FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
version 3.3t08 Jan. 17, 2001
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
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A1FXH8.1 A1FXH8_XANMA DNA repair protein RadC. ( 234) 604 713.6 1.2e-31 LINK:A1FXH8
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A1K4J9.1 A1K4J9_9RHOO DNA repair protein radC hom ( 225) 592 699.9 7.2e-31 LINK:A1K4J9
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Q0HE56.1 Q0HE56_SHESM DNA repair protein RadC. ( 225) 584 690.6 2.4e-30 LINK:Q0HE56
Q07WG1.1 Q07WG1_SHEFN DNA repair protein RadC. ( 225) 583 689.4 2.8e-30 LINK:Q07WG1
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A1REU4.1 A1REU4_9GAMM DNA repair protein RadC. ( 225) 579 684.8 5e-30 LINK:A1REU4
Q87F21.1 RADC_XYLFT DNA repair protein radC homol ( 224) 578 683.6 5.8e-30 LINK:Q87F21
Q0HZU3.1 Q0HZU3_SHESR DNA repair protein RadC. ( 225) 578 683.6 5.8e-30 LINK:Q0HZU3
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A0L1R9.1 A0L1R9_9GAMM DNA repair protein RadC. ( 225) 578 683.6 5.8e-30 LINK:A0L1R9
>>Q4QLV5.2 RADC_HAEI8 DNA repair protein radC homolog. (221 aa)
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:::::::::.::::::..::.:: .::::::::.:::.::::. ::::::. ::
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>>P44952.2 RADC_HAEIN DNA repair protein radC homolog. (221 aa)
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orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
:.: .::.:::::.::::::::::::::::::::::: :. :::::::::.:::::::::
P44952 LFLLTELQHEEREVFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTIYVSAVYPREIIKEALYCNAAALI
110 120 130 140 150 160
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:::::::::.::::::..::.:: .::::::::.:::.::::. ::::::. ::
P44952 LAHNHPSGITEPSYSDQLITKKIQDAAELMEIRVLDHLIVGKSDCYSFAENCLL
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>>Q3EDR0.1 Q3EDR0_ACTSC DNA repair protein. (220 aa)
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170 180 190 200 210 220
>>Q0I0X9.1 Q0I0X9_HAES1 DNA repair protein. (222 aa)
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10 20 30 40 50 60
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: :. :::::::::::. .:.:.::::::::::::.:::: ::. :
Q0I0X9 MTQQNTTLMPREKLLKYGASSLDDKELLAIFLRTGIKNCPVMQLSELV
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
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Q0I0X9 LAHFSSLRGLINADQKHFCQMKGLGITQFVQLQACTEMTKRYLLQELQFAQEFTSPDTVR
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q0I0X9 MYLQTELENKDREIFMVLFLDNQHRLIKKEEMFLGTINQANVYPREIIKTALFCNAAALI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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Q0I0X9 LAHNHPSGVSTPSMADRKMTENIKQLSELMEIRVLDHFIIGKGNYFSFAEQGWI
170 180 190 200 210 220
>>P57913.1 RADC_PASMU DNA repair protein radC homolog. (224 aa)
initn: 996 init1: 996 opt: 996 Z-score: 1169.8 bits: 223.7 E(): 4.8e-57
Smith-Waterman score: 996; 70.233% identity (70.233% ungapped) in 215 aa overlap (20-234:10-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
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P57913 MQNQVESLSLMPREKLLRFGAPALTDEELLAIFLRTGIKGCSVMQLSRHV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
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P57913 LQHFHSLRGLMSATQTEFCQLKGLGITQFIQLQACTEMSKRYLQEELKLTQAFKNSENVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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P57913 FYLQATLENKEREIFQVLFLDNQHRLIKQEEMFLGTINCTTIHPREIIKSALFCNAAALI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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P57913 LAHNHPSGNPEPSASDKMVTTKIQAAAELVEIRILDHFVIGKGCYYSFAENRLL
180 190 200 210 220
>>Q7VN51.1 RADC_HAEDU DNA repair protein radC homolog. (223 aa)
initn: 875 init1: 875 opt: 887 Z-score: 1043.1 bits: 200.3 E(): 5.5e-50
Smith-Waterman score: 887; 63.721% identity (63.721% ungapped) in 215 aa overlap (16-230:2-216)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
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Q7VN51 MTPSELMPREKLLTYGANALTDQELLAIFLRTGIKGLPVMQLANQV
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
: ::::::::.:: .:::..:::: ::::::::. ::::::: :.. . .... .
Q7VN51 LTTFGSLRALLTADLNAFCQIKGLGQTQFIQLQASKEMTKRYLAQQMQMCETINTPHLAI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q7VN51 MYFQTELEFEEREVFMVLFLDNQNRLIKKEKMFYGTINQATVHPREIIKEALKCNAAAII
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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Q7VN51 VAHNHPSGNCTASQADRQLTQKIKAACHLVEVRFVDHIIVGKGSYFSFEEERFHQNN
170 180 190 200 210 220
>>A0ITK5.1 A0ITK5_9ENTR DNA repair protein RadC. (227 aa)
initn: 781 init1: 781 opt: 788 Z-score: 927.8 bits: 179.0 E(): 1.5e-43
Smith-Waterman score: 788; 53.953% identity (53.953% ungapped) in 215 aa overlap (20-234:13-227)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
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A0ITK5 MSSQGITLWPDTLAPREKLLRYGASALSDAELLAIFLRTGFPGVHVMQLAEQL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
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A0ITK5 LEQFGSLYHLMSADHSVFCSHKGLGNSSYSQLQAISELAFRFFSSHLAQENAMLNPRMTQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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A0ITK5 HYLQSLLVHHEREVFLVLFLDNQHRVIRHQEMFAGTISSVVVYPREIVREALKANAAAII
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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A0ITK5 LAHNHPSGKAEPSHADRLITEQVVNACLLLEIRVLDHLVIGRGECVSFAERGWL
180 190 200 210 220
>>Q9KVC9.1 RADC_VIBCH DNA repair protein radC homolog. (224 aa)
initn: 773 init1: 773 opt: 778 Z-score: 916.3 bits: 176.8 E(): 6.4e-43
Smith-Waterman score: 778; 55.656% identity (56.164% ungapped) in 221 aa overlap (10-230:2-220)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
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Q9KVC9 MSLKQLPTES--MPREKLLQRGPQSLSDAELLAIFLRTGTQGMNVLALADLL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
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Q9KVC9 LRDFGSLRALFCASKEQFCRHKGLGEAKFVQLQAVLEMTQRYLAETLKRGDALTSPQQTK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q9KVC9 LYLSSVLRDRQREAFYILFLDNQHRVIRDEILFEGTIDAASVYPREVVKRALHHNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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Q9KVC9 LAHNHPSGVAEPSQADRRITDRLRDALGLVEIRVLDHFVVGDGEVVSFAERGWI
180 190 200 210 220
>>A1JHX2.1 A1JHX2_YEREN Putative DNA repair protein. (222 aa)
initn: 774 init1: 774 opt: 777 Z-score: 915.2 bits: 176.6 E(): 7.4e-43
Smith-Waterman score: 777; 52.582% identity (52.582% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:10-222)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
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A1JHX2 MEEWYGQVAPREKLLKYGAAVLTDAELLAIFLRTGIPGMHVMQMAEYL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
...:::: .:.::: .:.: ::.:.... :.:: .:.. : ....:. : :... ..
A1JHX2 IEEFGSLYGLISADYQALCAQKGIGVSKYSQIQAIAELAGRCFSSHLMQESVLQNPEITQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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A1JHX2 KFLQNILSHREREIFLVMFLDNQHRVIRHEEMFTGTISSVEIHPREIVREALKVNAAALI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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A1JHX2 LAHNHPSGKAEPSQADRLMTTQVIKACSLLDIRVLDHLVVGRGECVSFAERGWL
170 180 190 200 210 220
>>Q87T86.1 RADC_VIBPA DNA repair protein radC homolog. (224 aa)
initn: 770 init1: 770 opt: 770 Z-score: 907.0 bits: 175.1 E(): 2.1e-42
Smith-Waterman score: 770; 55.714% identity (55.714% ungapped) in 210 aa overlap (21-230:11-220)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::::. : .:: : :::::::::: .: :. :. .
Q87T86 MILKALPNESMPREKLLQRGPQALTDAELLAIFLRTGTQGMNVIELADFL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
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Q87T86 IQDFGSLRQLFSASEQEFCQHKGLGQAKYVQLQAVLEMTQRYLAETLKRGDALTSPEQTK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q87T86 LYLSSILRDRQREAFYILFLDNQHRVIKDEILFEGTLDAASVYPREVVKRALHHNAAALI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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Q87T86 LAHNHPSGVAEPSQADRRITRRLIDALALVDIRILDHFVIGDGESVSFAERGWI
180 190 200 210 220
>>Q7MPS7.1 RADC_VIBVY DNA repair protein radC homolog. (224 aa)
initn: 759 init1: 759 opt: 768 Z-score: 904.6 bits: 174.6 E(): 2.8e-42
Smith-Waterman score: 768; 54.299% identity (54.795% ungapped) in 221 aa overlap (10-230:2-220)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:: :. ..: :::::::. : ..: : :::::::::: .: :. :. .
Q7MPS7 MSLKNLPSES--MPREKLLQRGPQSLSDAELLAIFLRTGTQGMNVIELADFL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
:. ::::: :.:::...::. :::: ....::::. :::.::: . : .... . .:
Q7MPS7 LRDFGSLRKLFSADEQSFCRHKGLGQAKYVQLQAVLEMTQRYLAETLQRGDALTSPQHTK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q7MPS7 LYLSSMLRDRHREAFYVLFLDNQNRVIKDEVMFEGTIDAASVYPREVVKRALHYNAAALI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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Q7MPS7 LAHNHPSGVAEPSQADRRITRRLSDALGLVDIRVLDHFVVGDGEVVSFAERGWI
180 190 200 210 220
>>Q8DDY0.2 RADC_VIBVU DNA repair protein radC homolog. (224 aa)
initn: 759 init1: 759 opt: 768 Z-score: 904.6 bits: 174.6 E(): 2.8e-42
Smith-Waterman score: 768; 54.299% identity (54.795% ungapped) in 221 aa overlap (10-230:2-220)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:: :. ..: :::::::. : ..: : :::::::::: .: :. :. .
Q8DDY0 MSLKNLPSES--MPREKLLQRGPQSLSDAELLAIFLRTGTQGMNVIELADFL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
:. ::::: :.:::...::. :::: ....::::. :::.::: . : .... . .:
Q8DDY0 LRDFGSLRKLFSADEQSFCRHKGLGQAKYVQLQAVLEMTQRYLAETLQRGDALTSPQHTK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q8DDY0 LYLSSMLRDRHREAFYVLFLDNQNRVIKDEVMFEGTIDAASVYPREVVKRALHYNAAALI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
::::::::.:::: .:. ::... .: :..::.::::.:: : ::::.
Q8DDY0 LAHNHPSGVAEPSQADRRITRRLSDALGLVDIRVLDHFVVGDGEVVSFAERGWI
180 190 200 210 220
>>A0WF90.1 A0WF90_9GAMM DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 757 init1: 757 opt: 763 Z-score: 898.8 bits: 173.6 E(): 6e-42
Smith-Waterman score: 763; 53.991% identity (53.991% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::.. :. :: : :::::::::: .: .. :....
A0WF90 MSIKHWPEQERPREKLIQQGAGALSDSELLAIFLRTGTQGISAVELARQL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
: .::.::.:.::..: ::. ::: ... ::::. ::.::.:...:. : ::... :.
A0WF90 LAQFGGLRSLMSASREEFCQGLGLGDAKYTQLQAVLEMSKRHLQEQLMRETVFASAEHVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::...:.: ::.: :::::.:::::. ..::.:::... :::::..: .: ::::.:
A0WF90 TYLSSQLRHSPREVFAVLFLDTQHRLIRYQELFMGTIDAAAVYPREVVKAALQYNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
::::::::::::: .: ::.:: .: .:...:.::::.:: : :.::..:.
A0WF90 LAHNHPSGIAEPSQADISITDKIKRALDLVDVRLLDHFVVGDGLPVSLAERGLV
180 190 200 210 220
>>Q66GD6.1 RADC_YERPS DNA repair protein radC homolog. (222 aa)
initn: 758 init1: 758 opt: 761 Z-score: 896.6 bits: 173.1 E(): 8e-42
Smith-Waterman score: 761; 53.052% identity (53.052% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:10-222)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::::::. .: : ::::::::::: : :: ... .
Q66GD6 MDEWYGQVAPREKLLKYGAAVLTDAELLAIFLRTGIPGMHVMKMAEYL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
.. ::::..:.::: ...: ::.: ... :.:: :.. : ....:. : :. . . ..
Q66GD6 IETFGSLHGLISADYQTLCAHKGIGASKYSQIQAIGELACRCFSSHLMRESVLLNPGITQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
.:: : :.:::::.:.:::::::.:..:..: :::. ..:.::::..:.: ::::::
Q66GD6 KFLQNILSHREREIFLVVFLDNQHRVIRHEEMFTGTISSVEVHPREIVREALKVNAAALI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
:::::::: :::: .:..:: ..:.: :..::.:::..::.: : ::::.. :
Q66GD6 LAHNHPSGKAEPSQADRLITTQVIKACSLLDIRVLDHLVVGRGECVSFAERGWL
170 180 190 200 210 220
>>Q8ZJP3.1 RADC_YERPE DNA repair protein radC homolog. (222 aa)
initn: 758 init1: 758 opt: 761 Z-score: 896.6 bits: 173.1 E(): 8e-42
Smith-Waterman score: 761; 53.052% identity (53.052% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:10-222)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::::::. .: : ::::::::::: : :: ... .
Q8ZJP3 MDEWYGQVAPREKLLKYGAAVLTDAELLAIFLRTGIPGMHVMKMAEYL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
.. ::::..:.::: ...: ::.: ... :.:: :.. : ....:. : :. . . ..
