ID rs. chrom pos strand build center protLSID assayLSID panelLSID QC_code refallele refallele_freq_CEU refallele_count_CEU otherallele_CEU otherallele_freq_CEU otherallele_count_CEU totalcount_CEU refallele_YRI refallele_freq_YRI refallele_count_YRI otherallele_YRI otherallele_freq_YRI otherallele_count_YRI totalcount_YRI refallele_JC refallele_freq_JC refallele_count_JC otherallele_JC otherallele_freq_JC otherallele_count_JC totalcount_JC refallele_chimp otherallele_chimp chimpChrom chimpPos chimpStrand chimpAllele 41167 rs5958281 ChrX 121488026 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728029:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.61 74 T 0.38 46 120 C 0.27 33 T 0.72 87 120 C 0.29 52 T 0.70 126 178 C T chrX 126631879 + t 41168 rs6608112 ChrX 121490502 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728030:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.61 74 A 0.38 46 120 G 0.33 40 A 0.66 80 120 G 0.29 52 A 0.70 126 178 41169 rs12557170 ChrX 121496731 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1213262:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.70 85 T 0.29 35 120 C 0.95 115 T 0.04 5 120 C 0.62 112 T 0.37 66 178 C T chrX 126641013 + c 41170 rs12559418 ChrX 121497317 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1213263:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 1.00 118 G 0.00 0 118 A 1.00 178 G 0.00 0 178 A G chrX 126641600 + a 41171 rs695215 ChrX 121497893 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328578:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 118 T 0.00 0 118 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX_random 10943384 + c 41172 rs5958284 ChrX 121502551 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728031:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.61 74 T 0.38 46 120 C 0.33 40 T 0.66 80 120 C 0.29 53 T 0.70 125 178 C T chrX 126646940 + t 41173 rs2105889 ChrX 121503176 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328579:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.18 22 A 0.81 98 120 C 0.06 8 A 0.93 112 120 C 0.01 2 A 0.98 176 178 C A chrX 126647565 + a 41174 rs6648535 ChrX 121508067 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728033:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.65 79 T 0.34 41 120 C 0.89 107 T 0.10 13 120 C 0.29 53 T 0.70 125 178 C T chrX 126652464 + c 41175 rs12395206 ChrX 121513196 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:974470:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.90 109 A 0.09 11 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 41176 rs7890027 ChrX 121515686 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971579:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.97 117 T 0.02 3 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 126660094 + c 41177 rs5956568 ChrX 121516640 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:974471:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 0.90 108 C 0.10 12 120 T 1.00 178 C 0.00 0 178 41178 rs5911684 ChrX 121520356 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971580:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 G 0.00 0 120 T 1.00 120 G 0.00 0 120 T 1.00 178 G 0.00 0 178 41179 rs5910032 ChrX 121524726 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:970045:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 1.00 176 G 0.00 0 176 41180 rs6649064 ChrX 121527824 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971581:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 C 0.00 0 120 A 1.00 120 C 0.00 0 120 A 1.00 178 C 0.00 0 178 A C chrX 126672246 + a 41181 rs956373 ChrX 121529064 + ncbi_b34 broad urn:LSID:affymetrix.hapmap.org:Protocol:genotype_protocol_1:1 urn:LSID:affymetrix.hapmap.org:Assay:3004634:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 A 0.00 0 120 T 0.96 116 A 0.03 4 120 T 1.00 178 A 0.00 0 178 T A chrX 126673488 + t 41182 rs5911690 ChrX 121531250 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:974473:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.97 117 T 0.02 3 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 126676086 + c 41183 rs5958286 ChrX 121532491 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:970046:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 A 0.00 0 120 C 1.00 120 A 0.00 0 120 C 1.00 178 A 0.00 0 178 C A chrX 126677328 + c 41184 rs7063492 ChrX 121541220 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971582:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 C 0.00 0 120 A 1.00 120 C 0.00 0 120 A 1.00 178 C 0.00 0 178 A C chrX 126689138 + a 41185 rs5958287 ChrX 121541895 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:974474:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 118 T 0.00 0 118 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 126689809 + c 41186 rs12006860 ChrX 121544402 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:970047:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 T 0.00 0 120 G 1.00 120 T 0.00 0 120 G 1.00 178 T 0.00 0 178 G T chrX 126692356 + g 41187 