.374740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.9E-11	1	0.00000447	1	0.009909649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	182428731	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	54	6	11.1	62	6	9.7	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.883747512	0.883747512	1	0.696590674	0.696590674	1	1.046444444	1.046444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000329	1	0.000000756	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	182638158	C	T	RGS8	CCDS41443.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	42	17	40.5	33	10	30.3	49	4	8.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.224484165	0.983113071	3.279871115	2.175948187	1.087974093	2	1.682518519	1.682518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.73E-28	1	8.14E-16	1	0.000110643	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	182826618	A	G	DHX9	CCDS41444.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	46	4	8.7	54	5	9.3	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.692666969	0.692666969	1	0.667865285	0.667865285	1	1.149037037	1.149037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000862	1	0.00000806	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	183943014	T	G	GLT25D2	CCDS1360.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	50	21	42	45	16	35.6	47	8	17	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.343909505	1.019524667	3.279871115	2.556559585	0.852186528	3	3.488148148	1.162716049	3	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.79E-35	1	8.61E-26	1	1.03E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	184008503	C	A	GLT25D2	CCDS1360.1	r.?	-	-	upstream	25	0	0	55	0	0	51	8	15.7	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0	0	1	1.127471503	1.127471503	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.05E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	185066950	A	T	RNF2	CCDS1365.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	56	5	8.9	55	9	16.4	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.708590347	0.708590347	1	1.177740933	1.177740933	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000965	1	1.01E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	185387802	G	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	34	1	2.9	41	7	17.1	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.23088899	0.23088899	1	1.228010363	1.228010363	1	0.492444444	0.492444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.156694864	1	1.51E-09	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	185603750	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	71	6	8.5	63	13	20.6	50	1	2	124	0	0	354	46	13	305	48	15.7	297	16	5.4	TRUE	TRUE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.67674359	0.67674359	1	1.479357513	1.479357513	1	0.41037037	0.41037037	1	1.035019609	1.035019609	1	1.127471503	1.127471503	1	1.108	1.108	1	5	5	1	1	0.00000169	4.81E-49	1.01E-17	2.87E-55	0.221687443	4.72E-12	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	1	185611594	A	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	46	5	10.9	49	2	4.1	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.867824133	0.867824133	1	0.294435233	0.294435233	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000361	1	0.025168485	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	186763210	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	60	8	13.3	56	6	10.7	53	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.058904676	1.058904676	1	0.768404145	0.768404145	1	0.779703704	0.779703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.93E-10	1	0.000000409	1	0.029108399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	187104181	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	66	31	47	50	26	52	45	7	15.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.741993969	1.140896651	3.279871115	3.734300518	1.244766839	3	3.200888889	1.066962963	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.52E-53	1	1.61E-46	1	0.000000003	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	187612258	T	C	-	-	-	-	-	-	28	0	0	58	27	46.6	48	17	35.4	51	10	19.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.710147212	1.131186892	3.279871115	2.542196891	0.847398964	3	4.02162963	1.34054321	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.68E-46	1	2.8E-27	1	1.04E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	187840215	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	72	10	13.9	57	4	7	50	2	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.106674812	1.106674812	1	0.502694301	0.502694301	1	0.820740741	0.820740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.95E-12	1	0.000199821	1	0.026131524	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	187889115	A	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	57	7	12.3	52	9	17.3	62	3	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.979287783	0.979287783	1	1.242373057	1.242373057	1	0.984888889	0.984888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.66E-08	1	5.92E-12	1	0.003793816	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	189957565	T	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	61	13	21.3	56	7	12.5	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.69583982	0.84791991	2	0.897668394	0.897668394	1	1.313185185	1.313185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.41E-18	1	1.46E-08	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	190142621	G	A	FAM5C	CCDS1373.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	58	25	43.1	52	19	36.5	42	7	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.431488087	1.046226503	3.279871115	2.62119171	0.87373057	3	3.426592593	1.142197531	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.44E-42	1	1.24E-30	1	1.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	190816863	T	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	66	8	12.1	63	8	12.7	52	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.963364405	0.963364405	1	0.912031088	0.912031088	1	0.779703704	0.779703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.73E-09	1	1.18E-09	1	0.028101652	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	191252271	C	T	-	-	-	-	-	-	11	0	0	29	4	13.8	25	4	16	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.098713123	1.098713123	1	1.149015544	1.149015544	1	1.108	1.108	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000134	1	0.00000727	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	191499180	C	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	62	25	40.3	65	28	43.1	55	8	14.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.208560787	0.978258192	3.279871115	3.095160622	1.031720207	3	2.975185185	0.991728395	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.68E-41	1	6.12E-47	1	3.86E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	191749991	T	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	46	0	0	47	1	2.1	42	7	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0	0	1	0.15080829	0.15080829	1	3.426592593	1.142197531	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.209895027	1	1.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	193170114	G	A	CDC73	CCDS1382.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	48	6	12.5	44	4	9.1	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.995211162	0.995211162	1	0.653502591	0.653502591	1	1.087481481	1.087481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000016	1	0.0000723	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	193178705	G	A	CDC73	CCDS1382.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	48	8	16.7	65	11	16.9	51	2	3.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.329602113	1.329602113	1	1.213647668	1.213647668	1	0.800222222	0.800222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.23E-10	1	3.41E-14	1	0.027109304	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	193198769	A	T	CDC73	CCDS1382.1	r.?	-	-	intronic	49	0	0	54	15	27.8	65	19	29.2	60	8	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	2.213349624	0.970822258	2.279871115	2.096953368	1.048476684	2	2.728962963	0.909654321	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.2E-22	1	1.89E-28	1	7.93E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	193340218	G	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	51	7	13.7	59	8	13.6	55	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.090751434	1.090751434	1	0.976663212	0.976663212	1	0.369333333	0.369333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.46E-09	1	6.9E-10	1	0.240951649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	193498358	G	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	49	7	14.3	51	6	11.8	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.138521569	1.138521569	1	0.847398964	0.847398964	1	0.492444444	0.492444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.58E-09	1	0.000000232	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	193609763	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	68	2	2.9	61	12	19.7	42	6	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.23088899	0.824983277	0.279871115	1.414725389	1.414725389	1	2.934148148	0.978049383	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.045825786	1	3.39E-16	1	7.02E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	193773070	A	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	61	2	3.3	61	3	4.9	50	6	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.262735747	0.938774074	0.279871115	0.35188601	0.35188601	1	2.462222222	0.820740741	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.037660755	1	0.003623631	1	0.000000206	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	193841513	G	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	54	8	14.8	51	8	15.7	53	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.178330016	1.178330016	1	1.127471503	1.127471503	1	0.389851852	0.389851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.31E-10	1	2.05E-10	1	0.233303855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	194027887	C	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	46	9	19.6	48	12	25	40	7	17.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.560491102	1.560491102	1	1.795336788	0.897668394	2	3.590740741	1.19691358	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.82E-12	1	1.44E-17	1	1.26E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	194291753	C	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	54	8	14.8	63	3	4.8	44	0	0	31	0	0	279	21	7.5	191	5	2.6	304	0	0	TRUE	TRUE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.178330016	1.178330016	1	0.344704663	0.344704663	1	0	0	1	0.597126697	0.597126697	1	0.186715026	0.186715026	1	0	0	1	4	3	1	1	3.31E-10	2.87E-18	0.003968795	0.002914544	1	1	YES	1_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	1	195262577	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	64	12	18.8	53	9	17	55	3	5.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.496797588	1.496797588	1	1.220829016	1.220829016	1	1.128518519	1.128518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.3E-16	1	7.1E-12	1	0.002700822	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	197277842	A	G	CRB1	CCDS1390.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	54	9	16.7	50	6	12	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.329602113	1.329602113	1	0.861761658	0.861761658	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.48E-12	1	0.000000206	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	197985560	G	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	61	2	3.3	57	12	21.1	54	3	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.262735747	0.938774074	0.279871115	1.515264249	1.515264249	1	1.149037037	1.149037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.037660755	1	1.4E-16	1	0.00256299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	198840772	G	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	52	9	17.3	51	11	21.6	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.377372248	1.377372248	1	1.551170984	1.551170984	1	0.41037037	0.41037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-12	1	1.94E-15	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	199420712	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	46	4	8.7	48	8	16.7	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.692666969	0.692666969	1	1.199284974	1.199284974	1	0.471925926	0.471925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.0000862	1	1.23E-10	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	201857422	G	T	IPO9	CCDS1415.1	r.?	-	-	downstream	16	0	0	19	1	5.3	25	5	20	32	4	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.421969533	0.421969533	1	1.43626943	1.43626943	1	2.564814815	2.564814815	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.090843738	1	0.000000153	1	0.0000201	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	203777330	A	T	ZC3H11A	CCDS30978.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	56	11	19.6	64	9	14.1	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.560491102	1.560491102	1	1.012569948	1.012569948	1	0.923333333	0.923333333	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.91E-15	1	4.2E-11	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	203889138	G	T	-	-	-	-	-	-	15	0	0	16	3	18.8	10	2	20	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.496797588	1.496797588	1	1.43626943	1.43626943	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	0	NA	0	5	NA	1	1	0.0000667	1	0.001095391	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	203920227	A	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	45	22	48.9	39	19	48.7	29	5	17.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.893266066	1.187018005	3.279871115	3.497316062	1.165772021	3	3.529185185	1.176395062	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.79E-39	1	1.2E-33	1	0.000000336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	204008981	C	T	-	-	-	-	-	-	15	0	0	27	7	25.9	31	5	16.1	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	2.062077528	1.031038764	2	1.156196891	1.156196891	1	1.210592593	1.210592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	6.36E-11	1	0.000000476	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	205593705	C	T	ELK4	CCDS1456.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	59	19	32.2	63	21	33.3	38	6	15.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	2.563663954	1.12447758	2.279871115	2.391388601	1.195694301	2	3.241925926	1.080641975	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.2E-29	1	1.08E-32	1	3.76E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	205768032	G	A	SLC41A1	CCDS30988.1	r.?	-	-	intronic	9	0	0	28	10	35.7	21	5	23.8	35	17	48.6	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	2.842323079	0.947441026	3	1.709160622	1.709160622	1	9.972	3.324	3	NA	NA	0	0	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.18E-16	1	5.95E-08	1	3.18E-30	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	206688502	G	A	RASSF5	CCDS30998.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	51	5	9.8	44	1	2.3	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.780245551	0.780245551	1	0.165170984	0.165170984	1	1.313185185	1.313185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000606	1	0.197923942	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	208224467	C	T	PLXNA2	CCDS31013.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	41	5	12.2	30	3	10	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.971326094	0.971326094	1	0.718134715	0.718134715	1	2.010814815	2.010814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00000202	1	0.000458697	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	209709456	A	G	-	-	-	-	-	-	25	0	0	59	9	15.3	51	3	5.9	50	2	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.218138462	1.218138462	1	0.423699482	0.423699482	1	0.820740741	0.820740741	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.96E-11	1	0.002175924	1	0.026131524	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	210409732	T	C	SERTAD4	CCDS1494.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	43	7	16.3	49	6	12.2	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.297755355	1.297755355	1	0.876124352	0.876124352	1	1.169555556	1.169555556	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.15E-09	1	0.000000182	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	211508758	C	A	TRAF5	CCDS1497.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	46	4	8.7	46	15	32.6	30	1	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.692666969	0.692666969	1	2.341119171	1.170559585	2	0.677111111	0.677111111	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.0000862	1	1.35E-23	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	212273355	T	A	DTL	CCDS1502.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	59	22	37.3	54	17	31.5	49	8	16.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	2.969710108	0.989903369	3	2.262124352	1.131062176	2	3.344518519	1.114839506	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.79E-35	1	3.02E-26	1	1.47E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	213130254	A	G	VASH2	CCDS1511.1	r.?	-	-	intronic	20	0	0	60	11	18.3	42	6	14.3	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.456989141	1.456989141	1	1.026932642	1.026932642	1	0.902814815	0.902814815	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.34E-14	1	7.02E-08	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	213292230	G	T	RPS6KC1	CCDS1513.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	41	11	26.8	38	3	7.9	29	3	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	2.133732732	0.935900594	2.279871115	0.567326425	0.567326425	1	2.113407407	2.113407407	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.34E-16	1	0.000925091	1	0.000414371	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	213323433	C	T	RPS6KC1	CCDS1513.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	55	5	9.1	61	11	18	50	3	6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.724513726	0.724513726	1	1.292642487	1.292642487	1	1.231111111	1.231111111	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00000883	1	1.62E-14	1	0.002055544	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	213358371	G	A	RPS6KC1	CCDS1513.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	49	10	20.4	41	3	7.3	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.624184617	1.624184617	1	0.524238342	0.524238342	1	0.574518519	0.574518519	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	6.72E-14	1	0.001155993	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	213642124	T	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	60	5	8.3	40	7	17.5	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.660820212	0.660820212	1	1.256735751	1.256735751	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.0000136	1	1.26E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	214158431	A	T	PROX1	CCDS31021.1	r.?	-	-	upstream	15	0	0	40	13	32.5	22	8	36.4	51	7	13.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	2.587549021	1.134954079	2.279871115	2.614010363	0.871336788	3	2.811037037	0.937012346	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.3E-20	1	1.17E-13	1	7.46E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	214921381	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	45	21	46.7	51	23	45.1	43	5	11.6	93	0	0	331	118	35.6	324	111	34.3	276	22	8	TRUE	TRUE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.718108902	1.133614332	3.279871115	3.238787565	1.079595855	3	2.380148148	1.190074074	2	2.83436139	0.94478713	3	2.463202073	0.821067358	3	1.641481481	0.820740741	2	5	4	1	1	1.6E-36	2.07E-180	2.05E-39	1.72E-167	0.00000257	1.33E-19	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	1	215187398	A	C	KCNK2	CCDS41466.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	55	24	43.6	54	19	35.2	48	7	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.471296533	1.058363701	3.279871115	2.527834197	0.842611399	3	2.995703704	0.998567901	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.28E-40	1	2.97E-30	1	4.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	215220666	G	A	KCNK2	CCDS41466.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	57	7	12.3	64	18	28.1	58	3	5.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.979287783	0.979287783	1	2.017958549	1.008979275	2	1.066962963	1.066962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.66E-08	1	1.1E-26	1	0.003141421	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	216044214	T	G	USH2A	CCDS31025.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	50	5	10	45	0	0	55	0	0	23	0	0	242	13	5.4	141	7	5	245	0	0	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.79616893	0.79616893	1	0	0	1	0	0	1	0.429931222	1.536175758	0.279871115	0.359067358	0.359067358	1	0	NA	0	4	NA	1	1	0.00000549	4.76E-10	1	0.00000823	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	217781515	A	T	GPATCH2	CCDS1518.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	57	7	12.3	60	13	21.7	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.979287783	0.979287783	1	1.558352332	1.558352332	1	0.96437037	0.96437037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.66E-08	1	5.07E-18	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	219033859	C	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	44	7	15.9	53	16	30.2	43	6	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.265908598	1.265908598	1	2.168766839	1.08438342	2	2.872592593	0.957530864	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.55E-09	1	1.9E-24	1	8.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	219154345	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	49	8	16.3	62	10	16.1	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.297755355	1.297755355	1	1.156196891	1.156196891	1	1.80562963	1.80562963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.47E-10	1	8.29E-13	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	219279299	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	57	30	52.6	63	26	41.3	42	8	19	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	4.18784857	1.276833273	3.279871115	2.965896373	0.988632124	3	3.898518519	1.299506173	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.15E-53	1	4.45E-43	1	3.96E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	220472750	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	64	11	17.2	51	6	11.8	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.369410559	1.369410559	1	0.847398964	0.847398964	1	1.313185185	1.313185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.85E-14	1	0.000000232	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	223436984	C	T	SUSD4	CCDS41471.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	33	4	12.1	43	6	14	25	2	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.963364405	0.963364405	1	1.005388601	1.005388601	1	1.641481481	1.641481481	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.0000228	1	8.13E-08	1	0.006948068	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	223966814	C	G	TP53BP2	CCDS1538.1	r.?	-	-	downstream	24	0	0	35	0	0	51	4	7.8	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0	0	1	0.560145078	0.560145078	1	1.620962963	1.620962963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	0.000129466	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	224343557	A	G	FBXO28	CCDS1539.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	59	6	10.2	51	6	11.8	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.812092308	0.812092308	1	0.847398964	0.847398964	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000000561	1	0.000000232	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	224867762	C	T	CNIH3	CCDS1544.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	54	5	9.3	48	6	12.5	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.740437105	0.740437105	1	0.897668394	0.897668394	1	2.236518519	2.236518519	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00000806	1	0.00000016	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	225319247	C	T	DNAH14	CCDS44321.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	57	10	17.5	57	4	7	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.393295627	1.393295627	1	0.502694301	0.502694301	1	1.867185185	1.867185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.4E-13	1	0.000199821	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	225924859	G	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	56	3	5.4	55	7	12.7	31	4	12.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.429931222	0.429931222	1	0.912031088	0.912031088	1	2.646888889	0.882296296	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00284314	1	1.28E-08	1	0.0000177	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	228830109	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	50	6	12	63	9	14.3	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.955402716	0.955402716	1	1.026932642	1.026932642	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000000206	1	3.62E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	229578892	C	T	NUP133	CCDS1579.1	r.?	-	-	intronic	18	0	0	40	7	17.5	47	9	19.1	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.393295627	1.393295627	1	1.371637306	1.371637306	1	1.395259259	1.395259259	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.26E-09	1	2.24E-12	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	230677028	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	45	10	22.2	57	20	35.1	40	6	15	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.767495024	0.883747512	2	2.52065285	0.840217617	3	3.077777778	1.025925926	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.66E-14	1	9.67E-32	1	5.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	230747083	G	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	66	5	7.6	65	4	6.2	44	5	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.605088387	0.605088387	1	0.445243523	0.445243523	1	2.339111111	1.169555556	2	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.0000217	1	0.000331785	1	0.00000288	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	233003042	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	56	20	35.7	52	13	25	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	2.842323079	0.947441026	3	1.795336788	0.897668394	2	1.744074074	1.744074074	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	6.31E-32	1	6.47E-19	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	234203974	C	T	SLC35F3	CCDS1600.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	57	0	0	57	5	8.8	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0	0	1	0.631958549	0.631958549	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	0.0000105	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	234651607	T	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	73	29	39.7	63	30	47.6	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.160790651	0.963693554	3.279871115	3.418321244	1.139440415	3	2.503259259	0.834419753	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.86E-47	1	6.83E-52	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	235095193	C	T	-	-	-	-	-	-	18	0	0	39	21	53.8	34	8	23.5	24	3	12.5	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	4.283388842	1.305962549	3.279871115	1.68761658	1.68761658	1	2.564814815	2.564814815	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.73E-38	1	6.32E-12	1	0.000233853	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	236150963	G	A	NID1	CCDS1608.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	40	9	22.5	47	24	51.1	39	5	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.791380092	0.895690046	2	3.669668394	1.223222798	3	2.62637037	0.87545679	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.64E-13	1	8.6E-43	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	236155881	C	A	NID1	CCDS1608.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	19	8	42.1	19	10	52.6	34	5	14.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.351871194	1.021952106	3.279871115	3.777388601	1.259129534	3	3.016222222	1.005407407	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.81E-14	1	8.66E-19	1	0.000000771	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	237283559	G	A	RYR2	ENST00000366574	r.?	-	-	intronic	29	0	0	43	6	14	53	6	11.3	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.114636502	1.114636502	1	0.811492228	0.811492228	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	8.13E-08	1	0.000000293	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	237443661	A	G	RYR2	ENST00000366574	r.?	-	-	intronic	35	0	0	56	8	14.3	59	7	11.9	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.138521569	1.138521569	1	0.854580311	0.854580311	1	1.497851852	1.497851852	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.48E-10	1	2.12E-08	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	237640552	G	A	RYR2	ENST00000366574	r.?	-	-	intronic	28	0	0	36	7	19.4	47	5	10.6	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.544567724	1.544567724	1	0.761222798	0.761222798	1	0.41037037	0.41037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.74E-10	1	0.00000402	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	238063383	T	A	-	-	-	-	-	-	12	0	0	32	3	9.4	20	3	15	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.748398794	0.748398794	1	1.077202073	1.077202073	1	0.595037037	0.595037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000556213	1	0.0001337	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	238133577	C	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	44	13	29.5	48	13	27.1	42	4	9.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	2.348698343	1.030189087	2.279871115	1.946145078	0.973072539	2	1.949259259	1.949259259	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.49E-20	1	2E-19	1	0.0000601	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	238185085	A	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	53	0	0	52	7	13.5	36	1	2.8	60	0	0	278	8	2.9	329	21	6.4	275	19	6.9	TRUE	TRUE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0	0	1	0.969481865	0.969481865	1	0.574518519	0.574518519	1	0.23088899	0.824983277	0.279871115	0.459606218	0.459606218	1	1.415777778	1.415777778	1	3	4	1	1	1	0.0000947	8.58E-09	8.11E-17	0.165106833	5.47E-16	YES	0_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	1	238373016	T	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	42	15	35.7	49	14	28.6	30	5	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	2.842323079	0.947441026	3	2.053865285	1.026932642	2	3.426592593	1.142197531	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.65E-24	1	3.5E-21	1	0.000000401	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	238990444	A	G	-	-	-	-	-	-	25	0	0	64	12	18.8	56	13	23.2	55	6	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.496797588	1.496797588	1	1.666072539	0.833036269	2	2.236518519	1.118259259	2	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.3E-16	1	1.89E-18	1	0.000000367	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	239109509	C	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	51	12	23.5	55	4	7.3	37	3	8.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.870996985	0.935498492	2	0.524238342	0.524238342	1	1.662	1.662	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.24E-17	1	0.000173903	1	0.000855237	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	239132668	C	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	61	10	16.4	50	7	14	42	0	0	65	0	0	275	40	14.5	265	43	16.2	307	22	7.2	TRUE	TRUE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.305717045	1.305717045	1	1.005388601	1.005388601	1	0	0	1	1.154444948	1.154444948	1	1.163378238	1.163378238	1	1.477333333	0.738666667	2	5	5	1	1	6.98E-13	6.7E-45	6.46E-09	2.73E-50	1	1.31E-18	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	1	239275279	G	T	-	-	-	-	-	-	30	1	3.3	69	31	44.9	51	18	35.3	58	10	17.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.574798494	1.089920417	3.279871115	2.535015544	0.845005181	3	3.529185185	1.176395062	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	0.139615808	1	1.54E-52	1	9.1E-29	1	4.1E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	239412284	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	62	19	30.6	60	19	31.7	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	2.436276925	1.068602917	2.279871115	2.276487047	1.138243523	2	0.41037037	0.41037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	6.66E-29	1	3.21E-29	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	239676526	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	55	0	0	61	4	6.6	49	7	14.3	71	0	0	322	10	3.1	264	29	11	255	16	6.3	TRUE	TRUE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0	0	1	0.473968912	0.473968912	1	2.934148148	0.978049383	3	0.246812368	0.881878676	0.279871115	0.789948187	0.789948187	1	1.292666667	1.292666667	1	3	4	1	1	1	0.00000682	0.000259828	2.3E-29	5.58E-09	4.68E-13	YES	0_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	1	240039576	G	C	CHRM3	CCDS1616.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	50	8	16	43	3	7	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.273870287	1.273870287	1	0.502694301	0.502694301	1	1.210592593	1.210592593	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.74E-10	1	0.001328364	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	240248408	G	C	FMN2	ENST00000447095	r.?	-	-	intronic	23	0	0	57	19	33.3	62	30	48.4	39	7	17.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	2.651242536	0.883747512	3	3.475772021	1.158590674	3	3.672814815	1.224271605	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.01E-29	1	3.6E-52	1	1.04E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	240679020	G	C	GREM2	CCDS31070.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	57	26	45.6	59	26	44.1	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.630530319	1.106912495	3.279871115	3.166974093	1.055658031	3	1.867185185	1.867185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.57E-44	1	5.03E-44	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	240712492	C	T	GREM2	CCDS31070.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	51	6	11.8	54	2	3.7	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.939479337	0.939479337	1	0.265709845	0.265709845	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	4	NA	1	1	0.000000232	1	0.030129377	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	241481890	G	T	RGS7	CCDS31071.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	49	7	14.3	32	3	9.4	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.138521569	1.138521569	1	0.675046632	0.675046632	1	0.636074074	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	5.58E-09	1	0.000556213	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	242305593	C	G	PLD5	CCDS1621.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	45	6	13.3	63	5	7.9	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.058904676	1.058904676	1	0.567326425	0.567326425	1	1.087481481	1.087481481	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000000108	1	0.0000173	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	242852625	G	A	-	-	-	-	-	-	16	0	0	22	7	31.8	21	8	38.1	42	7	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	2.531817196	1.110508914	2.279871115	2.736093264	0.912031088	3	3.426592593	1.142197531	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.25E-11	1	7.5E-14	1	1.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	243007241	A	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	60	9	15	48	11	22.9	28	3	10.7	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.194253395	1.194253395	1	1.644528497	1.644528497	1	2.195481481	2.195481481	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.29E-11	1	9.31E-16	1	0.000372895	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	243049815	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	38	18	47.4	18	8	44.4	37	8	21.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.773840727	1.150606409	3.279871115	3.188518135	1.062839378	3	4.432	1.477333333	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.16E-31	1	1.63E-14	1	1.33E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	246777125	A	C	CNST	CCDS1628.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	21	1	4.8	26	3	11.5	21	1	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.382161086	0.382161086	1	0.825854922	0.825854922	1	0.984888889	0.984888889	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.099912572	1	0.000298167	1	0.099912572	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	247634312	T	C	-	-	-	-	-	-	13	0	0	32	2	6.2	43	4	9.3	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.493624736	0.493624736	1	0.667865285	0.667865285	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.011224977	1	0.000066	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	247634353	A	G	-	-	-	-	-	-	7	0	0	36	0	0	34	4	11.8	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0	0	1	0.847398964	0.847398964	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	0.0000257	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	248392880	G	A	-	-	-	-	-	-	16	0	0	23	5	21.7	23	7	30.4	28	3	10.7	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	1.727686577	1.727686577	1	2.183129534	1.091564767	2	2.195481481	2.195481481	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	9.75E-08	1	1.79E-11	1	0.000372895	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	248493964	T	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	72	5	6.9	68	12	17.6	52	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.549356561	0.549356561	1	1.263917098	1.263917098	1	0.779703704	0.779703704	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.0000331	1	1.37E-15	1	0.028101652	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	248658130	T	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	54	6	11.1	52	4	7.7	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	0.883747512	0.883747512	1	0.552963731	0.552963731	1	0.512962963	0.512962963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000000329	1	0.000139698	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	1	249169425	G	A	-	-	-	-	-	-	13	0	0	22	9	40.9	22	7	31.8	50	10	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.279871115	4	4	3	3	3	1	1	1	0.720128885	1	1	4	NA	NA	1	NA	NA	0.279871115	NA	NA	3.256330922	0.99282283	3.279871115	2.283668394	1.141834197	2	4.103703704	1.367901235	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	0	5	NA	1	1	9.16E-16	1	1.25E-11	1	8.36E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	332755	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	45	10	22.2	49	11	22.4	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	1.160621762	1.160621762	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.66E-14	1	1.19E-15	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	441068	C	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	22	5	22.7	18	3	16.7	51	1	2	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.289772727	1.289772727	1	0.865284974	0.865284974	1	0.37037037	0.37037037	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.67E-08	1	0.0000964	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	1930574	G	C	MYT1L	CCDS46222.1	r.?	-	-	intronic	18	0	0	34	11	32.4	31	4	12.9	37	4	10.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.840909091	1.840909091	1	0.668393782	0.668393782	1	2	2	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-17	1	0.0000177	1	0.0000362	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	2746022	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	33	4	12.1	35	9	25.7	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.6875	0.6875	1	1.331606218	1.331606218	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000228	1	1.23E-13	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	3583998	A	C	-	-	-	-	-	-	9	0	0	8	2	25	7	0	0	18	3	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	0	0	1	3.092592593	3.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000686131	1	1	1	0.0000964	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	4516722	G	A	ENSG00000228584	ENST00000446457	r.?	-	-	intronic	33	0	0	41	7	17.1	33	5	15.2	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.971590909	0.971590909	1	0.787564767	0.787564767	1	0.87037037	0.87037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.51E-09	1	0.00000066	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	6083289	G	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	33	9	27.3	39	6	15.4	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.551136364	1.551136364	1	0.797927461	0.797927461	1	0.462962963	0.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.76E-14	1	4.43E-08	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	6891425	G	C	-	-	-	-	-	-	27	0	0	39	5	12.8	44	0	0	51	0	0	132	0	0	219	18	8.2	226	17	7.5	275	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.727272727	0.727272727	1	0	0	1	0	0	1	0.465909091	0.465909091	1	0.388601036	0.388601036	1	0	0	1	4	3	1	1	0.00000156	1.5E-16	1	4.51E-15	1	1	YES	1_1	0_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	2	9517429	G	A	ASAP2	CCDS1661.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	27	2	7.4	41	10	24.4	23	5	21.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.420454545	0.420454545	1	1.264248705	1.264248705	1	4.018518519	4.018518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00807567	1	9.51E-15	1	9.75E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	10233503	G	A	-	-	-	-	-	-	14	0	0	14	4	28.6	14	3	21.4	25	2	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.625	1.625	1	1.10880829	1.10880829	1	1.481481481	1.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000601	1	0.0000437	1	0.006948068	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	11199809	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	43	8	18.6	34	0	0	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.056818182	1.056818182	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	4.85E-11	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	13164699	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	35	4	11.4	38	5	13.2	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.647727273	0.647727273	1	0.683937824	0.683937824	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000289	1	0.00000137	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	13518110	T	C	-	-	-	-	-	-	36	0	0	32	10	31.2	45	7	15.6	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.772727273	1.772727273	1	0.808290155	0.808290155	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.7E-16	1	0.000000003	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	13522789	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	40	9	22.5	29	5	17.2	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.278409091	1.278409091	1	0.89119171	0.89119171	1	0.87037037	0.87037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.64E-13	1	0.000000336	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	15005553	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	36	5	13.9	43	8	18.6	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.789772727	0.789772727	1	0.96373057	0.96373057	1	0	0	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000104	1	4.85E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	15150234	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	52	8	15.4	31	8	25.8	55	4	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.875	0.875	1	1.336787565	1.336787565	1	1.351851852	1.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.42E-10	1	2.78E-12	1	0.000173903	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	16746845	G	T	FAM49A	CCDS1688.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	38	7	18.4	45	10	22.2	57	2	3.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.045454545	1.045454545	1	1.150259067	1.150259067	1	0.648148148	0.648148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-10	1	2.66E-14	1	0.03327602	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	19647611	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	21	6	28.6	42	11	26.2	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.625	1.625	1	1.357512953	1.357512953	1	0.944444444	0.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.95E-10	1	1.81E-16	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	21206319	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	47	9	19.1	44	10	22.7	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.085227273	1.085227273	1	1.176165803	1.176165803	1	0.574074074	0.574074074	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-12	1	2.08E-14	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	21423576	T	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	46	5	10.9	37	7	18.9	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.619318182	0.619318182	1	0.979274611	0.979274611	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000361	1	7.05E-10	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	21457285	T	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	52	9	17.3	41	6	14.6	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.982954545	0.982954545	1	0.756476684	0.756476684	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-12	1	6.05E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	21538289	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	35	5	14.3	37	11	29.7	50	4	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.538860104	1.538860104	1	1.481481481	1.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000895	1	3.7E-17	1	0.000119787	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	22231152	G	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	37	10	27	41	4	9.8	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.534090909	1.534090909	1	0.507772021	0.507772021	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.01E-15	1	0.0000546	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	22312232	A	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	33	8	24.2	35	8	22.9	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.375	1.375	1	1.186528497	1.186528497	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-12	1	8.15E-12	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	22344748	G	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	36	4	11.1	30	6	20	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.630681818	0.630681818	1	1.03626943	1.03626943	1	0.925925926	0.925925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000324	1	8.37E-09	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	22884426	A	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	28	5	17.9	24	2	8.3	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.017045455	1.017045455	1	0.430051813	0.430051813	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000279	1	0.006413403	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	23509357	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	43	7	16.3	40	11	27.5	52	3	5.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.926136364	0.926136364	1	1.424870466	1.424870466	1	1.074074074	1.074074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.15E-09	1	9.88E-17	1	0.002300591	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	23669955	C	T	KLHL29	ENST00000486442	r.?	-	-	intronic	44	0	0	35	9	25.7	49	10	20.4	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.460227273	1.460227273	1	1.056994819	1.056994819	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.23E-13	1	6.72E-14	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	23747344	C	T	KLHL29	ENST00000486442	r.?	-	-	intronic	9	0	0	10	4	40	11	0	0	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.272727273	2.272727273	1	0	0	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000128	1	1	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	29119494	T	G	WDR43	CCDS46251.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	25	0	0	42	1	2.4	31	4	12.9	64	0	0	186	6	3.2	167	18	10.8	164	18	11	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.124352332	0.124352332	1	2.388888889	2.388888889	1	0.181818182	0.181818182	1	0.559585492	0.559585492	1	2.037037037	2.037037037	1	3	1	1	1	1	0.000384836	0.189842622	1.16E-18	0.0000177	8.34E-19	YES	0_1	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	2	29468069	G	A	ALK	CCDS33172.1	r.?	-	-	intronic	9	0	0	10	0	0	21	4	19	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.984455959	0.984455959	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1	1	0.00000349	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	29468102	G	T	ALK	CCDS33172.1	r.?	-	-	intronic	14	0	0	12	0	0	14	3	21.4	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.10880829	1.10880829	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000437	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	31201144	A	G	GALNT14	CCDS1773.2	r.?	-	-	intronic	24	0	0	23	6	26.1	36	3	8.3	35	3	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.482954545	1.482954545	1	0.430051813	0.430051813	1	1.592592593	1.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-09	1	0.000788827	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	32015041	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	36	9	25	35	4	11.4	35	5	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	0.590673575	0.590673575	1	2.648148148	2.648148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.63E-13	1	0.0000289	1	0.000000895	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	34157281	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	37	9	24.3	30	8	26.7	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.380681818	1.380681818	1	1.383419689	1.383419689	1	1.740740741	1.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.14E-13	1	2.07E-12	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	35743383	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	44	4	9.1	40	8	20	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.517045455	0.517045455	1	1.03626943	1.03626943	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000723	1	2.61E-11	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	36194286	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	43	9	20.9	45	8	17.8	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.1875	1.1875	1	0.922279793	0.922279793	1	1.611111111	1.611111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.45E-13	1	7.14E-11	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	36439787	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	43	15	34.9	32	5	15.6	36	4	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.982954545	1.982954545	1	0.808290155	0.808290155	1	2.055555556	2.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.05E-24	1	0.000000562	1	0.0000324	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	38446255	A	G	-	-	-	-	-	-	19	0	0	33	5	15.2	50	9	18	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.863636364	0.863636364	1	0.932642487	0.932642487	1	1.740740741	1.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000066	1	4.07E-12	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	39149296	T	C	ENSG00000214694	CCDS46263.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	37	3	8.1	32	9	28.1	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.460227273	0.460227273	1	1.455958549	1.455958549	1	1.462962963	1.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000855237	1	4.94E-14	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	39655815	C	T	MAP4K3	CCDS1803.1	r.?	-	-	intronic	6	0	0	19	8	42.1	15	1	6.7	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.392045455	2.392045455	1	0.347150259	0.347150259	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.81E-14	1	0.072431031	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	40788614	G	A	SLC8A1	CCDS46264.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	45	9	20	46	7	15.2	53	5	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	0.787564767	0.787564767	1	1.740740741	1.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-12	1	3.53E-09	1	0.00000734	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	40791794	T	A	SLC8A1	CCDS46264.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	44	10	22.7	52	6	11.5	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.289772727	1.289772727	1	0.595854922	0.595854922	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.08E-14	1	0.000000261	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	41126268	T	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	35	7	20	49	10	20.4	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	1.056994819	1.056994819	1	0.814814815	0.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.65E-10	1	6.72E-14	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	41580848	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	41	11	26.8	42	5	11.9	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.522727273	1.522727273	1	0.616580311	0.616580311	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.34E-16	1	0.00000228	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	41822587	C	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	41	6	14.6	46	9	19.6	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.829545455	0.829545455	1	1.015544041	1.015544041	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.05E-08	1	1.82E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	43189030	C	T	-	-	-	-	-	-	18	0	0	25	1	4	21	6	28.6	17	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.227272727	0.227272727	1	1.481865285	1.481865285	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.117779757	1	7.95E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	44084475	A	T	ABCG8	CCDS1815.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	27	9	33.3	28	5	17.9	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.892045455	1.892045455	1	0.92746114	0.92746114	1	1.203703704	1.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.44E-15	1	0.000000279	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	44410511	C	T	PPM1B	CCDS1816.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	35	7	20	46	16	34.8	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	1.803108808	1.803108808	1	0.87037037	0.87037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.65E-10	1	1.31E-25	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	45010233	G	A	-	-	-	-	-	-	15	0	0	35	6	17.1	25	8	32	29	1	3.4	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.971590909	0.971590909	1	1.658031088	1.658031088	1	0.62962963	0.62962963	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-08	1	3.92E-13	1	0.135292269	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	45077000	T	C	-	-	-	-	-	-	27	0	0	48	8	16.7	41	8	19.5	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	1.010362694	1.010362694	1	0.944444444	0.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.23E-10	1	3.22E-11	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	47515336	C	A	-	-	-	-	-	-	14	0	0	22	4	18.2	20	2	10	18	2	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	0.518134715	0.518134715	1	2.055555556	2.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000425	1	0.004473894	1	0.003626632	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	48171171	G	A	-	-	-	-	-	-	18	0	0	28	5	17.9	22	4	18.2	30	2	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.017045455	1.017045455	1	0.943005181	0.943005181	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000279	1	0.00000425	1	0.009909649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	51132278	C	T	NRXN1	CCDS46282.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	39	7	17.9	39	8	20.5	56	5	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.017045455	1.017045455	1	1.062176166	1.062176166	1	1.648148148	1.648148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-09	1	2.09E-11	1	0.00000965	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	51755802	T	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	34	8	23.5	42	6	14.3	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.335227273	1.335227273	1	0.740932642	0.740932642	1	1.574074074	1.574074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.32E-12	1	7.02E-08	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	51826493	A	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	42	6	14.3	37	11	29.7	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.538860104	1.538860104	1	1.388888889	1.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.02E-08	1	3.7E-17	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	53429021	C	G	-	-	-	-	-	-	27	0	0	27	7	25.9	28	8	28.6	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.471590909	1.471590909	1	1.481865285	1.481865285	1	1.814814815	1.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.36E-11	1	1.11E-12	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
	PD9849b	NA									NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FALSE	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
	2	55775601	C	T	SMEK2	CCDS46289.1	r.4298g>a	c.?	p.?	3'UTR variant	33	0	0	29	3	10.3	30	8	26.7	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.585227273	0.585227273	1	1.383419689	1.383419689	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000414371	1	2.07E-12	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	56861211	A	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	41	9	22	27	7	25.9	51	2	3.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.25	1.25	1	1.341968912	1.341968912	1	0.722222222	0.722222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-13	1	6.36E-11	1	0.027109304	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	58965815	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	53	5	9.4	45	3	6.7	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.534090909	0.534090909	1	0.347150259	0.347150259	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000734	1	0.001516071	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	59892083	C	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	19	8	42.1	16	3	18.8	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.392045455	2.392045455	1	0.974093264	0.974093264	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.81E-14	1	0.0000667	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	60123660	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	38	5	13.2	44	13	29.5	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.75	0.75	1	1.528497409	1.528497409	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000137	1	5.49E-20	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	60249706	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	28	9	32.1	29	9	31	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.823863636	1.823863636	1	1.606217617	1.606217617	1	0.814814815	0.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.24E-14	1	1.79E-14	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	60655708	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	38	9	23.7	37	9	24.3	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.346590909	1.346590909	1	1.259067358	1.259067358	1	1.62962963	1.62962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.79E-13	1	2.14E-13	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	61665959	G	A	USP34	CCDS42686.1	r.?	-	-	intronic	20	0	0	24	5	20.8	35	10	28.6	21	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.181818182	1.181818182	1	1.481865285	1.481865285	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000123	1	1.6E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	64264051	A	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	31	1	3.2	30	2	6.7	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.181818182	0.181818182	1	0.347150259	0.347150259	1	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	3	NA	1	1	0.143917729	1	0.009909649	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	65434318	A	G	-	-	-	-	-	-	21	0	0	28	6	21.4	17	1	5.9	29	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.215909091	1.215909091	1	0.305699482	0.305699482	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.36E-09	1	0.081683532	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	68087916	T	C	-	-	-	-	-	-	25	0	0	40	0	0	45	5	11.1	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.575129534	0.575129534	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000323	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	68581996	G	A	-	-	-	-	-	-	9	0	0	11	5	45.5	14	2	14.3	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.585227273	2.585227273	1	0.740932642	0.740932642	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.41E-09	1	0.002185852	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	68888594	G	C	-	-	-	-	-	-	28	0	0	30	7	23.3	33	10	30.3	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.323863636	1.323863636	1	1.569948187	1.569948187	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.44E-10	1	8.14E-16	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	69438740	G	T	ANTXR1	CCDS1892.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	36	5	13.9	42	6	14.3	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.789772727	0.789772727	1	0.740932642	0.740932642	1	1.814814815	1.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000104	1	7.02E-08	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	71427896	C	A	PAIP2B	CCDS46322.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	25	7	28	32	4	12.5	28	5	17.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.590909091	1.590909091	1	0.647668394	0.647668394	1	3.314814815	3.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.47E-11	1	0.0000201	1	0.000000279	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	71615428	C	T	ZNF638	CCDS1917.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	29	5	17.2	21	6	28.6	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.977272727	0.977272727	1	1.481865285	1.481865285	1	0.944444444	0.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000336	1	7.95E-10	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	71849543	C	T	DYSF	CCDS46323.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	32	2	6.2	37	8	21.6	22	1	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.352272727	0.352272727	1	1.119170984	1.119170984	1	0.833333333	0.833333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.011224977	1	1.33E-11	1	0.104413009	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	73708853	A	G	ALMS1	CCDS42697.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	34	10	29.4	29	4	13.8	22	2	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.670454545	1.670454545	1	0.715025907	0.715025907	1	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.15E-15	1	0.0000134	1	0.005403392	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	74976905	T	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	43	7	16.3	45	4	8.9	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.926136364	0.926136364	1	0.461139896	0.461139896	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.15E-09	1	0.0000791	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	77241625	C	T	LRRTM4	CCDS46346.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	35	6	17.1	35	8	22.9	42	5	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.971590909	0.971590909	1	1.186528497	1.186528497	1	2.203703704	2.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-08	1	8.15E-12	1	0.00000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	77505994	C	T	LRRTM4	CCDS46346.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	42	6	14.3	45	11	24.4	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.264248705	1.264248705	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.02E-08	1	4.24E-16	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	78888605	T	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	33	6	18.2	41	12	29.3	31	3	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	1.518134715	1.518134715	1	1.796296296	1.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.54E-08	1	1.69E-18	1	0.000505952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	79104904	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	38	5	13.2	43	3	7	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.75	0.75	1	0.362694301	0.362694301	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000137	1	0.001328364	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	79136878	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	47	4	8.5	40	7	17.5	55	3	5.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.482954545	0.482954545	1	0.906735751	0.906735751	1	1.018518519	1.018518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000939	1	1.26E-09	1	0.002700822	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	80186152	G	A	CTNNA2	CCDS42703.2	r.?	-	-	intronic	28	0	0	38	1	2.6	42	10	23.8	57	6	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.147727273	0.147727273	1	1.233160622	1.233160622	1	1.944444444	1.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.173434892	1	1.24E-14	1	0.000000456	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	80243325	T	G	CTNNA2	CCDS42703.2	r.?	-	-	intronic	33	0	0	42	10	23.8	35	5	14.3	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.352272727	1.352272727	1	0.740932642	0.740932642	1	0.888888889	0.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	1.24E-14	1	0.000000895	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	80451609	G	A	CTNNA2	CCDS42703.2	r.?	-	-	intronic	26	0	0	42	9	21.4	33	11	33.3	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.215909091	1.215909091	1	1.725388601	1.725388601	1	0.87037037	0.87037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.51E-13	1	8.54E-18	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	80518358	C	T	CTNNA2	CCDS42703.2	r.?	-	-	intronic	37	0	0	34	7	20.6	30	5	16.7	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.170454545	1.170454545	1	0.865284974	0.865284974	1	1.574074074	1.574074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.73E-10	1	0.000000401	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	81537967	A	G	-	-	-	-	-	-	26	0	0	41	7	17.1	39	9	23.1	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.971590909	0.971590909	1	1.196891192	1.196891192	1	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.51E-09	1	3.62E-13	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	81832488	T	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	57	8	14	34	9	26.5	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.795454545	0.795454545	1	1.373056995	1.373056995	1	0.777777778	0.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.19E-10	1	9.15E-14	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	81851835	C	G	-	-	-	-	-	-	29	0	0	35	10	28.6	34	12	35.3	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.625	1.625	1	1.829015544	1.829015544	1	0.981481481	0.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.6E-15	1	1.21E-19	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	83033582	C	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	34	8	23.5	40	5	12.5	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.335227273	1.335227273	1	0.647668394	0.647668394	1	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.32E-12	1	0.00000178	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	83210880	G	C	-	-	-	-	-	-	27	0	0	41	9	22	35	7	20	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.25	1.25	1	1.03626943	1.03626943	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-13	1	4.65E-10	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	83594763	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	22	6	27.3	41	7	17.1	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.551136364	1.551136364	1	0.886010363	0.886010363	1	0.37037037	0.37037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.09E-09	1	1.51E-09	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	83927599	T	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	45	5	11.1	43	9	20.9	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.630681818	0.630681818	1	1.082901554	1.082901554	1	0.592592593	0.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000323	1	9.45E-13	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	83966136	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	49	8	16.3	48	17	35.4	40	4	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.926136364	0.926136364	1	1.834196891	1.834196891	1	1.851851852	1.851851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-10	1	2.8E-27	1	0.0000495	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	83979070	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	39	6	15.4	34	4	11.8	50	3	6	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.875	0.875	1	0.611398964	0.611398964	1	1.111111111	1.111111111	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.43E-08	1	0.0000257	1	0.002055544	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	84193203	A	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	42	8	19	28	4	14.3	44	5	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.079545455	1.079545455	1	0.740932642	0.740932642	1	2.111111111	2.111111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.96E-11	1	0.0000116	1	0.00000288	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	84404223	A	C	-	-	-	-	-	-	44	0	0	46	4	8.7	46	2	4.3	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.494318182	0.494318182	1	0.222797927	0.222797927	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.0000862	1	0.022369545	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	84452698	G	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	27	4	14.8	26	7	26.9	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.840909091	0.840909091	1	1.393782383	1.393782383	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	0.00001	1	4.73E-11	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	86201452	G	A	AC012511.1	ENST00000503875	r.?	-	-	intronic	28	0	0	42	10	23.8	39	9	23.1	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.352272727	1.352272727	1	1.196891192	1.196891192	1	1.740740741	1.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.24E-14	1	3.62E-13	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	87113729	G	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	37	8	21.6	36	8	22.2	33	2	6.1	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.227272727	1.227272727	1	1.150259067	1.150259067	1	1.12962963	1.12962963	1	5.681818182	5.681818182	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.33E-11	0.005	1.04E-11	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	87302073	C	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	27	7	25.9	21	7	33.3	25	1	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.471590909	1.471590909	1	1.725388601	1.725388601	1	0.740740741	0.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.36E-11	1	8.54E-12	1	0.117779757	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	89012868	T	A	RPIA	CCDS2004.2	r.?	-	-	intronic	28	0	0	26	3	11.5	21	3	14.3	25	2	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.653409091	0.653409091	1	0.740932642	0.740932642	1	1.481481481	1.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000298167	1	0.000155401	1	0.006948068	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	89497990	T	C	-	-	-	-	-	-	31	0	0	38	7	18.4	44	10	22.7	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.045454545	1.045454545	1	1.176165803	1.176165803	1	0.888888889	0.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-10	1	2.08E-14	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	91625309	A	G	-	-	-	-	-	-	65	0	0	82	6	7.3	85	6	7.1	92	5	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.414772727	0.414772727	1	0.367875648	0.367875648	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.00000395	1	0.00000487	1	0.000107074	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	92062287	A	T	-	-	-	-	-	-	95	0	0	86	6	7	78	9	11.5	90	2	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.397727273	0.397727273	1	0.595854922	0.595854922	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.00000522	1	2.61E-10	1	0.075041956	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	95620985	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	42	0	0	30	0	0	44	5	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.111111111	2.111111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000288	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	95760043	C	T	MRPS5	CCDS2010.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	38	3	7.9	40	9	22.5	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.448863636	0.448863636	1	1.165803109	1.165803109	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000925091	1	4.64E-13	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	98820270	G	A	VWA3B	CCDS42718.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	37	4	10.8	41	9	22	29	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.613636364	0.613636364	1	1.139896373	1.139896373	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000362	1	5.92E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	104003549	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	37	12	32.4	36	8	22.2	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.840909091	1.840909091	1	1.150259067	1.150259067	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.03E-19	1	1.04E-11	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	104099246	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	28	2	7.1	24	5	20.8	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.403409091	0.403409091	1	1.077720207	1.077720207	1	0.944444444	0.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.008668191	1	0.000000123	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	105196466	G	A	-	-	-	-	-	-	15	0	0	22	7	31.8	18	4	22.2	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.806818182	1.806818182	1	1.150259067	1.150259067	1	0.925925926	0.925925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.25E-11	1	0.00000181	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	105458988	C	A	-	-	-	-	-	-	18	0	0	26	7	26.9	14	0	0	45	1	2.2	438	1	0.2	266	66	24.8	209	35	16.7	241	14	5.8	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.528409091	1.528409091	1	0	0	1	0.407407407	0.407407407	1	1.409090909	1.409090909	1	0.865284974	0.865284974	1	1.074074074	1.074074074	1	5	5	1	0.88869636	4.73E-11	1.51E-89	1	9.46E-42	0.201934322	3.68E-11	YES	1_1	0_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	2	106405802	G	A	NCK2	CCDS33266.1	r.?	-	-	intronic	11	0	0	13	4	30.8	11	4	36.4	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.75	1.75	1	1.886010363	1.886010363	1	1.814814815	1.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000431	1	0.000000201	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	106419317	C	T	NCK2	CCDS33266.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	45	7	15.6	35	1	2.9	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.886363636	0.886363636	1	0.150259067	0.150259067	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000000003	1	0.16091139	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	106864719	C	G	-	-	-	-	-	-	26	0	0	25	5	20	34	5	14.7	30	2	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	0.761658031	0.761658031	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000153	1	0.000000771	1	0.009909649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	107345541	T	A	-	-	-	-	-	-	20	0	0	19	7	36.8	35	3	8.6	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.090909091	2.090909091	1	0.445595855	0.445595855	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.73E-12	1	0.000725791	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	107524196	G	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	56	4	7.1	53	0	0	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.403409091	0.403409091	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000186538	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	107891800	A	G	-	-	-	-	-	-	26	0	0	38	12	31.6	46	8	17.4	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.795454545	1.795454545	1	0.901554404	0.901554404	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.86E-19	1	8.61E-11	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	109530279	G	A	EDAR	CCDS2081.1	r.?	-	-	intronic	11	0	0	17	4	23.5	13	2	15.4	30	3	10	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.335227273	1.335227273	1	0.797927461	0.797927461	1	1.851851852	1.851851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000141	1	0.001879825	1	0.000458697	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	109548147	G	A	EDAR	CCDS2081.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	37	7	18.9	36	6	16.7	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.073863636	1.073863636	1	0.865284974	0.865284974	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.05E-10	1	2.68E-08	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	109647798	C	T	-	-	-	-	-	-	12	0	0	31	3	9.7	25	4	16	26	3	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.551136364	0.551136364	1	0.829015544	0.829015544	1	2.12962963	2.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000505952	1	0.00000727	1	0.000298167	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	111381191	C	T	-	-	-	-	-	-	10	0	0	16	2	12.5	21	8	38.1	25	2	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	1.974093264	1.974093264	1	1.481481481	1.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.002863359	1	7.5E-14	1	0.006948068	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	112300745	C	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	32	6	18.8	44	8	18.2	29	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.068181818	1.068181818	1	0.943005181	0.943005181	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.27E-08	1	5.9E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	114405961	C	A	RABL2A	CCDS2118.1	r.?	-	-	downstream	7	0	0	10	1	10	4	0	0	12	3	25	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.568181818	0.568181818	1	0	0	1	4.62962963	4.62962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.04888987	1	1	1	0.0000266	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	115390889	C	A	DPP10	CCDS46400.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	25	0	0	31	0	0	33	4	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.240740741	2.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	115454667	C	A	DPP10	CCDS46400.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	42	5	11.9	52	11	21.2	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.676136364	0.676136364	1	1.098445596	1.098445596	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000228	1	2.44E-15	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	115756124	G	A	DPP10	CCDS46400.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	41	9	22	29	9	31	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.25	1.25	1	1.606217617	1.606217617	1	1.62962963	1.62962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-13	1	1.79E-14	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	116036472	C	A	DPP10	CCDS46400.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	46	0	0	41	4	9.8	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.507772021	0.507772021	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000546	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	116478502	C	T	DPP10	CCDS46400.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	36	7	19.4	44	13	29.5	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.102272727	1.102272727	1	1.528497409	1.528497409	1	1.388888889	1.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.74E-10	1	5.49E-20	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	116546329	G	T	DPP10	CCDS46400.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	25	4	16	22	5	22.7	59	1	1.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.909090909	0.909090909	1	1.176165803	1.176165803	1	0.314814815	0.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000727	1	7.67E-08	1	0.256019138	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	117289872	T	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	40	6	15	36	7	19.4	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852272727	0.852272727	1	1.005181347	1.005181347	1	0.462962963	0.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.18E-08	1	5.74E-10	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	118082463	G	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	43	7	16.3	37	6	16.2	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.926136364	0.926136364	1	0.839378238	0.839378238	1	0.777777778	0.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.15E-09	1	3.18E-08	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	118431874	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	32	4	12.5	40	10	25	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	1.295336788	1.295336788	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000201	1	7.22E-15	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	118797334	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	36	0	0	28	4	14.3	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.740932642	0.740932642	1	0.925925926	0.925925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.0000116	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	119304217	G	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	37	3	8.1	39	10	25.6	57	2	3.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.460227273	0.460227273	1	1.32642487	1.32642487	1	0.648148148	0.648148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000855237	1	5.44E-15	1	0.03327602	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	119927677	C	A	-	-	-	-	-	-	20	0	0	16	3	18.8	18	3	16.7	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.068181818	1.068181818	1	0.865284974	0.865284974	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000667	1	0.0000964	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	120119589	A	G	C2orf76	CCDS42739.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	28	2	7.1	37	6	16.2	27	1	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.403409091	0.403409091	1	0.839378238	0.839378238	1	0.685185185	0.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.008668191	1	3.18E-08	1	0.126579904	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	124310707	C	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	36	7	19.4	27	5	18.5	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.102272727	1.102272727	1	0.958549223	0.958549223	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.74E-10	1	0.00000023	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	124624970	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	40	1	2.5	39	7	17.9	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.142045455	0.142045455	1	0.92746114	0.92746114	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.181679879	1	1.04E-09	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	125346408	T	C	CNTNAP5	CCDS46401.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	28	3	10.7	33	5	15.2	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.607954545	0.607954545	1	0.787564767	0.787564767	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000372895	1	0.00000066	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	125468719	G	A	CNTNAP5	CCDS46401.1	r.?	-	-	intronic	14	0	0	27	6	22.2	23	4	17.4	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	0.901554404	0.901554404	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.23E-09	1	0.00000513	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	125727476	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	39	10	25.6	37	3	8.1	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.454545455	1.454545455	1	0.419689119	0.419689119	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.44E-15	1	0.000855237	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	125809506	T	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	37	4	10.8	34	3	8.8	29	1	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.613636364	0.613636364	1	0.455958549	0.455958549	1	0.62962963	0.62962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000362	1	0.000666058	1	0.135292269	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	127528028	T	C	-	-	-	-	-	-	17	0	0	33	9	27.3	43	10	23.3	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.551136364	1.551136364	1	1.207253886	1.207253886	1	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.76E-14	1	1.61E-14	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	128823643	C	T	-	-	-	-	-	-	19	1	5.3	21	6	28.6	33	10	30.3	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.625	1.625	1	1.569948187	1.569948187	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	0.090843738	1	7.95E-10	1	8.14E-16	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	129303732	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	37	2	5.4	37	9	24.3	42	4	9.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.306818182	0.306818182	1	1.259067358	1.259067358	1	1.759259259	1.759259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.014826063	1	2.14E-13	1	0.0000601	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	130024880	A	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	33	8	24.2	45	9	20	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.375	1.375	1	1.03626943	1.03626943	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-12	1	1.47E-12	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	130402550	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	37	3	8.1	44	14	31.8	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.460227273	0.460227273	1	1.647668394	1.647668394	1	1.351851852	1.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000855237	1	6.1E-22	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	130787607	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	35	5	14.3	25	2	8	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	0.414507772	0.414507772	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000000895	1	0.006948068	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	132887289	T	A	-	-	-	-	-	-	18	0	0	33	0	0	29	1	3.4	28	3	10.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.176165803	0.176165803	1	1.981481481	1.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.135292269	1	0.000372895	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	133638955	C	A	NCKAP5	CCDS46418.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	40	7	17.5	34	5	14.7	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.994318182	0.994318182	1	0.761658031	0.761658031	1	1.611111111	1.611111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-09	1	0.000000771	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	135468534	C	T	TMEM163	CCDS2172.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	36	4	11.1	36	5	13.9	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.630681818	0.630681818	1	0.720207254	0.720207254	1	0.814814815	0.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000324	1	0.00000104	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	137852392	G	T	THSD7B	ENST00000409968	r.?	-	-	intronic	23	0	0	36	7	19.4	48	7	14.6	52	3	5.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.102272727	1.102272727	1	0.756476684	0.756476684	1	1.074074074	1.074074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.74E-10	1	4.81E-09	1	0.002300591	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	137975370	G	A	THSD7B	ENST00000409968	r.?	-	-	intronic	31	0	0	44	7	15.9	35	6	17.1	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.903409091	0.903409091	1	0.886010363	0.886010363	1	0.37037037	0.37037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	2.24E-08	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	138148327	A	T	THSD7B	ENST00000409968	r.?	-	-	intronic	29	0	0	33	5	15.2	39	9	23.1	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.863636364	0.863636364	1	1.196891192	1.196891192	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000066	1	3.62E-13	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	139185176	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	33	4	12.1	41	11	26.8	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.6875	0.6875	1	1.388601036	1.388601036	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000228	1	1.34E-16	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	139226549	C	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	57	7	12.3	56	12	21.4	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.698863636	0.698863636	1	1.10880829	1.10880829	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.66E-08	1	1.11E-16	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	139859617	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	33	6	18.2	34	6	17.6	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	0.911917098	0.911917098	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.54E-08	1	1.86E-08	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	140648094	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	39	6	15.4	42	11	26.2	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.875	0.875	1	1.357512953	1.357512953	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.43E-08	1	1.81E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	140940167	A	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	47	7	14.9	54	11	20.4	54	6	11.1	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.846590909	0.846590909	1	1.056994819	1.056994819	1	2.055555556	2.055555556	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.12E-09	1	3.84E-15	1	0.000000329	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	141503822	A	G	LRP1B	CCDS2182.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	40	11	27.5	33	7	21.2	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.5625	1.5625	1	1.098445596	1.098445596	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.88E-17	1	2.98E-10	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	141848261	A	G	LRP1B	CCDS2182.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	36	12	33.3	34	7	20.6	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.892045455	1.892045455	1	1.067357513	1.067357513	1	1.462962963	1.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.73E-19	1	3.73E-10	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	141935134	A	C	LRP1B	CCDS2182.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	35	0	0	41	0	0	48	6	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.314814815	2.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	142337784	A	C	LRP1B	CCDS2182.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	40	8	20	42	7	16.7	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	0.865284974	0.865284974	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.61E-11	1	1.81E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	145467340	T	C	-	-	-	-	-	-	19	0	0	31	7	22.6	36	7	19.4	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.284090909	1.284090909	1	1.005181347	1.005181347	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.85E-10	1	5.74E-10	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	146904807	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	35	3	8.6	35	7	20	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.488636364	0.488636364	1	1.03626943	1.03626943	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000725791	1	4.65E-10	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	147017714	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	47	8	17	40	8	20	63	2	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.965909091	0.965909091	1	1.03626943	1.03626943	1	0.592592593	0.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.03E-10	1	2.61E-11	1	0.03993132	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	148347654	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	44	9	20.5	52	6	11.5	60	1	1.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.164772727	1.164772727	1	0.595854922	0.595854922	1	0.314814815	0.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.18E-12	1	0.000000261	1	0.259739042	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	149243754	C	T	MBD5	CCDS33302.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	51	12	23.5	47	6	12.8	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.335227273	1.335227273	1	0.663212435	0.663212435	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.24E-17	1	0.000000141	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	149629391	G	A	KIF5C	ENST00000435030	r.?	-	-	upstream	20	0	0	29	3	10.3	21	4	19	40	2	5	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.585227273	0.585227273	1	0.984455959	0.984455959	1	0.925925926	0.925925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000414371	1	0.00000349	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	149980975	T	A	LYPD6B	CCDS46423.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	35	5	14.3	32	7	21.9	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.134715026	1.134715026	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000895	1	2.36E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	153230137	C	T	FMNL2	CCDS46429.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	44	8	18.2	44	11	25	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	1.295336788	1.295336788	1	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.9E-11	1	3.22E-16	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	153693054	T	C	-	-	-	-	-	-	28	0	0	38	3	7.9	28	4	14.3	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.448863636	0.448863636	1	0.740932642	0.740932642	1	0.925925926	0.925925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000925091	1	0.0000116	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	153696407	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	35	4	11.4	41	7	17.1	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.647727273	0.647727273	1	0.886010363	0.886010363	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000289	1	1.51E-09	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	153811285	G	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	31	8	25.8	20	3	15	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.465909091	1.465909091	1	0.777202073	0.777202073	1	0.592592593	0.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.78E-12	1	0.0001337	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	154802635	G	C	GALNT13	CCDS2199.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	32	5	15.6	39	5	12.8	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.886363636	0.886363636	1	0.663212435	0.663212435	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000562	1	0.00000156	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	155159769	C	T	GALNT13	CCDS2199.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	38	4	10.5	35	4	11.4	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.596590909	0.596590909	1	0.590673575	0.590673575	1	2.148148148	2.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000403	1	0.0000289	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	156021440	C	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	41	5	12.2	51	5	9.8	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.693181818	0.693181818	1	0.507772021	0.507772021	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000202	1	0.00000606	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	156192479	A	C	-	-	-	-	-	-	45	0	0	38	4	10.5	46	11	23.9	33	5	15.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.596590909	0.596590909	1	1.238341969	1.238341969	1	2.814814815	2.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000403	1	5.55E-16	1	0.00000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	158669940	G	C	ACVR1	CCDS2206.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	33	5	15.2	29	5	17.2	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.863636364	0.863636364	1	0.89119171	0.89119171	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000066	1	0.000000336	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	163480174	C	T	KCNH7	CCDS2219.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	33	5	15.2	50	6	12	59	5	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.863636364	0.863636364	1	0.621761658	0.621761658	1	1.574074074	1.574074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000066	1	0.000000206	1	0.0000125	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	165593163	G	T	COBLL1	CCDS2223.2	r.?	-	-	intronic	20	0	0	39	7	17.9	38	8	21.1	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.017045455	1.017045455	1	1.093264249	1.093264249	1	1.351851852	1.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-09	1	1.67E-11	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	165593209	G	T	COBLL1	CCDS2223.2	r.?	-	-	intronic	26	0	0	38	5	13.2	35	4	11.4	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.75	0.75	1	0.590673575	0.590673575	1	0.833333333	0.833333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000137	1	0.0000289	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	165600678	T	C	COBLL1	CCDS2223.2	r.?	-	-	intronic	34	0	0	44	11	25	46	8	17.4	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	0.901554404	0.901554404	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.22E-16	1	8.61E-11	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	165954980	T	C	SCN3A	CCDS33312.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	31	0	0	46	6	13	45	3	6.7	97	0	0	254	6	2.4	221	35	15.8	288	22	7.6	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.67357513	0.67357513	1	1.240740741	1.240740741	1	0.136363636	0.136363636	1	0.81865285	0.81865285	1	1.407407407	1.407407407	1	3	1	1	1	1	0.001916706	0.000000123	7.49E-41	0.001516071	3.33E-19	YES	0_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	2	166113631	G	C	SCN2A	CCDS33314.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	34	5	14.7	35	4	11.4	41	4	9.8	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.835227273	0.835227273	1	0.590673575	0.590673575	1	1.814814815	1.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000771	1	0.0000289	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	166212611	T	C	SCN2A	CCDS33314.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	33	2	6.1	37	9	24.3	56	2	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.346590909	0.346590909	1	1.259067358	1.259067358	1	0.666666667	0.666666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.011909843	1	2.14E-13	1	0.032213353	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	166411948	G	A	CSRNP3	ENST00000421875	r.?	-	-	intronic	37	0	0	62	9	14.5	46	6	13	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.823863636	0.823863636	1	0.67357513	0.67357513	1	1.722222222	1.722222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.12E-11	1	0.000000123	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	166503172	G	A	CSRNP3	CCDS2225.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	41	6	14.6	51	12	23.5	50	5	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.829545455	0.829545455	1	1.21761658	1.21761658	1	1.851851852	1.851851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.05E-08	1	3.24E-17	1	0.00000549	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	167201400	G	A	SCN9A	CCDS46441.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	36	6	16.7	39	8	20.5	50	3	6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	1.062176166	1.062176166	1	1.111111111	1.111111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.68E-08	1	2.09E-11	1	0.002055544	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	167216469	C	T	SCN9A	CCDS46441.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	31	11	35.5	28	6	21.4	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.017045455	2.017045455	1	1.10880829	1.10880829	1	1.574074074	1.574074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.77E-18	1	5.36E-09	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	167975490	G	A	XIRP2	CCDS42769.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	39	7	17.9	35	6	17.1	52	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.017045455	1.017045455	1	0.886010363	0.886010363	1	0.351851852	0.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-09	1	2.24E-08	1	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	169456314	A	G	LASS6	CCDS2228.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	44	8	18.2	43	9	20.9	37	4	10.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	1.082901554	1.082901554	1	2	2	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.9E-11	1	9.45E-13	1	0.0000362	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	171355667	T	A	MYO3B	CCDS42773.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	46	3	6.5	41	13	31.7	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.369318182	0.369318182	1	1.642487047	1.642487047	1	1.296296296	1.296296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001615827	1	1.89E-20	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	173756411	C	T	RAPGEF4	CCDS42775.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	31	4	12.9	38	8	21.1	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.732954545	0.732954545	1	1.093264249	1.093264249	1	2.259259259	2.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000177	1	1.67E-11	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	174258887	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	37	5	13.5	49	9	18.4	29	4	13.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.767045455	0.767045455	1	0.953367876	0.953367876	1	2.555555556	2.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000119	1	3.35E-12	1	0.0000134	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	174883949	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	40	8	20	42	10	23.8	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	1.233160622	1.233160622	1	0.777777778	0.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.61E-11	1	1.24E-14	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	174918923	C	T	-	-	-	-	-	-	14	0	0	25	6	24	18	4	22.2	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.363636364	1.363636364	1	1.150259067	1.150259067	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	0.00000181	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	175280383	T	A	SCRN3	CCDS2258.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	29	7	24.1	35	5	14.3	25	3	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.369318182	1.369318182	1	0.740932642	0.740932642	1	2.222222222	2.222222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.11E-10	1	0.000000895	1	0.00026475	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	175520615	G	T	WIPF1	CCDS2260.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	53	11	20.8	48	10	20.8	49	4	8.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.181818182	1.181818182	1	1.077720207	1.077720207	1	1.518518519	1.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.07E-15	1	5.37E-14	1	0.000110643	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	176840032	A	C	KIAA1715	CCDS33332.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	42	6	14.3	39	3	7.7	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	0.398963731	0.398963731	1	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.02E-08	1	0.000998458	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	177984113	C	T	-	-	-	-	-	-	12	0	0	25	7	28	14	2	14.3	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.590909091	1.590909091	1	0.740932642	0.740932642	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.47E-11	1	0.002185852	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	178600236	C	T	PDE11A	CCDS42786.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	35	12	34.3	26	3	11.5	44	3	6.8	0	0	NA	2	1	50	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.948863636	1.948863636	1	0.595854922	0.595854922	1	1.259259259	1.259259259	1	2.840909091	2.840909091	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.83E-19	0.009975	0.000298167	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	180801399	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	37	9	24.3	42	7	16.7	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.380681818	1.380681818	1	0.865284974	0.865284974	1	0.925925926	0.925925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.14E-13	1	1.81E-09	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	180962041	T	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	32	6	18.8	37	8	21.6	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.068181818	1.068181818	1	1.119170984	1.119170984	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.27E-08	1	1.33E-11	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	181621083	G	A	-	-	-	-	-	-	49	0	0	35	5	14.3	43	5	11.6	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	0.601036269	0.601036269	1	1.351851852	1.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000895	1	0.00000257	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	181891622	G	A	UBE2E3	CCDS2282.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	44	13	29.5	41	10	24.4	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.676136364	1.676136364	1	1.264248705	1.264248705	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.49E-20	1	9.51E-15	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	182289380	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	60	18	30	36	6	16.7	45	3	6.7	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.704545455	1.704545455	1	0.865284974	0.865284974	1	1.240740741	1.240740741	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.89E-27	1	2.68E-08	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	185346471	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	48	10	20.8	49	9	18.4	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.181818182	1.181818182	1	0.953367876	0.953367876	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.37E-14	1	3.35E-12	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	185677123	C	A	ZNF804A	CCDS2291.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	54	4	7.4	29	7	24.1	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.420454545	0.420454545	1	1.248704663	1.248704663	1	0.888888889	0.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000161898	1	1.11E-10	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	185699974	C	G	ZNF804A	CCDS2291.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	35	4	11.4	32	6	18.8	52	5	9.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.647727273	0.647727273	1	0.974093264	0.974093264	1	1.777777778	1.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000289	1	1.27E-08	1	0.00000668	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	185714295	C	T	ZNF804A	CCDS2291.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	42	9	21.4	38	6	15.8	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.215909091	1.215909091	1	0.81865285	0.81865285	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.51E-13	1	3.76E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	187768962	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	48	4	8.3	46	1	2.2	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.471590909	0.471590909	1	0.113989637	0.113989637	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000102016	1	0.205924651	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	188232069	A	T	CALCRL	CCDS2293.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	34	7	20.6	37	8	21.6	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.170454545	1.170454545	1	1.119170984	1.119170984	1	0.888888889	0.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.73E-10	1	1.33E-11	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	188723100	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	35	6	17.1	32	6	18.8	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.971590909	0.971590909	1	0.974093264	0.974093264	1	1.185185185	1.185185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-08	1	1.27E-08	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	188857069	G	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	25	1	4	39	2	5.1	34	4	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.227272727	0.227272727	1	0.264248705	0.264248705	1	2.185185185	2.185185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.117779757	1	0.016387522	1	0.0000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	191669365	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	33	8	24.2	43	11	25.6	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.375	1.375	1	1.32642487	1.32642487	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-12	1	2.42E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	191708571	T	G	-	-	-	-	-	-	22	0	0	37	3	8.1	38	10	26.3	54	3	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.460227273	0.460227273	1	1.362694301	1.362694301	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000855237	1	4.06E-15	1	0.00256299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	192891124	G	A	TMEFF2	CCDS2314.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	33	6	18.2	46	9	19.6	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	1.015544041	1.015544041	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.54E-08	1	1.82E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	193702775	G	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	36	6	16.7	48	8	16.7	53	3	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	0.865284974	0.865284974	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.68E-08	1	1.23E-10	1	0.002429596	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	193834350	T	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	37	7	18.9	32	6	18.8	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.073863636	1.073863636	1	0.974093264	0.974093264	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.05E-10	1	1.27E-08	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	195555275	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	45	10	22.2	38	11	28.9	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	1.497409326	1.497409326	1	0.518518519	0.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.66E-14	1	5.19E-17	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	195614524	C	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	38	1	2.6	51	11	21.6	47	7	14.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.147727273	0.147727273	1	1.119170984	1.119170984	1	2.759259259	2.759259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.173434892	1	1.94E-15	1	4.12E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	196439182	G	C	SLC39A10	ENST00000458054	r.?	-	-	upstream	21	0	0	19	4	21.1	28	5	17.9	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.198863636	1.198863636	1	0.92746114	0.92746114	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000228	1	0.000000279	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	197243038	C	T	HECW2	CCDS33354.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	48	6	12.5	45	14	31.1	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	1.611398964	1.611398964	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000016	1	8.81E-22	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	197314424	T	A	HECW2	CCDS33354.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	44	5	11.4	36	6	16.7	37	3	8.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.647727273	0.647727273	1	0.865284974	0.865284974	1	1.5	1.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000288	1	2.68E-08	1	0.000855237	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	197562937	A	G	CCDC150	CCDS46478.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	40	6	15	35	9	25.7	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852272727	0.852272727	1	1.331606218	1.331606218	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.18E-08	1	1.23E-13	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	198924577	G	A	PLCL1	ENST00000428675	r.?	-	-	intronic	34	0	0	35	3	8.6	43	8	18.6	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.488636364	0.488636364	1	0.96373057	0.96373057	1	0.777777778	0.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000725791	1	4.85E-11	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	198998632	C	T	PLCL1	CCDS2326.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	43	8	18.6	38	7	18.4	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.056818182	1.056818182	1	0.953367876	0.953367876	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-11	1	8.61E-10	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	199897676	A	G	-	-	-	-	-	-	38	0	0	36	5	13.9	34	5	14.7	48	3	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.789772727	0.789772727	1	0.761658031	0.761658031	1	1.148148148	1.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000104	1	0.000000771	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	201492433	G	T	AOX1	CCDS33360.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	21	3	14.3	25	5	20	33	1	3	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.03626943	1.03626943	1	0.555555556	0.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000155401	1	0.000000153	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	201941043	C	T	FAM126B	CCDS2335.1	r.?	-	-	upstream	17	0	0	30	3	10	28	9	32.1	21	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.568181818	0.568181818	1	1.663212435	1.663212435	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000458697	1	1.24E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	202096871	T	C	CASP8	CCDS42799.1	r.?	-	-	upstream	28	0	0	27	3	11.1	27	6	22.2	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.630681818	0.630681818	1	1.150259067	1.150259067	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000334187	1	4.23E-09	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	203724542	G	T	ICA1L	CCDS2354.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	30	3	10	42	4	9.5	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.568181818	0.568181818	1	0.492227979	0.492227979	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000458697	1	0.0000601	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	205168420	A	C	-	-	-	-	-	-	31	0	0	33	5	15.2	39	10	25.6	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.863636364	0.863636364	1	1.32642487	1.32642487	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000066	1	5.44E-15	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	205189672	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	43	2	4.7	48	10	20.8	47	3	6.4	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.267045455	0.267045455	1	1.077720207	1.077720207	1	1.185185185	1.185185185	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.019709573	1	5.37E-14	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	205448060	A	G	PARD3B	CCDS42806.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	26	9	34.6	22	5	22.7	19	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.965909091	1.965909091	1	1.176165803	1.176165803	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.65E-15	1	7.67E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	206154797	A	T	PARD3B	CCDS42806.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	36	4	11.1	39	15	38.5	47	5	10.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.630681818	0.630681818	1	1.994818653	1.994818653	1	1.962962963	1.962962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000324	1	6.85E-25	1	0.00000402	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	208024989	T	C	KLF7	CCDS2373.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	27	7	25.9	43	7	16.3	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.471590909	1.471590909	1	0.844559585	0.844559585	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.36E-11	1	2.15E-09	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	210458230	C	T	MAP2	CCDS2384.1	r.?	-	-	intronic	8	0	0	14	4	28.6	17	4	23.5	23	2	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.625	1.625	1	1.21761658	1.21761658	1	1.611111111	1.611111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000601	1	0.00000141	1	0.00589844	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	210569316	G	A	MAP2	CCDS33369.1	r.907g>a	c.659G>A	p.R220H	missense	33	0	0	34	5	14.7	33	10	30.3	40	3	7.5	155	0	0	240	46	19.2	282	57	20.2	318	16	5	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.835227273	0.835227273	1	1.569948187	1.569948187	1	1.388888889	1.388888889	1	1.090909091	1.090909091	1	1.046632124	1.046632124	1	0.925925926	0.925925926	1	5	5	1	1	0.000000771	3.05E-57	8.14E-16	5.97E-72	0.001075403	1.31E-11	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	2	210743432	T	A	UNC80	CCDS46504.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	44	0	0	45	0	0	41	5	12.2	68	0	0	210	0	0	195	0	0	275	15	5.5	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.259259259	2.259259259	1	0	0	1	0	0	1	1.018518519	1.018518519	1	3	1	1	1	1	1	1	1	0.00000202	1.82E-11	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	2	213226591	C	T	ERBB4	CCDS2394.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	39	11	28.2	45	8	17.8	52	5	9.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.602272727	1.602272727	1	0.922279793	0.922279793	1	1.777777778	1.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.2E-17	1	7.14E-11	1	0.00000668	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	213542893	G	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	46	0	0	48	4	8.3	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.430051813	0.430051813	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000102016	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	214155515	T	A	SPAG16	CCDS2396.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	43	7	16.3	35	12	34.3	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.926136364	0.926136364	1	1.777202073	1.777202073	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.15E-09	1	1.83E-19	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	217143456	A	G	Mar-04	CCDS33376.1	r.?	-	-	intronic	18	0	0	36	8	22.2	32	6	18.8	27	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	0.974093264	0.974093264	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-11	1	1.27E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	221001967	G	A	-	-	-	-	-	-	16	0	0	34	7	20.6	31	5	16.1	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.170454545	1.170454545	1	0.834196891	0.834196891	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.73E-10	1	0.000000476	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	221037305	T	G	-	-	-	-	-	-	26	0	0	32	7	21.9	28	7	25	26	3	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.244318182	1.244318182	1	1.295336788	1.295336788	1	2.12962963	2.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.36E-10	1	8.44E-11	1	0.000298167	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	222283097	C	T	EPHA4	CCDS2447.1	r.5998g>a	c.?	p.?	3'UTR variant	18	0	0	24	6	25	34	8	23.5	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	1.21761658	1.21761658	1	1.203703704	1.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.95E-09	1	6.32E-12	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	222609786	A	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	40	11	27.5	37	6	16.2	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.5625	1.5625	1	0.839378238	0.839378238	1	1.574074074	1.574074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.88E-17	1	3.18E-08	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	222842497	G	C	-	-	-	-	-	-	23	0	0	56	14	25	39	9	23.1	39	5	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	1.196891192	1.196891192	1	2.37037037	2.37037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.91E-20	1	3.62E-13	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	225346991	C	A	CUL3	CCDS2462.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	34	6	17.6	44	10	22.7	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1.176165803	1.176165803	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.86E-08	1	2.08E-14	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	227731889	C	T	RHBDD1	CCDS2464.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	45	7	15.6	43	7	16.3	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.886363636	0.886363636	1	0.844559585	0.844559585	1	0.833333333	0.833333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000003	1	2.15E-09	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	229278874	A	G	-	-	-	-	-	-	23	0	0	46	6	13	38	8	21.1	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.738636364	0.738636364	1	1.093264249	1.093264249	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000123	1	1.67E-11	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	229781344	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	38	8	21.1	51	8	15.7	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.198863636	1.198863636	1	0.813471503	0.813471503	1	1.185185185	1.185185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.67E-11	1	2.05E-10	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	230099314	T	A	PID1	CCDS2471.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	36	5	13.9	31	5	16.1	52	4	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.789772727	0.789772727	1	0.834196891	0.834196891	1	1.425925926	1.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000104	1	0.000000476	1	0.000139698	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	231319505	T	A	SP100	CCDS2477.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	45	9	20	30	5	16.7	40	4	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	0.865284974	0.865284974	1	1.851851852	1.851851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-12	1	0.000000401	1	0.0000495	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	231391830	C	T	SP100	CCDS42832.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	39	4	10.3	30	5	16.7	19	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.585227273	0.585227273	1	0.865284974	0.865284974	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000447	1	0.000000401	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	232061515	G	A	ARMC9	CCDS2484.1	r.?	-	-	upstream	21	0	0	31	4	12.9	40	5	12.5	30	3	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.732954545	0.732954545	1	0.647668394	0.647668394	1	1.851851852	1.851851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000177	1	0.00000178	1	0.000458697	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	232853655	C	G	DIS3L2	CCDS42834.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	22	7	31.8	37	8	21.6	26	3	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.806818182	1.806818182	1	1.119170984	1.119170984	1	2.12962963	2.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.25E-11	1	1.33E-11	1	0.000298167	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	233124538	T	C	DIS3L2	CCDS42834.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	35	7	20	31	5	16.1	48	4	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	0.834196891	0.834196891	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.65E-10	1	0.000000476	1	0.000102016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	233240426	C	A	ALPP	CCDS2490.1	r.?	-	-	upstream	13	1	7.7	14	10	71.4	13	9	69.2	34	18	52.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.056818182	4.056818182	1	3.585492228	3.585492228	1	9.796296296	9.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	0.063085307	1	9.6E-21	1	1.37E-18	1	7.79E-33	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	233685891	C	T	GIGYF2	CCDS33401.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	23	5	21.7	24	6	25	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.232954545	1.232954545	1	1.295336788	1.295336788	1	1.351851852	1.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.75E-08	1	1.95E-09	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	234536534	T	A	UGT1A8	CCDS33402.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	48	6	12.5	47	12	25.5	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	1.321243523	1.321243523	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000016	1	1.09E-17	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	235313988	G	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	42	8	19	31	8	25.8	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.079545455	1.079545455	1	1.336787565	1.336787565	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.96E-11	1	2.78E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	235380988	T	C	-	-	-	-	-	-	25	0	0	35	9	25.7	38	6	15.8	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.460227273	1.460227273	1	0.81865285	0.81865285	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.23E-13	1	3.76E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	238350607	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	28	7	25	32	3	9.4	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	0.487046632	0.487046632	1	0.981481481	0.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.44E-11	1	0.000556213	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	240330192	C	T	-	-	-	-	-	-	13	0	0	19	2	10.5	17	5	29.4	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.596590909	0.596590909	1	1.523316062	1.523316062	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.004039874	1	1.84E-08	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	2	241643144	C	A	-	-	-	-	-	-	11	0	0	8	3	37.5	12	3	25	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.130681818	2.130681818	1	1.295336788	1.295336788	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	0.00000687	1	0.0000266	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	1144294	C	T	CNTN6	CCDS2557.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	6	1	16.7	8	1	12.5	28	6	21.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	0.647668394	0.647668394	1	3.962962963	1.981481481	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.029627491	1	0.039306956	1	5.36E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	2148199	C	T	CNTN4	CCDS43041.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	47	22	46.8	29	12	41.4	43	6	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.659090909	1.329545455	2	2.14507772	1.07253886	2	2.592592593	1.296296296	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.14E-38	1	1.17E-20	1	8.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	2250677	C	A	CNTN4	CCDS43041.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	50	8	16	41	9	22	49	3	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.909090909	0.909090909	1	1.139896373	1.139896373	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.74E-10	1	5.92E-13	1	0.001939399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	4160793	T	C	-	-	-	-	-	-	30	0	0	41	13	31.7	43	10	23.3	29	2	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.801136364	0.900568182	2	1.207253886	1.207253886	1	1.277777778	1.277777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.89E-20	1	1.61E-14	1	0.009279585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	4608486	T	A	ITPR1	CCDS46740.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	33	0	0	28	7	25	33	3	9.1	264	0	0	284	9	3.2	254	36	14.2	227	15	6.6	TRUE	TRUE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.295336788	1.295336788	1	1.685185185	1.685185185	1	0.181818182	0.181818182	1	0.735751295	0.735751295	1	1.222222222	1.222222222	1	3	1	1	1	1	0.0000166	8.44E-11	3.75E-40	0.000609557	1.18E-12	YES	0_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	3	5573226	T	C	-	-	-	-	-	-	27	0	0	34	5	14.7	42	6	14.3	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.835227273	0.835227273	1	0.740932642	0.740932642	1	0.37037037	0.37037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000771	1	7.02E-08	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	6606793	G	A	-	-	-	-	-	-	14	0	0	13	5	38.5	14	9	64.3	33	7	21.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.1875	2.1875	1	3.331606218	1.665803109	2	3.925925926	1.962962963	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.89E-09	1	3.82E-18	1	2.98E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	7498916	C	A	GRM7	CCDS43042.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	34	7	20.6	32	9	28.1	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.170454545	1.170454545	1	1.455958549	1.455958549	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.73E-10	1	4.94E-14	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	7507439	C	T	GRM7	CCDS43042.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	39	11	28.2	39	6	15.4	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.602272727	1.602272727	1	0.797927461	0.797927461	1	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.2E-17	1	4.43E-08	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	7522048	G	T	GRM7	CCDS43042.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	43	10	23.3	37	11	29.7	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.323863636	1.323863636	1	1.538860104	1.538860104	1	1.185185185	1.185185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.61E-14	1	3.7E-17	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	7752531	C	T	GRM7	CCDS43042.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	43	6	14	37	13	35.1	62	1	1.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.795454545	0.795454545	1	1.81865285	0.909326425	2	0.296296296	0.296296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.13E-08	1	3.89E-21	1	0.267123145	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	7764464	G	T	GRM7	CCDS43042.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	42	8	19	43	9	20.9	55	2	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.079545455	1.079545455	1	1.082901554	1.082901554	1	0.666666667	0.666666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	3.96E-11	1	9.45E-13	1	0.031164417	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	8638536	T	C	-	-	-	-	-	-	17	0	0	25	7	28	36	12	33.3	45	6	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.590909091	1.590909091	1	1.725388601	0.862694301	2	2.462962963	1.231481481	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.47E-11	1	2.73E-19	1	0.000000108	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	9083907	G	C	SRGAP3	CCDS33689.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	24	5	20.8	40	8	20	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.181818182	1.181818182	1	1.03626943	1.03626943	1	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000123	1	2.61E-11	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	10056747	G	A	-	-	-	-	-	-	12	0	0	19	0	0	25	4	16	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.829015544	0.829015544	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000727	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	12446960	C	T	PPARG	CCDS2610.2	r.?	-	-	intronic	35	0	0	39	5	12.8	35	7	20	29	1	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.727272727	0.727272727	1	1.03626943	1.03626943	1	0.62962963	0.62962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000156	1	4.65E-10	1	0.135292269	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	13154360	G	T	-	-	-	-	-	-	10	0	0	20	2	10	11	3	27.3	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.568181818	0.568181818	1	1.414507772	1.414507772	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.004473894	1	0.00002	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	14046198	C	T	TPRXL	ENST00000326972	r.?	-	-	intronic	32	0	0	44	9	20.5	34	11	32.4	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.164772727	1.164772727	1	1.678756477	0.839378238	2	0.944444444	0.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.18E-12	1	1.26E-17	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	14659418	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	34	7	20.6	33	6	18.2	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.170454545	1.170454545	1	0.943005181	0.943005181	1	0.388888889	0.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.73E-10	1	1.54E-08	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	14785650	C	T	C3orf20	CCDS33706.1	r.?	-	-	intronic	18	0	0	34	2	5.9	30	5	16.7	54	3	5.6	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.335227273	0.335227273	1	0.865284974	0.865284974	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.012612579	1	0.000000401	1	0.00256299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	15392180	G	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	17	5	29.4	26	11	42.3	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.670454545	1.670454545	1	2.191709845	1.095854922	2	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.84E-08	1	3.52E-19	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	18059617	C	T	AC139618.1	ENST00000448265	r.?	-	-	intronic	34	0	0	43	5	11.6	37	13	35.1	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.659090909	0.659090909	1	1.81865285	0.909326425	2	2.148148148	2.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000257	1	3.89E-21	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	18225425	G	C	AC139618.1	ENST00000448265	r.?	-	-	intronic	32	0	0	42	6	14.3	40	5	12.5	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	0.647668394	0.647668394	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.02E-08	1	0.00000178	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	19632554	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	39	10	25.6	49	12	24.5	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.454545455	1.454545455	1	1.269430052	1.269430052	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.44E-15	1	1.9E-17	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	20297663	G	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	31	8	25.8	46	6	13	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.465909091	1.465909091	1	0.67357513	0.67357513	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.78E-12	1	0.000000123	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	20514352	A	G	-	-	-	-	-	-	38	0	0	40	8	20	39	12	30.8	54	4	7.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	1.595854922	1.595854922	1	1.37037037	1.37037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.61E-11	1	8.43E-19	1	0.000161898	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	21521870	C	T	ZNF385D	CCDS2636.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	36	4	11.1	39	5	12.8	48	3	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.630681818	0.630681818	1	0.663212435	0.663212435	1	1.148148148	1.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000324	1	0.00000156	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	22395651	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	45	17	37.8	44	22	50	48	9	18.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.147727273	1.073863636	2	2.590673575	1.295336788	2	3.481481481	1.740740741	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.37E-28	1	4.51E-39	1	2.75E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	22411571	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	55	9	16.4	39	7	17.9	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.931818182	0.931818182	1	0.92746114	0.92746114	1	1.648148148	1.648148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.01E-11	1	1.04E-09	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	22783444	A	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	35	1	2.9	51	0	0	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.164772727	0.164772727	1	0	0	1	1.740740741	1.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.16091139	1	1	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	24757957	C	A	-	-	-	-	-	-	18	0	0	22	8	36.4	36	3	8.3	25	1	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.068181818	1.034090909	2	0.430051813	0.430051813	1	0.740740741	0.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.17E-13	1	0.000788827	1	0.117779757	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	24803994	G	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	50	12	24	38	13	34.2	42	8	19	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.363636364	1.363636364	1	1.772020725	0.886010363	2	3.518518519	1.759259259	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.49E-17	1	5.88E-21	1	3.96E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	27484213	G	A	SLC4A7	CCDS33721.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	31	6	19.4	32	7	21.9	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.102272727	1.102272727	1	1.134715026	1.134715026	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.03E-08	1	2.36E-10	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	28441330	A	T	ZCWPW2	CCDS33723.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	45	15	33.3	31	8	25.8	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.892045455	0.946022727	2	1.336787565	1.336787565	1	2.055555556	2.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.14E-24	1	2.78E-12	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	29101588	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	41	10	24.4	33	9	27.3	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.386363636	1.386363636	1	1.414507772	1.414507772	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.51E-15	1	6.76E-14	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	29361002	C	T	RBMS3	CCDS33725.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	38	14	36.8	45	16	35.6	49	5	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.090909091	1.045454545	2	1.844559585	0.922279793	2	1.888888889	1.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.28E-23	1	8.61E-26	1	0.00000496	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	29363353	C	A	RBMS3	CCDS33725.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	49	11	22.4	37	8	21.6	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.272727273	1.272727273	1	1.119170984	1.119170984	1	1.296296296	1.296296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.19E-15	1	1.33E-11	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	29477215	G	T	RBMS3	CCDS33725.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	13	6	46.2	21	9	42.9	37	2	5.4	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.625	1.3125	2	2.222797927	1.111398964	2	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.6E-11	1	5.44E-16	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	29567628	A	C	RBMS3	CCDS33725.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	20	3	15	21	7	33.3	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852272727	0.852272727	1	1.725388601	1.725388601	1	1.388888889	1.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0001337	1	8.54E-12	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	29607142	C	T	RBMS3	CCDS33725.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	40	0	0	40	0	0	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.259259259	2.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	29661516	A	G	RBMS3	CCDS33725.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	36	4	11.1	47	8	17	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.630681818	0.630681818	1	0.880829016	0.880829016	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000324	1	1.03E-10	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	30483034	A	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	33	3	9.1	37	9	24.3	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.517045455	0.517045455	1	1.259067358	1.259067358	1	0.592592593	0.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000609557	1	2.14E-13	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	30789026	G	T	GADL1	CCDS2649.2	r.?	-	-	intronic	46	0	0	43	9	20.9	39	10	25.6	53	5	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.1875	1.1875	1	1.32642487	1.32642487	1	1.740740741	1.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.45E-13	1	5.44E-15	1	0.00000734	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	30815811	G	A	GADL1	CCDS2649.2	r.?	-	-	intronic	36	0	0	29	13	44.8	51	17	33.3	41	8	19.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.545454545	1.272727273	2	1.725388601	0.862694301	2	3.611111111	1.805555556	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.69E-23	1	9.59E-27	1	3.22E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	31690142	T	C	-	-	-	-	-	-	16	0	0	13	4	30.8	12	4	33.3	43	9	20.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.75	1.75	1	1.725388601	1.725388601	1	3.87037037	1.935185185	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000431	1	0.0000003	1	9.45E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	33562015	G	A	CLASP2	ENST00000307312	r.?	-	-	intronic	24	0	0	32	10	31.2	23	6	26.1	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.772727273	0.886363636	2	1.352331606	1.352331606	1	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.7E-16	1	1.47E-09	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	34333389	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	45	10	22.2	36	5	13.9	56	2	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	0.720207254	0.720207254	1	0.666666667	0.666666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.66E-14	1	0.00000104	1	0.032213353	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	35042560	A	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	30	17	56.7	34	10	29.4	40	5	12.5	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.221590909	1.610795455	2	1.523316062	1.523316062	1	2.314814815	2.314814815	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.59E-32	1	1.15E-15	1	0.00000178	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	39436634	C	T	SLC25A38	CCDS2685.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	48	6	12.5	43	10	23.3	33	4	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	1.207253886	1.207253886	1	2.240740741	2.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000016	1	1.61E-14	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	39570009	A	G	MOBP	CCDS2687.1	r.?	-	-	downstream	43	0	0	34	4	11.8	42	3	7.1	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.670454545	0.670454545	1	0.367875648	0.367875648	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.0000257	1	0.001240292	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	43256290	C	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	36	6	16.7	28	6	21.4	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	1.10880829	1.10880829	1	0.462962963	0.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.68E-08	1	5.36E-09	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	44205255	C	T	-	-	-	-	-	-	33	1	3	34	13	38.2	34	13	38.2	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.170454545	1.085227273	2	1.979274611	0.989637306	2	1.740740741	1.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	0.15245715	1	1.03E-21	1	1.03E-21	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	44261540	A	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	40	3	7.5	30	5	16.7	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.426136364	0.426136364	1	0.865284974	0.865284974	1	0.574074074	0.574074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001075403	1	0.000000401	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	44413662	T	G	C3orf23	CCDS2712.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	32	5	15.6	34	15	44.1	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.886363636	0.886363636	1	2.284974093	1.142487047	2	1.648148148	1.648148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000562	1	5.18E-26	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	45349834	T	C	-	-	-	-	-	-	31	0	0	38	16	42.1	40	15	37.5	38	7	18.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.392045455	1.196022727	2	1.943005181	0.971502591	2	3.407407407	1.703703704	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.06E-27	1	1.09E-24	1	8.61E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	46546421	C	T	RTP3	CCDS2740.1	r.?	-	-	downstream	26	0	0	30	8	26.7	27	4	14.8	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.517045455	1.517045455	1	0.766839378	0.766839378	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.07E-12	1	0.00001	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	47462374	A	T	SCAP	CCDS2755.2	r.?	-	-	intronic	5	0	0	14	4	28.6	8	2	25	27	3	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.625	1.625	1	1.295336788	1.295336788	1	2.055555556	2.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000601	1	0.000686131	1	0.000334187	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	51146191	T	A	DOCK3	CCDS46835.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	41	3	7.3	37	8	21.6	40	5	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.414772727	0.414772727	1	1.119170984	1.119170984	1	2.314814815	2.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001155993	1	1.33E-11	1	0.00000178	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	51228920	G	T	DOCK3	CCDS46835.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	55	7	12.7	44	8	18.2	29	2	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.721590909	0.721590909	1	0.943005181	0.943005181	1	1.277777778	1.277777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.28E-08	1	5.9E-11	1	0.009279585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	58030252	T	C	FLNB	CCDS2885.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	17	2	11.8	17	4	23.5	25	2	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.670454545	0.670454545	1	1.21761658	1.21761658	1	1.481481481	1.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.003234386	1	0.00000141	1	0.006948068	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	60249916	A	G	FHIT	CCDS2894.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	50	9	18	54	9	16.7	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.022727273	1.022727273	1	0.865284974	0.865284974	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.07E-12	1	8.48E-12	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	61238101	A	C	FHIT	CCDS2894.1	r.?	-	-	upstream	29	0	0	49	15	30.6	44	19	43.2	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.738636364	0.869318182	2	2.238341969	1.119170984	2	0.555555556	0.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.1E-23	1	2.39E-32	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	61238104	T	G	FHIT	CCDS2894.1	r.?	-	-	upstream	28	0	0	47	15	31.9	45	20	44.4	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.8125	0.90625	2	2.300518135	1.150259067	2	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.97E-23	1	2.68E-34	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	61834545	A	C	PTPRG	CCDS2895.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	38	15	39.5	46	15	32.6	66	6	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.244318182	1.122159091	2	1.689119171	0.844559585	2	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.24E-25	1	1.35E-23	1	0.0000011	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	61968926	C	T	PTPRG	CCDS2895.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	41	9	22	28	3	10.7	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.25	1.25	1	0.554404145	0.554404145	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-13	1	0.000372895	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	62508443	T	G	CADPS	CCDS46858.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	35	7	20	38	9	23.7	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	1.227979275	1.227979275	1	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.65E-10	1	2.79E-13	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	62909462	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	42	18	42.9	38	14	36.8	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.4375	1.21875	2	1.906735751	0.953367876	2	1.296296296	1.296296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.2E-30	1	5.28E-23	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	63417381	C	G	SYNPR	CCDS46859.1	r.?	-	-	intronic	39	1	2.6	35	10	28.6	43	10	23.3	35	3	8.6	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.625	1.625	1	1.207253886	1.207253886	1	1.592592593	1.592592593	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	0.177567718	1	1.6E-15	1	1.61E-14	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	66052831	A	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	32	4	12.5	33	5	15.2	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	0.787564767	0.787564767	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000201	1	0.00000066	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	67337322	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	29	2	6.9	28	5	17.9	43	6	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.392045455	0.392045455	1	0.92746114	0.92746114	1	2.592592593	1.296296296	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.009279585	1	0.000000279	1	8.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	68270908	G	T	FAM19A1	ENST00000478136	r.?	-	-	intronic	28	0	0	46	0	0	31	0	0	55	4	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	1.351851852	1.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.000173903	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	68321352	C	T	FAM19A1	ENST00000478136	r.?	-	-	intronic	35	0	0	31	6	19.4	26	3	11.5	50	4	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.102272727	1.102272727	1	0.595854922	0.595854922	1	1.481481481	1.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.03E-08	1	0.000298167	1	0.000119787	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	68533196	C	T	FAM19A1	ENST00000478136	r.?	-	-	intronic	30	0	0	48	13	27.1	37	17	45.9	39	5	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.539772727	1.539772727	1	2.378238342	1.189119171	2	2.37037037	1.185185185	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2E-19	1	1.1E-29	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	68618651	G	T	-	-	-	-	-	-	51	0	0	37	4	10.8	47	16	34	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.613636364	0.613636364	1	1.761658031	0.880829016	2	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000362	1	1.98E-25	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	69790790	G	C	MITF	CCDS43106.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	27	12	44.4	35	10	28.6	43	7	16.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.522727273	1.261363636	2	1.481865285	1.481865285	1	3.018518519	1.509259259	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.96E-21	1	1.6E-15	1	2.15E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	71133480	C	G	FOXP1	CCDS2914.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	34	5	14.7	36	6	16.7	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.835227273	0.835227273	1	0.865284974	0.865284974	1	1.296296296	1.296296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000771	1	2.68E-08	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	73039652	C	G	AC103560.1	ENST00000509224	r.?	-	-	intronic	33	0	0	44	9	20.5	36	1	2.8	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.164772727	1.164772727	1	0.14507772	0.14507772	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	1.18E-12	1	0.165106833	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	73050842	C	T	PPP4R2	CCDS2917.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	36	6	16.7	39	4	10.3	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	0.533678756	0.533678756	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.68E-08	1	0.0000447	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	74230123	T	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	30	4	13.3	33	4	12.1	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.755681818	0.755681818	1	0.626943005	0.626943005	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000154	1	0.0000228	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	74673334	G	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	38	1	2.6	47	10	21.3	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.147727273	0.147727273	1	1.103626943	1.103626943	1	0.388888889	0.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.173434892	1	4.27E-14	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	74975986	C	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	36	6	16.7	46	12	26.1	56	3	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	1.352331606	1.352331606	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.68E-08	1	8.12E-18	1	0.00284314	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	75174152	C	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	22	5	22.7	26	13	50	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.289772727	1.289772727	1	2.590673575	1.295336788	2	1.462962963	1.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	7.67E-08	1	1.2E-23	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	75193855	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	43	7	16.3	36	6	16.7	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.926136364	0.926136364	1	0.865284974	0.865284974	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.15E-09	1	2.68E-08	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	75659562	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	48	5	10.4	38	1	2.6	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.590909091	0.590909091	1	0.134715026	0.134715026	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000447	1	0.173434892	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	76471659	G	A	ROBO2	ENST00000487694	r.?	-	-	intronic	24	0	0	37	9	24.3	49	13	26.5	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.380681818	1.380681818	1	1.373056995	1.373056995	1	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.14E-13	1	2.71E-19	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	80769565	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	40	18	45	43	20	46.5	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.556818182	1.278409091	2	2.409326425	1.204663212	2	2.259259259	2.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.9E-31	1	8.21E-35	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	85832234	T	G	CADM2	CCDS33792.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	41	0	0	39	0	0	53	4	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	1.388888889	1.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.000150502	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	87380402	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	42	14	33.3	29	16	55.2	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.892045455	0.946022727	2	2.860103627	1.430051813	2	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.83E-22	1	9.74E-30	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	88016215	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	44	8	18.2	38	5	13.2	54	2	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	0.683937824	0.683937824	1	0.685185185	0.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.9E-11	1	0.00000137	1	0.030129377	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	94037155	A	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	22	3	13.6	37	0	0	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.772727273	0.772727273	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000179267	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	94268209	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	42	15	35.7	42	17	40.5	48	7	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.028409091	1.014204545	2	2.098445596	1.049222798	2	2.703703704	1.351851852	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.65E-24	1	1.73E-28	1	4.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	94284190	T	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	42	0	0	30	0	0	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.018518519	2.018518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	94489361	A	G	-	-	-	-	-	-	29	0	0	35	12	34.3	46	17	37	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.948863636	0.974431818	2	1.917098446	0.958549223	2	1.648148148	1.648148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.83E-19	1	1.16E-27	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	94713099	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	19	2	10.5	28	13	46.4	42	8	19	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.596590909	0.596590909	1	2.404145078	1.202072539	2	3.518518519	1.759259259	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.004039874	1	4.26E-23	1	3.96E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	95235804	T	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	43	9	20.9	52	14	26.9	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.1875	1.1875	1	1.393782383	1.393782383	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.45E-13	1	9.04E-21	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	95825160	A	G	-	-	-	-	-	-	41	0	0	50	23	46	47	22	46.8	32	4	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.613636364	1.306818182	2	2.424870466	1.212435233	2	2.314814815	2.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.13E-39	1	3.14E-38	1	0.0000201	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	95825223	G	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	48	19	39.6	33	15	45.5	38	6	15.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.25	1.125	2	2.357512953	1.178756477	2	2.925925926	1.462962963	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.92E-31	1	2.91E-26	1	3.76E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	96053399	A	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	48	14	29.2	42	13	31	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.659090909	0.829545455	2	1.606217617	0.803108808	2	1.203703704	1.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.51E-21	1	2.72E-20	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	97259094	G	A	EPHA6	CCDS46876.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	51	0	0	45	0	0	36	4	11.1	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.055555556	2.055555556	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000324	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	98532462	C	A	DCBLD2	CCDS46878.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	34	1	2.9	33	7	21.2	38	1	2.6	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.164772727	0.164772727	1	1.098445596	1.098445596	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.156694864	1	2.98E-10	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	102773938	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	44	17	38.6	34	17	50	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.193181818	1.096590909	2	2.590673575	1.295336788	2	0.925925926	0.925925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.61E-28	1	1.64E-30	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	103539353	T	C	-	-	-	-	-	-	30	0	0	35	16	45.7	44	16	36.4	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.596590909	1.298295455	2	1.886010363	0.943005181	2	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.66E-28	1	5.57E-26	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	103826248	T	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	42	1	2.4	43	9	20.9	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.136363636	0.136363636	1	1.082901554	1.082901554	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.189842622	1	9.45E-13	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	105031195	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	36	10	27.8	42	9	21.4	30	2	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.579545455	1.579545455	1	1.10880829	1.10880829	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.21E-15	1	7.51E-13	1	0.009909649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	106617455	G	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	41	0	0	43	1	2.3	24	3	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.119170984	0.119170984	1	2.314814815	2.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.193893409	1	0.000233853	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	106811774	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	23	7	30.4	32	16	50	36	8	22.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.727272727	1.727272727	1	2.590673575	1.295336788	2	4.111111111	2.055555556	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.79E-11	1	8.51E-29	1	1.04E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	106981662	T	C	-	-	-	-	-	-	24	0	0	30	11	36.7	45	17	37.8	56	8	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.085227273	1.042613636	2	1.958549223	0.979274611	2	2.648148148	1.324074074	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.44E-18	1	7.37E-28	1	4.48E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	107046458	A	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	43	15	34.9	39	17	43.6	40	4	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.982954545	0.991477273	2	2.259067358	1.129533679	2	1.851851852	1.851851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.05E-24	1	3.51E-29	1	0.0000495	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	109231707	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	28	3	10.7	53	14	26.4	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.607954545	0.607954545	1	1.367875648	1.367875648	1	1.148148148	1.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000372895	1	1.22E-20	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	109365988	C	T	-	-	-	-	-	-	13	0	0	23	5	21.7	25	5	20	29	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.232954545	1.232954545	1	1.03626943	1.03626943	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.75E-08	1	0.000000153	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	109537929	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	28	0	0	39	6	15.4	31	3	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.797927461	0.797927461	1	1.796296296	1.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	4.43E-08	1	0.000505952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	109576924	C	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	39	11	28.2	29	4	13.8	32	4	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.602272727	1.602272727	1	0.715025907	0.715025907	1	2.314814815	2.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.2E-17	1	0.0000134	1	0.0000201	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	109576960	C	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	45	12	26.7	39	5	12.8	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.517045455	1.517045455	1	0.663212435	0.663212435	1	1.944444444	1.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.03E-18	1	0.00000156	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	109798747	G	C	-	-	-	-	-	-	36	0	0	53	0	0	40	0	0	41	6	14.6	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.703703704	1.351851852	2	0	0	1	NA	NA	1	0	0	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	6.05E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	110103256	T	G	-	-	-	-	-	-	26	0	0	45	1	2.2	41	4	9.8	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.125	0.125	1	0.507772021	0.507772021	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.201934322	1	0.0000546	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	110363946	G	C	-	-	-	-	-	-	34	0	0	37	9	24.3	46	10	21.7	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.380681818	1.380681818	1	1.124352332	1.124352332	1	1.185185185	1.185185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.14E-13	1	3.38E-14	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	111354390	T	A	CD96	CCDS2959.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	37	19	51.4	37	18	48.6	30	4	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.920454545	1.460227273	2	2.518134715	1.259067358	2	2.462962963	2.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.09E-34	1	6.16E-32	1	0.0000154	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	112132358	C	A	-	-	-	-	-	-	18	0	0	19	4	21.1	24	4	16.7	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.198863636	1.198863636	1	0.865284974	0.865284974	1	1.148148148	1.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000228	1	0.00000613	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	112159233	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	42	11	26.2	39	8	20.5	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.488636364	1.488636364	1	1.062176166	1.062176166	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.81E-16	1	2.09E-11	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	112163256	G	A	-	-	-	-	-	-	15	0	0	37	1	2.7	34	7	20.6	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.153409091	0.153409091	1	1.067357513	1.067357513	1	0.981481481	0.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.169281299	1	3.73E-10	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	112433116	C	T	-	-	-	-	-	-	15	0	0	20	5	25	14	4	28.6	26	2	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	1.481865285	1.481865285	1	1.425925926	1.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.55E-08	1	0.000000601	1	0.007502227	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	112561197	C	A	CD200R1L	CCDS43131.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	26	10	38.5	37	12	32.4	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.1875	1.09375	2	1.678756477	0.839378238	2	1.574074074	1.574074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.82E-17	1	4.03E-19	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	113682631	T	C	KIAA1407	CCDS2977.1	r.?	-	-	downstream	34	0	0	33	2	6.1	32	7	21.9	50	3	6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.346590909	0.346590909	1	1.134715026	1.134715026	1	1.111111111	1.111111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.011909843	1	2.36E-10	1	0.002055544	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	115240069	A	T	-	-	-	-	-	-	15	0	0	38	5	13.2	33	3	9.1	23	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.75	0.75	1	0.471502591	0.471502591	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000137	1	0.000609557	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	116294996	C	T	LSAMP	ENST00000474851	r.?	-	-	intronic	23	0	0	45	10	22.2	38	9	23.7	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	1.227979275	1.227979275	1	1.425925926	1.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.66E-14	1	2.79E-13	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	117582691	G	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	41	0	0	39	0	0	54	5	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	1.722222222	1.722222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000806	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	117897524	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	34	0	0	50	5	10	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.518134715	0.518134715	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000549	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	118073162	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	33	6	18.2	33	8	24.2	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	1.25388601	1.25388601	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.54E-08	1	4.85E-12	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	118366121	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	28	5	17.9	27	3	11.1	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.017045455	1.017045455	1	0.575129534	0.575129534	1	1.351851852	1.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000279	1	0.000334187	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	118657852	G	A	IGSF11	CCDS2983.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	23	7	30.4	47	20	42.6	33	4	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.727272727	1.727272727	1	2.207253886	1.103626943	2	2.240740741	2.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.79E-11	1	8.18E-34	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	119430085	G	A	C3orf15	CCDS2994.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	47	14	29.8	35	16	45.7	52	8	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.693181818	0.846590909	2	2.367875648	1.183937824	2	2.851851852	1.425925926	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.79E-21	1	5.66E-28	1	2.42E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	120304702	A	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	48	15	31.2	39	20	51.3	38	6	15.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.772727273	0.886363636	2	2.658031088	1.329015544	2	2.925925926	1.462962963	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.86E-23	1	6E-36	1	3.76E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	125083103	C	T	ZNF148	CCDS3031.1	r.?	-	-	intronic	14	0	0	40	14	35	28	8	28.6	32	5	15.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.988636364	0.994318182	2	1.481865285	1.481865285	1	2.888888889	1.444444444	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.25E-22	1	1.11E-12	1	0.000000562	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	125131294	C	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	34	8	23.5	25	2	8	25	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.335227273	1.335227273	1	0.414507772	0.414507772	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.32E-12	1	0.006948068	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	126241296	T	C	UROC1	CCDS3038.1	r.?	-	-	upstream	17	0	0	13	6	46.2	16	8	50	39	4	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.625	1.3125	2	2.590673575	1.295336788	2	1.907407407	1.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.6E-11	1	4.85E-15	1	0.0000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	126412327	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	33	5	15.2	42	8	19	21	4	19	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.863636364	0.863636364	1	0.984455959	0.984455959	1	3.518518519	1.759259259	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000066	1	3.96E-11	1	0.00000349	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	134757580	C	T	EPHB1	CCDS46921.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	27	8	29.6	20	7	35	39	4	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.681818182	1.681818182	1	1.813471503	1.813471503	1	1.907407407	1.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.97E-13	1	5.72E-12	1	0.0000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	135348842	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	42	4	9.5	48	12	25	32	2	6.2	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.539772727	0.539772727	1	1.295336788	1.295336788	1	1.148148148	1.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000601	1	1.44E-17	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	135444498	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	43	9	20.9	42	9	21.4	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.1875	1.1875	1	1.10880829	1.10880829	1	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.45E-13	1	7.51E-13	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	136799977	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	47	9	19.1	51	13	25.5	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.085227273	1.085227273	1	1.321243523	1.321243523	1	2.259259259	2.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-12	1	4.87E-19	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	137489845	G	A	-	-	-	-	-	-	10	0	0	12	0	0	8	0	0	39	7	17.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	3.314814815	1.657407407	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	1.04E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	137955725	G	A	ARMC8	CCDS3098.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	33	6	18.2	32	6	18.8	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	0.974093264	0.974093264	1	0.592592593	0.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.54E-08	1	1.27E-08	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	141408386	C	T	-	-	-	-	-	-	21	0	0	37	18	48.6	25	8	32	47	10	21.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.761363636	1.380681818	2	1.658031088	1.658031088	1	3.944444444	1.972222222	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.16E-32	1	3.92E-13	1	4.27E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	142830298	C	T	-	-	-	-	-	-	14	0	0	31	7	22.6	28	4	14.3	37	5	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.284090909	1.284090909	1	0.740932642	0.740932642	1	2.5	1.25	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.85E-10	1	0.0000116	1	0.00000119	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	143603264	T	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	46	22	47.8	34	14	41.2	48	6	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.715909091	1.357954545	2	2.134715026	1.067357513	2	2.314814815	1.157407407	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.68E-38	1	7.74E-24	1	0.00000016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	143932130	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	39	5	12.8	37	7	18.9	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.727272727	0.727272727	1	0.979274611	0.979274611	1	1.814814815	1.