Q8ZJP3 IETFGSLHGLISADYQTLCAHKGIGASKYSQIQAIGELACRCFSSHLMRESVLLNPGITQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
.:: : :.:::::.:.:::::::.:..:..: :::. ..:.::::..:.: ::::::
Q8ZJP3 KFLQNILSHREREIFLVVFLDNQHRVIRHEEMFTGTISSVEVHPREIVREALKVNAAALI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
:::::::: :::: .:..:: ..:.: :..::.:::..::.: : ::::.. :
Q8ZJP3 LAHNHPSGKAEPSQADRLITTQVIKACSLLDIRVLDHLVVGRGECVSFAERGWL
170 180 190 200 210 220
>>Q1C267.1 Q1C267_YERPA Putative DNA repair protein. (222 aa)
initn: 758 init1: 758 opt: 761 Z-score: 896.6 bits: 173.1 E(): 8e-42
Smith-Waterman score: 761; 53.052% identity (53.052% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:10-222)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::::::. .: : ::::::::::: : :: ... .
Q1C267 MDEWYGQVAPREKLLKYGAAVLTDAELLAIFLRTGIPGMHVMKMAEYL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
.. ::::..:.::: ...: ::.: ... :.:: :.. : ....:. : :. . . ..
Q1C267 IETFGSLHGLISADYQTLCAHKGIGASKYSQIQAIGELACRCFSSHLMRESVLLNPGITQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q1C267 KFLQNILSHREREIFLVVFLDNQHRVIRHEEMFTGTISSVEVHPREIVREALKVNAAALI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
:::::::: :::: .:..:: ..:.: :..::.:::..::.: : ::::.. :
Q1C267 LAHNHPSGKAEPSQADRLITTQVIKACSLLDIRVLDHLVVGRGECVSFAERGWL
170 180 190 200 210 220
>>Q0WKP3.1 Q0WKP3_YERPE Putative DNA repair protein. (222 aa)
initn: 758 init1: 758 opt: 761 Z-score: 896.6 bits: 173.1 E(): 8e-42
Smith-Waterman score: 761; 53.052% identity (53.052% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:10-222)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::::::. .: : ::::::::::: : :: ... .
Q0WKP3 MDEWYGQVAPREKLLKYGAAVLTDAELLAIFLRTGIPGMHVMKMAEYL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
.. ::::..:.::: ...: ::.: ... :.:: :.. : ....:. : :. . . ..
Q0WKP3 IETFGSLHGLISADYQTLCAHKGIGASKYSQIQAIGELACRCFSSHLMRESVLLNPGITQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q0WKP3 KFLQNILSHREREIFLVVFLDNQHRVIRHEEMFTGTISSVEVHPREIVREALKVNAAALI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
:::::::: :::: .:..:: ..:.: :..::.:::..::.: : ::::.. :
Q0WKP3 LAHNHPSGKAEPSQADRLITTQVIKACSLLDIRVLDHLVVGRGECVSFAERGWL
170 180 190 200 210 220
>>Q1CD02.1 Q1CD02_YERPN DNA repair protein. (222 aa)
initn: 758 init1: 758 opt: 761 Z-score: 896.6 bits: 173.1 E(): 8e-42
Smith-Waterman score: 761; 53.052% identity (53.052% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:10-222)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::::::. .: : ::::::::::: : :: ... .
Q1CD02 MDEWYGQVAPREKLLKYGAAVLTDAELLAIFLRTGIPGMHVMKMAEYL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
.. ::::..:.::: ...: ::.: ... :.:: :.. : ....:. : :. . . ..
Q1CD02 IETFGSLHGLISADYQTLCAHKGIGASKYSQIQAIGELACRCFSSHLMRESVLLNPGITQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
.:: : :.:::::.:.:::::::.:..:..: :::. ..:.::::..:.: ::::::
Q1CD02 KFLQNILSHREREIFLVVFLDNQHRVIRHEEMFTGTISSVEVHPREIVREALKVNAAALI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
:::::::: :::: .:..:: ..:.: :..::.:::..::.: : ::::.. :
Q1CD02 LAHNHPSGKAEPSQADRLITTQVIKACSLLDIRVLDHLVVGRGECVSFAERGWL
170 180 190 200 210 220
>>Q5E8M5.1 RADC_VIBF1 DNA repair protein radC homolog. (224 aa)
initn: 749 init1: 749 opt: 758 Z-score: 893.0 bits: 172.5 E(): 1.3e-41
Smith-Waterman score: 758; 54.299% identity (54.795% ungapped) in 221 aa overlap (10-230:2-220)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
::.:. .: :::::: : ..: : :::::::::: .: .. :. ..
Q5E8M5 MSLMNLPEES--RPREKLLALGPKSLTDAELLAIFLRTGTQGMNAIELADKL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
:..::::: :::.:.. ::. :::: ..: ::::..:::.::: ... : .... .:
Q5E8M5 LKEFGSLRKLLSSDENEFCSHKGLGTAKFAQLQAVVEMTERYLFEKIEKEDALTSPEHTK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q5E8M5 RYLTRMLRDRHREAFYVLFLDNQHRVLKGEILFEGTIDVAAVYPREVVKRSIDYNAAAII
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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Q5E8M5 LAHNHPSGVAEPSQADRRITKRISDAVELVDIRVLDHFVIGDGEIVSFAERGWI
180 190 200 210 220
>>Q1ZLM7.1 Q1ZLM7_9VIBR DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 739 init1: 739 opt: 748 Z-score: 881.4 bits: 170.3 E(): 5.6e-41
Smith-Waterman score: 748; 53.991% identity (53.991% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
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Q1ZLM7 MSLKQLPVASRPREKLLSHGSDALTDAELLAIFLRTGTQGMNALELATYL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
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Q1ZLM7 LDEFGSLRALLGAEKQIFCQFKGLGPAKFAQLQAVLALNERYLEETLKKDDVLTSPQNTR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
:: .:. ..:: :..::::::::.: : :: :::. ..:::::..:.:: ::::::
Q1ZLM7 RYLARKLRDKQREAFYILFLDNQHRVITGEVLFEGTIDCASVYPREVVKRSLELNAAALI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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Q1ZLM7 LAHNHPSGVAEPSQADRRITRKISDSLALVDIRVLDHFVVGDGEIISFTERGWL
180 190 200 210 220
>>P25531.3 RADC_ECOLI DNA repair protein radC. (222 aa)
initn: 734 init1: 734 opt: 742 Z-score: 874.5 bits: 169.0 E(): 1.4e-40
Smith-Waterman score: 742; 50.917% identity (51.152% ungapped) in 218 aa overlap (14-230:1-218)
10 20 30 40 50
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPL-MPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHS
:..:: : :::::.::.:. :: : ::::.::::: .: :..:..
P25531 MKNNSQLLMPREKMLKFGISALTDVELLALFLRTGTRGKDVLTLAKE
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
orf000 VLQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTV
.:..:::: .::... : : :.:.:...: ::.. .:...:: . .. : . . .
P25531 MLENFGSLYGLLTSEYEQFSGVHGIGVAKFAQLKGIAELARRYYNVRMREESPLLSPEMT
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
orf000 KLYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAAL
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P25531 REFLQSQLTGEEREIFMVIFLDSQHRVITHRRLFSGTLNHVEVHPREIIREAIKINASAL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
orf000 ILAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
::::::::: :::: .::.::..::.. ..:..:.:::...:.: ::::.
P25531 ILAHNHPSGCAEPSKADKLITERIIKSCQFMDLRVLDHIVIGRGEYVSFAERGWI
170 180 190 200 210 220
>>Q7MY28.1 RADC_PHOLL DNA repair protein radC homolog. (230 aa)
initn: 733 init1: 733 opt: 740 Z-score: 871.9 bits: 168.6 E(): 1.9e-40
Smith-Waterman score: 740; 50.704% identity (50.704% ungapped) in 213 aa overlap (18-230:14-226)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
: : :::::: :: .: : :::::::::: .: ::. ... .
Q7MY28 MGIDVAENTGEIYSNLAPREKLLAYGSVSLTDAELLAIFLRTGTRGLPVLRMAEFL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
:..:::: ::::: ..::. ::.:.... :::: .:..::....... : ..:. :...
Q7MY28 LKEFGSLYHLLSADYDTFCSHKGMGLAKYAQLQAIAELAKRFFSSQFMHEDIMSSPSVTQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q7MY28 EYLQNLLSGRDREIFVVLFLNNQNRVICHEEMFKGTINKVEVHPREIVRSAIKVNASSVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
:::::::: :::: .::..:.:.:.: .:. ...:::...:. : ::::.
Q7MY28 LAHNHPSGHAEPSLADKIVTDKVIDACNLVGVKVLDHLVIGRQCCVSFAERGWI
180 190 200 210 220 230
>>P65958.1 RADC_ECO57 DNA repair protein radC. (222 aa)
initn: 733 init1: 733 opt: 737 Z-score: 868.6 bits: 168.0 E(): 2.9e-40
Smith-Waterman score: 737; 50.459% identity (50.691% ungapped) in 218 aa overlap (14-230:1-218)
10 20 30 40 50
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPL-MPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHS
:..:. : :::::.::.:. :: : ::::.::::: .: :..:..
P65958 MKNNAQLLMPREKMLKFGISALTDVELLALFLRTGTRGKDVLTLAKE
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
orf000 VLQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTV
.:..:::: .::... : : :.:.:...: ::.. .:...:: . .. : . . .
P65958 MLENFGSLYGLLTSEYEQFSGVHGIGVAKFAQLKGIAELARRYYNVRMREESPLLSPEMT
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
orf000 KLYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAAL
. .::..: ::::::::.:::.:::.: . ::: ::.: ..:.:::::.:.. ::.::
P65958 REFLQSQLTGEEREIFMVIFLDSQHRVITHSRLFSGTLNHVEVHPREIIREAIKINASAL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
orf000 ILAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
::::::::: :::: .::.::..::.. ..:..:.:::...:.: ::::.
P65958 ILAHNHPSGCAEPSKADKLITERIIKSCQFMDLRVLDHIVIGRGEYVSFAERGWI
170 180 190 200 210 220
>>P65957.1 RADC_ECOL6 DNA repair protein radC. (222 aa)
initn: 733 init1: 733 opt: 737 Z-score: 868.6 bits: 168.0 E(): 2.9e-40
Smith-Waterman score: 737; 50.459% identity (50.691% ungapped) in 218 aa overlap (14-230:1-218)
10 20 30 40 50
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPL-MPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHS
:..:. : :::::.::.:. :: : ::::.::::: .: :..:..
P65957 MKNNAQLLMPREKMLKFGISALTDVELLALFLRTGTRGKDVLTLAKE
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
orf000 VLQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTV
.:..:::: .::... : : :.:.:...: ::.. .:...:: . .. : . . .
P65957 MLENFGSLYGLLTSEYEQFSGVHGIGVAKFAQLKGIAELARRYYNVRMREESPLLSPEMT
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
orf000 KLYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAAL
. .::..: ::::::::.:::.:::.: . ::: ::.: ..:.:::::.:.. ::.::
P65957 REFLQSQLTGEEREIFMVIFLDSQHRVITHSRLFSGTLNHVEVHPREIIREAIKINASAL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
orf000 ILAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
::::::::: :::: .::.::..::.. ..:..:.:::...:.: ::::.
P65957 ILAHNHPSGCAEPSKADKLITERIIKSCQFMDLRVLDHIVIGRGEYVSFAERGWI
170 180 190 200 210 220
>>P65959.1 RADC_SHIFL DNA repair protein radC. (222 aa)
initn: 733 init1: 733 opt: 737 Z-score: 868.6 bits: 168.0 E(): 2.9e-40
Smith-Waterman score: 737; 50.459% identity (50.691% ungapped) in 218 aa overlap (14-230:1-218)
10 20 30 40 50
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPL-MPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHS
:..:. : :::::.::.:. :: : ::::.::::: .: :..:..
P65959 MKNNAQLLMPREKMLKFGISALTDVELLALFLRTGTRGKDVLTLAKE
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
orf000 VLQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTV
.:..:::: .::... : : :.:.:...: ::.. .:...:: . .. : . . .
P65959 MLENFGSLYGLLTSEYEQFSGVHGIGVAKFAQLKGIAELARRYYNVRMREESPLLSPEMT
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
orf000 KLYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAAL
. .::..: ::::::::.:::.:::.: . ::: ::.: ..:.:::::.:.. ::.::
P65959 REFLQSQLTGEEREIFMVIFLDSQHRVITHSRLFSGTLNHVEVHPREIIREAIKINASAL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
orf000 ILAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
::::::::: :::: .::.::..::.. ..:..:.:::...:.: ::::.
P65959 ILAHNHPSGCAEPSKADKLITERIIKSCQFMDLRVLDHIVIGRGEYVSFAERGWI
170 180 190 200 210 220
>>Q31UY8.1 Q31UY8_SHIBS DNA repair protein. (224 aa)
initn: 733 init1: 733 opt: 737 Z-score: 868.6 bits: 168.0 E(): 2.9e-40
Smith-Waterman score: 737; 50.000% identity (50.228% ungapped) in 220 aa overlap (12-230:1-220)
10 20 30 40 50
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPL-MPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHS
.....:: : :::::.::.:. :: : ::::.::::: .: :..:..
Q31UY8 MKVKNNSQLLMPREKMLKFGISALTDVELLALFLRTGTRGKDVLTLAKE
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
orf000 VLQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTV
.:..:::: .::... : : :.:.:...: ::.. .:...:: . .. : . . .
Q31UY8 MLENFGSLYGLLTSEYEQFSGVHGIGVAKFAQLKGIAELARRYYNVRMREESPLLSPEMT
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
orf000 KLYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAAL
. .::..: ::::::::.:::.:::.: . ::: ::.: ..:.:::::.:.. ::.::
Q31UY8 REFLQSQLTGEEREIFMVIFLDSQHRVITHSRLFSGTLNHVEVHPREIIREAIKINASAL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
orf000 ILAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
::::::::: :::: .::.::..::.. ..:..:.:::...:.: ::::.
Q31UY8 ILAHNHPSGCAEPSKADKLITERIIKSCQFMDLRVLDHIVIGRGEYVSFAERGWI
170 180 190 200 210 220
>>Q6LVN4.1 RADC_PHOPR DNA repair protein radC homolog. (224 aa)
initn: 723 init1: 723 opt: 734 Z-score: 865.1 bits: 167.3 E(): 4.5e-40
Smith-Waterman score: 734; 56.338% identity (56.338% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::: :..:: : ::::::::::::: .. :. .