rs5958290 ChrX 121555509 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971583:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.07 9 G 0.92 111 120 A 0.06 8 G 0.93 112 120 A 0.00 0 G 1.00 178 178 A G chrX 126704057 + g 41188 rs12380918 ChrX 121557360 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:974475:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 126705922 + g 41189 rs2982134 ChrX 121562794 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728034:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.65 79 T 0.34 41 120 C 0.77 93 T 0.22 27 120 C 0.29 53 T 0.70 125 178 C T chrX 126711372 + t 41190 rs2071752 ChrX 121563996 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328582:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.60 72 C 0.40 48 120 G 0.85 101 C 0.14 17 118 G 0.69 123 C 0.30 53 176 G C chrX 126712574 + g 41191 rs6648545 ChrX 121566852 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:970048:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chr10 52313735 + c 41192 rs10458343 ChrX 121567464 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971584:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 41193 rs3005856 ChrX 121570953 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728035:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.19 23 T 0.80 97 120 G 0.63 76 T 0.36 44 120 G 0.09 16 T 0.91 162 178 G T chrX 126716648 + g 41194 rs2982136 ChrX 121572206 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328583:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.19 23 C 0.80 97 120 G 0.54 65 C 0.45 55 120 G 0.09 16 C 0.91 162 178 G C chrX 126717899 + g 41195 rs6649074 ChrX 121574374 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728036:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.19 23 A 0.80 97 120 G 0.63 76 A 0.36 44 120 G 0.09 16 A 0.91 162 178 G A chrX_random 10999539 + g 41196 rs5956573 ChrX 121576988 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:970049:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.90 108 T 0.10 12 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX_random 11002146 + c 41197 rs2982139 ChrX 121577241 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971585:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.97 117 A 0.02 3 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX_random 11002399 + g 41198 rs12843968 ChrX 121586963 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:970050:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 G 0.00 0 120 T 1.00 120 G 0.00 0 120 T 1.00 178 G 0.00 0 178 41199 rs12837223 ChrX 121586965 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971586:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 1.00 178 G 0.00 0 178 41200 rs7886786 ChrX 121592272 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:970051:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.55 66 A 0.45 54 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 126738062 + g 41201 rs5910038 ChrX 121592589 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971587:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.86 104 T 0.13 16 120 G 0.92 109 T 0.07 9 118 G 0.99 177 T 6.0e-03 1 178 G T chrX 126738379 + g 41202 rs12863477 ChrX 121596266 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1213264:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 G 0.00 0 120 T 1.00 120 G 0.00 0 120 T 1.00 178 G 0.00 0 178 T G chrX 126742041 + t 41203 rs583 ChrX 121598729 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:61310:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.77 93 A 0.22 27 120 G 0.99 117 A 8.0e-03 1 118 G 1.00 176 A 0.00 0 176 41204 rs16293 ChrX 121599932 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1213265:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.77 93 A 0.22 27 120 G 0.99 119 A 8.0e-03 1 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 126745695 + g 41205 rs5958298 ChrX 121604681 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:974479:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.93 112 T 0.06 8 120 C 0.95 115 T 0.04 5 120 C 0.99 177 T 6.0e-03 1 178 C T chrX_random 11057154 + c 41206 rs2050002 ChrX 121605349 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328584:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 T 0.00 0 120 A 0.49 58 T 0.50 60 118 A 1.00 178 T 0.00 0 178 A T chrX_random 11057822 + a 41207 rs12850342 ChrX 121609497 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1213266:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 A 0.00 0 120 C 1.00 120 A 0.00 0 120 C 1.00 178 A 0.00 0 178 C A chrX_random 11061969 + c 41208 rs2982153 ChrX 121616930 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328587:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.89 107 A 0.10 13 120 G 0.99 119 A 8.0e-03 1 120 G 0.73 129 A 0.26 47 176 G A chr10 87008701 + g 41209 rs5958301 ChrX 121621823 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:970052:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 G 0.00 0 120 T 0.95 114 G 0.05 6 120 T 1.00 178 G 0.00 0 