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	0.00000156	1	7.05E-10	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	144701086	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	44	8	18.2	51	7	13.7	57	3	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	0.70984456	0.70984456	1	0.981481481	0.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.9E-11	1	7.46E-09	1	0.002989991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	145044730	G	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	38	6	15.8	37	5	13.5	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.897727273	0.897727273	1	0.699481865	0.699481865	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.76E-08	1	0.00000119	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	145229372	C	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	34	9	26.5	47	15	31.9	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.505681818	1.505681818	1	1.652849741	0.82642487	2	1.574074074	1.574074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.15E-14	1	1.97E-23	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	145309893	T	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	46	6	13	53	14	26.4	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.738636364	0.738636364	1	1.367875648	1.367875648	1	0.888888889	0.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000123	1	1.22E-20	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	145777982	G	A	ENSG00000232013	ENST00000422482	r.?	-	-	upstream	46	0	0	44	9	20.5	42	13	31	51	8	15.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.164772727	1.164772727	1	1.606217617	0.803108808	2	2.907407407	1.453703704	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.18E-12	1	2.72E-20	1	2.05E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	146479459	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	36	2	5.6	31	5	16.1	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.318181818	0.318181818	1	0.834196891	0.834196891	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.014070883	1	0.000000476	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	146973454	T	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	39	5	12.8	46	7	15.2	53	3	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.727272727	0.727272727	1	0.787564767	0.787564767	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000156	1	3.53E-09	1	0.002429596	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	147117688	G	T	ZIC4	CCDS43160.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	27	7	25.9	41	9	22	49	4	8.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.471590909	1.471590909	1	1.139896373	1.139896373	1	1.518518519	1.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.36E-11	1	5.92E-13	1	0.000110643	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	147803146	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	44	6	13.6	44	10	22.7	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.772727273	0.772727273	1	1.176165803	1.176165803	1	1.203703704	1.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.37E-08	1	2.08E-14	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	148143377	G	T	-	-	-	-	-	-	21	0	0	31	5	16.1	16	4	25	35	3	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914772727	0.914772727	1	1.295336788	1.295336788	1	1.592592593	1.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000476	1	0.00000108	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	148903139	A	T	CP	CCDS3141.1	r.2435u>a	c.2172T>A	p.D724E	missense	32	0	0	28	5	17.9	39	10	25.6	35	3	8.6	57	0	0	163	24	14.7	146	27	18.5	140	5	3.6	TRUE	TRUE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.017045455	1.017045455	1	1.32642487	1.32642487	1	1.592592593	1.592592593	1	0.835227273	0.835227273	1	0.958549223	0.958549223	1	0.666666667	0.666666667	1	5	5	1	1	0.000000279	1.03E-27	5.44E-15	8.12E-34	0.000725791	0.000745055	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	3	149415185	A	C	WWTR1	CCDS3144.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	40	4	10	29	7	24.1	27	1	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.568181818	0.568181818	1	1.248704663	1.248704663	1	0.685185185	0.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000495	1	1.11E-10	1	0.126579904	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	149751908	G	A	PFN2	ENST00000497148	r.?	-	-	intronic	30	0	0	41	6	14.6	34	7	20.6	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.829545455	0.829545455	1	1.067357513	1.067357513	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.05E-08	1	3.73E-10	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	150004051	C	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	49	2	4.1	42	11	26.2	54	3	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.232954545	0.232954545	1	1.357512953	1.357512953	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.025168485	1	1.81E-16	1	0.00256299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	150531365	C	A	ENSG00000224010	ENST00000412550	r.?	-	-	intronic	41	0	0	45	8	17.8	37	5	13.5	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.011363636	1.011363636	1	0.699481865	0.699481865	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.14E-11	1	0.00000119	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	150619337	C	A	-	-	-	-	-	-	18	0	0	21	7	33.3	15	6	40	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.892045455	1.892045455	1	2.07253886	1.03626943	2	1.740740741	1.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.54E-12	1	7.52E-11	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	151092066	C	T	MED12L	CCDS33876.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	30	6	20	31	6	19.4	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	1.005181347	1.005181347	1	2.259259259	2.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.37E-09	1	1.03E-08	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	152516124	A	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	38	8	21.1	42	8	19	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.198863636	1.198863636	1	0.984455959	0.984455959	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.67E-11	1	3.96E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	154083325	C	A	GPR149	CCDS43162.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	36	5	13.9	44	12	27.3	31	3	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.789772727	0.789772727	1	1.414507772	1.414507772	1	1.796296296	1.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000104	1	4.44E-18	1	0.000505952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	155092248	G	A	PLCH1	ENST00000494598	r.?	-	-	downstream	29	0	0	37	8	21.6	39	11	28.2	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.227272727	1.227272727	1	1.461139896	1.461139896	1	1.185185185	1.185185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.33E-11	1	7.2E-17	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	155597688	T	C	GMPS	CCDS46941.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	24	5	20.8	21	5	23.8	27	1	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.181818182	1.181818182	1	1.233160622	1.233160622	1	0.685185185	0.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000123	1	5.95E-08	1	0.126579904	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	156838228	C	T	-	-	-	-	-	-	14	0	0	13	5	38.5	5	1	20	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.1875	2.1875	1	1.03626943	1.03626943	1	0.814814815	0.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.89E-09	1	0.024751247	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	162468404	T	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	52	19	36.5	57	25	43.9	39	5	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.073863636	1.036931818	2	2.274611399	1.137305699	2	2.37037037	1.185185185	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.24E-30	1	2.54E-42	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	162915307	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	46	10	21.7	34	11	32.4	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.232954545	1.232954545	1	1.678756477	0.839378238	2	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.38E-14	1	1.26E-17	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	163385685	T	G	-	-	-	-	-	-	44	0	0	43	11	25.6	48	11	22.9	53	4	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.454545455	1.454545455	1	1.186528497	1.186528497	1	1.388888889	1.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.42E-16	1	9.31E-16	1	0.000150502	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	163486321	T	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	52	19	36.5	44	12	27.3	56	6	10.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.073863636	1.036931818	2	1.414507772	1.414507772	1	1.981481481	1.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.24E-30	1	4.44E-18	1	0.000000409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	164165899	G	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	26	6	23.1	36	4	11.1	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.3125	1.3125	1	0.575129534	0.575129534	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.3E-09	1	0.0000324	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	166830888	G	C	-	-	-	-	-	-	21	0	0	31	5	16.1	34	6	17.6	31	4	12.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914772727	0.914772727	1	0.911917098	0.911917098	1	2.388888889	2.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000476	1	1.86E-08	1	0.0000177	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	168424502	T	A	-	-	-	-	-	-	18	0	0	40	5	12.5	24	1	4.2	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	0.21761658	0.21761658	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000178	1	0.113346489	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	170649379	T	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	49	11	22.4	50	8	16	30	1	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.272727273	1.272727273	1	0.829015544	0.829015544	1	0.611111111	0.611111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.19E-15	1	1.74E-10	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	171015438	T	C	TNIK	CCDS46956.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	25	6	24	42	9	21.4	49	4	8.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.363636364	1.363636364	1	1.10880829	1.10880829	1	1.518518519	1.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	7.51E-13	1	0.000110643	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	171415716	T	C	PLD1	CCDS46957.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	38	4	10.5	43	7	16.3	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.596590909	0.596590909	1	0.844559585	0.844559585	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000403	1	2.15E-09	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	171459438	T	C	PLD1	CCDS46957.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	54	8	14.8	38	7	18.4	33	7	21.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.840909091	0.840909091	1	0.953367876	0.953367876	1	3.925925926	1.962962963	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.31E-10	1	8.61E-10	1	2.98E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	172627591	C	T	SPATA16	CCDS3221.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	39	9	23.1	51	14	27.5	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.3125	1.3125	1	1.424870466	1.424870466	1	1.611111111	1.611111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.62E-13	1	6.64E-21	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	174204333	C	T	NAALADL2	ENST00000434257	r.?	-	-	intronic	30	0	0	51	5	9.8	34	0	0	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.556818182	0.556818182	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000606	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	177072959	G	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	21	3	14.3	30	10	33.3	24	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.725388601	0.862694301	2	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000155401	1	2.68E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	183398681	C	G	KLHL24	CCDS3246.1	r.3796c>g	c.?	p.?	3'UTR variant	25	0	0	28	4	14.3	37	9	24.3	33	4	12.1	0	0	NA	2	2	100	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.259067358	1.259067358	1	2.240740741	2.240740741	1	5.681818182	2.840909091	2	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000116	0.000025	2.14E-13	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	183412460	A	T	YEATS2	CCDS43175.1	r.?	-	-	upstream	20	0	0	35	5	14.3	25	4	16	27	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	0.829015544	0.829015544	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000895	1	0.00000727	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	185947425	G	T	DGKG	CCDS3274.1	r.?	-	-	intronic	11	0	0	18	4	22.2	23	1	4.3	30	2	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	0.222797927	0.222797927	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000181	1	0.108890944	1	0.009909649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	186068371	T	G	DGKG	CCDS3274.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	51	11	21.6	41	6	14.6	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.227272727	1.227272727	1	0.756476684	0.756476684	1	1.296296296	1.296296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.94E-15	1	6.05E-08	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	187465724	T	C	BCL6	CCDS3289.1	r.?	-	-	upstream	37	0	0	36	0	0	37	5	13.5	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.699481865	0.699481865	1	0.814814815	0.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.00000119	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	187644254	G	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	41	9	22	28	9	32.1	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.25	1.25	1	1.663212435	1.663212435	1	1.944444444	1.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-13	1	1.24E-14	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	190883338	C	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	40	14	35	40	15	37.5	45	7	15.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.988636364	0.994318182	2	1.943005181	0.971502591	2	2.888888889	1.444444444	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.25E-22	1	1.09E-24	1	0.000000003	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	191003619	C	T	UTS2D	CCDS3300.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	33	3	9.1	28	6	21.4	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.517045455	0.517045455	1	1.10880829	1.10880829	1	0.462962963	0.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000609557	1	5.36E-09	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	191485204	T	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	23	4	17.4	34	5	14.7	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.988636364	0.988636364	1	0.761658031	0.761658031	1	1.296296296	1.296296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000513	1	0.000000771	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	191849973	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	50	21	42	48	21	43.8	50	9	18	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.386363636	1.193181818	2	2.269430052	1.134715026	2	3.333333333	1.666666667	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.79E-35	1	9.35E-36	1	4.07E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	193165552	C	T	ATP13A4	CCDS3304.2	r.?	-	-	intronic	42	0	0	35	5	14.3	33	12	36.4	28	1	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.886010363	0.943005181	2	0.666666667	0.666666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000895	1	7.86E-20	1	0.130947004	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	193165784	G	A	ATP13A4	CCDS3304.2	r.?	-	-	intronic	35	0	0	41	10	24.4	30	7	23.3	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.386363636	1.386363636	1	1.207253886	1.207253886	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.51E-15	1	1.44E-10	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	193583124	T	C	-	-	-	-	-	-	18	0	0	29	10	34.5	38	10	26.3	30	1	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.960227273	0.980113636	2	1.362694301	1.362694301	1	0.611111111	0.611111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.79E-16	1	4.06E-15	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	193870273	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	40	8	20	51	7	13.7	25	11	44	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	0.70984456	0.70984456	1	8.148148148	4.074074074	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.61E-11	1	7.46E-09	1	2.04E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	193870287	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	39	4	10.3	49	2	4.1	30	9	30	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.585227273	0.585227273	1	0.212435233	0.212435233	1	5.555555556	2.777777778	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000447	1	0.025168485	1	2.54E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	194504586	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	42	18	42.9	35	18	51.4	47	8	17	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.4375	1.21875	2	2.663212435	1.331606218	2	3.148148148	1.574074074	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.2E-30	1	1.6E-32	1	1.03E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	195498018	G	A	MUC4	CCDS3310.1	r.?	-	-	intronic	15	1	6.7	11	2	18.2	13	4	30.8	38	7	18.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	1.595854922	1.595854922	1	3.407407407	1.703703704	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	0.072431031	1	0.001334363	1	0.000000431	1	8.61E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	196563811	G	A	PAK2	CCDS3321.1	r.?	-	-	downstream	31	0	0	41	8	19.5	29	5	17.2	29	1	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.107954545	1.107954545	1	0.89119171	0.89119171	1	0.62962963	0.62962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.22E-11	1	0.000000336	1	0.135292269	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	3	197855976	G	C	-	-	-	-	-	-	81	0	0	70	2	2.9	106	5	4.7	91	2	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.164772727	0.164772727	1	0.243523316	0.243523316	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.048267597	1	0.000208264	1	0.076482202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	131337	C	G	AC118278.1	ENST00000390127	r.?	-	-	downstream	33	0	0	45	5	11.1	35	9	25.7	59	8	13.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.677158432	0.677158432	1	1.53381083	1.53381083	1	2.926518519	0.975506173	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000323	1	1.23E-13	1	6.9E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	1060617	T	G	RNF212	CCDS3345.1	r.?	-	-	downstream	19	0	0	49	10	20.4	51	12	23.5	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.244507388	1.244507388	1	1.402511849	1.402511849	1	0.925296296	0.925296296	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.72E-14	1	3.24E-17	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	3041651	C	T	GRK4	CCDS33946.1	r.?	-	-	intronic	17	0	0	27	3	11.1	24	5	20.8	27	2	7.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.677158432	0.677158432	1	1.241372189	1.241372189	1	1.59237037	1.59237037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000334187	1	0.000000123	1	0.00807567	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	4317659	G	A	ZBTB49	CCDS3375.1	r.1704g>a	c.1583G>A	p.R528Q	missense	16	0	0	30	9	30	26	2	7.7	30	0	0	562	0	0	297	40	13.5	291	58	19.9	230	20	8.7	TRUE	TRUE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.830157923	1.290017134	1.418708228	0.459546436	0.459546436	1	0	0	1	0.823571065	0.823571065	1	1.18765897	1.18765897	1	1.872111111	0.936055556	2	5	5	1	1	2.54E-14	1.65E-43	0.007502227	8.49E-73	1	1.06E-18	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	4	4431961	T	A	STX18	CCDS3377.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	50	13	26	39	13	33.3	43	7	16.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.586136867	1.586136867	1	1.98738913	1.112268894	1.786788376	3.507518519	1.16917284	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.65E-19	1	8.79E-21	1	2.15E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	5883221	G	A	CRMP1	CCDS33950.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	40	10	25	35	5	14.3	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.525131602	1.525131602	1	0.85344338	0.85344338	1	0.968333333	0.968333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.22E-15	1	0.000000895	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	7291903	C	T	SORCS2	CCDS47008.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	22	4	18.2	19	3	15.8	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.110295807	1.110295807	1	0.942965413	0.942965413	1	0.494925926	0.494925926	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000425	1	0.000114071	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	7421901	G	A	SORCS2	CCDS47008.1	r.?	-	-	intronic	11	0	0	22	4	18.2	31	13	41.9	37	5	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.110295807	1.110295807	1	2.500648786	1.399521521	1.786788376	2.905	0.968333333	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000425	1	2.32E-22	1	0.00000119	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	8424218	T	C	ACOX3	CCDS3401.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	32	9	28.1	26	4	15.4	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.714247921	1.714247921	1	0.919092871	0.919092871	1	0.602518519	0.602518519	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.94E-14	1	0.00000856	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	8583630	C	T	GPR78	CCDS3403.1	r.?	-	-	intronic	14	0	0	15	1	6.7	13	5	38.5	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.408735269	0.408735269	1	2.297732178	1.285956529	1.786788376	0.688592593	0.688592593	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.072431031	1	3.89E-09	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	9494812	C	T	-	-	-	-	-	-	16	0	0	30	6	20	30	0	0	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.220105282	1.220105282	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	4	NA	1	1	8.37E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	10137861	G	T	-	-	-	-	-	-	20	0	0	37	8	21.6	39	13	33.3	36	7	19.4	110	0	0	124	38	30.6	117	42	35.9	134	10	7.5	TRUE	TRUE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.317713705	1.317713705	1	1.98738913	1.112268894	1.786788376	4.174592593	1.391530864	3	1.866761081	1.315817477	1.418708228	2.142560654	1.199112711	1.786788376	1.613888889	1.613888889	1	5	5	1	1	1.33E-11	2.84E-56	8.79E-21	1.79E-65	5.74E-10	2.03E-09	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	4	10193749	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	39	4	10.3	43	12	27.9	63	10	15.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.62835422	0.62835422	1	1.665109812	0.931900965	1.786788376	3.421444444	1.140481481	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000447	1	3.24E-18	1	9.81E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	11414624	G	T	HS3ST1	CCDS3408.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	41	13	31.7	41	5	12.2	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.933866872	1.363118105	1.418708228	0.728112534	0.728112534	1	0.494925926	0.494925926	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.89E-20	1	0.00000202	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	11889165	C	T	-	-	-	-	-	-	21	0	0	29	6	20.7	41	8	19.5	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.262808967	1.262808967	1	1.163786428	1.163786428	1	2.108814815	2.108814815	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.72E-09	1	3.22E-11	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	11924874	A	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	47	10	21.3	45	13	28.9	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.299412125	1.299412125	1	1.724791167	0.965302433	1.786788376	0.43037037	0.43037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.27E-14	1	7.68E-20	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	12331047	C	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	42	3	7.1	33	6	18.2	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.433137375	0.433137375	1	1.086200666	1.086200666	1	0.903777778	0.903777778	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001240292	1	1.54E-08	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	13443954	G	A	RAB28	CCDS3409.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	40	6	15	39	11	28.2	49	3	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.915078961	0.915078961	1	1.683014218	0.941921405	1.786788376	1.31262963	1.31262963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.18E-08	1	7.2E-17	1	0.001939399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	13551805	C	T	-	-	-	-	-	-	20	0	0	30	6	20	47	5	10.6	49	3	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.220105282	1.220105282	1	0.632622366	0.632622366	1	1.31262963	1.31262963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.37E-09	1	0.00000402	1	0.001939399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	15406879	G	A	C1QTNF7	CCDS47025.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	45	9	20	48	7	14.6	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.220105282	1.220105282	1	0.871347787	0.871347787	1	1.656925926	1.656925926	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-12	1	4.81E-09	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	15936812	G	A	FGFBP1	CCDS3418.1	r.?	-	-	downstream	39	0	0	40	4	10	52	16	30.8	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.610052641	0.610052641	1	1.838185742	1.028765223	1.786788376	1.699962963	1.699962963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000495	1	1.33E-24	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	16403246	G	A	-	-	-	-	-	-	11	0	0	30	7	23.3	22	3	13.6	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.421422654	1.421422654	1	0.811666432	0.811666432	1	1.463259259	1.463259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.44E-10	1	0.000179267	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	16514490	G	T	LDB2	CCDS3420.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	43	6	14	46	2	4.3	42	0	0	66	0	0	175	13	7.4	184	5	2.7	234	0	0	TRUE	TRUE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.854073697	0.854073697	1	0.256629828	0.326173893	0.786788376	0	0	1	0.451438954	1.078170726	0.418708228	0.161139659	0.161139659	1	0	0	1	4	3	1	1	8.13E-08	8.45E-12	0.022369545	0.002483183	1	1	YES	1_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	4	16554147	A	C	LDB2	CCDS3420.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	39	2	5.1	46	3	6.5	45	7	15.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.311126847	0.743063608	0.418708228	0.387928809	0.493053559	0.786788376	3.356888889	1.118962963	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.016387522	1	0.001615827	1	0.000000003	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	16808608	C	T	LDB2	CCDS3420.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	49	10	20.4	38	9	23.7	48	2	4.2	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.244507388	1.244507388	1	1.41444812	1.41444812	1	0.903777778	0.903777778	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.72E-14	1	2.79E-13	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	17578049	C	T	LAP3	CCDS3422.1	r.?	-	-	upstream	12	0	0	26	6	23.1	18	3	16.7	31	2	6.5	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.409221601	1.409221601	1	0.996678633	0.996678633	1	1.398703704	1.398703704	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.3E-09	1	0.0000964	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	17700508	A	G	FAM184B	CCDS47033.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	33	5	15.2	59	9	15.3	33	4	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.927280014	0.927280014	1	0.913124736	0.913124736	1	2.603740741	2.603740741	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000066	1	1.96E-11	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	18211698	A	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	43	10	23.3	42	4	9.5	28	3	10.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.421422654	1.421422654	1	0.566972875	0.566972875	1	2.302481481	2.302481481	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.61E-14	1	0.0000601	1	0.000372895	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	18218505	A	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	42	8	19	50	6	12	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.159100018	1.159100018	1	0.716176263	0.716176263	1	1.140481481	1.140481481	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.96E-11	1	0.000000206	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	18305802	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	43	10	23.3	40	10	25	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.421422654	1.421422654	1	1.492033882	1.492033882	1	2.496148148	0.832049383	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.61E-14	1	7.22E-15	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	18703052	T	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	46	4	8.7	59	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.530745798	0.530745798	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.0000862	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	19021342	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	39	10	25.6	44	7	15.9	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.561734761	1.561734761	1	0.948933549	0.948933549	1	1.032888889	1.032888889	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.44E-15	1	2.55E-09	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	19089612	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	53	4	7.5	40	6	15	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.457539481	0.457539481	1	0.895220329	0.895220329	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000150502	1	5.18E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	21490148	C	A	KCNIP4	CCDS43217.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	45	8	17.8	37	6	16.2	53	1	1.9	30	0	0	207	37	17.9	144	25	17.4	208	5	2.4	TRUE	TRUE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.085893701	1.085893701	1	0.966837955	0.966837955	1	0.408851852	0.408851852	1	1.091994227	1.091994227	1	1.038455582	1.038455582	1	0.516444444	0.516444444	1	5	5	1	1	7.14E-11	3.68E-45	3.18E-08	1.08E-30	0.233303855	0.00418367	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	4	21704869	C	G	KCNIP4	CCDS43216.1	r.?	-	-	intronic	20	0	0	41	6	14.6	53	19	35.8	51	7	13.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.890676856	0.890676856	1	2.136592518	1.195772564	1.786788376	2.948037037	0.982679012	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.05E-08	1	1.93E-30	1	7.46E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	21893078	C	A	KCNIP4	CCDS43216.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	23	6	26.1	31	10	32.3	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.592237393	1.592237393	1	1.927707775	1.078867425	1.786788376	1.01137037	1.01137037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-09	1	3.94E-16	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	22152871	A	T	-	-	-	-	-	-	7	0	0	14	5	35.7	24	4	16.7	19	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	2.177887928	2.177887928	1	0.996678633	0.996678633	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.03E-09	1	0.00000613	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	23194759	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	43	7	16.3	62	8	12.9	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.994385805	0.994385805	1	0.769889483	0.769889483	1	1.054407407	1.054407407	1	NA	NA	0	NA	NA	0	0	0	1	5	NA	1	1	2.15E-09	1	1.04E-09	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	23471323	G	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	54	7	13	45	7	15.6	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.793068433	0.793068433	1	0.931029142	0.931029142	1	0.494925926	0.494925926	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.13E-08	1	0.000000003	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	23645306	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	37	8	21.6	49	11	22.4	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.317713705	1.317713705	1	1.336862358	1.336862358	1	1.377185185	1.377185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.33E-11	1	1.19E-15	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	24273828	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	39	5	12.8	42	7	16.7	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.78086738	0.78086738	1	0.996678633	0.996678633	1	0.925296296	0.925296296	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000156	1	1.81E-09	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	25457983	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	40	11	27.5	42	10	23.8	43	6	14	1	0	0	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.677644763	1.182515706	1.418708228	1.420416255	1.420416255	1	3.012592593	1.004197531	3	NA	NA	0	0	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.88E-17	1	1.24E-14	1	8.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	25778490	A	C	SEL1L3	CCDS47037.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	38	3	7.9	45	7	15.6	30	2	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.481941586	0.481941586	1	0.931029142	0.931029142	1	1.441740741	1.441740741	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000925091	1	0.000000003	1	0.009909649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	25841331	G	A	SEL1L3	CCDS47037.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	44	8	18.2	31	5	16.1	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.110295807	1.110295807	1	0.96086982	0.96086982	1	2.108814815	2.108814815	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.9E-11	1	0.000000476	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	26027326	A	T	ENSG00000223895	ENST00000442025	r.?	-	-	intronic	33	0	0	34	4	11.8	43	10	23.3	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.719862116	0.719862116	1	1.390575578	1.390575578	1	0.537962963	0.537962963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000257	1	1.61E-14	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	29591769	T	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	35	3	8.6	49	8	16.3	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.524645271	0.524645271	1	0.972806091	0.972806091	1	0.473407407	0.473407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000725791	1	1.47E-10	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	29592208	G	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	34	0	0	41	4	9.8	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0	0	1	0.584877282	0.584877282	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000546	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	31884233	G	C	-	-	-	-	-	-	30	0	0	40	7	17.5	53	16	30.2	61	11	18	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.067592122	1.067592122	1	1.802376929	1.008724342	1.786788376	3.873333333	1.291111111	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-09	1	1.9E-24	1	1.62E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	32351183	C	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	44	9	20.5	39	8	20.5	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.250607914	1.250607914	1	1.223467783	1.223467783	1	1.570851852	1.570851852	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.18E-12	1	2.09E-11	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	32546386	G	A	-	-	-	-	-	-	17	0	0	37	4	10.8	35	10	28.6	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.658856852	0.658856852	1	1.706886761	0.955281993	1.786788376	1.01137037	1.01137037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000362	1	1.6E-15	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	33132382	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	24	2	8.3	40	10	25	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.506343692	0.506343692	1	1.492033882	1.492033882	1	1.699962963	1.699962963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.006413403	1	7.22E-15	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	33486526	T	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	53	7	13.2	47	9	19.1	56	5	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.805269486	0.805269486	1	1.139913886	1.139913886	1	1.915148148	1.915148148	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.85E-09	1	2.24E-12	1	0.00000965	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	34256836	G	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	45	9	20	43	10	23.3	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.220105282	1.220105282	1	1.390575578	1.390575578	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-12	1	1.61E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	36975148	A	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	49	9	18.4	29	8	27.6	51	4	7.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.122496859	1.122496859	1	1.647205405	1.647205405	1	1.678444444	1.678444444	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.35E-12	1	1.53E-12	1	0.000129466	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	37691603	C	T	RELL1	CCDS43221.1	r.?	-	-	upstream	25	0	0	42	11	26.2	39	11	28.2	29	1	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.598337919	1.598337919	1	1.683014218	0.941921405	1.786788376	0.73162963	0.73162963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.81E-16	1	7.2E-17	1	0.135292269	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	39492000	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	37	8	21.6	36	3	8.3	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.317713705	1.317713705	1	0.495355249	0.495355249	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.33E-11	1	0.000788827	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	41385523	C	T	LIMCH1	CCDS33977.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	33	9	27.3	44	8	18.2	37	3	8.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.66544371	1.66544371	1	1.086200666	1.086200666	1	1.743	1.743	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.76E-14	1	5.9E-11	1	0.000855237	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	42061411	G	T	SLC30A9	CCDS3465.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	32	4	12.5	37	8	21.6	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.762565801	0.762565801	1	1.289117274	1.289117274	1	1.032888889	1.032888889	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000201	1	1.33E-11	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	42113909	G	A	BEND4	CCDS47048.1	r.7811c>u	c.?	p.?	3'UTR variant	34	0	0	53	10	18.9	43	8	18.6	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.152999491	1.152999491	1	1.110073208	1.110073208	1	0.473407407	0.473407407	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.57E-13	1	4.85E-11	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	42321084	T	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	27	1	3.7	30	4	13.3	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.225719477	0.225719477	1	0.793762025	0.793762025	1	0.624037037	0.624037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.126579904	1	0.0000154	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	42484273	C	T	ATP8A1	CCDS3466.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	43	6	14	47	6	12.8	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.854073697	0.854073697	1	0.763921347	0.763921347	1	1.463259259	1.463259259	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.13E-08	1	0.000000141	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	42491425	C	T	ATP8A1	CCDS3466.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	38	11	28.9	46	17	37	37	4	10.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.763052132	1.242716506	1.418708228	2.208210145	1.235854326	1.786788376	2.324	2.324	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.19E-17	1	1.16E-27	1	0.0000362	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	42804890	G	T	-	-	-	-	-	-	10	0	0	17	2	11.8	22	3	13.6	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.719862116	0.719862116	1	0.811666432	0.811666432	1	2.388555556	1.194277778	2	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.003234386	1	0.000179267	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	42941840	T	C	GRXCR1	CCDS43225.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	40	2	5	31	6	19.4	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.30502632	0.728493734	0.418708228	1.157818292	1.157818292	1	1.054407407	1.054407407	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.017193422	1	1.03E-08	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	43268097	G	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	36	6	16.7	55	10	18.2	44	1	2.3	42	2	4.8	157	15	9.6	143	21	14.7	200	12	6	TRUE	TRUE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.01878791	1.01878791	1	1.086200666	1.086200666	1	0.494925926	0.494925926	1	0.585650535	1.398707969	0.418708228	0.877315922	0.877315922	1	1.291111111	1.291111111	1	5	5	1	0.018854633	2.68E-08	5.22E-15	2.33E-13	2.03E-24	0.197923942	6.26E-10	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	4	43427091	T	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	49	15	30.6	38	14	36.8	60	5	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.866761081	1.315817477	1.418708228	2.196273874	1.229174033	1.786788376	1.786037037	1.786037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.1E-23	1	5.28E-23	1	0.0000136	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	45654123	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	45	11	24.4	31	9	29	45	9	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.488528444	1.488528444	1	1.730759303	1.730759303	1	4.303703704	1.434567901	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.24E-16	1	3.57E-14	1	1.47E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	47397909	C	T	GABRB1	CCDS3474.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	39	2	5.1	50	7	14	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.311126847	0.743063608	0.418708228	0.835538974	0.835538974	1	0.537962963	0.537962963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.016387522	1	6.46E-09	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	48184918	C	A	TEC	CCDS3481.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	41	7	17.1	50	6	12	34	0	0	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.043190016	1.043190016	1	0.716176263	0.716176263	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.51E-09	1	0.000000206	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	48479516	G	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	37	5	13.5	32	10	31.2	31	2	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.823571065	0.823571065	1	1.862058284	1.04212581	1.786788376	1.398703704	1.398703704	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000119	1	5.7E-16	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	49490688	C	A	AC119752.1	ENST00000499236	r.?	-	-	intronic	50	0	0	45	7	15.6	31	9	29	54	6	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.95168212	0.95168212	1	1.730759303	1.730759303	1	2.388555556	1.194277778	2	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000003	1	3.57E-14	1	0.000000329	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	53841499	C	A	SCFD2	CCDS33984.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	42	2	4.8	44	8	18.2	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.292825268	0.699353984	0.418708228	1.086200666	1.086200666	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.018854633	1	5.9E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	54165929	T	C	SCFD2	CCDS33984.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	39	7	17.9	41	7	17.1	30	2	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.091994227	1.091994227	1	1.020551175	1.020551175	1	1.441740741	1.441740741	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-09	1	1.51E-09	1	0.009909649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	54361520	C	T	LNX1	CCDS3492.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	44	5	11.4	35	5	14.3	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.695460011	0.695460011	1	0.85344338	0.85344338	1	1.075925926	1.075925926	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000288	1	0.000000895	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	55015507	C	T	FIP1L1	ENST00000507166	r.?	-	-	intronic	8	0	0	13	5	38.5	9	2	22.2	15	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	2.348702668	1.655521989	1.418708228	1.324926087	1.324926087	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.89E-09	1	0.000879235	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	55537449	A	T	KIT	CCDS3496.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	32	7	21.9	41	6	14.6	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.336015284	1.336015284	1	0.871347787	0.871347787	1	0.968333333	0.968333333	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.36E-10	1	6.05E-08	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	55539805	C	T	KIT	CCDS3496.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	31	2	6.5	40	6	15	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.396534217	0.396534217	1	0.895220329	0.895220329	1	1.89362963	1.89362963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.010558179	1	5.18E-08	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	55949436	G	A	KDR	CCDS3497.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	43	9	20.9	43	10	23.3	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.27501002	1.27501002	1	1.390575578	1.390575578	1	1.829074074	1.829074074	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.45E-13	1	1.61E-14	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	56379442	G	C	CLOCK	CCDS3500.1	r.?	-	-	upstream	26	0	0	40	7	17.5	40	3	7.5	30	3	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.067592122	1.067592122	1	0.447610164	0.447610164	1	2.151851852	2.151851852	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-09	1	0.001075403	1	0.000458697	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	57476413	G	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	29	2	6.9	43	7	16.3	55	5	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.420936322	0.420936322	1	0.972806091	0.972806091	1	1.958185185	1.958185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.009279585	1	2.15E-09	1	0.00000883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	58653329	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	48	6	12.5	38	2	5.3	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.762565801	0.762565801	1	0.316311183	0.402028287	0.786788376	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000016	1	0.015598339	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	59014531	T	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	37	7	18.9	56	12	21.4	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.152999491	1.152999491	1	1.277181003	1.277181003	1	1.398703704	1.398703704	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.05E-10	1	1.11E-16	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	59622392	C	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	47	12	25.5	30	10	33.3	55	11	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.555634235	1.555634235	1	1.98738913	1.112268894	1.786788376	4.303703704	1.434567901	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.09E-17	1	2.68E-16	1	4.77E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	59636448	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	47	10	21.3	49	2	4.1	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.299412125	1.299412125	1	0.244693557	0.311003014	0.786788376	0.451888889	0.451888889	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.27E-14	1	0.025168485	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	60116434	G	A	-	-	-	-	-	-	31	1	3.2	42	10	23.8	44	10	22.7	53	6	11.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.451925286	1.451925286	1	1.354766764	1.354766764	1	2.431592593	0.810530864	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	0.143917729	1	1.24E-14	1	2.08E-14	1	0.000000293	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	60886055	G	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	43	7	16.3	50	10	20	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.994385805	0.994385805	1	1.193627105	1.193627105	1	1.441740741	1.441740741	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.15E-09	1	8.36E-14	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	61188652	T	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	38	4	10.5	53	6	11.3	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.640555273	0.640555273	1	0.674399314	0.674399314	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000403	1	0.000000293	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	61763044	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	35	1	2.9	51	6	11.8	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.176915266	0.176915266	1	0.704239992	0.704239992	1	1.829074074	1.829074074	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.16091139	1	0.000000232	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	61900758	G	C	-	-	-	-	-	-	37	0	0	42	5	11.9	39	1	2.6	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.725962643	0.725962643	1	0.155171524	0.155171524	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000228	1	0.177567718	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	62359133	T	A	LPHN3	ENST00000512091	r.?	-	-	intronic	32	0	0	39	1	2.6	45	4	8.9	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.158613687	0.158613687	1	0.531164062	0.531164062	1	0.494925926	0.494925926	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.177567718	1	0.0000791	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	63620722	T	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	41	10	24.4	34	9	26.5	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.488528444	1.488528444	1	1.581555914	1.581555914	1	2.108814815	2.108814815	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.51E-15	1	9.15E-14	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	63808515	C	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	37	9	24.3	46	10	21.7	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.482427918	1.482427918	1	1.295085409	1.295085409	1	1.527814815	1.527814815	1	NA	NA	0	NA	NA	0	0	0	1	5	NA	1	1	2.14E-13	1	3.38E-14	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	64017679	T	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	56	8	14.3	59	8	13.6	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.872375277	0.872375277	1	0.811666432	0.811666432	1	1.377185185	1.377185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.48E-10	1	6.9E-10	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	65482580	G	C	-	-	-	-	-	-	21	0	0	31	5	16.1	31	7	22.6	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.982184752	0.982184752	1	1.348798629	1.348798629	1	1.527814815	1.527814815	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000476	1	1.85E-10	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	65752974	G	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	40	3	7.5	45	9	20	46	8	17.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.457539481	0.457539481	1	1.193627105	1.193627105	1	3.744222222	1.248074074	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001075403	1	1.47E-12	1	8.61E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	65964771	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	49	6	12.2	44	5	11.4	50	6	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.744264222	0.744264222	1	0.68036745	0.68036745	1	2.582222222	0.860740741	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000182	1	0.00000288	1	0.000000206	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	66383588	C	G	EPHA5	CCDS3513.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	37	7	18.9	51	8	15.7	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.152999491	1.152999491	1	0.936997278	0.936997278	1	0.581	0.581	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.05E-10	1	2.05E-10	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	66458308	C	G	EPHA5	CCDS3513.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	45	5	11.1	48	1	2.1	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.677158432	0.677158432	1	0.125330846	0.125330846	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000323	1	0.213845552	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	66507786	A	G	EPHA5	CCDS3513.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	36	7	19.4	45	9	20	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.183502124	1.183502124	1	1.193627105	1.193627105	1	1.097444444	1.097444444	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.74E-10	1	1.47E-12	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	66937400	C	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	51	14	27.5	46	8	17.4	63	2	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.677644763	1.182515706	1.418708228	1.038455582	1.038455582	1	0.688592593	0.688592593	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.64E-21	1	8.61E-11	1	0.03993132	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	67056989	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	44	7	15.9	37	4	10.8	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.969983699	0.969983699	1	0.644558637	0.644558637	1	0.451888889	0.451888889	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	0.0000362	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	67080237	G	A	-	-	-	-	-	-	9	0	0	17	5	29.4	14	2	14.3	31	2	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.793554765	1.793554765	1	0.85344338	0.85344338	1	1.398703704	1.398703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.84E-08	1	0.002185852	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	67330402	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	36	5	13.9	34	6	17.6	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.847973171	0.847973171	1	1.050391853	1.050391853	1	1.226555556	1.226555556	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000104	1	1.86E-08	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	69969791	G	A	UGT2B7	CCDS3526.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	42	7	16.7	54	5	9.3	41	6	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.01878791	1.01878791	1	0.555036604	0.555036604	1	3.141703704	1.047234568	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.81E-09	1	0.00000806	1	6.05E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	73092676	T	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	37	7	18.9	41	5	12.2	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.152999491	1.152999491	1	0.728112534	0.728112534	1	1.269592593	1.269592593	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.05E-10	1	0.00000202	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	74668510	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	40	9	22.5	59	19	32.2	42	5	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.372618442	1.372618442	1	1.92173964	1.075527279	1.786788376	2.560703704	0.853567901	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.64E-13	1	2.2E-29	1	0.00000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	79331399	T	A	FRAS1	ENST00000264895	r.?	-	-	intronic	37	0	0	42	3	7.1	35	3	8.6	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.433137375	0.433137375	1	0.513259655	0.513259655	1	1.958185185	1.958185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001240292	1	0.000725791	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	79493383	A	G	ANXA3	CCDS3584.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	40	8	20	42	8	19	49	5	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.220105282	1.220105282	1	1.13394575	1.13394575	1	2.194888889	2.194888889	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.61E-11	1	3.96E-11	1	0.00000496	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	80193070	G	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	43	1	2.3	35	6	17.1	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.140312107	0.140312107	1	1.020551175	1.020551175	1	2.001222222	2.001222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.193893409	1	2.24E-08	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	80438788	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	42	7	16.7	44	9	20.5	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.01878791	1.01878791	1	1.223467783	1.223467783	1	1.377185185	1.377185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.81E-09	1	1.18E-12	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	80770695	G	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	45	6	13.3	49	7	14.3	54	2	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.811370013	0.811370013	1	0.85344338	0.85344338	1	0.796185185	0.796185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	0	0	1	5	NA	1	1	0.000000108	1	5.58E-09	1	0.030129377	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	81472177	A	T	C4orf22	CCDS3587.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	44	5	11.4	48	11	22.9	39	5	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.695460011	0.695460011	1	1.366703036	1.366703036	1	2.75437037	0.918123457	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000288	1	9.31E-16	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	81697529	T	C	C4orf22	CCDS3587.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	43	1	2.3	46	6	13	61	2	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.140312107	0.140312107	1	0.775857618	0.775857618	1	0.710111111	0.710111111	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.193893409	1	0.000000123	1	0.037660755	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	83137166	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	42	8	19	59	10	16.9	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.159100018	1.159100018	1	1.008614904	1.008614904	1	1.032888889	1.032888889	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.96E-11	1	4.91E-13	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	83604210	T	C	SCD5	CCDS34024.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	29	8	27.6	39	13	33.3	54	6	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.683745289	1.683745289	1	1.98738913	1.112268894	1.786788376	2.388555556	1.194277778	2	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.53E-12	1	8.79E-21	1	0.000000329	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	86436571	C	G	ARHGAP24	CCDS34025.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	33	8	24.2	37	5	13.5	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.476327391	1.476327391	1	0.805698296	0.805698296	1	1.31262963	1.31262963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-12	1	0.00000119	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	87028869	G	A	MAPK10	CCDS3612.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	51	2	3.9	49	7	14.3	50	2	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.23792053	0.568225112	0.418708228	0.85344338	0.85344338	1	0.860740741	0.860740741	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.027109304	1	5.58E-09	1	0.026131524	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	91286562	T	A	FAM190A	CCDS47100.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	52	15	28.8	40	12	30	63	2	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.756951606	1.238416449	1.418708228	1.790440658	1.002044048	1.786788376	0.688592593	0.688592593	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.15E-22	1	1.2E-18	1	0.03993132	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	91792990	C	T	FAM190A	CCDS47099.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	30	7	23.3	36	7	19.4	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.421422654	1.421422654	1	1.157818292	1.157818292	1	1.269592593	1.269592593	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.44E-10	1	5.74E-10	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	93939186	A	C	GRID2	CCDS3637.1	r.?	-	-	intronic	14	0	0	34	2	5.9	39	5	12.8	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.359931058	0.359931058	1	0.763921347	0.763921347	1	1.463259259	1.463259259	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.012612579	1	0.00000156	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	97741738	G	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	42	4	9.5	44	10	22.7	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.579550009	0.579550009	1	1.354766764	1.354766764	1	1.463259259	1.463259259	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000601	1	2.08E-14	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	97913031	A	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	42	7	16.7	54	12	22.2	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.01878791	1.01878791	1	1.324926087	1.324926087	1	0.903777778	0.903777778	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.81E-09	1	6.9E-17	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	98828282	C	A	C4orf37	CCDS3645.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	48	15	31.2	46	17	37	40	5	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.90336424	1.34161782	1.418708228	2.208210145	1.235854326	1.786788376	2.689814815	0.896604938	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.86E-23	1	1.16E-27	1	0.00000178	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	99758120	C	T	-	-	-	-	-	-	11	0	0	15	2	13.3	24	5	20.8	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.811370013	0.811370013	1	1.241372189	1.241372189	1	0.645555556	0.645555556	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.002513772	1	0.000000123	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	100159143	C	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	56	10	17.9	47	8	17	28	4	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.091994227	1.091994227	1	1.014583039	1.014583039	1	3.077148148	1.025716049	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.82E-13	1	1.03E-10	1	0.0000116	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	100506643	T	A	MTTP	CCDS3651.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	47	6	12.8	42	4	9.5	55	0	0	70	0	0	284	38	13.4	260	54	20.8	315	16	5.1	TRUE	TRUE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.78086738	0.78086738	1	0.566972875	0.566972875	1	0	0	1	0.817470539	0.817470539	1	1.241372189	1.241372189	1	1.097444444	1.097444444	1	5	5	1	1	0.000000141	2.64E-41	0.0000601	5.97E-69	1	1.14E-11	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	4	101440749	A	T	EMCN	CCDS3655.1	r.?	-	-	upstream	30	0	0	55	10	18.2	46	20	43.5	48	9	18.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.110295807	1.110295807	1	2.596138954	1.45296387	1.786788376	4.045481481	1.348493827	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.33E-13	1	4.72E-34	1	2.75E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	101542522	C	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	48	15	31.2	45	12	26.7	39	4	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.90336424	1.34161782	1.418708228	1.593492186	1.593492186	1	2.216407407	2.216407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.86E-23	1	6.03E-18	1	0.0000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	102529970	C	A	BANK1	ENST00000504592	r.?	-	-	intronic	34	0	0	39	8	20.5	42	10	23.8	44	2	4.5	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.250607914	1.250607914	1	1.420416255	1.420416255	1	0.968333333	0.968333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.09E-11	1	1.24E-14	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	103220904	C	A	SLC39A8	CCDS47117.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	51	2	3.9	53	4	7.5	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.23792053	0.568225112	0.418708228	0.447610164	0.447610164	1	1.205037037	1.205037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.027109304	1	0.000150502	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	103884466	T	C	NHEDC1	CCDS34041.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	41	5	12.2	39	11	28.2	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.744264222	0.744264222	1	1.683014218	0.941921405	1.786788376	1.226555556	1.226555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000202	1	7.2E-17	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	103888693	G	C	NHEDC1	CCDS34041.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	52	4	7.7	50	0	0	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.469740534	0.469740534	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000139698	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	104080525	T	C	CENPE	CCDS34042.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	63	13	20.6	56	9	16.1	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.25670844	1.25670844	1	0.96086982	0.96086982	1	1.699962963	1.699962963	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.01E-17	1	1.2E-11	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	104685474	T	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	41	6	14.6	37	5	13.5	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.890676856	0.890676856	1	0.805698296	0.805698296	1	0.516444444	0.516444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.05E-08	1	0.00000119	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	107383561	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	47	14	29.8	44	9	20.5	55	5	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.81795687	1.28141702	1.418708228	1.223467783	1.223467783	1	1.958185185	1.958185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.79E-21	1	1.18E-12	1	0.00000883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	108590359	G	A	PAPSS1	CCDS3676.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	48	8	16.7	45	11	24.4	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.01878791	1.01878791	1	1.456225068	1.456225068	1	1.463259259	1.463259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.23E-10	1	4.24E-16	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	108688994	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	52	15	28.8	46	6	13	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.756951606	1.238416449	1.418708228	0.775857618	0.775857618	1	0.925296296	0.925296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.15E-22	1	0.000000123	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	108912289	C	G	HADH	CCDS3678.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	27	2	7.4	30	6	20	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.451438954	0.451438954	1	1.193627105	1.193627105	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00807567	1	8.37E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	109001289	C	G	LEF1	CCDS3679.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	46	10	21.7	45	5	11.1	58	1	1.7	55	0	0	195	21	10.8	151	17	11.3	259	26	10	TRUE	TRUE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.323814231	1.323814231	1	0.662463043	0.662463043	1	0.365814815	0.365814815	1	0.658856852	0.658856852	1	0.674399314	0.857154649	0.786788376	2.151851852	1.075925926	2	5	4	1	1	3.38E-14	1.64E-21	0.00000323	4.93E-18	0.252280541	1.83E-25	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	4	109081117	C	T	LEF1	CCDS3679.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	44	7	15.9	57	15	26.3	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.969983699	0.969983699	1	1.569619643	0.878458616	1.786788376	1.032888889	1.032888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	5.53E-22	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	109172488	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	44	11	25	31	2	6.5	41	1	2.4	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.525131602	1.525131602	1	0.387928809	0.387928809	1	0.516444444	0.516444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.22E-16	1	0.010558179	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	109175560	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	57	4	7	38	5	13.2	49	5	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.427036849	1.019891227	0.418708228	0.787793889	0.787793889	1	2.194888889	2.194888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000199821	1	0.00000137	1	0.00000496	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	109886237	T	C	COL25A1	CCDS43258.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	41	7	17.1	58	5	8.6	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.043190016	1.043190016	1	0.513259655	0.513259655	1	1.570851852	1.570851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.51E-09	1	0.0000115	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	110171201	C	T	COL25A1	CCDS43258.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	37	7	18.9	38	9	23.7	35	3	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.152999491	1.152999491	1	1.41444812	1.41444812	1	1.850592593	1.850592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.05E-10	1	2.79E-13	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	110815244	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	38	6	15.8	53	21	39.6	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.963883173	0.963883173	1	2.363381668	1.322698144	1.786788376	2.345518519	1.172759259	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.76E-08	1	1.3E-34	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	111089081	G	A	ELOVL6	CCDS3690.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	34	5	14.7	37	8	21.6	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.896777382	0.896777382	1	1.289117274	1.289117274	1	1.656925926	1.656925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000771	1	1.33E-11	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	111473892	A	G	ENPEP	CCDS3691.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	52	12	23.1	49	16	32.7	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.409221601	1.409221601	1	1.951580317	1.092228013	1.786788376	1.915148148	1.915148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.19E-17	1	4.37E-25	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	111938688	G	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	48	6	12.5	39	7	17.9	53	3	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.762565801	0.762565801	1	1.068296259	1.068296259	1	1.226555556	1.226555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000016	1	1.04E-09	1	0.002429596	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	111961462	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	46	9	19.6	43	3	7	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.195703176	1.195703176	1	0.417769487	0.417769487	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.82E-12	1	0.001328364	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	112195724	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	36	5	13.9	52	8	15.4	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.847973171	0.847973171	1	0.919092871	0.919092871	1	0.602518519	0.602518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000104	1	2.42E-10	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	112866064	T	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	43	8	18.6	35	6	17.1	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.134697912	1.134697912	1	1.020551175	1.020551175	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-11	1	2.24E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	113726506	C	T	-	-	-	-	-	-	18	0	0	32	6	18.8	40	13	32.5	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.146898965	1.146898965	1	1.939644046	1.085547719	1.786788376	1.786037037	1.786037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.27E-08	1	1.3E-20	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	113805291	A	G	ANK2	ENST00000506722	r.?	-	-	intronic	35	0	0	31	3	9.7	34	9	26.5	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.591751062	0.591751062	1	1.581555914	1.581555914	1	1.463259259	1.463259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000505952	1	9.15E-14	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	115622735	A	G	-	-	-	-	-	-	32	0	0	47	11	23.4	36	16	44.4	40	5	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.42752318	1.42752318	1	2.649852174	1.483025192	1.786788376	2.689814815	0.896604938	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.21E-16	1	1.01E-27	1	0.00000178	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	116518867	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	47	10	21.3	49	6	12.2	49	2	4.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.299412125	1.299412125	1	0.728112534	0.728112534	1	0.882259259	0.882259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.27E-14	1	0.000000182	1	0.025168485	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	116709074	A	G	-	-	-	-	-	-	26	0	0	41	6	14.6	34	11	32.4	49	8	16.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.890676856	0.890676856	1	1.933675911	1.082207572	1.786788376	3.507518519	1.16917284	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.05E-08	1	1.26E-17	1	1.47E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	116710695	A	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	31	6	19.4	52	15	28.8	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.183502124	1.183502124	1	1.718823032	0.961962286	1.786788376	2.001222222	2.001222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.03E-08	1	1.15E-22	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	116831607	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	44	4	9.1	41	5	12.2	60	3	5	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.555147903	0.555147903	1	0.728112534	0.728112534	1	1.075925926	1.075925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000723	1	0.00000202	1	0.003458198	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	117295181	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	41	7	17.1	48	7	14.6	56	10	17.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.043190016	1.043190016	1	0.871347787	0.871347787	1	3.851814815	1.283938272	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.51E-09	1	4.81E-09	1	2.82E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	118000505	G	T	TRAM1L1	CCDS3707.1	r.?	-	-	downstream	34	0	0	50	9	18	49	12	24.5	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.098094754	1.098094754	1	1.462193204	1.462193204	1	1.269592593	1.269592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.07E-12	1	1.9E-17	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	118107075	T	C	-	-	-	-	-	-	37	0	0	35	4	11.4	48	2	4.2	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.695460011	0.695460011	1	0.250661692	0.318588454	0.786788376	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.0000289	1	0.024220359	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	118235846	C	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	37	8	21.6	55	14	25.5	48	5	10.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.317713705	1.317713705	1	1.521874559	1.521874559	1	2.237925926	2.237925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.33E-11	1	2.19E-20	1	0.00000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	118737605	C	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	40	6	15	28	8	28.6	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.915078961	0.915078961	1	1.706886761	1.706886761	1	1.613888889	1.613888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	5.18E-08	1	1.11E-12	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	118953630	C	T	NDST3	CCDS3708.1	r.?	-	-	upstream	11	0	0	15	3	20	18	4	22.2	53	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.220105282	1.220105282	1	1.324926087	1.324926087	1	0.408851852	0.408851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000544	1	0.00000181	1	0.233303855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	119060867	C	A	NDST3	CCDS3708.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	58	0	0	42	0	0	51	4	7.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0	0	1	0	0	1	1.678444444	1.678444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.000129466	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	119623249	T	G	METTL14	CCDS34053.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	43	15	34.9	43	15	34.9	53	6	11.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	2.129083717	1.500719933	1.418708228	2.082879299	1.165711243	1.786788376	2.431592593	0.810530864	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.05E-24	1	4.05E-24	1	0.000000293	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	120784038	C	T	-	-	-	-	-	-	20	0	0	40	2	5	28	5	17.9	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.30502632	0.728493734	0.418708228	1.068296259	1.068296259	1	1.162	1.162	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.017193422	1	0.000000279	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	120997165	T	C	-	-	-	-	-	-	16	0	0	46	6	13	34	4	11.8	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.793068433	0.793068433	1	0.704239992	0.704239992	1	0.946814815	0.946814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000123	1	0.0000257	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	121865182	A	G	-	-	-	-	-	-	19	0	0	33	5	15.2	13	4	30.8	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.927280014	0.927280014	1	1.838185742	1.838185742	1	0.946814815	0.946814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000066	1	0.000000431	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	122470042	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	42	9	21.4	55	8	14.5	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.305512652	1.305512652	1	0.865379651	0.865379651	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.51E-13	1	3.86E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	122556436	G	C	-	-	-	-	-	-	15	0	0	39	12	30.8	40	13	32.5	40	4	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.878962134	1.324417591	1.418708228	1.939644046	1.085547719	1.786788376	2.151851852	2.151851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.43E-19	1	1.3E-20	1	0.0000495	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	123234605	C	T	KIAA1109	CCDS43267.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	57	9	15.8	50	13	26	40	4	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.963883173	0.963883173	1	1.551715237	1.551715237	1	2.151851852	2.151851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.42E-11	1	3.65E-19	1	0.0000495	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	123363003	C	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	34	0	0	44	4	9.1	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0	0	1	0.543100333	0.543100333	1	1.269592593	1.269592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.0000723	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	123727341	G	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	51	4	7.8	63	11	17.5	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.47584106	0.47584106	1	1.044423717	1.044423717	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000129466	1	2.37E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	123731510	C	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	29	9	31	26	4	15.4	34	4	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.891163187	1.333017706	1.418708228	0.919092871	0.919092871	1	2.539185185	2.539185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.79E-14	1	0.00000856	1	0.0000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	123860847	A	G	SPATA5	CCDS3730.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	39	5	12.8	27	5	18.5	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.78086738	0.78086738	1	1.104105072	1.104105072	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000156	1	0.00000023	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	124599900	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	49	9	18.4	47	8	17	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.122496859	1.122496859	1	1.014583039	1.014583039	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.35E-12	1	1.03E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	124620886	T	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	39	6	15.4	46	11	23.9	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.939481067	0.939481067	1	1.426384391	1.426384391	1	1.162	1.162	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.43E-08	1	5.55E-16	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	125042444	A	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	40	9	22.5	40	6	15	49	3	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.372618442	1.372618442	1	0.895220329	0.895220329	1	1.31262963	1.31262963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.64E-13	1	5.18E-08	1	0.001939399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	127080803	G	C	-	-	-	-	-	-	37	0	0	44	10	22.7	36	10	27.8	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.384819495	1.384819495	1	1.659141676	1.659141676	1	1.463259259	1.463259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.08E-14	1	2.21E-15	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	127581795	G	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	41	7	17.1	41	8	19.5	61	6	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.043190016	1.043190016	1	1.163786428	1.163786428	1	2.108814815	2.108814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.51E-09	1	3.22E-11	1	0.000000685	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	128350322	C	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	48	10	20.8	46	13	28.3	44	6	13.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.268909493	1.268909493	1	1.688982354	0.945261552	1.786788376	2.926518519	0.975506173	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.37E-14	1	1.07E-19	1	9.37E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	130338788	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	46	7	15.2	47	1	2.1	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.927280014	0.927280014	1	0.125330846	0.125330846	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	3.53E-09	1	0.209895027	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	130534821	T	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	43	6	14	41	13	31.7	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.854073697	0.854073697	1	1.891898962	1.058826544	1.786788376	0.537962963	0.537962963	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.13E-08	1	1.89E-20	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	131282903	C	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	36	11	30.6	40	10	25	29	3	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.866761081	1.315817477	1.418708228	1.492033882	1.492033882	1	2.216407407	2.216407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.62E-17	1	7.22E-15	1	0.000414371	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	131714924	A	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	42	10	23.8	38	11	28.9	54	7	13	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.451925286	1.451925286	1	1.724791167	0.965302433	1.786788376	2.797407407	0.932469136	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.24E-14	1	5.19E-17	1	1.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	132280034	T	C	-	-	-	-	-	-	30	0	0	57	9	15.8	51	5	9.8	52	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.963883173	0.963883173	1	0.584877282	0.584877282	1	0.817703704	0.817703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.42E-11	1	0.00000606	1	0.028101652	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	133065494	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	48	10	20.8	43	11	25.6	52	4	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.268909493	1.268909493	1	1.527842695	1.527842695	1	1.656925926	1.656925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.37E-14	1	2.42E-16	1	0.000139698	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	135615824	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	43	9	20.9	41	3	7.3	51	0	0	79	0	0	211	27	12.8	239	3	1.3	239	0	0	TRUE	TRUE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.27501002	1.27501002	1	0.435673893	0.435673893	1	0	0	1	0.78086738	0.78086738	1	0.077585762	0.077585762	1	0	0	1	5	3	1	1	9.45E-13	2.82E-29	0.001155993	0.118993221	1	1	YES	1_1	1_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	4	135642499	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	49	9	18.4	36	8	22.2	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.122496859	1.122496859	1	1.324926087	1.324926087	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.35E-12	1	1.04E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	135725562	A	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	42	9	21.4	53	16	30.2	56	8	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.305512652	1.305512652	1	1.802376929	1.008724342	1.786788376	3.077148148	1.025716049	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.51E-13	1	1.9E-24	1	4.48E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	136636093	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	34	8	23.5	34	7	20.6	67	1	1.5	150	1	0.7	273	44	16.1	173	27	15.6	297	18	6.1	TRUE	TRUE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.433623706	1.433623706	1	1.229435918	1.229435918	1	0.322777778	0.322777778	1	0.982184752	0.982184752	1	0.931029142	0.931029142	1	1.31262963	1.31262963	1	5	5	1	0.528521263	6.32E-12	2.77E-51	3.73E-10	1.06E-31	0.285262761	3.04E-14	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	4	137035180	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	46	8	17.4	42	11	26.2	48	6	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.061491595	1.061491595	1	1.563651508	1.563651508	1	2.689814815	0.896604938	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-11	1	1.81E-16	1	0.00000016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	137767985	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	44	12	27.3	43	11	25.6	42	7	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.66544371	1.173915592	1.418708228	1.527842695	1.527842695	1	3.593592593	1.197864198	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.44E-18	1	2.42E-16	1	1.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	137782515	C	T	-	-	-	-	-	-	21	0	0	43	8	18.6	37	6	16.2	49	2	4.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.134697912	1.134697912	1	0.966837955	0.966837955	1	0.882259259	0.882259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-11	1	3.18E-08	1	0.025168485	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	138119864	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	45	11	24.4	45	11	24.4	67	4	6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.488528444	1.488528444	1	1.456225068	1.456225068	1	1.291111111	1.291111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.24E-16	1	4.24E-16	1	0.000372648	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	138936242	A	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	42	9	21.4	51	7	13.7	52	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.305512652	1.305512652	1	0.817634567	0.817634567	1	0.817703704	0.817703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.51E-13	1	7.46E-09	1	0.028101652	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	140942429	T	C	MAML3	CCDS43266.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	45	9	20	49	11	22.4	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.220105282	1.220105282	1	1.336862358	1.336862358	1	1.463259259	1.463259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-12	1	1.19E-15	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	140942452	G	A	MAML3	CCDS43266.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	46	9	19.6	46	11	23.9	50	4	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.195703176	1.195703176	1	1.426384391	1.426384391	1	1.721481481	1.721481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.82E-12	1	5.55E-16	1	0.000119787	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	141183794	G	A	SCOC	CCDS3750.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	43	9	20.9	45	9	20	30	2	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.27501002	1.27501002	1	1.193627105	1.193627105	1	1.441740741	1.441740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.45E-13	1	1.47E-12	1	0.009909649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	141294584	C	T	SCOC	CCDS3750.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	20	4	20	23	2	8.7	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.220105282	1.220105282	1	0.519227791	0.519227791	1	0.946814815	0.946814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000284	1	0.00589844	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	143750062	G	T	INPP4B	CCDS47112.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	44	5	11.4	37	12	32.4	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.695460011	0.695460011	1	1.933675911	1.082207572	1.786788376	0.537962963	0.537962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	0.00000288	1	4.03E-19	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	144952676	G	A	GYPB	ENST00000283126	r.?	-	-	intronic	40	0	0	47	12	25.5	55	5	9.1	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.555634235	1.555634235	1	0.543100333	0.543100333	1	1.829074074	1.829074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.09E-17	1	0.00000883	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	145431380	C	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	35	11	31.4	50	13	26	35	4	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.915565293	1.350217934	1.418708228	1.551715237	1.551715237	1	2.453111111	2.453111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.82E-17	1	3.65E-19	1	0.0000289	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	145530626	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	36	9	25	31	11	35.5	27	3	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.525131602	1.525131602	1	2.118688112	1.185752124	1.786788376	2.388555556	2.388555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.63E-13	1	3.77E-18	1	0.000334187	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	145845991	A	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	39	7	17.9	44	8	18.2	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.091994227	1.091994227	1	1.086200666	1.086200666	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-09	1	5.9E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	145877880	T	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	44	9	20.5	40	1	2.5	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.250607914	1.250607914	1	0.149203388	0.149203388	1	1.699962963	1.699962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.18E-12	1	0.181679879	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	146856909	G	A	ZNF827	CCDS34072.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	26	5	19.2	35	6	17.1	54	2	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.171301071	1.171301071	1	1.020551175	1.020551175	1	0.796185185	0.796185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000188	1	2.24E-08	1	0.030129377	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	146988151	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	35	4	11.4	53	8	15.1	44	5	11.4	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.695460011	0.695460011	1	0.901188464	0.901188464	1	2.453111111	0.817703704	3	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000289	1	2.83E-10	1	0.00000288	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	148176751	C	T	-	-	-	-	-	-	20	0	0	25	0	0	20	8	40	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0	0	1	2.387254211	1.336058731	1.786788376	0.624037037	0.624037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1	1	4.66E-14	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	148436114	C	T	EDNRA	CCDS3769.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	31	5	16.1	34	6	17.6	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.982184752	0.982184752	1	1.050391853	1.050391853	1	0.624037037	0.624037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000476	1	1.86E-08	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	149592971	T	C	-	-	-	-	-	-	48	0	0	41	9	22	42	6	14.3	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.34211581	1.34211581	1	0.85344338	0.85344338	1	0	0	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-13	1	7.02E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	149706665	C	G	-	-	-	-	-	-	20	0	0	45	8	17.8	28	1	3.6	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.085893701	1.085893701	1	0.214852879	0.214852879	1	0.946814815	0.946814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.14E-11	1	0.130947004	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	151520833	G	T	LRBA	CCDS3773.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	44	11	25	50	14	28	47	9	19.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.525131602	1.525131602	1	1.671077947	0.935241112	1.786788376	4.110037037	1.370012346	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.22E-16	1	4.84E-21	1	2.24E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	153038760	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	34	6	17.6	32	4	12.5	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.073692648	1.073692648	1	0.746016941	0.746016941	1	0.968333333	0.968333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.86E-08	1	0.0000201	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	153312756	C	G	FBXW7	CCDS3777.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	38	3	7.9	51	8	15.7	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.481941586	0.481941586	1	0.936997278	0.936997278	1	2.001222222	2.001222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000925091	1	2.05E-10	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	153511459	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	41	8	19.5	41	11	26.8	49	5	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.18960265	1.18960265	1	1.599460321	1.599460321	1	2.194888889	2.194888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.22E-11	1	1.34E-16	1	0.00000496	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	154398236	A	G	KIAA0922	CCDS3783.2	r.?	-	-	intronic	19	0	0	46	16	34.8	42	11	26.2	32	7	21.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	2.122983191	1.496419876	1.418708228	1.563651508	1.563651508	1	4.712555556	1.570851852	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.31E-25	1	1.81E-16	1	2.36E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	154419209	G	T	KIAA0922	CCDS3783.2	r.?	-	-	intronic	27	0	0	39	7	17.9	33	8	24.2	33	5	15.2	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.091994227	1.091994227	1	1.444288797	1.444288797	1	3.270814815	1.090271605	3	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-09	1	4.85E-12	1	0.00000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	155180107	A	C	DCHS2	CCDS3785.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	27	2	7.4	49	6	12.2	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.451438954	0.451438954	1	0.728112534	0.728112534	1	0.602518519	0.602518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00807567	1	0.000000182	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	155367280	G	A	DCHS2	CCDS47150.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	37	9	24.3	45	5	11.1	54	2	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.482427918	1.482427918	1	0.662463043	0.662463043	1	0.796185185	0.796185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.14E-13	1	0.00000323	1	0.030129377	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	155831116	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	49	11	22.4	41	5	12.2	44	6	13.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.366517916	1.366517916	1	0.728112534	0.728112534	1	2.926518519	0.975506173	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.19E-15	1	0.00000202	1	9.37E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	156725502	C	T	GUCY1B3	CCDS47154.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	37	5	13.5	46	9	19.6	52	4	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.823571065	0.823571065	1	1.169754563	1.169754563	1	1.656925926	1.656925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000119	1	1.82E-12	1	0.000139698	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	157266961	C	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	40	2	5	41	4	9.8	57	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.30502632	0.728493734	0.418708228	0.584877282	0.584877282	1	0.387333333	0.387333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.017193422	1	0.0000546	1	0.248523156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	157301076	A	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	46	16	34.8	43	14	32.6	49	7	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	2.122983191	1.496419876	1.418708228	1.945612182	1.088887866	1.786788376	3.077148148	1.025716049	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.31E-25	1	4.18E-22	1	5.58E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	157343038	T	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	49	9	18.4	45	12	26.7	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.122496859	1.122496859	1	1.593492186	1.593492186	1	1.398703704	1.398703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.35E-12	1	6.03E-18	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	158221699	G	T	GRIA2	CCDS43275.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	44	4	9.1	43	4	9.3	54	2	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.555147903	0.555147903	1	0.555036604	0.555036604	1	0.796185185	0.796185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000723	1	0.000066	1	0.030129377	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	159856197	G	T	C4orf45	CCDS47156.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	34	2	5.9	49	7	14.3	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.359931058	0.359931058	1	0.85344338	0.85344338	1	0.559481481	0.559481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.012612579	1	5.58E-09	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	160420907	G	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	33	2	6.1	44	9	20.5	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.372132111	0.372132111	1	1.223467783	1.223467783	1	1.097444444	1.097444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.011909843	1	1.18E-12	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	160475989	G	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	34	6	17.6	31	10	32.3	36	5	13.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.073692648	1.073692648	1	1.927707775	1.078867425	1.786788376	2.991074074	0.997024691	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.86E-08	1	3.94E-16	1	0.00000104	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	160740070	G	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	34	5	14.7	46	11	23.9	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.896777382	0.896777382	1	1.426384391	1.426384391	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000771	1	5.55E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	161260701	T	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	47	4	8.5	54	18	33.3	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.518544745	0.518544745	1	1.98738913	1.112268894	1.786788376	2.108814815	2.108814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000939	1	3.12E-28	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	162306604	G	A	FSTL5	CCDS3802.1	r.3276c>u	c.?	p.?	3'UTR variant	40	0	0	30	2	6.7	52	13	25	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.408735269	0.408735269	1	1.492033882	1.492033882	1	1.01137037	1.01137037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.009909649	1	6.47E-19	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	162624274	C	G	FSTL5	CCDS3802.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	51	11	21.6	46	8	17.4	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.317713705	1.317713705	1	1.038455582	1.038455582	1	1.054407407	1.054407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.94E-15	1	8.61E-11	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	162734473	G	A	FSTL5	CCDS3802.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	43	2	4.7	36	10	27.8	49	3	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.286724741	0.68478411	0.418708228	1.659141676	1.659141676	1	1.31262963	1.31262963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.019709573	1	2.21E-15	1	0.001939399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	162913888	C	T	FSTL5	CCDS3802.1	r.?	-	-	intronic	11	0	0	23	5	21.7	26	8	30.8	35	5	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.323814231	1.323814231	1	1.838185742	1.028765223	1.786788376	3.077148148	1.025716049	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.75E-08	1	5.63E-13	1	0.000000895	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	163747746	G	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	43	9	20.9	48	7	14.6	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.27501002	1.27501002	1	0.871347787	0.871347787	1	1.463259259	1.463259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.45E-13	1	4.81E-09	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	164786580	C	A	Mar-01	CCDS45732.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	47	2	4.3	53	5	9.4	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.262322636	0.626504611	0.418708228	0.561004739	0.561004739	1	1.398703704	1.398703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.02328732	1	0.00000734	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	165051687	G	A	Mar-01	CCDS45732.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	44	7	15.9	54	10	18.5	53	5	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.969983699	0.969983699	1	1.104105072	1.104105072	1	2.022740741	2.022740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	1.91E-13	1	0.00000734	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	165429923	T	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	43	6	14	42	5	11.9	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.854073697	0.854073697	1	0.710208128	0.710208128	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.13E-08	1	0.00000228	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	165504682	C	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	26	0	0	44	4	9.1	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0	0	1	0.543100333	0.543100333	1	1.269592593	1.269592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.0000723	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	165594312	A	G	-	-	-	-	-	-	32	0	0	32	7	21.9	32	7	21.9	41	6	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.336015284	1.336015284	1	1.30702168	1.30702168	1	3.141703704	1.047234568	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.36E-10	1	2.36E-10	1	6.05E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	166583160	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	39	6	15.4	46	8	17.4	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.939481067	0.939481067	1	1.038455582	1.038455582	1	1.89362963	1.89362963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.43E-08	1	8.61E-11	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	166701862	C	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	64	13	20.3	54	6	11.1	54	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.238406861	1.238406861	1	0.662463043	0.662463043	1	0.408851852	0.408851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-17	1	0.000000329	1	0.237137336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	167133083	G	C	-	-	-	-	-	-	25	0	0	37	6	16.2	38	5	13.2	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.988285278	0.988285278	1	0.787793889	0.787793889	1	1.01137037	1.01137037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.18E-08	1	0.00000137	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	167192798	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	40	10	25	50	13	26	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.525131602	1.525131602	1	1.551715237	1.551715237	1	0.43037037	0.43037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.22E-15	1	3.65E-19	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	167272665	G	A	-	-	-	-	-	-	15	0	0	26	9	34.6	43	8	18.6	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	2.110782138	1.487819762	1.418708228	1.110073208	1.110073208	1	1.570851852	1.570851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.65E-15	1	4.85E-11	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	167308358	A	G	-	-	-	-	-	-	41	0	0	41	11	26.8	60	12	20	49	3	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.634941078	1.634941078	1	1.193627105	1.193627105	1	1.31262963	1.31262963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.34E-16	1	2.74E-16	1	0.001939399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	167544933	G	A	-	-	-	-	-	-	50	0	0	55	5	9.1	52	9	17.3	56	6	10.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.555147903	0.555147903	1	1.032487446	1.032487446	1	2.302481481	1.151240741	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000883	1	5.92E-12	1	0.000000409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	168011314	C	T	SPOCK3	CCDS34095.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	55	6	10.9	45	11	24.4	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.664957379	0.664957379	1	1.456225068	1.456225068	1	2.108814815	2.108814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000367	1	4.24E-16	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	168928470	G	A	-	-	-	-	-	-	46	0	0	40	8	20	45	20	44.4	47	6	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.220105282	1.220105282	1	2.649852174	1.483025192	1.786788376	2.75437037	0.918123457	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.61E-11	1	2.68E-34	1	0.000000141	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	169245712	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	41	9	22	36	10	27.8	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.34211581	1.34211581	1	1.659141676	1.659141676	1	0.43037037	0.43037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-13	1	2.21E-15	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	171750297	A	C	-	-	-	-	-	-	25	0	0	43	7	16.3	56	7	12.5	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.994385805	0.994385805	1	0.746016941	0.746016941	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.15E-09	1	1.46E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	171750828	C	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	43	9	20.9	38	7	18.4	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.27501002	1.27501002	1	1.098136937	1.098136937	1	1.699962963	1.699962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.45E-13	1	8.61E-10	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	171753673	C	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	35	3	8.6	50	6	12	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.524645271	0.524645271	1	0.716176263	0.716176263	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000725791	1	0.000000206	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	171758640	A	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	47	6	12.8	49	12	24.5	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.78086738	0.78086738	1	1.462193204	1.462193204	1	0.537962963	0.537962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000141	1	1.9E-17	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	171971472	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	50	11	22	43	13	30.2	54	3	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.34211581	1.34211581	1	1.802376929	1.008724342	1.786788376	1.205037037	1.205037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.52E-15	1	3.88E-20	1	0.00256299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	171995888	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	47	8	17	46	7	15.2	56	6	10.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.03708949	1.03708949	1	0.9071566	0.9071566	1	2.302481481	1.151240741	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.03E-10	1	3.53E-09	1	0.000000409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	172032839	A	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	55	16	29.1	45	14	31.1	54	4	7.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.775253185	1.25131662	1.418708228	1.856090149	1.038785663	1.786788376	1.59237037	1.59237037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.78E-24	1	8.81E-22	1	0.000161898	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	172374344	T	C	-	-	-	-	-	-	14	0	0	32	7	21.9	35	10	28.6	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.336015284	1.336015284	1	1.706886761	0.955281993	1.786788376	1.334148148	1.334148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.36E-10	1	1.6E-15	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	172417019	T	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	44	3	6.8	42	4	9.5	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.414835796	0.414835796	1	0.566972875	0.566972875	1	0.43037037	0.43037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00142027	1	0.0000601	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	172655278	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	43	10	23.3	47	8	17	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.421422654	1.421422654	1	1.014583039	1.014583039	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.61E-14	1	1.03E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	174019704	C	G	-	-	-	-	-	-	24	0	0	31	6	19.4	40	11	27.5	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.183502124	1.183502124	1	1.64123727	1.64123727	1	1.097444444	1.097444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.03E-08	1	9.88E-17	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	174599776	G	A	-	-	-	-	-	-	31	1	3.2	41	14	34.1	50	11	22	37	6	16.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	2.080279506	1.466319476	1.418708228	1.312989816	1.312989816	1	3.486	1.162	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	0.143917729	1	1.9E-22	1	1.52E-15	1	3.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	175572210	G	A	GLRA3	CCDS3822.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	46	9	19.6	55	7	12.7	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.195703176	1.195703176	1	0.757953212	0.757953212	1	0.43037037	0.43037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.82E-12	1	1.28E-08	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	175653375	G	A	GLRA3	CCDS3822.1	r.?	-	-	intronic	10	0	0	21	4	19	18	1	5.6	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.159100018	1.159100018	1	0.334215589	0.334215589	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000349	1	0.086275114	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	177348063	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	45	11	24.4	46	15	32.6	42	8	19	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.488528444	1.488528444	1	1.945612182	1.088887866	1.786788376	4.088518519	1.362839506	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.24E-16	1	1.35E-23	1	3.96E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	179144566	T	C	-	-	-	-	-	-	15	0	0	39	6	15.4	55	8	14.5	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.939481067	0.939481067	1	0.865379651	0.865379651	1	0.43037037	0.43037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.43E-08	1	3.86E-10	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	179165887	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	55	18	32.7	35	8	22.9	53	9	17	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.994872136	1.406118676	1.418708228	1.366703036	1.366703036	1	3.658148148	1.219382716	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.61E-28	1	8.15E-12	1	7.1E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	179579018	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	45	10	22.2	47	8	17	53	3	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.354316863	1.354316863	1	1.014583039	1.014583039	1	1.226555556	1.226555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.66E-14	1	1.03E-10	1	0.002429596	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	179593034	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	32	3	9.4	29	6	20.7	32	4	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.573449483	0.573449483	1	1.235404054	1.235404054	1	2.689814815	0.896604938	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000556213	1	6.72E-09	1	0.0000201	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	179744579	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	40	5	12.5	47	10	21.3	40	5	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.762565801	0.762565801	1	1.271212867	1.271212867	1	2.689814815	0.896604938	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000178	1	4.27E-14	1	0.00000178	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	179850486	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	49	9	18.4	44	11	25	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.122496859	1.122496859	1	1.492033882	1.492033882	1	0.43037037	0.43037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.35E-12	1	3.22E-16	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	180037770	G	C	-	-	-	-	-	-	22	0	0	38	11	28.9	40	14	35	48	5	10.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.763052132	1.242716506	1.418708228	2.088847434	1.16905139	1.786788376	2.237925926	2.237925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.19E-17	1	1.25E-22	1	0.00000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	180109490	C	G	-	-	-	-	-	-	45	0	0	56	0	0	40	4	10	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0	0	1	0.596813553	0.596813553	1	1.463259259	1.463259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.0000495	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	180197966	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	40	9	22.5	25	7	28	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.372618442	1.372618442	1	1.671077947	1.671077947	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.64E-13	1	3.47E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	180324275	T	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	40	12	30	38	10	26.3	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.830157923	1.290017134	1.418708228	1.569619643	1.569619643	1	1.527814815	1.527814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.2E-18	1	4.06E-15	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	180586879	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	35	7	20	35	3	8.6	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.220105282	1.220105282	1	0.513259655	0.513259655	1	0.516444444	0.516444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.65E-10	1	0.000725791	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	180666996	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	45	13	28.9	44	8	18.2	32	5	15.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.763052132	1.242716506	1.418708228	1.086200666	1.086200666	1	3.356888889	1.118962963	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.68E-20	1	5.9E-11	1	0.000000562	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	180670974	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	26	7	26.9	36	3	8.3	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.641041604	1.641041604	1	0.495355249	0.495355249	1	1.205037037	1.205037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.73E-11	1	0.000788827	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	180758182	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	34	14	41.2	58	20	34.5	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	2.513416881	1.771623531	1.418708228	2.059006757	1.152350656	1.786788376	1.162	1.162	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.74E-24	1	1.47E-31	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	180804342	T	C	-	-	-	-	-	-	27	0	0	24	0	0	44	7	15.9	50	4	8	111	0	0	183	4	2.2	169	26	15.4	183	8	4.4	TRUE	TRUE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0	0	1	0.948933549	0.948933549	1	1.721481481	1.721481481	1	0.134211581	0.134211581	1	0.919092871	0.919092871	1	0.946814815	0.946814815	1	3	1	1	1	1	0.013946145	2.55E-09	2.05E-30	0.000119787	0.0000048	YES	0_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	4	181401850	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	40	1	2.5	50	7	14	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.15251316	0.15251316	1	0.835538974	0.835538974	1	1.140481481	1.140481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.181679879	1	6.46E-09	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	181472308	G	C	-	-	-	-	-	-	30	0	0	45	9	20	43	9	20.9	50	5	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.220105282	1.220105282	1	1.247340325	1.247340325	1	2.151851852	2.151851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-12	1	9.45E-13	1	0.00000549	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	182094181	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	46	7	15.2	58	9	15.5	62	2	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.927280014	0.927280014	1	0.925061007	0.925061007	1	0.688592593	0.688592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.53E-09	1	1.67E-11	1	0.038789653	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	182356758	T	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	32	6	18.8	31	3	9.7	31	4	12.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.146898965	1.146898965	1	0.578909146	0.578909146	1	2.775888889	0.925296296	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.27E-08	1	0.000505952	1	0.0000177	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	182368885	C	A	-	-	-	-	-	-	16	0	0	27	4	14.8	19	4	21.1	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.902877909	0.902877909	1	1.259276596	1.259276596	1	0.473407407	0.473407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00001	1	0.00000228	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	183717191	C	A	ODZ3	CCDS47165.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	35	8	22.9	43	5	11.6	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.397020548	1.397020548	1	0.692303721	0.692303721	1	0.537962963	0.537962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.15E-12	1	0.00000257	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	185245440	T	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	44	4	9.1	47	10	21.3	50	5	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.555147903	0.555147903	1	1.271212867	1.271212867	1	2.151851852	2.151851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000723	1	4.27E-14	1	0.00000549	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	186048691	A	T	-	-	-	-	-	-	9	0	0	7	4	57.1	3	2	66.7	34	24	70.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	3.48340058	2.455332612	1.418708228	3.980746396	3.980746396	1	15.19207407	5.064024691	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.16E-08	1	0.0000748	1	7.45E-48	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	186897970	C	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	25	4	16	25	5	20	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.976084226	0.976084226	1	1.193627105	1.193627105	1	1.506296296	1.506296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000727	1	0.000000153	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	187922424	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	26	7	26.9	40	3	7.5	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.641041604	1.641041604	1	0.447610164	0.447610164	1	0.516444444	0.516444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.73E-11	1	0.001075403	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	188451175	T	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	53	5	9.4	55	8	14.5	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.573449483	0.573449483	1	0.865379651	0.865379651	1	1.506296296	1.506296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000734	1	3.86E-10	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	189147169	G	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	30	2	6.7	40	5	12.5	24	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.408735269	0.408735269	1	0.746016941	0.746016941	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.009909649	1	0.00000178	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	189353475	G	T	-	-	-	-	-	-	20	0	0	30	5	16.7	42	16	38.1	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	1.01878791	1.01878791	1	2.273859636	1.272595941	1.786788376	0.516444444	0.516444444	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000401	1	2.25E-26	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	190430725	G	T	ENSG00000227461	ENST00000454642	r.?	-	-	downstream	32	0	0	44	4	9.1	47	9	19.1	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0.555147903	0.555147903	1	1.139913886	1.139913886	1	1.032888889	1.032888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000723	1	2.24E-12	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	4	190609512	A	C	-	-	-	-	-	-	48	0	0	82	0	0	77	4	5.2	61	1	1.6	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.418708228	2.786788376	5	1	1	3	1	1	2	0.581291772	0.213211624	1	2	2	NA	1	1	NA	0.418708228	0.786788376	NA	0	0	1	0.310343047	0.394442847	0.786788376	0.344296296	0.344296296	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.000632383	1	0.263440347	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	84018	C	T	-	-	-	-	-	-	20	1	5	16	1	6.2	11	0	0	59	6	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.37997012	0.37997012	1	0	0	1	2.194888889	1.097444444	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	0.09538952	1	0.077068876	1	1	1	0.000000561	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	250556	A	G	SDHA	CCDS3853.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	41	4	9.8	26	3	11.5	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.600597931	0.600597931	1	0.68484405	0.68484405	1	0.602518519	0.602518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000546	1	0.000298167	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	257036	C	T	SDHA	CCDS3853.1	r.?	-	-	downstream	17	0	0	37	4	10.8	31	4	12.9	29	2	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.661883434	0.661883434	1	0.76821637	0.76821637	1	1.484777778	1.484777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000362	1	0.0000177	1	0.009279585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	259740	C	T	SDHA	CCDS3853.1	r.?	-	-	downstream	10	0	0	7	2	28.6	4	1	25	41	11	26.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.75276539	1.75276539	1	1.488791414	1.488791414	1	5.766962963	1.922320988	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000516315	1	0.019850499	1	1.34E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	435328	G	A	AHRR	CCDS43297.1	r.2583g>a	c.?	p.?	3'UTR variant	7	0	0	6	1	16.7	1	0	0	29	6	20.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.023467903	1.023467903	1	0	0	1	4.454333333	1.484777778	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.029627491	1	1	1	6.72E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	588688	G	A	-	-	-	-	-	-	12	0	0	22	4	18.2	39	11	28.2	31	6	19.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.115396158	1.115396158	1	1.679356715	0.839678357	2	4.174592593	1.391530864	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000425	1	7.2E-17	1	1.03E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	1367326	G	T	ENSG00000227483	ENST00000446513	r.?	-	-	intronic	34	0	0	37	0	0	36	0	0	40	4	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0	0	1	0	0	1	2.151851852	2.151851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000495	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	1761294	G	A	-	-	-	-	-	-	9	0	0	8	3	37.5	7	1	14.3	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.298206369	2.298206369	1	0.851588689	0.851588689	1	1.226555556	1.226555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000687	1	0.034479353	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	3664446	T	C	-	-	-	-	-	-	16	0	0	45	17	37.8	43	16	37.2	52	7	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.316592019	1.15829601	2	2.215321624	1.107660812	2	2.905	0.968333333	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.37E-28	1	3.56E-26	1	8.58E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	4038978	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	47	24	51.1	40	18	45	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	3.131689212	1.565844606	2	2.679824545	1.339912273	2	2.496148148	0.832049383	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.6E-43	1	3.9E-31	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	4356854	G	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	44	1	2.3	23	6	26.1	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.140956657	0.140956657	1	1.554298236	1.554298236	1	0.451888889	0.451888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.197923942	1	1.47E-09	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	4424434	G	T	ENSG00000237600	ENST00000432969	r.?	-	-	upstream	18	0	0	45	3	6.7	37	7	18.9	53	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.410612871	0.410612871	1	1.125526309	1.125526309	1	0.408851852	0.408851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001516071	1	7.05E-10	1	0.233303855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	5538062	G	C	-	-	-	-	-	-	24	0	0	41	8	19.5	37	5	13.5	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.195067312	1.195067312	1	0.803947364	0.803947364	1	1.032888889	1.032888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.22E-11	1	0.00000119	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	5538063	G	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	40	8	20	38	5	13.2	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.225710063	1.225710063	1	0.786081867	0.786081867	1	0.537962963	0.537962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.61E-11	1	0.00000137	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	5588528	G	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	32	5	15.6	40	9	22.5	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.956053849	0.956053849	1	1.339912273	1.339912273	1	1.699962963	1.699962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000562	1	4.64E-13	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	5598863	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	40	1	2.5	41	5	12.2	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.153213758	0.153213758	1	0.72653021	0.72653021	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.181679879	1	0.00000202	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	6287966	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	44	3	6.8	41	7	17.1	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.416741421	0.416741421	1	1.018333327	1.018333327	1	0.946814815	0.946814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00142027	1	1.51E-09	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	6442895	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	37	0	0	51	4	7.8	49	2	4.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0	0	1	0.464502921	0.464502921	1	0.882259259	0.882259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.000129466	1	0.025168485	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	6741632	G	C	PAPD7	CCDS3871.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	43	4	9.3	32	6	18.8	51	2	3.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.569955179	0.569955179	1	1.119571143	1.119571143	1	0.839222222	0.839222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000066	1	1.27E-08	1	0.027109304	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	6984923	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	44	5	11.4	36	9	25	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.698654736	0.698654736	1	1.488791414	1.488791414	1	0.559481481	0.559481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000288	1	1.63E-13	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	7546619	C	T	ADCY2	CCDS3872.2	r.?	-	-	intronic	19	0	0	41	6	14.6	37	3	8.1	62	7	11.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.894768346	0.894768346	1	0.482368418	0.482368418	1	2.431592593	0.810530864	3	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	6.05E-08	1	0.000855237	1	3.02E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	8817442	G	A	-	-	-	-	-	-	46	0	0	46	10	21.7	49	9	18.4	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.329895419	1.329895419	1	1.095750481	1.095750481	1	1.205037037	1.205037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.38E-14	1	3.35E-12	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	9964660	G	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	37	11	29.7	37	14	37.8	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.820179444	0.910089722	2	2.251052618	1.125526309	2	1.032888889	1.032888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.7E-17	1	3.35E-23	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	10129734	G	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	38	11	28.9	29	5	17.2	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.771151041	0.885575521	2	1.024288493	1.024288493	1	1.31262963	1.31262963	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.19E-17	1	0.000000336	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	12514575	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	33	0	0	43	6	14	52	1	1.9	40	0	0	201	19	9.5	173	10	5.8	261	3	1.1	TRUE	TRUE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0	0	1	0.833723192	0.833723192	1	0.408851852	0.408851852	1	0.58221228	1.303269309	0.446732134	0.345399608	0.345399608	1	0.236703704	0.236703704	1	3	3	1	1	1	1.58E-18	8.13E-08	2.36E-08	0.229451111	0.143637148	YES	0_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	5	12709454	C	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	57	0	0	45	0	0	51	4	7.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0	0	1	0	0	1	1.678444444	1.678444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.000129466	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	12718381	G	A	-	-	-	-	-	-	11	0	0	20	4	20	15	3	20	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.225710063	1.225710063	1	1.191033131	1.191033131	1	2.388555556	1.194277778	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000284	1	0.0000544	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	13213687	T	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	52	4	7.7	48	6	12.5	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.471898374	0.471898374	1	0.744395707	0.744395707	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000139698	1	0.00000016	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	13764876	C	T	DNAH5	CCDS3882.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	48	6	12.5	50	1	2	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.76606879	0.76606879	1	0.119103313	0.119103313	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000016	1	0.221687443	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	13953689	G	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	53	6	11.3	31	7	22.6	39	0	0	107	0	0	221	16	7.2	197	29	14.7	260	16	6.2	TRUE	TRUE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.692526186	0.692526186	1	1.345867438	1.345867438	1	0	0	1	0.441255623	0.98774095	0.446732134	0.875409351	0.875409351	1	1.334148148	1.334148148	1	5	4	1	1	0.000000293	5.16E-14	1.85E-10	3.7E-33	1	6.3E-13	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	5	15176513	C	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	39	1	2.6	43	7	16.3	48	5	10.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.159342308	0.159342308	1	0.970692002	0.970692002	1	2.237925926	2.237925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.177567718	1	2.15E-09	1	0.00000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	15194238	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	44	15	34.1	50	12	24	55	5	9.1	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.089835658	1.044917829	2	1.429239757	1.429239757	1	1.958185185	1.958185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.12E-24	1	2.49E-17	1	0.00000883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	15511493	G	A	FBXL7	ENST00000504595	r.?	-	-	intronic	33	0	0	33	7	21.2	40	7	17.5	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.299252667	1.299252667	1	1.04215399	1.04215399	1	1.097444444	1.097444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.98E-10	1	1.26E-09	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	15521110	T	C	FBXL7	ENST00000504595	r.?	-	-	intronic	31	0	0	50	7	14	36	8	22.2	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.857997044	0.857997044	1	1.322046776	1.322046776	1	1.915148148	1.915148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.46E-09	1	1.04E-11	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	17095222	G	C	-	-	-	-	-	-	25	0	0	31	3	9.7	38	4	10.5	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.594469381	0.594469381	1	0.625292394	0.625292394	1	0.645555556	0.645555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000505952	1	0.0000403	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	17361052	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	40	3	7.5	44	4	9.1	29	4	13.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.459641274	0.459641274	1	0.541920075	0.541920075	1	2.969555556	0.989851852	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001075403	1	0.0000723	1	0.0000134	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	17363338	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	52	8	15.4	37	5	13.5	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.943796749	0.943796749	1	0.803947364	0.803947364	1	0.925296296	0.925296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.42E-10	1	0.00000119	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	18268827	T	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	40	1	2.5	50	5	10	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.153213758	NA	0	0.595516566	0.595516566	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.181679879	1	0.00000549	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	18707115	G	C	-	-	-	-	-	-	47	0	0	44	1	2.3	49	6	12.2	54	4	7.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.140956657	0.140956657	1	0.72653021	0.72653021	1	1.59237037	1.59237037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.197923942	1	0.000000182	1	0.000161898	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	18915948	C	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	26	9	34.6	46	10	21.7	55	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.120478409	1.060239205	2	1.292270947	1.292270947	1	0.387333333	0.387333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.65E-15	1	3.38E-14	1	0.240951649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	19069514	G	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	25	2	8	27	6	22.2	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.490284025	0.490284025	1	1.322046776	1.322046776	1	1.463259259	1.463259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.006948068	1	4.23E-09	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	19135945	C	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	44	10	22.7	46	16	34.8	47	6	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.391180922	1.391180922	1	2.072397648	1.036198824	2	2.75437037	0.918123457	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.08E-14	1	1.31E-25	1	0.000000141	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	19428267	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	29	8	27.6	42	4	9.5	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.691479887	1.691479887	1	0.565740737	0.565740737	1	1.075925926	1.075925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.53E-12	1	0.0000601	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	19452518	C	G	-	-	-	-	-	-	42	0	0	50	4	8	54	6	11.1	54	5	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.490284025	0.490284025	1	0.661023388	0.661023388	1	2.001222222	2.001222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000119787	1	0.000000329	1	0.00000806	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	20553576	C	T	CDH18	CCDS3652.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	51	10	19.6	48	3	6.2	56	2	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.201195862	1.201195862	1	0.369220271	0.477140658	0.773818506	0.774666667	0.774666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-13	1	0.001827434	1	0.032213353	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	20578396	G	T	CDH18	CCDS3652.1	r.?	-	-	upstream	29	0	0	43	12	27.9	43	11	25.6	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.709865538	1.100818201	1.553267866	1.524522408	1.524522408	1	0.559481481	0.559481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.24E-18	1	2.42E-16	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	24116837	C	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	33	8	24.2	34	4	11.8	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.483109176	1.483109176	1	0.702709547	0.702709547	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-12	1	0.0000257	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	24282896	C	G	-	-	-	-	-	-	17	0	0	27	6	22.2	24	4	16.7	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.36053817	1.36053817	1	0.994512665	0.994512665	1	0.602518519	0.602518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.23E-09	1	0.00000613	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	24460977	C	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	51	6	11.8	44	14	31.8	50	3	6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.723168937	0.723168937	1	1.893742679	0.946871339	2	1.291111111	1.291111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000232	1	6.1E-22	1	0.002055544	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	24687965	C	G	-	-	-	-	-	-	22	0	0	19	2	10.5	15	1	6.7	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.643497783	0.643497783	1	0.398996099	0.398996099	1	2.108814815	2.108814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.004039874	1	0.072431031	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	24718159	G	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	36	7	19.4	36	16	44.4	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.188938761	1.188938761	1	2.644093551	1.322046776	2	1.527814815	1.527814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.74E-10	1	1.01E-27	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	25011056	A	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	34	4	11.8	47	9	19.1	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.723168937	0.723168937	1	1.13743664	1.13743664	1	1.162	1.162	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000257	1	2.24E-12	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	25131666	T	G	AC106810.1	ENST00000515097	r.?	-	-	intronic	35	0	0	50	4	8	48	9	18.8	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.490284025	0.490284025	1	1.119571143	1.119571143	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000119787	1	2.75E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	25248786	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	53	12	22.6	56	10	17.9	48	0	0	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.385052371	1.385052371	1	1.065974652	1.065974652	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.39E-17	1	2.82E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	25404060	C	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	50	9	18	37	1	2.7	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.103139057	1.103139057	1	0.160789473	0.160789473	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	4	NA	1	1	4.07E-12	1	0.169281299	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	25417914	C	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	50	13	26	48	11	22.9	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.593423082	1.025852087	1.553267866	1.363732935	1.363732935	1	2.108814815	2.108814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.65E-19	1	9.31E-16	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	25621047	A	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	49	22	44.9	41	12	29.3	48	3	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.751719092	1.375859546	2	1.744863537	0.872431769	2	1.334148148	1.334148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-37	1	1.69E-18	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	25726344	A	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	46	17	37	30	14	46.7	56	6	10.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.267563617	1.133781808	2	2.781062361	1.390531181	2	2.302481481	1.151240741	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.16E-27	1	8.24E-25	1	0.000000409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	26254326	G	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	51	19	37.3	54	18	33.3	35	5	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.285949268	1.142974634	2	1.983070163	0.991535082	2	3.077148148	1.025716049	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.94E-31	1	3.12E-28	1	0.000000895	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	26304145	T	G	-	-	-	-	-	-	45	0	0	35	6	17.1	37	9	24.3	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.047982104	1.047982104	1	1.447105254	1.447105254	1	1.398703704	1.398703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-08	1	2.14E-13	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	26318412	A	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	33	5	15.2	56	4	7.1	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.931539648	0.931539648	1	0.422816762	0.546403011	0.773818506	1.786037037	1.786037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000066	1	0.000186538	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	27309963	A	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	36	16	44.4	37	16	43.2	25	2	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.72107634	1.36053817	2	2.572631563	1.286315782	2	1.721481481	1.721481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.01E-27	1	1.78E-27	1	0.006948068	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	27375064	T	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	47	12	25.5	45	16	35.6	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.562780331	1.562780331	1	2.120038973	1.060019487	2	2.108814815	2.108814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.09E-17	1	8.61E-26	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	27384993	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	55	3	5.5	58	7	12.1	62	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.337070267	0.754524337	0.446732134	0.720575044	0.720575044	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.002700822	1	1.88E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	27821123	A	G	-	-	-	-	-	-	15	0	0	33	7	21.2	38	7	18.4	58	1	1.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.299252667	1.299252667	1	1.095750481	1.095750481	1	0.365814815	0.365814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.98E-10	1	8.61E-10	1	0.252280541	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	28277648	T	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	36	11	30.6	47	16	34	55	4	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.875336397	0.937668198	2	2.024756323	1.012378162	2	1.570851852	1.570851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.62E-17	1	1.98E-25	1	0.000173903	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	29429149	C	T	-	-	-	-	-	-	38	1	2.6	47	12	25.5	53	12	22.6	66	11	16.7	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.562780331	1.562780331	1	1.345867438	1.345867438	1	3.593592593	1.197864198	3	6.128550316	6.128550316	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	0.173434892	1	1.09E-17	0.005	5.39E-17	1	4.07E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	29779396	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	51	16	31.4	37	12	32.4	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.924364799	0.9621824	2	1.929473673	0.964736836	2	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.28E-25	1	4.03E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	29938464	T	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	50	1	2	45	4	8.9	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.122571006	0.122571006	1	0.530009743	0.530009743	1	0.451888889	0.451888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.221687443	1	0.0000791	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	30075149	A	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	38	14	36.8	46	19	41.3	50	5	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.255306516	1.127653258	2	2.459483416	1.229741708	2	2.151851852	2.151851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.28E-23	1	6.97E-32	1	0.00000549	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	30195803	A	G	-	-	-	-	-	-	25	0	0	45	21	46.7	40	8	20	37	6	16.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.862032998	1.431016499	2	1.191033131	1.191033131	1	3.486	1.162	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.6E-36	1	2.61E-11	1	3.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	30576006	C	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	42	6	14.3	39	3	7.7	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.876382695	0.876382695	1	0.458547756	0.458547756	1	1.140481481	1.140481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.02E-08	1	0.000998458	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	30781529	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	28	11	39.3	41	8	19.5	48	3	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.408520274	1.204260137	2	1.161257303	1.161257303	1	1.334148148	1.334148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.7E-19	1	3.22E-11	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	30815071	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	29	0	0	37	0	0	38	5	13.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0	0	1	0	0	1	2.840444444	0.946814815	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000137	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	30860387	G	A	-	-	-	-	-	-	7	0	0	11	1	9.1	18	4	22.2	13	4	30.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.557698079	0.557698079	1	1.322046776	1.322046776	1	6.627703704	2.209234568	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.05364542	1	0.00000181	1	0.000000431	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	31040810	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	41	4	9.8	47	7	14.9	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.600597931	0.600597931	1	0.887319683	0.887319683	1	0.688592593	0.688592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000546	1	4.12E-09	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	31080870	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	30	5	16.7	41	8	19.5	30	1	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.023467903	1.023467903	1	1.161257303	1.161257303	1	0.710111111	0.710111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000401	1	3.22E-11	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	31264966	G	A	CDH6	CCDS3894.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	32	2	6.2	35	4	11.4	52	5	9.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.37997012	0.37997012	1	0.678888885	0.678888885	1	2.065777778	2.065777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.011224977	1	0.0000289	1	0.00000668	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	32252530	C	A	MTMR12	CCDS34138.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	44	0	0	35	1	2.9	27	7	25.9	77	0	0	234	1	0.4	251	8	3.2	202	16	7.9	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0	0	1	0.172699804	0.172699804	1	5.573296296	1.857765432	3	0.024514201	NA	0	0.190565301	0.190565301	1	1.699962963	0.849981481	2	3	NA	1	1	1	0.690542584	0.16091139	0.0000466	6.36E-11	1.27E-14	YES	0_0	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	5	32366944	A	T	ZFR	CCDS34139.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	48	3	6.2	46	9	19.6	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.37997012	0.850554707	0.446732134	1.167212469	1.167212469	1	0.688592593	0.688592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001827434	1	1.82E-12	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	33119787	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	39	0	0	48	5	10.4	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0	0	1	0.619337228	0.619337228	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000447	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	38308699	G	A	EGFLAM	CCDS3924.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	47	5	10.6	41	4	9.8	50	2	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.649626334	0.649626334	1	0.583606234	0.583606234	1	0.860740741	0.860740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000402	1	0.0000546	1	0.026131524	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	38959507	C	T	RICTOR	CCDS34148.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	43	5	11.6	50	6	12	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.710911837	0.710911837	1	0.714619879	0.714619879	1	0.581	0.581	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000257	1	0.000000206	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	39599295	C	A	-	-	-	-	-	-	17	0	0	32	4	12.5	27	3	11.1	52	6	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.76606879	0.76606879	1	0.661023388	0.661023388	1	2.47462963	0.824876543	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000201	1	0.000334187	1	0.000000261	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	39806358	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	43	0	0	45	6	13.3	56	2	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0	0	1	0.792037032	0.792037032	1	0.774666667	0.774666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.000000108	1	0.032213353	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	40565427	A	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	49	5	10.2	48	6	12.5	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.625112132	0.625112132	1	0.744395707	0.744395707	1	0.968333333	0.968333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000496	1	0.00000016	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	40820483	C	T	RPL37	CCDS3934.1	r.?	-	-	downstream	15	0	0	23	8	34.8	26	8	30.8	37	5	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.13273551	1.066367755	2	1.834191022	0.917095511	2	2.905	0.968333333	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.79E-13	1	5.63E-13	1	0.00000119	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	40885702	A	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	42	9	21.4	39	6	15.4	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.311509768	1.311509768	1	0.917095511	0.917095511	1	0.516444444	0.516444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.51E-13	1	4.43E-08	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	41148399	G	A	C6	CCDS3936.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	37	7	18.9	38	6	15.8	52	3	5.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.15829601	1.15829601	1	0.940916174	0.940916174	1	1.248074074	1.248074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.05E-10	1	3.76E-08	1	0.002300591	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	41178788	G	C	C6	CCDS3936.1	r.?	-	-	intronic	11	0	0	33	5	15.2	27	5	18.5	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.931539648	0.931539648	1	1.101705646	1.101705646	1	0.581	0.581	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000066	1	0.00000023	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	41262333	C	T	C6	CCDS3936.1	r.?	-	-	upstream	29	0	0	40	9	22.5	49	18	36.7	34	4	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.378923821	1.378923821	1	2.185545796	1.092772898	2	2.539185185	2.539185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.64E-13	1	3.8E-29	1	0.0000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	42143514	G	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	36	4	11.1	45	6	13.3	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.680269085	0.680269085	1	0.792037032	0.792037032	1	0.451888889	0.451888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000324	1	0.000000108	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	43128060	A	G	ZNF131	CCDS43313.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	47	12	25.5	47	19	40.4	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.562780331	1.562780331	1	2.405886925	1.202943462	2	1.205037037	1.205037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.09E-17	1	1.16E-31	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	43718500	A	G	-	-	-	-	-	-	6	0	0	19	9	47.4	13	0	0	33	9	27.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.90493285	1.452466425	2	0	0	1	5.874555556	1.958185185	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.72E-16	1	1	1	6.76E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	43837010	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	48	2	4.2	38	7	18.4	55	6	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.257399113	0.576182221	0.446732134	1.095750481	1.095750481	1	2.345518519	1.172759259	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.024220359	1	8.61E-10	1	0.000000367	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	44373702	G	A	FGF10	CCDS3950.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	31	4	12.9	51	6	11.8	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.790582991	0.790582991	1	0.702709547	0.702709547	1	1.398703704	1.398703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000177	1	0.000000232	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	45190608	T	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	48	4	8.3	44	7	15.9	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.508669676	0.508669676	1	0.946871339	0.946871339	1	1.829074074	1.829074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000102016	1	2.55E-09	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	45829451	A	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	50	2	4	41	4	9.8	59	2	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.245142013	0.548744972	0.446732134	0.583606234	0.583606234	1	0.73162963	0.73162963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.026131524	1	0.0000546	1	0.035441897	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	46099649	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	36	5	13.9	34	5	14.7	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.851868494	0.851868494	1	0.875409351	0.875409351	1	0.667074074	0.667074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000104	1	0.000000771	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	50378807	C	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	67	19	28.4	50	20	40	50	8	16	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.74050829	1.120546126	1.553267866	2.382066262	1.191033131	2	3.442962963	1.147654321	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.67E-28	1	3.9E-33	1	1.74E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	50415313	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	40	2	5	38	12	31.6	53	3	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.306427516	0.685931215	0.446732134	1.881832347	0.940916174	2	1.226555556	1.226555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.017193422	1	5.86E-19	1	0.002429596	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	50901047	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	54	0	0	36	5	13.9	61	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0	0	1	0.827768026	0.827768026	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000104	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	51004567	A	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	38	4	10.5	50	9	18	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.643497783	0.643497783	1	1.071929818	1.071929818	1	2.001222222	2.001222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000403	1	4.07E-12	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	51011831	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	25	1	4	34	5	14.7	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.245142013	0.245142013	1	0.875409351	0.875409351	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.117779757	1	0.000000771	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	51438157	G	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	44	4	9.1	29	3	10.3	39	4	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.557698079	0.557698079	1	0.613382063	0.613382063	1	2.216407407	2.216407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000723	1	0.000414371	1	0.0000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	51502610	A	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	37	14	37.8	49	13	26.5	36	7	19.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.316592019	1.15829601	2	1.578118899	1.578118899	1	4.174592593	1.391530864	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.35E-23	1	2.71E-19	1	5.74E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	51653547	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	38	2	5.3	42	5	11.9	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.324813167	0.324813167	1	0.708664713	0.708664713	1	1.398703704	1.398703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.015598339	1	0.00000228	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	53238343	C	T	-	-	-	-	-	-	20	0	0	24	3	12.5	28	4	14.3	28	1	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.76606879	0.76606879	1	0.851588689	0.851588689	1	0.774666667	0.774666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000233853	1	0.0000116	1	0.130947004	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	53258840	A	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	35	8	22.9	47	6	12.8	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.403438022	1.403438022	1	0.762261204	0.762261204	1	1.226555556	1.226555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.15E-12	1	0.000000141	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	54331615	G	A	GZMK	CCDS3964.1	r.?	-	-	downstream	33	0	0	42	4	9.5	40	9	22.5	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.58221228	0.58221228	1	1.339912273	1.339912273	1	1.269592593	1.269592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000601	1	4.64E-13	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	57476359	T	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	55	2	3.6	39	6	15.4	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.220627811	0.493870475	0.446732134	0.917095511	0.917095511	1	0.537962963	0.537962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.031164417	1	4.43E-08	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	58201103	A	G	-	-	-	-	-	-	41	0	0	57	12	21.1	48	11	22.9	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.293124117	1.293124117	1	1.363732935	1.363732935	1	0.473407407	0.473407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.4E-16	1	9.31E-16	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	58220902	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	41	15	36.6	40	18	45	54	3	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.243049416	1.121524708	2	2.679824545	1.339912273	2	1.205037037	1.205037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.71E-24	1	3.9E-31	1	0.00256299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	58383414	C	T	PDE4D	CCDS47213.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	42	17	40.5	33	11	33.3	39	6	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.482062878	1.241031439	2	1.983070163	0.991535082	2	3.313851852	1.104617284	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.73E-28	1	8.54E-18	1	4.43E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	59531621	T	C	PDE4D	CCDS47032.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	43	0	0	48	2	4.2	70	7	10	61	0	0	281	2	0.7	223	4	1.8	282	8	2.8	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0	0	1	0.250116958	0.323224316	0.773818506	2.151851852	1.075925926	2	0.042899852	NA	0	0.107192982	0.107192982	1	0.602518519	0.602518519	1	3	NA	1	1	1	0.410241987	0.024220359	0.026506209	7.11E-08	0.00010447	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	5	59568773	C	T	PDE4D	CCDS47032.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	34	9	26.5	44	9	20.5	42	5	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.624065834	1.624065834	1	1.220808959	1.220808959	1	2.560703704	0.853567901	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.15E-14	1	1.18E-12	1	0.00000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	59875891	T	G	-	-	-	-	-	-	20	0	0	40	14	35	35	12	34.3	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.144992611	1.072496305	2	2.04262182	1.02131091	2	1.31262963	1.31262963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.25E-22	1	1.83E-19	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	59922154	G	A	DEPDC1B	CCDS3977.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	42	6	14.3	39	2	5.1	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.876382695	0.876382695	1	0.303713448	0.39248667	0.773818506	1.613888889	1.613888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.02E-08	1	0.016387522	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	59960886	C	T	DEPDC1B	CCDS3977.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	35	7	20	36	17	47.2	35	3	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.225710063	1.225710063	1	2.81083819	1.405419095	2	1.850592593	1.850592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.65E-10	1	6E-30	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	60242636	A	G	ERCC8	CCDS3978.1	r.?	-	-	upstream	52	0	0	36	12	33.3	50	17	34	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.040807255	1.020403628	2	2.024756323	1.012378162	2	1.613888889	1.613888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.73E-19	1	6.43E-27	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	60902910	C	T	-	-	-	-	-	-	10	0	0	13	0	0	12	4	33.3	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0	0	1	1.983070163	1.983070163	1	2.108814815	2.108814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1	1	0.0000003	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	61150010	C	G	-	-	-	-	-	-	21	0	0	44	3	6.8	45	4	8.9	62	3	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.416741421	0.416741421	1	0.530009743	0.530009743	1	1.032888889	1.032888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00142027	1	0.0000791	1	0.003793816	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	61977008	C	G	-	-	-	-	-	-	27	0	0	34	3	8.8	40	8	20	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.539312428	0.539312428	1	1.191033131	1.191033131	1	0.645555556	0.645555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000666058	1	2.61E-11	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	62367673	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	44	5	11.4	46	7	15.2	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.698654736	0.698654736	1	0.90518518	0.90518518	1	1.377185185	1.377185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000288	1	3.53E-09	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	62579666	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	34	1	2.9	45	5	11.1	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.177727959	0.177727959	1	0.661023388	0.661023388	1	1.872111111	1.872111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.156694864	1	0.00000323	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	62683436	A	G	-	-	-	-	-	-	48	0	0	58	18	31	46	12	26.1	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.899850598	0.949925299	2	1.554298236	1.554298236	1	1.441740741	1.441740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.42E-27	1	8.12E-18	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	63848871	G	C	RGS7BP	CCDS34170.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	35	7	20	36	3	8.3	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.225710063	1.225710063	1	0.494278749	0.494278749	1	1.140481481	1.140481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.65E-10	1	0.000788827	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	64238642	A	C	CWC27	CCDS3982.2	r.?	-	-	intronic	28	0	0	39	6	15.4	48	11	22.9	54	6	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.943796749	0.943796749	1	1.363732935	1.363732935	1	2.388555556	1.194277778	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.43E-08	1	9.31E-16	1	0.000000329	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	64431279	C	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	36	4	11.1	29	5	17.2	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.680269085	0.680269085	1	1.024288493	1.024288493	1	0.624037037	0.624037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000324	1	0.000000336	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	65209982	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	36	19	52.8	45	17	37.8	36	5	13.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	3.235874567	1.617937283	2	2.251052618	1.125526309	2	2.991074074	0.997024691	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.51E-34	1	7.37E-28	1	0.00000104	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	65637287	A	T	AC092373.1	ENST00000510964	r.?	-	-	intronic	32	0	0	46	14	30.4	33	17	51.5	55	3	5.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.863079296	0.931539648	2	3.066910313	1.533455156	2	1.183518519	1.183518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-21	1	8.25E-31	1	0.002700822	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	65925376	A	G	MAST4	CCDS47224.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	40	1	2.5	49	6	12.2	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.153213758	0.153213758	1	0.72653021	0.72653021	1	0	0	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.181679879	1	0.000000182	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	66364679	A	T	MAST4	CCDS47225.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	57	7	12.3	32	4	12.5	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.753811689	0.753811689	1	0.744395707	0.744395707	1	1.699962963	1.699962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.66E-08	1	0.0000201	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	66364681	C	T	MAST4	CCDS47225.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	56	7	12.5	30	4	13.3	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.76606879	0.76606879	1	0.792037032	0.792037032	1	1.699962963	1.699962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.46E-08	1	0.0000154	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	66421314	A	C	MAST4	CCDS47225.1	r.?	-	-	intronic	15	0	0	37	4	10.8	38	4	10.5	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.661883434	0.661883434	1	0.625292394	0.625292394	1	1.527814815	1.527814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000362	1	0.0000403	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	67296643	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	53	7	13.2	44	3	6.8	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.808968642	0.808968642	1	0.404951265	0.404951265	1	0.43037037	0.43037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.85E-09	1	0.00142027	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	67307291	A	G	-	-	-	-	-	-	29	0	0	48	2	4.2	50	5	10	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.257399113	0.576182221	0.446732134	0.595516566	0.595516566	1	1.032888889	1.032888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.024220359	1	0.00000549	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	68757256	G	A	-	-	-	-	-	-	12	0	0	23	1	4.3	23	7	30.4	27	1	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.263527664	0.263527664	1	1.810370359	1.810370359	1	0.796185185	0.796185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.108890944	1	1.79E-11	1	0.126579904	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	68862044	C	T	GTF2H2C	CCDS43325.1	r.422+9c>u	c.134+9C>T	p.?	splice region	57	0	0	44	1	2.3	53	6	11.3	49	1	2	77	0	0	254	6	2.4	228	20	8.8	238	2	0.8	TRUE	TRUE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.140956657	0.140956657	1	0.672933719	0.672933719	1	0.43037037	0.43037037	1	0.147085208	0.147085208	1	0.524054578	0.677231901	0.773818506	0.172148148	0.172148148	1	3	2	1	1	0.197923942	0.001916706	0.000000293	8.88E-19	0.217776325	0.333927386	YES	0_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	5	70867035	G	A	BDP1	CCDS43328.1	r.?	-	-	downstream	22	0	0	29	5	17.2	45	7	15.6	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.054110654	1.054110654	1	0.929005842	0.929005842	1	1.226555556	1.226555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000336	1	0.000000003	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	71724261	C	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	43	5	11.6	47	1	2.1	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.710911837	0.710911837	1	0.125058479	0.125058479	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000257	1	0.209895027	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	72905340	C	T	-	-	-	-	-	-	20	0	0	46	1	2.2	33	7	21.2	29	4	13.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.134828107	0.134828107	1	1.262495119	1.262495119	1	2.969555556	0.989851852	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.205924651	1	2.98E-10	1	0.0000134	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	73523567	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	51	9	17.6	44	5	11.4	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.078624856	1.078624856	1	0.678888885	0.678888885	1	1.377185185	1.377185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.92E-12	1	0.00000288	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	75315701	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	44	9	20.5	49	11	22.4	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.256352815	1.256352815	1	1.333957107	1.333957107	1	1.570851852	1.570851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.18E-12	1	1.19E-15	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	76733463	A	G	WDR41	CCDS4038.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	54	2	3.7	47	8	17	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.226756362	0.507589099	0.446732134	1.012378162	1.012378162	1	1.140481481	1.140481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.030129377	1	1.03E-10	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	77345237	T	C	AP3B1	CCDS4041.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	55	6	10.9	37	4	10.8	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.668011984	0.668011984	1	0.643157891	0.643157891	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000367	1	0.0000362	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	77508524	G	A	AP3B1	CCDS4041.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	27	6	22.2	29	2	6.9	29	0	0	44	0	0	149	18	12.1	113	2	1.8	145	0	0	TRUE	TRUE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.36053817	1.36053817	1	0.41090643	0.41090643	1	0	0	1	0.741554588	0.741554588	1	0.107192982	0.107192982	1	0	0	1	5	3	1	1	4.23E-09	1.44E-19	0.009279585	0.110164676	1	1	YES	1_1	1_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	5	78926985	C	T	PAPD4	CCDS4048.