Q6LVN4 MSLKLLPEESRPREKLLTRGAKALSDAELLAIFLRTGIKGMNAVELATHL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
: .:::::::..::. :: :::: ... :::: ::..:.:.. : :... . ..
Q6LVN4 LAEFGSLRALFAADQTLFCLHKGLGPAKYAQLQAIIEMSQRHLEETLKEGDVLTSPQHTR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q6LVN4 HYLSQLLRDRQREVFYVLFLDNQHRVIAGEVLFEGTINSAAVYPREIVKRSLEFNAVALI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
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Q6LVN4 LAHNHPSGVAEPSQSDLRITRTISDALALVDIRVLDHFIVGDGEIVSFSEQGWL
180 190 200 210 220
>>Q1R4V4.1 Q1R4V4_ECOUT DNA repair protein. (224 aa)
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Smith-Waterman score: 733; 51.185% identity (51.185% ungapped) in 211 aa overlap (20-230:10-220)
10 20 30 40 50 60
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Q1R4V4 LENFGSLYGLLTSEYEQFSGVHGIGVAKFAQLKGIAELARRYYNVRMREESPLLSPEMTR
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orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q1R4V4 EFLQSQLTGEEREIFMVIFLDSQHRVITHSRLFSGTLNHVEVHPREIIREAIKINASALI
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Q1R4V4 LAHNHPSGCAEPSKADKLITERIIKSCQFMDLRVLDHIVIGRGEYVSFAERGWI
180 190 200 210 220
>>A1AHG9.1 A1AHG9_ECOK1 DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 733 init1: 733 opt: 733 Z-score: 863.9 bits: 167.1 E(): 5.3e-40
Smith-Waterman score: 733; 51.185% identity (51.185% ungapped) in 211 aa overlap (20-230:10-220)
10 20 30 40 50 60
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10 20 30 40 50
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A1AHG9 LENFGSLYGLLTSEYEQFSGVHGIGVAKFAQLKGIAELARRYYNVRMREESPLLSPEMTR
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orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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A1AHG9 EFLQSQLTGEEREIFMVIFLDSQHRVITHSRLFSGTLNHVEVHPREIIREAIKINASALI
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A1AHG9 LAHNHPSGCAEPSKADKLITERIIKSCQFMDLRVLDHIVIGRGEYVSFAERGWI
180 190 200 210 220
>>P65961.1 RADC_SALTI DNA repair protein radC. (221 aa)
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P65961 LQHFGSLYGLLSADFAQFRGVNGIGLAKFAQLKGIAELARRYYSVRMNEESALLSPEMTR
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P65961 EFLQSQLTGEEREIFLVIFLDAQHRVLQHSRLFSGTLNHVEVHPREIVREAIKLNASAVI
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P65961 LAHNHPSGCAEPSKADKLITERVIKCCQFMDIRVLDHLIIGRGEYVSFAERGWI
170 180 190 200 210 220
>>Q57IA4.1 RADC_SALCH DNA repair protein radC homolog. (221 aa)
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Smith-Waterman score: 732; 50.230% identity (50.230% ungapped) in 217 aa overlap (14-230:1-217)
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Q57IA4 MDTLDELLPREKMLRSGIASLSDVELLALFLRTGTPGKDVMTLAKEI
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Q57IA4 LQHFGSLYGLLSADFAQFRGVNGIGLAKFAQLKGIAELARRYYSVRMNEESALLSPEMTR
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orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q57IA4 EFLQSQLTGEEREIFLVIFLDAQHRVLQHSRLFSGTLNHVEVHPREIVREAIKLNASAVI
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Q57IA4 LAHNHPSGCAEPSKADKLITERVIKCCQFMDIRVLDHLIIGRGEYVSFAERGWI
170 180 190 200 210 220
>>P65960.1 RADC_SALTY DNA repair protein radC. (221 aa)
initn: 717 init1: 717 opt: 732 Z-score: 862.9 bits: 166.9 E(): 6e-40
Smith-Waterman score: 732; 50.230% identity (50.230% ungapped) in 217 aa overlap (14-230:1-217)
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P65960 MDTLDELLPREKMLRSGIASLSDVELLALFLRTGTPGKDVMTLAKEI
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P65960 LQHFGSLYGLLSADFAQFRGVNGIGLAKFAQLKGIAELARRYYSVRMNEESALLSPEMTR
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orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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P65960 EFLQSQLTGEEREIFLVIFLDAQHRVLQHSRLFSGTLNHVEVHPREIVREAIKLNASAVI
110 120 130 140 150 160
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P65960 LAHNHPSGCAEPSKADKLITERVIKCCQFMDIRVLDHLIIGRGEYVSFAERGWI
170 180 190 200 210 220
>>Q5PC30.1 RADC_SALPA DNA repair protein radC homolog. (221 aa)
initn: 715 init1: 715 opt: 730 Z-score: 860.5 bits: 166.5 E(): 8.2e-40
Smith-Waterman score: 730; 50.230% identity (50.230% ungapped) in 217 aa overlap (14-230:1-217)
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Q5PC30 MDTLDELLPREKMLRSGIASLSDVELLALFLRTGTPGKDVMTLAKEI
10 20 30 40
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Q5PC30 LQHFGSLYGLLSADFAQFRGVNGIGLAKFAQLKGIAELARRYYSVRMNEESALLSPEMTR
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q5PC30 EFLQSQLTGEEREIFLVIFLDVQHRVLQHSRLFSGTLNHVEVHPREIVREAIKLNASAVI
110 120 130 140 150 160
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orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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Q5PC30 LAHNHPSGCAEPSKADKLITERVIKCCQFMDIRVLDHLIIGRGEYVSFAERGWI
170 180 190 200 210 220
>>Q329L9.1 Q329L9_SHIDS DNA repair protein. (224 aa)
initn: 730 init1: 730 opt: 730 Z-score: 860.4 bits: 166.5 E(): 8.2e-40
Smith-Waterman score: 730; 50.711% identity (50.711% ungapped) in 211 aa overlap (20-230:10-220)
10 20 30 40 50 60
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::::::.::.:. :: : ::::.::::: .: :..:.. .
Q329L9 MKVKNNAQLLMPREKMLKFGISALTDVELLALFLRTGTRGKDVLTLAKEM
10 20 30 40 50
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:..:::: .::... : : :.:.:...: ::.. .:...:: . .. : . . ..
Q329L9 LENFGSLYGLLTSEYEQFSGVHGIGVAKFAQLKGIAELARRYYNVRMREESPLLSPEMTR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q329L9 EFLQSQLTGEEREIFMVIFLDSQHRVITHSRIFSGTLNHVEVHPREIIREAIKINASALI
120 130 140 150 160 170
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orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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Q329L9 LAHNHPSGCAEPSKADKLITERIIKSCQFMDLRVLDHIVIGRGEYVSFAERGWI
180 190 200 210 220
>>Q15ZW0.1 Q15ZW0_PSEA6 DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 722 init1: 722 opt: 729 Z-score: 859.3 bits: 166.3 E(): 9.6e-40
Smith-Waterman score: 729; 51.643% identity (51.643% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
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:::::: : .:: : ::::::::::::: .. :....
Q15ZW0 MKITQWPAHERPREKLLTQGPDALSDAELLAIFLRTGIKGLSAVDLARNL
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Q15ZW0 LNTFGSLRGLISASQQDFCLAKGLGEAKFVQLQASIELSQRFFAEQLQRETVFNSAQQTK
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orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q15ZW0 HFLIAQLRDEPNEVFGMLLLDSQHQLIKFRKMFFGTIDSASVYPRVLVKQALEDNAAAVI
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orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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Q15ZW0 LTHNHPSGVAEPSQADEHITARIISAMSLLDIKVLDHLVVGDGVAVSFAERGLI
180 190 200 210 220
>>Q0TBH1.1 Q0TBH1_ECOL5 DNA repair protein RadC. (214 aa)
initn: 728 init1: 728 opt: 728 Z-score: 858.4 bits: 166.0 E(): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 728; 50.952% identity (50.952% ungapped) in 210 aa overlap (21-230:1-210)
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Q0TBH1 MPREKMLKFGISALTDVELLALFLRTGTRGKDVLTLAKEM
10 20 30 40
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orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
:..:::: .::... : : :.:.:...: ::.. .:...:: . .. : . . ..
Q0TBH1 LENFGSLYGLLTSEYEQFSGVHGIGVAKFAQLKGIAELARRYYNVRMREESPLLSPEMTR
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q0TBH1 EFLQSQLTGEEREIFMVIFLDSQHRVITHSRLFSGTLNHVEVHPREIIREAIKINASALI
110 120 130 140 150 160
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orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
:::::::: :::: .::.::..::.. ..:..:.:::...:.: ::::.
Q0TBH1 LAHNHPSGCAEPSKADKLITERIIKSCQFMDLRVLDHIVIGRGEYVSFAERGWI
170 180 190 200 210
>>Q6DAV7.1 RADC_ERWCT DNA repair protein radC homolog. (221 aa)
initn: 718 init1: 718 opt: 722 Z-score: 851.2 bits: 164.7 E(): 2.7e-39
Smith-Waterman score: 722; 50.711% identity (50.711% ungapped) in 211 aa overlap (20-230:7-217)
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: :::::.. :.:.: : ::::::::::. : :: :....
Q6DAV7 MGWEKGLAPREKLVRLGAESLTDAELLAIFLRTGLPGVHVMQLAENL
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orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
: .:::: :..:.. :: ...:.::... :..: .:...: . ..: : .. . ..
Q6DAV7 LAQFGSLYQLMTAEQSAFHNARGVGISKYTQIKAIAELSRRLFFSRLAKEDAMLNPEATG
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orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::: : ..:::.:.::::::::..:.....:.:::: ..:.::::..:.: ::::::
Q6DAV7 QYLQLLLSRREREVFLVLFLDNQHHVIRHQEMFVGTINSVEVHPREIVREALKANAAALI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
:::::::: :::: .:. ::..:..: :.:::.:::...:.: ::::.
Q6DAV7 LAHNHPSGKAEPSQADRAITEQIVKACLLLEIRVLDHLVIGHGEFVSFAERGWI
170 180 190 200 210 220
>>Q2BHW0.1 Q2BHW0_9GAMM DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 709 init1: 709 opt: 716 Z-score: 844.2 bits: 163.5 E(): 6.7e-39
Smith-Waterman score: 716; 50.704% identity (50.704% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::: :. .: : ::::::::::.:: .. :....
Q2BHW0 MPITEWPAAERPREKLLLQGAATLSDAELLAIFLRTGVKGKSAVDLARDL
10 20 30 40 50
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orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
: .:::: :::..:.. ::...:::.... ::::. :: .::: . : .. . . ::
Q2BHW0 LLEFGSLSALLQSDQKCFCSANGLGVAKYAQLQAVLEMGRRYLTSVLEKGSALESPQQVK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
: ..:.: .::.: :::::.::.:. : :: ::::.. ::::::....:. ::.:..
Q2BHW0 ALLASQLRHYNREVFACLFLDNKHRVIQYENLFWGTINAAAVYPREIVSRALHHNAGAVV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
::::::::.:::: .:..:: :. .: :...:..::..:: : .::::...:
Q2BHW0 LAHNHPSGVAEPSDADEQITLKLQKALALVDVRVIDHMVVGDGEVFSFAEQGVL
180 190 200 210 220
>>A0Y2M4.1 A0Y2M4_9GAMM Associated with replication fork (224 aa)
initn: 709 init1: 709 opt: 716 Z-score: 844.2 bits: 163.5 E(): 6.7e-39
Smith-Waterman score: 716; 50.704% identity (50.704% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
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:::::.. :..:: : ::::::::::. : :. :.. .
A0Y2M4 MQLTSLPNAQRPREKLIEKGAKALSDAELLAIFLRTGLPGMNVIELAQHL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
:.. .:. :..:. . ::. :::: ....::::. :...::.... . ::.. :.:
A0Y2M4 LNENKTLHNLFNASMDEFCSQKGLGTAKYVQLQAVLELSQRYMQERCQRDAVFNSPSSVY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
:: ... ..:.::::.::.:.::.: : :: ::::...:::::..: .: ::::.:
A0Y2M4 DYLTIQMRGLQQEVFMVLYLDSQNRLVKDEILFYGTINAASVYPREVVKAALKNNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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A0Y2M4 FAHNHPSGIAEPSQADKLITNKLQQALQLVDINVLDHIIVGGETCVSFAERGLI
180 190 200 210 220
>>Q3JEI0.1 Q3JEI0_NITOC DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 715 init1: 715 opt: 715 Z-score: 843.0 bits: 163.2 E(): 7.7e-39
Smith-Waterman score: 715; 53.991% identity (53.991% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
::::::. : .:: : ::::::::::. : .. :.. .
Q3JEI0 MAITDWPVHERPREKLLQRGPNALSDAELLAIFLRTGVAGKTAVDLAREL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
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Q3JEI0 LESFGSLRALLEADLKQFCHAPGLGIAKYTQLQACLEMGRRHLEDTLKRGDVLTDPQTTQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q3JEI0 RYLVARLRAYPFEVFSCLFLDNRHRVLAFEELFRGTIDGASVHPREVLKRALAHNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
::::::::.:::: .:. :::.. :: :..::.:::.::: : ::::..::
Q3JEI0 LAHNHPSGVAEPSRADECITQRLKEALALVDIRVLDHIIVGDGETLSFAERGLL
180 190 200 210 220
>>Q9HTN5.1 RADC_PSEAE DNA repair protein radC homolog. (224 aa)
initn: 708 init1: 708 opt: 713 Z-score: 840.7 bits: 162.8 E(): 1e-38
Smith-Waterman score: 713; 50.235% identity (50.235% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
::::::. :. :: : ::::::::::. :: .. ::. .