178 41210 rs3005869 ChrX 121624748 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971588:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.47 57 T 0.52 63 120 C 0.80 96 T 0.20 24 120 C 0.70 126 T 0.29 52 178 C T chrX 126767240 + c 41211 rs3005870 ChrX 121625837 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728038:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.47 57 G 0.52 63 120 T 0.79 95 G 0.20 25 120 T 0.70 126 G 0.29 52 178 41212 rs3005871 ChrX 121626283 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328588:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.12 15 T 0.87 105 120 C 0.00 0 T 1.00 120 120 C 0.23 42 T 0.76 134 176 41213 rs3005872 ChrX 121626595 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328589:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.47 57 G 0.52 63 120 A 0.79 95 G 0.20 25 120 A 0.70 126 G 0.29 52 178 41214 rs3021245 ChrX 121629509 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328592:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.12 15 G 0.87 105 120 A 8.0e-03 1 G 0.99 119 120 A 0.23 41 G 0.76 135 176 41215 rs7881691 ChrX 121633707 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328593:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.66 80 T 0.33 40 120 C 0.54 65 T 0.45 55 120 C 0.54 97 T 0.45 81 178 C T chrX_random 11116418 + t 41216 rs12011324 ChrX 121637330 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1213267:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.16 20 C 0.83 100 120 T 0.03 4 C 0.96 116 120 T 0.27 48 C 0.73 130 178 T C chrX_random 11169744 - c 41217 rs6608115 ChrX 121639616 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328594:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.90 108 A 0.10 12 120 G 0.35 43 A 0.64 77 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 41218 rs3124045 ChrX 121642594 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328595:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.26 32 A 0.73 88 120 G 0.73 88 A 0.26 32 120 G 0.25 46 A 0.74 132 178 41219 rs7878701 ChrX 121648286 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728042:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.90 108 T 0.10 12 120 C 0.51 62 T 0.48 58 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 41220 rs7880177 ChrX 121648964 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728043:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.90 108 G 0.10 12 120 A 0.51 62 G 0.48 58 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 41221 rs7062528 ChrX 121651137 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1213268:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.90 108 C 0.10 12 120 G 0.51 62 C 0.48 58 120 G 1.00 178 C 0.00 0 178 41222 rs3021235 ChrX 121654343 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1213269:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.55 66 A 0.45 54 120 T 0.53 63 A 0.46 55 118 T 0.70 125 A 0.29 53 178 T A chrX 126797844 + t 41223 rs3021238 ChrX 121656222 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328597:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.55 66 C 0.45 54 120 T 0.39 47 C 0.60 73 120 T 0.70 125 C 0.29 53 178 T C chrX 126799714 + c 41224 rs6608123 ChrX 121656918 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328598:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 0.70 84 G 0.30 36 120 C 1.00 178 G 0.00 0 178 C G chrX 126800410 + c 41225 rs3021239 ChrX 121657443 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728044:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.45 54 A 0.55 66 120 T 0.19 23 A 0.80 97 120 T 0.69 124 A 0.30 54 178 T A chrX 126800935 + t 41226 rs2355669 ChrX 121663747 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328599:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.80 96 C 0.20 24 120 T 0.70 84 C 0.30 36 120 T 0.71 128 C 0.28 50 178 T C chrX 126809848 + t 41227 rs11260451 ChrX 121664590 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728045:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.65 79 C 0.34 41 120 T 0.48 58 C 0.51 62 120 T 0.95 170 C 0.04 8 178 T C chrX 126808284 + t 41228 rs3005849 ChrX 121665083 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728046:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.63 76 C 0.36 44 120 T 0.48 58 C 0.51 62 120 T 0.94 169 C 0.05 9 178 T C chrX 126808777 + t 41229 rs7878958 ChrX 121687677 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728047:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.65 78 A 0.35 42 120 G 0.46 56 A 0.53 64 120 G 0.93 165 A 0.06 11 176 41230 rs5958318 ChrX 121690577 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728048:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.42 51 T 0.57 69 120 C 0.30 37 T 0.69 83 120 C 0.65 116 T 0.34 62 178 41231 rs1474593 ChrX 121693359 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728049:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.65 78 C 0.35 42 120 T 0.48 58 C 0.51 62 120 T 0.92 165 C 0.07 13 178 T C chrX_random 11332474 - t 41232 rs1474594 ChrX 