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	35	1	2.9	40	6	15	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.177727959	0.177727959	1	0.893274848	0.893274848	1	0.559481481	0.559481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.16091139	1	5.18E-08	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	81004314	G	A	SSBP2	CCDS4056.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	43	12	27.9	54	19	35.2	45	1	2.2	59	2	3.4	235	74	31.5	184	67	36.4	216	22	10.2	TRUE	TRUE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.709865538	1.100818201	1.553267866	2.096218311	1.048109155	2	0.473407407	0.473407407	1	1.93049335	0.965246675	2	2.167680299	1.083840149	2	2.194888889	1.097444444	2	5	5	1	0.035441897	3.24E-18	5.07E-109	2.97E-30	5.85E-104	0.201934322	6.31E-22	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	5	81096726	T	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	46	3	6.5	46	5	10.9	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.398355771	0.398355771	1	0.649113056	0.649113056	1	1.054407407	1.054407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001615827	1	0.00000361	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	81785659	A	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	48	20	41.7	41	11	26.8	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.555605482	1.277802741	2	1.595984396	1.595984396	1	2.345518519	1.172759259	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.4E-33	1	1.34E-16	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	82715659	A	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	48	5	10.4	50	6	12	61	4	6.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.637369233	0.637369233	1	0.714619879	0.714619879	1	1.420222222	1.420222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000447	1	0.000000206	1	0.000259828	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	83333106	T	G	EDIL3	CCDS4062.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	48	2	4.2	38	6	15.8	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.257399113	0.576182221	0.446732134	0.940916174	0.940916174	1	0.516444444	0.516444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.024220359	1	3.76E-08	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	84208975	A	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	60	10	16.7	56	11	19.6	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.023467903	1.023467903	1	1.167212469	1.167212469	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.86E-13	1	5.91E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	84527987	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	35	5	14.3	44	2	4.5	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.876382695	0.876382695	1	0.267982455	0.346311768	0.773818506	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000000895	1	0.020580492	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	85507712	C	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	48	8	16.7	58	15	25.9	51	6	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.023467903	1.023467903	1	1.542387905	0.771193952	2	2.539185185	0.846395062	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.23E-10	1	7.42E-22	1	0.000000232	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	85750479	G	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	57	4	7	48	14	29.2	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.428998522	0.960303701	0.446732134	1.738908372	0.869454186	2	0.43037037	0.43037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000199821	1	2.51E-21	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	85781269	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	31	13	41.9	41	18	43.9	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.567862582	1.283931291	2	2.614317723	1.307158861	2	0.43037037	0.43037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.32E-22	1	6.91E-31	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	85902606	C	T	-	-	-	-	-	-	21	0	0	40	7	17.5	48	7	14.6	29	3	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.072496305	1.072496305	1	0.869454186	0.869454186	1	2.216407407	2.216407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-09	1	4.81E-09	1	0.000414371	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	85955704	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	46	0	0	51	5	9.8	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0	0	1	0.583606234	0.583606234	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000606	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	86884314	G	C	-	-	-	-	-	-	28	0	0	42	3	7.1	56	10	17.9	52	5	9.6	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.435127072	0.435127072	1	1.065974652	1.065974652	1	2.065777778	2.065777778	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001240292	1	2.82E-13	1	0.00000668	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	86946617	T	C	-	-	-	-	-	-	44	0	0	41	8	19.5	47	8	17	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.195067312	1.195067312	1	1.012378162	1.012378162	1	1.527814815	1.527814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.22E-11	1	1.03E-10	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	87192896	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	39	10	25.6	32	6	18.8	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.568908881	1.568908881	1	1.119571143	1.119571143	1	0.968333333	0.968333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.44E-15	1	1.27E-08	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	87402316	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	38	6	15.8	28	2	7.1	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.96831095	0.96831095	1	0.422816762	0.422816762	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.76E-08	1	0.008668191	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	87469604	T	C	-	-	-	-	-	-	20	0	0	39	2	5.1	37	6	16.2	37	4	10.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.312556066	0.69964984	0.446732134	0.964736836	0.964736836	1	2.324	2.324	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.016387522	1	3.18E-08	1	0.0000362	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	87752908	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	51	2	3.9	50	8	16	55	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.239013462	0.535026348	0.446732134	0.952826505	0.952826505	1	0.387333333	0.387333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.027109304	1	1.74E-10	1	0.240951649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	88002129	T	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	43	5	11.6	53	9	17	59	4	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.710911837	0.710911837	1	1.012378162	1.012378162	1	1.463259259	1.463259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000257	1	7.1E-12	1	0.00022841	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	88261452	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	32	1	3.1	38	5	13.2	40	5	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.18998506	0.18998506	1	0.786081867	0.786081867	1	2.689814815	0.896604938	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.14819814	1	0.00000137	1	0.00000178	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	90083966	G	A	GPR98	CCDS47246.1	r.13828g>a	c.13732G>A	p.G4578R	missense	20	0	0	39	6	15.4	35	5	14.3	39	1	2.6	105	0	0	226	26	11.5	280	40	14.3	241	15	6.2	TRUE	TRUE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.943796749	0.943796749	1	0.851588689	0.851588689	1	0.559481481	0.559481481	1	0.704783286	0.704783286	1	0.851588689	0.851588689	1	1.334148148	1.334148148	1	5	4	1	1	4.43E-08	5.08E-27	0.000000895	1.42E-44	0.177567718	2.79E-12	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	5	90897991	A	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	50	18	36	52	19	36.5	39	4	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.206278114	1.103139057	2	2.173635464	1.086817732	2	2.216407407	2.216407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-29	1	1.24E-30	1	0.0000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	90980525	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	42	9	21.4	47	7	14.9	66	3	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.311509768	1.311509768	1	0.887319683	0.887319683	1	0.968333333	0.968333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.51E-13	1	4.12E-09	1	0.004522888	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	91188197	T	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	37	7	18.9	47	6	12.8	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.15829601	1.15829601	1	0.762261204	0.762261204	1	0.473407407	0.473407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.05E-10	1	0.000000141	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	91374961	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	39	9	23.1	57	20	35.1	55	7	12.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.415695123	1.415695123	1	2.090263145	1.045131573	2	2.732851852	0.910950617	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.62E-13	1	9.67E-32	1	1.28E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	91832774	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	55	2	3.6	47	7	14.9	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.220627811	0.493870475	0.446732134	0.887319683	0.887319683	1	0.559481481	0.559481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.031164417	1	4.12E-09	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	93947061	C	T	C5orf36	CCDS4070.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	45	6	13.3	52	11	21.2	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.815097192	0.815097192	1	1.262495119	1.262495119	1	1.377185185	1.377185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000108	1	2.44E-15	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	94063780	T	G	MCTP1	CCDS47247.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	42	4	9.5	32	4	12.5	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.58221228	0.58221228	1	0.744395707	0.744395707	1	1.054407407	1.054407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000601	1	0.0000201	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	94519870	A	T	MCTP1	ENST00000515393	r.?	-	-	intronic	26	0	0	46	8	17.4	37	10	27	31	3	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.066367755	1.066367755	1	1.607894727	1.607894727	1	2.087296296	2.087296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-11	1	3.01E-15	1	0.000505952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	95130085	C	T	RHOBTB3	CCDS4077.1	r.3551c>u	c.?	p.?	3'UTR variant	41	0	0	35	10	28.6	47	7	14.9	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.75276539	0.876382695	2	0.887319683	0.887319683	1	1.527814815	1.527814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.6E-15	1	4.12E-09	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	95417400	A	T	MIR583	ENST00000384846	r.?	-	-	downstream	29	0	0	22	6	27.3	26	7	26.9	49	7	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.673094236	1.673094236	1	1.601939561	1.601939561	1	3.077148148	1.025716049	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.09E-09	1	4.73E-11	1	5.58E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	95587366	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	49	2	4.1	32	7	21.9	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.251270563	0.562463597	0.446732134	1.304181279	1.304181279	1	1.054407407	1.054407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.025168485	1	2.36E-10	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	96906686	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	45	8	17.8	54	5	9.3	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.090881956	1.090881956	1	0.553830406	0.553830406	1	0.43037037	0.43037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	7.14E-11	1	0.00000806	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	98097423	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	42	3	7.1	45	9	20	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.435127072	0.435127072	1	1.191033131	1.191033131	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001240292	1	1.47E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	99067977	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	40	4	10	42	7	16.7	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.612855032	0.612855032	1	0.994512665	0.994512665	1	0.494925926	0.494925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000495	1	1.81E-09	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	99085091	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	35	5	14.3	43	0	0	39	0	0	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.876382695	0.876382695	1	0	0	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000000895	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	99854888	A	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	50	6	12	45	9	20	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.735426038	0.735426038	1	1.191033131	1.191033131	1	0.667074074	0.667074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000206	1	1.47E-12	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	100323921	C	G	-	-	-	-	-	-	25	0	0	46	12	26.1	45	6	13.3	50	2	4	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.599551633	1.599551633	1	0.792037032	0.792037032	1	0.860740741	0.860740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.12E-18	1	0.000000108	1	0.026131524	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	101213738	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	42	11	26.2	47	22	46.8	30	3	10	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.605680183	1.605680183	1	2.787017527	1.393508763	2	2.151851852	2.151851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.81E-16	1	3.14E-38	1	0.000458697	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	104011519	G	A	ENSG00000232402	ENST00000438939	r.?	-	-	intronic	31	0	0	58	2	3.4	46	5	10.9	57	4	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.208370711	0.466433226	0.446732134	0.649113056	0.649113056	1	1.506296296	1.506296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.034352256	1	0.00000361	1	0.000199821	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	104229803	T	C	ENSG00000232402	ENST00000438939	r.?	-	-	intronic	37	0	0	55	11	20	54	4	7.4	54	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.225710063	1.225710063	1	0.440682259	0.569490462	0.773818506	0.408851852	0.408851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.77E-15	1	0.000161898	1	0.237137336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	105557801	T	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	46	4	8.7	42	7	16.7	39	4	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.533183878	0.533183878	1	0.994512665	0.994512665	1	2.216407407	2.216407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000862	1	1.81E-09	1	0.0000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	105848015	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	50	2	4	37	6	16.2	59	2	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.245142013	0.548744972	0.446732134	0.964736836	0.964736836	1	0.73162963	0.73162963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.026131524	1	3.18E-08	1	0.035441897	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	106287774	A	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	50	8	16	43	4	9.3	57	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.980568051	0.980568051	1	0.553830406	0.553830406	1	0.387333333	0.387333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.74E-10	1	0.000066	1	0.248523156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	106577518	C	A	-	-	-	-	-	-	17	0	0	35	6	17.1	28	6	21.4	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.047982104	1.047982104	1	1.27440545	1.27440545	1	1.269592593	1.269592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-08	1	5.36E-09	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	107058677	C	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	53	10	18.9	45	4	8.9	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.15829601	1.15829601	1	0.530009743	0.530009743	1	0.925296296	0.925296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.57E-13	1	0.0000791	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	107819605	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	56	0	0	45	6	13.3	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0	0	1	0.792037032	0.792037032	1	0.516444444	0.516444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.000000108	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	108050428	C	G	-	-	-	-	-	-	26	0	0	48	2	4.2	47	10	21.3	66	2	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.257399113	0.576182221	0.446732134	1.268450285	1.268450285	1	0.645555556	0.645555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.024220359	1	4.27E-14	1	0.043431387	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	109790508	C	A	TMEM232	CCDS33841.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	39	4	10.3	46	7	15.2	51	2	3.9	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.631240683	0.631240683	1	0.90518518	0.90518518	1	0.839222222	0.839222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000447	1	3.53E-09	1	0.027109304	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	110399244	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	44	2	4.5	36	7	19.4	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.275784764	0.617338094	0.446732134	1.155302137	1.155302137	1	0.516444444	0.516444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.020580492	1	5.74E-10	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	110907147	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	42	2	4.8	50	9	18	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.294170415	0.658493967	0.446732134	1.071929818	1.071929818	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.018854633	1	4.07E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	112794025	G	A	MCC	CCDS43351.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	23	4	17.4	22	2	9.1	31	3	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.066367755	1.066367755	1	0.541920075	0.541920075	1	2.087296296	2.087296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000513	1	0.005403392	1	0.000505952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	113019200	G	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	38	7	18.4	43	7	16.3	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.127653258	1.127653258	1	0.970692002	0.970692002	1	0.925296296	0.925296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-10	1	2.15E-09	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	114045276	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	44	4	9.1	50	8	16	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.557698079	0.557698079	1	0.952826505	0.952826505	1	0.946814815	0.946814815	1	NA	NA	1	5.955165656	5.955165656	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000723	1	1.74E-10	0.005	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	114244118	T	G	-	-	-	-	-	-	49	0	0	47	6	12.8	59	6	10.2	31	4	12.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.78445444	0.78445444	1	0.607426897	0.607426897	1	2.775888889	0.925296296	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000141	1	0.000000561	1	0.0000177	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	114927957	C	T	TICAM2	CCDS4119.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	45	3	6.7	40	5	12.5	57	3	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.410612871	0.410612871	1	0.744395707	0.744395707	1	1.140481481	1.140481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001516071	1	0.00000178	1	0.002989991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	115048575	A	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	53	8	15.1	43	4	9.3	41	6	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.925411098	0.925411098	1	0.553830406	0.553830406	1	3.141703704	1.047234568	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.83E-10	1	0.000066	1	6.05E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	115729119	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	44	4	9.1	41	6	14.6	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.557698079	0.557698079	1	0.869454186	0.869454186	1	1.162	1.162	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000723	1	6.05E-08	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	116393197	G	C	-	-	-	-	-	-	45	0	0	37	1	2.7	50	12	24	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.165470859	0.165470859	1	1.429239757	1.429239757	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.169281299	1	2.49E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	116517281	C	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	48	3	6.2	35	3	8.6	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.37997012	0.850554707	0.446732134	0.512144246	0.512144246	1	2.259444444	2.259444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001827434	1	0.000725791	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	116749327	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	54	16	29.6	58	22	37.9	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.814050894	0.907025447	2	2.257007784	1.128503892	2	1.377185185	1.377185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.69E-24	1	1.13E-35	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	116946064	A	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	49	2	4.1	48	6	12.5	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.251270563	0.562463597	0.446732134	0.744395707	0.744395707	1	1.054407407	1.054407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.025168485	1	0.00000016	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	117099508	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	52	19	36.5	47	16	34	48	9	18.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.236920865	1.118460433	2	2.024756323	1.012378162	2	4.045481481	1.348493827	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.24E-30	1	1.98E-25	1	2.75E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	120675495	A	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	43	11	25.6	74	22	29.7	49	6	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.568908881	1.568908881	1	1.7686842	0.8843421	2	2.625259259	0.87508642	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.42E-16	1	6.78E-33	1	0.000000182	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	120786670	G	C	-	-	-	-	-	-	41	0	0	52	19	36.5	47	10	21.3	58	8	13.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.236920865	1.118460433	2	1.268450285	1.268450285	1	2.969555556	0.989851852	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.24E-30	1	4.27E-14	1	5.99E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	122081381	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	45	6	13.3	39	6	15.4	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.815097192	0.815097192	1	0.917095511	0.917095511	1	0.624037037	0.624037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000108	1	4.43E-08	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	122773803	G	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	45	4	8.9	50	12	24	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.545440978	0.545440978	1	1.429239757	1.429239757	1	1.054407407	1.054407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000791	1	2.49E-17	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	123301356	T	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	41	4	9.8	51	10	19.6	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.600597931	0.600597931	1	1.167212469	1.167212469	1	0.473407407	0.473407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000546	1	1.04E-13	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	125495132	C	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	32	0	0	44	1	2.3	51	6	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0	0	1	0.13696881	0.13696881	1	2.539185185	0.846395062	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.197923942	1	0.000000232	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	128135050	G	C	SLC27A6	ENST00000508645	r.?	-	-	intronic	27	0	0	35	16	45.7	34	12	35.3	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.800747494	1.400373747	2	2.102173477	1.051086738	2	1.205037037	1.205037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.66E-28	1	1.21E-19	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	128751889	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	51	5	9.8	45	6	13.3	54	6	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.600597931	0.600597931	1	0.792037032	0.792037032	1	2.388555556	1.194277778	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000606	1	0.000000108	1	0.000000329	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	135857913	G	A	-	-	-	-	-	-	17	0	0	30	2	6.7	39	5	12.8	56	4	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.410612871	0.410612871	1	0.762261204	0.762261204	1	1.527814815	1.527814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.009909649	1	0.00000156	1	0.000186538	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	138557052	A	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	30	3	10	39	5	12.8	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.612855032	0.612855032	1	0.762261204	0.762261204	1	0.602518519	0.602518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000458697	1	0.00000156	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	140217210	C	A	PCDHA6	CCDS47281.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	41	0	0	47	1	2.1	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0	0	1	0.125058479	0.125058479	1	2.388555556	1.194277778	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.209895027	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	140226201	C	T	PCDHA9	CCDS34254.1	r.?	-	-	upstream	28	0	0	44	7	15.9	54	13	24.1	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.9744395	0.9744395	1	1.435194923	1.435194923	1	0.968333333	0.968333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	1.12E-18	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	140536602	C	T	PCDHB6	CCDS4248.1	r.?	-	-	downstream	11	0	0	20	2	10	29	4	13.8	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.612855032	0.612855032	1	0.821812861	0.821812861	1	1.699962963	1.699962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.004473894	1	0.0000134	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	140602995	G	T	PCDHB14	CCDS4256.1	r.50g>u	c.?	p.?	5'UTR variant	22	0	0	25	3	12	52	24	46.2	37	3	8.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.735426038	0.735426038	1	2.751286533	1.375643267	2	1.743	1.743	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00026475	1	2.22E-41	1	0.000855237	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	141219685	G	A	-	-	-	-	-	-	18	0	0	34	6	17.6	35	8	22.9	29	1	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.078624856	1.078624856	1	1.363732935	1.363732935	1	0.73162963	0.73162963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.86E-08	1	8.15E-12	1	0.135292269	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	141219687	G	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	34	6	17.6	36	9	25	29	1	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.078624856	1.078624856	1	1.488791414	1.488791414	1	0.73162963	0.73162963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.86E-08	1	1.63E-13	1	0.135292269	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	142427378	A	T	ARHGAP26	CCDS47297.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	58	18	31	52	7	13.5	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.899850598	0.949925299	2	0.803947364	0.803947364	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.42E-27	1	8.58E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	143215381	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	34	3	8.8	46	7	15.2	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.539312428	0.539312428	1	0.90518518	0.90518518	1	1.441740741	1.441740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000666058	1	3.53E-09	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	143436286	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	44	8	18.2	59	20	33.9	63	6	9.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.115396158	1.115396158	1	2.018801157	1.009400579	2	2.044259259	2.044259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.9E-11	1	2.21E-31	1	0.000000832	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	143499341	C	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	46	15	32.6	39	13	33.3	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.997907403	0.998953702	2	1.983070163	0.991535082	2	2.259444444	2.259444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.35E-23	1	8.79E-21	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	144697442	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	45	6	13.3	34	3	8.8	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.815097192	0.815097192	1	0.524054578	0.524054578	1	0.581	0.581	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000108	1	0.000666058	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	145858528	T	G	TCERG1	CCDS4282.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	42	6	14.3	39	0	0	27	0	0	63	0	0	235	34	14.5	219	11	5	243	0	0	TRUE	TRUE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.876382695	0.876382695	1	0	0	1	0	0	1	0.888639796	0.888639796	1	0.297758283	0.297758283	1	0	0	1	4	3	1	1	7.02E-08	2.49E-38	1	2.03E-08	1	1	YES	1_1	0_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	5	146878385	G	T	DPYSL3	ENST00000343218	r.?	-	-	intronic	28	0	0	36	4	11.1	53	11	20.8	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.680269085	0.680269085	1	1.238674456	1.238674456	1	0.494925926	0.494925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000324	1	3.07E-15	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	146913076	G	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	43	6	14	46	4	8.7	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.857997044	0.857997044	1	0.518099412	0.518099412	1	0.451888889	0.451888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.13E-08	1	0.0000862	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	147195542	T	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	42	3	7.1	46	5	10.9	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.435127072	0.435127072	1	0.649113056	0.649113056	1	1.140481481	1.140481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001240292	1	0.00000361	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	148905515	G	A	CSNK1A1	CCDS47303.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	52	4	7.7	45	9	20	37	0	0	39	0	0	186	14	7.5	185	28	15.1	161	13	8.1	TRUE	TRUE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.471898374	0.471898374	1	1.191033131	1.191033131	1	0	0	1	0.459641274	1.028896823	0.446732134	0.899230014	0.899230014	1	1.743	0.8715	2	5	5	1	1	0.000139698	1.13E-12	1.47E-12	2.01E-32	1	2.93E-12	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	5	149660091	C	T	CAMK2A	CCDS43386.1	r.?	-	-	intronic	18	0	0	27	10	37	25	11	44	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.267563617	1.133781808	2	2.620272889	1.310136444	2	1.075925926	1.075925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.62E-17	1	2.04E-19	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	150582189	G	T	CCDC69	CCDS4312.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	44	4	9.1	47	4	8.5	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.557698079	0.557698079	1	0.506189081	0.506189081	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000723	1	0.0000939	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	151643511	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	49	5	10.2	40	1	2.5	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.625112132	0.625112132	1	0.148879141	0.148879141	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000496	1	0.181679879	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	152020866	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	47	19	40.4	39	14	35.9	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.475934328	1.237967164	2	2.13790447	1.068952235	2	1.89362963	1.89362963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.16E-31	1	8.19E-23	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	152328009	A	C	-	-	-	-	-	-	36	0	0	32	2	6.2	40	6	15	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.37997012	0.37997012	1	0.893274848	0.893274848	1	1.656925926	1.656925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.011224977	1	5.18E-08	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	152581260	G	T	-	-	-	-	-	-	18	0	0	39	4	10.3	29	6	20.7	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.631240683	0.631240683	1	1.232719291	1.232719291	1	0.581	0.581	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000447	1	6.72E-09	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	153219305	G	A	-	-	-	-	-	-	16	0	0	34	10	29.4	33	5	15.2	35	5	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.801793793	0.900896896	2	0.90518518	0.90518518	1	3.077148148	1.025716049	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.15E-15	1	0.00000066	1	0.000000895	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	154529414	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	58	21	36.2	46	16	34.8	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.218535214	1.109267607	2	2.072397648	1.036198824	2	1.226555556	1.226555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.34E-33	1	1.31E-25	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	154752762	A	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	31	4	12.9	34	4	11.8	51	2	3.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.790582991	0.790582991	1	0.702709547	0.702709547	1	0.839222222	0.839222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000177	1	0.0000257	1	0.027109304	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	155968123	A	G	SGCD	CCDS47325.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	59	17	28.8	41	14	34.1	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.765022491	0.882511246	2	2.030711489	1.015355744	2	2.625259259	0.87508642	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.74E-25	1	1.9E-22	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	156558350	C	A	AC010609.1	ENST00000507127	r.?	-	-	downstream	26	0	0	31	2	6.5	26	7	26.9	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.398355771	0.398355771	1	1.601939561	1.601939561	1	0.559481481	0.559481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.010558179	1	4.73E-11	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	156846632	G	A	-	-	-	-	-	-	11	0	0	16	5	31.2	7	2	28.6	35	3	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.912107699	1.912107699	1	1.703177378	1.703177378	1	1.850592593	1.850592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000013	1	0.000516315	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	156964330	G	A	ADAM19	CCDS4338.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	46	9	19.6	45	7	15.6	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.201195862	1.201195862	1	0.929005842	0.929005842	1	0.688592593	0.688592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.82E-12	1	0.000000003	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	157443091	G	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	35	13	37.1	35	11	31.4	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.273692167	1.136846084	2	1.869922016	0.934961008	2	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.63E-21	1	1.82E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	157551688	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	41	13	31.7	41	8	19.5	36	5	13.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.94275045	0.971375225	2	1.161257303	1.161257303	1	2.991074074	0.997024691	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.89E-20	1	3.22E-11	1	0.00000104	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	158138013	A	C	EBF1	CCDS4343.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	46	0	0	53	4	7.5	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0	0	1	0.446637424	0.446637424	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000150502	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	158903462	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	43	2	4.7	43	6	14	48	4	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.288041865	0.644775342	0.446732134	0.833723192	0.833723192	1	1.786037037	1.786037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.019709573	1	8.13E-08	1	0.000102016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	159061277	C	T	-	-	-	-	-	-	16	0	0	41	4	9.8	37	7	18.9	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.600597931	0.600597931	1	1.125526309	1.125526309	1	1.097444444	1.097444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000546	1	7.05E-10	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	160873601	G	A	GABRB2	CCDS4355.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	42	7	16.7	45	11	24.4	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.023467903	1.023467903	1	1.45306042	1.45306042	1	0.925296296	0.925296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.81E-09	1	4.24E-16	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	160893919	A	C	GABRB2	CCDS4355.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	49	22	44.9	59	19	32.2	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.751719092	1.375859546	2	1.917563341	0.958781671	2	2.001222222	2.001222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-37	1	2.2E-29	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	160992554	A	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	39	3	7.7	40	9	22.5	55	5	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.471898374	0.471898374	1	1.339912273	1.339912273	1	1.958185185	1.958185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000998458	1	4.64E-13	1	0.00000883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	162543335	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	38	5	13.2	45	7	15.6	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.808968642	0.808968642	1	0.929005842	0.929005842	1	0.925296296	0.925296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000137	1	0.000000003	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	162791206	A	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	40	8	20	47	8	17	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.225710063	1.225710063	1	1.012378162	1.012378162	1	0.624037037	0.624037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.61E-11	1	1.03E-10	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	163170453	T	G	-	-	-	-	-	-	46	0	0	52	6	11.5	56	4	7.1	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.704783286	0.704783286	1	0.422816762	0.546403011	0.773818506	0.925296296	0.925296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000261	1	0.000186538	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	163233793	T	A	-	-	-	-	-	-	48	0	0	43	8	18.6	41	11	26.8	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.139910359	1.139910359	1	1.595984396	1.595984396	1	0.494925926	0.494925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-11	1	1.34E-16	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	163525930	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	54	7	13	46	4	8.7	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.796711541	0.796711541	1	0.518099412	0.518099412	1	0.451888889	0.451888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.13E-08	1	0.0000862	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	163614507	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	47	20	42.6	60	27	45	60	8	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.610762435	1.305381217	2	2.679824545	1.339912273	2	2.861962963	0.953987654	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.18E-34	1	5.59E-46	1	7.93E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	163715419	C	G	-	-	-	-	-	-	12	0	0	29	6	20.7	26	4	15.4	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.268609915	1.268609915	1	0.917095511	0.917095511	1	0.494925926	0.494925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.72E-09	1	0.00000856	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	164443060	C	A	-	-	-	-	-	-	17	0	0	41	14	34.1	50	15	30	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.089835658	1.044917829	2	1.786549697	0.893274848	2	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.9E-22	1	5.83E-23	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	165024232	T	C	-	-	-	-	-	-	36	0	0	56	7	12.5	46	4	8.7	37	3	8.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.76606879	0.76606879	1	0.518099412	0.518099412	1	1.743	1.743	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.46E-08	1	0.0000862	1	0.000855237	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	165841652	C	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	46	23	50	40	12	30	49	7	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	3.064275158	1.532137579	2	1.786549697	0.893274848	2	3.077148148	1.025716049	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.79E-41	1	1.2E-18	1	5.58E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	165843556	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	38	5	13.2	40	6	15	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.808968642	0.808968642	1	0.893274848	0.893274848	1	1.786037037	1.786037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000137	1	5.18E-08	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	166578547	C	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	29	1	3.4	26	3	11.5	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.208370711	0.208370711	1	0.68484405	0.68484405	1	2.108814815	2.108814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.135292269	1	0.000298167	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	167532506	C	T	ODZ2	ENST00000403607	r.?	-	-	intronic	26	0	0	34	14	41.2	45	15	33.3	43	8	18.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.52496273	1.262481365	2	1.983070163	0.991535082	2	4.002444444	1.334148148	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.74E-24	1	9.14E-24	1	4.85E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	167553109	G	T	ODZ2	ENST00000403607	r.?	-	-	intronic	31	0	0	39	8	20.5	34	6	17.6	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.256352815	1.256352815	1	1.048109155	1.048109155	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.09E-11	1	1.86E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	167614051	C	A	ODZ2	ENST00000403607	r.?	-	-	intronic	29	0	0	31	4	12.9	44	9	20.5	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.790582991	0.790582991	1	1.220808959	1.220808959	1	0.451888889	0.451888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000177	1	1.18E-12	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	167798043	G	A	WWC1	CCDS4366.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	38	17	44.7	36	4	11.1	25	2	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.739461991	1.369730996	2	0.661023388	0.661023388	1	1.721481481	1.721481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.99E-29	1	0.0000324	1	0.006948068	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	167957820	C	T	FBLL1	ENST00000338333	r.?	-	-	downstream	11	0	0	28	8	28.6	21	3	14.3	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.75276539	1.75276539	1	0.851588689	0.851588689	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.11E-12	1	0.000155401	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	168003532	C	T	PANK3	CCDS4368.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	47	10	21.3	41	13	31.7	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.305381217	1.305381217	1	1.887787513	0.943893756	2	0.645555556	0.645555556	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.27E-14	1	1.89E-20	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	168376125	G	T	SLIT3	CCDS4369.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	50	13	26	33	7	21.2	61	3	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.593423082	1.025852087	1.553267866	1.262495119	1.262495119	1	1.054407407	1.054407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.65E-19	1	2.98E-10	1	0.003623631	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	168655994	C	T	SLIT3	CCDS4369.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	49	8	16.3	36	3	8.3	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.998953702	0.998953702	1	0.494278749	0.494278749	1	1.140481481	1.140481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-10	1	0.000788827	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	168802963	G	A	-	-	-	-	-	-	14	0	0	21	6	28.6	22	6	27.3	26	1	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.75276539	1.75276539	1	1.625760224	1.625760224	1	0.817703704	0.817703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.95E-10	1	1.09E-09	1	0.122190858	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	169106259	C	A	DOCK2	CCDS4371.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	37	3	8.1	45	9	20	44	5	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.496412576	0.496412576	1	1.191033131	1.191033131	1	2.453111111	0.817703704	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000855237	1	1.47E-12	1	0.00000288	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	169267029	C	T	DOCK2	CCDS4371.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	36	11	30.6	41	17	41.5	50	3	6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.875336397	0.937668198	2	2.471393747	1.235696874	2	1.291111111	1.291111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.62E-17	1	1.03E-28	1	0.002055544	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	170185840	G	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	40	1	2.5	49	7	14.3	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.153213758	0.153213758	1	0.851588689	0.851588689	1	2.022740741	2.022740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.181679879	1	5.58E-09	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	170305658	T	G	RANBP17	CCDS34287.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	33	15	45.5	50	18	36	33	4	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.788490394	1.394245197	2	2.143859636	1.071929818	2	2.603740741	2.603740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.91E-26	1	5.92E-29	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	170510897	C	G	RANBP17	CCDS34287.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	40	12	30	39	9	23.1	31	2	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.838565095	0.919282547	2	1.375643267	1.375643267	1	1.398703704	1.398703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.2E-18	1	3.62E-13	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	172899775	G	C	-	-	-	-	-	-	24	0	0	36	7	19.4	37	7	18.9	31	3	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.188938761	1.188938761	1	1.125526309	1.125526309	1	2.087296296	2.087296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.74E-10	1	7.05E-10	1	0.000505952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	172902151	A	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	32	4	12.5	46	4	8.7	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.76606879	0.76606879	1	0.518099412	0.518099412	1	1.398703704	1.398703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000201	1	0.0000862	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	174034594	C	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	22	3	13.6	23	4	17.4	21	2	9.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.833482843	0.833482843	1	1.036198824	1.036198824	1	2.044259259	2.044259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000179267	1	0.00000513	1	0.004928472	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	174194121	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	40	7	17.5	33	4	12.1	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.072496305	1.072496305	1	0.720575044	0.720575044	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-09	1	0.0000228	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	174529763	G	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	51	8	15.7	57	0	0	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.9621824	0.9621824	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	2.05E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	174993561	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	31	11	35.5	29	8	27.6	32	5	15.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.175635362	1.087817681	2	1.643625721	1.643625721	1	3.356888889	1.118962963	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.77E-18	1	1.53E-12	1	0.000000562	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	174998694	C	A	-	-	-	-	-	-	13	0	0	23	8	34.8	46	20	43.5	28	1	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	2.13273551	1.066367755	2	2.59049706	1.29524853	2	0.774666667	0.774666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.79E-13	1	4.72E-34	1	0.130947004	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	175749964	C	T	C5orf25	CCDS4398.2	r.?	-	-	intronic	32	0	0	35	2	5.7	34	8	23.5	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.349327368	0.349327368	1	1.399463929	1.399463929	1	0.559481481	0.559481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.013332991	1	6.32E-12	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	177907884	C	T	COL23A1	CCDS4436.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	36	8	22.2	29	7	24.1	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	1.36053817	1.36053817	1	1.435194923	1.435194923	1	1.31262963	1.31262963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-11	1	1.11E-10	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	178734899	G	A	ADAMTS2	CCDS4444.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	10	6	60	14	7	50	29	2	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	3.67713019	1.838565095	2	2.977582828	1.488791414	2	1.484777778	1.484777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.23E-12	1	2.6E-13	1	0.009279585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	178817574	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	45	7	15.6	38	7	18.4	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.446732134	2.773818506	5	2	2	3	0	0	2	0.553267866	0.226181494	1	2	2	NA	1	1	NA	0.446732134	0.773818506	NA	0.956053849	0.956053849	1	1.095750481	1.095750481	1	2.388555556	1.194277778	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000003	1	8.61E-10	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	5	180721834	T	C	-	-	-	-	-	-	7	0	0	23	4	17.4	16	0	0	21	3	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.00000513	1	1	1	0.000155401	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	306138	C	A	DUSP22	CCDS4468.1	r.?	-	-	intronic	74	0	0	83	1	1.2	79	5	6.3	78	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.080181818	0.080181818	1	0.38942487	0.38942487	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.340346757	1	0.0000518	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	526638	C	T	EXOC2	CCDS34327.1	r.?	-	-	intronic	11	0	0	30	4	13.3	27	2	7.4	39	4	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.888681818	0.888681818	1	0.457419689	0.457419689	1	2.010407407	2.010407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000154	1	0.00807567	1	0.0000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	1253524	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	33	8	24.2	41	4	9.8	61	1	1.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.617	1.617	1	0.605772021	0.605772021	1	0.312296296	0.312296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-12	1	0.0000546	1	0.263440347	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	2517286	A	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	44	0	0	59	4	6.8	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.420331606	0.420331606	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00022841	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	3848581	G	C	FAM50B	CCDS4487.1	r.?	-	-	upstream	29	0	0	46	10	21.7	34	12	35.3	37	7	18.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.449954545	1.449954545	1	2.182015544	1.091007772	2	3.689	1.8445	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.38E-14	1	1.21E-19	1	7.05E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	3848594	G	C	FAM50B	CCDS4487.1	r.?	-	-	upstream	28	0	0	47	11	23.4	34	11	32.4	37	8	21.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.563545455	1.563545455	1	2.002756477	1.001378238	2	4.216	2.108	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.21E-16	1	1.26E-17	1	1.33E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	4635071	A	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	33	5	15.2	49	12	24.5	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.015636364	1.015636364	1	1.514430052	1.514430052	1	0.448925926	0.448925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000066	1	1.9E-17	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	5364003	C	T	FARS2	CCDS4494.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	57	1	1.8	30	2	6.7	32	4	12.5	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.120272727	0.120272727	1	0.414150259	0.414150259	1	2.439814815	2.439814815	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.248523156	1	0.009909649	1	0.0000201	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	5387055	A	C	FARS2	CCDS4494.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	41	17	41.5	33	11	33.3	35	1	2.9	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.772954545	1.386477273	2	2.058388601	1.029194301	2	0.566037037	0.566037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.03E-28	1	8.54E-18	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	5551772	G	A	FARS2	CCDS4494.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	49	13	26.5	43	13	30.2	46	8	17.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.770681818	0.885340909	2	1.866766839	0.93338342	2	3.396222222	1.698111111	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.71E-19	1	3.88E-20	1	8.61E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	7965817	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	36	8	22.2	45	18	40	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.483363636	1.483363636	1	2.47253886	1.23626943	2	2.127518519	2.127518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-11	1	5.76E-30	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	9418650	G	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	50	9	18	55	8	14.5	51	2	3.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.202727273	1.202727273	1	0.896295337	0.896295337	1	0.761222222	0.761222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.07E-12	1	3.86E-10	1	0.027109304	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	14060822	A	C	-	-	-	-	-	-	34	0	0	41	7	17.1	30	4	13.3	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.142590909	1.142590909	1	0.822119171	0.822119171	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.51E-09	1	0.0000154	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	15261735	G	T	JARID2	CCDS4533.1	r.?	-	-	intronic	15	0	0	23	7	30.4	33	15	45.5	29	5	17.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.031272727	1.015636364	2	2.812512953	1.406256477	2	3.357185185	1.678592593	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.79E-11	1	2.91E-26	1	0.000000336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	17844637	T	C	KIF13A	CCDS47380.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	29	4	13.8	44	5	11.4	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.922090909	0.922090909	1	0.704673575	0.704673575	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000134	1	0.00000288	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	18668269	G	T	AL136230.1	ENST00000510325	r.?	-	-	intronic	25	0	0	37	12	32.4	54	17	31.5	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.164909091	1.082454545	2	1.947124352	0.973562176	2	1.093037037	1.093037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.03E-19	1	3.02E-26	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	18964808	G	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	44	16	36.4	45	14	31.1	49	3	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.432181818	1.216090909	2	1.922398964	0.961199482	2	1.19062963	1.19062963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.57E-26	1	8.81E-22	1	0.001939399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	19548870	T	C	-	-	-	-	-	-	41	0	0	43	15	34.9	42	15	35.7	29	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.331954545	1.165977273	2	2.206740933	1.103370466	2	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.05E-24	1	2.65E-24	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	23173744	G	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	39	9	23.1	39	7	17.9	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.5435	1.5435	1	1.10646114	1.10646114	1	0.468444444	0.468444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.62E-13	1	1.04E-09	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	23367065	G	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	46	8	17.4	53	6	11.3	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.162636364	1.162636364	1	0.698492228	0.698492228	1	1.307740741	1.307740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-11	1	0.000000293	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	23964957	C	T	-	-	-	-	-	-	8	0	0	19	1	5.3	23	5	21.7	33	1	3	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.354136364	0.354136364	1	1.341352332	1.341352332	1	0.585555556	0.585555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.090843738	1	9.75E-08	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	24459812	G	A	GPLD1	CCDS4553.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	44	1	2.3	41	0	0	36	4	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.153681818	0.153681818	1	0	0	1	2.166555556	2.166555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.197923942	1	1	1	0.0000324	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	24564957	C	G	KIAA0319	CCDS34348.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	38	6	15.8	31	5	16.1	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.055727273	1.055727273	1	0.995196891	0.995196891	1	0.936888889	0.936888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.76E-08	1	0.000000476	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	24917905	G	A	-	-	-	-	-	-	10	0	0	18	4	22.2	20	2	10	35	3	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.483363636	1.483363636	1	0.618134715	0.618134715	1	1.678592593	1.678592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000181	1	0.004473894	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	24919896	G	C	-	-	-	-	-	-	28	0	0	40	13	32.5	49	14	28.6	48	4	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.171590909	1.085795455	2	1.767865285	0.883932642	2	1.620037037	1.620037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.3E-20	1	3.5E-21	1	0.000102016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	25430898	A	T	LRRC16A	ENST00000329474	r.?	-	-	intronic	19	0	0	47	7	14.9	37	6	16.2	36	5	13.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.995590909	0.995590909	1	1.001378238	1.001378238	1	2.713074074	1.356537037	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.12E-09	1	3.18E-08	1	0.00000104	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	26690083	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	41	5	12.2	28	2	7.1	71	2	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.815181818	0.815181818	1	0.438875648	0.438875648	1	0.546518519	0.546518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000202	1	0.008668191	1	0.04950591	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	27279416	G	A	POM121L2	ENST00000444565	r.534c>u	c.534C>T	p.F178F	silent	30	0	0	29	11	37.9	41	15	36.6	26	0	0	390	0	0	304	73	24	282	106	37.6	250	16	6.4	TRUE	TRUE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.532409091	1.266204545	2	2.262373057	1.131186528	2	0	0	1	1.603636364	0.801818182	2	2.324186528	1.162093264	2	1.249185185	1.249185185	1	5	5	1	1	1.56E-18	1.08E-97	1.71E-24	3.01E-165	1	3.46E-13	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	6	27553497	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	41	14	34.1	37	14	37.8	50	3	6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.2785	1.13925	2	2.336549223	1.168274611	2	1.171111111	1.171111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.9E-22	1	3.35E-23	1	0.002055544	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	28303171	T	C	ZNF323	CCDS4649.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	55	18	32.7	47	14	29.8	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.184954545	1.092477273	2	1.842041451	0.921020725	2	0.936888889	0.936888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.61E-28	1	1.79E-21	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	28487739	G	T	GPX6	CCDS43432.1	r.?	-	-	upstream	34	0	0	50	8	16	36	8	22.2	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.069090909	1.069090909	1	1.372259067	1.372259067	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.74E-10	1	1.04E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	29476224	G	A	-	-	-	-	-	-	14	0	0	24	5	20.8	21	6	28.6	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.389818182	1.389818182	1	1.767865285	1.767865285	1	1.151592593	1.151592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000123	1	7.95E-10	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	29816568	C	G	-	-	-	-	-	-	42	0	0	62	5	8.1	54	11	20.4	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.541227273	0.541227273	1	1.260994819	1.260994819	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000016	1	3.84E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	30348364	G	A	-	-	-	-	-	-	20	0	0	35	5	14.3	31	1	3.2	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.9555	0.9555	1	0.197803109	0.197803109	1	1.19062963	1.19062963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000895	1	0.143917729	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	32443449	C	G	-	-	-	-	-	-	19	0	0	27	3	11.1	38	8	21.1	30	2	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.741681818	0.741681818	1	1.304264249	1.304264249	1	1.307740741	1.307740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000334187	1	1.67E-11	1	0.009909649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	33815998	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	55	0	0	46	0	0	40	6	15	364	0	0	281	0	0	227	5	2.2	254	12	4.7	TRUE	TRUE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.777777778	2.777777778	1	0	0	1	0.135989637	0.135989637	1	0.87037037	0.87037037	1	3	1	1	1	1	1	1	0.006020667	5.18E-08	9.25E-09	YES	0_0	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	6	33978596	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	37	6	16.2	41	3	7.3	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.082454545	1.082454545	1	0.451238342	0.451238342	1	0.944444444	0.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.18E-08	1	0.001155993	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	33986143	C	G	GRM4	CCDS4787.1	r.?	-	-	downstream	30	0	0	36	11	30.6	32	13	40.6	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.044636364	1.022318182	2	2.509626943	1.254813472	2	0.407407407	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	2.62E-17	1	3.88E-22	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	34114517	G	A	GRM4	ENST00000374177	r.?	-	-	intronic	16	0	0	24	10	41.7	23	9	39.1	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.786318182	1.393159091	2	2.416906736	1.208453368	2	0.981481481	0.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.8E-17	1	1.5E-15	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	34788796	C	T	UHRF1BP1	CCDS43455.1	r.?	-	-	intronic	17	0	0	16	6	37.5	23	9	39.1	22	5	22.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.505681818	1.252840909	2	2.416906736	1.208453368	2	4.203703704	4.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.2E-10	1	1.5E-15	1	7.67E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	34810177	A	G	UHRF1BP1	CCDS43455.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	38	8	21.1	55	9	16.4	29	2	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.409863636	1.409863636	1	1.013740933	1.013740933	1	1.277777778	1.277777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.67E-11	1	1.01E-11	1	0.009279585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	34887709	T	C	ANKS1A	CCDS4798.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	31	2	6.5	40	10	25	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.434318182	0.434318182	1	1.545336788	1.545336788	1	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	NA	0	5	NA	1	1	0.010558179	1	7.22E-15	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	35598566	T	A	FKBP5	CCDS4808.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	36	0	0	42	4	9.5	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.587227979	0.587227979	1	0.518518519	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.0000601	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	36873014	A	G	C6orf89	CCDS4827.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	31	6	19.4	51	11	21.6	28	4	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.296272727	1.296272727	1	1.335170984	1.335170984	1	2.648148148	2.648148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.03E-08	1	1.94E-15	1	0.0000116	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	37638463	G	A	MDGA1	CCDS47417.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	47	8	17	41	5	12.2	25	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.135909091	1.135909091	1	0.754124352	0.754124352	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.03E-10	1	0.00000202	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	37763301	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	33	3	9.1	46	5	10.9	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.608045455	0.608045455	1	0.673766839	0.673766839	1	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000609557	1	0.00000361	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	37823369	G	C	ZFAND3	CCDS4836.1	r.?	-	-	intronic	20	0	0	43	5	11.6	26	0	0	35	0	0	134	0	0	270	34	12.6	227	2	0.9	205	0	0	FALSE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.775090909	0.775090909	1	0	0	1	0	NA	0	0.841909091	0.841909091	1	0.055632124	0.055632124	1	0	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000257	3.31E-36	1	0.313886678	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	6	38991095	C	T	DNAH8	CCDS4838.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	26	10	38.5	23	6	26.1	46	7	15.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.5725	1.28625	2	1.613331606	1.613331606	1	2.814814815	2.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.82E-17	1	1.47E-09	1	3.53E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	39281164	C	T	KCNK17	CCDS47419.1	r.?	-	-	intronic	7	0	0	16	7	43.8	3	1	33.3	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.926636364	1.463318182	2	2.058388601	2.058388601	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	8.59E-13	1	0.014925125	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	39571001	G	T	KIF6	CCDS4844.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	47	12	25.5	47	12	25.5	54	4	7.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.703863636	0.851931818	2	1.576243523	1.576243523	1	1.37037037	1.37037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.09E-17	1	1.09E-17	1	0.000161898	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	39943382	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	38	5	13.2	43	6	14	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.882	0.882	1	0.865388601	0.865388601	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00000137	1	8.13E-08	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	40824597	G	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	59	10	16.9	43	4	9.3	56	6	10.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.129227273	1.129227273	1	0.574865285	0.574865285	1	1.981481481	1.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.91E-13	1	0.000066	1	0.000000409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	40885763	A	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	50	17	34	37	14	37.8	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.271818182	1.135909091	2	2.336549223	1.168274611	2	1.62962963	1.62962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	6.43E-27	1	3.35E-23	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	44613556	G	A	-	-	-	-	-	-	11	0	0	15	2	13.3	16	6	37.5	33	0	0	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.888681818	0.888681818	1	2.318005181	1.159002591	2	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.002513772	1	1.2E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	45097673	G	A	SUPT3H	CCDS34466.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	42	3	7.1	25	5	20	36	4	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.474409091	0.474409091	1	1.23626943	1.23626943	1	2.055555556	2.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.001240292	1	0.000000153	1	0.0000324	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	45960451	C	T	CLIC5	CCDS47438.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	50	9	18	45	12	26.7	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.202727273	1.202727273	1	1.650419689	0.825209845	2	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.07E-12	1	6.03E-18	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	46287754	G	T	RCAN2	CCDS43469.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	53	10	18.9	52	8	15.4	56	4	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.262863636	1.262863636	1	0.951927461	0.951927461	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.57E-13	1	2.42E-10	1	0.000186538	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	46327442	C	T	RCAN2	ENST00000371374	r.?	-	-	intronic	28	0	0	41	16	39	54	15	27.8	52	7	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.605909091	1.302954545	2	1.718414508	0.859207254	2	2.5	2.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.4E-26	1	2.2E-22	1	8.58E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	46883020	C	T	GPR116	CCDS4919.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	53	0	0	39	5	12.8	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.791212435	0.791212435	1	0.37037037	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.00000156	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	46896236	C	A	GPR116	CCDS4919.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	39	1	2.6	35	9	25.7	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.173727273	0.173727273	1	1.588606218	1.588606218	1	2.018518519	2.018518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.177567718	1	1.23E-13	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	47036257	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	45	10	22.2	40	8	20	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.483363636	1.483363636	1	1.23626943	1.23626943	1	0.537037037	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	2.66E-14	1	2.61E-11	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	49207805	A	G	-	-	-	-	-	-	38	0	0	35	15	42.9	46	15	32.6	39	5	12.8	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.8665	1.43325	2	2.015119171	1.007559585	2	2.37037037	2.37037037	1	6.681818182	6.681818182	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	9.02E-26	0.005	1.35E-23	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	49875714	T	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	45	17	37.8	40	16	40	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.525727273	1.262863636	2	2.47253886	1.23626943	2	1.648148148	1.648148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	7.37E-28	1	8.56E-27	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	50612943	T	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	58	6	10.3	53	18	34	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.688227273	0.688227273	1	2.101658031	1.050829016	2	0.777777778	0.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000000506	1	2.09E-28	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	51389621	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	49	11	22.4	38	12	31.6	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.496727273	1.496727273	1	1.953305699	0.97665285	2	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.19E-15	1	5.86E-19	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	52930433	C	T	ICK	CCDS4949.1	r.?	-	-	upstream	9	0	0	17	5	29.4	8	3	37.5	33	1	3	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.964454545	1.964454545	1	2.318005181	2.318005181	1	0.555555556	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.84E-08	1	0.00000687	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	53188050	G	A	ELOVL5	CCDS4951.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	40	5	12.5	47	9	19.1	40	4	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.835227273	0.835227273	1	1.180637306	1.180637306	1	1.851851852	1.851851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00000178	1	2.24E-12	1	0.0000495	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	53289858	G	A	-	-	-	-	-	-	20	0	0	57	6	10.5	42	7	16.7	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.701590909	0.701590909	1	1.032284974	1.032284974	1	0.518518519	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000000456	1	1.81E-09	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	53837132	T	A	C6orf142	ENST00000505762	r.?	-	-	intronic	27	0	0	59	11	18.6	53	4	7.5	65	2	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.242818182	1.242818182	1	0.463601036	0.463601036	1	0.574074074	0.574074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.1E-14	1	0.000150502	1	0.042252341	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	54159967	G	A	-	-	-	-	-	-	9	0	0	24	4	16.7	11	0	0	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.115863636	1.115863636	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000613	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	54314005	A	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	50	18	36	62	36	58.1	53	12	22.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.405454545	1.202727273	2	3.591362694	1.795681347	2	4.185185185	4.185185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.92E-29	1	2.69E-66	1	5.39E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	56858156	T	C	BEND6	CCDS43476.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	44	16	36.4	44	15	34.1	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.432181818	1.216090909	2	2.107839378	1.053919689	2	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	5.57E-26	1	6.12E-24	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	57449600	G	C	PRIM2	ENST00000425433	r.?	-	-	intronic	7	0	0	18	3	16.7	10	0	0	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.115863636	1.115863636	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	4	NA	1	1	0.0000964	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	57800616	G	C	-	-	-	-	-	-	21	0	0	18	4	22.2	23	6	26.1	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.483363636	1.483363636	1	1.352331606	1.352331606	1	0.833333333	0.833333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00000181	1	1.47E-09	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	58057359	A	G	-	-	-	-	-	-	22	0	0	31	4	12.9	40	7	17.5	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.861954545	0.861954545	1	0.906735751	0.906735751	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.0000177	1	1.26E-09	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	62414590	C	T	KHDRBS2	CCDS4963.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	54	7	13	43	8	18.6	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.738636364	0.738636364	1	0.96373057	0.96373057	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.13E-08	1	4.85E-11	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	62580536	C	T	KHDRBS2	CCDS4963.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	34	8	23.5	20	5	25	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.335227273	1.335227273	1	1.295336788	1.295336788	1	0.833333333	0.833333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.32E-12	1	4.55E-08	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	62695737	C	T	KHDRBS2	CCDS4963.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	36	12	33.3	41	10	24.4	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.892045455	1.892045455	1	1.264248705	1.264248705	1	0.944444444	0.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.73E-19	1	9.51E-15	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	63063596	T	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	40	8	20	42	5	11.9	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	0.616580311	0.616580311	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.61E-11	1	0.00000228	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	63539995	C	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	28	3	10.7	28	5	17.9	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.607954545	0.607954545	1	0.92746114	0.92746114	1	2.055555556	2.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000372895	1	0.000000279	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	64400121	T	C	PHF3	CCDS4966.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	40	3	7.5	43	8	18.6	52	4	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.426136364	0.426136364	1	0.96373057	0.96373057	1	1.425925926	1.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001075403	1	4.85E-11	1	0.000139698	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	64519900	C	T	EYS	CCDS47445.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	20	6	30	17	2	11.8	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.704545455	1.704545455	1	0.611398964	0.611398964	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.7E-10	1	0.003234386	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	64908152	G	A	EYS	CCDS47445.1	r.?	-	-	intronic	17	0	0	14	3	21.4	19	4	21.1	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.215909091	1.215909091	1	1.093264249	1.093264249	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000437	1	0.00000228	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	65206667	A	G	EYS	CCDS47445.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	44	7	15.9	45	5	11.1	53	6	11.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.903409091	0.903409091	1	0.575129534	0.575129534	1	2.092592593	2.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	0.00000323	1	0.000000293	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	66216005	C	T	EYS	CCDS47446.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	42	8	19	30	9	30	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.079545455	1.079545455	1	1.554404145	1.554404145	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.96E-11	1	2.54E-14	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	66350653	G	T	EYS	CCDS47446.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	43	9	20.9	29	5	17.2	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.1875	1.1875	1	0.89119171	0.89119171	1	0.777777778	0.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.45E-13	1	0.000000336	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	66748378	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	41	6	14.6	39	7	17.9	54	3	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.829545455	0.829545455	1	0.92746114	0.92746114	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.05E-08	1	1.04E-09	1	0.00256299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	67768703	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	39	6	15.4	41	7	17.1	48	3	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.875	0.875	1	0.886010363	0.886010363	1	1.148148148	1.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.43E-08	1	1.51E-09	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	68074828	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	51	5	9.8	50	1	2	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.556818182	0.556818182	1	0.103626943	0.103626943	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000606	1	0.221687443	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	68389516	C	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	42	8	19	37	11	29.7	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.079545455	1.079545455	1	1.538860104	1.538860104	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.96E-11	1	3.7E-17	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	69335625	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	50	9	18	43	9	20.9	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.022727273	1.022727273	1	1.082901554	1.082901554	1	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.07E-12	1	9.45E-13	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	69803043	C	T	BAI3	CCDS4968.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	37	7	18.9	22	4	18.2	37	3	8.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.073863636	1.073863636	1	0.943005181	0.943005181	1	1.5	1.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.05E-10	1	0.00000425	1	0.000855237	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	71424194	T	G	SMAP1	CCDS43478.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	39	8	20.5	40	8	20	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.164772727	1.164772727	1	1.03626943	1.03626943	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.09E-11	1	2.61E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	71716738	G	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	39	6	15.4	28	4	14.3	26	3	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.875	0.875	1	0.740932642	0.740932642	1	2.12962963	2.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.43E-08	1	0.0000116	1	0.000298167	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	71884504	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	41	9	22	31	5	16.1	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.25	1.25	1	0.834196891	0.834196891	1	0.981481481	0.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-13	1	0.000000476	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	72353116	T	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	32	4	12.5	46	10	21.7	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	1.124352332	1.124352332	1	0.518518519	0.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000201	1	3.38E-14	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	73079079	C	T	RIMS1	CCDS47449.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	38	9	23.7	51	5	9.8	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.346590909	1.346590909	1	0.507772021	0.507772021	1	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.79E-13	1	0.00000606	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	73158492	G	C	-	-	-	-	-	-	47	0	0	44	11	25	49	8	16.3	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	0.844559585	0.844559585	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.22E-16	1	1.47E-10	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	73236229	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	33	6	18.2	42	10	23.8	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	1.233160622	1.233160622	1	0.462962963	0.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.54E-08	1	1.24E-14	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	73318364	G	C	-	-	-	-	-	-	28	0	0	38	6	15.8	33	5	15.2	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.897727273	0.897727273	1	0.787564767	0.787564767	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.76E-08	1	0.00000066	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	73439102	C	T	KCNQ5	CCDS4976.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	25	2	8	32	5	15.6	50	4	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.454545455	0.454545455	1	0.808290155	0.808290155	1	1.481481481	1.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.006948068	1	0.000000562	1	0.000119787	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	75335139	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	39	2	5.1	31	8	25.8	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.289772727	0.289772727	1	1.336787565	1.336787565	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.016387522	1	2.78E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	76210458	G	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	40	4	10	35	8	22.9	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.568181818	0.568181818	1	1.186528497	1.186528497	1	1.296296296	1.296296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000495	1	8.15E-12	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	76686180	G	A	IMPG1	CCDS4985.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	25	5	20	40	10	25	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	1.295336788	1.295336788	1	0.944444444	0.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000153	1	7.22E-15	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	76928358	C	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	41	6	14.6	49	12	24.5	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.829545455	0.829545455	1	1.269430052	1.269430052	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.05E-08	1	1.9E-17	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	78249503	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	34	5	14.7	46	12	26.1	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.835227273	0.835227273	1	1.352331606	1.352331606	1	0.37037037	0.37037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000771	1	8.12E-18	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	78302759	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	38	5	13.2	37	3	8.1	52	3	5.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.75	0.75	1	0.419689119	0.419689119	1	1.074074074	1.074074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000137	1	0.000855237	1	0.002300591	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	80290384	C	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	35	8	22.9	39	7	17.9	49	2	4.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.301136364	1.301136364	1	0.92746114	0.92746114	1	0.759259259	0.759259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.15E-12	1	1.04E-09	1	0.025168485	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	80510610	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	32	5	15.6	41	12	29.3	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.886363636	0.886363636	1	1.518134715	1.518134715	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000562	1	1.69E-18	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	80850679	A	G	BCKDHB	CCDS4994.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	28	4	14.3	39	7	17.9	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	0.92746114	0.92746114	1	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000116	1	1.04E-09	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	82144748	C	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	29	2	6.9	29	8	27.6	26	1	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.392045455	0.392045455	1	1.430051813	1.430051813	1	0.703703704	0.703703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.009279585	1	1.53E-12	1	0.122190858	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	83339801	G	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	46	12	26.1	31	7	22.6	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.482954545	1.482954545	1	1.170984456	1.170984456	1	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.12E-18	1	1.85E-10	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	84036946	G	A	ME1	CCDS34492.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	33	8	24.2	50	5	10	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.375	1.375	1	0.518134715	0.518134715	1	0.944444444	0.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-12	1	0.00000549	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	84248780	G	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	31	6	19.4	29	8	27.6	28	1	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.102272727	1.102272727	1	1.430051813	1.430051813	1	0.666666667	0.666666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.03E-08	1	1.53E-12	1	0.130947004	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	85283955	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	48	11	22.9	41	7	17.1	31	5	16.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.301136364	1.301136364	1	0.886010363	0.886010363	1	2.981481481	2.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.31E-16	1	1.51E-09	1	0.000000476	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	85470453	G	A	TBX18	CCDS34495.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	49	6	12.2	33	0	0	55	0	0	31	0	0	162	7	4.3	138	3	2.2	217	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.693181818	0.693181818	1	0	0	1	0	0	1	0.244318182	0.244318182	1	0.113989637	0.113989637	1	0	0	1	4	2	1	1	0.000000182	0.0000202	1	0.032543942	1	1	YES	1_1	0_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	6	85562566	T	C	-	-	-	-	-	-	24	0	0	42	10	23.8	35	9	25.7	68	3	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.352272727	1.352272727	1	1.331606218	1.331606218	1	0.814814815	0.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.24E-14	1	1.23E-13	1	0.004916956	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	86373811	G	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	43	7	16.3	43	9	20.9	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.926136364	0.926136364	1	1.082901554	1.082901554	1	1.148148148	1.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.15E-09	1	9.45E-13	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	87103769	A	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	40	6	15	30	4	13.3	53	3	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852272727	0.852272727	1	0.689119171	0.689119171	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.18E-08	1	0.0000154	1	0.002429596	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	88639239	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	39	6	15.4	34	6	17.6	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.875	0.875	1	0.911917098	0.911917098	1	1.425925926	1.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.43E-08	1	1.86E-08	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	89763199	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	24	0	0	25	4	16	29	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.829015544	0.829015544	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000727	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	89962251	G	A	GABRR2	CCDS5020.2	r.?	-	-	downstream	35	0	0	46	12	26.1	43	9	20.9	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.482954545	1.482954545	1	1.082901554	1.082901554	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.12E-18	1	9.45E-13	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	90612467	C	A	-	-	-	-	-	-	20	0	0	25	3	12	19	4	21.1	32	4	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.681818182	0.681818182	1	1.093264249	1.093264249	1	2.314814815	2.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00026475	1	0.00000228	1	0.0000201	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	94983457	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	45	8	17.8	50	9	18	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.011363636	1.011363636	1	0.932642487	0.932642487	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.14E-11	1	4.07E-12	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	95055025	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	31	5	16.1	42	8	19	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914772727	0.914772727	1	0.984455959	0.984455959	1	0.833333333	0.833333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000476	1	3.96E-11	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	95465453	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	47	10	21.3	48	10	20.8	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.210227273	1.210227273	1	1.077720207	1.077720207	1	1.388888889	1.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.27E-14	1	5.37E-14	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	95617910	G	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	39	8	20.5	38	3	7.9	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.164772727	1.164772727	1	0.409326425	0.409326425	1	0.462962963	0.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.09E-11	1	0.000925091	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	97691149	T	A	C6orf167	CCDS5039.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	38	7	18.4	53	8	15.1	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.045454545	1.045454545	1	0.78238342	0.78238342	1	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-10	1	2.83E-10	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	98094229	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	32	6	18.8	43	6	14	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.068181818	1.068181818	1	0.725388601	0.725388601	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.27E-08	1	8.13E-08	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	98765662	C	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	39	4	10.3	26	5	19.2	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.585227273	0.585227273	1	0.994818653	0.994818653	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000447	1	0.000000188	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	98813231	T	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	31	6	19.4	40	8	20	57	5	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.102272727	1.102272727	1	1.03626943	1.03626943	1	1.62962963	1.62962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.03E-08	1	2.61E-11	1	0.0000105	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	101191214	G	A	ASCC3	CCDS5046.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	31	7	22.6	32	4	12.5	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.284090909	1.284090909	1	0.647668394	0.647668394	1	0.555555556	0.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.85E-10	1	0.0000201	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	102087060	T	C	GRIK2	CCDS5049.1	r.?	-	-	intronic	15	0	0	38	8	21.1	21	3	14.3	47	5	10.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.198863636	1.198863636	1	0.740932642	0.740932642	1	1.962962963	1.962962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.67E-11	1	0.000155401	1	0.00000402	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	102382674	C	T	GRIK2	CCDS5049.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	47	12	25.5	35	8	22.9	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.448863636	1.448863636	1	1.186528497	1.186528497	1	0.87037037	0.87037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.09E-17	1	8.15E-12	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	103765454	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	31	3	9.7	29	4	13.8	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.551136364	0.551136364	1	0.715025907	0.715025907	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000505952	1	0.0000134	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	104415080	C	T	-	-	-	-	-	-	11	0	0	42	8	19	30	5	16.7	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.079545455	1.079545455	1	0.865284974	0.865284974	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.96E-11	1	0.000000401	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	104883146	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	25	4	16	38	7	18.4	44	6	13.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.909090909	0.909090909	1	0.953367876	0.953367876	1	2.518518519	2.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000727	1	8.61E-10	1	9.37E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	105349243	G	A	-	-	-	-	-	-	17	0	0	26	3	11.5	19	4	21.1	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.653409091	0.653409091	1	1.093264249	1.093264249	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000298167	1	0.00000228	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	105391066	C	T	C6orf220	ENST00000369123	r.?	-	-	upstream	34	0	0	37	5	13.5	26	5	19.2	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.767045455	0.767045455	1	0.994818653	0.994818653	1	1.351851852	1.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000119	1	0.000000188	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	105450185	A	G	LIN28B	CCDS34504.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	34	9	26.5	38	5	13.2	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.505681818	1.505681818	1	0.683937824	0.683937824	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.15E-14	1	0.00000137	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	105455407	T	C	LIN28B	CCDS34504.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	21	5	23.8	45	4	8.9	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.352272727	1.352272727	1	0.461139896	0.461139896	1	0.981481481	0.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.95E-08	1	0.0000791	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	106639982	C	T	ATG5	CCDS5055.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	24	4	16.7	27	4	14.8	42	5	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	0.766839378	0.766839378	1	2.203703704	2.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000613	1	0.00001	1	0.00000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	110289066	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	36	5	13.9	34	6	17.6	53	4	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.789772727	0.789772727	1	0.911917098	0.911917098	1	1.388888889	1.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000104	1	1.86E-08	1	0.000150502	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	111767386	G	A	REV3L	CCDS5091.2	r.?	-	-	intronic	29	0	0	23	5	21.7	21	6	28.6	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.232954545	1.232954545	1	1.481865285	1.481865285	1	1.351851852	1.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.75E-08	1	7.95E-10	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	112155573	A	C	FYN	CCDS5095.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	26	4	15.4	29	4	13.8	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.875	0.875	1	0.715025907	0.715025907	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000856	1	0.0000134	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	113994986	A	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	36	3	8.3	33	9	27.3	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.471590909	0.471590909	1	1.414507772	1.414507772	1	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000788827	1	6.76E-14	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	115083290	T	A	-	-	-	-	-	-	48	0	0	47	5	10.6	43	10	23.3	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.602272727	0.602272727	1	1.207253886	1.207253886	1	2.055555556	2.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000402	1	1.61E-14	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	115581467	T	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	38	9	23.7	46	9	19.6	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.346590909	1.346590909	1	1.015544041	1.015544041	1	0.925925926	0.925925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.79E-13	1	1.82E-12	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	115780974	A	G	-	-	-	-	-	-	32	0	0	39	6	15.4	46	10	21.7	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.875	0.875	1	1.124352332	1.124352332	1	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.43E-08	1	3.38E-14	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	116076716	G	C	-	-	-	-	-	-	46	0	0	40	7	17.5	29	5	17.2	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.994318182	0.994318182	1	0.89119171	0.89119171	1	0.388888889	0.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-09	1	0.000000336	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	117057813	C	T	KPNA5	CCDS5111.1	r.?	-	-	downstream	45	0	0	48	13	27.1	38	7	18.4	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.539772727	1.539772727	1	0.953367876	0.953367876	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2E-19	1	8.61E-10	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	117417069	C	G	-	-	-	-	-	-	27	0	0	31	3	9.7	35	4	11.4	19	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.551136364	0.551136364	1	0.590673575	0.590673575	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000505952	1	0.0000289	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	118209776	A	G	-	-	-	-	-	-	24	0	0	37	8	21.6	39	6	15.4	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.227272727	1.227272727	1	0.797927461	0.797927461	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.33E-11	1	4.43E-08	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	119632001	A	G	MAN1A1	CCDS5122.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	29	3	10.3	36	7	19.4	55	3	5.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.585227273	0.585227273	1	1.005181347	1.005181347	1	1.018518519	1.018518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000414371	1	5.74E-10	1	0.002700822	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	120527592	C	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	30	5	16.7	38	4	10.5	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	0.544041451	0.544041451	1	1.351851852	1.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000401	1	0.0000403	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	122282281	C	A	-	-	-	-	-	-	20	0	0	40	5	12.5	37	7	18.9	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	0.979274611	0.979274611	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000178	1	7.05E-10	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	123146586	A	G	-	-	-	-	-	-	26	0	0	27	4	14.8	28	8	28.6	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.840909091	0.840909091	1	1.481865285	1.481865285	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00001	1	1.11E-12	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	123837604	C	T	TRDN	ENST00000334268	r.?	-	-	intronic	35	0	0	42	0	0	37	6	16.2	43	0	0	37	0	0	183	0	0	124	7	5.6	220	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.839378238	0.839378238	1	0	0	1	0	0	1	0.29015544	0.29015544	1	0	0	1	2	2	1	1	1	1	3.18E-08	0.00000353	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	6	123981694	C	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	37	8	21.6	27	4	14.8	30	1	3.3	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.227272727	1.227272727	1	0.766839378	0.766839378	1	0.611111111	0.611111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.33E-11	1	0.00001	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	124005138	T	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	35	5	14.3	43	2	4.7	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	0.243523316	0.243523316	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000895	1	0.019709573	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	124281314	A	T	NKAIN2	CCDS34526.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	36	8	22.2	42	12	28.6	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	1.481865285	1.481865285	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-11	1	2.35E-18	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	124586452	T	C	NKAIN2	CCDS34526.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	39	7	17.9	48	11	22.9	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.017045455	1.017045455	1	1.186528497	1.186528497	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-09	1	9.31E-16	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	125087519	C	A	NKAIN2	CCDS34526.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	34	6	17.6	47	6	12.8	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	0.663212435	0.663212435	1	1.351851852	1.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.86E-08	1	0.000000141	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	127954068	A	C	-	-	-	-	-	-	37	0	0	32	9	28.1	31	5	16.1	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.596590909	1.596590909	1	0.834196891	0.834196891	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.94E-14	1	0.000000476	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	128020144	T	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	44	8	18.2	44	8	18.2	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	0.943005181	0.943005181	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.9E-11	1	5.9E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	129918069	C	T	ARHGAP18	CCDS34535.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	48	5	10.4	31	7	22.6	37	3	8.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.590909091	0.590909091	1	1.170984456	1.170984456	1	1.5	1.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000447	1	1.85E-10	1	0.000855237	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	132737534	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	34	10	29.4	48	10	20.8	43	6	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.670454545	1.670454545	1	1.077720207	1.077720207	1	2.592592593	2.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.15E-15	1	5.37E-14	1	8.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	133636384	C	T	EYA4	CCDS5166.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	48	7	14.6	43	8	18.6	49	3	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.829545455	0.829545455	1	0.96373057	0.96373057	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.81E-09	1	4.85E-11	1	0.001939399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	135325752	G	A	HBS1L	CCDS5173.1	r.?	-	-	intronic	20	0	0	38	4	10.5	36	7	19.4	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.596590909	0.596590909	1	1.005181347	1.005181347	1	0.944444444	0.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000403	1	5.74E-10	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	137646681	A	C	-	-	-	-	-	-	16	0	0	41	10	24.4	29	5	17.2	54	3	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.386363636	1.386363636	1	0.89119171	0.89119171	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.51E-15	1	0.000000336	1	0.00256299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	139998641	A	C	-	-	-	-	-	-	25	0	0	30	4	13.3	24	7	29.2	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.755681818	0.755681818	1	1.512953368	1.512953368	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000154	1	2.51E-11	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	140209826	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	45	7	15.6	47	10	21.3	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.886363636	0.886363636	1	1.103626943	1.103626943	1	0.981481481	0.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000003	1	4.27E-14	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	141049164	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	38	5	13.2	48	2	4.2	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.75	0.75	1	0.21761658	0.21761658	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000137	1	0.024220359	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	141960111	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	33	9	27.3	33	5	15.2	39	4	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.551136364	1.551136364	1	0.787564767	0.787564767	1	1.907407407	1.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.76E-14	1	0.00000066	1	0.0000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	144333589	G	T	PLAGL1	CCDS5202.1	r.?	-	-	upstream	28	0	0	36	4	11.1	25	6	24	33	4	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.630681818	0.630681818	1	1.243523316	1.243523316	1	2.240740741	2.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000324	1	2.55E-09	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	144737466	C	T	UTRN	CCDS34547.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	28	8	28.6	28	6	21.4	48	6	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.625	1.625	1	1.10880829	1.10880829	1	2.314814815	2.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.11E-12	1	5.36E-09	1	0.00000016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	145349834	A	G	-	-	-	-	-	-	32	0	0	36	5	13.9	49	7	14.3	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.789772727	0.789772727	1	0.740932642	0.740932642	1	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000104	1	5.58E-09	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	146086387	G	C	-	-	-	-	-	-	25	0	0	38	7	18.4	44	12	27.3	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.045454545	1.045454545	1	1.414507772	1.414507772	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-10	1	4.44E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	146588063	G	T	GRM1	CCDS47497.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	36	2	5.6	50	7	14	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.318181818	0.318181818	1	0.725388601	0.725388601	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.014070883	1	6.46E-09	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	147218433	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	43	9	20.9	36	12	33.3	57	4	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.1875	1.1875	1	1.725388601	1.725388601	1	1.296296296	1.296296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.45E-13	1	2.73E-19	1	0.000199821	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	147625070	T	C	STXBP5	CCDS5211.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	53	4	7.5	38	7	18.4	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.426136364	0.426136364	1	0.953367876	0.953367876	1	0.37037037	0.37037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000150502	1	8.61E-10	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	148174565	G	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	49	13	26.5	33	4	12.1	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.505681818	1.505681818	1	0.626943005	0.626943005	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.71E-19	1	0.0000228	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	148404855	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	35	3	8.6	38	5	13.2	35	4	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.488636364	0.488636364	1	0.683937824	0.683937824	1	2.111111111	2.111111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000725791	1	0.00000137	1	0.0000289	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	148611469	G	A	SASH1	ENST00000367469	r.?	-	-	intronic	13	0	0	14	1	7.1	15	5	33.3	25	1	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.403409091	0.403409091	1	1.725388601	1.725388601	1	0.740740741	0.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.067769881	1	0.000000009	1	0.117779757	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	149900905	C	G	C6orf72	CCDS5216.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	23	3	13	29	10	34.5	30	3	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.738636364	0.738636364	1	1.787564767	1.787564767	1	1.851851852	1.851851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000205387	1	1.79E-16	1	0.000458697	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	150424760	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	41	12	29.3	43	8	18.6	34	4	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.664772727	1.664772727	1	0.96373057	0.96373057	1	2.185185185	2.185185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.69E-18	1	4.85E-11	1	0.0000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	150615241	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	28	4	14.3	30	11	36.7	53	3	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.901554404	1.901554404	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000116	1	2.44E-18	1	0.002429596	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	150834035	C	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	24	0	0	36	5	13.9	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.720207254	0.720207254	1	0.981481481	0.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.00000104	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	151028393	G	C	PLEKHG1	CCDS34552.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	26	3	11.5	28	4	14.3	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.653409091	0.653409091	1	0.740932642	0.740932642	1	1.425925926	1.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000298167	1	0.0000116	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	151055832	C	T	PLEKHG1	CCDS34552.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	44	6	13.6	32	8	25	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.772727273	0.772727273	1	1.295336788	1.295336788	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.37E-08	1	3.69E-12	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	153495139	G	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	25	1	4	20	5	25	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.227272727	0.227272727	1	1.295336788	1.295336788	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.117779757	1	4.55E-08	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	154253713	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	39	4	10.3	48	9	18.8	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.585227273	0.585227273	1	0.974093264	0.974093264	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000447	1	2.75E-12	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	154336962	C	T	OPRM1	CCDS47503.1	r.?	-	-	intronic	27	1	3.7	42	8	19	41	11	26.8	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.079545455	1.079545455	1	1.388601036	1.388601036	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	0.126579904	1	3.96E-11	1	1.34E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	156499297	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	31	4	12.9	43	8	18.6	25	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.732954545	0.732954545	1	0.96373057	0.96373057	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000177	1	4.85E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	157134640	C	G	ARID1B	CCDS5251.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	33	7	21.2	22	3	13.6	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.204545455	1.204545455	1	0.704663212	0.704663212	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.98E-10	1	0.000179267	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	157182527	A	T	ARID1B	CCDS5251.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	32	7	21.9	26	4	15.4	44	5	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.244318182	1.244318182	1	0.797927461	0.797927461	1	2.111111111	2.111111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.36E-10	1	0.00000856	1	0.00000288	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	160662107	C	T	SLC22A2	CCDS5276.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	50	2	4	41	9	22	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.227272727	0.227272727	1	1.139896373	1.139896373	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.026131524	1	5.92E-13	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	160772186	C	T	SLC22A3	CCDS5277.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	18	1	5.6	26	6	23.1	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.318181818	0.318181818	1	1.196891192	1.196891192	1	1.425925926	1.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.086275114	1	3.3E-09	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	160810750	C	T	SLC22A3	CCDS5277.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	28	6	21.4	37	10	27	38	1	2.6	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.215909091	1.215909091	1	1.398963731	1.398963731	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.36E-09	1	3.01E-15	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	161123397	T	C	PLG	CCDS5279.1	r.?	-	-	intronic	38	1	2.6	36	7	19.4	47	11	23.4	53	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.102272727	1.102272727	1	1.212435233	1.212435233	1	0.703703704	0.703703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	0.173434892	1	5.74E-10	1	7.21E-16	1	0.029108399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	161573586	G	T	AGPAT4	CCDS5280.1	r.?	-	-	intronic	13	0	0	13	4	30.8	10	2	20	40	4	10	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.75	1.75	1	1.03626943	1.03626943	1	1.851851852	1.851851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000431	1	0.001095391	1	0.0000495	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	161984322	G	C	PARK2	CCDS5281.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	53	14	26.4	47	9	19.1	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.5	1.5	1	0.989637306	0.989637306	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.22E-20	1	2.24E-12	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	162074423	A	G	PARK2	CCDS5281.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	31	8	25.8	25	3	12	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.465909091	1.465909091	1	0.621761658	0.621761658	1	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.78E-12	1	0.00026475	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	162377467	C	A	PARK2	CCDS5281.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	45	14	31.1	35	11	31.4	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.767045455	1.767045455	1	1.626943005	1.626943005	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.81E-22	1	1.82E-17	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	162566207	G	T	PARK2	CCDS5281.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	43	13	30.2	31	6	19.4	30	1	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.715909091	1.715909091	1	1.005181347	1.005181347	1	0.611111111	0.611111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.88E-20	1	1.03E-08	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	162749906	G	A	PARK2	CCDS5281.1	r.?	-	-	intronic	15	0	0	25	7	28	19	7	36.8	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.590909091	1.590909091	1	1.906735751	1.906735751	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.47E-11	1	3.73E-12	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	162754936	C	T	PARK2	CCDS5281.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	46	2	4.3	32	4	12.5	49	4	8.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.244318182	0.244318182	1	0.647668394	0.647668394	1	1.518518519	1.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.022369545	1	0.0000201	1	0.000110643	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	162828694	A	G	PARK2	CCDS5281.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	33	10	30.3	35	2	5.7	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.721590909	1.721590909	1	0.295336788	0.295336788	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.14E-16	1	0.013332991	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	163431962	G	T	PACRG	CCDS43524.1	r.?	-	-	intronic	9	0	0	19	6	31.6	21	2	9.5	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.795454545	1.795454545	1	0.492227979	0.492227979	1	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.01E-10	1	0.004928472	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	164945008	C	A	ENSG00000237744	ENST00000425920	r.?	-	-	intronic	24	0	0	43	11	25.6	35	4	11.4	46	6	13	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.454545455	1.454545455	1	0.590673575	0.590673575	1	2.407407407	2.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.42E-16	1	0.0000289	1	0.000000123	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	165222634	C	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	36	8	22.2	32	8	25	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	1.295336788	1.295336788	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-11	1	3.69E-12	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	165480715	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	41	9	22	40	6	15	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.25	1.25	1	0.777202073	0.777202073	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-13	1	5.18E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	165890532	G	C	PDE10A	CCDS5289.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	37	3	8.1	40	11	27.5	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.460227273	0.460227273	1	1.424870466	1.424870466	1	1.462962963	1.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000855237	1	9.88E-17	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	166453891	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	29	8	27.6	45	9	20	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.568181818	1.568181818	1	1.03626943	1.03626943	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	1.53E-12	1	1.47E-12	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	167528077	C	T	CCR6	CCDS5298.1	r.?	-	-	intronic	14	0	0	22	5	22.7	26	5	19.2	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.289772727	1.289772727	1	0.994818653	0.994818653	1	1.425925926	1.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.67E-08	1	0.000000188	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	168674470	G	A	-	-	-	-	-	-	14	0	0	12	1	8.3	10	4	40	19	0	0	416	1	0.2	199	31	15.6	155	28	18.1	181	9	5	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.471590909	0.471590909	1	2.07253886	2.07253886	1	0	0	1	0.886363636	0.886363636	1	0.937823834	0.937823834	1	0.925925926	0.925925926	1	5	5	1	0.875719901	0.058377193	3.91E-36	0.000000128	1.05E-34	1	0.000000423	YES	0_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	6	168674771	G	C	-	-	-	-	-	-	8	0	0	13	1	7.7	10	1	10	15	3	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.4375	0.4375	1	0.518134715	0.518134715	1	3.703703704	3.703703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.063085307	1	0.04888987	1	0.0000544	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	169112537	C	T	ENSG00000237355	ENST00000431326	r.?	-	-	upstream	9	0	0	20	2	10	21	4	19	35	3	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.568181818	0.568181818	1	0.984455959	0.984455959	1	1.592592593	1.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.004473894	1	0.00000349	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	6	170770367	C	A	-	-	-	-	-	-	9	0	0	15	2	13.3	17	4	23.5	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.755681818	0.755681818	1	1.21761658	1.21761658	1	0.574074074	0.574074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.002513772	1	0.00000141	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	3148189	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	42	18	42.9	53	20	37.7	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.2955	1.64775	2	2.707367876	1.353683938	2	1.620962963	1.620962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.2E-30	1	1.65E-32	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	3209841	G	A	ENSG00000217455	ENST00000404626	r.?	-	-	intronic	23	0	0	49	9	18.4	36	4	11.1	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.413454545	1.413454545	1	0.797129534	0.797129534	1	1.538888889	1.538888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.35E-12	1	0.0000324	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	3604465	T	C	SDK1	CCDS34590.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	50	12	24	40	12	30	52	3	5.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.843636364	0.921818182	2	2.154404145	1.077202073	2	1.190074074	1.190074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.49E-17	1	1.2E-18	1	0.002300591	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	4367608	A	G	-	-	-	-	-	-	29	0	0	52	13	25	44	8	18.2	31	2	6.5	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.920454545	0.960227273	2	1.307005181	1.307005181	1	1.333703704	1.333703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.47E-19	1	5.9E-11	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	4501199	C	G	-	-	-	-	-	-	21	0	0	42	5	11.9	59	2	3.4	31	0	0	166	0	0	324	29	9	374	5	1.3	243	0	0	TRUE	TRUE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914136364	0.914136364	1	0.244165803	0.244165803	1	0	0	1	0.691363636	0.691363636	1	0.093357513	0.093357513	1	0	0	1	4	3	1	1	0.00000228	8.88E-27	0.035441897	0.041266252	1	1	YES	1_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	7	6148428	T	A	USP42	CCDS47535.1	r.?	-	-	intronic	18	0	0	35	6	17.1	29	3	10.3	30	3	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.313590909	1.313590909	1	0.739678756	0.739678756	1	2.051851852	2.051851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-08	1	0.000414371	1	0.000458697	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	6956519	G	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	47	9	19.1	42	7	16.7	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.467227273	1.467227273	1	1.199284974	1.199284974	1	0.533481481	0.533481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-12	1	1.81E-09	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	8490086	A	G	NXPH1	CCDS47540.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	75	18	24	56	14	25	59	9	15.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.843636364	0.921818182	2	1.795336788	0.897668394	2	3.139333333	1.569666667	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.78E-25	1	2.91E-20	1	1.96E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	8646318	C	T	NXPH1	CCDS47540.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	59	8	13.6	59	9	15.3	52	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.044727273	1.044727273	1	1.098746114	1.098746114	1	0.389851852	0.389851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.9E-10	1	1.96E-11	1	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	10096239	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	67	8	11.9	61	9	14.8	60	3	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914136364	0.914136364	1	1.062839378	1.062839378	1	1.025925926	1.025925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.96E-09	1	2.68E-11	1	0.003458198	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	10169396	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	58	18	31	66	20	30.3	52	8	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.381363636	1.190681818	2	2.175948187	1.087974093	2	3.159851852	1.579925926	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.42E-27	1	3.11E-30	1	2.42E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	10518222	A	C	AC009945.1	ENST00000510654	r.?	-	-	intronic	32	0	0	60	15	25	44	14	31.8	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.920454545	0.960227273	2	2.283668394	1.141834197	2	1.538888889	1.538888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.31E-21	1	6.1E-22	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	11159695	C	T	PHF14	CCDS47541.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	58	7	12.1	61	12	19.7	59	4	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.9295	0.9295	1	1.414725389	1.414725389	1	1.395259259	1.395259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.88E-08	1	3.39E-16	1	0.00022841	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	13858786	C	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	23	3	13	22	4	18.2	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.998636364	0.998636364	1	1.307005181	1.307005181	1	2.503259259	1.25162963	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000205387	1	0.00000425	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	14722988	T	A	DGKB	CCDS47547.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	61	10	16.4	48	5	10.4	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.259818182	1.259818182	1	0.746860104	0.746860104	1	0.451407407	0.451407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.98E-13	1	0.00000447	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	15447547	C	T	TMEM195	CCDS34604.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	60	12	20	63	10	15.9	59	3	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.536363636	1.536363636	1	1.141834197	1.141834197	1	1.046444444	1.046444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.74E-16	1	9.81E-13	1	0.003297476	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	15794758	T	G	-	-	-	-	-	-	24	0	0	52	9	17.3	37	4	10.8	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.328954545	1.328954545	1	0.775585492	0.775585492	1	0.430888889	0.430888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-12	1	0.0000362	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	18195738	T	C	HDAC9	ENST00000433709	r.?	-	-	intronic	36	0	0	44	12	27.3	61	14	23	53	7	13.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.097136364	1.048568182	2	1.651709845	0.825854922	2	2.708444444	1.354222222	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.44E-18	1	1.1E-19	1	9.85E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	18464393	G	A	HDAC9	ENST00000433709	r.?	-	-	intronic	37	0	0	54	14	25.9	31	10	32.3	47	5	10.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.989590909	0.994795455	2	2.31957513	1.159787565	2	2.174962963	2.174962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.64E-20	1	3.94E-16	1	0.00000402	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	18795743	G	A	HDAC9	CCDS47554.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	61	10	16.4	36	5	13.9	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.259818182	1.259818182	1	0.998207254	0.998207254	1	0.471925926	0.471925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.98E-13	1	0.00000104	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	19007465	G	A	HDAC9	CCDS47554.1	r.?	-	-	intronic	18	0	0	31	8	25.8	30	11	36.7	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.981909091	0.990954545	2	2.635554404	1.317777202	2	1.210592593	1.210592593	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.78E-12	1	2.44E-18	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	19461885	C	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	58	5	8.6	61	7	11.5	66	2	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.660636364	0.660636364	1	0.825854922	0.825854922	1	0.615555556	0.615555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000115	1	2.69E-08	1	0.043431387	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	19535457	A	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	59	11	18.6	61	10	16.4	54	4	7.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.428818182	1.428818182	1	1.177740933	1.177740933	1	1.51837037	1.51837037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.1E-14	1	6.98E-13	1	0.000161898	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	20617562	T	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	60	13	21.7	56	19	33.9	49	8	16.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.666954545	0.833477273	2	2.434476684	1.217238342	2	3.344518519	1.672259259	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.07E-18	1	6.79E-30	1	1.47E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	21008904	C	G	-	-	-	-	-	-	23	0	0	45	3	6.7	39	8	20.5	46	1	2.2	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.514681818	0.514681818	1	1.472176166	1.472176166	1	0.451407407	0.451407407	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001516071	1	2.09E-11	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	21347742	G	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	58	6	10.3	61	13	21.3	53	4	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.791227273	0.791227273	1	1.529626943	1.529626943	1	1.538888889	1.538888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000506	1	6.41E-18	1	0.000150502	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	21624997	C	A	DNAH11	ENST00000424253	r.?	-	-	intronic	34	0	0	42	4	9.5	62	15	24.2	56	2	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.729772727	0.729772727	1	1.73788601	0.868943005	2	0.738666667	0.738666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000601	1	2.28E-21	1	0.032213353	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	21757684	G	A	DNAH11	ENST00000424253	r.?	-	-	intronic	20	0	0	45	3	6.7	44	7	15.9	42	1	2.4	0	0	NA	4	0	0	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.514681818	0.514681818	1	1.141834197	1.141834197	1	0.492444444	0.492444444	1	0	0	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	0.001516071	1	2.55E-09	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	21907109	C	A	DNAH11	ENST00000424253	r.?	-	-	intronic	38	0	0	56	4	7.1	52	8	15.4	25	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.545409091	0.545409091	1	1.105927461	1.105927461	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000186538	1	2.42E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	22216181	C	T	RAPGEF5	ENST00000344041	r.?	-	-	intronic	34	0	0	46	9	19.6	43	11	25.6	51	8	15.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.505636364	1.505636364	1	1.83842487	0.919212435	2	3.221407407	1.610703704	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.82E-12	1	2.42E-16	1	2.05E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	22692631	A	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	42	8	19	51	4	7.8	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.459545455	1.459545455	1	0.560145078	0.560145078	1	1.210592593	1.210592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.96E-11	1	0.000129466	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	22744462	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	47	6	12.8	49	9	18.4	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.983272727	0.983272727	1	1.321367876	1.321367876	1	0.636074074	0.636074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000141	1	3.35E-12	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	22955615	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	47	9	19.1	39	7	17.9	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.467227273	1.467227273	1	1.28546114	1.28546114	1	0.574518519	0.574518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-12	1	1.04E-09	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	24166054	G	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	56	13	23.2	52	13	25	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.782181818	0.891090909	2	1.795336788	0.897668394	2	2.380148148	1.190074074	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.89E-18	1	6.47E-19	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	24655600	G	A	MPP6	CCDS5388.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	69	18	26.1	64	16	25	53	6	11.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.004954545	1.002477273	2	1.795336788	0.897668394	2	2.318592593	1.159296296	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.16E-26	1	5.94E-23	1	0.000000293	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	24837667	C	T	OSBPL3	CCDS5390.1	r.5251g>a	c.?	p.?	3'UTR variant	32	0	0	38	0	0	53	8	15.1	30	0	0	89	0	0	247	8	3.2	266	22	8.3	289	0	0	TRUE	TRUE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.08438342	1.08438342	1	0	0	1	0.245818182	0.245818182	1	0.596051813	0.596051813	1	0	0	1	2	2	1	1	1	0.0000416	2.83E-10	6.01E-20	1	1	YES	0_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	7	24942605	G	A	OSBPL3	CCDS5390.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	50	10	20	62	8	12.9	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.536363636	1.536363636	1	0.926393782	0.926393782	1	1.025925926	1.025925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.36E-14	1	1.04E-09	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	25194490	C	T	C7orf31	CCDS5394.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	38	3	7.9	50	9	18	27	1	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.606863636	0.606863636	1	1.292642487	1.292642487	1	0.759185185	0.759185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000925091	1	4.07E-12	1	0.126579904	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	25290767	G	T	-	-	-	-	-	-	34	1	2.9	56	15	26.8	53	15	28.3	37	5	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.058727273	1.029363636	2	2.032321244	1.016160622	2	2.77	1.385	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	0.156694864	1	4.09E-22	1	1.6E-22	1	0.00000119	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	25720029	G	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	47	2	4.3	39	5	12.8	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.330318182	0.330318182	1	0.919212435	0.919212435	1	1.436296296	1.436296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.02328732	1	0.00000156	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	25721779	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	64	17	26.6	62	20	32.3	51	6	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.043363636	1.021681818	2	2.31957513	1.159787565	2	2.421185185	1.210592593	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.43E-25	1	7.19E-31	1	0.000000232	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	26657184	G	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	25	7	28	20	3	15	49	9	18.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.150909091	1.075454545	2	1.077202073	1.077202073	1	3.775407407	1.887703704	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.47E-11	1	0.0001337	1	3.35E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	26848226	T	G	SKAP2	CCDS5400.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	56	4	7.1	60	7	11.7	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.545409091	0.545409091	1	0.840217617	0.840217617	1	1.456814815	1.456814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000186538	1	2.39E-08	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	27022779	G	A	SKAP2	ENST00000432747	r.?	-	-	intronic	32	0	0	52	7	13.5	41	4	9.8	39	4	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.037045455	1.037045455	1	0.703772021	0.703772021	1	2.113407407	2.113407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.58E-09	1	0.0000546	1	0.0000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	27156113	C	T	HOXA3	CCDS43559.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	49	7	14.3	38	4	10.5	55	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.0985	1.0985	1	0.754041451	0.754041451	1	0.369333333	0.369333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.58E-09	1	0.0000403	1	0.240951649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	27901984	C	T	JAZF1	CCDS5416.1	r.?	-	-	intronic	18	0	0	45	5	11.1	50	6	12	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852681818	0.852681818	1	0.861761658	0.861761658	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000323	1	0.000000206	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	28460228	C	T	CREB5	CCDS5417.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	30	7	23.3	38	16	42.1	57	5	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.789863636	1.789863636	1	3.02334715	1.511673575	2	1.80562963	1.80562963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	1.44E-10	1	3.06E-27	1	0.0000105	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	30163491	A	G	PLEKHA8	ENST00000396259	r.?	-	-	intronic	31	0	0	54	7	13	45	9	20	51	8	15.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.998636364	0.998636364	1	1.43626943	1.43626943	1	3.221407407	1.610703704	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.13E-08	1	1.47E-12	1	2.05E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	31062387	G	A	AC006978.1	ENST00000507825	r.?	-	-	intronic	17	0	0	33	5	15.2	36	5	13.9	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.167636364	1.167636364	1	0.998207254	0.998207254	1	0.984888889	0.984888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000066	1	0.00000104	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	31230737	A	T	AC006978.1	ENST00000507825	r.?	-	-	intronic	37	0	0	46	2	4.3	49	6	12.2	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.330318182	0.330318182	1	0.876124352	0.876124352	1	0.636074074	0.636074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.022369545	1	0.000000182	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	31518073	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	51	5	9.8	49	10	20.4	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.752818182	0.752818182	1	1.464994819	1.464994819	1	0.41037037	0.41037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000606	1	6.72E-14	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	31630120	G	T	CCDC129	CCDS5435.2	r.?	-	-	intronic	40	0	0	69	7	10.1	71	14	19.7	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.775863636	0.775863636	1	1.414725389	1.414725389	1	2.010814815	2.010814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.43E-08	1	1.13E-18	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	32229809	G	T	PDE1C	ENST00000396193	r.?	-	-	intronic	40	0	0	52	3	5.8	64	7	10.9	50	2	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.445545455	0.445545455	1	0.782766839	0.782766839	1	0.820740741	0.820740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.002300591	1	3.78E-08	1	0.026131524	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	32275968	G	A	PDE1C	ENST00000396193	r.?	-	-	intronic	38	0	0	53	11	20.8	52	13	25	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.597818182	1.597818182	1	1.795336788	0.897668394	2	1.497851852	1.497851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.07E-15	1	6.47E-19	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	34100912	G	A	BMPER	CCDS5442.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	59	8	13.6	56	1	1.8	63	0	0	42	0	0	334	28	8.4	300	16	5.3	308	1	0.3	TRUE	TRUE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.044727273	1.044727273	1	0.129264249	0.129264249	1	0	0	1	0.645272727	0.645272727	1	0.380611399	0.380611399	1	0.061555556	0.061555556	1	4	3	1	1	6.9E-10	4.02E-25	0.244746891	5.49E-12	1	0.78644543	YES	1_1	0_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	7	34338182	T	C	-	-	-	-	-	-	34	0	0	62	8	12.9	52	12	23.1	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.990954545	0.990954545	1	1.658891192	0.829445596	2	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-09	1	4.19E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	35066838	A	G	DPY19L1	CCDS43567.1	r.?	-	-	intronic	7	1	14.3	26	6	23.1	29	5	17.2	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.7745	1.7745	1	1.23519171	1.23519171	1	1.620962963	1.620962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	0.034479353	1	3.3E-09	1	0.000000336	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	35123712	G	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	59	5	8.5	40	4	10	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.652954545	0.652954545	1	0.718134715	0.718134715	1	0.533481481	0.533481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000125	1	0.0000495	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	35367660	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	49	13	26.5	48	17	35.4	46	7	15.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.035681818	1.017840909	2	2.542196891	1.271098446	2	3.118814815	1.559407407	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.71E-19	1	2.8E-27	1	3.53E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	35565360	G	A	-	-	-	-	-	-	13	0	0	24	5	20.8	22	4	18.2	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.597818182	1.597818182	1	1.307005181	1.307005181	1	0.574518519	0.574518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000123	1	0.00000425	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	35909051	G	A	Sep-07	ENST00000435235	r.?	-	-	intronic	36	0	0	58	16	27.6	54	16	29.6	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.120181818	1.060090909	2	2.125678756	1.062839378	2	1.456814815	1.456814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1E-23	1	2.69E-24	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	36068841	G	A	-	-	-	-	-	-	20	0	0	32	6	18.8	40	4	10	24	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.444181818	1.444181818	1	0.718134715	0.718134715	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.27E-08	1	0.0000495	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	36345872	C	T	EEPD1	CCDS34619.1	r.?	-	-	downstream	28	0	0	49	0	0	44	6	13.6	30	4	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.976663212	0.976663212	1	2.728962963	1.364481481	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	9.37E-08	1	0.0000154	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	36858622	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	44	1	2.3	44	6	13.6	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.176681818	0.176681818	1	0.976663212	0.976663212	1	1.005407407	1.005407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.197923942	1	9.37E-08	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	37763759	A	T	GPR141	CCDS5451.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	51	12	23.5	43	14	32.6	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.805227273	0.902613636	2	2.341119171	1.170559585	2	1.210592593	1.210592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.24E-17	1	4.18E-22	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	37924276	A	G	TXNDC3	CCDS5452.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	52	11	21.2	44	13	29.5	35	6	17.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.628545455	1.628545455	1	2.118497409	1.059248705	2	3.508666667	1.754333333	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.44E-15	1	5.49E-20	1	2.24E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	37980541	A	G	EPDR1	CCDS5454.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	46	11	23.9	56	9	16.1	48	3	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.835954545	0.917977273	2	1.156196891	1.156196891	1	1.272148148	1.272148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.55E-16	1	1.2E-11	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	38057209	A	G	SFRP4	ENST00000447200	r.?	-	-	intronic	35	0	0	47	5	10.6	44	5	11.4	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.814272727	0.814272727	1	0.818673575	0.818673575	1	0.451407407	0.451407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000402	1	0.00000288	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	39027244	C	A	POU6F2	ENST00000403058	r.?	-	-	intronic	30	0	0	52	7	13.5	59	13	22	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.037045455	1.037045455	1	1.579896373	1.579896373	1	1.025925926	1.025925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.58E-09	1	3.99E-18	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	39398900	G	C	POU6F2	CCDS34620.2	r.?	-	-	intronic	36	0	0	47	2	4.3	48	6	12.5	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.330318182	0.330318182	1	0.897668394	0.897668394	1	0.984888889	0.984888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.02328732	1	0.00000016	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	39707637	C	A	RALA	CCDS5460.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	50	8	16	57	16	28.1	37	4	10.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.229090909	1.229090909	1	2.017958549	1.008979275	2	2.216	2.216	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.74E-10	1	7.28E-24	1	0.0000362	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	40281246	C	T	C7orf10	ENST00000309930	r.?	-	-	intronic	17	0	0	29	4	13.8	41	7	17.1	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.060090909	1.060090909	1	1.228010363	1.228010363	1	0.595037037	0.595037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000134	1	1.51E-09	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	40723582	G	A	C7orf10	ENST00000309930	r.?	-	-	intronic	34	0	0	42	8	19	41	5	12.2	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.459545455	1.459545455	1	0.876124352	0.876124352	1	1.313185185	1.313185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.96E-11	1	0.00000202	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	40738475	G	A	C7orf10	ENST00000309930	r.?	-	-	intronic	23	0	0	43	13	30.2	44	10	22.7	48	9	18.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.319909091	1.159954545	2	1.630165803	1.630165803	1	3.857481481	1.928740741	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.88E-20	1	2.08E-14	1	2.75E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	40738498	C	A	C7orf10	ENST00000309930	r.?	-	-	intronic	20	0	0	50	15	30	49	10	20.4	45	9	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.304545455	1.152272727	2	1.464994819	1.464994819	1	4.103703704	2.051851852	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.83E-23	1	6.72E-14	1	1.47E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	40738623	T	A	C7orf10	ENST00000309930	r.?	-	-	intronic	25	0	0	53	16	30.2	42	14	33.3	58	7	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.319909091	1.159954545	2	2.391388601	1.195694301	2	2.482740741	1.24137037	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.9E-24	1	2.83E-22	1	1.88E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	40738633	T	A	C7orf10	ENST00000309930	r.?	-	-	intronic	25	0	0	52	17	32.7	51	16	31.4	62	8	12.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.511954545	1.255977273	2	2.254943005	1.127471503	2	2.646888889	1.323444444	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.42E-26	1	9.28E-25	1	1.04E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	41077339	T	C	-	-	-	-	-	-	22	0	0	40	2	5	44	5	11.4	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.384090909	0.384090909	1	0.818673575	0.818673575	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.017193422	1	0.00000288	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	41119172	C	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	45	12	26.7	46	8	17.4	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.051045455	1.025522727	2	1.249554404	1.249554404	1	0.882296296	0.882296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.03E-18	1	8.61E-11	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	42902050	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	47	11	23.4	41	4	9.8	25	1	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.797545455	0.898772727	2	0.703772021	0.703772021	1	0.820740741	0.820740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.21E-16	1	0.0000546	1	0.117779757	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	43296820	G	C	HECW1	CCDS5469.2	r.?	-	-	intronic	31	0	0	53	6	11.3	56	7	12.5	42	3	7.1	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.868045455	0.868045455	1	0.897668394	0.897668394	1	1.456814815	1.456814815	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000293	1	1.46E-08	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	43574222	G	A	HECW1	CCDS5469.2	r.?	-	-	intronic	36	0	0	45	9	20	51	9	17.6	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.536363636	1.536363636	1	1.263917098	1.263917098	1	0.96437037	0.96437037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-12	1	4.92E-12	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	43845301	A	T	BLVRA	CCDS5472.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	47	5	10.6	41	3	7.3	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.814272727	0.814272727	1	0.524238342	0.524238342	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000402	1	0.001155993	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	44984114	C	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	39	2	5.1	28	2	7.1	32	4	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.391772727	0.391772727	1	0.509875648	0.509875648	1	2.564814815	2.564814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.016387522	1	0.008668191	1	0.0000201	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	46139249	T	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	45	10	22.2	64	14	21.9	52	4	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.705363636	1.705363636	1	1.572715026	0.786357513	2	1.579925926	1.579925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.66E-14	1	2.31E-19	1	0.000139698	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	46823133	T	C	-	-	-	-	-	-	23	0	0	45	8	17.8	62	1	1.6	37	0	0	265	1	0.4	319	29	9.1	270	12	4.4	261	0	0	TRUE	TRUE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.367363636	1.367363636	1	0.114901554	0.114901554	1	0	0	1	0.699045455	0.699045455	1	0.315979275	0.315979275	1	0	0	1	4	3	1	0.735078993	7.14E-11	5.67E-27	0.267123145	1.82E-08	1	1	YES	1_1	0_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	7	47109778	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	48	11	22.9	50	10	20	44	5	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.759136364	0.879568182	2	1.43626943	1.43626943	1	2.339111111	1.169555556	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.31E-16	1	8.36E-14	1	0.00000288	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	48247530	C	T	ABCA13	CCDS47584.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	56	12	21.4	61	16	26.2	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.643909091	0.821954545	2	1.881512953	0.940756477	2	0.492444444	0.492444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.11E-16	1	2.5E-23	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	48410373	A	T	ABCA13	CCDS47584.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	53	12	22.6	54	18	33.3	55	6	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.736090909	0.868045455	2	2.391388601	1.195694301	2	2.236518519	1.118259259	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.39E-17	1	3.12E-28	1	0.000000367	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	48490761	A	G	ABCA13	CCDS47584.1	r.?	-	-	intronic	20	0	0	53	6	11.3	50	8	16	53	3	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.868045455	0.868045455	1	1.149015544	1.149015544	1	1.169555556	1.169555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000293	1	1.74E-10	1	0.002429596	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	49100400	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	59	7	11.9	54	4	7.4	56	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914136364	0.914136364	1	0.531419689	0.531419689	1	0.369333333	0.369333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.12E-08	1	0.000161898	1	0.244746891	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	49291905	G	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	66	1	1.5	52	7	13.5	57	4	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.115227273	0.115227273	1	0.969481865	0.969481865	1	1.436296296	1.436296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.281671117	1	8.58E-09	1	0.000199821	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	49307994	T	C	-	-	-	-	-	-	19	0	0	67	7	10.4	68	6	8.8	63	3	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.798909091	0.798909091	1	0.631958549	0.631958549	1	0.984888889	0.984888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.23E-08	1	0.00000131	1	0.003968795	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	49762919	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	46	15	32.6	51	13	25.5	64	5	7.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.504272727	1.252136364	2	1.831243523	0.915621762	2	1.600444444	1.600444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.35E-23	1	4.87E-19	1	0.0000186	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	51228647	C	A	COBL	CCDS34637.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	59	5	8.5	63	9	14.3	66	2	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.652954545	0.652954545	1	1.026932642	1.026932642	1	0.615555556	0.615555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000125	1	3.62E-11	1	0.043431387	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	51561885	G	A	-	-	-	-	-	-	18	0	0	57	17	29.8	44	12	27.3	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.289181818	1.144590909	2	1.960507772	0.980253886	2	1.80562963	1.80562963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.82E-26	1	4.44E-18	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	51657819	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	53	6	11.3	53	4	7.5	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.868045455	0.868045455	1	0.538601036	0.538601036	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000293	1	0.000150502	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	51943350	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	42	10	23.8	54	20	37	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.828272727	0.914136364	2	2.657098446	1.328549223	2	2.503259259	1.25162963	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.24E-14	1	2.61E-32	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	52166315	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	43	10	23.3	58	16	27.6	51	4	7.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.789863636	0.894931818	2	1.982051813	0.991025907	2	1.600444444	1.600444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	1.61E-14	1	1E-23	1	0.000129466	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	52178589	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	69	8	11.6	51	7	13.7	51	2	3.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.891090909	0.891090909	1	0.98384456	0.98384456	1	0.800222222	0.800222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.49E-09	1	7.46E-09	1	0.027109304	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	52201443	C	G	-	-	-	-	-	-	38	0	0	40	9	22.5	54	12	22.2	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.728409091	1.728409091	1	1.594259067	1.594259067	1	1.313185185	1.313185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.64E-13	1	6.9E-17	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	52580992	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	58	8	13.8	53	10	18.9	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.060090909	1.060090909	1	1.357274611	1.357274611	1	0.533481481	0.533481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.99E-10	1	1.57E-13	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	52742169	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	32	6	18.8	33	5	15.2	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.444181818	1.444181818	1	1.091564767	1.091564767	1	0.430888889	0.430888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.27E-08	1	0.00000066	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	52784973	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	31	6	19.4	26	7	26.9	40	5	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.490272727	1.490272727	1	1.931782383	1.931782383	1	2.564814815	1.282407407	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.03E-08	1	4.73E-11	1	0.00000178	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	52851703	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	54	7	13	54	7	13	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.998636364	0.998636364	1	0.93357513	0.93357513	1	1.025925926	1.025925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.13E-08	1	1.13E-08	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	53043101	T	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	55	18	32.7	64	20	31.2	50	2	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.511954545	1.255977273	2	2.240580311	1.120290155	2	0.820740741	0.820740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.61E-28	1	1.52E-30	1	0.026131524	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	53958784	A	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	45	11	24.4	63	14	22.2	52	6	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.874363636	0.937181818	2	1.594259067	0.797129534	2	2.35962963	1.179814815	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.24E-16	1	1.81E-19	1	0.000000261	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	55024663	G	A	-	-	-	-	-	-	12	0	0	22	6	27.3	15	3	20	48	6	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.097136364	1.048568182	2	1.43626943	1.43626943	1	2.564814815	1.282407407	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.09E-09	1	0.0000544	1	0.00000016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	55578435	C	T	VOPP1	CCDS47588.1	r.?	-	-	intronic	17	0	0	33	0	0	27	4	14.8	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.062839378	1.062839378	1	1.087481481	1.087481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.00001	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	55686734	G	A	-	-	-	-	-	-	20	0	0	31	4	12.9	45	5	11.1	52	1	1.9	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.990954545	0.990954545	1	0.797129534	0.797129534	1	0.389851852	0.389851852	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000177	1	0.00000323	1	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	56493936	A	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	39	7	17.9	49	9	18.4	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.375045455	1.375045455	1	1.321367876	1.321367876	1	0.595037037	0.595037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-09	1	3.35E-12	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	56501173	G	C	-	-	-	-	-	-	23	0	0	42	7	16.7	46	4	8.7	24	1	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.282863636	1.282863636	1	0.624777202	0.624777202	1	0.861777778	0.861777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.81E-09	1	0.0000862	1	0.113346489	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	56677040	G	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	52	5	9.6	64	9	14.1	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.737454545	0.737454545	1	1.012569948	1.012569948	1	0.923333333	0.923333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000668	1	4.2E-11	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	56741451	C	G	-	-	-	-	-	-	15	0	0	36	11	30.6	52	9	17.3	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.350636364	1.175318182	2	1.242373057	1.242373057	1	1.436296296	1.436296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.62E-17	1	5.92E-12	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	56784005	C	T	-	-	-	-	-	-	18	0	0	40	11	27.5	35	9	25.7	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.1125	1.05625	2	1.845606218	0.922803109	2	1.928740741	1.928740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.88E-17	1	1.23E-13	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	57217503	A	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	51	0	0	48	5	10.4	45	3	6.7	111	0	0	250	3	1.2	259	13	5	240	9	3.8	TRUE	TRUE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.746860104	0.746860104	1	1.374740741	1.374740741	1	0.092181818	0.092181818	1	0.359067358	0.359067358	1	0.779703704	0.779703704	1	3	1	1	1	1	0.131110451	0.00000447	1.09E-09	0.001516071	0.00000433	YES	0_0	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	7	57391091	C	T	-	-	-	-	-	-	16	0	0	25	4	16	23	1	4.3	29	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.229090909	1.229090909	1	0.308797927	0.308797927	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000727	1	0.108890944	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	57439146	C	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	39	11	28.2	33	9	27.3	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.166272727	1.083136364	2	1.960507772	0.980253886	2	1.867185185	1.867185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.2E-17	1	6.76E-14	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	57613016	T	C	-	-	-	-	-	-	59	0	0	79	8	10.1	69	9	13	80	1	1.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.775863636	0.775863636	1	0.93357513	0.93357513	1	0.246222222	0.246222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.43E-09	1	8.45E-11	1	0.33035218	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	57616850	A	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	49	0	0	55	6	10.9	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.782766839	0.782766839	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000367	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	57796015	G	C	-	-	-	-	-	-	45	0	0	47	12	25.5	49	5	10.2	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.958863636	0.979431818	2	0.732497409	0.732497409	1	1.497851852	1.497851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.09E-17	1	0.00000496	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	62494263	A	C	-	-	-	-	-	-	21	0	0	37	5	13.5	38	6	15.8	20	4	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.037045455	1.037045455	1	1.13465285	1.13465285	1	4.103703704	2.051851852	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000119	1	3.76E-08	1	0.00000284	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	62731040	G	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	37	8	21.6	25	10	40	41	8	19.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.659272727	1.659272727	1	2.87253886	1.43626943	2	4.001111111	2.000555556	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.33E-11	1	2.98E-17	1	3.22E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	63561388	C	T	-	-	-	-	-	-	12	0	0	25	3	12	19	5	26.3	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.921818182	0.921818182	1	1.888694301	1.888694301	1	1.620962963	1.620962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00026475	1	3.43E-08	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	64791237	T	C	-	-	-	-	-	-	37	0	0	42	12	28.6	45	9	20	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.197	1.0985	2	1.43626943	1.43626943	1	1.25162963	1.25162963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.35E-18	1	1.47E-12	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	65066892	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	56	18	32.1	53	14	26.4	49	5	10.2	0	0	NA	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.465863636	1.232931818	2	1.895875648	0.947937824	2	2.092888889	2.092888889	1	NA	NA	1	7.18134715	7.18134715	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.76E-28	1	1.22E-20	0.005	0.00000496	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	65188746	G	C	-	-	-	-	-	-	13	0	0	13	1	7.7	15	4	26.7	18	2	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.5915	0.5915	1	1.917419689	1.917419689	1	2.277555556	2.277555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.063085307	1	0.000000816	1	0.003626632	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	66895959	C	T	-	-	-	-	-	-	18	0	0	30	6	20	23	5	21.7	34	6	17.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.536363636	1.536363636	1	1.558352332	1.558352332	1	3.611259259	1.80562963	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.37E-09	1	9.75E-08	1	1.86E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	67408151	C	A	-	-	-	-	-	-	10	0	0	17	0	0	26	7	26.9	21	1	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.931782383	1.931782383	1	0.984888889	0.984888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1	1	4.73E-11	1	0.099912572	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	67423183	T	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	41	8	19.5	32	4	12.5	25	1	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.497954545	1.497954545	1	0.897668394	0.897668394	1	0.820740741	0.820740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.22E-11	1	0.0000201	1	0.117779757	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	67565244	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	47	14	29.8	46	11	23.9	28	1	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.289181818	1.144590909	2	1.716341969	0.858170984	2	0.738666667	0.738666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.79E-21	1	5.55E-16	1	0.130947004	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	67706597	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	42	13	31	49	12	24.5	32	5	15.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.381363636	1.190681818	2	1.759430052	0.879715026	2	3.200888889	1.600444444	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.72E-20	1	1.9E-17	1	0.000000562	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	68139714	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	35	7	20	55	8	14.5	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.536363636	1.536363636	1	1.041295337	1.041295337	1	1.928740741	1.928740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.65E-10	1	3.86E-10	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	68254505	T	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	45	4	8.9	47	5	10.6	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.683681818	0.683681818	1	0.761222798	0.761222798	1	1.025925926	1.025925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000791	1	0.00000402	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	68411740	A	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	45	10	22.2	57	19	33.3	27	3	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.705363636	1.705363636	1	2.391388601	1.195694301	2	2.277555556	2.277555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.66E-14	1	1.01E-29	1	0.000334187	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	68463941	G	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	45	11	24.4	47	10	21.3	29	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.874363636	0.937181818	2	1.529626943	1.529626943	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.24E-16	1	4.27E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	68742854	A	G	-	-	-	-	-	-	21	0	0	49	0	0	51	5	9.8	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.703772021	0.703772021	1	1.25162963	1.25162963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.00000606	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	68955916	G	C	-	-	-	-	-	-	24	0	0	36	11	30.6	52	19	36.5	21	2	9.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.350636364	1.175318182	2	2.62119171	1.310595855	2	1.949259259	1.949259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.62E-17	1	1.24E-30	1	0.004928472	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	69104457	A	C	AUTS2	CCDS5539.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	59	11	18.6	62	9	14.5	54	3	5.6	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.428818182	1.428818182	1	1.041295337	1.041295337	1	1.149037037	1.149037037	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.1E-14	1	3.12E-11	1	0.00256299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	69946663	G	A	AUTS2	CCDS5539.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	47	9	19.1	48	8	16.7	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.467227273	1.467227273	1	1.199284974	1.199284974	1	1.579925926	1.579925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-12	1	1.23E-10	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	70171703	G	A	AUTS2	CCDS5539.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	43	11	25.6	56	15	26.8	44	5	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.966545455	0.983272727	2	1.924601036	0.962300518	2	2.339111111	1.169555556	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.42E-16	1	4.09E-22	1	0.00000288	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	70183423	C	T	AUTS2	CCDS5539.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	34	11	32.4	46	13	28.3	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.488909091	1.244454545	2	2.032321244	1.016160622	2	0.471925926	0.471925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-17	1	1.07E-19	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	70386535	G	A	-	-	-	-	-	-	18	0	0	39	7	17.9	34	5	14.7	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.375045455	1.375045455	1	1.055658031	1.055658031	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-09	1	0.000000771	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	70712102	C	A	WBSCR17	CCDS5540.1	r.?	-	-	intronic	15	0	0	37	4	10.8	42	7	16.7	29	1	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.829636364	0.829636364	1	1.199284974	1.199284974	1	0.69762963	0.69762963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000362	1	1.81E-09	1	0.135292269	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	71296801	C	T	CALN1	CCDS47603.1	r.?	-	-	intronic	13	0	0	27	0	0	38	7	18.4	20	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.321367876	1.321367876	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1	1	8.61E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	71326550	C	A	CALN1	CCDS47603.