Q9HTN5 MSIRDWPEAERPREKLLEQGAAALSDAELLAIFLRTGVTGCSAVELSRRL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
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Q9HTN5 LSEFGGLRALLEADLASFCGHLGLGVAKYAQLQAVLEMGRRHLAERLRRDSILESPQAVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q9HTN5 DYLKARLRHEQHEVFACLFLDTRHRVLSFEVLFQGSIDGASVYPRQVVKRTLAHNAAALI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
:.:::::: :.:: .:...: .. :: :...:.:::::.: : :.::.. :
Q9HTN5 LTHNHPSGDARPSLADRQLTARLKEALALIDVRVLDHFIIGDGEPLSLAEYGWL
180 190 200 210 220
>>Q02E43.1 Q02E43_PSEAB DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 707 init1: 707 opt: 712 Z-score: 839.5 bits: 162.6 E(): 1.2e-38
Smith-Waterman score: 712; 50.235% identity (50.235% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
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Q02E43 MSIRDWPEAERPREKLLEQGAAALSDAELLAIFLRTGVTGCSAVELSRRL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
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Q02E43 LSEFGGLRALLEADLASFCGHLGLGVAKYAQLQAVLEMGRRHLAERLRRDSILESPQAVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q02E43 DYLKARLRHEQHEVFACLFLDTRHRVLAFEVLFQGSIDGASVYPRQVVKRTLAHNAAALI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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Q02E43 LTHNHPSGDARPSLADRQLTARLKEALALIDVRVLDHFIIGDGEPLSLAEYGWL
180 190 200 210 220
>>A0KEM8.1 A0KEM8_AERHH DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 709 init1: 709 opt: 712 Z-score: 839.5 bits: 162.6 E(): 1.2e-38
Smith-Waterman score: 712; 51.643% identity (51.643% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
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A0KEM8 MSIKEWPEDERPREKLLRQGPGGLSDAELLAIFLRTGVSGLSAVDLSRHL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
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A0KEM8 LQQFGSLRALLGAEQRAFCAAHGLGPAKYAQLQAVLEMGKRHLAEQLQRGDPLTSPQLTR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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A0KEM8 DYLQAQLRDRPREVFALLLLDNQHRVIQFVELFYGTLDSASVWPREIVQIALKHNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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A0KEM8 LAHNHPSGVAEPSRADRQITDRITAALALIDIRVLDHLVIGDGITVSFAERGWL
180 190 200 210 220
>>Q3IFE5.1 Q3IFE5_PSEHT Associated with replication fork (224 aa)
initn: 703 init1: 703 opt: 710 Z-score: 837.2 bits: 162.2 E(): 1.6e-38
Smith-Waterman score: 710; 50.704% identity (50.704% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::.. :..:: : ::::::::::. : :. :.. .
Q3IFE5 MQLTSLPNSQRPREKLIEKGAKALSDAELLAIFLRTGLPGMNVIELAQHL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
:.. .:. :..:. : :: :::: ....::::. :...::.... . .:.. ..:
Q3IFE5 LNENKTLHNLFNASMEEFCAQKGLGTAKYVQLQAVLELSQRYMQERCQRDAIFNSPNAVY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
:: ... ..:.::::.::.:.:::: : :: :::: ..:::::..: .: ::::.:
Q3IFE5 DYLTLQMRGLQQEVFMVLYLDSQNRLIKDEILFYGTINSASVYPREVVKAALKNNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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Q3IFE5 FAHNHPSGIAEPSQADKLITNKLQQALQLVDINVLDHIIVGGETCVSFAERGLI
180 190 200 210 220
>>Q0A583.1 Q0A583_ALHEH DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 701 init1: 701 opt: 709 Z-score: 836.0 bits: 161.9 E(): 1.9e-38
Smith-Waterman score: 709; 52.113% identity (52.113% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
::::::. :. :: : :::::::::: .: .. :.. .
Q0A583 MAITDWPAGERPREKLLERGAGALSDAELLAIFLRTGRQGLSAVDLAREL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
:. ::.:: :: :: . :: ::: ..: ::::. ::..:.:. : ..... :
Q0A583 LEAFGGLRPLLEADLDRFCDHLGLGPAKFTQLQAVLEMARRHLHAGLERGEALTSPEQVA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q0A583 RYLTARLRHQSREIFACLFLDNRHRVVRYEELFQGTIDAASVYPREVVQRALAHNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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Q0A583 LAHNHPSGVAEPSVADQALTRRLQEALGLVDIRVLDHFVVGDGRPVSFAERGLM
180 190 200 210 220
>>A0Y9M2.1 A0Y9M2_9GAMM DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 693 init1: 693 opt: 693 Z-score: 817.4 bits: 158.5 E(): 2.1e-37
Smith-Waterman score: 693; 49.765% identity (49.765% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:: :::: :. .: : :::::::::: : .. :....
A0Y9M2 MAITDWPEAERPRGKLLKQGAASLSDAELLAIFLRTGTPGMTAVDLARQL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
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A0Y9M2 LQNFGGLRALLSASAEQFCQGRGLGLAKYTQLQAVMEMSHRNLYETLERSDCLTSSQLTR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
:: . :. ...: : ::::.:::.: . :: :::... .::::... . ::::.:
A0Y9M2 RYLLSCLRDKQHEQFACLFLDSQHRVIAFDTLFYGTIDAACIYPREVVRCCMQHNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
.:::::::::::: .:..::...:.: :...:.::::.:: :. ::::..::
A0Y9M2 FAHNHPSGIAEPSQADEQITRRLIDALVLIDVRVLDHFVVGDGVLVSFAERGLL
180 190 200 210 220
>>Q0SYG5.1 Q0SYG5_SHIF8 DNA repair protein. (209 aa)
initn: 689 init1: 689 opt: 692 Z-score: 816.7 bits: 158.3 E(): 2.3e-37
Smith-Waterman score: 692; 49.756% identity (49.756% ungapped) in 205 aa overlap (26-230:1-205)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
.::.:. :: : ::::.::::: .: :..:.. .
Q0SYG5 MLKFGISALTDVELLALFLRTGTRGKDVLTLAKEM
10 20 30
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
:..:::: .::... : : :.:.:...: ::.. .:...:: . .. : . . ..
Q0SYG5 LENFGSLYGLLTSEYEQFSGVHGIGVAKFAQLKGIAELARRYYNVRMREESPLLSPEMTR
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
.::..: ::::::::.:::.:::.: . ::: ::.: ..:.:::::.:.. ::.:::
Q0SYG5 EFLQSQLTGEEREIFMVIFLDSQHRVITHSRLFSGTLNHVEVHPREIIREAIKINASALI
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
:::::::: :::: .::.::..::.. ..:..:.:::...:.: ::::.
Q0SYG5 LAHNHPSGCAEPSKADKLITERIIKSCQFMDLRVLDHIVIGRGEYVSFAERGWI
160 170 180 190 200
>>A0HY16.1 A0HY16_PSEME DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 686 init1: 686 opt: 686 Z-score: 809.3 bits: 157.0 E(): 5.8e-37
Smith-Waterman score: 686; 50.239% identity (50.239% ungapped) in 209 aa overlap (22-230:12-220)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::: :. :: : ::::::::::. :: .. :.. .
A0HY16 MSIRDWPAAERPREKLLAQGAAALTDAELLAIFLRTGVAGCSAVDLARRL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
: .:::::::: :. : . ::: ... ::::. ::..:.: ..: . .. . ..:.
A0HY16 LAEFGSLRALLEAELPDFSQHLGLGPAKYAQLQAVLEMARRHLAERLRRDSALESPQAVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::.:.:.:: .:.: :::: .::.. : :: :.:. ..::::...:..: ::::.:
A0HY16 DYLKAQLRHEPHEVFGCLFLDAKHRVLAFEVLFRGSIDSASVYPRQVVKRALANNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
:.::::::. ::: .:...::.. .: :.:.:.::::::: : :.::
A0HY16 LTHNHPSGVCEPSQADRVLTQRLKDALALVEVRVLDHFIVGDGEPLSMAELGWM
180 190 200 210 220
>>Q4J1N2.1 Q4J1N2_AZOVI DNA repair protein RadC. (335 aa)
initn: 684 init1: 684 opt: 688 Z-score: 809.0 bits: 157.5 E(): 6e-37
Smith-Waterman score: 688; 51.174% identity (51.174% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:123-335)
10 20 30 40 50
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGC
::::::. :. :: : ::::::::::. :
Q4J1N2 AKIAQPRAGSSGAARQGGGMGIRDWPAAERPREKLLEQGASALSDAELLAIFLRTGVAGQ
100 110 120 130 140 150
60 70 80 90 100 110
orf000 PVMALSHSVLQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEH
.. :.. .:. ::.::::: ::. :: . ::: ..: ::::. ::..:.: ..: .
Q4J1N2 TAVDLARHLLNDFGGLRALLEADRAAFSRRLGLGPAKFAQLQAVLEMSRRHLAERLRRDP
160 170 180 190 200 210
120 130 140 150 160 170
orf000 VFSDTSTVKLYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKES
.. . ..:. ::.:.:.:: .:.: :::: .::.. : :: ::.. ..::::...:..
Q4J1N2 ALESPQAVRDYLKARLRHEPHEVFGCLFLDAKHRVLAFEVLFQGTVDGASVYPRQVLKRA
220 230 240 250 260 270
180 190 200 210 220 230
orf000 LYCNAAALILAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEH
: :::::::.::::::::::: .: .:... :: :...:.::::::: : :.::.
Q4J1N2 LAHNAAALILTHNHPSGIAEPSQADFSLTRRLKEALALVDVRVLDHFIVGDGEPLSMAEQ
280 290 300 310 320 330
orf000 NLL
. :
Q4J1N2 GWL
>>Q1N4C9.1 Q1N4C9_9GAMM DNA repair protein RadC. (223 aa)
initn: 673 init1: 673 opt: 685 Z-score: 808.1 bits: 156.8 E(): 6.8e-37
Smith-Waterman score: 685; 51.174% identity (51.415% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-223)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::: : .: : ::::::::::: : .. :....
Q1N4C9 MSIKHWPQDQQPREKLLANGPTSLSDFELLAIFLRTGIPGLSAVELARDL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
...::::. :... : ::.: ::: ....::::. ::.::.: . : . ::. ..:.
Q1N4C9 IRRFGSLKNLFGTPLEEFCQVPGLGPAKYVQLQAVLEMAKRHLYESLEKGEGFSSPDSVE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
:: .:.: .:.: :.:::::::: :.:: :::. ..:::::..:. : ::::.:
Q1N4C9 RYLAHQLKHLPHEVFACLYLDNQHRLIAFEELFRGTIDGASVYPREVVKQVLAHNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
.:::::::::::: :: ::... .: :...:.::::.:: :::....:
Q1N4C9 FAHNHPSGIAEPSDSDIRITKRLQDALALVDVRVLDHFVVGD-EVISFAQRGML
180 190 200 210 220
>>Q2Y740.1 Q2Y740_NITMU DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 677 init1: 677 opt: 685 Z-score: 808.1 bits: 156.8 E(): 6.8e-37
Smith-Waterman score: 685; 49.296% identity (49.296% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
::::::: : : : ::::::::::: : .. :.. .
Q2Y740 MSISDWPEAERPREKLLKNGPAYLSDAELLAIFLRTGIAGKSAVDLAREL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
:..: .: .:..::. :::.: :.: ..: ::::. ::..: :..:: .... . :.
Q2Y740 LKRFRGLTGLFAADQGAFCQVPGMGPAKFAQLQAVLEMARRALEEELKSSDAMDSPGPVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
.:. :. .:.:.:. .::: ..:.: :.:: ::.. :.:::::..:..:. ::::.:
Q2Y740 AFLRLSLEGKEHEVFVSIFLDARNRVIATEELFQGTLTQTSVYPREVVKRALHHNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
.::::::: ::::..: ..::.. .: :...:.:::::::.:. ::::..:.
Q2Y740 FAHNHPSGAAEPSHADAVLTQSLKQALLLVDVRVLDHFIVGRGATLSFAEQGLI
180 190 200 210 220
>>Q21EE6.1 Q21EE6_SACD2 DEAD/DEAH box helicase-like. (224 aa)
initn: 685 init1: 685 opt: 685 Z-score: 808.1 bits: 156.8 E(): 6.8e-37
Smith-Waterman score: 685; 50.718% identity (50.718% ungapped) in 209 aa overlap (22-230:12-220)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
::::::. :..:: : ::::::::::.:: .. :.. .
Q21EE6 MAITDWPIEERPREKLLNRGAHALSDAELLAIFLRTGVKGKSAVDLAREL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
: .::.:: :: :... ::...::: ..: ::::. ::..:.: : . ...:..::
Q21EE6 LAYFGGLRPLLEASQQDFCQAQGLGNAKFSQLQAVLEMSRRHLAAALEQKTSLTSTTAVK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
...:.:.:.. :.: ...:..:..::: .:: :::. ..:::::..: .: ::::.:
Q21EE6 QFVSAQLRHRQSEVFALILLNTQNQLIKFVELFNGTIDSASVYPREVVKTALSHNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
::::::::::::: :: ::... .: .:..:: :::..:: ::::.
Q21EE6 LAHNHPSGIAEPSEPDKAITKRLQQALQLVDIRTLDHLVVGDTEAVSFAERGWI
180 190 200 210 220
>>Q1YUT1.1 Q1YUT1_9GAMM DNA repair protein RadC. (217 aa)
initn: 643 init1: 643 opt: 684 Z-score: 807.1 bits: 156.6 E(): 7.7e-37
Smith-Waterman score: 684; 46.948% identity (46.948% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:5-217)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::. :. :: : ::::::::::. : .. :....
Q1YUT1 MNERPREKLILRGASALSDAELLAIFLRTGLPGITAIDLARDL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
...::.: ::.:.:. .:::.::.: ..:.::.:..:.:.:::...: . ::.. :
Q1YUT1 IKEFGGLGALISSDHTTFCKAKGVGTAKFVQLKASVELTRRYLQEQLEGQPVFTSPEKVG
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::..... .::.:..:.::..:.:: ..:: ::.....:.:::.. ..: ::::.:
Q1YUT1 DYLSVQMRDYKREVFVMLLLDSKHQLIDTHELFQGTVDAASVHPREVVARALRKNAAAVI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
.:::::::.:::: .: ::... .: .:.:::.:::.:.:.: :.:... :
Q1YUT1 VAHNHPSGLAEPSQADIDITRRLKQALNLVEIRLLDHLIIGRGEVVSLAQRGKL
170 180 190 200 210
>>Q2SN69.1 Q2SN69_HAHCH DNA repair protein. (224 aa)
initn: 681 init1: 681 opt: 681 Z-score: 803.4 bits: 155.9 E(): 1.2e-36
Smith-Waterman score: 681; 49.761% identity (49.761% ungapped) in 209 aa overlap (22-230:12-220)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::. .: : . ::::::.::: .: .. :....