121693472 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328601:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.65 78 C 0.35 42 120 T 0.47 57 C 0.52 63 120 T 0.92 165 C 0.07 13 178 T C chrX_random 11332361 - t 41233 rs10907134 ChrX 121696802 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728050:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.65 78 G 0.35 42 120 A 0.48 58 G 0.51 62 120 A 0.92 165 G 0.07 13 178 41234 rs5958321 ChrX 121702011 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728051:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.42 51 A 0.57 69 120 G 0.30 37 A 0.69 83 120 G 0.64 114 A 0.36 64 178 G A chrX 126843788 + a 41235 rs5958324 ChrX 121703302 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728052:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.65 78 T 0.35 42 120 A 0.48 58 T 0.51 62 120 A 0.92 165 T 0.07 13 178 A T chrX 126845102 + a 41236 rs6648551 ChrX 121706278 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728053:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.42 51 T 0.57 69 120 C 0.30 37 T 0.69 83 120 C 0.64 114 T 0.36 64 178 C T chrX 126848083 + t 41237 rs5958329 ChrX 121709656 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728054:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.95 114 T 0.05 6 120 C 0.76 92 T 0.23 28 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 126850466 + c 41238 rs7885634 ChrX 121712975 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:970053:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 178 C 0.00 0 178 T C chrX 126854314 + t 41239 rs7051810 ChrX 121716184 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328602:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.65 78 C 0.35 42 120 T 0.51 62 C 0.48 58 120 T 0.92 165 C 0.07 13 178 T C chrX 126857531 + c 41240 rs2355676 ChrX 121716872 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728055:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.65 78 G 0.35 42 120 A 0.51 62 G 0.48 58 120 A 0.92 165 G 0.07 13 178 A G chrX 126858220 + a 41241 rs7053219 ChrX 121726823 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:335211:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.77 93 A 0.22 27 120 G 0.85 103 A 0.14 17 120 G 0.71 127 A 0.28 51 178 G A chrX 126868221 + a 41242 rs5958338 ChrX 121731982 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728056:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.42 51 G 0.57 69 120 A 0.35 43 G 0.64 77 120 A 0.64 114 G 0.36 64 178 A G chrX 126873363 + g 41243 rs2269176 ChrX 121736790 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328604:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.77 93 G 0.22 27 120 C 0.85 103 G 0.14 17 120 C 0.71 127 G 0.28 51 178 C G chrX 126878161 + g 41244 rs2269177 ChrX 121736940 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328605:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.77 93 G 0.22 27 120 C 0.94 112 G 0.05 6 118 C 0.71 127 G 0.28 51 178 C G chrX 126878311 + c 41245 rs2269178 ChrX 121737020 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:335212:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.42 51 C 0.57 69 120 T 0.15 18 C 0.85 102 120 T 0.64 114 C 0.36 64 178 T C chrX 126878391 + c 41246 rs10521712 ChrX 121737667 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728057:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.65 78 T 0.35 42 120 A 0.50 61 T 0.49 59 120 A 0.92 165 T 0.07 13 178 A T chrX 126879038 - a 41247 rs9856 ChrX 121743396 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:61311:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.42 51 T 0.57 69 120 C 0.30 36 T 0.70 84 120 C 0.64 114 T 0.36 64 178 C T chrX 126884772 + t 41248 rs8371 ChrX 121743670 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328606:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.77 93 T 0.22 27 120 C 0.85 103 T 0.14 17 120 C 0.71 127 T 0.28 51 178 C T chrX 126885046 + t 41249 rs10521711 ChrX 121745681 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728058:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.77 93 A 0.22 27 120 C 0.85 103 A 0.14 17 120 C 0.71 127 A 0.28 51 178 C A chrX 126887052 - c 41250 rs5958346 ChrX 121748690 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728059:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.39 47 A 0.60 73 120 G 0.30 37 A 0.69 83 120 G 0.47 85 A 0.52 93 178 G A chrX 126890097 + a 41251 rs7892447 ChrX 121751644 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728060:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.77 93 G 0.22 27 120 A 0.80 97 G 0.19 23 120 A 0.71 127 G 0.28 51 178 A G chrX 126893341 + g 41252 rs5958347 ChrX 121754155 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328607:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.85 102 C 0.15 18 120 A 0.64 77 C 0.35 43 120 A 0.69 124 C 0.30 54 178 A C chrX 126895814 + c 41253 rs12687515 ChrX 121755297 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728061:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.83 100 G 0.16 20 120 