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	47	5	10.6	53	8	15.1	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.814272727	0.814272727	1	1.08438342	1.08438342	1	0.636074074	0.636074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000402	1	2.83E-10	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	71443095	C	T	CALN1	CCDS47603.1	r.?	-	-	intronic	14	0	0	23	3	13	26	4	15.4	29	1	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.998636364	0.998636364	1	1.105927461	1.105927461	1	0.69762963	0.69762963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000205387	1	0.00000856	1	0.135292269	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	71937228	C	T	-	-	-	-	-	-	11	0	0	35	11	31.4	38	13	34.2	29	2	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.412090909	1.206045455	2	2.456020725	1.228010363	2	1.415777778	1.415777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.82E-17	1	5.88E-21	1	0.009279585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	71971887	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	31	7	22.6	53	9	17	23	0	0	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.736090909	1.736090909	1	1.220829016	1.220829016	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.85E-10	1	7.1E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	72333650	A	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	47	7	14.9	57	5	8.8	29	3	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.144590909	1.144590909	1	0.631958549	0.631958549	1	2.113407407	2.113407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.12E-09	1	0.0000105	1	0.000414371	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	72861279	G	A	BAZ1B	CCDS5549.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	54	15	27.8	49	14	28.6	30	3	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.135545455	1.067772727	2	2.053865285	1.026932642	2	2.051851852	2.051851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.2E-22	1	3.5E-21	1	0.000458697	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	73267767	T	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	37	0	0	33	0	0	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	1.80562963	1.80562963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	75833056	G	A	SRRM3	ENST00000388802	r.?	-	-	intronic	27	0	0	30	5	16.7	35	6	17.1	34	5	14.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.282863636	1.282863636	1	1.228010363	1.228010363	1	3.016222222	1.508111111	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000401	1	2.24E-08	1	0.000000771	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	76013849	G	A	SRCRB4D	CCDS5585.1	r.?	-	-	downstream	12	0	0	32	5	15.6	26	1	3.8	23	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.198363636	1.198363636	1	0.272891192	0.272891192	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000562	1	0.122190858	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	76156116	A	G	-	-	-	-	-	-	6	0	0	18	0	0	19	0	0	11	3	27.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	5.601555556	2.800777778	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.00002	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	76861375	G	A	CCDC146	CCDS34671.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	56	6	10.7	49	1	2	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.821954545	0.821954545	1	0.143626943	0.143626943	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000000409	1	0.217776325	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	79062184	C	A	MAGI2	CCDS5594.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	50	0	0	60	0	0	61	5	8.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	1.682518519	1.682518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000147	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	79062185	A	G	MAGI2	CCDS5594.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	50	0	0	59	0	0	61	5	8.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	1.682518519	1.682518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000147	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	79064849	C	A	MAGI2	CCDS5594.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	47	5	10.6	59	10	16.9	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.814272727	0.814272727	1	1.213647668	1.213647668	1	1.374740741	1.374740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000402	1	4.91E-13	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	79353081	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	52	2	3.8	46	8	17.4	60	3	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.291909091	0.291909091	1	1.249554404	1.249554404	1	1.025925926	1.025925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.028101652	1	8.61E-11	1	0.003458198	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	79360064	G	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	56	8	14.3	55	8	14.5	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.0985	1.0985	1	1.041295337	1.041295337	1	1.272148148	1.272148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.48E-10	1	3.86E-10	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	79391110	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	50	0	0	52	2	3.8	52	6	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.272891192	0.272891192	1	2.35962963	1.179814815	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.028101652	1	0.000000261	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	79654637	C	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	42	4	9.5	48	7	14.6	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.729772727	0.729772727	1	1.048476684	1.048476684	1	1.210592593	1.210592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000601	1	4.81E-09	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	80233570	T	A	CD36	CCDS34673.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	52	8	15.4	55	8	14.5	54	5	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.183	1.183	1	1.041295337	1.041295337	1	1.908222222	1.908222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.42E-10	1	3.86E-10	1	0.00000806	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	80373234	C	A	SEMA3C	CCDS5596.1	r.3794g>u	c.?	p.?	3'UTR variant	23	0	0	59	12	20.3	56	6	10.7	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.559409091	1.559409091	1	0.768404145	0.768404145	1	0.512962963	0.512962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.2E-16	1	0.000000409	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	81215743	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	48	0	0	59	9	15.3	60	5	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.098746114	1.098746114	1	1.703037037	1.703037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.96E-11	1	0.0000136	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	82071516	G	A	CACNA2D1	CCDS5598.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	41	9	22	54	12	22.2	59	2	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.69	1.69	1	1.594259067	1.594259067	1	0.69762963	0.69762963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-13	1	6.9E-17	1	0.035441897	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	82412854	C	T	PCLO	CCDS47630.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	23	6	26.1	18	7	38.9	54	7	13	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.004954545	2.004954545	1	2.793544041	1.396772021	2	2.667407407	1.333703704	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-09	1	2.37E-12	1	1.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	82694132	C	T	PCLO	CCDS47630.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	54	5	9.3	61	3	4.9	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.714409091	0.714409091	1	0.35188601	0.35188601	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000806	1	0.003623631	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	82851583	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	54	7	13	45	2	4.4	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.998636364	0.998636364	1	0.315979275	0.315979275	1	1.497851852	1.497851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.13E-08	1	0.021467209	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	83306914	C	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	58	10	17.2	47	6	12.8	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.321272727	1.321272727	1	0.919212435	0.919212435	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.1E-13	1	0.000000141	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	83875616	G	A	SEMA3A	ENST00000424555	r.?	-	-	intronic	22	0	0	47	12	25.5	39	8	20.5	51	4	7.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.958863636	0.979431818	2	1.472176166	1.472176166	1	1.600444444	1.600444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.09E-17	1	2.09E-11	1	0.000129466	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	84113636	C	G	SEMA3A	ENST00000424555	r.?	-	-	intronic	19	0	0	49	5	10.2	55	6	10.9	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.783545455	0.783545455	1	0.782766839	0.782766839	1	1.005407407	1.005407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000496	1	0.000000367	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	84279946	C	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	68	8	11.8	70	10	14.3	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.906454545	0.906454545	1	1.026932642	1.026932642	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.21E-09	1	2.95E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	84283077	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	62	7	11.3	73	9	12.3	59	4	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.868045455	0.868045455	1	0.883305699	0.883305699	1	1.395259259	1.395259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.02E-08	1	1.42E-10	1	0.00022841	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	84283111	T	C	-	-	-	-	-	-	45	0	0	65	8	12.3	70	9	12.9	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.944863636	0.944863636	1	0.926393782	0.926393782	1	1.210592593	1.210592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.53E-09	1	9.65E-11	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	84327548	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	61	7	11.5	65	10	15.4	61	2	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.883409091	0.883409091	1	1.105927461	1.105927461	1	0.677111111	0.677111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.69E-08	1	1.36E-12	1	0.037660755	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	84916657	G	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	57	9	15.8	53	17	32.1	52	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.213727273	1.213727273	1	2.305212435	1.152606218	2	0.779703704	0.779703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.42E-11	1	2.08E-26	1	0.028101652	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	85066451	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	56	17	30.4	56	17	30.4	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.335272727	1.167636364	2	2.183129534	1.091564767	2	0.882296296	0.882296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.22E-26	1	6.22E-26	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	85165913	T	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	46	5	10.9	44	8	18.2	54	4	7.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.837318182	0.837318182	1	1.307005181	1.307005181	1	1.51837037	1.51837037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000361	1	5.9E-11	1	0.000161898	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	86169873	G	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	59	13	22	43	22	51.2	43	6	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.69	0.845	2	3.676849741	1.83842487	2	2.872592593	1.436296296	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.99E-18	1	2.27E-39	1	8.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	86595378	C	T	KIAA1324L	CCDS47632.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	49	2	4.1	53	10	18.9	51	2	3.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.314954545	0.314954545	1	1.357274611	1.357274611	1	0.800222222	0.800222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.025168485	1	1.57E-13	1	0.027109304	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	87443714	C	A	RUNDC3B	CCDS5609.1	r.?	-	-	intronic	20	0	0	41	14	34.1	30	11	36.7	47	5	10.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.6195	1.30975	2	2.635554404	1.317777202	2	2.174962963	2.174962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	1.9E-22	1	2.44E-18	1	0.00000402	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	87831909	A	G	ADAM22	CCDS43608.1	r.8849a>g	c.?	p.?	3'UTR variant	42	0	0	59	11	18.6	47	5	10.6	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.428818182	1.428818182	1	0.761222798	0.761222798	1	0.430888889	0.430888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.1E-14	1	0.00000402	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	88070196	A	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	65	6	9.2	60	6	10	59	3	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.706727273	0.706727273	1	0.718134715	0.718134715	1	1.046444444	1.046444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000001	1	0.000000621	1	0.003297476	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	88170087	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	50	8	16	58	9	15.5	52	4	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.229090909	1.229090909	1	1.113108808	1.113108808	1	1.579925926	1.579925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.74E-10	1	1.67E-11	1	0.000139698	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	88409990	T	C	ZNF804B	CCDS5613.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	47	11	23.4	45	11	24.4	59	9	15.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.797545455	0.898772727	2	1.752248705	0.876124352	2	3.139333333	1.569666667	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.21E-16	1	4.24E-16	1	1.96E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	88763088	T	C	ZNF804B	CCDS5613.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	63	13	20.6	57	18	31.6	60	6	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.582454545	1.582454545	1	2.269305699	1.13465285	2	2.051851852	2.051851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.01E-17	1	9.84E-28	1	0.000000621	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	89035222	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	61	6	9.8	48	3	6.2	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.752818182	0.752818182	1	0.445243523	0.445243523	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000000685	1	0.001827434	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	89248222	A	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	63	14	22.2	51	8	15.7	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.705363636	0.852681818	2	1.127471503	1.127471503	1	0.471925926	0.471925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.81E-19	1	2.05E-10	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	89556504	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	53	6	11.3	68	5	7.4	53	3	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.868045455	0.868045455	1	0.531419689	0.531419689	1	1.169555556	1.169555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000293	1	0.0000251	1	0.002429596	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	90850393	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	48	4	8.3	43	9	20.9	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.637590909	0.637590909	1	1.500901554	1.500901554	1	1.579925926	1.579925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000102016	1	9.45E-13	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	91163362	A	C	-	-	-	-	-	-	24	0	0	76	8	10.5	56	4	7.1	52	3	5.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.806590909	0.806590909	1	0.509875648	0.509875648	1	1.190074074	1.190074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.44E-09	1	0.000186538	1	0.002300591	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	91427830	T	G	-	-	-	-	-	-	29	0	0	56	8	14.3	57	7	12.3	51	2	3.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.0985	1.0985	1	0.883305699	0.883305699	1	0.800222222	0.800222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.48E-10	1	1.66E-08	1	0.027109304	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	92809131	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	59	13	22	58	3	5.2	51	4	7.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.69	0.845	2	0.373430052	0.373430052	1	1.600444444	1.600444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.99E-18	1	0.003141421	1	0.000129466	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	93105251	C	T	CALCR	CCDS5631.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	71	12	16.9	55	13	23.6	50	4	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.298227273	1.298227273	1	1.694797927	0.847398964	2	1.641481481	1.641481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.38E-15	1	1.46E-18	1	0.000119787	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	93568773	G	A	-	-	-	-	-	-	17	0	0	35	5	14.3	50	7	14	49	2	4.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.0985	1.0985	1	1.005388601	1.005388601	1	0.841259259	0.841259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000895	1	6.46E-09	1	0.025168485	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	95081134	A	C	-	-	-	-	-	-	12	0	0	40	4	10	38	4	10.5	30	3	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.768181818	0.768181818	1	0.754041451	0.754041451	1	2.051851852	2.051851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000495	1	0.0000403	1	0.000458697	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	95618511	G	T	DYNC1I1	CCDS5644.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	52	6	11.5	39	6	15.4	40	6	15	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.883409091	0.883409091	1	1.105927461	1.105927461	1	3.077777778	1.538888889	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000261	1	4.43E-08	1	5.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	96379972	A	T	-	-	-	-	-	-	49	0	0	58	8	13.8	56	11	19.6	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.060090909	1.060090909	1	1.407544041	1.407544041	1	1.005407407	1.005407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.99E-10	1	5.91E-15	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	96574913	C	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	53	6	11.3	49	1	2	44	0	0	96	0	0	315	19	6	343	9	2.6	299	1	0.3	TRUE	TRUE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.868045455	0.868045455	1	0.143626943	0.143626943	1	0	0	1	0.460909091	0.460909091	1	0.186715026	0.186715026	1	0.061555556	0.061555556	1	4	3	1	1	0.000000293	6.48E-15	0.217776325	0.0000714	1	0.776590754	YES	1_1	0_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	7	96601291	T	C	-	-	-	-	-	-	20	0	0	36	7	19.4	61	3	4.9	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.490272727	1.490272727	1	0.35188601	0.35188601	1	1.826148148	1.826148148	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.74E-10	1	0.003623631	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	96919530	T	C	-	-	-	-	-	-	19	0	0	29	7	24.1	34	8	23.5	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.851318182	1.851318182	1	1.68761658	1.68761658	1	2.010814815	2.010814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.11E-10	1	6.32E-12	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	97065130	G	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	61	1	1.6	54	6	11.1	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.122909091	0.122909091	1	0.797129534	0.797129534	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.263440347	1	0.000000329	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	98188747	C	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	40	4	10	63	7	11.1	23	1	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.768181818	0.768181818	1	0.797129534	0.797129534	1	0.882296296	0.882296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000495	1	3.38E-08	1	0.108890944	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	98288796	C	T	-	-	-	-	-	-	16	0	0	25	6	24	24	7	29.2	25	1	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.843636364	1.843636364	1	2.096953368	1.048476684	2	0.820740741	0.820740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	2.51E-11	1	0.117779757	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	99464633	T	C	CYP3A43	CCDS5676.1	r.?	-	-	downstream	22	0	0	33	12	36.4	39	10	25.6	36	4	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.796181818	1.398090909	2	1.83842487	0.919212435	2	2.277555556	2.277555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.86E-20	1	5.44E-15	1	0.0000324	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	102005422	T	C	PRKRIP1	CCDS34714.1	r.?	-	-	intronic	15	0	0	36	8	22.2	39	2	5.1	40	4	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.705363636	1.705363636	1	0.366248705	0.366248705	1	2.051851852	2.051851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-11	1	0.016387522	1	0.0000495	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	102585056	G	T	LRRC17	CCDS34721.1	r.1623g>u	c.?	p.?	3'UTR variant	31	0	0	49	9	18.4	58	3	5.2	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.413454545	1.413454545	1	0.373430052	0.373430052	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.35E-12	1	0.003141421	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	103412060	C	T	RELN	CCDS47680.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	40	8	20	56	16	28.6	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.536363636	1.536363636	1	2.053865285	1.026932642	2	2.154444444	2.154444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.61E-11	1	5.26E-24	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	103595653	T	G	RELN	CCDS47680.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	48	9	18.8	47	5	10.6	59	7	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.444181818	1.444181818	1	0.761222798	0.761222798	1	2.441703704	1.220851852	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.75E-12	1	0.00000402	1	2.12E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	103636809	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	64	11	17.2	63	16	25.4	42	4	9.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.321272727	1.321272727	1	1.824062176	0.912031088	2	1.949259259	1.949259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.85E-14	1	4.48E-23	1	0.0000601	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	104292430	G	A	LHFPL3	ENST00000424859	r.?	-	-	intronic	41	0	0	64	7	10.9	63	8	12.7	51	2	3.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.837318182	0.837318182	1	0.912031088	0.912031088	1	0.800222222	0.800222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.78E-08	1	1.18E-09	1	0.027109304	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	104448081	C	A	LHFPL3	ENST00000424859	r.?	-	-	intronic	36	0	0	47	7	14.9	43	6	14	49	3	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.144590909	1.144590909	1	1.005388601	1.005388601	1	1.25162963	1.25162963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.12E-09	1	8.13E-08	1	0.001939399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	107347122	A	T	SLC26A4	CCDS5746.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	52	6	11.5	37	2	5.4	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.883409091	0.883409091	1	0.387792746	0.387792746	1	1.272148148	1.272148148	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000261	1	0.014826063	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	107692282	A	G	LAMB4	CCDS34732.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	55	18	32.7	60	14	23.3	33	4	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.511954545	1.255977273	2	1.673253886	0.836626943	2	2.482740741	2.482740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.61E-28	1	8.54E-20	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	108884059	C	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	60	11	18.3	60	17	28.3	51	6	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.405772727	1.405772727	1	2.032321244	1.016160622	2	2.421185185	1.210592593	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.34E-14	1	2.41E-25	1	0.000000232	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	109034113	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	61	0	0	51	5	9.8	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.703772021	0.703772021	1	1.908222222	1.908222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.00000606	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	110002853	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	59	0	0	59	7	11.9	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.854580311	0.854580311	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	2.12E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	110182393	C	A	-	-	-	-	-	-	17	0	0	36	11	30.6	29	6	20.7	29	2	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.350636364	1.175318182	2	1.48653886	1.48653886	1	1.415777778	1.415777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.62E-17	1	6.72E-09	1	0.009279585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	110766445	G	C	LRRN3	CCDS5754.1	r.?	-	-	downstream	43	0	0	48	14	29.2	47	11	23.4	46	6	13	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.243090909	1.121545455	2	1.680435233	0.840217617	2	2.667407407	1.333703704	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.51E-21	1	7.21E-16	1	0.000000123	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	110818388	C	A	IMMP2L	CCDS5753.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	52	8	15.4	54	11	20.4	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.183	1.183	1	1.464994819	1.464994819	1	1.867185185	1.867185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.42E-10	1	3.84E-15	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	111532380	C	A	DOCK4	CCDS47688.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	49	7	14.3	41	4	9.8	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.0985	1.0985	1	0.703772021	0.703772021	1	1.785111111	1.785111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.58E-09	1	0.0000546	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	112480344	A	T	C7orf60	CCDS43634.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	57	11	19.3	59	15	25.4	60	7	11.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.482590909	1.482590909	1	1.824062176	0.912031088	2	2.400666667	1.200333333	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.29E-15	1	9.9E-22	1	2.39E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	113166428	T	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	61	14	23	58	14	24.1	53	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.766818182	0.883409091	2	1.730704663	0.865352332	2	0.779703704	0.779703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.1E-19	1	5.04E-20	1	0.029108399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	113196849	T	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	38	6	15.8	46	9	19.6	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.213727273	1.213727273	1	1.407544041	1.407544041	1	1.333703704	1.333703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	3.76E-08	1	1.82E-12	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	113205860	T	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	48	3	6.2	57	4	7	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.476272727	0.476272727	1	0.502694301	0.502694301	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.001827434	1	0.000199821	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	115067719	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	41	7	17.1	40	6	15	59	3	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.313590909	1.313590909	1	1.077202073	1.077202073	1	1.046444444	1.046444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.51E-09	1	5.18E-08	1	0.003297476	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	117781189	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	38	4	10.5	61	6	9.8	55	6	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.806590909	0.806590909	1	0.703772021	0.703772021	1	2.236518519	1.118259259	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000403	1	0.000000685	1	0.000000367	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	117999225	A	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	66	9	13.6	59	11	18.6	54	4	7.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.044727273	1.044727273	1	1.33573057	1.33573057	1	1.51837037	1.51837037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.59E-11	1	1.1E-14	1	0.000161898	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	117999430	A	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	67	11	16.4	75	11	14.7	57	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.259818182	1.259818182	1	1.055658031	1.055658031	1	0.369333333	0.369333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-14	1	1.78E-13	1	0.248523156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	118082782	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	68	19	27.9	59	15	25.4	47	8	17	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.143227273	1.071613636	2	1.824062176	0.912031088	2	3.488148148	1.744074074	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.06E-28	1	9.9E-22	1	1.03E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	118099040	G	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	51	17	33.3	67	18	26.9	54	5	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.558045455	1.279022727	2	1.931782383	0.965891192	2	1.908222222	1.908222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.59E-27	1	2.83E-26	1	0.00000806	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	118148551	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	48	9	18.8	59	10	16.9	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.444181818	1.444181818	1	1.213647668	1.213647668	1	0.41037037	0.41037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.75E-12	1	4.91E-13	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	118311613	A	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	49	4	8.2	44	9	20.5	53	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.629909091	0.629909091	1	1.472176166	1.472176166	1	0.389851852	0.389851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000110643	1	1.18E-12	1	0.233303855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	118465125	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	64	16	25	56	20	35.7	39	7	17.9	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.920454545	0.960227273	2	2.563740933	1.281870466	2	3.672814815	1.836407407	2	7.681818182	7.681818182	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.94E-23	0.005	6.31E-32	1	1.04E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	118536722	A	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	60	17	28.3	53	13	24.5	41	7	17.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.173954545	1.086977273	2	1.759430052	0.879715026	2	3.508666667	1.754333333	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.41E-25	1	8.53E-19	1	1.51E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	119158826	C	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	62	20	32.3	60	17	28.3	52	8	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.481227273	1.240613636	2	2.032321244	1.016160622	2	3.159851852	1.579925926	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.19E-31	1	2.41E-25	1	2.42E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	120048806	G	A	KCND2	CCDS5776.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	51	7	13.7	50	9	18	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.052409091	1.052409091	1	1.292642487	1.292642487	1	0.41037037	0.41037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.46E-09	1	4.07E-12	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	120115733	A	T	KCND2	CCDS5776.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	54	13	24.1	53	5	9.4	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.851318182	0.925659091	2	0.675046632	0.675046632	1	0.984888889	0.984888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.12E-18	1	0.00000734	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	120657731	T	A	C7orf58	CCDS34739.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	58	13	22.4	43	8	18.6	50	9	18	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.720727273	0.860363636	2	1.33573057	1.33573057	1	3.693333333	1.846666667	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.12E-18	1	4.85E-11	1	4.07E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	120778369	G	A	C7orf58	CCDS34739.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	50	7	14	44	9	20.5	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.075454545	1.075454545	1	1.472176166	1.472176166	1	0.96437037	0.96437037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.46E-09	1	1.18E-12	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	121256705	G	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	46	6	13	50	6	12	43	6	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.998636364	0.998636364	1	0.861761658	0.861761658	1	2.872592593	1.436296296	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000123	1	0.000000206	1	8.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	121672917	G	A	PTPRZ1	CCDS34740.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	51	7	13.7	51	11	21.6	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.052409091	1.052409091	1	1.551170984	1.551170984	1	0.615555556	0.615555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.46E-09	1	1.94E-15	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	122614216	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	48	0	0	47	3	6.4	52	5	9.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.459606218	0.459606218	1	1.969777778	1.969777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.001719595	1	0.00000668	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	122681446	G	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	60	17	28.3	58	19	32.8	49	8	16.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.173954545	1.086977273	2	2.355481865	1.177740933	2	3.344518519	1.672259259	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.41E-25	1	1.5E-29	1	1.47E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	123142953	G	C	IQUB	CCDS5787.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	50	17	34	56	21	37.5	48	6	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.611818182	1.305909091	2	2.693005181	1.346502591	2	2.564814815	1.282407407	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.43E-27	1	5.43E-34	1	0.00000016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	123228216	G	T	ASB15	CCDS34742.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	66	5	7.6	54	5	9.3	49	4	8.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.583818182	0.583818182	1	0.667865285	0.667865285	1	1.682518519	1.682518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000217	1	0.00000806	1	0.000110643	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	125456608	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	64	13	20.3	50	7	14	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.559409091	1.559409091	1	1.005388601	1.005388601	1	1.456814815	1.456814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-17	1	6.46E-09	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	125640202	C	A	ENSG00000230519	ENST00000420567	r.?	-	-	intronic	31	0	0	59	6	10.2	51	9	17.6	60	2	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.783545455	0.783545455	1	1.263917098	1.263917098	1	0.677111111	0.677111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000561	1	4.92E-12	1	0.036544784	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	125660277	C	A	ENSG00000230519	ENST00000420567	r.?	-	-	intronic	43	0	0	52	9	17.3	46	4	8.7	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.328954545	1.328954545	1	0.624777202	0.624777202	1	0.882296296	0.882296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-12	1	0.0000862	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	125885838	G	A	-	-	-	-	-	-	13	0	0	29	12	41.4	34	12	35.3	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.180272727	1.590136364	2	2.535015544	1.267507772	2	1.703037037	1.703037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.17E-20	1	1.21E-19	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	126192209	C	T	GRM8	CCDS5794.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	57	5	8.8	60	10	16.7	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.676	0.676	1	1.199284974	1.199284974	1	0.451407407	0.451407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000105	1	5.86E-13	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	126662619	G	A	GRM8	CCDS5794.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	44	8	18.2	42	8	19	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.398090909	1.398090909	1	1.364455959	1.364455959	1	0.636074074	0.636074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.9E-11	1	3.96E-11	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	127269974	T	A	-	-	-	-	-	-	15	0	0	23	6	26.1	24	5	20.8	18	2	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.004954545	2.004954545	1	1.493720207	1.493720207	1	2.277555556	2.277555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-09	1	0.000000123	1	0.003626632	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	127269975	C	A	-	-	-	-	-	-	16	0	0	29	6	20.7	27	6	22.2	23	2	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.590136364	1.590136364	1	1.594259067	1.594259067	1	1.785111111	1.785111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.72E-09	1	4.23E-09	1	0.00589844	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	127871985	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	57	10	17.5	42	10	23.8	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.344318182	1.344318182	1	1.709160622	1.709160622	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.4E-13	1	1.24E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	128326262	G	A	FAM71F2	CCDS47701.1	r.?	-	-	downstream	21	0	0	31	10	32.3	40	13	32.5	35	4	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.481227273	1.240613636	2	2.333937824	1.166968912	2	2.339111111	2.339111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.94E-16	1	1.3E-20	1	0.0000289	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	129888439	T	C	-	-	-	-	-	-	25	0	0	51	9	17.6	54	17	31.5	30	1	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.352	1.352	1	2.262124352	1.131062176	2	0.677111111	0.677111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.92E-12	1	3.02E-26	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	130428142	G	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	59	6	10.2	57	8	14	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.783545455	0.783545455	1	1.005388601	1.005388601	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000561	1	5.19E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	130888951	G	A	MKLN1	ENST00000421797	r.?	-	-	intronic	19	0	0	27	5	18.5	32	7	21.9	31	3	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.421136364	1.421136364	1	1.572715026	1.572715026	1	1.990296296	1.990296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000023	1	2.36E-10	1	0.000505952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	132271893	A	G	PLXNA4	CCDS43646.1	r.?	-	-	intronic	17	0	0	40	9	22.5	37	10	27	32	4	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.728409091	1.728409091	1	1.938963731	0.969481865	2	2.564814815	2.564814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.64E-13	1	3.01E-15	1	0.0000201	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	132622300	A	C	CHCHD3	CCDS5828.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	54	2	3.7	65	6	9.2	58	4	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.284227273	0.284227273	1	0.660683938	0.660683938	1	1.415777778	1.415777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.030129377	1	0.000001	1	0.000213772	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	133834751	G	A	LRGUK	CCDS5830.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	38	8	21.1	32	3	9.4	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.620863636	1.620863636	1	0.675046632	0.675046632	1	0.595037037	0.595037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.67E-11	1	0.000556213	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	135103159	C	T	CNOT4	CCDS47719.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	45	9	20	47	13	27.7	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.536363636	1.536363636	1	1.989233161	0.99461658	2	2.236518519	2.236518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-12	1	1.47E-19	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	136177118	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	52	2	3.8	51	7	13.7	60	4	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.291909091	0.291909091	1	0.98384456	0.98384456	1	1.374740741	1.374740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.028101652	1	7.46E-09	1	0.000243755	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	137286800	G	A	DGKI	CCDS5845.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	56	8	14.3	65	1	1.5	53	0	0	45	0	0	334	20	6	320	10	3.1	354	1	0.3	TRUE	TRUE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.0985	1.0985	1	0.107720207	0.107720207	1	0	0	1	0.460909091	0.460909091	1	0.222621762	0.222621762	1	0.061555556	0.061555556	1	4	3	1	1	4.48E-10	1.47E-15	0.278061424	0.00000646	1	0.83042158	YES	1_1	0_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	7	137368416	T	G	DGKI	CCDS5845.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	58	14	24.1	56	11	19.6	62	5	8.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.851318182	0.925659091	2	1.407544041	1.407544041	1	1.662	1.662	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.04E-20	1	5.91E-15	1	0.000016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	137384711	G	T	DGKI	CCDS5845.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	53	13	24.5	55	23	41.8	40	4	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.882045455	0.941022727	2	3.001803109	1.500901554	2	2.051851852	2.051851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.53E-19	1	1.91E-38	1	0.0000495	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	138035308	A	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	33	9	27.3	47	13	27.7	22	3	13.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.097136364	1.048568182	2	1.989233161	0.99461658	2	2.790518519	2.790518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.76E-14	1	1.47E-19	1	0.000179267	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	138424527	G	T	ATP6V0A4	CCDS5849.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	32	3	9.4	48	7	14.6	22	2	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.722090909	0.722090909	1	1.048476684	1.048476684	1	1.867185185	1.867185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000556213	1	4.81E-09	1	0.005403392	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	140357574	C	T	DENND2A	ENST00000489552	r.?	-	-	intronic	22	0	0	38	9	23.7	38	4	10.5	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.820590909	0.910295455	2	0.754041451	0.754041451	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.79E-13	1	0.0000403	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	142547478	C	T	-	-	-	-	-	-	21	0	0	26	5	19.2	38	5	13.2	49	5	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.474909091	1.474909091	1	0.947937824	0.947937824	1	2.092888889	2.092888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000188	1	0.00000137	1	0.00000496	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	143706337	C	A	OR6B1	CCDS43667.1	r.?	-	-	downstream	37	0	0	41	6	14.6	55	9	16.4	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.121545455	1.121545455	1	1.177740933	1.177740933	1	1.867185185	1.867185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.05E-08	1	1.01E-11	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	143851878	G	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	59	10	16.9	85	12	14.1	49	4	8.2	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.298227273	1.298227273	1	1.012569948	1.012569948	1	1.682518519	1.682518519	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.91E-13	1	2.29E-14	1	0.000110643	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	144186363	C	T	TPK1	CCDS5888.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	42	4	9.5	55	12	21.8	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.729772727	0.729772727	1	1.565533679	1.565533679	1	0.492444444	0.492444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000601	1	8.78E-17	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	144835476	G	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	47	5	10.6	45	2	4.4	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.814272727	0.814272727	1	0.315979275	0.315979275	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000402	1	0.021467209	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	145401096	C	G	-	-	-	-	-	-	24	0	0	70	4	5.7	47	5	10.6	50	6	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.437863636	0.437863636	1	0.761222798	0.761222798	1	2.462222222	1.231111111	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000440508	1	0.00000402	1	0.000000206	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	146635281	A	C	CNTNAP2	CCDS5889.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	51	12	23.5	52	13	25	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.805227273	0.902613636	2	1.795336788	0.897668394	2	1.908222222	1.908222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.24E-17	1	6.47E-19	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	146732796	A	T	CNTNAP2	CCDS5889.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	50	7	14	49	11	22.4	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.075454545	1.075454545	1	1.608621762	1.608621762	1	1.538888889	1.538888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.46E-09	1	1.19E-15	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	146751611	C	A	CNTNAP2	CCDS5889.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	52	3	5.8	43	6	14	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.445545455	0.445545455	1	1.005388601	1.005388601	1	0.471925926	0.471925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.002300591	1	8.13E-08	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	146900959	C	A	CNTNAP2	CCDS5889.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	45	0	0	51	8	15.7	48	0	0	45	1	2.2	261	0	0	205	11	5.4	274	0	0	TRUE	TRUE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.127471503	1.127471503	1	0	0	1	0	0	1	0.387792746	0.387792746	1	0	0	1	2	2	1	0.201934322	1	1	2.05E-10	1.03E-08	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	7	147547490	C	A	CNTNAP2	CCDS5889.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	38	2	5.3	45	9	20	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.407136364	0.407136364	1	1.43626943	1.43626943	1	1.210592593	1.210592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.015598339	1	1.47E-12	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	149004627	G	T	-	-	-	-	-	-	20	0	0	30	8	26.7	31	6	19.4	30	1	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.051045455	1.025522727	2	1.393181347	1.393181347	1	0.677111111	0.677111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.07E-12	1	1.03E-08	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	150199959	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	51	13	25.5	51	17	33.3	42	6	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.958863636	0.979431818	2	2.391388601	1.195694301	2	2.934148148	1.467074074	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.87E-19	1	9.59E-27	1	7.02E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	150331881	C	T	GIMAP6	CCDS34778.1	r.?	-	-	upstream	27	0	0	45	12	26.7	43	5	11.6	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.051045455	1.025522727	2	0.833036269	0.833036269	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.03E-18	1	0.00000257	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	150868836	G	A	ASB10	CCDS47750.1	r.?	-	-	downstream	32	0	0	40	5	12.5	33	2	6.1	52	4	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.960227273	0.960227273	1	0.438062176	0.438062176	1	1.579925926	1.579925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000178	1	0.011909843	1	0.000139698	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	151278621	G	A	PRKAG2	CCDS43683.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	45	11	24.4	49	12	24.5	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.874363636	0.937181818	2	1.759430052	0.879715026	2	1.928740741	1.928740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.24E-16	1	1.9E-17	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	151566455	A	T	PRKAG2	CCDS43683.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	40	13	32.5	44	9	20.5	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.496590909	1.248295455	2	1.472176166	1.472176166	1	1.867185185	1.867185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.3E-20	1	1.18E-12	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	151964471	G	T	BAGE3	CCDS5931.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	63	4	6.3	73	12	16.4	78	3	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.483954545	0.483954545	1	1.177740933	1.177740933	1	0.779703704	0.779703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000294233	1	3.39E-15	1	0.007193566	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	152293266	C	T	-	-	-	-	-	-	18	0	0	42	7	16.7	38	4	10.5	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.282863636	1.282863636	1	0.754041451	0.754041451	1	1.25162963	1.25162963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.81E-09	1	0.0000403	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	152298325	C	T	-	-	-	-	-	-	13	0	0	25	8	32	24	4	16.7	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.458181818	1.229090909	2	1.199284974	1.199284974	1	1.149037037	1.149037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.92E-13	1	0.00000613	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	152746639	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	42	9	21.4	42	16	38.1	28	2	7.1	2	0	0	1	1	100	2	1	50	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.643909091	1.643909091	1	2.736093264	1.368046632	2	1.456814815	1.456814815	1	7.681818182	7.681818182	1	3.590673575	3.590673575	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.51E-13	0.005	2.25E-26	0.009975	0.008668191	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	152922165	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	58	16	27.6	50	18	36	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.120181818	1.060090909	2	2.585284974	1.292642487	2	0.512962963	0.512962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1E-23	1	5.92E-29	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	153288484	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	37	4	10.8	36	4	11.1	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.829636364	0.829636364	1	0.797129534	0.797129534	1	2.277555556	2.277555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000362	1	0.0000324	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	153399796	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	63	6	9.5	71	7	9.9	58	4	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.729772727	0.729772727	1	0.710953368	0.710953368	1	1.415777778	1.415777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000832	1	7.85E-08	1	0.000213772	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	153463633	T	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	62	8	12.9	41	6	14.6	47	5	10.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.990954545	0.990954545	1	1.048476684	1.048476684	1	2.174962963	2.174962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-09	1	6.05E-08	1	0.00000402	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	153486831	A	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	48	5	10.4	51	7	13.7	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.798909091	0.798909091	1	0.98384456	0.98384456	1	1.703037037	1.703037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000447	1	7.46E-09	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	153525017	G	T	-	-	-	-	-	-	15	0	0	41	6	14.6	34	6	17.6	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.121545455	1.121545455	1	1.263917098	1.263917098	1	0.533481481	0.533481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.05E-08	1	1.86E-08	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	153652384	G	A	DPP6	ENST00000404039	r.?	-	-	intronic	21	0	0	36	5	13.9	35	7	20	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.067772727	1.067772727	1	1.43626943	1.43626943	1	0.533481481	0.533481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000104	1	4.65E-10	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	153659306	T	C	DPP6	ENST00000404039	r.?	-	-	intronic	17	0	0	34	3	8.8	44	5	11.4	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.676	0.676	1	0.818673575	0.818673575	1	0.923333333	0.923333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	0.000666058	1	0.00000288	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	154193625	C	T	DPP6	ENST00000404039	r.?	-	-	intronic	30	0	0	50	9	18	41	12	29.3	36	1	2.8	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.382727273	1.382727273	1	2.104134715	1.052067358	2	0.574518519	0.574518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.07E-12	1	1.69E-18	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	154748565	G	A	PAXIP1	CCDS47753.1	r.?	-	-	intronic	18	0	0	25	3	12	38	8	21.1	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.921818182	0.921818182	1	1.515264249	1.515264249	1	1.333703704	1.333703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00026475	1	1.67E-11	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	155103637	G	A	INSIG1	CCDS5938.1	r.?	-	-	downstream	43	0	0	60	7	11.7	63	7	11.1	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.898772727	0.898772727	1	0.797129534	0.797129534	1	1.436296296	1.436296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.39E-08	1	3.38E-08	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	155315028	G	A	CNPY1	CCDS43684.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	12	2	16.7	18	4	22.2	48	6	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.282863636	1.282863636	1	1.594259067	1.594259067	1	2.564814815	1.282407407	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001595918	1	0.00000181	1	0.00000016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	155336123	C	G	-	-	-	-	-	-	11	0	0	18	0	0	4	0	0	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.154444444	2.154444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	155445723	C	T	RBM33	CCDS5941.2	r.?	-	-	intronic	26	0	0	39	9	23.1	66	12	18.2	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.7745	1.7745	1	1.307005181	1.307005181	1	0.533481481	0.533481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.62E-13	1	9.36E-16	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	155842423	G	T	-	-	-	-	-	-	15	0	0	17	4	23.5	11	4	36.4	41	5	12.2	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.805227273	1.805227273	1	2.614010363	1.307005181	2	2.503259259	1.25162963	2	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000141	1	0.000000201	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	155976427	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	38	8	21.1	50	9	18	55	3	5.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.620863636	1.620863636	1	1.292642487	1.292642487	1	1.128518519	1.128518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.67E-11	1	4.07E-12	1	0.002700822	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	157409973	G	A	PTPRN2	CCDS5949.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	16	3	18.8	11	5	45.5	47	5	10.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.444181818	1.444181818	1	3.267512953	1.633756477	2	2.174962963	2.174962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000667	1	1.41E-09	1	0.00000402	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	158035157	G	T	PTPRN2	CCDS5949.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	47	6	12.8	49	9	18.4	49	2	4.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.983272727	0.983272727	1	1.321367876	1.321367876	1	0.841259259	0.841259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000141	1	3.35E-12	1	0.025168485	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	7	159008797	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	41	5	12.2	40	1	2.5	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	4	2	2	2	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.937181818	0.937181818	1	0.179533679	0.179533679	1	1.210592593	1.210592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000202	1	0.181679879	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	218829	A	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	51	4	7.8	34	0	0	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.443181818	0.443181818	1	0	0	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.000129466	1	1	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	981929	G	A	C8orf68	ENST00000450568	r.?	-	-	intronic	11	0	0	17	3	17.6	21	12	57.1	28	2	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	2.958549223	1.479274611	2	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000807	1	6.88E-23	1	0.008668191	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	1035338	T	A	C8orf68	ENST00000450568	r.?	-	-	intronic	33	0	0	49	2	4.1	26	3	11.5	36	5	13.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.232954545	0.232954545	1	0.595854922	0.595854922	1	2.574074074	1.287037037	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.025168485	1	0.000298167	1	0.00000104	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	1088349	T	G	C8orf68	ENST00000450568	r.?	-	-	downstream	12	0	0	11	2	18.2	8	0	0	25	3	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	0	0	1	2.222222222	2.222222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001334363	1	1	1	0.00026475	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	2509470	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	40	10	25	26	10	38.5	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	1.994818653	0.997409326	2	1.388888889	1.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.22E-15	1	4.82E-17	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	2635599	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	34	5	14.7	41	8	19.5	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.835227273	0.835227273	1	1.010362694	1.010362694	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000771	1	3.22E-11	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	3289701	C	A	CSMD1	ENST00000318252	r.?	-	-	intronic	39	0	0	31	8	25.8	39	3	7.7	40	4	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.465909091	1.465909091	1	0.398963731	0.398963731	1	1.851851852	1.851851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.78E-12	1	0.000998458	1	0.0000495	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	3536970	G	A	CSMD1	ENST00000318252	r.?	-	-	intronic	37	0	0	42	3	7.1	59	9	15.3	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.403409091	0.403409091	1	0.792746114	0.792746114	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001240292	1	1.96E-11	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	3785508	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	38	5	13.2	28	7	25	48	7	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.75	0.75	1	1.295336788	1.295336788	1	2.703703704	1.351851852	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000137	1	8.44E-11	1	4.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	4216041	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	42	8	19	39	7	17.9	53	3	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.079545455	1.079545455	1	0.92746114	0.92746114	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.96E-11	1	1.04E-09	1	0.002429596	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	4277012	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	37	6	16.2	30	5	16.7	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.920454545	0.920454545	1	0.865284974	0.865284974	1	1.740740741	1.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.18E-08	1	0.000000401	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	4336100	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	33	13	39.4	34	13	38.2	47	8	17	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.238636364	1.119318182	2	1.979274611	0.989637306	2	3.148148148	1.574074074	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.37E-22	1	1.03E-21	1	1.03E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	4940751	C	G	-	-	-	-	-	-	27	0	0	29	7	24.1	48	8	16.7	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.369318182	1.369318182	1	0.865284974	0.865284974	1	0.925925926	0.925925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.11E-10	1	1.23E-10	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	5028218	A	G	-	-	-	-	-	-	25	0	0	35	3	8.6	35	7	20	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.488636364	0.488636364	1	1.03626943	1.03626943	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000725791	1	4.65E-10	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	5101822	C	T	-	-	-	-	-	-	16	0	0	36	9	25	24	5	20.8	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	1.077720207	1.077720207	1	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.63E-13	1	0.000000123	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	5127056	C	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	41	20	48.8	39	16	41	33	4	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.772727273	1.386363636	2	2.124352332	1.062176166	2	2.240740741	2.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.32E-35	1	5.16E-27	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	5365746	G	C	-	-	-	-	-	-	43	0	0	37	7	18.9	37	0	0	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.073863636	1.073863636	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	7.05E-10	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	5415356	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	38	6	15.8	35	3	8.6	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.897727273	0.897727273	1	0.445595855	0.445595855	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.76E-08	1	0.000725791	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	5882938	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	46	2	4.3	40	4	10	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.244318182	0.244318182	1	0.518134715	0.518134715	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.022369545	1	0.0000495	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	6878945	C	T	DEFA3	CCDS5962.1	r.?	-	-	upstream	31	0	0	36	8	22.2	34	13	38.2	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	1.979274611	0.989637306	2	1.296296296	1.296296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-11	1	1.03E-21	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	7196255	T	G	USP17L1P	ENST00000382655	r.?	-	-	downstream	23	0	0	20	4	20	20	1	5	23	0	0	149	0	0	81	4	4.9	74	3	4.1	74	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	0.259067358	0.259067358	1	0	0	1	0.278409091	0.278409091	1	0.212435233	0.212435233	1	0	0	1	5	2	1	1	0.00000284	0.000765256	0.09538952	0.006220661	1	1	YES	1_1	0_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	8	7196256	G	T	USP17L1P	ENST00000382655	r.?	-	-	downstream	23	0	0	22	4	18.2	20	1	5	23	0	0	149	0	0	81	3	3.7	76	3	3.9	74	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	0.259067358	0.259067358	1	0	0	1	0.210227273	0.210227273	1	0.202072539	0.202072539	1	0	0	1	5	2	1	1	0.00000425	0.007979008	0.09538952	0.006696581	1	1	YES	1_1	0_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	8	9240467	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	35	6	17.1	34	9	26.5	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.971590909	0.971590909	1	1.373056995	1.373056995	1	1.425925926	1.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-08	1	9.15E-14	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	10521113	C	T	RP1L1	ENST00000329335	r.?	-	-	intronic	16	0	0	27	12	44.4	24	10	41.7	21	3	14.3	0	0	NA	2	2	100	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.522727273	1.261363636	2	2.160621762	1.080310881	2	2.648148148	2.648148148	1	5.681818182	2.840909091	2	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.96E-21	0.000025	1.8E-17	1	0.000155401	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	11068867	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	35	4	11.4	36	10	27.8	40	6	15	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.647727273	0.647727273	1	1.440414508	1.440414508	1	2.777777778	1.388888889	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000289	1	2.21E-15	1	5.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	11799241	G	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	29	9	31	29	11	37.9	36	5	13.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.761363636	0.880681818	2	1.96373057	0.981865285	2	2.574074074	1.287037037	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.79E-14	1	1.56E-18	1	0.00000104	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	11893464	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	52	9	17.3	55	12	21.8	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.982954545	0.982954545	1	1.129533679	1.129533679	1	0.37037037	0.37037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-12	1	8.78E-17	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	12743460	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	41	8	19.5	38	8	21.1	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.107954545	1.107954545	1	1.093264249	1.093264249	1	1.944444444	1.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.22E-11	1	1.67E-11	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	13253769	C	A	DLC1	CCDS5989.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	26	7	26.9	16	6	37.5	34	5	14.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.528409091	1.528409091	1	1.943005181	1.943005181	1	2.722222222	1.361111111	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.73E-11	1	1.2E-10	1	0.000000771	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	13933387	A	C	-	-	-	-	-	-	31	0	0	33	13	39.4	39	18	46.2	42	4	9.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.238636364	1.119318182	2	2.393782383	1.196891192	2	1.759259259	1.759259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.37E-22	1	2.15E-31	1	0.0000601	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	14100675	C	A	SGCZ	CCDS5992.2	r.?	-	-	intronic	31	0	0	43	4	9.3	30	4	13.3	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.528409091	0.528409091	1	0.689119171	0.689119171	1	2.259259259	2.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000066	1	0.0000154	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	14250347	G	A	SGCZ	CCDS5992.2	r.?	-	-	intronic	32	0	0	48	14	29.2	39	17	43.6	50	6	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.659090909	0.829545455	2	2.259067358	1.129533679	2	2.222222222	1.111111111	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.51E-21	1	3.51E-29	1	0.000000206	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	14326403	T	C	SGCZ	CCDS5992.2	r.?	-	-	intronic	34	0	0	43	12	27.9	36	4	11.1	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.585227273	1.585227273	1	0.575129534	0.575129534	1	1.425925926	1.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	3.24E-18	1	0.0000324	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	14326490	G	A	SGCZ	CCDS5992.2	r.?	-	-	intronic	32	0	0	37	8	21.6	40	6	15	67	2	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.227272727	1.227272727	1	0.777202073	0.777202073	1	0.555555556	0.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	1.33E-11	1	5.18E-08	1	0.044622585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	16377341	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	45	0	0	39	0	0	63	5	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	1.462962963	1.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000173	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	16932399	C	G	EFHA2	CCDS5999.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	36	4	11.1	44	6	13.6	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.630681818	0.630681818	1	0.704663212	0.704663212	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000324	1	9.37E-08	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	16936426	T	A	EFHA2	CCDS5999.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	44	5	11.4	53	7	13.2	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.647727273	0.647727273	1	0.683937824	0.683937824	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000288	1	9.85E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	17154723	G	A	VPS37A	CCDS6001.1	r.3775g>a	c.?	p.?	3'UTR variant	44	0	0	41	4	9.8	41	11	26.8	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.556818182	0.556818182	1	1.388601036	1.388601036	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000546	1	1.34E-16	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	18620853	A	C	PSD3	CCDS43720.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	44	0	0	41	0	0	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	1.814814815	1.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	20347599	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	41	13	31.7	43	18	41.9	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.801136364	0.900568182	2	2.170984456	1.085492228	2	0.574074074	0.574074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.89E-20	1	2.06E-30	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	20493100	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	49	7	14.3	37	8	21.6	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.119170984	1.119170984	1	0.888888889	0.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.58E-09	1	1.33E-11	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	21184984	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	56	10	17.9	42	7	16.7	39	5	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.017045455	1.017045455	1	0.865284974	0.865284974	1	2.37037037	1.185185185	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.82E-13	1	1.81E-09	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	21213862	G	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	18	4	22.2	27	14	51.9	52	6	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	2.689119171	1.344559585	2	2.12962963	2.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000181	1	1.15E-25	1	0.000000261	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	21232134	C	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	37	12	32.4	51	15	29.4	48	8	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.840909091	0.920454545	2	1.523316062	0.761658031	2	3.092592593	1.546296296	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.03E-19	1	8.22E-23	1	1.23E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	23442724	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	30	3	10	26	6	23.1	35	3	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.568181818	0.568181818	1	1.196891192	1.196891192	1	1.592592593	1.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000458697	1	3.3E-09	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	25528171	C	T	-	-	-	-	-	-	12	0	0	14	4	28.6	10	4	40	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.625	1.625	1	2.07253886	2.07253886	1	0.574074074	0.574074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000601	1	0.000000128	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	27025969	C	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	37	14	37.8	37	13	35.1	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.147727273	1.073863636	2	1.81865285	0.909326425	2	1.722222222	1.722222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.35E-23	1	3.89E-21	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	28384492	C	G	FZD3	CCDS6069.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	28	3	10.7	31	6	19.4	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.607954545	0.607954545	1	1.005181347	1.005181347	1	0.944444444	0.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000372895	1	1.03E-08	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	29589458	C	T	-	-	-	-	-	-	18	0	0	43	7	16.3	31	4	12.9	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.926136364	0.926136364	1	0.668393782	0.668393782	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.15E-09	1	0.0000177	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	29903764	C	T	-	-	-	-	-	-	9	0	0	13	9	69.2	14	7	50	28	1	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.931818182	1.965909091	2	2.590673575	1.295336788	2	0.666666667	0.666666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.37E-18	1	2.6E-13	1	0.130947004	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	30021443	C	T	DCTN6	CCDS6076.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	19	4	21.1	26	6	23.1	20	2	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.198863636	1.198863636	1	1.196891192	1.196891192	1	1.851851852	1.851851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000228	1	3.3E-09	1	0.004473894	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	30701411	C	G	TEX15	CCDS6080.1	r.5123g>c	c.5123G>C	p.R1708T	missense	33	0	0	36	9	25	26	8	30.8	31	2	6.5	97	0	0	207	35	16.9	220	41	18.6	264	12	4.5	TRUE	TRUE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	1.595854922	1.595854922	1	1.203703704	1.203703704	1	0.960227273	0.960227273	1	0.96373057	0.96373057	1	0.833333333	0.833333333	1	5	5	1	1	1.63E-13	6.62E-42	5.63E-13	1.16E-50	0.010558179	1.42E-08	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	8	31037986	C	G	-	-	-	-	-	-	23	0	0	36	15	41.7	36	16	44.4	43	7	16.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.369318182	1.184659091	2	2.300518135	1.150259067	2	3.018518519	1.509259259	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.54E-25	1	1.01E-27	1	2.15E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	31251610	G	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	46	1	2.2	49	5	10.2	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.125	0.125	1	0.528497409	0.528497409	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.205924651	1	0.00000496	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	31252826	A	G	-	-	-	-	-	-	46	0	0	38	4	10.5	29	4	13.8	59	2	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.596590909	0.596590909	1	0.715025907	0.715025907	1	0.62962963	0.62962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000403	1	0.0000134	1	0.035441897	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	31276289	G	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	34	9	26.5	34	10	29.4	27	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.505681818	1.505681818	1	1.523316062	1.523316062	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.15E-14	1	1.15E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	32642139	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	39	5	12.8	46	12	26.1	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.727272727	0.727272727	1	1.352331606	1.352331606	1	1.648148148	1.648148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000156	1	8.12E-18	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	32722571	A	C	-	-	-	-	-	-	28	0	0	28	9	32.1	26	5	19.2	33	1	3	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.823863636	0.911931818	2	0.994818653	0.994818653	1	0.555555556	0.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.24E-14	1	0.000000188	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	33187995	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	41	13	31.7	27	6	22.2	33	7	21.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.801136364	0.900568182	2	1.150259067	1.150259067	1	3.925925926	1.962962963	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.89E-20	1	4.23E-09	1	2.98E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	33434712	T	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	40	12	30	29	4	13.8	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.704545455	0.852272727	2	0.715025907	0.715025907	1	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.2E-18	1	0.0000134	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	33856639	T	A	-	-	-	-	-	-	17	0	0	23	6	26.1	40	24	60	50	4	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.482954545	1.482954545	1	3.10880829	1.554404145	2	1.481481481	1.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-09	1	3.47E-45	1	0.000119787	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	33912618	C	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	30	13	43.3	26	12	46.2	45	7	15.6	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.460227273	1.230113636	2	2.393782383	1.196891192	2	2.888888889	1.444444444	2	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.35E-22	1	2.21E-21	1	0.000000003	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	35001749	A	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	42	6	14.3	33	8	24.2	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.25388601	1.25388601	1	0.518518519	0.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.02E-08	1	4.85E-12	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	35001791	T	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	37	5	13.5	36	7	19.4	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.767045455	0.767045455	1	1.005181347	1.005181347	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000119	1	5.74E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	35002073	T	C	-	-	-	-	-	-	24	0	0	38	7	18.4	32	10	31.2	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.045454545	1.045454545	1	1.616580311	1.616580311	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-10	1	5.7E-16	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	35513360	G	A	UNC5D	CCDS6093.2	r.?	-	-	intronic	32	0	0	40	15	37.5	38	11	28.9	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.130681818	1.065340909	2	1.497409326	1.497409326	1	1.388888889	1.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.09E-24	1	5.19E-17	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	36341789	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	87	18	20.7	67	14	20.9	54	5	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.176136364	1.176136364	1	1.082901554	1.082901554	1	1.722222222	1.722222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.29E-24	1	4.66E-19	1	0.00000806	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	36393494	G	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	103	0	0	110	0	0	65	6	9.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	1.703703704	1.703703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.000001	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	36447511	G	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	88	10	11.4	100	18	18	63	3	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.647727273	0.647727273	1	0.932642487	0.932642487	1	0.888888889	0.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.09E-11	1	7.93E-23	1	0.003968795	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	36652965	G	A	KCNU1	ENST00000399881	r.?	-	-	intronic	26	0	0	70	7	10	76	7	9.2	52	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.568181818	0.568181818	1	0.476683938	0.476683938	1	0.703703704	0.703703704	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.11E-08	1	0.000000126	1	0.028101652	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	36775722	G	A	KCNU1	ENST00000399881	r.?	-	-	intronic	32	0	0	217	124	57.1	203	109	53.7	118	49	41.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	32	32	35	30	30	32	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20.37431818	1.018715909	20	18.89238342	0.994335969	19	21.38018519	1.018104056	21	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.7E-223	1	4E-192	1	5.7E-80	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	36899442	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	264	12	4.5	302	8	2.6	123	0	0	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	32	32	35	30	30	32	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.605681818	1.605681818	1	0.914715026	0.914715026	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.42E-08	1	0.000166706	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	36995198	C	G	-	-	-	-	-	-	29	0	0	266	33	12.4	293	44	15	132	14	10.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	32	32	35	30	30	32	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.424545455	1.106136364	4	5.277202073	1.055440415	5	5.460962963	0.910160494	6	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.71E-35	1	7.33E-50	1	9.63E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	37054768	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	261	21	8	243	13	5.3	105	5	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	32	32	35	30	30	32	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.854545455	0.951515152	3	1.864611399	0.932305699	2	2.472888889	0.824296296	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.29E-19	1	5.01E-10	1	0.000199261	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	37074253	G	C	-	-	-	-	-	-	26	0	0	239	17	7.1	287	26	9.1	107	8	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	32	32	35	30	30	32	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.533409091	0.844469697	3	3.201502591	1.06716753	3	3.863888889	0.965972222	4	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.14E-14	1	2.62E-24	1	0.000000082	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	37131080	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	248	12	4.8	228	13	5.7	103	6	5.8	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	32	32	35	30	30	32	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.712727273	0.856363636	2	2.005336788	1.002668394	2	2.988074074	0.996024691	3	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.09E-09	1	2.29E-10	1	0.0000148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	37150899	G	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	192	11	5.7	201	11	5.5	90	3	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	32	32	35	30	30	32	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.033863636	1.016931818	2	1.934974093	0.967487047	2	1.700111111	1.700111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.21E-09	1	8.39E-09	1	0.01062894	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	37419978	G	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	170	143	84.1	188	161	85.6	90	51	56.7	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	32	32	35	30	30	32	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30.00840909	1.000280303	30	30.11523316	1.003841105	30	29.211	1.007275862	29	35.68181818	1.189393939	30	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.36E-298	0.005	0	1	1.72E-92	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	37589227	G	T	ERLIN2	CCDS6095.1	r.?	-	-	upstream	29	0	0	196	7	3.6	257	24	9.3	88	5	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	32	32	35	30	30	32	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.284545455	1.284545455	1	3.271865285	1.090621762	3	2.936555556	0.978851852	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000679	1	7.13E-23	1	0.0000867	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	37629464	C	T	PROSC	CCDS6096.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	159	3	1.9	162	8	4.9	68	1	1.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	32	32	35	30	30	32	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.677954545	0.677954545	1	1.72388601	1.72388601	1	0.772777778	0.772777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.046274814	1	0.00000195	1	0.288836448	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	37657593	C	A	GPR124	CCDS6097.2	r.?	-	-	intronic	27	0	0	119	5	4.2	138	6	4.3	72	3	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	32	32	35	30	30	32	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.498636364	1.498636364	1	1.512797927	1.512797927	1	2.163777778	2.163777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000355764	1	0.0000764	1	0.00576558	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	38156462	A	G	WHSC1L1	CCDS43729.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	53	2	3.8	60	7	11.7	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	9	4	4	6	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.367909091	0.367909091	1	1.074217617	1.074217617	1	0.663481481	0.663481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.029108399	1	2.39E-08	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	38572208	C	T	-	-	-	-	-	-	18	0	0	195	126	64.6	189	119	63	95	48	50.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	28	28	25	26	26	23	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20.46645455	1.023322727	20	19.6442487	0.982212435	20	20.96685185	0.998421517	21	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.33E-237	1	8.11E-222	1	9.08E-84	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	38789307	A	G	PLEKHA2	ENST00000388745	r.?	-	-	intronic	31	0	0	227	23	10.1	236	36	15.3	77	7	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	28	28	25	26	26	23	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.199863636	1.066621212	3	4.770746114	0.954149223	5	3.778185185	0.944546296	4	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	8.44E-23	1	2.35E-41	1	0.000000138	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	38790628	C	T	PLEKHA2	ENST00000388745	r.?	-	-	intronic	18	0	0	155	15	9.7	162	17	10.5	79	7	8.9	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	28	28	25	26	26	23	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.073136364	1.024378788	3	3.274041451	1.09134715	3	3.695148148	0.923787037	4	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.3E-15	1	1.65E-17	1	0.000000165	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	38791847	C	T	PLEKHA2	ENST00000388745	r.?	-	-	intronic	31	0	0	196	17	8.7	225	24	10.7	61	6	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	28	28	25	26	26	23	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.756318182	0.918772727	3	3.336404145	1.112134715	3	4.068814815	1.017203704	4	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.19E-16	1	2.9E-24	1	0.000000685	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	38791863	C	T	PLEKHA2	ENST00000388745	r.?	-	-	intronic	32	0	0	214	15	7	240	23	9.6	70	7	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	28	28	25	26	26	23	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.217727273	1.108863636	2	2.993409326	0.997803109	3	4.151851852	1.037962963	4	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.02E-13	1	3.05E-22	1	7.11E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	38792630	C	G	PLEKHA2	ENST00000388745	r.?	-	-	intronic	18	0	0	180	28	15.6	199	23	11.6	68	5	7.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	28	28	25	26	26	23	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.942363636	0.988472727	5	3.617036269	0.904259067	4	3.07237037	1.024123457	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	8.97E-33	1	3.95E-24	1	0.0000251	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	38793475	C	T	PLEKHA2	ENST00000388745	r.?	-	-	intronic	35	0	0	236	28	11.9	239	28	11.7	97	12	12.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	28	28	25	26	26	23	2	2	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.770136364	0.942534091	4	3.648217617	0.912054404	4	5.148296296	1.029659259	5	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.33E-29	1	3.34E-29	1	1.18E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	38827376	C	T	HTRA4	CCDS6110.1	r.?	-	-	upstream	12	0	0	130	17	13.1	146	19	13	77	3	3.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	5	25	4	4	23	1	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.137318182	1.137318182	1	1.06357513	1.06357513	1	1.619222222	1.619222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.64E-19	1	3.34E-21	1	0.006942426	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	38827377	C	A	HTRA4	CCDS6110.1	r.?	-	-	upstream	12	0	0	130	17	13.1	144	18	12.5	77	3	3.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	5	25	4	4	23	1	1	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.137318182	1.137318182	1	1.022668394	1.022668394	1	1.619222222	1.619222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.64E-19	1	7.67E-20	1	0.006942426	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	39513373	T	G	ADAM18	CCDS6113.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	50	10	20	45	10	22.2	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	5	8	4	4	5	1	1	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.736363636	0.868181818	2	1.816259067	0.908129534	2	0.637481481	0.637481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.36E-14	1	2.66E-14	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	40062346	A	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	61	3	4.9	55	4	7.3	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	8	2	2	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.376409091	0.376409091	1	0.524238342	0.524238342	1	0.612962963	0.612962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.003623631	1	0.000173903	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	41169477	C	T	SFRP1	CCDS34886.1	r.?	-	-	upstream	27	0	0	48	11	22.9	45	12	26.7	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	8	2	2	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.759136364	0.879568182	2	1.917419689	0.958709845	2	1.324	1.324	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.31E-16	1	6.03E-18	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	41960533	C	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	42	12	28.6	57	11	19.3	37	3	8.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	8	2	2	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.197	1.0985	2	1.386	1.386	1	1.986	1.986	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.35E-18	1	7.29E-15	1	0.000855237	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	43038714	C	T	HGSNAT	CCDS47852.1	r.?	-	-	intronic	20	0	0	25	12	48	19	2	10.5	33	5	15.2	1	0	0	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	8	2	2	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.687272727	1.843636364	2	0.754041451	0.754041451	1	3.726814815	0.931703704	4	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.2E-21	1	0.004039874	1	0.00000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	43124703	G	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	33	9	27.3	24	7	29.2	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4	4	8	2	2	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.097136364	1.048568182	2	2.096953368	1.048476684	2	2.280222222	2.280222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.76E-14	1	2.51E-11	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	47865187	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	37	13	35.1	42	11	26.2	45	6	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.398318182	1.132772727	3	2.405512953	0.801837651	3	3.260962963	1.086987654	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.89E-21	1	1.81E-16	1	0.000000108	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	48626891	C	T	KIAA0146	CCDS43737.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	32	16	50	45	21	46.7	33	4	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.840909091	1.210227273	4	4.287689119	1.07192228	4	2.966740741	0.98891358	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.51E-29	1	1.6E-36	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	48884657	C	T	MCM4	CCDS6143.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	34	13	38.2	51	19	37.3	29	5	17.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.698454545	0.924613636	4	3.424642487	1.141547496	3	4.217185185	1.054296296	4	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.03E-21	1	7.94E-31	1	0.000000336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	49181902	C	A	-	-	-	-	-	-	16	0	0	44	9	20.5	38	8	21.1	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.984772727	0.992386364	2	1.937264249	0.968632124	2	1.446592593	1.446592593	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.18E-12	1	1.67E-11	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	49602322	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	37	17	45.9	51	33	64.7	62	11	17.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.443954545	1.110988636	4	5.940331606	1.485082902	4	4.339777778	1.084944444	4	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.1E-29	1	2.98E-63	1	1.96E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	49958542	A	G	-	-	-	-	-	-	24	0	0	46	7	15.2	51	12	23.5	54	5	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.471636364	1.471636364	1	2.15761658	1.07880829	2	2.280222222	2.280222222	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.53E-09	1	3.24E-17	1	0.00000806	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	50229386	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	74	9	12.2	65	7	10.8	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.181181818	1.181181818	1	0.991585492	0.991585492	1	0.49037037	0.49037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.61E-10	1	4.22E-08	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	50332931	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	73	14	19.2	89	18	20.2	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.858909091	0.929454545	2	1.854632124	0.927316062	2	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.71E-18	1	8.26E-24	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	51153688	T	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	46	19	41.3	71	36	50.7	57	13	22.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.998590909	0.999647727	4	4.654943005	1.163735751	4	5.590222222	1.118044444	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.97E-32	1	2.71E-63	1	2.44E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	51448389	A	T	SNTG1	CCDS6147.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	72	27	37.5	74	38	51.4	69	14	20.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.630681818	0.907670455	4	4.719212435	1.179803109	4	4.977259259	0.995451852	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.82E-43	1	5.19E-67	1	7.3E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	51783913	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	58	9	15.5	84	22	26.2	62	8	12.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.500681818	1.500681818	1	2.405512953	0.801837651	3	3.162888889	1.054296296	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.67E-11	1	1.66E-31	1	1.04E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	51839466	A	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	59	10	16.9	74	17	23	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.636227273	1.636227273	1	2.111709845	1.055854922	2	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.91E-13	1	1.34E-23	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	53196867	G	A	ST18	CCDS6149.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	70	6	8.6	84	10	11.9	54	2	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.832636364	0.832636364	1	1.092580311	1.092580311	1	0.907185185	0.907185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000156	1	1.93E-11	1	0.030129377	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	53240958	A	C	ST18	CCDS6149.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	65	8	12.3	74	8	10.8	54	4	7.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.190863636	1.190863636	1	0.991585492	0.991585492	1	1.81437037	1.81437037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.53E-09	1	4.39E-09	1	0.000161898	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	53910551	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	54	5	9.3	59	9	15.3	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.900409091	0.900409091	1	1.404746114	1.404746114	1	0.563925926	0.563925926	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000806	1	1.96E-11	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	54832940	T	G	RGS20	CCDS6155.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	66	30	45.5	55	25	45.5	43	9	20.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.405227273	1.101306818	4	4.177512953	1.044378238	4	5.12437037	1.024874074	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.31E-51	1	7.96E-43	1	9.45E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	55630188	C	T	RP1	ENST00000427058	r.?	-	-	intronic	36	0	0	71	15	21.1	68	14	20.6	59	6	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.042863636	1.021431818	2	1.891357513	0.945678756	2	2.500888889	0.83362963	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.15E-20	1	5.84E-19	1	0.000000561	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	56082756	C	A	XKR4	CCDS34893.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	51	8	15.7	57	10	17.5	45	6	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.520045455	1.520045455	1	1.606735751	1.606735751	1	3.260962963	1.086987654	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.05E-10	1	3.4E-13	1	0.000000108	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	56130621	G	T	XKR4	CCDS34893.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	78	9	11.5	78	12	15.4	57	4	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.113409091	1.113409091	1	1.413927461	1.413927461	1	1.716296296	1.716296296	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.61E-10	1	7.82E-15	1	0.000199821	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	56406057	C	T	XKR4	CCDS34893.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	75	7	9.3	72	3	4.2	56	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.900409091	0.900409091	1	0.38561658	0.38561658	1	0.441333333	0.441333333	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000115	1	0.00576558	1	0.244746891	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	56547953	T	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	59	27	45.8	62	29	46.8	42	9	21.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.434272727	1.108568182	4	4.296870466	1.074217617	4	5.246962963	1.049392593	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.09E-46	1	6.51E-50	1	7.51E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	57361705	C	T	PENK	CCDS6168.1	r.?	-	-	upstream	22	0	0	52	9	17.3	57	14	24.6	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.674954545	1.674954545	1	2.258611399	1.129305699	2	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-12	1	3.84E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	57520228	C	G	-	-	-	-	-	-	25	0	0	65	30	46.2	62	29	46.8	64	16	25	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.473	1.11825	4	4.296870466	1.074217617	4	6.12962963	1.225925926	5	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.36E-51	1	6.51E-50	1	5.94E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	57520243	A	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	73	33	45.2	71	33	46.5	68	14	20.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.376181818	1.094045455	4	4.269326425	1.067331606	4	5.050814815	1.010162963	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.05E-56	1	1.81E-56	1	5.84E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	57606197	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	61	26	42.6	55	21	38.2	53	7	13.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.124454545	1.031113636	4	3.507274611	0.876818653	4	3.236444444	1.078814815	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.53E-43	1	3.41E-34	1	9.85E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	57646712	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	78	9	11.5	61	9	14.8	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.113409091	1.113409091	1	1.358839378	1.358839378	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.61E-10	1	2.68E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	57750970	G	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	67	17	25.4	62	13	21	55	5	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.459181818	0.819727273	3	1.928082902	0.964041451	2	2.231185185	2.231185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.03E-24	1	8.08E-18	1	0.00000883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	58037267	T	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	71	15	21.1	64	7	10.9	54	2	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.042863636	1.021431818	2	1.000766839	1.000766839	1	0.907185185	0.907185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.15E-20	1	3.78E-08	1	0.030129377	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	58162474	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	67	3	4.5	63	8	12.7	49	5	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.435681818	0.435681818	1	1.166031088	1.166031088	1	2.500888889	0.83362963	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.004717431	1	1.18E-09	1	0.00000496	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	58545349	A	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	91	21	23.1	78	13	16.7	58	3	5.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.2365	1.11825	2	1.533284974	1.533284974	1	1.274962963	1.274962963	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.54E-29	1	1.99E-16	1	0.003141421	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	59617545	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	60	10	16.7	81	7	8.6	47	0	0	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.616863636	1.616863636	1	0.789595855	0.789595855	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.86E-13	1	0.000000197	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	59868589	C	T	TOX	CCDS34897.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	54	11	20.4	55	10	18.2	73	7	9.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.975090909	0.987545455	2	1.671005181	1.671005181	1	2.353777778	1.176888889	2	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.84E-15	1	2.33E-13	1	9.54E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	60002239	C	A	TOX	CCDS34897.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	69	17	24.6	56	14	25	61	4	6.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.381727273	1.190863636	2	2.295336788	1.147668394	2	1.618222222	1.618222222	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.56E-24	1	2.91E-20	1	0.000259828	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	60101600	A	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	74	4	5.4	70	6	8.6	49	5	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.522818182	0.522818182	1	0.789595855	0.789595855	1	2.500888889	0.83362963	3	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00054411	1	0.00000156	1	0.00000496	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	60118134	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	71	0	0	69	2	2.9	48	4	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.266259067	0.266259067	1	2.035037037	2.035037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.04704084	1	0.000102016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	60349695	T	G	-	-	-	-	-	-	26	0	0	74	4	5.4	56	2	3.6	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.522818182	0.522818182	1	0.330528497	0.330528497	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00054411	1	0.032213353	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	60574213	A	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	80	12	15	75	8	10.7	55	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.452272727	1.452272727	1	0.982404145	0.982404145	1	0.441333333	0.441333333	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.07E-14	1	4.89E-09	1	0.240951649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	60667532	A	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	60	15	25	78	15	19.2	53	6	11.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.420454545	0.806818182	3	1.762818653	0.881409326	2	2.770592593	0.923530864	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.31E-21	1	9.92E-20	1	0.000000293	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	60701381	G	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	102	40	39.2	60	26	43.3	73	13	17.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.795272727	0.948818182	4	3.975523316	0.993880829	4	4.364296296	1.091074074	4	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.51E-64	1	8.84E-44	1	7.97E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	60888367	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	60	8	13.3	57	4	7	54	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.287681818	1.287681818	1	0.642694301	0.642694301	1	0.465851852	0.465851852	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.93E-10	1	0.000199821	1	0.237137336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	60920242	C	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	71	32	45.1	51	25	49	42	10	23.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.3665	1.091625	4	4.498860104	1.124715026	4	5.835407407	1.167081481	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.05E-54	1	6.52E-44	1	1.24E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	61693570	G	A	CHD7	CCDS47865.1	r.2154g>a	c.1677G>A	p.S559S	silent	32	0	0	66	5	7.6	57	6	10.5	44	2	4.5	114	0	0	404	38	9.4	420	37	8.8	308	18	5.8	TRUE	TRUE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.735818182	0.735818182	1	0.964041451	0.964041451	1	1.103333333	1.103333333	1	0.910090909	0.910090909	1	0.807958549	0.807958549	1	1.422074074	1.422074074	1	5	4	1	1	0.0000217	2.13E-35	0.000000456	1.83E-33	0.020580492	5.65E-14	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	8	62263722	G	T	CLVS1	CCDS6176.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	70	8	11.4	83	10	12	63	4	6.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.103727273	1.103727273	1	1.101761658	1.101761658	1	1.544666667	1.544666667	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.8E-09	1	1.7E-11	1	0.000294233	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	62277945	G	A	CLVS1	CCDS6176.1	r.?	-	-	intronic	11	0	0	36	1	2.8	51	7	13.7	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.271090909	0.271090909	1	1.25784456	1.25784456	1	1.446592593	1.446592593	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.165106833	1	7.46E-09	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	62340017	G	A	CLVS1	CCDS6176.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	63	5	7.9	71	9	12.7	50	2	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.764863636	0.764863636	1	1.166031088	1.166031088	1	0.980740741	0.980740741	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000173	1	1.1E-10	1	0.026131524	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	62730131	C	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	65	4	6.2	67	3	4.5	60	1	1.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.600272727	0.600272727	1	0.413160622	0.413160622	1	0.416814815	0.416814815	1	NA	NA	0	NA	NA	0	0	0	1	5	NA	1	1	0.000331785	1	0.004717431	1	0.259739042	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	63728238	C	T	NKAIN3	ENST00000328472	r.?	-	-	intronic	26	0	0	72	8	11.1	56	8	14.3	60	2	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.074681818	1.074681818	1	1.312932642	1.312932642	1	0.809111111	0.809111111	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.52E-09	1	4.48E-10	1	0.036544784	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	64311210	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	64	17	26.6	67	11	16.4	65	6	9.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.575363636	0.858454545	3	1.505740933	1.505740933	1	2.255703704	1.127851852	2	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.43E-25	1	4.85E-14	1	0.000001	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	64604979	G	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	91	10	11	79	8	10.1	54	4	7.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.065	1.065	1	0.927316062	0.927316062	1	1.81437037	1.81437037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.34E-11	1	7.43E-09	1	0.000161898	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	64805850	T	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	69	17	24.6	66	13	19.7	58	3	5.2	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.381727273	1.190863636	2	1.808725389	0.904362694	2	1.274962963	1.274962963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.56E-24	1	1.95E-17	1	0.003141421	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	65061517	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	68	27	39.7	67	33	49.3	61	12	19.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.843681818	0.960920455	4	4.526404145	1.131601036	4	4.830148148	0.96602963	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.16E-44	1	1.4E-57	1	3.39E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	65134098	A	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	72	14	19.4	60	14	23.3	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.878272727	0.939136364	2	2.139253886	1.069626943	2	1.029777778	1.029777778	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.39E-18	1	8.54E-20	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	65146304	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	64	16	25	70	17	24.3	55	4	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.420454545	0.806818182	3	2.231067358	1.115533679	2	1.789851852	1.789851852	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.94E-23	1	4.68E-24	1	0.000173903	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	65217456	A	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	74	29	39.2	69	27	39.1	58	14	24.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.795272727	0.948818182	4	3.589906736	0.897476684	4	5.908962963	1.181792593	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.68E-47	1	6.8E-44	1	5.04E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	65361026	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	65	1	1.5	75	12	16	48	3	6.2	0	0	NA	3	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.145227273	0.145227273	1	1.469015544	1.469015544	1	1.520148148	1.520148148	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.278061424	1	4.77E-15	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	65473457	G	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	81	19	23.5	66	13	19.7	47	9	19.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.275227273	1.137613636	2	1.808725389	0.904362694	2	4.683037037	0.936607407	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.15E-26	1	1.95E-17	1	2.24E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	65473458	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	81	19	23.5	66	13	19.7	47	9	19.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.275227273	1.137613636	2	1.808725389	0.904362694	2	4.683037037	0.936607407	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.15E-26	1	1.95E-17	1	2.24E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	65930199	A	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	66	21	31.8	66	38	57.6	50	4	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.078818182	1.026272727	3	5.288455959	1.32211399	4	1.961481481	1.961481481	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.42E-32	1	1.08E-69	1	0.000119787	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	66446104	G	A	-	-	-	-	-	-	14	0	0	44	3	6.8	48	8	16.7	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.658363636	0.658363636	1	1.533284974	1.533284974	1	1.054296296	1.054296296	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00142027	1	1.23E-10	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	66471395	G	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	59	20	33.9	63	27	42.9	31	3	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.282136364	1.094045455	3	3.938797927	0.984699482	4	2.378296296	2.378296296	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.21E-31	1	3.06E-45	1	0.000505952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	67138658	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	55	28	50.9	56	22	39.3	50	13	26	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.928045455	1.232011364	4	3.60826943	0.902067358	4	6.374814815	1.274962963	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.25E-49	1	4.34E-36	1	3.65E-19	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	67305101	T	A	-	-	-	-	-	-	9	0	0	29	1	3.4	37	9	24.3	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.329181818	0.329181818	1	2.231067358	1.115533679	2	0.612962963	0.612962963	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.135292269	1	2.14E-13	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	68079607	C	T	CSPP1	CCDS47870.1	r.?	-	-	intronic	11	0	0	19	4	21.1	4	2	50	37	1	2.7	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.042863636	2.042863636	1	4.590673575	1.147668394	4	0.662	0.662	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000228	1	0.000149002	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	69018102	G	A	PREX2	CCDS6201.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	53	6	11.3	60	7	11.7	53	3	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.094045455	1.094045455	1	1.074217617	1.074217617	1	1.397555556	1.397555556	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000293	1	2.39E-08	1	0.002429596	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	69887224	A	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	60	5	8.3	71	7	9.9	37	5	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.803590909	0.803590909	1	0.908953368	0.908953368	1	3.31	1.103333333	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000136	1	7.85E-08	1	0.00000119	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	69909847	A	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	78	5	6.4	69	5	7.2	56	4	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.619636364	0.619636364	1	0.661056995	0.661056995	1	1.740814815	1.740814815	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000487	1	0.0000269	1	0.000186538	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	70373054	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	72	3	4.2	64	8	12.5	53	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.406636364	0.406636364	1	1.147668394	1.147668394	1	0.931703704	0.931703704	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00576558	1	1.35E-09	1	0.029108399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	70384259	G	A	SULF1	CCDS6204.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	69	9	13	70	1	1.4	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.258636364	1.258636364	1	0.12853886	0.12853886	1	1.029777778	1.029777778	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.45E-11	1	0.295930304	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	70639277	C	A	SLCO5A1	CCDS6205.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	55	7	12.7	74	4	5.4	54	4	7.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.229590909	1.229590909	1	0.495792746	0.495792746	1	1.81437037	1.81437037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.28E-08	1	0.00054411	1	0.000161898	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	70951922	G	A	-	-	-	-	-	-	9	0	0	38	8	21.1	41	11	26.8	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.042863636	1.021431818	2	2.460601036	0.820200345	3	2.991259259	0.99708642	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.67E-11	1	1.34E-16	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	70971664	G	A	PRDM14	CCDS6206.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	30	6	20	57	14	24.6	17	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.936363636	1.936363636	1	2.258611399	1.129305699	2	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.37E-09	1	3.84E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	71178713	G	A	NCOA2	CCDS47872.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	61	29	47.5	64	36	56.2	40	9	22.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.598863636	1.149715909	4	5.159917098	1.289979275	4	5.516666667	1.103333333	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.48E-50	1	1.42E-65	1	4.64E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	71762589	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	64	6	9.4	55	5	9.1	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.910090909	0.910090909	1	0.835502591	0.835502591	1	2.231185185	2.231185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000914	1	0.00000883	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	71970145	C	T	-	-	-	-	-	-	21	0	0	50	8	16	42	3	7.1	54	3	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.549090909	1.549090909	1	0.651875648	0.651875648	1	1.373037037	1.373037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.74E-10	1	0.001240292	1	0.00256299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	72457828	G	A	-	-	-	-	-	-	16	0	0	22	6	27.3	17	5	29.4	34	4	11.8	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.643136364	0.881045455	3	2.699316062	0.899772021	3	2.893185185	0.964395062	3	9.681818182	9.681818182	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.09E-09	0.005	1.84E-08	1	0.0000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	72876326	T	C	AC016057.1	ENST00000457356	r.?	-	-	intronic	29	0	0	75	10	13.3	71	8	11.3	71	3	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.287681818	1.287681818	1	1.037492228	1.037492228	1	1.029777778	1.029777778	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.02E-12	1	3.14E-09	1	0.00554578	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	73018779	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	53	9	17	52	6	11.5	24	2	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.645909091	1.645909091	1	1.055854922	1.055854922	1	2.035037037	2.035037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.1E-12	1	0.000000261	1	0.006413403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	73523593	G	A	KCNB2	CCDS6209.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	61	14	23	53	10	18.9	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.226818182	1.113409091	2	1.735274611	0.867637306	2	2.721555556	0.907185185	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.1E-19	1	1.57E-13	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	74475340	C	T	STAU2	CCDS6214.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	69	0	0	63	5	7.9	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.725326425	0.725326425	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000173	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	74828284	G	A	-	-	-	-	-	-	16	0	0	45	14	31.1	39	10	25.6	42	4	9.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.011045455	1.003681818	3	2.35042487	1.175212435	2	2.329259259	2.329259259	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.81E-22	1	5.44E-15	1	0.0000601	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	75488043	G	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	61	11	18	73	18	24.7	56	5	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.742727273	0.871363636	2	2.267792746	1.133896373	2	2.182148148	2.182148148	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.62E-14	1	1.62E-25	1	0.00000965	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	77057231	G	C	-	-	-	-	-	-	22	0	0	61	8	13.1	57	4	7	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.268318182	1.268318182	1	0.642694301	0.642694301	1	1.397555556	1.397555556	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.09E-10	1	0.000199821	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	77098159	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	64	31	48.4	65	29	44.6	61	11	18	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.686	1.1715	4	4.094880829	1.023720207	4	4.413333333	1.103333333	4	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.05E-54	1	3.92E-49	1	1.62E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	77772306	C	T	ZFHX4	CCDS47878.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	70	26	37.1	61	26	42.6	60	16	26.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.591954545	0.897988636	4	3.911253886	0.977813472	4	6.546444444	1.309288889	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.35E-41	1	1.53E-43	1	1.86E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	78329711	T	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	71	13	18.3	72	17	23.6	60	2	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.771772727	0.885886364	2	2.166797927	1.083398964	2	0.809111111	0.809111111	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.42E-17	1	7.97E-24	1	0.036544784	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	78461762	T	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	73	16	21.9	69	4	5.8	66	7	10.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.120318182	1.060159091	2	0.532518135	0.532518135	1	2.598962963	0.866320988	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.15E-22	1	0.000416985	1	0.000000047	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	78638541	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	61	13	21.3	63	10	15.9	68	7	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.062227273	1.031113636	2	1.459834197	1.459834197	1	2.525407407	0.841802469	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.41E-18	1	9.81E-13	1	0.000000058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	78841900	G	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	87	6	6.9	70	11	15.7	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.668045455	0.668045455	1	1.441471503	1.441471503	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000558	1	8.06E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	79375260	A	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	70	12	17.1	78	16	20.5	34	4	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.655590909	0.827795455	2	1.882176166	0.941088083	2	2.893185185	0.964395062	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.99E-15	1	1.96E-21	1	0.0000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	79567985	T	C	-	-	-	-	-	-	41	0	0	82	0	0	88	5	5.7	56	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.523336788	0.523336788	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000867	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	79588423	T	C	FAM164A	CCDS6223.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	70	19	27.1	56	11	19.6	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.623772727	0.874590909	3	1.799544041	0.899772021	2	2.402814815	0.800938272	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.5E-28	1	5.91E-15	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	79686382	T	A	IL7	CCDS6224.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	84	13	15.5	68	7	10.3	72	6	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.500681818	1.500681818	1	0.945678756	0.945678756	1	2.035037037	2.035037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.49E-16	1	0.000000058	1	0.00000184	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	80259013	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	68	0	0	83	5	6	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.550880829	0.550880829	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000656	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	80277821	G	C	-	-	-	-	-	-	21	0	0	68	0	0	83	4	4.8	60	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.440704663	0.440704663	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000838577	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	80369907	A	C	-	-	-	-	-	-	27	0	0	53	13	24.5	66	13	19.7	57	3	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.372045455	1.186022727	2	1.808725389	0.904362694	2	1.299481481	1.299481481	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.53E-19	1	1.95E-17	1	0.002989991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	80444000	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	69	15	21.7	52	12	23.1	44	5	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.100954545	1.050477273	2	2.120891192	1.060445596	2	2.795111111	0.931703704	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.34E-20	1	4.19E-17	1	0.00000288	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	81121929	C	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	53	8	15.1	55	8	14.5	31	2	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.461954545	1.461954545	1	1.331295337	1.331295337	1	1.593703704	1.593703704	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.83E-10	1	3.86E-10	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	81926377	C	A	PAG1	CCDS6227.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	63	23	36.5	68	35	51.5	62	2	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.533863636	0.883465909	4	4.728393782	1.182098446	4	0.784592593	0.784592593	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.25E-37	1	6.85E-62	1	0.038789653	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	82418584	G	A	-	-	-	-	-	-	46	0	0	87	45	51.7	78	46	59	51	8	15.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5.0055	1.251375	4	5.416994819	1.354248705	4	3.849407407	0.962351852	4	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.9E-79	1	9.5E-85	1	2.05E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	82801668	C	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	66	3	4.5	64	9	14.1	56	3	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.435681818	0.435681818	1	1.294569948	1.294569948	1	1.324	1.324	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.004522888	1	4.2E-11	1	0.00284314	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	82879123	T	C	-	-	-	-	-	-	36	0	0	64	12	18.8	67	16	23.9	51	6	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.820181818	0.910090909	2	2.194341969	1.097170984	2	2.893185185	0.964395062	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.3E-16	1	1.35E-22	1	0.000000232	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	82967359	A	C	-	-	-	-	-	-	27	0	0	46	15	32.6	46	16	34.8	52	6	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.156272727	1.052090909	3	3.195108808	1.065036269	3	2.81962963	0.939876543	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.35E-23	1	1.31E-25	1	0.000000261	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	84110533	A	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	84	36	42.9	76	32	42.1	47	12	25.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.1535	1.038375	4	3.86534715	0.966336788	4	6.252222222	1.250444444	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.26E-60	1	5.07E-53	1	1.09E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	84634641	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	72	35	48.6	70	34	48.6	58	12	20.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.705363636	1.176340909	4	4.462134715	1.115533679	4	5.075333333	1.015066667	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.05E-60	1	5.33E-59	1	1.76E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	85201216	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	73	22	30.1	57	26	45.6	53	6	11.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.914227273	0.971409091	3	4.186694301	1.046673575	4	2.770592593	0.923530864	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.79E-33	1	1.57E-44	1	0.000000293	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	86191639	C	T	CA13	CCDS6236.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	55	3	5.5	64	5	7.8	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.5325	0.5325	1	0.716145078	0.716145078	1	0.686518519	0.686518519	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.002700822	1	0.0000186	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	86289922	C	T	-	-	-	-	-	-	18	0	0	62	5	8.1	39	8	20.5	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.784227273	0.784227273	1	1.882176166	0.941088083	2	0.612962963	0.612962963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000016	1	2.09E-11	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	87862754	G	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	66	14	21.2	88	16	18.2	51	8	15.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.052545455	1.026272727	2	1.671005181	0.835502591	2	3.849407407	0.962351852	4	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.71E-19	1	1.57E-20	1	2.05E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	88905273	G	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	43	8	18.6	34	6	17.6	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.800818182	1.800818182	1	1.615917098	1.615917098	1	1.49562963	1.49562963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-11	1	1.86E-08	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	89746596	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	56	6	10.7	62	8	12.9	48	3	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.035954545	1.035954545	1	1.184393782	1.184393782	1	1.520148148	1.520148148	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000409	1	1.04E-09	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	89770630	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	79	7	8.9	73	9	12.3	55	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.861681818	0.861681818	1	1.129305699	1.129305699	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000165	1	1.42E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	90257304	T	C	-	-	-	-	-	-	34	0	0	46	8	17.4	58	5	8.6	58	4	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.684636364	1.684636364	1	0.789595855	0.789595855	1	1.691777778	1.691777778	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-11	1	0.0000115	1	0.000213772	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	91741654	T	G	-	-	-	-	-	-	26	0	0	57	18	31.6	55	10	18.2	53	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.059454545	1.019818182	3	1.671005181	1.671005181	1	0.465851852	0.465851852	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.84E-28	1	2.33E-13	1	0.233303855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	92179645	C	T	LRRC69	CCDS47890.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	53	10	18.9	69	12	17.4	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.829863636	0.914931818	2	1.597554404	1.597554404	1	2.231185185	2.231185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.57E-13	1	1.65E-15	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	92204473	T	A	LRRC69	CCDS47890.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	79	9	11.4	60	6	10	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.103727273	1.103727273	1	0.918134715	0.918134715	1	0.711037037	0.711037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.93E-10	1	0.000000621	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	92224553	G	A	LRRC69	CCDS47890.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	53	4	7.5	60	5	8.3	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.726136364	0.726136364	1	0.762051813	0.762051813	1	0.662	0.662	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000150502	1	0.0000136	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	92398826	G	T	SLC26A7	CCDS6254.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	68	0	0	61	0	0	59	4	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	1.667259259	1.667259259	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.00022841	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	92595391	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	70	6	8.6	62	7	11.3	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.832636364	0.832636364	1	1.037492228	1.037492228	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000156	1	3.02E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	92843907	T	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	76	9	11.8	74	7	9.5	52	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.142454545	1.142454545	1	0.872227979	0.872227979	1	0.931703704	0.931703704	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.06E-10	1	0.000000105	1	0.028101652	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	92895559	C	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	76	10	13.2	62	9	14.5	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.278	1.278	1	1.331295337	1.331295337	1	1.716296296	1.716296296	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.9E-12	1	3.12E-11	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	93034490	C	T	RUNX1T1	CCDS47891.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	79	12	15.2	68	11	16.2	49	2	4.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.471636364	1.471636364	1	1.487378238	1.487378238	1	1.005259259	1.005259259	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.17E-15	1	5.76E-14	1	0.025168485	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	93034813	C	T	RUNX1T1	CCDS47891.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	70	17	24.3	75	25	33.3	47	6	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.352681818	1.176340909	2	3.057388601	1.019129534	3	3.13837037	1.046123457	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.68E-24	1	1.23E-38	1	0.000000141	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	93660637	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	64	12	18.8	68	15	22.1	56	8	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.820181818	0.910090909	2	2.02907772	1.01453886	2	3.506148148	0.876537037	4	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.3E-16	1	1.06E-20	1	4.48E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	94252617	G	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	55	9	16.4	55	13	23.6	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.587818182	1.587818182	1	2.166797927	1.083398964	2	1.029777778	1.029777778	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.01E-11	1	1.46E-18	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	94277521	G	A	-	-	-	-	-	-	20	0	0	54	6	11.1	38	3	7.9	52	3	5.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.074681818	1.074681818	1	0.725326425	0.725326425	1	1.422074074	1.422074074	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000329	1	0.000925091	1	0.002300591	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	94440353	A	G	AC011118.2	ENST00000501400	r.?	-	-	intronic	22	0	0	47	14	29.8	74	19	25.7	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.885181818	0.961727273	3	2.359606218	1.179803109	2	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.79E-21	1	3.14E-27	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	94591964	G	T	AC011118.2	ENST00000501400	r.?	-	-	intronic	29	0	0	63	10	15.9	84	20	23.8	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.539409091	1.539409091	1	2.185160622	1.092580311	2	2.133111111	2.133111111	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.81E-13	1	7.54E-28	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	94620600	C	A	AC011118.2	ENST00000501400	r.?	-	-	intronic	27	0	0	62	13	21	63	11	17.5	36	4	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.033181818	1.016590909	2	1.606735751	1.606735751	1	2.721555556	0.907185185	3	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.08E-18	1	2.37E-14	1	0.0000324	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	94800802	T	C	TMEM67	CCDS47893.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	50	7	14	63	2	3.2	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.355454545	1.355454545	1	0.293803109	0.293803109	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	4	NA	1	1	6.46E-09	1	0.03993132	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	95148801	G	A	CDH17	CCDS6260.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	69	6	8.7	69	3	4.3	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.842318182	0.842318182	1	0.394797927	0.394797927	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000143	1	0.005121501	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	95541676	T	C	KIAA1429	CCDS34923.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	47	10	21.3	64	10	15.6	35	5	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.062227273	1.031113636	2	1.432290155	1.432290155	1	3.506148148	0.876537037	4	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.27E-14	1	1.16E-12	1	0.000000895	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	95822597	T	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	51	24	47.1	59	32	54.2	36	5	13.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.560136364	1.140034091	4	4.976290155	1.244072539	4	3.408074074	1.136024691	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.2E-41	1	9.88E-58	1	0.00000104	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	96535154	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	68	6	8.8	49	4	8.2	53	3	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852	0.852	1	0.752870466	0.752870466	1	1.397555556	1.397555556	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000131	1	0.000110643	1	0.002429596	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	96850336	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	51	4	7.8	66	11	16.7	52	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.755181818	0.755181818	1	1.533284974	1.533284974	1	0.465851852	0.465851852	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000129466	1	4.07E-14	1	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	97391899	G	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	55	19	34.5	49	18	36.7	37	7	18.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.340227273	1.113409091	3	3.369554404	1.123184801	3	4.634	0.9268	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.51E-30	1	3.8E-29	1	7.05E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	97492713	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	43	5	11.6	63	3	4.8	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.123090909	1.123090909	1	0.440704663	0.440704663	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000257	1	0.003968795	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	98064971	A	G	ENSG00000104324	CCDS6273.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	68	6	8.8	67	2	3	52	0	0	51	0	0	356	20	5.6	303	10	3.3	324	0	0	TRUE	TRUE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852	0.852	1	0.275440415	0.275440415	1	0	0	1	0.542181818	0.542181818	1	0.302984456	0.302984456	1	0	0	1	4	3	1	1	0.00000131	4.91E-15	0.044622585	0.00000401	1	1	YES	1_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	8	98436248	G	C	-	-	-	-	-	-	31	0	0	85	0	0	63	5	7.9	45	0	0	75	0	0	392	0	0	420	21	5	349	0	0	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.725326425	0.725326425	1	0	0	1	0	NA	0	0.459067358	0.459067358	1	0	0	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000173	1.02E-14	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	8	98540048	G	A	-	-	-	-	-	-	34	1	2.9	70	33	47.1	87	41	47.1	36	6	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.560136364	1.140034091	4	4.324414508	1.081103627	4	4.094592593	1.023648148	4	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	0.156694864	1	9.75E-57	1	4.16E-70	1	2.68E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	100310306	G	T	VPS13B	CCDS6280.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	64	0	0	42	5	11.9	39	0	0	163	0	0	390	1	0.3	356	13	3.7	269	1	0.4	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.092580311	1.092580311	1	0	0	1	0.029045455	NA	0	0.339709845	0.339709845	1	0.098074074	0.098074074	1	2	NA	1	1	1	0.858420136	0.00000228	4.73E-08	1	0.740337807	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	8	100890580	A	G	VPS13B	CCDS6280.1	r.?	-	-	downstream	35	0	0	42	8	19	73	13	17.8	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.839545455	1.839545455	1	1.634279793	0.817139896	2	2.402814815	0.800938272	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.96E-11	1	7.97E-17	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	102118677	C	T	-	-	-	-	-	-	18	0	0	70	11	15.7	67	4	6	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.520045455	1.520045455	1	0.550880829	0.550880829	1	2.182148148	2.182148148	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.06E-14	1	0.000372648	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	102136448	C	T	-	-	-	-	-	-	12	0	0	40	6	15	33	8	24.2	49	6	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.452272727	1.452272727	1	2.22188601	1.110943005	2	2.991259259	0.99708642	3	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.18E-08	1	4.85E-12	1	0.000000182	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	102191126	T	C	-	-	-	-	-	-	28	0	0	65	13	20	64	19	29.7	40	5	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.936363636	0.968181818	2	2.726860104	0.908953368	3	3.064814815	1.021604938	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.57E-17	1	1.34E-28	1	0.00000178	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	102219101	T	A	ZNF706	CCDS6291.1	r.?	-	-	upstream	25	0	0	53	14	26.4	40	6	15	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.556	0.852	3	1.377202073	1.377202073	1	2.133111111	2.133111111	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.22E-20	1	5.18E-08	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	102516087	A	G	GRHL2	CCDS34931.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	48	5	10.4	65	4	6.2	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.006909091	1.006909091	1	0.569243523	0.569243523	1	0.588444444	0.588444444	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000447	1	0.000331785	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	103079826	G	C	NCALD	CCDS6292.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	72	3	4.2	54	7	13	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.406636364	0.406636364	1	1.19357513	1.19357513	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00576558	1	1.13E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	104687687	G	T	RIMS2	ENST00000504942	r.?	-	-	intronic	35	0	0	51	9	17.6	55	17	30.9	52	3	5.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.704	1.704	1	2.837036269	0.945678756	3	1.422074074	1.422074074	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.92E-12	1	4.35E-26	1	0.002300591	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	105473667	A	G	DPYS	CCDS6302.1	r.?	-	-	intronic	17	0	0	50	9	18	61	10	16.4	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.742727273	1.742727273	1	1.505740933	1.505740933	1	2.231185185	2.231185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.07E-12	1	6.98E-13	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	105820851	C	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	81	4	4.9	65	5	7.7	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.474409091	0.474409091	1	0.706963731	0.706963731	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000765256	1	0.0000201	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	106180194	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	81	7	8.6	69	8	11.6	62	6	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.832636364	0.832636364	1	1.065036269	1.065036269	1	2.378296296	1.189148148	2	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000197	1	2.49E-09	1	0.000000756	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	106381739	C	T	ZFPM2	CCDS47908.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	70	5	7.1	62	5	8.1	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.687409091	0.687409091	1	0.743689119	0.743689119	1	1.593703704	1.593703704	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000289	1	0.000016	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	106777655	C	T	ZFPM2	CCDS47908.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	54	4	7.4	78	6	7.7	64	3	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.716454545	0.716454545	1	0.706963731	0.706963731	1	1.15237037	1.15237037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000161898	1	0.00000295	1	0.004148608	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	106818924	T	C	ZFPM2	CCDS47908.1	r.?	-	-	downstream	24	0	0	56	17	30.4	59	13	22	52	6	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.943272727	0.981090909	3	2.019896373	1.009948187	2	2.81962963	0.939876543	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.22E-26	1	3.99E-18	1	0.000000261	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	106820895	C	G	ZFPM2	CCDS47908.1	r.?	-	-	downstream	27	0	0	50	7	14	65	11	16.9	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.355454545	1.355454545	1	1.551647668	1.551647668	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.46E-09	1	3.41E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	108455808	G	A	ANGPT1	CCDS6306.1	r.?	-	-	intronic	11	0	0	34	0	0	30	5	16.7	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.533284974	1.533284974	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000000401	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	108642036	A	G	-	-	-	-	-	-	25	0	0	59	3	5.1	48	5	10.4	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.493772727	0.493772727	1	0.954860104	0.954860104	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.003297476	1	0.00000447	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	109082847	A	T	RSPO2	CCDS6307.1	r.?	-	-	intronic	14	0	0	40	7	17.5	51	11	21.6	32	2	6.2	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.694318182	1.694318182	1	1.983170984	0.991585492	2	1.520148148	1.520148148	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-09	1	1.94E-15	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	109086776	G	T	RSPO2	CCDS6307.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	65	18	27.7	72	16	22.2	46	6	13	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.681863636	0.893954545	3	2.038259067	1.019129534	2	3.187407407	1.062469136	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.52E-26	1	4.82E-22	1	0.000000123	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	109192528	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	51	5	9.8	55	4	7.3	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948818182	0.948818182	1	0.670238342	0.670238342	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000606	1	0.000173903	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	109233303	A	G	EIF3E	CCDS6308.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	66	10	15.2	77	13	16.9	66	4	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.471636364	1.471636364	1	1.551647668	1.551647668	1	1.49562963	1.49562963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.6E-12	1	1.67E-16	1	0.000351793	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	109902579	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	61	8	13.1	72	17	23.6	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.268318182	1.268318182	1	2.166797927	1.083398964	2	1.201407407	1.201407407	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.09E-10	1	7.97E-24	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	110050685	T	G	-	-	-	-	-	-	42	0	0	86	11	12.8	75	10	13.3	53	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.239272727	1.239272727	1	1.221119171	1.221119171	1	0.465851852	0.465851852	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.47E-13	1	6.02E-12	1	0.233303855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	110973516	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	46	10	21.7	51	8	15.7	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.100954545	1.050477273	2	1.441471503	1.441471503	1	2.133111111	2.133111111	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.38E-14	1	2.05E-10	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	111262013	A	C	-	-	-	-	-	-	24	0	0	61	17	27.9	64	13	20.3	56	3	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.701227273	0.900409091	3	1.863813472	0.931906736	2	1.324	1.324	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.33E-25	1	1.26E-17	1	0.00284314	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	111465880	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	77	17	22.1	66	13	19.7	62	4	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.139681818	1.069840909	2	1.808725389	0.904362694	2	1.593703704	1.593703704	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.82E-23	1	1.95E-17	1	0.000276647	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	111511816	A	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	82	15	18.3	69	11	15.9	63	3	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.771772727	0.885886364	2	1.459834197	1.459834197	1	1.176888889	1.176888889	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.22E-19	1	6.82E-14	1	0.003968795	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	111656993	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	53	6	11.3	62	5	8.1	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.094045455	1.094045455	1	0.743689119	0.743689119	1	2.721555556	0.907185185	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000293	1	0.000016	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	111904778	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	51	8	15.7	64	7	10.9	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.520045455	1.520045455	1	1.000766839	1.000766839	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.05E-10	1	3.78E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	111930194	C	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	82	6	7.3	80	10	12.5	70	7	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.706772727	0.706772727	1	1.147668394	1.147668394	1	2.451851852	0.817283951	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000395	1	1.17E-11	1	7.11E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	112043614	A	G	-	-	-	-	-	-	38	0	0	89	38	42.7	84	34	40.5	60	15	25	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.134136364	1.033534091	4	3.718445596	0.929611399	4	6.12962963	1.225925926	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.77E-63	1	1.68E-55	1	1.31E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	112048441	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	79	33	41.8	62	31	50	50	11	22	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.047	1.01175	4	4.590673575	1.147668394	4	5.394074074	1.078814815	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.74E-54	1	1.86E-54	1	1.52E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	112429786	G	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	76	4	5.3	79	8	10.1	50	3	6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.513136364	0.513136364	1	0.927316062	0.927316062	1	1.471111111	1.471111111	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00060191	1	7.43E-09	1	0.002055544	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	112513900	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	73	9	12.3	71	6	8.5	61	2	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.190863636	1.190863636	1	0.780414508	0.780414508	1	0.809111111	0.809111111	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.42E-10	1	0.00000169	1	0.037660755	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	112743473	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	79	14	17.7	75	5	6.7	61	1	1.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.713681818	0.856840909	2	0.615150259	0.615150259	1	0.392296296	0.392296296	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.6E-18	1	0.0000403	1	0.263440347	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	112902912	G	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	62	8	12.9	56	5	8.9	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.248954545	1.248954545	1	0.817139896	0.817139896	1	1.103333333	1.103333333	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-09	1	0.00000965	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	112922421	C	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	60	20	33.3	57	13	22.8	59	6	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.224045455	1.074681818	3	2.09334715	1.046673575	2	2.500888889	0.83362963	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.3E-31	1	2.44E-18	1	0.000000561	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	113696777	A	G	CSMD3	CCDS6315.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	77	28	36.4	67	39	58.2	52	8	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.524181818	0.881045455	4	5.343544041	1.33588601	4	3.775851852	0.943962963	4	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.3E-44	1	9.3E-72	1	2.42E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	114416757	G	T	CSMD3	CCDS6315.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	56	0	0	77	0	0	64	7	10.9	53	0	0	295	0	0	286	0	0	267	13	4.9	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.672518519	0.890839506	3	0	NA	0	0	NA	0	1.201407407	1.201407407	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	3.78E-08	1.57E-09	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	8	116013615	A	C	-	-	-	-	-	-	21	0	0	65	26	40	61	23	37.7	66	8	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.872727273	0.968181818	4	3.461367876	0.865341969	4	2.966740741	0.98891358	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.24E-42	1	3.73E-37	1	1.73E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	116252724	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	88	10	11.4	85	10	11.8	59	5	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.103727273	1.103727273	1	1.083398964	1.083398964	1	2.084074074	2.084074074	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.09E-11	1	2.17E-11	1	0.0000125	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	117260130	C	T	AF130342.1	ENST00000505156	r.?	-	-	intronic	22	0	0	57	3	5.3	64	7	10.9	54	2	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.513136364	0.513136364	1	1.000766839	1.000766839	1	0.907185185	0.907185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.002989991	1	3.78E-08	1	0.030129377	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	117961886	G	A	SLC30A8	CCDS6322.1	r.?	-	-	upstream	24	0	0	52	0	0	32	5	15.6	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.432290155	1.432290155	1	0.686518519	0.686518519	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.000000562	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	118045815	C	T	SLC30A8	CCDS6322.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	73	5	6.8	73	7	9.6	54	0	0	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.658363636	0.658363636	1	0.881409326	0.881409326	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000354	1	9.54E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	118879985	C	T	EXT1	CCDS6324.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	83	8	9.6	84	8	9.5	52	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.929454545	0.929454545	1	0.872227979	0.872227979	1	0.465851852	0.465851852	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000011	1	1.21E-08	1	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	118906195	G	A	EXT1	CCDS6324.1	r.?	-	-	intronic	18	0	0	45	4	8.9	55	7	12.7	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.861681818	0.861681818	1	1.166031088	1.166031088	1	2.084074074	2.084074074	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000791	1	1.28E-08	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	119008412	T	C	EXT1	CCDS6324.1	r.?	-	-	intronic	20	0	0	53	12	22.6	54	15	27.8	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.188090909	1.094045455	2	2.552414508	0.850804836	3	0.563925926	0.563925926	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.39E-17	1	2.2E-22	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	119998133	T	C	-	-	-	-	-	-	28	0	0	65	25	38.5	63	27	42.9	50	7	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.7275	0.931875	4	3.938797927	0.984699482	4	3.432592593	0.858148148	4	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.6E-40	1	3.06E-45	1	6.46E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	120620589	C	T	ENPP2	CCDS6329.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	74	9	12.2	60	4	6.7	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.181181818	1.181181818	1	0.615150259	0.615150259	1	1.324	1.324	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.61E-10	1	0.000243755	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	121947682	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	70	7	10	75	12	16	63	7	11.1	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.968181818	0.968181818	1	1.469015544	1.469015544	1	2.721555556	0.907185185	3	NA	NA	0	0	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.11E-08	1	4.77E-15	1	3.38E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	123383178	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	64	31	48.4	61	26	42.6	54	6	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.686	1.1715	4	3.911253886	0.977813472	4	2.721555556	0.907185185	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.05E-54	1	1.53E-43	1	0.000000329	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	123596444	A	C	-	-	-	-	-	-	17	0	0	66	6	9.1	67	5	7.5	60	4	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.881045455	0.881045455	1	0.688601036	0.688601036	1	1.642740741	1.642740741	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000011	1	0.0000233	1	0.000243755	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	123711309	C	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	57	6	10.5	67	5	7.5	36	4	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.016590909	1.016590909	1	0.688601036	0.688601036	1	2.721555556	0.907185185	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000456	1	0.0000233	1	0.0000324	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	124184169	G	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	42	18	42.9	46	16	34.8	43	7	16.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.1535	1.038375	4	3.195108808	1.065036269	3	3.996518519	0.99912963	4	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.2E-30	1	1.31E-25	1	2.15E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	124691430	C	A	ANXA13	CCDS34939.1	r.?	-	-	downstream	36	0	0	79	19	24.1	80	17	21.2	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.333318182	1.166659091	2	1.946445596	0.973222798	2	2.231185185	2.231185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.27E-26	1	5.75E-23	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	125138759	C	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	83	3	3.6	57	5	8.8	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.348545455	0.348545455	1	0.807958549	0.807958549	1	1.054296296	1.054296296	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.008529565	1	0.0000105	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	125638237	G	A	MTSS1	CCDS6353.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	59	7	11.9	59	6	10.2	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.152136364	1.152136364	1	0.936497409	0.936497409	1	1.103333333	1.103333333	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.12E-08	1	0.000000561	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	126225742	C	G	NSMCE2	CCDS6356.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	29	0	0	27	5	18.5	11	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.698549223	1.698549223	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1	1	0.00000023	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	126401391	C	T	-	-	-	-	-	-	21	0	0	49	5	10.2	50	13	26	28	1	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.987545455	0.987545455	1	2.387150259	1.19357513	2	0.882666667	0.882666667	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000496	1	3.65E-19	1	0.130947004	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	126767509	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	79	6	7.6	75	2	2.7	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.735818182	0.735818182	1	0.247896373	0.247896373	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000318	1	0.054571821	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	126847543	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	69	7	10.1	82	1	1.2	63	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.977863636	0.977863636	1	0.110176166	0.110176166	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	4	NA	1	1	6.43E-08	1	0.337031917	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	128122476	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	67	23	34.3	73	31	42.5	53	7	13.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.320863636	1.106954545	3	3.902072539	0.975518135	4	3.236444444	1.078814815	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.12E-36	1	1.47E-51	1	9.85E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	129601281	C	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	69	13	18.8	59	13	22	67	5	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.820181818	0.910090909	2	2.019896373	1.009948187	2	1.838888889	1.838888889	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.64E-17	1	3.99E-18	1	0.0000233	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	129832332	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	70	28	40	67	30	44.8	54	14	25.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.872727273	0.968181818	4	4.113243523	1.028310881	4	6.350296296	1.270059259	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.5E-46	1	7.78E-51	1	1.64E-20	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	129893639	C	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	44	12	27.3	47	6	12.8	53	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.643136364	0.881045455	3	1.175212435	1.175212435	1	0.465851852	0.465851852	1	NA	NA	0	NA	NA	0	0	0	1	5	NA	1	1	4.44E-18	1	0.000000141	1	0.233303855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	129914962	G	A	-	-	-	-	-	-	12	0	0	61	7	11.5	40	9	22.5	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.113409091	1.113409091	1	2.065803109	1.032901554	2	2.721555556	0.907185185	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.69E-08	1	4.64E-13	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	129979341	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	64	24	37.5	78	30	38.5	49	12	24.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.630681818	0.907670455	4	3.534818653	0.883704663	4	6.007037037	1.201407407	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.23E-38	1	2.54E-48	1	1.9E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	130657431	C	T	AC013300.1	ENST00000446592	r.?	-	-	intronic	27	0	0	63	17	27	69	13	18.8	48	4	8.3	3	0	0	0	0	NA	2	0	0	1	0	0	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.614090909	0.871363636	3	1.726093264	0.863046632	2	2.035037037	2.035037037	1	NA	NA	0	0	NA	0	0	0	1	5	NA	1	1	6.22E-25	1	3.64E-17	1	0.000102016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	131296986	C	T	ASAP1	CCDS6362.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	66	23	34.8	65	33	50.8	59	11	18.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.369272727	1.123090909	3	4.664124352	1.166031088	4	4.560444444	0.912088889	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.38E-36	1	3.6E-58	1	1.1E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	131776098	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	75	22	29.3	82	22	26.8	57	3	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.836772727	0.945590909	3	2.460601036	0.820200345	3	1.299481481	1.299481481	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.55E-33	1	9.09E-32	1	0.002989991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	132114003	C	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	68	14	20.6	44	6	13.6	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.994454545	0.997227273	2	1.248663212	1.248663212	1	1.054296296	1.054296296	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.84E-19	1	9.37E-08	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	132403319	A	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	60	13	21.7	79	14	17.7	50	4	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.100954545	1.050477273	2	1.625098446	0.812549223	2	1.961481481	1.961481481	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.07E-18	1	5.6E-18	1	0.000119787	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	132768505	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	75	8	10.7	65	9	13.8	54	4	7.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.035954545	1.035954545	1	1.267025907	1.267025907	1	1.81437037	1.81437037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.89E-09	1	4.85E-11	1	0.000161898	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	133155880	G	C	KCNQ3	CCDS34943.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	79	8	10.1	67	1	1.5	68	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.977863636	0.977863636	1	0.137720207	0.137720207	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	4	NA	1	1	7.43E-09	1	0.285262761	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	133422068	A	C	KCNQ3	CCDS34943.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	63	6	9.5	44	8	18.2	46	1	2.2	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.919772727	0.919772727	1	1.671005181	1.671005181	1	0.539407407	0.539407407	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000832	1	5.9E-11	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	133422303	G	C	KCNQ3	CCDS34943.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	62	10	16.1	75	12	16	51	6	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.558772727	1.558772727	1	1.469015544	1.469015544	1	2.893185185	0.964395062	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.29E-13	1	4.77E-15	1	0.000000232	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	133458262	G	C	KCNQ3	CCDS34943.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	52	2	3.8	55	5	9.1	31	2	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.367909091	0.367909091	1	0.835502591	0.835502591	1	1.593703704	1.593703704	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.028101652	1	0.00000883	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	133511172	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	67	5	7.5	83	9	10.8	50	2	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.726136364	0.726136364	1	0.991585492	0.991585492	1	0.980740741	0.980740741	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000233	1	4.6E-10	1	0.026131524	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	136343346	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	48	19	39.6	51	18	35.3	58	15	25.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.834	0.9585	4	3.241015544	1.080338515	3	6.350296296	1.270059259	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.92E-31	1	9.1E-29	1	7.42E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	136920204	G	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	79	9	11.4	61	4	6.6	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.103727273	1.103727273	1	0.605968912	0.605968912	1	2.133111111	2.133111111	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.93E-10	1	0.000259828	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	136995000	T	C	-	-	-	-	-	-	28	0	0	66	14	21.2	73	17	23.3	50	4	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.052545455	1.026272727	2	2.139253886	1.069626943	2	1.961481481	1.961481481	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.71E-19	1	1.03E-23	1	0.000119787	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	137158274	G	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	56	3	5.4	55	6	10.9	49	3	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.522818182	0.522818182	1	1.000766839	1.000766839	1	1.49562963	1.49562963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00284314	1	0.000000367	1	0.001939399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	137263528	T	C	-	-	-	-	-	-	25	0	0	62	14	22.6	82	14	17.1	64	7	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.188090909	1.094045455	2	1.570010363	1.570010363	1	2.672518519	0.890839506	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.42E-19	1	9.77E-18	1	3.78E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	137486857	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	66	7	10.6	69	4	5.8	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.026272727	1.026272727	1	0.532518135	0.532518135	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000047	1	0.000416985	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	137503184	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	81	14	17.3	89	17	19.1	51	4	7.8	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.674954545	0.837477273	2	1.753637306	0.876818653	2	1.912444444	1.912444444	1	NA	NA	0	0	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.14E-18	1	4.11E-22	1	0.000129466	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	137779635	C	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	63	2	3.2	58	8	13.8	51	2	3.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.309818182	0.309818182	1	1.267025907	1.267025907	1	0.956222222	0.956222222	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.03993132	1	5.99E-10	1	0.027109304	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	137984745	T	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	82	35	42.7	79	37	46.8	43	6	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.134136364	1.033534091	4	4.296870466	1.074217617	4	3.432592593	0.858148148	4	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.12E-58	1	2.74E-63	1	8.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	138103401	T	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	75	30	40	58	28	48.3	34	8	23.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.872727273	0.968181818	4	4.434590674	1.108647668	4	5.761851852	1.15237037	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.85E-49	1	9.36E-49	1	6.32E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	138361070	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	62	7	11.3	72	7	9.7	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.094045455	1.094045455	1	0.890590674	0.890590674	1	1.103333333	1.103333333	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.02E-08	1	8.66E-08	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	138633287	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	63	9	14.3	60	1	1.7	68	2	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.3845	1.3845	1	0.156082902	0.156082902	1	0.711037037	0.711037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.62E-11	1	0.259739042	1	0.045825786	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	138634923	A	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	80	10	12.5	69	13	18.8	60	7	11.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.210227273	1.210227273	1	1.726093264	0.863046632	2	2.868666667	0.956222222	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.17E-11	1	3.64E-17	1	2.39E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	138652394	G	A	-	-	-	-	-	-	51	0	0	90	6	6.7	77	9	11.7	64	2	3.1	0	0	NA	0	0	NA	2	2	100	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.648681818	0.648681818	1	1.074217617	1.074217617	1	0.760074074	0.760074074	1	NA	NA	0	9.18134715	2.295336788	4	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000679	1	2.32E-10	0.000025	0.041085601	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	138787077	G	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	60	15	25	56	9	16.1	49	4	8.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.420454545	0.806818182	3	1.478196891	1.478196891	1	2.010518519	2.010518519	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.31E-21	1	1.2E-11	1	0.000110643	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	138960323	T	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	61	9	14.8	68	9	13.2	61	2	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.432909091	1.432909091	1	1.211937824	1.211937824	1	0.809111111	0.809111111	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.68E-11	1	7.38E-11	1	0.037660755	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	139205420	G	C	FAM135B	CCDS6375.2	r.?	