Q2SN69 MPISDWPKADRPREKLIAHGSSKLSETELLAIFFRTGTRGRSAVDLARDT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
..:::.:: ::.:. : : .. ::: ..: ::::.::..::::.... : ... ..
Q2SN69 INHFGGLRPLLDASFEEFRQIPGLGEAKFTQLQAATELAKRYLQEKMQRSHNLTSPELTR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::.:.:.: :.: .::::::::.: :.:: :::. ..:.:::.... : ::::.:
Q2SN69 EYLSAHLRHYPYEVFAALFLDNQHRVIAYEELFRGTIDSASVHPREVVRRVLKHNAAAII
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
.:::::::.:::: ::: ::. . .: .:...:.:::.::: : :.::.
Q2SN69 FAHNHPSGVAEPSLSDKEITETLRKALRLVDVRVLDHMIVGDGEVVSLAERGWI
180 190 200 210 220
>>A1SR15.1 A1SR15_9GAMM DNA repair protein RadC. (225 aa)
initn: 679 init1: 679 opt: 680 Z-score: 802.3 bits: 155.7 E(): 1.4e-36
Smith-Waterman score: 680; 48.571% identity (48.571% ungapped) in 210 aa overlap (22-231:13-222)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
::::::. :. :: : :::::::::: .: :..::...
A1SR15 MTKLKDWPNQERPREKLLQKGTAALSDAELLAIFLRTGCRGVDVVTLSKQL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
:..::::.::..:.. ::. :::: ....::::. ::..:::.. : ....... .:
A1SR15 LSQFGSLHALFAASESDFCEKKGLGQAKYVQLQAVLEMSSRYLQEPLSKGNALTSAAQTK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
.: :..:. :.: ...::.:::.:. ...:.:.:. ..:.:: : .. : ::::.:
A1SR15 AFLIAKMHNLPYEVFAAILLDTQHRIIRFHEFFFGSIDCATVHPRIIAQKVLSENAAAII
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
:.:::::: : .::::::::. : .:...:.:::..::. : ::::..
A1SR15 LVHNHPSGDPSASEADKMITQKIVSALQLIDVRVLDHLVVGHKKCTSFAENGWI
180 190 200 210 220
>>Q3K4M8.1 Q3K4M8_PSEPF DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 672 init1: 672 opt: 672 Z-score: 793.0 bits: 154.0 E(): 4.7e-36
Smith-Waterman score: 672; 49.761% identity (49.761% ungapped) in 209 aa overlap (22-230:12-220)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::.::. : .: : ::::::::::. : .. :.. .
Q3K4M8 MSIRDWPAAERPRERLLEQGSASLSDAELLAIFLRTGVPGKSAVDLARHL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
:..::::: :: ::.::: : ::: ..: ::::. ::.::.: .. . .. . ..:.
Q3K4M8 LNQFGSLRLLLEADQEAFSKQLGLGPAKFAQLQAAQEMSKRHLAERSRQKTALENPQVVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::.. :.:: .:.: ::::..:... : :: :.:. : :.:::..:.:: ::::.:
Q3K4M8 DYLKVMLRHEPHEVFGCLFLDSKHQVLTFEALFRGSIDNTAVHPREVVKRSLANNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
: :::::: ..:: .:...:... .: ::...:.::::::: : :.::
Q3K4M8 LCHNHPSGNSDPSQADRLLTKRLQKALELIDVRVLDHFIVGDGEPLSMAECGWM
180 190 200 210 220
>>Q0AHY0.1 Q0AHY0_NITEC DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 664 init1: 664 opt: 671 Z-score: 791.8 bits: 153.8 E(): 5.5e-36
Smith-Waterman score: 671; 47.418% identity (47.418% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::.. :. .: : ::::::::::: : .. :....
Q0AHY0 MAISDWPEAERPREKLIQKGATVLSDAELLAIFLRTGITGKSAVELARNL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
: ::::: : .:. . : :. :.: ..: ::::. ::..: : .:: .... ..:.
Q0AHY0 LTHFGSLTKLCAANLHEFSKLPGMGPAKFAQLQAVMEMARRALAEELKSGDIMDSPQSVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::. : . .:.:. .::: .:: : :.:: ::.. ..:::::..:..:: ::::.:
Q0AHY0 SYLRLSLGGKPHEVFVGIFLDARHRTIMIEELFRGTLTQASVYPREVVKRALYHNAAAMI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
.:::::::.:::: .:.:.::.. .: :.....::::..:.. ::::..:.
Q0AHY0 FAHNHPSGVAEPSRADEMLTQSLKQALALVDVKVLDHFVIGNNETVSFAERGLI
180 190 200 210 220
>>Q4K3S4.1 Q4K3S4_PSEF5 DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 662 init1: 662 opt: 664 Z-score: 783.7 bits: 152.3 E(): 1.6e-35
Smith-Waterman score: 664; 49.048% identity (49.048% ungapped) in 210 aa overlap (22-231:12-221)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::.::. :. .: : ::::::::::. : .. :.. .
Q4K3S4 MSIRDWPAAERPRERLLEQGAISLSDAELLAIFLRTGVAGKSAVDLARHL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
:..::::: :: ::. .: . ::: ... :::. ::..:.: ..: . .. . .:.
Q4K3S4 LRRFGSLRRLLEADQLTFTRQLGLGPAKYALLQAVLEMARRHLAEKLHRQSALENPLVVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::.. :.:: .:.: ::::..::.. : :: :.:. :.::::..::..: ::::.:
Q4K3S4 DYLKSMLRHEPHEVFGCLFLDTRHRVLTFEVLFQGSIDSTTVYPRQVIKRALAHNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
: ::::::: ::: .:...:... :: ::...:.:::::::.: :.::..
Q4K3S4 LCHNHPSGICEPSPADRVVTRRLQEALELIDVRVLDHFIVGEGDPLSMAEYGWI
180 190 200 210 220
>>Q82UL9.1 RADC_NITEU DNA repair protein radC homolog. (224 aa)
initn: 656 init1: 656 opt: 663 Z-score: 782.5 bits: 152.0 E(): 1.8e-35
Smith-Waterman score: 663; 47.887% identity (47.887% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::.. :. :: : ::::::::::: : .. :....
Q82UL9 MAISDWPEAERPREKLIEKGAAALSDAELLAIFLRTGITGVSAVELARKL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
: ::::: : .:. . : .. :.: ..: ::::. ::.:: : .:: .... ..:.
Q82UL9 LTHFGSLTKLCAASLHEFSELPGMGPAKFAQLQAVMEMAKRALAEELKNGDIMDSPQSVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
:: :. . :.:. .::: .:: : :.:: ::.. ..:::::..:..:: ::::.:
Q82UL9 NYLCLSLKGKPYEVFVGIFLDARHRTIVTEELFNGTLTQASVYPREVVKRALYHNAAAMI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
.:::::::::::: .:...::.. .: :.....::::..:.. ::::..:.
Q82UL9 FAHNHPSGIAEPSTADEILTQSLKQALALVDVKVLDHFVIGSSEVVSFAERGLI
180 190 200 210 220
>>Q1QT91.1 Q1QT91_CHRSD DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 660 init1: 660 opt: 663 Z-score: 782.5 bits: 152.0 E(): 1.8e-35
Smith-Waterman score: 663; 48.826% identity (48.826% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::: :. :: : ::::::::.:.:: .. :....
Q1QT91 MAIHEWPEGERPREKLLALGASALSDAELLAIFLRVGVKGRSAVDLARDL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
: ::.:: :: :: :: .::: ....::::. :...:.: . : .... . :.
Q1QT91 LLAFGGLRPLLEADLARFCAEHGLGEAKYVQLQASLELSRRHLGSLLERGAALTSPTLVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
.: ..:.: .: : .::::.:::.:. : : ::.. ..:::::. ...: ::.:::
Q1QT91 RFLTSQLRHLPHEAFAALFLDTQHRVIRFETLSKGTLDSASVYPREVSRRALALNAGALI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
.:::::::.:::: .:. :::.. .: :..::.::::.:: : ::::.. :
Q1QT91 FAHNHPSGVAEPSDADRRITQRLSDALGLFDIRVLDHFVVGDGEVVSFAERGWL
180 190 200 210 220
>>Q88BD1.1 RADC_PSESM DNA repair protein radC homolog. (224 aa)
initn: 631 init1: 631 opt: 651 Z-score: 768.6 bits: 149.5 E(): 1.1e-34
Smith-Waterman score: 651; 47.418% identity (47.418% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::.::. :. .: : ::::::::::. : .. :.. .
Q88BD1 MSIRSWPAAERPRERLLELGAASLSDAELLAIFLRTGVAGKSAVDLARHL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
:..: .::.::.::. :: ::: ..: ::::. ::..:.. . : . .. . . :.
Q88BD1 LNQFDGLRSLLDADQPAFTAQLGLGPAKFAQLQAVMEMARRHMAESLRRDSALENPAQVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::.:.:.:: .:.: :::::.::.. : :: ::::.. :.::...:..: :::.::
Q88BD1 NYLKAQLRHEPHEVFACLFLDNKHRVMTFEILFRGTINASYVHPRQVVKRALAHNAASLI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
: :::::::. :: :: .:... :: .:.....::: ::: : :..:..:.
Q88BD1 LCHNHPSGITTPSRSDIDLTKRLKEALKLVDVHVLDHVIVGDGEPLSMVEKGLM
180 190 200 210 220
>>A1U6L4.1 A1U6L4_MARHY DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 641 init1: 641 opt: 649 Z-score: 766.2 bits: 149.0 E(): 1.5e-34
Smith-Waterman score: 649; 45.540% identity (45.540% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::.:: .:...: : :::::::::: : :::::.. .
A1U6L4 MTDSSWPTDERPRERLLAHGAQSLSDAELLAIFLRTGTTGMPVMALARHL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
...:..::.:..:... : .::::: ... :.::. ::..: . . : . . . ..
A1U6L4 IDEFSGLRGLMTASRRQFLQVKGLGTAKYAQVQAAMEMARRVMDEPLRQGDPLRSPADTR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
.: ..: .:.: :::::.::.:. ..:: :::. . :::::.....: ::::.:
A1U6L4 RFLTSRLGTYPHEVFAGLFLDNRHRVIQYRELFRGTIDGAAVYPREVVRQALEDNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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A1U6L4 FAHNHPSGVAEPSQADISLTRRLKEALGLVDIRVLDHMVIGHGEVISLAERGLM
180 190 200 210 220
>>Q5QZB4.1 RADC_IDILO DNA repair protein radC homolog. (224 aa)
initn: 649 init1: 649 opt: 649 Z-score: 766.2 bits: 149.0 E(): 1.5e-34
Smith-Waterman score: 649; 47.418% identity (47.418% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
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Q5QZB4 MSVKEWPVSERPREKLQTQGAEYLSDAELLAILLGSGSGGQDVVSFARRL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
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Q5QZB4 LSDFGGVGALLTATPEQLLACNGIGPARVNQLRVVLELSRRYLKWQLERSDGFTEPTMVK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
:: ..:.:. ::.: .:.::.::::.. :.:: ::::.. :::::.:: . ::::.:
Q5QZB4 DYLTSQLRHQGREVFAILLLDSQHRLLRYEELFQGTINAAPVYPREVIKLVMQYNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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Q5QZB4 LAHNHPSGVAEPSQADQRVTERVKKALTLIDVALLDHFVVGAGDPISFAERGLL
180 190 200 210 220
>>Q88C97.1 RADC_PSEPK DNA repair protein radC homolog. (226 aa)
initn: 649 init1: 649 opt: 649 Z-score: 766.2 bits: 149.0 E(): 1.5e-34
Smith-Waterman score: 649; 48.571% identity (48.571% ungapped) in 210 aa overlap (22-231:12-221)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
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Q88C97 MNIREWPAEERPREKLLQRGAGSLTDTELLAVFLGSGVRGCNVVELSRGL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
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Q88C97 LVKFGSLRRLLEADREAFVGELGLGPVRYSQLQALLEIGRRHLATSIERESAMDSPAAVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q88C97 RYLKAMLRHEASEVFGCLFLDTKHRPLAFEILFRGTIDRASVYPREVVRRALVHNAAALI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
: :::::::.::: .: .: .. .. :...:.:::.:.: : :..::.