A 0.65 78 G 0.35 42 120 A 0.71 128 G 0.28 50 178 A G chrX 126896956 + g 41254 rs11260453 ChrX 121759820 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728062:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.82 99 T 0.17 21 120 C 0.88 106 T 0.11 14 120 C 0.72 129 T 0.27 49 178 C T chrX 126902331 + t 41255 rs2064812 ChrX 121762014 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328608:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.82 99 A 0.17 21 120 G 0.40 48 A 0.60 72 120 G 0.72 129 A 0.27 49 178 G A chrX 126904523 + a 41256 rs5958357 ChrX 121769975 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728063:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.69 83 T 0.30 37 120 C 0.94 113 T 0.05 7 120 C 0.71 128 T 0.28 50 178 41257 rs5956593 ChrX 121774437 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728064:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.70 85 A 0.29 35 120 T 0.93 112 A 0.06 8 120 T 0.83 149 A 0.16 29 178 T A chrX 126916582 + a 41258 rs5958358 ChrX 121778749 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728065:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.70 85 G 0.29 35 120 T 0.79 95 G 0.20 25 120 T 0.83 149 G 0.16 29 178 41259 rs12837188 ChrX 121780756 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971589:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 1.00 178 G 0.00 0 178 41260 rs5910046 ChrX 121787956 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971590:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 41261 rs9781736 ChrX 121788755 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:974482:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 41262 rs12396518 ChrX 121789818 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:970055:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 1.00 118 G 0.00 0 118 C 1.00 178 G 0.00 0 178 41263 rs2224307 ChrX 121790023 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328609:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.85 102 C 0.15 18 120 T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 0.84 151 C 0.15 27 178 41264 rs5958364 ChrX 121803546 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728066:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.85 102 G 0.15 18 120 A 0.82 99 G 0.17 21 120 A 0.82 144 G 0.17 30 174 A G chrX 126945582 + g 41265 rs6649132 ChrX 121804252 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728067:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.85 102 G 0.15 18 120 C 0.82 99 G 0.17 21 120 C 0.82 144 G 0.17 30 174 C G chrX 126946316 + g 41266 rs199430 ChrX 121808138 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328610:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.85 102 T 0.15 18 120 A 0.50 60 T 0.50 60 120 A 0.82 146 T 0.18 32 178 A T chrX 126950198 + t 41267 rs5958366 ChrX 121808344 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728068:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 0.92 111 G 0.07 9 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 A G chrX 126950404 + g 41268 rs199431 ChrX 121808996 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728069:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 0.75 91 C 0.24 29 120 T 1.00 178 C 0.00 0 178 41269 rs725525 ChrX 121811100 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328612:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 126953161 + c 41270 rs4825497 ChrX 121811954 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1213270:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.84 101 G 0.15 19 120 A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 A G chrX 126954014 + a 41271 rs199421 ChrX 121814744 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328613:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 0.91 108 G 0.08 10 118 A 1.00 178 G 0.00 0 178 A G chrX 126956810 + a 41272 rs12856956 ChrX 121819614 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971591:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 A G chrX 126961678 + a 41273 rs12559968 ChrX 121822538 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:970056:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.92 111 C 0.07 9 120 T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 0.83 149 C 0.16 29 178 T C chrX 126964223 + t 41274 rs5958368 ChrX 121822689 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971592:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 0.96 116 G 0.03 4 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 A G chrX 126964374 + a 41275 rs199425 ChrX 121825415 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:970057:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 1.00 120 G 0.00 0 120 A 0.75 91 G 0.24 29 120 A 1.00 178 G 0.00 0 178 A G chrX 126967739 + a 41276 rs6649134 ChrX 121825792 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971593:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.85 102 G 0.15 18 120 A 0.82 99 G 0.17 21 120 A 0.83 146 G 0.17 30 176 41277 rs199427 ChrX 121831751 