-	-	intronic	27	0	0	52	12	23.1	53	14	26.4	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.2365	1.11825	2	2.423875648	0.807958549	3	1.446592593	1.446592593	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.19E-17	1	1.22E-20	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	139229678	T	A	FAM135B	CCDS6375.2	r.?	-	-	intronic	14	0	0	30	4	13.3	41	2	4.9	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.287681818	1.287681818	1	0.44988601	0.44988601	1	0.711037037	0.711037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000154	1	0.018015855	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	139304601	G	T	FAM135B	CCDS6375.2	r.?	-	-	intronic	31	0	0	74	24	32.4	64	22	34.4	55	12	21.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.136909091	1.045636364	3	3.15838342	1.052794473	3	5.345037037	1.069007407	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.21E-37	1	1.57E-34	1	8.78E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	139350783	C	A	FAM135B	CCDS6375.2	r.?	-	-	intronic	21	0	0	37	6	16.2	26	1	3.8	24	3	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.568454545	1.568454545	1	0.348891192	0.348891192	1	3.064814815	3.064814815	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.18E-08	1	0.122190858	1	0.000233853	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	139383251	G	T	FAM135B	CCDS6375.2	r.?	-	-	intronic	28	0	0	63	1	1.6	59	0	0	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.154909091	0.154909091	1	0	0	1	2.672518519	0.890839506	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.27078753	1	1	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	139524163	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	60	7	11.7	78	10	12.8	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.132772727	1.132772727	1	1.175212435	1.175212435	1	1.078814815	1.078814815	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.39E-08	1	9.02E-12	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	139570151	G	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	64	11	17.2	50	10	20	58	10	17.2	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.665272727	1.665272727	1	1.83626943	0.918134715	2	4.217185185	1.054296296	4	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.85E-14	1	8.36E-14	1	4.1E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	139666824	C	A	COL22A1	CCDS6376.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	55	7	12.7	55	8	14.5	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.229590909	1.229590909	1	1.331295337	1.331295337	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.28E-08	1	3.86E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	139782384	C	T	COL22A1	CCDS6376.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	38	8	21.1	25	7	28	50	2	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.042863636	1.021431818	2	2.570777202	0.856925734	3	0.980740741	0.980740741	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.67E-11	1	3.47E-11	1	0.026131524	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	139975079	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	50	14	28	59	8	13.6	36	7	19.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.710909091	0.903636364	3	1.248663212	1.248663212	1	4.756592593	0.951318519	5	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.84E-21	1	6.9E-10	1	5.74E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	140706504	C	T	KCNK9	CCDS6377.1	r.?	-	-	intronic	10	0	0	31	1	3.2	28	5	17.9	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.309818182	0.309818182	1	1.64346114	1.64346114	1	2.402814815	0.800938272	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.143917729	1	0.000000279	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	141057979	T	C	TRAPPC9	CCDS34946.1	r.?	-	-	intronic	11	0	0	23	6	26.1	14	0	0	37	0	0	1	0	0	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.526954545	0.842318182	3	0	0	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	141436964	T	C	TRAPPC9	CCDS34946.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	63	14	22.2	70	10	14.3	30	2	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.149363636	1.074681818	2	1.312932642	1.312932642	1	1.642740741	1.642740741	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.81E-19	1	2.95E-12	1	0.009909649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	141477244	T	G	-	-	-	-	-	-	21	0	0	64	8	12.5	76	10	13.2	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.210227273	1.210227273	1	1.211937824	1.211937824	1	0.588444444	0.588444444	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.35E-09	1	6.9E-12	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	142238692	G	C	SLC45A4	CCDS34948.1	r.?	-	-	upstream	19	0	0	24	2	8.3	32	7	21.9	55	5	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.803590909	0.803590909	1	2.010715026	1.005357513	2	2.231185185	2.231185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.006413403	1	2.36E-10	1	0.00000883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	143239816	G	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	24	4	16.7	24	2	8.3	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.616863636	1.616863636	1	0.762051813	0.762051813	1	1.324	1.324	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000613	1	0.006413403	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	144183477	G	C	-	-	-	-	-	-	12	0	0	16	4	25	21	1	4.8	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.420454545	2.420454545	1	0.440704663	0.440704663	1	1.667259259	1.667259259	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000108	1	0.099912572	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	144471822	G	A	-	-	-	-	-	-	12	0	0	12	5	41.7	13	1	7.7	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.037318182	1.009329545	4	0.706963731	0.706963731	1	2.231185185	2.231185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.4E-09	1	0.063085307	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	8	144536939	C	G	ZC3H3	CCDS6402.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	41	20	48.8	34	12	35.3	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	6	6	8	4	4	5	2	2	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4.724727273	1.181181818	4	3.241015544	1.080338515	3	2.991259259	0.99708642	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.32E-35	1	1.21E-19	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	986688	C	T	DMRT3	CCDS6443.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	44	6	13.6	23	3	13	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.772727273	0.772727273	1	0.67357513	0.67357513	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.37E-08	1	0.000205387	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	1390025	G	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	39	5	12.8	33	1	3	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.727272727	0.727272727	1	0.155440415	0.155440415	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000156	1	0.15245715	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	1841100	C	T	-	-	-	-	-	-	11	0	0	18	4	22.2	18	2	11.1	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	0.575129534	0.575129534	1	0.981481481	0.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000181	1	0.003626632	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	2190293	T	C	SMARCA2	CCDS34977.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	39	7	17.9	49	11	22.4	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.017045455	1.017045455	1	1.160621762	1.160621762	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-09	1	1.19E-15	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	2446917	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	44	7	15.9	37	11	29.7	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.903409091	0.903409091	1	1.538860104	1.538860104	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	3.7E-17	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	2924940	C	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	35	7	20	45	5	11.1	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	0.575129534	0.575129534	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.65E-10	1	0.00000323	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	3445361	G	T	RFX3	CCDS6449.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	40	9	22.5	26	6	23.1	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.278409091	1.278409091	1	1.196891192	1.196891192	1	1.296296296	1.296296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.64E-13	1	3.3E-09	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	3850823	G	A	GLIS3	CCDS6451.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	32	5	15.6	34	3	8.8	33	4	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.886363636	0.886363636	1	0.455958549	0.455958549	1	2.240740741	2.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000562	1	0.000666058	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	6162588	C	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	35	9	25.7	41	9	22	45	1	2.2	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.460227273	1.460227273	1	1.139896373	1.139896373	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.23E-13	1	5.92E-13	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	6739017	C	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	33	9	27.3	27	5	18.5	29	2	6.9	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.551136364	1.551136364	1	0.958549223	0.958549223	1	1.277777778	1.277777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.76E-14	1	0.00000023	1	0.009279585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	6876280	A	T	KDM4C	CCDS6471.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	31	7	22.6	30	3	10	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.284090909	1.284090909	1	0.518134715	0.518134715	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.85E-10	1	0.000458697	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	7104019	C	T	KDM4C	CCDS6471.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	38	9	23.7	45	6	13.3	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.346590909	1.346590909	1	0.689119171	0.689119171	1	0.888888889	0.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.79E-13	1	0.000000108	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	7358765	C	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	49	7	14.3	32	10	31.2	52	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.616580311	1.616580311	1	0.351851852	0.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.58E-09	1	5.7E-16	1	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	7648766	G	C	-	-	-	-	-	-	34	0	0	38	8	21.1	36	10	27.8	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.198863636	1.198863636	1	1.440414508	1.440414508	1	1.574074074	1.574074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.67E-11	1	2.21E-15	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	8307554	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	44	6	13.6	34	5	14.7	35	2	5.7	0	0	NA	2	2	100	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.772727273	0.772727273	1	0.761658031	0.761658031	1	1.055555556	1.055555556	1	5.681818182	5.681818182	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.37E-08	0.000025	0.000000771	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	8830880	C	G	PTPRD	CCDS43786.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	30	5	16.7	44	6	13.6	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	0.704663212	0.704663212	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000401	1	9.37E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	8861807	C	T	PTPRD	CCDS43786.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	36	10	27.8	29	5	17.2	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.579545455	1.579545455	1	0.89119171	0.89119171	1	0.388888889	0.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.21E-15	1	0.000000336	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	9658432	T	A	PTPRD	CCDS43786.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	47	11	23.4	37	6	16.2	54	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.329545455	1.329545455	1	0.839378238	0.839378238	1	0.351851852	0.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.21E-16	1	3.18E-08	1	0.237137336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	10134511	A	C	PTPRD	CCDS43786.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	42	4	9.5	42	9	21.4	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.539772727	0.539772727	1	1.10880829	1.10880829	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000601	1	7.51E-13	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	10718437	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	43	1	2.3	38	8	21.1	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.130681818	0.130681818	1	1.093264249	1.093264249	1	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.193893409	1	1.67E-11	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	11096683	C	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	53	10	18.9	48	15	31.2	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.073863636	1.073863636	1	1.616580311	1.616580311	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.57E-13	1	2.86E-23	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	11906878	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	44	5	11.4	47	10	21.3	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.647727273	0.647727273	1	1.103626943	1.103626943	1	0.555555556	0.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000288	1	4.27E-14	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	11995350	G	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	34	10	29.4	39	6	15.4	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.670454545	1.670454545	1	0.797927461	0.797927461	1	0.944444444	0.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.15E-15	1	4.43E-08	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	12026608	A	C	-	-	-	-	-	-	31	0	0	43	0	0	45	0	0	35	4	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.111111111	2.111111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000289	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	12402462	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	46	9	19.6	47	14	29.8	60	4	6.7	71	0	0	192	33	17.2	164	26	15.9	224	8	3.6	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.113636364	1.113636364	1	1.544041451	1.544041451	1	1.240740741	1.240740741	1	0.977272727	0.977272727	1	0.823834197	0.823834197	1	0.666666667	0.666666667	1	5	5	1	1	1.82E-12	7.45E-40	1.79E-21	9.02E-31	0.000243755	0.0000208	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	9	12413007	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	45	10	22.2	35	5	14.3	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	0.740932642	0.740932642	1	0.592592593	0.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.66E-14	1	0.000000895	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	12595178	A	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	44	10	22.7	38	5	13.2	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.289772727	1.289772727	1	0.683937824	0.683937824	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.08E-14	1	0.00000137	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	12716680	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	47	0	0	42	5	11.9	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.616580311	0.616580311	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000228	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	14571291	C	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	45	5	11.1	33	7	21.2	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.630681818	0.630681818	1	1.098445596	1.098445596	1	2.148148148	2.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000323	1	2.98E-10	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	15059635	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	30	6	20	34	7	20.6	29	2	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	1.067357513	1.067357513	1	1.277777778	1.277777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.37E-09	1	3.73E-10	1	0.009279585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	15875725	T	A	C9orf93	CCDS6481.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	48	10	20.8	48	13	27.1	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.181818182	1.181818182	1	1.404145078	1.404145078	1	1.814814815	1.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.37E-14	1	2E-19	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	16241724	G	C	C9orf92	ENST00000380685	r.?	-	-	intronic	31	0	0	25	2	8	30	3	10	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.454545455	0.454545455	1	0.518134715	0.518134715	1	2.148148148	2.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.006948068	1	0.000458697	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	16765303	C	T	BNC2	CCDS6482.2	r.?	-	-	intronic	43	0	0	40	5	12.5	43	10	23.3	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	1.207253886	1.207253886	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000178	1	1.61E-14	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	16894702	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	23	8	34.8	39	5	12.8	28	2	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.977272727	1.977272727	1	0.663212435	0.663212435	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.79E-13	1	0.00000156	1	0.008668191	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	17424773	C	T	CNTLN	CCDS43789.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	35	6	17.1	41	9	22	35	4	11.4	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.971590909	0.971590909	1	1.139896373	1.139896373	1	2.111111111	2.111111111	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-08	1	5.92E-13	1	0.0000289	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	17890258	C	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	39	8	20.5	40	9	22.5	57	4	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.164772727	1.164772727	1	1.165803109	1.165803109	1	1.296296296	1.296296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.09E-11	1	4.64E-13	1	0.000199821	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	18476248	T	C	ADAMTSL1	CCDS47954.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	44	9	20.5	47	13	27.7	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.164772727	1.164772727	1	1.435233161	1.435233161	1	1.462962963	1.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.18E-12	1	1.47E-19	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	18476252	T	G	ADAMTSL1	CCDS47954.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	44	9	20.5	45	13	28.9	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.164772727	1.164772727	1	1.497409326	1.497409326	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.18E-12	1	7.68E-20	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	19717518	C	T	SLC24A2	CCDS6493.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	55	12	21.8	38	9	23.7	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.238636364	1.238636364	1	1.227979275	1.227979275	1	1.185185185	1.185185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.78E-17	1	2.79E-13	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	19869322	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	41	6	14.6	36	7	19.4	31	5	16.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.829545455	0.829545455	1	1.005181347	1.005181347	1	2.981481481	2.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.05E-08	1	5.74E-10	1	0.000000476	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	20448067	T	G	MLLT3	CCDS6494.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	42	6	14.3	42	12	28.6	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.481865285	1.481865285	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.02E-08	1	2.35E-18	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	20945156	C	T	KIAA1797	CCDS34993.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	34	5	14.7	46	9	19.6	51	4	7.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.835227273	0.835227273	1	1.015544041	1.015544041	1	1.444444444	1.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000771	1	1.82E-12	1	0.000129466	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	21109382	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	38	10	26.3	27	1	3.7	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.494318182	1.494318182	1	0.191709845	0.191709845	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.06E-15	1	0.126579904	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	21130392	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	33	4	12.1	39	8	20.5	42	4	9.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.6875	0.6875	1	1.062176166	1.062176166	1	1.759259259	1.759259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000228	1	2.09E-11	1	0.0000601	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	21197655	G	A	IFNA7	CCDS34995.1	r.?	-	-	downstream	21	0	0	23	7	30.4	35	6	17.1	25	3	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.727272727	1.727272727	1	0.886010363	0.886010363	1	2.222222222	2.222222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.79E-11	1	2.24E-08	1	0.00026475	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	24037094	T	C	-	-	-	-	-	-	25	0	0	30	3	10	33	7	21.2	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.568181818	0.568181818	1	1.098445596	1.098445596	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000458697	1	2.98E-10	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	25872924	A	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	40	5	12.5	38	8	21.1	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	1.093264249	1.093264249	1	1.388888889	1.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000178	1	1.67E-11	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	26176434	C	T	-	-	-	-	-	-	51	0	0	33	8	24.2	34	7	20.6	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.375	1.375	1	1.067357513	1.067357513	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-12	1	3.73E-10	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	26670954	C	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	35	11	31.4	31	4	12.9	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.784090909	1.784090909	1	0.668393782	0.668393782	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.82E-17	1	0.0000177	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	27301828	G	A	C9orf11	CCDS35001.1	r.?	-	-	upstream	21	0	0	28	4	14.3	34	10	29.4	27	1	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.523316062	1.523316062	1	0.685185185	0.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000116	1	1.15E-15	1	0.126579904	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	27612051	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	41	9	22	46	10	21.7	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.25	1.25	1	1.124352332	1.124352332	1	0.388888889	0.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-13	1	3.38E-14	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	27781201	C	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	38	7	18.4	49	6	12.2	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.045454545	1.045454545	1	0.632124352	0.632124352	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-10	1	0.000000182	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	27807833	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	38	7	18.4	42	11	26.2	49	2	4.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.045454545	1.045454545	1	1.357512953	1.357512953	1	0.759259259	0.759259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-10	1	1.81E-16	1	0.025168485	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	28833684	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	46	9	19.6	34	4	11.8	58	6	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.113636364	1.113636364	1	0.611398964	0.611398964	1	1.907407407	1.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.82E-12	1	0.0000257	1	0.000000506	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	29728765	C	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	33	5	15.2	37	8	21.6	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.863636364	0.863636364	1	1.119170984	1.119170984	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000066	1	1.33E-11	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	30577893	T	C	-	-	-	-	-	-	24	0	0	33	3	9.1	26	5	19.2	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.517045455	0.517045455	1	0.994818653	0.994818653	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000609557	1	0.000000188	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	31926153	G	T	-	-	-	-	-	-	38	1	2.6	38	6	15.8	27	7	25.9	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.897727273	0.897727273	1	1.341968912	1.341968912	1	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	0.173434892	1	3.76E-08	1	6.36E-11	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	32375934	C	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	22	4	18.2	32	3	9.4	27	2	7.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	0.487046632	0.487046632	1	1.37037037	1.37037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000425	1	0.000556213	1	0.00807567	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	32638429	C	T	TAF1L	ENST00000242310	r.?	-	-	upstream	24	0	0	29	3	10.3	44	9	20.5	26	1	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.585227273	0.585227273	1	1.062176166	1.062176166	1	0.703703704	0.703703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000414371	1	1.18E-12	1	0.122190858	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	32754444	C	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	40	6	15	32	8	25	18	1	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852272727	0.852272727	1	1.295336788	1.295336788	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.18E-08	1	3.69E-12	1	0.086275114	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	32885345	A	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	32	4	12.5	43	6	14	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	0.725388601	0.725388601	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000201	1	8.13E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	34488496	G	A	DNAI1	CCDS6557.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	37	4	10.8	30	4	13.3	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.613636364	0.613636364	1	0.689119171	0.689119171	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000362	1	0.0000154	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	34790436	T	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	35	3	8.6	40	8	20	39	5	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.488636364	0.488636364	1	1.03626943	1.03626943	1	2.37037037	2.37037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000725791	1	2.61E-11	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	36198543	A	T	CLTA	CCDS6601.1	r.?	-	-	intronic	10	0	0	9	3	33.3	10	3	30	30	2	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.892045455	1.892045455	1	1.554404145	1.554404145	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000103	1	0.0000146	1	0.009909649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	36816874	T	C	-	-	-	-	-	-	24	0	0	21	5	23.8	41	9	22	29	3	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.352272727	1.352272727	1	1.139896373	1.139896373	1	1.907407407	1.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.95E-08	1	5.92E-13	1	0.000414371	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	37381463	G	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	19	1	5.3	20	7	35	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.301136364	0.301136364	1	1.813471503	1.813471503	1	0.555555556	0.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.090843738	1	5.72E-12	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	37655616	G	A	FRMPD1	CCDS6612.1	r.?	-	-	intronic	10	0	0	15	4	26.7	14	4	28.6	29	1	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.517045455	1.517045455	1	1.481865285	1.481865285	1	0.62962963	0.62962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000816	1	0.000000601	1	0.135292269	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	40499209	A	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	24	4	16.7	25	5	20	31	3	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	1.03626943	1.03626943	1	1.796296296	1.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000613	1	0.000000153	1	0.000505952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	42499590	A	G	-	-	-	-	-	-	45	0	0	57	2	3.5	43	5	11.6	52	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.198863636	0.198863636	1	0.601036269	0.601036269	1	0.703703704	0.703703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.03327602	1	0.00000257	1	0.028101652	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	43614794	T	A	-	-	-	-	-	-	17	0	0	24	4	16.7	27	9	33.3	24	2	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	1.725388601	1.725388601	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000613	1	8.44E-15	1	0.006413403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	44868869	G	T	ENSG00000204814	ENST00000377548	r.?	-	-	intronic	17	0	0	17	7	41.2	27	4	14.8	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.340909091	2.340909091	1	0.766839378	0.766839378	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.45E-12	1	0.00001	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	45710658	G	T	-	-	-	-	-	-	12	0	0	19	2	10.5	15	4	26.7	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.596590909	0.596590909	1	1.383419689	1.383419689	1	2.259259259	2.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.004039874	1	0.000000816	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	66278856	G	A	-	-	-	-	-	-	60	0	0	77	8	10.4	80	7	8.8	83	1	1.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.590909091	0.590909091	1	0.455958549	0.455958549	1	0.222222222	0.222222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	6.05E-09	1	0.00000018	1	0.340346757	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	66293846	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	38	7	18.4	33	11	33.3	29	3	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.045454545	1.045454545	1	1.725388601	1.725388601	1	1.907407407	1.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-10	1	8.54E-18	1	0.000414371	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	66584859	A	G	-	-	-	-	-	-	29	0	0	35	7	20	30	9	30	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	1.554404145	1.554404145	1	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.65E-10	1	2.54E-14	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	69919039	A	C	-	-	-	-	-	-	9	0	0	15	0	0	18	3	16.7	13	1	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.865284974	0.865284974	1	1.425925926	1.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1	1	0.0000964	1	0.063085307	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	70624930	T	G	-	-	-	-	-	-	7	0	0	14	0	0	6	0	0	15	3	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	3.703703704	3.703703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000544	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	72706276	A	G	MAMDC2	CCDS6631.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	32	6	18.8	37	11	29.7	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.068181818	1.068181818	1	1.538860104	1.538860104	1	0.555555556	0.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.27E-08	1	3.7E-17	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	73291699	G	A	TRPM3	CCDS43835.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	34	5	14.7	28	4	14.3	31	2	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.835227273	0.835227273	1	0.740932642	0.740932642	1	1.203703704	1.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000771	1	0.0000116	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	74871972	C	T	GDA	CCDS6641.1	r.?	-	-	downstream	25	0	0	27	4	14.8	35	12	34.3	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.840909091	0.840909091	1	1.777202073	1.777202073	1	1.351851852	1.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	0.00001	1	1.83E-19	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	75056496	T	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	27	9	33.3	39	7	17.9	25	1	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.892045455	1.892045455	1	0.92746114	0.92746114	1	0.740740741	0.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.44E-15	1	1.04E-09	1	0.117779757	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	75137441	A	T	TMC1	CCDS6643.1	r.?	-	-	intronic	15	0	0	20	4	20	19	5	26.3	41	3	7.3	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	1.362694301	1.362694301	1	1.351851852	1.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000284	1	3.43E-08	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	75345769	G	A	TMC1	CCDS6643.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	34	5	14.7	27	5	18.5	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.835227273	0.835227273	1	0.958549223	0.958549223	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000771	1	0.00000023	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	76269972	C	T	-	-	-	-	-	-	10	0	0	17	3	17.6	22	4	18.2	40	6	15	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	0.943005181	0.943005181	1	2.777777778	2.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000807	1	0.00000425	1	5.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	76678129	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	46	9	19.6	39	7	17.9	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.113636364	1.113636364	1	0.92746114	0.92746114	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.82E-12	1	1.04E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	76922309	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	37	5	13.5	37	7	18.9	38	7	18.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.767045455	0.767045455	1	0.979274611	0.979274611	1	3.407407407	3.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000119	1	7.05E-10	1	8.61E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	77960222	C	T	-	-	-	-	-	-	48	0	0	37	9	24.3	39	7	17.9	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.380681818	1.380681818	1	0.92746114	0.92746114	1	0.555555556	0.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.14E-13	1	1.04E-09	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	77977629	G	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	36	3	8.3	30	8	26.7	27	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.471590909	0.471590909	1	1.383419689	1.383419689	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000788827	1	2.07E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	78294070	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	52	6	11.5	31	10	32.3	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.653409091	0.653409091	1	1.67357513	1.67357513	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000261	1	3.94E-16	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	79207590	T	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	31	9	29	34	7	20.6	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.647727273	1.647727273	1	1.067357513	1.067357513	1	1.351851852	1.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.57E-14	1	3.73E-10	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	81210213	A	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	29	3	10.3	33	5	15.2	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.585227273	0.585227273	1	0.787564767	0.787564767	1	1.814814815	1.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000414371	1	0.00000066	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	81862999	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	27	8	29.6	43	10	23.3	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.681818182	1.681818182	1	1.207253886	1.207253886	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.97E-13	1	1.61E-14	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	81931748	G	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	47	12	25.5	48	12	25	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.448863636	1.448863636	1	1.295336788	1.295336788	1	1.296296296	1.296296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.09E-17	1	1.44E-17	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	83945486	T	C	-	-	-	-	-	-	36	0	0	34	5	14.7	50	6	12	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.835227273	0.835227273	1	0.621761658	0.621761658	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000771	1	0.000000206	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	84704798	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	30	7	23.3	30	6	20	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.323863636	1.323863636	1	1.03626943	1.03626943	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.44E-10	1	8.37E-09	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	85083076	C	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	21	6	28.6	26	4	15.4	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.625	1.625	1	0.797927461	0.797927461	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.95E-10	1	0.00000856	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	85394630	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	47	5	10.6	33	6	18.2	51	6	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.602272727	0.602272727	1	0.943005181	0.943005181	1	2.185185185	2.185185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000402	1	1.54E-08	1	0.000000232	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	87176752	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	42	4	9.5	44	6	13.6	48	4	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.539772727	0.539772727	1	0.704663212	0.704663212	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000601	1	9.37E-08	1	0.000102016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	87900370	G	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	33	9	27.3	29	3	10.3	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.551136364	1.551136364	1	0.533678756	0.533678756	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.76E-14	1	0.000414371	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	88248424	C	A	AGTPBP1	CCDS6672.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	41	9	22	33	7	21.2	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.25	1.25	1	1.098445596	1.098445596	1	1.388888889	1.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-13	1	2.98E-10	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	88341369	G	A	AGTPBP1	CCDS6672.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	33	8	24.2	43	11	25.6	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.375	1.375	1	1.32642487	1.32642487	1	0.592592593	0.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-12	1	2.42E-16	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	89248352	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	32	6	18.8	33	4	12.1	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.068181818	1.068181818	1	0.626943005	0.626943005	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.27E-08	1	0.0000228	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	89399169	C	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	36	1	2.8	32	4	12.5	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.159090909	0.159090909	1	0.647668394	0.647668394	1	2.148148148	2.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.165106833	1	0.0000201	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	90156096	G	A	DAPK1	CCDS43842.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	34	2	5.9	36	6	16.7	28	2	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.335227273	0.335227273	1	0.865284974	0.865284974	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.012612579	1	2.68E-08	1	0.008668191	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	90368409	G	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	33	8	24.2	31	10	32.3	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.375	1.375	1	1.67357513	1.67357513	1	1.148148148	1.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-12	1	3.94E-16	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	90625220	G	A	-	-	-	-	-	-	17	0	0	27	5	18.5	46	7	15.2	30	1	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.051136364	1.051136364	1	0.787564767	0.787564767	1	0.611111111	0.611111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000023	1	3.53E-09	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	93088862	G	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	33	7	21.2	31	6	19.4	40	4	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.204545455	1.204545455	1	1.005181347	1.005181347	1	1.851851852	1.851851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.98E-10	1	1.03E-08	1	0.0000495	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	93506418	G	A	-	-	-	-	-	-	11	0	0	22	7	31.8	21	6	28.6	34	1	2.9	65	0	0	41	4	9.8	38	10	26.3	48	4	8.3	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.806818182	1.806818182	1	1.481865285	1.481865285	1	0.537037037	0.537037037	1	0.556818182	0.556818182	1	1.362694301	1.362694301	1	1.537037037	1.537037037	1	5	5	1	1	1.25E-11	0.0000546	7.95E-10	4.06E-15	0.156694864	0.000102016	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	9	93962662	A	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	36	6	16.7	39	10	25.6	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	1.32642487	1.32642487	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.68E-08	1	5.44E-15	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	94012109	T	C	AUH	CCDS6689.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	22	2	9.1	22	6	27.3	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.517045455	0.517045455	1	1.414507772	1.414507772	1	0.888888889	0.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.005403392	1	1.09E-09	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	94403357	A	G	ROR2	ENST00000375715	r.?	-	-	intronic	26	0	0	32	6	18.8	41	5	12.2	31	2	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.068181818	1.068181818	1	0.632124352	0.632124352	1	1.203703704	1.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.27E-08	1	0.00000202	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	94576883	T	C	ROR2	CCDS6691.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	20	3	15	12	3	25	39	1	2.6	3	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852272727	0.852272727	1	1.295336788	1.295336788	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0001337	1	0.0000266	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	95786493	A	G	FGD3	CCDS43849.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	22	4	18.2	15	4	26.7	31	2	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	1.383419689	1.383419689	1	1.203703704	1.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000425	1	0.000000816	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	96518712	A	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	36	9	25	38	4	10.5	19	1	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	0.544041451	0.544041451	1	0.981481481	0.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.63E-13	1	0.0000403	1	0.090843738	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	96874986	G	C	PTPDC1	CCDS6707.1	r.?	-	-	downstream	30	0	0	35	1	2.9	44	8	18.2	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.164772727	0.164772727	1	0.943005181	0.943005181	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.16091139	1	5.9E-11	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	97526505	G	A	MIR24-1	CCDS6713.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	24	4	16.7	24	3	12.5	36	4	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	0.647668394	0.647668394	1	2.055555556	2.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000613	1	0.000233853	1	0.0000324	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	98066734	T	A	FANCC	CCDS35071.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	31	8	25.8	30	4	13.3	28	1	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.465909091	1.465909091	1	0.689119171	0.689119171	1	0.666666667	0.666666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.78E-12	1	0.0000154	1	0.130947004	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	99195329	T	C	-	-	-	-	-	-	27	0	0	40	10	25	39	9	23.1	25	2	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	1.196891192	1.196891192	1	1.481481481	1.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.22E-15	1	3.62E-13	1	0.006948068	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	100966222	G	A	TBC1D2	CCDS35080.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	31	5	16.1	38	6	15.8	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.914772727	0.914772727	1	0.81865285	0.81865285	1	0.555555556	0.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000476	1	3.76E-08	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	101378449	C	T	GABBR2	CCDS6736.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	25	10	40	32	8	25	35	3	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.272727273	2.272727273	1	1.295336788	1.295336788	1	1.592592593	1.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.98E-17	1	3.69E-12	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	103843621	C	T	ENSG00000148123	CCDS6751.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	42	9	21.4	34	6	17.6	29	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.215909091	1.215909091	1	0.911917098	0.911917098	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.51E-13	1	1.86E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	104005269	C	T	ENSG00000148123	CCDS6751.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	45	9	20	39	5	12.8	50	4	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	0.663212435	0.663212435	1	1.481481481	1.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-12	1	0.00000156	1	0.000119787	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	104823567	C	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	28	4	14.3	26	3	11.5	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	0.595854922	0.595854922	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000116	1	0.000298167	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	104823568	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	28	4	14.3	26	3	11.5	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	0.595854922	0.595854922	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000116	1	0.000298167	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	105125352	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	39	10	25.6	31	8	25.8	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.454545455	1.454545455	1	1.336787565	1.336787565	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.44E-15	1	2.78E-12	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	105540252	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	34	6	17.6	39	10	25.6	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1.32642487	1.32642487	1	1.388888889	1.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.86E-08	1	5.44E-15	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	105976354	C	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	28	4	14.3	41	8	19.5	25	2	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.010362694	1.010362694	1	1.481481481	1.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000116	1	3.22E-11	1	0.006948068	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	106912824	A	C	-	-	-	-	-	-	16	0	0	29	6	20.7	26	7	26.9	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.176136364	1.176136364	1	1.393782383	1.393782383	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.72E-09	1	4.73E-11	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	107346978	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	35	9	25.7	54	14	25.9	35	3	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	3	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.460227273	1.460227273	1	1.341968912	1.341968912	1	1.592592593	1.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	1.23E-13	1	1.64E-20	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	107473521	C	T	-	-	-	-	-	-	16	0	0	25	4	16	29	4	13.8	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.909090909	0.909090909	1	0.715025907	0.715025907	1	0.944444444	0.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000727	1	0.0000134	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	107585624	C	T	ABCA1	CCDS6762.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	28	0	0	36	5	13.9	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.720207254	0.720207254	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000104	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	107775335	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	26	5	19.2	28	4	14.3	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.090909091	1.090909091	1	0.740932642	0.740932642	1	1.62962963	1.62962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000188	1	0.0000116	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	108529853	A	C	TMEM38B	CCDS6768.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	43	9	20.9	45	10	22.2	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.1875	1.1875	1	1.150259067	1.150259067	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.45E-13	1	2.66E-14	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	109388932	G	A	-	-	-	-	-	-	20	0	0	30	4	13.3	26	6	23.1	26	1	3.8	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.755681818	0.755681818	1	1.196891192	1.196891192	1	0.703703704	0.703703704	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000154	1	3.3E-09	1	0.122190858	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	110748234	A	C	-	-	-	-	-	-	28	0	0	32	7	21.9	34	8	23.5	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.244318182	1.244318182	1	1.21761658	1.21761658	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.36E-10	1	6.32E-12	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	111486355	T	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	28	6	21.4	36	8	22.2	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.215909091	1.215909091	1	1.150259067	1.150259067	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.36E-09	1	1.04E-11	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	113450524	C	A	MUSK	CCDS48005.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	38	8	21.1	40	6	15	39	1	2.6	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.198863636	1.198863636	1	0.777202073	0.777202073	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.67E-11	1	5.18E-08	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	113476008	T	G	MUSK	CCDS48005.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	38	0	0	37	6	16.2	45	0	0	101	0	0	202	1	0.5	181	15	8.3	220	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.839378238	0.839378238	1	0	0	1	0.028409091	0.028409091	1	0.430051813	0.430051813	1	0	0	1	2	2	1	1	1	0.636702583	3.18E-08	4.33E-14	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	9	113868699	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	39	5	12.8	19	4	21.1	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.727272727	0.727272727	1	1.093264249	1.093264249	1	0.592592593	0.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000156	1	0.00000228	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	116677241	C	T	ZNF618	CCDS48008.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	36	4	11.1	38	6	15.8	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.630681818	0.630681818	1	0.81865285	0.81865285	1	0.814814815	0.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000324	1	3.76E-08	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	117365710	C	A	-	-	-	-	-	-	13	0	0	22	2	9.1	23	6	26.1	21	2	9.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.517045455	0.517045455	1	1.352331606	1.352331606	1	1.759259259	1.759259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.005403392	1	1.47E-09	1	0.004928472	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	118465413	A	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	52	7	13.5	40	10	25	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.767045455	0.767045455	1	1.295336788	1.295336788	1	2.055555556	2.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.58E-09	1	7.22E-15	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	118583634	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	46	10	21.7	27	4	14.8	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.232954545	1.232954545	1	0.766839378	0.766839378	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.38E-14	1	0.00001	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	118956282	C	T	PAPPAS	CCDS6813.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	56	10	17.9	31	5	16.1	51	5	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.017045455	1.017045455	1	0.834196891	0.834196891	1	1.814814815	1.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.82E-13	1	0.000000476	1	0.00000606	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	120120400	G	A	ASTN2	CCDS48009.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	34	6	17.6	44	6	13.6	50	3	6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	0.704663212	0.704663212	1	1.111111111	1.111111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.86E-08	1	9.37E-08	1	0.002055544	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	120181599	C	T	ASTN2	CCDS48009.1	r.?	-	-	upstream	38	0	0	32	2	6.2	34	5	14.7	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.352272727	0.352272727	1	0.761658031	0.761658031	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.011224977	1	0.000000771	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	120501262	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	36	11	30.6	44	4	9.1	39	5	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.738636364	1.738636364	1	0.471502591	0.471502591	1	2.37037037	2.37037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.62E-17	1	0.0000723	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	120528859	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	34	7	20.6	37	7	18.9	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.170454545	1.170454545	1	0.979274611	0.979274611	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.73E-10	1	7.05E-10	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	121073782	T	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	49	11	22.4	37	12	32.4	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.272727273	1.272727273	1	1.678756477	1.678756477	1	0.388888889	0.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.19E-15	1	4.03E-19	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	121789878	T	C	-	-	-	-	-	-	15	0	0	32	8	25	32	8	25	35	5	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	1.295336788	1.295336788	1	2.648148148	2.648148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.69E-12	1	3.69E-12	1	0.000000895	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	121909882	T	C	-	-	-	-	-	-	27	0	0	44	6	13.6	38	5	13.2	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.772727273	0.772727273	1	0.683937824	0.683937824	1	0.777777778	0.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.37E-08	1	0.00000137	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	124680905	C	A	TTLL11	CCDS48012.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	31	3	9.7	32	6	18.8	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.551136364	0.551136364	1	0.974093264	0.974093264	1	0.944444444	0.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000505952	1	1.27E-08	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	125524899	G	C	SKA2L	ENST00000425592	r.777g>c	c.?	p.?	3'UTR variant	30	0	0	35	6	17.1	39	6	15.4	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.971590909	0.971590909	1	0.797927461	0.797927461	1	1.722222222	1.722222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-08	1	4.43E-08	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	126198233	C	T	DENND1A	CCDS35133.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	24	10	41.7	28	1	3.6	56	2	3.6	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.369318182	2.369318182	1	0.186528497	0.186528497	1	0.666666667	0.666666667	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.8E-17	1	0.130947004	1	0.032213353	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	130464827	A	C	C9orf117	CCDS43878.1	r.?	-	-	upstream	26	0	0	22	4	18.2	23	5	21.7	22	3	13.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	1.124352332	1.124352332	1	2.518518519	2.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000425	1	9.75E-08	1	0.000179267	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	133389573	C	T	-	-	-	-	-	-	15	0	0	19	4	21.1	16	2	12.5	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.198863636	1.198863636	1	0.647668394	0.647668394	1	1.62962963	1.62962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000228	1	0.002863359	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	136507025	G	T	DBH	CCDS6977.2	r.?	-	-	intronic	9	0	0	8	1	12.5	15	7	46.7	32	5	15.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	2.419689119	2.419689119	1	2.888888889	2.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.039306956	1	4.85E-13	1	0.000000562	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	137476508	T	C	-	-	-	-	-	-	26	0	0	39	9	23.1	32	5	15.6	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.3125	1.3125	1	0.808290155	0.808290155	1	1.740740741	1.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.62E-13	1	0.000000562	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	9	140084406	C	G	SSNA1	CCDS7034.1	r.480c>g	c.?	p.?	3'UTR variant	19	0	0	16	3	18.8	8	0	0	38	2	5.3	335	0	0	139	24	17.3	110	21	19.1	90	9	10	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.068181818	1.068181818	1	0	0	1	0.981481481	0.981481481	1	0.982954545	0.982954545	1	0.989637306	0.989637306	1	1.851851852	1.851851852	1	5	5	1	1	0.0000667	1.82E-29	1	5.87E-27	0.015598339	9.58E-10	YES	1_1	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	826782	C	T	-	-	-	-	-	-	15	0	0	15	4	26.7	8	3	37.5	24	2	8.3	739	4	0.5	434	135	31.1	317	112	35.3	199	16	8	TRUE	TRUE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.784045455	1.784045455	1	2.318005181	2.318005181	1	1.620037037	1.620037037	1	2.078045455	1.039022727	2	2.182015544	1.091007772	2	1.561481481	0.780740741	2	5	5	1	0.505166579	0.000000816	1.52E-196	0.00000687	8.45E-171	0.006413403	1E-14	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	882876	G	A	LARP4B	CCDS31131.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	44	2	4.5	41	2	4.9	29	4	13.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.300681818	0.300681818	1	0.30288601	0.30288601	1	2.693555556	1.346777778	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.020580492	1	0.018015855	1	0.0000134	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	1013350	C	T	ENSG00000205740	ENST00000381466	r.?	-	-	downstream	16	0	0	21	1	4.8	32	6	18.8	49	3	6.1	0	0	NA	0	0	NA	2	2	100	1	0	0	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.320727273	0.320727273	1	1.162093264	1.162093264	1	1.19062963	1.19062963	1	NA	NA	1	6.18134715	3.090673575	2	0	0	1	5	NA	1	1	0.099912572	1	1.27E-08	0.000025	0.001939399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	1383393	C	A	ADARB2	CCDS7058.1	r.?	-	-	intronic	9	0	0	16	1	6.2	12	3	25	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.414272727	0.414272727	1	1.545336788	1.545336788	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.077068876	1	0.0000266	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	1831941	G	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	30	6	20	37	1	2.7	37	0	0	349	0	0	283	27	9.5	221	11	5	203	1	0.5	TRUE	TRUE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.336363636	1.336363636	1	0.166896373	0.166896373	1	0	0	1	0.634772727	0.634772727	1	0.309067358	0.309067358	1	0.097592593	0.097592593	1	4	3	1	1	8.37E-09	8.71E-26	0.169281299	2.23E-08	1	0.63851907	YES	1_1	0_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	5319068	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	31	4	12.9	42	11	26.2	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.861954545	0.861954545	1	1.619512953	1.619512953	1	0.975925926	0.975925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000177	1	1.81E-16	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	6498147	C	A	PRKCQ	CCDS7079.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	42	10	23.8	43	6	14	37	4	10.8	0	0	NA	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.590272727	1.590272727	1	0.865388601	0.865388601	1	2.108	2.108	1	NA	NA	1	6.18134715	6.18134715	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.24E-14	1	8.13E-08	0.005	0.0000362	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	6613354	A	G	PRKCQ	CCDS7079.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	49	7	14.3	36	2	5.6	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.9555	0.9555	1	0.34615544	0.34615544	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	5.58E-09	1	0.014070883	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	6648161	C	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	42	5	11.9	36	0	0	53	0	0	159	0	0	256	28	10.9	219	11	5	246	1	0.4	TRUE	TRUE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.795136364	0.795136364	1	0	0	1	0	0	1	0.728318182	0.728318182	1	0.309067358	0.309067358	1	0.078074074	0.078074074	1	4	3	1	1	0.00000228	2.36E-28	1	2.03E-08	1	0.70860784	YES	1_1	0_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	7189699	C	G	-	-	-	-	-	-	11	0	0	17	0	0	20	4	20	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.23626943	1.23626943	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1	1	0.00000284	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	7214559	G	A	SFMBT2	CCDS31138.1	r.2140c>u	c.2049C>T	p.S683S	silent	9	0	0	27	5	18.5	26	5	19.2	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.236136364	1.236136364	1	1.186818653	1.186818653	1	0.468444444	0.468444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000023	1	0.000000188	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	7621206	G	A	ITIH5	CCDS31139.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	45	9	20	35	6	17.1	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.336363636	1.336363636	1	1.057010363	1.057010363	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-12	1	2.24E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	7664061	C	A	ITIH5	CCDS31139.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	47	6	12.8	33	6	18.2	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.855272727	0.855272727	1	1.125005181	1.125005181	1	0.546518519	0.546518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000141	1	1.54E-08	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	7700742	C	T	ITIH5	CCDS31139.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	52	8	15.4	39	4	10.3	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.029	1.029	1	0.636678756	0.636678756	1	1.659074074	1.659074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.42E-10	1	0.0000447	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	9636983	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	28	7	25	33	7	21.2	51	7	13.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.670454545	1.670454545	1	1.310445596	1.310445596	1	2.674037037	1.337018519	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.44E-11	1	2.98E-10	1	7.46E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	10160596	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	39	3	7.7	38	7	18.4	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.5145	0.5145	1	1.137367876	1.137367876	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000998458	1	8.61E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	10223686	T	C	-	-	-	-	-	-	28	0	0	50	8	16	51	8	15.7	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.069090909	1.069090909	1	0.970471503	0.970471503	1	0.605074074	0.605074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.74E-10	1	2.05E-10	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	10389208	G	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	34	0	0	34	0	0	48	4	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	1.620037037	1.620037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.000102016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	10763473	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	41	9	22	50	17	34	31	4	12.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.47	1.47	1	2.101658031	1.050829016	2	2.517888889	2.517888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-13	1	6.43E-27	1	0.0000177	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	11129479	G	A	CELF2	CCDS44354.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	48	8	16.7	47	9	19.1	39	5	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.115863636	1.115863636	1	1.180637306	1.180637306	1	2.49837037	1.249185185	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.23E-10	1	2.24E-12	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	11159468	C	T	CELF2	CCDS44354.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	55	8	14.5	52	10	19.2	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.968863636	0.968863636	1	1.186818653	1.186818653	1	0.39037037	0.39037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.86E-10	1	1.28E-13	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	13146635	G	A	OPTN	CCDS7094.1	r.?	-	-	intronic	11	0	0	32	3	9.4	29	5	17.2	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.628090909	0.628090909	1	1.06319171	1.06319171	1	0.585555556	0.585555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000556213	1	0.000000336	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	13469284	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	35	6	17.1	44	8	18.2	30	1	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.142590909	1.142590909	1	1.125005181	1.125005181	1	0.644111111	0.644111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-08	1	5.9E-11	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	14729454	T	A	FAM107B	CCDS7102.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	38	2	5.3	34	7	20.6	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.354136364	0.354136364	1	1.273357513	1.273357513	1	2.049444444	2.049444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	0.015598339	1	3.73E-10	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	15327333	C	T	FAM171A1	CCDS31154.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	51	3	5.9	37	10	27	34	1	2.9	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.394227273	0.394227273	1	1.668963731	1.668963731	1	0.566037037	0.566037037	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.002175924	1	3.01E-15	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	15513804	G	A	-	-	-	-	-	-	20	0	0	30	11	36.7	27	14	51.9	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.452227273	1.226113636	2	3.208119171	1.604059585	2	1.71762963	1.71762963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.44E-18	1	1.15E-25	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	15955350	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	46	10	21.7	51	10	19.6	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.449954545	1.449954545	1	1.211544041	1.211544041	1	1.151592593	1.151592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.38E-14	1	1.04E-13	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	16208669	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	38	6	15.8	45	9	20	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.055727273	1.055727273	1	1.23626943	1.23626943	1	0.878333333	0.878333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.76E-08	1	1.47E-12	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	16977228	C	A	CUBN	CCDS7113.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	40	6	15	44	4	9.1	53	4	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.002272727	1.002272727	1	0.562502591	0.562502591	1	1.463888889	1.463888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.18E-08	1	0.0000723	1	0.000150502	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	17128245	G	A	CUBN	CCDS7113.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	34	13	38.2	41	8	19.5	46	8	17.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.552454545	1.276227273	2	1.205362694	1.205362694	1	3.396222222	1.698111111	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.03E-21	1	3.22E-11	1	8.61E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	18531346	C	T	CACNB2	CCDS7127.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	47	1	2.1	39	7	17.9	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.140318182	0.140318182	1	1.10646114	1.10646114	1	0.507481481	0.507481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.209895027	1	1.04E-09	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	18772159	A	T	CACNB2	CCDS7128.1	r.?	-	-	intronic	17	0	0	19	0	0	30	0	0	21	3	14.3	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.791148148	2.791148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.000155401	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	19445254	C	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	36	4	11.1	54	11	20.4	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.741681818	0.741681818	1	1.260994819	1.260994819	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000324	1	3.84E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	19576989	C	A	C10orf112	ENST00000377266	r.?	-	-	intronic	23	0	0	38	7	18.4	42	7	16.7	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.229454545	1.229454545	1	1.032284974	1.032284974	1	1.385814815	1.385814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-10	1	1.81E-09	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	20917465	T	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	44	4	9.1	59	2	3.4	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.608045455	0.608045455	1	0.210165803	0.210165803	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.0000723	1	0.035441897	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	22705368	G	A	SPAG6	CCDS7139.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	50	5	10	51	8	15.7	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.668181818	0.668181818	1	0.970471503	0.970471503	1	1.151592593	1.151592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000549	1	2.05E-10	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	23054400	G	A	-	-	-	-	-	-	17	0	0	39	5	12.8	42	5	11.9	48	3	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.855272727	0.855272727	1	0.735580311	0.735580311	1	1.210148148	1.210148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000156	1	0.00000228	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	23219866	T	C	ARMC3	CCDS7142.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	32	5	15.6	23	4	17.4	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.042363636	1.042363636	1	1.075554404	1.075554404	1	0.605074074	0.605074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000562	1	0.00000513	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	23902891	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	41	5	12.2	42	8	19	26	2	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.815181818	0.815181818	1	1.174455959	1.174455959	1	1.502925926	1.502925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000202	1	3.96E-11	1	0.007502227	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	25093949	C	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	48	4	8.3	38	0	0	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.554590909	0.554590909	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000102016	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	25257501	T	C	-	-	-	-	-	-	25	0	0	41	5	12.2	52	9	17.3	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.815181818	0.815181818	1	1.069373057	1.069373057	1	1.620037037	1.620037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000202	1	5.92E-12	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	25912451	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	45	8	17.8	51	3	5.9	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.189363636	1.189363636	1	0.364699482	0.364699482	1	1.912814815	1.912814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.14E-11	1	0.002175924	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	26502746	G	A	GAD2	CCDS7149.1	r.?	-	-	upstream	24	0	0	33	5	15.2	39	5	12.8	55	4	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.015636364	1.015636364	1	0.791212435	0.791212435	1	1.424851852	1.424851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000066	1	0.00000156	1	0.000173903	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	26849392	G	A	APBB1IP	CCDS31167.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	50	0	0	46	0	0	34	5	14.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.869222222	1.434611111	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000771	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	27554351	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	35	1	2.9	50	3	6	36	7	19.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.193772727	0.193772727	1	0.370880829	0.370880829	1	3.786592593	1.893296296	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.16091139	1	0.002055544	1	5.74E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	31459747	C	G	-	-	-	-	-	-	24	0	0	38	4	10.5	53	5	9.4	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.701590909	0.701590909	1	0.581046632	0.581046632	1	1.541962963	1.541962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000403	1	0.00000734	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	31566100	A	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	53	7	13.2	53	10	18.9	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.882	0.882	1	1.168274611	1.168274611	1	0.839296296	0.839296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.85E-09	1	1.57E-13	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	31749037	G	T	ZEB1	CCDS44370.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	44	9	20.5	29	8	27.6	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.369772727	1.369772727	1	1.706051813	1.706051813	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.18E-12	1	1.53E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	31991754	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	46	5	10.9	43	5	11.6	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.728318182	0.728318182	1	0.717036269	0.717036269	1	0.448925926	0.448925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000361	1	0.00000257	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	31991989	C	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	41	4	9.8	45	1	2.2	49	3	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.654818182	0.654818182	1	0.135989637	0.135989637	1	1.19062963	1.19062963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000546	1	0.201934322	1	0.001939399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	31993824	G	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	43	7	16.3	47	6	12.8	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.089136364	1.089136364	1	0.791212435	0.791212435	1	0.91737037	0.91737037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.15E-09	1	0.000000141	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	32662666	T	C	EPC1	ENST00000375110	r.?	-	-	intronic	39	0	0	77	8	10.4	62	7	11.3	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.694909091	0.694909091	1	0.698492228	0.698492228	1	0.487962963	0.487962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.05E-09	1	3.02E-08	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	33201967	C	A	ITGB1	CCDS31178.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	39	11	28.2	55	18	32.7	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.884272727	0.942136364	2	2.021300518	1.010650259	2	1.112555556	1.112555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.2E-17	1	4.61E-28	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	34082745	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	32	5	15.6	55	11	20	52	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.042363636	1.042363636	1	1.23626943	1.23626943	1	0.741703704	0.741703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000562	1	4.77E-15	1	0.028101652	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	34084650	A	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	32	2	6.2	41	7	17.1	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.414272727	0.414272727	1	1.057010363	1.057010363	1	1.834740741	1.834740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.011224977	1	1.51E-09	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	34428362	A	C	PARD3	CCDS7178.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	47	0	0	45	4	8.9	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.550139896	0.550139896	1	1.71762963	1.71762963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	3	NA	1	1	1	1	0.0000791	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	35279910	A	G	-	-	-	-	-	-	19	0	0	33	0	0	32	8	25	31	2	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.545336788	1.545336788	1	1.268703704	1.268703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	3.69E-12	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	35389878	C	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	49	5	10.2	31	1	3.2	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.681545455	0.681545455	1	0.197803109	0.197803109	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000496	1	0.143917729	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	35539552	G	A	CCNY	CCDS7190.1	r.312g>a	c.?	p.?	5'UTR variant	28	0	0	41	7	17.1	41	6	14.6	34	4	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.142590909	1.142590909	1	0.902476684	0.902476684	1	2.303185185	2.303185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.51E-09	1	6.05E-08	1	0.0000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	36281512	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	41	8	19.5	46	7	15.2	53	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.302954545	1.302954545	1	0.939564767	0.939564767	1	0.741703704	0.741703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.22E-11	1	3.53E-09	1	0.029108399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	36625889	T	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	48	9	18.8	44	8	18.2	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.256181818	1.256181818	1	1.125005181	1.125005181	1	1.268703704	1.268703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.75E-12	1	5.9E-11	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	37755400	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	43	22	51.2	30	12	40	24	2	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.421090909	1.710545455	2	2.47253886	1.23626943	2	1.620037037	1.620037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.27E-39	1	1.94E-20	1	0.006413403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	37844985	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	40	7	17.5	56	15	26.8	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.169318182	1.169318182	1	1.656601036	0.828300518	2	0.819777778	0.819777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-09	1	4.09E-22	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	38176854	A	G	-	-	-	-	-	-	25	0	0	37	5	13.5	49	10	20.4	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.902045455	0.902045455	1	1.260994819	1.260994819	1	0.585555556	0.585555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000119	1	6.72E-14	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	38202280	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	26	4	15.4	36	2	5.6	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.029	1.029	1	0.34615544	0.34615544	1	0.468444444	0.468444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000856	1	0.014070883	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	39073658	G	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	38	7	18.4	38	7	18.4	26	1	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.229454545	1.229454545	1	1.137367876	1.137367876	1	0.741703704	0.741703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-10	1	8.61E-10	1	0.122190858	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	42958796	G	T	CCNYL2	ENST00000345581	r.?	-	-	intronic	26	0	0	55	10	18.2	51	5	9.8	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.216090909	1.216090909	1	0.605772021	0.605772021	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.33E-13	1	0.00000606	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	44618751	G	C	-	-	-	-	-	-	26	0	0	38	4	10.5	36	4	11.1	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.701590909	0.701590909	1	0.686129534	0.686129534	1	0.487962963	0.487962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	0.0000403	1	0.0000324	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	45372709	C	T	-	-	-	-	-	-	12	0	0	31	9	29	25	5	20	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.937727273	0.968863636	2	1.23626943	1.23626943	1	0.975925926	0.975925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.57E-14	1	0.000000153	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	46138991	G	A	ANUBL1	CCDS7214.1	r.?	-	-	intronic	15	0	0	25	7	28	25	2	8	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3	3	3	2	2	2	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.870909091	1.870909091	1	0.494507772	0.494507772	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.47E-11	1	0.006948068	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	48576079	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	25	8	32	39	16	41	56	5	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	3	2	2	2	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.818181818	1.818181818	1	2.124352332	1.062176166	2	1.737148148	1.737148148	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.92E-13	1	5.16E-27	1	0.00000965	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	48656139	G	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	36	8	22.2	40	6	15	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	3	2	2	2	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	0.777202073	0.777202073	1	0.409888889	0.409888889	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-11	1	5.18E-08	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	50115795	G	C	WDFY4	CCDS44385.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	35	7	20	37	10	27	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	1.398963731	1.398963731	1	1.611111111	1.611111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.65E-10	1	3.01E-15	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	50327573	G	A	C10orf72	CCDS31198.1	r.?	-	-	upstream	33	0	0	42	10	23.8	43	13	30.2	42	6	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.352272727	1.352272727	1	1.564766839	1.564766839	1	2.648148148	1.324074074	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.24E-14	1	3.88E-20	1	7.02E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	53572191	G	A	PRKG1	CCDS7244.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	39	14	35.9	38	15	39.5	51	7	13.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.039772727	1.019886364	2	2.046632124	1.023316062	2	2.537037037	1.268518519	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.19E-23	1	4.24E-25	1	7.46E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	54354367	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	41	11	26.8	41	10	24.4	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.522727273	1.522727273	1	1.264248705	1.264248705	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.34E-16	1	9.51E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	56158960	T	A	PCDH15	CCDS44404.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	45	6	13.3	33	8	24.2	40	6	15	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.755681818	0.755681818	1	1.25388601	1.25388601	1	2.777777778	1.388888889	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000108	1	4.85E-12	1	5.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	56290983	C	T	PCDH15	CCDS44404.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	37	11	29.7	43	12	27.9	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.6875	0.84375	2	1.445595855	1.445595855	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.7E-17	1	3.24E-18	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	56435898	T	C	PCDH15	CCDS44404.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	51	2	3.9	44	7	15.9	43	6	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.221590909	0.221590909	1	0.823834197	0.823834197	1	2.592592593	1.296296296	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.027109304	1	2.55E-09	1	8.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	57297342	C	T	PCDH15	ENST00000373957	r.?	-	-	intronic	22	0	0	31	6	19.4	42	7	16.7	36	5	13.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.102272727	1.102272727	1	0.865284974	0.865284974	1	2.574074074	1.287037037	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.03E-08	1	1.81E-09	1	0.00000104	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	57846574	T	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	29	8	27.6	47	14	29.8	40	5	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.568181818	1.568181818	1	1.544041451	1.544041451	1	2.314814815	2.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.53E-12	1	1.79E-21	1	0.00000178	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	58424998	G	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	49	5	10.2	30	0	0	43	0	0	62	0	0	179	10	5.6	200	11	5.5	215	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.579545455	0.579545455	1	0	0	1	0	0	1	0.318181818	0.318181818	1	0.284974093	0.284974093	1	0	0	1	4	2	1	1	0.00000496	3.27E-08	1	7.97E-09	1	1	YES	1_1	0_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	58831284	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	32	3	9.4	46	9	19.6	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.534090909	0.534090909	1	1.015544041	1.015544041	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000556213	1	1.82E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	59065103	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	30	12	40	39	19	48.7	48	7	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.272727273	1.136363636	2	2.523316062	1.261658031	2	2.703703704	1.351851852	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.94E-20	1	1.2E-33	1	4.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	59189049	T	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	48	9	18.8	31	5	16.1	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.068181818	1.068181818	1	0.834196891	0.834196891	1	0.777777778	0.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.75E-12	1	0.000000476	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	61267228	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	61	22	36.1	43	12	27.9	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.051136364	1.025568182	2	1.445595855	1.445595855	1	1.722222222	1.722222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.38E-35	1	3.24E-18	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	61499112	T	C	SLC16A9	CCDS7256.1	r.?	-	-	upstream	26	0	0	33	10	30.3	27	8	29.6	34	5	14.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.721590909	0.860795455	2	1.533678756	1.533678756	1	2.722222222	1.361111111	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.14E-16	1	7.97E-13	1	0.000000771	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	62098067	C	A	ANK3	CCDS7258.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	36	0	0	42	4	9.5	58	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.492227979	0.492227979	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000601	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	62571473	C	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	114	66	57.9	233	200	85.8	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.289772727	1.644886364	2	4.445595855	2.222797927	2	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.02E-120	1	0	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	62571690	T	G	-	-	-	-	-	-	23	0	0	99	65	65.7	227	182	80.2	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.732954545	1.866477273	2	4.155440415	2.077720207	2	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.78E-124	1	0	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	63051029	G	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	115	0	0	213	0	0	91	20	22	144	0	0	1012	1	0.1	1676	2	0.1	542	103	19	TRUE	TRUE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	4.074074074	2.037037037	2	0.005681818	0.005681818	1	0.005181347	0.005181347	1	3.518518519	1.759259259	2	3	1	1	1	1	0.993734471	1	0.997883435	4.44E-27	1.42E-125	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	63052248	C	G	-	-	-	-	-	-	45	0	0	127	0	0	256	7	2.7	84	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.139896373	0.139896373	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.000348608	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	63052258	C	A	-	-	-	-	-	-	47	0	0	122	0	0	265	8	3	86	1	1.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.155440415	0.155440415	1	0.222222222	0.222222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.000068	1	0.350192164	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	63054476	C	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	147	0	0	219	7	3.2	82	0	0	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.165803109	0.165803109	1	0	0	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.000135162	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	63054597	C	G	-	-	-	-	-	-	22	0	0	136	0	0	267	9	3.4	91	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.176165803	0.176165803	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.0000102	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	63056492	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	129	0	0	245	9	3.7	71	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.191709845	0.191709845	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	NA	1	1	1	1	0.00000512	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	63072132	G	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	124	0	0	226	0	0	70	16	22.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	4.240740741	2.12037037	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	2.93E-22	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	63072165	C	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	123	0	0	213	0	0	67	17	25.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	4.703703704	2.351851852	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	2.03E-24	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	63073041	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	145	0	0	261	0	0	83	14	16.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	3.12962963	1.564814815	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	1.17E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	63073155	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	143	0	0	229	0	0	93	14	15.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.796296296	1.398148148	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	6.26E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	63073589	C	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	137	0	0	252	1	0.4	86	15	17.4	87	0	0	757	0	0	1165	1	0.1	521	74	14.2	TRUE	TRUE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.020725389	0.020725389	1	3.222222222	1.611111111	2	0	0	1	0.005181347	0.005181347	1	2.62962963	1.314814815	2	3	1	1	1	1	1	0.717241058	0.997090026	4.76E-19	8.41E-81	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	63073611	C	G	-	-	-	-	-	-	29	0	0	124	0	0	245	0	0	87	18	20.7	96	0	0	838	0	0	1277	2	0.2	569	82	14.4	TRUE	TRUE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	3.833333333	1.916666667	2	0	0	1	0.010362694	0.010362694	1	2.666666667	1.333333333	2	3	1	1	1	1	1	1	0.987688601	5.29E-24	7E-90	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	63073647	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	136	0	0	262	0	0	69	10	14.5	93	0	0	836	0	0	1331	1	0.1	629	95	15.1	TRUE	TRUE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.685185185	1.342592593	2	0	0	1	0.005181347	0.005181347	1	2.796296296	1.398148148	2	3	1	1	1	1	1	1	0.998733747	2.54E-12	7.24E-106	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	63073701	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	147	0	0	257	0	0	81	14	17.3	96	0	0	842	0	0	1335	0	0	637	103	16.2	TRUE	TRUE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	3.203703704	1.601851852	2	0	0	1	0	0	1	3	1.5	2	3	1	1	1	1	1	1	1	8.14E-18	7.63E-118	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	63074321	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	111	0	0	238	0	0	78	15	19.2	96	0	0	971	0	0	1424	3	0.2	639	108	16.9	TRUE	TRUE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	3.555555556	1.777777778	2	0	0	1	0.010362694	0.010362694	1	3.12962963	1.564814815	2	3	1	1	1	1	1	1	0.973194925	9.92E-20	1.12E-125	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	63074338	C	G	-	-	-	-	-	-	41	0	0	115	0	0	245	0	0	79	16	20.3	88	0	0	968	0	0	1460	2	0.1	625	97	15.5	TRUE	TRUE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	3.759259259	1.87962963	2	0	0	1	0.005181347	0.005181347	1	2.87037037	1.435185185	2	3	1	1	1	1	1	1	0.994470432	2.45E-21	2.91E-109	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	63074354	C	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	111	0	0	236	2	0.8	78	15	19.2	90	0	0	934	0	0	1453	2	0.1	623	100	16.1	TRUE	TRUE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.041450777	0.041450777	1	3.555555556	1.777777778	2	0	0	1	0.005181347	0.005181347	1	2.981481481	1.490740741	2	3	1	1	1	1	1	0.33029547	0.994297132	9.92E-20	3.96E-114	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	63074380	C	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	113	0	0	220	0	0	85	16	18.8	78	0	0	901	2	0.2	1394	3	0.2	615	92	15	TRUE	TRUE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	3.481481481	1.740740741	2	0.011363636	0.011363636	1	0.010362694	0.010362694	1	2.777777778	1.388888889	2	3	1	1	1	1	0.93958631	1	0.969969678	8.67E-21	3.52E-102	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	63111329	C	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	124	0	0	220	0	0	110	15	13.6	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.518518519	1.259259259	2	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	2.3E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	63112854	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	121	0	0	215	0	0	84	15	17.9	132	0	0	1136	3	0.3	1891	1	0.1	643	122	19	TRUE	TRUE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	3.314814815	1.657407407	2	0.017045455	0.017045455	1	0.005181347	0.005181347	1	3.518518519	1.759259259	2	3	1	1	1	1	0.922639443	1	0.999923538	3.27E-19	2.65E-148	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	63112933	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	145	0	0	236	0	0	73	14	19.2	167	0	0	1103	0	0	1922	2	0.1	698	120	17.2	TRUE	TRUE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	3.555555556	1.777777778	2	0	0	1	0.005181347	0.005181347	1	3.185185185	1.592592593	2	3	1	1	1	1	1	1	0.999302332	1.71E-18	2.22E-140	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	63125260	C	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	135	0	0	250	1	0.4	94	18	19.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.020725389	0.020725389	1	3.537037037	1.768518519	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.714392119	1	2.4E-23	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	63127565	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	168	0	0	292	0	0	74	12	16.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	3	1.5	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	4.02E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	63127915	T	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	141	0	0	247	0	0	63	9	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.648148148	1.324074074	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	3.62E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	63232861	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	148	0	0	256	0	0	81	16	19.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	3.666666667	1.833333333	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	3.77E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	63364227	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	161	108	67.1	264	224	84.8	98	66	67.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.8125	1.90625	2	4.393782383	2.196891192	2	12.46296296	6.231481481	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.17E-206	1	0	1	7.62E-127	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	64608334	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	41	7	17.1	36	7	19.4	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.971590909	0.971590909	1	1.005181347	1.005181347	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.51E-09	1	5.74E-10	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	65380912	T	C	REEP3	CCDS44411.1	r.1234u>c	c.?	p.?	3'UTR variant	23	0	0	40	7	17.5	26	6	23.1	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.994318182	0.994318182	1	1.196891192	1.196891192	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-09	1	3.3E-09	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	67026821	C	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	35	8	22.9	32	8	25	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.301136364	1.301136364	1	1.295336788	1.295336788	1	0.888888889	0.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.15E-12	1	3.69E-12	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	67424666	A	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	36	6	16.7	27	5	18.5	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	0.958549223	0.958549223	1	1.388888889	1.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.68E-08	1	0.00000023	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	67908523	G	A	CTNNA3	CCDS7269.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	43	5	11.6	55	7	12.7	48	3	6.2	0	0	NA	2	2	100	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.659090909	0.659090909	1	0.658031088	0.658031088	1	1.148148148	1.148148148	1	5.681818182	2.840909091	2	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000257	0.000025	1.28E-08	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	68354126	C	A	CTNNA3	CCDS7269.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	27	8	29.6	38	12	31.6	58	7	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.681818182	1.681818182	1	1.637305699	0.81865285	2	2.240740741	1.12037037	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.97E-13	1	5.86E-19	1	1.88E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	73009983	C	A	UNC5B	CCDS7309.1	r.?	-	-	intronic	17	0	0	11	1	9.1	15	7	46.7	37	5	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.517045455	0.517045455	1	2.419689119	1.20984456	2	2.5	1.25	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.05364542	1	4.85E-13	1	0.00000119	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	73243624	C	A	CDH23	CCDS44429.1	r.?	-	-	intronic	10	0	0	27	4	14.8	17	3	17.6	51	2	3.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.840909091	0.840909091	1	0.911917098	0.911917098	1	0.722222222	0.722222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00001	1	0.0000807	1	0.027109304	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	74852933	T	C	P4HA1	CCDS41537.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	31	12	38.7	43	14	32.6	32	4	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.198863636	1.099431818	2	1.689119171	0.844559585	2	2.314814815	2.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.16E-20	1	4.18E-22	1	0.0000201	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	78158171	C	A	C10orf11	CCDS7351.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	46	5	10.9	34	5	14.7	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.619318182	0.619318182	1	0.761658031	0.761658031	1	0.574074074	0.574074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000361	1	0.000000771	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	80301630	G	T	-	-	-	-	-	-	15	0	0	32	15	46.9	32	12	37.5	51	6	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.664772727	1.332386364	2	1.943005181	0.971502591	2	2.185185185	1.092592593	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.59E-26	1	5.03E-20	1	0.000000232	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	80481438	A	C	-	-	-	-	-	-	31	0	0	30	11	36.7	37	14	37.8	35	5	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.085227273	1.042613636	2	1.958549223	0.979274611	2	2.648148148	1.324074074	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.44E-18	1	3.35E-23	1	0.000000895	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	82883784	C	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	46	5	10.9	30	6	20	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.619318182	0.619318182	1	1.03626943	1.03626943	1	1.388888889	1.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000361	1	8.37E-09	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	85936180	T	G	C10orf99	CCDS7371.1	r.?	-	-	intronic	13	0	0	21	8	38.1	24	12	50	28	7	25	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.164772727	1.082386364	2	2.590673575	1.295336788	2	4.62962963	2.314814815	2	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.5E-14	1	6.25E-22	1	8.44E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	86308745	T	G	-	-	-	-	-	-	27	0	0	26	6	23.1	41	16	39	44	7	15.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.3125	1.3125	1	2.020725389	1.010362694	2	2.944444444	1.472222222	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.3E-09	1	1.4E-26	1	2.55E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	86502270	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	31	10	32.3	45	10	22.2	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.835227273	0.917613636	2	1.150259067	1.150259067	1	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.94E-16	1	2.66E-14	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	86947206	T	C	-	-	-	-	-	-	37	0	0	51	15	29.4	40	21	52.5	44	6	13.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.670454545	0.835227273	2	2.720207254	1.360103627	2	2.518518519	1.259259259	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.22E-23	1	5.72E-38	1	9.37E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	90594490	G	A	ANKRD22	CCDS7390.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	34	6	17.6	44	11	25	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1.295336788	1.295336788	1	0.944444444	0.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.86E-08	1	3.22E-16	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	90626004	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	35	3	8.6	29	5	17.2	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.488636364	0.488636364	1	0.89119171	0.89119171	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000725791	1	0.000000336	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	91260338	C	T	SLC16A12	CCDS7404.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	33	4	12.1	39	7	17.9	26	1	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.6875	0.6875	1	0.92746114	0.92746114	1	0.703703704	0.703703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000228	1	1.04E-09	1	0.122190858	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	92750679	G	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	35	8	22.9	31	11	35.5	41	2	4.9	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.301136364	1.301136364	1	1.839378238	0.919689119	2	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.15E-12	1	3.77E-18	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	93557416	T	C	TNKS2	CCDS7417.1	r.?	-	-	upstream	43	0	0	35	3	8.6	38	7	18.4	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.488636364	0.488636364	1	0.953367876	0.953367876	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000725791	1	8.61E-10	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	94146697	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	37	4	10.8	24	4	16.7	23	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.613636364	0.613636364	1	0.865284974	0.865284974	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000362	1	0.00000613	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	97644262	G	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	39	0	0	31	0	0	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	1.722222222	1.722222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	98244058	G	C	TLL2	CCDS7449.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	45	17	37.8	49	19	38.8	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.147727273	1.073863636	2	2.010362694	1.005181347	2	0.925925926	0.925925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.37E-28	1	3.12E-31	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	99500172	C	T	ZFYVE27	CCDS31262.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	35	4	11.4	43	14	32.6	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.647727273	0.647727273	1	1.689119171	0.844559585	2	0.944444444	0.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000289	1	4.18E-22	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	100343540	C	A	HPSE2	CCDS7477.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	44	6	13.6	47	11	23.4	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.772727273	0.772727273	1	1.212435233	1.212435233	1	0.833333333	0.833333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.37E-08	1	7.21E-16	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	100999041	C	T	HPSE2	CCDS7477.1	r.?	-	-	upstream	16	0	0	25	4	16	21	5	23.8	36	4	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.909090909	0.909090909	1	1.233160622	1.233160622	1	2.055555556	2.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000727	1	5.95E-08	1	0.0000324	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	101076020	C	T	-	-	-	-	-	-	14	0	0	15	1	6.7	4	0	0	36	5	13.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.380681818	0.380681818	1	0	0	1	2.574074074	1.287037037	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.072431031	1	1	1	0.00000104	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	102276361	G	A	SEC31B	CCDS7495.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	8	2	25	16	4	25	29	3	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	1.295336788	1.295336788	1	1.907407407	1.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000686131	1	0.00000108	1	0.000414371	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	102417701	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	34	5	14.7	43	9	20.9	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.835227273	0.835227273	1	1.082901554	1.082901554	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000771	1	9.45E-13	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	104869762	T	A	NT5C2	CCDS7544.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	40	5	12.5	40	3	7.5	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	0.388601036	0.388601036	1	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000178	1	0.001075403	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	106654590	G	A	SORCS3	CCDS7558.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	53	21	39.6	42	20	47.6	38	5	13.2	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.25	1.125	2	2.466321244	1.233160622	2	2.444444444	1.222222222	2	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.3E-34	1	4.41E-35	1	0.00000137	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	108974489	C	T	-	-	-	-	-	-	12	0	0	33	7	21.2	26	7	26.9	36	1	2.8	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.204545455	1.204545455	1	1.393782383	1.393782383	1	0.518518519	0.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.98E-10	1	4.73E-11	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	109122464	C	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	47	12	25.5	38	8	21.1	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.448863636	1.448863636	1	1.093264249	1.093264249	1	2.055555556	2.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.09E-17	1	1.67E-11	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	110212871	G	C	-	-	-	-	-	-	27	0	0	44	13	29.5	27	10	37	40	4	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.676136364	0.838068182	2	1.917098446	0.958549223	2	1.851851852	1.851851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.49E-20	1	7.62E-17	1	0.0000495	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	110257478	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	45	9	20	40	9	22.5	39	5	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	1.165803109	1.165803109	1	2.37037037	1.185185185	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-12	1	4.64E-13	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	111006623	T	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	42	16	38.1	50	22	44	40	5	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.164772727	1.082386364	2	2.279792746	1.139896373	2	2.314814815	2.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.25E-26	1	1.85E-37	1	0.00000178	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	111413457	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	47	10	21.3	45	7	15.6	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.210227273	1.210227273	1	0.808290155	0.808290155	1	0.833333333	0.833333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.27E-14	1	0.000000003	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	113728137	G	A	-	-	-	-	-	-	17	0	0	39	12	30.8	40	8	20	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.75	0.875	2	1.03626943	1.03626943	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.43E-19	1	2.61E-11	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	113990597	T	C	-	-	-	-	-	-	30	0	0	39	9	23.1	35	2	5.7	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.3125	1.3125	1	0.295336788	0.295336788	1	0.518518519	0.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.62E-13	1	0.013332991	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	115090763	G	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	26	12	46.2	25	12	48	19	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.625	1.3125	2	2.487046632	1.243523316	2	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.21E-21	1	1.2E-21	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	116083085	A	T	AFAP1L2	CCDS31287.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	32	6	18.8	35	7	20	42	1	2.4	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.068181818	1.068181818	1	1.03626943	1.03626943	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.27E-08	1	4.65E-10	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	122205342	C	T	-	-	-	-	-	-	20	0	0	26	5	19.2	19	1	5.3	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.090909091	1.090909091	1	0.274611399	0.274611399	1	2.148148148	2.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000188	1	0.090843738	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	122538029	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	42	7	16.7	45	8	17.8	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	0.922279793	0.922279793	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.81E-09	1	7.14E-11	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	122822069	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	327	0	0	603	15	2.5	85	0	0	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	FALSE	FALSE	15	26	2	13	23	2	2	3	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.729533679	0.729533679	1	0	NA	0	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.000000637	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	122837562	A	G	-	-	-	-	-	-	15	0	0	163	16	9.8	359	7	1.9	64	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	15	26	2	13	23	2	2	3	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.830818182	0.915409091	2	0.554445596	0.554445596	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.23E-16	1	0.002450064	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	122860333	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	218	10	4.6	480	5	1	66	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	15	26	2	13	23	2	2	3	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.859363636	0.859363636	1	0.291813472	0.291813472	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000000206	1	0.095365164	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	122914968	C	G	-	-	-	-	-	-	46	0	0	210	11	5.2	411	0	0	59	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	15	26	2	13	23	2	2	3	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.971454545	0.971454545	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.32E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	122914989	C	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	212	9	4.2	435	0	0	60	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	15	26	2	13	23	2	2	3	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.784636364	0.784636364	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000158	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	122917510	G	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	164	0	0	309	18	5.8	69	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	15	26	2	13	23	2	2	3	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.692518135	0.846259067	2	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	5.97E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	122919985	C	G	-	-	-	-	-	-	20	0	0	249	0	0	461	24	5.2	75	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	15	26	2	13	23	2	2	3	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.517430052	0.758715026	2	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	5.44E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	122920901	C	G	-	-	-	-	-	-	29	0	0	237	0	0	446	20	4.5	76	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	15	26	2	13	23	2	2	3	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.313160622	1.313160622	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	3.25E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	122921057	C	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	234	0	0	473	15	3.2	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	15	26	2	13	23	2	2	3	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.933803109	0.933803109	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	2.91E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	122921101	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	234	0	0	481	13	2.7	69	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	15	26	2	13	23	2	2	3	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.787896373	0.787896373	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.00000141	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	122921115	C	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	225	0	0	461	13	2.8	73	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	15	26	2	13	23	2	2	3	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.81707772	0.81707772	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.000000883	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	122972036	T	C	-	-	-	-	-	-	22	0	0	26	5	19.2	26	6	23.1	31	2	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	15	26	2	13	23	2	2	3	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.586909091	0.896727273	4	6.740891192	0.962984456	7	1.203703704	1.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000000188	1	3.3E-09	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	123123462	C	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	136	0	0	242	8	3.3	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	15	26	2	13	23	2	2	3	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.962984456	0.962984456	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.000036	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	123130189	G	A	-	-	-	-	-	-	18	0	0	83	55	66.3	139	112	80.6	56	19	33.9	2	0	0	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	TRUE	FALSE	15	26	2	13	23	2	2	3	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12.38604545	1.032170455	12	23.5201658	1.022615904	23	6.277777778	3.138888889	2	NA	NA	1	29.18134715	1.268754224	23	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.46E-105	1	7.53E-230	0.005	6.79E-30	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	123281927	C	T	FGFR2	CCDS44486.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	104	78	75	199	168	84.4	48	18	37.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	15	26	18	13	23	16	2	3	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14.01136364	1.077797203	13	24.62905699	1.070828565	23	12.94444444	0.995726496	13	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	6.56E-156	1	0	1	2.42E-29	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	123339822	C	G	FGFR2	CCDS44486.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	143	0	0	285	0	0	100	11	11	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	15	26	18	13	23	16	2	3	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	NA	0	0	0	1	3.797037037	0.949259259	4	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1	1	4.6E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	123353784	C	G	FGFR2	CCDS44486.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	172	0	0	283	7	2.5	114	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	15	26	18	13	23	16	2	3	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	NA	0	0.729533679	0.729533679	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.000631314	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	123366766	G	C	-	-	-	-	-	-	24	0	0	120	19	15.8	229	53	23.1	81	8	9.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	15	26	18	13	23	16	2	3	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.951727273	0.983909091	3	6.740891192	0.962984456	7	3.417333333	1.139111111	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	6.88E-23	1	1.86E-70	1	9.08E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	123468164	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	123	81	65.9	191	150	78.5	33	0	0	462	0	0	871	532	61.1	1240	1010	81.5	262	2	0.8	TRUE	TRUE	15	26	18	13	23	16	2	3	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12.31131818	1.025943182	12	22.90735751	0.995972066	23	0	0	1	11.41459091	1.037690083	11	23.78279793	1.034034692	23	0.276148148	0.276148148	1	5	5	1	1	5.01E-154	0	5.53E-304	0	1	0.376990019	YES	1_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	123468167	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	123	81	65.9	190	147	77.4	34	0	0	468	1	0.2	883	542	61.4	1259	1026	81.5	264	0	0	TRUE	TRUE	15	26	18	13	23	16	2	3	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12.31131818	1.025943182	12	22.58636269	0.982015769	23	0	0	1	11.47063636	1.042785124	11	23.78279793	1.034034692	23	0	0	1	5	5	1	0.904236108	5.01E-154	0	4.2E-296	0	1	1	YES	1_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	123468229	C	G	-	-	-	-	-	-	24	0	0	108	78	72.2	178	143	80.3	38	0	0	467	0	0	993	653	65.8	1574	1277	81.1	264	1	0.4	TRUE	FALSE	15	26	18	13	23	16	2	3	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13.48827273	1.037559441	13	23.43262176	1.018809642	23	0	0	1	12.29263636	1.024386364	12	23.66607254	1.028959676	23	0.138074074	NA	0	5	NA	1	1	1.26E-153	0	1.18E-292	0	1	0.733747731	YES	1_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	123468271	C	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	92	66	71.7	165	133	80.6	36	0	0	474	1	0.2	1102	752	68.2	1750	1438	82.2	269	1	0.4	TRUE	FALSE	15	26	18	13	23	16	2	3	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13.39486364	1.030374126	13	23.5201658	1.022615904	23	0	0	1	12.741	0.980076923	13	23.98706736	1.042915972	23	0.138074074	NA	0	5	NA	1	0.907073352	6.75E-130	0	1.09E-272	0	1	0.740337807	YES	1_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	123468292	C	G	-	-	-	-	-	-	20	0	0	79	53	67.1	147	118	80.3	45	0	0	464	1	0.2	1128	776	68.8	1781	1441	80.9	256	0	0	TRUE	FALSE	15	26	18	13	23	16	2	3	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12.5355	0.964269231	13	23.43262176	1.018809642	23	0	0	1	12.85309091	0.988699301	13	23.60770984	1.026422167	23	0	NA	0	5	NA	1	0.902296647	5.07E-102	0	1.09E-241	0	1	1	YES	1_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	123468308	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	78	56	71.8	145	116	80	49	0	0	468	1	0.2	1160	808	69.7	1839	1506	81.9	255	1	0.4	TRUE	FALSE	15	26	18	13	23	16	2	3	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13.41354545	1.031811189	13	23.34507772	1.015003379	23	0	0	1	13.02122727	1.001632867	13	23.89952332	1.039109709	23	0.138074074	NA	0	5	NA	1	0.904236108	1.76E-110	0	2.8E-237	0	1	0.721461271	YES	1_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	123468424	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	96	68	70.8	151	126	83.4	24	0	0	346	0	0	995	687	69	1548	1262	81.5	250	1	0.4	TRUE	FALSE	15	26	18	13	23	16	2	3	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13.22672727	1.017440559	13	24.33724352	1.058141023	23	0	0	1	12.89045455	0.991573427	13	23.78279793	1.034034692	23	0.138074074	NA	0	5	NA	1	1	3.87E-133	0	2.43E-262	0	1	0.714392119	YES	1_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	123468767	C	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	98	70	71.4	162	126	77.8	32	0	0	294	1	0.3	835	599	71.7	1370	1122	81.9	262	2	0.8	TRUE	FALSE	15	26	18	13	23	16	2	3	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13.33881818	1.026062937	13	22.70308808	0.987090786	23	0	0	1	13.39486364	1.030374126	13	23.89952332	1.039109709	23	0.276148148	NA	0	5	NA	1	0.770920757	1.9E-137	0	1.37E-254	0	1	0.376990019	YES	1_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	123468957	C	T	-	-	-	-	-	-	20	0	0	82	57	69.5	148	123	83.1	34	0	0	264	0	0	796	539	67.7	1219	994	81.5	262	0	0	TRUE	FALSE	15	26	18	13	23	16	2	3	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12.98386364	0.998758741	13	24.24969948	1.05433476	23	0	0	1	12.64759091	0.972891608	13	23.78279793	1.034034692	23	0	NA	0	5	NA	1	1	4.64E-111	0	1.13E-255	0	1	1	YES	1_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	123469227	C	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	123	82	66.7	235	188	80	42	0	0	155	0	0	672	470	69.9	1107	899	81.2	208	0	0	TRUE	TRUE	15	26	18	13	23	16	2	3	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12.46077273	1.038397727	12	23.34507772	1.015003379	23	0	0	1	13.05859091	1.004506993	13	23.69525389	1.03022843	23	0	0	1	5	5	1	1	1.29E-156	0	0	0	1	1	YES	1_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	123469260	C	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	118	81	68.6	230	187	81.3	38	0	0	194	0	0	843	587	69.6	1373	1111	80.9	239	0	0	TRUE	FALSE	15	26	18	13	23	16	2	3	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12.81572727	0.985825175	13	23.72443523	1.031497184	23	0	0	1	13.00254545	1.000195804	13	23.60770984	1.026422167	23	0	NA	0	5	NA	1	1	2.02E-156	0	0	0	1	1	YES	1_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	123469352	C	T	-	-	-	-	-	-	20	0	0	102	65	63.7	184	155	84.2	31	0	0	197	1	0.5	905	627	69.3	1556	1289	82.8	251	0	0	TRUE	FALSE	15	26	18	13	23	16	2	3	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11.90031818	0.991693182	12	24.5706943	1.068291057	23	0	0	1	12.9465	0.995884615	13	24.16215544	1.050528497	23	0	NA	0	5	NA	1	0.627482305	1.91E-122	0	9.88131291682493e-324	0	1	1	YES	1_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	123469596	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	118	78	66.1	275	229	83.3	52	1	1.9	4	0	0	26	15	57.7	41	37	90.2	7	0	0	TRUE	FALSE	15	26	18	13	23	16	2	3	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	12.34868182	1.029056818	12	24.30806218	1.056872269	23	0.655851852	0.655851852	1	10.77940909	0.979946281	11	26.32157513	1.14441631	23	0	NA	0	5	NA	1	1	1.38E-148	2.24E-28	0	7.23E-81	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	123469626	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	121	86	71.1	281	232	82.6	51	1	2	2	0	0	13	9	69.2	21	19	90.5	3	0	0	TRUE	FALSE	15	26	18	13	23	16	2	3	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	13.28277273	1.021751748	13	24.10379275	1.047990989	23	0.69037037	0.69037037	1	12.92781818	0.994447552	13	26.40911917	1.148222573	23	0	NA	0	5	NA	1	1	3.51E-168	1.37E-18	0	3.97E-42	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	123652249	C	T	ATE1	CCDS31299.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	141	0	0	239	0	0	83	13	15.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	15	26	18	13	23	16	2	3	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	NA	0	0	0	1	5.419407407	1.083881481	5	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1	1	4.66E-16	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	123654478	G	T	ATE1	CCDS31299.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	108	0	0	223	7	3.1	97	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	15	26	18	13	23	16	2	3	2	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	NA	0	0.904621762	0.904621762	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.000151059	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	123883539	G	A	TACC2	CCDS7626.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	31	7	22.6	19	3	15.8	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.265953368	5	2	2	4	0	0	1	1	0.734046632	1	NA	3	NA	NA	0	NA	NA	0.265953368	NA	1.284090909	1.284090909	1	0.860673482	0.860673482	1	1.958185185	1.958185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.85E-10	1	0.000114071	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	124986776	G	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	155	0	0	217	11	5.1	76	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.265953368	5	2	2	4	0	0	1	1	0.734046632	1	NA	3	NA	NA	0	NA	NA	0.265953368	NA	0	0	1	0.277812326	1.044590368	0.265953368	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	1.85E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	125000275	C	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	148	103	69.6	231	197	85.3	80	38	47.5	79	0	0	143	106	74.1	223	173	77.6	91	42	46.2	TRUE	TRUE	2	2.265953368	5	2	2	4	0	0	1	1	0.734046632	1	NA	3	NA	NA	0	NA	NA	0.265953368	NA	3.954545455	1.977272727	2	4.646547342	2.050592659	2.265953368	10.2212963	2.555324074	4	4.210227273	2.105113636	2	4.227105202	1.865486405	2.265953368	9.941555556	2.485388889	4	5	4	1	1	1.7E-199	2.51E-210	0	0	2.89E-65	2.83E-71	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	125000469	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	106	76	71.7	215	183	85.1	78	39	50	329	0	0	689	497	72.1	938	755	80.5	372	188	50.5	TRUE	TRUE	2	2.265953368	5	2	2	4	0	0	1	1	0.734046632	1	NA	3	NA	NA	0	NA	NA	0.265953368	NA	4.073863636	2.036931818	2	4.635652741	2.045784704	2.265953368	10.75925926	2.689814815	4	4.096590909	2.048295455	2	4.385076917	1.935201747	2.265953368	10.86685185	2.716712963	4	5	4	1	1	2.61E-149	0	0	0	4.09E-68	3.95252516672997e-323	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	125000511	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	124	82	66.1	209	174	83.3	70	39	55.7	197	0	0	420	305	72.6	647	526	81.3	271	133	49.1	TRUE	TRUE	2	2.265953368	5	2	2	4	0	0	1	1	0.734046632	1	NA	3	NA	NA	0	NA	NA	0.265953368	NA	3.755681818	1.877840909	2	4.537601332	2.002513113	2.265953368	11.98581481	2.996453704	4	4.125	2.0625	2	4.428655321	1.954433566	2.265953368	10.56559259	2.641398148	4	5	4	1	1	3.79E-156	0	0	0	1.12E-70	8.11E-227	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	125268286	C	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	93	0	0	135	7	5.2	64	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.265953368	5	2	2	4	0	0	1	1	0.734046632	1	NA	3	NA	NA	0	NA	NA	0.265953368	NA	0	0	1	0.283259627	1.065072532	0.265953368	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000619	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	125449474	C	A	GPR26	CCDS7636.1	r.2865c>a	c.?	p.?	3'UTR variant	32	0	0	99	0	0	252	7	2.8	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.265953368	5	2	2	4	0	0	1	1	0.734046632	1	NA	3	NA	NA	0	NA	NA	0.265953368	NA	0	0	1	0.152524415	0.573500594	0.265953368	0	0	1	NA	NA	0	0	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000317219	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	125559874	C	A	CPXM2	CCDS7637.1	r.?	-	-	intronic	32	1	3.1	115	4	3.5	213	12	5.6	57	2	3.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.265953368	5	2	2	4	0	0	1	1	0.734046632	1	NA	3	NA	NA	0	NA	NA	0.265953368	NA	0.198863636	0.198863636	1	0.305048829	1.147001188	0.265953368	0.753148148	0.753148148	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	0.14819814	1	0.002780947	1	1.28E-09	1	0.03327602	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	125594149	G	C	CPXM2	CCDS7637.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	123	0	0	199	11	5.5	76	0	0	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.265953368	5	2	2	4	0	0	1	1	0.734046632	1	NA	3	NA	NA	0	NA	NA	0.265953368	NA	0	0	1	0.299601528	1.126519024	0.265953368	0	0	1	NA	NA	0	0	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	7.56E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	125594643	G	T	CPXM2	CCDS7637.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	114	0	0	262	9	3.4	109	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.265953368	5	2	2	4	0	0	1	1	0.734046632	1	NA	3	NA	NA	0	NA	NA	0.265953368	NA	0	0	1	0.185208218	0.696393579	0.265953368	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000877	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	125597744	G	A	CPXM2	CCDS7637.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	146	0	0	238	9	3.8	88	1	1.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.265953368	5	2	2	4	0	0	1	1	0.734046632	1	NA	3	NA	NA	0	NA	NA	0.265953368	NA	0	0	1	0.20699742	0.778322235	0.265953368	0.236703704	0.236703704	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.00000405	1	0.356673997	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	125605234	G	A	CPXM2	CCDS7637.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	152	0	0	242	8	3.3	92	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.265953368	5	2	2	4	0	0	1	1	0.734046632	1	NA	3	NA	NA	0	NA	NA	0.265953368	NA	0	0	1	0.179760917	0.675911415	0.265953368	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000036	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	125606220	G	T	CPXM2	CCDS7637.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	112	0	0	231	11	4.8	73	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.265953368	5	2	2	4	0	0	1	1	0.734046632	1	NA	3	NA	NA	0	NA	NA	0.265953368	NA	0	0	1	0.261470425	0.983143876	0.265953368	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	3.51E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	125606862	G	T	CPXM2	CCDS7637.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	106	0	0	189	6	3.2	69	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.265953368	5	2	2	4	0	0	1	1	0.734046632	1	NA	3	NA	NA	0	NA	NA	0.265953368	NA	0	0	1	0.174313617	0.655429251	0.265953368	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000418831	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	126621558	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	102	0	0	167	7	4.2	74	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.265953368	5	2	2	4	0	0	1	1	0.734046632	1	NA	3	NA	NA	0	NA	NA	0.265953368	NA	0	0	1	0.228786622	0.860250891	0.265953368	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000246	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	126642841	C	T	ZRANB1	CCDS7642.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	90	2	2.2	163	7	4.3	66	0	0	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.265953368	5	2	2	4	0	0	1	1	0.734046632	1	NA	3	NA	NA	0	NA	NA	0.265953368	NA	0.125	0.125	1	0.234233922	0.880733055	0.265953368	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.075041956	1	0.0000211	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	126644374	C	G	ZRANB1	CCDS7642.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	142	1	0.7	229	10	4.4	71	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2.265953368	5	2	2	4	0	0	1	1	0.734046632	1	NA	3	NA	NA	0	NA	NA	0.265953368	NA	0.039772727	NA	0	0.239681223	0.901215219	0.265953368	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.509230612	1	0.000000324	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	126644425	C	T	ZRANB1	CCDS7642.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	149	0	0	218	9	4.1	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.265953368	5	2	2	4	0	0	1	1	0.734046632	1	NA	3	NA	NA	0	NA	NA	0.265953368	NA	0	0	1	0.223339321	0.839768727	0.265953368	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000198	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	129044961	C	T	DOCK1	ENST00000398025	r.?	-	-	intronic	30	0	0	116	93	80.2	238	208	87.4	85	39	45.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	NA	32	31	NA	30	26	NA	2	5	NA	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	30.74849741	1.024949914	30	21.811	0.991409091	22	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.02E-190	1	0	1	3.65E-66	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	129045490	C	T	DOCK1	ENST00000398025	r.?	-	-	intronic	18	0	0	135	102	75.6	271	232	85.6	86	42	48.8	468	1	0.2	488	180	36.9	629	328	52.1	356	76	21.3	FALSE	FALSE	NA	32	31	NA	30	26	NA	2	5	NA	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	30.11523316	1.003841105	30	23.18903704	1.008219002	23	NA	NA	1	18.32948187	1.018304548	18	10.12144444	1.012144444	10	NA	NA	1	0.904236108	5.4E-204	1.77E-277	0	0	1.19E-72	2.53E-97	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	129045518	C	T	DOCK1	ENST00000398025	r.?	-	-	intronic	22	0	0	118	89	75.4	267	233	87.3	81	37	45.7	436	0	0	424	103	24.3	515	191	37.1	369	49	13.3	FALSE	FALSE	NA	32	31	NA	30	26	NA	2	5	NA	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	30.71331606	1.023777202	30	21.71596296	0.987089226	22	NA	NA	1	13.05227979	1.004021523	13	6.319962963	1.05332716	6	NA	NA	1	1	4.49E-178	1.12E-137	0	7.07E-295	9.3E-63	1.31E-52	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	129045525	C	T	DOCK1	ENST00000398025	r.?	-	-	intronic	23	0	0	115	87	75.7	271	237	87.5	81	36	44.4	434	1	0.2	412	81	19.7	481	159	33.1	368	44	12	FALSE	FALSE	NA	32	31	NA	30	26	NA	2	5	NA	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	30.78367876	1.026122625	30	21.09822222	1.004677249	21	NA	NA	1	11.64502591	0.970418826	12	5.702222222	0.95037037	6	NA	NA	1	0.886442181	2.56E-174	1.93E-100	0	3.86E-236	1.52E-60	2.37E-45	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	129045530	C	T	DOCK1	ENST00000398025	r.?	-	-	intronic	20	0	0	114	85	74.6	262	227	86.6	79	31	39.2	436	2	0.5	406	68	16.7	468	140	29.9	355	36	10.1	FALSE	FALSE	NA	32	31	NA	30	26	NA	2	5	NA	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	30.46704663	1.015568221	30	18.62725926	0.980382066	19	NA	NA	1	10.5192228	0.956292982	11	4.79937037	0.959874074	5	NA	NA	1	0.641256654	2.29E-169	1.61E-79	0	5.78E-201	3.23E-50	8.46E-35	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	129045545	C	T	DOCK1	ENST00000398025	r.?	-	-	intronic	27	0	0	114	88	77.2	265	228	86	83	35	42.2	422	0	0	405	61	15.1	454	126	27.8	349	31	8.9	FALSE	FALSE	NA	32	31	NA	30	26	NA	2	5	NA	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	30.25595855	1.008531952	30	20.05281481	1.002640741	20	NA	NA	1	9.780414508	0.978041451	10	4.229148148	1.057287037	4	NA	NA	1	1	9.66E-178	1.52E-68	0	2.71E-176	7.09E-58	2.06E-28	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	129045586	C	T	DOCK1	ENST00000398025	r.?	-	-	intronic	30	0	0	112	80	71.4	237	203	85.7	81	33	40.7	343	0	0	365	46	12.6	409	84	20.5	329	32	9.7	FALSE	FALSE	NA	32	31	NA	30	26	NA	2	5	NA	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	30.15041451	1.005013817	30	19.34003704	1.017896686	19	NA	NA	1	7.212176166	1.030310881	7	4.609296296	0.921859259	5	NA	NA	1	1	7.4E-157	2.05E-48	0	7.87E-106	4.96E-54	1.56E-30	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	129045605	C	T	DOCK1	ENST00000398025	r.?	-	-	intronic	26	0	0	113	81	71.7	203	169	83.3	78	34	43.6	293	0	0	346	53	15.3	379	94	24.8	318	37	11.6	FALSE	FALSE	NA	32	31	NA	30	26	NA	2	5	NA	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	29.30606218	1.010553868	29	20.71807407	0.986574956	21	NA	NA	1	8.724974093	0.969441566	9	5.512148148	0.918691358	6	NA	NA	1	1	5.16E-159	3.43E-60	0	9.22E-127	6.78E-57	5.9E-38	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	129045606	C	T	DOCK1	ENST00000398025	r.?	-	-	intronic	24	0	0	113	81	71.7	207	172	83.1	78	34	43.6	289	0	0	346	53	15.3	381	96	25.2	317	39	12.3	FALSE	FALSE	NA	32	31	NA	30	26	NA	2	5	NA	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	29.23569948	1.008127568	29	20.71807407	0.986574956	21	NA	NA	1	8.865699482	0.98507772	9	5.844777778	0.97412963	6	NA	NA	1	1	5.16E-159	3.43E-60	0	3.66E-130	6.78E-57	6.96E-41	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	129045614	C	T	DOCK1	ENST00000398025	r.?	-	-	intronic	22	0	0	121	83	68.6	221	187	84.6	74	35	47.3	281	1	0.4	339	58	17.1	379	107	28.2	302	36	11.9	FALSE	FALSE	NA	32	31	NA	30	26	NA	2	5	NA	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	29.76341969	0.99211399	30	22.47625926	1.021648148	22	NA	NA	1	9.921139896	0.99211399	10	5.654703704	0.942450617	6	NA	NA	1	0.755496157	3.36E-160	1.18E-68	0	6.58E-151	3.78E-60	2.32E-37	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	130070770	G	C	-	-	-	-	-	-	21	0	0	47	16	34	31	8	25.8	59	3	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	8	2	2	5	0	0	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.931818182	0.965909091	2	1.336787565	1.336787565	1	1.250444444	1.250444444	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.98E-25	1	2.78E-12	1	0.003297476	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	130448018	C	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	31	4	12.9	17	3	17.6	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	8	2	2	5	0	0	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.732954545	0.732954545	1	0.911917098	0.911917098	1	1.078814815	1.078814815	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000177	1	0.0000807	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	130583506	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	35	7	20	42	9	21.4	45	0	0	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	8	2	2	5	0	0	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	1.10880829	1.10880829	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.65E-10	1	7.51E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	130634641	G	C	-	-	-	-	-	-	30	0	0	39	5	12.8	44	9	20.5	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	8	2	2	5	0	0	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.727272727	0.727272727	1	1.062176166	1.062176166	1	0.735555556	0.735555556	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000156	1	1.18E-12	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	130634835	G	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	40	10	25	47	10	21.3	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	8	2	2	5	0	0	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	1.103626943	1.103626943	1	1.176888889	1.176888889	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.22E-15	1	4.27E-14	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	130634951	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	31	6	19.4	35	7	20	33	1	3	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	8	2	2	5	0	0	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.102272727	1.102272727	1	1.03626943	1.03626943	1	0.735555556	0.735555556	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.03E-08	1	4.65E-10	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	130635080	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	50	5	10	36	7	19.4	56	1	1.8	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	8	2	2	5	0	0	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.568181818	0.568181818	1	1.005181347	1.005181347	1	0.441333333	0.441333333	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000549	1	5.74E-10	1	0.244746891	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	130637430	G	C	-	-	-	-	-	-	19	0	0	23	4	17.4	23	6	26.1	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	8	2	2	5	0	0	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.988636364	0.988636364	1	1.352331606	1.352331606	1	1.838888889	1.838888889	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000513	1	1.47E-09	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	131518568	A	C	MGMT	CCDS7660.2	r.?	-	-	intronic	19	0	0	30	2	6.7	24	6	25	59	1	1.7	517	1	0.2	311	34	10.9	244	62	25.4	210	12	5.7	TRUE	TRUE	2	2	8	2	2	5	0	0	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.380681818	0.380681818	1	1.295336788	1.295336788	1	0.416814815	0.416814815	1	0.619318182	0.619318182	1	1.316062176	1.316062176	1	1.397555556	1.397555556	1	5	5	1	0.925091216	0.009909649	4.47E-34	1.95E-09	5.97E-85	0.256019138	1.09E-09	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	131518601	A	C	MGMT	CCDS7660.2	r.?	-	-	intronic	18	0	0	26	2	7.7	24	6	25	55	1	1.8	478	0	0	273	31	11.4	212	56	26.4	182	8	4.4	TRUE	TRUE	2	2	8	2	2	5	0	0	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.4375	0.4375	1	1.295336788	1.295336788	1	0.441333333	0.441333333	1	0.647727273	0.647727273	1	1.367875648	0.683937824	2	1.078814815	1.078814815	1	5	4	1	1	0.007502227	9.89E-32	1.95E-09	5.74E-78	0.240951649	0.00000461	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	10	132242600	T	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	45	15	33.3	38	15	39.5	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	8	2	2	5	0	0	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.892045455	0.946022727	2	2.046632124	1.023316062	2	1.078814815	1.078814815	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.14E-24	1	4.24E-25	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	132681350	A	G	-	-	-	-	-	-	26	0	0	30	14	46.7	36	15	41.7	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	8	2	2	5	0	0	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.653409091	1.326704545	2	2.160621762	1.080310881	2	2.15762963	2.15762963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.24E-25	1	1.54E-25	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	133499288	C	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	25	3	12	19	4	21.1	28	2	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	8	2	2	5	0	0	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.681818182	0.681818182	1	1.093264249	1.093264249	1	1.740814815	1.740814815	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00026475	1	0.00000228	1	0.008668191	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	134797346	G	A	-	-	-	-	-	-	14	0	0	8	3	37.5	2	1	50	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	8	2	2	5	0	0	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.130681818	2.130681818	1	2.590673575	2.590673575	1	1.201407407	1.201407407	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000687	1	0.009975	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	10	135016428	G	A	KNDC1	CCDS7674.1	r.?	-	-	intronic	6	0	0	10	1	10	9	4	44.4	37	6	16.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	8	2	2	5	0	0	3	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.568181818	0.568181818	1	2.300518135	2.300518135	1	3.972	0.993	4	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.04888987	1	7.72E-08	1	3.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	1623783	T	C	KRTAP5-2	CCDS31331.1	r.?	-	-	upstream	29	0	0	30	7	23.3	24	5	20.8	24	1	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.323863636	1.323863636	1	1.077720207	1.077720207	1	0.777777778	0.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.44E-10	1	0.000000123	1	0.113346489	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	4564102	C	A	OR52M1	CCDS31353.1	r.?	-	-	upstream	36	0	0	36	6	16.7	43	8	18.6	42	7	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	0.96373057	0.96373057	1	3.092592593	3.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.68E-08	1	4.85E-11	1	1.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	4860747	C	T	MMP26	CCDS7752.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	29	6	20.7	31	10	32.3	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.176136364	1.176136364	1	1.67357513	1.67357513	1	0.925925926	0.925925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.72E-09	1	3.94E-16	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	4878159	C	T	MMP26	CCDS7752.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	50	11	22	38	3	7.9	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.25	1.25	1	0.409326425	0.409326425	1	0.814814815	0.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.52E-15	1	0.000925091	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	5598326	G	A	HBG2	CCDS7755.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	30	3	10	44	10	22.7	42	4	9.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.568181818	0.568181818	1	1.176165803	1.176165803	1	1.759259259	1.759259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000458697	1	2.08E-14	1	0.0000601	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	6179954	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	32	8	25	29	7	24.1	36	2	5.6	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	1.248704663	1.248704663	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	3.69E-12	1	1.11E-10	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	6219146	C	A	OR52W1	CCDS31407.1	r.?	-	-	upstream	34	0	0	29	4	13.8	37	7	18.9	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.784090909	0.784090909	1	0.979274611	0.979274611	1	1.62962963	1.62962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000134	1	7.05E-10	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	6614105	C	A	RRP8	CCDS31411.1	r.?	-	-	downstream	35	0	0	32	5	15.6	33	8	24.2	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.886363636	0.886363636	1	1.25388601	1.25388601	1	0.518518519	0.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000562	1	4.85E-12	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	7199560	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	33	8	24.2	36	9	25	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.375	1.375	1	1.295336788	1.295336788	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-12	1	1.63E-13	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	7381277	A	G	SYT9	CCDS7778.1	r.?	-	-	intronic	11	0	0	16	1	6.2	15	4	26.7	12	2	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.352272727	0.352272727	1	1.383419689	1.383419689	1	3.092592593	3.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.077068876	1	0.000000816	1	0.001595918	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	7541103	C	T	PPFIBP2	CCDS31419.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	25	5	20	27	6	22.2	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	1.150259067	1.150259067	1	1.425925926	1.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000153	1	4.23E-09	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	7821419	A	T	OR5P2	CCDS7782.1	r.?	-	-	upstream	40	0	0	33	7	21.2	28	4	14.3	32	4	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.204545455	1.204545455	1	0.740932642	0.740932642	1	2.314814815	2.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.98E-10	1	0.0000116	1	0.0000201	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	12383782	G	T	MICALCL	CCDS41620.1	r.?	-	-	downstream	24	0	0	29	6	20.7	30	7	23.3	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.176136364	1.176136364	1	1.207253886	1.207253886	1	0.555555556	0.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.72E-09	1	1.44E-10	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	12440910	G	A	PARVA	CCDS44541.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	31	6	19.4	32	5	15.6	31	3	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.102272727	1.102272727	1	0.808290155	0.808290155	1	1.796296296	1.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.03E-08	1	0.000000562	1	0.000505952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	12610338	G	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	30	7	23.3	33	6	18.2	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.323863636	1.323863636	1	0.943005181	0.943005181	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.44E-10	1	1.54E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	13474669	T	C	BTBD10	CCDS7811.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	44	7	15.9	53	5	9.4	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.903409091	0.903409091	1	0.487046632	0.487046632	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	0.00000734	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	16218885	C	T	SOX6	CCDS7821.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	41	3	7.3	35	6	17.1	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.414772727	0.414772727	1	0.886010363	0.886010363	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001155993	1	2.24E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	16308069	A	G	SOX6	CCDS7821.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	51	8	15.7	48	10	20.8	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.892045455	0.892045455	1	1.077720207	1.077720207	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.05E-10	1	5.37E-14	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	16542242	G	A	-	-	-	-	-	-	8	0	0	14	5	35.7	8	2	25	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.028409091	2.028409091	1	1.295336788	1.295336788	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.03E-09	1	0.000686131	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	16736714	G	C	-	-	-	-	-	-	36	0	0	33	6	18.2	36	5	13.9	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	0.720207254	0.720207254	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.54E-08	1	0.00000104	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	17118296	G	A	PIK3C2A	CCDS7824.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	34	4	11.8	42	2	4.8	26	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.670454545	0.670454545	1	0.248704663	0.248704663	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.0000257	1	0.018854633	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	19070985	A	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	55	17	30.9	38	6	15.8	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.755681818	1.755681818	1	0.81865285	0.81865285	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.35E-26	1	3.76E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	19659427	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	34	3	8.8	41	5	12.2	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.5	0.5	1	0.632124352	0.632124352	1	1.388888889	1.388888889	1	NA	NA	1	5.18134715	5.18134715	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000666058	1	0.00000202	0.005	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	21989184	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	40	5	12.5	38	7	18.4	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	0.953367876	0.953367876	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000178	1	8.61E-10	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	22481184	C	T	-	-	-	-	-	-	34	1	2.9	32	9	28.1	42	6	14.3	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.596590909	1.596590909	1	0.740932642	0.740932642	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	0.156694864	1	4.94E-14	1	7.02E-08	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	24591057	T	G	LUZP2	CCDS31446.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	39	4	10.3	39	5	12.8	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.585227273	0.585227273	1	0.663212435	0.663212435	1	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000447	1	0.00000156	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	25206912	A	G	-	-	-	-	-	-	25	0	0	41	4	9.8	45	2	4.4	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.556818182	0.556818182	1	0.227979275	0.227979275	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.0000546	1	0.021467209	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	25426685	G	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	42	8	19	44	10	22.7	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.079545455	1.079545455	1	1.176165803	1.176165803	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.96E-11	1	2.08E-14	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	25639023	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	36	7	19.4	37	10	27	24	2	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.102272727	1.102272727	1	1.398963731	1.398963731	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.74E-10	1	3.01E-15	1	0.006413403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	25795260	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	44	7	15.9	37	6	16.2	54	2	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.903409091	0.903409091	1	0.839378238	0.839378238	1	0.685185185	0.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	3.18E-08	1	0.030129377	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	26270313	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	44	6	13.6	38	7	18.4	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.772727273	0.772727273	1	0.953367876	0.953367876	1	0.87037037	0.87037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.37E-08	1	8.61E-10	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	26284703	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	36	9	25	41	6	14.6	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	0.756476684	0.756476684	1	1.351851852	1.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.63E-13	1	6.05E-08	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	26492450	A	C	ANO3	CCDS31447.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	54	13	24.1	32	6	18.8	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.369318182	1.369318182	1	0.974093264	0.974093264	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.12E-18	1	1.27E-08	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	26542012	A	T	ANO3	CCDS31447.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	39	3	7.7	51	13	25.5	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.4375	0.4375	1	1.321243523	1.321243523	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000998458	1	4.87E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	29228321	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	37	6	16.2	36	8	22.2	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.920454545	0.920454545	1	1.150259067	1.150259067	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.18E-08	1	1.04E-11	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	29405143	C	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	48	9	18.8	42	9	21.4	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.068181818	1.068181818	1	1.10880829	1.10880829	1	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.75E-12	1	7.51E-13	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	29536359	G	C	-	-	-	-	-	-	31	0	0	28	5	17.9	40	5	12.5	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.017045455	1.017045455	1	0.647668394	0.647668394	1	0.462962963	0.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000279	1	0.00000178	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	30952522	G	A	DCDC5	ENST00000406071	r.?	-	-	intronic	43	0	0	42	6	14.3	44	8	18.2	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	0.943005181	0.943005181	1	1.296296296	1.296296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.02E-08	1	5.9E-11	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	32460760	C	T	WT1	CCDS7878.2	r.?	-	-	upstream	7	0	0	12	4	33.3	7	1	14.3	26	4	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.892045455	1.892045455	1	0.740932642	0.740932642	1	2.851851852	2.851851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000003	1	0.034479353	1	0.00000856	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	32509252	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	35	8	22.9	36	7	19.4	25	1	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.301136364	1.301136364	1	1.005181347	1.005181347	1	0.740740741	0.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.15E-12	1	5.74E-10	1	0.117779757	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	32744115	C	A	CCDC73	CCDS41630.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	40	1	2.5	37	4	10.8	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.142045455	0.142045455	1	0.559585492	0.559585492	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.181679879	1	0.0000362	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	33171455	C	T	CSTF3	CCDS7883.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	21	3	14.3	28	11	39.3	25	2	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	2.03626943	2.03626943	1	1.481481481	1.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000155401	1	9.7E-19	1	0.006948068	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	33274855	C	G	HIPK3	CCDS7884.1	r.?	-	-	upstream	24	0	0	26	8	30.8	26	4	15.4	26	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.75	1.75	1	0.797927461	0.797927461	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.63E-13	1	0.00000856	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	33856621	A	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	46	5	10.9	34	1	2.9	29	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.619318182	0.619318182	1	0.150259067	0.150259067	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000361	1	0.156694864	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	35662479	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	29	5	17.2	26	4	15.4	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.977272727	0.977272727	1	0.797927461	0.797927461	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000336	1	0.00000856	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	38785634	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	35	6	17.1	37	7	18.9	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.971590909	0.971590909	1	0.979274611	0.979274611	1	1.611111111	1.611111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-08	1	7.05E-10	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	39613782	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	48	7	14.6	36	6	16.7	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.829545455	0.829545455	1	0.865284974	0.865284974	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.81E-09	1	2.68E-08	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	39967817	A	C	-	-	-	-	-	-	25	0	0	35	6	17.1	29	7	24.1	27	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.971590909	0.971590909	1	1.248704663	1.248704663	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-08	1	1.11E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	39967819	A	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	35	6	17.1	30	7	23.3	25	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.971590909	0.971590909	1	1.207253886	1.207253886	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-08	1	1.44E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	41103883	T	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	48	7	14.6	45	11	24.4	50	3	6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.829545455	0.829545455	1	1.264248705	1.264248705	1	1.111111111	1.111111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.81E-09	1	4.24E-16	1	0.002055544	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	41147604	A	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	33	3	9.1	30	5	16.7	52	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.517045455	0.517045455	1	0.865284974	0.865284974	1	0.703703704	0.703703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000609557	1	0.000000401	1	0.028101652	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	41262093	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	39	9	23.1	43	12	27.9	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.3125	1.3125	1	1.445595855	1.445595855	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.62E-13	1	3.24E-18	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	41754680	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	28	6	21.4	26	7	26.9	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.215909091	1.215909091	1	1.393782383	1.393782383	1	0.555555556	0.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.36E-09	1	4.73E-11	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	42508800	T	C	-	-	-	-	-	-	34	0	0	39	5	12.8	45	10	22.2	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.727272727	0.727272727	1	1.150259067	1.150259067	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000156	1	2.66E-14	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	42810238	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	47	10	21.3	52	6	11.5	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.210227273	1.210227273	1	0.595854922	0.595854922	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.27E-14	1	0.000000261	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	43040021	G	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	49	7	14.3	36	6	16.7	39	4	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	0.865284974	0.865284974	1	1.907407407	1.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	5.58E-09	1	2.68E-08	1	0.0000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	45321547	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	41	4	9.8	41	8	19.5	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.556818182	0.556818182	1	1.010362694	1.010362694	1	1.388888889	1.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000546	1	3.22E-11	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	45530360	A	C	-	-	-	-	-	-	37	0	0	42	6	14.3	46	11	23.9	50	5	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.238341969	1.238341969	1	1.851851852	1.851851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.02E-08	1	5.55E-16	1	0.00000549	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	46994366	A	G	C11orf49	CCDS41641.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	35	12	34.3	39	12	30.8	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.948863636	1.948863636	1	1.595854922	1.595854922	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.83E-19	1	8.43E-19	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	47703302	G	A	AGBL2	CCDS7944.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	21	6	28.6	28	3	10.7	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.625	1.625	1	0.554404145	0.554404145	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.95E-10	1	0.000372895	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	49594529	G	T	ENSG00000205035	ENST00000357667	r.?	-	-	upstream	12	0	0	31	4	12.9	24	7	29.2	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.732954545	0.732954545	1	1.512953368	1.512953368	1	0.777777778	0.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000177	1	2.51E-11	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	49634024	T	C	ENSG00000205035	ENST00000357667	r.?	-	-	intronic	27	0	0	30	4	13.3	30	5	16.7	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.755681818	0.755681818	1	0.865284974	0.865284974	1	0.388888889	0.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000154	1	0.000000401	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	49731612	T	A	ENSG00000205035	ENST00000357667	r.?	-	-	intronic	29	0	0	36	5	13.9	30	7	23.3	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.789772727	0.789772727	1	1.207253886	1.207253886	1	0.981481481	0.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000104	1	1.44E-10	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	49923681	A	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	35	5	14.3	31	4	12.9	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	0.668393782	0.668393782	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000895	1	0.0000177	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	51375927	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	36	6	16.7	35	9	25.7	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	1.331606218	1.331606218	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.68E-08	1	1.23E-13	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	51533491	C	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	20	2	10	30	5	16.7	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.568181818	0.568181818	1	0.865284974	0.865284974	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.004473894	1	0.000000401	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	55101490	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	50	10	20	41	8	19.5	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	1.010362694	1.010362694	1	1.203703704	1.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.36E-14	1	3.22E-11	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	55103424	G	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	40	7	17.5	48	12	25	35	3	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.994318182	0.994318182	1	1.295336788	1.295336788	1	1.592592593	1.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-09	1	1.44E-17	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	55502817	G	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	33	7	21.2	33	5	15.2	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.204545455	1.204545455	1	0.787564767	0.787564767	1	1.185185185	1.185185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.98E-10	1	0.00000066	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	55569667	T	C	-	-	-	-	-	-	28	0	0	41	11	26.8	44	13	29.5	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.522727273	1.522727273	1	1.528497409	1.528497409	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.34E-16	1	5.49E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	55611980	T	C	OR5D16	CCDS31512.1	r.?	-	-	downstream	32	0	0	41	8	19.5	53	12	22.6	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.107954545	1.107954545	1	1.170984456	1.170984456	1	1.648148148	1.648148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.22E-11	1	5.39E-17	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	56225115	A	T	OR5M9	CCDS31531.1	r.?	-	-	downstream	34	0	0	44	8	18.2	45	8	17.8	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	0.922279793	0.922279793	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.9E-11	1	7.14E-11	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	56348276	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	49	10	20.4	37	6	16.2	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.159090909	1.159090909	1	0.839378238	0.839378238	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.72E-14	1	3.18E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	56474455	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	43	9	20.9	47	9	19.1	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.1875	1.1875	1	0.989637306	0.989637306	1	1.203703704	1.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.45E-13	1	2.24E-12	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	56505220	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	47	14	29.8	27	4	14.8	51	2	3.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.693181818	1.693181818	1	0.766839378	0.766839378	1	0.722222222	0.722222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.79E-21	1	0.00001	1	0.027109304	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	56978179	G	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	31	0	0	25	4	16	44	2	4.5	268	0	0	210	6	2.9	249	33	13.3	233	12	5.2	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.829015544	0.829015544	1	0.833333333	0.833333333	1	0.164772727	0.164772727	1	0.689119171	0.689119171	1	0.962962963	0.962962963	1	3	1	1	1	1	0.000727208	0.00000727	6.05E-36	0.020580492	3.53E-09	YES	0_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	11	57655872	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	27	5	18.5	33	11	33.3	29	1	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.051136364	1.051136364	1	1.725388601	1.725388601	1	0.62962963	0.62962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000023	1	8.54E-18	1	0.135292269	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	58527469	G	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	41	7	17.1	55	10	18.2	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.971590909	0.971590909	1	0.943005181	0.943005181	1	2.018518519	2.018518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.51E-09	1	2.33E-13	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	59980098	C	T	MS4A4E	ENST00000427611	r.?	-	-	intronic	21	0	0	26	5	19.2	23	5	21.7	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.090909091	1.090909091	1	1.124352332	1.124352332	1	2.148148148	2.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000188	1	9.75E-08	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	61855344	A	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	37	4	10.8	41	3	7.3	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.613636364	0.613636364	1	0.378238342	0.378238342	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.0000362	1	0.001155993	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	63283399	G	C	LGALS12	CCDS44634.1	r.?	-	-	intronic	7	0	0	17	10	58.8	5	0	0	29	18	62.1	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.340909091	3.340909091	1	0	0	1	11.5	11.5	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.84E-19	1	1	1	1.25E-34	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	64701647	C	G	PPP2R5B	CCDS8085.1	r.2410c>g	c.?	p.?	3'UTR variant	10	0	0	6	0	0	19	6	31.6	34	5	14.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.637305699	1.637305699	1	2.722222222	2.722222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1	1	4.01E-10	1	0.000000771	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	66167678	A	G	-	-	-	-	-	-	20	0	0	32	4	12.5	31	2	6.5	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	0.336787565	0.336787565	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.0000201	1	0.010558179	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	66932025	G	A	KDM2A	CCDS44657.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	39	7	17.9	27	5	18.5	24	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.017045455	1.017045455	1	0.958549223	0.958549223	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-09	1	0.00000023	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	67231499	G	C	CABP4	CCDS8166.1	r.?	-	-	downstream	7	0	0	13	2	15.4	12	2	16.7	30	5	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.875	0.875	1	0.865284974	0.865284974	1	3.092592593	3.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001879825	1	0.001595918	1	0.000000401	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	67889318	G	A	CHKA	CCDS8178.1	r.?	-	-	upstream	9	0	0	16	4	25	6	0	0	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000108	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	67891876	G	T	CHKA	CCDS8178.1	r.?	-	-	upstream	29	0	0	34	7	20.6	30	10	33.3	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.170454545	1.170454545	1	1.725388601	1.725388601	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.73E-10	1	2.68E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	70298543	C	T	-	-	-	-	-	-	8	0	0	14	1	7.1	18	6	33.3	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.403409091	0.403409091	1	1.725388601	1.725388601	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.067769881	1	2.75E-10	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	73440872	G	A	RAB6A	CCDS8223.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	28	4	14.3	36	9	25	23	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.295336788	1.295336788	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000116	1	1.63E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	73614572	G	T	PAAF1	CCDS8226.