ID rs. chrom pos strand build center protLSID assayLSID panelLSID QC_code refallele refallele_freq_CEU refallele_count_CEU otherallele_CEU otherallele_freq_CEU otherallele_count_CEU totalcount_CEU refallele_YRI refallele_freq_YRI refallele_count_YRI otherallele_YRI otherallele_freq_YRI otherallele_count_YRI totalcount_YRI refallele_JC refallele_freq_JC refallele_count_JC otherallele_JC otherallele_freq_JC otherallele_count_JC totalcount_JC refallele_chimp otherallele_chimp chimpChrom chimpPos chimpStrand chimpAllele 52288 rs7879112 ChrX 151582941 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972916:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 G 0.00 0 120 T 1.00 120 G 0.00 0 120 T 1.00 178 G 0.00 0 178 T G chrX 157951737 + t 52289 rs12397274 ChrX 151586997 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971381:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 0.85 102 C 0.15 18 120 T 1.00 178 C 0.00 0 178 T C chrX 157955759 + c 52290 rs6571299 ChrX 151587104 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732467:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.99 119 T 8.0e-03 1 120 C 0.63 76 T 0.36 44 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 157955866 + c 52291 rs5945358 ChrX 151588399 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972917:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 1.00 178 G 0.00 0 178 52292 rs5987171 ChrX 151591315 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732468:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.31 38 G 0.68 82 120 A 0.19 23 G 0.80 97 120 A 0.81 145 G 0.18 33 178 52293 rs2857747 ChrX 151595329 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214783:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 1.00 178 G 0.00 0 178 52294 rs2071127 ChrX 151597460 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333785:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 8.0e-03 1 A 0.99 119 120 G 0.39 47 A 0.60 73 120 G 0.16 29 A 0.83 149 178 G A chrX 157966135 + g 52295 rs4646266 ChrX 151599861 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214784:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.98 118 A 0.01 2 120 C 0.86 104 A 0.13 16 120 C 0.95 170 A 0.04 8 178 52296 rs5987173 ChrX 151600132 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971382:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.88 106 A 0.11 14 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX_random 29634514 - g 52297 rs2857753 ChrX 151604928 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972918:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 A 0.00 0 120 C 1.00 120 A 0.00 0 120 C 1.00 178 A 0.00 0 178 C A chrX_random 29629717 + c 52298 rs4243542 ChrX 151607788 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732469:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.98 118 T 0.01 2 120 C 0.85 102 T 0.15 18 120 C 0.93 166 T 0.06 12 178 52299 rs4646263 ChrX 151608353 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732470:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.72 87 A 0.27 33 120 G 0.30 37 A 0.69 83 120 G 0.34 61 A 0.65 115 176 52300 rs3761531 ChrX 151611679 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333787:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.72 87 T 0.27 33 120 C 0.60 73 T 0.39 47 120 C 0.40 71 T 0.59 105 176 C T chrX_random 29622721 + c 52301 rs5945361 ChrX 151614304 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732471:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.70 85 G 0.29 35 120 A 0.00 0 G 1.00 120 120 A 0.27 49 G 0.72 129 178 A G chrX_random 29620106 - g 52302 rs12012901 ChrX 151615008 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971383:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 C 0.00 0 120 G 1.00 120 C 0.00 0 120 G 1.00 176 C 0.00 0 176 G C chrX_random 29619402 - g 52303 rs6655267 ChrX 151617713 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732472:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 0.63 76 G 0.36 44 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 52304 rs12156710 ChrX 151618695 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972919:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.70 85 T 0.29 35 120 C 0.38 46 T 0.61 74 120 C 0.30 54 T 0.69 124 178 52305 rs10126066 ChrX 151620172 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971384:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.85 103 A 0.14 17 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX_random 29685195 + g 52306 rs4898455 ChrX 151622791 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732473:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.98 118 G 0.01 2 120 A 0.84 101 G 0.15 19 120 A 0.93 166 G 0.06 12 178 52307 rs7065317 ChrX 151625626 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732474:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.98 118 A 0.01 2 120 G 0.81 98 A 0.18 22 120 G 0.93 167 A 0.06 11 178 52308 rs4898457 ChrX 151626260 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971385:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.70 85 A 0.29 35 120 G 0.03 4 A 0.96 116 120 G 0.24 44 A 0.75 134 178 52309 rs5945169 ChrX 151629941 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972921:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.72 87 C 0.27 33 120 A 0.15 19 C 0.84 101 120 A 0.29 53 C 0.70 125 178 A C chrX 157998632 + c 52310 rs7052686 ChrX 151630366 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732475:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.70 85 T 0.29 35 120 G 0.01 2 T 0.98 118 120 G 0.26 47 T 0.73 131 178 G T chrX 157999057 + t 52311 rs5987180 ChrX 151632220 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214785:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.88 106 T 0.11 14 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 52312 rs5945369 ChrX 151633708 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214786:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.72 87 T 0.27 33 120 A 0.43 51 T 0.56 67 118 A 0.33 60 T 0.66 118 178 A T chrX 158003824 + t 52313 rs3761528 ChrX 151636353 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:335570:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.70 85 G 0.29 35 120 A 0.01 2 G 0.98 118 120 A 0.23 42 G 0.76 136 178 52314 rs3761527 ChrX 151636528 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333790:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.66 80 G 0.33 40 120 A 0.08 10 G 0.91 110 120 A 0.23 42 G 0.76 136 178 52315 rs5196 ChrX 151638522 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333792:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 T 0.00 0 120 A 0.90 109 T 0.09 11 120 A 1.00 178 T 0.00 0 178 52316 rs5200 ChrX 151639304 + ncbi_b34 sanger urn:lsid:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:lsid:sanger.hapmap.org:Assay:4246370:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.92 111 T 0.07 9 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 52317 rs5201 ChrX 151639897 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333795:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.00 0 G 1.00 120 120 A 0.03 4 G 0.96 116 120 A 0.25 45 G 0.74 133 178 A G chrX 158010006 + g 52318 rs5203 ChrX 151640083 + ncbi_b34 sanger urn:lsid:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:lsid:sanger.hapmap.org:Assay:4247989:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.96 116 A 0.03 4 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158010192 + g 52319 rs3213441 ChrX 151644478 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333799:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 158015068 + c 52320 rs2269368 ChrX 151657723 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333801:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.78 94 T 0.21 26 120 C 0.47 57 T 0.52 63 120 C 0.33 58 T 0.67 118 176 C T chrX 158028714 + t 52321 rs4898462 ChrX 151661052 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333803:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 118 A 0.00 0 118 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158032033 + g 52322 rs2071128 ChrX 151663297 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333804:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.82 94 A 0.17 20 114 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.32 57 A 0.67 119 176 G A chrX 158034442 + g 52323 rs2071131 ChrX 151664249 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333807:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.78 94 A 0.21 26 120 G 0.96 116 A 0.03 4 120 G 0.32 57 A 0.67 119 176 52324 rs2269370 ChrX 151664333 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:335571:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.78 94 A 0.21 26 120 C 0.65 78 A 0.35 42 120 C 0.31 55 A 0.68 121 176 52325 rs1557501 ChrX 151665034 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:61932:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.72 87 T 0.27 33 120 C 0.31 38 T 0.68 82 120 C 0.25 44 T 0.75 132 176 C T chrX 158036177 + t 52326 rs4898373 ChrX 151666032 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732478:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 0.95 115 C 0.04 5 120 T 0.96 171 C 0.03 7 178 T C chrX 158037175 + t 52327 rs7883568 ChrX 151671708 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214787:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 0.85 102 C 0.15 18 120 T 0.98 176 C 0.01 2 178 T C chrX 158043216 + t 52328 rs2269371 ChrX 151674929 + ncbi_b34 sanger urn:lsid:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:lsid:sanger.hapmap.org:Assay:4249953:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 0.84 101 C 0.15 19 120 T 0.96 172 C 0.03 6 178 T C chrX 158046412 + t 52329 rs2269372 ChrX 151675449 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333812:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.75 91 G 0.24 29 120 A 0.30 37 G 0.69 83 120 A 0.19 34 G 0.80 144 178 52330 rs3027869 ChrX 151679442 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732480:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.75 91 A 0.24 29 120 G 0.90 109 A 0.09 11 120 G 0.19 34 A 0.80 144 178 52331 rs762656 ChrX 151679556 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:61933:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.75 91 G 0.24 29 120 A 0.33 40 G 0.66 80 120 A 0.19 34 G 0.80 144 178 A G chrX 158050954 + g 52332 rs3027871 ChrX 151680344 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333814:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.69 123 A 0.30 53 176 G A chrX 158051740 + g 52333 rs2071132 ChrX 151683940 