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328615:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.85 102 A 0.15 18 120 G 0.49 59 A 0.50 61 120 G 0.82 143 A 0.17 31 174 G A chrX 126974082 + a 41278 rs9779399 ChrX 121835007 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1213271:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.85 102 A 0.15 18 120 G 0.96 116 A 0.03 4 120 G 0.83 146 A 0.17 30 176 G A chrX 126977325 + g 41279 rs798870 ChrX 121836332 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328616:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.76 92 A 0.23 28 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 126978648 + g 41280 rs12844878 ChrX 121839395 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:1213272:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.93 110 T 0.06 8 118 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 126981723 + c 41281 rs2782444 ChrX 121845764 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:974485:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.00 0 T 1.00 120 120 A 0.23 28 T 0.76 92 120 A 0.00 0 T 1.00 178 178 A T chrX 126988143 + t 41282 rs12837381 ChrX 121846481 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:970058:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 178 C 0.00 0 178 T C chrX 126988862 + t 41283 rs10126765 ChrX 121849906 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971594:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 G 0.00 0 120 T 0.96 116 G 0.03 4 120 T 1.00 178 G 0.00 0 178 41284 rs1027515 ChrX 121852000 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:61313:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.26 32 C 0.73 88 120 G 0.80 95 C 0.19 23 118 G 0.50 89 C 0.49 87 176 G C chrX 126994354 - g 41285 rs1027514 ChrX 121852063 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328619:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.26 32 T 0.73 88 120 C 0.78 94 T 0.21 26 120 C 0.50 89 T 0.49 87 176 C T chrX 126994417 - c 41286 rs12394712 ChrX 121855477 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728070:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.92 111 T 0.07 9 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 126997847 + t 41287 rs1498498 ChrX 121857127 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328620:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.00 0 C 1.00 120 120 G 0.23 28 C 0.76 92 120 G 0.00 0 C 1.00 178 178 G C chrX 126999497 + c 41288 rs7049819 ChrX 121866254 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328621:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.85 102 G 0.15 18 120 A 0.96 116 G 0.03 4 120 A 0.83 146 G 0.17 30 176 A G chrX 127008605 + a 41289 rs12384210 ChrX 121872396 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:974486:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 41290 rs7879997 ChrX 121873445 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:970059:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 0.96 116 C 0.03 4 120 T 1.00 178 C 0.00 0 178 T C chrX 127015873 + t 41291 rs12847593 ChrX 121873868 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971595:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 127016294 + g 41292 rs5958377 ChrX 121875774 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728071:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.26 32 C 0.73 88 120 T 0.80 96 C 0.20 24 120 T 0.50 88 C 0.49 86 174 41293 rs3737191 ChrX 121880982 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328622:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 0.98 176 A 0.01 2 178 41294 rs2236535 ChrX 121881756 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328623:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 0.98 175 C 0.01 3 178 41295 rs7063522 ChrX 121881782 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728072:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 0.85 103 T 0.14 17 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 41296 rs6608141 ChrX 121885739 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328624:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.88 106 A 0.11 14 120 G 0.72 87 A 0.27 33 120 G 0.67 120 A 0.32 58 178 G A chrX 127028592 + g 41297 rs2297651 ChrX 121892790 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328625:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.85 102 C 0.15 18 120 A 0.82 99 C 0.17 21 120 A 0.82 144 C 0.17 30 174 A C chrX 127035431 + c 41298 rs5911742 ChrX 121895312 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728073:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.26 32 C 0.73 88 120 T 0.80 97 C 0.19 23 120 T 0.50 89 C 0.49 87 176 T C chrX 127037947 + t 41299 rs5956608 ChrX 121899790 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328626:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.85 102 C 0.15 18 120 A 0.80 97 C 0.19 23 120 A 0.83 146 C 0.17 30 176 A C chrX 127042432 + c 41300 rs5911744 ChrX 121902241 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728074:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.34 41 T 0.65 