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	18	2	11.1	37	5	13.5	30	1	3.3	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.630681818	0.630681818	1	0.699481865	0.699481865	1	0.611111111	0.611111111	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.003626632	1	0.00000119	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	75376630	C	T	MAP6	CCDS44686.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	37	6	16.2	42	6	14.3	35	4	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.920454545	0.920454545	1	0.740932642	0.740932642	1	2.111111111	2.111111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.18E-08	1	7.02E-08	1	0.0000289	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	78744971	A	G	ODZ4	CCDS44688.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	48	3	6.2	29	5	17.2	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.352272727	0.352272727	1	0.89119171	0.89119171	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001827434	1	0.000000336	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	80045750	A	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	41	7	17.1	44	10	22.7	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.971590909	0.971590909	1	1.176165803	1.176165803	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.51E-09	1	2.08E-14	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	80230104	C	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	30	4	13.3	37	8	21.6	48	5	10.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.755681818	0.755681818	1	1.119170984	1.119170984	1	1.925925926	1.925925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000154	1	1.33E-11	1	0.00000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	80867977	C	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	30	5	16.7	35	5	14.3	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	0.740932642	0.740932642	1	1.944444444	1.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000401	1	0.000000895	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	81754685	G	A	AP002802.1	ENST00000500502	r.?	-	-	intronic	29	0	0	29	5	17.2	36	9	25	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.977272727	0.977272727	1	1.295336788	1.295336788	1	0.777777778	0.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000336	1	1.63E-13	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	82397852	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	45	9	20	38	7	18.4	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	0.953367876	0.953367876	1	1.425925926	1.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-12	1	8.61E-10	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	82476073	G	A	-	-	-	-	-	-	20	0	0	24	2	8.3	24	6	25	54	3	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.471590909	0.471590909	1	1.295336788	1.295336788	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.006413403	1	1.95E-09	1	0.00256299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	82624907	G	A	C11orf82	CCDS8263.1	r.?	-	-	upstream	24	0	0	36	9	25	38	8	21.1	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	1.093264249	1.093264249	1	1.425925926	1.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.63E-13	1	1.67E-11	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	83263689	A	G	DLG2	CCDS41696.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	34	6	17.6	26	6	23.1	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1.196891192	1.196891192	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.86E-08	1	3.3E-09	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	85658133	T	C	-	-	-	-	-	-	28	0	0	28	8	28.6	37	6	16.2	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.625	1.625	1	0.839378238	0.839378238	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.11E-12	1	3.18E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	86060389	T	A	C11orf73	CCDS8275.1	r.?	-	-	downstream	25	0	0	31	2	6.5	27	5	18.5	28	1	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.369318182	0.369318182	1	0.958549223	0.958549223	1	0.666666667	0.666666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.010558179	1	0.00000023	1	0.130947004	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	87259846	T	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	34	2	5.9	39	8	20.5	49	3	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.335227273	0.335227273	1	1.062176166	1.062176166	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.012612579	1	2.09E-11	1	0.001939399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	88271687	A	G	GRM5	CCDS44694.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	43	8	18.6	32	6	18.8	57	5	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.056818182	1.056818182	1	0.974093264	0.974093264	1	1.62962963	1.62962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-11	1	1.27E-08	1	0.0000105	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	88728613	C	T	GRM5	CCDS44694.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	30	2	6.7	26	7	26.9	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.380681818	0.380681818	1	1.393782383	1.393782383	1	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.009909649	1	4.73E-11	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	89092153	C	T	NOX4	CCDS8285.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	39	6	15.4	37	3	8.1	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.875	0.875	1	0.419689119	0.419689119	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	4.43E-08	1	0.000855237	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	89875102	C	T	NAALAD2	CCDS8288.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	60	12	20	45	6	13.3	57	3	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	0.689119171	0.689119171	1	0.981481481	0.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.74E-16	1	0.000000108	1	0.002989991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	90565511	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	41	10	24.4	43	14	32.6	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.386363636	1.386363636	1	1.689119171	1.689119171	1	1.185185185	1.185185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.51E-15	1	4.18E-22	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	91499579	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	36	7	19.4	37	11	29.7	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.102272727	1.102272727	1	1.538860104	1.538860104	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	5.74E-10	1	3.7E-17	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	92291198	G	A	FAT3	CCDS44706.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	44	2	4.5	35	10	28.6	37	6	16.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.255681818	0.255681818	1	1.481865285	1.481865285	1	3	3	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.020580492	1	1.6E-15	1	3.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	92547287	C	T	FAT3	CCDS44706.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	30	4	13.3	41	10	24.4	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.755681818	0.755681818	1	1.264248705	1.264248705	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000154	1	9.51E-15	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	93956617	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	39	7	17.9	42	7	16.7	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.017045455	1.017045455	1	0.865284974	0.865284974	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-09	1	1.81E-09	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	95556448	A	G	CEP57	CCDS8304.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	38	3	7.9	45	12	26.7	55	3	5.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.448863636	0.448863636	1	1.383419689	1.383419689	1	1.018518519	1.018518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000925091	1	6.03E-18	1	0.002700822	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	97082236	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	32	7	21.9	29	3	10.3	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.244318182	1.244318182	1	0.533678756	0.533678756	1	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.36E-10	1	0.000414371	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	97136839	C	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	38	6	15.8	54	11	20.4	49	2	4.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.897727273	0.897727273	1	1.056994819	1.056994819	1	0.759259259	0.759259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.76E-08	1	3.84E-15	1	0.025168485	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	97384753	T	G	-	-	-	-	-	-	32	0	0	56	0	0	41	9	22	50	1	2	90	1	1.1	226	15	6.6	278	24	8.6	323	7	2.2	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.139896373	1.139896373	1	0.37037037	0.37037037	1	0.375	0.375	1	0.445595855	0.445595855	1	0.407407407	0.407407407	1	3	3	1	0.363091174	1	1.11E-12	5.92E-13	4.63E-22	0.221687443	0.001354568	YES	0_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	11	97505564	T	G	-	-	-	-	-	-	20	0	0	37	8	21.6	22	3	13.6	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.227272727	1.227272727	1	0.704663212	0.704663212	1	0.87037037	0.87037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.33E-11	1	0.000179267	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	97505572	T	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	35	9	25.7	27	3	11.1	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.460227273	1.460227273	1	0.575129534	0.575129534	1	0.814814815	0.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.23E-13	1	0.000334187	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	97604775	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	39	4	10.3	35	7	20	48	4	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.585227273	0.585227273	1	1.03626943	1.03626943	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000447	1	4.65E-10	1	0.000102016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	98167552	G	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	33	9	27.3	42	11	26.2	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.551136364	1.551136364	1	1.357512953	1.357512953	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.76E-14	1	1.81E-16	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	98415060	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	45	0	0	38	5	13.2	41	0	0	24	0	0	115	1	0.9	133	21	15.8	183	6	3.3	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.683937824	0.683937824	1	0	0	1	0.051136364	0.051136364	1	0.81865285	0.81865285	1	0.611111111	0.611111111	1	2	1	1	1	1	0.438106141	0.00000137	4.12E-25	1	0.000353036	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	98901404	C	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	27	9	33.3	29	5	17.2	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.892045455	1.892045455	1	0.89119171	0.89119171	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.44E-15	1	0.000000336	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	99652648	A	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	45	5	11.1	39	6	15.4	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.630681818	0.630681818	1	0.797927461	0.797927461	1	1.203703704	1.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000323	1	4.43E-08	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	102942133	T	C	DCUN1D5	CCDS8325.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	43	8	18.6	35	11	31.4	32	4	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.056818182	1.056818182	1	1.626943005	1.626943005	1	2.314814815	2.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-11	1	1.82E-17	1	0.0000201	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	103889313	C	T	PDGFD	CCDS41703.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	44	8	18.2	33	9	27.3	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	1.414507772	1.414507772	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.9E-11	1	6.76E-14	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	104440710	C	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	31	7	22.6	28	5	17.9	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.284090909	1.284090909	1	0.92746114	0.92746114	1	1.574074074	1.574074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.85E-10	1	0.000000279	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	104548181	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	32	5	15.6	32	4	12.5	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.886363636	0.886363636	1	0.647668394	0.647668394	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000562	1	0.0000201	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	105373466	T	G	-	-	-	-	-	-	29	0	0	44	7	15.9	41	10	24.4	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.903409091	0.903409091	1	1.264248705	1.264248705	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	9.51E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	105637235	G	A	GRIA4	CCDS41706.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	49	8	16.3	50	9	18	53	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.926136364	0.926136364	1	0.932642487	0.932642487	1	0.703703704	0.703703704	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-10	1	4.07E-12	1	0.029108399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	107540654	A	G	ELMOD1	CCDS44723.1	r.?	-	-	downstream	20	0	0	27	2	7.4	30	5	16.7	16	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.420454545	0.420454545	1	0.865284974	0.865284974	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00807567	1	0.000000401	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	109485902	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	30	4	13.3	49	8	16.3	49	4	8.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.755681818	0.755681818	1	0.844559585	0.844559585	1	1.518518519	1.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	0.0000154	1	1.47E-10	1	0.000110643	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	109613751	T	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	42	3	7.1	39	7	17.9	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.403409091	0.403409091	1	0.92746114	0.92746114	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001240292	1	1.04E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	109613752	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	39	2	5.1	38	7	18.4	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.289772727	0.289772727	1	0.953367876	0.953367876	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.016387522	1	8.61E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	109613753	A	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	42	3	7.1	39	7	17.9	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.403409091	0.403409091	1	0.92746114	0.92746114	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001240292	1	1.04E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	109958589	T	C	-	-	-	-	-	-	21	0	0	36	10	27.8	33	5	15.2	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.579545455	1.579545455	1	0.787564767	0.787564767	1	0.388888889	0.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	2.21E-15	1	0.00000066	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	111289559	G	T	AP002451.1	CCDS3757.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	52	7	13.5	41	12	29.3	49	4	8.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.767045455	0.767045455	1	1.518134715	1.518134715	1	1.518518519	1.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.58E-09	1	1.69E-18	1	0.000110643	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	111683739	C	A	ALG9	CCDS41714.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	18	4	22.2	31	8	25.8	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	1.336787565	1.336787565	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000181	1	2.78E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	112140125	G	C	AP002841.2	ENST00000504610	r.?	-	-	upstream	36	0	0	50	10	20	44	10	22.7	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	1.176165803	1.176165803	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.36E-14	1	2.08E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	114799935	C	A	-	-	-	-	-	-	18	0	0	23	7	30.4	22	5	22.7	36	1	2.8	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.727272727	1.727272727	1	1.176165803	1.176165803	1	0.518518519	0.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.79E-11	1	7.67E-08	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	115653190	T	C	-	-	-	-	-	-	26	0	0	38	9	23.7	42	10	23.8	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.346590909	1.346590909	1	1.233160622	1.233160622	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.79E-13	1	1.24E-14	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	118663937	A	G	DDX6	CCDS44751.1	r.?	-	-	upstream	25	0	0	35	4	11.4	39	5	12.8	30	2	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.647727273	0.647727273	1	0.663212435	0.663212435	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000289	1	0.00000156	1	0.009909649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	118969958	A	T	DPAGT1	CCDS8411.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	26	5	19.2	23	5	21.7	28	3	10.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.090909091	1.090909091	1	1.124352332	1.124352332	1	1.981481481	1.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000188	1	9.75E-08	1	0.000372895	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	120290191	A	T	ARHGEF12	CCDS41727.1	r.?	-	-	intronic	20	0	0	22	1	4.5	29	6	20.7	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.255681818	0.255681818	1	1.07253886	1.07253886	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.104413009	1	6.72E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	121743304	G	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	29	8	27.6	20	4	20	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.568181818	1.568181818	1	1.03626943	1.03626943	1	0.462962963	0.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.53E-12	1	0.00000284	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	121869265	C	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	37	8	21.6	40	9	22.5	25	2	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.227272727	1.227272727	1	1.165803109	1.165803109	1	1.481481481	1.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.33E-11	1	4.64E-13	1	0.006948068	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	121869510	A	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	33	10	30.3	39	7	17.9	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.721590909	1.721590909	1	0.92746114	0.92746114	1	1.722222222	1.722222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.14E-16	1	1.04E-09	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	122236802	C	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	28	8	28.6	36	10	27.8	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.625	1.625	1	1.440414508	1.440414508	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.11E-12	1	2.21E-15	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	122709830	C	T	CRTAM	CCDS8437.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	14	2	14.3	9	3	33.3	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.725388601	1.725388601	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.002185852	1	0.0000103	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	125127279	G	A	PKNOX2	CCDS41730.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	43	5	11.6	43	11	25.6	49	5	10.2	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.659090909	0.659090909	1	1.32642487	1.32642487	1	1.888888889	1.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000257	1	2.42E-16	1	0.00000496	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	125884418	C	T	CDON	CCDS8468.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	37	7	18.9	43	10	23.3	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.073863636	1.073863636	1	1.207253886	1.207253886	1	0.888888889	0.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.05E-10	1	1.61E-14	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	126873809	G	A	PRR10	ENST00000404882	r.512g>a	c.?	p.?	3'UTR variant	10	0	0	12	5	41.7	6	1	16.7	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.369318182	2.369318182	1	0.865284974	0.865284974	1	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.4E-09	1	0.029627491	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	127030421	C	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	39	5	12.8	50	11	22	54	3	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.727272727	0.727272727	1	1.139896373	1.139896373	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000156	1	1.52E-15	1	0.00256299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	127186481	T	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	52	7	13.5	39	4	10.3	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.767045455	0.767045455	1	0.533678756	0.533678756	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.58E-09	1	0.0000447	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	127686550	A	G	-	-	-	-	-	-	29	0	0	32	4	12.5	43	9	20.9	52	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	1.082901554	1.082901554	1	0.703703704	0.703703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000201	1	9.45E-13	1	0.028101652	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	128104348	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	42	9	21.4	39	5	12.8	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.215909091	1.215909091	1	0.663212435	0.663212435	1	1.62962963	1.62962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.51E-13	1	0.00000156	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	128669707	C	T	FLI1	CCDS44768.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	30	4	13.3	26	11	42.3	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.755681818	0.755681818	1	2.191709845	2.191709845	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000154	1	3.52E-19	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	130922198	C	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	32	6	18.8	34	8	23.5	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.068181818	1.068181818	1	1.21761658	1.21761658	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.27E-08	1	6.32E-12	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	131201424	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	42	9	21.4	39	6	15.4	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.215909091	1.215909091	1	0.797927461	0.797927461	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.51E-13	1	4.43E-08	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	131358003	C	A	OPCML	CCDS41733.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	26	2	7.7	46	7	15.2	56	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.4375	0.4375	1	0.787564767	0.787564767	1	0.333333333	0.333333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.007502227	1	3.53E-09	1	0.244746891	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	131519374	C	G	OPCML	CCDS41733.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	33	4	12.1	36	11	30.6	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.6875	0.6875	1	1.585492228	1.585492228	1	0.925925926	0.925925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000228	1	2.62E-17	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	131870587	A	C	OPCML	CCDS8491.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	49	8	16.3	35	7	20	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.926136364	0.926136364	1	1.03626943	1.03626943	1	0.388888889	0.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-10	1	4.65E-10	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	132373724	A	T	ENSG00000183715	CCDS8492.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	44	7	15.9	35	6	17.1	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.903409091	0.903409091	1	0.886010363	0.886010363	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	2.24E-08	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	133076709	G	A	ENSG00000183715	CCDS31722.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	15	1	6.7	27	7	25.9	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.380681818	0.380681818	1	1.341968912	1.341968912	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.072431031	1	6.36E-11	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	133203632	T	G	ENSG00000183715	CCDS31722.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	55	9	16.4	42	4	9.5	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.931818182	0.931818182	1	0.492227979	0.492227979	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.01E-11	1	0.0000601	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	11	134590280	G	C	-	-	-	-	-	-	37	0	0	24	6	25	22	6	27.3	28	1	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	1.414507772	1.414507772	1	0.666666667	0.666666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.95E-09	1	1.09E-09	1	0.130947004	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	184176	G	A	IQSEC3	CCDS31725.1	r.?	-	-	upstream	40	0	0	69	7	10.1	76	11	14.5	102	4	3.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.573863636	0.573863636	1	0.751295337	0.751295337	1	0.722222222	0.722222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.43E-08	1	2.08E-13	1	0.001799146	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	896664	A	T	WNK1	CCDS8506.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	38	9	23.7	44	10	22.7	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.346590909	1.346590909	1	1.176165803	1.176165803	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.79E-13	1	2.08E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	2033954	G	T	ENSG00000235049	ENST00000418006	r.?	-	-	downstream	11	0	0	15	4	26.7	18	2	11.1	22	1	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.517045455	1.517045455	1	0.575129534	0.575129534	1	0.833333333	0.833333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000816	1	0.003626632	1	0.104413009	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	2666205	G	T	CACNA1C	CCDS44794.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	45	10	22.2	53	11	20.8	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	1.077720207	1.077720207	1	0	0	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.66E-14	1	3.07E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	4166741	T	C	-	-	-	-	-	-	30	0	0	37	8	21.6	41	7	17.1	42	5	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.227272727	1.227272727	1	0.886010363	0.886010363	1	2.203703704	2.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.33E-11	1	1.51E-09	1	0.00000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	4266668	C	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	36	5	13.9	40	12	30	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.789772727	0.789772727	1	1.554404145	1.554404145	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000104	1	1.2E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	5709508	C	T	ANO2	CCDS44807.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	38	7	18.4	36	1	2.8	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.045454545	1.045454545	1	0.14507772	0.14507772	1	1.203703704	1.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-10	1	0.165106833	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	8775680	C	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	43	10	23.3	48	10	20.8	25	2	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.323863636	1.323863636	1	1.077720207	1.077720207	1	1.481481481	1.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.61E-14	1	5.37E-14	1	0.006948068	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	10113513	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	41	7	17.1	43	11	25.6	41	6	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.971590909	0.971590909	1	1.32642487	1.32642487	1	2.703703704	2.703703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.51E-09	1	2.42E-16	1	6.05E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	10144988	G	A	CLEC1B	CCDS41752.1	r.?	-	-	downstream	23	0	0	40	8	20	35	6	17.1	52	3	5.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	0.886010363	0.886010363	1	1.074074074	1.074074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.61E-11	1	2.24E-08	1	0.002300591	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	11591896	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	33	7	21.2	37	7	18.9	53	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.204545455	1.204545455	1	0.979274611	0.979274611	1	0.351851852	0.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.98E-10	1	7.05E-10	1	0.233303855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	12229112	G	A	BCL2L14	CCDS8646.1	r.?	-	-	intronic	9	0	0	10	3	30	17	4	23.5	12	4	33.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.704545455	1.704545455	1	1.21761658	1.21761658	1	6.166666667	6.166666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000146	1	0.00000141	1	0.0000003	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	14497682	T	C	-	-	-	-	-	-	27	0	0	48	4	8.3	37	15	40.5	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.471590909	0.471590909	1	2.098445596	2.098445596	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000102016	1	2.58E-25	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	14790779	G	T	GUCY2C	CCDS8664.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	48	13	27.1	43	13	30.2	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.539772727	1.539772727	1	1.564766839	1.564766839	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2E-19	1	3.88E-20	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	15145229	T	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	27	9	33.3	34	10	29.4	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.892045455	1.892045455	1	1.523316062	1.523316062	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.44E-15	1	1.15E-15	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	15562132	A	G	PTPRO	CCDS8675.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	34	4	11.8	27	5	18.5	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.670454545	0.670454545	1	0.958549223	0.958549223	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000257	1	0.00000023	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	15835469	A	G	EPS8	CCDS31753.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	41	8	19.5	46	8	17.4	49	6	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.107954545	1.107954545	1	0.901554404	0.901554404	1	2.259259259	2.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.22E-11	1	8.61E-11	1	0.000000182	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	17159683	A	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	34	5	14.7	34	6	17.6	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.835227273	0.835227273	1	0.911917098	0.911917098	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000771	1	1.86E-08	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	17344338	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	37	8	21.6	40	6	15	44	5	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.227272727	1.227272727	1	0.777202073	0.777202073	1	2.111111111	2.111111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.33E-11	1	5.18E-08	1	0.00000288	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	18530751	A	C	PIK3C2G	CCDS44839.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	50	9	18	56	9	16.1	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.022727273	1.022727273	1	0.834196891	0.834196891	1	1.351851852	1.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.07E-12	1	1.2E-11	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	18912159	G	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	37	8	21.6	32	3	9.4	26	0	0	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.227272727	1.227272727	1	0.487046632	0.487046632	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.33E-11	1	0.000556213	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	19994367	G	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	26	4	15.4	42	9	21.4	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.875	0.875	1	1.10880829	1.10880829	1	0.833333333	0.833333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000856	1	7.51E-13	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	20452620	T	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	36	10	27.8	40	6	15	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.579545455	1.579545455	1	0.777202073	0.777202073	1	0.888888889	0.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.21E-15	1	5.18E-08	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	23493494	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	30	7	23.3	30	2	6.7	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.323863636	1.323863636	1	0.347150259	0.347150259	1	1.296296296	1.296296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.44E-10	1	0.009909649	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	24009604	G	A	SOX5	CCDS8699.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	39	5	12.8	53	10	18.9	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.727272727	0.727272727	1	0.979274611	0.979274611	1	0.814814815	0.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000156	1	1.57E-13	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	24339690	C	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	35	8	22.9	29	8	27.6	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.301136364	1.301136364	1	1.430051813	1.430051813	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.15E-12	1	1.53E-12	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	24721469	A	G	-	-	-	-	-	-	42	0	0	51	10	19.6	49	11	22.4	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.113636364	1.113636364	1	1.160621762	1.160621762	1	0.87037037	0.87037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-13	1	1.19E-15	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	24787866	T	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	40	10	25	36	2	5.6	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	0.29015544	0.29015544	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	7.22E-15	1	0.014070883	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	24998041	G	A	BCAT1	CCDS44845.1	r.?	-	-	intronic	11	0	0	9	1	11.1	18	5	27.8	25	3	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.630681818	0.630681818	1	1.440414508	1.440414508	1	2.222222222	2.222222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.044110422	1	2.54E-08	1	0.00026475	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	25079919	A	T	BCAT1	CCDS44845.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	39	5	12.8	41	5	12.2	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.727272727	0.727272727	1	0.632124352	0.632124352	1	0.777777778	0.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000156	1	0.00000202	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	26134743	C	T	RASSF8	CCDS8705.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	34	7	20.6	37	6	16.2	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.170454545	1.170454545	1	0.839378238	0.839378238	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.73E-10	1	3.18E-08	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	26176300	A	T	RASSF8	CCDS8705.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	43	6	14	29	7	24.1	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.795454545	0.795454545	1	1.248704663	1.248704663	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.13E-08	1	1.11E-10	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	29577450	T	C	OVCH1	ENST00000318184	r.?	-	-	downstream	32	0	0	41	4	9.8	39	4	10.3	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.556818182	0.556818182	1	0.533678756	0.533678756	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000546	1	0.0000447	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	29819833	C	A	TMTC1	CCDS8718.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	43	10	23.3	35	6	17.1	49	2	4.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.323863636	1.323863636	1	0.886010363	0.886010363	1	0.759259259	0.759259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.61E-14	1	2.24E-08	1	0.025168485	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	29837826	G	A	TMTC1	CCDS8718.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	42	4	9.5	50	14	28	54	2	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.539772727	0.539772727	1	1.450777202	1.450777202	1	0.685185185	0.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000601	1	4.84E-21	1	0.030129377	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	32462001	C	T	BICD1	CCDS8726.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	32	5	15.6	42	8	19	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.886363636	0.886363636	1	0.984455959	0.984455959	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000562	1	3.96E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	39117845	C	T	CPNE8	CCDS8733.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	42	8	19	34	3	8.8	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.079545455	1.079545455	1	0.455958549	0.455958549	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.96E-11	1	0.000666058	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	39366691	A	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	38	7	18.4	32	8	25	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.045454545	1.045454545	1	1.295336788	1.295336788	1	0.981481481	0.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-10	1	3.69E-12	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	39442176	G	C	-	-	-	-	-	-	25	0	0	20	7	35	36	8	22.2	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.988636364	1.988636364	1	1.150259067	1.150259067	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.72E-12	1	1.04E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	39568145	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	37	6	16.2	49	11	22.4	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.920454545	0.920454545	1	1.160621762	1.160621762	1	1.944444444	1.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.18E-08	1	1.19E-15	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	39679932	C	T	-	-	-	-	-	-	13	0	0	25	3	12	23	5	21.7	50	4	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.681818182	0.681818182	1	1.124352332	1.124352332	1	1.481481481	1.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00026475	1	9.75E-08	1	0.000119787	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	40937827	A	G	MUC19	ENST00000380816	r.?	-	-	intronic	32	0	0	46	10	21.7	41	6	14.6	49	4	8.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.232954545	1.232954545	1	0.756476684	0.756476684	1	1.518518519	1.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.38E-14	1	6.05E-08	1	0.000110643	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	40980924	A	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	34	3	8.8	49	12	24.5	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.5	0.5	1	1.269430052	1.269430052	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000666058	1	1.9E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	41814480	A	G	PDZRN4	ENST00000402685	r.?	-	-	intronic	38	0	0	44	13	29.5	44	10	22.7	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.676136364	1.676136364	1	1.176165803	1.176165803	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.49E-20	1	2.08E-14	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	42518053	A	C	GXYLT1	CCDS41772.1	r.?	-	-	intronic	20	0	0	40	11	27.5	38	3	7.9	30	1	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.5625	1.5625	1	0.409326425	0.409326425	1	0.611111111	0.611111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.88E-17	1	0.000925091	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	43366076	A	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	38	6	15.8	52	9	17.3	57	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.897727273	0.897727273	1	0.896373057	0.896373057	1	0.333333333	0.333333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.76E-08	1	5.92E-12	1	0.248523156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	43619579	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	39	6	15.4	35	9	25.7	56	1	1.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.875	0.875	1	1.331606218	1.331606218	1	0.333333333	0.333333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.43E-08	1	1.23E-13	1	0.244746891	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	44511222	C	A	TMEM117	CCDS8745.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	42	6	14.3	36	2	5.6	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	0.29015544	0.29015544	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	7.02E-08	1	0.014070883	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	44858321	T	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	37	9	24.3	52	13	25	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.380681818	1.380681818	1	1.295336788	1.295336788	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.14E-13	1	6.47E-19	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	46613736	A	G	SLC38A1	CCDS41774.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	31	3	9.7	40	8	20	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.551136364	0.551136364	1	1.03626943	1.03626943	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000505952	1	2.61E-11	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	46769328	C	A	SLC38A2	CCDS8749.1	r.?	-	-	upstream	30	0	0	30	6	20	38	6	15.8	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	0.81865285	0.81865285	1	0.388888889	0.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.37E-09	1	3.76E-08	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	47879334	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	53	10	18.9	39	5	12.8	50	6	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.073863636	1.073863636	1	0.663212435	0.663212435	1	2.222222222	2.222222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.57E-13	1	0.00000156	1	0.000000206	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	49043044	T	A	C12orf41	CCDS44869.1	r.?	-	-	downstream	37	0	0	25	6	24	30	8	26.7	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.363636364	1.363636364	1	1.383419689	1.383419689	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	2.07E-12	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	49637557	C	G	-	-	-	-	-	-	22	0	0	21	4	19	38	8	21.1	28	2	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.079545455	1.079545455	1	1.093264249	1.093264249	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000349	1	1.67E-11	1	0.008668191	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	49687716	G	A	PRPH	CCDS8783.1	r.232g>a	c.?	p.?	5'UTR variant	20	0	0	19	2	10.5	13	6	46.2	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.596590909	0.596590909	1	2.393782383	2.393782383	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.004039874	1	2.6E-11	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	53611275	G	C	RARG	CCDS8850.1	r.?	-	-	intronic	15	0	0	13	3	23.1	18	0	0	27	1	3.7	236	0	0	115	12	10.4	62	14	22.6	66	2	3	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.3125	1.3125	1	0	0	1	0.685185185	0.685185185	1	0.590909091	0.590909091	1	1.170984456	1.170984456	1	0.555555556	0.555555556	1	5	5	1	1	0.0000344	9.35E-13	1	1.42E-19	0.126579904	0.043431387	YES	1_1	0_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	12	53813919	T	A	SP1	CCDS8857.1	r.?	-	-	downstream	34	0	0	21	4	19	34	9	26.5	25	1	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.079545455	1.079545455	1	1.373056995	1.373056995	1	0.740740741	0.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000349	1	9.15E-14	1	0.117779757	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	55398642	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	50	7	14	36	7	19.4	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.795454545	0.795454545	1	1.005181347	1.005181347	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.46E-09	1	5.74E-10	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	55723782	G	A	OR6C3	CCDS31819.1	r.?	-	-	upstream	31	0	0	45	7	15.6	35	4	11.4	24	1	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.886363636	0.886363636	1	0.590673575	0.590673575	1	0.777777778	0.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000003	1	0.0000289	1	0.113346489	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	56446825	T	G	-	-	-	-	-	-	18	0	0	30	2	6.7	28	8	28.6	28	3	10.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.380681818	0.380681818	1	1.481865285	1.481865285	1	1.981481481	1.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.009909649	1	1.11E-12	1	0.000372895	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	57535801	C	T	ENSG00000123384	CCDS8932.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	17	7	41.2	24	6	25	30	2	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.340909091	2.340909091	1	1.295336788	1.295336788	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.45E-12	1	1.95E-09	1	0.009909649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	59625947	T	C	-	-	-	-	-	-	34	0	0	45	8	17.8	35	5	14.3	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.011363636	1.011363636	1	0.740932642	0.740932642	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.14E-11	1	0.000000895	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	59808891	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	35	5	14.3	41	9	22	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.139896373	1.139896373	1	0.462962963	0.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000895	1	5.92E-13	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	61450582	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	38	9	23.7	35	5	14.3	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.346590909	1.346590909	1	0.740932642	0.740932642	1	0.388888889	0.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.79E-13	1	0.000000895	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	61724680	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	44	5	11.4	44	8	18.2	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.647727273	0.647727273	1	0.943005181	0.943005181	1	2.148148148	2.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000288	1	5.9E-11	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	63238513	C	T	PPM1H	CCDS44934.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	43	5	11.6	33	7	21.2	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.659090909	0.659090909	1	1.098445596	1.098445596	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000257	1	2.98E-10	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	63507690	G	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	33	3	9.1	41	5	12.2	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.517045455	0.517045455	1	0.632124352	0.632124352	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000609557	1	0.00000202	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	65657749	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	36	4	11.1	31	6	19.4	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.630681818	0.630681818	1	1.005181347	1.005181347	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000324	1	1.03E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	66160620	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	37	6	16.2	48	7	14.6	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.920454545	0.920454545	1	0.756476684	0.756476684	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.18E-08	1	4.81E-09	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	66924342	C	T	GRIP1	CCDS41807.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	44	3	6.8	40	6	15	28	2	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.386363636	0.386363636	1	0.777202073	0.777202073	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00142027	1	5.18E-08	1	0.008668191	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	67814552	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	36	2	5.6	43	11	25.6	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.318181818	0.318181818	1	1.32642487	1.32642487	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.014070883	1	2.42E-16	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	67945837	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	39	8	20.5	42	3	7.1	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.164772727	1.164772727	1	0.367875648	0.367875648	1	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.09E-11	1	0.001240292	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	68286349	C	T	-	-	-	-	-	-	18	0	0	32	6	18.8	34	6	17.6	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.068181818	1.068181818	1	0.911917098	0.911917098	1	2.148148148	2.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.27E-08	1	1.86E-08	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	68847019	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	40	6	15	32	5	15.6	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852272727	0.852272727	1	0.808290155	0.808290155	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.18E-08	1	0.000000562	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	69008551	G	C	RAP1B	CCDS8984.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	37	10	27	39	8	20.5	37	5	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.534090909	1.534090909	1	1.062176166	1.062176166	1	2.5	2.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.01E-15	1	2.09E-11	1	0.00000119	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	71548197	T	A	TSPAN8	CCDS8999.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	35	5	14.3	33	10	30.3	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.569948187	1.569948187	1	0.981481481	0.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000895	1	8.14E-16	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	71844857	G	A	LGR5	CCDS9000.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	53	7	13.2	57	14	24.6	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.75	0.75	1	1.274611399	1.274611399	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.85E-09	1	3.84E-20	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	71957516	A	G	LGR5	CCDS9000.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	26	2	7.7	35	7	20	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.4375	0.4375	1	1.03626943	1.03626943	1	0.944444444	0.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.007502227	1	4.65E-10	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	72840702	C	A	TRHDE	CCDS9004.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	44	8	18.2	51	9	17.6	48	3	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	0.911917098	0.911917098	1	1.148148148	1.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.9E-11	1	4.92E-12	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	73191438	A	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	44	6	13.6	45	9	20	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.772727273	0.772727273	1	1.03626943	1.03626943	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.37E-08	1	1.47E-12	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	74005352	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	27	6	22.2	40	7	17.5	31	4	12.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	0.906735751	0.906735751	1	2.388888889	2.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.23E-09	1	1.26E-09	1	0.0000177	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	74693032	G	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	24	1	4.2	33	5	15.2	36	1	2.8	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.238636364	0.238636364	1	0.787564767	0.787564767	1	0.518518519	0.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.113346489	1	0.00000066	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	74936835	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	35	7	20	48	12	25	50	4	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	1.295336788	1.295336788	1	1.481481481	1.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	4.65E-10	1	1.44E-17	1	0.000119787	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	75047357	A	G	-	-	-	-	-	-	32	0	0	45	13	28.9	46	11	23.9	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.642045455	1.642045455	1	1.238341969	1.238341969	1	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	5.18134715	5.18134715	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.68E-20	1	5.55E-16	0.005	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	76603360	C	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	35	6	17.1	43	9	20.9	49	5	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.971590909	0.971590909	1	1.082901554	1.082901554	1	1.888888889	1.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-08	1	9.45E-13	1	0.00000496	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	78147678	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	44	1	2.3	48	7	14.6	35	3	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.130681818	0.130681818	1	0.756476684	0.756476684	1	1.592592593	1.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.197923942	1	4.81E-09	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	78553754	C	A	NAV3	CCDS41815.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	29	2	6.9	40	3	7.5	40	5	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.392045455	0.392045455	1	0.388601036	0.388601036	1	2.314814815	2.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.009279585	1	0.001075403	1	0.00000178	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	80931981	A	G	PTPRQ	ENST00000418574	r.?	-	-	intronic	35	0	0	35	5	14.3	41	9	22	50	6	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.139896373	1.139896373	1	2.222222222	2.222222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000895	1	5.92E-13	1	0.000000206	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	82363574	A	G	-	-	-	-	-	-	46	0	0	45	15	33.3	30	7	23.3	56	3	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.892045455	1.892045455	1	1.207253886	1.207253886	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.14E-24	1	1.44E-10	1	0.00284314	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	82640886	A	T	-	-	-	-	-	-	16	0	0	47	10	21.3	36	6	16.7	28	2	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.210227273	1.210227273	1	0.865284974	0.865284974	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.27E-14	1	2.68E-08	1	0.008668191	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	82900073	T	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	42	7	16.7	31	6	19.4	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	1.005181347	1.005181347	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.81E-09	1	1.03E-08	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	83411614	C	T	TMTC2	CCDS9025.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	29	6	20.7	20	2	10	30	1	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.176136364	1.176136364	1	0.518134715	0.518134715	1	0.611111111	0.611111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.72E-09	1	0.004473894	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	84001075	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	37	7	18.9	44	9	20.5	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.073863636	1.073863636	1	1.062176166	1.062176166	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.05E-10	1	1.18E-12	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	84922715	T	C	-	-	-	-	-	-	42	0	0	45	7	15.6	47	11	23.4	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.886363636	0.886363636	1	1.212435233	1.212435233	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000003	1	7.21E-16	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	85078341	C	T	-	-	-	-	-	-	16	0	0	27	5	18.5	12	1	8.3	47	5	10.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.051136364	1.051136364	1	0.430051813	0.430051813	1	1.962962963	1.962962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000023	1	0.058377193	1	0.00000402	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	85389403	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	32	5	15.6	44	6	13.6	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.886363636	0.886363636	1	0.704663212	0.704663212	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000562	1	9.37E-08	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	85389423	G	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	32	7	21.9	47	9	19.1	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.244318182	1.244318182	1	0.989637306	0.989637306	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.36E-10	1	2.24E-12	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	86584145	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	49	10	20.4	47	11	23.4	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.159090909	1.159090909	1	1.212435233	1.212435233	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.72E-14	1	7.21E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	86770436	A	G	-	-	-	-	-	-	44	0	0	33	4	12.1	36	6	16.7	26	1	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.6875	0.6875	1	0.865284974	0.865284974	1	0.703703704	0.703703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000228	1	2.68E-08	1	0.122190858	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	89210169	A	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	45	8	17.8	48	7	14.6	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.011363636	1.011363636	1	0.756476684	0.756476684	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.14E-11	1	4.81E-09	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	89380841	T	C	-	-	-	-	-	-	31	0	0	32	8	25	33	11	33.3	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	1.725388601	1.725388601	1	0.814814815	0.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.69E-12	1	8.54E-18	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	89473890	A	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	57	11	19.3	47	8	17	59	1	1.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.096590909	1.096590909	1	0.880829016	0.880829016	1	0.314814815	0.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.29E-15	1	1.03E-10	1	0.256019138	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	91210021	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	47	7	14.9	52	12	23.1	38	5	13.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.846590909	0.846590909	1	1.196891192	1.196891192	1	2.444444444	2.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.12E-09	1	4.19E-17	1	0.00000137	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	91579124	C	A	DCN	CCDS9039.1	r.?	-	-	upstream	27	0	0	44	10	22.7	44	8	18.2	50	2	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.289772727	1.289772727	1	0.943005181	0.943005181	1	0.740740741	0.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.08E-14	1	5.9E-11	1	0.026131524	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	91737013	C	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	54	9	16.7	47	12	25.5	42	4	9.5	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	1.321243523	1.321243523	1	1.759259259	1.759259259	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.48E-12	1	1.09E-17	1	0.0000601	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	94323394	C	T	AC025261.1	ENST00000505974	r.?	-	-	intronic	32	0	0	45	4	8.9	36	9	25	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.505681818	0.505681818	1	1.295336788	1.295336788	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000791	1	1.63E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	94418825	C	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	42	9	21.4	29	2	6.9	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.215909091	1.215909091	1	0.357512953	0.357512953	1	0.981481481	0.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.51E-13	1	0.009279585	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	95129592	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	37	8	21.6	40	4	10	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.227272727	1.227272727	1	0.518134715	0.518134715	1	0.407407407	0.407407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.33E-11	1	0.0000495	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	95868818	A	C	METAP2	CCDS9052.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	28	2	7.1	35	8	22.9	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.403409091	0.403409091	1	1.186528497	1.186528497	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.008668191	1	8.15E-12	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	97515224	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	30	9	30	37	7	18.9	37	2	5.4	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.704545455	1.704545455	1	0.979274611	0.979274611	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.54E-14	1	7.05E-10	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	97599994	A	G	-	-	-	-	-	-	42	0	0	42	9	21.4	31	8	25.8	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.215909091	1.215909091	1	1.336787565	1.336787565	1	1.814814815	1.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.51E-13	1	2.78E-12	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	97911203	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	43	7	16.3	46	11	23.9	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.926136364	0.926136364	1	1.238341969	1.238341969	1	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.15E-09	1	5.55E-16	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	98469636	G	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	43	4	9.3	41	8	19.5	52	3	5.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.528409091	0.528409091	1	1.010362694	1.010362694	1	1.074074074	1.074074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000066	1	3.22E-11	1	0.002300591	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	99920924	G	C	ANKS1B	ENST00000329257	r.?	-	-	intronic	28	0	0	43	5	11.6	40	9	22.5	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.659090909	0.659090909	1	1.165803109	1.165803109	1	0.777777778	0.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000257	1	4.64E-13	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	100917457	C	A	NR1H4	CCDS9078.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	28	6	21.4	31	7	22.6	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.215909091	1.215909091	1	1.170984456	1.170984456	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.36E-09	1	1.85E-10	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	101214940	A	T	ANO4	CCDS31884.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	38	6	15.8	34	8	23.5	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.897727273	0.897727273	1	1.21761658	1.21761658	1	0.833333333	0.833333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.76E-08	1	6.32E-12	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	102011379	T	A	MYBPC1	CCDS9083.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	33	7	21.2	35	8	22.9	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.204545455	1.204545455	1	1.186528497	1.186528497	1	0.814814815	0.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.98E-10	1	8.15E-12	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	102268981	A	C	DRAM1	CCDS41823.1	r.?	-	-	upstream	23	0	0	34	5	14.7	33	8	24.2	28	2	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.835227273	0.835227273	1	1.25388601	1.25388601	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000771	1	4.85E-12	1	0.008668191	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	103191221	G	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	33	7	21.2	33	9	27.3	41	5	12.2	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.204545455	1.204545455	1	1.414507772	1.414507772	1	2.259259259	2.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.98E-10	1	6.76E-14	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	103797481	G	A	C12orf42	CCDS44963.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	26	4	15.4	36	9	25	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.875	0.875	1	1.295336788	1.295336788	1	1.944444444	1.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000856	1	1.63E-13	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	103883271	G	T	C12orf42	CCDS44963.1	r.?	-	-	intronic	18	0	0	28	1	3.6	39	6	15.4	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.204545455	0.204545455	1	0.797927461	0.797927461	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.130947004	1	4.43E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	103948421	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	48	1	2.1	44	5	11.4	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.119318182	0.119318182	1	0.590673575	0.590673575	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.213845552	1	0.00000288	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	104252329	G	A	ENSG00000187809	ENST00000434328	r.?	-	-	intronic	28	0	0	35	6	17.1	36	9	25	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.971590909	0.971590909	1	1.295336788	1.295336788	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-08	1	1.63E-13	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	104487674	C	T	HCFC2	CCDS9097.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	38	6	15.8	33	5	15.2	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.897727273	0.897727273	1	0.787564767	0.787564767	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.76E-08	1	0.00000066	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	106066687	C	G	-	-	-	-	-	-	25	0	0	27	2	7.4	18	4	22.2	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.420454545	0.420454545	1	1.150259067	1.150259067	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00807567	1	0.00000181	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	108763278	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	29	4	13.8	27	4	14.8	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.784090909	0.784090909	1	0.766839378	0.766839378	1	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000134	1	0.00001	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	109719749	G	A	FOXN4	CCDS9126.2	r.?	-	-	intronic	19	0	0	14	2	14.3	22	5	22.7	49	3	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.176165803	1.176165803	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.002185852	1	7.67E-08	1	0.001939399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	109847843	A	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	21	3	14.3	37	6	16.2	30	4	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	0.839378238	0.839378238	1	2.462962963	2.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000155401	1	3.18E-08	1	0.0000154	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	113785282	G	C	-	-	-	-	-	-	43	0	0	38	5	13.2	41	9	22	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.75	0.75	1	1.139896373	1.139896373	1	0.555555556	0.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000137	1	5.92E-13	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	115644085	T	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	39	9	23.1	28	3	10.7	35	5	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.3125	1.3125	1	0.554404145	0.554404145	1	2.648148148	2.648148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.62E-13	1	0.000372895	1	0.000000895	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	115890940	T	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	25	6	24	21	1	4.8	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.363636364	1.363636364	1	0.248704663	0.248704663	1	1.722222222	1.722222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	0.099912572	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	116273852	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	30	3	10	33	7	21.2	25	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.568181818	0.568181818	1	1.098445596	1.098445596	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000458697	1	2.98E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	116279583	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	31	2	6.5	37	6	16.2	43	2	4.7	1	0	0	8	0	0	6	2	33.3	3	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.369318182	0.369318182	1	0.839378238	0.839378238	1	0.87037037	0.87037037	1	0	0	1	1.725388601	1.725388601	1	0	0	1	5	5	1	1	0.010558179	1	3.18E-08	0.000370028	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	116363602	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	26	6	23.1	33	4	12.1	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.3125	1.3125	1	0.626943005	0.626943005	1	1.740740741	1.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.3E-09	1	0.0000228	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	117180984	T	A	RNFT2	CCDS44987.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	21	2	9.5	26	6	23.1	17	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.539772727	0.539772727	1	1.196891192	1.196891192	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.004928472	1	3.3E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	117602977	C	A	FBXO21	CCDS9184.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	27	3	11.1	25	4	16	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.630681818	0.630681818	1	0.829015544	0.829015544	1	0.518518519	0.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000334187	1	0.00000727	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	122237470	G	A	-	-	-	-	-	-	11	0	0	10	0	0	8	4	50	21	4	19	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	2.590673575	2.590673575	1	3.518518519	3.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1	1	4.31E-08	1	0.00000349	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	123851176	C	G	-	-	-	-	-	-	15	0	0	5	0	0	12	1	8.3	18	3	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.430051813	0.430051813	1	3.092592593	3.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1	1	0.058377193	1	0.0000964	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	124313014	G	C	DNAH10	CCDS9255.2	r.?	-	-	intronic	28	0	0	30	5	16.7	44	6	13.6	25	1	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	0.704663212	0.704663212	1	0.740740741	0.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000401	1	9.37E-08	1	0.117779757	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	124363670	C	T	DNAH10	CCDS9255.2	r.?	-	-	intronic	32	0	0	34	10	29.4	46	6	13	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.670454545	1.670454545	1	0.67357513	0.67357513	1	0.555555556	0.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.15E-15	1	0.000000123	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	124632906	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	39	8	20.5	30	6	20	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.164772727	1.164772727	1	1.03626943	1.03626943	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.09E-11	1	8.37E-09	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	125048622	G	A	NCOR2	ENST00000458234	r.?	-	-	intronic	24	0	0	26	7	26.9	29	7	24.1	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.528409091	1.528409091	1	1.248704663	1.248704663	1	1.814814815	1.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.73E-11	1	1.11E-10	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	126016971	G	T	TMEM132B	CCDS41859.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	40	1	2.5	38	6	15.8	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.142045455	0.142045455	1	0.81865285	0.81865285	1	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.181679879	1	3.76E-08	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	126545629	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	36	9	25	34	7	20.6	50	5	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	1.067357513	1.067357513	1	1.851851852	1.851851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.63E-13	1	3.73E-10	1	0.00000549	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	126697362	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	42	7	16.7	39	6	15.4	60	4	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	0.797927461	0.797927461	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.81E-09	1	4.43E-08	1	0.000243755	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	126946509	C	T	ENSG00000214043	ENST00000397346	r.?	-	-	intronic	39	0	0	38	4	10.5	37	11	29.7	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.596590909	0.596590909	1	1.538860104	1.538860104	1	1.148148148	1.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000403	1	3.7E-17	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	126969518	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	26	5	19.2	30	9	30	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.090909091	1.090909091	1	1.554404145	1.554404145	1	0.555555556	0.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000188	1	2.54E-14	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	127690392	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	23	3	13	37	10	27	27	2	7.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.738636364	0.738636364	1	1.398963731	1.398963731	1	1.37037037	1.37037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000205387	1	3.01E-15	1	0.00807567	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	127989955	T	A	-	-	-	-	-	-	17	0	0	32	3	9.4	34	6	17.6	29	2	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.534090909	0.534090909	1	0.911917098	0.911917098	1	1.277777778	1.277777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000556213	1	1.86E-08	1	0.009279585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	128056295	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	28	5	17.9	26	5	19.2	27	2	7.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.017045455	1.017045455	1	0.994818653	0.994818653	1	1.37037037	1.37037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000279	1	0.000000188	1	0.00807567	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	128209976	T	C	-	-	-	-	-	-	30	0	0	42	10	23.8	37	6	16.2	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.352272727	1.352272727	1	0.839378238	0.839378238	1	0.925925926	0.925925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.24E-14	1	3.18E-08	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	128712600	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	37	0	0	41	5	12.2	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.632124352	0.632124352	1	0.388888889	0.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.00000202	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	128913874	C	T	TMEM132C	CCDS45009.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	42	10	23.8	46	2	4.3	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.352272727	1.352272727	1	0.222797927	0.222797927	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	1.24E-14	1	0.022369545	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	129371445	C	T	GLT1D1	CCDS9265.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	32	2	6.2	30	9	30	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.352272727	0.352272727	1	1.554404145	1.554404145	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.011224977	1	2.54E-14	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	129612251	C	G	TMEM132D	CCDS9266.1	r.?	-	-	intronic	20	0	0	20	3	15	22	4	18.2	27	1	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.852272727	0.852272727	1	0.943005181	0.943005181	1	0.685185185	0.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0001337	1	0.00000425	1	0.126579904	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	129906426	A	T	TMEM132D	CCDS9266.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	44	3	6.8	49	6	12.2	31	2	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.386363636	0.386363636	1	0.632124352	0.632124352	1	1.203703704	1.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00142027	1	0.000000182	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	130052427	C	A	TMEM132D	CCDS9266.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	33	8	24.2	35	5	14.3	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.375	1.375	1	0.740932642	0.740932642	1	0.888888889	0.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-12	1	0.000000895	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	130131636	C	T	TMEM132D	CCDS9266.1	r.?	-	-	intronic	20	0	0	34	8	23.5	37	9	24.3	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.335227273	1.335227273	1	1.259067358	1.259067358	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.32E-12	1	2.14E-13	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	130252594	C	A	TMEM132D	CCDS9266.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	38	2	5.3	33	6	18.2	35	3	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.301136364	0.301136364	1	0.943005181	0.943005181	1	1.592592593	1.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.015598339	1	1.54E-08	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	130491835	G	A	-	-	-	-	-	-	17	0	0	33	6	18.2	29	5	17.2	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	0.89119171	0.89119171	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.54E-08	1	0.000000336	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	130560324	A	T	-	-	-	-	-	-	14	0	0	29	6	20.7	22	6	27.3	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.176136364	1.176136364	1	1.414507772	1.414507772	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.72E-09	1	1.09E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	130719475	G	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	27	4	14.8	25	2	8	33	4	12.1	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.840909091	0.840909091	1	0.414507772	0.414507772	1	2.240740741	2.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00001	1	0.006948068	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	130727583	G	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	17	2	11.8	24	6	25	29	3	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.670454545	0.670454545	1	1.295336788	1.295336788	1	1.907407407	1.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.003234386	1	1.95E-09	1	0.000414371	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	130755448	C	T	-	-	-	-	-	-	10	0	0	16	2	12.5	21	4	19	28	1	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	0.984455959	0.984455959	1	0.666666667	0.666666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.002863359	1	0.00000349	1	0.130947004	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	130963059	C	T	RIMBP2	CCDS31925.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	16	5	31.2	27	6	22.2	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.772727273	1.772727273	1	1.150259067	1.150259067	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000013	1	4.23E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	131016398	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	36	7	19.4	35	6	17.1	34	2	5.9	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.102272727	1.102272727	1	0.886010363	0.886010363	1	1.092592593	1.092592593	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.74E-10	1	2.24E-08	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	12	132042243	G	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	33	8	24.2	37	4	10.8	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	1	1	1	1	1	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.375	1.375	1	0.559585492	0.559585492	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-12	1	0.0000362	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	19020255	C	T	-	-	-	-	-	-	5	0	0	9	0	0	2	0	0	16	4	25	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000108	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	19575994	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	34	17	50	45	20	44.4	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.840909091	1.420454545	2	2.300518135	1.150259067	2	1.611111111	1.611111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.64E-30	1	2.68E-34	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	19604123	C	A	ENSG00000187721	ENST00000340284	r.?	-	-	intronic	30	0	0	27	9	33.3	31	16	51.6	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.892045455	0.946022727	2	2.67357513	1.336787565	2	1.944444444	1.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.44E-15	1	4.27E-29	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	21778878	G	A	-	-	-	-	-	-	16	0	0	23	1	4.3	24	6	25	28	1	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.244318182	0.244318182	1	1.295336788	1.295336788	1	0.666666667	0.666666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.108890944	1	1.95E-09	1	0.130947004	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	22341005	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	31	4	12.9	47	13	27.7	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.732954545	0.732954545	1	1.435233161	1.435233161	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000177	1	1.47E-19	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	24157297	C	G	TNFRSF19	CCDS9301.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	38	7	18.4	39	9	23.1	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.045454545	1.045454545	1	1.196891192	1.196891192	1	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-10	1	3.62E-13	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	24544131	T	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	31	9	29	35	18	51.4	31	2	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.647727273	1.647727273	1	2.663212435	1.331606218	2	1.203703704	1.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.57E-14	1	1.6E-32	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	28304296	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	38	7	18.4	30	5	16.7	34	6	17.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.045454545	1.045454545	1	0.865284974	0.865284974	1	3.259259259	1.62962963	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-10	1	0.000000401	1	1.86E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	28466687	G	A	AL390738.2	ENST00000499662	r.?	-	-	intronic	17	0	0	45	1	2.2	30	2	6.7	30	5	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.125	0.125	1	0.347150259	0.347150259	1	3.092592593	1.546296296	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.201934322	1	0.009909649	1	0.000000401	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	28535493	G	T	CDX2	CCDS9328.1	r.?	-	-	downstream	11	0	0	17	3	17.6	7	4	57.1	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	2.958549223	1.479274611	2	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000807	1	2.16E-08	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	29343392	T	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	37	7	18.9	42	10	23.8	53	3	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.073863636	1.073863636	1	1.233160622	1.233160622	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.05E-10	1	1.24E-14	1	0.002429596	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	29503834	C	T	-	-	-	-	-	-	44	0	0	38	2	5.3	45	5	11.1	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.301136364	0.301136364	1	0.575129534	0.575129534	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.015598339	1	0.00000323	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	29533208	A	G	-	-	-	-	-	-	26	0	0	31	13	41.9	35	11	31.4	37	4	10.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.380681818	1.190340909	2	1.626943005	1.626943005	1	2	2	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.32E-22	1	1.82E-17	1	0.0000362	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	29792125	T	A	MTUS2	CCDS45022.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	42	6	14.3	29	5	17.2	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	0.89119171	0.89119171	1	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.02E-08	1	0.000000336	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	30810459	G	T	KATNAL1	CCDS31956.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	34	4	11.8	27	7	25.9	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.670454545	0.670454545	1	1.341968912	1.341968912	1	1.740740741	1.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000257	1	6.36E-11	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	33774274	G	A	STARD13	CCDS9350.1	r.?	-	-	intronic	20	0	0	28	8	28.6	31	9	29	40	2	5	0	0	NA	2	2	100	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.625	1.625	1	1.502590674	1.502590674	1	0.925925926	0.925925926	1	5.681818182	2.840909091	2	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.11E-12	0.000025	3.57E-14	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	37251755	G	A	C13orf36	CCDS9358.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	39	11	28.2	49	15	30.6	42	4	9.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.602272727	1.602272727	1	1.585492228	0.792746114	2	1.759259259	1.759259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.2E-17	1	4.1E-23	1	0.0000601	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	37845584	G	C	-	-	-	-	-	-	31	0	0	37	4	10.8	41	9	22	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.613636364	0.613636364	1	1.139896373	1.139896373	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000362	1	5.92E-13	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	38310966	A	T	TRPC4	CCDS45037.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	46	6	13	40	7	17.5	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.738636364	0.738636364	1	0.906735751	0.906735751	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000123	1	1.26E-09	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	39417975	A	T	FREM2	CCDS31960.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	32	5	15.6	42	8	19	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.886363636	0.886363636	1	0.984455959	0.984455959	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000562	1	3.96E-11	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	40049982	G	A	LHFP	CCDS9369.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	33	3	9.1	33	7	21.2	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.517045455	0.517045455	1	1.098445596	1.098445596	1	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000609557	1	2.98E-10	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	40103378	G	A	LHFP	CCDS9369.1	r.?	-	-	intronic	18	0	0	34	4	11.8	33	6	18.2	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.670454545	0.670454545	1	0.943005181	0.943005181	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000257	1	1.54E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	41235250	T	C	FOXO1	CCDS9371.1	r.?	-	-	intronic	18	0	0	28	14	50	26	7	26.9	31	8	25.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.840909091	1.420454545	2	1.393782383	1.393782383	1	4.777777778	2.388888889	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.29E-25	1	4.73E-11	1	2.78E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	46669507	C	T	CPB2	CCDS9401.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	33	3	9.1	31	6	19.4	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.517045455	0.517045455	1	1.005181347	1.005181347	1	0.574074074	0.574074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000609557	1	1.03E-08	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	47634359	A	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	38	11	28.9	33	10	30.3	37	4	10.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.642045455	1.642045455	1	1.569948187	1.569948187	1	2	2	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.19E-17	1	8.14E-16	1	0.0000362	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	50089120	G	A	PHF11	CCDS41887.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	34	6	17.6	28	4	14.3	26	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	0.740932642	0.740932642	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.86E-08	1	0.0000116	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	51780509	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	24	9	37.5	31	13	41.9	30	2	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.130681818	1.065340909	2	2.170984456	1.085492228	2	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.39E-15	1	2.32E-22	1	0.009909649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	52173531	G	T	WDFY2	CCDS9429.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	36	5	13.9	40	5	12.5	51	2	3.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.789772727	0.789772727	1	0.647668394	0.647668394	1	0.722222222	0.722222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000104	1	0.00000178	1	0.027109304	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	52187112	G	T	WDFY2	CCDS9429.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	50	5	10	35	4	11.4	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.568181818	0.568181818	1	0.590673575	0.590673575	1	1.425925926	1.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000549	1	0.0000289	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	52427207	C	T	ENSG00000233500	ENST00000456762	r.?	-	-	intronic	19	0	0	25	8	32	35	14	40	37	5	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.818181818	1.818181818	1	2.07253886	1.03626943	2	2.5	1.25	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.92E-13	1	1.28E-23	1	0.00000119	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	54387530	C	T	-	-	-	-	-	-	13	0	0	27	6	22.2	29	5	17.2	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	0.89119171	0.89119171	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.23E-09	1	0.000000336	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	54655366	C	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	46	9	19.6	33	18	54.5	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.113636364	1.113636364	1	2.823834197	1.411917098	2	0.37037037	0.37037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.82E-12	1	3.68E-33	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	55312447	C	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	40	16	40	40	10	25	50	4	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.272727273	1.136363636	2	1.295336788	1.295336788	1	1.481481481	1.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.56E-27	1	7.22E-15	1	0.000119787	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	55828965	A	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	54	1	1.9	44	7	15.9	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.107954545	0.107954545	1	0.823834197	0.823834197	1	0.777777778	0.777777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.237137336	1	2.55E-09	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	56158553	T	C	-	-	-	-	-	-	34	0	0	43	13	30.2	45	13	28.9	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.715909091	0.857954545	2	1.497409326	1.497409326	1	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.88E-20	1	7.68E-20	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	57134663	T	G	-	-	-	-	-	-	23	0	0	45	2	4.4	39	7	17.9	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.25	0.25	1	0.92746114	0.92746114	1	0.888888889	0.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.021467209	1	1.04E-09	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	59519732	C	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	49	12	24.5	48	19	39.6	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.392045455	1.392045455	1	2.051813472	1.025906736	2	0.925925926	0.925925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.9E-17	1	1.92E-31	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	62669861	G	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	44	10	22.7	29	5	17.2	42	5	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.289772727	1.289772727	1	0.89119171	0.89119171	1	2.203703704	2.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.08E-14	1	0.000000336	1	0.00000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	62958670	T	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	41	10	24.4	36	15	41.7	51	6	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.386363636	1.386363636	1	2.160621762	1.080310881	2	2.185185185	1.092592593	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.51E-15	1	1.54E-25	1	0.000000232	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	63474809	T	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	54	21	38.9	48	20	41.7	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.210227273	1.105113636	2	2.160621762	1.080310881	2	1.611111111	1.611111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.12E-34	1	1.4E-33	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	63860599	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	25	6	24	42	14	33.3	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.363636364	1.363636364	1	1.725388601	0.862694301	2	0.833333333	0.833333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	2.83E-22	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	64089352	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	58	19	32.8	50	19	38	47	6	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.863636364	0.931818182	2	1.968911917	0.984455959	2	2.37037037	1.185185185	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.5E-29	1	5E-31	1	0.000000141	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	64818601	A	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	35	13	37.1	43	15	34.9	36	5	13.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.107954545	1.053977273	2	1.808290155	0.904145078	2	2.574074074	1.287037037	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.63E-21	1	4.05E-24	1	0.00000104	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	65415684	A	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	37	8	21.6	45	14	31.1	35	3	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.227272727	1.227272727	1	1.611398964	0.805699482	2	1.592592593	1.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.33E-11	1	8.81E-22	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	65994102	C	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	51	10	19.6	46	10	21.7	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.113636364	1.113636364	1	1.124352332	1.124352332	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-13	1	3.38E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	66551888	T	C	-	-	-	-	-	-	26	0	0	37	2	5.4	39	4	10.3	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.306818182	0.306818182	1	0.533678756	0.533678756	1	0.518518519	0.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.014826063	1	0.0000447	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	67117484	C	T	PCDH9	CCDS9443.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	57	12	21.1	40	11	27.5	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.198863636	1.198863636	1	1.424870466	1.424870466	1	1.462962963	1.462962963	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.4E-16	1	9.88E-17	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	67940767	A	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	46	16	34.8	42	18	42.9	47	9	19.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.977272727	0.988636364	2	2.222797927	1.111398964	2	3.537037037	1.768518519	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.31E-25	1	1.2E-30	1	2.24E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	68937183	C	A	-	-	-	-	-	-	13	0	0	17	5	29.4	19	5	26.3	15	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.670454545	1.670454545	1	1.362694301	1.362694301	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.84E-08	1	3.43E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	69689596	C	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	37	4	10.8	33	6	18.2	30	1	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.613636364	0.613636364	1	0.943005181	0.943005181	1	0.611111111	0.611111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000362	1	1.54E-08	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	69890495	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	46	16	34.8	40	17	42.5	52	8	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.977272727	0.988636364	2	2.202072539	1.101036269	2	2.851851852	1.425925926	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.31E-25	1	6.07E-29	1	2.42E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	70384528	C	T	KLHL1	CCDS9445.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	39	16	41	40	14	35	35	4	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.329545455	1.164772727	2	1.813471503	0.906735751	2	2.111111111	2.111111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.16E-27	1	1.25E-22	1	0.0000289	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	71085357	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	25	4	16	25	6	24	54	3	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.909090909	0.909090909	1	1.243523316	1.243523316	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000727	1	2.55E-09	1	0.00256299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	72749603	G	T	-	-	-	-	-	-	51	0	0	55	9	16.4	41	16	39	48	5	10.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.931818182	0.931818182	1	2.020725389	1.010362694	2	1.925925926	1.925925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.01E-11	1	1.4E-26	1	0.00000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	74740510	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	41	11	26.8	35	4	11.4	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.522727273	1.522727273	1	0.590673575	0.590673575	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	1.34E-16	1	0.0000289	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	76075475	C	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	24	3	12.5	37	6	16.2	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	0.839378238	0.839378238	1	0.888888889	0.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000233853	1	3.18E-08	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	76381480	A	G	LMO7	CCDS9454.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	40	12	30	50	19	38	34	4	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.704545455	0.852272727	2	1.968911917	0.984455959	2	2.185185185	2.185185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.2E-18	1	5E-31	1	0.0000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	77364970	T	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	45	9	20	34	5	14.7	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	0.761658031	0.761658031	1	0.814814815	0.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-12	1	0.000000771	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	77729941	C	G	MYCBP2	CCDS31994.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	41	6	14.6	50	8	16	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.829545455	0.829545455	1	0.829015544	0.829015544	1	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.05E-08	1	1.74E-10	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	78347733	G	C	-	-	-	-	-	-	19	0	0	40	3	7.5	41	12	29.3	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.426136364	0.426136364	1	1.518134715	1.518134715	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001075403	1	1.69E-18	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	78486017	T	A	EDNRB	CCDS9461.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	30	8	26.7	48	21	43.8	37	4	10.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.517045455	1.517045455	1	2.269430052	1.134715026	2	2	2	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.07E-12	1	9.35E-36	1	0.0000362	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	80909052	T	A	SPRY2	CCDS9463.1	r.?	-	-	downstream	34	0	0	41	1	2.4	43	4	9.3	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.136363636	0.136363636	1	0.481865285	0.481865285	1	0.592592593	0.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.18577148	1	0.000066	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	81499662	C	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	48	8	16.7	49	9	18.4	50	3	6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	0.953367876	0.953367876	1	1.111111111	1.111111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.23E-10	1	3.35E-12	1	0.002055544	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	81661358	G	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	22	7	31.8	16	5	31.2	37	5	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.806818182	1.806818182	1	1.616580311	1.616580311	1	2.5	1.25	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.25E-11	1	0.000000013	1	0.00000119	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	83081841	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	40	14	35	46	18	39.1	42	5	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.988636364	0.994318182	2	2.025906736	1.012953368	2	2.203703704	2.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.25E-22	1	9.41E-30	1	0.00000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	84312335	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	50	8	16	35	9	25.7	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.909090909	0.909090909	1	1.331606218	1.331606218	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.74E-10	1	1.23E-13	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	84528294	T	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	45	8	17.8	46	7	15.2	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.011363636	1.011363636	1	0.787564767	0.787564767	1	0.87037037	0.87037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.14E-11	1	3.53E-09	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	86196372	A	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	33	9	27.3	44	9	20.5	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.551136364	1.551136364	1	1.062176166	1.062176166	1	1.462962963	1.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.76E-14	1	1.18E-12	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	87061563	G	A	-	-	-	-	-	-	16	0	0	26	10	38.5	28	6	21.4	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.1875	1.09375	2	1.10880829	1.10880829	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.82E-17	1	5.36E-09	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	87210386	T	G	-	-	-	-	-	-	29	0	0	28	9	32.1	28	11	39.3	50	9	18	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.823863636	0.911931818	2	2.03626943	1.018134715	2	3.333333333	1.666666667	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.24E-14	1	9.7E-19	1	4.07E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	87695278	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	49	11	22.4	27	9	33.3	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.272727273	1.272727273	1	1.725388601	1.725388601	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.19E-15	1	8.44E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	88497115	T	G	-	-	-	-	-	-	25	0	0	42	5	11.9	50	12	24	55	2	3.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.676136364	0.676136364	1	1.243523316	1.243523316	1	0.666666667	0.666666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000228	1	2.49E-17	1	0.031164417	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	90202115	A	C	-	-	-	-	-	-	31	0	0	44	13	29.5	40	15	37.5	47	6	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.676136364	0.838068182	2	1.943005181	0.971502591	2	2.37037037	1.185185185	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.49E-20	1	1.09E-24	1	0.000000141	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	90439025	T	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	39	0	0	45	8	17.8	59	0	0	58	0	0	221	0	0	228	28	12.3	328	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.922279793	0.922279793	1	0	0	1	0	0	1	0.637305699	0.637305699	1	0	0	1	2	2	1	1	1	1	7.14E-11	8.67E-30	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	13	91131814	C	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	33	15	45.5	29	11	37.9	46	8	17.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.585227273	1.292613636	2	1.96373057	0.981865285	2	3.222222222	1.611111111	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.91E-26	1	1.56E-18	1	8.61E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	91267933	A	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	33	9	27.3	29	11	37.9	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.551136364	1.551136364	1	1.96373057	0.981865285	2	1.648148148	1.648148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.76E-14	1	1.56E-18	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	91539120	T	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	46	16	34.8	35	11	31.4	47	12	25.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.977272727	0.988636364	2	1.626943005	1.626943005	1	4.722222222	2.361111111	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.31E-25	1	1.82E-17	1	1.09E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	91709396	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	35	4	11.4	40	7	17.5	59	3	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.647727273	0.647727273	1	0.906735751	0.906735751	1	0.944444444	0.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000289	1	1.26E-09	1	0.003297476	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	93108901	T	A	GPC5	CCDS9468.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	33	7	21.2	40	7	17.5	21	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.204545455	1.204545455	1	0.906735751	0.906735751	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.98E-10	1	1.26E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	93647586	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	49	9	18.4	34	10	29.4	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.045454545	1.045454545	1	1.523316062	1.523316062	1	2.148148148	2.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.35E-12	1	1.15E-15	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	94024057	G	C	GPC6	CCDS9469.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	34	5	14.7	42	5	11.9	52	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.835227273	0.835227273	1	0.616580311	0.616580311	1	0.351851852	0.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000771	1	0.00000228	1	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	94121415	A	G	GPC6	CCDS9469.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	31	9	29	51	12	23.5	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.647727273	1.647727273	1	1.21761658	1.21761658	1	0.388888889	0.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.57E-14	1	3.24E-17	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	94322323	G	A	GPC6	CCDS9469.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	53	2	3.8	46	9	19.6	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.215909091	0.215909091	1	1.015544041	1.015544041	1	0.574074074	0.574074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.029108399	1	1.82E-12	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	95360212	G	A	SOX21	CCDS9473.1	r.?	-	-	downstream	13	0	0	16	4	25	11	2	18.2	40	5	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	0.943005181	0.943005181	1	2.314814815	2.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	0.00000108	1	0.001334363	1	0.00000178	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	95438122	C	A	AL139381.2	ENST00000505287	r.?	-	-	intronic	29	0	0	38	15	39.5	40	16	40	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.244318182	1.122159091	2	2.07253886	1.03626943	2	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.24E-25	1	8.56E-27	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	95920079	T	A	ABCC4	CCDS9474.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	38	8	21.1	27	5	18.5	26	1	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.198863636	1.198863636	1	0.958549223	0.958549223	1	0.703703704	0.703703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.67E-11	1	0.00000023	1	0.122190858	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	96079828	T	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	23	2	8.7	39	4	10.3	31	2	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.494318182	0.494318182	1	0.533678756	0.533678756	1	1.203703704	1.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00589844	1	0.0000447	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	96268326	T	C	DZIP1	CCDS9478.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	35	10	28.6	30	10	33.3	28	4	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.625	1.625	1	1.725388601	0.862694301	2	2.648148148	1.324074074	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.6E-15	1	2.68E-16	1	0.0000116	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	98263479	G	T	-	-	-	-	-	-	13	0	0	31	6	19.4	37	3	8.1	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.102272727	1.102272727	1	0.419689119	0.419689119	1	0.555555556	0.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.03E-08	1	0.000855237	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	100840462	G	A	PCCA	CCDS9496.2	r.?	-	-	intronic	24	0	0	23	5	21.7	18	3	16.7	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.232954545	1.232954545	1	0.865284974	0.865284974	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.75E-08	1	0.0000964	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	102000228	A	T	NALCN	CCDS9498.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	41	13	31.7	44	16	36.4	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.801136364	0.900568182	2	1.886010363	0.943005181	2	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.89E-20	1	5.57E-26	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	102446681	T	A	FGF14	CCDS9500.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	42	10	23.8	30	9	30	26	1	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.352272727	1.352272727	1	1.554404145	1.554404145	1	0.703703704	0.703703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.24E-14	1	2.54E-14	1	0.122190858	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	103822341	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	43	5	11.6	43	9	20.9	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.659090909	0.659090909	1	1.082901554	1.082901554	1	1.648148148	1.648148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000257	1	9.45E-13	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	108275576	G	A	FAM155A	CCDS32006.1	r.?	-	-	intronic	50	0	0	48	5	10.4	47	5	10.6	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.590909091	0.590909091	1	0.549222798	0.549222798	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000447	1	0.00000402	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	108651727	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	40	8	20	42	17	40.5	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	2.098445596	1.049222798	2	1.388888889	1.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.61E-11	1	1.73E-28	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	109480699	G	A	MYO16	CCDS32008.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	47	10	21.3	30	8	26.7	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.210227273	1.210227273	1	1.383419689	1.383419689	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.27E-14	1	2.07E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	109481064	C	A	MYO16	CCDS32008.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	38	7	18.4	34	5	14.7	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.045454545	1.045454545	1	0.761658031	0.761658031	1	2.259259259	2.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-10	1	0.000000771	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	109682624	G	A	MYO16	CCDS32008.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	31	3	9.7	50	10	20	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.551136364	0.551136364	1	1.03626943	1.03626943	1	1.574074074	1.574074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000505952	1	8.36E-14	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	110130826	G	A	-	-	-	-	-	-	17	0	0	31	10	32.3	31	4	12.9	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.835227273	0.917613636	2	0.668393782	0.668393782	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.94E-16	1	0.0000177	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	110979177	G	A	COL4A2	CCDS41907.1	r.?	-	-	intronic	10	0	0	14	7	50	8	6	75	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.840909091	1.420454545	2	3.886010363	1.943005181	2	1.814814815	1.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.6E-13	1	4.34E-13	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	112281394	G	T	ENSG00000204398	ENST00000375713	r.?	-	-	intronic	9	0	0	24	7	29.2	12	3	25	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.659090909	1.659090909	1	1.295336788	1.295336788	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.51E-11	1	0.0000266	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	112694785	T	C	-	-	-	-	-	-	20	0	0	31	4	12.9	30	7	23.3	37	3	8.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.732954545	0.732954545	1	1.207253886	1.207253886	1	1.5	1.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000177	1	1.44E-10	1	0.000855237	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	13	112856825	C	T	AL162499.2	ENST00000507553	r.?	-	-	downstream	6	0	0	8	2	25	8	4	50	37	5	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	2.590673575	1.295336788	2	2.5	1.25	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000686131	1	4.31E-08	1	0.00000119	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	19302035	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	27	3	11.1	31	7	22.6	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.657680113	0.657680113	1	1.170984456	1.170984456	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000334187	1	1.85E-10	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	20200363	C	A	ENSG00000232660	ENST00000426759	r.?	-	-	downstream	35	0	0	44	13	29.5	38	9	23.7	43	1	2.3	32	0	0	148	31	20.9	130	28	21.5	162	7	4.3	TRUE	TRUE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.747888589	1.405927757	1.243227883	1.227979275	1.227979275	1	0.425925926	0.425925926	1	1.238334628	1.238334628	1	1.113989637	1.113989637	1	0.796296296	0.796296296	1	5	5	1	1	5.49E-20	2.07E-40	2.79E-13	5.02E-37	0.193893409	0.0000202	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	14	21155916	A	G	RNASE4	CCDS9555.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	40	7	17.5	34	12	35.3	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.036883061	1.036883061	1	1.829015544	1.829015544	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.26E-09	1	1.21E-19	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	21737676	G	A	HNRNPC	CCDS41915.1	r.?	-	-	upstream	9	0	0	13	2	15.4	11	1	9.1	32	5	15.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.912457094	0.912457094	1	0.471502591	0.471502591	1	2.888888889	2.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.001879825	1	0.05364542	1	0.000000562	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	22324244	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	48	9	18.8	56	11	19.6	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.11390866	1.11390866	1	1.015544041	1.015544041	1	0.87037037	0.87037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.75E-12	1	5.91E-15	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	22726919	G	T	TRAC	ENST00000446346	r.?	-	-	intronic	18	0	0	44	11	25	32	10	31.2	24	2	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.481261516	1.481261516	1	1.616580311	1.616580311	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.22E-16	1	5.7E-16	1	0.006413403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	23030601	C	T	DAD1	CCDS9571.1	r.?	-	-	downstream	33	0	0	36	5	13.9	36	5	13.9	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.823581403	0.823581403	1	0.720207254	0.720207254	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00000104	1	0.00000104	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	26197905	T	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	37	4	10.8	41	8	19.5	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.639904975	0.639904975	1	1.010362694	1.010362694	1	1.722222222	1.722222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.0000362	1	3.22E-11	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	26481968	C	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	50	13	26	33	5	15.2	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.540511977	1.540511977	1	0.787564767	0.787564767	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.65E-19	1	0.00000066	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	27556645	A	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	47	10	21.3	27	7	25.9	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.262034812	1.262034812	1	1.341968912	1.341968912	1	1.722222222	1.722222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.27E-14	1	6.36E-11	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	27808811	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	51	12	23.5	41	6	14.6	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.392385825	1.392385825	1	0.756476684	0.756476684	1	1.944444444	1.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.24E-17	1	6.05E-08	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	28108539	G	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	40	1	2.5	43	6	14	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.148126152	0.148126152	1	0.725388601	0.725388601	1	0.388888889	0.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	0.181679879	1	8.13E-08	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	28420092	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	38	10	26.3	46	11	23.9	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.558287115	1.558287115	1	1.238341969	1.238341969	1	0.925925926	0.925925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.06E-15	1	5.55E-16	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	29472656	A	C	-	-	-	-	-	-	32	0	0	46	13	28.3	42	7	16.7	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.676788036	1.348737475	1.243227883	0.865284974	0.865284974	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.07E-19	1	1.81E-09	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	29769192	T	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	40	3	7.5	47	7	14.9	39	6	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.444378455	0.444378455	1	0.772020725	0.772020725	1	2.851851852	2.851851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.001075403	1	4.12E-09	1	4.43E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	30135384	C	T	PRKD1	CCDS9637.1	r.664g>a	c.434G>A	p.R145H	missense	31	0	0	43	8	18.6	27	6	22.2	47	2	4.3	122	0	0	280	57	20.4	263	54	20.5	309	9	2.9	TRUE	TRUE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.102058568	1.102058568	1	1.150259067	1.150259067	1	0.796296296	0.796296296	1	1.208709397	1.208709397	1	1.062176166	1.062176166	1	0.537037037	0.537037037	1	5	5	1	1	4.85E-11	3.83E-72	4.23E-09	1.18E-68	0.02328732	0.0000321	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	14	30620945	G	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	40	7	17.5	28	7	25	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.036883061	1.036883061	1	1.295336788	1.295336788	1	0.555555556	0.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.26E-09	1	8.44E-11	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	32248880	C	G	NUBPL	CCDS41940.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	56	11	19.6	35	7	20	32	4	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.161309029	1.161309029	1	1.03626943	1.03626943	1	2.314814815	2.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.91E-15	1	4.65E-10	1	0.0000201	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	32277591	A	G	NUBPL	CCDS41940.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	38	9	23.7	34	5	14.7	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.404235917	1.404235917	1	0.761658031	0.761658031	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.79E-13	1	0.000000771	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	32699667	A	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	44	5	11.4	40	5	12.5	37	3	8.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.675455251	0.675455251	1	0.647668394	0.647668394	1	1.5	1.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00000288	1	0.00000178	1	0.000855237	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	34739254	G	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	48	0	0	37	5	13.5	25	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0	0	1	0.699481865	0.699481865	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	2	NA	1	1	1	1	0.00000119	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	35857260	A	T	-	-	-	-	-	-	12	0	0	23	5	21.7	29	3	10.3	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.285734996	1.285734996	1	0.533678756	0.533678756	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.75E-08	1	0.000414371	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	36354055	G	A	-	-	-	-	-	-	6	0	0	10	1	10	8	3	37.5	19	5	26.3	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.592504607	0.592504607	1	1.943005181	1.943005181	1	4.87037037	4.87037037	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.04888987	1	0.00000687	1	3.43E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	36600812	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	38	9	23.7	30	8	26.7	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.404235917	1.404235917	1	1.383419689	1.383419689	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.79E-13	1	2.07E-12	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	40933201	C	A	-	-	-	-	-	-	20	0	0	29	7	24.1	17	2	11.8	58	5	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.427936102	1.427936102	1	0.611398964	0.611398964	1	1.592592593	1.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.11E-10	1	0.003234386	1	0.0000115	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	41801868	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	27	4	14.8	40	9	22.5	56	4	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.876906818	0.876906818	1	1.165803109	1.165803109	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00001	1	4.64E-13	1	0.000186538	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	41838168	T	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	44	6	13.6	50	14	28	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.805806265	0.805806265	1	1.450777202	1.450777202	1	0.87037037	0.87037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	9.37E-08	1	4.84E-21	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	44432352	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	35	5	14.3	32	10	31.2	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.847281587	0.847281587	1	1.616580311	1.616580311	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000000895	1	5.7E-16	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	46792717	T	C	-	-	-	-	-	-	28	0	0	37	3	8.1	34	7	20.6	51	2	3.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.479928731	0.479928731	1	1.067357513	1.067357513	1	0.722222222	0.722222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000855237	1	3.73E-10	1	0.027109304	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	46811207	G	C	-	-	-	-	-	-	26	0	0	43	8	18.6	49	8	16.3	52	3	5.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.102058568	1.102058568	1	0.844559585	0.844559585	1	1.074074074	1.074074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.85E-11	1	1.47E-10	1	0.002300591	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	47689847	C	T	MDGA2	CCDS41948.1	r.?	-	-	intronic	44	0	0	46	15	32.6	38	9	23.7	62	4	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.931565017	1.553669318	1.243227883	1.227979275	1.227979275	1	1.203703704	1.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.35E-23	1	2.79E-13	1	0.000276647	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	47690465	C	G	MDGA2	CCDS41948.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	33	7	21.2	26	3	11.5	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.256109766	1.256109766	1	0.595854922	0.595854922	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.98E-10	1	0.000298167	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	48456022	C	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	19	4	21.1	32	9	28.1	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.25018472	1.25018472	1	1.455958549	1.455958549	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00000228	1	4.94E-14	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	49739296	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	38	7	18.4	39	5	12.8	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.090208476	1.090208476	1	0.663212435	0.663212435	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	8.61E-10	1	0.00000156	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	50789345	A	G	ATP5S	CCDS32075.1	r.961a>g	c.269A>G	p.N90S	missense	25	0	0	15	4	26.7	19	5	26.3	27	1	3.7	295	0	0	171	36	21.1	165	28	17	77	7	9.1	TRUE	TRUE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.581987299	1.581987299	1	1.362694301	1.362694301	1	0.685185185	0.685185185	1	1.25018472	1.25018472	1	0.880829016	0.880829016	1	1.685185185	1.685185185	1	5	5	1	1	0.000000816	9.34E-47	3.43E-08	6.81E-34	0.126579904	0.000000138	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	14	52191980	G	T	FRMD6	CCDS9704.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	42	6	14.3	37	7	18.9	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.847281587	0.847281587	1	0.979274611	0.979274611	1	1.462962963	1.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	7.02E-08	1	7.05E-10	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	52325357	C	A	GNG2	CCDS32082.1	r.?	-	-	upstream	46	0	0	40	2	5	48	7	14.6	55	0	0	67	0	0	236	7	3	194	12	6.2	274	0	0	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.296252303	1.218003048	0.243227883	0.756476684	0.756476684	1	0	0	1	0.177751382	0.730801829	0.243227883	0.321243523	0.321243523	1	0	NA	0	5	NA	1	1	0.017193422	0.00021348	4.81E-09	4.42E-10	1	1	YES	1_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	14	54761854	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	36	10	27.8	28	8	28.6	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.647162806	1.647162806	1	1.481865285	1.481865285	1	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.21E-15	1	1.11E-12	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	55001076	C	T	CGRRF1	CCDS9719.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	30	9	30	23	7	30.4	27	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.77751382	1.429757041	1.243227883	1.575129534	1.575129534	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.54E-14	1	1.79E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	56188304	A	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	39	8	20.5	39	12	30.8	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.214634443	1.214634443	1	1.595854922	1.595854922	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.09E-11	1	8.43E-19	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	57305404	C	T	-	-	-	-	-	-	15	0	0	37	13	35.1	30	5	16.7	21	1	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	2.079691169	1.672815738	1.243227883	0.865284974	0.865284974	1	0.888888889	0.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.89E-21	1	0.000000401	1	0.099912572	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	57529607	G	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	28	8	28.6	28	4	14.3	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.694563175	1.694563175	1	0.740932642	0.740932642	1	1.148148148	1.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.11E-12	1	0.0000116	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	58013163	G	C	-	-	-	-	-	-	25	0	0	34	6	17.6	34	5	14.7	37	3	8.1	0	0	NA	4	4	100	0	0	NA	4	0	0	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.042808107	1.042808107	1	0.761658031	0.761658031	1	1.5	1.5	1	5.925046065	4.765856803	1.243227883	NA	NA	1	0	NA	0	5	NA	1	1	1.86E-08	6.25E-10	0.000000771	1	0.000855237	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	58335930	A	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	45	9	20	53	10	18.9	31	0	0	17	0	0	66	7	10.6	45	14	31.1	85	4	4.7	TRUE	TRUE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.185009213	1.185009213	1	0.979274611	0.979274611	1	0	0	1	0.628054883	0.628054883	1	1.611398964	1.611398964	1	0.87037037	0.87037037	1	5	5	1	1	1.47E-12	0.000000047	1.57E-13	8.81E-22	1	0.000916711	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	58345810	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	40	4	10	38	9	23.7	48	4	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.592504607	0.592504607	1	1.227979275	1.227979275	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.0000495	1	2.79E-13	1	0.000102016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	58357194	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	40	5	12.5	52	11	21.2	40	5	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.740630758	0.740630758	1	1.098445596	1.098445596	1	2.314814815	2.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00000178	1	2.44E-15	1	0.00000178	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	58534213	T	C	C14orf37	CCDS32089.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	37	8	21.6	33	5	15.2	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.27980995	1.27980995	1	0.787564767	0.787564767	1	0.37037037	0.37037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.33E-11	1	0.00000066	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	58615644	C	G	C14orf37	CCDS32089.1	r.?	-	-	intronic	20	0	0	29	6	20.7	39	8	20.5	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.226484535	1.226484535	1	1.062176166	1.062176166	1	0.462962963	0.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.72E-09	1	2.09E-11	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	58872250	T	G	TIMM9	CCDS9735.1	r.?	-	-	downstream	23	0	0	31	7	22.6	19	6	31.6	31	4	12.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.339060411	1.339060411	1	1.637305699	1.637305699	1	2.388888889	2.388888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.85E-10	1	4.01E-10	1	0.0000177	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	62698900	G	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	41	9	22	25	6	24	36	2	5.6	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.303510134	1.303510134	1	1.243523316	1.243523316	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-13	1	2.55E-09	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	62992450	A	G	-	-	-	-	-	-	47	0	0	46	8	17.4	34	1	2.9	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.030958015	1.030958015	1	0.150259067	0.150259067	1	1.722222222	1.722222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-11	1	0.156694864	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	63020569	G	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	44	7	15.9	43	6	14	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.942082324	0.942082324	1	0.725388601	0.725388601	1	0.87037037	0.87037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	8.13E-08	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	64515048	C	T	SYNE2	CCDS9761.2	r.?	-	-	intronic	25	0	0	40	4	10	33	9	27.3	27	1	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.592504607	0.592504607	1	1.414507772	1.414507772	1	0.685185185	0.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000495	1	6.76E-14	1	0.126579904	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	64664668	C	G	SYNE2	CCDS9761.2	r.?	-	-	intronic	34	0	0	40	8	20	40	7	17.5	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.185009213	1.185009213	1	0.906735751	0.906735751	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.61E-11	1	1.26E-09	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	64876218	T	C	MTHFD1	CCDS9763.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	28	7	25	30	3	10	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.481261516	1.481261516	1	0.518134715	0.518134715	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.44E-11	1	0.000458697	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	65734893	G	A	ENSG00000214760	ENST00000398929	r.?	-	-	upstream	41	0	0	35	8	22.9	38	11	28.9	26	2	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.356835549	1.356835549	1	1.497409326	1.497409326	1	1.425925926	1.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.15E-12	1	5.19E-17	1	0.007502227	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	66766099	A	G	-	-	-	-	-	-	45	0	0	48	13	27.1	31	7	22.6	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.605687484	1.291547194	1.243227883	1.170984456	1.170984456	1	0.888888889	0.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2E-19	1	1.85E-10	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	68638447	G	A	RAD51L1	CCDS9789.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	40	7	17.5	33	9	27.3	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.036883061	1.036883061	1	1.414507772	1.414507772	1	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-09	1	6.76E-14	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	69605983	G	A	DCAF5	CCDS32106.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	40	7	17.5	33	9	27.3	29	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.036883061	1.036883061	1	1.414507772	1.414507772	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-09	1	6.76E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	69627612	T	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	44	11	25	24	2	8.3	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.481261516	1.481261516	1	0.430051813	0.430051813	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	3.22E-16	1	0.006413403	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	70427316	T	C	SMOC1	CCDS32110.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	43	3	7	40	10	25	31	2	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.414753225	0.414753225	1	1.295336788	1.295336788	1	1.203703704	1.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001328364	1	7.22E-15	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	71078183	A	C	AL357153.1	ENST00000500016	r.?	-	-	intronic	31	0	0	34	11	32.4	43	7	16.3	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.919714925	1.544137604	1.243227883	0.844559585	0.844559585	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-17	1	2.15E-09	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	72715995	G	T	RGS6	CCDS9808.1	r.?	-	-	intronic	30	1	3.3	44	12	27.3	42	5	11.9	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.617537576	1.617537576	1	0.616580311	0.616580311	1	0.87037037	0.87037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	0.139615808	1	4.44E-18	1	0.00000228	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	72817695	C	T	RGS6	CCDS9808.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	41	8	19.5	44	2	4.5	41	0	0	60	0	0	252	24	9.5	185	11	5.9	244	0	0	TRUE	TRUE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.155383983	1.155383983	1	0.233160622	0.233160622	1	0	0	1	0.562879376	0.562879376	1	0.305699482	0.305699482	1	0	0	1	4	3	1	1	3.22E-11	4.46E-23	0.020580492	3.54E-09	1	1	YES	1_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	14	72857692	G	C	RGS6	CCDS9808.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	38	2	5.3	30	8	26.7	49	6	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.314027441	1.291083231	0.243227883	1.383419689	1.383419689	1	2.259259259	2.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.015598339	1	2.07E-12	1	0.000000182	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	74480854	T	C	ENTPD5	CCDS9825.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	45	7	15.6	47	11	23.4	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.924307186	0.924307186	1	1.212435233	1.212435233	1	0.592592593	0.592592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000003	1	7.21E-16	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	74492524	A	G	C14orf45	CCDS32119.2	r.?	-	-	intronic	22	0	0	36	8	22.2	26	3	11.5	26	3	11.5	1	0	0	1	0	0	1	1	100	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.315360226	1.315360226	1	0.595854922	0.595854922	1	2.12962963	2.12962963	1	0	0	1	5.18134715	5.18134715	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-11	1	0.000298167	0.005	0.000298167	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	75304337	G	A	YLPM1	CCDS45135.1	r.?	-	-	downstream	24	0	0	33	3	9.1	40	9	22.5	40	4	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.539179192	0.539179192	1	1.165803109	1.165803109	1	1.851851852	1.851851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000609557	1	4.64E-13	1	0.0000495	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	75321890	G	A	PROX2	CCDS45136.1	r.1724c>u	c.1724C>T	p.S575L	missense	30	0	0	38	3	7.9	33	7	21.2	49	1	2	163	0	0	218	34	15.6	171	29	17	165	6	3.6	TRUE	TRUE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.468078639	0.468078639	1	1.098445596	1.098445596	1	0.37037037	0.37037037	1	0.924307186	0.924307186	1	0.880829016	0.880829016	1	0.666666667	0.666666667	1	5	5	1	1	0.000925091	1.71E-39	2.98E-10	4.88E-35	0.217776325	0.000202807	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	14	75699686	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	21	6	28.6	28	9	32.1	25	2	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.694563175	1.694563175	1	1.663212435	1.663212435	1	1.481481481	1.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.95E-10	1	1.24E-14	1	0.006948068	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	75699687	A	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	21	6	28.6	27	8	29.6	28	3	10.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.694563175	1.694563175	1	1.533678756	1.533678756	1	1.981481481	1.981481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.95E-10	1	7.97E-13	1	0.000372895	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	76286078	C	T	TTLL5	CCDS32124.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	32	5	15.6	37	9	24.3	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.924307186	0.924307186	1	1.259067358	1.259067358	1	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000562	1	2.14E-13	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	77347091	G	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	43	9	20.9	32	3	9.4	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.238334628	1.238334628	1	0.487046632	0.487046632	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.45E-13	1	0.000556213	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	78719842	C	T	-	-	-	-	-	-	20	0	0	33	4	12.1	25	2	8	29	2	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.716930574	0.716930574	1	0.414507772	0.414507772	1	1.277777778	1.277777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000228	1	0.006948068	1	0.009279585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	79040904	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	31	11	35.5	28	3	10.7	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	2.103391353	1.691879165	1.243227883	0.554404145	0.554404145	1	0.87037037	0.87037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.77E-18	1	0.000372895	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	79203959	C	T	NRXN3	CCDS9870.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	51	7	13.7	36	7	19.4	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.811731311	0.811731311	1	1.005181347	1.005181347	1	0.944444444	0.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.46E-09	1	5.74E-10	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	79417604	A	T	NRXN3	CCDS9870.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	47	16	34	36	5	13.9	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	2.014515662	1.620391313	1.243227883	0.720207254	0.720207254	1	1.037037037	1.037037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.98E-25	1	0.00000104	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	79634593	C	T	NRXN3	CCDS9870.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	31	9	29	24	5	20.8	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.718263359	1.718263359	1	1.077720207	1.077720207	1	0.87037037	0.87037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.57E-14	1	0.000000123	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	79887291	G	C	NRXN3	CCDS45145.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	41	7	17.1	30	6	20	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.013182877	1.013182877	1	1.03626943	1.03626943	1	1.148148148	1.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.51E-09	1	8.37E-09	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	79968234	T	A	NRXN3	CCDS45145.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	40	8	20	38	11	28.9	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.185009213	1.185009213	1	1.497409326	1.497409326	1	2.018518519	2.018518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.61E-11	1	5.19E-17	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	81284575	T	C	C14orf145	CCDS32130.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	30	4	13.3	42	8	19	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.788031127	0.788031127	1	0.984455959	0.984455959	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000154	1	3.96E-11	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	81880294	T	C	-	-	-	-	-	-	24	0	0	43	10	23.3	36	8	22.2	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.380535733	1.380535733	1	1.150259067	1.150259067	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.61E-14	1	1.04E-11	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	82314810	C	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	42	7	16.7	39	5	12.8	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.989482693	0.989482693	1	0.663212435	0.663212435	1	1.814814815	1.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.81E-09	1	0.00000156	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	82418168	G	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	46	8	17.4	29	7	24.1	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.030958015	1.030958015	1	1.248704663	1.248704663	1	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-11	1	1.11E-10	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	82546677	T	C	-	-	-	-	-	-	34	0	0	51	3	5.9	31	5	16.1	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.349577718	1.437243597	0.243227883	0.834196891	0.834196891	1	0.814814815	0.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.002175924	1	0.000000476	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	82660405	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	31	5	16.1	33	6	18.2	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.953932416	0.953932416	1	0.943005181	0.943005181	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000476	1	1.54E-08	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	83996393	A	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	47	7	14.9	45	8	17.8	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.882831864	0.882831864	1	0.922279793	0.922279793	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.12E-09	1	7.14E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	84068117	T	C	-	-	-	-	-	-	30	0	0	50	11	22	48	9	18.8	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.303510134	1.303510134	1	0.974093264	0.974093264	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.52E-15	1	2.75E-12	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	84649290	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	43	9	20.9	41	12	29.3	30	1	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.238334628	1.238334628	1	1.518134715	1.518134715	1	0.611111111	0.611111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.45E-13	1	1.69E-18	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	84698514	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	34	6	17.6	35	4	11.4	49	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.042808107	1.042808107	1	0.590673575	0.590673575	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.86E-08	1	0.0000289	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	84844890	G	A	-	-	-	-	-	-	18	0	0	31	5	16.1	37	7	18.9	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.953932416	0.953932416	1	0.979274611	0.979274611	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000476	1	7.05E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	85110475	T	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	42	6	14.3	32	2	6.2	47	5	10.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.847281587	0.847281587	1	0.321243523	0.321243523	1	1.962962963	1.962962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.02E-08	1	0.011224977	1	0.00000402	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	86446801	G	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	38	7	18.4	38	8	21.1	42	7	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.090208476	1.090208476	1	1.093264249	1.093264249	1	3.092592593	3.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-10	1	1.67E-11	1	1.81E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	86460608	T	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	44	0	0	49	9	18.4	37	2	5.4	54	0	0	201	10	5	191	31	16.2	292	16	5.5	TRUE	TRUE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0	0	1	0.953367876	0.953367876	1	1	1	1	0.296252303	1.218003048	0.243227883	0.839378238	0.839378238	1	1.018518519	1.018518519	1	3	5	1	1	1	0.000000097	3.35E-12	1.02E-36	0.014826063	3.66E-12	YES	0_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	14	86774081	A	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	43	0	0	39	4	10.3	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0	0	1	0.533678756	0.533678756	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000447	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	87322868	T	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	63	17	27	43	5	11.6	57	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.599762438	1.286781337	1.243227883	0.601036269	0.601036269	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.22E-25	1	0.00000257	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	87395456	C	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	36	9	25	44	5	11.4	58	5	8.6	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.481261516	1.481261516	1	0.590673575	0.590673575	1	1.592592593	1.592592593	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.63E-13	1	0.00000288	1	0.0000115	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	87769827	A	G	-	-	-	-	-	-	22	0	0	41	10	24.4	46	6	13	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.44571124	1.44571124	1	0.67357513	0.67357513	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.51E-15	1	0.000000123	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	87848062	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	29	7	24.1	40	2	5	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.427936102	1.427936102	1	0.259067358	0.259067358	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.11E-10	1	0.017193422	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	88355806	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	40	12	30	36	8	22.2	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.77751382	1.429757041	1.243227883	1.150259067	1.150259067	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.2E-18	1	1.04E-11	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	88683322	A	C	KCNK10	CCDS9881.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	22	9	40.9	17	3	17.6	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	2.423343841	1.949235432	1.243227883	0.911917098	0.911917098	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.16E-16	1	0.0000807	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	89621297	G	T	FOXN3	CCDS32138.1	r.?	-	-	downstream	27	0	0	45	6	13.3	35	0	0	45	0	0	299	0	0	309	14	4.5	277	0	0	261	0	0	TRUE	TRUE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.788031127	0.788031127	1	0	0	1	0	0	1	0.266627073	1.096202743	0.243227883	0	0	1	0	0	1	4	3	1	1	0.000000108	9.49E-10	1	1	1	1	YES	1_1	0_0	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	14	90679521	A	G	-	-	-	-	-	-	22	0	0	50	10	20	25	5	20	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.185009213	1.185009213	1	1.03626943	1.03626943	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.36E-14	1	0.000000153	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	90946601	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	29	2	6.9	31	5	16.1	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.408828178	0.408828178	1	0.834196891	0.834196891	1	1.055555556	1.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.009279585	1	0.000000476	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	91026251	C	T	TTC7B	CCDS32140.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	23	3	13	16	4	25	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.770255988	0.770255988	1	1.295336788	1.295336788	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000205387	1	0.00000108	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	91742911	G	A	CCDC88C	CCDS45151.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	40	2	5	52	7	13.5	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.296252303	1.218003048	0.243227883	0.699481865	0.699481865	1	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.017193422	1	8.58E-09	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	92120965	T	A	CATSPERB	CCDS32142.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	43	11	25.6	28	9	32.1	23	2	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.516811793	1.516811793	1	1.663212435	1.663212435	1	1.611111111	1.611111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.42E-16	1	1.24E-14	1	0.00589844	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	92746229	A	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	51	11	21.6	36	13	36.1	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.27980995	1.27980995	1	1.870466321	1.870466321	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.94E-15	1	2.53E-21	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	95000526	T	C	-	-	-	-	-	-	24	0	0	30	6	20	41	8	19.5	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.185009213	1.185009213	1	1.010362694	1.010362694	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.37E-09	1	3.22E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	95643571	T	A	CLMN	CCDS9933.1	r.?	-	-	downstream	25	0	0	35	4	11.4	39	5	12.8	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.675455251	0.675455251	1	0.663212435	0.663212435	1	0.518518519	0.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000289	1	0.00000156	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	96339941	C	T	AL133167.1	ENST00000503525	r.?	-	-	upstream	39	0	0	33	4	12.1	26	4	15.4	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.716930574	0.716930574	1	0.797927461	0.797927461	1	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000228	1	0.00000856	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	96370846	G	A	AL133167.1	ENST00000503525	r.?	-	-	intronic	8	0	0	19	8	42.1	13	6	46.2	37	16	43.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	2.494444393	2.006425714	1.243227883	2.393782383	2.393782383	1	8	8	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.81E-14	1	2.6E-11	1	1.78E-27	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	96560132	G	A	C14orf132	ENST00000421193	r.7488g>a	-	-	non-coding variant	40	0	0	34	9	26.5	35	7	20	50	3	6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.570137207	1.570137207	1	1.03626943	1.03626943	1	1.111111111	1.111111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.15E-14	1	4.65E-10	1	0.002055544	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	96700056	C	A	BDKRB2	CCDS9942.1	r.?	-	-	intronic	20	0	0	30	9	30	26	7	26.9	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.77751382	1.429757041	1.243227883	1.393782383	1.393782383	1	0.888888889	0.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.54E-14	1	4.73E-11	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	96738240	C	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	51	8	15.7	36	8	22.2	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.930232232	0.930232232	1	1.150259067	1.150259067	1	0.833333333	0.833333333	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.05E-10	1	1.04E-11	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	97511232	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	34	9	26.5	27	6	22.2	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.570137207	1.570137207	1	1.150259067	1.150259067	1	1.185185185	1.185185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.15E-14	1	4.23E-09	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	98050827	A	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	32	0	0	35	0	0	48	4	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0	0	1	0	0	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.000102016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	98651129	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	27	4	14.8	28	1	3.6	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.876906818	0.876906818	1	0.186528497	0.186528497	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00001	1	0.130947004	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	98663782	C	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	39	13	33.3	41	4	9.8	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.97304034	1.587030315	1.243227883	0.507772021	0.507772021	1	0.944444444	0.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.79E-21	1	0.0000546	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	98701487	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	53	8	15.1	44	9	20.5	56	3	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.894681956	0.894681956	1	1.062176166	1.062176166	1	1	1	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.83E-10	1	1.18E-12	1	0.00284314	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	101225471	G	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	33	12	36.4	23	4	17.4	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	2.156716768	1.734771876	1.243227883	0.901554404	0.901554404	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.86E-20	1	0.00000513	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	101691722	C	A	-	-	-	-	-	-	9	0	0	17	2	11.8	11	4	36.4	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.699155436	0.699155436	1	1.886010363	1.886010363	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.003234386	1	0.000000201	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	103792185	C	G	-	-	-	-	-	-	7	0	0	14	2	14.3	16	1	6.2	22	4	18.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.847281587	0.847281587	1	0.321243523	0.321243523	1	3.37037037	3.37037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.002185852	1	0.077068876	1	0.00000425	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	104109564	G	C	C14orf153	CCDS32165.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	17	7	41.2	34	6	17.6	25	3	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	2.441118979	1.963533003	1.243227883	0.911917098	0.911917098	1	2.222222222	2.222222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.45E-12	1	1.86E-08	1	0.00026475	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	104666541	C	T	-	-	-	-	-	-	6	0	0	11	4	36.4	2	0	0	17	1	5.9	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	2.156716768	2.156716768	1	0	0	1	1.092592593	1.092592593	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000201	1	1	1	0.081683532	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	105393810	A	G	PLD4	CCDS9995.2	r.?	-	-	intronic	8	0	0	9	3	33.3	7	3	42.9	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.97304034	1.97304034	1	2.222797927	2.222797927	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000103	1	0.00000431	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	106194165	T	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	31	9	29	34	5	14.7	35	6	17.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.718263359	1.718263359	1	0.761658031	0.761658031	1	3.166666667	3.166666667	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.57E-14	1	0.000000771	1	2.24E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	106452075	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	35	7	20	37	6	16.2	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.185009213	1.185009213	1	0.839378238	0.839378238	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.65E-10	1	3.18E-08	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	106683177	C	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	42	7	16.7	54	9	16.7	30	2	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.989482693	0.989482693	1	0.865284974	0.865284974	1	1.240740741	1.240740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.81E-09	1	8.48E-12	1	0.009909649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	106784844	G	C	-	-	-	-	-	-	97	0	0	122	14	11.5	116	0	0	100	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	0.681380297	0.681380297	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	3.15E-15	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	14	106940577	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	35	8	22.9	41	5	12.2	44	3	6.8	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.243227883	2	2	1	1	1	1	1	1	0.756772117	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.243227883	NA	NA	1.356835549	1.356835549	1	0.632124352	0.632124352	1	1.259259259	1.259259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.15E-12	1	0.00000202	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	21174155	A	G	-	-	-	-	-	-	11	0	0	30	4	13.3	37	4	10.8	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.854715303	0.854715303	1	0.667585492	0.667585492	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000154	1	0.0000362	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	22559165	C	T	-	-	-	-	-	-	52	0	0	88	6	6.8	61	3	4.9	91	2	2.2	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.436997298	0.586878676	0.74461267	0.30288601	0.30288601	1	0.473407407	0.473407407	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000596	1	0.003623631	1	0.076482202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	22809332	G	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	34	6	17.6	27	0	0	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.13105183	1.13105183	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	4	NA	1	1	1.86E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	23011937	C	T	NIPA2	CCDS10010.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	34	4	11.8	59	10	16.9	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.75831884	0.75831884	1	1.044647668	1.044647668	1	0.602518519	0.602518519	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000257	1	4.91E-13	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	23112155	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	35	3	8.6	46	5	10.9	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.552673053	0.552673053	1	0.673766839	0.673766839	1	1.269592593	1.269592593	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000725791	1	0.00000361	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	23969318	C	T	-	-	-	-	-	-	12	0	0	17	4	23.5	11	2	18.2	30	3	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.51021125	1.51021125	1	1.125005181	1.125005181	1	2.151851852	2.151851852	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000141	1	0.001334363	1	0.000458697	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	24284065	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	33	9	27.3	43	15	34.9	28	5	17.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.754415622	1.754415622	1	2.157290155	1.078645078	2	3.851814815	1.283938272	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.76E-14	1	4.05E-24	1	0.000000279	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	24744063	G	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	48	7	14.6	48	5	10.4	37	3	8.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.938258904	0.938258904	1	0.642860104	0.642860104	1	1.743	1.743	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.81E-09	1	0.00000447	1	0.000855237	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	25739193	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	36	7	19.4	55	11	20	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.246727585	1.246727585	1	1.23626943	1.23626943	1	2.108814815	2.108814815	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.74E-10	1	4.77E-15	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	25932883	G	T	ATP10A	CCDS32178.1	r.3364c>a	c.3258C>A	p.A1086A	silent	29	0	0	38	12	31.6	36	7	19.4	43	4	9.3	537	0	0	338	95	28.1	310	99	31.9	283	28	9.9	TRUE	TRUE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	2.030752149	1.164013184	1.74461267	1.199181347	1.199181347	1	2.001222222	2.001222222	1	1.805827069	1.035087673	1.74461267	1.971849741	0.98592487	2	2.130333333	1.065166667	2	5	5	1	1	5.86E-19	5.62E-134	5.74E-10	5.76E-146	0.000066	4E-27	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	15	26037822	C	T	ATP10A	CCDS32178.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	18	6	33.3	20	3	15	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	2.140001473	1.226634147	1.74461267	0.927202073	0.927202073	1	0.624037037	0.624037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.75E-10	1	0.0001337	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	26576297	A	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	35	3	8.6	33	6	18.2	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.552673053	0.552673053	1	1.125005181	1.125005181	1	0.451888889	0.451888889	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000725791	1	1.54E-08	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	26757398	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	55	8	14.5	45	10	22.2	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.931832473	0.931832473	1	1.372259067	1.372259067	1	0.559481481	0.559481481	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.86E-10	1	2.66E-14	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	26800199	C	T	GABRB3	CCDS10019.1	r.?	-	-	intronic	14	0	0	24	1	4.2	27	4	14.8	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.269910096	NA	0	0.914839378	0.914839378	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.113346489	1	0.00001	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	26923144	C	T	GABRB3	CCDS10019.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	37	4	10.8	47	9	19.1	44	3	6.8	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.694054532	0.694054532	1	1.180637306	1.180637306	1	1.463259259	1.463259259	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000362	1	2.24E-12	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	26950865	G	A	GABRB3	CCDS10019.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	42	6	14.3	50	1	2	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.918979612	0.918979612	1	0.123626943	0.123626943	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	4	NA	1	1	7.02E-08	1	0.221687443	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	27304275	C	T	GABRG3	CCDS45195.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	36	7	19.4	41	11	26.8	60	2	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.246727585	1.246727585	1	1.656601036	1.656601036	1	0.710111111	0.710111111	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.74E-10	1	1.34E-16	1	0.036544784	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	27460032	C	T	GABRG3	CCDS45195.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	44	5	11.4	46	8	17.4	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.732613117	0.732613117	1	1.075554404	1.075554404	1	0.43037037	0.43037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000288	1	8.61E-11	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	27871727	G	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	39	4	10.3	27	5	18.5	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.661922378	0.661922378	1	1.143549223	1.143549223	1	1.915148148	1.915148148	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000447	1	0.00000023	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	30506705	A	G	ENSG00000225930	ENST00000455163	r.?	-	-	downstream	37	0	0	36	5	13.9	51	7	13.7	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.893273888	0.893273888	1	0.84684456	0.84684456	1	2.259444444	2.259444444	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000104	1	7.46E-09	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	31375396	C	A	TRPM1	CCDS10024.2	r.?	-	-	intronic	23	0	0	28	6	21.4	29	4	13.8	33	4	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.375256202	1.375256202	1	0.853025907	0.853025907	1	2.603740741	2.603740741	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.36E-09	1	0.0000134	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	33628933	C	T	RYR3	CCDS45210.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	28	5	17.9	15	1	6.7	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.150331122	1.150331122	1	0.414150259	0.414150259	1	1.226555556	1.226555556	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000279	1	0.072431031	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	33671586	G	T	RYR3	CCDS45210.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	56	11	19.6	62	11	17.7	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.259580447	1.259580447	1	1.094098446	1.094098446	1	0.667074074	0.667074074	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.91E-15	1	1.96E-14	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	33993089	T	C	RYR3	CCDS45210.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	41	7	17.1	46	8	17.4	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	2	2	100	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.098919676	1.098919676	1	1.075554404	1.075554404	1	0.494925926	0.494925926	1	NA	NA	0	6.18134715	3.090673575	2	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.51E-09	1	8.61E-11	0.000025	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	34949132	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	40	3	7.5	58	6	10.3	42	4	9.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.481982314	0.481982314	1	0.636678756	0.636678756	1	2.044259259	2.044259259	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001075403	1	0.000000506	1	0.0000601	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	35755226	A	G	ATPBD4	CCDS10043.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	44	12	27.3	56	7	12.5	50	4	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.754415622	1.005618985	1.74461267	0.772668394	0.772668394	1	1.721481481	1.721481481	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.44E-18	1	1.46E-08	1	0.000119787	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	35801093	A	C	ATPBD4	CCDS10043.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	45	14	31.1	38	16	42.1	58	11	19	55	0	0	210	58	27.6	185	58	31.4	310	12	3.9	TRUE	TRUE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.998619995	1.145595254	1.74461267	2.60234715	1.301173575	2	4.088518519	1.362839506	3	1.773694915	1.016669743	1.74461267	1.940943005	0.970471503	2	0.839222222	0.839222222	1	5	5	1	1	8.81E-22	5.63E-82	3.06E-27	1.08E-85	8.96E-15	0.000000082	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	15	37258099	T	C	MEIS2	CCDS45217.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	43	4	9.3	55	10	18.2	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.597658069	0.597658069	1	1.125005181	1.125005181	1	1.872111111	1.872111111	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000066	1	2.33E-13	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	39160691	G	C	-	-	-	-	-	-	26	0	0	39	5	12.8	27	4	14.8	29	2	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.822583149	0.822583149	1	0.914839378	0.914839378	1	1.484777778	1.484777778	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000156	1	0.00001	1	0.009279585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	39229739	C	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	36	6	16.7	41	5	12.2	33	4	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.073213952	1.073213952	1	0.754124352	0.754124352	1	2.603740741	2.603740741	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.68E-08	1	0.00000202	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	39526966	G	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	55	4	7.3	59	5	8.5	54	2	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.469129452	0.469129452	1	0.525414508	0.525414508	1	0.796185185	0.796185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000173903	1	0.0000125	1	0.030129377	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	39568181	C	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	41	10	24.4	29	13	44.8	32	6	18.8	54	0	0	231	62	26.8	216	65	30.1	243	19	7.8	TRUE	TRUE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.568049128	1.568049128	1	2.769243523	1.384621762	2	4.045481481	1.348493827	3	1.722283468	0.987201055	1.74461267	1.860585492	0.930292746	2	1.678444444	0.839222222	2	5	5	1	1	9.51E-15	1.26E-86	7.69E-23	1.81E-94	1.27E-08	5.57E-17	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	15	40677215	T	G	C15orf23	CCDS45226.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	42	8	19	50	6	12	43	0	0	43	0	0	196	30	15.3	160	24	15	159	9	5.7	TRUE	TRUE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.221021862	1.221021862	1	0.741761658	0.741761658	1	0	0	1	0.98324392	0.98324392	1	0.927202073	0.927202073	1	1.226555556	1.226555556	1	5	5	1	1	3.96E-11	8.86E-35	0.000000206	6.44E-28	1	0.000000141	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	15	40677218	T	A	C15orf23	CCDS45226.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	42	9	21.4	50	6	12	40	0	0	45	0	0	201	32	15.9	161	23	14.3	158	9	5.7	TRUE	TRUE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.375256202	1.375256202	1	0.741761658	0.741761658	1	0	0	1	1.021802505	1.021802505	1	0.883932642	0.883932642	1	1.226555556	1.226555556	1	5	5	1	1	7.51E-13	1.45E-37	0.000000206	2.61E-26	1	0.000000134	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	15	41295771	G	A	INO80	CCDS10071.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	24	2	8.3	34	6	17.6	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.533393761	0.533393761	1	1.087917098	1.087917098	1	0.559481481	0.559481481	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.006413403	1	1.86E-08	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	41419971	G	A	-	-	-	-	-	-	14	0	0	21	4	19	18	2	11.1	21	3	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.221021862	1.221021862	1	0.686129534	0.686129534	1	3.077148148	3.077148148	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000349	1	0.003626632	1	0.000155401	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	43394595	T	C	UBR1	CCDS10091.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	38	10	26.3	52	10	19.2	42	5	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.690151314	1.690151314	1	1.186818653	1.186818653	1	2.560703704	0.853567901	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.06E-15	1	1.28E-13	1	0.00000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	43541503	G	A	TGM5	CCDS32212.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	53	13	24.5	33	5	15.2	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.574475559	1.574475559	1	0.939564767	0.939564767	1	0.43037037	0.43037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.53E-19	1	0.00000066	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	44101066	G	A	MFAP1	CCDS10105.