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333815:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.75 91 A 0.24 29 120 G 0.30 37 A 0.69 83 120 G 0.19 34 A 0.80 142 176 G A chrX 158055338 + a 52334 rs762654 ChrX 151689242 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333820:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.89 107 A 0.10 13 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158061170 + g 52335 rs730106 ChrX 151689561 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333821:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.75 91 C 0.24 29 120 T 0.30 37 C 0.69 83 120 T 0.19 34 C 0.80 144 178 T C chrX 158061489 + c 52336 rs7883972 ChrX 151691749 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333823:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.77 93 T 0.22 27 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 158063678 + c 52337 rs632 ChrX 151694375 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333825:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.75 91 G 0.24 29 120 A 0.29 35 G 0.70 85 120 A 0.19 34 G 0.80 142 176 A G chrX 158066305 - g 52338 rs17422 ChrX 151695330 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333826:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.75 91 C 0.24 29 120 T 0.30 37 C 0.69 83 120 T 0.18 33 C 0.81 143 176 T C chrX 158067251 - c 52339 rs12392452 ChrX 151697817 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732481:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 0.42 51 G 0.57 69 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 A G chrX 158069738 + g 52340 rs5945380 ChrX 151698845 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732482:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.00 0 C 1.00 120 120 T 0.00 0 C 1.00 120 120 T 0.06 12 C 0.93 166 178 T C chrX 158070767 + c 52341 rs12556144 ChrX 151700331 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971388:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 178 C 0.00 0 178 T C chrX 158072250 + t 52342 rs7061316 ChrX 151704893 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971389:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.97 117 T 0.02 3 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 158077542 + c 52343 rs2266888 ChrX 151707624 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333829:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.75 91 A 0.24 29 120 G 0.80 96 A 0.20 24 120 G 0.19 34 A 0.80 142 176 G A chrX 158080795 + g 52344 rs5987189 ChrX 151710468 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972925:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.89 107 T 0.10 13 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 52345 rs6643653 ChrX 151713922 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971390:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.78 92 G 0.22 26 118 A 0.86 104 G 0.13 16 120 A 0.19 34 G 0.80 142 176 52346 rs6571303 ChrX 151715858 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732483:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.76 92 T 0.23 28 120 C 0.87 105 T 0.12 15 120 C 0.25 45 T 0.74 131 176 C T chrX 158085201 + c 52347 rs13397 ChrX 151716152 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333832:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.78 94 A 0.21 26 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.32 57 A 0.68 121 178 G A chrX 158085495 + g 52348 rs2239471 ChrX 151716403 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333833:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 52349 rs5986946 ChrX 151718019 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732484:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.90 109 A 0.09 11 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158087394 + g 52350 rs12010065 ChrX 151718950 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732485:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 0.87 105 G 0.12 15 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 A G chrX 158088325 + g 52351 rs5945382 ChrX 151720437 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971391:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.78 92 C 0.22 26 118 T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 178 C 0.00 0 178 52352 rs6643655 ChrX 151720522 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972927:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 1.00 178 G 0.00 0 178 52353 rs6655271 ChrX 151727539 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732486:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.98 118 G 0.01 2 120 A 0.58 70 G 0.41 50 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 52354 rs11797641 ChrX 151727837 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971392:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 52355 rs12395190 ChrX 151731821 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971393:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.85 103 A 0.14 17 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX_random 29799317 - g 52356 rs11795678 ChrX 151733632 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972929:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.23 28 A 0.76 92 120 G 0.67 81 A 0.32 39 120 G 0.83 149 A 0.16 29 178 G A chrX 158102946 + g 52357 rs12558322 ChrX 151739810 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972930:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 1.00 176 G 0.00 0 176 C G chrX_random 29791332 - c 52358 rs4898375 ChrX 151741130 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732487:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.22 27 G 0.77 93 120 A 8.0e-03 1 G 0.99 119 120 A 0.82 147 G 0.17 31 178 52359 rs633 ChrX 151742132 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:61935:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.23 28 T 0.76 92 120 C 0.44 53 T 0.55 67 120 C 0.83 149 T 0.16 29 178 52360 rs3027898 ChrX 151743794 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732488:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.23 28 A 0.76 92 120 C 0.50 61 A 0.49 59 120 C 0.83 149 A 0.16 29 178 52361 rs3027907 ChrX 151747349 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732490:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 0.76 92 G 0.23 28 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 A G chrX 158116707 + a 52362 rs11465835 ChrX 151750581 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732491:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 T 0.00 0 120 G 0.95 115 T 0.04 5 120 G 1.00 178 T 0.00 0 178 G T chrX 158119952 - g 52363 rs2075595 ChrX 151751921 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333837:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.92 165 T 0.07 13 178 C T chrX 158121283 + c 52364 rs1059702 ChrX 151752096 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333838:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.00 0 C 1.00 120 120 T 8.0e-03 1 C 0.99 119 120 T 0.82 147 C 0.17 31 178 T C chrX 158121458 - c 52365 rs3027917 ChrX 151755974 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971395:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.96 114 A 0.03 4 118 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158125337 + g 52366 rs2734643 ChrX 151759091 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971396:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.80 97 T 0.19 23 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 158128455 + c 52367 rs2734647 ChrX 151760084 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333840:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.22 27 C 0.77 93 120 T 8.0e-03 1 C 0.99 119 120 T 0.82 146 C 0.18 32 178 T C chrX 158129448 + c 52368 rs3813459 ChrX 151761264 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333841:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 176 C 0.00 0 176 T C chrX 158130629 - t 52369 rs3813458 ChrX 151761319 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:335573:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 0.96 171 G 0.03 7 178 C G chrX 158130684 - c 52370 rs2075596 ChrX 151765296 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333842:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.21 26 G 0.78 94 120 A 8.0e-03 1 G 0.99 119 120 A 0.82 146 G 0.18 32 178 A G chrX 158134656 + g 52371 rs3027933 ChrX 151766778 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333844:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.21 26 C 0.78 94 120 G 0.17 21 C 0.82 99 120 G 0.83 148 C 0.16 30 178 G C chrX 158136144 + c 52372 rs6643812 ChrX 151772110 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972932:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 A G chrX 158141532 + a 52373 rs3027935 ChrX 151772372 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732494:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.97 117 T 0.02 3 120 C 0.73 88 T 0.26 32 120 C 0.98 176 T 0.01 2 178 C T chrX 158141794 + t 52374 rs3027937 ChrX 151774564 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971397:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 A 0.00 0 120 T 0.82 99 A 0.17 21 120 T 1.00 178 A 0.00 0 178 52375 rs10218386 ChrX 151776950 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214788:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.99 119 T 8.0e-03 1 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 158146378 + c 52376 rs3027939 ChrX 151778482 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333845:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.99 119 G 8.0e-03 1 120 A 0.72 87 G 0.27 33 120 A 0.98 176 G 0.01 2 178 52377 rs17435 ChrX 151779884 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:61936:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.22 27 A 0.77 93 120 T 0.65 79 A 0.34 41 120 T 0.83 148 A 0.16 30 178 52378 rs12011960 ChrX 151782116 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972933:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 158150853 + c 52379 rs7059306 ChrX 151782894 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971398:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.80 97 A 0.19 23 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158152195 + g 52380 rs7884370 ChrX 151790785 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333847:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.99 119 G 8.0e-03 1 120 A 0.72 87 G 0.27 33 120 A 0.98 176 G 0.01 2 178 A G chrX 158160121 + g 52381 rs1734787 ChrX 151793350 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:61937:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.78 94 C 0.21 26 120 A 0.93 112 C 0.06 8 120 A 0.16 30 C 0.83 148 178 A C chrX 158162688 + a 52382 rs5987201 ChrX 151797946 