Q88C97 LCHNHPSGISEPSQDDVHLTLSLKRGLALIDVRVLDHIIIGDGEPLSMVEHGWIVV
180 190 200 210 220
>>Q7NTH5.1 Q7NTH5_CHRVO DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 641 init1: 641 opt: 644 Z-score: 760.4 bits: 148.0 E(): 3.1e-34
Smith-Waterman score: 644; 48.826% identity (48.826% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
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Q7NTH5 MSIASWPESERPREKLLSQGAATLNDSELLAIFLRTGIKGVNAVELARRL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
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Q7NTH5 LQEFGSLSALLAAPLPAFKAKPGLGEAKYAQLMACTELARRALSEQMRLGDALSSPQQVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q7NTH5 DYLRLSIGRREVETFVVIFLSAQNRLIEVEEVFKGTLTETRVYPREVLRRALRHNAAALI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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Q7NTH5 IAHNHPSGVSEPSSADRVLTDTLKRALELVDIRLLDHFVVTGGHAESFAERGWL
180 190 200 210 220
>>Q1H4K1.1 Q1H4K1_METFK DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 630 init1: 630 opt: 644 Z-score: 760.4 bits: 148.0 E(): 3.1e-34
Smith-Waterman score: 644; 45.070% identity (45.070% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
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Q1H4K1 MAITDWPEGERPREKLRAAGAMALSDAELLAIFLRTGVAGKSAVDLAREL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
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Q1H4K1 LKRFSSLNGIFAASAEEICQVHGMGLSKFVQLQAIFEMSRRALLEQMQGRDVLTSPQAVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q1H4K1 QYLSLRIGALPREVFIGIFLDAQHRVLAVEELFSGTLTQTSVYPREVVKCALRHNAAAMI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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Q1H4K1 FAHNHPSGVPEPSQADRALTEALKAALNLIDIRVLDHFVVAGNQLVSFSERGLI
180 190 200 210 220
>>A1EY48.1 A1EY48_COXBU DNA repair protein RadC, degener (224 aa)
initn: 640 init1: 640 opt: 640 Z-score: 755.8 bits: 147.1 E(): 5.6e-34
Smith-Waterman score: 640; 45.070% identity (45.070% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
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A1EY48 MSITQWPTSERPREKLLREDAHILSDAELIAVIIQKGVRGCNAVELAREW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
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A1EY48 LNHLGGLASLLNADFHRLSGLRGLGKAVYCKLKAAAELQRRYLRQSLERKGQLGCTQDAQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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A1EY48 QLLYAQLRHHESEVFACLFLDNRHRIIQFEKLFYGSINQASVHPREIIKRALYHNSAALI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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A1EY48 VAHNHPSGVPDPSQADRAATTHLKEALALIDVRLLDHIIIGDRNSFSFAESGLL
180 190 200 210 220
>>Q48Q04.1 Q48Q04_PSE14 DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 619 init1: 619 opt: 639 Z-score: 754.6 bits: 146.9 E(): 6.5e-34
Smith-Waterman score: 639; 46.479% identity (46.479% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
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Q48Q04 MSIRSWPAAERPRERLLELGAGSLSDAELLAIFLRTGVAGKSAVDLARHL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
:..: .::.::.:: .: . ::: ..: ::::. ::..:.. . : . .. . . :.
Q48Q04 LNQFDGLRSLLDADLSTFTSQLGLGPAKFAQLQAVMEMARRHMAESLRRDSALENPTQVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q48Q04 NYLKAQLRHEQHEVFACLFLDNKHRVMTFEILFRGTINASYVHPRQVVKRAMAHNAASLI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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Q48Q04 LCHNHPSGITTPSRSDIDLTKRLKEALMLVDVHVLDHVIVGDGEPLSMVERGLM
180 190 200 210 220
>>Q3SFR5.1 Q3SFR5_THIDA DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 638 init1: 638 opt: 638 Z-score: 753.4 bits: 146.7 E(): 7.5e-34
Smith-Waterman score: 638; 46.890% identity (46.890% ungapped) in 209 aa overlap (22-230:12-220)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
::::::: :. :: : ::.:.:::::. : .. :....
Q3SFR5 MAIRDWPEDARPREKLLKQGAAALTDAELVAVFLRTGVAGKSAVDLGRDL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
...::.: :: ::. : :.. :.: ... :::. ::..: : ... ..:. ..:.
Q3SFR5 IERFGGLGALCRADRVAACRAPGVGEAKYALLQAVMEMARRTLAEDMQAGDALSSPAAVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q3SFR5 DYLRLILRDKEYEVFCCVFLNAQNRVIAVEELFRGTLTQTSVYPREIVKRALAHNAAAMI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
::::::::. ::: .:. .:... :: :..::.:::::.. .. ::::
Q3SFR5 LAHNHPSGVNEPSQADRSLTRRLAEALALVDIRVLDHFIIAGASALSFAEAGHL
180 190 200 210 220
>>Q4ZZX7.1 Q4ZZX7_PSEU2 DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 618 init1: 618 opt: 638 Z-score: 753.4 bits: 146.7 E(): 7.5e-34
Smith-Waterman score: 638; 47.418% identity (47.418% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::.::. :. .: : ::::::::::. : .. :.. .
Q4ZZX7 MSIRSWPAAERPRERLLELGAASLSDAELLAIFLRTGVAGKSAVDLARHL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
:..: .:: ::.:: :: . ::: ..: ::::. ::..:.. . : : .. . . :.
Q4ZZX7 LNQFDGLRPLLDADLSAFTSQLGLGPAKFAQLQAVMEMARRHMAESLRRESALENPTQVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q4ZZX7 SYLKALLRHEPHEVFGCLFLDNKHRVMTFEILFRGTINASYVHPRQVVKRAMAHNAASLI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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Q4ZZX7 LCHNHPSGITTPSRSDIDLTKRLKEALLLVDVHVLDHVIVGDGEPLSMVERGLM
180 190 200 210 220
>>A1WZF2.1 A1WZF2_ECTHA DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 631 init1: 631 opt: 637 Z-score: 752.3 bits: 146.5 E(): 8.7e-34
Smith-Waterman score: 637; 47.418% identity (47.418% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::.:.. : .:: : :::::::::: .: .. :.. .
A1WZF2 MSIRSWPREERPRERLIQRGPQALSDAELLAIFLRTGRRGQSAVELAREL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
: :..::.:: ::.:.: ::: ... :.::. :...:.: ..: ..:. . ..
A1WZF2 LAAFSGLRGLLEADRETFAARPGLGDAKYAQMQAALEIARRHLGEQLQRGPTLSSPAQTR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
:: : :. . :.: :::::.::.: :.:: :::: ..:::::.....: ::::.:
A1WZF2 TYLAALLRDHPSEVFGGLFLDNRHRVIGFEELFRGTINGASVYPRELVRRALAHNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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A1WZF2 VAHNHPSGITEPSAADEALTHRLREALGLVDVRLLDHFVVGDGEPVSLAERGVL
180 190 200 210 220
>>Q8XWN0.1 RADC_RALSO DNA repair protein radC homolog. (224 aa)
initn: 632 init1: 632 opt: 632 Z-score: 746.5 bits: 145.4 E(): 1.8e-33
Smith-Waterman score: 632; 47.143% identity (47.143% ungapped) in 210 aa overlap (22-231:12-221)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::: : :: : ::::::::.:. : .. :.. .
Q8XWN0 MAIADWPAHERPREKLLTQGPAALSDAELLAIFLRVGMPGKSAVDLAREL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
: ::::: : :... : ..:.: ... ::.: :...: ::.:. ... . ..::
Q8XWN0 LAHFGSLGRLCHASRREFSAIHGMGPAKYAQLHALLEVARRALKEEIAYGQTLESPQSVK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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Q8XWN0 DFLRLTLGHRPQEVFACLFLDVRHRLIAWEELFQGTLTEARVYPREIAKRALHHNASALI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
:.::::.: .::: :: ..:... .: :...:.:::.:::.. ::: ::.
Q8XWN0 LSHNHPTGHVEPSESDLVLTRELCRALALLDVRVLDHMIVGRAEVYSFLEHGKM
180 190 200 210 220
>>Q2XA15.1 Q2XA15_PSEPU DNA repair protein RadC. (235 aa)
initn: 632 init1: 632 opt: 632 Z-score: 746.1 bits: 145.4 E(): 1.9e-33
Smith-Waterman score: 632; 48.095% identity (48.095% ungapped) in 210 aa overlap (22-231:21-230)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
::::::. :. .: : ::::.:: .:..: :. ::...
Q2XA15 MGRSKGRGGMNIREWPAEERPREKLLQRGAGSLTDTELLAVFLGSGVRGRNVVELSRGL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
: .::::: :: ::.::: ::: ... :::: :. .:.: . : .... ..:.
Q2XA15 LVKFGSLRRLLEADREAFVGELGLGPVRYSQLQALLEIGRRHLATSIERESAMDSPAAVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::.: :.:: :.: ::::..:: . : :: :::. ..:::::.....: ::::::
Q2XA15 RYLKAMLRHEASEVFGCLFLDTKHRPLAFEILFRGTIDRASVYPREVVRRALVHNAAALI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
: :::::::.::: .: .: .. .. :...:.:::.:.: : :..::.
Q2XA15 LCHNHPSGISEPSQDDVHLTLSLKRGLALIDVRVLDHIIIGDGEPLSMVEHGWIVA
180 190 200 210 220 230
>>A1H957.1 A1H957_BURPI Putative DNA repair protein radc (224 aa)
initn: 623 init1: 623 opt: 623 Z-score: 736.0 bits: 143.4 E(): 7.1e-33
Smith-Waterman score: 623; 45.714% identity (45.714% ungapped) in 210 aa overlap (22-231:12-221)
10 20 30 40 50 60
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:::::: .: :: : ::::::::.:. : .. :.. .
A1H957 MAIVDWPAHERPREKLLAHGPAALSDAELLAIFLRVGVPGKSAVDLAREL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
: ::::: : :... : ...:.: ... ::.: :...: ::... ..: ....::
A1H957 LAHFGSLARLCHASQQEFSSINGMGPAKYAQLHALLEVARRALKEDFTQGQTFESAQSVK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
.:. : :. .:.: .::: .:::: :.:: ::.. . :::::: :..:. ::::.:
A1H957 DFLRLTLGHRPHEVFACFFLDVRHRLIAWEELFRGTLTEARVYPREIAKRALHHNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
::::::.: .::: :: ..:... .: .... .:::.:::.. :.: ::.
A1H957 LAHNHPTGNTEPSESDVILTRELCRALAMLDVIVLDHMIVGRNHVYGFLEHGKM
180 190 200 210 220
>>Q31EB6.1 Q31EB6_THICR DNA repair protein radC homolog. (237 aa)
initn: 586 init1: 586 opt: 621 Z-score: 733.3 bits: 143.0 E(): 9.9e-33
Smith-Waterman score: 621; 46.729% identity (46.948% ungapped) in 214 aa overlap (22-234:24-237)
10 20 30 40 50
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSH
:::::::.:. : : ::::::::.:.:: .. :..
Q31EB6 MMGLSYQKICKNMAITDWHENDRPREKLLKFGAPHLSDAELLAIFLRVGVKGKSAVELAQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
orf000 SVLQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTST
..:.:::::. ::.::. :::..:::: ....::.:. ::..:.... : .....
Q31EB6 DLLDHFGSLERLLNADEAAFCEAKGLGQAKYVQLKAVLEMSRRHFESGLKKGEALTQPEK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
orf000 VKLYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAA
: :: .. :. :::: ...::.:...:. :: :::: ..:. ::..: : .:::
Q31EB6 VARLLQHHIGHQSREIFGLVLLDQQNQFIQFVPLFTGTINQATVHIREVLKTVLDHHAAA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
orf000 LILAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVG-KGTCYSFAEHNLL
.::::::::: :: ::. .:..: .. .:.: : :::.:.: .: :::.....:
Q31EB6 VILAHNHPSGDPTPSQSDRDLTHQIQQGLQLIETRCLDHIILGDHGRWYSFTQQGIL
190 200 210 220 230
>>Q47BA9.1 Q47BA9_DECAR DNA repair protein RadC. (226 aa)
initn: 555 init1: 432 opt: 620 Z-score: 732.4 bits: 142.8 E(): 1.1e-32
Smith-Waterman score: 620; 46.512% identity (46.948% ungapped) in 215 aa overlap (22-234:12-226)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::.:: .: :: : :::::.::.:..: .. :....
Q47BA9 MAITDWPEGERPRERLLAHGPAALSDAELLAIYLRVGVRGKSAVDLARDL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
orf000 LQHF-GSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTV
:..: : : .: :. : . .:.:.:... ::.:. :.:.: :.::. . :.. . :
Q47BA9 LHRFDGRLGTLAEASLEELASVSGIGMAKAAQLKASFELTRRALSQEMATRDSFTSPGKV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
orf000 KLYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAAL
. .:. .: . .:.::.:.:: :..:.: :.:: ::.. :.:::::..: .: ::::.
Q47BA9 RDWLRLKLASRGHEVFMALWLDAQNQLLKAEELFTGTLTQTSVYPREVVKAALAHNAAAV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
orf000 ILAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIV-GKGTCYSFAEHNLL
:::::::::::::: .:.:.:... :: ......:::::: :. ::::..::
Q47BA9 ILAHNHPSGIAEPSRADEMLTRSLKEALAMVDVKVLDHFIVAGNTPPLSFAERGLL
180 190 200 210 220
>>Q33QZ8.1 Q33QZ8_9GAMM DNA repair protein RadC. (233 aa)
initn: 612 init1: 612 opt: 612 Z-score: 722.9 bits: 141.1 E(): 3.8e-32
Smith-Waterman score: 612; 44.498% identity (44.498% ungapped) in 209 aa overlap (22-230:20-228)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
::::::. :: : : ::::..::.:.:: ...:.. .
Q33QZ8 MAPRQGVFMAIKDWPQGEGPREKLLRSGVAQLSDAELLAVLLRNGLKGQSAVSLARVM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
: :::.::::.::. .: ..:.: ... ::::. :..:: ...: ...:: . ..
Q33QZ8 LTHFGGLRALFSASLSELCDIQGIGPVKYAQLQAAIELSKRIAQENLQRGKILSDPDLTR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::. .: . :.: .:.::.:::.:. .:: :::. ..:::::... : .:::.:
Q33QZ8 DYLMRQLADRAYEVFAILLLDSQHRVIQFVELFRGTIDSASVYPREVVSLVLEKKAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
. :::::: ::::..:. ::... : ... .:::..:: ::::.
Q33QZ8 VCHNHPSGGAEPSHADRRITERLKYALATIDVSLLDHMVVGDREIVSFAERGWID
180 190 200 210 220 230
>>A1VSK8.1 A1VSK8_9BURK DNA repair protein RadC. (224 aa)
initn: 606 init1: 606 opt: 611 Z-score: 722.0 bits: 140.9 E(): 4.2e-32
Smith-Waterman score: 611; 45.540% identity (45.540% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::: : :: : ::::..::::. : .. ... .
A1VSK8 MLIKDLPADARPREKLLARGPAALSDAELLALLLRTGLPGKNALQMGQEL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
:..::.. .:: . ::. ..:::: .. .. :. :...: : .:: . .:. ..:.
A1VSK8 LDNFGGVAGLLHTGAEALKSIKGLGPAKRAEIVAVLELARRALAEELKEKALFTTPQAVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::: .: . .::: :::::.::::: :.:: ::.. :.:::::.. ..: :::...