79 120 G 0.83 100 T 0.16 20 120 G 0.67 119 T 0.32 57 176 G T chrX 127044886 + g 41301 rs5911745 ChrX 121904759 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728075:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.00 0 T 1.00 120 120 A 0.23 28 T 0.76 92 120 A 0.00 0 T 1.00 178 178 A T chrX 127047476 + t 41302 rs4825499 ChrX 121905428 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:974487:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 T 0.00 0 120 G 1.00 120 T 0.00 0 120 G 1.00 178 T 0.00 0 178 G T chrX 127048145 + g 41303 rs5958385 ChrX 121910182 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728076:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.15 18 A 0.85 102 120 G 0.51 62 A 0.48 58 120 G 0.17 30 A 0.83 146 176 G A chrX 127053669 + g 41304 rs5910058 ChrX 121916274 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728077:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.88 106 G 0.11 14 120 T 0.71 86 G 0.28 34 120 T 0.66 119 G 0.33 59 178 T G chrX 127059827 + t 41305 rs4825883 ChrX 121921040 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728078:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.26 32 A 0.73 88 120 T 0.82 99 A 0.17 21 120 T 0.50 89 A 0.49 87 176 T A chrX 127064593 + t 41306 rs12843859 ChrX 121927548 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:970060:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 C 0.00 0 120 G 1.00 120 C 0.00 0 120 G 1.00 178 C 0.00 0 178 G C chrX 127071088 + g 41307 rs12833103 ChrX 121929466 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971596:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 120 T 0.00 0 120 C 1.00 178 T 0.00 0 178 C T chrX 127073007 + c 41308 rs3913241 ChrX 121931182 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728079:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.26 32 C 0.73 88 120 A 0.78 94 C 0.21 26 120 A 0.50 89 C 0.49 87 176 A C chrX 127074725 - a 41309 rs3913240 ChrX 121935208 - ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728080:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 0.15 18 A 0.85 102 120 T 0.50 60 A 0.50 60 120 T 0.18 32 A 0.82 146 178 T A chrX 127078822 - t 41310 rs5911758 ChrX 121942901 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:970061:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.00 0 G 1.00 120 120 A 0.00 0 G 1.00 120 120 A 0.00 0 G 1.00 178 178 A G chrX 127086509 + g 41311 rs12845276 ChrX 121943796 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971597:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 120 A 0.00 0 120 G 1.00 178 A 0.00 0 178 G A chrX 127087406 + g 41312 rs6608152 ChrX 121947263 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328627:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.85 102 T 0.15 18 120 C 0.82 99 T 0.17 21 120 C 0.83 146 T 0.17 30 176 C T chrX 127090892 + t 41313 rs5958390 ChrX 121948252 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728081:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ G 0.15 18 A 0.85 102 120 G 0.51 62 A 0.48 58 120 G 0.17 30 A 0.83 146 176 G A chrX 127091887 + g 41314 rs6655785 ChrX 121949262 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728082:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.85 102 T 0.15 18 120 A 0.89 107 T 0.10 13 120 A 0.82 147 T 0.17 31 178 41315 rs6608153 ChrX 121951861 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728083:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.26 32 C 0.73 88 120 A 0.80 96 C 0.20 24 120 A 0.51 91 C 0.48 85 176 41316 rs4825885 ChrX 121957285 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.0.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:328628:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.15 18 G 0.85 102 120 A 0.46 56 G 0.53 64 120 A 0.17 30 G 0.83 146 176 A G chrX 127101128 + a 41317 rs5910060 ChrX 121964740 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:974489:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 1.00 120 G 0.00 0 120 C 1.00 178 G 0.00 0 178 C G chrX 127108857 + c 41318 rs5911766 ChrX 121966178 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728084:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ C 0.73 88 T 0.26 32 120 C 0.44 53 T 0.55 67 120 C 0.47 83 T 0.52 93 176 C T chrX 127110326 + t 41319 rs5956616 ChrX 121974278 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:971598:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.73 88 G 0.26 32 120 A 0.46 56 G 0.53 64 120 A 0.48 87 G 0.51 91 178 A G chrX 127118477 + g 41320 rs1827045 ChrX 121976670 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:728085:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ T 1.00 120 C 0.00 0 120 T 0.99 119 C 8.0e-03 1 120 T 1.00 178 C 0.00 0 178 T C chrX 127120867 + t 41321 rs5958398 ChrX 121976769 + ncbi_b34 illumina urn:LSID:illumina.hapmap.org:Protocol:Golden_Gate_1.1.0:1 urn:LSID:illumina.hapmap.org:Assay:970063:1 urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 QC+ A 0.73 88 C 0.26 32 120 A 0.44 53 C 0.55 67 120 A 0.48 86 C 0.51 90 176 A C chrX 127120966 + c