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732496:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.99 119 T 8.0e-03 1 120 C 0.73 88 T 0.26 32 120 C 0.98 176 T 0.01 2 178 C T chrX 158167282 + c 52383 rs1734791 ChrX 151798824 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971399:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.78 94 T 0.21 26 120 A 0.74 89 T 0.25 31 120 A 0.16 30 T 0.83 148 178 A T chrX 158168171 + a 52384 rs1734792 ChrX 151808964 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732498:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.21 26 C 0.78 94 120 A 0.20 24 C 0.80 96 120 A 0.82 146 C 0.18 32 178 A C chrX 158179135 + c 52385 rs6643820 ChrX 151810536 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972935:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 T 0.00 0 120 G 1.00 120 T 0.00 0 120 G 1.00 178 T 0.00 0 178 G T chrX 158180707 + g 52386 rs11156611 ChrX 151812078 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732499:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.99 119 A 8.0e-03 1 120 G 0.77 93 A 0.22 27 120 G 0.98 176 A 0.01 2 178 G A chrX 158181937 + g 52387 rs5987204 ChrX 151815492 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732500:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.99 119 A 8.0e-03 1 120 G 0.77 93 A 0.22 27 120 G 0.98 176 A 0.01 2 178 G A chrX 158185341 + a 52388 rs2239464 ChrX 151816335 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333848:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.22 27 G 0.77 93 120 A 0.63 76 G 0.36 44 120 A 0.84 149 G 0.15 27 176 A G chrX 158186183 + a 52389 rs5986954 ChrX 151817199 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732501:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.99 119 G 8.0e-03 1 120 A 0.78 94 G 0.21 26 120 A 0.98 176 G 0.01 2 178 A G chrX 158187047 + g 52390 rs12390885 ChrX 151823919 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732502:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.99 119 A 8.0e-03 1 120 G 0.77 93 A 0.22 27 120 G 0.98 176 A 0.01 2 178 G A chrX 158193963 + a 52391 rs12387941 ChrX 151824598 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972936:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 C 0.00 0 120 A 1.00 120 C 0.00 0 120 A 1.00 178 C 0.00 0 178 A C chrX 158194642 + a 52392 rs5945175 ChrX 151826661 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972937:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.90 108 C 0.10 12 120 T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 178 C 0.00 0 178 T C chrX 158196697 + t 52393 rs10465414 ChrX 151828581 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971402:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158198631 + g 52394 rs7050893 ChrX 151831499 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972938:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.96 116 T 0.03 4 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 158201641 + c 52395 rs11575803 ChrX 151832076 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971403:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 158202218 - c 52396 rs10126881 ChrX 151833665 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972939:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 0.86 104 G 0.13 16 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 A G chrX 158203806 + a 52397 rs5987208 ChrX 151837515 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971404:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.99 119 A 8.0e-03 1 120 G 0.78 94 A 0.21 26 120 G 0.98 176 A 0.01 2 178 G A chrX 158207723 + a 52398 rs5987210 ChrX 151838935 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972940:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 T 0.00 0 120 G 0.99 119 T 8.0e-03 1 120 G 1.00 178 T 0.00 0 178 52399 rs6643826 ChrX 151839264 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971405:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 C 0.00 0 120 G 1.00 120 C 0.00 0 120 G 1.00 178 C 0.00 0 178 G C chrX 158209445 + g 52400 rs5945397 ChrX 151841430 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972941:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.86 104 A 0.13 16 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158211622 + g 52401 rs5987211 ChrX 151843959 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971406:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.99 119 T 8.0e-03 1 120 C 0.77 93 T 0.22 27 120 C 0.98 176 T 0.01 2 178 52402 rs1296660 ChrX 151846904 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214789:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.00 0 A 1.00 120 120 G 0.00 0 A 1.00 120 120 G 0.00 0 A 1.00 178 178 52403 rs3850327 ChrX 151848927 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732503:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.92 111 A 0.07 9 120 G 0.55 66 A 0.45 54 120 G 0.98 176 A 0.01 2 178 52404 rs6643828 ChrX 151850067 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214790:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 52405 rs1296661 ChrX 151850837 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333850:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.70 84 T 0.30 36 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 158221025 + c 52406 rs5945401 ChrX 151854313 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214791:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.65 79 G 0.34 41 120 A 0.22 27 G 0.77 93 120 A 0.75 135 G 0.24 43 178 A G chrX 158224487 + g 52407 rs2071649 ChrX 151855822 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333851:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.61 74 G 0.38 46 120 A 0.28 34 G 0.71 86 120 A 0.75 135 G 0.24 43 178 A G chrX 158225993 + a 52408 rs5986958 ChrX 151858385 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732504:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.65 79 A 0.34 41 120 G 0.29 35 A 0.70 85 120 G 0.75 135 A 0.24 43 178 G A chrX 158228570 + a 52409 rs1014457 ChrX 151863404 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333852:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.89 107 A 0.10 13 120 T 0.94 113 A 0.05 7 120 T 0.99 177 A 6.0e-03 1 178 T A chrX 158233591 + t 52410 rs1034393 ChrX 151864298 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214792:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 A 0.00 0 120 C 1.00 120 A 0.00 0 120 C 1.00 176 A 0.00 0 176 C A chrX 158234483 + c 52411 rs5987215 ChrX 151868498 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732505:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.59 71 G 0.40 49 120 T 0.12 15 G 0.87 105 120 T 0.75 134 G 0.24 44 178 T G chrX 158238678 + g 52412 rs7063960 ChrX 151871536 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972942:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 C 0.00 0 120 A 1.00 120 C 0.00 0 120 A 1.00 178 C 0.00 0 178 A C chrX 158241717 + a 52413 rs12008704 ChrX 151872512 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971407:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 0.85 103 C 0.14 17 120 T 1.00 178 C 0.00 0 178 T C chrX 158242695 + t 52414 rs5986960 ChrX 151873152 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732506:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 A 0.00 0 120 C 0.53 64 A 0.46 56 120 C 1.00 178 A 0.00 0 178 C A chrX 158243373 + c 52415 rs5986968 ChrX 151998267 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732510:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 C 0.00 0 120 G 0.83 100 C 0.16 20 120 G 1.00 178 C 0.00 0 178 G C chr1 225638409 - c 52416 rs2315056 ChrX 152001743 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732511:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.68 82 T 0.31 38 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 52417 rs2283759 ChrX 152004020 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333855:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 116 G 0.00 0 116 A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 52418 rs5987242 ChrX 152007999 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732512:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 T 0.00 0 120 A 0.52 63 T 0.47 57 120 A 1.00 178 T 0.00 0 178 A T chrX 158363027 + a 52419 rs6655282 ChrX 152014460 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971412:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.82 99 A 0.17 21 120 G 0.46 56 A 0.53 64 120 G 0.90 161 A 0.09 17 178 G A chrX 158369540 + a 52420 rs2266894 ChrX 152016799 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333858:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.58 104 T 0.41 74 178 C T chrX 158371881 + c 52421 rs5987244 ChrX 152017617 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732514:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.73 88 A 0.26 32 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158372699 + a 52422 rs5987245 ChrX 152019287 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732515:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.78 94 G 0.21 26 120 A 0.70 84 G 0.30 36 120 A 0.88 157 G 0.11 21 178 A G chrX 158374274 + a 52423 rs5987246 ChrX 152021501 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:335574:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 0.40 49 G 0.59 71 120 C 1.00 178 G 0.00 0 178 C G chrX 158376459 + g 52424 rs766420 ChrX 152022308 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333860:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.78 94 C 0.21 26 120 G 0.30 36 C 0.70 84 120 G 0.80 144 C 0.19 34 178 G C chrX 158377265 - g 52425 rs766419 ChrX 152022565 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:61938:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.78 94 C 0.21 26 120 T 0.30 36 C 0.70 84 120 T 0.80 144 C 0.19 34 178 T C chrX 158377522 - t 52426 rs2239466 ChrX 152022787 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333861:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.78 94 G 0.21 26 120 A 0.12 15 G 0.87 105 120 A 0.80 144 G 0.19 34 178 A G chrX 158377744 + g 52427 rs2239467 ChrX 152023198 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333862:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.78 94 G 0.21 26 120 A 0.39 47 G 0.60 73 120 A 0.80 144 G 0.19 34 178 A G chrX 158378154 + a 52428 rs2872817 ChrX 152026322 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333863:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.80 97 G 0.19 23 120 A 0.65 79 G 0.34 41 120 A 0.75 135 G 0.24 43 178 A G chrX 158382202 + a 52429 rs5945413 ChrX 152031655 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732516:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.80 