A1VSK8 DYLQLQLGSRPHEIFAVLFLDSQHRLIALEELFRGTLTQTSVYPREVVIRALALNAASVV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
:::::::: :.:: .:.:.:: . : :...:.::::.: . :.:: .:.
A1VSK8 LAHNHPSGAAQPSRADEMLTQTLKTALALVDVRVLDHFVVTASLAVSMAEMGLV
180 190 200 210 220
>>Q5P7Z7.1 Q5P7Z7_AZOSE DNA repair protein, radC. (225 aa)
initn: 593 init1: 593 opt: 609 Z-score: 719.7 bits: 140.4 E(): 5.7e-32
Smith-Waterman score: 609; 46.262% identity (46.479% ungapped) in 214 aa overlap (22-234:12-225)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::: :. :: : ::::.:::.:..: .. :....
Q5P7Z7 MAITDWPENERPREKLLTRGTAALSDAELLALFLRVGMRGKSAVDLARDL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
::.:::: : .:. : . :.:.... ::::. :...: : ... :: . .:.
Q5P7Z7 LQQFGSLTRLCAASAAEFSAIPGMGLAKYAQLQAVMELARRALAEQMNDADVFESPLAVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
.:. .. .:.: ::.:: ..:::. .:: ::.. :.:::::..: .: ::::.:
Q5P7Z7 NWLRLRIGSLPHEVFHVLLLDARNRLIEAVELFRGTLTQTSVYPREVVKLALARNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIV-GKGTCYSFAEHNLL
:::::::: :::: .:...:... .: ::..::.:::::: ... ::::..::
Q5P7Z7 LAHNHPSGAAEPSPADELLTRSLKQALELVDIRVLDHFIVTAHAQPLSFAERGLL
180 190 200 210 220
>>Q05N72.1 Q05N72_9BURK DNA repair protein RadC. (283 aa)
initn: 593 init1: 593 opt: 607 Z-score: 715.9 bits: 140.1 E(): 9.3e-32
Smith-Waterman score: 607; 45.070% identity (45.070% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:67-279)
10 20 30 40 50
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGC
::::: .:..:: : ::::::::.:.::
Q05N72 QNSKLSHKVIVSRPTPNLHSSIPNWPKSEQPREKLRIHGARALTDAELLAIFLRVGVKGK
40 50 60 70 80 90
60 70 80 90 100 110
orf000 PVMALSHSVLQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEH
...:....:..:::: ::.. : : ...:.:.... :.::. :..:: :.. : .
Q05N72 SAVTLAKDLLHYFGSLPRLLASTPEEFIRIHGMGLSKWSQIQAAYELVKRSLEEGLAQNS
100 110 120 130 140 150
120 130 140 150 160 170
orf000 VFSDTSTVKLYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKES
.::. . :: :::... . .:.:. :.:: . .::. ..:: :.:. : ::::::.::.
Q05N72 IFSSPGHVKEYLQSKIGRLPHEVFLCLYLDPRLHLIECQELFRGSITQTAVYPREILKEA
160 170 180 190 200 210
180 190 200 210 220 230
orf000 LYCNAAALILAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEH
: ::.:::.::::::: :: .:. .:: ...: . ..: .::: ::... .::.:
Q05N72 LSRNASALIVAHNHPSGNPLPSQADQDLTQTLLKALQWVDISLLDHCIVSSSGFFSFSES
220 230 240 250 260 270
orf000 NLL
.:.
Q05N72 GLMNHDD
280
>>A1FLW1.1 A1FLW1_PSEPU DNA repair protein RadC. (226 aa)
initn: 591 init1: 591 opt: 604 Z-score: 713.8 bits: 139.4 E(): 1.2e-31
Smith-Waterman score: 604; 46.190% identity (46.190% ungapped) in 210 aa overlap (22-231:12-221)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::.. :: .: : ::::.:: .:..: :. :....
A1FLW1 MKISEWPAEERPREKLMQRGVGSLSDAELLAVFLGSGVRGRNVVELARGL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
: .::.:: :: ::..:: ::: ... :::: :. .: : . . .. . :.:.
A1FLW1 LVKFGGLRQLLEADRDAFVGELGLGPVRYGQLQALLEIGRRNLATSIERDCALESPSAVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::.: :.:: :.: ::::..:: . : :: :::. ...::::....::. ::::::
A1FLW1 RYLKAMLRHEPSEVFGCLFLDSKHRPLAFEILFRGTIDRASIYPREVVRRSLMHNAAALI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
: :::::: .::: .: .: . .. :...:.:::.::: : :..:..
A1FLW1 LCHNHPSGNSEPSQDDVHMTLALKRGLALIDVRVLDHIIVGDGEPLSMVEQGWIVA
180 190 200 210 220
>>Q1I2U3.1 Q1I2U3_PSEE4 DNA repair protein radC. (226 aa)
initn: 601 init1: 601 opt: 604 Z-score: 713.8 bits: 139.4 E(): 1.2e-31
Smith-Waterman score: 604; 46.009% identity (46.009% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
::::::. :. .: : ::::.:: .:.:: :. :....
Q1I2U3 MNIREWPVEERPREKLLNRGAGSLSDAELLAVFLGSGVKGRNVLELARGL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
: .::.:: .: ::..:: ::: ... :::: :. .: : . . : :... .:.
Q1I2U3 LVKFGGLRQVLEADRQAFLGELGLGPVRYSQLQALLEIGRRNLAMSIERESVMDNPLAVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::.: :.:: :.: ::::..:: . : :: :::. ...::::.....: ::::::
Q1I2U3 RYLKAMLRHEASEVFGCLFLDTKHRPLAFEILFRGTIDRASIYPREVVRRALLHNAAALI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
: :::::: ::: .: .: . .. :...:..:: ::: : :. ::. :
Q1I2U3 LCHNHPSGNCEPSQDDVHLTLMLKRSLALIDVRVVDHVIVGDGEPLSMIEHGWLAG
180 190 200 210 220
>>A1FXH8.1 A1FXH8_XANMA DNA repair protein RadC. (234 aa)
initn: 600 init1: 422 opt: 604 Z-score: 713.6 bits: 139.4 E(): 1.2e-31
Smith-Waterman score: 604; 47.685% identity (48.815% ungapped) in 216 aa overlap (22-234:12-225)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::. : :: : ::::.:: .:. : .. ....
A1FXH8 MPIHDWPEQERPREKLMARGPTALSDAELLALFLGSGFGGRDAVQTARDL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEH---VFSDTS
:: : ::.::. . . .. ::: .. : : :...::: :: :: : .. .
A1FXH8 LQAHGPLRVLLDRPARELARLPGLGPARSCTLAAGLELAHRYLAAEL--EHGEAVGNNPA
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
orf000 TVKLYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAA
.: ::: .:. . :::::.:::::.:::: :.:: ::::.. :::::.....: :::
A1FXH8 AVGRYLQHRLRGQAREIFMALFLDNRHRLIACEELFHGTINAAPVYPREVVRRALLHNAA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
orf000 ALILAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
:.::.:::::: ::: .: ::... .: ....:.::::.::.: ::::..::
A1FXH8 AVILSHNHPSGDPEPSSADTRITDELQQALAMVDVRLLDHFVVGEGRPVSFAERGLLSPP
170 180 190 200 210 220
A1FXH8 QPRLFG
230
>>A0X5S4.1 A0X5S4_9GAMM DNA repair protein RadC. (225 aa)
initn: 603 init1: 603 opt: 603 Z-score: 712.7 bits: 139.1 E(): 1.4e-31
Smith-Waterman score: 603; 43.541% identity (43.541% ungapped) in 209 aa overlap (22-230:12-220)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
::::::. ::. : : ::::..::.:.:: .. :.. .
A0X5S4 MAIKDWPEGEAPREKLLSQGVKQLSDAELLAVLLRVGLKGLSAVELARIM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
...::.::.::.:.. :.. :.: ..: :.::..:. : ...: ...:: . ..
A0X5S4 INEFGGLRSLLNASQAQVCRLDGIGPVKFAQMQAAVELGARISQENLKRGKILSDPDLTR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::. .: . :.: .:.::.:::.:. .:: :::: ..:::::... : .:::.:
A0X5S4 DYLMRQLSDRAYEVFAILLLDSQHRVIQFVELFRGTINSASVYPREVVSLVLEKKAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
. ::::::::::: .:. ::... .: . ... .:::..:: ::::.
A0X5S4 VCHNHPSGIAEPSTADRRITERLKQALQTIDVSLLDHMVVGDREIVSFAERGWID
180 190 200 210 220
>>Q12EY8.1 Q12EY8_POLSJ DNA repair protein RadC. (244 aa)
initn: 599 init1: 599 opt: 599 Z-score: 707.5 bits: 138.3 E(): 2.7e-31
Smith-Waterman score: 599; 46.009% identity (46.009% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:32-244)
10 20 30 40 50
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGC
:::::: : :: : ::::..::::. :
Q12EY8 SGRKAGFAPLPLPDRTPSPMLLKDLPEDARPREKLLARGPAALSDAELLALLLRTGLPGK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
orf000 PVMALSHSVLQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEH
.. ... ... ::.. .:: . ::. ..:::: .. .: :. :...: : .:: .
Q12EY8 NALQMGQELVDTFGGVAGLLHTGPEALKSIKGLGPAKRAELVAVLELARRALAEELKEKA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
orf000 VFSDTSTVKLYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKES
.:: ..:. ::: .: . .::: :::::.::::: :.:: ::.. :.:::::.. ..
Q12EY8 LFSTPQAVRDYLQLQLGGRPHEIFAVLFLDSQHRLIALEELFRGTLTQTSVYPREVVVRA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
orf000 LYCNAAALILAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEH
: :::...:::::::: : :: .:. .:: . : :...:.::::.: . :.::
Q12EY8 LALNAASVVLAHNHPSGAATPSRADEALTQTLKSALALVDVRVLDHFVVTSTQAVSMAEL
190 200 210 220 230 240
orf000 NLL
.::
Q12EY8 GLL
>>Q0VT58.1 Q0VT58_ALCBS DNA repair protein RadC homolog. (224 aa)
initn: 567 init1: 567 opt: 594 Z-score: 702.3 bits: 137.2 E(): 5.3e-31
Smith-Waterman score: 594; 46.154% identity (46.154% ungapped) in 208 aa overlap (22-229:12-219)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::: :..:: : :::::::::: .: .. :..
Q0VT58 MAITDWPEDERPREKLLARGAQALSDAELLAIFLRTGQQGLTAVDLARRQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
: :.:::.:. . : . .. :.:... : :. :. .::: . : ... . .
Q0VT58 LVSSGGLRAMLDLSPERMAHLPGMGVARRALLLAALELGRRYLAEPLERGLPLDNPDKAG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
: :.:. :.: :::::.:::: :.:: :::... :::::...... ::::.:
Q0VT58 QLLTAQLRGLPFEVFACLFLDNKHRLIAFEKLFQGTIDAAAVYPREVVRRAMEHNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
::::::::.:::: ::. ::....:: :.:.:.:::...: : :.:
Q0VT58 LAHNHPSGVAEPSQSDHAITRRLVEALGLVEVRVLDHLVIGDGGWVSLASRGAV
180 190 200 210 220
>>A1K4J9.1 A1K4J9_9RHOO DNA repair protein radC homolog. (225 aa)
initn: 563 init1: 563 opt: 592 Z-score: 699.9 bits: 136.8 E(): 7.2e-31
Smith-Waterman score: 592; 44.860% identity (45.070% ungapped) in 214 aa overlap (22-234:12-225)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
::::::. :..:: : ::::.:::.::.: .. :....
A1K4J9 MAITDWPEDERPREKLLSRGANALSDAELLALFLRVGIRGRTAVDLARDL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
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A1K4J9 IARFGTLTRLCSATSSEFAAIPGMGLAKYAQLQAVMELARRALSETLCARDLFDSPEAVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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A1K4J9 DWLRLRLGHLPHETFCVLLLDARNTLIDAVDLFRGTLTQTSVYPREVVKLALDRNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIV-GKGTCYSFAEHNLL
.::::::: :::: .:...:... .: :..::.::::.: ..: ::::..:.
A1K4J9 FAHNHPSGAAEPSSADEQLTRHLKDALALVDIRVLDHFVVPAHGKPTSFAERGLI
180 190 200 210 220
>>Q46XP0.1 Q46XP0_RALEJ DNA repair protein RadC. (228 aa)
initn: 589 init1: 589 opt: 591 Z-score: 698.7 bits: 136.6 E(): 8.5e-31
Smith-Waterman score: 591; 43.192% identity (43.192% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
::::: . :. :: : ::::.:::.: : .. :....
Q46XP0 MSITNWPACERPREKLQECGAAALSDAELLAVFLRVGATGKSAVELARDL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
. .:::: :..:: .: ..:.: ... ::::. :...:.: . : . ... ..:.
Q46XP0 MVRFGSLTRLFTADARAVLGIRGMGEAKYTQLQAVPELARRMLAESLELPSGLDSPAAVR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::. : .:.:. ::::...:.: .:.:: ::.: : :::::. ...: :::..:
Q46XP0 SYLRLTLAPLAQEVFVCLFLDTRNRMIASEELFRGTLNQTAVYPREVARRALAHNAASVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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Q46XP0 VAHNHPSGCCTPSQSDLQMTRMLARALDLIDVRLLDHFVVAGTHVHSFAEHGELKTAT
180 190 200 210 220
>>A0H7B7.1 A0H7B7_COMTE DNA repair protein RadC. (230 aa)
initn: 586 init1: 467 opt: 587 Z-score: 693.9 bits: 135.7 E(): 1.5e-30
Smith-Waterman score: 587; 45.089% identity (46.759% ungapped) in 224 aa overlap (19-234:7-230)
10 20 30 40 50
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPL--MPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSH
:: .::::: . :. :: : ::::..::::. : :. ...