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	40	8	20	41	7	17.1	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.28528617	1.28528617	1	1.057010363	1.057010363	1	1.89362963	1.89362963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.61E-11	1	1.51E-09	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	46483531	T	G	-	-	-	-	-	-	29	0	0	45	4	8.9	33	7	21.2	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.571952346	0.571952346	1	1.310445596	1.310445596	1	0.473407407	0.473407407	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000791	1	2.98E-10	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	47076015	A	C	-	-	-	-	-	-	40	0	0	47	8	17	46	15	32.6	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.092493245	1.092493245	1	2.015119171	1.007559585	2	0.43037037	0.43037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.03E-10	1	1.35E-23	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	47683556	A	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	38	4	10.5	42	8	19	44	5	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.674775239	0.674775239	1	1.174455959	1.174455959	1	2.453111111	0.817703704	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000403	1	3.96E-11	1	0.00000288	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	48730318	C	T	FBN1	CCDS32232.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	45	16	35.6	47	19	40.4	39	6	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	2.287809383	1.311356625	1.74461267	2.497264249	1.248632124	2	3.313851852	1.104617284	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-26	1	1.16E-31	1	4.43E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	48902614	T	A	FBN1	CCDS32232.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	55	13	23.6	43	6	14	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.516637681	1.516637681	1	0.865388601	0.865388601	1	0.624037037	0.624037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.46E-18	1	8.13E-08	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	49688432	G	T	C15orf33	CCDS32237.1	r.?	-	-	intronic	8	0	0	14	6	42.9	9	4	44.4	32	15	46.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	2.756938835	1.580258405	1.74461267	2.744518135	1.372259067	2	10.09218519	3.364061728	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.53E-11	1	7.72E-08	1	1.59E-26	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	49688435	C	G	C15orf33	CCDS32237.1	r.?	-	-	intronic	6	0	0	14	5	35.7	8	4	50	31	17	54.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	2.294235814	1.315040212	1.74461267	3.090673575	1.545336788	2	11.79214815	3.930716049	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.03E-09	1	4.31E-08	1	1.89E-31	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	50021398	A	G	-	-	-	-	-	-	27	0	0	53	5	9.4	53	5	9.4	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.6040845	0.6040845	1	0.581046632	0.581046632	1	2.001222222	2.001222222	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000734	1	0.00000734	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	50373234	C	T	ATP8B4	CCDS32238.1	r.?	-	-	intronic	14	0	0	23	2	8.7	20	4	20	54	6	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.559099484	0.559099484	1	1.23626943	1.23626943	1	2.388555556	1.194277778	2	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00589844	1	0.00000284	1	0.000000329	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	50937235	A	C	TRPM7	CCDS42035.1	r.?	-	-	intronic	9	0	0	19	3	15.8	17	4	23.5	25	2	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.015376075	1.015376075	1	1.45261658	1.45261658	1	1.721481481	1.721481481	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000114071	1	0.00000141	1	0.006948068	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	52298154	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	36	13	36.1	50	16	32	29	5	17.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	2.319941537	1.329774556	1.74461267	1.978031088	0.989015544	2	3.701185185	1.233728395	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.53E-21	1	6.4E-25	1	0.000000336	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	52427373	G	C	GNB5	CCDS10149.1	r.?	-	-	intronic	13	0	0	23	3	13	25	10	40	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.835436011	0.835436011	1	2.47253886	1.23626943	2	1.162	1.162	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000205387	1	2.98E-17	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	53091506	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	29	4	13.8	27	5	18.5	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.886847457	0.886847457	1	1.143549223	1.143549223	1	0.925296296	0.925296296	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000134	1	0.00000023	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	53156441	C	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	54	19	35.2	61	18	29.5	49	7	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	2.26210366	1.296622281	1.74461267	1.823497409	0.911748705	2	3.077148148	1.025716049	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.97E-30	1	4.08E-27	1	5.58E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	53458434	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	48	8	16.7	44	6	13.6	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.073213952	1.073213952	1	0.840663212	0.840663212	1	1.269592593	1.269592593	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.23E-10	1	9.37E-08	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	54741949	G	A	UNC13C	CCDS45264.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	41	10	24.4	60	12	20	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.568049128	1.568049128	1	1.23626943	1.23626943	1	1.032888889	1.032888889	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.51E-15	1	2.74E-16	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	54948276	G	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	54	5	9.3	46	6	13	57	2	3.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.597658069	0.597658069	1	0.80357513	0.80357513	1	0.753148148	0.753148148	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000806	1	0.000000123	1	0.03327602	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	56506166	T	C	RFX7	ENST00000423270	r.?	-	-	intronic	38	0	0	49	13	26.5	44	7	15.9	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.703004176	0.976150297	1.74461267	0.982834197	0.982834197	1	1.958185185	1.958185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.71E-19	1	2.55E-09	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	57553730	A	G	TCF12	CCDS10159.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	38	4	10.5	45	9	20	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.674775239	0.674775239	1	1.23626943	1.23626943	1	0.537962963	0.537962963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000403	1	1.47E-12	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	58367652	A	C	AC025431.1	ENST00000498888	r.?	-	-	downstream	33	0	0	45	5	11.1	52	8	15.4	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.713333824	0.713333824	1	0.951927461	0.951927461	1	0.516444444	0.516444444	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000323	1	2.42E-10	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	58707697	G	A	LIPC	CCDS10166.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	30	9	30	33	13	39.4	42	5	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.927929255	1.105075808	1.74461267	2.435450777	1.217725389	2	2.560703704	0.853567901	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.54E-14	1	6.37E-22	1	0.00000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	59280308	G	T	RNF111	CCDS10169.1	r.?	-	-	intronic	13	0	0	14	3	21.4	10	2	20	22	3	13.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.375256202	1.375256202	1	1.23626943	1.23626943	1	2.926518519	2.926518519	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000437	1	0.001095391	1	0.000179267	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	61950004	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	45	5	11.1	49	4	8.2	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.713333824	0.713333824	1	0.506870466	0.506870466	1	1.377185185	1.377185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000323	1	0.000110643	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	62151903	T	C	VPS13C	CCDS32257.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	39	3	7.7	58	6	10.3	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.494835176	0.494835176	1	0.636678756	0.636678756	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000998458	1	0.000000506	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	63279670	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	46	14	30.4	27	6	22.2	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.953634979	1.119810152	1.74461267	1.372259067	1.372259067	1	1.872111111	1.872111111	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-21	1	4.23E-09	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	63826367	G	T	USP3	CCDS32265.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	50	9	18	48	6	12.5	37	5	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.156757553	1.156757553	1	0.772668394	0.772668394	1	2.905	0.968333333	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.07E-12	1	0.00000016	1	0.00000119	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	64894241	G	C	ZNF609	CCDS32270.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	54	13	24.1	42	11	26.2	26	3	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.548769835	1.548769835	1	1.619512953	1.619512953	1	2.47462963	2.47462963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.12E-18	1	1.81E-16	1	0.000298167	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	67435248	G	A	SMAD3	CCDS10222.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	40	9	22.5	31	10	32.3	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.445946942	1.445946942	1	1.99657513	0.998287565	2	1.334148148	1.334148148	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.64E-13	1	3.94E-16	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	67692817	G	T	IQCH	CCDS32273.1	r.?	-	-	intronic	15	0	0	17	1	5.9	22	4	18.2	26	2	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.37915942	NA	0	1.125005181	1.125005181	1	1.656925926	1.656925926	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.081683532	1	0.00000425	1	0.007502227	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	70256110	G	C	-	-	-	-	-	-	34	0	0	44	6	13.6	42	8	19	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.873994596	0.873994596	1	1.174455959	1.174455959	1	1.958185185	1.958185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.37E-08	1	3.96E-11	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	71790056	G	T	THSD4	CCDS10238.2	r.?	-	-	intronic	25	0	0	37	18	48.6	37	14	37.8	33	4	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	3.123245394	1.790222809	1.74461267	2.336549223	1.168274611	2	2.603740741	2.603740741	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.16E-32	1	3.35E-23	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	72887402	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	35	4	11.4	31	6	19.4	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.732613117	0.732613117	1	1.199181347	1.199181347	1	1.226555556	1.226555556	1	NA	NA	0	NA	NA	0	0	0	1	5	NA	1	1	0.0000289	1	1.03E-08	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	73423402	C	A	NEO1	CCDS10247.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	35	5	14.3	27	1	3.7	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.918979612	0.918979612	1	0.228709845	0.228709845	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000000895	1	0.126579904	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	73768297	A	G	C15orf60	CCDS45296.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	44	5	11.4	45	6	13.3	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.732613117	0.732613117	1	0.822119171	0.822119171	1	0.624037037	0.624037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000288	1	0.000000108	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	73867181	G	T	NPTN	CCDS10249.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	38	6	15.8	42	9	21.4	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.015376075	1.015376075	1	1.32280829	1.32280829	1	1.097444444	1.097444444	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.76E-08	1	7.51E-13	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	76182707	G	A	UBE2Q2	CCDS10286.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	43	10	23.3	44	4	9.1	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.497358388	1.497358388	1	0.562502591	0.562502591	1	1.097444444	1.097444444	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.61E-14	1	0.0000723	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	77467615	G	A	ENSG00000173517	CCDS42062.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	27	7	25.9	27	5	18.5	29	4	13.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.66444559	1.66444559	1	1.143549223	1.143549223	1	2.969555556	0.989851852	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.36E-11	1	0.00000023	1	0.0000134	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	77481958	C	A	ENSG00000173517	CCDS42062.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	46	9	19.6	43	14	32.6	52	3	5.8	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.259580447	1.259580447	1	2.015119171	1.007559585	2	1.248074074	1.248074074	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.82E-12	1	4.18E-22	1	0.002300591	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	77830395	A	G	-	-	-	-	-	-	20	0	0	33	2	6.1	31	4	12.9	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.392012282	0.392012282	1	0.797393782	0.797393782	1	1.656925926	1.656925926	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.011909843	1	0.0000177	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	79832251	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	47	16	34	45	17	37.8	57	3	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	2.184986489	1.252419249	1.74461267	2.336549223	1.168274611	2	1.140481481	1.140481481	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.98E-25	1	7.37E-28	1	0.002989991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	79899347	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	52	6	11.5	44	2	4.5	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.739039548	0.739039548	1	0.278160622	0.278160622	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000000261	1	0.020580492	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	80940566	C	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	35	7	20	38	5	13.2	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.28528617	1.28528617	1	0.815937824	0.815937824	1	0.516444444	0.516444444	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.65E-10	1	0.00000137	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	82289021	C	T	-	-	-	-	-	-	20	0	0	27	5	18.5	20	7	35	19	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.188889707	1.188889707	1	2.163471503	1.081735751	2	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000023	1	5.72E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	83535913	A	G	HOMER2	CCDS45334.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	48	8	16.7	44	5	11.4	26	1	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.073213952	1.073213952	1	0.704673575	0.704673575	1	0.817703704	0.817703704	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.23E-10	1	0.00000288	1	0.122190858	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	83536798	A	T	HOMER2	CCDS45334.1	r.?	-	-	intronic	46	0	0	48	4	8.3	49	10	20.4	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.533393761	0.533393761	1	1.260994819	1.260994819	1	1.205037037	1.205037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000102016	1	6.72E-14	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	84244874	G	A	SH3GL3	CCDS10325.2	r.?	-	-	intronic	23	0	0	32	4	12.5	52	13	25	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.803303856	0.803303856	1	1.545336788	1.545336788	1	1.656925926	1.656925926	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000201	1	6.47E-19	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	84633189	G	T	ADAMTSL3	CCDS10326.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	43	4	9.3	48	7	14.6	47	5	10.6	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.597658069	0.597658069	1	0.902476684	0.902476684	1	2.280962963	2.280962963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000066	1	4.81E-09	1	0.00000402	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	85787285	G	C	-	-	-	-	-	-	9	0	0	20	0	0	22	3	13.6	12	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0	NA	0	0.840663212	0.840663212	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000179267	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	85893018	C	T	-	-	-	-	-	-	16	0	0	28	0	0	37	6	16.2	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0	NA	0	1.001378238	1.001378238	1	0.688592593	0.688592593	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	3.18E-08	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	86198198	C	T	AKAP13	CCDS32320.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	34	3	8.8	31	6	19.4	37	3	8.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.565525915	0.565525915	1	1.199181347	1.199181347	1	1.743	1.743	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000666058	1	1.03E-08	1	0.000855237	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	87122933	T	C	AGBL1	ENST00000421325	r.?	-	-	intronic	39	0	0	46	9	19.6	46	12	26.1	37	2	5.4	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.259580447	1.259580447	1	1.613331606	1.613331606	1	1.162	1.162	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.82E-12	1	8.12E-18	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	87171672	C	T	AGBL1	ENST00000421325	r.?	-	-	intronic	21	0	0	22	0	0	35	0	0	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0	NA	0	0	0	1	2.345518519	1.172759259	2	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	88715143	G	A	NTRK3	CCDS10340.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	40	7	17.5	38	7	18.4	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.124625399	1.124625399	1	1.137367876	1.137367876	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-09	1	8.61E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	89519792	T	C	-	-	-	-	-	-	34	0	0	41	4	9.8	43	6	14	34	4	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.629790223	0.629790223	1	0.865388601	0.865388601	1	2.539185185	2.539185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000546	1	8.13E-08	1	0.0000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	90109944	G	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	40	16	40	39	14	35.9	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	2.570572341	1.473434411	1.74461267	2.219103627	1.109551813	2	1.334148148	1.334148148	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.56E-27	1	8.19E-23	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	90397059	T	A	AP3S2	CCDS10357.1	r.?	-	-	intronic	4	0	0	7	0	0	4	0	0	31	3	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0	NA	0	0	0	1	2.087296296	2.087296296	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.000505952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	91875056	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	46	12	26.1	43	18	41.9	30	3	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.677298452	0.961415953	1.74461267	2.589984456	1.294992228	2	2.151851852	2.151851852	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.12E-18	1	2.06E-30	1	0.000458697	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	92412842	T	A	SLCO3A1	CCDS10371.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	38	3	7.9	39	7	17.9	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.507688037	0.507688037	1	1.10646114	1.10646114	1	1.699962963	1.699962963	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000925091	1	1.04E-09	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	92939934	G	A	ST8SIA2	CCDS10372.1	r.?	-	-	intronic	6	0	0	17	4	23.5	25	1	4	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.51021125	1.51021125	1	0.247253886	0.247253886	1	1.269592593	1.269592593	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000141	1	0.117779757	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	93426930	T	C	-	-	-	-	-	-	20	0	0	29	5	17.2	28	4	14.3	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.105346106	1.105346106	1	0.883932642	0.883932642	1	1.054407407	1.054407407	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000336	1	0.0000116	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	93564539	T	A	CHD2	CCDS10374.2	r.?	-	-	intronic	27	0	0	39	10	25.6	32	5	15.6	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.645166298	1.645166298	1	0.964290155	0.964290155	1	0.494925926	0.494925926	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.44E-15	1	0.000000562	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	93603441	C	T	RGMA	CCDS45357.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	28	2	7.1	23	6	26.1	51	6	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.45627659	0.45627659	1	1.613331606	1.613331606	1	2.539185185	0.846395062	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.008668191	1	1.47E-09	1	0.000000232	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	94363525	A	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	43	10	23.3	51	7	13.7	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.497358388	1.497358388	1	0.84684456	0.84684456	1	1.205037037	1.205037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.61E-14	1	7.46E-09	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	94389183	C	T	-	-	-	-	-	-	11	0	0	24	3	12.5	32	6	18.8	31	3	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.803303856	0.803303856	1	1.162093264	1.162093264	1	2.087296296	2.087296296	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000233853	1	1.27E-08	1	0.000505952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	94455941	A	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	43	6	14	48	6	12.5	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.899700319	0.899700319	1	0.772668394	0.772668394	1	2.388555556	1.194277778	2	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.13E-08	1	0.00000016	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	95009743	G	T	MCTP2	CCDS32338.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	55	10	18.2	44	4	9.1	57	2	3.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.169610415	1.169610415	1	0.562502591	0.562502591	1	0.753148148	0.753148148	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.33E-13	1	0.0000723	1	0.03327602	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	95165299	G	C	-	-	-	-	-	-	27	0	0	36	4	11.1	37	7	18.9	48	5	10.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.713333824	0.713333824	1	1.168274611	1.168274611	1	2.237925926	2.237925926	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000324	1	7.05E-10	1	0.00000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	95398757	G	T	-	-	-	-	-	-	9	0	0	16	2	12.5	11	1	9.1	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.803303856	0.803303856	1	0.562502591	0.562502591	1	1.958185185	1.958185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.002863359	1	0.05364542	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	96210589	G	A	-	-	-	-	-	-	17	0	0	45	8	17.8	42	9	21.4	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.143904692	1.143904692	1	1.32280829	1.32280829	1	1.226555556	1.226555556	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.14E-11	1	7.51E-13	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	96557151	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	31	4	12.9	38	4	10.5	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.82900958	0.82900958	1	0.649041451	0.649041451	1	2.625259259	0.87508642	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000177	1	0.0000403	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	96589943	T	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	44	9	20.5	41	10	24.4	47	6	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.317418325	1.317418325	1	1.508248705	1.508248705	1	2.75437037	0.918123457	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.18E-12	1	9.51E-15	1	0.000000141	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	97374375	C	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	34	3	8.8	34	5	14.7	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.565525915	0.565525915	1	0.908658031	0.908658031	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000666058	1	0.000000771	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	97646335	T	C	-	-	-	-	-	-	22	0	0	42	5	11.9	45	8	17.8	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.764745271	0.764745271	1	1.100279793	1.100279793	1	0.473407407	0.473407407	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000228	1	7.14E-11	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	97693535	G	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	33	5	15.2	41	6	14.6	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.976817489	0.976817489	1	0.902476684	0.902476684	1	1.054407407	1.054407407	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000066	1	6.05E-08	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	97932641	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	47	10	21.3	58	7	12.1	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.368829771	1.368829771	1	0.747943005	0.747943005	1	1.054407407	1.054407407	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.27E-14	1	1.88E-08	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	98093381	A	C	-	-	-	-	-	-	36	0	0	62	8	12.9	55	10	18.2	55	4	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.82900958	0.82900958	1	1.125005181	1.125005181	1	1.570851852	1.570851852	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-09	1	2.33E-13	1	0.000173903	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	98093982	A	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	41	6	14.6	54	8	14.8	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.938258904	0.938258904	1	0.914839378	0.914839378	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.05E-08	1	3.31E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	98197384	G	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	53	0	0	49	4	8.2	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0	NA	0	0.506870466	0.506870466	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000110643	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	98676383	C	A	-	-	-	-	-	-	51	0	0	43	9	20.9	41	6	14.6	57	2	3.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.343124048	1.343124048	1	0.902476684	0.902476684	1	0.753148148	0.753148148	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.45E-13	1	6.05E-08	1	0.03327602	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	99987602	G	T	-	-	-	-	-	-	11	0	0	16	3	18.8	11	4	36.4	26	6	23.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.208169	1.208169	1	2.250010363	2.250010363	1	4.970777778	1.656925926	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000667	1	0.000000201	1	3.3E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	100520768	C	T	ADAMTS17	CCDS10383.1	r.?	-	-	intronic	14	0	0	19	4	21.1	26	4	15.4	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.35597691	1.35597691	1	0.951927461	0.951927461	1	0.624037037	0.624037037	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000228	1	0.00000856	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	100671923	C	A	ADAMTS17	CCDS10383.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	28	3	10.7	32	6	18.8	33	3	9.1	1	1	100	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	0.687628101	0.687628101	1	1.162093264	1.162093264	1	1.958185185	1.958185185	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	0.005	0.000372895	1	1.27E-08	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	101246569	C	T	-	-	-	-	-	-	14	0	0	28	5	17.9	16	0	0	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.150331122	1.150331122	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000000279	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	15	102461436	G	C	OR4F4	CCDS32343.1	r.?	-	-	downstream	11	0	0	21	4	19	34	12	35.3	40	6	15	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.74461267	3	5	1	2	3	1	1	2	0.25538733	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.74461267	NA	NA	1.221021862	1.221021862	1	2.182015544	1.091007772	2	3.227777778	1.075925926	3	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000349	1	1.21E-19	1	5.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	536654	G	A	RAB11FIP3	CCDS32351.1	r.?	-	-	intronic	17	0	0	12	4	33.3	14	5	35.7	30	2	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	3.340073114	5.536427274	3	2	3	2	1	2	1	0.659926886	0.463572726	NA	3	3	NA	1	3	NA	0.340073114	0.536427274	2.891045455	0.963681818	3	2.328147034	0.994903544	2.340073114	1.477681368	1.477681368	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000003	1	6.03E-09	1	0.009909649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	864520	A	T	PRR25	CCDS45372.1	r.?	-	-	downstream	10	0	0	23	1	4.3	19	6	31.6	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	3.340073114	5.536427274	3	2	3	2	1	2	1	0.659926886	0.463572726	NA	3	3	NA	1	3	NA	0.340073114	0.536427274	0.373318182	0.373318182	1	2.060768804	1.030384402	2	2.690703387	1.092195639	2.463572726	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.108890944	1	4.01E-10	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	1533607	C	T	C16orf38	CCDS32362.1	r.?	-	-	downstream	12	0	0	21	0	0	26	4	15.4	26	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	3.340073114	5.536427274	3	2	3	2	1	2	1	0.659926886	0.463572726	NA	3	3	NA	1	3	NA	0.340073114	0.536427274	0	0	1	1.004298721	1.004298721	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1	1	0.00000856	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	1533612	G	A	C16orf38	CCDS32362.1	r.?	-	-	downstream	11	0	0	21	0	0	27	4	14.8	26	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	3.340073114	5.536427274	3	2	3	2	1	2	1	0.659926886	0.463572726	NA	3	3	NA	1	3	NA	0.340073114	0.536427274	0	0	1	0.965170199	0.965170199	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1	1	0.00001	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	1533617	C	T	C16orf38	CCDS32362.1	r.?	-	-	downstream	12	0	0	20	0	0	29	4	13.8	27	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	3.340073114	5.536427274	3	2	3	2	1	2	1	0.659926886	0.463572726	NA	3	3	NA	1	3	NA	0.340073114	0.536427274	0	0	1	0.899955997	0.899955997	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1	1	0.0000134	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	2770994	C	T	PRSS27	CCDS10476.1	r.?	-	-	upstream	9	0	0	9	3	33.3	5	1	20	27	3	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	5	3.340073114	5.536427274	3	2	3	2	1	2	1	0.659926886	0.463572726	NA	3	3	NA	1	3	NA	0.340073114	0.536427274	2.891045455	2.891045455	1	1.304284053	1.304284053	1	2.448098983	2.448098983	1	NA	NA	1	NA	NA	0	0	0	1	5	NA	1	1	0.0000103	1	0.024751247	1	0.000334187	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	4082058	G	A	ADCY9	CCDS32382.1	r.?	-	-	intronic	10	0	0	20	6	30	18	6	33.3	22	3	13.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	4.801869947	5.536427274	3	2	3	2	2	2	1	0.198130053	0.463572726	NA	3	3	NA	2	3	NA	0.801869947	0.536427274	2.604545455	0.868181818	3	2.658411294	0.94879896	2.801869947	2.999472628	2.999472628	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.7E-10	1	2.75E-10	1	0.000179267	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	4248609	C	A	SRL	CCDS42113.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	53	4	7.5	65	0	0	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	5	4.801869947	5.536427274	3	2	3	2	2	2	1	0.198130053	0.463572726	NA	3	3	NA	2	3	NA	0.801869947	0.536427274	0.651136364	0.651136364	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.000150502	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	4754941	G	A	ANKS3	CCDS10520.1	r.?	-	-	intronic	10	0	0	23	8	34.8	17	7	41.2	41	6	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	4.801869947	5.536427274	3	2	3	2	2	2	1	0.198130053	0.463572726	NA	3	3	NA	2	3	NA	0.801869947	0.536427274	3.021272727	1.007090909	3	3.289085444	1.173889405	2.801869947	3.220022086	1.073340695	3	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.79E-13	1	1.45E-12	1	6.05E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	4992319	A	G	-	-	-	-	-	-	14	0	0	40	10	25	27	8	29.6	29	3	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	4.801869947	5.536427274	3	2	3	2	2	2	1	0.198130053	0.463572726	NA	3	3	NA	2	3	NA	0.801869947	0.536427274	2.170454545	1.085227273	2	2.363032261	0.843376854	2.801869947	2.271659417	2.271659417	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.22E-15	1	7.97E-13	1	0.000414371	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	5515244	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	51	24	47.1	38	12	31.6	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	4.801869947	5.536427274	3	2	3	2	2	2	1	0.198130053	0.463572726	NA	3	3	NA	2	3	NA	0.801869947	0.536427274	4.089136364	1.363045455	3	2.522696603	0.900361776	2.801869947	1.94083523	1.94083523	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.2E-41	1	5.86E-19	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	6364496	A	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	36	2	5.6	72	8	11.1	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	4.801869947	5.536427274	3	2	3	2	2	2	1	0.198130053	0.463572726	NA	3	3	NA	2	3	NA	0.801869947	0.536427274	0.486181818	0.486181818	1	0.886137098	0.886137098	1	1.10274729	1.10274729	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.014070883	1	3.52E-09	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	6673822	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	58	10	17.2	62	9	14.5	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	4.801869947	5.536427274	3	2	3	2	2	2	1	0.198130053	0.463572726	NA	3	3	NA	2	3	NA	0.801869947	0.536427274	1.493272727	1.493272727	1	1.157566479	1.157566479	1	0.573428591	0.573428591	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.1E-13	1	3.12E-11	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	6809200	G	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	45	8	17.8	54	6	11.1	44	5	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	4.801869947	5.536427274	3	2	3	2	2	2	1	0.198130053	0.463572726	NA	3	3	NA	2	3	NA	0.801869947	0.536427274	1.545363636	1.545363636	1	0.886137098	0.886137098	1	2.51426382	1.020576253	2.463572726	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.14E-11	1	0.000000329	1	0.00000288	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	6908192	C	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	62	27	43.5	54	24	44.4	30	4	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	4.801869947	5.536427274	3	2	3	2	2	2	1	0.198130053	0.463572726	NA	3	3	NA	2	3	NA	0.801869947	0.536427274	3.776590909	1.258863636	3	3.544548391	1.265065281	2.801869947	2.93330779	0.977769263	3	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.76E-45	1	7.24E-41	1	0.0000154	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	7095545	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	47	11	23.4	54	23	42.6	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	4.801869947	5.536427274	3	2	3	2	2	2	1	0.198130053	0.463572726	NA	3	3	NA	2	3	NA	0.801869947	0.536427274	2.031545455	1.015772727	2	3.400850484	1.21377885	2.801869947	0.573428591	0.573428591	1	NA	NA	1	0	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.21E-16	1	1.12E-38	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	7938800	C	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	58	6	10.3	56	6	10.7	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	5	5	5.536427274	3	3	3	2	2	2	1	1	0.463572726	NA	NA	3	NA	NA	3	NA	NA	0.536427274	0.894227273	0.894227273	1	0.875404145	0.875404145	1	1.543846205	1.543846205	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000506	1	0.000000409	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	9922417	C	A	GRIN2A	CCDS10539.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	40	5	12.5	40	6	15	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	3.342639447	2.449705845	2	2	2	0	1	0	1	0.657360553	0.550294155	NA	2	2	NA	2	1	NA	0.342639447	0.449705845	0.710227273	0.710227273	1	0.97859799	0.97859799	1	0.531110282	0.531110282	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000178	1	5.18E-08	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	10051501	G	A	GRIN2A	CCDS10539.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	41	10	24.4	32	7	21.9	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	NA	2.449705845	2	NA	2	0	NA	0	1	NA	0.550294155	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.449705845	1.386363636	1.386363636	1	NA	NA	1	0.493173833	0.493173833	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	9.51E-15	1	2.36E-10	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	10233788	G	A	GRIN2A	CCDS10539.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	37	13	35.1	41	15	36.6	47	7	14.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.449705845	2	2	2	0	0	0	1	1	0.550294155	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.449705845	1.994318182	0.997159091	2	1.896373057	0.948186528	2	2.82626543	1.413132715	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.89E-21	1	1.71E-24	1	4.12E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	10430713	G	A	-	-	-	-	-	-	12	0	0	14	4	28.6	11	2	18.2	12	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.449705845	2	2	2	0	0	0	1	1	0.550294155	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.449705845	1.625	1.625	1	0.943005181	0.943005181	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000601	1	0.001334363	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	12698979	C	T	-	-	-	-	-	-	49	0	0	36	6	16.7	38	11	28.9	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.449705845	2	2	2	0	0	0	1	1	0.550294155	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.449705845	0.948863636	0.948863636	1	1.497409326	1.497409326	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.68E-08	1	5.19E-17	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	13976446	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	40	6	15	31	7	22.6	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.449705845	2	2	2	0	0	0	1	1	0.550294155	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.449705845	0.852272727	0.852272727	1	1.170984456	1.170984456	1	0.948411218	0.948411218	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.18E-08	1	1.85E-10	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	14115778	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	38	14	36.8	38	14	36.8	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.449705845	2	2	2	0	0	0	1	1	0.550294155	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.449705845	2.090909091	1.045454545	2	1.906735751	0.953367876	2	0.948411218	0.948411218	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.28E-23	1	5.28E-23	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	15112546	C	T	PDXDC1	CCDS32393.1	r.?	-	-	intronic	57	0	0	120	26	21.7	128	41	32	68	8	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.449705845	2	2	2	0	0	0	1	1	0.550294155	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.449705845	1.232954545	1.232954545	1	1.658031088	0.829015544	2	2.238250475	1.119125237	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.44E-34	1	1.62E-61	1	2.21E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	15320948	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	98	27	27.6	130	47	36.2	65	5	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.449705845	2	2	2	0	0	0	1	1	0.550294155	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.449705845	1.568181818	0.784090909	2	1.875647668	0.937823834	2	1.460553276	1.460553276	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.38E-39	1	3E-73	1	0.0000201	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	15386323	C	A	-	-	-	-	-	-	8	0	0	27	4	14.8	21	2	9.5	17	1	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.449705845	2	2	2	0	0	0	1	1	0.550294155	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.449705845	0.840909091	0.840909091	1	0.492227979	0.492227979	1	1.119125237	1.119125237	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00001	1	0.004928472	1	0.081683532	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	15930401	C	T	MYH11	CCDS45424.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	47	3	6.4	65	9	13.8	30	2	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.449705845	2	2	2	0	0	0	1	1	0.550294155	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.449705845	0.363636364	0.363636364	1	0.715025907	0.715025907	1	1.270871032	1.270871032	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001719595	1	4.85E-11	1	0.009909649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	16182373	C	A	ABCC1	CCDS42122.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	49	5	10.2	69	11	15.9	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2.449705845	2	2	2	0	0	0	1	1	0.550294155	NA	NA	2	NA	NA	1	NA	NA	0.449705845	0.579545455	0.579545455	1	0.823834197	0.823834197	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000496	1	6.82E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	16981636	C	G	-	-	-	-	-	-	20	0	0	58	9	15.5	63	12	19	51	4	7.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.72742382	5.510608181	2.449705845	3	3	2	1	2	0	0.27257618	0.489391819	0.550294155	3	4	2	2	2	1	0.72742382	0.510608181	0.449705845	1.30343251	1.30343251	1	1.651471513	1.093249417	1.510608181	1.4795215	1.4795215	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.67E-11	1	5.15E-16	1	0.000129466	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	17017486	C	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	63	17	27	79	27	34.2	40	4	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.72742382	5.510608181	2.449705845	3	3	2	1	2	0	0.27257618	0.489391819	0.550294155	3	4	2	2	2	1	0.72742382	0.510608181	0.449705845	2.27049534	0.99908437	2.27257618	2.972648723	0.990882908	3	1.896822436	1.896822436	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	6.22E-25	1	5.9E-42	1	0.0000495	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	17018687	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	69	14	20.3	82	36	43.9	40	7	17.5	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.72742382	5.510608181	2.449705845	3	3	2	1	2	0	0.27257618	0.489391819	0.550294155	3	4	2	2	2	1	0.72742382	0.510608181	0.449705845	1.707076126	0.853538063	2	3.81576839	1.086925169	3.510608181	3.319439264	1.659719632	2	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	7.3E-19	1	2.7E-60	1	1.26E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	17024387	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	81	23	28.4	73	18	24.7	52	8	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.72742382	5.510608181	2.449705845	3	3	2	1	2	0	0.27257618	0.489391819	0.550294155	3	4	2	2	2	1	0.72742382	0.510608181	0.449705845	2.388224728	1.050888744	2.27257618	2.146912967	1.073456483	2	2.921106552	1.460553276	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	8.61E-34	1	1.62E-25	1	2.42E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	17118616	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	58	14	24.1	74	25	33.8	27	4	14.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.72742382	5.510608181	2.449705845	3	3	2	1	2	0	0.27257618	0.489391819	0.550294155	3	4	2	2	2	1	0.72742382	0.510608181	0.449705845	2.026627322	1.013313661	2	2.937880902	0.979293634	3	2.807297206	1.403648603	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.04E-20	1	8.25E-39	1	0.00001	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	17756941	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	76	12	15.8	79	24	30.4	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4.72742382	5.510608181	2.449705845	3	3	2	1	2	0	0.27257618	0.489391819	0.550294155	3	4	2	2	2	1	0.72742382	0.510608181	0.449705845	1.328660236	1.328660236	1	2.642354421	1.052475827	2.510608181	0.493173833	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	5.63E-15	1	5.2E-36	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	17893512	A	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	69	27	39.1	62	29	46.8	44	6	13.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.72742382	5.510608181	2.449705845	3	3	2	1	2	0	0.27257618	0.489391819	0.550294155	3	4	2	2	2	1	0.72742382	0.510608181	0.449705845	3.288013623	1.096004541	3	4.067835095	1.158726604	3.510608181	2.579678513	1.289839257	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	6.8E-44	1	6.51E-50	1	9.37E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	18839290	A	C	SMG1	CCDS45430.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	55	11	20	43	7	16.3	27	2	7.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.72742382	5.510608181	2.449705845	3	3	2	1	2	0	0.27257618	0.489391819	0.550294155	3	4	2	2	2	1	0.72742382	0.510608181	0.449705845	1.6818484	0.8409242	2	1.416788719	1.416788719	1	1.403648603	1.403648603	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.77E-15	1	2.15E-09	1	0.00807567	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	20409269	C	G	PDILT	CCDS10584.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	53	5	9.4	30	1	3.3	54	0	0	380	0	0	376	49	13	305	28	9.2	206	8	3.9	FALSE	TRUE	4.72742382	5.510608181	2.449705845	3	3	2	1	2	0	0.27257618	0.489391819	0.550294155	3	4	2	2	2	1	0.72742382	0.510608181	0.449705845	0.790468748	0.790468748	1	0.286834526	0.286834526	1	0	NA	0	1.09320146	1.09320146	1	0.79965989	0.79965989	1	0.73976075	0.73976075	1	NA	5	1	1	0.00000734	3.4E-52	0.139615808	3.24E-26	1	0.0000114	YES	1_1	0_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	16	20409382	C	G	PDILT	CCDS10584.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	47	4	8.5	52	6	11.5	55	3	5.5	188	0	0	203	28	13.8	209	15	7.2	108	5	4.6	TRUE	TRUE	4.72742382	5.510608181	2.449705845	3	3	2	1	2	0	0.27257618	0.489391819	0.550294155	3	4	2	2	2	1	0.72742382	0.510608181	0.449705845	0.71478557	0.71478557	1	0.999574863	0.999574863	1	1.04325234	1.04325234	1	1.160475396	1.160475396	1	0.625820784	1.225637989	0.510608181	0.872538321	0.872538321	1	5	5	1	1	0.0000939	3.03E-31	0.000000261	3.56E-13	0.002700822	0.000227198	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	16	21348674	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	43	8	18.6	40	2	5	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	8	5.510608181	7	6	3	6	2	2	1	1	0.489391819	1	NA	4	NA	NA	2	NA	NA	0.510608181	NA	2.172818182	1.086409091	2	0.434597767	0.434597767	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.85E-11	1	0.017193422	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	21679587	G	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	64	7	10.9	79	15	19	30	1	3.3	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	8	9.438610352	7	6	7	6	2	2	1	1	0.561389648	1	NA	8	NA	NA	2	NA	NA	0.438610352	NA	1.273318182	1.273318182	1	2.397791926	0.983261604	2.438610352	0.776111111	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	3.78E-08	1	1.22E-19	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	22904388	G	T	HS3ST2	CCDS10606.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	75	44	58.7	91	62	68.1	57	21	36.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	8	9.438610352	7	6	7	6	2	2	1	1	0.561389648	1	NA	8	NA	NA	2	NA	NA	0.438610352	NA	6.857227273	1.142871212	6	8.594191059	1.155349004	7.438610352	8.654814815	1.442469136	6	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.54E-81	1	9.13E-120	1	8.56E-34	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	23034157	A	G	-	-	-	-	-	-	32	0	0	85	55	64.7	117	79	67.5	51	14	27.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	8	9.438610352	7	6	7	6	2	2	1	1	0.561389648	1	NA	8	NA	NA	2	NA	NA	0.438610352	NA	7.558136364	1.259689394	6	8.518471314	1.145169717	7.438610352	6.467592593	1.077932099	6	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2E-104	1	1.16E-151	1	6.64E-21	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	23554665	G	C	EARS2	CCDS42132.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	66	35	53	98	64	65.3	37	10	27	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	8	9.438610352	7	6	7	6	2	2	1	1	0.561389648	1	NA	8	NA	NA	2	NA	NA	0.438610352	NA	6.191363636	1.031893939	6	8.240832249	1.107845667	7.438610352	6.35	1.058333333	6	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.6E-62	1	1.15E-121	1	3.01E-15	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	23720637	A	T	ERN2	CCDS32407.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	89	2	2.2	109	8	7.3	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	8	9.438610352	7	6	7	6	2	2	1	1	0.561389648	1	NA	8	NA	NA	2	NA	NA	0.438610352	NA	0.257	NA	0	0.921256898	0.921256898	1	0.611481481	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.073610556	1	9.48E-08	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	24027109	G	C	PRKCB	CCDS10619.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	62	27	43.5	75	49	65.3	47	16	34	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	8	9.438610352	7	6	7	6	2	2	1	1	0.561389648	1	NA	8	NA	NA	2	NA	NA	0.438610352	NA	5.081590909	1.016318182	5	8.240832249	1.107845667	7.438610352	7.996296296	1.332716049	6	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.76E-45	1	1.58E-93	1	1.98E-25	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	24415316	C	A	RNU7-24P	ENST00000458867	r.?	-	-	upstream	19	0	0	39	5	12.8	41	0	0	47	2	4.3	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	8	9.438610352	7	6	7	6	2	2	1	1	0.561389648	1	NA	8	NA	NA	2	NA	NA	0.438610352	NA	1.495272727	1.495272727	1	0	0	1	1.011296296	1.011296296	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00000156	1	1	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	24519775	C	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	42	2	4.8	73	6	8.2	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	8	9.438610352	7	6	7	6	2	2	1	1	0.561389648	1	NA	8	NA	NA	2	NA	NA	0.438610352	NA	0.560727273	0.560727273	1	1.034836515	1.034836515	1	0.564444444	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.018854633	1	0.000002	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	25150755	C	T	LCMT1	CCDS45445.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	62	14	22.6	84	17	20.2	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	8	9.438610352	7	6	7	6	2	2	1	1	0.561389648	1	NA	8	NA	NA	2	NA	NA	0.438610352	NA	2.640090909	0.880030303	3	2.549231416	1.045362336	2.438610352	2.210740741	2.210740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.42E-19	1	1.42E-22	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	25451359	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	73	14	19.2	85	22	25.9	49	12	24.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.23248927	4.202464413	4	3	3	3	1	1	1	0.76751073	0.797535587	1	3	3	NA	2	2	NA	0.23248927	0.202464413	NA	1.519547031	1.519547031	1	1.912407195	0.956203597	2	5.027037037	1.675679012	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.71E-18	1	2.23E-31	1	1.9E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	25451420	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	73	14	19.2	85	17	20	37	9	24.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.23248927	4.202464413	4	3	3	3	1	1	1	0.76751073	0.797535587	1	3	3	NA	2	2	NA	0.23248927	0.202464413	NA	1.519547031	1.519547031	1	1.476762313	1.476762313	1	4.986	1.662	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.71E-18	1	1.77E-22	1	2.14E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	25823960	A	T	HS3ST4	ENST00000331351	r.?	-	-	intronic	36	0	0	75	12	16	68	13	19.1	49	4	8.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.23248927	4.202464413	4	3	3	3	1	1	1	0.76751073	0.797535587	1	3	3	NA	2	2	NA	0.23248927	0.202464413	NA	1.266289192	1.266289192	1	1.410308009	1.410308009	1	1.682518519	1.682518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.77E-15	1	2.96E-17	1	0.000110643	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	25824125	C	T	HS3ST4	ENST00000331351	r.?	-	-	intronic	23	0	0	79	6	7.6	63	6	9.5	53	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.23248927	4.202464413	4	3	3	3	1	1	1	0.76751073	0.797535587	1	3	3	NA	2	2	NA	0.23248927	0.202464413	NA	0.601487366	0.601487366	1	0.701462098	0.701462098	1	0.779703704	0.779703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000318	1	0.000000832	1	0.029108399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	25844312	C	T	HS3ST4	ENST00000331351	r.?	-	-	intronic	27	0	0	76	4	5.3	86	8	9.3	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.23248927	4.202464413	4	3	3	3	1	1	1	0.76751073	0.797535587	1	3	3	NA	2	2	NA	0.23248927	0.202464413	NA	0.419458295	0.419458295	1	0.686694475	0.686694475	1	1.538888889	1.538888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00060191	1	1.47E-08	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	26074573	G	T	HS3ST4	ENST00000331351	r.?	-	-	intronic	29	0	0	53	11	20.8	48	19	39.6	34	6	17.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.23248927	4.202464413	4	3	3	3	1	1	1	0.76751073	0.797535587	1	3	3	NA	2	2	NA	0.23248927	0.202464413	NA	1.64617595	1.64617595	1	2.923989379	0.974663126	3	3.611259259	1.203753086	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.07E-15	1	1.92E-31	1	1.86E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	26816988	G	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	48	11	22.9	30	7	23.3	31	2	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.23248927	4.202464413	4	3	3	3	1	1	1	0.76751073	0.797535587	1	3	3	NA	2	2	NA	0.23248927	0.202464413	NA	1.812376406	1.025383538	1.76751073	1.720428094	1.720428094	1	1.333703704	1.333703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.31E-16	1	1.44E-10	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	27853394	G	A	GSG1L	CCDS45450.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	26	11	42.3	30	13	43.3	34	4	11.8	404	1	0.2	272	55	20.2	242	37	15.3	163	7	4.3	TRUE	TRUE	4.252124502	4	4	2	2	3	2	2	1	0.747875498	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.252124502	NA	NA	3.356057755	1.490174168	2.252124502	3.109523316	1.554761658	2	2.421185185	2.421185185	1	1.602656422	0.801328211	2	1.098746114	1.098746114	1	0.882296296	0.882296296	1	5	5	1	0.868014986	3.52E-19	1.7E-69	1.35E-22	1.7E-42	0.0000257	0.0000211	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	16	27853464	G	A	GSG1L	CCDS45450.1	r.?	-	-	intronic	15	0	0	16	1	6.2	25	7	28	34	3	8.8	351	3	0.9	214	15	7	224	24	10.7	127	4	3.1	TRUE	TRUE	4.252124502	4	4	2	2	3	2	2	1	0.747875498	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.252124502	NA	NA	0.491904446	0.491904446	1	2.010777202	1.005388601	2	1.80562963	1.80562963	1	0.555375988	0.555375988	1	0.768404145	0.768404145	1	0.636074074	0.636074074	1	5	4	1	0.257196885	0.077068876	5.02E-13	3.47E-11	2.61E-24	0.000666058	0.003965886	YES	0_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	16	28252427	T	C	-	-	-	-	-	-	17	0	0	31	4	12.9	24	4	16.7	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	FALSE	FALSE	4.252124502	4	4	2	2	3	2	2	1	0.747875498	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.252124502	NA	NA	1.023478606	1.023478606	1	1.199284974	1.199284974	1	0.595037037	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	0	NA	0	NA	NA	1	1	0.0000177	1	0.00000613	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	29744825	G	A	-	-	-	-	-	-	14	0	0	35	1	2.9	39	5	12.8	19	3	15.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.164772727	NA	0	0.663212435	0.663212435	1	3.241925926	1.080641975	3	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.16091139	1	0.00000156	1	0.000114071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	29745123	G	A	-	-	-	-	-	-	18	0	0	38	2	5.3	48	7	14.6	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.301136364	0.301136364	1	0.756476684	0.756476684	1	1.272148148	1.272148148	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.015598339	1	4.81E-09	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	30712768	T	G	SRCAP	CCDS10689.2	r.?	-	-	intronic	22	0	0	70	2	2.9	96	6	6.2	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.164772727	0.164772727	1	0.321243523	0.321243523	1	0.554	0.554	1	NA	NA	1	0	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.048267597	1	0.00000986	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	32095471	C	G	-	-	-	-	-	-	22	0	0	18	3	16.7	11	1	9.1	58	1	1.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	0.471502591	0.471502591	1	0.348814815	0.348814815	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000964	1	0.05364542	1	0.252280541	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	32411969	G	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	69	9	13	63	8	12.7	51	4	7.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.738636364	0.738636364	1	0.658031088	0.658031088	1	1.600444444	1.600444444	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.45E-11	1	1.18E-09	1	0.000129466	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	32632761	C	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	75	14	18.7	81	13	16	73	2	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.0625	1.0625	1	0.829015544	0.829015544	1	0.554	0.554	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.57E-18	1	3.34E-16	1	0.052016623	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	32654641	T	A	-	-	-	-	-	-	78	0	0	83	4	4.8	106	8	7.5	85	2	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.272727273	0.272727273	1	0.388601036	0.388601036	1	0.492444444	0.492444444	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.000838577	1	7.62E-08	1	0.067975933	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	32944306	C	G	ENSG00000230462	ENST00000423205	r.?	-	-	intronic	7	0	0	27	9	33.3	29	15	51.7	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.892045455	0.946022727	2	2.678756477	1.339378238	2	1.928740741	1.928740741	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.44E-15	1	2.22E-27	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	32944556	C	G	ENSG00000230462	ENST00000423205	r.?	-	-	intronic	23	0	0	51	12	23.5	57	22	38.6	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.335227273	1.335227273	1	2	1	2	0.984888889	0.984888889	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.24E-17	1	7.03E-36	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	32945278	C	A	ENSG00000230462	ENST00000423205	r.1154c>a	c.1154C>A	p.S385Y	missense	22	0	0	44	10	22.7	37	11	29.7	48	3	6.2	659	0	0	718	135	18.8	538	112	20.8	352	29	8.2	TRUE	TRUE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.289772727	1.289772727	1	1.538860104	1.538860104	1	1.272148148	1.272148148	1	1.068181818	1.068181818	1	1.077720207	1.077720207	1	1.682518519	0.841259259	2	5	5	1	1	2.08E-14	2.51E-163	3.7E-17	3.25E-141	0.001827434	9.53E-26	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	16	33355106	C	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	59	6	10.2	56	7	12.5	55	3	5.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.579545455	0.579545455	1	0.647668394	0.647668394	1	1.128518519	1.128518519	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000561	1	1.46E-08	1	0.002700822	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	33461060	G	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	47	4	8.5	54	2	3.7	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.482954545	0.482954545	1	0.191709845	0.191709845	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.0000939	1	0.030129377	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	47396560	A	T	ITFG1	CCDS10728.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	34	13	38.2	34	15	44.1	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.170454545	1.085227273	2	2.284974093	1.142487047	2	1.744074074	1.744074074	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.03E-21	1	5.18E-26	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	47689552	T	A	PHKB	CCDS42161.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	36	8	22.2	34	6	17.6	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	0.911917098	0.911917098	1	0.430888889	0.430888889	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-11	1	1.86E-08	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	47693315	T	C	PHKB	CCDS42161.1	r.?	-	-	intronic	47	0	0	49	12	24.5	63	11	17.5	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.392045455	1.392045455	1	0.906735751	0.906735751	1	1.80562963	1.80562963	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.9E-17	1	2.37E-14	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	47698301	C	A	PHKB	CCDS42161.1	r.?	-	-	intronic	20	0	0	35	8	22.9	27	8	29.6	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.301136364	1.301136364	1	1.533678756	1.533678756	1	1.538888889	1.538888889	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.15E-12	1	7.97E-13	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	48395645	C	T	SIAH1	CCDS32444.1	r.1212g>a	c.788G>A	p.R263Q	missense	33	0	0	41	7	17.1	40	3	7.5	36	2	5.6	134	1	0.7	177	23	13	181	37	20.4	180	7	3.9	TRUE	TRUE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.971590909	0.971590909	1	0.388601036	0.388601036	1	1.149037037	1.149037037	1	0.738636364	0.738636364	1	1.056994819	1.056994819	1	0.800222222	0.800222222	1	5	5	1	0.48915068	1.51E-09	2.5E-25	0.001075403	1.72E-47	0.014070883	0.0000397	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	16	49697568	G	T	ZNF423	CCDS32445.1	r.?	-	-	intronic	13	0	0	13	8	61.5	17	8	47.1	39	6	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.494318182	1.747159091	2	2.440414508	1.220207254	2	3.159851852	1.053283951	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.92E-16	1	9.12E-15	1	4.43E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	50014372	T	C	-	-	-	-	-	-	23	0	0	27	4	14.8	26	3	11.5	22	4	18.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.840909091	0.840909091	1	0.595854922	0.595854922	1	3.73437037	1.244790123	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00001	1	0.000298167	1	0.00000425	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	51538331	T	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	58	12	20.7	44	21	47.7	44	7	15.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.176136364	1.176136364	1	2.471502591	1.235751295	2	3.262444444	1.087481481	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.76E-16	1	8.6E-37	1	2.55E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	51589280	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	63	18	28.6	55	22	40	46	7	15.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.625	0.8125	2	2.07253886	1.03626943	2	3.118814815	1.039604938	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.98E-27	1	2.65E-36	1	3.53E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	52199610	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	49	15	30.6	66	22	33.3	45	6	13.3	98	2	2	306	45	14.7	284	50	17.6	297	13	4.4	TRUE	TRUE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.738636364	0.869318182	2	1.725388601	0.862694301	2	2.728962963	0.909654321	3	0.835227273	0.835227273	1	0.911917098	0.911917098	1	0.902814815	0.902814815	1	5	5	1	0.086801297	4.1E-23	1.58E-50	3.52E-34	4.36E-60	0.000000108	5.63E-09	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	16	52204845	C	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	47	14	29.8	74	13	17.6	39	4	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.693181818	0.846590909	2	0.911917098	0.911917098	1	2.113407407	2.113407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.79E-21	1	9.62E-17	1	0.0000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	52256056	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	57	17	29.8	60	28	46.7	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.693181818	0.846590909	2	2.419689119	1.20984456	2	2.503259259	0.834419753	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.82E-26	1	3.31E-48	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	52256296	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	53	23	43.4	53	27	50.9	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.465909091	1.232954545	2	2.637305699	1.31865285	2	2.503259259	0.834419753	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.43E-39	1	6.4E-48	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	52256385	G	C	-	-	-	-	-	-	17	0	0	33	7	21.2	47	22	46.8	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.204545455	1.204545455	1	2.424870466	1.212435233	2	0.533481481	0.533481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.98E-10	1	3.14E-38	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	52256560	G	C	-	-	-	-	-	-	19	0	0	34	8	23.5	37	15	40.5	24	3	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.335227273	1.335227273	1	2.098445596	1.049222798	2	2.564814815	2.564814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.32E-12	1	2.58E-25	1	0.000233853	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	53138050	C	A	CHD9	CCDS45485.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	35	9	25.7	45	3	6.7	30	2	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.460227273	1.460227273	1	0.347150259	0.347150259	1	1.374740741	1.374740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.23E-13	1	0.001516071	1	0.009909649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	55519670	C	T	MMP2	CCDS10752.1	r.1322c>u	c.813C>T	p.Y271Y	silent	16	0	0	27	12	44.4	28	12	42.9	40	3	7.5	428	2	0.5	273	110	40.3	172	51	29.7	194	15	7.7	TRUE	TRUE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.522727273	1.261363636	2	2.222797927	1.111398964	2	1.538888889	1.538888889	1	2.289772727	1.144886364	2	1.538860104	0.769430052	2	1.579925926	0.789962963	2	5	5	1	0.631283117	3.96E-21	1.44E-175	6.9E-21	4.17E-74	0.001075403	1.2E-13	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	16	56188474	C	T	AC040168.1	ENST00000501259	r.?	-	-	intronic	25	0	0	31	15	48.4	18	5	27.8	29	6	20.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.75	1.375	2	1.440414508	1.440414508	1	4.247333333	1.415777778	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.51E-27	1	2.54E-08	1	6.72E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	59299404	G	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	37	8	21.6	41	11	26.8	53	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.227272727	1.227272727	1	1.388601036	1.388601036	1	0.389851852	0.389851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.33E-11	1	1.34E-16	1	0.233303855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	59456786	G	C	-	-	-	-	-	-	31	0	0	42	5	11.9	43	4	9.3	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.676136364	0.676136364	1	0.481865285	0.481865285	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000228	1	0.000066	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	61144592	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	42	6	14.3	35	8	22.9	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.186528497	1.186528497	1	0.471925926	0.471925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.02E-08	1	8.15E-12	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	61475855	A	G	-	-	-	-	-	-	23	0	0	41	14	34.1	33	13	39.4	54	6	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.9375	0.96875	2	2.041450777	1.020725389	2	2.277555556	1.138777778	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.9E-22	1	6.37E-22	1	0.000000329	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	61671420	A	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	28	4	14.3	34	6	17.6	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	0.911917098	0.911917098	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000116	1	1.86E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	61871745	T	A	CDH8	CCDS10802.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	57	17	29.8	41	21	51.2	35	4	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.693181818	0.846590909	2	2.652849741	1.32642487	2	2.339111111	2.339111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.82E-26	1	1.17E-37	1	0.0000289	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	62772418	C	A	-	-	-	-	-	-	20	0	0	40	14	35	35	10	28.6	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.988636364	0.994318182	2	1.481865285	1.481865285	1	1.928740741	1.928740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.25E-22	1	1.6E-15	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	62992135	C	T	-	-	-	-	-	-	16	0	0	25	14	56	12	6	50	50	6	12	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.181818182	1.590909091	2	2.590673575	1.295336788	2	2.462222222	0.820740741	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.58E-26	1	1.41E-11	1	0.000000206	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	63718949	A	G	-	-	-	-	-	-	24	0	0	42	13	31	35	14	40	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.761363636	0.880681818	2	2.07253886	1.03626943	2	0.902814815	0.902814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.72E-20	1	1.28E-23	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	63823219	C	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	33	12	36.4	33	13	39.4	39	1	2.6	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.068181818	1.034090909	2	2.041450777	1.020725389	2	0.533481481	0.533481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.86E-20	1	6.37E-22	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	63894725	G	A	-	-	-	-	-	-	16	0	0	19	5	26.3	6	2	33.3	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.494318182	1.494318182	1	1.725388601	1.725388601	1	2.380148148	1.190074074	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.43E-08	1	0.000370028	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	65019801	C	T	CDH11	CCDS10803.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	75	36	48	64	37	57.8	39	7	17.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.727272727	1.363636364	2	2.994818653	1.497409326	2	3.672814815	1.224271605	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.93E-62	1	5.4E-68	1	1.04E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	65186366	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	52	13	25	55	26	47.3	50	6	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	2.450777202	1.225388601	2	2.462222222	0.820740741	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.47E-19	1	4.61E-45	1	0.000000206	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	65905599	G	A	-	-	-	-	-	-	17	0	0	53	1	1.9	74	7	9.5	52	5	9.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.107954545	0.107954545	1	0.492227979	0.492227979	1	1.969777778	1.969777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.233303855	1	0.000000105	1	0.00000668	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	67111005	T	C	CBFB	CCDS10827.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	85	6	7.1	112	10	8.9	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.403409091	0.403409091	1	0.461139896	0.461139896	1	0.512962963	0.512962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.00000487	1	3.48E-10	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	67262050	C	G	FHOD1	CCDS10834.1	r.?	-	-	downstream	26	0	0	55	13	23.6	82	20	24.4	39	4	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.475750323	2	4	2	2	3	2	0	1	0.524249677	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.475750323	NA	NA	1.925186167	0.962593084	2	1.264248705	1.264248705	1	2.113407407	2.113407407	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.46E-18	1	4.4E-28	1	0.0000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	67262472	C	G	TMEM208	CCDS45511.1	r.343c>g	c.237C>G	p.F79L	missense	16	0	0	28	5	17.9	36	5	13.9	44	5	11.4	395	0	0	393	84	21.4	353	88	24.9	193	25	13	TRUE	TRUE	4.475750323	2	4	2	2	3	2	0	1	0.524249677	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.475750323	NA	NA	1.460204762	1.460204762	1	0.720207254	0.720207254	1	2.339111111	1.169555556	2	1.74571966	0.87285983	2	1.29015544	1.29015544	1	2.667407407	0.889135802	3	5	5	1	1	0.000000279	1.99E-107	0.00000104	5.24E-119	0.00000288	2.32E-27	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	16	67262678	C	T	FHOD1	CCDS10834.1	r.?	-	-	downstream	13	0	0	23	4	17.4	20	4	20	51	9	17.6	16	0	0	28	3	10.7	15	3	20	11	3	27.3	TRUE	TRUE	4.475750323	2	4	2	2	3	2	0	1	0.524249677	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.475750323	NA	NA	1.41941692	1.41941692	1	1.03626943	1.03626943	1	3.611259259	1.203753086	3	0.87285983	0.87285983	1	1.03626943	1.03626943	1	5.601555556	1.867185185	3	5	5	1	1	0.00000513	0.000372895	0.00000284	0.0000544	4.92E-12	0.00002	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	67263486	C	G	FHOD1	CCDS10834.1	r.3796g>c	c.?	p.?	3'UTR variant	12	0	0	42	9	21.4	47	13	27.7	36	8	22.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.475750323	2	4	2	2	3	2	0	1	0.524249677	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.475750323	NA	NA	1.74571966	1.74571966	1	1.435233161	1.435233161	1	4.555111111	1.51837037	3	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.51E-13	1	1.47E-19	1	1.04E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	67263511	C	A	FHOD1	CCDS10834.1	r.3771g>u	c.?	p.?	3'UTR variant	12	0	0	42	7	16.7	55	14	25.5	40	5	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.475750323	2	4	2	2	3	2	0	1	0.524249677	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.475750323	NA	NA	1.36231394	1.36231394	1	1.321243523	1.321243523	1	2.564814815	0.854938272	3	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.81E-09	1	2.19E-20	1	0.00000178	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	68815053	T	C	CDH1	CCDS10869.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	45	11	24.4	52	19	36.5	31	3	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.475750323	5	4	2	3	3	2	2	1	0.524249677	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.475750323	NA	NA	1.990446715	0.995223358	2	2.98619171	0.995397237	3	1.990296296	1.990296296	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.24E-16	1	1.24E-30	1	0.000505952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	70484735	G	A	FUK	CCDS10891.2	r.?	-	-	upstream	10	0	0	15	3	20	11	4	36.4	25	2	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.475750323	5	4	2	3	3	2	2	1	0.524249677	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.475750323	NA	NA	1.631513701	1.631513701	1	2.978010363	0.992670121	3	1.641481481	1.641481481	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.0000544	1	0.000000201	1	0.006948068	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	70674649	C	T	-	-	-	-	-	-	16	0	0	37	2	5.4	53	12	22.6	29	2	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.475750323	5	4	2	3	3	2	2	1	0.524249677	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.475750323	NA	NA	0.440508699	0.440508699	1	1.848984456	0.924492228	2	1.415777778	1.415777778	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.014826063	1	5.39E-17	1	0.009279585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	70897089	C	A	HYDIN2	CCDS42189.1	r.11597-4g>u	c.11469-4G>T	p.?	splice region	52	0	0	95	23	24.2	108	21	19.4	70	6	8.6	414	3	0.7	784	135	17.2	763	134	17.6	483	30	6.2	TRUE	TRUE	4.475750323	5	4	2	3	3	2	2	1	0.524249677	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.475750323	NA	NA	1.974131578	0.987065789	2	1.587181347	0.793590674	2	1.764592593	1.764592593	1	1.403101783	0.950771795	1.475750323	1.439917098	0.719958549	2	1.272148148	1.272148148	1	5	4	1	0.342309863	5.51E-32	8.65E-158	3.87E-27	7.33E-158	0.00000156	5.15E-23	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	16	74435973	A	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	38	10	26.3	50	10	20	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.494318182	1.494318182	1	1.03626943	1.03626943	1	1.826148148	1.826148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.06E-15	1	8.36E-14	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	74818539	C	T	-	-	-	-	-	-	18	0	0	22	6	27.3	24	5	20.8	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.551136364	1.551136364	1	1.077720207	1.077720207	1	1.210592593	1.210592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.09E-09	1	0.000000123	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	76268311	C	T	-	-	-	-	-	-	16	0	0	22	4	18.2	22	0	0	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000425	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	77391457	G	T	ADAMTS18	CCDS10926.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	27	4	14.8	35	3	8.6	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.840909091	0.840909091	1	0.445595855	0.445595855	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00001	1	0.000725791	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	77559122	C	T	-	-	-	-	-	-	15	0	0	32	1	3.1	20	4	20	25	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.176136364	0.176136364	1	1.03626943	1.03626943	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.14819814	1	0.00000284	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	78082747	T	G	-	-	-	-	-	-	7	0	0	7	1	14.3	7	3	42.9	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	2.222797927	2.222797927	1	0.512962963	0.512962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.034479353	1	0.00000431	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	78418433	G	A	WWOX	CCDS42196.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	36	15	41.7	31	12	38.7	30	3	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.369318182	1.184659091	2	2.005181347	1.002590674	2	2.051851852	2.051851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.54E-25	1	3.16E-20	1	0.000458697	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	78444333	A	G	WWOX	CCDS42196.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	23	8	34.8	30	12	40	26	4	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.977272727	0.988636364	2	2.07253886	1.03626943	2	3.159851852	1.053283951	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.79E-13	1	1.94E-20	1	0.00000856	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	78559584	G	A	WWOX	CCDS42196.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	27	10	37	33	12	36.4	25	3	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.102272727	1.051136364	2	1.886010363	0.943005181	2	2.462222222	2.462222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.62E-17	1	7.86E-20	1	0.00026475	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	78791835	C	T	WWOX	CCDS42196.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	27	10	37	27	13	48.1	33	4	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.102272727	1.051136364	2	2.492227979	1.24611399	2	2.482740741	2.482740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.62E-17	1	2.29E-23	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	82542942	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	43	7	16.3	45	6	13.3	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.926136364	0.926136364	1	0.689119171	0.689119171	1	0.533481481	0.533481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.15E-09	1	0.000000108	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	82722623	C	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	39	0	0	33	0	0	53	6	11.3	253	1	0.4	268	2	0.7	219	4	1.8	269	16	5.9	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.318592593	1.159296296	2	0.039772727	NA	0	0.093264249	0.093264249	1	1.210592593	1.210592593	1	3	NA	1	0.718654853	1	0.387579889	1	0.025025033	0.000000293	1.06E-12	YES	0_0	0_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	16	83114674	C	T	CDH13	ENST00000268613	r.?	-	-	intronic	15	0	0	17	4	23.5	34	6	17.6	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.335227273	1.335227273	1	0.911917098	0.911917098	1	0.471925926	0.471925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000141	1	1.86E-08	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	84696835	C	T	KLHL36	CCDS10948.1	r.3112c>u	c.?	p.?	3'UTR variant	20	0	0	24	6	25	24	0	0	42	1	2.4	469	0	0	261	33	12.6	170	34	20	200	5	2.5	TRUE	TRUE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	0	0	1	0.492444444	0.492444444	1	0.715909091	0.715909091	1	1.03626943	1.03626943	1	0.512962963	0.512962963	1	5	5	1	1	1.95E-09	3E-35	1	2.02E-43	0.189842622	0.00354548	YES	1_1	0_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	16	84823406	G	A	-	-	-	-	-	-	13	0	0	25	9	36	19	9	47.4	20	3	15	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.045454545	1.022727273	2	2.455958549	1.227979275	2	3.077777778	3.077777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.71E-15	1	1.72E-16	1	0.0001337	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	85900030	C	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	43	18	41.9	35	14	40	30	3	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.380681818	1.190340909	2	2.07253886	1.03626943	2	2.051851852	2.051851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.06E-30	1	1.28E-23	1	0.000458697	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	86025566	C	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	24	15	62.5	23	10	43.5	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.551136364	1.775568182	2	2.25388601	1.126943005	2	2.154444444	2.154444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.82E-29	1	1.05E-17	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	16	86143401	C	T	-	-	-	-	-	-	14	0	0	14	5	35.7	12	5	41.7	31	0	0	220	0	0	116	22	19	96	17	17.7	84	6	7.1	TRUE	TRUE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.028409091	2.028409091	1	2.160621762	2.160621762	1	0	0	1	1.079545455	1.079545455	1	0.917098446	0.917098446	1	1.456814815	1.456814815	1	5	5	1	1	6.03E-09	4.22E-28	2.4E-09	1.64E-21	1	0.00000455	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	16	89252957	C	T	CDH15	CCDS10976.1	r.?	-	-	intronic	13	0	0	11	4	36.4	15	3	20	39	5	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.068181818	2.068181818	1	1.03626943	1.03626943	1	2.62637037	0.87545679	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000201	1	0.0000544	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	885431	C	A	NXN	CCDS10998.1	r.?	-	-	upstream	15	0	0	28	7	25	30	7	23.3	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	1.207253886	1.207253886	1	0.537037037	0.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.44E-11	1	1.44E-10	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	1894300	G	A	RTN4RL1	CCDS45569.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	30	6	20	28	9	32.1	29	1	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	1.663212435	1.663212435	1	0.62962963	0.62962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.37E-09	1	1.24E-14	1	0.135292269	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	2080353	T	G	SMG6	CCDS11016.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	26	8	30.8	24	8	33.3	28	4	14.3	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.75	1.75	1	1.725388601	1.725388601	1	2.648148148	1.324074074	2	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.63E-13	1	2.68E-13	1	0.0000116	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	2584011	G	A	PAFAH1B1	CCDS32528.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	24	3	12.5	30	4	13.3	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	0.689119171	0.689119171	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000233853	1	0.0000154	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	2781349	C	A	RAP1GAP2	CCDS45573.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	23	4	17.4	22	4	18.2	12	1	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.988636364	0.988636364	1	0.943005181	0.943005181	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000513	1	0.00000425	1	0.058377193	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	3023278	G	A	-	-	-	-	-	-	15	0	0	27	3	11.1	24	6	25	23	1	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.630681818	0.630681818	1	1.295336788	1.295336788	1	0.796296296	0.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000334187	1	1.95E-09	1	0.108890944	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	7578478	G	C	TP53	CCDS11118.1	r.642c>g	c.452C>G	p.P151R	missense	13	0	0	9	3	33.3	4	2	50	20	3	15	495	0	0	251	90	35.9	175	60	34.3	118	12	10.2	TRUE	TRUE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.892045455	1.892045455	1	2.590673575	2.590673575	1	2.777777778	2.777777778	1	2.039772727	1.019886364	2	1.777202073	0.888601036	2	1.888888889	0.944444444	2	5	5	1	1	0.0000103	2.62E-138	0.000149002	2.27E-91	0.0001337	1.28E-12	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	17	8726263	G	A	-	-	-	-	-	-	20	0	0	30	5	16.7	20	2	10	27	3	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	0.518134715	0.518134715	1	2.055555556	2.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000401	1	0.004473894	1	0.000334187	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	10122096	G	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	29	7	24.1	33	14	42.4	23	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.369318182	1.369318182	1	2.196891192	1.098445596	2	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.11E-10	1	4.57E-24	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	10190734	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	38	12	31.6	31	10	32.3	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.795454545	0.897727273	2	1.67357513	1.67357513	1	2.055555556	2.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.86E-19	1	3.94E-16	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	12520581	A	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	41	15	36.6	39	20	51.3	29	2	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.079545455	1.039772727	2	2.658031088	1.329015544	2	1.277777778	1.277777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.71E-24	1	6E-36	1	0.009279585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	12977903	T	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	25	6	24	36	11	30.6	34	5	14.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.363636364	1.363636364	1	1.585492228	1.585492228	1	2.722222222	1.361111111	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	2.62E-17	1	0.000000771	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	13266248	C	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	34	8	23.5	35	5	14.3	50	3	6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.335227273	1.335227273	1	0.740932642	0.740932642	1	1.111111111	1.111111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.32E-12	1	0.000000895	1	0.002055544	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	15101018	T	C	-	-	-	-	-	-	36	0	0	48	8	16.7	34	5	14.7	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	0.761658031	0.761658031	1	0.425925926	0.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.23E-10	1	0.000000771	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	15467789	T	C	FAM18B2	CCDS45617.1	r.?	-	-	upstream	44	0	0	44	17	38.6	39	12	30.8	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.193181818	1.096590909	2	1.595854922	1.595854922	1	1.148148148	1.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.61E-28	1	8.43E-19	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	20775342	G	A	CCDC144NL	CCDS32591.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	41	12	29.3	32	8	25	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.664772727	0.832386364	2	1.295336788	1.295336788	1	1.462962963	1.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.69E-18	1	3.69E-12	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	26607779	C	G	-	-	-	-	-	-	43	0	0	51	17	33.3	35	13	37.1	42	4	9.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.892045455	0.946022727	2	1.922279793	0.961139896	2	1.759259259	1.759259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.59E-27	1	1.63E-21	1	0.0000601	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	28375622	C	T	EFCAB5	ENST00000394835	r.?	-	-	intronic	28	0	0	42	12	28.6	41	14	34.1	36	4	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.625	0.8125	2	1.766839378	0.883419689	2	2.055555556	2.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.35E-18	1	1.9E-22	1	0.0000324	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	31733365	G	A	ACCN1	CCDS42296.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	32	6	18.8	28	5	17.9	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.068181818	1.068181818	1	0.92746114	0.92746114	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.27E-08	1	0.000000279	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	33602841	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	40	7	17.5	42	14	33.3	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.994318182	0.994318182	1	1.725388601	0.862694301	2	0.518518519	0.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.26E-09	1	2.83E-22	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	34275330	A	T	LYZL6	CCDS11302.1	r.?	-	-	upstream	18	0	0	38	8	21.1	26	5	19.2	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.198863636	1.198863636	1	0.994818653	0.994818653	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.67E-11	1	0.000000188	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	34296055	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	36	16	44.4	33	15	45.5	37	4	10.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.522727273	1.261363636	2	2.357512953	1.178756477	2	2	2	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.01E-27	1	2.91E-26	1	0.0000362	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	38006269	G	T	IKZF3	CCDS11346.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	32	7	21.9	37	5	13.5	18	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.244318182	1.244318182	1	0.699481865	0.699481865	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.36E-10	1	0.00000119	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	39986733	C	T	NT5C3L	CCDS11410.1	r.?	-	-	intronic	15	0	0	10	5	50	18	9	50	33	5	15.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.840909091	1.420454545	2	2.590673575	1.295336788	2	2.814814815	1.407407407	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.71E-10	1	9.12E-17	1	0.00000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	40555360	T	A	PTRF	CCDS11425.1	r.2677a>u	c.?	p.?	3'UTR variant	12	0	0	13	2	15.4	18	3	16.7	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.875	0.875	1	0.865284974	0.865284974	1	0.574074074	0.574074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001879825	1	0.0000964	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	42353721	T	C	-	-	-	-	-	-	19	0	0	26	3	11.5	21	6	28.6	25	1	4	0	0	NA	2	2	100	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.653409091	0.653409091	1	1.481865285	1.481865285	1	0.740740741	0.740740741	1	5.681818182	2.840909091	2	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000298167	0.000025	7.95E-10	1	0.117779757	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	46838903	A	G	TTLL6	CCDS45724.1	r.?	-	-	downstream	12	0	0	24	7	29.2	26	10	38.5	30	4	13.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.659090909	1.659090909	1	1.994818653	0.997409326	2	2.462962963	2.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.51E-11	1	4.82E-17	1	0.0000154	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	48002153	G	A	-	-	-	-	-	-	10	0	0	16	8	50	10	7	70	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.840909091	1.420454545	2	3.626943005	1.813471503	2	0.944444444	0.944444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-15	1	9.25E-15	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	48963810	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	20	7	35	46	20	43.5	32	4	12.5	0	0	NA	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.988636364	0.994318182	2	2.25388601	1.126943005	2	2.314814815	2.314814815	1	NA	NA	1	5.18134715	5.18134715	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.72E-12	1	4.72E-34	0.005	0.0000201	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	50383083	A	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	42	10	23.8	42	14	33.3	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.352272727	1.352272727	1	1.725388601	0.862694301	2	0.888888889	0.888888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.24E-14	1	2.83E-22	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	50915735	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	44	6	13.6	32	5	15.6	48	3	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.772727273	0.772727273	1	0.808290155	0.808290155	1	1.148148148	1.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.37E-08	1	0.000000562	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	51539564	A	G	-	-	-	-	-	-	34	0	0	44	16	36.4	40	17	42.5	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.068181818	1.034090909	2	2.202072539	1.101036269	2	1.574074074	1.574074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.57E-26	1	6.07E-29	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	51626849	G	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	33	8	24.2	42	7	16.7	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.375	1.375	1	0.865284974	0.865284974	1	0.444444444	0.444444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-12	1	1.81E-09	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	53842208	T	A	PCTP	CCDS45741.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	48	18	37.5	49	14	28.6	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.130681818	1.065340909	2	1.481865285	1.481865285	1	0.37037037	0.37037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.42E-29	1	3.5E-21	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	57074140	A	T	TRIM37	CCDS32694.1	r.?	-	-	downstream	16	0	0	22	3	13.6	31	2	6.5	26	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.772727273	0.772727273	1	0.336787565	0.336787565	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000179267	1	0.010558179	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	59222221	C	T	BCAS3	CCDS45749.1	r.?	-	-	intronic	33	1	3	24	10	41.7	41	21	51.2	40	9	22.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.369318182	1.184659091	2	2.652849741	1.32642487	2	4.166666667	2.083333333	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	0.15245715	1	1.8E-17	1	1.17E-37	1	4.64E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	59840945	C	T	BRIP1	CCDS11631.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	41	14	34.1	42	22	52.4	37	3	8.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.9375	0.96875	2	2.715025907	1.357512953	2	1.5	1.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.9E-22	1	1.11E-39	1	0.000855237	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	60302337	G	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	33	7	21.2	15	5	33.3	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.204545455	1.204545455	1	1.725388601	1.725388601	1	0.518518519	0.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.98E-10	1	0.000000009	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	60959246	C	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	46	6	13	35	7	20	30	1	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.738636364	0.738636364	1	1.03626943	1.03626943	1	0.611111111	0.611111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000123	1	4.65E-10	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	61860155	G	T	DDX42	CCDS32704.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	32	0	0	50	12	24	33	0	0	135	0	0	245	0	0	235	43	18.3	201	0	0	TRUE	TRUE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.243523316	1.243523316	1	0	0	1	0	0	1	0.948186528	0.948186528	1	0	0	1	2	2	1	1	1	1	2.49E-17	1.1E-52	1	1	YES	0_0	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	17	62495245	T	A	DDX5	CCDS11659.1	r.?	-	-	downstream	33	0	0	43	8	18.6	46	5	10.9	28	2	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.056818182	1.056818182	1	0.564766839	0.564766839	1	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-11	1	0.00000361	1	0.008668191	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	66162636	C	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	25	2	8	22	4	18.2	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.454545455	0.454545455	1	0.943005181	0.943005181	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.006948068	1	0.00000425	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	67234600	G	C	ABCA10	CCDS11684.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	36	5	13.9	39	10	25.6	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.789772727	0.789772727	1	1.32642487	1.32642487	1	1.351851852	1.351851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000104	1	5.44E-15	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	67583110	G	A	-	-	-	-	-	-	9	0	0	23	6	26.1	17	4	23.5	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.482954545	1.482954545	1	1.21761658	1.21761658	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-09	1	0.00000141	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	68315698	A	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	41	18	43.9	37	15	40.5	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.494318182	1.247159091	2	2.098445596	1.049222798	2	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.91E-31	1	2.58E-25	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	68331587	T	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	35	7	20	30	5	16.7	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	0.865284974	0.865284974	1	0.518518519	0.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.65E-10	1	0.000000401	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	68489964	C	T	-	-	-	-	-	-	21	0	0	32	8	25	49	15	30.6	44	6	13.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	1.585492228	0.792746114	2	2.518518519	1.259259259	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.69E-12	1	4.1E-23	1	9.37E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	69066239	T	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	28	17	60.7	41	17	41.5	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.448863636	1.724431818	2	2.150259067	1.075129534	2	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.56E-32	1	1.03E-28	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	69870397	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	29	6	20.7	45	11	24.4	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.176136364	1.176136364	1	1.264248705	1.264248705	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.72E-09	1	4.24E-16	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	69958867	G	A	-	-	-	-	-	-	45	0	0	44	8	18.2	39	5	12.8	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	0.663212435	0.663212435	1	1.722222222	1.722222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.9E-11	1	0.00000156	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	70723021	A	G	SLC39A11	CCDS11690.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	31	7	22.6	32	5	15.6	28	4	14.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.284090909	1.284090909	1	0.808290155	0.808290155	1	2.648148148	1.324074074	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.85E-10	1	0.000000562	1	0.0000116	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	71894049	T	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	40	0	0	39	4	10.3	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.533678756	0.533678756	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000447	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	72899093	T	G	-	-	-	-	-	-	14	0	0	17	4	23.5	21	4	19	27	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.335227273	1.335227273	1	0.984455959	0.984455959	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000141	1	0.00000349	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	74905014	G	A	MGAT5B	CCDS11751.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	17	3	17.6	29	8	27.6	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1.430051813	1.430051813	1	0.518518519	0.518518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000807	1	1.53E-12	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	74973559	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	26	11	42.3	30	10	33.3	33	9	27.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.403409091	1.201704545	2	1.725388601	0.862694301	2	5.055555556	2.527777778	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.52E-19	1	2.68E-16	1	6.76E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	74975388	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	37	7	18.9	31	5	16.1	24	2	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.073863636	1.073863636	1	0.834196891	0.834196891	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.05E-10	1	0.000000476	1	0.006413403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	75344110	C	G	Sep-09	CCDS45791.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	32	6	18.8	35	8	22.9	25	1	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.068181818	1.068181818	1	1.186528497	1.186528497	1	0.740740741	0.740740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.27E-08	1	8.15E-12	1	0.117779757	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	75918080	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	32	6	18.8	26	4	15.4	29	2	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.068181818	1.068181818	1	0.797927461	0.797927461	1	1.277777778	1.277777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.27E-08	1	0.00000856	1	0.009279585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	76206520	C	T	BIRC5	CCDS32752.1	r.?	-	-	upstream	7	0	0	10	4	40	7	3	42.9	29	3	10.3	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.272727273	2.272727273	1	2.222797927	2.222797927	1	1.907407407	1.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000128	1	0.00000431	1	0.000414371	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	76521375	C	T	DNAH17	ENST00000300671	r.?	-	-	intronic	6	0	0	8	1	12.5	14	4	28.6	18	2	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.710227273	0.710227273	1	1.481865285	1.481865285	1	2.055555556	2.055555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.039306956	1	0.000000601	1	0.003626632	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	76937470	G	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	24	5	20.8	16	3	18.8	26	2	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.181818182	1.181818182	1	0.974093264	0.974093264	1	1.425925926	1.425925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000123	1	0.0000667	1	0.007502227	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	17	80600038	C	T	WDR45L	CCDS11815.2	r.?	-	-	intronic	10	0	0	9	2	22.2	11	5	45.5	20	2	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	2.357512953	1.178756477	2	1.851851852	1.851851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000879235	1	1.41E-09	1	0.004473894	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	1890024	C	G	-	-	-	-	-	-	21	0	0	44	1	2.3	47	8	17	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.143262406	NA	0	1.050829016	1.050829016	1	0.968333333	0.968333333	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.197923942	1	1.03E-10	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	4939344	G	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	39	9	23.1	42	4	9.5	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.43885286	1.43885286	1	0.587227979	0.587227979	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.62E-13	1	0.0000601	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	5387763	G	T	EPB41L3	CCDS11838.1	r.?	-	-	downstream	20	0	0	23	4	17.4	30	4	13.3	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.083811245	1.083811245	1	0.822119171	0.822119171	1	1.506296296	1.506296296	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000513	1	0.0000154	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	5457777	C	T	EPB41L3	CCDS11838.1	r.?	-	-	intronic	15	0	0	33	4	12.1	29	6	20.7	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.753684831	0.753684831	1	1.27953886	1.27953886	1	0.903777778	0.903777778	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000228	1	6.72E-09	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	5529418	G	A	EPB41L3	CCDS11838.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	37	4	10.8	42	7	16.7	31	4	12.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.672710428	0.672710428	1	1.032284974	1.032284974	1	2.775888889	0.925296296	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000362	1	1.81E-09	1	0.0000177	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	7144190	C	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	31	9	29	50	9	18	26	1	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.806352075	1.167661928	1.546982077	1.112642487	1.112642487	1	0.817703704	0.817703704	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.57E-14	1	4.07E-12	1	0.122190858	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	7403832	C	T	-	-	-	-	-	-	8	0	0	24	5	20.8	37	6	16.2	27	1	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.295590454	1.295590454	1	1.001378238	1.001378238	1	0.796185185	0.796185185	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000123	1	3.18E-08	1	0.126579904	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	7673402	T	C	PTPRM	CCDS11840.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	45	3	6.7	50	7	14	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.417329617	0.417329617	1	0.865388601	0.865388601	1	1.097444444	1.097444444	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001516071	1	6.46E-09	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	7726542	A	G	PTPRM	CCDS11840.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	44	7	15.9	35	3	8.6	56	3	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.990379241	0.990379241	1	0.531595855	0.531595855	1	1.162	1.162	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.55E-09	1	0.000725791	1	0.00284314	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	8156620	C	A	PTPRM	CCDS11840.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	45	15	33.3	39	13	33.3	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	2.074190486	1.340798008	1.546982077	2.058388601	1.029194301	2	0.451888889	0.451888889	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.14E-24	1	8.79E-21	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	8168941	C	T	PTPRM	CCDS11840.1	r.?	-	-	intronic	20	0	0	45	5	11.1	53	11	20.8	51	3	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.691396829	0.691396829	1	1.285720207	1.285720207	1	1.269592593	1.269592593	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000323	1	3.07E-15	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	8533174	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	32	0	0	48	4	8.3	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0	NA	0	0.513051813	0.513051813	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000102016	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	8656134	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	37	3	8.1	44	5	11.4	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.504532821	0.504532821	1	0.704673575	0.704673575	1	1.613888889	1.613888889	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000855237	1	0.00000288	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	8783418	G	A	KIAA0802	CCDS11841.1	r.?	-	-	intronic	10	0	0	15	3	20	11	6	54.5	51	9	17.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.245760052	1.245760052	1	3.368834197	1.684417098	2	3.787259259	1.262419753	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000544	1	7.07E-12	1	4.92E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	9024473	C	T	-	-	-	-	-	-	21	0	0	30	5	16.7	28	4	14.3	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.040209643	1.040209643	1	0.883932642	0.883932642	1	0.559481481	0.559481481	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000401	1	0.0000116	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	9081067	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	26	7	26.9	23	6	26.1	26	2	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.67554727	1.67554727	1	1.613331606	1.613331606	1	1.656925926	1.656925926	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.73E-11	1	1.47E-09	1	0.007502227	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	10419653	C	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	38	10	26.3	33	13	39.4	48	6	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.638174468	1.638174468	1	2.435450777	1.217725389	2	2.689814815	0.896604938	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.06E-15	1	6.37E-22	1	0.00000016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	10812397	C	T	ENSG00000168738	ENST00000302079	r.?	-	-	intronic	8	0	0	23	4	17.4	18	3	16.7	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.083811245	1.083811245	1	1.032284974	1.032284974	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000513	1	0.0000964	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	13648907	C	T	C18orf1	CCDS32793.1	r.4840c>u	c.?	p.?	3'UTR variant	34	0	0	54	5	9.3	41	7	17.1	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	2	100	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.579278424	0.579278424	1	1.057010363	1.057010363	1	1.656925926	1.656925926	1	NA	NA	0	NA	NA	1	21.51851852	7.172839506	3	5	NA	1	1	0.00000806	1	1.51E-09	1	0.000998458	0.000025	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	13917390	C	A	MC2R	CCDS11869.1	r.?	-	-	upstream	31	0	0	49	5	10.2	47	9	19.1	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.635337626	0.635337626	1	1.180637306	1.180637306	1	1.441740741	1.441740741	1	NA	NA	0	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	0.00000496	1	2.24E-12	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	14272052	G	C	-	-	-	-	-	-	22	0	0	35	5	14.3	51	2	3.9	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.890718437	0.890718437	1	0.241072539	0.241072539	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000000895	1	0.027109304	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	14280968	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	41	6	14.6	37	7	18.9	20	2	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.909404838	0.909404838	1	1.168274611	1.168274611	1	2.151851852	2.151851852	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.05E-08	1	7.05E-10	1	0.004473894	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	14919498	A	T	-	-	-	-	-	-	18	0	0	33	3	9.1	49	9	18.4	31	0	0	197	0	0	178	30	16.9	116	17	14.7	140	10	7.1	TRUE	TRUE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.566820824	0.566820824	1	1.137367876	1.137367876	1	0	0	1	1.052667244	1.052667244	1	0.908658031	0.908658031	1	1.527814815	1.527814815	1	5	5	1	1	0.000609557	4.18E-36	3.35E-12	4.88E-20	1	3.1E-09	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	18	20579835	C	A	RBBP8	CCDS11875.1	r.?	-	-	intronic	40	1	2.5	37	10	27	36	14	38.9	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.68177607	1.68177607	1	2.404544041	1.202272021	2	2.625259259	0.87508642	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	0.181679879	1	3.01E-15	1	2.09E-23	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	23521363	G	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	38	2	5.3	30	7	23.3	27	1	3.7	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.330126414	0.330126414	1	1.440253886	1.440253886	1	0.796185185	0.796185185	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.015598339	1	1.44E-10	1	0.126579904	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	25271314	A	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	43	5	11.6	56	8	14.3	53	4	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.72254083	0.72254083	1	0.883932642	0.883932642	1	1.613888889	1.613888889	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000257	1	4.48E-10	1	0.000150502	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	25486005	C	G	-	-	-	-	-	-	15	0	0	21	4	19	22	5	22.7	49	6	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.183472049	1.183472049	1	1.403165803	1.403165803	1	2.625259259	0.87508642	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000349	1	7.67E-08	1	0.000000182	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	25512770	C	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	42	3	7.1	66	10	15.2	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.442244818	0.442244818	1	0.939564767	0.939564767	1	1.613888889	1.613888889	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001240292	1	1.6E-12	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	25596957	C	A	CDH2	CCDS11891.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	43	5	11.6	41	6	14.6	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.72254083	0.72254083	1	0.902476684	0.902476684	1	1.075925926	1.075925926	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000257	1	6.05E-08	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	25877153	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	35	5	14.3	39	5	12.8	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.890718437	0.890718437	1	0.791212435	0.791212435	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000895	1	0.00000156	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	26688910	G	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	44	0	0	46	0	0	48	4	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0	NA	0	0	0	1	1.786037037	1.786037037	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.000102016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	26851009	C	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	37	6	16.2	44	1	2.3	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.009065642	1.009065642	1	0.142170984	0.142170984	1	0.43037037	0.43037037	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.18E-08	1	0.197923942	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	27067635	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	42	9	21.4	45	3	6.7	60	2	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.332963255	1.332963255	1	0.414150259	0.414150259	1	0.710111111	0.710111111	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.51E-13	1	0.001516071	1	0.036544784	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	27186502	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	40	3	7.5	57	12	21.1	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.467160019	0.467160019	1	1.304264249	1.304264249	1	1.915148148	1.915148148	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001075403	1	1.4E-16	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	27306069	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	38	5	13.2	51	11	21.6	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.822201634	0.822201634	1	1.335170984	1.335170984	1	0.516444444	0.516444444	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000137	1	1.94E-15	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	27362272	A	C	-	-	-	-	-	-	34	0	0	36	9	25	52	19	36.5	51	6	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.557200065	1.557200065	1	2.25619171	1.128095855	2	2.539185185	0.846395062	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.63E-13	1	1.24E-30	1	0.000000232	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	27581325	A	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	55	10	18.2	49	8	16.3	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.133641647	1.133641647	1	1.007559585	1.007559585	1	0.925296296	0.925296296	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.33E-13	1	1.47E-10	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	27668668	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	46	9	19.6	42	8	19	28	2	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.220844851	1.220844851	1	1.174455959	1.174455959	1	1.527814815	1.527814815	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.82E-12	1	3.96E-11	1	0.008668191	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	28231539	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	54	6	11.1	35	5	14.3	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.691396829	0.691396829	1	0.883932642	0.883932642	1	0.968333333	0.968333333	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000329	1	0.000000895	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	29861563	C	A	FAM59A	CCDS11905.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	34	4	11.8	33	2	6.1	29	1	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.734998431	0.734998431	1	0.377062176	0.377062176	1	0.73162963	0.73162963	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000257	1	0.011909843	1	0.135292269	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	30018350	T	C	FAM59A	CCDS11905.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	45	7	15.6	41	6	14.6	37	4	10.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.97169284	0.97169284	1	0.902476684	0.902476684	1	2.324	2.324	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000003	1	6.05E-08	1	0.0000362	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	30309440	T	C	KLHL14	CCDS32813.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	38	8	21.1	52	9	17.3	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.314276855	1.314276855	1	1.069373057	1.069373057	1	2.345518519	1.172759259	2	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.67E-11	1	5.92E-12	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	32971869	C	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	27	2	7.4	21	4	19	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.460931219	0.460931219	1	1.174455959	1.174455959	1	1.334148148	1.334148148	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00807567	1	0.00000349	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	34163001	A	C	FHOD3	CCDS32816.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	45	3	6.7	37	7	18.9	54	5	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.417329617	0.417329617	1	1.168274611	1.168274611	1	2.001222222	2.001222222	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001516071	1	7.05E-10	1	0.00000806	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	34212387	A	G	FHOD3	CCDS32816.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	64	16	25	52	14	26.9	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.557200065	1.006605111	1.546982077	1.662782383	0.831391192	2	1.613888889	1.613888889	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.94E-23	1	9.04E-21	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	34428411	C	T	KIAA1328	CCDS45855.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	44	10	22.7	42	14	33.3	41	6	14.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.413937659	1.413937659	1	2.058388601	1.029194301	2	3.141703704	1.047234568	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.08E-14	1	2.83E-22	1	6.05E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	34739732	C	T	KIAA1328	CCDS45855.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	53	13	24.5	42	3	7.1	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.526056063	1.526056063	1	0.438875648	0.438875648	1	0.903777778	0.903777778	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.53E-19	1	0.001240292	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	34969144	T	C	CELF4	CCDS32818.1	r.?	-	-	intronic	20	0	0	15	4	26.7	20	3	15	40	4	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.663089669	1.663089669	1	0.927202073	0.927202073	1	2.151851852	2.151851852	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000816	1	0.0001337	1	0.0000495	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	35750522	A	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	53	7	13.2	50	8	16	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.822201634	0.822201634	1	0.989015544	0.989015544	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	9.85E-09	1	1.74E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	36691523	T	C	-	-	-	-	-	-	28	0	0	41	8	19.5	49	9	18.4	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.21461605	1.21461605	1	1.137367876	1.137367876	1	0.946814815	0.946814815	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.22E-11	1	3.35E-12	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	36747035	A	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	42	7	16.7	43	8	18.6	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.040209643	1.040209643	1	1.14973057	1.14973057	1	1.269592593	1.269592593	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.81E-09	1	4.85E-11	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	37213258	T	C	AC105201.1	ENST00000510201	r.?	-	-	intronic	46	0	0	45	4	8.9	51	0	0	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.554363223	0.554363223	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.0000791	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	37888449	A	G	-	-	-	-	-	-	29	0	0	39	4	10.3	47	8	17	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.641566427	0.641566427	1	1.050829016	1.050829016	1	1.613888889	1.613888889	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000447	1	1.03E-10	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	40042589	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	39	5	12.8	34	5	14.7	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.797286433	0.797286433	1	0.908658031	0.908658031	1	0.968333333	0.968333333	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000156	1	0.000000771	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	40056775	G	C	-	-	-	-	-	-	20	0	0	39	2	5.1	52	6	11.5	27	2	7.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.317668813	0.580766403	0.546982077	0.710854922	0.710854922	1	1.59237037	1.59237037	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.016387522	1	0.000000261	1	0.00807567	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	40137187	G	C	-	-	-	-	-	-	26	0	0	37	9	24.3	52	21	40.4	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.513598463	1.513598463	1	2.497264249	1.248632124	2	1.89362963	1.89362963	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.14E-13	1	7.89E-35	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	40502618	C	T	RIT2	CCDS11921.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	42	4	9.5	48	5	10.4	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.591736025	0.591736025	1	0.642860104	0.642860104	1	0.559481481	0.559481481	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000601	1	0.00000447	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	41540030	C	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	27	3	11.1	38	10	26.3	31	3	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.691396829	0.691396829	1	1.625694301	1.625694301	1	2.087296296	2.087296296	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000334187	1	4.06E-15	1	0.000505952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	44170317	G	A	LOXHD1	ENST00000398722	r.?	-	-	intronic	30	0	0	57	12	21.1	34	5	14.7	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.314276855	1.314276855	1	0.908658031	0.908658031	1	1.915148148	1.915148148	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.4E-16	1	0.000000771	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	44409056	G	C	PIAS2	CCDS32824.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	44	13	29.5	41	11	26.8	53	4	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.837496076	1.187794031	1.546982077	1.656601036	1.656601036	1	1.613888889	1.613888889	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.49E-20	1	1.34E-16	1	0.000150502	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	44452295	G	A	PIAS2	CCDS32824.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	49	5	10.2	49	7	14.3	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.635337626	0.635337626	1	0.883932642	0.883932642	1	1.054407407	1.054407407	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000496	1	5.58E-09	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	45151007	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	35	5	14.3	38	6	15.8	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.890718437	0.890718437	1	0.97665285	0.97665285	1	2.001222222	2.001222222	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000895	1	3.76E-08	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	46014600	G	T	-	-	-	-	-	-	12	0	0	53	4	7.5	34	5	14.7	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.467160019	0.467160019	1	0.908658031	0.908658031	1	1.398703704	1.398703704	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000150502	1	0.000000771	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	46325619	C	T	KIAA0427	CCDS45864.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	24	5	20.8	25	3	12	42	2	4.8	0	0	NA	2	2	100	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.295590454	1.295590454	1	0.741761658	0.741761658	1	1.032888889	1.032888889	1	6.228800259	4.026420443	1.546982077	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000123	0.000025	0.00026475	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	46381386	C	T	KIAA0427	CCDS45864.1	r.?	-	-	intronic	14	0	0	18	4	22.2	30	4	13.3	49	3	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.382793657	1.382793657	1	0.822119171	0.822119171	1	1.31262963	1.31262963	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000181	1	0.0000154	1	0.001939399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	46956339	G	A	DYM	CCDS11937.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	37	6	16.2	47	6	12.8	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.009065642	1.009065642	1	0.791212435	0.791212435	1	0.624037037	0.624037037	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.18E-08	1	0.000000141	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	47032374	G	A	-	-	-	-	-	-	9	0	0	8	3	37.5	6	2	33.3	30	11	36.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	2.335800097	2.335800097	1	2.058388601	2.058388601	1	7.897296296	2.632432099	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000687	1	0.000370028	1	2.44E-18	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	47551229	G	C	MYO5B	CCDS42436.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	51	13	25.5	42	15	35.7	33	8	24.2	131	0	0	225	54	24	264	94	35.6	240	10	4.2	TRUE	TRUE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.588344066	1.026737213	1.546982077	2.206740933	1.103370466	2	5.207481481	1.73582716	3	1.494912062	0.966340906	1.546982077	2.200559585	1.100279793	2	0.903777778	0.903777778	1	5	5	1	1	4.87E-19	1.05E-72	2.65E-24	5.01E-144	4.85E-12	0.000000497	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	18	49710620	T	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	33	11	33.3	32	5	15.6	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	2.074190486	1.340798008	1.546982077	0.964290155	0.964290155	1	2.496148148	0.832049383	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.54E-18	1	0.000000562	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	50020901	T	C	DCC	CCDS11952.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	43	5	11.6	55	15	27.3	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.72254083	0.72254083	1	1.687507772	0.843753886	2	1.441740741	1.441740741	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000257	1	3.01E-22	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	50332439	C	A	DCC	CCDS11952.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	54	13	24.1	49	9	18.4	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.501140862	1.501140862	1	1.137367876	1.137367876	1	1.915148148	1.915148148	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.12E-18	1	3.35E-12	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	51145806	G	T	-	-	-	-	-	-	15	0	0	27	5	18.5	21	2	9.5	42	5	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.152328048	1.152328048	1	0.587227979	0.587227979	1	2.560703704	0.853567901	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000023	1	0.004928472	1	0.00000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	51672623	G	C	-	-	-	-	-	-	39	0	0	50	20	40	64	12	18.8	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	2.491520103	1.610568177	1.546982077	1.162093264	1.162093264	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.9E-33	1	6.3E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	51677905	C	T	MBD2	CCDS11953.1	r.?	-	-	downstream	30	0	0	44	3	6.8	43	6	14	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.423558418	0.423558418	1	0.865388601	0.865388601	1	0.559481481	0.559481481	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00142027	1	8.13E-08	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	51736399	G	A	MBD2	CCDS11953.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	32	0	0	56	8	14.3	37	0	0	54	0	0	215	6	2.8	222	15	6.8	237	0	0	FALSE	TRUE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0	NA	0	0.883932642	0.883932642	1	0	0	1	0.174406407	0.174406407	1	0.420331606	0.420331606	1	0	0	1	NA	2	1	1	1	0.000821427	4.48E-10	8.55E-13	1	1	YES	0_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	18	51781799	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	35	4	11.4	41	10	24.4	40	6	15	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.710083229	0.710083229	1	1.508248705	1.508248705	1	3.227777778	1.075925926	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000289	1	9.51E-15	1	5.18E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	53132994	A	C	TCF4	CCDS42438.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	48	10	20.8	41	9	22	57	5	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.295590454	1.295590454	1	1.359896373	1.359896373	1	1.89362963	1.89362963	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.37E-14	1	5.92E-13	1	0.0000105	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	53281059	G	A	TCF4	ENST00000398339	r.?	-	-	intronic	30	0	0	45	10	22.2	41	6	14.6	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.382793657	1.382793657	1	0.902476684	0.902476684	1	1.075925926	1.075925926	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.66E-14	1	6.05E-08	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	53333864	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	45	7	15.6	60	8	13.3	30	2	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.97169284	0.97169284	1	0.822119171	0.822119171	1	1.441740741	1.441740741	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000003	1	7.93E-10	1	0.009909649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	53966948	C	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	51	16	31.4	63	22	34.9	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.955843281	1.264296019	1.546982077	2.157290155	1.078645078	2	0.602518519	0.602518519	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.28E-25	1	1.03E-34	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	54422217	T	G	WDR7	CCDS11962.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	31	8	25.8	47	4	8.5	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.607030467	1.607030467	1	0.525414508	0.525414508	1	1.269592593	1.269592593	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.78E-12	1	0.0000939	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	54423175	G	T	WDR7	CCDS11962.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	52	9	17.3	40	5	12.5	52	5	9.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.077582445	1.077582445	1	0.772668394	0.772668394	1	2.065777778	2.065777778	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.92E-12	1	0.00000178	1	0.00000668	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	54793471	G	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	52	1	1.9	48	7	14.6	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.118347205	NA	0	0.902476684	0.902476684	1	0.925296296	0.925296296	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.229451111	1	4.81E-09	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	56314691	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	27	7	25.9	28	4	14.3	32	3	9.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.613259267	1.613259267	1	0.883932642	0.883932642	1	2.022740741	2.022740741	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.36E-11	1	0.0000116	1	0.000556213	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	57385281	G	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	43	12	27.9	42	4	9.5	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.737835272	1.123371304	1.546982077	0.587227979	0.587227979	1	0.537962963	0.537962963	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.24E-18	1	0.0000601	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	58068126	C	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	30	13	43.3	36	10	27.8	46	10	21.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	2.697070512	1.743440052	1.546982077	1.718414508	0.859207254	2	4.669518519	1.556506173	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.35E-22	1	2.21E-15	1	3.38E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	58407726	G	A	-	-	-	-	-	-	12	0	0	13	1	7.7	21	5	23.8	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.47961762	0.47961762	1	1.471160622	1.471160622	1	0.559481481	0.559481481	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.063085307	1	5.95E-08	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	58532991	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	41	10	24.4	51	21	41.2	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.519827263	1.519827263	1	2.546715026	1.273357513	2	1.398703704	1.398703704	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.51E-15	1	4.73E-35	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	58877853	A	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	24	4	16.7	33	7	21.2	44	2	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.040209643	1.040209643	1	1.310445596	1.310445596	1	0.968333333	0.968333333	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000613	1	2.98E-10	1	0.020580492	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	61441892	T	C	SERPINB7	CCDS11988.1	r.?	-	-	upstream	36	0	0	41	12	29.3	48	17	35.4	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.825038476	1.17974119	1.546982077	2.188196891	1.094098446	2	2.001222222	2.001222222	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.69E-18	1	2.8E-27	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	63550728	C	T	CDH7	CCDS11993.1	r.5186c>u	c.?	p.?	3'UTR variant	24	0	0	52	8	15.4	40	8	20	48	3	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.95923524	0.95923524	1	1.23626943	1.23626943	1	1.334148148	1.334148148	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.42E-10	1	2.61E-11	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	63640544	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	44	13	29.5	44	12	27.3	52	7	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.837496076	1.187794031	1.546982077	1.687507772	0.843753886	2	2.905	0.968333333	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.49E-20	1	4.44E-18	1	8.58E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	63781084	C	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	43	13	30.2	50	18	36	66	8	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.881097678	1.215978974	1.546982077	2.225284974	1.112642487	2	2.603740741	0.86791358	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.88E-20	1	5.92E-29	1	1.73E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	64110783	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	57	0	0	47	0	0	63	6	9.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0	NA	0	0	0	1	2.044259259	2.044259259	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	1	1	0.000000832	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	64270081	A	G	CDH19	CCDS11994.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	62	9	14.5	49	7	14.3	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.903176037	0.903176037	1	0.883932642	0.883932642	1	0.925296296	0.925296296	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.12E-11	1	5.58E-09	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	64287679	C	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	42	6	14.3	47	3	6.4	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.890718437	0.890718437	1	0.395606218	0.395606218	1	1.377185185	1.377185185	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.02E-08	1	0.001719595	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	65529546	A	G	AC114689.1	ENST00000500778	r.?	-	-	intronic	35	0	0	36	4	11.1	47	8	17	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.691396829	0.691396829	1	1.050829016	1.050829016	1	1.915148148	1.915148148	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000324	1	1.03E-10	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	66062832	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	35	4	11.4	30	5	16.7	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.710083229	0.710083229	1	1.032284974	1.032284974	1	0.559481481	0.559481481	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000289	1	0.000000401	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	66148734	A	G	-	-	-	-	-	-	32	0	0	33	7	21.2	41	13	31.7	51	9	17.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.320505655	1.320505655	1	1.959487047	0.979743523	2	3.787259259	1.262419753	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.98E-10	1	1.89E-20	1	4.92E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	66241610	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	43	9	20.9	41	4	9.8	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.301819254	1.301819254	1	0.605772021	0.605772021	1	0.473407407	0.473407407	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.45E-13	1	0.0000546	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	66287706	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	34	2	5.9	37	10	27	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.367499215	0.367499215	1	1.668963731	1.668963731	1	2.259444444	2.259444444	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.012612579	1	3.01E-15	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	66323808	T	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	54	9	16.7	40	6	15	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.040209643	1.040209643	1	0.927202073	0.927202073	1	0.946814815	0.946814815	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.48E-12	1	5.18E-08	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	66457441	T	C	CCDC102B	CCDS11996.2	r.?	-	-	intronic	10	0	0	17	4	23.5	15	4	26.7	47	12	25.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.463768061	1.463768061	1	1.650419689	1.650419689	1	5.487222222	1.829074074	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000141	1	0.000000816	1	1.09E-17	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	67594093	G	A	CD226	CCDS11997.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	43	7	16.3	42	5	11.9	52	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.015294442	1.015294442	1	0.735580311	0.735580311	1	0.408851852	0.408851852	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.15E-09	1	0.00000228	1	0.229451111	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	68460930	G	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	36	5	13.9	58	7	12.1	48	4	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.865803236	0.865803236	1	0.747943005	0.747943005	1	1.786037037	1.786037037	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000104	1	1.88E-08	1	0.000102016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	68656160	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	39	8	20.5	46	10	21.7	25	1	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.276904053	1.276904053	1	1.341352332	1.341352332	1	0.860740741	0.860740741	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.09E-11	1	3.38E-14	1	0.117779757	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	68688732	G	A	-	-	-	-	-	-	41	0	0	50	9	18	30	8	26.7	39	5	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.121184047	1.121184047	1	1.650419689	1.650419689	1	2.75437037	0.918123457	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.07E-12	1	2.07E-12	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	70319025	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	24	2	8.3	26	5	19.2	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.516990421	0.516990421	1	1.186818653	1.186818653	1	1.613888889	1.613888889	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.006413403	1	0.000000188	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	70748760	G	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	41	5	12.2	44	18	40.9	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.759913632	0.759913632	1	2.528170984	1.264085492	2	2.625259259	0.87508642	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000202	1	3.47E-30	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	71245486	C	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	37	8	21.6	36	8	22.2	56	0	0	80	0	0	223	39	17.5	256	44	17.2	278	6	2.2	TRUE	TRUE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.345420856	1.345420856	1	1.372259067	1.372259067	1	0	0	1	1.090040045	1.090040045	1	1.06319171	1.06319171	1	0.473407407	0.473407407	1	5	5	1	1	1.33E-11	4.07E-47	1.04E-11	1.37E-52	1	0.002995432	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	18	71384268	A	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	37	7	18.9	39	6	15.4	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.177243249	1.177243249	1	0.951927461	0.951927461	1	0.516444444	0.516444444	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.05E-10	1	4.43E-08	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	71553064	G	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	33	8	24.2	46	9	19.6	40	4	10	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.507369663	1.507369663	1	1.211544041	1.211544041	1	2.151851852	2.151851852	1	NA	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-12	1	1.82E-12	1	0.0000495	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	72171011	G	T	CNDP2	CCDS12006.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	21	3	14.3	16	0	0	53	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.890718437	0.890718437	1	0	0	1	0.408851852	0.408851852	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000155401	1	1	1	0.233303855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	72389792	A	T	ZNF407	CCDS45885.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	47	9	19.1	45	22	48.9	51	4	7.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.189700849	1.189700849	1	3.022678756	1.511339378	2	1.678444444	1.678444444	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-12	1	8.79E-39	1	0.000129466	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	73080602	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	39	10	25.6	34	16	47.1	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.594572866	1.594572866	1	2.911414508	1.455707254	2	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.44E-15	1	3.09E-28	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	74285743	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	29	6	20.7	41	4	9.8	26	4	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.289361654	1.289361654	1	0.605772021	0.605772021	1	3.313851852	1.104617284	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.72E-09	1	0.0000546	1	0.00000856	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	74885046	C	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	38	3	7.9	52	6	11.5	34	4	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.49207522	0.49207522	1	0.710854922	0.710854922	1	2.539185185	2.539185185	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000925091	1	0.000000261	1	0.0000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	75170103	G	A	-	-	-	-	-	-	43	0	0	47	8	17	42	0	0	41	0	0	70	0	0	223	9	4	200	5	2.5	235	0	0	TRUE	TRUE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.058896044	1.058896044	1	0	0	1	0	0	1	0.24915201	0.24915201	1	0.154533679	0.154533679	1	0	0	1	4	2	1	1	1.03E-10	0.00000239	1	0.00354548	1	1	YES	1_1	0_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	18	75617776	G	A	-	-	-	-	-	-	5	0	0	5	1	20	9	0	0	62	7	11.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.245760052	1.245760052	1	0	0	1	2.431592593	0.810530864	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.024751247	1	1	1	3.02E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	75707508	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	34	2	5.9	50	10	20	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.367499215	0.367499215	1	1.23626943	1.23626943	1	0.43037037	0.43037037	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.012612579	1	8.36E-14	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	75802964	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	28	4	14.3	39	4	10.3	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.890718437	0.890718437	1	0.636678756	0.636678756	1	1.872111111	1.872111111	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000116	1	0.0000447	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	76111305	T	C	-	-	-	-	-	-	21	0	0	42	7	16.7	47	8	17	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.040209643	1.040209643	1	1.050829016	1.050829016	1	1.463259259	1.463259259	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.81E-09	1	1.03E-10	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	76174534	C	A	-	-	-	-	-	-	18	0	0	35	8	22.9	34	6	17.6	53	3	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.426395259	1.426395259	1	1.087917098	1.087917098	1	1.226555556	1.226555556	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.15E-12	1	1.86E-08	1	0.002429596	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	76260519	C	A	-	-	-	-	-	-	7	0	0	16	2	12.5	16	2	12.5	51	4	7.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0.778600032	0.778600032	1	0.772668394	0.772668394	1	1.678444444	1.678444444	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.002863359	1	0.002863359	1	0.000129466	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	76857546	C	T	ATP9B	CCDS12014.1	r.?	-	-	intronic	10	0	0	17	5	29.4	29	6	20.7	11	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	1.831267276	1.831267276	1	1.27953886	1.27953886	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.84E-08	1	6.72E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	18	77447692	T	G	CTDP1	CCDS12017.1	r.?	-	-	intronic	8	0	0	10	0	0	26	3	11.5	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.546982077	3	5	1	2	3	1	1	2	0.453017923	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.546982077	NA	NA	0	NA	0	0.710854922	0.710854922	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1	1	0.000298167	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	125171	C	T	-	-	-	-	-	-	7	0	0	12	6	50	9	4	44.4	14	5	35.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	1.41E-11	1	7.72E-08	1	6.03E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	1411150	C	T	DAZAP1	CCDS12066.1	r.?	-	-	intronic	8	0	0	16	3	18.8	11	4	36.4	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.202828852	1.202828852	1	2.250010363	2.250010363	1	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.0000667	1	0.000000201	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	1738990	G	A	-	-	-	-	-	-	15	0	0	17	2	11.8	14	4	28.6	29	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.754967045	0.754967045	1	1.767865285	1.767865285	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.003234386	1	0.000000601	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	2249314	C	T	AMH	CCDS12085.1	r.202c>u	c.?	p.?	5'UTR variant	16	0	0	9	3	33.3	7	0	0	19	2	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	2.130542594	2.130542594	1	0	0	1	1.944444444	1.944444444	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.0000103	1	1	1	0.004039874	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	2459247	C	A	LMNB2	CCDS12090.1	r.?	-	-	upstream	12	0	0	12	4	33.3	10	2	20	17	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	2.130542594	2.130542594	1	1.23626943	1.23626943	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.0000003	1	0.001095391	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	3079325	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	32	4	12.5	32	2	6.2	31	6	19.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.799753226	0.799753226	1	0.383243523	0.383243523	1	3.592592593	1.796296296	2	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.0000201	1	0.011224977	1	1.03E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	4418225	T	G	CHAF1A	CCDS32875.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	21	3	14.3	26	5	19.2	16	2	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.91491769	0.91491769	1	1.186818653	1.186818653	1	2.314814815	2.314814815	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000155401	1	0.000000188	1	0.002863359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	4620165	C	T	-	-	-	-	-	-	14	0	0	4	2	50	11	4	36.4	18	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	3.199012904	3.199012904	1	2.250010363	2.250010363	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000149002	1	0.000000201	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	6721629	A	T	C3	CCDS32883.1	r.?	-	-	upstream	25	1	4	27	4	14.8	34	8	23.5	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.94690782	0.94690782	1	1.45261658	1.45261658	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	0	NA	0	NA	NA	0.117779757	1	0.00001	1	6.32E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	7480742	T	C	ARHGEF18	CCDS12177.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	34	5	14.7	46	6	13	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.940509794	0.940509794	1	0.80357513	0.80357513	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000000771	1	0.000000123	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	7748489	T	G	C19orf59	CCDS12183.1	r.?	-	-	downstream	12	0	0	14	1	7.1	20	4	20	26	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.454259832	NA	0	1.23626943	1.23626943	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.067769881	1	0.00000284	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	7843040	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	26	10	38.5	32	12	37.5	34	6	17.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	2.463239936	1.435280848	1.716207626	2.318005181	1.159002591	2	3.259259259	1.62962963	2	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.82E-17	1	5.03E-20	1	1.86E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	9843032	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	22	5	22.7	21	1	4.8	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.452351858	1.452351858	1	0.296704663	0.296704663	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	7.67E-08	1	0.099912572	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	10495431	A	G	-	-	-	-	-	-	7	1	14.3	11	6	54.5	12	4	33.3	33	14	42.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	3.486924065	2.0317612	1.716207626	2.058388601	2.058388601	1	7.851851852	3.925925926	2	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	0.034479353	1	7.07E-12	1	0.0000003	1	4.57E-24	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	11539412	G	A	CCDC151	CCDS42501.1	r.?	-	-	intronic	9	0	0	22	6	27.3	22	2	9.1	20	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.746661045	1.746661045	1	0.562502591	0.562502591	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.09E-09	1	0.005403392	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	14350217	A	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	27	4	14.8	36	0	0	14	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.94690782	0.94690782	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.00001	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	14610709	T	A	GIPC1	CCDS12310.1	r.?	-	-	upstream	25	0	0	31	2	6.5	39	6	15.4	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.415871677	0.415871677	1	0.951927461	0.951927461	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.010558179	1	4.43E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	14799288	G	A	ZNF333	CCDS12316.1	r.?	-	-	upstream	21	0	0	28	3	10.7	28	8	28.6	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.684588761	0.684588761	1	1.767865285	1.767865285	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000372895	1	1.11E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	18356768	C	T	PDE4C	CCDS12373.1	r.?	-	-	intronic	18	0	0	25	5	20	19	1	5.3	33	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.279605162	1.279605162	1	0.327611399	0.327611399	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000000153	1	0.090843738	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	18592044	G	A	ELL	CCDS12380.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	29	6	20.7	34	4	11.8	26	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.324391342	1.324391342	1	0.729398964	0.729398964	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	6.72E-09	1	0.0000257	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	18735582	C	T	TMEM59L	CCDS12383.1	r.?	-	-	downstream	29	0	0	39	0	0	37	7	18.9	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0	NA	0	1.168274611	1.168274611	1	0.574074074	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	7.05E-10	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	20311826	C	T	ZNF90	CCDS46029.1	r.?	-	-	downstream	33	0	0	48	7	14.6	37	7	18.9	26	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.934111768	0.934111768	1	1.168274611	1.168274611	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.81E-09	1	7.05E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	20690805	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	53	7	13.2	39	9	23.1	25	1	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.844539407	0.844539407	1	1.427891192	1.427891192	1	0.740740741	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	9.85E-09	1	3.62E-13	1	0.117779757	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	21805994	C	T	AC092364.2	ENST00000504760	r.?	-	-	intronic	29	0	0	51	18	35.3	38	9	23.7	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	2.25850311	1.315984777	1.716207626	1.464979275	1.464979275	1	1.814814815	1.814814815	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	9.1E-29	1	2.79E-13	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	22111523	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	30	3	10	46	6	13	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.639802581	0.639802581	1	0.80357513	0.80357513	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000458697	1	0.000000123	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	22342111	G	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	48	11	22.9	47	8	17	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.46514791	1.46514791	1	1.050829016	1.050829016	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	9.31E-16	1	1.03E-10	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	22764004	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	34	9	26.5	43	7	16.3	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.695476839	1.695476839	1	1.007559585	1.007559585	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	9.15E-14	1	2.15E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	23355771	C	G	-	-	-	-	-	-	7	0	0	7	3	42.9	6	4	66.7	23	8	34.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	2.744753071	2.744753071	1	4.122958549	2.061479275	2	6.444444444	3.222222222	2	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00000431	1	9.3E-09	1	1.79E-13	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	23519575	T	A	ENSG00000235694	ENST00000439808	r.?	-	-	intronic	20	0	0	22	2	9.1	30	8	26.7	28	3	10.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.582220348	0.582220348	1	1.650419689	1.650419689	1	1.981481481	1.981481481	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.005403392	1	2.07E-12	1	0.000372895	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	24128576	G	A	AC011503.1	ENST00000300996	r.?	-	-	intronic	34	0	0	37	4	10.8	28	4	14.3	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.690986787	0.690986787	1	0.883932642	0.883932642	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.0000362	1	0.0000116	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	27788364	G	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	33	2	6.1	38	5	13.2	26	1	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.390279574	0.390279574	1	0.815937824	0.815937824	1	0.703703704	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.011909843	1	0.00000137	1	0.122190858	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	28381495	C	A	-	-	-	-	-	-	15	0	0	19	3	15.8	16	3	18.8	31	2	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.010888078	1.010888078	1	1.162093264	1.162093264	1	1.203703704	1.203703704	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000114071	1	0.0000667	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	28910531	G	C	-	-	-	-	-	-	28	0	0	31	9	29	31	15	48.4	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.855427484	1.081120639	1.716207626	2.991772021	1.49588601	2	1.388888889	1.388888889	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.57E-14	1	8.51E-27	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	28927632	G	A	AC005307.1	ENST00000511462	r.1776c>u	-	-	non-coding variant	34	0	0	47	7	14.9	48	7	14.6	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.953305845	0.953305845	1	0.902476684	0.902476684	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.12E-09	1	4.81E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	28938266	T	G	AC005307.1	ENST00000511462	r.?	-	-	intronic	27	0	0	40	1	2.5	43	4	9.3	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.159950645	NA	0	0.574865285	0.574865285	1	0.537037037	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.181679879	1	0.000066	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	29356281	G	A	-	-	-	-	-	-	16	0	0	30	5	16.7	42	7	16.7	35	0	0	493	0	0	283	49	17.3	248	34	13.7	205	7	3.4	FALSE	TRUE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.06847031	1.06847031	1	1.032284974	1.032284974	1	0	NA	0	1.106858465	1.106858465	1	0.84684456	0.84684456	1	0.62962963	0.62962963	1	NA	5	1	1	0.000000401	1.54E-58	1.81E-09	1.67E-37	1	0.0000898	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	19	29488122	G	C	-	-	-	-	-	-	23	0	0	35	7	20	34	5	14.7	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.279605162	1.279605162	1	0.908658031	0.908658031	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.65E-10	1	0.000000771	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	29877231	G	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	40	6	15	34	7	20.6	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.959703871	0.959703871	1	1.273357513	1.273357513	1	0.518518519	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	5.18E-08	1	3.73E-10	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	30474455	C	T	C19orf2	CCDS12420.1	r.?	-	-	intronic	48	0	0	50	7	14	47	9	19.1	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.895723613	0.895723613	1	1.180637306	1.180637306	1	0	NA	0	NA	NA	0	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	6.46E-09	1	2.24E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	30486748	C	T	C19orf2	CCDS12420.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	39	13	33.3	42	13	31	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	2.130542594	1.241424733	1.716207626	1.916217617	0.958108808	2	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	8.79E-21	1	2.72E-20	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	30735673	C	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	24	4	16.7	27	4	14.8	27	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.06847031	1.06847031	1	0.914839378	0.914839378	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000613	1	0.00001	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	31162890	G	A	-	-	-	-	-	-	12	0	0	32	7	21.9	22	8	36.4	38	0	0	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.401167652	1.401167652	1	2.250010363	1.125005181	2	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	2.36E-10	1	1.17E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	31181382	T	C	-	-	-	-	-	-	30	0	0	41	5	12.2	47	11	23.4	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.780559149	0.780559149	1	1.446435233	1.446435233	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000202	1	7.21E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	31195956	C	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	45	5	11.1	34	5	14.7	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.710180865	0.710180865	1	0.908658031	0.908658031	1	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00000323	1	0.000000771	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	31510654	G	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	46	0	0	56	7	12.5	27	1	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0	NA	0	0.772668394	0.772668394	1	0.685185185	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	1.46E-08	1	0.126579904	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	31592891	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	48	16	33.3	40	12	30	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	2.130542594	1.241424733	1.716207626	1.854404145	0.927202073	2	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.96E-25	1	1.2E-18	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	32111137	C	T	ENSG00000232700	ENST00000441786	r.?	-	-	intronic	29	0	0	41	6	14.6	49	7	14.3	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.934111768	0.934111768	1	0.883932642	0.883932642	1	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	6.05E-08	1	5.58E-09	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	32322608	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	38	6	15.8	45	5	11.1	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.010888078	1.010888078	1	0.686129534	0.686129534	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	3.76E-08	1	0.00000323	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	32581746	C	T	AC005265.1	ENST00000513947	r.?	-	-	downstream	27	0	0	47	13	27.7	57	14	24.6	32	4	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.772253149	1.03265661	1.716207626	1.520611399	1.520611399	1	2.314814815	2.314814815	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.47E-19	1	3.84E-20	1	0.0000201	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	32738161	C	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	33	3	9.1	31	4	12.9	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.582220348	0.582220348	1	0.797393782	0.797393782	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000609557	1	0.0000177	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	33043775	C	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	36	9	25	43	6	14	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.599506452	1.599506452	1	0.865388601	0.865388601	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.63E-13	1	8.13E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	33232280	G	A	TDRD12	CCDS46038.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	30	2	6.7	33	7	21.2	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.428667729	0.428667729	1	1.310445596	1.310445596	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.009909649	1	2.98E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	33281004	G	T	TDRD12	CCDS46038.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	40	4	10	32	5	15.6	31	2	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.639802581	0.639802581	1	0.964290155	0.964290155	1	1.203703704	1.203703704	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.0000495	1	0.000000562	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	36869759	T	C	ZFP14	CCDS33002.1	r.?	-	-	intronic	14	0	0	12	3	25	11	0	0	22	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.599506452	1.599506452	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.0000266	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	38499222	T	C	SIPA1L3	CCDS33007.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	35	1	2.9	45	8	17.8	30	1	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.185542748	NA	0	1.100279793	1.100279793	1	0.611111111	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.16091139	1	7.14E-11	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	39009306	C	T	RYR1	CCDS33011.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	21	0	0	21	4	19	19	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0	NA	0	1.174455959	1.174455959	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.00000349	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	39289740	C	G	LGALS4	CCDS12521.1	r.?	-	-	downstream	7	0	0	20	5	25	16	6	37.5	23	3	13	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.599506452	1.599506452	1	2.318005181	1.159002591	2	2.407407407	2.407407407	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.55E-08	1	1.2E-10	1	0.000205387	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	39608623	T	C	-	-	-	-	-	-	24	0	0	29	9	31	40	9	22.5	18	0	0	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.983388	1.155680683	1.716207626	1.390803109	1.390803109	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.79E-14	1	4.64E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	40456917	C	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	44	6	13.6	53	7	13.2	29	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.87013151	0.87013151	1	0.815937824	0.815937824	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	9.37E-08	1	9.85E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	40650039	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	39	10	25.6	43	16	37.2	26	3	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.637894607	1.637894607	1	2.29946114	1.14973057	2	2.12962963	2.12962963	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.44E-15	1	3.56E-26	1	0.000298167	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	40814614	G	A	-	-	-	-	-	-	13	0	0	30	7	23.3	31	6	19.4	23	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.490740013	1.490740013	1	1.199181347	1.199181347	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.44E-10	1	1.03E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	47188449	G	A	PRKD2	CCDS12689.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	26	4	15.4	25	9	36	18	0	0	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.985295974	0.985295974	1	2.225284974	1.112642487	2	0	NA	0	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000856	1	3.71E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	47284994	G	A	SLC1A5	CCDS12692.1	r.?	-	-	intronic	17	0	0	21	3	14.3	26	10	38.5	18	1	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.91491769	0.91491769	1	2.379818653	1.189909326	2	1.037037037	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000155401	1	4.82E-17	1	0.086275114	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	47583580	C	T	ZC3H4	CCDS42582.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	26	4	15.4	31	2	6.5	18	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.985295974	0.985295974	1	0.401787565	0.401787565	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000856	1	0.010558179	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	48350071	C	T	CRX	CCDS12706.1	r.?	-	-	downstream	14	0	0	23	5	21.7	21	10	47.6	31	2	6.5	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.3883716	1.3883716	1	2.942321244	1.471160622	2	1.203703704	1.203703704	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	9.75E-08	1	3.28E-18	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	48965114	G	A	KCNJ14	CCDS12721.1	r.609g>a	c.133G>A	p.V45M	missense	8	0	0	12	4	33.3	4	0	0	24	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	2.130542594	2.130542594	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.0000003	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	49531707	G	T	CGB	CCDS12749.1	r.?	-	-	upstream	7	0	0	17	4	23.5	10	0	0	20	1	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.503536065	1.503536065	1	0	0	1	0.925925926	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000141	1	1	1	0.09538952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	50469193	T	A	SIGLEC11	CCDS12790.2	r.?	-	-	upstream	22	0	0	29	3	10.3	24	6	25	22	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.658996658	0.658996658	1	1.545336788	1.545336788	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000414371	1	1.95E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	51181148	C	T	SHANK1	CCDS12799.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	43	5	11.6	37	5	13.5	29	3	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.742170994	0.742170994	1	0.834481865	0.834481865	1	1.907407407	1.907407407	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00000257	1	0.00000119	1	0.000414371	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	55074980	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	37	11	29.7	39	16	41	30	7	23.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.900213665	1.107216654	1.716207626	2.534352332	1.267176166	2	4.314814815	2.157407407	2	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.7E-17	1	5.16E-27	1	1.44E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	55354771	G	A	KIR3DL1	ENST00000355608	r.?	-	-	intronic	21	0	0	25	8	32	26	11	42.3	26	4	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	2.047368258	1.192960705	1.716207626	2.614709845	1.307354922	2	2.851851852	1.425925926	2	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.92E-13	1	3.52E-19	1	0.00000856	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	56493372	A	G	NLRP8	CCDS12937.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	45	8	17.8	40	10	25	29	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.138848594	1.138848594	1	1.545336788	1.545336788	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	7.14E-11	1	7.22E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	56575902	T	C	NLRP5	CCDS12938.1	r.?	-	-	downstream	26	0	0	40	6	15	42	6	14.3	26	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.959703871	0.959703871	1	0.883932642	0.883932642	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	5.18E-08	1	7.02E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	56740055	T	C	ZSCAN5A	CCDS12941.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	31	6	19.4	22	9	40.9	28	2	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.241217007	1.241217007	1	2.528170984	1.264085492	2	1.314814815	1.314814815	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.03E-08	1	9.16E-16	1	0.008668191	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	56950066	A	G	ZNF667	CCDS12944.1	r.?	-	-	downstream	28	0	0	52	6	11.5	34	8	23.5	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	0.735772968	0.735772968	1	1.45261658	1.45261658	1	0.537037037	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000000261	1	6.32E-12	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	57467442	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	36	7	19.4	43	5	11.6	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.241217007	1.241217007	1	0.717036269	0.717036269	1	0	NA	0	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	5.74E-10	1	0.00000257	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	19	58389415	T	A	ZNF814	CCDS46212.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	28	8	28.6	28	11	39.3	19	3	15.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.716207626	3	2	1	2	2	1	1	0	0.283792374	1	1	2	NA	NA	1	NA	NA	0.716207626	NA	NA	1.829835381	1.829835381	1	2.42926943	1.214634715	2	2.925925926	2.925925926	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.11E-12	1	9.7E-19	1	0.000114071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	529957	A	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	60	13	21.7	53	14	26.4	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.775229222	0.887614611	2	1.895875648	0.947937824	2	1.643851852	1.643851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.07E-18	1	1.22E-20	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	1834986	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	49	1	2	67	8	11.9	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.163615596	NA	0	0.854580311	0.854580311	1	1.778962963	1.778962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.217776325	1	1.96E-09	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	3676168	G	A	SIGLEC1	CCDS13060.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	22	6	27.3	20	4	20	25	1	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.233352892	0.893712354	2.498961642	1.43626943	1.43626943	1	0.900740741	0.900740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	1.09E-09	1	0.00000284	1	0.117779757	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	3685513	C	A	SIGLEC1	CCDS13060.1	r.?	-	-	intronic	20	0	0	41	6	14.6	45	2	4.4	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.194393854	1.194393854	1	0.315979275	0.315979275	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	6.05E-08	1	0.021467209	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	3775618	C	T	CDC25B	CCDS13067.1	r.?	