97 T 0.19 23 120 A 0.05 6 T 0.95 114 120 A 0.77 138 T 0.22 40 178 A T chrX 158458547 - t 52430 rs7891985 ChrX 152044654 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732517:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 0.39 47 C 0.60 73 120 T 1.00 178 C 0.00 0 178 T C chrX 158443359 - c 52431 rs2070819 ChrX 152046203 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333866:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.95 114 G 0.05 6 120 A 0.30 37 G 0.69 83 120 A 0.89 160 G 0.10 18 178 A G chrX 158441808 - g 52432 rs2070827 ChrX 152050607 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732518:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.95 114 A 0.05 6 120 G 0.43 52 A 0.56 68 120 G 0.89 160 A 0.10 18 178 G A chrX 158437336 - a 52433 rs2239469 ChrX 152052787 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732519:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.95 114 A 0.05 6 120 C 0.06 8 A 0.93 112 120 C 0.89 160 A 0.10 18 178 C A chrX 158435040 - a 52434 rs2070829 ChrX 152054067 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333868:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.95 114 C 0.05 6 120 G 0.91 110 C 0.08 10 120 G 0.89 160 C 0.10 18 178 G C chrX 158433761 - g 52435 rs5987247 ChrX 152054677 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732520:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 0.89 107 C 0.10 13 120 T 1.00 178 C 0.00 0 178 T C chrX 158433150 - t 52436 rs3819330 ChrX 152057804 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333869:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 178 C 0.00 0 178 T C chrX 158430047 - t 52437 rs7888047 ChrX 152059250 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732521:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 0.66 78 G 0.33 40 118 A 1.00 178 G 0.00 0 178 52438 rs12556583 ChrX 152061978 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732523:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 0.88 157 G 0.11 21 178 52439 rs2070817 ChrX 152064378 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732524:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.97 117 T 0.02 3 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.98 176 T 0.01 2 178 52440 rs6655285 ChrX 152069901 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971413:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 A 0.00 0 120 C 1.00 120 A 0.00 0 120 C 1.00 178 A 0.00 0 178 C A chrX 158417909 - c 52441 rs2000995 ChrX 152074197 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972949:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.00 0 C 1.00 120 120 T 0.00 0 C 1.00 120 120 T 0.00 0 C 1.00 178 178 T C chrX 158413587 - c 52442 rs6643847 ChrX 152074600 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972950:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158419553 + g 52443 rs2070818 ChrX 152077074 + ncbi_b34 sanger urn:lsid:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:lsid:sanger.hapmap.org:Assay:4244986:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 C 0.00 0 120 G 1.00 120 C 0.00 0 120 G 0.98 176 C 0.01 2 178 G C chrX 158410676 - g 52444 rs17428 ChrX 152077879 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:61939:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.80 97 T 0.19 23 120 C 0.70 78 T 0.29 32 110 C 0.76 136 T 0.23 42 178 C T chrX 158409870 - t 52445 rs736579 ChrX 152079886 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333873:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 1.00 178 G 0.00 0 178 52446 rs5945423 ChrX 152080287 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732525:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.80 97 C 0.19 23 120 G 0.16 20 C 0.83 100 120 G 0.76 136 C 0.23 42 178 G C chrX 158445224 + c 52447 rs3813457 ChrX 152094356 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333874:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.98 176 T 0.01 2 178 C T chrX 158461130 - c 52448 rs915941 ChrX 152094563 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:61940:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.95 114 C 0.05 6 120 A 0.28 34 C 0.71 86 120 A 0.89 160 C 0.10 18 178 A C chrX 158461338 + c 52449 rs2070820 ChrX 152094806 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333876:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 A 0.00 0 120 T 1.00 120 A 0.00 0 120 T 0.97 173 A 0.02 5 178 T A chrX 158461581 + t 52450 rs2070821 ChrX 152095212 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333878:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.95 114 C 0.05 6 120 T 0.28 34 C 0.71 86 120 T 0.89 160 C 0.10 18 178 T C chrX 158461986 + c 52451 rs915943 ChrX 152095411 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333879:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.80 97 C 0.19 23 120 G 0.00 0 C 1.00 120 120 G 0.76 136 C 0.23 42 178 G C chrX 158462185 + c 52452 rs17423 ChrX 152097577 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333880:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.99 119 T 8.0e-03 1 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 158464393 + c 52453 rs2283762 ChrX 152100111 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333882:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.95 114 G 0.05 6 120 T 0.37 45 G 0.62 75 120 T 0.89 160 G 0.10 18 178 52454 rs4898484 ChrX 152104775 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333885:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.95 114 G 0.05 6 120 C 0.13 16 G 0.86 104 120 C 0.89 160 G 0.10 18 178 C G chrX 158471595 + c 52455 rs2070807 ChrX 152105222 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333886:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.95 114 A 0.05 6 120 G 0.13 16 A 0.86 104 120 G 0.89 160 A 0.10 18 178 G A chrX 158472112 - g 52456 rs2070806 ChrX 152105651 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333887:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 158472541 - c 52457 rs4898492 ChrX 152109977 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333888:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.00 0 G 1.00 120 120 A 0.00 0 G 1.00 120 120 A 0.00 0 G 1.00 178 178 52458 rs5986977 ChrX 152110212 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214797:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.95 115 A 0.04 5 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158477180 + g 52459 rs17432 ChrX 152113948 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333889:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.99 119 T 8.0e-03 1 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 158480944 + c 52460 rs743548 ChrX 152118331 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333891:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.96 106 G 0.03 4 110 A 0.88 106 G 0.11 14 120 A 0.89 160 G 0.10 18 178 A G chrX 158485316 - a 52461 rs743549 ChrX 152118550 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333892:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.95 114 G 0.05 6 120 A 0.88 106 G 0.11 14 120 A 0.89 160 G 0.10 18 178 A G chrX 158485539 - a 52462 rs4898494 ChrX 152122030 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333893:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.95 114 T 0.05 6 120 A 0.88 106 T 0.11 14 120 A 0.91 162 T 0.09 16 178 52463 rs11156577 ChrX 152127945 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732526:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.94 113 C 0.05 7 120 T 0.50 61 C 0.49 59 120 T 0.98 176 C 0.01 2 178 T C chrX 158495948 + c 52464 rs3737557 ChrX 152127974 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333894:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.76 92 C 0.23 28 120 T 0.27 33 C 0.72 87 120 T 0.79 142 C 0.20 36 178 T C chrX 158495977 + t 52465 rs762514 ChrX 152143134 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732527:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.95 114 G 0.05 6 120 A 0.31 38 G 0.68 82 120 A 0.95 170 G 0.04 8 178 A G chrX 158511162 + g 52466 rs3788801 ChrX 152144201 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333899:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158512229 - g 52467 rs7886627 ChrX 152147509 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732528:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.95 114 G 0.05 6 120 A 0.49 59 G 0.50 61 120 A 0.91 162 G 0.09 16 178 A G chrX 158515548 + g 52468 rs4898496 ChrX 152150680 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971415:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 118 A 0.00 0 118 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158518764 + c 52469 rs7053956 ChrX 152153703 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971416:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 0.93 112 C 0.06 8 120 T 1.00 178 C 0.00 0 178 T C chrX 158521786 + t 52470 rs5987266 ChrX 152164152 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732531:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.81 98 C 0.18 22 120 G 0.11 14 C 0.88 106 120 G 0.90 161 C 0.09 17 178 G C chrX 158532231 + c 52471 rs5986981 ChrX 152165252 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732532:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.81 98 T 0.18 22 120 C 0.24 29 T 0.75 91 120 C 0.89 160 T 0.10 18 178 52472 rs5987267 ChrX 152167269 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732533:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.81 98 C 0.18 22 120 G 0.05 6 C 0.95 114 120 G 0.89 160 C 0.10 18 178 G C chrX 158535441 + t 52473 rs5945431 ChrX 152169620 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732535:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.81 98 G 0.18 22 120 A 0.39 47 G 0.60 73 120 A 0.89 159 G 0.10 19 178 A G chrX 158537794 + a 52474 rs7051335 ChrX 152171729 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971417:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 52475 rs12850928 ChrX 152173361 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972953:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 C 0.00 0 120 G 1.00 120 C 0.00 0 120 G 1.00 178 C 0.00 0 178 G C chrX 158541544 + g 52476 rs12392443 ChrX 152174688 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971418:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 0.93 112 G 0.06 8 120 C 1.00 178 G 0.00 0 178 C G chrX 158542889 + c 52477 rs4542114 ChrX 152177091 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732536:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.76 92 G 0.23 28 120 A 0.05 6 G 0.95 114 120 A 0.89 159 G 0.10 19 178 A G chrX 158545295 + g 52478 rs2315325 ChrX 