A0H7B7 MPIKDLPLDAQPREKLAQRGAAALSDAELLAVILRTGMAGKTVLQMAQ
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
orf000 SVL------QHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHV
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A0H7B7 ELLELPGDRQATGGLAGLLAADYQALATVKGLGPAKRAELMAVLELARRATAQQLREREV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
orf000 FSDTSTVKLYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESL
::. .:: ::: .: . .:.: :::::.:.::. :..: ::.. :.:::::.. ..:
A0H7B7 FSSPEAVKHYLQLHLAARPHEVFAVLFLDSQNRLLALEEMFRGTLTQTSVYPREVVLRAL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
orf000 YCNAAALILAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHN
. .:.:.::::::::: ..:: .: .: . : :...:.:::.::: :. :.::.
A0H7B7 HHHAGAVILAHNHPSGSVQPSSADCALTATLKAALALIDVRVLDHIIVGPGAACSMAEEA
170 180 190 200 210 220
orf000 LL
::
A0H7B7 LL
230
>>Q12SF5.1 Q12SF5_SHEDO DNA repair protein RadC. (225 aa)
initn: 583 init1: 583 opt: 586 Z-score: 692.9 bits: 135.5 E(): 1.8e-30
Smith-Waterman score: 586; 40.845% identity (40.845% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
::.:::. :. : : ::::...:.::.: ... .. .
Q12SF5 MAIKDWPQGEGPRDKLLQQGAARLSDAELLAVLIRNGISGQNALTTGRLL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
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Q12SF5 LSHFGGLRSLMTATEDKVCQIPGVGPVKYAQLQAAAEISKRISRENLQRGQILTNPDLTR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::. .: . :.: .:.::.:::.:. .:: :::. ..:::::... : :::.:
Q12SF5 DYLMRQLADRSYEVFALLLLDSQHRVIQFVELFRGTIDSASVYPREVVSLVLEKRAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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Q12SF5 ICHNHPSGIAEPSQADRRITERLKNALATIDVSLLDHMVVGDFEIVSFAERGWLN
180 190 200 210 220
>>Q8E9M2.1 RADC_SHEON DNA repair protein radC homolog. (225 aa)
initn: 584 init1: 584 opt: 584 Z-score: 690.6 bits: 135.0 E(): 2.4e-30
Smith-Waterman score: 584; 42.584% identity (42.584% ungapped) in 209 aa overlap (22-230:12-220)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
::.::: :. : : ::::..::.:..: .. :..:.
Q8E9M2 MAIKDWPEGEGPRDKLLLKGASHLSDAELLAVLLRNGLSGLNAVDLARSL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
.:.::.::.:: : :. :.. :.: ... ::::..:...: ...: .:... . ..
Q8E9M2 IQEFGGLRSLLCAPKHQVCRLPGVGPVKYAQLQAAAELARRVAQENLQRGQVLTNPDLTR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::. .: . :.: .:.::.:::.:. .:: :::. ..:::::... : .:::.:
Q8E9M2 DYLMRQLADRSYEVFAILLLDSQHRVIQFVELFRGTIDSASVYPREVVSLVLEKKAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
. ::::::::::: .:. ::... .: ... .:::..:: ::::.
Q8E9M2 VCHNHPSGIAEPSQADRRITERLKNALATIDVSLLDHMVVGDREIVSFAERGWIN
180 190 200 210 220
>>Q0HE56.1 Q0HE56_SHESM DNA repair protein RadC. (225 aa)
initn: 584 init1: 584 opt: 584 Z-score: 690.6 bits: 135.0 E(): 2.4e-30
Smith-Waterman score: 584; 42.584% identity (42.584% ungapped) in 209 aa overlap (22-230:12-220)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
::.::: :. : : ::::..::.:..: .. :..:.
Q0HE56 MAIKDWPEGEGPRDKLLVKGAAHLSDAELLAVLLRNGLSGLNAVDLARSL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
.:.::.::.:: : :. :.. :.: ... ::::..:...: ...: .:... . ..
Q0HE56 IQEFGGLRSLLCAPKHQVCRLPGVGPVKYAQLQAAAELARRVAQENLQRGQVLTNPDLTR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::. .: . :.: .:.::.:::.:. .:: :::. ..:::::... : .:::.:
Q0HE56 DYLMRQLADRSYEVFAILLLDSQHRVIQFVELFRGTIDSASVYPREVVSLVLEKKAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
. ::::::::::: .:. ::... .: ... .:::..:: ::::.
Q0HE56 VCHNHPSGIAEPSQADRRITERLKNALATIDVSLLDHMVVGDREIVSFAERGWIN
180 190 200 210 220
>>Q07WG1.1 Q07WG1_SHEFN DNA repair protein RadC. (225 aa)
initn: 583 init1: 583 opt: 583 Z-score: 689.4 bits: 134.8 E(): 2.8e-30
Smith-Waterman score: 583; 43.541% identity (43.541% ungapped) in 209 aa overlap (22-230:12-220)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::: :. : : ::::..::.:. : .. :....
Q07WG1 MGIKDWPQGEGPREKLLLKGAGHLSDAELLAVILRNGLAGQNAVDLARNM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
...::.::.::::.: ::. :.: ... ::::..:..:: ...: ..... . ..
Q07WG1 INQFGGLRSLLSASKSQVCKLAGVGPVKYAQLQAAVEISKRIAHENLQRGQILTNPDLTR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::. .: . :.: .:.::.:::.:. .:: :::. ..:::::... : .:::.:
Q07WG1 DYLMRQLADRSYEVFALLLLDTQHRVIQFVELFRGTIDSASVYPREVVSLVLEKKAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
. ::::::::::: .:. ::..: .: ... .:::..:: ::::.
Q07WG1 VCHNHPSGIAEPSQADRRITERIKNALATIDVSLLDHMVVGDQEIVSFAERGWIV
180 190 200 210 220
>>A1S2D2.1 A1S2D2_9GAMM DNA repair protein RadC. (225 aa)
initn: 580 init1: 580 opt: 580 Z-score: 685.9 bits: 134.2 E(): 4.3e-30
Smith-Waterman score: 580; 42.584% identity (42.584% ungapped) in 209 aa overlap (22-230:12-220)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
::::::. :. : : ::::..::.:..: .. :.. .
A1S2D2 MAIRDWPEGEGPREKLLQRGAAHLSDAELLAVLLRNGVSGQNAVDLAREL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
. .::.:: :.:: :. :...::: ... ::::..:...: . : :... . ..
A1S2D2 IGEFGGLRPLFSATKQQVCRLQGLGPVKYAQLQASAELARRLAGESLQRGAVLTSPDLTR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::. .: . :.: ::.::.:::.:. .:: :::....:::::... : :::.:
A1S2D2 DYLRFQLADRAYEVFAVLLLDSQHRVIQFVELFRGTIDAASVYPRELVSLVLEKRAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
. ::::::.:::: .:. ::... .: ... .:::..:: ::::.
A1S2D2 VCHNHPSGVAEPSQADRRITERLKNALATIDVSLLDHMVVGDREIVSFAERGWIG
180 190 200 210 220
>>Q9PGZ8.2 RADC_XYLFA DNA repair protein radC homolog. (224 aa)
initn: 576 init1: 576 opt: 579 Z-score: 684.8 bits: 134.0 E(): 5e-30
Smith-Waterman score: 579; 43.192% identity (43.192% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::: .:. .: : ::::::: .:..: .. ....
Q9PGZ8 MHINNWPTHERPREKLLAHGAATLSDAELLAIFLGSGLRGHDAVQTARNL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
:. : :: ::. . .. :::... .: :. :.. :.: : . : ..
Q9PGZ8 LHTHGPLRELLDRPPGDLMRLPGLGLARACKLTAALELSTRHLAAALQRGASIHDPISAG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
:. .:. . :.: ::::::.:: :. :.:: :::: ..:.:::.....: ::::.:
Q9PGZ8 RYFAQRLRANPNEVFAVLFLDNRHRAISFEELFHGTINGAEVHPREVVRRALTLNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
..:::::: ::: .:.::::.. .: .:...:..:::..: :. :::::. :
Q9PGZ8 VGHNHPSGNREPSPADRMITQRLKNALDLIDVRLVDHFVIGDGAPVSFAEHGWL
180 190 200 210 220
>>A1REU4.1 A1REU4_9GAMM DNA repair protein RadC. (225 aa)
initn: 579 init1: 579 opt: 579 Z-score: 684.8 bits: 134.0 E(): 5e-30
Smith-Waterman score: 579; 42.105% identity (42.105% ungapped) in 209 aa overlap (22-230:12-220)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
::.:::. :. : : ::::..::.:. : .. :..:.
A1REU4 MGIKDWPEGEGPRDKLLQKGAAYLSDAELLAVLLRNGLAGLNAVDLARSL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
...::.:: :: : :. :.. :.: ... ::::..:...: ...: .:... . ..
A1REU4 ISEFGGLRNLLCAPKNQVCRLPGVGPVKYAQLQAAAELARRVAQENLQRGQVLTNPDLTR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
::. .: . :.: .:.::.:::.:. .:: :::. ..:::::... : .:::.:
A1REU4 DYLMRQLTDRSYEVFAILLLDSQHRVIQFVELFRGTIDSASVYPREVVSLVLEKKAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
. ::::::::::: .:. ::... .: ... .:::..:: ::::.
A1REU4 VCHNHPSGIAEPSQADRRITERLKNALATIDVSLLDHMVVGDREIVSFAERGWIN
180 190 200 210 220
>>Q87F21.1 RADC_XYLFT DNA repair protein radC homolog. (224 aa)
initn: 575 init1: 575 opt: 578 Z-score: 683.6 bits: 133.8 E(): 5.8e-30
Smith-Waterman score: 578; 43.192% identity (43.192% ungapped) in 213 aa overlap (22-234:12-224)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
:::::: .:. .: : ::::::: .:..: .. ....
Q87F21 MHINNWPTHERPREKLLAHGAATLSDAELLAIFLGSGLRGHDAVQTARNL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
:. : :: ::. . .. :::... .: :. :.. :.: : . : ..
Q87F21 LHTHGPLRELLDRPPGDLMRLPGLGLARACKLTAALELSTRHLAAALQRGASIHDPISAG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
:. .:. . :.: ::::::.:: :. :.:: :::: ..:.:::.....: ::::.:
Q87F21 RYFAQRLRANPNEVFAVLFLDNRHRAISFEELFHGTINGAEVHPREVVRRALTLNAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
..:::::: ::: .:.::::.. .: .:...:..:::..: :. :::::. :
Q87F21 VGHNHPSGNREPSPADQMITQRLKNALDLIDVRLVDHFVIGDGAPVSFAEHGWL
180 190 200 210 220
>>Q0HZU3.1 Q0HZU3_SHESR DNA repair protein RadC. (225 aa)
initn: 578 init1: 578 opt: 578 Z-score: 683.6 bits: 133.8 E(): 5.8e-30
Smith-Waterman score: 578; 42.105% identity (42.105% ungapped) in 209 aa overlap (22-230:12-220)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
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Q0HZU3 MAIKDWPEGEGPRDKLLVKGAAHLSDAELLAVLLRNGLSGLNAVDLARSL
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...::.::.:: : :. :.. :.: ... ::::..:...: ...: .:... . ..
Q0HZU3 IHEFGGLRSLLCAPKHQVCRLPGVGPVKYAQLQAAAELARRVAQENLQRGQVLTNPDLTR
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Q0HZU3 VCHNHPSGIAEPSQADRRITERLKNALATIDVSLLDHMVVGDREIVSFAERGWIN
180 190 200 210 220
>>A0J8W5.1 A0J8W5_9GAMM DNA repair protein RadC. (225 aa)
initn: 578 init1: 578 opt: 578 Z-score: 683.6 bits: 133.8 E(): 5.8e-30
Smith-Waterman score: 578; 40.191% identity (40.191% ungapped) in 209 aa overlap (22-230:12-220)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
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A0J8W5 MGIKDWPDGEGPRDRLIKFGVSQLSDAEVLAVLLRNGSQGLNAVELARNL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
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A0J8W5 INEFGGLREVLAASQSQVCRLSGMGPVKFAQLRAAVELSSRVSAQNLKRGKILSDPDLTR
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130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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A0J8W5 DYLMRQLRDRAYEVFAILLLDSQHRVIQFVELFRGTIDSASVYPRDVVSLVLEKKAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
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A0J8W5 VCHNHPSGVAEPSHADRRITERLKCALSTIDVSLLDHMVVGDREIVSFAERGWID
180 190 200 210 220
>>A0L1R9.1 A0L1R9_9GAMM DNA repair protein RadC. (225 aa)
initn: 578 init1: 578 opt: 578 Z-score: 683.6 bits: 133.8 E(): 5.8e-30
Smith-Waterman score: 578; 42.105% identity (42.105% ungapped) in 209 aa overlap (22-230:12-220)
10 20 30 40 50 60
orf000 MKIDRTFFFSLINMQTNSPLMPREKLLKYGVEALEDHELLAIFLRTGIKGCPVMALSHSV
::.::: :. : : ::::..::.:..: .. :..:.
A0L1R9 MAIKDWPEGEGPRDKLLVKGAAHLSDAELLAVLLRNGLSGLNAVDLARSL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
orf000 LQHFGSLRALLSADKEAFCKVKGLGITQFIQLQATTEMTKRYLKQELLIEHVFSDTSTVK
...::.::.:: : :. :.. :.: ... ::::..:...: ...: .:... . ..
A0L1R9 IHEFGGLRSLLCAPKHQVCRLPGVGPVKYAQLQAAAELARRVAQENLQRGQVLTNPDLTR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
orf000 LYLQAELHHEEREIFMVLFLDNQHRLIKKERLFLGTINVTNVYPREIIKESLYCNAAALI
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A0L1R9 DYLMRQLADRSYEVFAILLLDSQHRVIQFVELFRGTIDSASVYPREVVSLVLEKKAAAVI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
orf000 LAHNHPSGIAEPSYSDKMITQKIIEAAELMEIRILDHFIVGKGTCYSFAEHNLL
. ::::::::::: .:. ::... .: ... .:::..:: ::::.
A0L1R9 VCHNHPSGIAEPSQADRRITERLKNALATIDVSLLDHMVVGDREIVSFAERGWIN
180 190 200 210 220
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639146251 residues in 2035238 library sequences
Scomplib [33t08]
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Function used was FASTA [version 3.3t08 Jan. 17, 2001]