-	-	upstream	13	0	0	11	3	27.3	13	5	38.5	29	7	24.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.233352892	2.233352892	1	2.764818653	1.382409326	2	5.426962963	1.808987654	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00002	1	3.89E-09	1	1.11E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	4648817	C	T	-	-	-	-	-	-	11	0	0	35	12	34.3	26	11	42.3	26	1	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.806007479	1.122869368	2.498961642	3.037709845	1.518854922	2	0.855703704	0.855703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.83E-19	1	3.52E-19	1	0.122190858	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	5157445	G	A	CDS2	CCDS13088.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	53	7	13.2	56	10	17.9	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.079862937	1.079862937	1	1.28546114	1.28546114	1	0.495407407	0.495407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.85E-09	1	2.82E-13	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	6169725	G	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	49	14	28.6	52	18	34.6	50	2	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.339703029	0.936270085	2.498961642	2.484746114	1.242373057	2	0.900740741	0.900740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.5E-21	1	1.39E-28	1	0.026131524	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	6570558	G	T	-	-	-	-	-	-	39	0	0	49	4	8.2	76	5	6.6	66	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.670823946	0.670823946	1	0.473968912	0.473968912	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000110643	1	0.000043	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	6649339	C	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	50	6	12	50	4	8	63	2	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.981693579	0.981693579	1	0.574507772	0.574507772	1	0.720592593	0.720592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000206	1	0.000119787	1	0.03993132	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	6886581	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	48	0	0	55	7	12.7	53	3	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0	0	1	0.912031088	0.912031088	1	1.283555556	1.283555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1.28E-08	1	0.002429596	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	7239736	G	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	71	9	12.7	59	8	13.6	37	3	8.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.038959038	1.038959038	1	0.976663212	0.976663212	1	1.824	1.824	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.1E-10	1	6.9E-10	1	0.000855237	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	7654566	T	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	60	16	26.7	58	19	32.8	47	5	10.6	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.184268213	1.092134106	2	2.355481865	1.177740933	2	2.386962963	1.193481481	2	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.86E-23	1	1.5E-29	1	0.00000402	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	8263310	C	A	PLCB1	CCDS13103.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	44	3	6.8	56	10	17.9	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.556293028	0.556293028	1	1.28546114	1.28546114	1	0.945777778	0.945777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00142027	1	2.82E-13	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	8624967	G	T	PLCB1	CCDS13103.1	r.?	-	-	intronic	8	0	0	3	1	33.3	7	3	42.9	28	14	50	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.724199681	2.724199681	1	3.080797927	1.540398964	2	11.25925926	3.75308642	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.014925125	1	0.00000431	1	2.29E-25	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	8692787	C	T	PLCB1	CCDS13103.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	37	6	16.2	49	8	16.3	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.325286331	1.325286331	1	1.170559585	1.170559585	1	0.653037037	0.653037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.18E-08	1	1.47E-10	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	8789267	A	T	PLCB1	CCDS13103.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	63	9	14.3	58	9	15.5	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.169851515	1.169851515	1	1.113108808	1.113108808	1	1.261037037	1.261037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.62E-11	1	1.67E-11	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	8915865	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	45	10	22.2	42	12	28.6	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.816133121	0.90806656	2	2.053865285	1.026932642	2	1.531259259	1.531259259	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.66E-14	1	2.35E-18	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	9327522	G	C	PLCB4	CCDS13104.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	53	8	15.1	38	7	18.4	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.235297753	1.235297753	1	1.321367876	1.321367876	1	0.653037037	0.653037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.83E-10	1	8.61E-10	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	9520431	G	A	PAK7	CCDS13107.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	58	4	6.9	56	9	16.1	63	3	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.564473808	0.564473808	1	1.156196891	1.156196891	1	1.080888889	1.080888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000213772	1	1.2E-11	1	0.003968795	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	10523020	G	T	C20orf94	CCDS33439.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	46	4	8.7	53	7	13.2	48	3	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.711727845	0.711727845	1	0.947937824	0.947937824	1	1.396148148	1.396148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000862	1	9.85E-09	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	11407255	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	60	10	16.7	65	8	12.3	57	1	1.8	43	0	0	229	19	8.3	178	13	7.3	255	6	2.4	TRUE	TRUE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.36619023	1.36619023	1	0.883305699	0.883305699	1	0.405333333	0.405333333	1	0.679004725	0.679004725	1	0.524238342	0.524238342	1	0.540444444	0.540444444	1	5	3	1	1	5.86E-13	1.84E-17	1.53E-09	1.05E-11	0.248523156	0.001954686	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	20	11562282	A	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	58	12	20.7	68	8	11.8	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.693421423	1.129729659	1.498961642	0.847398964	0.847398964	1	1.148444444	1.148444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.76E-16	1	2.21E-09	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	12532484	A	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	64	11	17.2	62	7	11.3	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.40709413	1.40709413	1	0.811492228	0.811492228	1	0.968296296	0.968296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.85E-14	1	3.02E-08	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	12802765	A	G	-	-	-	-	-	-	29	0	0	55	17	30.9	46	8	17.4	45	7	15.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.527860965	1.011564533	2.498961642	1.249554404	1.249554404	1	3.512888889	1.170962963	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.35E-26	1	8.61E-11	1	0.000000003	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	13337816	T	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	58	4	6.9	50	3	6	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.564473808	0.564473808	1	0.430880829	0.430880829	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000213772	1	0.002055544	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	13717863	T	A	ESF1	CCDS13117.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	63	6	9.5	54	5	9.3	41	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.777174083	0.777174083	1	0.667865285	0.667865285	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000832	1	0.00000806	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	13785918	C	T	C20orf7	CCDS13118.1	r.?	-	-	intronic	20	0	0	34	8	23.5	47	7	14.9	25	1	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.922483258	0.961241629	2	1.070020725	1.070020725	1	0.900740741	0.900740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.32E-12	1	4.12E-09	1	0.117779757	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	13810236	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	48	15	31.2	45	12	26.7	40	7	17.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.552403305	1.021385548	2.498961642	1.917419689	0.958709845	2	3.940740741	1.313580247	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.86E-23	1	6.03E-18	1	1.26E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	13864096	G	A	SEL1L2	CCDS42852.1	r.?	-	-	intronic	15	0	0	31	8	25.8	27	3	11.1	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.110641194	1.055320597	2	0.797129534	0.797129534	1	0.472888889	0.472888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.78E-12	1	0.000334187	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	14215492	C	G	MACROD2	CCDS13120.2	r.?	-	-	intronic	36	0	0	69	6	8.7	59	4	6.8	49	5	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.711727845	0.711727845	1	0.488331606	0.488331606	1	2.296888889	2.296888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000143	1	0.00022841	1	0.00000496	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	14520327	C	G	MACROD2	CCDS13120.2	r.?	-	-	intronic	36	0	0	67	0	0	69	0	0	58	5	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0	0	1	0	0	1	1.936592593	1.936592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.0000115	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	14685383	G	A	MACROD2	CCDS13120.2	r.?	-	-	intronic	29	0	0	46	3	6.5	55	5	9.1	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.531750689	0.531750689	1	0.653502591	0.653502591	1	1.508740741	1.508740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001615827	1	0.00000883	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	15478746	C	T	MACROD2	CCDS13120.2	r.?	-	-	intronic	30	0	0	37	12	32.4	50	16	32	52	4	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.650572663	1.060669607	2.498961642	2.298031088	1.149015544	2	1.733925926	1.733925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.03E-19	1	6.4E-25	1	0.000139698	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	15885276	G	A	MACROD2	CCDS13120.2	r.?	-	-	intronic	13	0	0	30	4	13.3	25	2	8	46	0	0	0	0	NA	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.088043717	1.088043717	1	0.574507772	0.574507772	1	0	0	1	NA	NA	1	7.18134715	7.18134715	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000154	1	0.006948068	0.005	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	16285169	T	A	KIF16B	CCDS13122.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	75	10	13.3	59	8	13.6	50	2	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.088043717	1.088043717	1	0.976663212	0.976663212	1	0.900740741	0.900740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.02E-12	1	6.9E-10	1	0.026131524	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	18042503	G	A	OVOL2	CCDS13132.1	r.?	-	-	upstream	21	0	0	59	11	18.6	31	5	16.1	35	7	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.521625047	1.521625047	1	1.156196891	1.156196891	1	4.503703704	1.501234568	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.1E-14	1	0.000000476	1	4.65E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	18434428	T	C	C20orf12	CCDS46582.1	r.631a>g	c.422A>G	p.Y141C	missense	24	0	0	54	18	33.3	46	13	28.3	49	6	12.2	106	0	0	289	102	35.3	322	98	30.4	248	19	7.7	TRUE	TRUE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.724199681	1.090132652	2.498961642	2.032321244	1.016160622	2	2.747259259	0.915753086	3	2.887815278	1.155606084	2.498961642	2.183129534	1.091564767	2	1.733925926	0.866962963	2	5	5	1	1	3.12E-28	1.18E-155	1.07E-19	4.3E-142	0.000000182	8.13E-17	YES	1_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	20	18845462	A	G	-	-	-	-	-	-	32	0	0	53	17	32.1	48	17	35.4	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.626030323	1.050848592	2.498961642	2.542196891	1.271098446	2	1.193481481	1.193481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.08E-26	1	2.8E-27	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	19412561	T	C	SLC24A3	CCDS13140.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	48	14	29.2	59	18	30.5	58	4	6.9	0	0	NA	2	2	100	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.388787708	0.955912115	2.498961642	2.190310881	1.09515544	2	1.553777778	1.553777778	1	8.180779823	3.273671627	2.498961642	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.51E-21	0.000025	2.03E-27	1	0.000213772	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	19819774	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	32	4	12.5	33	6	18.2	42	0	0	435	0	0	402	54	13.4	329	43	13.1	221	10	4.5	TRUE	TRUE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.022597478	1.022597478	1	1.307005181	1.307005181	1	0	0	1	1.096224496	1.096224496	1	0.940756477	0.940756477	1	1.013333333	1.013333333	1	5	5	1	1	0.0000201	4.43E-58	1.54E-08	4.56E-46	1	0.000000234	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	20	20136542	A	T	C20orf26	CCDS33447.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	56	12	21.4	63	21	33.3	55	5	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.750686882	0.875343441	2	2.391388601	1.195694301	2	2.049185185	2.049185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.11E-16	1	1.08E-32	1	0.00000883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	21033399	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	32	4	12.5	40	5	12.5	51	4	7.8	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.022597478	1.022597478	1	0.897668394	0.897668394	1	1.756444444	1.756444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000201	1	0.00000178	1	0.000129466	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	21157388	T	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	52	3	5.8	50	4	8	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.47448523	0.47448523	1	0.574507772	0.574507772	1	1.576296296	1.576296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.002300591	1	0.000119787	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	21294968	T	C	XRN2	CCDS13144.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	60	7	11.7	55	8	14.5	33	4	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.957151239	0.957151239	1	1.041295337	1.041295337	1	2.724740741	0.908246914	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.39E-08	1	3.86E-10	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	21830142	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	66	15	22.7	57	13	22.8	55	4	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.85703702	0.92851851	2	1.63734715	0.818673575	2	1.643851852	1.643851852	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.45E-21	1	2.44E-18	1	0.000173903	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	22005975	G	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	54	8	14.8	50	5	10	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.210755414	1.210755414	1	0.718134715	0.718134715	1	0.495407407	0.495407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.31E-10	1	0.00000549	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	22197045	G	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	75	15	20	49	14	28.6	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.636155965	1.09152624	1.498961642	2.053865285	1.026932642	2	1.959111111	1.959111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.25E-20	1	3.5E-21	1	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	22197047	G	C	-	-	-	-	-	-	45	0	0	74	15	20.3	46	13	28.3	49	5	10.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.660698304	1.107899134	1.498961642	2.032321244	1.016160622	2	2.296888889	2.296888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.22E-20	1	1.07E-19	1	0.00000496	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	22492096	G	A	-	-	-	-	-	-	18	0	0	41	6	14.6	20	4	20	51	3	5.9	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.194393854	1.194393854	1	1.43626943	1.43626943	1	1.328592593	1.328592593	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.05E-08	1	0.00000284	1	0.002175924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	23640397	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	45	5	11.1	56	11	19.6	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.90806656	0.90806656	1	1.407544041	1.407544041	1	1.688888889	1.688888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000323	1	5.91E-15	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	23765800	A	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	56	5	8.9	52	9	17.3	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.728089404	0.728089404	1	1.242373057	1.242373057	1	0.608	0.608	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000965	1	5.92E-12	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	23987911	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	50	14	28	43	12	27.9	50	6	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.290618351	0.916628056	2.498961642	2.003595855	1.001797927	2	2.702222222	0.900740741	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.84E-21	1	3.24E-18	1	0.000000206	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	24011328	C	A	-	-	-	-	-	-	50	0	0	61	11	18	81	15	18.5	52	6	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.472540368	1.472540368	1	1.328549223	1.328549223	1	2.58962963	0.863209877	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.62E-14	1	1.82E-19	1	0.000000261	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	24292004	A	C	-	-	-	-	-	-	22	0	0	69	11	15.9	51	3	5.9	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.300743992	1.300743992	1	0.423699482	0.423699482	1	1.05837037	1.05837037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	6.82E-14	1	0.002175924	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	24703429	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	37	15	40.5	43	14	32.6	39	4	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	3.313215828	1.325837009	2.498961642	2.341119171	1.170559585	2	2.319407407	2.319407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.58E-25	1	4.18E-22	1	0.0000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	24855978	G	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	25	3	12	20	7	35	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.981693579	0.981693579	1	2.513471503	1.256735751	2	0.585481481	0.585481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00026475	1	5.72E-12	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	25491666	C	A	NINL	CCDS33452.1	r.?	-	-	intronic	13	0	0	29	6	20.7	11	1	9.1	45	0	0	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.693421423	1.693421423	1	0.653502591	0.653502591	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.72E-09	1	0.05364542	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	26240507	T	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	50	4	8	56	6	10.7	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.654462386	0.654462386	1	0.768404145	0.768404145	1	0.540444444	0.540444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000119787	1	0.000000409	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	29435306	A	C	-	-	-	-	-	-	91	0	0	115	5	4.3	130	10	7.7	93	3	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.351773532	0.705011173	0.498961642	0.552963731	0.552963731	1	0.720592593	0.720592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000303924	1	1.51E-09	1	0.011611924	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	29558961	T	C	-	-	-	-	-	-	25	0	0	57	9	15.8	56	5	8.9	46	4	8.7	0	0	NA	0	0	NA	1	1	100	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.292563212	1.292563212	1	0.639139896	0.639139896	1	1.959111111	1.959111111	1	NA	NA	1	7.18134715	7.18134715	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.42E-11	1	0.00000965	0.005	0.0000862	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	29810172	G	A	-	-	-	-	-	-	38	0	0	54	7	13	51	12	23.5	27	3	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.063501377	1.063501377	1	1.68761658	0.84380829	2	2.499555556	2.499555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.13E-08	1	3.24E-17	1	0.000334187	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	30365509	G	A	TPX2	CCDS13190.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	46	7	15.2	60	10	16.7	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.243478533	1.243478533	1	1.199284974	1.199284974	1	1.080888889	1.080888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.53E-09	1	5.86E-13	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	30462493	G	A	TTLL9	CCDS42863.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	42	7	16.7	46	8	17.4	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.36619023	1.36619023	1	1.249554404	1.249554404	1	0.698074074	0.698074074	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.81E-09	1	8.61E-11	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	30617107	G	C	C20orf160	CCDS13195.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	29	0	0	26	4	15.4	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0	0	1	1.105927461	1.105927461	1	1.37362963	1.37362963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1	1	0.00000856	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	31599969	A	C	BPIL1	CCDS13210.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	57	6	10.5	37	9	24.3	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.858981881	0.858981881	1	1.745067358	1.745067358	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000456	1	2.14E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	31660236	C	T	C20orf185	CCDS13212.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	45	9	20	52	16	30.8	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.636155965	1.636155965	1	2.211854922	1.105927461	2	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.47E-12	1	1.33E-24	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	32533709	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	50	5	10	63	10	15.9	29	2	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.818077982	0.818077982	1	1.141834197	1.141834197	1	1.553777778	1.553777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000549	1	9.81E-13	1	0.009279585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	33657227	A	T	TRPC4AP	CCDS13246.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	45	4	8.9	51	10	19.6	31	2	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.728089404	0.728089404	1	1.407544041	1.407544041	1	1.463703704	1.463703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000791	1	1.04E-13	1	0.010558179	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	34839086	C	A	C20orf4	CCDS13273.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	41	3	7.3	45	9	20	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.597196927	0.597196927	1	1.43626943	1.43626943	1	1.598814815	1.598814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.001155993	1	1.47E-12	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	34859612	C	T	C20orf4	ENST00000397286	r.?	-	-	downstream	13	0	0	19	5	26.3	14	1	7.1	34	1	2.9	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.151545094	2.151545094	1	0.509875648	0.509875648	1	0.653037037	0.653037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.43E-08	1	0.067769881	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	35629206	C	T	RBL1	CCDS13289.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	20	5	25	4	0	0	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.045194956	2.045194956	1	0	0	1	0.608	0.608	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.55E-08	1	1	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	36874591	G	A	KIAA1755	CCDS33467.1	r.?	-	-	intronic	9	0	0	21	1	4.8	24	4	16.7	45	1	2.2	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.392677432	0.392677432	1	1.199284974	1.199284974	1	0.495407407	0.495407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.099912572	1	0.00000613	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	36906264	A	C	BPI	ENST00000451435	r.?	-	-	intronic	30	0	0	39	7	17.9	31	12	38.7	38	5	13.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.464359588	1.464359588	1	2.779181347	1.389590674	2	2.972444444	0.990814815	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.04E-09	1	3.16E-20	1	0.00000137	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	37710633	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	44	15	34.1	54	15	27.8	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.78964592	1.116322025	2.498961642	1.996414508	0.998207254	2	1.98162963	1.98162963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.12E-24	1	2.2E-22	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	37804665	G	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	60	13	21.7	66	11	16.7	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.775229222	0.887614611	2	1.199284974	1.199284974	1	0.472888889	0.472888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.07E-18	1	4.07E-14	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	40127898	G	T	CHD6	CCDS13317.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	50	5	10	46	5	10.9	31	3	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.818077982	0.818077982	1	0.782766839	0.782766839	1	2.184296296	2.184296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000549	1	0.00000361	1	0.000505952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	40279407	A	G	-	-	-	-	-	-	23	0	0	50	20	40	45	9	20	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	3.272311929	1.309468651	2.498961642	1.43626943	1.43626943	1	0.675555556	0.675555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.9E-33	1	1.47E-12	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	40566183	A	G	-	-	-	-	-	-	22	0	0	44	5	11.4	46	6	13	36	6	16.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.9326089	0.9326089	1	0.93357513	0.93357513	1	3.760592593	1.253530864	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000288	1	0.000000123	1	2.68E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	41571747	G	A	PTPRT	CCDS42874.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	49	0	0	61	1	1.6	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0	0	1	0.114901554	0.114901554	1	2.499555556	0.833185185	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.263440347	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	41635408	C	T	PTPRT	CCDS42874.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	58	15	25.9	63	6	9.5	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.118821974	1.059410987	2	0.682227979	0.682227979	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.42E-22	1	0.000000832	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	43150889	T	A	SERINC3	CCDS13333.1	r.?	-	-	upstream	22	0	0	34	5	14.7	42	10	23.8	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.202574634	1.202574634	1	1.709160622	1.709160622	1	2.206814815	2.206814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000771	1	1.24E-14	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	43503140	T	C	-	-	-	-	-	-	29	0	0	52	17	32.7	52	15	28.8	35	4	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.675115002	1.070490622	2.498961642	2.068227979	1.03411399	2	2.567111111	2.567111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.42E-26	1	1.15E-22	1	0.0000289	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	43819213	A	C	-	-	-	-	-	-	26	0	0	56	8	14.3	60	8	13.3	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.169851515	1.169851515	1	0.955119171	0.955119171	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.48E-10	1	7.93E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	43868986	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	59	9	15.3	56	8	14.3	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.251659313	1.251659313	1	1.026932642	1.026932642	1	1.37362963	1.37362963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.96E-11	1	4.48E-10	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	44080710	C	T	-	-	-	-	-	-	18	0	0	36	0	0	42	5	11.9	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0	0	1	0.854580311	0.854580311	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000228	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	44654014	C	T	SLC12A5	CCDS46610.1	r.?	-	-	intronic	18	0	0	40	7	17.5	31	11	35.5	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.431636469	1.431636469	1	2.549378238	1.274689119	2	1.98162963	1.98162963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	1.26E-09	1	3.77E-18	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	45968921	T	C	ZMYND8	CCDS46613.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	35	4	11.4	41	7	17.1	25	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.9326089	0.9326089	1	1.228010363	1.228010363	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000289	1	1.51E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	46857014	G	A	-	-	-	-	-	-	18	0	0	47	9	19.1	41	9	22	46	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.562528946	1.562528946	1	1.579896373	1.579896373	1	0.495407407	0.495407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-12	1	5.92E-13	1	0.205924651	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	47551310	G	A	ARFGEF2	CCDS13411.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	56	9	16.1	57	7	12.3	29	2	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.317105552	1.317105552	1	0.883305699	0.883305699	1	1.553777778	1.553777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.2E-11	1	1.66E-08	1	0.009279585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	50485742	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	65	12	18.5	55	9	16.4	27	1	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.513444267	1.513444267	1	1.177740933	1.177740933	1	0.833185185	0.833185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.7E-16	1	1.01E-11	1	0.126579904	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	50743466	A	T	ZFP64	CCDS13439.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	36	0	0	47	2	4.3	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0	0	1	0.308797927	0.308797927	1	1.778962963	1.778962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.02328732	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	50759151	C	T	ZFP64	CCDS13439.1	r.?	-	-	intronic	15	0	0	19	0	0	36	5	13.9	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0	0	1	0.998207254	0.998207254	1	1.125925926	1.125925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1	1	0.00000104	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	50925808	T	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	61	11	18	51	6	11.8	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.472540368	1.472540368	1	0.847398964	0.847398964	1	0.968296296	0.968296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.62E-14	1	0.000000232	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	51557835	C	T	-	-	-	-	-	-	16	0	0	32	10	31.2	25	8	32	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.552403305	1.021385548	2.498961642	2.298031088	1.149015544	2	2.364444444	2.364444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.7E-16	1	3.92E-13	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	51919328	T	A	TSHZ2	CCDS33490.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	50	14	28	50	19	38	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.290618351	0.916628056	2.498961642	2.728911917	1.364455959	2	0.968296296	0.968296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.84E-21	1	5E-31	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	52643306	G	A	BCAS1	CCDS13444.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	62	7	11.3	54	11	20.4	50	2	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.92442812	0.92442812	1	1.464994819	1.464994819	1	0.900740741	0.900740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.02E-08	1	3.84E-15	1	0.026131524	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	52949735	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	54	0	0	44	0	0	52	5	9.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.161777778	2.161777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.00000668	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	53156629	G	A	DOK5	CCDS13446.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	46	16	34.8	49	19	38.8	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.846911379	1.139237726	2.498961642	2.786362694	1.393181347	2	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.31E-25	1	3.12E-31	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	53546900	G	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	30	1	3.3	20	5	25	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.269965734	0.269965734	1	1.795336788	1.795336788	1	1.103407407	1.103407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.139615808	1	4.55E-08	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	53689086	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	63	4	6.3	58	2	3.4	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.515389129	0.515389129	1	0.244165803	0.244165803	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000294233	1	0.034352256	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	53926829	G	T	-	-	-	-	-	-	49	0	0	62	7	11.3	51	6	11.8	50	3	6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.92442812	0.92442812	1	0.847398964	0.847398964	1	1.351111111	1.351111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.02E-08	1	0.000000232	1	0.002055544	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	54455303	A	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	54	0	0	57	5	8.8	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0	0	1	0.631958549	0.631958549	1	1.148444444	1.148444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.0000105	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	54681380	G	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	34	8	23.5	26	6	23.1	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.922483258	0.961241629	2	1.658891192	1.658891192	1	1.328592593	1.328592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.32E-12	1	3.3E-09	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	54681382	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	35	7	20	27	6	22.2	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.636155965	1.636155965	1	1.594259067	1.594259067	1	1.328592593	1.328592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.65E-10	1	4.23E-09	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	54736100	C	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	28	10	35.7	29	9	31	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.920538397	1.168700771	2.498961642	2.226217617	1.113108808	2	1.080888889	1.080888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.18E-16	1	1.79E-14	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	54741608	T	A	-	-	-	-	-	-	9	0	0	32	8	25	25	8	32	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.045194956	1.022597478	2	2.298031088	1.149015544	2	2.364444444	2.364444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.69E-12	1	3.92E-13	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	56453873	G	A	-	-	-	-	-	-	20	0	0	25	5	20	31	15	48.4	40	5	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.636155965	1.636155965	1	3.475772021	1.73788601	2	2.814814815	0.938271605	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000153	1	8.51E-27	1	0.00000178	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	57092565	C	T	APCDD1L	CCDS13467.1	r.?	-	-	upstream	19	0	0	41	4	9.8	54	6	11.1	50	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.801716423	0.801716423	1	0.797129534	0.797129534	1	0.45037037	0.45037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000546	1	0.000000329	1	0.221687443	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	57805243	C	G	ZNF831	CCDS42894.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	61	4	6.6	45	2	4.4	51	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.539931468	0.539931468	1	0.315979275	0.315979275	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.000259828	1	0.021467209	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	57956033	G	A	-	-	-	-	-	-	15	0	0	45	10	22.2	24	7	29.2	45	8	17.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.816133121	0.90806656	2	2.096953368	1.048476684	2	4.008296296	1.336098765	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.66E-14	1	2.51E-11	1	7.14E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	58228780	G	T	PHACTR3	CCDS13480.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	51	6	11.8	51	10	19.6	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.965332019	0.965332019	1	1.407544041	1.407544041	1	0.540444444	0.540444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000232	1	1.04E-13	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	58319881	C	A	PHACTR3	CCDS13480.1	r.?	-	-	intronic	7	0	0	16	4	25	20	1	5	42	5	11.9	2	0	0	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.045194956	2.045194956	1	0.359067358	0.359067358	1	2.679703704	0.893234568	3	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000108	1	0.09538952	1	0.00000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	58394207	C	A	PHACTR3	CCDS13480.1	r.?	-	-	intronic	9	0	0	30	4	13.3	29	3	10.3	61	3	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.088043717	1.088043717	1	0.739678756	0.739678756	1	1.103407407	1.103407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000154	1	0.000414371	1	0.003623631	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	59214710	G	A	AL161940.1	ENST00000506383	r.?	-	-	intronic	19	0	0	53	6	11.3	39	9	23.1	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.92442812	0.92442812	1	1.658891192	1.658891192	1	1.463703704	1.463703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000293	1	3.62E-13	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	59669048	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	56	13	23.2	59	15	25.4	46	7	15.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.897940919	0.94897046	2	1.824062176	0.912031088	2	3.422814815	1.140938272	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.89E-18	1	9.9E-22	1	3.53E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	59804323	C	A	ENSG00000212701	ENST00000391394	r.?	-	-	intronic	14	0	0	18	2	11.1	11	4	36.4	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	0.90806656	0.90806656	1	2.614010363	1.307005181	2	2.049185185	2.049185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.003626632	1	0.000000201	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	59832569	C	T	CDH4	CCDS13488.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	27	9	33.3	14	4	28.6	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	2.724199681	1.090132652	2.498961642	2.053865285	2.053865285	1	0.517925926	0.517925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.44E-15	1	0.000000601	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	60393242	C	T	CDH4	CCDS13488.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	22	4	18.2	28	0	0	40	0	0	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.488901928	1.488901928	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000425	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	61755020	G	A	-	-	-	-	-	-	10	0	0	8	1	12.5	16	9	56.2	27	5	18.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.022597478	1.022597478	1	4.035917098	2.017958549	2	4.165925926	1.388641975	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.039306956	1	2.16E-17	1	0.00000023	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	61773990	G	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	44	10	22.7	42	10	23.8	42	5	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.85703702	0.92851851	2	1.709160622	1.709160622	1	2.679703704	0.893234568	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.08E-14	1	1.24E-14	1	0.00000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	20	62389193	G	A	ZBTB46	CCDS13538.1	r.?	-	-	intronic	9	0	0	15	2	13.3	7	0	0	11	4	36.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	4.498961642	4	6	2	2	3	2	2	3	0.501038358	1	1	3	NA	NA	2	NA	NA	0.498961642	NA	NA	1.088043717	1.088043717	1	0	0	1	8.196740741	2.732246914	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.002513772	1	1	1	0.000000201	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	9686709	G	C	-	-	-	-	-	-	42	0	0	29	3	10.3	27	3	11.1	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.585227273	0.585227273	1	0.575129534	0.575129534	1	0.925925926	0.925925926	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000414371	1	0.000334187	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	9916930	G	A	ENSG00000227328	ENST00000416067	r.?	-	-	intronic	92	0	0	75	4	5.3	122	8	6.6	121	1	0.8	1	0	0	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.301136364	0.301136364	1	0.341968912	0.341968912	1	0.148148148	0.148148148	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	0.000572493	1	0.000000227	1	0.454753646	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	14657932	C	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	38	0	0	36	4	11.1	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.575129534	0.575129534	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.0000324	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	15068215	G	A	-	-	-	-	-	-	10	0	0	14	4	28.6	5	0	0	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.625	1.625	1	0	0	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000601	1	1	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	18714623	C	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	40	11	27.5	29	5	17.2	24	2	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.5625	1.5625	1	0.89119171	0.89119171	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	9.88E-17	1	0.000000336	1	0.006413403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	18726365	G	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	40	8	20	25	6	24	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	1.243523316	1.243523316	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.61E-11	1	2.55E-09	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	19071770	G	C	-	-	-	-	-	-	25	0	0	39	0	0	37	2	5.4	38	5	13.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.279792746	0.279792746	1	2.444444444	1.222222222	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	3	NA	1	1	1	1	0.014826063	1	0.00000137	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	19246406	G	A	CHODL	ENST00000427223	r.?	-	-	intronic	33	0	0	24	4	16.7	38	3	7.9	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	0.409326425	0.409326425	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.00000613	1	0.000925091	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	19746437	G	T	PRSS7	CCDS13571.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	29	8	27.6	28	5	17.9	47	5	10.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.568181818	1.568181818	1	0.92746114	0.92746114	1	1.962962963	1.962962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.53E-12	1	0.000000279	1	0.00000402	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	22229334	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	43	0	0	38	6	15.8	35	2	5.7	109	0	0	215	5	2.3	204	26	12.7	257	12	4.7	TRUE	TRUE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.81865285	0.81865285	1	1.055555556	1.055555556	1	0.130681818	0.130681818	1	0.658031088	0.658031088	1	0.87037037	0.87037037	1	3	1	1	1	1	0.004805854	3.76E-08	3.33E-28	0.013332991	1.05E-08	YES	0_1	1_1	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	21	24732500	G	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	47	16	34	35	20	57.1	43	7	16.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.931818182	0.965909091	2	2.958549223	1.479274611	2	3.018518519	1.509259259	2	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.98E-25	1	2.88E-37	1	2.15E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	24831796	A	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	31	11	35.5	35	17	48.6	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	2	100	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.017045455	1.008522727	2	2.518134715	1.259067358	2	1.722222222	1.722222222	1	NA	NA	1	NA	NA	1	18.51851852	9.259259259	2	5	NA	1	1	3.77E-18	1	3.18E-30	1	0.000066	0.000025	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	25252079	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	39	4	10.3	30	5	16.7	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.585227273	0.585227273	1	0.865284974	0.865284974	1	0.5	0.5	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000447	1	0.000000401	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	25260046	G	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	13	1	7.7	18	5	27.8	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.4375	0.4375	1	1.440414508	1.440414508	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	0	1	5	NA	1	1	0.063085307	1	2.54E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	25739189	C	G	-	-	-	-	-	-	35	0	0	22	12	54.5	24	15	62.5	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3.096590909	1.548295455	2	3.238341969	1.619170984	2	1.462962963	1.462962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.51E-22	1	3.82E-29	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	26068643	C	T	-	-	-	-	-	-	18	0	0	26	7	26.9	15	4	26.7	29	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.528409091	1.528409091	1	1.383419689	1.383419689	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.73E-11	1	0.000000816	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	26305174	G	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	30	5	16.7	30	6	20	35	4	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.948863636	0.948863636	1	1.03626943	1.03626943	1	2.111111111	2.111111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000401	1	8.37E-09	1	0.0000289	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	27009685	G	T	JAM2	CCDS42911.1	r.?	-	-	upstream	30	0	0	48	22	45.8	38	21	55.3	42	5	11.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.602272727	1.301136364	2	2.865284974	1.432642487	2	2.203703704	2.203703704	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.76E-38	1	1.27E-38	1	0.00000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	28991604	A	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	43	14	32.6	35	13	37.1	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.852272727	0.926136364	2	1.922279793	0.961139896	2	1.814814815	1.814814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.18E-22	1	1.63E-21	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	29221601	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	32	10	31.2	27	8	29.6	31	3	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.772727273	0.886363636	2	1.533678756	1.533678756	1	1.796296296	1.796296296	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.7E-16	1	7.97E-13	1	0.000505952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	31107944	G	A	GRIK1	CCDS42913.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	27	4	14.8	34	6	17.6	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.840909091	0.840909091	1	0.911917098	0.911917098	1	1.148148148	1.148148148	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00001	1	1.86E-08	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	31287255	C	T	GRIK1	CCDS42913.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	32	8	25	44	6	13.6	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.420454545	1.420454545	1	0.704663212	0.704663212	1	0.481481481	0.481481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.69E-12	1	9.37E-08	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	31608849	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	39	9	23.1	34	9	26.5	54	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.3125	1.3125	1	1.373056995	1.373056995	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.62E-13	1	9.15E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	31991240	G	T	KRTAP6-1	CCDS13602.1	r.?	-	-	upstream	47	0	0	36	3	8.3	43	4	9.3	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.471590909	0.471590909	1	0.481865285	0.481865285	1	1.12962963	1.12962963	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000788827	1	0.000066	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	32042333	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	41	21	51.2	36	16	44.4	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.909090909	1.454545455	2	2.300518135	1.150259067	2	1.685185185	1.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.17E-37	1	1.01E-27	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	32093655	G	T	KRTAP21-3	ENST00000444335	r.?	-	-	upstream	44	0	0	50	10	20	45	5	11.1	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.136363636	1.136363636	1	0.575129534	0.575129534	1	1.092592593	1.092592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.36E-14	1	0.00000323	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	33574044	G	C	-	-	-	-	-	-	31	0	0	32	14	43.8	32	12	37.5	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.488636364	1.244318182	2	1.943005181	0.971502591	2	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.65E-24	1	5.03E-20	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	34619737	T	A	IFNAR2	CCDS13622.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	21	3	14.3	35	12	34.3	27	1	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.777202073	0.888601036	2	0.685185185	0.685185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000155401	1	1.83E-19	1	0.126579904	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	42898677	T	A	TMPRSS2	ENST00000454499	r.?	-	-	intronic	24	0	0	23	4	17.4	19	1	5.3	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.988636364	0.988636364	1	0.274611399	0.274611399	1	1.537037037	1.537037037	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000513	1	0.090843738	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	44088986	G	A	PDE9A	CCDS13690.1	r.?	-	-	intronic	10	0	0	17	2	11.8	6	3	50	29	4	13.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.670454545	0.670454545	1	2.590673575	2.590673575	1	2.555555556	2.555555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.003234386	1	0.00000247	1	0.0000134	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	47282929	C	A	PCBP3	CCDS42974.2	r.?	-	-	intronic	15	0	0	17	5	29.4	13	3	23.1	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.670454545	1.670454545	1	1.196891192	1.196891192	1	0	0	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.84E-08	1	0.0000344	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	47285428	G	C	PCBP3	CCDS42974.2	r.?	-	-	intronic	10	0	0	26	5	19.2	27	5	18.5	41	2	4.9	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.090909091	1.090909091	1	0.958549223	0.958549223	1	0.907407407	0.907407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000188	1	0.00000023	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	21	47306003	C	T	PCBP3	CCDS42974.2	r.?	-	-	intronic	20	0	0	18	0	0	16	4	25	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	2	2	2	2	0	0	0	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	1.295336788	1.295336788	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.00000108	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	19099362	T	A	DGCR2	CCDS33598.1	r.?	-	-	intronic	15	0	0	23	2	8.7	20	4	20	25	2	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.494318182	0.494318182	1	1.03626943	1.03626943	1	1.641481481	1.641481481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00589844	1	0.00000284	1	0.006948068	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	20992707	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	31	16	51.6	39	15	38.5	35	3	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.931818182	1.465909091	2	1.994818653	0.997409326	2	1.764592593	1.764592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.27E-29	1	6.85E-25	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	22276465	C	G	PPM1F	CCDS13796.1	r.3281g>c	c.?	p.?	3'UTR variant	13	0	0	19	7	36.8	8	2	25	25	5	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.090909091	1.045454545	2	1.295336788	1.295336788	1	4.103703704	1.367901235	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.73E-12	1	0.000686131	1	0.000000153	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	24175348	G	A	SMARCB1	CCDS13817.1	r.?	-	-	intronic	9	0	0	14	4	28.6	8	5	62.5	29	3	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.625	1.625	1	3.238341969	1.619170984	2	2.113407407	2.113407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000601	1	1.73E-10	1	0.000414371	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	25756678	C	A	LRP5L	CCDS33626.1	r.?	-	-	intronic	15	0	0	14	5	35.7	8	1	12.5	26	4	15.4	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.028409091	2.028409091	1	0.647668394	0.647668394	1	3.159851852	1.053283951	3	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.03E-09	1	0.039306956	1	0.00000856	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	26124311	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	27	8	29.6	43	15	34.9	50	2	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.681818182	1.681818182	1	1.808290155	0.904145078	2	0.820740741	0.820740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.97E-13	1	4.05E-24	1	0.026131524	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	26792358	A	G	-	-	-	-	-	-	26	0	0	45	22	48.9	33	13	39.4	24	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.778409091	1.389204545	2	2.041450777	1.020725389	2	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.79E-39	1	6.37E-22	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	27694467	G	A	-	-	-	-	-	-	13	0	0	18	4	22.2	18	4	22.2	35	3	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.261363636	1.261363636	1	1.150259067	1.150259067	1	1.764592593	1.764592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000181	1	0.00000181	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	27880679	C	T	-	-	-	-	-	-	12	0	0	14	5	35.7	13	7	53.8	23	3	13	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.028409091	2.028409091	1	2.787564767	1.393782383	2	2.667407407	2.667407407	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.03E-09	1	1.31E-13	1	0.000205387	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	30194618	G	A	ASCC2	CCDS13869.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	28	10	35.7	27	14	51.9	30	1	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.028409091	1.014204545	2	2.689119171	1.344559585	2	0.677111111	0.677111111	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.18E-16	1	1.15E-25	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	31759702	G	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	22	4	18.2	32	6	18.8	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.034090909	1.034090909	1	0.974093264	0.974093264	1	1.867185185	1.867185185	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000425	1	1.27E-08	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	32464629	G	T	SLC5A1	CCDS13902.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	35	4	11.4	22	6	27.3	30	2	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.647727273	0.647727273	1	1.414507772	1.414507772	1	1.374740741	1.374740741	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000289	1	1.09E-09	1	0.009909649	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	35199523	A	G	-	-	-	-	-	-	29	0	0	38	5	13.2	29	6	20.7	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.75	0.75	1	1.07253886	1.07253886	1	2.010814815	2.010814815	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000137	1	6.72E-09	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	35283976	C	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	57	15	26.3	39	10	25.6	47	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.494318182	1.494318182	1	1.32642487	1.32642487	1	0.430888889	0.430888889	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.53E-22	1	5.44E-15	1	0.209895027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	35624722	G	A	-	-	-	-	-	-	33	0	0	26	5	19.2	38	4	10.5	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.090909091	1.090909091	1	0.544041451	0.544041451	1	2.154444444	2.154444444	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000188	1	0.0000403	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	35898164	T	C	-	-	-	-	-	-	26	0	0	24	11	45.8	43	21	48.8	32	6	18.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.602272727	1.301136364	2	2.528497409	1.264248705	2	3.857481481	1.28582716	3	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.15E-19	1	4.52E-37	1	1.27E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	36181570	G	C	RBM9	CCDS13921.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	38	4	10.5	39	2	5.1	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.596590909	0.596590909	1	0.264248705	0.264248705	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	0.0000403	1	0.016387522	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	36361031	C	T	RBM9	CCDS43013.1	r.?	-	-	intronic	49	0	0	48	18	37.5	33	10	30.3	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.130681818	1.065340909	2	1.569948187	1.569948187	1	1.169555556	1.169555556	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.42E-29	1	8.14E-16	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	38197776	C	A	H1F0	CCDS13956.1	r.?	-	-	upstream	8	0	0	12	4	33.3	8	2	25	9	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.892045455	1.892045455	1	1.295336788	1.295336788	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000003	1	0.000686131	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	42808861	G	T	NFAM1	CCDS14034.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	15	4	26.7	26	6	23.1	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.517045455	1.517045455	1	1.196891192	1.196891192	1	0.656592593	0.656592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000816	1	3.3E-09	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	43695783	C	T	SCUBE1	CCDS14048.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	28	4	14.3	29	8	27.6	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.8125	0.8125	1	1.430051813	1.430051813	1	0.574518519	0.574518519	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000116	1	1.53E-12	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	45059928	A	C	PRR5	ENST00000432186	r.?	-	-	upstream	20	0	0	22	5	22.7	17	3	17.6	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.289772727	1.289772727	1	0.911917098	0.911917098	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.67E-08	1	0.0000807	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	45746868	A	T	SMC1B	CCDS43027.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	37	5	13.5	33	3	9.1	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.767045455	0.767045455	1	0.471502591	0.471502591	1	0.656592593	0.656592593	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000119	1	0.000609557	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	48394253	T	G	-	-	-	-	-	-	17	0	0	29	4	13.8	21	4	19	29	2	6.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.784090909	0.784090909	1	0.984455959	0.984455959	1	1.415777778	1.415777778	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000134	1	0.00000349	1	0.009279585	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	49181119	G	T	FAM19A5	ENST00000336769	r.?	-	-	intronic	13	0	0	16	3	18.8	9	1	11.1	27	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.068181818	1.068181818	1	0.575129534	0.575129534	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.0000667	1	0.044110422	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	22	49302253	G	A	-	-	-	-	-	-	22	0	0	19	5	26.3	24	5	20.8	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.494318182	1.494318182	1	1.077720207	1.077720207	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	3.43E-08	1	0.000000123	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	2913134	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	46	8	17.4	49	8	16.3	28	2	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	1.094956765	1.094956765	1	0.979050464	0.979050464	1	1.284807614	1.284807614	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	8.61E-11	1	1.47E-10	1	0.008668191	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	3874184	G	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	43	14	32.6	31	13	41.9	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	2.051470721	1.273385395	1.611036791	2.516700272	1.378940244	1.825097414	0.524780575	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.18E-22	1	2.32E-22	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	4478847	G	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	41	12	29.3	35	8	22.9	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	1.843806507	1.14448442	1.611036791	1.375475805	1.375475805	1	0.579068221	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.69E-18	1	8.15E-12	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	5562343	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	37	9	24.3	39	17	43.6	48	9	18.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	1.529163758	1.529163758	1	2.61880983	1.4348877	1.825097414	3.402025795	3.402025795	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.14E-13	1	3.51E-29	1	2.75E-12	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	6089129	T	C	NLGN4X	CCDS14126.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	43	9	20.9	35	5	14.3	41	3	7.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	1.315206689	1.315206689	1	0.858921573	0.858921573	1	1.320999378	1.320999378	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	9.45E-13	1	0.000000895	1	0.001155993	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	10357855	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	52	6	11.5	31	8	25.8	19	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	0.723678322	0.723678322	1	1.549662697	1.549662697	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000000261	1	2.78E-12	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	10466673	C	A	MID1	CCDS14138.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	37	4	10.8	38	7	18.4	48	1	2.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	0.679628337	0.679628337	1	1.1051858	1.1051858	1	0.38001352	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.0000362	1	8.61E-10	1	0.213845552	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	10707396	A	T	MID1	CCDS14138.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	40	0	0	31	0	0	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	0	0	1	0	0	1	1.501958197	1.501958197	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	1	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	11057154	G	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	45	0	0	51	4	7.8	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	0	0	1	0.468502676	0.468502676	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1	1	0.000129466	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	11455614	G	A	ARHGAP6	CCDS14140.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	45	2	4.4	38	4	10.5	39	5	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	0.276885619	0.453140667	0.611036791	0.630676679	0.630676679	1	2.316272882	2.316272882	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.021467209	1	0.0000403	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	11462645	T	C	ARHGAP6	CCDS14140.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	46	7	15.2	38	8	21.1	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	0.956513956	0.956513956	1	1.267359803	1.267359803	1	1.212424087	1.212424087	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.53E-09	1	1.67E-11	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	12277168	G	T	FRMPD4	CCDS35201.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	52	4	7.7	36	1	2.8	50	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	0.484549833	0.484549833	1	0.168180448	0.168180448	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000139698	1	0.165106833	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	12345490	G	A	FRMPD4	CCDS35201.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	59	0	0	47	0	0	49	9	18.4	76	0	0	289	0	0	217	0	0	322	16	5	TRUE	TRUE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	0	0	1	0	0	1	3.329642268	3.329642268	1	0	0	1	0	0	1	0.904794095	0.904794095	1	3	1	1	1	1	1	1	1	3.35E-12	1.58E-11	YES	0_0	0_0	1_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	X	12667344	C	T	FRMPD4	CCDS35201.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	37	5	13.5	37	6	16.2	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	0.849535421	0.849535421	1	0.973044019	0.973044019	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000119	1	3.18E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	13537020	A	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	42	9	21.4	32	7	21.9	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	1.346670964	1.346670964	1	1.315411359	1.315411359	1	1.284807614	1.284807614	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	7.51E-13	1	2.36E-10	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	13725270	T	G	RAB9A	CCDS14156.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	39	7	17.9	38	3	7.9	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	1.12642104	1.12642104	1	0.474509121	0.474509121	1	0.542876457	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.04E-09	1	0.000925091	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	13767653	G	T	OFD1	CCDS14157.1	r.1262+1g>u	c.935+1G>T	p.?	ess splice	35	0	0	44	10	22.7	51	8	15.7	40	0	0	62	0	0	233	33	14.2	179	20	11.2	247	19	7.7	FALSE	TRUE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	1.428478079	1.428478079	1	0.943011797	0.943011797	1	0	NA	0	0.893585406	0.893585406	1	0.672721791	0.815324082	0.825097414	1.393382906	1.393382906	1	NA	4	1	1	2.08E-14	6.23E-37	2.05E-10	6.96E-21	1	7.54E-17	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	X	14636860	T	A	GLRA2	CCDS48085.1	r.?	-	-	intronic	17	0	0	40	6	15	41	6	14.6	40	1	2.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	0.943928246	0.943928246	1	0.876940906	0.876940906	1	0.452397047	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	5.18E-08	1	6.05E-08	1	0.181679879	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	15230126	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	48	6	12.5	49	2	4.1	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	0.786606872	0.786606872	1	0.246264227	0.298466851	0.825097414	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000016	1	0.025168485	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	15484837	C	A	BMX	CCDS14168.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	46	15	32.6	38	11	28.9	50	6	12	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	2.051470721	1.273385395	1.611036791	1.735862479	0.951106755	1.825097414	2.171505827	2.171505827	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.35E-23	1	5.19E-17	1	0.000000206	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	16236060	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	49	11	22.4	39	6	15.4	43	5	11.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	1.409599514	1.409599514	1	0.924992463	0.924992463	1	2.099122299	2.099122299	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.19E-15	1	4.43E-08	1	0.00000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	16939254	G	A	-	-	-	-	-	-	34	0	0	38	5	13.2	51	7	13.7	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	0.830656856	0.830656856	1	0.822882905	0.822882905	1	1.121944677	1.121944677	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00000137	1	7.46E-09	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	17084888	C	A	REPS2	CCDS14180.2	r.?	-	-	intronic	25	0	0	47	7	14.9	22	6	27.3	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	0.937635391	0.937635391	1	1.639759366	1.639759366	1	1.103848795	1.103848795	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.12E-09	1	1.09E-09	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	17262879	G	A	-	-	-	-	-	-	6	0	0	24	2	8.3	9	2	22.2	21	5	23.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	0.522306963	0.522306963	1	1.333430693	1.333430693	1	4.30681989	4.30681989	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.006413403	1	0.000879235	1	5.95E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	17421767	G	T	NHS	CCDS14181.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	74	15	20.3	46	7	15.2	56	5	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	1.277449559	1.277449559	1	0.912979574	0.912979574	1	1.610533488	1.610533488	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.22E-20	1	3.53E-09	1	0.00000965	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	18171888	G	C	-	-	-	-	-	-	26	0	0	49	7	14.3	43	4	9.3	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	0.899878261	0.899878261	1	0.558599344	0.558599344	1	1.682917016	1.682917016	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.58E-09	1	0.000066	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	18260428	A	G	SCML2	CCDS14185.1	r.?	-	-	intronic	41	0	0	54	17	31.5	62	14	22.6	31	4	12.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	1.982249316	1.230418404	1.611036791	1.357456471	1.357456471	1	2.334368764	2.334368764	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.02E-26	1	1.42E-19	1	0.0000177	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	18516014	C	T	CDKL5	CCDS14186.1	r.?	-	-	intronic	21	0	0	49	0	0	32	5	15.6	35	3	8.6	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	0	0	1	0.937005352	0.937005352	1	1.556245843	1.556245843	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	0.000000562	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	18556147	G	C	CDKL5	CCDS14186.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	36	4	11.1	41	6	14.6	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	0.698506902	0.698506902	1	0.876940906	0.876940906	1	0.470492929	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.0000324	1	6.05E-08	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	19079185	G	A	GPR64	CCDS43923.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	31	14	45.2	32	16	50	29	1	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	2.844370448	1.765552757	1.611036791	3.003222282	1.645513417	1.825097414	0.615259984	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.49E-24	1	8.51E-29	1	0.135292269	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	19549799	G	A	SH3KBP1	CCDS14193.1	r.?	-	-	downstream	9	0	0	22	4	18.2	20	4	20	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	1.145299605	1.145299605	1	1.201288913	1.201288913	1	0.542876457	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000425	1	0.00000284	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	19750813	C	T	SH3KBP1	CCDS14193.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	55	18	32.7	38	17	44.7	30	7	23.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	2.057763576	1.277291486	1.611036791	2.68488072	1.471088995	1.825097414	4.216340481	4.216340481	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.61E-28	1	1.99E-29	1	1.44E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	20382593	A	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	42	7	16.7	44	7	15.9	39	3	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	1.05090678	1.05090678	1	0.955024686	0.955024686	1	1.393382906	1.393382906	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.81E-09	1	2.55E-09	1	0.000998458	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	23322806	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	32	11	34.4	40	18	45	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	2.164742111	1.343695019	1.611036791	2.702900054	1.480962076	1.825097414	1.900067599	1.900067599	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.72E-18	1	3.9E-31	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	23939897	C	T	CXorf58	CCDS14209.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	27	6	22.2	29	2	6.9	23	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.611036791	2.825097414	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.388963209	0.174902586	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.611036791	0.825097414	0.577363372	1.397013804	1.397013804	1	0.414444675	0.414444675	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.23E-09	1	0.009279585	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	25103098	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	37	2	5.4	29	4	13.8	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.12884327	1.725233998	1.577363372	2	1	1	0	0	0	0.87115673	0.274766002	0.422636628	2	2	1	1	0	1	0.12884327	0.725233998	0.577363372	0.313775718	0.313775718	1	0.677108198	0.677108198	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.014826063	1	0.0000134	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	25517751	C	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	36	6	16.7	31	0	0	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.12884327	1.725233998	1.577363372	2	1	1	0	0	0	0.87115673	0.274766002	0.422636628	2	2	1	1	0	1	0.12884327	0.725233998	0.577363372	0.970380462	0.970380462	1	0	0	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	4	NA	1	1	2.68E-08	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	27018769	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	44	8	18.2	51	5	9.8	46	1	2.2	37	0	0	174	33	19	145	18	12.4	199	15	7.5	TRUE	TRUE	2.12884327	1.725233998	1.577363372	2	1	1	0	0	0	0.87115673	0.274766002	0.422636628	2	2	1	1	0	1	0.12884327	0.725233998	0.577363372	1.057540384	1.057540384	1	0.480844952	0.663020424	0.725233998	0.398109402	0.398109402	1	1.104025676	1.104025676	1	0.608416062	0.838923802	0.725233998	1.357191142	1.357191142	1	5	4	1	1	5.9E-11	2.29E-41	0.00000606	8.71E-20	0.205924651	1.74E-13	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	X	27217790	C	G	-	-	-	-	-	-	21	0	0	42	5	11.9	29	1	3.4	31	3	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.083401022	1.0921257	1.577363372	1	1	1	0	0	0	0.916598978	0.9078743	0.422636628	1	1	1	1	1	1	0.083401022	0.0921257	0.577363372	0.567061085	0.567061085	1	0.145298077	0.145298077	1	1.755300543	1.755300543	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000228	1	0.135292269	1	0.000505952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	27307975	G	T	-	-	-	-	-	-	41	0	0	37	18	48.6	42	17	40.5	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.083401022	1.0921257	1.577363372	1	1	1	0	0	0	0.916598978	0.9078743	0.422636628	1	1	1	1	1	1	0.083401022	0.0921257	0.577363372	2.315896533	2.315896533	1	1.730756504	1.730756504	1	0.760027039	0.760027039	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	6.16E-32	1	1.73E-28	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	27570355	T	C	-	-	-	-	-	-	30	0	0	30	10	33.3	37	13	35.1	40	8	20	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.083401022	1.0921257	1.577363372	1	1	1	0	0	0	0.916598978	0.9078743	0.422636628	1	1	1	1	1	1	0.083401022	0.0921257	0.577363372	1.586817995	1.586817995	1	1.49998897	1.49998897	1	3.619176378	3.619176378	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.68E-16	1	3.89E-21	1	2.61E-11	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	30354409	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	41	16	39	40	14	35	51	7	13.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.083401022	1.0921257	1.577363372	1	1	1	0	0	0	0.916598978	0.9078743	0.422636628	1	1	1	1	1	1	0.083401022	0.0921257	0.577363372	1.858435489	1.858435489	1	1.495715498	1.495715498	1	2.479135819	2.479135819	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.4E-26	1	1.25E-22	1	7.46E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	31362313	C	T	DMD	CCDS14233.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	30	6	20	40	11	27.5	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.083401022	1.0921257	1.577363372	1	1	1	0	0	0	0.916598978	0.9078743	0.422636628	1	1	1	1	1	1	0.083401022	0.0921257	0.577363372	0.953043841	0.953043841	1	1.175205034	1.175205034	1	0.434301165	0.434301165	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.37E-09	1	9.88E-17	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	31391620	A	T	DMD	CCDS14233.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	36	7	19.4	36	4	11.1	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.083401022	1.0921257	1.577363372	1	1	1	0	0	0	0.916598978	0.9078743	0.422636628	1	1	1	1	1	1	0.083401022	0.0921257	0.577363372	0.924452526	0.924452526	1	0.474355486	0.474355486	1	0.524780575	0.524780575	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.74E-10	1	0.0000324	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	31471957	G	T	DMD	CCDS14233.1	r.?	-	-	intronic	14	0	0	26	7	26.9	25	4	16	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1.083401022	1.0921257	1.577363372	1	1	1	0	0	0	0.916598978	0.9078743	0.422636628	1	1	1	1	1	1	0.083401022	0.0921257	0.577363372	1.281843966	1.281843966	1	0.683755656	0.683755656	1	0.506684693	0.506684693	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.73E-11	1	0.00000727	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	32637981	C	T	DMD	CCDS14233.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	42	1	2.4	34	5	14.7	50	4	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.210576409	2.221318393	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.789423591	0.778681607	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.210576409	0.221318393	0.577363372	0.14141747	0.14141747	1	0.794191835	0.794191835	1	1.447670551	1.447670551	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	0.189842622	1	0.000000771	1	0.000119787	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	32656837	G	T	DMD	CCDS14233.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	40	11	27.5	51	18	35.3	37	3	8.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.210576409	2.221318393	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.789423591	0.778681607	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.210576409	0.221318393	0.577363372	1.620408512	1.620408512	1	1.907140937	1.561542795	1.221318393	1.465766433	1.465766433	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	9.88E-17	1	9.1E-29	1	0.000855237	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	32822903	C	T	DMD	CCDS14233.1	r.?	-	-	intronic	12	0	0	27	12	44.4	30	12	40	32	4	12.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.210576409	2.221318393	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.789423591	0.778681607	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.210576409	0.221318393	0.577363372	2.616223198	2.161138429	1.210576409	2.161066217	1.769453592	1.221318393	2.261985236	2.261985236	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.96E-21	1	1.94E-20	1	0.0000201	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	34935663	C	T	-	-	-	-	-	-	50	0	0	50	3	6	48	7	14.6	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.210576409	2.221318393	1.577363372	1	1	1	1	1	0	0.789423591	0.778681607	0.422636628	2	2	1	1	1	1	0.210576409	0.221318393	0.577363372	0.353543675	0.353543675	1	0.788789169	0.788789169	1	0.95908174	0.95908174	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.002055544	1	4.81E-09	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	36104454	G	A	CXorf59	CCDS14238.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	36	8	22.2	33	6	18.2	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.203463928	1.577363372	1	1	1	1	1	0	1	0.796536072	0.422636628	NA	2	1	NA	1	1	NA	0.203463928	0.577363372	1.261363636	1.261363636	1	0.980035616	0.980035616	1	0.778122921	0.778122921	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.04E-11	1	1.54E-08	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	36712648	C	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	48	8	16.7	42	4	9.5	52	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2.203463928	1.577363372	1	1	1	1	1	0	1	0.796536072	0.422636628	NA	2	1	NA	1	1	NA	0.203463928	0.577363372	0.948863636	0.948863636	1	0.511557052	0.511557052	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.23E-10	1	0.0000601	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	37268731	C	A	PRRG1	CCDS14239.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	47	6	12.8	43	2	4.7	48	0	0	112	0	0	280	32	11.4	259	16	6.2	284	2	0.7	FALSE	FALSE	2	2.203463928	1.577363372	1	1	1	1	1	0	1	0.796536072	0.422636628	NA	2	1	NA	1	1	NA	0.203463928	0.577363372	0.727272727	0.727272727	1	0.253086121	1.24388693	0.203463928	0	NA	0	0.647727273	0.647727273	1	0.333858287	1.64087212	0.203463928	0.126671173	NA	0	NA	NA	1	1	0.000000141	8.57E-33	0.019709573	5.94E-13	1	0.415413225	YES	1_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	X	37619665	G	T	ENSG00000250349	ENST00000465127	r.?	-	-	intronic	25	0	0	23	9	39.1	28	14	50	33	5	15.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.203463928	1.577363372	1	1	1	1	1	0	1	0.796536072	0.422636628	NA	2	1	NA	1	1	NA	0.203463928	0.577363372	2.221590909	2.221590909	1	2.692405539	2.237213328	1.203463928	2.750574047	2.750574047	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.5E-15	1	2.29E-25	1	0.00000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	38220499	A	T	OTC	CCDS14247.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	33	11	33.3	38	10	26.3	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.203463928	1.577363372	1	1	1	1	1	0	1	0.796536072	0.422636628	NA	2	1	NA	1	1	NA	0.203463928	0.577363372	1.892045455	1.892045455	1	1.416205314	1.416205314	1	1.972451126	1.972451126	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	8.54E-18	1	4.06E-15	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	38417204	C	T	TSPAN7	CCDS14248.1	r.?	-	-	upstream	37	0	0	50	16	32	43	7	16.3	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2.203463928	1.577363372	1	1	1	1	1	0	1	0.796536072	0.422636628	NA	2	1	NA	1	1	NA	0.203463928	0.577363372	1.818181818	1.818181818	1	0.877724206	0.877724206	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	6.4E-25	1	2.15E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	38599901	T	G	-	-	-	-	-	-	32	0	0	47	7	14.9	52	10	19.2	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2.203463928	1.577363372	1	1	1	1	1	0	1	0.796536072	0.422636628	NA	2	1	NA	1	1	NA	0.203463928	0.577363372	0.846590909	0.846590909	1	1.033883727	1.033883727	1	0.361917638	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.12E-09	1	1.28E-13	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	38838464	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	56	1	1.8	59	7	11.9	44	4	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.203463928	1.577363372	1	1	1	1	1	0	1	0.796536072	0.422636628	NA	2	1	NA	1	1	NA	0.203463928	0.577363372	0.102272727	0.102272727	1	0.640792518	0.640792518	1	1.646725252	1.646725252	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	0.244746891	1	2.12E-08	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	38912701	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	46	7	15.2	42	6	14.3	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2	2.203463928	1.577363372	1	1	1	1	1	0	1	0.796536072	0.422636628	NA	2	1	NA	1	1	NA	0.203463928	0.577363372	0.863636364	0.863636364	1	0.770027984	0.770027984	1	0.524780575	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	3.53E-09	1	7.02E-08	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	39115202	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	59	7	11.9	46	6	13	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2.203463928	1.577363372	1	1	1	1	1	0	1	0.796536072	0.422636628	NA	2	1	NA	1	1	NA	0.203463928	0.577363372	0.676136364	0.676136364	1	0.70002544	0.70002544	1	0.796218803	0.796218803	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.12E-08	1	0.000000123	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	40949758	G	T	USP9X	CCDS43930.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	38	7	18.4	42	7	16.7	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1.172765447	1.577363372	1	1	1	0	0	0	1	0.827234553	0.422636628	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.172765447	0.577363372	0.861454545	0.861454545	1	0.727136804	0.727136804	1	1.230519969	1.230519969	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.61E-10	1	1.81E-09	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	41682212	A	G	CASK	CCDS48095.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	40	10	25	39	7	17.9	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	1	1.172765447	1.577363372	1	1	1	0	0	0	1	0.827234553	0.422636628	NA	2	1	NA	0	1	NA	0.172765447	0.577363372	1.170454545	1.170454545	1	0.779386155	0.779386155	1	0.977177622	0.977177622	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	7.22E-15	1	1.04E-09	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	42214407	A	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	26	7	26.9	43	16	37.2	26	4	15.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.298436798	3	1.577363372	1	2	1	1	1	0	0.701563202	1	0.422636628	2	NA	1	1	NA	1	0.298436798	NA	0.577363372	1.60868859	1.60868859	1	2.29946114	1.14973057	2	2.786765811	2.786765811	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.73E-11	1	3.56E-26	1	0.00000856	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	45331348	C	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	39	5	12.8	35	7	20	31	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.298436798	3	1.577363372	1	2	1	1	1	0	0.701563202	1	0.422636628	2	NA	1	1	NA	1	0.298436798	NA	0.577363372	0.765472637	0.765472637	1	1.23626943	1.23626943	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000156	1	4.65E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	46201859	G	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	37	4	10.8	26	6	23.1	26	3	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.298436798	3	1.577363372	1	2	1	1	1	0	0.701563202	1	0.422636628	2	NA	1	1	NA	1	0.298436798	NA	0.577363372	0.645867538	0.645867538	1	1.427891192	1.427891192	1	2.081026417	2.081026417	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.0000362	1	3.3E-09	1	0.000298167	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	46813911	T	C	PHF16	CCDS14271.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	40	6	15	39	6	15.4	30	1	3.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.298436798	3	1.577363372	1	2	1	1	1	0	0.701563202	1	0.422636628	2	NA	1	1	NA	1	0.298436798	NA	0.577363372	0.897038247	0.897038247	1	0.951927461	0.951927461	1	0.597164102	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	5.18E-08	1	4.43E-08	1	0.139615808	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	47067039	T	A	UBA1	CCDS14275.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	29	12	41.4	32	12	37.5	37	5	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.298436798	3	1.577363372	1	2	1	1	1	0	0.701563202	1	0.422636628	2	NA	1	1	NA	1	0.298436798	NA	0.577363372	2.475825562	1.906774026	1.298436798	2.318005181	1.159002591	2	2.442944055	2.442944055	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.17E-20	1	5.03E-20	1	0.00000119	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	47608072	C	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	32	12	37.5	32	9	28.1	39	4	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.298436798	3	1.577363372	1	2	1	1	1	0	0.701563202	1	0.422636628	2	NA	1	1	NA	1	0.298436798	NA	0.577363372	2.242595618	1.727150386	1.298436798	1.736958549	1.736958549	1	1.863875835	1.863875835	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.03E-20	1	4.94E-14	1	0.0000447	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	49131927	C	G	PPP1R3F	CCDS35254.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	40	7	17.5	25	4	16	27	0	0	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.298436798	3	1.577363372	1	2	1	1	1	0	0.701563202	1	0.422636628	2	NA	1	1	NA	1	0.298436798	NA	0.577363372	1.046544622	1.046544622	1	0.989015544	0.989015544	1	0	NA	0	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.26E-09	1	0.00000727	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	49354485	C	T	GAGE12H	CCDS43948.1	r.?	-	-	downstream	22	0	0	21	1	4.8	8	0	0	65	6	9.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	4	0	0	TRUE	FALSE	2.298436798	3	1.577363372	1	2	1	1	1	0	0.701563202	1	0.422636628	2	NA	1	1	NA	1	0.298436798	NA	0.577363372	0.287052239	0.287052239	1	0	0	1	1.664821134	1.664821134	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	NA	0	5	NA	1	1	0.099912572	1	1	1	0.000001	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	49687168	G	C	CLCN5	CCDS14328.1	r.?	-	-	upstream	14	0	0	14	3	21.4	4	0	0	39	0	0	145	0	0	87	7	8	66	2	3	58	0	0	FALSE	FALSE	2.298436798	3	1.577363372	1	2	1	1	1	0	0.701563202	1	0.422636628	2	NA	1	1	NA	1	0.298436798	NA	0.577363372	1.279774566	1.279774566	1	0	0	1	0	NA	0	0.478420398	0.478420398	1	0.185440415	0.185440415	1	0	NA	0	NA	NA	1	1	0.0000437	0.000000322	1	0.043431387	1	1	YES	1_1	0_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	X	49824702	C	T	CLCN5	CCDS14328.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	24	9	37.5	20	5	25	43	4	9.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.298436798	3	1.577363372	1	2	1	1	1	0	0.701563202	1	0.422636628	2	NA	1	1	NA	1	0.298436798	NA	0.577363372	2.242595618	1.727150386	1.298436798	1.545336788	1.545336788	1	1.682917016	1.682917016	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.39E-15	1	4.55E-08	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	50072012	G	A	CCNB3	CCDS14331.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	26	5	19.2	29	7	24.1	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.298436798	3	1.577363372	1	2	1	1	1	0	0.701563202	1	0.422636628	2	NA	1	1	NA	1	0.298436798	NA	0.577363372	1.148208956	1.148208956	1	1.489704663	1.489704663	1	0.470492929	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000000188	1	1.11E-10	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	50320368	C	T	-	-	-	-	-	-	45	0	0	60	10	16.7	58	6	10.3	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.298436798	3	1.577363372	1	2	1	1	1	0	0.701563202	1	0.422636628	2	NA	1	1	NA	1	0.298436798	NA	0.577363372	0.998702582	0.998702582	1	0.636678756	0.636678756	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	5.86E-13	1	0.000000506	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	51684009	G	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	58	15	25.9	53	3	5.7	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.298436798	3	1.577363372	1	2	1	1	1	0	0.701563202	1	0.422636628	2	NA	1	1	NA	1	0.298436798	NA	0.577363372	1.54888604	1.1928852	1.298436798	0.352336788	0.352336788	1	1.067657032	1.067657032	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	7.42E-22	1	0.002429596	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	52047524	G	A	-	-	-	-	-	-	39	0	0	39	6	15.4	46	4	8.7	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.298436798	3	1.577363372	1	2	1	1	1	0	0.701563202	1	0.422636628	2	NA	1	1	NA	1	0.298436798	NA	0.577363372	0.920959267	0.920959267	1	0.537777202	0.537777202	1	1.357191142	1.357191142	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.43E-08	1	0.0000862	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	53552748	G	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	22	4	18.2	31	8	25.8	29	1	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.298436798	3	1.577363372	1	2	1	1	1	0	0.701563202	1	0.422636628	2	NA	1	1	NA	1	0.298436798	NA	0.577363372	1.088406406	1.088406406	1	1.594787565	1.594787565	1	0.615259984	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000425	1	2.78E-12	1	0.135292269	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	53636647	A	G	HUWE1	CCDS35301.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	30	10	33.3	39	15	38.5	33	4	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.298436798	3	1.577363372	1	2	1	1	1	0	0.701563202	1	0.422636628	2	NA	1	1	NA	1	0.298436798	NA	0.577363372	1.991424908	1.533709543	1.298436798	2.379818653	1.189909326	2	2.189601709	2.189601709	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.68E-16	1	6.85E-25	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	53864578	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	46	10	21.7	43	6	14	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.298436798	3	1.577363372	1	2	1	1	1	0	0.701563202	1	0.422636628	2	NA	1	1	NA	1	0.298436798	NA	0.577363372	1.297715331	1.297715331	1	0.865388601	0.865388601	1	1.067657032	1.067657032	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.38E-14	1	8.13E-08	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	54906685	A	G	-	-	-	-	-	-	26	0	0	52	10	19.2	44	4	9.1	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	2.298436798	3	1.577363372	1	2	1	1	1	0	0.701563202	1	0.422636628	2	NA	1	1	NA	1	0.298436798	NA	0.577363372	1.148208956	1.148208956	1	0.562502591	0.562502591	1	0.506684693	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.28E-13	1	0.0000723	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	55232810	G	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	25	12	48	50	18	36	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2.298436798	3	1.577363372	1	2	1	1	1	0	0.701563202	1	0.422636628	2	NA	1	1	NA	1	0.298436798	NA	0.577363372	2.870522391	2.210752494	1.298436798	2.225284974	1.112642487	2	2.207697591	2.207697591	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.2E-21	1	5.92E-29	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	58009273	T	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	38	7	18.4	46	5	10.9	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.317107266	1.317107266	1	0.623500773	0.623500773	1	0.524780575	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	8.61E-10	1	0.00000361	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	62081774	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	41	9	22	55	17	30.9	29	3	10.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.574802165	1.574802165	1	1.767538888	1.14861516	1.538843426	1.863875835	1.863875835	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.92E-13	1	4.35E-26	1	0.000414371	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	63855158	C	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	57	9	15.8	56	11	19.6	33	4	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.130994282	1.130994282	1	1.121157353	1.121157353	1	2.189601709	2.189601709	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.42E-11	1	5.91E-15	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	64184817	A	T	ZC4H2	CCDS14380.1	r.?	-	-	intronic	35	0	0	59	7	11.9	51	7	13.7	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.851824808	0.851824808	1	0.783666109	0.783666109	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	2.12E-08	1	7.46E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	64551873	A	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	46	5	10.9	49	11	22.4	50	3	6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.780242891	0.780242891	1	1.281322689	1.281322689	1	1.085752913	1.085752913	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00000361	1	1.19E-15	1	0.002055544	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	64597836	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	28	7	25	20	7	35	22	1	4.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.789547915	1.789547915	1	2.002066702	1.301020408	1.538843426	0.814314685	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	8.44E-11	1	5.72E-12	1	0.104413009	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	64611021	T	C	-	-	-	-	-	-	35	0	0	44	9	20.5	45	8	17.8	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.46742929	1.46742929	1	1.018193923	1.018193923	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.18E-12	1	7.14E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	64776366	G	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	44	10	22.7	38	7	18.4	33	1	3	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.624909507	1.624909507	1	1.052515066	1.052515066	1	0.542876457	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	2.08E-14	1	8.61E-10	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	64870721	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	41	7	17.1	30	4	13.3	27	1	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.224050774	1.224050774	1	0.760785347	0.760785347	1	0.66954763	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.51E-09	1	0.0000154	1	0.126579904	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	64990376	G	C	-	-	-	-	-	-	23	0	0	44	11	25	58	11	19	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.789547915	0.894773958	2	1.086836209	1.086836209	1	1.031465268	1.031465268	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.22E-16	1	8.96E-15	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	65009351	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	53	9	17	40	9	22.5	40	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.216892582	1.216892582	1	1.28704288	1.28704288	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	7.1E-12	1	4.64E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	65392294	G	T	HEPH	CCDS14384.2	r.606g>u	c.274G>T	p.E92*	nonsense	28	0	0	40	7	17.5	37	6	16.2	27	1	3.7	504	0	0	335	48	14.3	292	68	23.3	286	11	3.8	FALSE	TRUE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.252683541	1.252683541	1	0.926670873	0.926670873	1	0.66954763	NA	0	1.023621407	1.023621407	1	1.332804404	0.866107872	1.538843426	0.687643512	0.687643512	1	NA	5	1	1	1.26E-09	3.24E-53	3.18E-08	4.14E-90	0.126579904	0.0000003	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	X	65734483	C	G	-	-	-	-	-	-	25	0	0	48	9	18.8	32	3	9.4	43	4	9.3	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.345740032	1.345740032	1	0.537697914	0.537697914	1	1.682917016	1.682917016	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.75E-12	1	0.000556213	1	0.000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	65977659	G	T	-	-	-	-	-	-	19	0	0	41	7	17.1	33	7	21.2	24	1	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.224050774	1.224050774	1	1.212680402	1.212680402	1	0.760027039	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.51E-09	1	2.98E-10	1	0.113346489	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	66078126	A	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	33	4	12.1	25	4	16	42	0	0	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.866141191	0.866141191	1	0.915230492	0.915230492	1	0	NA	0	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.0000228	1	0.00000727	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	66668050	G	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	37	6	16.2	47	4	8.5	36	1	2.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.159627049	1.159627049	1	0.486216199	0.486216199	1	0.506684693	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	3.18E-08	1	0.0000939	1	0.165106833	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	67173538	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	53	13	24.5	48	9	18.8	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.753756957	0.876878478	2	1.075395828	1.075395828	1	0.524780575	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	8.53E-19	1	2.75E-12	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	67255932	G	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	46	7	15.2	53	7	13.2	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.088045132	1.088045132	1	0.755065156	0.755065156	1	0.850506449	0.850506449	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.53E-09	1	9.85E-09	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	67266797	T	A	OPHN1	CCDS14388.1	r.3268a>u	c.?	p.?	3'UTR variant	26	0	0	50	6	12	45	13	28.9	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.858982999	0.858982999	1	1.653135076	1.074271137	1.538843426	0.416205283	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000000206	1	7.68E-20	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	67375421	C	T	OPHN1	CCDS14388.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	49	3	6.1	58	13	22.4	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.436649691	0.436649691	1	1.281322689	1.281322689	1	1.230519969	1.230519969	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.001939399	1	3.12E-18	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	67635251	T	A	OPHN1	CCDS14388.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	34	4	11.8	63	2	3.2	31	0	0	104	1	1	235	30	12.8	248	6	2.4	191	0	0	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.844666616	0.844666616	1	0.183046098	0.339701831	0.538843426	0	NA	0	0.916248533	0.916248533	1	0.137284574	0.137284574	1	0	NA	0	NA	NA	1	0.406254409	0.0000257	2.55E-32	0.03993132	0.001700411	1	1	YES	1_1	1_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	X	68665826	G	A	-	-	-	-	-	-	42	0	0	46	9	19.6	48	12	25	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.403005565	1.403005565	1	1.430047644	1.430047644	1	1.121944677	1.121944677	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.82E-12	1	1.44E-17	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	69307416	A	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	41	9	22	36	11	30.6	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.574802165	1.574802165	1	1.750378316	1.137463557	1.538843426	1.067657032	1.067657032	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.92E-13	1	2.62E-17	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	71595512	C	G	HDAC8	CCDS14420.1	r.?	-	-	intronic	36	0	0	45	7	15.6	38	5	13.2	41	4	9.8	0	0	NA	4	2	50	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.116677899	1.116677899	1	0.755065156	0.755065156	1	1.773396425	1.773396425	1	3.57909583	3.57909583	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000000003	0.000149002	0.00000137	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	71643465	C	T	HDAC8	CCDS14420.1	r.?	-	-	intronic	42	0	0	51	12	23.5	54	5	9.3	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.68217504	1.104059963	1.523626521	0.531977724	0.531977724	1	0.470492929	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	3.24E-17	1	0.00000806	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	73671495	C	A	SLC16A2	CCDS14426.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	35	8	22.9	41	8	19.5	38	2	5.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.63922589	1.63922589	1	1.115437162	1.115437162	1	0.95908174	0.95908174	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	8.15E-12	1	3.22E-11	1	0.015598339	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	73962071	G	C	KIAA2022	CCDS35337.1	r.2973c>g	c.2321C>G	p.S774C	missense	35	0	0	48	8	16.7	54	6	11.1	36	1	2.8	94	0	0	252	40	15.9	226	34	15	234	11	4.7	FALSE	TRUE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.195418007	1.195418007	1	0.634941154	0.634941154	1	0.506684693	NA	0	1.138152474	1.138152474	1	0.858028586	0.858028586	1	0.850506449	0.850506449	1	NA	5	1	1	1.23E-10	1.71E-46	0.000000329	6.21E-39	0.165106833	0.00000004	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	X	74396603	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	60	7	11.7	46	5	10.9	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.837508424	0.837508424	1	0.623500773	0.623500773	1	1.031465268	1.031465268	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.39E-08	1	0.00000361	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	75028467	T	G	-	-	-	-	-	-	33	0	0	38	8	21.1	48	6	12.5	37	1	2.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.51037844	1.51037844	1	0.715023822	0.715023822	1	0.488588811	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.67E-11	1	0.00000016	1	0.169281299	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	75982227	G	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	41	8	19.5	40	5	12.5	29	1	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.395847374	1.395847374	1	0.715023822	0.715023822	1	0.615259984	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	3.22E-11	1	0.00000178	1	0.135292269	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	76342133	G	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	39	7	17.9	28	5	17.9	24	1	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.281316307	1.281316307	1	1.023914113	1.023914113	1	0.760027039	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.04E-09	1	0.000000279	1	0.113346489	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	76508353	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	43	8	18.6	34	5	14.7	27	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.331423649	1.331423649	1	0.840868015	0.840868015	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.85E-11	1	0.000000771	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	76545229	G	T	-	-	-	-	-	-	20	0	0	39	16	41	48	14	29.2	25	2	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	2.934858581	1.46742929	2	1.670295648	1.08542274	1.538843426	1.447670551	1.447670551	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.16E-27	1	2.51E-21	1	0.006948068	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	76933436	C	T	ATRX	CCDS14434.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	29	6	20.7	25	8	32	26	2	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.481745674	1.481745674	1	1.830460984	1.189504373	1.538843426	1.393382906	1.393382906	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	6.72E-09	1	3.92E-13	1	0.007502227	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	77539979	C	A	CYSLTR1	CCDS14439.1	r.?	-	-	intronic	7	0	0	27	4	14.8	36	7	19.4	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.059412366	1.059412366	1	1.109716972	1.109716972	1	1.013369386	1.013369386	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00001	1	5.74E-10	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	77558488	T	C	CYSLTR1	CCDS14439.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	43	10	23.3	36	11	30.6	39	5	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.667858657	1.667858657	1	1.750378316	1.137463557	1.538843426	2.316272882	2.316272882	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.61E-14	1	2.62E-17	1	0.00000156	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	77592577	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	44	6	13.6	36	1	2.8	37	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.973514066	0.973514066	1	0.160165336	0.160165336	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	9.37E-08	1	0.165106833	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	77691487	G	T	-	-	-	-	-	-	27	0	0	52	15	28.8	45	5	11.1	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	2.061559198	1.030779599	2	0.634941154	0.634941154	1	1.013369386	1.013369386	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.15E-22	1	0.00000323	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	78356007	G	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	44	11	25	42	4	9.5	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.789547915	0.894773958	2	0.543418105	0.543418105	1	0.524780575	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	3.22E-16	1	0.0000601	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	78694007	T	C	-	-	-	-	-	-	27	0	0	43	9	20.9	44	8	18.2	48	3	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.496062057	1.496062057	1	1.041074685	1.041074685	1	1.121944677	1.121944677	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	9.45E-13	1	5.9E-11	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	78943157	A	C	-	-	-	-	-	-	30	0	0	42	2	4.8	47	6	12.8	49	2	4.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.3435932	0.3435932	1	0.732184394	0.732184394	1	0.741931158	0.741931158	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.018854633	1	0.000000141	1	0.025168485	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	79619666	A	T	-	-	-	-	-	-	36	0	0	61	13	21.3	38	2	5.3	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.524694824	1.524694824	1	0.303170101	0.562631158	0.538843426	0.434301165	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	6.41E-18	1	0.015598339	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	80046996	A	G	BRWD3	CCDS14447.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	45	10	22.2	39	7	17.9	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.589118549	1.589118549	1	1.023914113	1.023914113	1	1.538149961	1.538149961	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.66E-14	1	1.04E-09	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	80151777	C	A	-	-	-	-	-	-	25	0	0	44	4	9.1	40	4	10	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.651395441	0.651395441	1	0.572019058	0.572019058	1	0.977177622	0.977177622	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.0000723	1	0.0000495	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	80643613	C	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	51	7	13.7	49	6	12.2	52	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.980672257	0.980672257	1	0.69786325	0.69786325	1	0.687643512	0.687643512	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	7.46E-09	1	0.000000182	1	0.028101652	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	80687795	A	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	57	16	28.1	49	10	20.4	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	2.011451857	1.005725928	2	1.166918877	1.166918877	1	1.610533488	1.610533488	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	7.28E-24	1	6.72E-14	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	80874049	G	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	54	15	27.8	47	19	40.4	47	6	12.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.989977282	0.994988641	2	2.310956993	1.501749271	1.538843426	2.316272882	2.316272882	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.2E-22	1	1.16E-31	1	0.000000141	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	81123581	C	T	-	-	-	-	-	-	24	0	0	36	13	36.1	38	13	34.2	41	7	17.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	2.584107189	1.292053595	2	1.956305177	1.271282799	1.538843426	3.094395803	3.094395803	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.53E-21	1	5.88E-21	1	1.51E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	81358529	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	45	8	17.8	61	18	29.5	53	1	1.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.274158116	1.274158116	1	1.68745622	1.096574344	1.538843426	0.343821756	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	7.14E-11	1	4.08E-27	1	0.233303855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	81766401	C	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	42	8	19	52	8	15.4	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.360056415	1.360056415	1	0.880909349	0.880909349	1	0.579068221	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	3.96E-11	1	2.42E-10	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	81939702	C	T	-	-	-	-	-	-	18	0	0	27	7	25.9	29	4	13.8	30	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.85397164	1.85397164	1	0.789386299	0.789386299	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	6.36E-11	1	0.0000134	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	82009091	C	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	44	9	20.5	38	8	21.1	57	4	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.46742929	1.46742929	1	1.206960212	1.206960212	1	1.266711732	1.266711732	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.18E-12	1	1.67E-11	1	0.000199821	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	82117928	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	55	6	10.9	36	5	13.9	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.780242891	0.780242891	1	0.79510649	0.79510649	1	0.886698213	0.886698213	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000000367	1	0.00000104	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	82370871	G	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	52	6	11.5	46	13	28.3	35	2	5.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.823192041	0.823192041	1	1.618813933	1.05196793	1.538843426	1.031465268	1.031465268	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000000261	1	1.07E-19	1	0.013332991	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	82381996	T	G	-	-	-	-	-	-	27	0	0	44	6	13.6	42	6	14.3	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.973514066	0.973514066	1	0.817987252	0.817987252	1	0.416205283	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	9.37E-08	1	7.02E-08	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	82517820	G	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	47	17	36.2	39	4	10.3	48	4	8.3	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	2.591265381	1.295632691	2	0.589179629	0.589179629	1	1.501958197	1.501958197	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.81E-27	1	0.0000447	1	0.000102016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	82843200	C	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	31	6	19.4	34	5	14.7	33	2	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.388689182	1.388689182	1	0.840868015	0.840868015	1	1.103848795	1.103848795	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.03E-08	1	0.000000771	1	0.011909843	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	83063504	T	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	40	10	25	35	6	17.1	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.789547915	0.894773958	2	0.978152588	0.978152588	1	1.646725252	1.646725252	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	7.22E-15	1	2.24E-08	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	83969023	A	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	50	10	20	29	5	17.2	48	3	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.431638332	1.431638332	1	0.983872779	0.983872779	1	1.121944677	1.121944677	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	8.36E-14	1	0.000000336	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	84115007	G	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	46	7	15.2	43	7	16.3	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.088045132	1.088045132	1	0.932391064	0.932391064	1	0.977177622	0.977177622	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.53E-09	1	2.15E-09	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	84527036	T	A	ZNF711	CCDS35344.1	r.2794u>a	c.?	p.?	3'UTR variant	27	0	0	50	12	24	47	7	14.9	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.717965999	1.1275506	1.523626521	0.852308396	0.852308396	1	0.416205283	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	2.49E-17	1	4.12E-09	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	85192134	G	T	CHM	CCDS14454.1	r.?	-	-	intronic	16	0	0	29	8	27.6	22	9	40.9	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.975660898	0.987830449	2	2.339557946	1.520335277	1.538843426	1.501958197	1.501958197	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.53E-12	1	9.16E-16	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	85205511	C	T	CHM	CCDS14454.1	r.?	-	-	intronic	37	0	0	45	8	17.8	39	5	12.8	50	2	4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.274158116	1.274158116	1	0.732184394	0.732184394	1	0.723835276	0.723835276	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	7.14E-11	1	0.00000156	1	0.026131524	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	85425069	C	T	DACH2	CCDS48140.1	r.?	-	-	intronic	39	0	0	36	12	33.3	46	9	19.6	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	2.383677823	1.191838911	2	1.121157353	1.121157353	1	0.560972339	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	2.73E-19	1	1.82E-12	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	86079184	G	A	DACH2	CCDS48140.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	65	13	20	31	8	25.8	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.431638332	1.431638332	1	1.475809169	1.475809169	1	1.284807614	1.284807614	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.57E-17	1	2.78E-12	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	86278163	A	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	48	12	25	43	9	20.9	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.789547915	0.894773958	2	1.19551983	1.19551983	1	0.886698213	0.886698213	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.44E-17	1	9.45E-13	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	86306143	C	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	36	3	8.3	42	6	14.3	55	3	5.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.594129908	0.594129908	1	0.817987252	0.817987252	1	0.995273504	0.995273504	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000788827	1	7.02E-08	1	0.002700822	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	86420504	C	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	50	15	30	44	7	15.9	49	4	8.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	2.147457498	1.073728749	2	0.909510302	0.909510302	1	1.483862315	1.483862315	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.83E-23	1	2.55E-09	1	0.000110643	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	86467925	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	49	9	18.4	53	7	13.2	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.317107266	1.317107266	1	0.755065156	0.755065156	1	1.212424087	1.212424087	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.35E-12	1	9.85E-09	1	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	86481987	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	52	3	5.8	38	7	18.4	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.415175116	0.415175116	1	1.052515066	1.052515066	1	0.868602331	0.868602331	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.002300591	1	8.61E-10	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	86891428	T	A	KLHL4	CCDS14457.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	37	6	16.2	41	8	19.5	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.159627049	1.159627049	1	1.115437162	1.115437162	1	0.416205283	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	3.18E-08	1	3.22E-11	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	87165937	G	T	-	-	-	-	-	-	20	0	0	43	0	0	36	6	16.7	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0	0	1	0.955271826	0.955271826	1	0.760027039	0.760027039	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	2.68E-08	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	87243692	G	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	34	12	35.3	41	17	41.5	27	1	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	2.526841656	1.263420828	2	2.373879089	1.542638484	1.538843426	0.66954763	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.21E-19	1	1.03E-28	1	0.126579904	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	87512117	C	G	-	-	-	-	-	-	27	0	0	60	12	20	44	6	13.6	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.431638332	1.431638332	1	0.777945918	0.777945918	1	1.266711732	1.266711732	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.74E-16	1	9.37E-08	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	87586595	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	61	6	9.8	48	6	12.5	33	4	12.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.701502783	0.701502783	1	0.715023822	0.715023822	1	2.189601709	2.189601709	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000000685	1	0.00000016	1	0.0000228	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	87785995	G	A	-	-	-	-	-	-	24	0	0	35	6	17.1	40	6	15	35	4	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	2	2	100	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.224050774	1.224050774	1	0.858028586	0.858028586	1	2.062930536	2.062930536	1	NA	NA	1	NA	NA	1	18.09588189	18.09588189	1	5	NA	1	1	2.24E-08	1	5.18E-08	1	0.0000289	0.000025	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	88070349	G	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	48	7	14.6	33	5	15.2	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.045095982	1.045095982	1	0.869468968	0.869468968	1	0.434301165	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.81E-09	1	0.00000066	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	88157028	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	47	6	12.8	43	11	25.6	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.916248533	0.916248533	1	1.464368787	1.464368787	1	1.013369386	1.013369386	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000000141	1	2.42E-16	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	88170067	C	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	41	8	19.5	53	5	9.4	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.395847374	1.395847374	1	0.537697914	0.537697914	1	0.560972339	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	3.22E-11	1	0.00000734	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	88219295	T	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	53	12	22.6	44	1	2.3	43	6	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.617751315	1.617751315	1	0.131564383	0.131564383	1	2.533423465	2.533423465	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.39E-17	1	0.197923942	1	8.13E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	89051062	G	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	44	1	2.3	49	6	12.2	50	5	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.164638408	0.164638408	1	0.69786325	0.69786325	1	1.809588189	1.809588189	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	0.197923942	1	0.000000182	1	0.00000549	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	90073272	T	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	40	9	22.5	44	17	38.6	45	3	6.7	0	0	NA	0	0	NA	2	2	100	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.610593124	1.610593124	1	2.207993562	1.43483965	1.538843426	1.212424087	1.212424087	1	NA	NA	1	5.720190576	3.717201166	1.538843426	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.64E-13	1	4.61E-28	0.000025	0.001516071	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	90080935	C	A	-	-	-	-	-	-	36	0	0	59	9	15.3	49	5	10.2	36	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.095203324	1.095203324	1	0.583459439	0.583459439	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.96E-11	1	0.00000496	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	90600446	T	C	-	-	-	-	-	-	33	0	0	46	17	37	37	10	27	33	5	15.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	2.648530914	1.324265457	2	1.544451456	1.544451456	1	2.750574047	2.750574047	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.16E-27	1	3.01E-15	1	0.00000066	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	90640411	T	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	52	8	15.4	45	8	17.8	51	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.102361516	1.102361516	1	1.018193923	1.018193923	1	0.361917638	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	2.42E-10	1	7.14E-11	1	0.225579006	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	91085624	C	A	PCDH11X	CCDS14461.1	r.?	-	-	upstream	35	0	0	44	11	25	53	10	18.9	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.789547915	0.894773958	2	1.081116019	1.081116019	1	1.538149961	1.538149961	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.22E-16	1	1.57E-13	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	91269987	A	T	PCDH11X	CCDS14461.1	r.?	-	-	intronic	34	0	0	47	7	14.9	43	4	9.3	45	0	0	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.066570557	1.066570557	1	0.531977724	0.531977724	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.12E-09	1	0.000066	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	91360418	G	A	PCDH11X	CCDS14461.1	r.?	-	-	intronic	19	0	0	31	3	9.7	29	6	20.7	35	3	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.694344591	0.694344591	1	1.184079449	1.184079449	1	1.556245843	1.556245843	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000505952	1	6.72E-09	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	91448660	C	T	PCDH11X	CCDS14461.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	43	3	7	63	11	17.5	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.501073416	0.501073416	1	1.001033351	1.001033351	1	0.434301165	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.001328364	1	2.37E-14	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	92409700	C	G	-	-	-	-	-	-	26	0	0	43	10	23.3	34	10	29.4	42	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.667858657	1.667858657	1	1.681736029	1.681736029	1	0.434301165	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.61E-14	1	1.15E-15	1	0.189842622	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	92409701	C	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	44	12	27.3	37	16	43.2	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.954186323	0.977093162	2	2.471122329	1.605830904	1.538843426	0.868602331	0.868602331	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.44E-18	1	1.78E-27	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	92907472	C	T	-	-	-	-	-	-	18	0	0	53	8	15.1	44	5	11.4	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.080886941	1.080886941	1	0.652101726	0.652101726	1	0.579068221	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	2.83E-10	1	0.00000288	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	93514549	C	G	-	-	-	-	-	-	46	0	0	44	5	11.4	41	5	12.2	52	2	3.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.816033849	0.816033849	1	0.69786325	0.69786325	1	0.687643512	0.687643512	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00000288	1	0.00000202	1	0.028101652	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	93794205	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	62	6	9.7	43	7	16.3	46	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.694344591	0.694344591	1	0.932391064	0.932391064	1	0.778122921	0.778122921	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000000756	1	2.15E-09	1	0.022369545	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	93908753	C	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	43	5	11.6	49	5	10.2	35	4	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.830350233	0.830350233	1	0.583459439	0.583459439	1	2.062930536	2.062930536	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00000257	1	0.00000496	1	0.0000289	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	93983370	C	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	49	11	22.4	48	6	12.5	48	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.603434932	1.603434932	1	0.715023822	0.715023822	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.19E-15	1	0.00000016	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	94084868	A	G	-	-	-	-	-	-	40	0	0	41	9	22	39	7	17.9	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.574802165	1.574802165	1	1.023914113	1.023914113	1	0.886698213	0.886698213	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.92E-13	1	1.04E-09	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	94164640	C	G	-	-	-	-	-	-	24	0	0	35	5	14.3	28	5	17.9	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.023621407	1.023621407	1	1.023914113	1.023914113	1	0.470492929	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000000895	1	0.000000279	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	94598671	C	T	-	-	-	-	-	-	43	0	0	50	9	18	49	9	18.4	39	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.288474499	1.288474499	1	1.052515066	1.052515066	1	0.470492929	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.07E-12	1	3.35E-12	1	0.177567718	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	95326811	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	44	4	9.1	62	0	0	53	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.651395441	0.651395441	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.0000723	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	95481167	C	T	-	-	-	-	-	-	25	0	0	49	7	14.3	41	0	0	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.023621407	1.023621407	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	5.58E-09	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	95904637	G	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	51	10	19.6	32	4	12.5	33	1	3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.403005565	1.403005565	1	0.715023822	0.715023822	1	0.542876457	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.04E-13	1	0.0000201	1	0.15245715	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	96181087	A	T	DIAPH2	CCDS14467.1	r.?	-	-	intronic	33	0	0	41	5	12.2	36	9	25	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.873299383	0.873299383	1	1.430047644	1.430047644	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000202	1	1.63E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	96237915	G	T	DIAPH2	CCDS14467.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	38	13	34.2	47	13	27.7	47	7	14.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	2.448101548	1.224050774	2	1.58449279	1.029664723	1.538843426	2.696286402	2.696286402	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.88E-21	1	1.47E-19	1	4.12E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	96492093	T	A	DIAPH2	CCDS14467.1	r.?	-	-	intronic	24	0	0	42	12	28.6	33	5	15.2	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	2.047242815	1.023621407	2	0.869468968	0.869468968	1	0.579068221	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	2.35E-18	1	0.00000066	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	97110950	C	T	-	-	-	-	-	-	20	0	0	46	12	26.1	35	4	11.4	44	4	9.1	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.868288023	0.934144012	2	0.652101726	0.652101726	1	1.646725252	1.646725252	1	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	8.12E-18	1	0.0000289	1	0.0000723	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	97578188	A	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	53	16	30.2	51	13	25.5	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	2.161773881	1.080886941	2	1.458648597	1.458648597	1	0.416205283	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.9E-24	1	4.87E-19	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	97625976	G	A	-	-	-	-	-	-	21	0	0	41	5	12.2	44	10	22.7	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.873299383	0.873299383	1	1.298483261	1.298483261	1	1.357191142	1.357191142	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00000202	1	2.08E-14	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	97825529	G	T	-	-	-	-	-	-	38	0	0	50	4	8	43	8	18.6	41	4	9.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.572655333	0.572655333	1	1.063955447	1.063955447	1	1.773396425	1.773396425	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000119787	1	4.85E-11	1	0.0000546	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	98128907	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	44	7	15.9	32	4	12.5	35	3	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.138152474	1.138152474	1	0.715023822	0.715023822	1	1.556245843	1.556245843	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.55E-09	1	0.0000201	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	98809233	G	T	-	-	-	-	-	-	29	0	0	52	12	23.1	53	9	17	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	1.653542274	1.085267453	1.523626521	0.972432398	0.972432398	1	0.922889976	0.922889976	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.19E-17	1	7.1E-12	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	98967541	G	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	55	3	5.5	51	10	19.6	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	2.538843426	1.577363372	2	1	1	1	1	0	0.523626521	0.461156574	0.422636628	2	2	1	2	1	1	0.476373479	0.538843426	0.577363372	0.393700541	0.393700541	1	1.121157353	1.121157353	1	0.434301165	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.002700822	1	1.04E-13	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	101244450	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	59	11	18.6	45	9	20	33	3	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.331423649	1.331423649	1	1.23626943	1.23626943	1	1.646725252	1.646725252	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.1E-14	1	1.47E-12	1	0.000609557	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	101334718	G	C	-	-	-	-	-	-	43	0	0	48	2	4.2	59	12	20.3	46	5	10.9	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.30064405	0.631109966	0.476373479	1.254813472	1.254813472	1	1.972451126	1.972451126	1	NA	NA	1	0	0	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.024220359	1	2.2E-16	1	0.00000361	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	102934593	G	C	MORF4L2	CCDS14512.1	r.?	-	-	intronic	27	0	0	36	7	19.4	32	6	18.8	29	4	13.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.388689182	1.388689182	1	1.162093264	1.162093264	1	2.497231701	2.497231701	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.74E-10	1	1.27E-08	1	0.0000134	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	103159110	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	41	8	19.5	24	7	29.2	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.395847374	1.395847374	1	1.804953368	1.804953368	1	0.524780575	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	3.22E-11	1	2.51E-11	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	103503992	G	A	ESX1	CCDS14516.1	r.?	-	-	upstream	16	0	0	38	9	23.7	40	8	20	31	6	19.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.696491424	1.696491424	1	1.23626943	1.23626943	1	3.510601087	3.510601087	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.79E-13	1	2.61E-11	1	1.03E-08	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	103893463	C	T	IL1RAPL2	CCDS14517.1	r.?	-	-	intronic	40	0	0	28	1	3.6	48	7	14.6	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.2576949	0.2576949	1	0.902476684	0.902476684	1	0.434301165	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.130947004	1	4.81E-09	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	104375057	C	T	IL1RAPL2	CCDS14517.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	47	18	38.3	48	11	22.9	45	5	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	2.741587406	1.370793703	2	1.415528497	1.415528497	1	2.00864289	2.00864289	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.52E-29	1	9.31E-16	1	0.00000323	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	104881759	C	G	IL1RAPL2	CCDS14517.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	39	4	10.3	41	5	12.2	67	4	6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.737293741	0.737293741	1	0.754124352	0.754124352	1	1.085752913	1.085752913	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.0000447	1	0.00000202	1	0.000372648	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	106466761	C	A	CXorf41	CCDS14528.1	r.?	-	-	intronic	31	0	0	59	6	10.2	50	4	8	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.730135549	0.730135549	1	0.494507772	0.494507772	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000000561	1	0.000119787	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	107245626	A	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	46	5	10.9	44	2	4.5	45	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.780242891	0.780242891	1	0.278160622	0.278160622	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000361	1	0.020580492	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	107325352	A	T	VSIG1	CCDS14535.1	r.?	-	-	downstream	34	0	0	53	9	17	48	6	12.5	52	3	5.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.216892582	1.216892582	1	0.772668394	0.772668394	1	1.04956115	1.04956115	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	7.1E-12	1	0.00000016	1	0.002300591	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	108118354	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	49	8	16.3	38	9	23.7	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.166785241	1.166785241	1	1.464979275	1.464979275	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.47E-10	1	2.79E-13	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	108449024	T	A	-	-	-	-	-	-	31	0	0	52	7	13.5	60	14	23.3	31	3	9.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.966355874	0.966355874	1	1.440253886	1.440253886	1	1.755300543	1.755300543	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	8.58E-09	1	8.54E-20	1	0.000505952	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	108847940	C	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	42	9	21.4	53	11	20.8	35	4	11.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.531853015	1.531853015	1	1.285720207	1.285720207	1	2.062930536	2.062930536	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	7.51E-13	1	3.07E-15	1	0.0000289	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	109625976	G	T	AMMECR1	ENST00000372057	r.?	-	-	intronic	32	0	0	41	13	31.7	46	16	34.8	48	4	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	1	0	0	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	2.269146756	1.134573378	2	2.151108808	1.075554404	2	1.501958197	1.501958197	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	NA	0	5	NA	1	1	1.89E-20	1	1.31E-25	1	0.000102016	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	110123409	C	A	-	-	-	-	-	-	44	0	0	43	7	16.3	54	0	0	41	0	0	86	0	0	223	24	10.8	244	5	2	182	0	0	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.166785241	1.166785241	1	0	0	1	0	NA	0	0.773084699	0.773084699	1	0.123626943	0.123626943	1	0	NA	0	NA	NA	1	1	2.15E-09	2.34E-24	1	0.00808952	1	1	YES	1_1	0_1	0_0	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	X	110550332	C	A	DCX	CCDS14556.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	34	17	50	42	16	38.1	32	7	21.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	3.57909583	1.789547915	2	2.355093264	1.177546632	2	3.962998134	3.962998134	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.64E-30	1	2.25E-26	1	2.36E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	111702504	G	A	ZCCHC16	CCDS35369.1	r.?	-	-	downstream	26	0	0	50	8	16	37	3	8.1	43	3	7	2	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.145310666	1.145310666	1	0.500689119	0.500689119	1	1.266711732	1.266711732	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.74E-10	1	0.000855237	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	112685600	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	46	11	23.9	42	6	14.3	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.710807807	1.122852473	1.523626521	0.883932642	0.883932642	1	1.429574669	1.429574669	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.55E-16	1	7.02E-08	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	112729496	C	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	47	10	21.3	45	5	11.1	42	2	4.8	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	2	0	0	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.524694824	1.524694824	1	0.686129534	0.686129534	1	0.868602331	0.868602331	1	NA	NA	1	NA	NA	1	0	NA	0	5	NA	1	1	4.27E-14	1	0.00000323	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	112741099	A	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	44	5	11.4	38	8	21.1	41	1	2.4	76	0	0	273	36	13.2	224	13	5.8	222	6	2.7	FALSE	TRUE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.816033849	0.816033849	1	1.304264249	1.304264249	1	0.434301165	NA	0	0.944881299	0.944881299	1	0.358518135	0.358518135	1	0.488588811	0.846241439	0.577363372	NA	3	1	1	0.00000288	5.54E-39	1.67E-11	1.85E-10	0.18577148	0.000968817	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	X	112741106	T	G	-	-	-	-	-	-	29	0	0	46	5	10.9	35	7	20	38	1	2.6	79	1	1.3	279	37	13.3	222	13	5.9	227	5	2.2	FALSE	TRUE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.780242891	0.780242891	1	1.23626943	1.23626943	1	0.470492929	NA	0	0.952039491	0.952039491	1	0.364699482	0.364699482	1	0.398109402	0.689530062	0.577363372	NA	3	1	0.326987115	0.00000361	4.1E-40	4.65E-10	1.65E-10	0.173434892	0.006020667	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	X	112829402	G	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	37	7	18.9	28	5	17.9	42	2	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.352898224	1.352898224	1	1.10646114	1.10646114	1	0.868602331	0.868602331	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	7.05E-10	1	0.000000279	1	0.018854633	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	112879999	T	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	49	14	28.6	59	16	27.1	47	4	8.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	2.047242815	1.023621407	2	1.675145078	0.837572539	2	1.538149961	1.538149961	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.5E-21	1	1.37E-23	1	0.0000939	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	113221881	G	T	-	-	-	-	-	-	32	0	0	72	11	15.3	45	0	0	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.095203324	1.095203324	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.12E-13	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	113320157	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	45	18	40	46	14	30.4	36	3	8.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	2.863276664	1.431638332	2	1.879129534	0.939564767	2	1.501958197	1.501958197	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.76E-30	1	1.26E-21	1	0.000788827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	113432318	C	T	-	-	-	-	-	-	33	0	0	59	10	16.9	42	6	14.3	47	2	4.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.209734391	1.209734391	1	0.883932642	0.883932642	1	0.778122921	0.778122921	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.91E-13	1	7.02E-08	1	0.02328732	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	114115188	C	T	HTR2C	CCDS14564.1	r.?	-	-	intronic	38	0	0	50	7	14	43	8	18.6	38	1	2.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.002146832	1.002146832	1	1.14973057	1.14973057	1	0.470492929	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	6.46E-09	1	4.85E-11	1	0.173434892	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	114363739	G	A	LRCH2	CCDS48155.1	r.?	-	-	intronic	22	0	0	44	5	11.4	42	1	2.4	52	0	0	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.816033849	0.816033849	1	0.148352332	0.148352332	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000288	1	0.189842622	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	115102598	A	C	-	-	-	-	-	-	38	0	0	51	0	0	46	7	15.2	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0	0	1	0.939564767	0.939564767	1	1.121944677	1.121944677	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	3.53E-09	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	116790397	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	56	12	21.4	53	19	35.8	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.531853015	1.531853015	1	2.21292228	1.10646114	2	0.760027039	0.760027039	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.11E-16	1	1.93E-30	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	117231303	G	C	KLHL13	ENST00000371882	r.?	-	-	intronic	32	0	0	32	10	31.2	54	20	37	35	3	8.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	2.233355798	1.116677899	2	2.287098446	1.143549223	2	1.556245843	1.556245843	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.7E-16	1	2.61E-32	1	0.000725791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	117269798	T	A	-	-	-	-	-	-	37	0	0	57	5	8.8	48	5	10.4	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.629920866	0.629920866	1	0.642860104	0.642860104	1	0.886698213	0.886698213	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.0000105	1	0.00000447	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	117538292	T	C	WDR44	CCDS14572.1	r.1670-9u>c	c.1275-9T>C	p.?	splice region	30	0	0	39	5	12.8	40	8	20	42	1	2.4	52	0	0	229	28	12.2	220	42	19.1	228	10	4.4	FALSE	TRUE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.916248533	0.916248533	1	1.23626943	1.23626943	1	0.434301165	NA	0	0.873299383	0.873299383	1	1.180637306	1.180637306	1	0.796218803	0.796218803	1	NA	5	1	1	0.00000156	9.84E-30	2.61E-11	2.48E-52	0.189842622	0.000000311	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	X	117588538	A	T	WDR44	CCDS14572.1	r.?	-	-	downstream	34	0	0	46	18	39.1	50	22	44	32	5	15.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	2.798852939	1.39942647	2	2.719792746	1.359896373	2	2.822957575	2.822957575	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	9.41E-30	1	1.85E-37	1	0.000000562	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	118140847	G	A	LONRF3	CCDS14575.1	r.?	-	-	intronic	18	0	0	23	8	34.8	25	7	28	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	2.491050698	1.245525349	2	1.730777202	1.730777202	1	0.524780575	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.79E-13	1	3.47E-11	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	118718106	C	A	UBE2A	CCDS14580.1	r.1521c>a	c.?	p.?	3'UTR variant	34	0	0	39	9	23.1	44	8	18.2	34	4	11.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.653542274	1.653542274	1	1.125005181	1.125005181	1	2.135314063	2.135314063	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.62E-13	1	5.9E-11	1	0.0000257	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	119161481	C	T	-	-	-	-	-	-	21	0	0	45	1	2.2	49	7	14.3	46	1	2.2	317	0	0	344	5	1.5	289	35	12.1	269	13	4.8	FALSE	TRUE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.157480217	0.157480217	1	0.883932642	0.883932642	1	0.398109402	NA	0	0.107372875	0.107372875	1	0.747943005	0.747943005	1	0.868602331	0.868602331	1	NA	1	1	1	0.201934322	0.030530817	5.58E-09	1.29E-36	0.205924651	1.72E-09	YES	0_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	X	119405233	C	T	FAM70A	CCDS43986.1	r.?	-	-	intronic	43	0	0	51	4	7.8	41	6	14.6	50	3	6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.55833895	0.55833895	1	0.902476684	0.902476684	1	1.085752913	1.085752913	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000129466	1	6.05E-08	1	0.002055544	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	119488225	G	A	-	-	-	-	-	-	40	0	0	54	15	27.8	49	11	22.4	34	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.989977282	0.994988641	2	1.384621762	1.384621762	1	0.524780575	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	2.2E-22	1	1.19E-15	1	0.156694864	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	119615288	G	A	-	-	-	-	-	-	17	0	0	19	1	5.3	27	7	25.9	43	0	0	0	0	NA	1	0	0	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.379384158	0.379384158	1	1.600968912	1.600968912	1	0	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.090843738	1	6.36E-11	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	119927804	A	T	ENSG00000228279	ENST00000439600	r.?	-	-	intronic	30	0	0	39	4	10.3	49	7	14.3	32	1	3.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.737293741	0.737293741	1	0.883932642	0.883932642	1	0.560972339	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.0000447	1	5.58E-09	1	0.14819814	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	120513292	C	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	49	11	22.4	35	6	17.1	42	1	2.4	73	1	1.4	250	41	16.4	221	24	10.9	268	24	9	FALSE	TRUE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.603434932	1.603434932	1	1.057010363	1.057010363	1	0.434301165	NA	0	1.173943432	1.173943432	1	0.673766839	0.673766839	1	1.62862937	1.62862937	1	NA	4	1	0.306438632	1.19E-15	3.14E-48	2.24E-08	1.88E-24	0.189842622	1.94E-22	YES	1_1	1_1	0_1	somatic	custom.pulldown.HiSeq
PD9849b	X	120580713	C	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	46	8	17.4	50	6	12	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.245525349	1.245525349	1	0.741761658	0.741761658	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	8.61E-11	1	0.000000206	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	120619167	T	C	-	-	-	-	-	-	30	0	0	52	3	5.8	56	12	21.4	62	4	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.415175116	0.415175116	1	1.32280829	1.32280829	1	1.176232323	1.176232323	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.002300591	1	1.11E-16	1	0.000276647	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	120835112	A	G	-	-	-	-	-	-	39	0	0	55	4	7.3	48	5	10.4	45	1	2.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.522547991	0.522547991	1	0.642860104	0.642860104	1	0.398109402	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000173903	1	0.00000447	1	0.201934322	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	120904132	T	G	-	-	-	-	-	-	32	0	0	50	11	22	41	11	26.8	38	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.574802165	1.574802165	1	1.656601036	1.656601036	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.52E-15	1	1.34E-16	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	123313566	G	T	-	-	-	-	-	-	16	0	0	29	7	24.1	28	6	21.4	19	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.72512419	1.72512419	1	1.32280829	1.32280829	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.11E-10	1	5.36E-09	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	123625423	C	T	ODZ1	CCDS14609.1	r.?	-	-	intronic	39	1	2.6	52	16	30.8	51	11	21.6	63	4	6.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	2.204723031	1.102361516	2	1.335170984	1.335170984	1	1.140040559	1.140040559	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	0.177567718	1	1.33E-24	1	1.94E-15	1	0.000294233	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	123809103	G	C	ODZ1	CCDS14609.1	r.?	-	-	intronic	45	0	0	61	16	26.2	53	7	13.2	43	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.875446215	0.937723108	2	0.815937824	0.815937824	1	0.416205283	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	2.5E-23	1	9.85E-09	1	0.193893409	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	123845047	G	T	ODZ1	CCDS14609.1	r.?	-	-	intronic	32	0	0	53	5	9.4	49	5	10.2	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.672870016	0.672870016	1	0.630497409	0.630497409	1	0.904794095	0.904794095	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00000734	1	0.00000496	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	124052774	C	T	ODZ1	CCDS14609.1	r.?	-	-	intronic	28	0	0	66	24	36.4	48	24	50	28	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	2.605581764	1.302790882	2	3.090673575	1.545336788	2	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	3.04E-38	1	1.71E-42	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	124589028	A	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	41	7	17.1	53	7	13.2	47	3	6.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.224050774	1.224050774	1	0.815937824	0.815937824	1	1.158136441	1.158136441	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.51E-09	1	9.85E-09	1	0.001719595	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	124673077	C	G	-	-	-	-	-	-	36	0	0	51	13	25.5	52	14	26.9	52	7	13.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.825338873	0.912669437	2	1.662782383	0.831391192	2	2.442944055	2.442944055	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.87E-19	1	9.04E-21	1	8.58E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	124673585	C	T	-	-	-	-	-	-	35	0	0	51	5	9.8	48	1	2.1	43	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.701502783	0.701502783	1	0.12980829	0.12980829	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000606	1	0.213845552	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	125083546	T	G	-	-	-	-	-	-	28	0	0	39	7	17.9	37	6	16.2	37	2	5.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.281316307	1.281316307	1	1.001378238	1.001378238	1	0.977177622	0.977177622	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.04E-09	1	3.18E-08	1	0.014826063	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	125481270	G	A	-	-	-	-	-	-	30	0	0	49	11	22.4	44	6	13.6	55	5	9.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.603434932	1.603434932	1	0.840663212	0.840663212	1	1.646725252	1.646725252	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.19E-15	1	9.37E-08	1	0.00000883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	125993203	C	T	-	-	-	-	-	-	47	0	0	52	12	23.1	42	14	33.3	38	4	10.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.653542274	1.085267453	1.523626521	2.058388601	1.029194301	2	1.900067599	1.900067599	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.19E-17	1	2.83E-22	1	0.0000403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	126523624	C	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	23	2	8.7	13	5	38.5	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.622762674	0.622762674	1	2.379818653	1.189909326	2	1.357191142	1.357191142	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00589844	1	3.89E-09	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	127293911	C	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	58	7	12.1	37	7	18.9	52	3	5.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.866141191	0.866141191	1	1.168274611	1.168274611	1	1.04956115	1.04956115	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.88E-08	1	7.05E-10	1	0.002300591	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	127912245	C	A	-	-	-	-	-	-	27	0	0	49	0	0	56	9	16.1	37	3	8.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0	0	1	0.995196891	0.995196891	1	1.465766433	1.465766433	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	1.2E-11	1	0.000855237	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	128562997	T	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	52	11	21.2	58	10	17.2	49	3	6.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.517536632	1.517536632	1	1.06319171	1.06319171	1	1.103848795	1.103848795	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.44E-15	1	4.1E-13	1	0.001939399	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	128957898	G	C	ZDHHC9	CCDS35395.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	29	2	6.9	35	4	11.4	21	1	4.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.493915225	0.493915225	1	0.704673575	0.704673575	1	0.868602331	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.009279585	1	0.0000289	1	0.099912572	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	129284204	C	G	AIFM1	CCDS48167.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	26	4	15.4	30	7	23.3	29	1	3.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.102361516	1.102361516	1	1.440253886	1.440253886	1	0.615259984	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000856	1	1.44E-10	1	0.135292269	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	129935848	C	A	ENOX2	CCDS14626.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	45	4	8.9	50	7	14	44	1	2.3	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.637079058	0.637079058	1	0.865388601	0.865388601	1	0.416205283	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.0000791	1	6.46E-09	1	0.197923942	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	130122570	T	G	-	-	-	-	-	-	24	0	0	48	11	22.9	43	6	14	41	2	4.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.63922589	1.63922589	1	0.865388601	0.865388601	1	0.886698213	0.886698213	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	9.31E-16	1	8.13E-08	1	0.018015855	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	130879179	T	C	-	-	-	-	-	-	30	0	0	51	4	7.8	43	8	18.6	31	1	3.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.55833895	0.55833895	1	1.14973057	1.14973057	1	0.579068221	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.000129466	1	4.85E-11	1	0.143917729	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	131547387	T	A	MBNL3	CCDS14633.1	r.?	-	-	intronic	35	1	2.9	53	8	15.1	40	3	7.5	45	4	8.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.080886941	1.080886941	1	0.463601036	0.463601036	1	1.610533488	1.610533488	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	0.16091139	1	2.83E-10	1	0.001075403	1	0.0000791	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	131848240	T	A	HS6ST2	CCDS48169.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	54	9	16.7	36	6	16.7	30	3	10	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.195418007	1.195418007	1	1.032284974	1.032284974	1	1.809588189	1.809588189	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	8.48E-12	1	2.68E-08	1	0.000458697	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	132042246	T	A	HS6ST2	CCDS48169.1	r.?	-	-	intronic	26	0	0	61	11	18	43	4	9.3	48	3	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.288474499	1.288474499	1	0.574865285	0.574865285	1	1.121944677	1.121944677	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.62E-14	1	0.000066	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	132410857	T	C	-	-	-	-	-	-	21	0	0	41	7	17.1	36	5	13.9	28	2	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.224050774	1.224050774	1	0.859207254	0.859207254	1	1.284807614	1.284807614	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.51E-09	1	0.00000104	1	0.008668191	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	132467777	G	A	GPC4	CCDS14637.1	r.?	-	-	intronic	30	0	0	38	8	21.1	41	6	14.6	39	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.51037844	1.51037844	1	0.902476684	0.902476684	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.67E-11	1	6.05E-08	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	132677892	A	T	GPC3	CCDS14638.1	r.?	-	-	intronic	17	0	0	47	5	10.6	54	11	20.4	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.758768316	0.758768316	1	1.260994819	1.260994819	1	1.592437606	1.592437606	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.00000402	1	3.84E-15	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	134747092	A	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	39	9	23.1	58	6	10.3	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.653542274	1.653542274	1	0.636678756	0.636678756	1	0.922889976	0.922889976	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.62E-13	1	0.000000506	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	136533821	C	T	-	-	-	-	-	-	17	0	0	33	6	18.2	32	0	0	27	1	3.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.302790882	1.302790882	1	0	0	1	0.66954763	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.54E-08	1	1	1	0.126579904	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	136822065	C	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	36	1	2.8	40	4	10	35	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.200429366	0.200429366	1	0.618134715	0.618134715	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.165106833	1	0.0000495	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	136845189	G	A	-	-	-	-	-	-	14	0	0	43	9	20.9	31	13	41.9	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.496062057	1.496062057	1	2.589984456	1.294992228	2	0.524780575	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	9.45E-13	1	2.32E-22	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	137211390	G	A	-	-	-	-	-	-	28	0	0	40	9	22.5	39	8	20.5	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.610593124	1.610593124	1	1.267176166	1.267176166	1	0.524780575	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.64E-13	1	2.09E-11	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	137541560	C	T	-	-	-	-	-	-	31	0	0	57	10	17.5	34	3	8.8	32	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.252683541	1.252683541	1	0.543958549	0.543958549	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	3.4E-13	1	0.000666058	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	137624015	G	T	-	-	-	-	-	-	22	0	0	54	7	13	66	8	12.1	38	3	7.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.930564916	0.930564916	1	0.747943005	0.747943005	1	1.429574669	1.429574669	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.13E-08	1	1.73E-09	1	0.000925091	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	138051252	T	C	FGF13	ENST00000370603	r.?	-	-	intronic	30	0	0	50	9	18	46	8	17.4	40	2	5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.288474499	1.288474499	1	1.075554404	1.075554404	1	0.904794095	0.904794095	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.07E-12	1	8.61E-11	1	0.017193422	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	138251125	A	G	FGF13	ENST00000436198	r.?	-	-	intronic	37	0	0	68	14	20.6	35	4	11.4	49	2	4.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.474587482	1.474587482	1	0.704673575	0.704673575	1	0.741931158	0.741931158	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.84E-19	1	0.0000289	1	0.025168485	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	138298093	G	C	FGF13	ENST00000448673	r.?	-	-	intronic	27	0	0	42	5	11.9	59	0	0	34	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.851824808	0.851824808	1	0	0	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.00000228	1	1	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	138608471	G	T	F9	CCDS14666.1	r.?	-	-	upstream	46	0	0	51	13	25.5	34	5	14.7	41	1	2.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.825338873	0.912669437	2	0.908658031	0.908658031	1	0.434301165	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.87E-19	1	0.000000771	1	0.18577148	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	138636482	C	A	F9	CCDS14666.1	r.?	-	-	intronic	23	0	0	54	13	24.1	47	3	6.4	48	2	4.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.72512419	1.132248728	1.523626521	0.395606218	0.395606218	1	0.760027039	0.760027039	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.12E-18	1	0.001719595	1	0.024220359	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	138866316	G	T	ATP11C	CCDS14668.1	r.?	-	-	intronic	29	0	0	39	10	25.6	47	4	8.5	35	1	2.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.832497065	0.916248533	2	0.525414508	0.525414508	1	0.524780575	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	5.44E-15	1	0.0000939	1	0.16091139	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	140706988	G	A	-	-	-	-	-	-	29	0	0	53	12	22.6	61	19	31.1	52	3	5.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.617751315	1.617751315	1	1.922398964	0.961199482	2	1.04956115	1.04956115	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.39E-17	1	4.64E-29	1	0.002300591	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	141598169	C	A	-	-	-	-	-	-	32	0	0	56	11	19.6	47	9	19.1	48	3	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.403005565	1.403005565	1	1.180637306	1.180637306	1	1.121944677	1.121944677	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.91E-15	1	2.24E-12	1	0.001827434	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	141794662	A	T	-	-	-	-	-	-	40	0	0	53	0	0	46	1	2.2	52	4	7.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0	0	1	0.135989637	0.135989637	1	1.393382906	1.393382906	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	3	NA	1	1	1	1	0.205924651	1	0.000139698	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	141912216	G	C	-	-	-	-	-	-	34	0	0	67	10	14.9	54	11	20.4	44	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.066570557	1.066570557	1	1.260994819	1.260994819	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	1.87E-12	1	3.84E-15	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	142392471	G	T	-	-	-	-	-	-	26	0	0	45	7	15.6	64	8	12.5	41	5	12.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.116677899	1.116677899	1	0.772668394	0.772668394	1	2.207697591	2.207697591	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000000003	1	1.35E-09	1	0.00000202	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	142440671	C	G	-	-	-	-	-	-	12	0	0	18	7	38.9	32	10	31.2	27	3	11.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	2.784536556	1.392268278	2	1.928580311	0.964290155	2	2.00864289	2.00864289	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.37E-12	1	5.7E-16	1	0.000334187	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	142952769	G	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	48	3	6.2	37	11	29.7	49	1	2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.443807883	0.443807883	1	1.835860104	0.917930052	2	0.361917638	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	0.001827434	1	3.7E-17	1	0.217776325	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	143025903	G	T	-	-	-	-	-	-	34	0	0	50	7	14	42	7	16.7	44	3	6.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.002146832	1.002146832	1	1.032284974	1.032284974	1	1.230519969	1.230519969	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	6.46E-09	1	1.81E-09	1	0.00142027	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	143331489	G	T	-	-	-	-	-	-	42	0	0	68	14	20.6	41	10	24.4	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.474587482	1.474587482	1	1.508248705	1.508248705	1	0.850506449	0.850506449	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	5.84E-19	1	9.51E-15	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	143362577	C	T	-	-	-	-	-	-	46	0	0	43	12	27.9	43	5	11.6	34	2	5.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.997135473	0.998567737	2	0.717036269	0.717036269	1	1.067657032	1.067657032	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.24E-18	1	0.00000257	1	0.012612579	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	143912750	C	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	39	6	15.4	44	8	18.2	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.102361516	1.102361516	1	1.125005181	1.125005181	1	1.357191142	1.357191142	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	4.43E-08	1	5.9E-11	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	144250221	C	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	55	11	20	67	11	16.4	47	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.431638332	1.431638332	1	1.013740933	1.013740933	1	0	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	NA	NA	1	1	4.77E-15	1	4.85E-14	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	144256120	G	T	-	-	-	-	-	-	37	0	0	54	4	7.4	39	6	15.4	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.529706183	0.529706183	1	0.951927461	0.951927461	1	0.850506449	0.850506449	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.000161898	1	4.43E-08	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	144791937	T	C	-	-	-	-	-	-	31	0	0	40	12	30	25	10	40	43	3	7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	2.147457498	1.073728749	2	2.47253886	1.23626943	2	1.266711732	1.266711732	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.2E-18	1	2.98E-17	1	0.001328364	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	145034199	A	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	62	9	14.5	57	5	8.8	43	2	4.7	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.037937791	1.037937791	1	0.543958549	0.543958549	1	0.850506449	0.850506449	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	3.12E-11	1	0.0000105	1	0.019709573	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	145119799	G	T	-	-	-	-	-	-	30	0	0	41	7	17.1	33	7	21.2	46	3	6.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.224050774	1.224050774	1	1.310445596	1.310445596	1	1.176232323	1.176232323	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	1.51E-09	1	2.98E-10	1	0.001615827	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	145241335	T	A	-	-	-	-	-	-	16	0	0	35	2	5.7	34	4	11.8	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	0.408016925	0.408016925	1	0.729398964	0.729398964	1	0.796218803	0.796218803	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	0.013332991	1	0.0000257	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	145241438	T	C	-	-	-	-	-	-	24	0	0	35	6	17.1	40	10	25	39	2	5.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	3.476373479	3	1.577363372	2	2	1	1	1	0	0.523626521	1	0.422636628	2	NA	1	2	NA	1	0.476373479	NA	0.577363372	1.224050774	1.224050774	1	1.545336788	1.545336788	1	0.922889976	0.922889976	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	0	5	NA	1	1	2.24E-08	1	7.22E-15	1	0.016387522	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	145870471	A	G	-	-	-	-	-	-	30	0	0	37	16	43.2	28	16	57.1	48	10	20.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.454545455	1.227272727	2	2.958549223	1.479274611	2	4.267851852	1.422617284	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.78E-27	1	4.39E-30	1	5.37E-14	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	147160253	G	A	-	-	-	-	-	-	19	0	0	32	12	37.5	29	10	34.5	32	7	21.9	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.130681818	1.065340909	2	1.787564767	0.893782383	2	4.493555556	1.497851852	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	5.03E-20	1	1.79E-16	1	2.36E-10	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	148549259	T	A	-	-	-	-	-	-	23	0	0	36	11	30.6	34	5	14.7	34	3	8.8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.738636364	0.869318182	2	0.761658031	0.761658031	1	1.80562963	1.80562963	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.62E-17	1	0.000000771	1	0.000666058	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	148644570	A	G	-	-	-	-	-	-	37	0	0	76	4	5.3	57	8	14	80	0	0	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.301136364	0.301136364	1	0.725388601	0.725388601	1	0	0	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	0.00060191	1	5.19E-10	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	148695075	A	C	HSFX2	CCDS48179.1	r.?	-	-	intronic	25	0	0	35	13	37.1	35	8	22.9	32	2	6.2	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2.107954545	1.053977273	2	1.186528497	1.186528497	1	1.272148148	1.272148148	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1.63E-21	1	8.15E-12	1	0.011224977	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	149423514	T	G	-	-	-	-	-	-	31	0	0	45	7	15.6	58	9	15.5	65	1	1.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.886363636	0.886363636	1	0.803108808	0.803108808	1	0.307777778	0.307777778	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000003	1	1.67E-11	1	0.278061424	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	150924517	T	A	-	-	-	-	-	-	26	0	0	15	0	0	23	3	13	42	0	0	2	0	0	0	0	NA	2	0	0	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0.67357513	0.67357513	1	0	0	1	NA	NA	0	0	0	1	NA	NA	1	2	NA	1	1	1	1	0.000205387	1	1	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	150994076	T	C	-	-	-	-	-	-	26	0	0	35	6	17.1	34	5	14.7	45	2	4.4	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.971590909	0.971590909	1	0.761658031	0.761658031	1	0.902814815	0.902814815	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	2.24E-08	1	0.000000771	1	0.021467209	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	151234164	T	A	-	-	-	-	-	-	35	0	0	39	12	30.8	38	15	39.5	50	7	14	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.75	0.875	2	2.046632124	1.023316062	2	2.872592593	0.957530864	3	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	8.43E-19	1	4.24E-25	1	6.46E-09	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	151284433	A	T	MAGEA5	ENST00000509345	r.?	-	-	upstream	10	0	0	25	4	16	19	1	5.3	40	3	7.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0.909090909	0.909090909	1	0.274611399	0.274611399	1	1.538888889	1.538888889	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.00000727	1	0.090843738	1	0.001075403	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	153566259	G	T	-	-	-	-	-	-	7	0	0	7	0	0	5	0	0	26	3	11.5	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	0	1	0	0	1	2.35962963	2.35962963	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	1	1	1	1	0.000298167	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	153752023	C	T	-	-	-	-	-	-	23	0	0	15	4	26.7	21	6	28.6	25	2	8	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.517045455	1.517045455	1	1.481865285	1.481865285	1	1.641481481	1.641481481	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	0.000000816	1	7.95E-10	1	0.006948068	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	X	153982355	A	C	GAB3	CCDS48198.1	r.?	-	-	upstream	27	0	0	33	8	24.2	36	14	38.9	36	2	5.6	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	TRUE	FALSE	2	2	4	2	2	3	0	0	1	1	1	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1.375	1.375	1	2.015544041	1.007772021	2	1.149037037	1.149037037	1	NA	NA	0	NA	NA	1	NA	NA	1	5	NA	1	1	4.85E-12	1	2.09E-23	1	0.014070883	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA
PD9849b	Y	10039155	A	T	-	-	-	-	-	-	28	0	0	37	4	10.8	46	5	10.9	42	3	7.1	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	0	0	NA	FALSE	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	NA	NA	1	1	0.0000362	1	0.00000361	1	0.001240292	1	NO	inad_validation_depth	inad_validation_depth	inad_validation_depth	NA	NA