152178442 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732537:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.81 98 G 0.18 22 120 T 0.03 4 G 0.96 116 120 T 0.89 159 G 0.10 19 178 T G chrX 158546648 + g 52479 rs11689 ChrX 152180281 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214798:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158548487 + g 52480 rs5945433 ChrX 152181931 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732539:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.81 98 T 0.18 22 120 G 0.04 5 T 0.95 115 120 G 0.89 158 T 0.10 18 176 G T chrX_random 30060476 - g 52481 rs11796433 ChrX 152185412 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214800:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX_random 30056182 - g 52482 rs5945435 ChrX 152185729 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732540:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.83 100 C 0.16 20 120 G 0.02 3 C 0.97 117 120 G 0.83 149 C 0.16 29 178 G C chrX_random 30056676 - g 52483 rs12392447 ChrX 152192250 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732541:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.83 100 A 0.16 20 120 G 0.02 3 A 0.97 117 120 G 0.83 149 A 0.16 29 178 G A chrX 158560465 + a 52484 rs5945195 ChrX 152193241 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732542:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.83 100 A 0.16 20 120 G 0.02 3 A 0.97 117 120 G 0.83 149 A 0.16 29 178 G A chrX 158561463 + a 52485 rs961142 ChrX 152197648 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972954:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 T 0.00 0 120 A 1.00 120 T 0.00 0 120 A 1.00 178 T 0.00 0 178 52486 rs5987270 ChrX 152199481 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971419:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.65 78 T 0.35 42 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 52487 rs12389256 ChrX 152202179 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732544:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 0.77 93 G 0.22 27 120 C 1.00 178 G 0.00 0 178 C G chrX 158570402 + g 52488 rs1009938 ChrX 152204189 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333904:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.00 0 T 1.00 120 120 G 0.00 0 T 1.00 120 120 G 0.00 0 T 1.00 178 178 52489 rs2315329 ChrX 152206812 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972955:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.00 0 A 1.00 120 120 C 0.00 0 A 1.00 120 120 C 0.00 0 A 1.00 178 178 52490 rs2315331 ChrX 152206814 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971420:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.00 0 T 1.00 120 120 G 0.00 0 T 1.00 120 120 G 0.00 0 T 1.00 178 178 52491 rs7053165 ChrX 152211426 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972956:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 158579668 + c 52492 rs5986873 ChrX 152212711 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971421:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.67 81 T 0.32 39 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 158580954 + c 52493 rs6643678 ChrX 152225180 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214802:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158593370 + g 52494 rs1050757 ChrX 152227409 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732545:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.83 100 G 0.16 20 120 A 0.01 2 G 0.98 118 120 A 0.86 153 G 0.14 25 178 A G chrX 158595613 - g 52495 rs2071429 ChrX 152228059 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214803:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.83 100 C 0.16 20 120 T 0.01 2 C 0.98 118 120 T 0.86 153 C 0.14 25 178 52496 rs1050828 ChrX 152231768 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732547:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.88 106 A 0.11 14 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158599879 - g 52497 rs762516 ChrX 152232214 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333908:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.83 100 T 0.16 20 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 158600325 + c 52498 rs743544 ChrX 152232717 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333909:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.98 118 T 0.01 2 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.51 91 T 0.48 87 178 C T chrX 158600847 - c 52499 rs2472393 ChrX 152238847 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732548:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.83 98 T 0.16 20 118 C 0.01 2 T 0.98 118 120 C 0.86 154 T 0.13 24 178 C T chrX 158607017 + t 52500 rs2472394 ChrX 152238902 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214804:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.86 104 A 0.13 16 120 C 0.85 103 A 0.14 17 120 C 0.93 166 A 0.06 12 178 C A chrX 158607072 + c 52501 rs2515910 ChrX 152239135 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214805:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 158607304 - c 52502 rs11797720 ChrX 152240990 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972958:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 178 C 0.00 0 178 T C chrX 158609154 + t 52503 rs4256746 ChrX 152246180 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971424:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158614346 + g 52504 rs6643680 ChrX 152249427 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971425:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 158617713 + c 52505 rs7887673 ChrX 152292450 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971426:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 118 A 0.00 0 118 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158628773 + g 52506 rs4898389 ChrX 152295188 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732549:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.83 100 G 0.16 20 120 A 0.03 4 G 0.96 116 120 A 0.86 154 G 0.13 24 178 A G chrX 158631512 + g 52507 rs7879049 ChrX 152297244 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732551:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.86 104 G 0.13 16 120 A 0.65 79 G 0.34 41 120 A 0.93 166 G 0.06 12 178 52508 rs7053878 ChrX 152301651 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333910:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 A 0.00 0 120 T 0.98 118 A 0.01 2 120 T 0.87 155 A 0.12 23 178 52509 rs12008793 ChrX 152308752 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971427:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 C 0.00 0 120 G 1.00 120 C 0.00 0 120 G 1.00 178 C 0.00 0 178 52510 rs5987002 ChrX 152344921 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971428:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.77 93 T 0.22 27 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 52511 rs4526543 ChrX 152345552 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732552:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.61 74 C 0.38 46 120 T 0.10 12 C 0.90 108 120 T 0.80 143 C 0.19 35 178 52512 rs10127172 ChrX 152352889 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732553:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.61 74 T 0.38 46 120 C 0.02 3 T 0.97 117 120 C 0.80 141 T 0.19 35 176 C T chrX_random 30259429 + c 52513 rs5945222 ChrX 152354755 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732554:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.61 74 T 0.38 46 120 C 0.02 3 T 0.97 117 120 C 0.80 143 T 0.19 35 178 C T chrX_random 30261297 + t 52514 rs5945223 ChrX 152355221 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732555:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.61 74 T 0.38 46 120 G 0.09 11 T 0.90 109 120 G 0.80 143 T 0.19 35 178 G T chrX_random 30261764 + g 52515 rs5945224 ChrX 152355686 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732556:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.61 74 A 0.38 46 120 G 0.02 3 A 0.97 117 120 G 0.80 143 A 0.19 35 178 G A chrX_random 30262224 + g 52516 rs5987005 ChrX 152360418 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732557:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.61 74 C 0.38 46 120 T 0.02 3 C 0.97 117 120 T 0.80 143 C 0.19 35 178 T C chrX_random 30266962 + c 52517 rs3813455 ChrX 152371686 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333914:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.95 114 G 0.05 6 120 C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 0.93 167 G 0.06 11 178 C G chrX_random 30278327 + c 52518 rs4431759 ChrX 152372024 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333915:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.61 74 T 0.38 46 120 C 0.02 3 T 0.97 117 120 C 0.80 143 T 0.19 35 178 C T chrX_random 30278660 + t 52519 rs4131998 ChrX 152374608 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333916:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.00 0 T 1.00 120 120 C 0.00 0 T 1.00 120 120 C 0.00 0 T 1.00 178 178 C T chrX_random 30281344 - c 52520 rs5945109 ChrX 152375300 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732559:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.61 74 G 0.38 46 120 A 0.02 3 G 0.97 117 120 A 0.80 143 G 0.19 35 178 A G chrX_random 30282036 + g 52521 rs5987011 ChrX 152376383 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732560:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.61 74 A 0.38 46 120 G 0.04 5 A 0.95 115 120 G 0.80 143 A 0.19 35 178 52522 rs4898392 ChrX 152384024 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971429:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 52523 rs6571262 ChrX 152387809 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333917:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.38 46 A 0.61 74 120 C 0.97 117 A 0.02 3 120 C 0.19 35 A 0.80 143 178 C A chrX 158786958 + a 52524 rs925293 ChrX 152392094 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333918:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158791269 - g 52525 rs6643690 ChrX 152393979 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732561:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 0.53 96 C 0.46 82 178 T C chrX 158793155 + t 52526 rs885348 ChrX 152394977 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333919:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 T 0.00 0 120 A 1.00 120 T 0.00 0 120 A 1.00 178 T 0.00 0 178 A T chrX 158794153 + a 52527 rs884840 ChrX 152395582 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333920:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.38 46 A 0.61 74 120 G 0.97 117 A 0.02 3 120 G 0.19 35 A 0.80 143 178 G A chrX 158794758 - g 52528 rs7888328 ChrX 152395770 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214806:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 158794946 + c 52529 rs6643693 ChrX 152401775 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214808:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 52530 rs6643615 ChrX 152402949 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732562:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.38 46 T 0.61 74 120 C 0.97 117 T 0.02 3 120 C 0.19 35 T 0.80 143 178 C T chrX 158801986 + c 52531 rs4568767 ChrX 152403412 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214809:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 A G chrX 158802449 + a 52532 rs2664169 ChrX 152407214 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333922:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.30 37 C 0.69 83 120 T 0.25 30 C 0.75 90 120 T 0.14 26 C 0.85 152 178 T C chrX 158806253 + c 52533 rs6643696 ChrX 152410172 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732563:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.72 87 A 0.27 33 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158809214 + a 52534 rs6571263 ChrX 152411781 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333923:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.72 87 T 0.27 33 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 158810829 + c 52535 rs2664170 ChrX 152413153 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732564:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.31 38 A 0.68 82 120 G 0.55 67 A 0.44 53 120 G 0.16 30 A 0.83 148 178 52536 rs5987015 ChrX 152415532 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333924:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.31 38 A 0.68 82 120 G 0.53 64 A 0.46 56 120 G 0.16 30 A 0.83 148 178 G A chrX 158815247 + a 52537 rs2728526 ChrX 152416768 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333926:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.31 38 T 0.68 82 120 C 0.53 64 T 0.46 56 120 C 0.16 30 T 0.83 148 178 C T chrX 158816478 + t 52538 rs1848764 ChrX 152418093 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732565:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 A 0.00 0 120 T 0.77 93 A 0.22 27 120 T 1.00 178 A 0.00 0 178 T A chrX 158817801 - t 52539 rs4396057 ChrX 152421820 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972965:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 158821521 + c 52540 rs6643697 ChrX 152422840 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971430:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 0.99 119 G 8.0e-03 1 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 52541 rs7885619 ChrX 152428268 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971431:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 G 0.00 0 120 T 0.85 103 G 0.14 17 120 T 1.00 178 G 0.00 0 178 T G chrX 158827977 + t 52542 rs2728529 ChrX 152428747 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972967:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 C 0.00 0 120 A 1.00 120 C 0.00 0 120 A 1.00 178 C 0.00 0 178 A C chrX 158828456 + a 52543 rs2728725 ChrX 152431307 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732566:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.31 38 C 0.68 82 120 T 0.40 49 C 0.59 71 120 T 0.16 30 C 0.83 148 178 T C chrX 158830852 + t 52544 rs5987018 ChrX 152434953 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732567:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.99 119 A 8.0e-03 1 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158834874 + a 52545 rs2063320 ChrX 152436411 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333927:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.17 21 A 0.82 99 120 C 0.55 67 A 0.44 53 120 C 0.13 24 A 0.86 154 178 C A chrX 158836331 + a 52546 rs6571265 ChrX 152442234 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971432:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.00 0 G 1.00 120 120 T 0.01 2 G 0.98 118 120 T 0.00 0 G 1.00 178 178 52547 rs12390914 ChrX 152444236 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972968:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 0.99 119 G 8.0e-03 1 120 C 1.00 178 G 0.00 0 178 C G chrX 158844088 + g 52548 rs12389145 ChrX 152448569 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214810:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 A 0.00 0 120 C 1.00 118 A 0.00 0 118 C 1.00 178 A 0.00 0 178 52549 rs2063321 ChrX 152449676 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333928:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 T 0.00 0 120 A 0.75 91 T 0.24 29 120 A 1.00 178 T 0.00 0 178 A T chrX 158849516 + a 52550 rs12687233 ChrX 152450813 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971433:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 G 0.00 0 120 T 1.00 120 G 0.00 0 120 T 1.00 178 G 0.00 0 178 T G chrX 158850642 + t 52551 rs5987019 ChrX 152456120 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972969:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 118 A 0.00 0 118 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158855687 + g 52552 rs5987020 ChrX 152458286 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732568:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 0.77 93 G 0.22 27 120 C 1.00 178 G 0.00 0 178 C G chrX 158857850 + g 52553 rs2853347 ChrX 152461788 + ncbi_b34 bcm urn:LSID:bcm.hapmap.org:Protocol:genotype_0002:1 urn:LSID:bcm.hapmap.org:Assay:181324:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 A 0.00 0 120 C 1.00 120 A 0.00 0 120 C 1.00 178 A 0.00 0 178 C A chrX 158861394 + c 52554 rs2728533 ChrX 152464155 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333930:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 118 A 0.00 0 118 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158863755 + g 52555 rs2853350 ChrX 152465067 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214812:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158864342 + g 52556 rs2728726 ChrX 152466630 + ncbi_b34 sanger urn:lsid:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:lsid:sanger.hapmap.org:Assay:4245660:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 A 0.00 0 120 C 1.00 120 A 0.00 0 120 C 1.00 178 A 0.00 0 178 C A chrX 158865885 + c 52557 rs2853355 ChrX 152469069 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214813:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 178 C 0.00 0 178 52558 rs3752356 ChrX 152472105 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333932:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.93 167 A 0.06 11 178 G A chrX 158870643 + g 52559 rs7064090 ChrX 152472206 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732569:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 T 0.00 0 120 G 1.00 120 T 0.00 0 120 G 1.00 178 T 0.00 0 178 G T chrX 158870744 + g 52560 rs2728729 ChrX 152476898 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732570:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.29 35 G 0.70 85 120 A 0.72 87 G 0.27 33 120 A 0.17 31 G 0.82 147 178 A G chrX 158875527 + a 52561 rs5987026 ChrX 152479672 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732571:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 0.70 85 C 0.29 35 120 T 1.00 178 C 0.00 0 178 T C chrX 158878519 + c 52562 rs5945238 ChrX 152480060 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972970:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.90 108 T 0.10 12 120 C 0.83 100 T 0.16 20 120 C 0.91 163 T 0.08 15 178 52563 rs5987027 ChrX 152481658 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971435:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.70 85 T 0.29 35 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 52564 rs5987028 ChrX 152484334 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972971:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX_random 30357252 - g 52565 rs2221730 ChrX 152486634 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333933:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.26 32 G 0.73 88 120 A 0.80 96 G 0.20 24 120 A 0.15 27 G 0.84 151 178 A G chrX 158885459 - a 52566 rs2664162 ChrX 152487665 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333935:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.26 32 T 0.73 88 120 G 0.80 96 T 0.20 24 120 G 0.15 27 T 0.84 151 178 G T chrX_random 30353923 + t 52567 rs2048294 ChrX 152490197 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333936:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.26 32 A 0.73 88 120 T 0.80 96 A 0.20 24 120 T 0.15 27 A 0.84 151 178 T A chrX 158889049 - t 52568 rs4898396 ChrX 152490369 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333937:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.73 88 A 0.26 32 120 C 0.33 40 A 0.66 80 120 C 0.84 151 A 0.15 27 178 C A chrX 158889215 + c 52569 rs1848762 ChrX 152490503 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:61946:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.26 32 A 0.73 88 120 C 0.78 94 A 0.21 26 120 C 0.14 26 A 0.85 150 176 C A chrX 158889348 - a 52570 rs2728538 ChrX 152492716 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333938:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.23 28 T 0.76 92 120 A 0.45 54 T 0.55 66 120 A 0.14 26 T 0.85 152 178 A T chrX_random 30348892 - t 52571 rs2664161 ChrX 152498561 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333939:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.22 27 G 0.77 93 120 A 0.82 99 G 0.17 21 120 A 0.14 26 G 0.85 152 178 52572 rs5945116 ChrX 152500284 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971436:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.90 108 T 0.10 12 120 A 0.96 116 T 0.03 4 120 A 0.94 168 T 0.05 10 178 A T chrX 158899173 + a 52573 rs5986883 ChrX 152503831 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971437:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 0.96 114 G 0.03 4 118 C 1.00 178 G 0.00 0 178 C G chrX 158902712 + c 52574 rs5986885 ChrX 152507778 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972973:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 0.95 115 G 0.04 5 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 A G chrX 158906590 + a 52575 rs7066562 ChrX 152511310 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333940:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 C 0.00 0 120 A 0.85 103 C 0.14 17 120 A 1.00 178 C 0.00 0 178 A C chrX 158913775 - c 52576 rs4065968 ChrX 152513638 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214815:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 178 C 0.00 0 178 T C chrX 158911410 - t 52577 rs10782375 ChrX 152516276 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971438:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.12 15 A 0.87 105 120 G 0.14 17 A 0.85 103 120 G 0.08 15 A 0.91 163 178 G A chrX 158908771 - a 52578 rs6643620 ChrX 152520733 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732572:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.30 36 A 0.70 84 120 G 0.91 110 A 0.08 10 120 G 0.19 34 A 0.80 144 178 G A chrX 158918275 + g 52579 rs1467061 ChrX 152524579 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333941:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.90 108 G 0.10 12 120 A 0.54 65 G 0.45 55 120 A 0.94 168 G 0.05 10 178 A G chrX 158922460 - g 52580 rs5945250 ChrX 152528254 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333942:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.77 93 T 0.22 27 120 G 0.17 21 T 0.82 99 120 G 0.88 158 T 0.11 20 178 G T chrX 158926112 + t 52581 rs5987041 ChrX 152529842 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732573:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.97 117 T 0.02 3 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 158927703 + t 52582 rs1050705 ChrX 152533042 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214816:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.27 33 A 0.72 87 120 G 0.92 111 A 0.07 9 120 G 0.12 23 A 0.87 155 178 52583 rs5987042 ChrX 152535519 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732574:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.93 112 A 0.06 8 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 158933410 + a 52584 rs5987043 ChrX 152537772 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732575:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 0.68 82 G 0.31 38 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 A G chrX 158935634 + a 52585 rs4898398 ChrX 152547790 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333944:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.87 105 A 0.12 15 120 G 0.80 96 A 0.20 24 120 G 0.93 167 A 0.06 11 178 G A chrX 158945808 + g 52586 rs12392769 ChrX 152551717 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972975:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 T 0.00 0 120 G 0.93 112 T 0.06 8 120 G 1.00 178 T 0.00 0 178 52587 rs4074307 ChrX 152559485 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333946:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.72 87 G 0.27 33 120 A 0.07 9 G 0.92 111 120 A 0.88 157 G 0.11 21 178 A G chrX 158990420 + g 52588 rs4898352 ChrX 152561352 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732577:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.27 33 A 0.72 87 120 T 0.92 111 A 0.07 9 120 T 0.11 21 A 0.88 157 178 T A chrX 158992287 + t 52589 rs4384155 ChrX 152561883 + ncbi_b34 sanger urn:lsid:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:lsid:sanger.hapmap.org:Assay:4249174:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.00 0 C 1.00 120 120 G 0.00 0 C 1.00 120 120 G 0.00 0 C 1.00 178 178 G C chrX 158992737 + c 52590 rs5945121 ChrX 152568343 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972977:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.00 0 T 1.00 120 120 C 8.0e-03 1 T 0.99 119 120 C 0.00 0 T 1.00 178 178 C T chrX_random 30476255 + t 52591 rs4394567 ChrX 152569923 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971442:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 A 0.00 0 120 C 1.00 120 A 0.00 0 120 C 1.00 178 A 0.00 0 178 C A chrX_random 30477831 + c 52592 rs5987056 ChrX 152570119 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972978:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.95 114 T 0.05 6 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX_random 30478027 + t 52593 rs5987057 ChrX 152570380 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732578:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 0.95 114 G 0.05 6 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 A G chrX_random 30478288 + g 52594 rs6643714 ChrX 152571541 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971443:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.35 43 T 0.64 77 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.19 35 T 0.80 143 178 C T chrX_random 30479450 + c 52595 rs1800291 ChrX 152580378 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:61948:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.15 18 C 0.84 100 118 G 0.69 83 C 0.30 37 120 G 0.05 10 C 0.94 168 178 52596 rs5987062 ChrX 152584659 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732579:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 T 0.00 0 120 G 0.95 114 T 0.05 6 120 G 1.00 178 T 0.00 0 178 G T chrX 159022775 + t 52597 rs5986893 ChrX 152589171 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971445:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 T 0.00 0 120 G 0.95 114 T 0.05 6 120 G 1.00 178 T 0.00 0 178 52598 rs12014480 ChrX 152589510 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972981:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.73 88 A 0.26 32 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 52599 rs7886299 ChrX 152596129 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732580:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.90 108 C 0.10 12 120 A 0.79 95 C 0.20 25 120 A 0.94 168 C 0.05 10 178 52600 rs5945258 ChrX 152605174 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732583:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.90 108 T 0.10 12 120 C 0.79 95 T 0.20 25 120 C 0.94 168 T 0.05 10 178 C T chrX 159046062 + c 52601 rs12397268 ChrX 152607169 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732584:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.95 114 T 0.05 6 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 159048039 + t 52602 rs5987072 ChrX 152609571 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732585:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 A 0.00 0 120 T 0.95 114 A 0.05 6 120 T 1.00 178 A 0.00 0 178 T A chrX 159050445 + g 52603 rs5987073 ChrX 152612773 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732586:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 0.95 114 G 0.05 6 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 A G chrX 159053643 + g 52604 rs5945264 ChrX 152614525 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732587:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.85 102 T 0.15 18 120 C 0.60 73 T 0.39 47 120 C 0.94 168 T 0.05 10 178 C T chrX 159055392 + t 52605 rs1857644 ChrX 152615261 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333948:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 G 0.00 0 120 T 1.00 120 G 0.00 0 120 T 1.00 178 G 0.00 0 178 T G chrX 159056128 - t 52606 rs7053448 ChrX 152615435 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333949:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.85 102 C 0.15 18 120 T 0.93 112 C 0.06 8 120 T 0.94 168 C 0.05 10 178 T C chrX 159056302 + t 52607 rs7058826 ChrX 152617214 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333950:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.90 108 T 0.10 12 120 C 0.95 115 T 0.04 5 120 C 0.94 168 T 0.05 10 178 C T chrX 159058080 + c 52608 rs1936645 ChrX 152620395 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732588:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.27 33 C 0.72 87 120 G 0.83 100 C 0.16 20 120 G 0.12 22 C 0.87 156 178 G C chrX 159061270 - g 52609 rs6571276 ChrX 152627850 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971447:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.22 27 A 0.77 93 120 G 0.24 29 A 0.75 91 120 G 0.12 22 A 0.87 156 178 52610 rs5945128 ChrX 152633165 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732589:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.83 100 C 0.16 20 120 T 0.55 67 C 0.44 53 120 T 0.92 164 C 0.07 14 178 T C chrX 159073945 + t 52611 rs5945269 ChrX 152641601 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971448:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.84 101 G 0.15 19 120 A 0.69 83 G 0.30 37 120 A 0.92 165 G 0.07 13 178 52612 rs5987077 ChrX 152646708 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732590:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.26 32 A 0.73 88 120 T 0.74 89 A 0.25 31 120 T 0.13 24 A 0.86 154 178 T A chrX 159086597 + t 52613 rs2096362 ChrX 152654556 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333952:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.26 32 G 0.73 88 120 A 0.59 71 G 0.40 49 120 A 0.13 24 G 0.86 154 178 52614 rs6643720 ChrX 152659960 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972985:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 G 0.00 0 120 T 1.00 120 G 0.00 0 120 T 1.00 178 G 0.00 0 178 T G chrX 159099992 + t 52615 rs1470586 ChrX 152660958 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732591:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.78 94 A 0.21 26 120 G 0.82 99 A 0.17 21 120 G 0.86 154 A 0.13 24 178 G A chrX 159100986 - g 52616 rs895747 ChrX 152661197 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333953:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.00 0 A 1.00 120 120 C 8.0e-03 1 A 0.99 119 120 C 0.00 0 A 1.00 178 178 C A chrX 159101225 - a 52617 rs1075950 ChrX 152661355 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333954:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.26 32 C 0.73 88 120 T 0.59 71 C 0.40 49 120 T 0.13 24 C 0.86 154 178 T C chrX 159101383 + t 52618 rs5987079 ChrX 152669674 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732592:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.26 32 G 0.73 88 120 A 0.47 57 G 0.52 63 120 A 0.13 24 G 0.86 154 178 A G chrX 159109800 + a 52619 rs2197761 ChrX 152671313 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972986:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 A 0.00 0 120 C 1.00 120 A 0.00 0 120 C 1.00 178 A 0.00 0 178 C A chrX 159111460 - c 52620 rs4898404 ChrX 152673773 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971451:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.00 0 C 1.00 120 120 T 8.0e-03 1 C 0.99 119 120 T 0.00 0 C 1.00 178 178 T C chrX 159113920 + c 52621 rs12859886 ChrX 152684222 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972987:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 C 0.00 0 120 A 1.00 120 C 0.00 0 120 A 1.00 178 C 0.00 0 178 A C chrX 159124685 + a 52622 rs12860228 ChrX 152684273 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971452:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 T 0.00 0 120 A 1.00 120 T 0.00 0 120 A 1.00 178 T 0.00 0 178 A T chrX 159124736 + a 52623 rs12836184 ChrX 152684329 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972988:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 178 C 0.00 0 178 T C chrX 159124792 + t 52624 rs2313058 ChrX 152686539 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971453:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.26 32 C 0.73 88 120 T 0.59 71 C 0.40 49 120 T 0.13 24 C 0.86 154 178 52625 rs5945277 ChrX 152687594 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972989:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 159128061 + g 52626 rs5945279 ChrX 152694780 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732593:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.78 94 T 0.21 26 120 C 0.69 83 T 0.30 37 120 C 0.86 154 T 0.13 24 178 C T chrX 159135313 + c 52627 rs5945134 ChrX 152696522 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732594:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.78 94 C 0.21 26 120 T 0.80 97 C 0.19 23 120 T 0.86 154 C 0.13 24 178 T C chrX 159137059 + t 52628 rs7881389 ChrX 152701138 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732595:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.91 110 C 0.08 10 120 T 0.53 64 C 0.46 56 120 T 0.93 166 C 0.06 12 178 T C chrX 159141678 - t 52629 rs1448032 ChrX 152703119 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732596:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.91 110 T 0.08 10 120 C 0.65 79 T 0.34 41 120 C 0.93 166 T 0.06 12 178 C T chrX 159143668 - c 52630 rs5945282 ChrX 152704705 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732597:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.64 77 A 0.35 43 120 G 0.00 0 A 1.00 120 120 G 0.79 141 A 0.20 37 178 52631 rs2051161 ChrX 152708165 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:61949:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.65 78 G 0.35 42 120 C 0.03 4 G 0.96 116 120 C 0.75 134 G 0.24 44 178 52632 rs4898408 ChrX 152708357 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732598:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.78 94 C 0.21 26 120 G 0.85 102 C 0.15 18 120 G 0.82 147 C 0.17 31 178 52633 rs5987084 ChrX 152711586 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971454:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 159152172 + c 52634 rs2000326 ChrX 152712445 - ncbi_b34 bcm urn:LSID:bcm.hapmap.org:Protocol:genotype_0002:1 urn:LSID:bcm.hapmap.org:Assay:184302:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 159153029 - c 52635 rs12558406 ChrX 152718601 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972990:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.98 118 C 0.01 2 120 A 1.00 120 C 0.00 0 120 A 1.00 178 C 0.00 0 178 A C chrX 159159132 + a 52636 rs4515720 ChrX 152722787 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971455:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 159163321 + c 52637 rs3752329 ChrX 152722812 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732601:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 178 C 0.00 0 178 T C chrX 159163346 - t 52638 rs5945286 ChrX 152724992 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972991:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.91 110 T 0.08 10 120 C 0.83 100 T 0.16 20 120 C 0.93 166 T 0.06 12 178 C T chrX 159164968 + c 52639 rs12010372 ChrX 152726193 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971456:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 0.90 108 G 0.10 12 120 C 1.00 178 G 0.00 0 178 C G chrX 159166795 + c 52640 rs3850322 ChrX 152726556 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732602:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 0.90 109 G 0.09 11 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 A G chrX 159167158 + g 52641 rs3850324 ChrX 152728228 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972992:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 C 0.00 0 120 A 1.00 120 C 0.00 0 120 A 1.00 178 C 0.00 0 178 A C chrX 159168812 + a 52642 rs5986904 ChrX 152730141 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214817:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 G 0.00 0 120 T 0.75 91 G 0.24 29 120 T 1.00 178 G 0.00 0 178 52643 rs965691 ChrX 152730521 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732603:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.67 81 G 0.32 39 120 A 0.00 0 G 1.00 120 120 A 0.82 146 G 0.18 32 178 52644 rs5986906 ChrX 152733882 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214818:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.96 116 A 0.03 4 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 52645 rs5945287 ChrX 152736344 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732604:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.75 90 A 0.25 30 120 G 0.64 77 A 0.35 43 120 G 0.82 146 A 0.18 32 178 G A chr1 3529765 + a 52646 rs12839639 ChrX 152740038 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971457:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 C 0.00 0 120 G 1.00 120 C 0.00 0 120 G 1.00 178 C 0.00 0 178 G C chrX 159170890 + g 52647 rs11156589 ChrX 152747765 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732605:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.72 87 T 0.27 33 120 C 0.42 51 T 0.57 69 120 C 0.82 146 T 0.18 32 178 C T chrX 159178627 + t 52648 rs5945301 ChrX 152753582 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732606:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.77 93 T 0.22 27 120 C 0.63 76 T 0.36 44 120 C 0.82 146 T 0.18 32 178 52649 rs5945289 ChrX 152758998 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732607:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.77 93 G 0.22 27 120 T 0.43 52 G 0.56 68 120 T 0.82 146 G 0.18 32 178 52650 rs5945290 ChrX 152759827 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732608:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.95 114 T 0.05 6 120 C 0.79 95 T 0.20 25 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 52651 rs5945291 ChrX 152760305 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971459:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 52652 rs5986908 ChrX 152765250 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732609:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.72 87 C 0.27 33 120 G 0.36 44 C 0.63 76 120 G 0.82 146 C 0.18 32 178 G C chrX 159196443 + c 52653 rs4898358 ChrX 152766225 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732610:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.77 93 G 0.22 27 120 A 0.55 67 G 0.44 53 120 A 0.82 146 G 0.18 32 178 A G chrX 159197419 + a 52654 rs895744 ChrX 152768105 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732611:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.27 33 T 0.72 87 120 G 0.66 80 T 0.33 40 120 G 0.18 32 T 0.82 146 178 G T chrX 159199296 + g 52655 rs2290069 ChrX 152770581 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732612:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 0.98 175 G 0.01 3 178 A G chrX 159201773 + a 52656 rs4898413 ChrX 152771343 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732613:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.32 39 A 0.67 81 120 T 0.85 102 A 0.15 18 120 T 0.18 32 A 0.82 146 178 52657 rs9803473 ChrX 152776480 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214819:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 159207605 + g 52658 rs5945140 ChrX 152777944 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1214820:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.36 44 T 0.63 76 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.27 49 T 0.72 129 178 C T chrX 159209069 + c 52659 rs1128863 ChrX 152779176 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732614:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.95 114 G 0.05 6 120 A 0.75 91 G 0.24 29 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 52660 rs7879736 ChrX 152780382 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333956:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.72 87 T 0.27 33 120 C 0.35 43 T 0.64 77 120 C 0.82 146 T 0.18 32 178 52661 rs7472099 ChrX 152780462 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732615:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.32 39 G 0.67 81 120 A 0.85 102 G 0.15 18 120 A 0.18 32 G 0.82 146 178 52662 rs5986909 ChrX 152788732 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732616:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.27 33 T 0.72 87 120 G 0.63 76 T 0.36 44 120 G 0.18 33 T 0.81 145 178 G T chrX 159220771 + t 52663 rs6655063 ChrX 152790968 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971460:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 159222977 + c 52664 rs12395409 ChrX 152792723 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972996:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 C 0.00 0 120 A 1.00 120 C 0.00 0 120 A 1.00 178 C 0.00 0 178 52665 rs5945296 ChrX 152794241 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971461:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.32 38 G 0.67 78 116 A 0.92 111 G 0.07 9 120 A 0.15 27 G 0.84 151 178 A G chrX 159226250 + a 52666 rs5987089 ChrX 152797991 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972997:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.00 0 A 1.00 120 120 C 0.00 0 A 1.00 120 120 C 0.00 0 A 1.00 178 178 C A chrX 159230000 + a 52667 rs12384885 ChrX 152801402 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972998:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.25 30 A 0.75 90 120 C 0.90 108 A 0.10 12 120 C 0.21 38 A 0.78 140 178 52668 rs9699183 ChrX 152807532 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:972999:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.00 0 A 1.00 120 120 G 8.0e-03 1 A 0.99 119 120 G 0.00 0 A 1.00 178 178 52669 rs6642356 ChrX 152825120 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732617:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.22 27 T 0.77 91 118 C 0.70 85 T 0.29 35 120 C 0.21 38 T 0.78 140 178 C T chrX 159257120 + c 52670 rs6567793 ChrX 152830355 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:732618:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.24 29 G 0.75 91 120 A 0.98 118 G 0.01 2 120 A 0.19 34 G 0.80 144 178 A G chrX 159262391 + a 52671 rs7391214 ChrX 152831976 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:333957:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.05 7 C 0.94 113 120 T 0.30 36 C 0.70 84 120 T 0.01 2 C 0.98 176 178 T C chrX 159264012 + c